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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF18243_low_39 (Length: 433)
Name: NF18243_low_39
Description: NF18243
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF18243_low_39 |
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Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 37901966 - 37901550
Alignment:
| Q |
1 |
tccaaatattaaatgggatgtctttgagttgatgatgaggtattttggcagtctcccttttataacattttgacgtttctataatagggctctatatttg |
100 |
Q |
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| T |
37901966 |
tccaaatattaaatgggatgtctttgagttgatgatgaggtattttggcagtctcccttttataacattttgacgtttctataatagggctctatatttg |
37901867 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
37901866 |
aactgattttctgttgaaattttagatatatatacactggagcagtagatattgatttggatcttgctccggacctccttaaagctgcagatcaatatct |
37901767 |
T |
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| Q |
201 |
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300 |
Q |
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| T |
37901766 |
tcttgatggtcttaagagtctttgcgaatatgctatttctgaggtaggccacaacttgagtttcagttgcttttatttttgttgaatttttaatggttta |
37901667 |
T |
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| Q |
301 |
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400 |
Q |
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| T |
37901666 |
atttaatactgttaaattattcttgtaggatatttctgtggaaaatgtttcacagatgtatgtgatgtcagacacttttaatgctacatcattaagatat |
37901567 |
T |
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| Q |
401 |
gcatgcatactctttgt |
417 |
Q |
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| T |
37901566 |
gcatgcatactctttgt |
37901550 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 37908477 - 37908061
Alignment:
| Q |
1 |
tccaaatattaaatgggatgtctttgagttgatgatgaggtattttggcagtctcccttttataacattttgacgtttctataatagggctctatatttg |
100 |
Q |
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| T |
37908477 |
tccaaatattaaatgggatgtctttgagttgatgatgaggtattttggcagtctcccttttataacattttgacgtttctataatagggctctatatttg |
37908378 |
T |
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| Q |
101 |
aactgattttctgttgaaattttagatatatatacactggagcagtagatattgatttggatcttgctccggacctccttaaagctgcagatcaatatct |
200 |
Q |
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| T |
37908377 |
aactgattttctgttgaaattttagatatatatacactggagcagtagatattgatttggatcttgctccggacctccttaaagctgcagatcaatatct |
37908278 |
T |
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| Q |
201 |
tcttgatggtcttaagagtctttgcgaatatgctatttctgaggtaggccacaacttgagtttcagttgcttttatttttgttgaatttttaatggttta |
300 |
Q |
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| T |
37908277 |
tcttgatggtcttaagagtctttgcgaatatgctatttctgaggtaggccacaacttgagtttcagttgcttttatttttgttgaatttttaatggttta |
37908178 |
T |
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| Q |
301 |
atttaatactgttaaattattcttgtaggatatttctgtggaaaatgtttcacagatgtatgtgatgtcagacacttttaatgctacatcattaagatat |
400 |
Q |
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| T |
37908177 |
atttaatactgttaaattattcttgtaggatatttctgtggaaaatgtttcacagatgtatgtgatgtcagacacttttaatgctacatcattaagatat |
37908078 |
T |
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| Q |
401 |
gcatgcatactctttgt |
417 |
Q |
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| T |
37908077 |
gcatgcatactctttgt |
37908061 |
T |
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