View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18224_low_4 (Length: 408)

Name: NF18224_low_4
Description: NF18224
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18224_low_4
NF18224_low_4
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (23-402)||(2807499-2807878)
chr3 (24-381)||(2759447-2759804)
chr3 (23-388)||(2855351-2855716)
chr3 (23-388)||(2838141-2838506)
chr3 (23-375)||(5413118-5413470)
chr3 (23-379)||(2818789-2819145)
chr3 (23-375)||(2769301-2769653)
chr3 (63-375)||(2790592-2790904)
chr3 (63-392)||(2797633-2797962)
chr3 (63-388)||(2749267-2749592)
chr3 (228-342)||(3201381-3201495)
chr3 (256-342)||(3722009-3722095)
chr3 (294-342)||(3197940-3197988)
[»] scaffold0691 (1 HSPs)
scaffold0691 (23-381)||(5700-6058)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 402
Target Start/End: Original strand, 2807499 - 2807878
Alignment:
Q  23 agcaattttgtcaggaaactgaagaccctcttccaaataagttacgcaaattggatgacaaatcactgattgtagaagtgaggcaatacttgcaacataa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2807499 agcaattttgtcaggaaactgaagaccctcttccaaataagttacgcaaattggatgacaaatcactgattgtagaagtgaggcaatacctgcaacataa 2807598  T
Q  123 gaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttctgaccaagttgaatttgctatgcctaacaacaataaaggtagtaggatcataatc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2807599 gaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttctgaccaggttgaatttgctatgcctaacaacaataaaggtagtaggatcataatc 2807698  T
Q  223 acaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2807699 acaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactct 2807798  T
Q  323 tctgcaagaaagtatttagatttgatcttgatgggcactgtccaccggagcttgaggctatgtcaatagatattcttcga 402  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2807799 tctgcaagaaagtatttagattcgatcttgatgggcactgtccaccggagcttgaggctatgtcaatagatattgttcga 2807878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 24 - 381
Target Start/End: Original strand, 2759447 - 2759804
Alignment:
Q  24 gcaattttgtcaggaaactgaagaccctcttccaaataagttacgcaaattggatgacaaatcactgattgtagaagtgaggcaatacttgcaacataag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||  ||| || ||| ||||| |  ||||||||    
T  2759447 gcaattttgtcaggaaactgaagaccctcttccaaagaagttacacaaaatggatgacaggtcactgattacagaggtaaggaaatacctagaacataag 2759546  T
Q  124 aggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttctgaccaagttgaatttgctatgcctaacaacaataaaggtagtaggatcataatca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2759547 aggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttccgaccaggttgaatttgccatgcctaataacaacaaaggtagtaggatcataatca 2759646  T
Q  224 caactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactctt 323  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2759647 ccactagaattatgcaagttgcagattttttcaagaaatcatttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactctt 2759746  T
Q  324 ctgcaagaaagtatttagatttgatcttgatgggcactgtccaccggagcttgaggct 381  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  2759747 ctgcaagaaagtatttagatatgatcttggagggcgttgtccaccggagcttgaggct 2759804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2855716 - 2855351
Alignment:
Q  23 agcaattttgtcaggaaactgaagaccctcttccaaataagttacgcaaattggatgacaaatcactgattgtagaagtgaggcaatacttgcaacataa 122  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||   | ||| | |||| |||||||| | ||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  2855716 agcaattttgtcggggaactgaagaccctcttccactgatgttgcacaaaatggatgaccagtcactgattatacaagtaaggcaatacctgcaacataa 2855617  T
Q  123 gaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttctgaccaagttgaatttgctatgcctaacaacaataaaggtagtaggatcataatc 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2855616 gaggtatttggtattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccaggttgaatttgccatgcctaataacaataaaggtagtaggatcataatc 2855517  T
Q  223 acaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactct 322  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2855516 actactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcataacctgcaacttttgcctccaaacaaagcatgggaactct 2855417  T
Q  323 tctgcaagaaagtatttagatttgatcttgatgggcactgtccaccggagcttgaggctatgtcaa 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2855416 tctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttgaggctgtgtcaa 2855351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2838506 - 2838141
Alignment:
Q  23 agcaattttgtcaggaaactgaagaccctcttccaaataagttacgcaaattggatgacaaatcactgattgtagaagtgaggcaatacttgcaacataa 122  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||| | ||||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  2838506 agcaattttgtcggggaactgaagaccctcttccacagatgttgcacaaaaaggatgaccagtcactgattgaagaagtgaggcaatacctccaacataa 2838407  T
Q  123 gaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttctgaccaagttgaatttgctatgcctaacaacaataaaggtagtaggatcataatc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2838406 gaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataacaataaaggtagtaggatcataatc 2838307  T
Q  223 acaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactct 322  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2838306 actactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcataacctgcaacttttgcctccaaacaaagcatgggaactct 2838207  T
Q  323 tctgcaagaaagtatttagatttgatcttgatgggcactgtccaccggagcttgaggctatgtcaa 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  2838206 tctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaa 2838141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Original strand, 5413118 - 5413470
Alignment:
Q  23 agcaattttgtcaggaaactgaagaccctcttccaaataagttacgcaaattggatgacaaatcactgattgtagaagtgaggcaatacttgcaacataa 122  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||  | | ||||| |||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5413118 agcaattttgtcggggaactgaagactctcttccgcagatgttacacaaaatggatgaccggtcactgattatagaagtgaggcaatacctgcaacataa 5413217  T
Q  123 gaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttctgaccaagttgaatttgctatgcctaacaacaataaaggtagtaggatcataatc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5413218 gaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaacaagatttctctgaccaggttgaatttgcgatgcctaaaaacaataaaggtagtaggatcataatc 5413317  T
Q  223 acaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactct 322  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  5413318 accactagaatgatgcaagttgcggattttttcaaaaaatcctttctagtatatgttcacaacctgcaacttttgcctccaaacaaagcatgggaacttt 5413417  T
Q  323 tctgcaagaaagtatttagatttgatcttgatgggcactgtccaccggagctt 375  Q
     ||||||||| || ||| ||||||| |||| |||| | |||||| ||||||||    
T  5413418 actgcaagaaggtgtttggatttgaacttggtgggaattgtccatcggagctt 5413470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 379
Target Start/End: Original strand, 2818789 - 2819145
Alignment:
Q  23 agcaattttgtcaggaaactgaagaccctcttccaaataagttacgcaaattggatgacaaatcactgattgtagaagtgaggcaatacttgcaacataa 122  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||  || | | |  ||||||||| |||||||||  | ||||||| |||| || ||| ||||| |  |||||||    
T  2818789 agcaattttatcaggaagctgaagaccctgatctagagattttacgcaaaatggatgacaggttactgattatagaggtaaggaaatacctagaacataa 2818888  T
Q  123 gaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttctgaccaagttgaatttgctatgcctaacaacaataaaggtagtaggatcataatc 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2818889 gaggtatttaatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttccgaccaggttgaatttgccatgcccaataacaacaaaggtagtaggatcataatc 2818988  T
Q  223 acaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactct 322  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818989 accacaagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcatttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactct 2819088  T
Q  323 tctgcaagaaagtatttagatttgatcttgatgggcactgtccaccggagcttgagg 379  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| |  ||||||||||| |||||||    
T  2819089 tctgcaagaaagtatttaggtctgagcttggtggtcgttgtccaccggaacttgagg 2819145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Original strand, 2769301 - 2769653
Alignment:
Q  23 agcaattttgtcaggaaactgaagaccctcttccaaataagttacgcaaattggatgacaaatcactgattgtagaagtgaggcaatacttgcaacataa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||| |||| |||||||||  |||||| |  |||| || ||| ||||| | ||||||||    
T  2769301 agcaattttgtcaggaaactgaagaacctctgctaaagatgttacacaaaatggatgacatgtcactggtaatagaggtaaggaaatacctacaacataa 2769400  T
Q  123 gaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttctgaccaagttgaatttgctatgcctaacaacaataaaggtagtaggatcataatc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||     
T  2769401 gaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttccgaccaggttgaattttccatgccaaataacaataaacgtagtaggatcataata 2769500  T
Q  223 acaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactct 322  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2769501 accacaagaatgatgcatgttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcttaacatgcaacttttgcctcctaacaaagcatgggaactct 2769600  T
Q  323 tctgcaagaaagtatttagatttgatcttgatgggcactgtccaccggagctt 375  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2769601 tctgcaagaaagcattcagatttgaacttgatgggcaatgtccaccagagctt 2769653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 63 - 375
Target Start/End: Original strand, 2790592 - 2790904
Alignment:
Q  63 gttacgcaaattggatgacaaatcactgattgtagaagtgaggcaatacttgcaacataagaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagat 162  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2790592 gttacacaaaatggatgacaagtcactcattctacaagtgaggcaatacctgaaacataaaaagtatttgatattcttcgatgatgtatggcaagaagat 2790691  T
Q  163 ttttctgaccaagttgaatttgctatgcctaacaacaataaaggtagtaggatcataatcacaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaat 262  Q
    ||||| |||||  |||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2790692 ttttccgaccagattgaatttgccattccaaataacaataaaggttgtaggatcataatcaccactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaat 2790791  T
Q  263 cctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactcttctgcaagaaagtatttagatttgatcttgatgggcactg 362  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||    
T  2790792 cttttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgacaccaaacaaagcatgggaactcttctgcaagaaagcattcagatttgagcttggtgggcattg 2790891  T
Q  363 tccaccggagctt 375  Q
    |||||| ||||||    
T  2790892 tccaccagagctt 2790904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 63 - 392
Target Start/End: Original strand, 2797633 - 2797962
Alignment:
Q  63 gttacgcaaattggatgacaaatcactgattgtagaagtgaggcaatacttgcaacataagaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagat 162  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2797633 gttacacaaaatggatgacaagtcattgattatacaagtgaggcaatacctgcaacataaaaagtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagac 2797732  T
Q  163 ttttctgaccaagttgaatttgctatgcctaacaacaataaaggtagtaggatcataatcacaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaat 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2797733 ttttctgaccaggttgaatttgccatgcctaataacaacaaagcaaataggatcatcatcaccacgagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaat 2797832  T
Q  263 cctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactcttctgcaagaaagtatttagatttgatcttgatgggcactg 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||| ||    
T  2797833 cctttcaagttcatgttcacaacttgcaacttttgacaccaaacaaatcatgggaactcttctgcaagaaagcattcagatttgaggttggtgggcattg 2797932  T
Q  363 tccaccggagcttgaggctatgtcaataga 392  Q
    |||||| |||||| |  | |||||||||||    
T  2797933 tccaccagagcttaactccatgtcaataga 2797962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 63 - 388
Target Start/End: Original strand, 2749267 - 2749592
Alignment:
Q  63 gttacgcaaattggatgacaaatcactgattgtagaagtgaggcaatacttgcaacataagaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagat 162  Q
    ||||| |||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2749267 gttacacaaaatggatgaccagtcactaattatagaagtgaggcaatacctgcaacataagaggtatttgatattctttgatgacgtatggcaagaagat 2749366  T
Q  163 ttttctgaccaagttgaatttgctatgcctaacaacaataaaggtagtaggatcataatcacaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaat 262  Q
    ||| | ||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  2749367 tttgcggaccaggttcaatttgccatgccaaataacaataaaggtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaat 2749466  T
Q  263 cctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactcttctgcaagaaagtatttagatttgatcttgatgggcactg 362  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| || ||    
T  2749467 cctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctccaaacaaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattg 2749566  T
Q  363 tccaccggagcttgaggctatgtcaa 388  Q
    |||| | || ||||||||| ||||||    
T  2749567 tccatcagaacttgaggctgtgtcaa 2749592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 342
Target Start/End: Original strand, 3201381 - 3201495
Alignment:
Q  228 tagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactcttctgc 327  Q
    |||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |||    
T  3201381 tagaatgatgcatgtagctgaatattttaagaaatcttttcttgttcatattcaccacctacaacctttgcctccaaacaaagcgtgggaactgttttgc 3201480  T
Q  328 aagaaagtatttaga 342  Q
    || || | |||||||    
T  3201481 aacaaggcatttaga 3201495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 342
Target Start/End: Original strand, 3722009 - 3722095
Alignment:
Q  256 aagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactcttctgcaagaaagtatttaga 342  Q
    |||||||| ||||  |||||| ||||| |  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  3722009 aagaaatcttttcctgttcatattcacgaactacaacctttgattccaaacaaagcatgggaactgttttgcaacaaggtatttaga 3722095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3197988 - 3197940
Alignment:
Q  294 tttgactccaaacaaagcatgggaactcttctgcaagaaagtatttaga 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||    
T  3197988 tttgactccaaacaaagcatgggaactgttttgcaacaaggcatttaga 3197940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0691 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0691
Description:

Target: scaffold0691; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 6058 - 5700
Alignment:
Q  23 agcaattttgtcaggaaactgaagaccctcttccaaataagttacgcaaattggatgacaaatcactgattgtagaagtgaggcaatacttgcaacataa 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | ||||| |||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6058 agcaattttgtcgggaaactgaagaccctcttccgcaaatgttacacaaaatggatgacaagtcattaattatagaagtgaggcaatacctgcaacataa 5959  T
Q  123 gaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttctgaccaagttgaatttgctatgcctaacaacaataaaggtagtaggatcataatc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5958 gaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttctgaccaggttgaatttgccatgcctaataacaataaaggtagtaggattataatc 5859  T
Q  223 acaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaacaaagcatgggaactct 322  Q
    || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5858 accacaagaatgatgcttgttgccgaatttttcaagaaatcctttatagttcatgttcacaaactgcaactcttgcctccaaacaaagtatgggaactct 5759  T
Q  323 tctgcaagaaagtatttagatttgatcttgatgggcactgtccaccggagcttgaggct 381  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  5758 tctgcaaaaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccacttgagcttgaggct 5700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University