View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18213_high_5 (Length: 493)

Name: NF18213_high_5
Description: NF18213
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18213_high_5
NF18213_high_5
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (15-493)||(27623522-27624002)
chr6 (15-493)||(27284177-27284655)
chr6 (15-489)||(13518009-13518483)
chr6 (15-493)||(8899514-8899993)
chr6 (15-493)||(27355926-27356405)
chr6 (15-493)||(22928696-22929176)
chr6 (15-493)||(16755724-16756204)
chr6 (15-493)||(29555462-29555941)
chr6 (15-493)||(33370246-33370725)
chr6 (15-493)||(4763668-4764146)
chr6 (15-487)||(34458323-34458794)
chr6 (15-493)||(28166398-28166878)
chr6 (15-493)||(27491037-27491516)
chr6 (15-493)||(26772444-26772922)
chr6 (15-493)||(26110226-26110704)
chr6 (15-488)||(27063391-27063864)
chr6 (15-493)||(26791720-26792199)
chr6 (15-493)||(27200090-27200569)
chr6 (15-493)||(4539573-4540053)
chr6 (15-493)||(16680043-16680523)
chr6 (15-493)||(27248664-27249144)
chr6 (15-493)||(4531192-4531671)
chr6 (15-493)||(28213358-28213838)
chr6 (15-493)||(4778784-4779264)
chr6 (15-493)||(29507320-29507801)
chr6 (15-448)||(30551815-30552249)
chr6 (15-493)||(29578919-29579397)
chr6 (15-493)||(13292766-13293239)
chr6 (15-493)||(16937840-16938319)
chr6 (18-493)||(14139218-14139688)
chr6 (18-493)||(27013637-27014106)
chr6 (15-493)||(26926674-26927135)
chr6 (15-493)||(27030926-27031403)
chr6 (15-493)||(24869614-24870087)
chr6 (15-454)||(27208848-27209283)
chr6 (15-454)||(27239945-27240380)
chr6 (15-493)||(27025049-27025524)
chr6 (15-317)||(26666473-26666774)
chr6 (15-493)||(24299575-24300049)
chr6 (15-493)||(15406348-15406823)
chr6 (15-493)||(15418135-15418610)
chr6 (27-380)||(20174567-20174930)
chr6 (27-380)||(22161061-22161424)
chr6 (322-493)||(23851450-23851621)
chr6 (414-493)||(4718349-4718429)
chr6 (439-493)||(20174453-20174507)
chr6 (439-493)||(22161484-22161538)
chr6 (465-493)||(27184832-27184860)
chr6 (465-493)||(27264380-27264408)
chr6 (465-493)||(30552282-30552310)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (15-493)||(32296499-32296979)
chr3 (15-493)||(5727848-5728328)
chr3 (15-493)||(5716938-5717418)
chr3 (15-493)||(5764040-5764520)
chr3 (15-493)||(47029323-47029803)
chr3 (15-493)||(28109862-28110346)
chr3 (15-493)||(29658879-29659358)
chr3 (15-493)||(8217502-8217983)
chr3 (15-493)||(29142665-29143147)
chr3 (15-493)||(24334043-24334524)
chr3 (15-493)||(31958366-31958847)
chr3 (15-493)||(4340587-4341067)
chr3 (15-493)||(4629655-4630133)
chr3 (15-493)||(16618400-16618882)
chr3 (15-489)||(5603224-5603701)
chr3 (15-493)||(5472858-5473336)
chr3 (15-493)||(10648941-10649420)
chr3 (15-493)||(4422789-4423267)
chr3 (15-493)||(28027161-28027638)
chr3 (15-493)||(18248608-18249087)
chr3 (15-493)||(21680571-21681049)
chr3 (15-487)||(16422059-16422532)
chr3 (15-493)||(22381492-22381969)
chr3 (15-493)||(4790544-4791024)
chr3 (15-493)||(51787892-51788371)
chr3 (15-493)||(18286266-18286744)
chr3 (15-493)||(18301567-18302045)
chr3 (15-493)||(10402019-10402497)
chr3 (15-493)||(17970777-17971254)
chr3 (15-493)||(18231063-18231542)
chr3 (15-493)||(20570757-20571236)
chr3 (15-493)||(28345041-28345519)
chr3 (15-493)||(48471797-48472280)
chr3 (15-493)||(22864759-22865236)
chr3 (15-493)||(22879818-22880295)
chr3 (15-493)||(17978861-17979343)
chr3 (15-493)||(6536654-6537133)
chr3 (15-493)||(20071905-20072384)
chr3 (18-493)||(5590275-5590751)
chr3 (15-493)||(5019583-5020061)
chr3 (15-493)||(11104272-11104752)
chr3 (15-493)||(31030156-31030628)
chr3 (15-492)||(18057131-18057612)
chr3 (15-493)||(7079094-7079576)
chr3 (15-493)||(6207770-6208245)
chr3 (18-493)||(18336498-18336968)
chr3 (15-493)||(19700357-19700847)
chr3 (15-493)||(32445024-32445494)
chr3 (15-493)||(4727503-4727976)
chr3 (15-493)||(15735011-15735485)
chr3 (15-493)||(35886634-35887109)
chr3 (15-493)||(4689521-4689994)
chr3 (15-493)||(5658005-5658480)
chr3 (15-493)||(8283369-8283859)
chr3 (293-485)||(15886894-15887089)
chr3 (15-264)||(15886652-15886895)
chr3 (317-493)||(8002430-8002607)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (15-493)||(3047-3528)
scaffold0159 (15-258)||(17949-18194)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (15-493)||(3795452-3795932)
chr5 (15-489)||(33881045-33881519)
chr5 (15-493)||(18369300-18369779)
chr5 (15-493)||(30174379-30174859)
chr5 (19-493)||(11555268-11555742)
chr5 (15-493)||(22894331-22894808)
chr5 (15-493)||(33298447-33298930)
chr5 (15-493)||(37352412-37352891)
chr5 (15-493)||(37746090-37746574)
chr5 (15-493)||(28953548-28954027)
chr5 (15-493)||(37760896-37761376)
chr5 (15-493)||(32590044-32590522)
chr5 (15-493)||(6880217-6880697)
chr5 (15-493)||(41680618-41681098)
chr5 (15-484)||(8659240-8659709)
chr5 (15-493)||(18494536-18495014)
chr5 (15-493)||(28655156-28655636)
chr5 (15-493)||(37665254-37665733)
chr5 (15-493)||(30157947-30158427)
chr5 (15-493)||(9323391-9323869)
chr5 (15-493)||(43084172-43084651)
chr5 (18-493)||(9544478-9544955)
chr5 (15-493)||(13318596-13319074)
chr5 (15-493)||(23631883-23632364)
chr5 (15-493)||(24729884-24730363)
chr5 (15-489)||(15752626-15753094)
chr5 (15-493)||(12138090-12138568)
chr5 (15-493)||(13180561-13181036)
chr5 (15-493)||(40467321-40467800)
chr5 (15-493)||(33522293-33522776)
chr5 (38-489)||(30035345-30035795)
chr5 (15-493)||(11329551-11330032)
chr5 (15-493)||(31820178-31820655)
chr5 (15-493)||(13436442-13436928)
chr5 (15-493)||(2516979-2517459)
chr5 (15-493)||(34622432-34622912)
chr5 (15-493)||(26486310-26486778)
chr5 (15-493)||(18122184-18122663)
chr5 (18-493)||(31437378-31437847)
chr5 (22-487)||(25206198-25206670)
chr5 (22-487)||(25270354-25270826)
chr5 (15-493)||(5643716-5644191)
chr5 (15-493)||(22992892-22993363)
chr5 (15-493)||(15652528-15653005)
chr5 (15-493)||(23897789-23898261)
chr5 (15-493)||(33783401-33783875)
chr5 (15-493)||(24608160-24608634)
chr5 (15-493)||(30940550-30941023)
chr5 (15-485)||(24975771-24976236)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (15-493)||(11945-12421)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (15-493)||(28355780-28356262)
chr8 (15-493)||(9360529-9361007)
chr8 (15-493)||(31360435-31360914)
chr8 (15-493)||(29835230-29835708)
chr8 (15-493)||(19680355-19680833)
chr8 (15-493)||(33248273-33248751)
chr8 (15-493)||(31483700-31484181)
chr8 (15-493)||(18796613-18797093)
chr8 (15-493)||(44566888-44567369)
chr8 (15-493)||(12086553-12087033)
chr8 (15-493)||(15773481-15773960)
chr8 (15-493)||(21342000-21342480)
chr8 (15-493)||(18715389-18715868)
chr8 (15-493)||(19910992-19911473)
chr8 (52-493)||(33264638-33265079)
chr8 (15-493)||(19202205-19202673)
chr8 (15-493)||(27602744-27603215)
chr8 (15-472)||(22074759-22075216)
chr8 (143-493)||(16260130-16260480)
chr8 (18-493)||(19655180-19655653)
chr8 (15-493)||(22138814-22139286)
chr8 (15-493)||(2131098-2131571)
chr8 (15-493)||(19694002-19694477)
chr8 (15-493)||(14569064-14569540)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (15-493)||(39856555-39857032)
chr4 (15-493)||(20332290-20332770)
chr4 (15-493)||(40099504-40099984)
chr4 (15-493)||(24586229-24586709)
chr4 (15-489)||(14104466-14104939)
chr4 (15-488)||(27157180-27157657)
chr4 (15-493)||(18794485-18794964)
chr4 (15-493)||(54839310-54839787)
chr4 (15-493)||(30759682-30760159)
chr4 (15-493)||(14753362-14753840)
chr4 (15-493)||(5700458-5700937)
chr4 (15-493)||(33667671-33668148)
chr4 (15-493)||(1906171-1906654)
chr4 (15-493)||(34182832-34183309)
chr4 (15-493)||(5011795-5012275)
chr4 (18-493)||(21975619-21976098)
chr4 (15-493)||(15233735-15234217)
chr4 (15-493)||(31120378-31120861)
chr4 (15-493)||(36338394-36338865)
chr4 (15-493)||(6575780-6576251)
chr4 (15-476)||(15380106-15380567)
chr4 (15-472)||(15276497-15276957)
chr4 (19-493)||(24118580-24119055)
chr4 (15-493)||(17018970-17019445)
chr4 (15-493)||(14670934-14671410)
chr4 (15-380)||(1673892-1674258)
chr4 (15-322)||(36324185-36324484)
chr4 (390-493)||(18311421-18311526)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (15-493)||(27809606-27810087)
chr2 (15-493)||(12592715-12593198)
chr2 (15-493)||(37945723-37946203)
chr2 (15-493)||(12661444-12661922)
chr2 (15-493)||(3788399-3788877)
chr2 (15-493)||(22922001-22922482)
chr2 (15-493)||(254510-254989)
chr2 (15-493)||(19410342-19410824)
chr2 (15-493)||(39895973-39896452)
chr2 (15-493)||(37383582-37384061)
chr2 (15-493)||(40239414-40239892)
chr2 (15-493)||(13930402-13930883)
chr2 (15-493)||(16167383-16167862)
chr2 (15-493)||(12710459-12710938)
chr2 (15-493)||(27782137-27782616)
chr2 (15-493)||(37679749-37680230)
chr2 (15-493)||(37695014-37695495)
chr2 (15-493)||(27122430-27122907)
chr2 (15-493)||(34867588-34868066)
chr2 (15-493)||(11629043-11629521)
chr2 (15-493)||(21671028-21671510)
chr2 (15-493)||(34160749-34161230)
chr2 (15-493)||(37931277-37931763)
chr2 (15-487)||(21697031-21697506)
chr2 (15-493)||(32055708-32056185)
chr2 (15-493)||(16823195-16823677)
chr2 (15-493)||(16897803-16898285)
chr2 (15-493)||(9343845-9344324)
chr2 (15-493)||(39045680-39046159)
chr2 (15-493)||(31882192-31882670)
chr2 (15-472)||(27396250-27396717)
chr2 (15-493)||(34297062-34297533)
chr2 (15-472)||(19450276-19450742)
chr2 (15-351)||(31868644-31868979)
chr2 (15-493)||(34268784-34269257)
chr2 (15-493)||(28888184-28888658)
chr2 (15-493)||(23122436-23122910)
chr2 (19-493)||(27428315-27428783)
chr2 (15-493)||(20843818-20844296)
chr2 (15-202)||(23116993-23117180)
chr2 (346-493)||(31887682-31887830)
chr2 (414-493)||(27821894-27821974)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (15-493)||(3647055-3647534)
chr1 (15-493)||(10968574-10969054)
chr1 (15-493)||(20334283-20334763)
chr1 (15-493)||(10951000-10951480)
chr1 (37-493)||(51644129-51644588)
chr1 (15-493)||(41787177-41787658)
chr1 (15-493)||(28590992-28591470)
chr1 (15-493)||(28155637-28156116)
chr1 (15-485)||(16201895-16202373)
chr1 (15-493)||(20466688-20467173)
chr1 (15-493)||(21891630-21892095)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (15-493)||(5141088-5141568)
chr7 (15-493)||(16745274-16745754)
chr7 (15-493)||(26441157-26441637)
chr7 (15-493)||(24586289-24586768)
chr7 (15-493)||(4138999-4139480)
chr7 (15-493)||(5164288-5164767)
chr7 (15-493)||(26663666-26664146)
chr7 (15-493)||(26678858-26679338)
chr7 (15-493)||(26518697-26519174)
chr7 (15-493)||(31558148-31558626)
chr7 (15-493)||(11446792-11447271)
chr7 (15-493)||(5153988-5154466)
chr7 (15-493)||(16443757-16444236)
chr7 (15-493)||(39206893-39207372)
chr7 (15-493)||(4205293-4205772)
chr7 (15-487)||(16047226-16047695)
chr7 (37-493)||(26509471-26509930)
chr7 (15-493)||(31084376-31084856)
chr7 (15-493)||(45393122-45393602)
chr7 (15-493)||(3451222-3451702)
chr7 (15-493)||(26313603-26314081)
chr7 (15-493)||(2160475-2160955)
chr7 (15-493)||(11418533-11419012)
chr7 (15-493)||(26268839-26269322)
chr7 (15-493)||(45737207-45737686)
chr7 (18-493)||(2779156-2779626)
chr7 (15-493)||(31129809-31130282)
chr7 (15-472)||(10847509-10847968)
chr7 (15-316)||(26595750-26596053)
chr7 (15-485)||(16512194-16512659)
chr7 (15-493)||(10910680-10911153)
chr7 (317-493)||(26531926-26532103)
chr7 (415-493)||(16732684-16732763)
chr7 (456-493)||(2104357-2104394)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (15-493)||(9510-9987)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (15-493)||(1564-2043)
scaffold0322 (15-493)||(11954-12443)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (15-493)||(8797-9275)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (15-488)||(4471-4948)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (15-493)||(9821-10299)
scaffold0143 (15-493)||(33204-33680)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (15-493)||(15476-15962)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (15-493)||(18492-18973)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (15-493)||(13856-14336)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (15-472)||(25044-25509)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (15-493)||(5973-6449)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (15-493)||(24774-25249)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (241-493)||(284-537)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (15-187)||(1-173)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (257-472)||(26243-26458)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (15-448)||(40497-40953)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 27623522 - 27624002
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623522 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27623621  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaa-tgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27623622 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatata 27623721  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623722 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27623821  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  27623822 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 27623921  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623922 ctgatggagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 27624002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 27284177 - 27284655
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284177 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27284276  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284277 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 27284376  T
Q  215 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27284377 ctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 27284475  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27284476 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaagcttc 27284575  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284576 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 27284655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 489
Target Start/End: Original strand, 13518009 - 13518483
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518009 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13518108  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 13518208  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518209 ctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 13518308  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||   || | ||| |    
T  13518309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagctttt 13518408  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttg 489  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13518409 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttg 13518483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 8899514 - 8899993
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899514 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8899613  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8899614 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 8899713  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899714 actttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 8899812  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||||    
T  8899813 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 8899912  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899913 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 8899993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 27355926 - 27356405
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27355926 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27356025  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356026 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 27356125  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356126 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 27356224  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||     
T  27356225 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 27356324  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356325 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 27356405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 22928696 - 22929176
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22928696 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctattgct 22928795  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 211  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  22928796 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 22928895  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22928896 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 22928994  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  22928995 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagct 22929094  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929095 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 22929176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16756204 - 16755724
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756204 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16756105  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat--gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756104 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattgtcaaaatatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 16756005  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16756004 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 16755906  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| |  | |||    
T  16755905 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctt 16755806  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755805 ttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 16755724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 29555941 - 29555462
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29555941 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgtt 29555842  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555841 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagcttttaattttctaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 29555742  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  29555741 gctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggattt 29555643  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29555642 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttc 29555543  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29555542 tgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttc 29555462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 33370246 - 33370725
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370246 cacagactatcctggaggagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33370345  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33370346 caggttcgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgctttgtatata 33370445  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370446 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 33370544  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||     
T  33370545 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 33370644  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370645 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 33370725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4764146 - 4763668
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764146 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4764047  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4764046 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 4763947  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  4763946 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 4763848  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  4763847 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 4763748  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763747 cgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 4763668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 487
Target Start/End: Original strand, 34458323 - 34458794
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458323 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34458422  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458423 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaaccattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 34458521  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458522 cttagaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 34458620  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| |    
T  34458621 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctttt 34458720  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttt 487  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  | | || |||||||||||||||||||||||    
T  34458721 gatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggcggttggccagatatagttacttgccttt 34458794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 28166878 - 28166398
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166878 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28166779  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  28166778 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 28166679  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28166678 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 28166580  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | || |||| |||||  || | |||    
T  28166579 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttggattcgcaagcgtaggagctt 28166480  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166479 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 28166398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27491516 - 27491037
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491516 cacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27491417  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27491416 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 27491317  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27491316 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 27491218  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| | || | |||     
T  27491217 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtataggagcttt 27491118  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27491117 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttctgtttc 27491037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 26772444 - 26772922
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26772444 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26772543  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772544 caggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 26772643  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26772644 gctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 26772741  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||| ||||||  ||||| |||     
T  26772742 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttt 26772841  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26772842 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttc 26772922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 26110226 - 26110704
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110226 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatatggaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26110325  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110326 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 26110425  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26110426 ctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26110524  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||| ||||||  ||||| ||| |    
T  26110525 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagctttt 26110624  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110625 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 26110704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 27063864 - 27063391
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063864 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27063765  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27063764 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 27063665  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  27063664 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 27063567  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||| |  | ||      
T  27063566 acaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcacaagcataagagctct 27063467  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgcctttt 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | || || ||||||||||||||||||||||||    
T  27063466 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacgatggttagccagatatagttacttgcctttt 27063391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26792199 - 26791720
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26792199 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26792100  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26792099 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 26792000  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  26791999 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggattt 26791901  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | |||     
T  26791900 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 26791801  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791800 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 26791720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27200569 - 27200090
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200569 cacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27200471  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27200470 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacat 27200371  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27200370 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 27200273  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||| |||||| |||||| ||    
T  27200272 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagct 27200173  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200172 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 27200090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 4539573 - 4540053
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4539573 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 4539672  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539673 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 4539772  T
Q  215 ctttgaaagt-agaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4539773 ctttgaaagtaaaaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 4539871  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  4539872 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 4539971  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539972 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 4540053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16680523 - 16680043
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16680523 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgtcgct 16680424  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16680423 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 16680324  T
Q  214 gctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  16680323 actttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacggatt 16680225  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||   || | |||    
T  16680224 ttcaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagctt 16680125  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccaga-tatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16680124 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccagattatagttacttgccttttgtttc 16680043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 27248664 - 27249144
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248664 cacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27248762  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27248763 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacat 27248862  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27248863 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 27248960  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||| |||||| |||||| ||    
T  27248961 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagct 27249060  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc--aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27249061 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 27249144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4531671 - 4531192
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaa-atagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgc 113  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4531671 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaagatagacacccacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgc 4531573  T
Q  114 tcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  4531572 tcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagagaatgttttgtatac 4531473  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  4531472 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcacgactccacggatt 4531374  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||| |||    
T  4531373 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaacttcgaattcacaagtacagaagctt 4531274  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531273 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 4531192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 28213838 - 28213358
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28213838 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 28213739  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28213738 caggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 28213639  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28213638 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 28213540  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  28213539 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 28213440  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213439 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 28213358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4779264 - 4778784
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4779264 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4779166  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4779165 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtataca 4779066  T
Q  214 gcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  4779065 gcttttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggatt 4778967  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||  || | ||    
T  4778966 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 4778867  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778866 ttagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 4778784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 29507801 - 29507320
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29507801 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttccatttgaatgtaccctgttgct 29507702  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29507701 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatata 29507602  T
Q  214 gctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||| || |  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29507601 gctttgaaagtaaaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 29507503  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||  || | ||    
T  29507502 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 29507403  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29507402 tttgatgaagatagtcattaacagctgcatatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttatttgccttttgtttc 29507320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 448
Target Start/End: Original strand, 30551815 - 30552249
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30551815 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 30551914  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30551915 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 30552014  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30552015 gctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 30552113  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac-tt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || | ||||| |||||| |||||| | ||    
T  30552114 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagcttt 30552213  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc 448  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552214 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc 30552249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 29579397 - 29578919
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29579397 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 29579298  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  29579297 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaggaaaatgatttgtatata 29579198  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29579197 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 29579100  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||  ||||   || | |||     
T  29579099 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatttgcaagtgtaggagcttt 29579000  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29578999 agatgaagatagtcatcaacggcggcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 29578919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 13292766 - 13293239
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292766 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13292865  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292866 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 13292960  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13292961 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 13293059  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||||||  |||||  || | ||| |    
T  13293060 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagctttt 13293159  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293160 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaggcggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 13293239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 16937840 - 16938319
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937840 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16937939  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  16937940 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaggaaaataatttgtatata 16938039  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  16938040 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattc 16938137  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| | ||||||| |||| ||| || |||    
T  16938138 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcgcaagtacaaaagctt 16938237  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16938238 cagatggagatggccattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttatttc 16938319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 493
Target Start/End: Original strand, 14139218 - 14139688
Alignment:
Q  18 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 117  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14139218 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccatgttgctcag 14139317  T
Q  118 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 217  Q
    |||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139318 gtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 14139412  T
Q  218 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 317  Q
    |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  14139413 tgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 14139511  T
Q  318 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||| |  | ||| ||||    
T  14139512 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgat 14139611  T
Q  418 gaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139612 gaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 14139688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27014106 - 27013637
Alignment:
Q  18 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 117  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27014106 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattaaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 27014007  T
Q  118 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 217  Q
    |||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014006 gtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 27013913  T
Q  218 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 317  Q
    |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27013912 tgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 27013814  T
Q  318 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||| |  | ||| ||||    
T  27013813 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgat 27013714  T
Q  418 gaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013713 gaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 27013637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26927135 - 26926674
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||         |||||||||||||||||||||||    
T  26927135 cacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacata------ctc---------tcatttgaatgtaccctgttgct 26927051  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  26927050 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatata 26926951  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  26926950 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 26926853  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||  ||    |||     
T  26926852 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgcttt 26926755  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926754 tgatgaagatggtcattaacagctgcggatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 26926674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27031403 - 27030926
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27031403 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27031305  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 211  Q
    |||||||||||||||||| |    |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  27031304 caggtttgcttttcaaaaaa----aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgttttttgtaca 27031209  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27031208 taactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 27031110  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||  || | ||    
T  27031109 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaatacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagcgtaggagct 27031010  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatt--gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031009 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaacgggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 27030926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24870087 - 24869614
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24870087 cacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 24869989  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  24869988 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 24869896  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24869895 taactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24869797  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| |  | ||    
T  24869796 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagct 24869697  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869696 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 24869614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 27209283 - 27208848
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27209283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27209185  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gta 209  Q
    || |||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||    
T  27209184 caagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 27209092  T
Q  210 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 309  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27209091 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 27208993  T
Q  310 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaa 409  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||| || |     
T  27208992 atttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggag 27208893  T
Q  410 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg 454  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27208892 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggg 27208848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 454
Target Start/End: Original strand, 27239945 - 27240380
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27239945 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27240043  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gta 209  Q
    || |||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||    
T  27240044 caagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 27240136  T
Q  210 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 309  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27240137 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 27240235  T
Q  310 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaa 409  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||| || |     
T  27240236 atttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggag 27240335  T
Q  410 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg 454  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240336 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggg 27240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27025524 - 27025049
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27025524 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactagctcatgcatgtctcgtttgaatgtaccctgttgct 27025425  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--gtat 210  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||     
T  27025424 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgtac 27025332  T
Q  211 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27025331 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 27025233  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || | | ||||||| |||||  || | |    
T  27025232 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagagactttgaattcgcaagcgtaggagc 27025133  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025132 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 27025049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Original strand, 26666473 - 26666774
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26666473 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26666572  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666573 caggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 26666672  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26666673 gctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 26666770  T
Q  314 acaa 317  Q
    ||||    
T  26666771 acaa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 24299575 - 24300049
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24299575 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgcttatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttact 24299673  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 212  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||| | ||| ||||| ||| ||    
T  24299674 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgttccgagcatttgtcattattaaaaaagaagggaaacgtttttgtacat 24299768  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    | |||||| |||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24299769 aactttgagagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 24299867  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | |||    
T  24299868 tacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtgatacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 24299967  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24299968 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 24300049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 15406348 - 15406823
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15406348 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 15406446  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||      ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  15406447 caggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 15406540  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15406541 tatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15406639  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  | || | ||||||| |||||  ||   |    
T  15406640 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtaggggc 15406739  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406740 ttttgatgaagatggccattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttttgtttc 15406823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 15418135 - 15418610
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15418135 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 15418233  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||      ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  15418234 caggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 15418327  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15418328 tatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15418426  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  | || | ||||||| |||||  ||   |    
T  15418427 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtaggggc 15418526  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418527 ttttgatgaagatggccattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttttgtttc 15418610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20174930 - 20174567
Alignment:
Q  27 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |     |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  20174930 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 20174831  T
Q  127 tcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 217  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  20174830 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 20174731  T
Q  218 tgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 315  Q
    || |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  20174730 tggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttac 20174632  T
Q  316 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||    
T  20174631 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgagcatggtaaacactatatttcc 20174567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Original strand, 22161061 - 22161424
Alignment:
Q  27 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |     |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22161061 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 22161160  T
Q  127 tcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 217  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  22161161 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 22161260  T
Q  218 tgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 315  Q
    || |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  22161261 tggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttac 22161359  T
Q  316 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||    
T  22161360 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgagcatggtaaacactatatttcc 22161424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 322 - 493
Target Start/End: Original strand, 23851450 - 23851621
Alignment:
Q  322 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatgaag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  23851450 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaag 23851549  T
Q  422 acggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851550 atggtcattaacagctgcagatgccccaagggaatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 23851621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 493
Target Start/End: Original strand, 4718349 - 4718429
Alignment:
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4718349 tgatgaagataggcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 4718429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 439 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20174507 - 20174453
Alignment:
Q  439 cagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20174507 cagatgcctaaaggggatggtgacttgctagaaatagttacttgccttttgtttc 20174453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 439 - 493
Target Start/End: Original strand, 22161484 - 22161538
Alignment:
Q  439 cagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22161484 cagatgcctaaaggggatggtgacttgctagaaatagttacttgccttttgtttc 22161538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 465 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27184860 - 27184832
Alignment:
Q  465 gccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184860 gccagatatagttacttgccttttgtttc 27184832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 465 - 493
Target Start/End: Original strand, 27264380 - 27264408
Alignment:
Q  465 gccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27264380 gccagatatagttacttgccttttgtttc 27264408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 465 - 493
Target Start/End: Original strand, 30552282 - 30552310
Alignment:
Q  465 gccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552282 gccagatatagttacttgccttttgtttc 30552310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 32296979 - 32296499
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32296979 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 32296880  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296879 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 32296780  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32296779 ctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattc 32296680  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32296679 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcgcagaaacttc 32296580  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296579 tgatgaaaatggtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 32296499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 5728328 - 5727848
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728328 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5728229  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728228 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5728129  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728128 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5728029  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  5728028 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 5727929  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727928 agatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 5727848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 5717418 - 5716938
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717418 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5717319  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717318 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5717219  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717218 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5717119  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  5717118 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 5717019  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717018 agatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 5716938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 5764040 - 5764520
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764040 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5764139  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764140 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5764239  T
Q  215 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764240 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5764339  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  5764340 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 5764439  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764440 agatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 5764520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 47029803 - 47029323
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029803 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 47029704  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 47029604  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029603 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 47029504  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  47029503 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 47029404  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47029403 agatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggagccggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttc 47029323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 28109862 - 28110346
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109862 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28109961  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat----gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109962 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaacgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 28110061  T
Q  211 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28110062 atagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacgga 28110161  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaa 409  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||| ||||||     
T  28110162 ttcataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaag 28110261  T
Q  410 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110262 cttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 28110346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 29658879 - 29659358
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658879 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29658978  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658979 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 29659078  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659079 actttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 29659177  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||     
T  29659178 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 29659277  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659278 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 29659358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 8217983 - 8217502
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217983 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8217884  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8217883 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 8217784  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217783 taactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 8217685  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||| || | ||    
T  8217684 ccacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagct 8217585  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217584 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 8217502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 29142665 - 29143147
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29142665 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgct 29142764  T
Q  115 caggtttgcttttc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29142765 caggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 29142864  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142865 tagctttgaaagtagaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 29142964  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  29142965 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 29143064  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143065 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 29143147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24334524 - 24334043
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24334524 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 24334425  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24334424 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatag 24334325  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24334324 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 24334225  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||| |||||||   | ||| |||    
T  24334224 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagctt 24334125  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334124 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 24334043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 31958366 - 31958847
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31958366 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 31958465  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958466 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 31958565  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31958566 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31958665  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||| |||||||   | ||| |||    
T  31958666 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagctt 31958765  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31958766 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagtcacttgccttttgtttc 31958847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 4340587 - 4341067
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4340587 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 4340686  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4340687 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 4340786  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4340787 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 4340885  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac-tt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||| |||||| |||||| | ||    
T  4340886 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttt 4340985  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4340986 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacagtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttc 4341067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4630133 - 4629655
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4630133 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4630035  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4630034 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 4629935  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4629934 actttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatta 4629836  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||||    
T  4629835 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 4629736  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629735 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 4629655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 16618400 - 16618882
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16618400 cacagactatcctggggaagagcctccttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16618499  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 208  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  16618500 caggtttgcttt-caaaatggacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 16618598  T
Q  209 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 308  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16618599 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 16618697  T
Q  309 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||||| |||||||||||    
T  16618698 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaa 16618797  T
Q  409 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618798 gcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 16618882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 489
Target Start/End: Original strand, 5603224 - 5603701
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5603224 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttttatttgaaggtaccctgttgct 5603323  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603324 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5603423  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5603424 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 5603523  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||| |||||||   | ||| |||    
T  5603524 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagctt 5603623  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttg 489  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  5603624 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagtcacttgccttttg 5603701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 5473336 - 5472858
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473336 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5473237  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5473236 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 5473138  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473137 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5473039  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||| |  | |||     
T  5473038 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 5472939  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5472938 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccaggtatagctacttgccttttgtttc 5472858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 10649420 - 10648941
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649420 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10649321  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10649320 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 10649221  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649220 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 10649122  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  10649121 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 10649022  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10649021 agatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 10648941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4423267 - 4422789
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423267 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4423168  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4423167 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 4423068  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  4423067 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 4422969  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  4422968 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 4422869  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4422868 cgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 4422789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 28027638 - 28027161
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027638 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28027539  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  28027538 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatag 28027439  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28027438 ctttgaaagtagaag-aaaatagaatttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacggattca 28027341  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| | ||||| |||||| |||||| ||| |    
T  28027340 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctttt 28027241  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027240 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 28027161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18249087 - 18248608
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18249087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18248988  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18248987 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatgta 18248888  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248887 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttc-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggattc 18248789  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||     
T  18248788 acaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 18248689  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248688 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 18248608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21681049 - 21680571
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21681049 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 21680951  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  21680950 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatata 21680851  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680850 actttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 21680752  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||||    
T  21680751 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 21680652  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21680651 agatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 21680571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16422532 - 16422059
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422532 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16422433  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 211  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  16422432 caggtttgcttt-caaaatacacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 16422334  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16422333 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 16422235  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||    
T  16422234 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacattt-ccggaaactttgaattcgcaagcacagaagct 16422136  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttg-ccagatatagttacttgccttt 487  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  16422135 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccctaagggaacggtggttggcccagatatagttacttgccttt 16422059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 22381492 - 22381969
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  22381492 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtacactgtcgct 22381590  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381591 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 22381690  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22381691 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 22381789  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | |||     
T  22381790 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctt- 22381888  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381889 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 22381969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 4790544 - 4791024
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790544 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4790643  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4790644 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 4790743  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||     
T  4790744 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacggattt 4790842  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||  || | |||    
T  4790843 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 4790942  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  | | || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4790943 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggcggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 4791024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 51788371 - 51787892
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788371 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 51788272  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51788271 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatata 51788172  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788171 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 51788073  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  51788072 acaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 51787973  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  51787972 agatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 51787892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 18286266 - 18286744
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18286266 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18286364  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286365 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 18286464  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18286465 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18286562  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||  |||||| |  | |||    
T  18286563 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaagcataagagctt 18286662  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286663 ttgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 18286744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 18301567 - 18302045
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18301567 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18301665  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301666 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 18301765  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18301766 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18301863  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||  |||||| |  | |||    
T  18301864 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaagcataagagctt 18301963  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301964 ttgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 18302045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 10402497 - 10402019
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402497 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10402398  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402397 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 10402298  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  10402297 gctttgaaagtagaa-aaaaatagaatttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggattt 10402200  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||| || | |||     
T  10402199 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 10402100  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10402099 tgatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttc 10402019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 17970777 - 17971254
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970777 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacgcatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 17970876  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  17970877 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatag 17970976  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17970977 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 17971074  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| |  | ||| |    
T  17971075 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctttt 17971174  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971175 gatgaagacggtcattgacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 17971254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18231542 - 18231063
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18231542 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgactgtaccctgttgct 18231443  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231442 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 18231343  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231342 gctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 18231244  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  18231243 gcaaatcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 18231144  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231143 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 18231063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 20570757 - 20571236
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20570757 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacacttgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 20570856  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20570857 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 20570956  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20570957 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 20571055  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||     
T  20571056 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 20571155  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571156 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggtcggccagatatagttacttgccttttgtttc 20571236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 28345519 - 28345041
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345519 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28345420  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28345419 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 28345320  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28345319 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 28345222  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||| |||||||   | ||| ||||    
T  28345221 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttc 28345122  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345121 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 28345041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 48472280 - 48471797
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472280 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 48472181  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-----caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472180 caggtttgcttttcaaaatagacagaaagttttcaatttttaaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 48472081  T
Q  210 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  48472080 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccatgg 48471982  T
Q  310 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaa 409  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || ||    
T  48471981 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggaa 48471882  T
Q  410 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471881 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 48471797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 22864759 - 22865236
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864759 cacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 22864858  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22864859 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacag 22864958  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaa-aatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||     
T  22864959 ctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggattt 22865055  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| |||||| |  | |||     
T  22865056 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 22865155  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865156 tgatgaagacggtcattaacagctgccgatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 22865236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 22879818 - 22880295
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879818 cacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 22879917  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22879918 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacag 22880017  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaa-aatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||     
T  22880018 ctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggattt 22880114  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| |||||| |  | |||     
T  22880115 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 22880214  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880215 tgatgaagacggtcattaacagctgccgatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 22880295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 17978861 - 17979343
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17978861 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatatttcctttgaatgtaccctgttgct 17978960  T
Q  115 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17978961 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 17979060  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17979061 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 17979159  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac-t 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || | ||||| |||||| |||||| | |    
T  17979160 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 17979259  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc--aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979260 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 17979343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 6536654 - 6537133
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6536654 cacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgct 6536753  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536754 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 6536853  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  6536854 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 6536952  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| |||||| |  | |||     
T  6536953 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 6537052  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6537053 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 6537133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20072384 - 20071905
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072384 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20072285  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20072284 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 20072185  T
Q  211 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  20072184 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacgga 20072087  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||  ||    |    
T  20072086 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgc 20071989  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20071988 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 20071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 18 - 493
Target Start/End: Original strand, 5590275 - 5590751
Alignment:
Q  18 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 117  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590275 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacctattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 5590374  T
Q  118 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5590375 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagct 5590474  T
Q  217 ttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 316  Q
    ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  5590475 ttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 5590573  T
Q  317 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctga 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||   |||| | |||||||||||| |||||| |||  ||    
T  5590574 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctttaga 5590673  T
Q  417 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590674 tgaagatagtcatcaacggcggcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 5590751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 5020061 - 5019583
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5020061 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5019962  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5019961 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 5019862  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5019861 gctttgaaagtagaag-aaagtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattt 5019764  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  5019763 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 5019664  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5019663 agatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 5019583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 11104272 - 11104752
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104272 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11104371  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata--t 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||  |    
T  11104372 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatattt 11104471  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  11104472 agctttgaaagtaaaaagaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacggatt 11104570  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | |||| || |||||  || | |||    
T  11104571 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaactcgcaagcgtaggagctt 11104670  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
      ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104671 tagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 11104752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 31030156 - 31030628
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31030156 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatcttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 31030254  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030255 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 31030349  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  31030350 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 31030448  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||  || | ||| |    
T  31030449 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttt 31030548  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030549 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 31030628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18057612 - 18057131
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057612 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18057513  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 211  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  18057512 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 18057413  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18057412 taactttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18057314  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | |    
T  18057313 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 18057214  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgttt 492  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18057213 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgttt 18057131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 7079576 - 7079094
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079576 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 7079477  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttc-aattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa-aatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7079476 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttttaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagaatagaaagaaaatgttttgtatat 7079377  T
Q  213 a----gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 308  Q
    |    |||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7079376 atatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 7079278  T
Q  309 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||  ||       
T  7079277 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattc 7079180  T
Q  409 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079179 gcttttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 7079094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 6208245 - 6207770
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6208245 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6208147  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6208146 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcctttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 6208053  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6208052 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 6207953  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||  |||||  || | ||    
T  6207952 tacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagct 6207853  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207852 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 6207770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18336968 - 18336498
Alignment:
Q  18 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 117  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18336968 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcag 18336870  T
Q  118 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 217  Q
    |||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336869 gtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcataatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 18336775  T
Q  218 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18336774 tgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 18336676  T
Q  318 agcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctga 416  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||| | || | ||| |||    
T  18336675 agcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagtataggagcttttga 18336576  T
Q  417 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18336575 tgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttc 18336498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 19700847 - 19700357
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19700847 cacagactatcctggggaagaatctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19700748  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----- 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         
T  19700747 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttttt 19700649  T
Q  207 ------gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatg 300  Q
          ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19700648 ttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtg 19700550  T
Q  301 actccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaa 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| |||    
T  19700549 actccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcactacatttcctagaaactttgaattcgcaa 19700450  T
Q  401 gcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     || || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19700449 acataggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagacgccccaagggaacggtggttggcctgatatagttacttgccttttgtttc 19700357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 32445494 - 32445024
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32445494 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 32445396  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  32445395 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaacagaaagaaaatgttttgtatataa 32445303  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  32445302 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 32445204  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| | |||| |  | ||| |    
T  32445203 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcgagcataagagctttt 32445104  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445103 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 32445024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4727976 - 4727503
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4727976 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4727878  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4727877 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 4727784  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4727783 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4727685  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||  |||||  || | |||    
T  4727684 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagctt 4727585  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727584 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 4727503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 15735011 - 15735485
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15735011 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 15735109  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||| |    
T  15735110 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaagggaaatgtttttgtaca 15735204  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15735205 taactttgaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15735302  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||   |   ||    
T  15735303 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgttggggct 15735402  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15735403 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttc 15735485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 35887109 - 35886634
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |     
T  35887109 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgtatgtt-cgtttgaatgtaccctgttaca 35887011  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  35887010 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 35886917  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35886916 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 35886818  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||  |||||  || | |    
T  35886817 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagc 35886718  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35886717 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 35886634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4689994 - 4689521
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4689994 cacagactatcctggaggagaatctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 4689896  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  4689895 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 4689803  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4689802 taacttagaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 4689705  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | |    
T  4689704 ttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacgcagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 4689605  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4689604 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggatggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttc 4689521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 5658480 - 5658005
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5658480 cacagactatccttgaggagaacctgcttgtaacatgcgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 5658382  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
     |||||||||||||||||      |||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  5658381 taggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 5658288  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat--gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 309  Q
    || | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5658287 taacgttgaaagtaaaaggaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaaatgatatgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccacgg 5658189  T
Q  310 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaa 409  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| |  |     
T  5658188 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagag 5658089  T
Q  410 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5658088 cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccccagggaacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttc 5658005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 8283369 - 8283859
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8283369 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 8283468  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg- 202  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||          |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  8283469 caggtttgctttccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgt 8283568  T
Q  203 ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgac 302  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||   ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8283569 ttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaaacacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 8283667  T
Q  303 tccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  8283668 tccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 8283767  T
Q  403 acagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
      || | |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283768 gtaggagctttcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 8283859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 293 - 485
Target Start/End: Original strand, 15886894 - 15887089
Alignment:
Q  293 aaggcatgactccacggattc-acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattct 390  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | |    
T  15886894 aaggcgtgactccacggattttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaacttt 15886993  T
Q  391 gaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcct 485  Q
    |||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  15886994 gaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcct 15887089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 264
Target Start/End: Original strand, 15886652 - 15886895
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15886652 cacagactatccgggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatg-ttcgtttgaatgtaccctgttgct 15886750  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaat-gttttgtata 211  Q
    ||||||||||||||||       ||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |  ||||||| |    
T  15886751 caggtttgcttttcaa-------aaaactttttcaattttcaagatgtttgcttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaagtatttttgtaca 15886843  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 264  Q
    || ||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  15886844 taactttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaaacacaggctcaa 15886895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 317 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 8002607 - 8002430
Alignment:
Q  317 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctga 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||  ||    
T  8002607 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttaga 8002508  T
Q  417 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8002507 tgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 8002430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 3047 - 3528
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3047 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 3146  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3147 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatag 3246  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3247 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 3346  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3347 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaactt 3446  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3447 ctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 3528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18194 - 17949
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 18095  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18094 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatag 17995  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 258  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17994 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaag 17949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 3795932 - 3795452
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795932 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3795833  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795832 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 3795733  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795732 ctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 3795633  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||     
T  3795632 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaggcttt 3795533  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795532 agatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 3795452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 33881519 - 33881045
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881519 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33881420  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881419 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 33881320  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881319 ctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 33881220  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||   || | ||| |    
T  33881219 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagctttt 33881120  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttg 489  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33881119 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttg 33881045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 18369300 - 18369779
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369300 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18369399  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369400 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 18369499  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18369500 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcgaaggttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattca 18369599  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||   || |  || |    
T  18369600 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagttttt 18369699  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369700 gatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacagtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 18369779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 30174859 - 30174379
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174859 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 30174760  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174759 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 30174660  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174659 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 30174560  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  30174559 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 30174460  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30174459 agatgaagataggcattaacagccgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttc 30174379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 11555742 - 11555268
Alignment:
Q  19 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 118  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555742 gactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 11555643  T
Q  119 tttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagcttt 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555642 tttgcttttcaaaatagacaagaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagcttt 11555543  T
Q  219 gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11555542 gaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaa 11555444  T
Q  319 gcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatg 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||  |||||  || | ||| |||||    
T  11555443 gcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatg 11555344  T
Q  419 aagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555343 aagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 11555268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22894808 - 22894331
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22894808 cacagactatcctggggaagagtctgcttgtaacacatatcgaaatagacatcaacatacactcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 22894709  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22894708 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaccttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatggtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtacata 22894610  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  22894609 gctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 22894511  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22894510 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttc 22894411  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894410 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtagttggccagatatagttacttgccttttgtttc 22894331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 33298930 - 33298447
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33298930 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgct 33298831  T
Q  115 caggtttgcttttc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33298830 caggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 33298731  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298730 tagctttgaaagtagaaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 33298631  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |    
T  33298630 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 33298531  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298530 ttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 33298447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 37352412 - 37352891
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37352412 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 37352511  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  37352512 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 37352611  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37352612 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 37352710  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||| ||||||  ||||| |||     
T  37352711 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttt 37352810  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352811 tgatgaagacagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 37352891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 37746090 - 37746574
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacat----atactc--gctcatgcatgtttcatttgaatgtaccct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37746090 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacattaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccct 37746189  T
Q  109 gttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746190 gttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 37746289  T
Q  209 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 308  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37746290 atatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 37746389  T
Q  309 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| |||||| |  |    
T  37746390 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataaga 37746489  T
Q  409 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746490 gcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 37746574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 28953548 - 28954027
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28953548 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28953646  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28953647 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattcccaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 28953746  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953747 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 28953845  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  28953846 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 28953945  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28953946 cagatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgtttc 28954027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 37761376 - 37760896
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37761376 cacagtctatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtgccctgttgct 37761277  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761276 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 37761177  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37761176 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatt 37761078  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||| || | |||    
T  37761077 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctt 37760978  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37760977 ttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 37760896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 32590044 - 32590522
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590044 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 32590143  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32590144 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgatttgtatata 32590243  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  32590244 gctttgaaagtagaagaaag-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaattc 32590341  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||| |||||| |||||| |||     
T  32590342 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttt 32590441  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590442 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 32590522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 6880697 - 6880217
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880697 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacacattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 6880598  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6880597 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatata 6880498  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6880497 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 6880399  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||| ||||||  ||    
T  6880398 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagatt 6880299  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880298 cagatgaagatggtcattaacagttgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 6880217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 41681098 - 41680618
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41681098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 41681000  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41680999 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 41680900  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41680899 agctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaagggcacgactccacggatt 41680800  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | |||    
T  41680799 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 41680700  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680699 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 41680618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 484
Target Start/End: Original strand, 8659240 - 8659709
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8659240 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 8659339  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8659340 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 8659439  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8659440 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaaacaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 8659538  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||  | |||     
T  8659539 acaaagcttggcgaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttccc-gaaactttgaattcacaagtacaagagcttt 8659637  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcc 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  8659638 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcc 8659709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 18494536 - 18495014
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494536 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18494635  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||    
T  18494636 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaagtaaattgtatatag 18494735  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18494736 ctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattca 18494834  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |  |||||| | |||| || | ||| |    
T  18494835 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaacttcgaattcgccagcataggagctttt 18494934  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494935 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 18495014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 28655636 - 28655156
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655636 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28655537  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28655536 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttgtata 28655437  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28655436 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggat 28655339  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||| || | ||    
T  28655338 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagct 28655239  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655238 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtagttggccagatatagttacttgccttttgtttc 28655156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 37665254 - 37665733
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37665254 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 37665352  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37665353 caggtttgctttttaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 37665452  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37665453 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 37665551  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| |||||| |  | |||    
T  37665552 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaattttgaattcgcaagcataagagctt 37665651  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665652 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 37665733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 30158427 - 30157947
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30158427 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 30158328  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30158327 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 30158228  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30158227 gctttgaaagtagaagaaaggtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 30158129  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac-tt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| | ||||| ||| || ||| || | ||    
T  30158128 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacgagtacataagcttt 30158029  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30158028 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcctcaaggggaacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttc 30157947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 9323869 - 9323391
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9323869 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 9323770  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9323769 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 9323670  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9323669 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 9323572  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  9323571 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttc 9323472  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9323471 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttc 9323391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 43084651 - 43084172
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084651 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 43084552  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43084551 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaactttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 43084452  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084451 actttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 43084353  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | |||| || | |||     
T  43084352 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccgaaaactttgaattcgccagcataggagcttt 43084253  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||   | || || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  43084252 tgatgaagataatcattaacagcagcagatgcccccaggggggcggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 43084172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 18 - 493
Target Start/End: Original strand, 9544478 - 9544955
Alignment:
Q  18 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 117  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544478 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 9544577  T
Q  118 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9544578 gtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 9544677  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  9544678 gctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 9544775  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| | ||||||| |||||| |  | |||     
T  9544776 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacattt-cctgaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 9544874  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544875 tgatgaaaatggtcattaacagctgtagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 9544955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 13318596 - 13319074
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318596 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13318695  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318696 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 13318795  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  13318796 ctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 13318894  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| |||||  |  | ||| |    
T  13318895 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcataacatttcccagaaactttgaattcgcaagcgtatgagctttt 13318994  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318995 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 13319074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 23632364 - 23631883
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632364 cacagactatcctggaggagaaccggcttataacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 23632265  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 211  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632264 caagtttgcttttcaaaaatagacaaaaagctttttcaattttcaagatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 23632165  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23632164 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 23632066  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||||||  |||||  || | ||    
T  23632065 tcacgaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagct 23631966  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23631965 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 23631883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24730363 - 24729884
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24730363 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 24730264  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24730263 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatat 24730164  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24730163 agctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 24730066  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||   || | |||    
T  24730065 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagctt 24729966  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729965 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 24729884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 489
Target Start/End: Original strand, 15752626 - 15753094
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752626 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15752725  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  15752726 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatcaa----gaaagaaaatgttttgtatatag 15752821  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15752822 ctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattca 15752919  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | ||| |    
T  15752920 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctttt 15753019  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttg 489  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15753020 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttg 15753094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12138568 - 12138090
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12138568 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12138469  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12138468 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 12138369  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12138368 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 12138271  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  12138270 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttc 12138171  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12138170 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgtcttttgtttc 12138090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 13180561 - 13181036
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180561 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13180660  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180661 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 13180755  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  13180756 ctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 13180855  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  |  | |||     
T  13180856 caaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtatgagcttt 13180955  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13180956 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttc 13181036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 40467321 - 40467800
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467321 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40467420  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40467421 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatata 40467520  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  40467521 gctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 40467619  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  40467620 ataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 40467719  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467720 agatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 40467800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 33522776 - 33522293
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33522776 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 33522677  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33522676 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 33522577  T
Q  214 gctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    |||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33522576 gctttgaaagtaaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 33522478  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac-t 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || | ||||| |||||| |||||| | |    
T  33522477 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 33522378  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522377 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 33522293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 38 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 30035795 - 30035345
Alignment:
Q  38 ctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagac 137  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30035795 ctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaac 30035696  T
Q  138 aaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaata 236  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30035695 aaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-ta 30035597  T
Q  237 gagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatt 336  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30035596 gaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatt 30035498  T
Q  337 ttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagc 436  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30035497 ttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagc 30035398  T
Q  437 tgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttg 489  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30035397 tgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttg 30035345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 11330032 - 11329551
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11329933  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat- 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||     
T  11329932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatt 11329833  T
Q  213 -agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11329832 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 11329734  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||   || | ||    
T  11329733 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagct 11329634  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11329633 tttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 11329551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 31820178 - 31820655
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31820178 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccttgttgct 31820277  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31820278 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 31820377  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31820378 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 31820475  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| |    
T  31820476 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctttt 31820575  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820576 gatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 31820655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 13436442 - 13436928
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436442 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaatatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13436541  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaag-aaaatgttttgta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13436542 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcgttgccattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgta 13436641  T
Q  210 tatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13436642 tatagctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 13436740  T
Q  309 gattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacaga 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||| ||     
T  13436741 gattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcatagg 13436840  T
Q  408 aacttctga-tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436841 agcttttgattgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 13436928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 2517459 - 2516979
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2517459 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacacgttgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 2517360  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517359 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 2517260  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2517259 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatct-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccacggat 2517162  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  2517161 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 2517062  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2517061 tttgatgaagataggcattgacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttc 2516979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 34622912 - 34622432
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622912 cacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34622813  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622812 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 34622713  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  34622712 gctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattc 34622614  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||  || | |||    
T  34622613 acaaaacttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 34622514  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622513 tagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 34622432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26486778 - 26486310
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26486778 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 26486679  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26486678 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 26486579  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||           |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26486578 ctttgaaa-----------atagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26486491  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  26486490 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttc 26486391  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26486390 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttc 26486310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 18122184 - 18122663
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18122184 cacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18122282  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  18122283 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttctcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatata 18122382  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18122383 gctttgaaagtagaaaaaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18122481  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||| |  | |||    
T  18122482 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctt 18122581  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122582 ttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 18122663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 31437847 - 31437378
Alignment:
Q  18 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 117  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31437847 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 31437748  T
Q  118 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 217  Q
    |||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437747 gtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 31437654  T
Q  218 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 317  Q
    |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  31437653 tgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 31437555  T
Q  318 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||| |  | ||| ||||    
T  31437554 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgat 31437455  T
Q  418 gaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437454 gaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 31437378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 22 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 25206670 - 25206198
Alignment:
Q  22 tatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttt 121  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25206670 tatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggttt 25206571  T
Q  122 gcttttcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatata 213  Q
    ||||| |||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25206570 gcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacata 25206472  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  25206471 gctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 25206373  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||| ||| || || | |||    
T  25206372 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagctt 25206273  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25206272 ctgatgaagatggtcattaacagctgtagatgccccaacgggatggtggttggccagatatagttacttgccttt 25206198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 22 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 25270826 - 25270354
Alignment:
Q  22 tatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttt 121  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25270826 tatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggttt 25270727  T
Q  122 gcttttcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatata 213  Q
    ||||| |||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25270726 gcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacata 25270628  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  25270627 gctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 25270529  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||| ||| || || | |||    
T  25270528 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagctt 25270429  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25270428 ctgatgaagatggtcattaacagctgtagatgccccaacgggatggtggttggccagatatagttacttgccttt 25270354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 5644191 - 5643716
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5644191 cacagattatcttggaggagaacctgcttttaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 5644093  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5644092 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcgattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 5643993  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5643992 gctttgaaagtaaaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 5643895  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | || | ||||||| ||||  ||    |||     
T  5643894 acaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaag--cattcgcttt 5643797  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643796 tgatgaaaatgggcattaacagctgcagatgccccaaggggaacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 5643716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 22992892 - 22993363
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22992892 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 22992990  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22992991 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgcttgtttcgagcatcatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 22993084  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  22993085 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 22993183  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||| | ||||||| |||||| || | ||| |    
T  22993184 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcgatacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagctttt 22993283  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993284 gatgaggatagtcattaacagctgcagatgccccaagggtgacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 22993363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 15652528 - 15653005
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15652528 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 15652626  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||    | | | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652627 caggtttgcttttttttaaaaaaaaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 15652726  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  15652727 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 15652825  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | ||| |    
T  15652826 caaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctttt 15652925  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652926 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccgagggagacggtggtcggccagatatagttacttgccttttgtttc 15653005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 23898261 - 23897789
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23898261 cacagactatcctggagaagaatctgcttgcaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 23898162  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----gta 209  Q
    ||||||||||||          |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    |||    
T  23898161 caggtttgcttt----------caaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttttttgta 23898072  T
Q  210 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 309  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |     
T  23898071 catagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatga 23897973  T
Q  310 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaa 409  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | |||||||  ||||| || |     
T  23897972 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcggaagcataggag 23897873  T
Q  410 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23897872 cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 23897789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 33783875 - 33783401
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33783875 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 33783777  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa--tagaaagaaaatgtttt-gtat 210  Q
    | ||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||     
T  33783776 ccggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 33783684  T
Q  211 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33783683 ataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 33783585  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | |    
T  33783584 tttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagc 33783485  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33783484 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttc 33783401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24608634 - 24608160
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24608634 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacacttgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 24608535  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 211  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  24608534 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 24608442  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||   ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24608441 taactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaagcacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24608343  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | |    
T  24608342 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagc 24608243  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24608242 ttttgatgaagatggtcattagtagctgcagacgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 24608160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 30941023 - 30940550
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30941023 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cttttgaatgtaccctgttgct 30940925  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 211  Q
    ||||||||||||||||||        |  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  30940924 caggtttgcttttcaaaa--------actttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 30940833  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||  |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30940832 taactttgaaagtaaaaagaaagcaga-atttcaaacaaaagcacaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 30940734  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | |    
T  30940733 ttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 30940634  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940633 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 30940550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24976236 - 24975771
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24976236 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcgtttgaatgtaccctgttgct 24976137  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||        |  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  24976136 caggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 24976045  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24976044 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24975946  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||| | ||||||| | |||| || | ||    
T  24975945 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcgagcataggagct 24975846  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcct 485  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  24975845 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcct 24975771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12421 - 11945
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12421 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12322  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12321 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttatatatag 12222  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12221 ctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 12123  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||    ||| |    
T  12122 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaag--cattcgctttt 12025  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 11945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 28355780 - 28356262
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355780 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28355879  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355880 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 28355979  T
Q  215 ctttgaaagtagaag--aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355980 ctttgaaagtagaagaaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 28356079  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||| ||||||  |    
T  28356080 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagat 28356179  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356180 tcagatgaagatggtcattaacagttgtagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 28356262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 9361007 - 9360529
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361007 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9360908  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360907 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 9360808  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360807 ctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 9360709  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||| |  | ||| |    
T  9360708 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctttt 9360609  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360608 gatgaaaatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 9360529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 31360914 - 31360435
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360914 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31360815  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31360814 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 31360715  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360714 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 31360616  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  31360615 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 31360516  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360515 agatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 31360435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 29835708 - 29835230
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835708 cacagattatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29835609  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29835608 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 29835509  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  29835508 ctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 29835410  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||  ||||     
T  29835409 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaggcttca 29835310  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835309 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 29835230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 19680833 - 19680355
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680833 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 19680734  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19680733 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 19680634  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19680633 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 19680536  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||| |||||| ||||    
T  19680535 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 19680436  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19680435 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttttgtttc 19680355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 33248751 - 33248273
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248751 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33248652  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248651 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 33248552  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33248551 ctttgaaagtagaagaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 33248453  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | ||| |    
T  33248452 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttt 33248353  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  33248352 gatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggagacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 33248273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 31483700 - 31484181
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31483700 cacagactatcctggaggagaacctgctcgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccttgttgct 31483799  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483800 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 31483899  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31483900 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31483999  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||| |||||||     ||| |||    
T  31484000 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgtggaagctt 31484099  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31484100 cagatgaagatggtcatcaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 31484181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18797093 - 18796613
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797093 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18796994  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18796993 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 18796894  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  18796893 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 18796795  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||| || | |||    
T  18796794 ataaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagctt 18796695  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18796694 ttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccctaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 18796613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 44567369 - 44566888
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567369 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 44567270  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44567269 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 44567170  T
Q  211 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44567169 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 44567072  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc-cggaaattctgaattcacaagcacagaaa 409  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| | ||||||| |||||  || |     
T  44567071 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaaactttgaattcgcaagcgtaggag 44566972  T
Q  410 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44566971 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 44566888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 12086553 - 12087033
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12086553 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 12086652  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12086653 caggcttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 12086752  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12086753 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 12086851  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  12086852 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 12086951  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086952 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 12087033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15773960 - 15773481
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773960 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15773861  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15773860 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatata 15773761  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||| |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  15773760 gctctgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 15773662  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  15773661 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 15773562  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773561 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggaacgatggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 15773481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 21342000 - 21342480
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342000 cacagactattctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21342099  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21342100 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgcttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 21342199  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  21342200 gctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacagaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 21342298  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||  |||||| || | |||    
T  21342299 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagctt 21342398  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21342399 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagtcacttgccttttgtttc 21342480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18715868 - 18715389
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715868 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagtcatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18715769  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt----caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18715768 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 18715669  T
Q  211 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18715668 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 18715571  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||  ||    |    
T  18715570 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgc 18715473  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715472 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 18715389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 19910992 - 19911473
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19910992 cacagactatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 19911091  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 211  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  19911092 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 19911191  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19911192 tagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 19911290  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| | ||||||  |||||  || | ||    
T  19911291 ttacaaagcttggaaaaaggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatctcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagct 19911390  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911391 tttgatgaagatcgtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 19911473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 52 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 33265079 - 33264638
Alignment:
Q  52 tattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaat 151  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33265079 tattgaaatagacattgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaat 33264980  T
Q  152 tttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaa 250  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  33264979 tttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaa 33264882  T
Q  251 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 350  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264881 aagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 33264782  T
Q  351 tacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 450  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||  | || | ||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33264781 tacattgaacacagtaatcatggcatttcctaggaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaa 33264682  T
Q  451 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33264681 gggggacggtggttggccagatatagttacttgctttttgtttc 33264638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 19202205 - 19202673
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19202205 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19202304  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19202305 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 19202404  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||           |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19202405 ctttgaaa-----------atagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 19202492  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaa-attctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || | | |||||||||||| |||||||||||    
T  19202493 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaagactttgaattcacaagtacagaaacttc 19202592  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19202593 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttgtgtttc 19202673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 27602744 - 27603215
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  27602744 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgca 27602842  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||        || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  27602843 caggtttgcttttcaaaa--------aacttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 27602934  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602935 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtctaagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27603033  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  27603034 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 27603133  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603134 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaagggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 27603215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 472
Target Start/End: Original strand, 22074759 - 22075216
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22074759 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 22074858  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtata 211  Q
    || | ||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |    
T  22074859 catgcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttattttcaagaagtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtaca 22074957  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22074958 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcctaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22075056  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||| ||| |||| || ||    
T  22075057 ttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggcaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacacaaaagct 22075156  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagata 472  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22075157 tctgatg-agatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagata 22075216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 143 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16260480 - 16260130
Alignment:
Q  143 gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16260480 gttttcgattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt 16260382  T
Q  243 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260381 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattg 16260282  T
Q  343 gttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcaga 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| | ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260281 gttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcaga 16260182  T
Q  443 tgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||| ||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16260181 tgccctaagggagacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttc 16260130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 493
Target Start/End: Original strand, 19655180 - 19655653
Alignment:
Q  18 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19655180 agactatcctggggaagagtctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgttttgtttgaatgtaccctgttgctcag 19655279  T
Q  118 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatag 214  Q
    ||||||||| |||||      |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||     
T  19655280 gtttgcttt-caaaa------aaaacttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataa 19655372  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |    
T  19655373 ctttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacggattta 19655471  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaa--ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | |||    
T  19655472 caaagcttggaaaatggtaattttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctt 19655571  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655572 ttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 19655653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22139286 - 22138814
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22139286 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtttcatttcaatgtaccctgttgct 22139187  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    || ||||||||| |||||        |  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  22139186 caagtttgcttt-caaaa--------actttttcaattttcaagacgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 22139096  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22139095 taactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22138997  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | |    
T  22138996 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagc 22138897  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22138896 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttc 22138814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 2131098 - 2131571
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2131098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 2131196  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    |||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  2131197 caggtttgcttttcaaag-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 2131289  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  2131290 taactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggat 2131388  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | ||    
T  2131389 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 2131488  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2131489 tttgatgaagaaggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 2131571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 19694477 - 19694002
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19694477 cacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 19694379  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  19694378 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 19694285  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19694284 taactttgaaagtaaaaagaaagcggagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 19694186  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | |    
T  19694185 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 19694086  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19694085 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 19694002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 14569540 - 14569064
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14569540 cacagaatatcctggaggagaacctgcttgtaacatgtattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 14569442  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtat-- 210  Q
    ||||||||  ||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |      
T  14569441 caggtttgtctttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttttttg 14569349  T
Q  211 ---atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 307  Q
       ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14569348 aacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 14569250  T
Q  308 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacaga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||  ||| | ||||||| | | || ||     
T  14569249 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatt-cccaaaaactttgaattcgccatcatagg 14569151  T
Q  408 aacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569150 agcttttgatgaagatagtcgttaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 14569064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 39857032 - 39856555
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39856933  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 39856833  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856832 ctttgaaagtagaagaaaaa-agagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 39856735  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||||     
T  39856734 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttca 39856635  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39856634 gatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaagggggacggtggttggccagatacagttacttgccttttgtttc 39856555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 20332290 - 20332770
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332290 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20332389  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20332390 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatag 20332489  T
Q  215 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332490 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 20332589  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  20332590 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 20332689  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332690 agatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 20332770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 40099504 - 40099984
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099504 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40099603  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099604 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 40099703  T
Q  215 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099704 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 40099803  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  40099804 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 40099903  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  40099904 agatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttc 40099984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 24586229 - 24586709
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24586229 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctattgct 24586328  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586329 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtccttatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 24586428  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586429 ctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 24586528  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  24586529 caaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 24586628  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586629 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 24586709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 14104939 - 14104466
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104939 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 14104840  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104839 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 14104740  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14104739 ctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattca 14104641  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||   || | ||| |    
T  14104640 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagctttt 14104541  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttg 489  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14104540 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttg 14104466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 488
Target Start/End: Original strand, 27157180 - 27157657
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27157279  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27157280 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 27157379  T
Q  214 gctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157380 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27157479  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||    
T  27157480 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 27157579  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg--attgtgatttgccagatatagttacttgcctttt 488  Q
     |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||     ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27157580 ttgatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacgggtggttggccagatatagttacttgcctttt 27157657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 18794485 - 18794964
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794485 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 18794584  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18794585 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 18794684  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794685 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 18794783  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    |||| | |||||||||||| |||||| |||     
T  18794784 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagtttttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 18794883  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794884 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 18794964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 54839787 - 54839310
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839787 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 54839688  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54839687 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 54839588  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  54839587 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt-caagcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 54839490  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | |||     
T  54839489 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 54839390  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839389 tgatgaagatggtcattaacaactgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 54839310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 30760159 - 30759682
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30760159 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgct 30760060  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30760059 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 30759960  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30759959 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 30759862  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||   || | ||| |    
T  30759861 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagctttt 30759762  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759761 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 30759682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 14753362 - 14753840
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14753362 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 14753460  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753461 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 14753560  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14753561 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 14753658  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| |||||| |  | |||    
T  14753659 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagctt 14753758  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753759 ttgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 14753840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 5700937 - 5700458
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700937 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5700838  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700837 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5700738  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5700737 gctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 5700640  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||| |||||| |  | |||    
T  5700639 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcataagagctt 5700540  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagg-ggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700539 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggaggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 5700458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 33667671 - 33668148
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33667671 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgct 33667770  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33667771 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 33667870  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33667871 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 33667968  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||   || | ||| |    
T  33667969 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagctttt 33668068  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33668069 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttccttgccttttgtttc 33668148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 1906654 - 1906171
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1906654 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1906555  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgttt----tg 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  1906554 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcttttg 1906456  T
Q  208 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 307  Q
    || || |||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1906455 tacatggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 1906357  T
Q  308 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacaga 407  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||      
T  1906356 agatatacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacatg 1906257  T
Q  408 aacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906256 agcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatatagttacttgccttttgtttc 1906171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 34182832 - 34183309
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34182832 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 34182930  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34182931 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 34183029  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  34183030 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 34183128  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| |||||| |  | |||     
T  34183129 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 34183228  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183229 tgatggagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 34183309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 5012275 - 5011795
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5012275 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtgccctgttgct 5012176  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  5012175 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatccaagtagaaagaaaatgatttgtatata 5012076  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5012075 gctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 5011977  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  5011976 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 5011877  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5011876 cagatgaaaatggtcattaacagctgcagatgcctcaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 5011795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 18 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21976098 - 21975619
Alignment:
Q  18 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 117  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21976098 agactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgg 21975999  T
Q  118 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21975998 gtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagct 21975899  T
Q  217 ttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 316  Q
    ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21975898 ttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcgcagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcaca 21975800  T
Q  317 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac-ttctg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || | ||||| |||||| |||||| | || ||    
T  21975799 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttg 21975700  T
Q  416 atgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975699 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 21975619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15234217 - 15233735
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15234217 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgcc 15234118  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  15234117 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaaactttttcaagtttcaagatgtttgcttcaagcattgtcattatcaagataaaaagaaatttttttgt 15234019  T
Q  209 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 308  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||    
T  15234018 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactctacg 15233920  T
Q  309 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||   ||| | ||||||| |||||||| ||    
T  15233919 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacatagtaaccactacatttcctataaactttgaattcgcaagcacaaaa 15233820  T
Q  409 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233819 gcttatgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 15233735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 31120378 - 31120861
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31120378 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 31120477  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 212  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31120478 cgggtttgcttttcaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 31120577  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31120578 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 31120676  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac-t 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |  |||| |||||| |||||| | |    
T  31120677 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaacttcgaatccacaagtacagaagctt 31120776  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120777 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagataccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 31120861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 36338394 - 36338865
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36338394 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 36338492  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338493 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 36338586  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36338587 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 36338685  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||| |  | ||| |    
T  36338686 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggcggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctttt 36338785  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338786 gatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 36338865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 6576251 - 6575780
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6576251 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6576153  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||       |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576152 caggtttgcttttcaaag------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 6576059  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  6576058 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 6575960  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||  |||||| || | ||| |    
T  6575959 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagctttt 6575860  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575859 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 6575780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 476
Target Start/End: Original strand, 15380106 - 15380567
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  15380106 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaaaagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 15380205  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatat 212  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  15380206 caggcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttaatttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacat 15380304  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15380305 agctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 15380403  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| | ||||||| |||||||| || |||    
T  15380404 tacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacgataaccactacatttccttgaaactttgaattcgcaagcacaaaagctt 15380503  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagt 476  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15380504 cggatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatatagt 15380567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 472
Target Start/End: Original strand, 15276497 - 15276957
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  15276497 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 15276596  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 209  Q
    || |||| |||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  15276597 caagtttacttt-caaaacagacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgta 15276695  T
Q  210 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 309  Q
     |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15276696 catagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 15276794  T
Q  310 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaa 409  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||||| |||||||||||     
T  15276795 atttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaag 15276894  T
Q  410 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagata 472  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15276895 cttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagata 15276957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24119055 - 24118580
Alignment:
Q  19 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 118  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24119055 gactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccagcacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctccgg 24118957  T
Q  119 tttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118956 tttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 24118857  T
Q  218 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 317  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  24118856 tgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 24118758  T
Q  318 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| |||||| |  | ||| ||||    
T  24118757 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgat 24118658  T
Q  418 gaagacggtca-ttaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccaga-tatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  24118657 gaggacggtcatttaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccatattatagttacttgcctttcgtttc 24118580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 17019445 - 17018970
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17019445 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 17019347  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 212  Q
    ||||||||||||||||||      |||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  17019346 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattctcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacat 17019253  T
Q  213 agcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||| ||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17019252 agcttttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcataggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 17019154  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | |    
T  17019153 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 17019054  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17019053 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 17018970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 14671410 - 14670934
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14671410 cacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 14671311  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtt-ttgtata 211  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| |    
T  14671310 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttcttgtaca 14671217  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  14671216 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggat 14671118  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||  || | |    
T  14671117 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagcgtaggagc 14671018  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671017 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 14670934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 1674258 - 1673892
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1674258 cacagactatcctagggaagaacctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1674161  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 209  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  1674160 caagtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttttgta 1674062  T
Q  210 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 309  Q
     || |||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  1674061 catggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccacgg 1673963  T
Q  310 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 380  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1673962 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagtaaccactacatttcc 1673892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Original strand, 36324185 - 36324484
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36324185 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 36324283  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324284 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 36324377  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36324378 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 36324476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 493
Target Start/End: Original strand, 18311421 - 18311526
Alignment:
Q  390 tgaattcacaagcacagaaacttct-gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 487  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  18311421 tgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacagtggttggccagatatagttacttgcctct 18311520  T
Q  488 tgtttc 493  Q
    ||||||    
T  18311521 tgtttc 18311526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27810087 - 27809606
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27810087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaacctgttgct 27809988  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809987 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 27809888  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809887 ctttgaaagtagaagaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27809788  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| |  | |||    
T  27809787 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctt 27809688  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809687 ttgatgaagatggtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 27809606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12593198 - 12592715
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593198 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12593099  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12593098 caggtttgctttccaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 12592999  T
Q  211 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592998 atagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 12592899  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| |  | |    
T  12592898 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagc 12592799  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592798 ttttgatgaagatggtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 12592715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 37945723 - 37946203
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945723 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactcttactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37945822  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945823 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 37945922  T
Q  215 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945923 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 37946022  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  37946023 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 37946122  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946123 agatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 37946203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12661922 - 12661444
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661922 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12661823  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661822 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 12661723  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12661722 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 12661624  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||  |||||  || | ||| |    
T  12661623 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagctttt 12661524  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661523 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 12661444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 3788877 - 3788399
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788877 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3788778  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788777 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 3788678  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3788677 ctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggattta 3788579  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||| || | ||| |    
T  3788578 taaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctttt 3788479  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788478 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 3788399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 22922001 - 22922482
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22922001 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 22922100  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922101 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 22922200  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22922201 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 22922300  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||| |||||||   | ||| |||    
T  22922301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagctt 22922400  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22922401 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttctgtttc 22922482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 254510 - 254989
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254510 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 254609  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254610 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 254708  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254709 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 254808  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  254809 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 254908  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  |||||  || || ||||||||||||||||| |  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  254909 agatgaagatagtcatcgacggcagcagatgccccaagggggacggtggctggccagatatagttacttgccttttgtttc 254989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 19410342 - 19410824
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19410342 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtatcctgttgct 19410441  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19410442 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatag 19410541  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19410542 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 19410641  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||| |||||||   | ||| |||    
T  19410642 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagctt 19410741  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa--ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410742 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 19410824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 39896452 - 39895973
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896452 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39896353  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896352 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 39896253  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  39896252 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattca 39896154  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| | ||||||| |||| |||||| ||||    
T  39896153 caaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttccccaaaaactttgaattctcaagtacagaagcttc 39896054  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39896053 agatgacgatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgcctcttgtttc 39895973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 37384061 - 37383582
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37384061 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 37383962  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383961 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 37383862  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  37383861 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattca 37383763  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||| || | |||     
T  37383762 caaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 37383663  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37383662 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttc 37383582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 40239892 - 40239414
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40239892 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 40239794  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  40239793 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatata 40239694  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239693 actttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 40239595  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||||    
T  40239594 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 40239495  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239494 agatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 40239414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 13930402 - 13930883
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930402 cacagactatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13930501  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13930502 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 13930601  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13930602 agctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggatt 13930701  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||    
T  13930702 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 13930801  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930802 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 13930883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16167862 - 16167383
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167862 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16167763  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16167762 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 16167663  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167662 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 16167564  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  16167563 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 16167464  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
      |||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16167463 atatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 16167383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 12710459 - 12710938
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12710459 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 12710558  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710559 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 12710658  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710659 agctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 12710756  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  12710757 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 12710856  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12710857 cagatgaagacggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgtttc 12710938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27782616 - 27782137
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27782616 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 27782517  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27782516 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 27782417  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782416 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 27782318  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||     
T  27782317 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 27782218  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782217 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 27782137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 37679749 - 37680230
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679749 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37679848  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37679849 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 37679948  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37679949 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 37680046  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |    
T  37680047 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagc 37680146  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680147 ttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 37680230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 37695014 - 37695495
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695014 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37695113  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37695114 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 37695213  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37695214 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 37695311  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |    
T  37695312 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagc 37695411  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695412 ttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 37695495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27122907 - 27122430
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122907 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27122808  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27122807 caggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatag 27122708  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27122707 ctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 27122610  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||  || | ||| |    
T  27122609 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttt 27122510  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122509 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 27122430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 34868066 - 34867588
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34868066 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34867967  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34867966 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 34867867  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  34867866 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggattc 34867769  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||| ||||   || | |||     
T  34867768 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatttcatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttt 34867669  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867668 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 34867588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 11629043 - 11629521
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11629043 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 11629141  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11629142 caggtttgtttttcaaaatagacaaagagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 11629241  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11629242 agctttgaaaataaaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 11629339  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  11629340 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 11629439  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629440 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 11629521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 21671028 - 21671510
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671028 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21671127  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21671128 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 21671227  T
Q  211 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21671228 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacgga 21671325  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaa 409  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||     
T  21671326 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaag 21671425  T
Q  410 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671426 cttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 21671510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 34161230 - 34160749
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161230 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtgacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34161131  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161130 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 34161031  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34161030 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 34160932  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| |||||| |  | ||    
T  34160931 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagct 34160832  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160831 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 34160749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 37931763 - 37931277
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37931763 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 37931664  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931663 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 37931564  T
Q  214 gctttgaaagtagaag------aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 307  Q
    ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931563 gctttgaaagtagaagaaaaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 37931464  T
Q  308 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacaga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  ||     
T  37931463 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtagg 37931364  T
Q  408 aacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||  ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37931363 agctttagatgaagataggcattaacagctgcagatgctccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttc 37931277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 15 - 487
Target Start/End: Original strand, 21697031 - 21697506
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21697031 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 21697130  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21697131 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgta 21697229  T
Q  210 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 309  Q
     |||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21697230 catagctttgaaagtaggaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 21697328  T
Q  310 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaa 409  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||     
T  21697329 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaag 21697428  T
Q  410 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 487  Q
    |||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21697429 ctttagatgaaggtggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 21697506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 32056185 - 32055708
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056185 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 32056086  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056085 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 32055986  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  32055985 gctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggattt 32055888  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||| || | |||     
T  32055887 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 32055788  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055787 tgatgaagatggttattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 32055708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 16823195 - 16823677
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16823195 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 16823294  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16823295 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 16823394  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16823395 gctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 16823493  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac-tt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || | ||||| |||||| |||||| | ||    
T  16823494 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagcttt 16823593  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823594 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 16823677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16898285 - 16897803
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16898285 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 16898186  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16898185 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 16898086  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16898085 gctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 16897987  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac-tt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || | ||||| |||||| |||||| | ||    
T  16897986 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagcttt 16897887  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897886 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 16897803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 9343845 - 9344324
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343845 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9343944  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9343945 caggtttgcttttcaaaatggacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatata 9344044  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  9344045 gctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 9344143  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  9344144 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 9344243  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344244 agatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 9344324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 39045680 - 39046159
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39045779  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39045780 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatata 39045879  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  39045880 gctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 39045978  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  39045979 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttagtggtacattgaacacagtaatcattacattttctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 39046078  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39046079 agatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatacagttacttgccttttgtttc 39046159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 31882670 - 31882192
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31882670 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 31882571  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882570 caagtttgcttttcaaaatagaaaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31882471  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  31882470 gctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31882373  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  31882372 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 31882273  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31882272 agatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttttgtttc 31882192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 27396717 - 27396250
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27396717 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 27396618  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag----------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtt 204  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27396617 taggtttgcttt-caaaaaggacaaaaaactttttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattataaagatagaaagaaaatgtt 27396519  T
Q  205 tt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgac 302  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27396518 ttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 27396420  T
Q  303 tccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagc 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  27396419 tccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 27396320  T
Q  403 acagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagata 472  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27396319 acaaaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagata 27396250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 34297533 - 34297062
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297533 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34297434  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297433 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcgaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 34297340  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  34297339 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattca 34297241  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| ||||||    | ||| |    
T  34297240 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcatgagagctttt 34297141  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34297140 gatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccagatataattacttgccttttgtttc 34297062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 472
Target Start/End: Original strand, 19450276 - 19450742
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||    
T  19450276 cacagactatcctggggaagagcctgcttataacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacatttcgtttgaacgtaccttgttgct 19450375  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt------caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-- 206  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  19450376 caggtttacttt-caaaacagacaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttt 19450474  T
Q  207 ---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgact 303  Q
       ||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |    
T  19450475 tttgtacatacctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacatgctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgatt 19450573  T
Q  304 ccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagca 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  19450574 ccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 19450673  T
Q  404 cagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagata 472  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19450674 cagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagata 19450742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 351
Target Start/End: Original strand, 31868644 - 31868979
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868644 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31868743  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31868744 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 31868843  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  31868844 gctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31868941  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 351  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31868942 acaatgcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 31868979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 34268784 - 34269257
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34268784 cacagactatcctagagaagaatctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 34268883  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||       ||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  34268884 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 34268976  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34268977 taactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacatgctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 34269075  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||  |||| | ||||||||||||||  | | ||    
T  34269076 ttacaaagcttggagaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcatgacatttcctagaaactttgaattcacaagcatgggagct 34269175  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  34269176 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttc 34269257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 28888658 - 28888184
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28888658 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28888560  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  28888559 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 28888466  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  28888465 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggat 28888367  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| |  | ||    
T  28888366 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagct 28888267  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888266 tttgatgaagattgtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 28888184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 23122436 - 23122910
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23122436 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 23122534  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 212  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  23122535 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacat 23122628  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    | ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  23122629 aactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatt 23122727  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | ||    
T  23122728 tgcaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 23122827  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23122828 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttc 23122910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 493
Target Start/End: Original strand, 27428315 - 27428783
Alignment:
Q  19 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27428315 gactatcctgggggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcagg 27428413  T
Q  119 tttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagc 215  Q
    ||||||||||||||        |  ||| |||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | | ||| |    
T  27428414 tttgcttttcaaaa--------acttttgcaattttcaagatgtttgtttcgaacatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgcacataac 27428505  T
Q  216 tttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 315  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  27428506 tttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttac 27428604  T
Q  316 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | |||| ||||||||| |  |  || ||    
T  27428605 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaactcacaagcataagagtttttg 27428704  T
Q  416 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27428705 atgaagatggtcattaccagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttc 27428783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20844296 - 20843818
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20844296 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 20844197  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--at 210  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |     
T  20844196 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaac 20844102  T
Q  211 atagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 309  Q
    ||| |||| ||| ||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  20844101 ataacttttgaaggtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccacgg 20844003  T
Q  310 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | || | ||||||| |||||  || |    
T  20844002 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtag-a 20843904  T
Q  409 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20843903 gcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 20843818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23117180 - 23116993
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23117180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgcc 23117081  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||  ||||||||||||||| || || |||| | |||||||    
T  23117080 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatggtcaaaaacgttagttcaagcattgtcatgatgaagataggaggaaaatg 23116993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 346 - 493
Target Start/End: Original strand, 31887682 - 31887830
Alignment:
Q  346 ggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgc 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31887682 ggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgc 31887781  T
Q  446 cccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31887782 cccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 31887830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27821974 - 27821894
Alignment:
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27821974 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 27821894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 3647534 - 3647055
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647534 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3647435  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647434 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 3647335  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  3647334 ctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 3647235  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || | ||| |    
T  3647234 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttt 3647135  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647134 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 3647055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 10969054 - 10968574
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969054 cacagaccatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10968955  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10968954 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatag 10968855  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968854 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 10968755  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  10968754 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaggacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 10968655  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968654 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 10968574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 20334283 - 20334763
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20334382  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtat 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  20334383 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtac 20334481  T
Q  211 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  20334482 atagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaatttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgga 20334580  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| |    
T  20334581 tttacaaggcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagc 20334680  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334681 ttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 20334763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 10951480 - 10951000
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10951480 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 10951381  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10951380 caggtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgttttgtatatag 10951281  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10951280 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagattc 10951181  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| | ||||   || | |||     
T  10951180 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatccgcaagtgtaggagcttt 10951081  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951080 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 10951000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 37 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 51644588 - 51644129
Alignment:
Q  37 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644588 cctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 51644489  T
Q  137 caaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa- 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51644488 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaa 51644389  T
Q  235 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51644388 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaa 51644289  T
Q  335 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaaca 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||| |||    
T  51644288 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattgaca 51644189  T
Q  435 gctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644188 gctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 51644129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 41787177 - 41787658
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787177 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 41787276  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787277 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 41787376  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  41787377 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggat 41787474  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |    
T  41787475 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 41787574  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  41787575 ttttgatgaagatagtcattaacagctgtagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 41787658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 28591470 - 28590992
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591470 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28591371  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28591370 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatag 28591271  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28591270 ctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattca 28591172  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||   || |  || |    
T  28591171 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagttttt 28591072  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28591071 gatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggtcggccagatatagctacttgccttttatttc 28590992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 28156116 - 28155637
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28156116 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28156017  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28156016 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 28155917  T
Q  211 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28155916 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 28155819  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||  ||    |    
T  28155818 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgc 28155721  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28155720 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgtcttttgtttc 28155637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 485
Target Start/End: Original strand, 16201895 - 16202373
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16201895 cacagactatcctggagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16201994  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--- 206  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  16201995 caggtttgcttt-caaaatagacgaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaaatagaaagaaaatgttttttt 16202093  T
Q  207 --gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 304  Q
      ||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16202094 ttgtacatggctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 16202192  T
Q  305 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcac 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||    
T  16202193 cacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaattactacatgtcctggaaactttgaattcgcaagcac 16202292  T
Q  405 agaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcct 485  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  16202293 aggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagaggatggtggttggccagatatagttacttgcct 16202373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20467173 - 20466688
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  20467173 cacagactatcatggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcacgcatgtttcgtttgaatgtaccttgctgct 20467074  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttc--------aattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--tt 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||||         |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20467073 caggtttgcttt-caaaatagacaggaactttttttttttctaattttgaagatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatggttt 20466975  T
Q  205 ttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 304  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20466974 ttgtacatagctttgaaagtggaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 20466876  T
Q  305 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcac 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | ||||||  ||||||     
T  20466875 cacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcat 20466776  T
Q  405 agaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20466775 agaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtgatttgccaaatat-gttacttgccttttgtttc 20466688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 21891630 - 21892095
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21891630 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 21891728  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||          
T  21891729 caggtttgcttttcaaaaaaaactt----ttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttt------ 21891818  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
         ||||  || || | ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21891819 -----tgaacataaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 21891912  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  21891913 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaagct 21892012  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892013 tctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 21892095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 5141088 - 5141568
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141088 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5141187  T
Q  115 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5141188 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 5141287  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141288 aactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5141386  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  5141387 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 5141486  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141487 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 5141568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 16745274 - 16745754
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16745274 cacagactatcctgaaggagaacttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatataccctgttgct 16745373  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745374 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 16745473  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745474 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 16745572  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||    
T  16745573 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcacagaagctt 16745672  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745673 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 16745754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26441637 - 26441157
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441637 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26441538  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26441537 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatag 26441438  T
Q  215 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441437 ctttgaaagtaaaagaaaaaatggagtttttaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggattc 26441338  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||||    
T  26441337 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcatagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 26441238  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441237 agacgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 26441157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 24586289 - 24586768
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586289 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 24586388  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24586389 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatatag 24586488  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24586489 ctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacgaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 24586587  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||| ||||||  |||    
T  24586588 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagattc 24586687  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586688 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgcctcaaggggaacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 24586768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 4138999 - 4139480
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138999 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4139098  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139099 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 4139198  T
Q  215 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4139199 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4139298  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||| |||||||   | ||| |||    
T  4139299 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagctt 4139398  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4139399 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttttgtttc 4139480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 5164767 - 5164288
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5164767 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5164668  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata- 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5164667 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgttattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5164568  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  5164567 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattc 5164469  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||  |||||  || | |||     
T  5164468 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttt 5164369  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164368 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 5164288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 26663666 - 26664146
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26663666 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26663765  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26663766 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatag 26663865  T
Q  215 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663866 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 26663965  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  26663966 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 26664065  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26664066 agatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttc 26664146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 26678858 - 26679338
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26678858 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26678957  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26678958 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatag 26679057  T
Q  215 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679058 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 26679157  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  26679158 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 26679257  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     | ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26679258 aggtgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttc 26679338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26519174 - 26518697
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26519174 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26519075  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26519074 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 26518975  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26518974 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26518877  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | ||| |    
T  26518876 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttt 26518777  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518776 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 26518697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 31558148 - 31558626
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558148 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31558247  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31558248 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 31558347  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  31558348 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31558446  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  31558447 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 31558546  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558547 cgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 31558626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 11447271 - 11446792
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11447271 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcacttgattgtaccctgttgct 11447172  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447171 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 11447072  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11447071 agctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 11446974  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  11446973 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 11446874  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446873 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 11446792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 5154466 - 5153988
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5154466 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5154367  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154366 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5154267  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  5154266 ctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 5154168  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| |  | ||| |    
T  5154167 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctttt 5154068  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154067 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 5153988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 16443757 - 16444236
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16443757 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16443856  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  16443857 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtaca 16443955  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16443956 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccacggat 16444054  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||| | ||||||| |||||||| || ||    
T  16444055 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcttagaaactttgaattcgcaagcacataagct 16444154  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16444155 tcagacgaagatggtcgttaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 16444236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 39206893 - 39207372
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206893 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39206992  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  39206993 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatata 39207092  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207093 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 39207191  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||     
T  39207192 acaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 39207291  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  39207292 agatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 39207372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4205772 - 4205293
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205772 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4205673  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4205672 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 4205573  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4205572 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 4205475  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaat-tctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  | |||||||||||| |||||| |||    
T  4205474 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 4205375  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205374 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacgatggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 4205293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16047695 - 16047226
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16047695 cacagactatcccggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtatcctgttgct 16047596  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16047595 caggcttgcttt-caaaatagacaaaaacttttcaattttcaggatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaat-ttttgtacatag 16047498  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  16047497 ctttgacagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 16047399  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  16047398 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttct 16047299  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  16047298 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttgcccagatatagttacttgccttt 16047226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 37 - 493
Target Start/End: Original strand, 26509471 - 26509930
Alignment:
Q  37 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 136  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509471 cctgcttgtgacatgtattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 26509570  T
Q  137 caaaaag-ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509571 caaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 26509670  T
Q  236 agagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaat 335  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26509671 ggagttttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaat 26509770  T
Q  336 ttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaaca 434  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||||||||||    
T  26509771 ttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaaca 26509870  T
Q  435 gctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26509871 gctgcagatgccccaagggggacggcggttggccagatatagttacttgcctttcgtttc 26509930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 31084376 - 31084856
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31084376 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 31084475  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084476 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31084575  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  31084576 gctttgaaagtagaagaaaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggattc 31084674  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  31084675 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 31084774  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084775 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 31084856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 45393602 - 45393122
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393602 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatactgaaatggacatcaccatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 45393503  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  45393502 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtgtata 45393403  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45393402 gctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 45393304  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac-tt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||| |||||| ||| || | ||    
T  45393303 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacataagcttt 45393204  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45393203 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccctttgtttc 45393122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 3451702 - 3451222
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3451702 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattggaatagacattcacataccctcgctcatgcatgttccatttgattgtaccctgttgct 3451603  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451602 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 3451503  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451502 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcaccagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 3451405  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  3451404 tcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 3451305  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3451304 tcagatgaggacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgtttc 3451222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 26313603 - 26314081
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26313603 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 26313702  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26313703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 26313802  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26313803 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26313900  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  26313901 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttc 26314000  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26314001 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttc 26314081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 2160955 - 2160475
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160955 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 2160856  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 211  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  2160855 cagatttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 2160756  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2160755 tagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 2160657  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | ||    
T  2160656 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 2160557  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||||||||||| |||||||    
T  2160556 tttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggaatggtggttggctagatatagttacttgcctcttgtttc 2160475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 11418533 - 11419012
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418533 cacagactatcctggaggaggacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11418632  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11418633 caggtttgcttttcaaaacagacagaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 11418732  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  11418733 gctttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 11418831  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||  |||||| || | |||     
T  11418832 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagcttt 11418931  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418932 tgatgaagatagtcatgaacagctgcagatgccctaagggagacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttc 11419012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 26268839 - 26269322
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268839 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26268938  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26268939 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgta 26269038  T
Q  210 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 309  Q
     ||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26269039 catagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 26269137  T
Q  310 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaa 409  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||   |||| | |||||||||||| ||||||     
T  26269138 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 26269237  T
Q  410 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26269238 cttttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 26269322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 45737686 - 45737207
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737686 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagatatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 45737587  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45737586 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 45737487  T
Q  211 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45737486 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 45737389  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||  ||    |    
T  45737388 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgc 45737291  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737290 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 45737207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 18 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 2779626 - 2779156
Alignment:
Q  18 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 117  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2779626 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 2779527  T
Q  118 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 217  Q
    |||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779526 gtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 2779432  T
Q  218 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 317  Q
    |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  2779431 tgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 2779333  T
Q  318 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||| |  | ||| ||||    
T  2779332 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgat 2779233  T
Q  418 gaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779232 gaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 2779156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 31130282 - 31129809
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31130282 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgct 31130183  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130182 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 31130088  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  31130087 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 31129989  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| |||||| |  | ||| |    
T  31129988 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctttt 31129889  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129888 gatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 31129809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 10847968 - 10847509
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  10847968 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 10847871  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 208  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  10847870 caggtttacttt-caaaacagacaaaaaacttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 10847772  T
Q  209 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 308  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10847771 acatagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-cagacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 10847673  T
Q  309 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 408  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||||| |||||||||||    
T  10847672 gatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaa 10847573  T
Q  409 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagata 472  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10847572 gcttctgatgaagatgatcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagata 10847509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26596053 - 26595750
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596053 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26595954  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26595953 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgtgttgtatata 26595854  T
Q  214 gctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595853 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26595754  T
Q  313 caca 316  Q
    ||||    
T  26595753 caca 26595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 485
Target Start/End: Original strand, 16512194 - 16512659
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16512194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcatttgaatgtaccctgttgct 16512293  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||        |  ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  16512294 caggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattatcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 16512385  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16512386 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggcttaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 16512484  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | ||    
T  16512485 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagct 16512584  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcct 485  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  16512585 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcct 16512659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 10910680 - 10911153
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10910680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccatgttgct 10910778  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  10910779 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 10910871  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10910872 taactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 10910970  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaact 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | || |||| |||||  || | ||    
T  10910971 ttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttagtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgtattcgcaagcgtaggagct 10911070  T
Q  412 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    | |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10911071 tttgatgaagatagtcgttaacagcggcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 10911153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 317 - 493
Target Start/End: Original strand, 26531926 - 26532103
Alignment:
Q  317 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctga 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |||  ||    
T  26531926 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttaga 26532025  T
Q  417 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532026 tgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 26532103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 415 - 493
Target Start/End: Original strand, 16732684 - 16732763
Alignment:
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16732684 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 16732763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 493
Target Start/End: Original strand, 2104357 - 2104394
Alignment:
Q  456 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2104357 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 2104394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 9510 - 9987
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9510 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9609  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 9709  T
Q  215 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  9710 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattta 9808  T
Q  315 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | ||| |    
T  9809 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctttt 9908  T
Q  415 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9909 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttc 9987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 2043 - 1564
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2043 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgatcgtaccctgttgct 1944  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1943 caggtttgcttttcaaagtaaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 1844  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  1843 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 1746  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1745 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcataagcacagaaactt 1646  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1645 ctgatgaagatggtcattaacaactgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 1564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12443 - 11954
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12443 cacagactatcctggagaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12344  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat--- 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |       
T  12343 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagcaaatgttttttttttt 12245  T
Q  211 --------atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaa-ttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatga 301  Q
            ||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  12244 ttttttacatagctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtga 12146  T
Q  302 ctccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaag 401  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||    
T  12145 ctccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgagttcgcaag 12046  T
Q  402 cacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12045 tacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgtcttttgtttc 11954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 8797 - 9275
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8797 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8896  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8897 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 8996  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8997 gctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 9094  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||| |||||| |  | |||     
T  9095 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 9194  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagg-ggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9195 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggaggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 9275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 488
Target Start/End: Original strand, 4471 - 4948
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4471 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4570  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 212  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4571 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 4670  T
Q  213 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4671 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4769  T
Q  313 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattgg-ttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||| || | |    
T  4770 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggtttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagc 4869  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt 488  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  4870 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagacatagttacttgcctttt 4948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 10299 - 9821
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10299 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10200  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10199 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaaacattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 10100  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  10099 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggattc 10002  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | |||     
T  10001 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 9902  T
Q  414 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9901 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttc 9821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 33680 - 33204
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 33582  T
Q  115 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||||||||| |||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  33581 caggtttgcttttacaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 33487  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33486 taactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 33388  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||| ||   |    
T  33387 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggggc 33288  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 33204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15962 - 15476
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15962 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15863  T
Q  115 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa------tgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatgtttt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||    
T  15862 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcatcgtttaaaatagaaggaaaatgtttt 15763  T
Q  207 gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15762 gtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 15664  T
Q  307 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacag 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| ||||    
T  15663 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacag 15564  T
Q  407 aaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15563 aagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 15476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18973 - 18492
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18973 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18874  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18873 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 18774  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  18773 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggat 18676  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||  || | |    
T  18675 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 18576  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18575 ttttgatgaagatagtcattaacagctgtagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttc 18492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 14336 - 13856
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14336 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 14237  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 213  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14236 caggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 14137  T
Q  214 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14136 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 14038  T
Q  314 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  14037 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 13938  T
Q  413 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13937 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 13856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 25509 - 25044
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25509 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 25410  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt- 206  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  25409 caggtttgcttt-caaaacagacaaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagataatgttttt 25311  T
Q  207 --gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 304  Q
      ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  25310 tcgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcgcaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactc 25212  T
Q  305 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcac 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||||  |||||||    
T  25211 cacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcac 25112  T
Q  405 agaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagata 472  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25111 agaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagata 25044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 6449 - 5973
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6449 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 6350  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--at 210  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |     
T  6349 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaac 6257  T
Q  211 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 310  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6256 ataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaatatgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 6158  T
Q  311 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaa 409  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  || |     
T  6157 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttactggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggag 6058  T
Q  410 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6057 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 5973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 24774 - 25249
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24774 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 24872  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 211  Q
    ||||||| ||||||||||      |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  24873 caggttttcttttcaaaa------aaaaattttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 24966  T
Q  212 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 311  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24967 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 25065  T
Q  312 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaac 410  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||  |||||  || | |    
T  25066 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacccagcaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagc 25165  T
Q  411 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25166 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttc 25249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 241 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 537 - 284
Alignment:
Q  241 tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 340  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  537 tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 438  T
Q  341 tggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgca 440  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||    
T  437 tggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgca 338  T
Q  441 gatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttc 493  Q
    |||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  337 gatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttc 284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 173 - 1
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  173 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtagcacatattgaaatagacatcaacatacacttgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 74  T
Q  115 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  73 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 257 - 472
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26458
Alignment:
Q  257 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26243 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatggaaattttatttgttggtggtacatt 26342  T
Q  357 gaacacagtaatcactacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 456  Q
    || ||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26343 gagcacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattagcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 26442  T
Q  457 tgtgatttgccagata 472  Q
     ||| ||||| |||||    
T  26443 ggtggtttgctagata 26458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 448
Target Start/End: Original strand, 40497 - 40953
Alignment:
Q  15 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacac-atattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatg-tttcatttgaatgtaccctgttg 112  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  40497 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacattatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcattatttcgtttgaatgtaccctgttg 40596  T
Q  113 ctcaggtttg-cttttcaaaatagacaaaaagttttcaa-ttttcaa-aatgtttgtttc-aagca--ttgt-cattat--caaaatagaaagaaaa--- 200  Q
    |||||||||| |||||| |||     |||   ||| ||| ||||||| | |||||||||| |||||  |||| ||||||   ||||||||| |||||       
T  40597 ctcaggtttgtcttttctaaa-----aaactttttccaatttttcaagattgtttgtttcgaagcaatttgtacattattaaaaaatagaaggaaaaatg 40691  T
Q  201 tgttttgtatatagctttg-aaagtagaaga-aaaatagagttttcaaa--caaaagcaaaggctc-aaattgatgtataagagtggtggtc-agccaaa 294  Q
    | ||||||| ||| ||||| |||||| || | |||  ||||||||||||   ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  40692 ttttttgtacataactttgaaaagtaaaaaagaaagcagagttttcaaaacaaaaagcacagactcaaaattgatgtataagagtggtggtcaagccgaa 40791  T
Q  295 ggcatgactcc-acggattcac-aaagcttgg-aaaatggtaa-ttttattggttggtggtac-attg-aacacagtaatcactacatttcccggaaatt 388  Q
    ||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||  |||| |    
T  40792 ggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaaatggtaatttttattggttggtggtacaattgaaacacaacaatcattacatttcctagaaact 40891  T
Q  389 ctgaa-ttcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc 448  Q
     |||| ||| | |||| || | | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40892 ttgaatttcgcgagcataggagctttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccc 40953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University