View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18227_low_25 (Length: 337)

Name: NF18227_low_25
Description: NF18227
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18227_low_25
NF18227_low_25
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (19-326)||(43745080-43745385)
chr8 (31-233)||(12528747-12528949)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (31-323)||(28220194-28220486)
chr5 (141-326)||(42555574-42555759)
chr5 (46-117)||(42555759-42555830)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (19-326)||(3147503-3147810)
chr7 (31-321)||(8585341-8585631)
chr7 (31-317)||(8628775-8629061)
chr7 (31-270)||(7877419-7877658)
chr7 (31-321)||(8667662-8667952)
chr7 (31-321)||(10494009-10494299)
chr7 (31-267)||(13333145-13333381)
chr7 (30-326)||(8659605-8659901)
chr7 (31-270)||(8602217-8602456)
chr7 (30-326)||(1301702-1302002)
chr7 (31-326)||(6789755-6790050)
chr7 (31-324)||(8647120-8647410)
chr7 (31-270)||(27830561-27830800)
chr7 (31-318)||(17268182-17268469)
chr7 (31-290)||(8654693-8654952)
chr7 (31-270)||(8382562-8382801)
chr7 (31-230)||(8636069-8636268)
chr7 (31-321)||(8671265-8671555)
chr7 (30-230)||(29581567-29581767)
chr7 (31-233)||(8570554-8570756)
chr7 (49-270)||(8590899-8591120)
chr7 (31-233)||(8576569-8576771)
chr7 (85-326)||(8640179-8640418)
chr7 (31-151)||(17260484-17260604)
chr7 (31-233)||(8581943-8582145)
chr7 (31-230)||(29577395-29577594)
chr7 (31-237)||(8559576-8559782)
chr7 (28-149)||(8610157-8610278)
chr7 (125-321)||(8545969-8546165)
chr7 (34-233)||(8538282-8538481)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (31-321)||(28910825-28911115)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (19-320)||(16657153-16657454)
chr2 (19-290)||(12234920-12235191)
chr2 (19-317)||(12245045-12245343)
chr2 (31-321)||(16661627-16661917)
chr2 (31-290)||(11999637-11999896)
chr2 (31-289)||(14703651-14703909)
chr2 (31-290)||(7542469-7542728)
chr2 (31-290)||(12258247-12258506)
chr2 (89-230)||(43625713-43625855)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (31-290)||(34466459-34466718)
chr1 (55-323)||(15595308-15595571)
chr1 (30-169)||(4678345-4678484)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (31-321)||(9335526-9335816)
chr4 (31-321)||(30775495-30775785)
chr4 (31-317)||(35132691-35132975)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 43745080 - 43745385
Alignment:
Q  19 ctcttttccagaccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttcc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43745080 ctcttttccagaccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatcta--gtggctttcc 43745177  T
Q  119 gctgataatcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43745178 gctgataatcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggcaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcat 43745277  T
Q  219 agatgatatttcttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccac 318  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43745278 agatgagatttcttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccac 43745377  T
Q  319 aacttcat 326  Q
    ||||||||    
T  43745378 aacttcat 43745385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Original strand, 12528747 - 12528949
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||   || ||||  || ||||||||| ||||||||||    ||||||   |||||  ||||||    
T  12528747 ccatatgcaagagcagctgcagttggttcgttgattatccgtattacattgaggccagcaatgacaccagcatccttggtggctcgtcgctgcgaatcat 12528846  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    ||||||| || ||||| ||||  ||||||||||| |||||  | |  | |||||  ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  12528847 tgaaatacgctggcaccgtaatcactgcattcttaacaggtgactcaagaaatgcatctgcaatctctcgcatctgtgatagaatcatagaggatatttc 12528946  T
Q  231 ttc 233  Q
    |||    
T  12528947 ttc 12528949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 323
Target Start/End: Original strand, 28220194 - 28220486
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||  || |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28220194 ccatatgcaatagcagcagcagtgggttcattgactatccttagaacatttagaccagcaatggtacctgcatctatggtggctttccgctgataatcat 28220293  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28220294 tgaaataagcaggcacagtaataactgcattcttgacaggaaattccaaaaaggcctctgcaatctcacgcatctttgttagaaccatagatgagatttc 28220393  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28220394 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcatgggtttgtcgttcgttccggaaatgaccttgaatggccacaactt 28220486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 141 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 42555759 - 42555574
Alignment:
Q  141 cggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttcttcggcacat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  42555759 cggcacagtaacaactgcattcttgacaggcatttccaaaaatgcctctgcaatcttgcgcatctttgttagaatcatagatgagatttcttcggcgcat 42555660  T
Q  241 aggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaacttcat 326  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42555659 aggtgtttctcctgtccctcgtacgttacataaatcatgggcttgccatttattccggaaatgaccttgaatggccacaacttcat 42555574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 42555830 - 42555759
Alignment:
Q  46 gcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||| |||||||  |||||||||    
T  42555830 gcagcagtgggttcattgattatcttcataacattcagaccagcaatagtacctgcatctattgtggctttc 42555759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 3147503 - 3147810
Alignment:
Q  19 ctcttttccagaccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttcc 118  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||  || |||||||    
T  3147503 ctcttgtccagtccatacgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgcataatattaaggccagcaataacaccagcatctattgtcgctttcc 3147602  T
Q  119 gctgataatcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcat 218  Q
    |||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   ||||||| |||  |||||||||||||||| |||    
T  3147603 gctgagcatcattgaaataagcaggtacggtaacaactgcattcttgacaggcaattctaaaaactcctctgcagtcttgcgcatctttgttagaaccat 3147702  T
Q  219 agatgatatttcttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccac 318  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  3147703 agatgagatttcttcagcacataggtgcttctcctgtcccttgcacttaaccgaaatcatgggtttgtcattcactccgcaaatgaccttgaatggccac 3147802  T
Q  319 aacttcat 326  Q
    ||| ||||    
T  3147803 aacatcat 3147810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8585631 - 8585341
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||    
T  8585631 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttcgctgagaatcat 8585532  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||  ||| |||| |||||||||||||||    ||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  8585531 tgaaataagcaggcacagtcacaactgcattttgaacaggtgatttcaaatatgtctctgcaatcttcttcatgtttgtgaggatgatagatgatatttc 8585432  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaac 321  Q
     || |||||||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||    
T  8585431 ctcagcacataggttcttttcttgacccttgtacttaacagtaatcataggtttgtcattaacaccagagataaccttgaatggccacaac 8585341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 317
Target Start/End: Original strand, 8628775 - 8629061
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||| ||||||    
T  8628775 ccatatgcaatagctgcagcagtggggtcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcattcatggtggcttttcgctgagaatcat 8628874  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||  ||| |||| | | |||||||||||    ||| ||||  || || ||||||||||||||    
T  8628875 tgaaataagcaggcacggtgacaactgcattttttacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttc 8628974  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggcca 317  Q
     || |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||  || |||||||| |  || ||||| |||||||| |||||    
T  8628975 ctcagcacataggttcttctcttgacccttgtacttaacagcaatcataggcttgtcattaagaccagaaataaccttgaatggcca 8629061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7877658 - 7877419
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||  || || ||||  ||||||||||||   |||||||| || ||| ||||||    
T  7877658 ccatatgcaagggcagcagcagttggttcattaattatccgcataacattgaggccggcaactgcaccagcatcttttgtggcttttcgttgagaatcat 7877559  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  7877558 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggtgactccaaaaacttctctgcaatctcgcgcatctttgtaaggatcatggatgatatttc 7877459  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaaca 270  Q
     |||||||| | |||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  7877458 ctcggcacaaaagtgcttttcctcgcccttatacttaaca 7877419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Original strand, 8667662 - 8667952
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   || |||| ||| |||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||| ||||||    
T  8667662 ccatatgcaatagctgccgcagtaggttcattgattatccgaatgacattaagtccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcat 8667761  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |   || | ||| ||| |||| ||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  8667762 tgaagtaagctggcacagtaacaacggcattcttgaccggcgaccccagatatgcctccgcaacctctcgcatctttgtaagcaccatagaagatatttc 8667861  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaac 321  Q
     || ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |  || ||||| |||||||| |||||||||    
T  8667862 ctcagcacaaaagtgcttctcttgacccttgtacttaacagtaatcataggtttgtcattaacaccagaaataaccttgaatggccacaac 8667952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10494299 - 10494009
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || || ||| |||| |    
T  10494299 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagcaccagcatcaatagtagcctttcgttgagaatcgt 10494200  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |   |||| ||| |||||||| ||| ||||||||| | || | |||||||||||||||    
T  10494199 tgaagtaagccggcacagtaacaacagcattcttgactggtgaccccaaatatgcctctgcaacctctcgcatctttataaggaccatagatgatatttc 10494100  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaac 321  Q
     |||||||| | ||||||||| || |||||||||||| | | |||||  ||||||||||| |  || ||| | |||||||| |||||||||    
T  10494099 ctcggcacaaaagtgcttctcttgacccttgtacttagcggtaatcataggtttgtcattgacacctgaagtaaccttgaatggccacaac 10494009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13333381 - 13333145
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    || | || ||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||    
T  13333381 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattattcgaatgatattaaggccagcaatagcaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcat 13333282  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |   || | ||| |||||||| ||| ||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  13333281 tgaagtaagccggcacagtaacaacggcattcttgactggtgaccccatatatgcctctgcaacctctcgcatctttgtaaggaccatagatgatatttc 13333182  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtactta 267  Q
     |||||||| | ||||||||| || |||||| |||||    
T  13333181 ctcggcacaaaagtgcttctcttgacccttgcactta 13333145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 8659605 - 8659901
Alignment:
Q  30 accatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || |||| ||| |||||||||||||| | |||||  |||||||| |||||| |||||    
T  8659605 accatatgcaatagctgcagcagtaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaatggcaccggaatctatggtggcttttcgctgagaatca 8659704  T
Q  130 ttgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatattt 229  Q
    ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||  |    | | ||||||||||||  || ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  8659705 ttgaactatgcaggcactgtaacaacagcattcttcacaggtgacattagatatgtctctgcaacttctcgcatttttgtaagtaccatagatgatattt 8659804  T
Q  230 cttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaacttcat 326  Q
    | || ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| | ||||||| ||||  || |  || |||||||| ||||||||| ||||    
T  8659805 cctccgcacaaaagtgcttctcctgacccttgtactgaacattaatcatgagtttgtcgttcacaccagcgataaccttgaatggccacaacatcat 8659901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 8602217 - 8602456
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||  ||| ||||  || |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||    
T  8602217 ccatatgcaagagcagctgcagttggctcattgattatccgcattacattgagaccagcaatggcaccagcatcttttgtggcttttcgctgagaatcat 8602316  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | || |||  |||||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||| |||||    
T  8602317 taaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggtgactccagaaacttctctgcaatttcacgcatctttgtaaggaccattgatgagatttc 8602416  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaaca 270  Q
     || ||||| | |||||| |||   ||||| |||||||||    
T  8602417 ctcagcacagaagtgcttttccccacccttatacttaaca 8602456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 1301702 - 1302002
Alignment:
Q  30 accatatgcaatagctgcagcagtgg----gttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgata 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |    ||||||| |||||||  || |||| ||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||| |    
T  1301702 accatacgcaatagctgcagcagtagctaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaattgcaccggcatctatggtggcttttcgctgaga 1301801  T
Q  126 atcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgat 225  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| |||||  | || ||  |    | | ||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||||    
T  1301802 atcattgaaatgtgcaggcacagtaacaacagcatttgtcactggtgacattagatatgtctctgcaatttctcgcatcttcgtaaggaccatagatgat 1301901  T
Q  226 atttcttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaacttca 325  Q
    ||||| ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||| |||    
T  1301902 atttcctccacgcaaaagtgcttctcctgacccttgtacttaacaacaatcacgggtttgtcattcacaccggcgatgaccttgaatggccacaacatca 1302001  T
Q  326 t 326  Q
    |    
T  1302002 t 1302002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 6789755 - 6790050
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  6789755 ccatatgcaagagcagcagctgttggttcattgattattcgtataacattaagaccagcaatggcaccagcatctaaagtggctttccgttgagaatcat 6789854  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |      | |||||| || |||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || | |||    
T  6789855 tgaaataagcaggcacagtaataactgcattttttatctctgactgcaaatatttctcagcaatctcccgcatcttggtgaggatcatagacgaaacttc 6789954  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaacttcat 326  Q
     ||  ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||| |  || | |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  6789955 ctcaacacatagttgcttctcctcacccttatactcaacaacaatcatgggcttgtcattgacgccagcaatgaccttgaatggccaaaacatcat 6790050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 324
Target Start/End: Original strand, 8647120 - 8647410
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||   || | || ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8647120 ccatatgcgagagcagcagctgttggttcattgattatccggatgatattaaggccagcaatggccccggcatctatagtggcttttcgctgataatcat 8647219  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||  |    ||| || ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  8647220 tgaagtatgcaggcacagtaacaactgcattctttacaggggacattaaatatttctctgcaacctctcgcatctttgtgaggatcatcgatgatatttc 8647319  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaacttc 324  Q
     || |||||     ||||||| |  |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||  ||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  8647320 ctcagcacaataacgcttctcttcacccttgtatttaacaataatcatgggtttgtcattcacccc---aatgaccttgaatggccacaacttc 8647410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27830800 - 27830561
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  27830800 ccatatgcaatagctgcagcagtaggctcgcttattatccgcataacattaaggccagcaatggcaccggaatctacagtggcttttcgttgagagtcat 27830701  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||||||||| ||||| || |  ||||||||||| || ||  |||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||| || | ||| ||||| |||||    
T  27830700 tgaaataagctggcacggttattactgcattcttaaccggtgattgcaaatatgcctccgcgatctctcgcatctttgtaaggaccattgatgaaatttc 27830601  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaaca 270  Q
     || ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||    
T  27830600 ctccgcacataagtgtttctcctgactcttgtacttaaca 27830561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 17268182 - 17268469
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |    
T  17268182 ccatatgcaatagctgcagcagttggttcattgattaccttcaatacattaaggccagcaatgacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcgt 17268281  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||| |||||||| |||||||  || |||||| | || |   |||  | | ||  ||| |||||||| ||||||||||| || | |||||| || |||||    
T  17268282 tgaagtaagccgggacagtaatgacagcattcataaccgatgattctagatattcctcagcaatctcccgcatctttgtgagtaccatagacgaaatttc 17268381  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattca-atccggaaatgaccttgaacggccac 318  Q
     || ||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||    
T  17268382 ctctgcacaaaagtgtttctcccgtcccttgtacttgagggaaatcattggtttgtcattcatatcc-gcaatgaccttgaatggccac 17268469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 290
Target Start/End: Original strand, 8654693 - 8654952
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   || || | ||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | ||||    
T  8654693 ccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcat 8654792  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||| || |||||||||||||||||  |||| ||||| ||  ||   |   ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  8654793 tgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggtgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttc 8654892  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcatt 290  Q
     || ||||| |  |||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8654893 ctcagcacaaaattgcttctcttgacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcatt 8654952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8382801 - 8382562
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||  ||| ||||  || |||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  8382801 ccatatgcaagagcagcggcagttggctcattgattatccgcattacattgaggccagcaatcgcaccagcatcttttgtggctttccgttgagaatcat 8382702  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| |||||| || |||  | | ||||||  ||||||||||||||||||||||| | || | |||||| || |||||    
T  8382701 tgaaatatgcaggcacggtaacaactacattctcgataggtgactccaaaaaattctctgcaatctcacgcatctttttgaggaccatagaggagatttc 8382602  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaaca 270  Q
     |||||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||    
T  8382601 ctcggcacaaaggtgtttttcctcacccttatacttaaca 8382562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8636268 - 8636069
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||   || |||| ||| || ||||||||||||||||||   |||| ||| |||||| ||||||    
T  8636268 ccatacgcaaaagctgcagcagttggttcattgattatccgaattacattaaggccggcaatggcaccagcatctttggtggatttacgctgagaatcat 8636169  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||   ||| || | ||| ||| |||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  8636168 tgaaataagcgggcacagtaatgactgcattcttgacagatgattccagatatgcctcagcaatctctcgcatctttgtcaggaccatagacgatatttc 8636069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8671555 - 8671265
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||| ||| |||||||| | ||||||||| |  |||||  | |||||| ||||||    
T  8671555 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaagtccagcaatagtaccagcatcaatggtggccgttcgctgagaatcat 8671456  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | | || | ||| ||| |||| ||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  8671455 tgaagtaagctggcacggtaacaacggcattcttgaccggtgactccagatatgcctccgcaacctctcgcatctttgtaagcaccatagaagatatttc 8671356  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaac 321  Q
     || ||||| |  ||||||||  | || | |||||| |||| |||||  ||||||||||| |  || ||||| |||||||| |||||||||    
T  8671355 ctcagcacaaaattgcttctctagaccttcgtacttgacagtaatcataggtttgtcattaacaccagaaataaccttgaatggccacaac 8671265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29581767 - 29581567
Alignment:
Q  30 accatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatca 129  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||  || ||||| ||    |||||||||   |||||||| |||||| |||||    
T  29581767 accatatgcaagtgcagcagcagttggttcgttgattatcctcattacattgaggccagctataatgccagcatctttggtggcttttcgctgagaatca 29581668  T
Q  130 ttgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatattt 229  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  29581667 ttgaaataagcaggcacggtaatcactgcattctttacaggcaattccaaaaatttctctgcaatatcatgcatctttgagaggatcatagatgatattt 29581568  T
Q  230 c 230  Q
    |    
T  29581567 c 29581567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Original strand, 8570554 - 8570756
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||  || ||||||||  |||| ||||||  ||||||| | || ||  ||||||    
T  8570554 ccatatgcaagagctgccgcagtcggttcattgattatccgcattacattgagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcat 8570653  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    | |||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  8570654 taaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggagactccaaaaatgcttctgcaatctctcgcatctttgagagaatcacagatgatatttc 8570753  T
Q  231 ttc 233  Q
    |||    
T  8570754 ttc 8570756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Original strand, 8590899 - 8591120
Alignment:
Q  49 gcagtgggttcattgattatcttcataacat-caagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcattgaaataagccggcaca 147  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||   || ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  8590899 gcagttggttcattaattatccgcattacattcaagcc-agcaatgacaccagcatctttggtagctttcctctgagaatcattaaaataagctggcaca 8590997  T
Q  148 gtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttcttcggcacataggtgct 247  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | ||||||  | || |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| || ||||| ||  |||    
T  8590998 gtaacaactgcattcttgacaggtgactccaaaaacttttcagcaatctctcgcatctttgtgagaaccatggatgagatttcctccgcacaaagacgct 8591097  T
Q  248 tctcctgtcccttgtacttaaca 270  Q
    | ||||  |||||||||||||||    
T  8591098 tttcctcacccttgtacttaaca 8591120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Original strand, 8576569 - 8576771
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||  || |||||||| ||||| ||||||  ||||||| | || ||  ||||||    
T  8576569 ccatacgcaagagctgccgcagtcggttcattgattatctgcatgacattgagaccagcaattgcacctgcatctttagtggctcttcgttgggaatcat 8576668  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    | |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  8576669 taaaataagcaggcacagaaatcactgcattcttaacaggtgtctgcagaaaagcctctgcaatctctcgcatctttgagagaatcacagatgatatttc 8576768  T
Q  231 ttc 233  Q
    |||    
T  8576769 ttc 8576771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8640418 - 8640179
Alignment:
Q  85 ccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgac---aggaaattgcaaaa 181  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||    ||| |||  |||     
T  8640418 ccagcaatggccccggcatctatggtggctttttgctgataatcattgaagtaagcaggcatagtaacaactgcattctttacggggggacatt--aaat 8640321  T
Q  182 atgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttcttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacggg 281  Q
    || ||||||||| ||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||| |  |||||||| ||||||  ||||  |||    
T  8640320 atttctctgcaacctctcgcatcttcgaaaggatcatagatgatatttcctcggcacaaaaacgcttctcttcacccttgtatttaacaataatcgtggg 8640221  T
Q  282 tttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaacttcat 326  Q
    |||||||||||  ||   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8640220 tttgtcattcacccc---aatgaccttgaatggccacaacttcat 8640179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 151
Target Start/End: Original strand, 17260484 - 17260604
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  17260484 ccatatgcaatagctgcagcaataggttcattaattaacttcaaaacataaaggccagcaataacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcat 17260583  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaa 151  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  17260584 tgaaataagcaggaacagtaa 17260604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Original strand, 8581943 - 8582145
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||  || || |||||  |||| ||||||  ||||||| | || ||  ||||||    
T  8581943 ccatatgcaagagctgccgcagtcggttcattgattatccgcattacattgagacctgcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcat 8582042  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    | |||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||  | | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  8582043 taaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgtcagaataacagatgatatttc 8582142  T
Q  231 ttc 233  Q
    |||    
T  8582143 ttc 8582145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29577594 - 29577395
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||  || ||||||||    || ||||||   |||||||| |||||| ||||||    
T  29577594 ccatatgcaagtgcagcagcagttggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaataatgccggcatctttggtggcttttcgctgagaatcat 29577495  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||||||||| ||||| || |  ||||||||||| || || || | ||||||| |||||||||||||  |||||||||  || |||||||| ||||||||    
T  29577494 tgaaataagctggcactgtgatcactgcattctttacgggtaactccaaaaatttctctgcaatctcctgcatctttgagaggatcatagacgatatttc 29577395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 8559576 - 8559782
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||  |||| ||||||   |||||| | |  ||| ||||||    
T  8559576 ccatatgcaagagcagctgcagttggttcattgattatctgcattacattaagaccagcaatttcacctgcatctttggtggctcttctttgagaatcat 8559675  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    | |||||||| || || ||||  || |||||||  || |   | | ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  8559676 taaaataagcaggtacggtaatcacagcattctcaaccgtcgactccaaaaatgcttctgcaatctctcgcatctgtgtgagaatcatagctgatatttc 8559775  T
Q  231 ttcggca 237  Q
    |||||||    
T  8559776 ttcggca 8559782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Original strand, 8610157 - 8610278
Alignment:
Q  28 agaccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataat 127  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||   || |||| ||| |||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  8610157 agaccatatgcaagagccgcagccgttggttcattgataatccggattacattaaggccagaaatgacaccagcatcttttgtggctttccgctgagaat 8610256  T
Q  128 cattgaaataagccggcacagt 149  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  8610257 cattaaaataagcaggcacagt 8610278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 321
Target Start/End: Original strand, 8545969 - 8546165
Alignment:
Q  125 aatcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatga 224  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||  | | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||  || |||| ||||||    
T  8545969 aatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatga 8546068  T
Q  225 tatttcttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaac 321  Q
    ||||||||| |||   | |||||| ||||  |||||||| || |||  |||    ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||    
T  8546069 tatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaac 8546165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 8538282 - 8538481
Alignment:
Q  34 tatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcattga 133  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||  ||| ||||  || ||||||||| |||||||||||   |||||| | |||||  |||||||||    
T  8538282 tatgcaagagcagcagctgtaggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaatgacaccagcatctttggtggctcttcgctgtgaatcattga 8538381  T
Q  134 aataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttcttc 233  Q
    ||||||| || || ||||  |||||||| ||||||||  | | |||||||   || || | ||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  8538382 aataagcaggtactgtaatcactgcatttttgacaggtgactccaaaaatacttcagcgaactcccgcatctttgtgaggaccatagctgatatttcttc 8538481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Original strand, 28910825 - 28911115
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||||   ||||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||||    
T  28910825 ccatatgaaatagctacagcagtgagctcattgattatccgcataacattaagcctgacaatggcaccagcatctatggtggctttcctctaagaatcat 28910924  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||||||| | | || |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||  |||| || |||||| |||||    
T  28910925 tgaaataaccagtcaaagtaacaattgcattcttgacgggcaattccaaaaatgtcactgcaatctcgcgaatctttgagagaaccacagatgagatttc 28911024  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaac 321  Q
     || |||||||  | |||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  28911025 ctcagcacataatttcttctcctgatccttgtacttgacagatatcatggggttgtcattgacaccggcaatgaccttgaacggcgacaac 28911115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16657454 - 16657153
Alignment:
Q  19 ctcttttccagaccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttcc 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |    
T  16657454 ctcttgtcaagaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaatgacattaaggccagcgatggcaccagcatctatggtggcttttc 16657355  T
Q  119 gctgataatcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcat 218  Q
    ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | | || ||||| ||| ||||  || ||||||||||| || |||||    
T  16657354 gctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattcttgacaggcgactccataaatgcctcagcaacttctcgcatctttgtaaggatcat 16657255  T
Q  219 agatgatatttcttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccac 318  Q
    |||||||||||| || ||||| |  ||  |||| || ||||| |||| || || |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  16657254 agatgatatttcctcagcacaaaattggctctcttgacccttatactgaagagtaatcattggtttgtcattcactccggcaatgaccttgaatggccac 16657155  T
Q  319 aa 320  Q
    ||    
T  16657154 aa 16657153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Original strand, 12234920 - 12235191
Alignment:
Q  19 ctcttttccagaccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttcc 118  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| || ||  ||||||| || |||| | |||||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |    
T  12234920 ctcttgtcaagaccatatgcaacagcggctgccatgggttcgttcattaccctcataacattgaggccagcaatgacaccagcatctatagttgcttttc 12235019  T
Q  119 gctgataatcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcat 218  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||| || || || ||||||||||| || | |||    
T  12235020 gttgagaatcattgaaataagcaggcacggtaacaactgcattcttaactggaaattgtaaatatgcctcagcgatttctcgcatctttgtgagtaccat 12235119  T
Q  219 agatgatatttcttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcatt 290  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  12235120 agatgatacttcttcgggacatagctgcttctctcgacccttgtacttgacaataatcatgggtttgtcatt 12235191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12245343 - 12245045
Alignment:
Q  19 ctcttttccagaccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttcc 118  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  || |||||||| |  ||||||||||  || ||||| |    
T  12245343 ctcttttcaaggccatatgcaacagctgcagcagtgggttcattcattaccctcataacattgagaccagcaattgagccagcatctatcgttgcttttc 12245244  T
Q  119 gctgataatcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcat 218  Q
    ||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||  |||  ||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||| | |||    
T  12245243 gctgagaatcactaaaataagcaggtacagtaacaacagcattctttaccggtgattctaaatatgcctcagcaatttctcgcatctttgttagtaccat 12245144  T
Q  219 agatgatatttcttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggcca 317  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |  ||||||||||| |  || | | ||||||||||||||||    
T  12245143 agatgatacttcttcagcacatagctgcttctcctggcctttgtagttaacagtaattattggtttgtcattgacaccagcagtgaccttgaacggcca 12245045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16661917 - 16661627
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||| |    
T  16661917 ccatatgcaatagctgctgcagtgggttcattgattatcctcacaacgttaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttcgctgagaatcgt 16661818  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    | |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||  ||| |||| | | |||||||| |||   ||| ||||| || |  |||||||| |||||    
T  16661817 taaaataagcaggaacagtgacaactgcatttttaaccggtgattccaaataagcctctgcaacctccttcatgtttgtgaggacaatagatgagatttc 16661718  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaac 321  Q
     |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||   ||||||||||| |  || | ||| ||||||||||||||||||    
T  16661717 ctcggcacaaaggagcttctcctgacccttgtacttaacactaatcgtaggtttgtcattaacaccagcaataaccttgaacggccacaac 16661627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 290
Target Start/End: Original strand, 11999637 - 11999896
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||     
T  11999637 ccatatgcaacagttgcagcagtgggttcattcattacccttataacattgatgccagcaattgcaccggcatctatagtggcttttcgttgagaatcac 11999736  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    | |||||||| || |||||||||||  ||||||| || ||  |||  ||| ||| ||| ||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||| |||    
T  11999737 taaaataagctggtacagtaacaacaacattctttaccggtgattctaaatatgcctcagcaatttctcgcatcttcgttagtaccatagatgatacttc 11999836  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcatt 290  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  11999837 ttcagcacatagctgcttctcctggcctttgtacttaacagtaattattggtttgtcatt 11999896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 289
Target Start/End: Original strand, 14703651 - 14703909
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||  || || |||||  |||||||||| | ||||||||| |  ||| |||||     
T  14703651 ccatatgcaatagctgcagctgtaggttcattcattaccctcataacattgaggccggcaataacaccagcatccatagtggcttttctttgagaatcac 14703750  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||   | |  ||| ||||||| ||||| || ||||||||    || | ||||||||||| |||    
T  14703751 taaaataagcaggcaccgtaacaactgcattcttaacagttgactctaaatatgtctcagcaatttctcgcatcttcaccagtaccatagatgatacttc 14703850  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcat 289  Q
    ||||||| | || | |||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14703851 ttcggcatagagcttcttctcctgatccttgtacttaaccgtaatcatgggtttgtcat 14703909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 290
Target Start/End: Original strand, 7542469 - 7542728
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||  | |||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||    
T  7542469 ccatatgcaacagctgcggcagtaggttcattcattgccctcataacattgaggccagcaatggcacccgcatctatagtggcttttcgttgagaatcat 7542568  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||    ||  ||| | | ||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||  ||    
T  7542569 taaaataagcaggtacagtaacaactgcattcgtcacagttgtttctaaatacgactcagcaatttctcgcatctttgtgagtaccatagatgatacctc 7542668  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcatt 290  Q
    ||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  7542669 ttcagcatggagttgtttctcctgatccttgtacttaacggtaatcatgggtctgtcatt 7542728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12258506 - 12258247
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  || ||| ||||   |||  |||||| |||||||||||  ||  |||||     
T  12258506 ccatatgcaaaagctgcagcagtaggttcatttaatatcttcataacattcaggccaacaatattacccacatctatagtggctttcctttgtgaatcac 12258407  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||| |  | || |||||||| |||    
T  12258406 taaaatatgcaggcacagtaacaactgcattcttaacgggtgattctaaatatgcctcagcaatttctcgcatctttgtcaataccacagatgatacttc 12258307  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcatt 290  Q
     |||||||| || |||||||| ||   ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||    
T  12258306 ctcggcacaaagctgcttctcttgattcttgtactttaccgtaatcatgggtttgccatt 12258247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 230
Target Start/End: Original strand, 43625713 - 43625855
Alignment:
Q  89 caatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgac---aggaaattgcaaaaatgt 185  Q
    ||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    ||| |||  |||||| |    
T  43625713 caatgacaccaacatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaagtaagcaggcacggtaacaactgcattctttacggggggacatt--aaaaattt 43625810  T
Q  186 ctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  43625811 ctctgcaacctctcgcatctttgtgaggatcatagacgatatttc 43625855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34466718 - 34466459
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  34466718 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatttgcaaaacattaaggccagcaatagtaccagcatccacagtagcttttcgctgagaatcat 34466619  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    | |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  ||  ||| |||| ||  ||||||| | || ||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  34466618 taaaataagcaggcacggtgataactgcattcttaattggtgattccaaatattcctctgcagtatcccgcatctttgaaaggatcatagatgagatttc 34466519  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcatt 290  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||  || ||||||||    
T  34466518 ctcagcacataggtgcttctcctgacccttatacttaagggaaatcattggcttgtcatt 34466459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 323
Target Start/End: Original strand, 15595308 - 15595571
Alignment:
Q  55 ggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcattgaaataagccggcacagtaacaa 154  Q
    ||||||||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  15595308 ggttcattgattacccgtataacattaaggccagcaatggcacctgcatctatagtggcttttcgttgagaatcattgagataagcaggcacggtaacaa 15595407  T
Q  155 ctgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttcttcggcacataggtgcttctcctg 254  Q
    ||||||| || || ||| | |  |||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| | | |||| || ||    
T  15595408 ctgcattgtttacgggagact--aaaaatttctctgcaacctctcgcatctttttgagaatcatagacgatatttcctcagcacaaaagcgcttttcttg 15595505  T
Q  255 tcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaactt 323  Q
     |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||  ||   |||||||||||| |||||||||||    
T  15595506 acccttgtatttaacaataatcatgggtttgtcattcacacc---aatgaccttgaatggccacaactt 15595571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4678484 - 4678345
Alignment:
Q  30 accatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatca 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |  || |||| ||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||| |||||    
T  4678484 accatatgcaatagctgcaacagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgttgagaatca 4678385  T
Q  130 ttgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacag 169  Q
    ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  4678384 ttgaagtatgcaggcacagtaacaacgacattcttcacag 4678345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9335816 - 9335526
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||| ||| |||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||| ||||||    
T  9335816 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcat 9335717  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |   |||| ||| ||| |||| ||| | ||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  9335716 tgaagtaagctggcacggtaacaacggcattcttgaccggcgaccccaaatatgcctccgcaacctctctcatctttgtaagcaacatagaagatatttc 9335617  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaac 321  Q
     || ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| |  || ||||| |||||||| |||||||||    
T  9335616 ctcagcacaaaagtgcttctcttgacccttgtagttaacagtaatcataggtttgtcattaacaccagaaataaccttgaatggccacaac 9335526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Original strand, 30775495 - 30775785
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||   |||||    
T  30775495 ccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcat 30775594  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||| || || ||  ||| |||| |  ||||||||||||| | ||| ||||| || |  || ||||| |||||    
T  30775595 tgaaataagcaggcacagtgataactgcatttttaactggggattccaaatacatctctgcaatctctctcatatttgtgaggactattgatgaaatttc 30775694  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaac 321  Q
     |||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||||||    
T  30775695 ctcggcacagaggagtttctcctggcccttgaacttaagggaaatcatgggtttgtcattaacaccagaaacaaccttgaatggccacaac 30775785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 317
Target Start/End: Original strand, 35132691 - 35132975
Alignment:
Q  31 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatctacagtggctttccgctgataatcat 130  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||     
T  35132691 ccatatgcaaccgctgcggcagtaggttcattcattactctcataacattgggaccagcaatagcaccagcatctatagtggcttttcgttgagaatcac 35132790  T
Q  131 tgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggaaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgatatttc 230  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||  ||| |||   ||||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||| |||    
T  35132791 taaaataagcaggcacagtaacaactgcattcttaacagttgattctaaatatg--cctgcaatttctcgcatctttgtgagtaccatggatgatacttc 35132888  T
Q  231 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggcca 317  Q
    ||| ||| | || ||||| ||||   ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |  |||| | |||||||||| |||||    
T  35132889 ttccgcatagagttgcttttcctcatccttgtacttaaccgtaatcatgggtttgtcatttacaccggcagtgaccttgaatggcca 35132975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University