View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18249_high_2 (Length: 511)

Name: NF18249_high_2
Description: NF18249
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18249_high_2
NF18249_high_2
[»] chr1 (244 HSPs)
chr1 (15-379)||(1210665-1211029)
chr1 (15-379)||(30202128-30202492)
chr1 (15-380)||(34792346-34792711)
chr1 (18-377)||(49347393-49347752)
chr1 (15-379)||(8671840-8672202)
chr1 (15-380)||(9592654-9593019)
chr1 (15-379)||(22090014-22090380)
chr1 (15-378)||(51440764-51441127)
chr1 (20-379)||(51601983-51602340)
chr1 (16-379)||(32230959-32231315)
chr1 (15-376)||(43240380-43240743)
chr1 (17-380)||(696191-696555)
chr1 (18-379)||(4001453-4001814)
chr1 (85-379)||(4029112-4029406)
chr1 (17-379)||(15085856-15086206)
chr1 (17-379)||(32082754-32083105)
chr1 (17-379)||(8391694-8392056)
chr1 (20-379)||(38807669-38808031)
chr1 (113-379)||(25979229-25979495)
chr1 (17-375)||(37462878-37463231)
chr1 (15-342)||(9509238-9509565)
chr1 (179-379)||(37311753-37311953)
chr1 (158-379)||(39318193-39318412)
chr1 (212-377)||(52921197-52921362)
chr1 (15-362)||(9599409-9599756)
chr1 (26-379)||(27847798-27848155)
chr1 (16-374)||(39140434-39140794)
chr1 (17-377)||(18469082-18469440)
chr1 (125-376)||(52561590-52561841)
chr1 (18-379)||(32404525-32404890)
chr1 (96-379)||(48431397-48431687)
chr1 (83-377)||(2544587-2544875)
chr1 (378-511)||(45647767-45647898)
chr1 (259-379)||(4707219-4707338)
chr1 (245-378)||(32079176-32079307)
chr1 (71-379)||(38868858-38869166)
chr1 (219-379)||(41560353-41560513)
chr1 (267-379)||(24020265-24020377)
chr1 (59-378)||(36623884-36624184)
chr1 (16-379)||(6025526-6025889)
chr1 (83-379)||(3818854-3819150)
chr1 (202-380)||(4415455-4415634)
chr1 (288-379)||(44751677-44751768)
chr1 (295-380)||(29577452-29577537)
chr1 (288-380)||(44941773-44941865)
chr1 (98-379)||(5338727-5338997)
chr1 (83-373)||(40416359-40416649)
chr1 (23-242)||(43423645-43423866)
chr1 (288-377)||(42337749-42337838)
chr1 (17-276)||(34827205-34827462)
chr1 (259-377)||(46423216-46423331)
chr1 (125-378)||(8796239-8796492)
chr1 (242-379)||(10200304-10200441)
chr1 (15-379)||(26016357-26016721)
chr1 (110-379)||(478695-478965)
chr1 (285-379)||(28090692-28090786)
chr1 (231-376)||(29128919-29129065)
chr1 (276-377)||(40568410-40568511)
chr1 (248-379)||(52532614-52532745)
chr1 (278-379)||(34444539-34444640)
chr1 (15-164)||(1661346-1661499)
chr1 (302-377)||(28533674-28533749)
chr1 (38-145)||(52561843-52561950)
chr1 (225-379)||(11941578-11941732)
chr1 (83-377)||(36339804-36340097)
chr1 (278-379)||(6084158-6084259)
chr1 (125-369)||(7762445-7762689)
chr1 (45-372)||(19908040-19908371)
chr1 (247-379)||(19936612-19936744)
chr1 (218-379)||(28511795-28511960)
chr1 (305-377)||(38877343-38877415)
chr1 (292-379)||(5113940-5114027)
chr1 (278-377)||(25715326-25715425)
chr1 (58-377)||(35828562-35828869)
chr1 (15-350)||(40419559-40419893)
chr1 (191-377)||(50806765-50806949)
chr1 (309-379)||(3777258-3777328)
chr1 (287-377)||(21769711-21769801)
chr1 (125-354)||(28528385-28528614)
chr1 (298-379)||(32111987-32112068)
chr1 (266-379)||(43375596-43375709)
chr1 (42-195)||(51812472-51812625)
chr1 (218-376)||(8342885-8343040)
chr1 (96-288)||(37263332-37263523)
chr1 (315-379)||(41165502-41165566)
chr1 (316-379)||(4318843-4318906)
chr1 (22-159)||(14226047-14226182)
chr1 (125-379)||(16272820-16273073)
chr1 (278-379)||(7133300-7133401)
chr1 (304-376)||(4590533-4590605)
chr1 (130-374)||(42501143-42501387)
chr1 (87-379)||(52832037-52832329)
chr1 (33-250)||(39894722-39894934)
chr1 (324-379)||(43481796-43481851)
chr1 (309-379)||(2914121-2914191)
chr1 (197-379)||(26299187-26299352)
chr1 (278-380)||(45510830-45510932)
chr1 (17-163)||(4379927-4380081)
chr1 (291-376)||(22175341-22175426)
chr1 (310-379)||(37430418-37430487)
chr1 (251-379)||(42539210-42539339)
chr1 (292-377)||(50257767-50257852)
chr1 (278-369)||(109002-109092)
chr1 (304-375)||(15437130-15437201)
chr1 (218-373)||(19908388-19908543)
chr1 (218-373)||(29577147-29577301)
chr1 (289-375)||(1290033-1290119)
chr1 (225-342)||(8676897-8677017)
chr1 (17-152)||(19936444-19936571)
chr1 (97-288)||(27637720-27637913)
chr1 (223-361)||(29807984-29808122)
chr1 (302-379)||(17268987-17269064)
chr1 (292-373)||(27072491-27072572)
chr1 (330-379)||(38758018-38758067)
chr1 (302-379)||(50846769-50846846)
chr1 (302-375)||(52073050-52073123)
chr1 (243-376)||(52292188-52292320)
chr1 (302-370)||(2429636-2429704)
chr1 (96-248)||(13827699-13827851)
chr1 (20-164)||(18793201-18793345)
chr1 (302-378)||(30396728-30396804)
chr1 (279-379)||(31274399-31274499)
chr1 (309-377)||(43028808-43028876)
chr1 (239-338)||(16142019-16142118)
chr1 (301-379)||(27704156-27704235)
chr1 (218-376)||(44008702-44008859)
chr1 (280-379)||(50636266-50636365)
chr1 (304-379)||(51584953-51585028)
chr1 (215-313)||(8628150-8628248)
chr1 (125-271)||(9002382-9002528)
chr1 (217-379)||(12930309-12930471)
chr1 (22-160)||(17815402-17815537)
chr1 (297-379)||(26113437-26113519)
chr1 (208-351)||(27520233-27520378)
chr1 (95-313)||(41611806-41612024)
chr1 (325-379)||(52814292-52814346)
chr1 (302-379)||(1704834-1704911)
chr1 (322-379)||(10569069-10569126)
chr1 (278-379)||(11584180-11584281)
chr1 (250-379)||(44905354-44905483)
chr1 (302-371)||(49377508-49377577)
chr1 (221-373)||(8203138-8203290)
chr1 (329-377)||(12231592-12231640)
chr1 (302-374)||(16943362-16943434)
chr1 (140-372)||(30833982-30834214)
chr1 (303-379)||(39525973-39526049)
chr1 (104-374)||(990469-990732)
chr1 (95-369)||(10272259-10272530)
chr1 (304-379)||(14224294-14224368)
chr1 (302-373)||(14225840-14225911)
chr1 (154-377)||(33560858-33561081)
chr1 (323-377)||(4380188-4380241)
chr1 (266-374)||(15438800-15438904)
chr1 (278-379)||(40920526-40920628)
chr1 (140-377)||(50771555-50771792)
chr1 (87-164)||(52073675-52073753)
chr1 (15-93)||(52442788-52442866)
chr1 (314-376)||(52815094-52815155)
chr1 (338-379)||(8809499-8809540)
chr1 (282-379)||(15706969-15707066)
chr1 (326-379)||(49051174-49051227)
chr1 (329-374)||(50830637-50830682)
chr1 (327-379)||(7082536-7082588)
chr1 (96-164)||(8343071-8343139)
chr1 (100-164)||(13827930-13827994)
chr1 (26-161)||(17275137-17275262)
chr1 (279-379)||(35672869-35672969)
chr1 (306-374)||(39797212-39797280)
chr1 (20-92)||(40920822-40920894)
chr1 (325-377)||(43898439-43898491)
chr1 (303-375)||(43934332-43934404)
chr1 (266-354)||(48865730-48865818)
chr1 (333-376)||(853782-853825)
chr1 (302-365)||(7083097-7083160)
chr1 (315-374)||(7210930-7210989)
chr1 (278-353)||(14557751-14557826)
chr1 (17-164)||(16943097-16943243)
chr1 (338-377)||(29975442-29975481)
chr1 (302-357)||(37294128-37294183)
chr1 (21-104)||(41611098-41611181)
chr1 (217-348)||(52878328-52878459)
chr1 (266-337)||(52900682-52900753)
chr1 (313-379)||(2728847-2728913)
chr1 (278-336)||(39776936-39776994)
chr1 (292-374)||(52981410-52981492)
chr1 (338-379)||(6757462-6757503)
chr1 (325-379)||(7601361-7601411)
chr1 (337-374)||(8725812-8725849)
chr1 (20-89)||(16142172-16142241)
chr1 (20-164)||(16822235-16822376)
chr1 (338-379)||(21519167-21519208)
chr1 (302-379)||(39123367-39123443)
chr1 (278-379)||(39515866-39515967)
chr1 (326-371)||(49062469-49062514)
chr1 (18-90)||(51234537-51234610)
chr1 (338-379)||(52901039-52901080)
chr1 (278-362)||(7124324-7124408)
chr1 (325-377)||(14732334-14732386)
chr1 (306-378)||(17640066-17640138)
chr1 (227-372)||(17815611-17815753)
chr1 (302-370)||(37429906-37429974)
chr1 (278-379)||(48861373-48861476)
chr1 (278-378)||(51812692-51812792)
chr1 (302-373)||(2694423-2694494)
chr1 (336-379)||(3059554-3059597)
chr1 (344-379)||(7913781-7913816)
chr1 (344-379)||(7922074-7922109)
chr1 (231-334)||(11331247-11331350)
chr1 (231-334)||(11489268-11489371)
chr1 (332-379)||(22319837-22319884)
chr1 (344-379)||(22930642-22930677)
chr1 (344-379)||(30985306-30985341)
chr1 (121-156)||(31274578-31274613)
chr1 (338-377)||(37831616-37831655)
chr1 (20-211)||(39422209-39422398)
chr1 (106-161)||(44905548-44905603)
chr1 (332-375)||(46388612-46388654)
chr1 (22-88)||(4590813-4590879)
chr1 (103-161)||(7921843-7921901)
chr1 (155-237)||(9602204-9602286)
chr1 (29-172)||(19908573-19908718)
chr1 (303-377)||(34863648-34863722)
chr1 (329-379)||(37099760-37099810)
chr1 (304-369)||(37263566-37263632)
chr1 (297-379)||(41017215-41017296)
chr1 (310-375)||(43598923-43598989)
chr1 (111-189)||(46388392-46388470)
chr1 (344-377)||(4298323-4298356)
chr1 (132-181)||(10569263-10569312)
chr1 (350-379)||(11572405-11572434)
chr1 (304-365)||(30445314-30445375)
chr1 (338-375)||(45168483-45168520)
chr1 (332-373)||(46395056-46395096)
chr1 (344-377)||(51173925-51173958)
chr1 (315-379)||(2001124-2001188)
chr1 (304-360)||(13578919-13578975)
chr1 (302-377)||(16822020-16822095)
chr1 (337-373)||(17028936-17028972)
chr1 (96-164)||(23791857-23791925)
chr1 (83-139)||(29578163-29578218)
chr1 (338-370)||(31012417-31012449)
chr1 (302-370)||(34375039-34375107)
chr1 (135-286)||(46226380-46226532)
chr1 (345-377)||(51432987-51433019)
[»] chr4 (255 HSPs)
chr4 (15-377)||(31959814-31960176)
chr4 (15-379)||(436149-436513)
chr4 (15-379)||(52569513-52569877)
chr4 (18-379)||(48174091-48174452)
chr4 (15-379)||(4440775-4441137)
chr4 (15-379)||(33227129-33227493)
chr4 (15-378)||(56375210-56375573)
chr4 (15-380)||(33190845-33191210)
chr4 (15-377)||(48622543-48622903)
chr4 (18-378)||(1777016-1777374)
chr4 (15-379)||(53707714-53708078)
chr4 (15-379)||(43433838-43434208)
chr4 (15-377)||(23906297-23906663)
chr4 (15-379)||(46582824-46583186)
chr4 (15-379)||(28236105-28236466)
chr4 (26-379)||(37797783-37798135)
chr4 (18-379)||(47265193-47265561)
chr4 (17-379)||(39100534-39100893)
chr4 (17-377)||(27450180-27450533)
chr4 (15-351)||(50286891-50287217)
chr4 (74-370)||(39708412-39708708)
chr4 (17-378)||(27983122-27983476)
chr4 (119-379)||(8286455-8286723)
chr4 (16-360)||(37773468-37773811)
chr4 (87-374)||(20192025-20192311)
chr4 (83-376)||(26037506-26037799)
chr4 (114-378)||(32479057-32479321)
chr4 (17-374)||(1793382-1793741)
chr4 (191-379)||(21236954-21237142)
chr4 (17-379)||(45204838-45205208)
chr4 (29-378)||(51421666-51422013)
chr4 (15-377)||(20591306-20591662)
chr4 (223-379)||(6957726-6957882)
chr4 (20-313)||(41009414-41009707)
chr4 (223-379)||(12494791-12494947)
chr4 (20-378)||(20601651-20602003)
chr4 (20-379)||(1211390-1211747)
chr4 (146-327)||(50679556-50679736)
chr4 (15-139)||(12494670-12494794)
chr4 (17-379)||(35690226-35690555)
chr4 (16-373)||(54470128-54470485)
chr4 (223-379)||(21528416-21528572)
chr4 (126-376)||(53518325-53518571)
chr4 (223-372)||(7947065-7947214)
chr4 (25-375)||(16002857-16003206)
chr4 (18-163)||(31458951-31459098)
chr4 (267-379)||(19154861-19154973)
chr4 (213-376)||(4548140-4548303)
chr4 (272-379)||(19969358-19969465)
chr4 (140-379)||(31961264-31961503)
chr4 (129-379)||(20821002-20821255)
chr4 (153-378)||(28351617-28351842)
chr4 (79-377)||(46372008-46372306)
chr4 (16-377)||(42639020-42639381)
chr4 (15-379)||(56224985-56225352)
chr4 (147-379)||(2589124-2589356)
chr4 (79-377)||(31897428-31897724)
chr4 (83-379)||(35555648-35555941)
chr4 (216-372)||(50862764-50862908)
chr4 (15-154)||(49987348-49987487)
chr4 (297-379)||(19061933-19062015)
chr4 (34-379)||(10208977-10209318)
chr4 (213-377)||(51811280-51811442)
chr4 (15-378)||(7092218-7092581)
chr4 (19-339)||(21106908-21107236)
chr4 (15-195)||(33709839-33710024)
chr4 (16-157)||(44047568-44047709)
chr4 (266-379)||(55007917-55008030)
chr4 (79-374)||(31339521-31339803)
chr4 (182-379)||(31459093-31459278)
chr4 (304-378)||(49939733-49939807)
chr4 (59-204)||(28497452-28497598)
chr4 (132-379)||(13805263-13805510)
chr4 (268-379)||(34208267-34208378)
chr4 (224-379)||(37488220-37488375)
chr4 (105-379)||(42285701-42285972)
chr4 (17-370)||(34233031-34233393)
chr4 (313-379)||(50238613-50238679)
chr4 (313-379)||(50238699-50238765)
chr4 (218-378)||(2557670-2557831)
chr4 (278-379)||(25575007-25575108)
chr4 (102-287)||(26356626-26356811)
chr4 (17-379)||(29398741-29399088)
chr4 (17-204)||(50662311-50662497)
chr4 (218-379)||(53540413-53540574)
chr4 (263-379)||(5306464-5306580)
chr4 (304-379)||(32633404-32633479)
chr4 (22-203)||(51252635-51252814)
chr4 (15-164)||(17900400-17900549)
chr4 (239-376)||(26024851-26024988)
chr4 (302-379)||(45209203-45209280)
chr4 (24-177)||(41192763-41192918)
chr4 (18-236)||(25257722-25257938)
chr4 (316-379)||(30634104-30634167)
chr4 (224-379)||(31043201-31043356)
chr4 (26-378)||(44360014-44360369)
chr4 (60-308)||(50680704-50680953)
chr4 (20-359)||(55578956-55579295)
chr4 (13-377)||(25755235-25755598)
chr4 (248-377)||(28550455-28550584)
chr4 (279-379)||(20105516-20105616)
chr4 (283-379)||(25427860-25427956)
chr4 (24-164)||(38570960-38571099)
chr4 (307-379)||(50869878-50869950)
chr4 (304-379)||(7066497-7066571)
chr4 (292-379)||(12443292-12443379)
chr4 (304-375)||(34585691-34585762)
chr4 (243-374)||(37042667-37042798)
chr4 (120-359)||(47372676-47372915)
chr4 (218-377)||(49987531-49987690)
chr4 (126-374)||(17666053-17666294)
chr4 (19-225)||(2588905-2589120)
chr4 (310-379)||(15661870-15661939)
chr4 (15-161)||(31403234-31403382)
chr4 (302-379)||(32339766-32339843)
chr4 (296-373)||(36255526-36255603)
chr4 (302-379)||(40932922-40932999)
chr4 (278-379)||(51438628-51438729)
chr4 (278-375)||(55388213-55388310)
chr4 (283-375)||(1095633-1095725)
chr4 (318-378)||(15665324-15665384)
chr4 (278-378)||(41192244-41192344)
chr4 (327-379)||(46153940-46153992)
chr4 (72-195)||(1427466-1427589)
chr4 (302-381)||(3979127-3979206)
chr4 (302-377)||(8284346-8284421)
chr4 (278-377)||(29209175-29209274)
chr4 (302-377)||(49738550-49738625)
chr4 (15-145)||(10775654-10775784)
chr4 (228-374)||(13296566-13296712)
chr4 (329-379)||(56130404-56130454)
chr4 (98-378)||(22420716-22420993)
chr4 (278-375)||(22873601-22873698)
chr4 (15-88)||(43070053-43070126)
chr4 (306-379)||(44719359-44719432)
chr4 (219-292)||(55809075-55809148)
chr4 (80-172)||(30621409-30621501)
chr4 (325-377)||(38017319-38017371)
chr4 (324-379)||(1328612-1328667)
chr4 (324-379)||(4879107-4879162)
chr4 (21-92)||(25967552-25967623)
chr4 (83-377)||(40018189-40018477)
chr4 (17-172)||(45175930-45176083)
chr4 (314-377)||(46236708-46236771)
chr4 (302-373)||(49686900-49686971)
chr4 (305-379)||(6958237-6958310)
chr4 (309-375)||(21359227-21359293)
chr4 (169-378)||(21945644-21945846)
chr4 (235-313)||(41009283-41009361)
chr4 (66-164)||(46715585-46715678)
chr4 (234-379)||(56439568-56439714)
chr4 (302-371)||(7544537-7544605)
chr4 (228-361)||(8598957-8599090)
chr4 (276-333)||(41729494-41729551)
chr4 (20-164)||(50471453-50471595)
chr4 (297-378)||(50967027-50967108)
chr4 (325-377)||(28348287-28348339)
chr4 (225-377)||(31403034-31403186)
chr4 (16-83)||(18966474-18966541)
chr4 (224-379)||(20999129-20999284)
chr4 (304-379)||(35622674-35622749)
chr4 (304-379)||(36556758-36556833)
chr4 (304-379)||(39446908-39446983)
chr4 (325-380)||(44047367-44047422)
chr4 (217-375)||(45184135-45184291)
chr4 (306-377)||(47372915-47372986)
chr4 (109-164)||(47611741-47611796)
chr4 (337-379)||(8327143-8327185)
chr4 (304-374)||(13262421-13262491)
chr4 (59-161)||(36557246-36557347)
chr4 (324-377)||(813147-813200)
chr4 (302-371)||(1965639-1965708)
chr4 (333-378)||(6478662-6478706)
chr4 (306-375)||(17900691-17900760)
chr4 (308-377)||(32613643-32613712)
chr4 (324-377)||(54529647-54529700)
chr4 (102-209)||(20131167-20131274)
chr4 (315-379)||(26275014-26275078)
chr4 (297-377)||(36799657-36799737)
chr4 (315-379)||(38585249-38585313)
chr4 (60-172)||(38903925-38904036)
chr4 (109-189)||(45185215-45185295)
chr4 (337-377)||(49416949-49416989)
chr4 (325-377)||(50471757-50471809)
chr4 (302-379)||(56200153-56200234)
chr4 (304-379)||(883358-883433)
chr4 (344-379)||(26772535-26772570)
chr4 (83-210)||(38266134-38266261)
chr4 (13-161)||(45423537-45423681)
chr4 (218-372)||(47147496-47147648)
chr4 (344-379)||(49454477-49454512)
chr4 (221-332)||(50287988-50288099)
chr4 (292-379)||(54963648-54963734)
chr4 (325-375)||(8598898-8598948)
chr4 (139-205)||(20605241-20605307)
chr4 (297-379)||(54935351-54935433)
chr4 (19-164)||(934649-934793)
chr4 (24-161)||(1380296-1380433)
chr4 (315-364)||(14623243-14623292)
chr4 (344-377)||(26357008-26357041)
chr4 (266-359)||(28486092-28486185)
chr4 (329-374)||(32630495-32630540)
chr4 (278-375)||(34379586-34379682)
chr4 (344-377)||(38789623-38789656)
chr4 (322-379)||(42293263-42293320)
chr4 (342-379)||(48451071-48451108)
chr4 (324-373)||(52359963-52360012)
chr4 (80-161)||(55768717-55768798)
chr4 (80-161)||(55832973-55833054)
chr4 (331-375)||(20047670-20047714)
chr4 (323-379)||(25959225-25959281)
chr4 (338-374)||(32745831-32745867)
chr4 (111-163)||(44860862-44860914)
chr4 (96-164)||(49738817-49738885)
chr4 (344-379)||(3601417-3601452)
chr4 (325-376)||(4136744-4136795)
chr4 (328-375)||(8459056-8459103)
chr4 (336-371)||(10536580-10536615)
chr4 (315-377)||(11400444-11400507)
chr4 (315-377)||(11410171-11410234)
chr4 (336-379)||(23294023-23294066)
chr4 (302-377)||(27338387-27338462)
chr4 (306-357)||(28467649-28467700)
chr4 (344-379)||(35585854-35585889)
chr4 (336-379)||(43774098-43774141)
chr4 (324-379)||(46539109-46539164)
chr4 (344-379)||(49370043-49370078)
chr4 (344-379)||(51051453-51051488)
chr4 (304-375)||(51550251-51550322)
chr4 (336-379)||(52357924-52357967)
chr4 (325-363)||(1380600-1380638)
chr4 (297-379)||(1989785-1989867)
chr4 (319-377)||(6931722-6931780)
chr4 (333-375)||(10775473-10775515)
chr4 (325-379)||(20654868-20654922)
chr4 (247-337)||(30621241-30621331)
chr4 (98-156)||(42293470-42293528)
chr4 (337-379)||(44940738-44940780)
chr4 (345-379)||(49416204-49416238)
chr4 (305-379)||(51176784-51176858)
chr4 (347-381)||(51879747-51879781)
chr4 (345-379)||(53413941-53413975)
chr4 (315-373)||(53517725-53517783)
chr4 (266-379)||(26510559-26510671)
chr4 (332-377)||(28764374-28764419)
chr4 (18-75)||(40933198-40933255)
chr4 (302-379)||(51841196-51841273)
chr4 (276-377)||(55768500-55768600)
chr4 (276-377)||(55832756-55832856)
chr4 (133-165)||(21214792-21214824)
chr4 (111-183)||(29182498-29182570)
chr4 (347-379)||(29283829-29283861)
chr4 (322-378)||(30662042-30662098)
chr4 (302-360)||(34809232-34809287)
chr4 (307-379)||(52227893-52227965)
[»] chr3 (207 HSPs)
chr3 (15-379)||(52138720-52139084)
chr3 (18-379)||(28245360-28245721)
chr3 (15-379)||(54278940-54279303)
chr3 (15-379)||(51447715-51448071)
chr3 (17-379)||(21995-22356)
chr3 (17-379)||(5168750-5169116)
chr3 (18-377)||(47233596-47233955)
chr3 (15-377)||(25191299-25191659)
chr3 (78-377)||(35033129-35033428)
chr3 (15-378)||(54128298-54128662)
chr3 (128-379)||(48508268-48508519)
chr3 (15-278)||(33272122-33272390)
chr3 (20-379)||(53519511-53519864)
chr3 (83-377)||(38850108-38850403)
chr3 (13-379)||(43694769-43695129)
chr3 (207-379)||(12096703-12096875)
chr3 (20-379)||(19676079-19676447)
chr3 (37-377)||(45289091-45289434)
chr3 (34-379)||(49503566-49503897)
chr3 (42-375)||(39600683-39601016)
chr3 (96-378)||(50960636-50960914)
chr3 (15-269)||(45728066-45728324)
chr3 (59-371)||(38430807-38431129)
chr3 (234-379)||(52156082-52156227)
chr3 (29-377)||(48734147-48734481)
chr3 (17-367)||(19736918-19737255)
chr3 (25-367)||(19757829-19758158)
chr3 (83-244)||(38060419-38060580)
chr3 (102-342)||(48953454-48953697)
chr3 (111-368)||(39235154-39235409)
chr3 (17-376)||(26490239-26490596)
chr3 (99-379)||(42510014-42510292)
chr3 (15-313)||(27917492-27917788)
chr3 (239-377)||(38060858-38060996)
chr3 (273-379)||(47555330-47555436)
chr3 (249-379)||(53262295-53262425)
chr3 (33-300)||(3186707-3186973)
chr3 (65-378)||(31454224-31454537)
chr3 (85-377)||(54364976-54365268)
chr3 (83-375)||(30294125-30294418)
chr3 (240-377)||(49042081-49042219)
chr3 (59-377)||(54424959-54425289)
chr3 (266-379)||(311307-311420)
chr3 (288-379)||(7895878-7895969)
chr3 (13-335)||(52678892-52679212)
chr3 (264-379)||(2133610-2133725)
chr3 (229-365)||(17022684-17022820)
chr3 (289-379)||(48532151-48532242)
chr3 (248-377)||(15296060-15296189)
chr3 (18-374)||(49841534-49841895)
chr3 (120-315)||(19162650-19162842)
chr3 (304-377)||(31566161-31566234)
chr3 (17-377)||(2340717-2341074)
chr3 (304-379)||(40273203-40273278)
chr3 (106-360)||(37351418-37351672)
chr3 (282-377)||(30797822-30797917)
chr3 (278-377)||(40106620-40106719)
chr3 (312-379)||(45834598-45834665)
chr3 (229-378)||(45486848-45487000)
chr3 (17-237)||(50249303-50249529)
chr3 (23-160)||(344928-345065)
chr3 (266-379)||(29601063-29601176)
chr3 (110-377)||(36303994-36304248)
chr3 (278-379)||(39208791-39208892)
chr3 (309-374)||(41529975-41530040)
chr3 (219-379)||(27893213-27893373)
chr3 (302-378)||(46148235-46148311)
chr3 (96-336)||(21200551-21200787)
chr3 (288-379)||(33271908-33271999)
chr3 (18-164)||(36820174-36820318)
chr3 (284-379)||(45374475-45374570)
chr3 (289-379)||(52927846-52927936)
chr3 (59-172)||(3987011-3987124)
chr3 (304-377)||(24778609-24778682)
chr3 (15-92)||(38850014-38850091)
chr3 (266-367)||(40116348-40116449)
chr3 (81-210)||(41842678-41842806)
chr3 (111-375)||(659541-659805)
chr3 (302-378)||(37083291-37083367)
chr3 (17-372)||(46431684-46432031)
chr3 (278-377)||(14415260-14415358)
chr3 (17-372)||(23534576-23534929)
chr3 (278-377)||(40991614-40991713)
chr3 (222-377)||(11284120-11284270)
chr3 (288-366)||(24541343-24541421)
chr3 (279-377)||(48712075-48712173)
chr3 (83-260)||(11581432-11581609)
chr3 (96-377)||(42026536-42026817)
chr3 (218-377)||(29475811-29475968)
chr3 (218-379)||(41482141-41482298)
chr3 (306-377)||(7278675-7278746)
chr3 (305-376)||(21862742-21862813)
chr3 (17-152)||(31337751-31337884)
chr3 (315-377)||(52882662-52882724)
chr3 (302-379)||(388260-388337)
chr3 (59-163)||(29600863-29600968)
chr3 (302-379)||(31146907-31146983)
chr3 (329-378)||(39512777-39512826)
chr3 (285-378)||(39781917-39782009)
chr3 (315-376)||(45468795-45468856)
chr3 (282-374)||(32170592-32170684)
chr3 (17-89)||(45236778-45236850)
chr3 (304-379)||(3987543-3987618)
chr3 (304-379)||(20208207-20208282)
chr3 (17-92)||(30345445-30345520)
chr3 (283-379)||(35420455-35420552)
chr3 (283-374)||(49045023-49045114)
chr3 (257-377)||(54422837-54422963)
chr3 (18-156)||(29817427-29817565)
chr3 (313-375)||(31452963-31453025)
chr3 (226-340)||(40116505-40116619)
chr3 (325-379)||(50249607-50249661)
chr3 (218-374)||(45493695-45493851)
chr3 (302-374)||(46367390-46367462)
chr3 (317-377)||(53214871-53214931)
chr3 (283-378)||(4472386-4472481)
chr3 (304-379)||(30332558-30332633)
chr3 (15-58)||(47542031-47542074)
chr3 (317-375)||(21427586-21427644)
chr3 (338-380)||(48259947-48259989)
chr3 (17-79)||(48953694-48953756)
chr3 (219-288)||(26990337-26990406)
chr3 (303-380)||(31260964-31261040)
chr3 (310-375)||(35481143-35481208)
chr3 (302-379)||(39535399-39535475)
chr3 (331-380)||(44102953-44103002)
chr3 (15-92)||(46568036-46568113)
chr3 (310-375)||(49888402-49888467)
chr3 (315-379)||(344770-344834)
chr3 (73-164)||(31453151-31453242)
chr3 (218-373)||(33755348-33755501)
chr3 (229-380)||(34844569-34844721)
chr3 (339-379)||(35701093-35701133)
chr3 (18-90)||(38054624-38054696)
chr3 (325-381)||(49933436-49933492)
chr3 (302-377)||(7120790-7120865)
chr3 (344-379)||(23610930-23610965)
chr3 (338-377)||(27192466-27192505)
chr3 (332-379)||(35032764-35032811)
chr3 (278-372)||(36049309-36049401)
chr3 (315-378)||(37102807-37102870)
chr3 (315-378)||(40672366-40672429)
chr3 (229-380)||(43308696-43308847)
chr3 (344-379)||(43529295-43529330)
chr3 (337-379)||(237294-237336)
chr3 (306-372)||(6988113-6988179)
chr3 (306-376)||(21427995-21428065)
chr3 (28-154)||(26388414-26388540)
chr3 (302-376)||(34719081-34719155)
chr3 (100-154)||(37534429-37534483)
chr3 (102-164)||(39535653-39535715)
chr3 (297-379)||(53266893-53266975)
chr3 (342-379)||(829149-829186)
chr3 (123-172)||(3870649-3870698)
chr3 (332-373)||(8566670-8566711)
chr3 (325-374)||(26990442-26990491)
chr3 (292-361)||(27795996-27796065)
chr3 (191-377)||(31337560-31337741)
chr3 (36-116)||(33307087-33307165)
chr3 (324-373)||(34253689-34253738)
chr3 (324-377)||(35465758-35465811)
chr3 (270-371)||(41842529-41842630)
chr3 (305-374)||(46140617-46140686)
chr3 (325-374)||(54485767-54485816)
chr3 (305-365)||(7942864-7942924)
chr3 (331-379)||(24084320-24084368)
chr3 (337-377)||(43396082-43396122)
chr3 (337-373)||(52077473-52077509)
chr3 (324-379)||(7446274-7446329)
chr3 (324-379)||(7454416-7454471)
chr3 (344-379)||(21000720-21000755)
chr3 (344-379)||(36764934-36764969)
chr3 (326-377)||(40122645-40122696)
chr3 (344-379)||(41230513-41230548)
chr3 (96-163)||(44134044-44134111)
chr3 (332-375)||(44443208-44443250)
chr3 (347-378)||(48328200-48328231)
chr3 (304-379)||(50631879-50631954)
chr3 (278-378)||(55244461-55244565)
chr3 (334-368)||(944467-944501)
chr3 (333-379)||(4660165-4660211)
chr3 (344-378)||(21506270-21506304)
chr3 (333-379)||(34067137-34067183)
chr3 (98-164)||(36868437-36868503)
chr3 (302-375)||(37598171-37598245)
chr3 (303-377)||(44133845-44133918)
chr3 (296-366)||(53951956-53952026)
chr3 (349-378)||(21513070-21513099)
chr3 (321-358)||(24103420-24103457)
chr3 (349-378)||(26874857-26874886)
chr3 (300-377)||(32052395-32052472)
chr3 (326-379)||(34812775-34812828)
chr3 (333-370)||(37102989-37103026)
chr3 (336-377)||(41965819-41965860)
chr3 (302-371)||(41971277-41971345)
chr3 (302-375)||(47804666-47804738)
chr3 (336-377)||(49090632-49090673)
chr3 (17-90)||(50621647-50621720)
chr3 (326-379)||(53266818-53266871)
chr3 (317-360)||(1512046-1512090)
chr3 (285-377)||(6780663-6780755)
chr3 (337-377)||(30305256-30305296)
chr3 (324-380)||(32052538-32052594)
chr3 (346-378)||(33034848-33034880)
chr3 (15-55)||(42510333-42510373)
chr3 (267-311)||(44571599-44571643)
chr3 (345-377)||(50891993-50892025)
[»] chr7 (225 HSPs)
chr7 (15-380)||(37617864-37618230)
chr7 (16-377)||(34869341-34869702)
chr7 (15-379)||(11593880-11594244)
chr7 (15-379)||(12841273-12841637)
chr7 (15-379)||(49029196-49029559)
chr7 (15-370)||(35906208-35906563)
chr7 (17-379)||(39906370-39906730)
chr7 (15-379)||(33349804-33350168)
chr7 (15-379)||(44855172-44855534)
chr7 (15-375)||(46355858-46356217)
chr7 (17-379)||(45836480-45836840)
chr7 (15-324)||(13859061-13859370)
chr7 (60-379)||(6374833-6375152)
chr7 (13-379)||(36651912-36652276)
chr7 (19-379)||(43281600-43281958)
chr7 (15-379)||(31005143-31005489)
chr7 (18-376)||(35558994-35559353)
chr7 (95-379)||(31682600-31682884)
chr7 (60-379)||(29650349-29650668)
chr7 (17-379)||(43491230-43491592)
chr7 (17-379)||(38606927-38607276)
chr7 (81-379)||(2885720-2886018)
chr7 (98-379)||(22349623-22349904)
chr7 (96-379)||(36869235-36869525)
chr7 (15-251)||(33072874-33073108)
chr7 (20-376)||(23404343-23404697)
chr7 (18-377)||(36136687-36137046)
chr7 (208-379)||(38900070-38900240)
chr7 (105-379)||(15682184-15682458)
chr7 (26-374)||(28627936-28628284)
chr7 (212-377)||(40979928-40980093)
chr7 (134-379)||(32631615-32631848)
chr7 (168-375)||(31681022-31681226)
chr7 (146-378)||(7273151-7273383)
chr7 (17-334)||(47848596-47848912)
chr7 (153-379)||(24598186-24598411)
chr7 (230-377)||(48919247-48919394)
chr7 (252-378)||(27648937-27649063)
chr7 (30-377)||(8492236-8492580)
chr7 (246-378)||(21078068-21078200)
chr7 (17-207)||(7272961-7273151)
chr7 (217-379)||(9210702-9210864)
chr7 (151-378)||(1011103-1011329)
chr7 (113-379)||(38135211-38135476)
chr7 (17-137)||(32630517-32630636)
chr7 (271-378)||(33073105-33073212)
chr7 (98-379)||(12966025-12966300)
chr7 (282-379)||(28208326-28208423)
chr7 (267-376)||(34035155-34035264)
chr7 (17-249)||(25579205-25579431)
chr7 (20-260)||(43282330-43282574)
chr7 (218-374)||(45601599-45601755)
chr7 (59-199)||(46014359-46014498)
chr7 (15-213)||(36514371-36514567)
chr7 (17-300)||(7189296-7189593)
chr7 (15-379)||(36101775-36102127)
chr7 (20-379)||(48735899-48736256)
chr7 (59-379)||(26741892-26742215)
chr7 (20-204)||(39811882-39812066)
chr7 (225-379)||(42187572-42187725)
chr7 (15-371)||(5335842-5336193)
chr7 (273-374)||(47852265-47852366)
chr7 (242-376)||(14057625-14057759)
chr7 (242-376)||(14367653-14367787)
chr7 (304-378)||(31869101-31869175)
chr7 (15-92)||(36869574-36869651)
chr7 (17-162)||(42187393-42187537)
chr7 (17-202)||(19262609-19262791)
chr7 (230-376)||(34745882-34746028)
chr7 (267-379)||(42969870-42969982)
chr7 (270-378)||(47652722-47652830)
chr7 (300-375)||(24777166-24777241)
chr7 (282-376)||(24177628-24177721)
chr7 (15-110)||(24598409-24598508)
chr7 (313-379)||(40630652-40630718)
chr7 (15-379)||(14593681-14594036)
chr7 (83-163)||(27021906-27021986)
chr7 (15-163)||(28020884-28021032)
chr7 (252-379)||(28355322-28355450)
chr7 (15-164)||(30200176-30200321)
chr7 (278-377)||(33732017-33732114)
chr7 (96-204)||(40169650-40169758)
chr7 (142-349)||(1569063-1569270)
chr7 (239-374)||(40149016-40149150)
chr7 (269-379)||(33103100-33103210)
chr7 (266-379)||(27893561-27893674)
chr7 (310-379)||(28708596-28708665)
chr7 (307-380)||(31840442-31840515)
chr7 (228-377)||(37976368-37976517)
chr7 (215-379)||(44951274-44951439)
chr7 (130-379)||(48202701-48202949)
chr7 (278-377)||(34341395-34341494)
chr7 (257-377)||(40415169-40415295)
chr7 (192-378)||(19119423-19119608)
chr7 (297-379)||(25891090-25891172)
chr7 (302-379)||(4604754-4604831)
chr7 (239-340)||(36239833-36239934)
chr7 (302-379)||(48515482-48515559)
chr7 (315-379)||(5418294-5418358)
chr7 (315-375)||(6263479-6263539)
chr7 (15-164)||(16013204-16013357)
chr7 (304-376)||(34029677-34029749)
chr7 (281-361)||(34926538-34926618)
chr7 (228-376)||(38103616-38103762)
chr7 (15-203)||(1740717-1740909)
chr7 (101-378)||(7220750-7221039)
chr7 (266-377)||(8519046-8519157)
chr7 (304-379)||(16013484-16013559)
chr7 (282-377)||(30814125-30814220)
chr7 (96-167)||(38920795-38920866)
chr7 (151-378)||(1531372-1531587)
chr7 (118-252)||(6420615-6420749)
chr7 (218-380)||(24549686-24549847)
chr7 (305-379)||(33281097-33281170)
chr7 (278-379)||(2882734-2882835)
chr7 (302-379)||(41483694-41483771)
chr7 (59-164)||(41948480-41948585)
chr7 (305-377)||(20158671-20158743)
chr7 (266-377)||(28541943-28542055)
chr7 (315-379)||(29312209-29312273)
chr7 (319-379)||(29318793-29318853)
chr7 (315-379)||(47700054-47700117)
chr7 (324-379)||(20525050-20525105)
chr7 (228-379)||(47796150-47796301)
chr7 (96-286)||(18605237-18605427)
chr7 (332-378)||(21244282-21244328)
chr7 (149-379)||(33139208-33139437)
chr7 (96-194)||(35713696-35713794)
chr7 (297-374)||(36245259-36245336)
chr7 (304-377)||(45558539-45558611)
chr7 (305-365)||(17759483-17759543)
chr7 (315-375)||(30144975-30145035)
chr7 (304-377)||(38921086-38921161)
chr7 (302-374)||(39812145-39812217)
chr7 (15-164)||(40830148-40830292)
chr7 (85-161)||(45558352-45558428)
chr7 (308-379)||(1523856-1523927)
chr7 (304-379)||(6807700-6807775)
chr7 (228-331)||(21517426-21517529)
chr7 (304-379)||(35865912-35865987)
chr7 (325-376)||(39738446-39738497)
chr7 (302-377)||(40138948-40139023)
chr7 (15-172)||(40139124-40139278)
chr7 (303-378)||(41461318-41461393)
chr7 (222-357)||(43281958-43282092)
chr7 (42-154)||(47796359-47796473)
chr7 (26-92)||(1523747-1523813)
chr7 (96-286)||(18637563-18637753)
chr7 (96-286)||(18650997-18651187)
chr7 (297-375)||(24376025-24376103)
chr7 (297-379)||(48515373-48515455)
chr7 (318-379)||(17907722-17907783)
chr7 (266-379)||(25731472-25731585)
chr7 (306-379)||(28021146-28021219)
chr7 (302-379)||(40008429-40008506)
chr7 (87-210)||(5418071-5418195)
chr7 (325-369)||(6682583-6682627)
chr7 (335-379)||(20899411-20899455)
chr7 (20-92)||(27021991-27022063)
chr7 (96-300)||(28562443-28562647)
chr7 (327-379)||(30199965-30200017)
chr7 (278-377)||(32879192-32879292)
chr7 (339-379)||(43423989-43424029)
chr7 (279-338)||(6807388-6807447)
chr7 (218-349)||(22174123-22174254)
chr7 (266-337)||(31859046-31859117)
chr7 (344-379)||(35725569-35725604)
chr7 (248-355)||(40391845-40391952)
chr7 (224-375)||(40830331-40830481)
chr7 (218-340)||(44401164-44401284)
chr7 (302-369)||(45054311-45054378)
chr7 (25-152)||(45841206-45841332)
chr7 (344-379)||(47413713-47413748)
chr7 (278-380)||(3457544-3457645)
chr7 (15-164)||(24549906-24550049)
chr7 (149-227)||(26925264-26925342)
chr7 (113-203)||(30144793-30144883)
chr7 (302-376)||(30914503-30914577)
chr7 (344-378)||(33650869-33650903)
chr7 (302-372)||(33871479-33871549)
chr7 (325-379)||(45840994-45841048)
chr7 (334-379)||(12241684-12241728)
chr7 (304-377)||(25578069-25578142)
chr7 (324-377)||(25579103-25579156)
chr7 (85-162)||(30632958-30633035)
chr7 (297-377)||(45903916-45903997)
chr7 (307-379)||(475987-476059)
chr7 (98-202)||(3457368-3457471)
chr7 (343-379)||(3928344-3928380)
chr7 (302-378)||(19262457-19262533)
chr7 (325-381)||(26847836-26847892)
chr7 (307-379)||(27021723-27021795)
chr7 (337-377)||(35734691-35734731)
chr7 (337-377)||(41157897-41157937)
chr7 (218-378)||(42177018-42177177)
chr7 (125-172)||(9797909-9797956)
chr7 (97-156)||(27893769-27893828)
chr7 (96-171)||(30914674-30914749)
chr7 (33-92)||(35713617-35713676)
chr7 (249-372)||(35922407-35922530)
chr7 (71-138)||(37439580-37439647)
chr7 (338-376)||(635309-635347)
chr7 (344-378)||(5577498-5577532)
chr7 (344-374)||(30188512-30188542)
chr7 (317-379)||(35066744-35066805)
chr7 (336-378)||(38504695-38504737)
chr7 (17-158)||(40008636-40008777)
chr7 (324-378)||(41948724-41948778)
chr7 (337-375)||(48735683-48735721)
chr7 (96-164)||(6429156-6429225)
chr7 (83-152)||(23720829-23720898)
chr7 (34-91)||(25731639-25731696)
chr7 (59-164)||(25826683-25826788)
chr7 (310-351)||(37595891-37595932)
chr7 (64-137)||(42177255-42177328)
chr7 (342-375)||(43653184-43653217)
chr7 (344-373)||(44930960-44930989)
chr7 (325-366)||(47155183-47155224)
chr7 (301-378)||(47185807-47185883)
chr7 (337-377)||(28359495-28359535)
chr7 (61-189)||(28858012-28858138)
chr7 (347-379)||(29012335-29012367)
chr7 (315-379)||(29013153-29013217)
chr7 (27-87)||(29653844-29653904)
chr7 (334-374)||(30425134-30425174)
[»] chr8 (204 HSPs)
chr8 (15-380)||(36565238-36565603)
chr8 (15-379)||(36545067-36545433)
chr8 (61-379)||(11523721-11524040)
chr8 (15-376)||(36394949-36395312)
chr8 (15-379)||(40813242-40813608)
chr8 (15-379)||(39946777-39947132)
chr8 (17-379)||(42854002-42854364)
chr8 (97-374)||(12491141-12491418)
chr8 (18-376)||(2796478-2796838)
chr8 (17-378)||(18125097-18125454)
chr8 (42-379)||(21121105-21121429)
chr8 (17-377)||(45419161-45419517)
chr8 (17-379)||(37077687-37078033)
chr8 (169-379)||(42469725-42469935)
chr8 (67-374)||(8932676-8932982)
chr8 (18-377)||(29520583-29520931)
chr8 (17-377)||(8879446-8879800)
chr8 (196-379)||(2027631-2027814)
chr8 (245-378)||(25473402-25473535)
chr8 (27-379)||(32043522-32043871)
chr8 (115-377)||(26904908-26905168)
chr8 (222-379)||(14742080-14742234)
chr8 (17-255)||(18751998-18752233)
chr8 (15-378)||(39953263-39953626)
chr8 (266-377)||(44529396-44529507)
chr8 (268-379)||(44047530-44047641)
chr8 (98-342)||(43904700-43904947)
chr8 (120-379)||(30559718-30559982)
chr8 (104-379)||(32930970-32931244)
chr8 (87-353)||(29700268-29700534)
chr8 (257-379)||(15215410-15215532)
chr8 (266-379)||(490506-490619)
chr8 (18-289)||(10079995-10080264)
chr8 (185-376)||(35362651-35362842)
chr8 (106-379)||(35643606-35643872)
chr8 (153-373)||(12025847-12026058)
chr8 (15-375)||(16917104-16917462)
chr8 (247-378)||(45041315-45041445)
chr8 (15-161)||(13171865-13172011)
chr8 (17-371)||(16351312-16351653)
chr8 (223-379)||(23492163-23492318)
chr8 (243-376)||(25288912-25289045)
chr8 (243-376)||(25300247-25300380)
chr8 (224-377)||(35914601-35914754)
chr8 (17-313)||(45512558-45512856)
chr8 (218-377)||(2216411-2216568)
chr8 (19-189)||(6510616-6510784)
chr8 (15-198)||(30748379-30748560)
chr8 (17-379)||(5908564-5908930)
chr8 (46-195)||(7046285-7046434)
chr8 (218-379)||(43733330-43733490)
chr8 (288-380)||(10668494-10668586)
chr8 (305-380)||(1928584-1928659)
chr8 (15-89)||(12492130-12492204)
chr8 (217-379)||(28169514-28169675)
chr8 (131-379)||(42584407-42584642)
chr8 (179-375)||(7531646-7531842)
chr8 (126-319)||(9904940-9905132)
chr8 (218-379)||(30198264-30198425)
chr8 (218-379)||(30812814-30812975)
chr8 (303-379)||(32276893-32276969)
chr8 (299-379)||(32569708-32569788)
chr8 (278-374)||(44699649-44699745)
chr8 (47-162)||(9695583-9695698)
chr8 (267-379)||(31715992-31716106)
chr8 (29-164)||(44681252-44681387)
chr8 (64-165)||(12796912-12797011)
chr8 (267-377)||(26363660-26363768)
chr8 (233-379)||(39967497-39967643)
chr8 (19-172)||(2518597-2518749)
chr8 (302-379)||(27556300-27556377)
chr8 (17-158)||(30113416-30113557)
chr8 (15-233)||(39760572-39760786)
chr8 (217-376)||(3801995-3802154)
chr8 (302-377)||(12611704-12611779)
chr8 (17-92)||(15215556-15215631)
chr8 (288-379)||(8255529-8255622)
chr8 (243-376)||(14459043-14459177)
chr8 (15-109)||(25288822-25288916)
chr8 (15-109)||(25300157-25300251)
chr8 (278-379)||(3473753-3473854)
chr8 (83-378)||(13589474-13589762)
chr8 (315-380)||(35323993-35324058)
chr8 (325-373)||(26055651-26055699)
chr8 (292-376)||(36143538-36143622)
chr8 (302-377)||(35646930-35647005)
chr8 (224-351)||(38391919-38392046)
chr8 (324-379)||(41031418-41031473)
chr8 (324-379)||(41031524-41031579)
chr8 (192-306)||(5266027-5266140)
chr8 (100-210)||(10824331-10824441)
chr8 (15-210)||(36143289-36143480)
chr8 (12-158)||(39051059-39051205)
chr8 (18-147)||(42493536-42493663)
chr8 (330-379)||(1064955-1065004)
chr8 (278-379)||(21425229-21425330)
chr8 (15-148)||(30456441-30456573)
chr8 (302-379)||(30689942-30690019)
chr8 (17-378)||(30783041-30783400)
chr8 (315-380)||(39651025-39651090)
chr8 (302-374)||(1313771-1313843)
chr8 (17-137)||(13986416-13986536)
chr8 (223-379)||(14903689-14903845)
chr8 (302-379)||(41212068-41212147)
chr8 (278-380)||(43350728-43350827)
chr8 (304-379)||(36042407-36042482)
chr8 (304-379)||(38901817-38901892)
chr8 (83-164)||(2776442-2776524)
chr8 (98-164)||(18474173-18474239)
chr8 (36-245)||(25985462-25985668)
chr8 (215-297)||(28269759-28269840)
chr8 (306-371)||(18741843-18741908)
chr8 (306-371)||(18746807-18746872)
chr8 (267-376)||(36069774-36069883)
chr8 (220-379)||(39388907-39389070)
chr8 (218-379)||(41444337-41444501)
chr8 (326-378)||(4558207-4558259)
chr8 (219-379)||(16994442-16994602)
chr8 (226-342)||(17491689-17491805)
chr8 (304-376)||(18473973-18474045)
chr8 (224-379)||(79156-79310)
chr8 (324-379)||(12985919-12985974)
chr8 (221-377)||(23023351-23023509)
chr8 (325-380)||(31309583-31309638)
chr8 (328-379)||(35085135-35085186)
chr8 (324-379)||(40982894-40982949)
chr8 (59-210)||(44373740-44373891)
chr8 (315-378)||(45512443-45512506)
chr8 (43-164)||(78988-79112)
chr8 (278-380)||(10824186-10824288)
chr8 (282-360)||(16035744-16035822)
chr8 (338-379)||(24837934-24837975)
chr8 (336-377)||(30980058-30980099)
chr8 (329-377)||(4061897-4061945)
chr8 (325-377)||(9695815-9695867)
chr8 (327-379)||(16921451-16921503)
chr8 (96-164)||(25985813-25985880)
chr8 (96-156)||(41444547-41444607)
chr8 (17-164)||(41971991-41972134)
chr8 (304-375)||(2518400-2518471)
chr8 (273-376)||(3464172-3464274)
chr8 (325-380)||(5057596-5057651)
chr8 (336-379)||(9842361-9842404)
chr8 (307-378)||(12692239-12692310)
chr8 (325-368)||(14742847-14742890)
chr8 (344-379)||(16918494-16918529)
chr8 (241-300)||(25439471-25439530)
chr8 (336-379)||(32978115-32978158)
chr8 (325-379)||(1549389-1549443)
chr8 (239-377)||(4955335-4955473)
chr8 (20-90)||(16252860-16252930)
chr8 (201-379)||(24399788-24399965)
chr8 (278-380)||(30748646-30748748)
chr8 (158-260)||(38178377-38178479)
chr8 (129-374)||(3079609-3079850)
chr8 (342-375)||(5030418-5030451)
chr8 (59-150)||(33666726-33666814)
chr8 (305-378)||(35320399-35320472)
chr8 (304-373)||(39702163-39702232)
chr8 (306-379)||(42493428-42493501)
chr8 (315-379)||(1070279-1070343)
chr8 (325-377)||(3638335-3638387)
chr8 (302-378)||(5810277-5810353)
chr8 (325-377)||(16971772-16971824)
chr8 (278-366)||(18742034-18742122)
chr8 (278-366)||(18746998-18747086)
chr8 (17-92)||(29735728-29735804)
chr8 (18-318)||(33827816-33828116)
chr8 (22-90)||(36069570-36069638)
chr8 (324-375)||(1335555-1335606)
chr8 (83-162)||(6483245-6483324)
chr8 (99-138)||(7103274-7103313)
chr8 (59-210)||(11733711-11733862)
chr8 (344-379)||(16008393-16008428)
chr8 (302-373)||(16715480-16715551)
chr8 (221-376)||(27037761-27037915)
chr8 (87-158)||(34196064-34196135)
chr8 (333-379)||(4011484-4011530)
chr8 (302-379)||(5127299-5127377)
chr8 (333-375)||(5205413-5205455)
chr8 (336-377)||(14744522-14744564)
chr8 (22-88)||(25439394-25439460)
chr8 (302-372)||(26639233-26639303)
chr8 (102-164)||(29645044-29645106)
chr8 (304-342)||(30456329-30456367)
chr8 (333-379)||(39049825-39049871)
chr8 (344-377)||(2938342-2938375)
chr8 (83-164)||(23023231-23023312)
chr8 (344-377)||(25439552-25439585)
chr8 (336-377)||(27449183-27449224)
chr8 (344-377)||(32838891-32838924)
chr8 (266-379)||(33076295-33076408)
chr8 (336-377)||(40640609-40640650)
chr8 (337-378)||(41604656-41604697)
chr8 (339-379)||(1489753-1489793)
chr8 (331-379)||(18626977-18627025)
chr8 (278-366)||(18737149-18737237)
chr8 (215-247)||(28255022-28255054)
chr8 (219-255)||(29709821-29709857)
chr8 (122-338)||(29735834-29736050)
chr8 (104-172)||(38689547-38689615)
chr8 (325-373)||(39051372-39051420)
chr8 (346-374)||(43903921-43903949)
chr8 (329-377)||(44456991-44457039)
[»] chr6 (114 HSPs)
chr6 (15-379)||(28085296-28085660)
chr6 (15-379)||(32755839-32756205)
chr6 (17-374)||(30031178-30031535)
chr6 (21-379)||(5258146-5258506)
chr6 (17-377)||(35043441-35043801)
chr6 (17-376)||(608081-608442)
chr6 (17-377)||(9706698-9707052)
chr6 (17-379)||(20427634-20427996)
chr6 (67-379)||(12890556-12890859)
chr6 (17-378)||(9593709-9594072)
chr6 (18-337)||(5631741-5632064)
chr6 (15-379)||(14030726-14031079)
chr6 (41-377)||(21351837-21352171)
chr6 (17-249)||(10099987-10100217)
chr6 (106-379)||(30679417-30679680)
chr6 (218-379)||(34143763-34143924)
chr6 (218-379)||(34156379-34156540)
chr6 (97-334)||(33496963-33497198)
chr6 (15-379)||(28026827-28027187)
chr6 (265-377)||(34934830-34934942)
chr6 (263-379)||(31818999-31819115)
chr6 (217-377)||(5095956-5096116)
chr6 (24-342)||(6055806-6056123)
chr6 (144-272)||(7133795-7133923)
chr6 (144-272)||(7136718-7136846)
chr6 (167-338)||(5080912-5081083)
chr6 (258-379)||(3206457-3206578)
chr6 (218-379)||(34503-34664)
chr6 (101-377)||(2689646-2689915)
chr6 (17-128)||(5080777-5080888)
chr6 (246-379)||(10098894-10099025)
chr6 (96-377)||(31818533-31818813)
chr6 (16-379)||(10617232-10617586)
chr6 (15-164)||(33083978-33084127)
chr6 (17-233)||(26291700-26291917)
chr6 (103-342)||(24665818-24666058)
chr6 (304-375)||(30789076-30789147)
chr6 (257-379)||(5897619-5897741)
chr6 (23-183)||(9568588-9568750)
chr6 (299-377)||(1615223-1615301)
chr6 (218-378)||(8364679-8364839)
chr6 (142-379)||(579465-579702)
chr6 (85-379)||(7513387-7513683)
chr6 (257-375)||(7492551-7492669)
chr6 (283-379)||(4245870-4245966)
chr6 (306-377)||(12119642-12119714)
chr6 (278-378)||(12133901-12134001)
chr6 (304-379)||(38980-39055)
chr6 (17-255)||(25493972-25494210)
chr6 (71-189)||(2079317-2079434)
chr6 (15-93)||(33998288-33998366)
chr6 (103-379)||(6293390-6293660)
chr6 (305-374)||(21886314-21886383)
chr6 (306-379)||(30642980-30643053)
chr6 (324-377)||(33730194-33730247)
chr6 (98-158)||(8364575-8364635)
chr6 (302-374)||(21089604-21089676)
chr6 (304-379)||(1008050-1008124)
chr6 (280-379)||(9568884-9568982)
chr6 (306-377)||(18130814-18130885)
chr6 (218-376)||(33997545-33997703)
chr6 (22-158)||(6641628-6641764)
chr6 (302-378)||(32945455-32945531)
chr6 (17-105)||(33496106-33496194)
chr6 (16-91)||(5129123-5129198)
chr6 (278-369)||(5983814-5983905)
chr6 (302-378)||(7337192-7337270)
chr6 (306-377)||(23888478-23888549)
chr6 (337-380)||(24698854-24698897)
chr6 (310-369)||(32068635-32068694)
chr6 (302-380)||(9109506-9109584)
chr6 (324-378)||(29900275-29900329)
chr6 (302-379)||(586057-586134)
chr6 (238-379)||(1747944-1748084)
chr6 (17-111)||(2065018-2065116)
chr6 (319-376)||(5053750-5053807)
chr6 (38-135)||(5095816-5095913)
chr6 (15-163)||(12134115-12134263)
chr6 (87-151)||(21870299-21870363)
chr6 (304-367)||(10453272-10453335)
chr6 (327-378)||(29931068-29931119)
chr6 (302-357)||(32080676-32080731)
chr6 (302-369)||(32097944-32098011)
chr6 (103-380)||(43049-43326)
chr6 (292-338)||(1911577-1911623)
chr6 (324-377)||(6692696-6692749)
chr6 (325-374)||(21870069-21870118)
chr6 (331-372)||(29354741-29354782)
chr6 (304-361)||(33084138-33084195)
chr6 (17-81)||(2689578-2689642)
chr6 (343-379)||(3127274-3127310)
chr6 (26-172)||(7150526-7150669)
chr6 (292-351)||(413280-413339)
chr6 (324-379)||(2307854-2307909)
chr6 (344-379)||(4878295-4878330)
chr6 (326-377)||(7150311-7150362)
chr6 (292-359)||(7513008-7513075)
chr6 (97-379)||(31831857-31832139)
chr6 (337-379)||(451947-451989)
chr6 (302-372)||(2079488-2079558)
chr6 (266-336)||(14389202-14389272)
chr6 (345-379)||(21531802-21531836)
chr6 (337-379)||(27840048-27840090)
chr6 (344-378)||(31434441-31434475)
chr6 (185-246)||(3963889-3963950)
chr6 (15-56)||(6293690-6293731)
chr6 (232-288)||(38900-38956)
chr6 (278-374)||(655397-655493)
chr6 (325-373)||(4240386-4240433)
chr6 (305-361)||(8021265-8021321)
chr6 (104-248)||(9749353-9749497)
chr6 (347-379)||(10422704-10422736)
chr6 (318-378)||(30537218-30537278)
chr6 (295-379)||(30856726-30856810)
[»] chr5 (178 HSPs)
chr5 (21-379)||(4496308-4496668)
chr5 (15-379)||(12492382-12492749)
chr5 (15-378)||(24178430-24178793)
chr5 (15-378)||(1287578-1287951)
chr5 (15-379)||(28976857-28977219)
chr5 (15-375)||(2075475-2075836)
chr5 (15-379)||(10639217-10639586)
chr5 (15-379)||(1275185-1275548)
chr5 (60-370)||(38684932-38685242)
chr5 (17-377)||(3301766-3302126)
chr5 (17-377)||(16347380-16347738)
chr5 (98-376)||(20456776-20457054)
chr5 (43-379)||(14665658-14665996)
chr5 (15-379)||(34272942-34273297)
chr5 (153-379)||(2915494-2915719)
chr5 (26-379)||(26884687-26885040)
chr5 (226-379)||(29816513-29816666)
chr5 (184-380)||(13561383-13561579)
chr5 (127-373)||(38501422-38501668)
chr5 (191-375)||(14911268-14911452)
chr5 (59-330)||(14749271-14749542)
chr5 (239-377)||(16913882-16914021)
chr5 (17-378)||(27816-28165)
chr5 (275-379)||(30213755-30213859)
chr5 (83-379)||(79501-79797)
chr5 (15-337)||(36215420-36215730)
chr5 (59-380)||(7359258-7359577)
chr5 (59-379)||(6859345-6859665)
chr5 (87-372)||(2712936-2713213)
chr5 (268-378)||(5558314-5558424)
chr5 (33-368)||(6888931-6889267)
chr5 (83-379)||(14667751-14668055)
chr5 (42-288)||(31636009-31636253)
chr5 (17-345)||(32516480-32516805)
chr5 (248-379)||(28276391-28276522)
chr5 (16-313)||(17340500-17340798)
chr5 (73-377)||(43557833-43558133)
chr5 (266-379)||(418032-418145)
chr5 (17-378)||(7678402-7678760)
chr5 (98-379)||(43475243-43475523)
chr5 (102-377)||(1525651-1525923)
chr5 (224-379)||(11675658-11675814)
chr5 (306-381)||(408490-408565)
chr5 (15-374)||(11002424-11002783)
chr5 (106-360)||(30588460-30588712)
chr5 (218-365)||(9235172-9235316)
chr5 (26-158)||(15168721-15168855)
chr5 (18-246)||(21952274-21952508)
chr5 (19-375)||(10082747-10083096)
chr5 (289-378)||(38132531-38132619)
chr5 (238-378)||(2090556-2090696)
chr5 (286-378)||(18855798-18855890)
chr5 (299-379)||(42576214-42576294)
chr5 (304-379)||(28411885-28411960)
chr5 (220-379)||(29922409-29922568)
chr5 (256-379)||(39040917-39041040)
chr5 (257-379)||(2393039-2393160)
chr5 (292-374)||(7640510-7640592)
chr5 (218-376)||(12576861-12577019)
chr5 (219-368)||(15588399-15588546)
chr5 (278-379)||(32442124-32442224)
chr5 (292-380)||(9400708-9400796)
chr5 (80-260)||(15489609-15489789)
chr5 (263-379)||(20367061-20367177)
chr5 (86-378)||(38684471-38684763)
chr5 (304-375)||(3442873-3442944)
chr5 (245-315)||(2552932-2553002)
chr5 (50-255)||(42199243-42199446)
chr5 (305-378)||(42272687-42272760)
chr5 (44-172)||(418190-418318)
chr5 (132-379)||(9917458-9917695)
chr5 (309-377)||(27386554-27386622)
chr5 (96-164)||(33667217-33667285)
chr5 (15-102)||(20318907-20318989)
chr5 (297-379)||(5860036-5860118)
chr5 (297-379)||(11069160-11069242)
chr5 (233-378)||(5303582-5303730)
chr5 (96-379)||(18350900-18351189)
chr5 (96-260)||(28676596-28676760)
chr5 (303-379)||(32366186-32366262)
chr5 (279-379)||(38830504-38830603)
chr5 (302-377)||(28186782-28186857)
chr5 (280-378)||(2645175-2645273)
chr5 (15-89)||(28186956-28187030)
chr5 (324-378)||(36551375-36551429)
chr5 (266-379)||(41894237-41894357)
chr5 (231-377)||(42504247-42504393)
chr5 (308-377)||(9121078-9121147)
chr5 (122-235)||(15986879-15986992)
chr5 (222-375)||(33667562-33667715)
chr5 (302-379)||(36123180-36123257)
chr5 (302-379)||(41200344-41200421)
chr5 (18-138)||(219692-219812)
chr5 (125-360)||(23979976-23980209)
chr5 (221-377)||(27998567-27998723)
chr5 (304-372)||(28985292-28985360)
chr5 (106-359)||(29938126-29938374)
chr5 (315-379)||(39322077-39322141)
chr5 (217-376)||(25938091-25938250)
chr5 (304-375)||(27800037-27800108)
chr5 (315-377)||(218052-218114)
chr5 (197-311)||(15168873-15168987)
chr5 (122-248)||(36200769-36200894)
chr5 (324-377)||(3000968-3001021)
chr5 (324-377)||(9234115-9234168)
chr5 (26-163)||(31906592-31906729)
chr5 (303-377)||(41108727-41108803)
chr5 (24-92)||(5305545-5305613)
chr5 (218-378)||(6788190-6788349)
chr5 (132-236)||(11675547-11675651)
chr5 (309-381)||(43423492-43423563)
chr5 (324-375)||(10668569-10668620)
chr5 (115-210)||(21093772-21093867)
chr5 (309-379)||(32006161-32006232)
chr5 (151-290)||(33157918-33158057)
chr5 (18-117)||(34039960-34040059)
chr5 (153-336)||(43035039-43035222)
chr5 (324-373)||(8081967-8082017)
chr5 (281-379)||(21193650-21193748)
chr5 (306-376)||(30639717-30639787)
chr5 (15-77)||(36200702-36200764)
chr5 (282-379)||(683699-683796)
chr5 (310-379)||(4026326-4026395)
chr5 (336-377)||(10989085-10989126)
chr5 (338-379)||(13606995-13607036)
chr5 (281-366)||(15252755-15252840)
chr5 (329-377)||(7367172-7367220)
chr5 (217-313)||(14725640-14725736)
chr5 (99-163)||(37065533-37065597)
chr5 (278-370)||(41808105-41808197)
chr5 (324-379)||(4653481-4653536)
chr5 (338-377)||(10124388-10124427)
chr5 (329-376)||(16014485-16014532)
chr5 (344-379)||(29929303-29929338)
chr5 (258-377)||(31220546-31220664)
chr5 (319-378)||(35118321-35118380)
chr5 (59-114)||(42504446-42504501)
chr5 (304-366)||(1935402-1935464)
chr5 (321-379)||(24391022-24391080)
chr5 (15-57)||(27998343-27998385)
chr5 (305-374)||(2049271-2049339)
chr5 (324-377)||(19137907-19137960)
chr5 (344-377)||(32489295-32489328)
chr5 (334-379)||(34119859-34119904)
chr5 (251-379)||(37065632-37065761)
chr5 (96-273)||(38578625-38578802)
chr5 (338-379)||(42408698-42408739)
chr5 (297-369)||(12534414-12534486)
chr5 (333-377)||(21952600-21952644)
chr5 (144-248)||(27799892-27799996)
chr5 (293-377)||(39012776-39012860)
chr5 (87-164)||(41833795-41833874)
chr5 (344-379)||(3563413-3563448)
chr5 (332-379)||(3775072-3775119)
chr5 (23-90)||(34194783-34194850)
chr5 (297-379)||(1104706-1104787)
chr5 (85-183)||(4026529-4026627)
chr5 (20-82)||(6368220-6368282)
chr5 (339-377)||(15584252-15584290)
chr5 (325-375)||(30639301-30639351)
chr5 (337-379)||(32925105-32925147)
chr5 (344-374)||(34190971-34191001)
chr5 (296-379)||(39668904-39668991)
chr5 (292-378)||(41833656-41833742)
chr5 (325-366)||(3448776-3448817)
chr5 (338-379)||(7090314-7090355)
chr5 (338-375)||(10668648-10668685)
chr5 (338-371)||(18741227-18741260)
chr5 (106-163)||(27553842-27553899)
chr5 (346-379)||(31635927-31635960)
chr5 (96-153)||(38341641-38341698)
chr5 (302-375)||(39128269-39128342)
chr5 (315-376)||(39766741-39766802)
chr5 (19-56)||(43558135-43558172)
chr5 (50-90)||(2788583-2788623)
chr5 (316-356)||(11753216-11753256)
chr5 (13-49)||(14748998-14749034)
chr5 (347-379)||(35720626-35720658)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (15-379)||(31388-31752)
scaffold0018 (87-164)||(44081-44158)
[»] chr2 (186 HSPs)
chr2 (15-375)||(8180700-8181060)
chr2 (15-379)||(3865992-3866356)
chr2 (15-377)||(36183371-36183733)
chr2 (15-377)||(38452686-38453051)
chr2 (15-376)||(3243654-3244013)
chr2 (15-379)||(4807512-4807879)
chr2 (17-379)||(38429806-38430167)
chr2 (17-379)||(12734623-12734984)
chr2 (83-379)||(2610576-2610872)
chr2 (17-379)||(41197225-41197588)
chr2 (17-377)||(11992108-11992466)
chr2 (17-377)||(41763043-41763401)
chr2 (66-379)||(25834650-25834962)
chr2 (116-379)||(451646-451909)
chr2 (17-379)||(45367623-45367984)
chr2 (137-379)||(7326158-7326400)
chr2 (24-377)||(18424378-18424728)
chr2 (167-378)||(28508750-28508961)
chr2 (102-378)||(24583630-24583907)
chr2 (17-351)||(23997539-23997858)
chr2 (17-377)||(38434873-38435234)
chr2 (212-379)||(35643065-35643232)
chr2 (21-379)||(9556367-9556724)
chr2 (96-379)||(12141545-12141828)
chr2 (199-377)||(31959625-31959803)
chr2 (152-375)||(39029638-39029867)
chr2 (21-379)||(6237751-6238110)
chr2 (264-379)||(227358-227473)
chr2 (257-379)||(30306194-30306316)
chr2 (96-376)||(18958908-18959192)
chr2 (80-379)||(43751945-43752244)
chr2 (257-379)||(38328368-38328488)
chr2 (215-376)||(45543074-45543234)
chr2 (219-379)||(43573128-43573287)
chr2 (104-379)||(44437719-44437994)
chr2 (275-379)||(3635321-3635425)
chr2 (100-379)||(12882043-12882317)
chr2 (15-370)||(4598569-4598926)
chr2 (237-377)||(9996623-9996766)
chr2 (134-379)||(42543274-42543519)
chr2 (17-164)||(16097199-16097350)
chr2 (266-379)||(9496037-9496150)
chr2 (64-376)||(37481618-37481930)
chr2 (295-377)||(12474927-12475009)
chr2 (192-375)||(35755247-35755434)
chr2 (83-375)||(13149319-13149612)
chr2 (71-377)||(11412697-11412992)
chr2 (15-210)||(7825278-7825475)
chr2 (15-360)||(41545326-41545670)
chr2 (307-379)||(17670680-17670752)
chr2 (266-374)||(19336896-19337004)
chr2 (280-376)||(39709202-39709298)
chr2 (96-379)||(6218968-6219249)
chr2 (191-378)||(13443907-13444094)
chr2 (289-379)||(9531598-9531688)
chr2 (297-379)||(12520060-12520142)
chr2 (230-379)||(12489800-12489949)
chr2 (15-254)||(23714384-23714620)
chr2 (15-254)||(24102056-24102292)
chr2 (91-164)||(43238306-43238379)
chr2 (218-373)||(33504346-33504502)
chr2 (15-92)||(2610448-2610525)
chr2 (96-379)||(3481145-3481438)
chr2 (15-374)||(42092439-42092796)
chr2 (83-379)||(43832087-43832382)
chr2 (221-364)||(37470146-37470289)
chr2 (278-379)||(8197539-8197640)
chr2 (278-379)||(8202299-8202400)
chr2 (185-373)||(19234988-19235176)
chr2 (185-377)||(5758995-5759187)
chr2 (307-379)||(17626284-17626356)
chr2 (223-379)||(33287549-33287705)
chr2 (224-379)||(7431887-7432042)
chr2 (304-379)||(15025703-15025778)
chr2 (252-378)||(30743686-30743812)
chr2 (59-377)||(13240763-13241063)
chr2 (297-378)||(19863436-19863517)
chr2 (297-378)||(19867768-19867849)
chr2 (297-378)||(19872669-19872750)
chr2 (306-379)||(25384680-25384753)
chr2 (218-375)||(26670891-26671048)
chr2 (17-210)||(45077670-45077870)
chr2 (295-379)||(42549835-42549919)
chr2 (302-377)||(10516749-10516824)
chr2 (218-377)||(19855585-19855744)
chr2 (17-148)||(30743545-30743675)
chr2 (17-162)||(19337069-19337209)
chr2 (45-174)||(40759049-40759179)
chr2 (311-375)||(522445-522509)
chr2 (282-366)||(3720426-3720510)
chr2 (297-377)||(17429252-17429332)
chr2 (17-264)||(13592411-13592656)
chr2 (125-367)||(26784350-26784592)
chr2 (304-376)||(887065-887138)
chr2 (324-377)||(16521007-16521060)
chr2 (281-374)||(45077915-45078008)
chr2 (315-379)||(14444889-14444953)
chr2 (239-378)||(28960210-28960350)
chr2 (278-378)||(32402683-32402783)
chr2 (98-242)||(32443668-32443812)
chr2 (312-379)||(12470895-12470962)
chr2 (303-378)||(14397957-14398032)
chr2 (324-379)||(15775843-15775898)
chr2 (295-378)||(21281462-21281545)
chr2 (15-69)||(451930-451984)
chr2 (268-378)||(9394629-9394739)
chr2 (297-375)||(34931634-34931712)
chr2 (80-133)||(227307-227360)
chr2 (65-154)||(19024150-19024239)
chr2 (324-373)||(45482989-45483038)
chr2 (304-376)||(624687-624759)
chr2 (307-379)||(3305807-3305879)
chr2 (25-164)||(9578916-9579053)
chr2 (15-164)||(9647822-9647967)
chr2 (179-347)||(21834638-21834806)
chr2 (80-164)||(38860158-38860242)
chr2 (336-379)||(10403891-10403934)
chr2 (304-379)||(15015154-15015229)
chr2 (325-380)||(33971534-33971589)
chr2 (302-377)||(36993742-36993816)
chr2 (97-203)||(11017316-11017422)
chr2 (103-172)||(14197367-14197437)
chr2 (306-364)||(29968624-29968682)
chr2 (325-379)||(33393339-33393393)
chr2 (337-379)||(38429651-38429693)
chr2 (336-377)||(2073307-2073348)
chr2 (280-377)||(3030864-3030960)
chr2 (304-369)||(19024387-19024452)
chr2 (302-374)||(19224988-19225061)
chr2 (297-362)||(23915708-23915773)
chr2 (338-379)||(37520689-37520730)
chr2 (331-379)||(8560804-8560852)
chr2 (322-378)||(15222472-15222528)
chr2 (179-379)||(17581543-17581743)
chr2 (299-375)||(32364923-32364999)
chr2 (108-164)||(41858744-41858800)
chr2 (279-374)||(186135-186230)
chr2 (125-172)||(907710-907757)
chr2 (344-379)||(1648113-1648148)
chr2 (306-377)||(2515171-2515242)
chr2 (297-376)||(7615471-7615550)
chr2 (302-377)||(9647611-9647686)
chr2 (320-375)||(12026014-12026069)
chr2 (344-379)||(13188391-13188426)
chr2 (278-377)||(13474214-13474313)
chr2 (304-355)||(19334174-19334225)
chr2 (332-379)||(26566292-26566339)
chr2 (279-377)||(26850419-26850517)
chr2 (252-378)||(18790105-18790231)
chr2 (325-379)||(36819406-36819459)
chr2 (218-379)||(45436965-45437124)
chr2 (302-379)||(335710-335787)
chr2 (324-377)||(32706472-32706525)
chr2 (278-375)||(36366819-36366916)
chr2 (303-367)||(440924-440988)
chr2 (310-377)||(2901960-2902028)
chr2 (319-379)||(24214010-24214070)
chr2 (15-79)||(24583904-24583968)
chr2 (310-377)||(32443851-32443919)
chr2 (97-161)||(41330131-41330195)
chr2 (325-377)||(44415853-44415905)
chr2 (335-374)||(11414571-11414610)
chr2 (344-379)||(14530529-14530564)
chr2 (13-163)||(18188701-18188848)
chr2 (321-379)||(23354105-23354164)
chr2 (336-379)||(25284954-25284997)
chr2 (320-379)||(32395594-32395653)
chr2 (335-374)||(43970020-43970059)
chr2 (322-376)||(9078804-9078858)
chr2 (349-379)||(14520948-14520978)
chr2 (324-370)||(44877440-44877486)
chr2 (13-82)||(13149231-13149300)
chr2 (19-112)||(17581392-17581485)
chr2 (302-371)||(19015946-19016015)
chr2 (310-379)||(32541792-32541861)
chr2 (278-375)||(36650625-36650721)
chr2 (130-203)||(43260439-43260512)
chr2 (327-379)||(1765609-1765661)
chr2 (83-163)||(12905082-12905162)
chr2 (349-377)||(14255807-14255835)
chr2 (325-361)||(15836170-15836206)
chr2 (325-377)||(16113674-16113726)
chr2 (345-377)||(25721364-25721396)
chr2 (98-170)||(44411715-44411787)
chr2 (344-380)||(44527792-44527828)
chr2 (344-372)||(45653470-45653498)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (52-379)||(946-1271)
[»] scaffold0024 (3 HSPs)
scaffold0024 (17-377)||(82643-83000)
scaffold0024 (286-374)||(48119-48207)
scaffold0024 (315-372)||(18943-19000)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (13-379)||(4278-4636)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (17-379)||(86607-86967)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (223-379)||(25530-25686)
scaffold0157 (15-139)||(25683-25807)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (204-377)||(16687-16860)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (137-379)||(11547-11787)
scaffold0113 (15-163)||(11810-11960)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (167-379)||(4708-4920)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (245-378)||(481-614)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (85-375)||(7431-7720)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (234-379)||(14722-14867)
scaffold0199 (110-163)||(14626-14678)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (287-379)||(28887-28979)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (218-379)||(58224-58385)
scaffold0050 (307-375)||(45447-45514)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (239-376)||(160325-160462)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (266-377)||(25443-25554)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (231-379)||(1520-1665)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (292-378)||(6771-6857)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (289-375)||(16438-16524)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (306-371)||(3648-3713)
scaffold0491 (278-366)||(3839-3927)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (306-379)||(99284-99357)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (99-163)||(11802-11866)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (257-337)||(39481-39561)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (315-364)||(194086-194135)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (327-379)||(19149-19201)
[»] scaffold0179 (1 HSPs)
scaffold0179 (324-375)||(26049-26100)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (304-379)||(163192-163267)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (326-379)||(40610-40663)
[»] scaffold1858 (1 HSPs)
scaffold1858 (278-370)||(883-974)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 244)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 1210665 - 1211029
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1210665 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 1210764  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1210765 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 1210864  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210865 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 1210964  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210965 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1211029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30202492 - 30202128
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30202492 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 30202393  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30202392 aaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaagtt 30202293  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202292 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 30202193  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202192 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30202128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 34792711 - 34792346
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34792711 cagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 34792612  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34792611 aaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 34792512  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34792511 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacac 34792412  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34792411 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgc 34792346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 49347752 - 49347393
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  49347752 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcatctatagtagaaaa 49347653  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49347652 gttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaa 49347553  T
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347552 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 49347453  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347452 ggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 8671840 - 8672202
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  8671840 cagagataaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtaga 8671937  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8671938 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 8672037  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8672038 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 8672137  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8672138 tatagcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 8672202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Original strand, 9592654 - 9593019
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9592654 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 9592753  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9592754 aaagtttgtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 9592853  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  9592854 aaaagaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaacac 9592953  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9592954 tatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgc 9593019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 22090014 - 22090380
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagta 112  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22090014 cagagatgaggatgctgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagta 22090113  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22090114 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaag 22090213  T
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090214 ttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 22090313  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090314 actatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgttg 22090380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 51441127 - 51440764
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51441127 cagagatgaggatgttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtaga 51441028  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  51441027 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaagtt 51440928  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51440927 aaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 51440828  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51440827 tacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 51440764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Original strand, 51601983 - 51602340
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  51601983 atgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaaagt 51602080  T
Q  120 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602081 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 51602180  T
Q  220 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  51602181 aggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatgg 51602280  T
Q  320 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602281 cgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 51602340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32231315 - 32230959
Alignment:
Q  16 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32231315 agagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 32231216  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32231215 aaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 32231116  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32231115 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacact 32231016  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt-gggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| || |||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32231015 atggtgtaatttgatccat--------ccccacttagtggggataaggcttggttgttgttgttg 32230959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43240743 - 43240380
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  43240743 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtgggggtagcacctatagta 43240644  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 212  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  43240643 gaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaag 43240544  T
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43240543 ttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 43240444  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43240443 actatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 380
Target Start/End: Original strand, 696191 - 696555
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  696191 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 696290  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  696291 agttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatggaggagagtcaggttaa 696390  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  696391 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacacta 696490  T
Q  317 -tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696491 ttggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 696555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4001814 - 4001453
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4001814 agatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 4001715  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4001714 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 4001615  T
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  4001614 agaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctat 4001515  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4001514 gacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 4001453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 85 - 379
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029406
Alignment:
Q  85 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  185 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 284  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  285 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 4029406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 15085856 - 15086206
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15085856 gagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 15085955  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  15085956 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcagattaa 15086055  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||            |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  15086056 aagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacacta 15086143  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15086144 tgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 15086206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32083105 - 32082754
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32083105 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 32083006  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32083005 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 32082906  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  32082905 aagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacacta 32082818  T
Q  317 tggc-gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  32082817 cggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttagtttttgttgttg 32082754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 8391694 - 8392056
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8391694 gagatgaagatgttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 8391793  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  8391794 agttggtagaaaataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaa 8391893  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | | |||||||| ||||    
T  8391894 aggaggtatatgaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatagaatacta 8391993  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||    
T  8391994 tggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtaggaaaagacttagtcgttgttgttg 8392056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38808031 - 38807669
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  38808031 atgaggatgttgtgttggat-agtggtaagaccagacgggatagaattagaaatgacaccattagagagagagagaatgggggtagcacctatagtagaa 38807933  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | |    
T  38807932 aagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagatggaggagagtcagatca 38807833  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38807832 aaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgatagaacact 38807733  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38807732 atggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 38807669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 113 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979229
Alignment:
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 25979296  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25979295 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 25979229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37463231 - 37462878
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  37463231 gagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagag--agagttggggtagcacctatagtagaaa 37463134  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc-aagtta 215  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||||||||||   || |||| ||||  |||||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |   |    
T  37463133 agacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaa 37463037  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  37463036 aaagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgat-caaatatggtttatcatagaacatt 37462938  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37462937 atggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 37462878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 9509238 - 9509565
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9509238 cagagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtaga 9509337  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||  ||    
T  9509338 aaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcatatt 9509437  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||| ||   |||||||| || |||||| |||| |||||| |||||     
T  9509438 agaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatgattgaacat 9509537  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccga 342  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9509538 tatggcgtaattcgatccatgtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 179 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37311953 - 37311753
Alignment:
Q  179 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 278  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37311953 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 37311854  T
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37311853 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgtt 37311754  T
Q  379 g 379  Q
    |    
T  37311753 g 37311753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 158 - 379
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318412
Alignment:
Q  158 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 257  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  258 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtggga 39318390  T
Q  358 taaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  39318391 taaggcttgtttgttgttgttg 39318412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 377
Target Start/End: Original strand, 52921197 - 52921362
Alignment:
Q  212 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52921197 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaa 52921296  T
Q  312 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52921297 cactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52921362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9599756 - 9599409
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  9599756 cagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagtaga 9599657  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||  | ||||| | | |||  |||||| ||||| ||||||||||||||  |     
T  9599656 aaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcagatc 9599557  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||| |||||| || |||| |||||||||||      
T  9599556 ataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaacgt 9599457  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||    
T  9599456 tatggcgtaatttgatccatgtagctgaccttacttagtgggaaaagg 9599409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27848155 - 27847798
Alignment:
Q  26 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  27848155 atgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtag 27848057  T
Q  126 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 225  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||||  | | |||||||||    
T  27848056 aaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtag 27847957  T
Q  226 aggaagacc-taggaaaactattagagaaacaatta-gaaag---gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 320  Q
    ||||||||| | | |||| ||| |||||||| | ||  ||||   ||||||||||| |||||||| | |  |||| |||| |||||| ||||| |||| |    
T  27847956 aggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgcc 27847857  T
Q  321 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27847856 gtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataaggcttggtcattgttgttg 27847798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 374
Target Start/End: Original strand, 39140434 - 39140794
Alignment:
Q  16 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa-------gattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctat 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  39140434 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaactggtaagactagatgagataggattaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagcacctat 39140533  T
Q  109 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 208  Q
    |||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  39140534 agtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagt 39140633  T
Q  209 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 308  Q
    ||  ||| ||||||||||||||   |||  |||  |||  ||||||| ||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |  ||||    
T  39140634 cagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaagttat--gagaaactattaggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagata 39140728  T
Q  309 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39140729 gaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18469440 - 18469082
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||| ||||||||||||| |    
T  18469440 gagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacaattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaga 18469343  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    || || ||||||||||| |||| | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||  |||| |||||| ||||||   | ||    
T  18469342 agatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaa 18469243  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||| ||    
T  18469242 aagaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacatta 18469143  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||| || ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  18469142 tggtgtaatttggttcatgtagacgaccccacttagtgggataatgctttgatgttgttgt 18469082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 125 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 224  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 324  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||| |||||||  |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32404890 - 32404525
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacat----gataggat--taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt 111  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||     |||  |||  ||| || |||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  32404890 agatgaggatgttgcgttagatgcgtggtaagaatagacagctaagattagatattagaaacgacaacattcgagagtgagt-tgggtaacacctatagt 32404792  T
Q  112 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 211  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||     
T  32404791 aaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaagatggaggatagtcat 32404692  T
Q  212 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 311  Q
     | | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||    
T  32404691 atcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaacatggtttatgatataa 32404592  T
Q  312 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32404591 cataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc-tggttgttgttgttg 32404525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48431687 - 48431397
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||| |||||    
T  48431687 gggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatca 48431588  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggt-------caatgagttgga 288  Q
     |||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| |        |||||||||||    
T  48431587 gatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgga 48431488  T
Q  289 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||| | ||||| ||||  ||||| | ||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48431487 tccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 48431397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 377
Target Start/End: Original strand, 2544587 - 2544875
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| || | ||||    
T  2544587 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaa 2544686  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||     ||| ||  |||||||    
T  2544687 ggagagtagatcagatggaggatagtcaaac-actagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactataaga-----tttggaaatcaatga 2544780  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| | |||| |||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2544781 gttggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgt 2544875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 378 - 511
Target Start/End: Original strand, 45647767 - 45647898
Alignment:
Q  378 tgcaccattggtggaaaagtgttttacacttaaaaacaaattagaacccaccgacataacaaataattgtgtaacttccnnnnnnnnaaaaccgtcaaac 477  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  45647767 tgcaccgttggtggaaaagtgttttacacttaaaaacaaattagaacccaccgacataacaaataattgtgtaacttccttttttt--aaaccgtcaaac 45647864  T
Q  478 atgattcgcaagattgaagatttgtgattggttc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45647865 atgattcgcaagattgaagatttgtgattggttc 45647898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 259 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707219
Alignment:
Q  259 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  359 aaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgttgttg 4707219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32079307 - 32079176
Alignment:
Q  245 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 344  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  32079307 attagagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgacc 32079210  T
Q  345 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32079209 ccacttggtgggataaggcttggttgttgttgtt 32079176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 379
Target Start/End: Original strand, 38868858 - 38869166
Alignment:
Q  71 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 170  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||  | |||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38868858 aatgacaacattaaagagagggttggagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaacactagtag 38868957  T
Q  171 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattt 270  Q
    || || | |  || ||||| ||| | |||||||  |||||| | |  ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| |    
T  38868958 attctctagcgaggagagtagattagatggagggtagtcaaatcattagaggcagaagaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatct 38869057  T
Q  271 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    || | | |||| |||||||  | || |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  38869058 agcgattaatgggttggatagatatatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttg 38869157  T
Q  371 ttgttgttg 379  Q
     ||||||||    
T  38869158 ctgttgttg 38869166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 219 - 379
Target Start/End: Original strand, 41560353 - 41560513
Alignment:
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 318  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |   |||||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  41560353 gaggtagaagaagacctagaaaagctataagagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatg 41560452  T
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41560453 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 41560513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 267 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020265
Alignment:
Q  267 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  367 gttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||    
T  24020277 gttgttgttgttg 24020265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36624184 - 36623884
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  36624184 gatagaattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagtacttgcagtagaaaagattgtagaaaataggcttaggtggttt-ggcatgtcgaga 36624086  T
Q  159 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 258  Q
    ||||||| |||     ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||            ||||||||| ||    
T  36624085 gaagactggta-----tgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcagaagaggtagaggaagacc------------tagagaaactat 36624003  T
Q  259 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc-gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 357  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||||| || |  |||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  36624002 tagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggctgtaa--tgatccatgtagtcgaccctacttagtggga 36623905  T
Q  358 taaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||| ||||| ||||||    
T  36623904 taaggctttgttgtcgttgtt 36623884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 379
Target Start/End: Original strand, 6025526 - 6025889
Alignment:
Q  16 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||  |||| |||||| ||||| | ||||| ||||| |||  || |||||||||||||| ||    
T  6025526 agagacgaggatgttttgctggatgtttggcaagactagactggataagattagaaatgatagcattaaagagatagttgggttagcacctatagtaaaa 6025625  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    | | |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||   | ||| ||    |||| ||||| ||||| ||| |||  |||||| | |    
T  6025626 acgatggttgaaactaggcttagatgacttgggcatgtacagagaacacctatggatactccaataaggagagtagatcagatgtagggtagtcaaatca 6025725  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || | || ||| ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||      
T  6025726 ctagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagatactagtaaaaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatg 6025825  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6025826 atggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataatacttggttgtttttgttg 6025889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3819150 - 3818854
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||| | || ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||| || | ||||    
T  3819150 agagagagagttgaggtagcacctatggtagaaaagatggtggtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaaagaagacttgtggattctctagtaa 3819051  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
      ||||| ||||| |||||||  | ||||   |  ||||  |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| | |||||    
T  3819050 agagagtagatcagatggagggtaatcaaaccactagagaaagaggaagaccttgaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaatga 3818951  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||  |||| |||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3818950 gttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttg 3818854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 202 - 380
Target Start/End: Original strand, 4415455 - 4415634
Alignment:
Q  202 ggagagtcaagttaaaaga-ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 300  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  4415455 ggagagtcaggttaaaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgat 4415554  T
Q  301 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
     | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  4415555 tttttatagaacattatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtggaaaaagacttggttgttgttgttgc 4415634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 379
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751768
Alignment:
Q  288 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44751768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 380
Target Start/End: Original strand, 29577452 - 29577537
Alignment:
Q  295 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29577452 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 29577537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 288 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941773
Alignment:
Q  288 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 44941773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 379
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338997
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  198 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 297  Q
    ||||||| | |||  | |  ||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||           ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |    
T  5338827 tggaggatattcagatcactagaggcagaagtagacctagaaaaactataagagaaa-----------gatctagagattaatgagttggatcgaaatgt 5338915  T
Q  298 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5338916 gatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggctcggttgttgttgttg 5338997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 373
Target Start/End: Original strand, 40416359 - 40416649
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||  ||| ||||    
T  40416359 agagagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaa 40416458  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
    | ||||| ||||| ||| |||| |||||  | |  | ||  ||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||  || ||| || || | |||||    
T  40416459 ggagagtagatcagatgcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaagacctagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctatagattaatga 40416558  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| || || |||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  40416559 gttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatgtgatccctttagccgaccccacttagtgggttaaggtttggctgttg 40416649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Original strand, 43423645 - 43423866
Alignment:
Q  23 aggatgttgcgttggatgagtggt--aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagtt 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  43423645 aggatgttgcgttggatgtgtgggggaagactagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagat 43423744  T
Q  121 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 220  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||  | |||||    |||||| | |  |||    
T  43423745 ggtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagtagagtagactagatggatagtagtcaaatcactaga 43423844  T
Q  221 ggtagaggaagacctaggaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  43423845 ggtagaggaagacctagaaaaa 43423866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 288 - 377
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337838
Alignment:
Q  288 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42337838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34827462 - 34827205
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   ||| |||||| ||||||   ||||   |||||||  ||||||| | ||||| || ||    
T  34827462 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgatataagattagaaatgact--attatgtagagagttggggtagcgcatatagaagtaa 34827365  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    || |||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||   |||||||| | ||||||| ||| ||| | |||||||||||| | ||||     
T  34827364 agatggtagaaaataggcttctttggtttggacatgtaaagagaagaccgatagatgctctagtaagaaaagtagattagatggaggagagtaaggttag 34827265  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggt 276  Q
    || |  || |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34827264 aaaaaataaaggaagacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt 34827205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423216
Alignment:
Q  259 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaaca---tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  359 aaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgt 46423216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 378
Target Start/End: Original strand, 8796239 - 8796492
Alignment:
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |   || ||||| |||||  |||  |||||||| |||||  | |  ||||| |    
T  8796239 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcggatggaggatagtcagatcactagaggca 8796338  T
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 324  Q
    |||||||||| |  |||||| | |||||||| ||||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |    
T  8796339 gaggaagaccaataaaaactttaagagaaactattaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaa 8796438  T
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8796439 tttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 8796492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10200441 - 10200304
Alignment:
Q  242 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 341  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  10200441 actatgagagagactattagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccg 10200342  T
Q  342 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10200341 acctcacttaatgggataatgcttggttgttgttgttg 10200304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 26016357 - 26016721
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||  ||| |   |||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||    
T  26016357 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaggatataattataaataatggcattagagagagagttggggtaacacctatatgaga 26016456  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||   |  || |||| | ||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||  |     
T  26016457 aaagatggtagaaactagatttaggtggtttgggtatgtagaaagaagacctatgcattctgtagcaaggagattagatcagatgaaggggagtcagatc 26016556  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |  |||||||   | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   |||  |||| | || |||||||     
T  26016557 actagaggtaagagtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaatgatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttggtagaacat 26016656  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  26016657 tgtggcgtcgtttgatacatgtagctgagcccacttagtggggtaagacttagttgttcttgttg 26016721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 379
Target Start/End: Original strand, 478695 - 478965
Alignment:
Q  110 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 209  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||  ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||     
T  478695 gtagaaaagttggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacattcagatagaa-acttgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcagatgaaagagagtt 478792  T
Q  210 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 309  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||  || | |||| ||||||||    
T  478793 aggtcaaaagagttagaggaagacctacaaaatctataagagaaactattaggaaagttttagaggttaatgagttggatggaagtatggt-tatgatag 478891  T
Q  310 aacactatggc-----gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || |||||| |      | |||||||| || ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  478892 aatactatgacataatttgatttgatctatttagccaat-ccacttagtgggataaagtttggttgttgttgttg 478965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 285 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28090786 - 28090692
Alignment:
Q  285 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28090786 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 28090692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 231 - 376
Target Start/End: Original strand, 29128919 - 29129065
Alignment:
Q  231 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 330  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || || ||||    
T  29128919 gacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgat 29129018  T
Q  331 -ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29129019 cccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggtttttgttg 29129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 276 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568410
Alignment:
Q  276 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40568412  T
Q  376 gt 377  Q
    ||    
T  40568411 gt 40568410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 248 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 52532745 - 52532614
Alignment:
Q  248 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 347  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  52532745 agagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgacccca 52532646  T
Q  348 cttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52532645 cttagtgggaaaaggcttggttgttgtggttg 52532614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444640
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 34444638  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  34444639 tg 34444640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 1661346 - 1661499
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattag----gaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatag 110  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||  || ||||| ||||  ||||||||||||    ||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  1661346 cagagatgaagatgttgtgttgaatgtctgataagactagatgtgataggattagaaatgaatgacaatatttgagagagagttggggtagcacctatag 1661445  T
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1661446 tagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagac 1661499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Original strand, 28533674 - 28533749
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28533674 tatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28533749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561843
Alignment:
Q  38 atgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 137  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaatgatgatagaaaataggctta 52561851  T
Q  138 gatggttt 145  Q
    | ||||||    
T  52561850 ggtggttt 52561843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11941732 - 11941578
Alignment:
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 324  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||||||||  | | |||| ||||||| |||| ||||||||      
T  11941732 gaggaagacctagaaaaacaataagagaagctattagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtat 11941633  T
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11941632 tttgatccatgtagtcggcctcacttagtgggatacggcttggttgttgttgttg 11941578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36340097 - 36339804
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||   |||||  ||| ||||    
T  36340097 agagagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaa 36339998  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
    |  | || ||||| |||||||| |   |  | |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||    
T  36339997 ggcgggttgatcagatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatga 36339899  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||   |||  ||||  |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36339898 gttggacagaaacatggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 36339804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084259
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggttgttattgt 6084257  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  6084258 tg 6084259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7762689 - 7762445
Alignment:
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 224  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||| ||| |||  |||| ||| | ||| || |  | ||||||| ||    
T  7762689 gaaaatatgattagatggtttgggcatgtagagagaagaattgtagatgttatagtatgaaaagtaaatcatatgaaagagtgttagatcaaaagagata 7762590  T
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 324  Q
     |    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||| || |    
T  7762589 aaaagggacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatggtgtaa 7762490  T
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
    ||||||  ||||| ||| |  |||||| | |||||||||||||||    
T  7762489 tttgatttatgtaaccgtttacacttaataggataaggcttggtt 7762445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19908371 - 19908040
Alignment:
Q  45 gtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtt 144  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||  |||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||  ||||  | | |||| || ||    
T  19908371 gtaagactagacatgacagggttagaaatgacaaaattaaagagagagttgtggtagcacctatagtaaaaaagatgggggaaaccaagtttaggtgatt 19908272  T
Q  145 tgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa--- 241  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| ||||| ||||   |||| |||||| | || ||  | |  | ||||||||| |||| ||| |||       
T  19908271 tgggcatgtagagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagcaaatcagatggag-atagccagatcagtaaaggtagaggtagacttagaaaatta 19908173  T
Q  242 --actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 339  Q
      ||||| ||||| || |||||||    ||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  19908172 taactataagagacacgattagaatttttttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagc 19908073  T
Q  340 cgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19908072 cgaccccacttagtgggataaggcttgattgtt 19908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 379
Target Start/End: Original strand, 19936612 - 19936744
Alignment:
Q  247 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc 346  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  19936612 tagaaaaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactcc 19936711  T
Q  347 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19936712 gcttagtgggataagacttgattgttgttgttg 19936744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28511960 - 28511795
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  | ||| || || || ||| | ||||||||||| | |||  |||| |||||||||||| |||    
T  28511960 agaggcagagaaagacctagaaaaactattagagaaattactaggaaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttatgatagaacattat 28511861  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg----ataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||    
T  28511860 ggcgtaatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggatacataagacttggttgttgttgttg 28511795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 305 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877343
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgt 38877343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 292 - 379
Target Start/End: Original strand, 5113940 - 5114027
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5113940 aaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataacgtttggttgttgttgttg 5114027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25715425 - 25715326
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||| | | |||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25715425 aatgagttgaaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35828869 - 35828562
Alignment:
Q  58 tgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 157  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  35828869 tgataagattagaaatgacaatattagagagagagtttgagtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagag 35828770  T
Q  158 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 257  Q
    |||||||   |||||  ||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||  |    ||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||  |    
T  35828769 agaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcatatggaggatagtcagatccctagaggcagaggaagatctggaaaaactattag-gaaa-ga 35828672  T
Q  258 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 357  Q
    || || |  |||        ||||||||||||  |||| |||| || ||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  35828671 tttgata--att--------aatgagttggatggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatccatgtaaccgaccccgcttagtggga 35828582  T
Q  358 taaggcttggttgttgttgt 377  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  35828581 aaagacttggttgttgttgt 35828562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 350
Target Start/End: Original strand, 40419559 - 40419893
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  |||||| | ||||   ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  40419559 cagagatgaggatggtgcgttgaatgtatggtaaaactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacttatagtaga 40419658  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    | || |||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  || |||  ||| | ||| ||||| | ||| ||||||| |||| |  |     
T  40419659 atagatggtagtaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtggattatgtagcaaggagagtagttcagatggaggggagttagata 40419758  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |  |||||||| || |||| ||| ||| ||||   |||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||| |||    
T  40419759 actagaggtaggggtagacatagaaaatctatacaagaaactattatgaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatagatcac 40419858  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 350  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||    
T  40419859 tatggcgtcgttt-attcatgtagccgaccccactt 40419893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 377
Target Start/End: Original strand, 50806765 - 50806949
Alignment:
Q  191 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 290  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |  ||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |  ||||||  |||| | |||| |||||||     
T  50806765 gatcaaatggaggggagtcaaatcactagaagtagatgaagacctagaaaaacaataagagaaactatcaagaaggat--agagattaatgcgttggata 50806862  T
Q  291 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     |||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50806863 aaaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgt 50806949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777258
Alignment:
Q  309 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgttgttg 3777258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 287 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769711
Alignment:
Q  287 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgt 21769711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 354
Target Start/End: Original strand, 28528385 - 28528614
Alignment:
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 224  Q
    |||| ||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |    ||| |||    
T  28528385 gaaactagacttaggtggtttcggcatgtcgggagaagacttgtggattctgtagtaaggacagtagatcaaatggaggggagtcaaatccctagaagta 28528484  T
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 324  Q
    | ||||||||||  |||||||| | |||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||| ||||||||||||     
T  28528485 ggggaagacctaaaaaaactataacagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaccactatggcgtcg 28528584  T
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtg 354  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28528585 tttgattcatgtagccgaccccacttagtg 28528614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 298 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32112068 - 32111987
Alignment:
Q  298 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  32112068 ggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttg 32111987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43375709 - 43375596
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| ||||  ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  43375709 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttagtgggataaagatt 43375610  T
Q  366 ggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||    
T  43375609 ggttgttgttgttg 43375596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Original strand, 51812472 - 51812625
Alignment:
Q  42 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 141  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  | |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||    
T  51812472 gtggtaagattagacacgataagattagaaatgactactttagagagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtg 51812571  T
Q  142 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
     ||||||||||||||||||| | | ||||||  ||| ||||||| ||| |||||    
T  51812572 atttgggcatgtagagagaaaaattgtagattttgtagtaagaaaagtagatca 51812625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8343040 - 8342885
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| | || | |||| ||||| |||    
T  8343040 agagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaacaattaataaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgatggaacattat 8342941  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    | |||   |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8342940 gacgt---ttgatcaatgtatctgatcccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 8342885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 288
Target Start/End: Original strand, 37263332 - 37263523
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||| ||| || |||| || |||||| |||||  ||||    
T  37263332 gggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaaaacttgtggatgttgcggtaaggagagtaaatca 37263431  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 288  Q
     ||||||| | ||||| | |  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || | | | ||| ||||| |||||||||||||    
T  37263432 gatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaatactattagtgaaactatca-agaagatctagagatcaatgagttgga 37263523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 379
Target Start/End: Original strand, 41165502 - 41165566
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41165502 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 41165566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 316 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4318906 - 4318843
Alignment:
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4318906 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 4318843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14226182 - 14226047
Alignment:
Q  22 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 121  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||  |    |||||||||||  |||||||| ||    
T  14226182 gaggattttgtgttggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacattggagagag--ttgcagtagcacctatcatagaaaagatg 14226085  T
Q  122 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 159  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14226084 gtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagag 14226047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16273073 - 16272820
Alignment:
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  16273073 gaaaataggtttaggtggtttgtacatttagagagaaaacttgtagattctatagtaagaagagtggatcaaatagaggataatcatattacaagaggta 16272974  T
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 324  Q
     || | ||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||  ||||| || | ||||||| | ||| || | |||| |||||||||||| |||| | |      
T  16272973 tagaacgacctagaagaactattagagaaattattatgaaatatttatagattaatgagtagtatctaattatggtttatgatagaacaatatgacatat 16272874  T
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  16272873 tttgatccatgtaatcaat-ccacttagtgggataatgtctggatgttgttgttg 16272820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7133401 - 7133300
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7133401 aatgagttggaccgaaatacggtgaatgatagaacattttggcctaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 7133302  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  7133301 tg 7133300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4590605 - 4590533
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4590605 tgatagaacaatatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 374
Target Start/End: Original strand, 42501143 - 42501387
Alignment:
Q  130 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 229  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||  || ||| |||| | ||| ||||| | ||| |||||||  |||||| | |  ||||||||||||    
T  42501143 taggcttgggtggtttggacatgtagagaagagacccgtggattctgtagaaaggagagtagttcagatggagggtagtcaaatcattagaggtagagga 42501242  T
Q  230 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 329  Q
    | |||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| ||  ||||| ||| |    
T  42501243 aaacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctatagattaatgagttggatagaaatatggaatatgatagaacattacagcgtcgtttaa 42501342  T
Q  330 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  42501343 tccatgtagccgaccctacttagtgggataaagtttggttattgt 42501387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 379
Target Start/End: Original strand, 52832037 - 52832329
Alignment:
Q  87 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 186  Q
    |||||||  |||||| | ||| |||||||||| || || ||||||   |||| ||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||   ||    
T  52832037 agagagttggggtagtagctacagtagaaaagatgatacaaaataaatttaggtggtttgggcatgttaagagaagaccgatagatgttgttgtacagag 52832136  T
Q  187 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 286  Q
    ||| ||| | |||||||||||||   ||| || ||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||  |||||||| |||||||||||  || |||||    
T  52832137 agtagataagatggaggagagtcgtattagaataggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtattagaaaagatttagaggttgataagttg 52832236  T
Q  287 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     || ||||| | || |  ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||| | | ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  52832237 aatacaaatattgtttcagatagaacattatgacgtaatttgatccatatagttgattcaatttagtaggataagatttggttgttgttgttg 52832329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 250
Target Start/End: Original strand, 39894722 - 39894934
Alignment:
Q  33 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 132  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   |||||||||| |||| |||| || | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  39894722 gttggataagtggcaagattagatgagataggattaagaataacactatcatagagagaat-tgggtagcccctatagtagaaaagatggga-aaaatag 39894819  T
Q  133 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 232  Q
       ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  || | ||   ||||||||   | |||||| ||||||||| |    
T  39894820 atctaggtggtttgggcatgtacggagaagacttgtagatgttgtggtacgaagagtaaattagat---ggagagtccgatcaaaagatgtagaggaaaa 39894916  T
Q  233 cctaggaaaactattaga 250  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  39894917 cctagaaaaactattaga 39894934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43481851 - 43481796
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43481851 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43481796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2914191 - 2914121
Alignment:
Q  309 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914191 gaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 2914121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 379
Target Start/End: Original strand, 26299187 - 26299352
Alignment:
Q  197 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 296  Q
    |||||||| |||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||| |     
T  26299187 atggaggatagtcagattaccagaggtagaggaaaacctaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgggtccaactg 26299286  T
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
                     ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26299287 -----------------ctatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgctgttgttg 26299352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 45510932 - 45510830
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  45510932 aatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggctgatgttgt 45510833  T
Q  378 tgc 380  Q
    |||    
T  45510832 tgc 45510830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 4379927 - 4380081
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--------gggtagcacctat 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||        |||||||| ||||    
T  4379927 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagagagagagtgagtgttggggtagcaactat 4380026  T
Q  109 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    |||||||||| |||| |||| || | |||| ||||||   |||||||||||||||    
T  4380027 agtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175426
Alignment:
Q  291 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttg 22175426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37430487 - 37430418
Alignment:
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37430487 aacattatggcgtagtttgatccatatagccgatcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttg 37430418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42539339 - 42539210
Alignment:
Q  251 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat-ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 349  Q
    ||||||||||| ||  | || ||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||  || || || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42539339 gaaacaattaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaaaatttagtttatgatagaacatcattggtgtaatttgatccatgtagacgaccccact 42539240  T
Q  350 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42539239 tagtgggaaaaggcttggttattgttgttg 42539210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 377
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257852
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgt 50257852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 109092 - 109002
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
    ||||||||||||  | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  109092 aatgagttggataaatatatgatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagcctgtcccac-tagtgggataaagcttggtt 109002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15437201 - 15437130
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15437201 tgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 15437130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19908543 - 19908388
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |   ||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||   |||    
T  19908543 agaggcagaggtagacctagaaaaactttaagagacattgttagaaaagatttagagattaacgagttggattcaaatatggtttataatagaatcttat 19908444  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
     ||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19908443 tgcgtagtttgatccatgtacctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttg 19908388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29577301 - 29577147
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  | | |||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  29577301 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaacataaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatggt-tatgatagaacattat 29577203  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29577202 ggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggatagtgcttggttgttg 29577147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290033
Alignment:
Q  289 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8677017 - 8676897
Alignment:
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg---tatgatagaacactatggcg 321  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | ||||||     
T  8677017 gaggaaaacctaggaaatctataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggca 8676918  T
Q  322 tcatttgatccatgtagccga 342  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  8676917 taatttgatccatgtagccga 8676897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Original strand, 19936444 - 19936571
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||        ||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  19936444 gagatgagaatgttgtgttggatgagtggtaagactagatgggataggaataggaatgacacc--------gagagttagggtagcacctatagcaaaaa 19936535  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 152  Q
    || |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  19936536 agatggtagaaaataggtttatgtggtttgggcatg 19936571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637720
Alignment:
Q  97 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc-- 194  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||  || |||| ||| ||||| ||||| ||||      
T  27637913 ggtagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagacatgtggatgttgtagtaaggagagtagatcat 27637814  T
Q  195 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 288  Q
    | ||||||  ||| ||| | |  |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| || |  |||||| ||| | |||||||||||||    
T  27637813 atatggagtggaggcaaatcactagaggtaggggaagacctaaaaaaacttttagagaaactatcaagaaggatctagtgatcaatgagttgga 27637720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 361
Target Start/End: Original strand, 29807984 - 29808122
Alignment:
Q  223 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 322  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |  |||||| || |  | || |||||| ||  |||| |||| | ||||| ||||||||||||     
T  29807984 tagaagaagacctagaaaaactataagagaaacgatcaagaaggatctaaatattaacgagttgaataaaaatatggtttttgataaaacactatggcga 29808083  T
Q  323 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 361  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29808084 catttgattcatgtagccgattccacttagtgggataag 29808122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17269064 - 17268987
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  17269064 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggaaaagtcttggttagtgttgttg 17268987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072491
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtgggaaaaggcttggttgttg 27072491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 330 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38758067 - 38758018
Alignment:
Q  330 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38758067 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 38758018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 50846769 - 50846846
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  50846769 tatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttg 50846846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 52073123 - 52073050
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  52073123 tatgatagaacattatggcggcgattgatccatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgtt 52073050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 376
Target Start/End: Original strand, 52292188 - 52292320
Alignment:
Q  243 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 342  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||| | | || |||||||||| | ||| | || |||||||||||||| || |    
T  52292188 ctataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttgga-ccaattattgtttatgatagaaaattattgagtaatttgatccatgtaaccaa 52292286  T
Q  343 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52292287 ccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52292320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2429704 - 2429636
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  2429704 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggacaaagcttggttg 2429636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13827851 - 13827699
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||| | || |||||||| |||||||||||||||   |||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  13827851 gggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtagatca 13827752  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 248  Q
     |||||  | |||||  | |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13827751 tatggaacatagtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatta 13827699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18793345 - 18793201
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 119  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||  ||||||  ||||| |||||| ||  |||||| || ||| |||||||||     
T  18793345 atgatgatgttgcgttggatgtgtggaaagactagacaggatagaactaaaaatgacgacattaaagagagggttggggtaggacttattgtagaaaaga 18793246  T
Q  120 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  18793245 tggtagaaactagacttagttgattttggcatgcagagagaagac 18793201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30396804 - 30396728
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30396804 tatgatagaacattatggtggcgtttgatccgtgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgtt 30396728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31274499 - 31274399
Alignment:
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||| |||  |||| |||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31274499 atgagttagattgaaatatggtttatgatataacgttatggcgtaatttgatctgtgtagctgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtt 31274400  T
Q  379 g 379  Q
    |    
T  31274399 g 31274399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43028876 - 43028808
Alignment:
Q  309 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43028876 gaacactatggtgtcgtttgattcatgtaagcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43028808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16142118 - 16142019
Alignment:
Q  239 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||| | |||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  16142118 aaaactataagagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 379
Target Start/End: Original strand, 27704156 - 27704235
Alignment:
Q  301 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg-ataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  27704156 gtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaagacttgtttgttgttgttg 27704235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 376
Target Start/End: Original strand, 44008702 - 44008859
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| ||  |||||| || ||||| ||||||||||||||    |||| ||||||| ||||||  ||    
T  44008702 agaggcagaggaagacctagaaaaaatctaagagaaactatcgagaaag-atctagagatcaatgagttggatagggattttgtgtatggtagaacgtta 44008800  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    || || |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44008801 tg-cgccatttgatccatttagccgaacctacttagtgagatacggcttggttgttgttg 44008859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 379
Target Start/End: Original strand, 50636266 - 50636365
Alignment:
Q  280 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||| | |||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  50636266 tgagttggataaaaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcgattctacttagcgggataaggcttgattgttgttgttg 50636365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Original strand, 51584953 - 51585028
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51584953 tgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 51585028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 313
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628248
Alignment:
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||| |||| | || || |||||||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaaca 8628248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 271
Target Start/End: Original strand, 9002382 - 9002528
Alignment:
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 224  Q
    ||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  9002382 gaaaataggtttaggtagtttggacatgtagagaaaaaacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcaaatagaggataatcatattagaagaggta 9002481  T
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattta 271  Q
     || |||||||||  ||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||    
T  9002482 tagaaagacctagagaaactatcagaaaaactatttgaaaagattta 9002528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12930471 - 12930309
Alignment:
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||| |||||||  ||||  ||  ||||| || | | |||||||||||||||| || | |||||||||| | ||    
T  12930471 aagaggtagagagaggcctaggaaaattataagagaaattattatgaaaaatttaaagattagtgagttggatccaaatatgatttatgatagaagatta 12930372  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  12930371 tgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccacttagcaaaataaggattggttgttgttgttg 12930309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 160
Target Start/End: Original strand, 17815402 - 17815537
Alignment:
Q  22 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 121  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || |||||  ||||| ||||| |||||||  |||||||||||| || || ||| || |||| | |||||| ||    
T  17815402 gaggatgttgtgttggatgtgtggta-gactagacgggatagcattagaaatgacaatattagagagaga-tgagg-taggacttataatggaaaagatg 17815498  T
Q  122 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 160  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17815499 gtggaaactaggcttagttggtttgggcatgtagagaga 17815537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26113519 - 26113437
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  26113519 tggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataagactacattgttgttgttg 26113437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27520378 - 27520233
Alignment:
Q  208 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa--ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 305  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||  |||| |||||||| ||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||| || | ||||    
T  27520378 tcaagtcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataagagaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatg 27520279  T
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 351  Q
    |||||||| ||||  || ||||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  27520278 atagaacattatgatgtaatttgattcatgtagtcgacctcactta 27520233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 313
Target Start/End: Original strand, 41611806 - 41612024
Alignment:
Q  95 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 194  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||   ||||||| ||| ||| ||| ||| |||     
T  41611806 tgggtagcacttatattagaaaagatggtagaaaataggtttatgtggtttgagaatgtagagagaagatatgtagatgatgtagtacgaaaagtagatt 41611905  T
Q  195 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 294  Q
    |||| ||||   ||||    || ||||||||||||| | |||  |||| ||| ||||| |   ||||||| |||||||| || ||||||||| || ||||    
T  41611906 aaatagaggtttgtcagagcaagagaggtagaggaaaatctataaaaaatataagagatattgttagaaaagatttagatgttaatgagttgaattcaaa 41612005  T
Q  295 tttggtgtatgatagaaca 313  Q
    | |||| ||| ||||||||    
T  41612006 tatggtttatcatagaaca 41612024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 52814346 - 52814292
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52814346 tttgatccatgtagcctatcccacttagtgggttaaggcttggttgtttttgttg 52814292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 1704834 - 1704911
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1704834 tatgatagaacatcatggcataatttgatccatgttgctgaccccacttagtgtgataagacttggttgttgttgttg 1704911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10569126 - 10569069
Alignment:
Q  322 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10569126 tcatttgatccatgtagccggttccacttaaagggataaggcttggttgttgttgttg 10569069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Original strand, 11584180 - 11584281
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11584180 aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 11584279  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  11584280 tg 11584281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44905483 - 44905354
Alignment:
Q  250 agaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 349  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | |||||| | || | || || || | |    
T  44905483 agaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatggcataatttgacctatttggctgaccctatt 44905384  T
Q  350 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  44905383 taataggataaggtttggttgttgttgttg 44905354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 371
Target Start/End: Original strand, 49377508 - 49377577
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  49377508 tatgatagaacattatggcggtgtttgatccatgtagccgactccagttagtgggataaggcttggttgt 49377577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8203290 - 8203138
Alignment:
Q  221 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 320  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||| | |||||||||||   |  | || |  | ||||||||| ||||||    
T  8203290 ggtagaagaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttggacggaggtatgatagaagatagaacattatggc 8203191  T
Q  321 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||   || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  8203190 gttgatttatccatgtagccgaccccacttagtgtgataagatttggttgttg 8203138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 377
Target Start/End: Original strand, 12231592 - 12231640
Alignment:
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12231592 atccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 12231640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Original strand, 16943362 - 16943434
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16943362 tatgatagaacattatggcggcgtttgatccatgtagtcgaccccacctagtgagataatgcttggttgttgt 16943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30834214 - 30833982
Alignment:
Q  140 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 239  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | |||| || |  |||| ||||| ||||| ||||| |  |||||| |  | ||||| |||||||||||||| |    
T  30834214 tggtttggtcgtgtagagagaagacttgcagattctataataaggagagtagatcagatggaaggtagtcaaatcgatagagggagaggaagacctagaa 30834115  T
Q  240 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 339  Q
    || |||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| | || | |||  ||||| | ||||||||||| | |||||||||    
T  30834114 aagctataagagaaactattacgaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgacggaacattgtggcgtcatttaaaccatgtagc 30834015  T
Q  340 cgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
     || | || || | ||||||||||||| |||||    
T  30834014 ggacctcattttgagggataaggcttgattgtt 30833982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 379
Target Start/End: Original strand, 39525973 - 39526049
Alignment:
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39525973 atgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagctgaccctatttagtgggaccaggcttggttgttgttgttg 39526049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 990732 - 990469
Alignment:
Q  104 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||   ||||| |||| | ||| ||||| ||| | |||||      
T  990732 cctatagtagaaaagatggtaggaaataggctcaggtggtttaggtatgtaaagagaagacatatagattctgtagcaaggagagtagattagatggaat 990633  T
Q  204 agagtcaagttaaaagaggtagaggaag-acctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 301  Q
    | |||||  | |    ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||     
T  990632 atagtcagatcactgtaggcagaggaagcacattggaaaactattagagaaactattgagata-gatctagagattaatgagttggatcaacatatggtt 990534  T
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||||||||||        | ||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  990533 tatgatagaaca--------ttatttgattcatgtagccgacaccacttaacgggataaggcttggttgttgt 990469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 369
Target Start/End: Original strand, 10272259 - 10272530
Alignment:
Q  95 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 194  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |  |||||| ||||||||||||||||||  || ||| | || | ||| ||||  ||||    
T  10272259 tgggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggttttggcatgtagagagaagacctgtggattc-gtaggaaggagaggagatc 10272357  T
Q  195 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 294  Q
    | ||||| | ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||  |||||| ||||  | ||| ||| |||   | |    
T  10272358 agatggatgggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaacttataagagaaactattaagaaggatctagaaattaataagtaggagaaaca 10272457  T
Q  295 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
      |||| | |||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  10272458 cctggtttttgatagaacac--cggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggaataaggtttggtt 10272530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Original strand, 14224294 - 14224368
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14224294 tgatagaccactatggcgtcattt-attcatgcagccgaccctacttagtgggacaaggattggttgttgttgttg 14224368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14225911 - 14225840
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  14225911 tatgatagaacagtatggtgtcgtttgatccatgtagccggccccacttagtgggatatgaattggttgttg 14225840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33561081 - 33560858
Alignment:
Q  154 agagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaa 253  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| |||   |||||||  |||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||| | || |||    
T  33561081 agagagaagacctgtagattctgtagtaaggagagtagatatgatggagggtagtcaaatcactagaggcagaggaagtcctagaaaaactgtaagggaa 33560982  T
Q  254 acaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt 353  Q
    || ||||   | ||| ||||| | |  |||||||||  |||| |||| ||| | |||||| |||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||    
T  33560981 actattaagtaagatctagagattagcgagttggatataaatatggtatatcagagaacattatgacattgtttgatccatgtagccaaccctacttagt 33560882  T
Q  354 gggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  33560881 gggataaggcttggctgttgttgt 33560858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 377
Target Start/End: Original strand, 4380188 - 4380241
Alignment:
Q  323 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4380188 cattttatccatgtagccga-cccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 4380241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15438904 - 15438800
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| |||| |||| |||||||||| |   || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  15438904 gatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaaaa---tgacgttatttgatgcatgtagccgaccccacttagt-agataaggctt 15438809  T
Q  366 ggttgttgt 374  Q
    |||||||||    
T  15438808 ggttgttgt 15438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40920628 - 40920526
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  40920628 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagaatattatggtgtcttttgattcatgtagtcgacccccacttagtgggatcaggtttggttgttcttg 40920529  T
Q  377 ttg 379  Q
    |||    
T  40920528 ttg 40920526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 50771792 - 50771555
Alignment:
Q  140 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |    
T  50771792 tggtttgggc-tgtagagagaagacccatggattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatgactagaggtaggggaagacctagaa 50771694  T
Q  240 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    ||||||| || ||||| ||||  |||||  ||||| | ||| |||||||   | |  ||| | | | ||||||||| ||||| || || ||| |||| ||    
T  50771693 aaactataagcgaaactattaagaaggacctagagattaataagttggagaaagacatggttttttaatagaacaccatggcatcgttcgattcatgcag 50771594  T
Q  339 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50771593 ccaactccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 50771555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 52073753 - 52073675
Alignment:
Q  87 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  52073753 agagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 52442866 - 52442788
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt 93  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||    
T  52442866 cagacatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagataagattagaaatgagaacattggagagagagt 52442788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 314 - 376
Target Start/End: Original strand, 52815094 - 52815155
Alignment:
Q  314 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52815094 ctatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttag-aggataaggcttggttgttgttg 52815155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8809540 - 8809499
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8809540 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 8809499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15707066 - 15706969
Alignment:
Q  282 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||  |||| |||||| |||| ||||| |||| || | ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15707066 agttggatagaaatatggtgtttgattgaacattatgacgccgtttgatccacgcagccgtccccacttagtgggataaggctttgttgttattgttg 15706969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 49051227 - 49051174
Alignment:
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  49051227 ttgatacatgtagccgatcccacttagtgggataaggttttgttgtcgttgttg 49051174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50830682 - 50830637
Alignment:
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50830682 atccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgt 50830637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 379
Target Start/End: Original strand, 7082536 - 7082588
Alignment:
Q  327 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  7082536 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggctgggttgtggttgttg 7082588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8343139 - 8343071
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  8343139 gggtaacacctttagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggactgggcatgtagagagaagac 8343071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13827994 - 13827930
Alignment:
Q  100 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13827994 agcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagac 13827930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Original strand, 17275137 - 17275262
Alignment:
Q  26 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |          ||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||| | || |    
T  17275137 atgttgcgttggatgtgtggtaagactacacatgataggataa----------cattagagagagatttggggtagcttctatagtagaaaagattgtgg 17275226  T
Q  126 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 161  Q
    ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17275227 aaacttggcttaggtggtttgtgcatgtagagagaa 17275262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 379
Target Start/End: Original strand, 35672869 - 35672969
Alignment:
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||| ||| ||||| | || ||||||||||   ||||| || |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35672869 atgagtttgatacaaatatagtttatgatagaatgttatggtgtaatttgatcgatgtagctgatctcgcttagtgggataagacttggttgatgttgtt 35672968  T
Q  379 g 379  Q
    |    
T  35672969 g 35672969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 374
Target Start/End: Original strand, 39797212 - 39797280
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39797212 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtaatcaattccacttagtggaataaggcttgattgttgt 39797280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 40920894 - 40920822
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 92  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  40920894 atgaagatgttgcattggatgtgtggtaagattagacgagataggattagaaattacaatattagagagagag 40920822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 43898439 - 43898491
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43898439 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 43898491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43934404 - 43934332
Alignment:
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43934404 atgatagaacattatggcggcgtttgttccatgtagctaaccccacttagtgggataaggtttggttgctgtt 43934332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 48865818 - 48865730
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtg 354  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| || |||| |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  48865818 gatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccactcagtg 48865730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 853825 - 853782
Alignment:
Q  333 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  853825 atgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttg 853782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 365
Target Start/End: Original strand, 7083097 - 7083160
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||    
T  7083097 tatgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctgaccccgcttagtgggttaaagctt 7083160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7210989 - 7210930
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7210989 tatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataagcctcggttgttgt 7210930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 353
Target Start/End: Original strand, 14557751 - 14557826
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt 353  Q
    ||||||||||| | |||| | || |||||||||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14557751 aatgagttggaccgaaatgtagtttatgatagaacattatggcgtattttgatccacgtggccgatcccacttagt 14557826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 16943097 - 16943243
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||  |||||  || |||  ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  16943097 gagatgagaatattgtgttggatgcgtgataagactagacgagataaaattagacattacaatattagggagagagttggggtagtacctatagtagaaa 16943196  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    || |||| |||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16943197 agatggtggaaactagatttag-tggtttgggcgtgtagggagaagac 16943243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 377
Target Start/End: Original strand, 29975442 - 29975481
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29975442 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29975481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37294183 - 37294128
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 357  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  37294183 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccatttagtggga 37294128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 104
Target Start/End: Original strand, 41611098 - 41611181
Alignment:
Q  21 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| | |||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||    
T  41611098 tgagaatgttgcgttggatgagtagtaagaatggacgggatatgattaggaatgacgctattagagagagtgttggggtagcac 41611181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 52878459 - 52878328
Alignment:
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  | | |||||||||||  ||    
T  52878459 aagaggtataggaagacttaggaaaattataagagtaattattataaaagatttagaggttaatgagttgaatccaactacgatttatgatagaacttta 52878360  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 348  Q
    | | || ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  52878359 tagtgtaatttgattcatgtaaccgataccac 52878328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 52900753 - 52900682
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 337  Q
    ||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  52900753 gatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 379
Target Start/End: Original strand, 2728847 - 2728913
Alignment:
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| || ||| |||||||||||    
T  2728847 actattgcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttactaggataatgcctggatgttgttgttg 2728913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39776994 - 39776936
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 336  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  39776994 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacacaatggcgtaatttgatcaatgt 39776936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 52981492 - 52981410
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  52981492 aaatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccttgtagccaaccccacttggtgggataacgattggttgttgt 52981410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Original strand, 6757462 - 6757503
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6757462 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgttg 6757503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 379
Target Start/End: Original strand, 7601361 - 7601411
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7601361 tttgatccatgtagccgacccca----gtgggataaggcttggttgttgttgttg 7601411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8725849 - 8725812
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8725849 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 8725812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16142241 - 16142172
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 89  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16142241 atgaagatgttatgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcaggaatgccaccattagagaga 16142172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16822376 - 16822235
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 119  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||  |||||  ||||  |  || ||| || ||  ||||| |||     
T  16822376 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaatactagataagataggattagaaatgacagtattagtaagag--ttaggatagaacttac-gtagacaaga 16822280  T
Q  120 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16822279 tggtagaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 16822235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Original strand, 21519167 - 21519208
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21519167 gccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 21519208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39123443 - 39123367
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| || | ||||||||||||    
T  39123443 tatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga-cccccttagtggtgtaagactcgattgttgttgttg 39123367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39515967 - 39515866
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||| |||||| |  ||||||| |||||||  | | || |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39515967 aatgagttggatcaaaatatggattatggtagaacattatggcattgtttgatctatgtagctaaccacaattagtgagataagacttggttgttgttgt 39515868  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  39515867 tg 39515866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 49062514 - 49062469
Alignment:
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  49062514 ttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggtttgattgt 49062469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Original strand, 51234537 - 51234610
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattaga-catgataggattaggaatgacaccattagagagag 90  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  51234537 agatgaggatgttgtgttggacgtgtggtaagactaaaacatgataggattagaaattacaacattagagagag 51234610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Original strand, 52901039 - 52901080
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52901039 gccgaccccacttagtgggataaggcttggtggttgttgttg 52901080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 362
Target Start/End: Original strand, 7124324 - 7124408
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 362  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| || |||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  7124324 aatgaattggatagaaatatggtataggatagagcattatggtgtcgtttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataagg 7124408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14732386 - 14732334
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14732386 tttgattcatgtggcccatcccacttagtgggatacggcttggttgctgttgt 14732334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17640138 - 17640066
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17640138 atagaacattatggcgtcgtttgattcatgttgtcaatccaacttagtgggataagacttagttgttattgtt 17640066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 372
Target Start/End: Original strand, 17815611 - 17815753
Alignment:
Q  227 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 325  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||| || ||| | |  ||||||| |||  |||| |||| ||||||||| || | ||| ||| |    
T  17815611 ggaagacctagaaaaattataagagaaactatttagaaag-atctagtgattgatgagttagatagaaatatggtatatgatagagcattttggtgtcgt 17815709  T
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17815710 ttgatccatgtag---atctcacttagtgagataaggcttggttgtt 17815753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37429974 - 37429906
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    |||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||    
T  37429974 tatgatagcacattgtggtgtaatttgatccatgtagccgaccccatttaatgggataagggttggttg 37429906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48861476 - 48861373
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtat--gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||  |||||| || |||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || ||    
T  48861476 aatgagttggatagaaatatggtatatttgatagagcattatgacgtcgtttgattcatgtcgccgaccccacttagtgggataagacttcgtttttttt 48861377  T
Q  376 gttg 379  Q
    ||||    
T  48861376 gttg 48861373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Original strand, 51812692 - 51812792
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||| |||| |||| |||| |||||||||| | |||| ||| |||| ||  || ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  51812692 aatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaatattatgccgtaatttaatatatatatacgaccccactaagtgggataaggcttggtttttgttgt 51812791  T
Q  378 t 378  Q
    |    
T  51812792 t 51812792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2694494 - 2694423
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||||||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2694494 tatgatagaacattatggtatagtttgatccatttagcagaccccacttagtgggatacggtttggttgttg 2694423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 379
Target Start/End: Original strand, 3059554 - 3059597
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3059554 tagccgactccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttg 3059597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7913816 - 7913781
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7913816 cccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 7913781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Original strand, 7922074 - 7922109
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7922074 cccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 7922109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11331350 - 11331247
Alignment:
Q  231 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 330  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||| ||||||  |||| ||||  || |||||||    
T  11331350 gacctagaaaaagtataagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11331251  T
Q  331 ccat 334  Q
    ||||    
T  11331250 ccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11489371 - 11489268
Alignment:
Q  231 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 330  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||| ||||||  |||| ||||  || |||||||    
T  11489371 gacctagaaaaagtataagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11489272  T
Q  331 ccat 334  Q
    ||||    
T  11489271 ccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22319884 - 22319837
Alignment:
Q  332 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  22319884 catgcagccgatcccacttagtgggataaagtttgtttgttgttgttg 22319837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Original strand, 22930642 - 22930677
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22930642 cccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttg 22930677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30985341 - 30985306
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30985341 cccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttg 30985306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31274613 - 31274578
Alignment:
Q  121 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31274613 ggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaga 31274578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 377
Target Start/End: Original strand, 37831616 - 37831655
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37831616 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgt 37831655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39422398 - 39422209
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 119  Q
    ||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||| |   ||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||  | ||| ||| |||||||||||||     
T  39422398 atgagaatgttgtgttagatgtgtggtaggattatatgagatagaattagaaatgacaatattaga-agagagttggagtaacacatatagtagaaaaga 39422300  T
Q  120 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 211  Q
    | ||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||  ||| || || ||| | ||||| ||||||| |||||||    
T  39422299 tagtagaaactagacttaggtgctt-ggacatgtagagagaagacatgtagattatgtagttaggagaatagatcatatggaggggagtcaa 39422209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44905603 - 44905548
Alignment:
Q  106 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 161  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  44905603 tatagtagaaaagacggtagaaaatatgcttaggtggtttggacatgtaaagagaa 44905548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Original strand, 46388612 - 46388654
Alignment:
Q  332 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46388612 catgtagctgatcccactta-tgggataaggcttggttgttgtt 46388654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 4590879 - 4590813
Alignment:
Q  22 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 88  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  4590879 gaggatgttgcgttgaatgtgcggtgagactagacaagataggattagaaatgacaatattagagag 4590813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 161
Target Start/End: Original strand, 7921843 - 7921901
Alignment:
Q  103 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 161  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  7921843 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttatgtggtttggacatgtagagagaa 7921901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Original strand, 9602204 - 9602286
Alignment:
Q  155 gagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctag 237  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||| || ||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||    
T  9602204 gagagaagactagtagattgtgtagtaagaagagaagatcagatagagggtagtcaaattgcaagaggcagaggaagacctag 9602286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19908718 - 19908573
Alignment:
Q  29 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattag--agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 126  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||  |||||||||  ||| | |||||| || |||||||   || ||    
T  19908718 ttgcgttggatgtgttgtaagactagacatgatatgatttgtaatgacaacattagaaagagagagttcgggcaacacctaaagaagaaaagagagtgga 19908619  T
Q  127 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 172  Q
    ||  || ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||    
T  19908618 aaccagacttaagtggtttgagcatgtatagagaaaacttgtagat 19908573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Original strand, 34863648 - 34863722
Alignment:
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| | ||| | |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  34863648 atgatagaacattatggtatcatttcatccatgtagccaaccccgcctagtgaaataaggattggttgttgttgt 34863722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37099810 - 37099760
Alignment:
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37099810 atccatgtagccggccccacttggtgggaaaaggcttggttattgttgttg 37099760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 369
Target Start/End: Original strand, 37263566 - 37263632
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttga-tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  37263566 tgatagaacactatggcgtcgtttaaattcacgtagccagccccacttagtgggataaggcttggtt 37263632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #225
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41017296 - 41017215
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||||||||| ||| || | ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41017296 tggtttatgatagaacattatagcataatttggtcgatgtagc-gactccacttagtggaataagacttggttgttgttgttg 41017215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #226
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43598989 - 43598923
Alignment:
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgtt 375  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43598989 aacattatggcgtagtttgatccatgtagcagaccctacttactgggataaggctttggttgttgtt 43598923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #227
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 189
Target Start/End: Original strand, 46388392 - 46388470
Alignment:
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 189  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  46388392 tagaaaagatggtggaaactcggcttaggtagtttgcacatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagt 46388470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #228
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 4298323 - 4298356
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4298323 cccacttagtgggataaggcctggttgttgttgt 4298356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10569312 - 10569263
Alignment:
Q  132 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggta 181  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||    
T  10569312 ggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctgtagta 10569263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #230
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 379
Target Start/End: Original strand, 11572405 - 11572434
Alignment:
Q  350 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11572405 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 11572434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 365
Target Start/End: Original strand, 30445314 - 30445375
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  30445314 tgatagaacaccatgacgtcgtttgattcatgtagccaactccacttagtgggataaagctt 30445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45168520 - 45168483
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45168520 gccgatctcacttagtgggataaggcttgtttgttgtt 45168483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #233
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Original strand, 46395056 - 46395096
Alignment:
Q  332 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46395056 catgtagctgatcccactta-tgggataaggcttggttgttg 46395096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #234
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 51173925 - 51173958
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51173925 cccacttagcgggataaggcttggttgttgttgt 51173958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #235
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2001188 - 2001124
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  2001188 tatggcgttgtttgattcatgtagcagacctcacttagtggtataaggcttttttgttgttgttg 2001124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #236
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13578975 - 13578919
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 360  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  13578975 tgatagaacactatgacgtcgtttgattcatatagccgactccacttagtggaataa 13578919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #237
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16822095 - 16822020
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt-ggttgttgttgt 377  Q
    |||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  16822095 tatgattgaacattatggcggc-tttggtccatgtagtcgaccccacttagtgggataaaacttgggttgttgttgt 16822020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #238
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 373
Target Start/End: Original strand, 17028936 - 17028972
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17028936 agccgatcccacttagtggcataaggattggttgttg 17028972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #239
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23791925 - 23791857
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||||| ||| || ||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23791925 gggtaggacccatggtagaaaagatggtagatactaaacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagac 23791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #240
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 29578218 - 29578163
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 139  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  29578218 agagagagagt-tggctagcacctatagtagaaaaaatggtggaaaatgggcttaga 29578163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #241
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 370
Target Start/End: Original strand, 31012417 - 31012449
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31012417 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 31012449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #242
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34375107 - 34375039
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    |||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  34375107 tatgatagaacattgtgatgtcgtttgatctatgtagtcgatcccacttaatggaataaagcttggttg 34375039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #243
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 46226532 - 46226380
Alignment:
Q  135 ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca-agttaaaagaggtagaggaagac 233  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||  |||||| |   |||||||||||| ||||||    
T  46226532 ttaggtggtttggacttgtagagagaatacaaatagatgatgtggtatgaagagtagatcatatagagaggagtcagatcaaaaagaggtagaagaagac 46226433  T
Q  234 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 286  Q
     ||| ||||| || || ||||| ||||  ||  ||||| |||| |||||||||    
T  46226432 ttagaaaaaccataagtgaaactattatgaaatatttataggttaatgagttg 46226380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #244
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 51433019 - 51432987
Alignment:
Q  345 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51433019 ccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 51432987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 255)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31960176 - 31959814
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31960176 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 31960077  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31960076 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 31959977  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959976 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 31959877  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959876 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31959814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 436149 - 436513
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  436149 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 436248  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  436249 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 436348  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  436349 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacac 436448  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436449 tatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 436513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 52569877 - 52569513
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52569877 cagagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 52569778  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52569777 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 52569678  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52569677 aaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 52569578  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52569577 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 52569513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48174452 - 48174091
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48174452 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaa 48174353  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48174352 gttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaa 48174253  T
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  48174252 agaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacattat 48174153  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48174152 ggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 48174091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 4440775 - 4441137
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  4440775 cagagattaggatgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagagag--tgggggcagcacctatagtaga 4440872  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4440873 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 4440972  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4440973 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 4441072  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  4441073 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgtcgtcgttgttg 4441137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 33227129 - 33227493
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33227129 cagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 33227228  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33227229 aaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaagtt 33227328  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33227329 aaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 33227428  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33227429 tatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacctagtggaataaggcttggttgtttttgttg 33227493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 378
Target Start/End: Original strand, 56375210 - 56375573
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  56375210 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctataataga 56375309  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  56375310 aaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagtt 56375409  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56375410 aaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 56375509  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56375510 tatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 56375573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33191210 - 33190845
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33191210 cagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 33191111  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  33191110 aaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaagtt 33191011  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33191010 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacac 33190911  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33190910 tatgacgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtttttgttgc 33190845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48622903 - 48622543
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  48622903 cagagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacccatagtaga 48622806  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48622805 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaagtt 48622706  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48622705 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacac 48622606  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48622605 tatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48622543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1777374 - 1777016
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    |||||||||||||| ||||    
T  1777374 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tggaaatagcacctatagtaaaaaa 1777277  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1777276 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaa 1777177  T
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1777176 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacagtat 1777077  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1777076 ggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgtt 1777016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 53707714 - 53708078
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53707714 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagagtggaggtagcacctatagtaga 53707813  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  53707814 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaagtt 53707913  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53707914 aaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 53708013  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53708014 tatgacgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 53708078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 43433838 - 43434208
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag------agagagtgtgggtagcacctat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||    
T  43433838 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctat 43433937  T
Q  109 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43433938 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggagagt 43434037  T
Q  209 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  43434038 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtaggata 43434137  T
Q  309 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43434138 gaacactacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43434208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23906663 - 23906297
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag------tgtgggtagcacctat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||||    
T  23906663 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctat 23906564  T
Q  109 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23906563 agtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggagagt 23906466  T
Q  209 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 308  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23906465 caagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 23906366  T
Q  309 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23906365 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 23906297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 46583186 - 46582824
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  46583186 cagagatgaggatgttgcattagagaagtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcacctatagtaga 46583087  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta-gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46583086 aaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 46582989  T
Q  214 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46582988 taaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacc 46582889  T
Q  314 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46582888 ctatggcgtcatttgatccatgtagccta-cccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 46582824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 28236105 - 28236466
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  28236105 cagagattatgatgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtaga 28236202  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  28236203 aaagttggtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaagtt 28236302  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  28236303 aaaat-ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaatat 28236401  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28236402 tatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 28236466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 26 - 379
Target Start/End: Original strand, 37797783 - 37798135
Alignment:
Q  26 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37797783 atgttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtag 37797882  T
Q  126 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 225  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||    
T  37797883 aaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttag 37797981  T
Q  226 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  37797982 aggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcat 37798081  T
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37798082 ttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgttg 37798135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47265561 - 47265193
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47265561 agatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaa 47265462  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac---tagt----agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||    |||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||| ||     
T  47265461 ggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggagattct 47265362  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  47265361 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatgataga 47265262  T
Q  311 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47265261 acactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgttg 47265193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39100893 - 39100534
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  39100893 gagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagaagaaa 39100796  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  39100795 agttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatgc-gttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaa 39100697  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||    
T  39100696 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacatta 39100597  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39100596 tggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 39100534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27450533 - 27450180
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  27450533 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaat----aatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 27450440  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||    
T  27450439 agttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaa 27450340  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  27450339 aagaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat-tttgatagaacacta 27450241  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27450240 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgttgt 27450180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 351
Target Start/End: Original strand, 50286891 - 50287217
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||    ||||||||||||    
T  50286891 cagagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag-----ggg----acctatagtaga 50286981  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  50286982 aaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaagtt 50287081  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50287082 aaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaacac 50287181  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 351  Q
    ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  50287182 tatgg-gccatttgatccatgtagtcgaccccactta 50287217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 74 - 370
Target Start/End: Original strand, 39708412 - 39708708
Alignment:
Q  74 gacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatg 173  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||    
T  39708412 gacaccattagggagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatg 39708511  T
Q  174 ctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga 273  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39708512 ccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttaga 39708611  T
Q  274 ggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39708612 ggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttggttg 39708708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 27983122 - 27983476
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27983122 gagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaa 27983221  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    |||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  27983222 agttggtag-------gcttagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaa 27983314  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||  | | |||||||||||    
T  27983315 aagaggtagaggaagacataagaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacacta 27983414  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27983415 tgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttgttgtt 27983476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 119 - 379
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286723
Alignment:
Q  119 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  219 ga--------ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 310  Q
    ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  311 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 8286723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37773811 - 37773468
Alignment:
Q  16 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  37773811 agagatgagaatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattagagagagtaag-gggtagcacctatagtagaa 37773713  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||   || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  37773712 aagtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaattta 37773613  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37773612 aaagaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaacact 37773513  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 360  Q
    ||| | | |||||||| || ||||||| ||| |||| || |||||    
T  37773512 atgacataatttgatctatatagccgaccccgcttaatgagataa 37773468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 87 - 374
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192311
Alignment:
Q  87 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 186  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  187 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 286  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  287 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat-caagtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgt 20192311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 83 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26037799 - 26037506
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||  ||| |||| || ||||    
T  26037799 agagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaa 26037700  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26037699 gaagagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatga 26037600  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26037599 gttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 114 - 378
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479321
Alignment:
Q  114 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  214 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  314 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgtt 32479321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 374
Target Start/End: Original strand, 1793382 - 1793741
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |  ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  1793382 gagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaagacttaacgggataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaa 1793481  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||| ||| ||||| |||||||||  ||   | ||    
T  1793482 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggaggag--tcgtatcaa 1793579  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac----aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |    
T  1793580 aagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagc 1793679  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1793680 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 1793741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 191 - 379
Target Start/End: Original strand, 21236954 - 21237142
Alignment:
Q  191 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21236954 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 21237053  T
Q  291 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21237054 caaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgttg 21237142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45205208 - 45204838
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  45205208 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaa 45205109  T
Q  116 aagttggtagaaaataggctt--agatggtttgggcatgtagagagaagac---tagt----agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 206  Q
    ||| ||||||||||||| |||  || ||||||| ||| |||||||||||||   ||||    ||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  45205108 aagatggtagaaaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggaga 45205009  T
Q  207 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 306  Q
    | ||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  45205008 g-cagatcaaaagaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatga 45204910  T
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45204909 tagaacatta-ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 45204838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 51421666 - 51422013
Alignment:
Q  29 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 128  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| |||||||||  || || ||||||    
T  51421666 ttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattagagagtg--ttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaa 51421763  T
Q  129 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 228  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||   ||||  | ||||||||||||||    
T  51421764 ataggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagagg 51421863  T
Q  229 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 328  Q
    ||||  ||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||| |||||    
T  51421864 aagatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttg 51421963  T
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51421964 atccatgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 51422013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20591662 - 20591306
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||   ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20591662 cagatatgaggatgttgtgctggatgaatagtaagactagacggaattagattgagaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtaga 20591563  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||     
T  20591562 aaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtcgt-gtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt- 20591465  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  20591464 ---agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggt-tatgatagaacac 20591369  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     ||| ||| ||||||| ||| ||  ||| ||   ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20591368 aatgacgtaatttgattcatatattcgaccctttttagtgggataagacttgattgttgttgt 20591306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 223 - 379
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957882
Alignment:
Q  223 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  323 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 6957882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41009707 - 41009414
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  41009707 atgaggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatgggggtagcacctatagtagaaaagt 41009608  T
Q  120 tggt-agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 218  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||| || ||||||| | | ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  41009607 tggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaa 41009508  T
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||    
T  41009507 gtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 223 - 379
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494947
Alignment:
Q  223 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  323 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12494947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20602003 - 20601651
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  | ||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||  | || ||| ||||||||||||||    
T  20602003 atgaggatgttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccactagggagagagtggagataacacttatagtagaaaagt 20601904  T
Q  120 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||  || | |||||||||||||| || |||||    
T  20601903 tggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagtcaggtcaaaag 20601804  T
Q  220 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 319  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||     
T  20601803 aggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccattagaaag-----tcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacattatga 20601710  T
Q  320 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  20601709 cgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataagagttaattgttgttgtt 20601651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1211747 - 1211390
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 119  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||||||||| | ||||    
T  1211747 atgaggatgttgcactggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccatt--cgagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagt 1211650  T
Q  120 tggtag--aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
    ||||||  || ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||   | |||    
T  1211649 tggtaggaaatatatgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaa 1211550  T
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||     
T  1211549 agagatagaggaagacataggagaactataagataaattattagaaa-aaattagaggtcaatgagttggatcc--atttggtttctcatagaacactaa 1211453  T
Q  318 ggcgt-catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1211452 ggcgtaaatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgttg 1211390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 327
Target Start/End: Original strand, 50679556 - 50679736
Alignment:
Q  146 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 245  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||   | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50679556 gggcatgtagaaagaaga-tcgtagatgtcatcgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 50679654  T
Q  246 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 327  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  50679655 ttagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Original strand, 12494670 - 12494794
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12494670 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 12494769  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttaga 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12494770 aaagttggtagaaaataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 35690226 - 35690555
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||       
T  35690226 gagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacacctttaaagagagagttggggtagcacctatagtag--- 35690322  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
             ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||                     |||||||||| | |||||||| |||||  | ||    
T  35690323 ---------aaaataggcttaggtggtttgggcatgtagatagaag---------------------aagagtggattagatggaggaaagtcagatcaa 35690392  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  |||||||||| |||||||| |||||||    ||| |||||||||||| ||    
T  35690393 aagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacatta 35690492  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35690493 tggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttg 35690555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 54470128 - 54470485
Alignment:
Q  16 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   |||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  54470128 agagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaa 54470227  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    ||| |||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||| |||||  |||||||||||   |||||| |||    
T  54470228 aagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtaaattatgtagtaaggagagtaaatcaaatggagagtagtcaaatta 54470327  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
      ||||| | | ||||||| || |||||||| |||||| | ||||  || | | ||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||  || || |    
T  54470328 ctagaggcaaaagaagaccaagaaaaactataagagaatctattaataaagttctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgactgagcatt 54470427  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54470428 attgcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggattaggcttggttgttg 54470485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 223 - 379
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528572
Alignment:
Q  223 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 322  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| |     
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  323 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 21528572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 126 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 53518571 - 53518325
Alignment:
Q  126 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||   |||||| | | |||||||||    
T  53518571 aaaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatggag---agtcaaatcagaagaggtag 53518475  T
Q  226 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 325  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| |||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  53518474 aggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 53518375  T
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  53518374 ttgatccatgcag-cgaccccacttagtgggataggactcggttgttgttg 53518325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 223 - 372
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  223 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  323 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 375
Target Start/End: Original strand, 16002857 - 16003206
Alignment:
Q  25 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 124  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||| ||| |||||||| ||    
T  16002857 gatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagagtgagtgaggatggcacctatggtataaaagttgata 16002956  T
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 224  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||  |||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| || ||| | || ||||||  ||    
T  16002957 gaaaatagtcttagatgg-ttgaacatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaagaaata 16003055  T
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 324  Q
    |||||| |||    |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||| ||| |    
T  16003056 gaggaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgacgtaa 16003155  T
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||| |||||| ||  |||||||| ||| | |||||   |||||||||||||    
T  16003156 tttaatccatataagcgatcccatttaataggatataacttggttgttgtt 16003206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Original strand, 31458951 - 31459098
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag--agagtgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||    
T  31458951 agatgaggatgttgcgttggttgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatagtagaa 31459050  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31459051 aagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 267 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154861
Alignment:
Q  267 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  367 gttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||    
T  19154873 gttgttgttgttg 19154861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 376
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548303
Alignment:
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttggttgttgttg 4548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 272 - 379
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969465
Alignment:
Q  272 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  372 tgttgttg 379  Q
    ||||||||    
T  19969458 tgttgttg 19969465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31961503 - 31961264
Alignment:
Q  140 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || || ||||||||| | ||||||  ||||||| | |  |||||||| || |||||||| |    
T  31961503 tggtttgggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagttaggagagtggattagatggagaggagtcaaatcactagaggtaggggtagacctagaa 31961404  T
Q  240 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 339  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||||||   | |  ||||   ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  31961403 aaactataagagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagc 31961304  T
Q  340 cgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31961303 cgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31961264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821002
Alignment:
Q  129 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |  ||| || ||| ||| | |||||| ||| |||  | |||||||||||| |    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  229 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac----actatggcgtca 324  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    |||||  | | |    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaaca-ttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacgaacactatatcataa 20821057  T
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  20821056 ttcgatccatgtagctgatcttacttagtaagataaggtttggttattgttgttg 20821002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 378
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351842
Alignment:
Q  153 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 252  Q
    ||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  253 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttag 352  Q
    ||| ||||  || ||||||||| | | |||||||||||||||| | || |||  ||||||  |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttag 28351816  T
Q  353 tgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  28351817 tggggtaaggcttggctgttgttgtt 28351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 377
Target Start/End: Original strand, 46372008 - 46372306
Alignment:
Q  79 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 178  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||     
T  46372008 cattagagatagagttggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgta 46372107  T
Q  179 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 278  Q
     |||||||||  ||||| || |||| ||| ||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  46372108 ctaagaagagcagatcagatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataa 46372207  T
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||   | |  |||| | |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  46372208 atgagttggagaaagacatggtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagttgggtaaggcttggttgttgttgt 46372306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42639381 - 42639020
Alignment:
Q  16 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    ||||||||| |||||  ||| ||||  |||||| | |||||  ||||||||||  |||  || | |||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  42639381 agagatgagaatgttatgtttgatgtatggtaacactagacgggataggattataaatagcaaccttagagagagagttagggttgcacctatagtagaa 42639282  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    ||| |||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  | ||  || | ||||||| ||||||| | |    
T  42639281 aagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttatggattctgtggtaaggggggtaaattagatggaggggagtcaaatca 42639182  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
      ||||||||||||| | |||| ||||||   |||||||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||||| |    
T  42639181 ctagaggtagaggaatatctagaaaaactgcaagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggatagaaatatggtatttgatagaacatt 42639082  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||| | | || ||||||||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42639081 atggcgtcgtgtaattcatgtagccaaccccgcttagtgggataaggcatgcttgttgttgt 42639020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 56224985 - 56225352
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga---ttagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt 111  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |  || ||  |||||||||    
T  56224985 cagagatgatgatgttgtggtggatgagtggtaagacactaagacatgatatgattaggaatgacaccataagagaaag--ttgggataatacctatagt 56225082  T
Q  112 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 211  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||     |||||| ||| ||| | |||||  |||| ||||||||||||| |    
T  56225083 ataaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagagagaaggaacatagatgttgtagtacgtagagtatatcatatggaggagagtcta 56225182  T
Q  212 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaa--aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 309  Q
     | || | || ||||| |||| |||  ||  |||||| || | ||| ||||  || | ||||||||| ||| | || ||||||||| |||| | | ||||    
T  56225183 atcaagaaagttagagaaagatctaaaaagaaactataaggggaactattatgaaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttatag 56225282  T
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  56225283 aacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataaggatcggttgttgttgttg 56225352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 2589124 - 2589356
Alignment:
Q  147 ggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 246  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| |||| || || ||||| ||||||||||||| |||| || |||  |||||||||| | ||||||| ||||  ||    
T  2589124 ggcatgtagagagaaaacttgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagttaaattactagaggtagagcacgacctagaaaaagcat 2589223  T
Q  247 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc 346  Q
     |||||||| || |  | |||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||    
T  2589224 aagagaaactatcaagatggatctagagattaatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaacccc 2589323  T
Q  347 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2589324 agttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 2589356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31897724 - 31897428
Alignment:
Q  79 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 178  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||| ||||     
T  31897724 cattagagagatagttggggtagcaccta--gtagaaaagatggtagaaactagacttgggtggtttgcgcatgtagagagcagacctgtggattctgta 31897627  T
Q  179 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 278  Q
    || || ||||| ||| | ||||||| ||||||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  31897626 gttaggagagtcgattagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataa 31897527  T
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||   | |  ||||   ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31897526 atgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31897428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35555941 - 35555648
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||| || |    
T  35555941 agagagagagttcgggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacctgtggattctgtagtta 35555842  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
    | ||||| ||| | || |||||||||   || |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||   |||  | ||||| | |||||    
T  35555841 ggagagtagattagatagaggagagttgggtcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactatt---aagagtctagagataaatga 35555745  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||   | |  |||| | |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35555744 gttggagaaagacatggtttttgatagtacagtatggcgtcgtttgattcatgtagccgactccatttagtgggacaaggcttggttgtttttgttg 35555648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 216 - 372
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862908
Alignment:
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga-gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt-------------t 50862850  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    || || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50862851 taaggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 50862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Original strand, 49987348 - 49987487
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  49987348 cagagatgaggatgttgtgttgaatgtttagtaagactagacatgataggattagaaatgacaacattagatagagagtctgggtcacacctatagtaga 49987447  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 154  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  49987448 aaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19062015 - 19061933
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19062015 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgttg 19061933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 379
Target Start/End: Original strand, 10208977 - 10209318
Alignment:
Q  34 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 133  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||||| ||||||||||    |  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||      
T  10208977 ttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagag----ttggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaa 10209072  T
Q  134 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta--gaggaag 231  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||  ||  | | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || ||||  | || ||    
T  10209073 cttagttggtttgggcatgtagcgagaagacctgtgaattttttagtaaggagagtagatcagatggaggagagtcatatgactagtggtagggggggag 10209172  T
Q  232 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc 331  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |||||||||||  ||||||| ||||||     
T  10209173 acctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacac--tggcgtcgtttgatt 10209270  T
Q  332 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10209271 caagtagccgaccccacttagtgggataaggcgtggttgttgctgttg 10209318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 213 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 51811442 - 51811280
Alignment:
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||  ||||||||   ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  51811442 ttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaac 51811343  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51811342 actatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt-gttgttgttgt 51811280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7092581 - 7092218
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||   |||| |||||| |||||||  |||||||| |||||  |  ||||||||||||||||    
T  7092581 cagagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagtctagaagggatatgattag-aatgacatgattagagacagagttggaatagcacctatagtaga 7092483  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||  || ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | | ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||        
T  7092482 aaatatgatagaaaataggtttaagtggtttgggcatatagagagaagacatgtagatgttatagtatgaagagtagatcagatggatgagagtcagaac 7092383  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg--atagaac 312  Q
    | ||||||| |||||||||||| || || ||| || ||||  ||||  || ||||||||||| |||| ||| |||| |||| || | ||||  ||||||     
T  7092382 ataagaggtggaggaagaccta-gagaaatataagtgaaattattatgaaagatttagaggttaatgcgttagatctaaatatgatttatgatatagaat 7092284  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    | ||| || | | || |||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||||||    
T  7092283 attatagcataaattaatccatgtaaacgaccccacttagtagcataaggcttggatattgttgtt 7092218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 21106908 - 21107236
Alignment:
Q  19 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattaga----gagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |    ||||||||   ||||| | ||||||||||    
T  21106908 gatgaggatgttgggttcgatgtgtggtaagactagacgtgatagaattagaaatgacaacattatatatagagagagttgaggtagtatctatagtaga 21107007  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa---gactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa-atggaggagagtca 210  Q
    || | | || |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||   |||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  21107008 aaggatagttgaaaataggcttaggtagtttgggcatctagagagaagacgacttgtagattatgtagtaaggagagtggatcaagatggagggtagtca 21107107  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 310  Q
      | |   || | || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||||| | | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21107108 gatcactggatgcagcggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagttttagtgattaattagttggatccaaatatggtttatgataga 21107207  T
Q  311 acactatggcgtcatttgatccatgtagc 339  Q
    ||  |||||| |  ||||||| |||||||    
T  21107208 actttatggcttagtttgatctatgtagc 21107236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Original strand, 33709839 - 33710024
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggat-----taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     ||| |||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  33709839 cagagatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacacctata 33709938  T
Q  110 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||   || ||| |||| ||||  |||||||||||    
T  33709939 gtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaagaactgtggattctgtagtaaagagagtggatca 33710024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44047709 - 44047568
Alignment:
Q  16 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44047709 agagacgaggatgttgcattgaatgcgtggtaggattaggcgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaa 44047610  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 157  Q
    ||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44047609 aaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagag 44047568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Original strand, 55007917 - 55008030
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55007917 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 55008016  T
Q  366 ggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||    
T  55008017 ggttgttgttgttg 55008030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 374
Target Start/End: Original strand, 31339521 - 31339803
Alignment:
Q  79 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 178  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||     
T  31339521 cattagagagagagttggggtagaacctatggtagaaaaat-ggtcgaaactaagcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtagattatgta 31339619  T
Q  179 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 278  Q
    ||||| | ||| ||||||||| ||   |||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    |||       | ||||| | |    
T  31339620 gtaaggatagtagatcaaatgaagagtagtcaa-tcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatatgagaa----tta-------tctagagatta 31339707  T
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31339708 atgagttggatcgaaatatggtacatgatagaacattatgacgtcgtttggtccatgtatccgaccccacttagtgggataaggcttgcttgttgt 31339803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 182 - 379
Target Start/End: Original strand, 31459093 - 31459278
Alignment:
Q  182 agaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatg 281  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||           ||||| |||||||| | ||||    
T  31459093 agaagagtagatcatatgtaggagagtcagatcaaaagaggtaaaggaagacctagaaaaactattag-----------gaaag-atttagagattaatg 31459180  T
Q  282 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31459181 agttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtcgttg 31459278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 304 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49939807 - 49939733
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49939807 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgtt 49939733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Original strand, 28497452 - 28497598
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 156  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28497452 gataggattagaaatgacaacatcagagagagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtaga 28497550  T
Q  157 gagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 204  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28497551 gagaagacttgtagattatgtagtaaggagagtagatcagatggagga 28497598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13805510 - 13805263
Alignment:
Q  132 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 231  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||| | ||| ||| | ||||| ||||||||  ||||  | |  ||||| |||||||     
T  13805510 ggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctttagattttgtagcaaggagactagatcacatggaggattgtcagatcactagaggcagaggaaa 13805411  T
Q  232 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc 331  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |  || ||||| |||   ||| |||||||   |||| |||| |||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  13805410 acctagaaaaactataagagaaactatgaagaaagattttgagagtaataagttggacggaaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatc 13805311  T
Q  332 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13805310 catgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttg 13805263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208267
Alignment:
Q  268 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 367  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  368 ttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||    
T  34208278 ttgttgttgttg 34208267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 379
Target Start/End: Original strand, 37488220 - 37488375
Alignment:
Q  224 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 323  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||  | ||| |||| |||| |||| ||||  |||||||| || ||||||||     
T  37488220 agaggtagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgta 37488319  T
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37488320 atttgatccatgtagccagccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 37488375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285701
Alignment:
Q  105 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||| || |||||||  |||| | ||||||     
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtggattctgtagtcagaagagcagatc-agtggaggg 42285874  T
Q  205 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 304  Q
    ||||||  | |  |||||| | || |||||||| ||| ||||   |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |    
T  42285873 gagtcagatcactagaggtgggggtagacctagaaaagctat--aagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggttttt 42285776  T
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  42285775 gatagaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccacttagttggataagacttggttgttgttgttg 42285701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34233393 - 34233031
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||    
T  34233393 gagatgatgatgttgtgttggatgtgtgataagactagatgtgataggattagaaacgacaacattagagatagagagttgggatagcacctatagtaga 34233294  T
Q  115 aaa-gttggtagaaaataggcttaga-------tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 206  Q
    ||| |||||  |||||| |||||||        |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||||      
T  34233293 aaaagttggg-gaaaattggcttaggacttgggtggtttggacatgtagagagagaacatgtagattatgtagtaaggagagtagatgagatggaggatc 34233195  T
Q  207 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 306  Q
    ||||  | |  ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||   || ||  ||||| | |||||||| |||| ||||  ||| |||||    
T  34233194 gtcagatcactagaggcagaggaaaacctagaaaaactatcagagaaactattcataaagacctagagattaatgagttagatcaaaataaggtttatga 34233095  T
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||    
T  34233094 tagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccgacgccactcagtgggacaatgcttggttg 34233031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 313 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238613
Alignment:
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 50238613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 313 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238699
Alignment:
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 50238699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2557831 - 2557670
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||  |||||| |  || | || |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  2557831 agaggtagaggaagatctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaggatctgaagattaacgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 2557732  T
Q  318 -ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
     || || ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2557731 tggtgtaatttgatccatgtagccaactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 2557670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Original strand, 25575007 - 25575108
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25575007 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25575106  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  25575107 tg 25575108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 287
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356811
Alignment:
Q  102 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||| ||||  |||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagacatgtgggtattgtagtaaggagagtagatcggatgga 26356725  T
Q  202 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 287  Q
    || ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||  |||||| ||||| | ||||||||||    
T  26356726 ggggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactgttatgaaggatctagagattaatgagttgg 26356811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 29398741 - 29399088
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    || ||||||  |||||||  ||||| || |||||   | |||||||||| |||||||    
T  29398741 gagatgaggatgttgc-ttggatttgtggtaagattagatggaattggattacaaatgacaatattagggaaagagttgcgatagcacctatggtagaaa 29398839  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    || |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| || || ||||| || |  || ||||| |||||| | |     
T  29398840 agatggtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagacctatagattctgtagtgaggagagtagaccggatagaggatagtcaaatcac 29398939  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||  |||           |||| | ||| ||  | || |||||||| | ||||  ||| |||||||||||| ||    
T  29398940 tagaggcagaggaagacctagaaaaact--tag-----------gaaatgtttt-gaaattaacgagttggaacgaaataaggtttatgatagaacatta 29399025  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29399026 tggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 29399088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 204
Target Start/End: Original strand, 50662311 - 50662497
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||||| || |   ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||    
T  50662311 gagacgaggatgttgtgtaggatgtgtggtaagactatatgagataggattggaaatgacagcattagagagag--tttgggcaacacctatagtagaaa 50662408  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatgg-tttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 204  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  50662409 agatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagacttgtagattctattgtaaggagagtagatctaatgaagga 50662497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540574
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || || || ||| | |||||||||||   |||| |||| |||||||||||| |||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattat 53540512  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53540513 ggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgggataagacttggttgttattgttg 53540574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 379
Target Start/End: Original strand, 5306464 - 5306580
Alignment:
Q  263 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 362  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||    
T  5306464 aaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccacttggtgggataagg 5306563  T
Q  363 cttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||    
T  5306564 cttggttgttgttgttg 5306580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32633479 - 32633404
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32633479 tgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 32633404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 51252814 - 51252635
Alignment:
Q  22 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 121  Q
    |||||| ||| ||| |||| || |||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  51252814 gaggattttgtgttagatgtgtcgtaagactagacgagataggattagaaatgactacattagagagag--ttggggtagcacctctagtagaaaagatg 51252717  T
Q  122 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 203  Q
    || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || ||| || ||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  51252716 gtggaaactaggcttaggtggtatgggcatgtagagagaagacatgtggattctatggcaaggagagtaggtcaaatggagg 51252635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 17900400 - 17900549
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||  ||||| ||||||  |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  17900400 cagaaatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataaaattagaaatgacgacattagagacggagttggggtagcacctatagtaga 17900499  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||  |||||||| ||| || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  17900500 aaagacggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagac 17900549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024851
Alignment:
Q  239 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    ||||||||  ||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| | |  |||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  339 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26024888 ccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttg 26024851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45209280 - 45209203
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45209280 tatgatagaatattatggcgtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 45209203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 177
Target Start/End: Original strand, 41192763 - 41192918
Alignment:
Q  24 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||  ||||||| | ||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||| ||    
T  41192763 ggatgttgcgttggatgtgtggtatgattagacaggatacaattataaatgacagcgttagagagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatg 41192862  T
Q  122 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgt 177  Q
    || |||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41192863 gtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagattctgt 41192918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25257938 - 25257722
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    |||||||  ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |   |||| |||||| | || ||||    
T  25257938 agatgagcttgttgtgttggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttgaggtaacacctacaatataaaa 25257841  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
    | ||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||  ||| | |      
T  25257840 gatggtagaagctagacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtgaatgctgttgtaaggagagtagatcagatggaggggacacaaatcact 25257741  T
Q  218 agaggtagaggaagaccta 236  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  25257740 agaggtaggggaagaccta 25257722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 316 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30634167 - 30634104
Alignment:
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30634167 atggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30634104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 379
Target Start/End: Original strand, 31043201 - 31043356
Alignment:
Q  224 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 323  Q
    ||||||||||| ||  ||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || |     
T  31043201 agaggaagacccagataaactaaaagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcata 31043300  T
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| || ||| || |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||    
T  31043301 atttgatccttgcagctgaccccacttagtgcaataaagcttagttattgttgttg 31043356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 378
Target Start/End: Original strand, 44360014 - 44360369
Alignment:
Q  26 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattaga----gagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 121  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||| |  ||||| ||||| |||||||  ||||||    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44360014 atgttgtgttggatgtgtggtaggactaggcgagatagaattagaaatgacaatattagatggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatg 44360113  T
Q  122 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 221  Q
    ||||||| |||  |||| | |||||||||||||||||||||||  || || | ||| ||||| | | | ||||| ||||||| ||| ||| | |  || |    
T  44360114 gtagaaactaga-ttaggttgtttgggcatgtagagagaagacatgtggacgatgtagtaaggataatagatcatatggaggggaggcaaatcactagtg 44360212  T
Q  222 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 321  Q
       |  |||||| ||| |||||||||||||||||  | |  |||||| | |||| ||||||||||||   | |   ||| | ||||||||||||||| ||    
T  44360213 cctggagaagacttagaaaaactattagagaaactgtcaagaaggatcttgaggccaatgagttggagaaagacacggtttttgatagaacactatgacg 44360312  T
Q  322 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  44360313 tcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataaggcttgtttattgttgtt 44360369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 308
Target Start/End: Original strand, 50680704 - 50680953
Alignment:
Q  60 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt-gggcatgtagaga 158  Q
    |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  50680704 ataggattggaaataacaacattagagagagagttagggcaacacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagaga 50680803  T
Q  159 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa-caa 257  Q
    |||| || |||||| | || ||||| ||||| |||| |||| |||| ||| |  | |  | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||  |     
T  50680804 gaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatgaaggatagttagatcactataggcagaggtagacctagaaaaactataagagaaattat 50680903  T
Q  258 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 308  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||  ||| |||| |||||||    
T  50680904 ttagaaa-gatctagagattaatgagttggatcggaatatggtttatgata 50680953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 55578956 - 55579295
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaa 117  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||  | ||  |||| ||||| ||||||||| |||  | |||||| || ||  || |||||||||| |||||    
T  55578956 atgaggatgttgtgttgaataagtggtaagaggaaacgagataagattatgaatgacactattttatagagagagttggaataacacctatagt-gaaaa 55579054  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
      |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||    || ||| ||| ||| |||||||  ||   ||||||||||||||| | |||    
T  55579055 aatggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaagatatataaatgttgtagtatgaagagtaaatttgatggaggagagtcaaatcaaa 55579154  T
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||| |||   || |||||| ||||  |||||||||||  |||   ||| ||||||| |||| |||    
T  55579155 agaggtagaagaagacctagaaaaactataaaataaactattttgaaagatttaaaggttcatgagttggatttaaacaaggtttatgata-aacattat 55579253  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 359  Q
    |   | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  55579254 gatataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgtgata 55579295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 25755235 - 25755598
Alignment:
Q  13 aacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 112  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| | || |||| | |||||  |||||||||||||  ||    
T  25755235 aacagagatgagaatgttgtgttagatgtgtggtaagactagacatgatatgattggaaatgaaaacaataga-aaagagttggggtagcacctatctta 25755333  T
Q  113 gaaaag-ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 211  Q
    ||||||   ||| |||||| ||| |||||||||||| || |||||| ||||||   |||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||    ||||    
T  25755334 gaaaagaaaggtggaaaatcggcatagatggtttggacacgtagagcgaagacctatagattatgttgtaagtagagtagatcaaatggagggtgatcaa 25755433  T
Q  212 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 311  Q
     |    ||||| | |||||||| || |||||| || |||||||| ||||   | || || | | | ||||||||||||    || || | ||| ||||||    
T  25755434 atcgttagaggcaaaggaagacgta-gaaaaccataagagaaactattaagtaagacttggggattaatgagttggatagggatatgatatatcatagaa 25755532  T
Q  312 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    || ||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25755533 cattatagtgtcatttgatccatgaagtcgatcccatttaatgggataaggcttggttgtttttgt 25755598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28550584 - 28550455
Alignment:
Q  248 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 347  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||  |||||   | |||||||| ||||||| || ||||    
T  28550584 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgacccca 28550485  T
Q  348 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28550484 cttattgggataaggtttggttgttgttgt 28550455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20105616 - 20105516
Alignment:
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||   |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  20105616 atgagttggactgaaatatggtatatgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagccaatctcacttagtaggacaaggcttggtggttgttgtt 20105517  T
Q  379 g 379  Q
    |    
T  20105516 g 20105516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 283 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25427956 - 25427860
Alignment:
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  25427956 gttggatctaaatttggtctatgattgaacactacggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttaatgagataagacttggttgttgttgttg 25427860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38571099 - 38570960
Alignment:
Q  24 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 123  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||| | ||    
T  38571099 ggatgttgtgttggatgtgtggtac-actagacaagataggattggaaatgacaacatttgagagagagctggggaagcacctatagtacaaaagatagt 38571001  T
Q  124 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38571000 ggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaaagaagac 38570960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 307 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 50869950 - 50869878
Alignment:
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50869950 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 50869878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7066571 - 7066497
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7066571 tgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 7066497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 292 - 379
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443379
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatcccaaatcgtaggataaggcttggttgttgttgttg 12443379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Original strand, 34585691 - 34585762
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34585691 tgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcttaacccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 34585762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37042798 - 37042667
Alignment:
Q  243 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 342  Q
    |||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | | ||||||||||  ||||  ||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37042798 ctataagagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccga 37042699  T
Q  343 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37042698 cccgacttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 359
Target Start/End: Original strand, 47372676 - 47372915
Alignment:
Q  120 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 219  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||  ||| | ||||||||| ||| | | |||||  |||||| | |  ||    
T  47372676 tggtggaaactagacttcgatggtttaggcatgtagagcgaagacccgtggattttgtaggaagaagagtagattagacggagggtagtcaaatcactag 47372775  T
Q  220 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 319  Q
    ||| ||||| |||| |  ||||||||| |||||||| | ||  || |||  |||| | ||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  47372776 aggcagaggtagacttgagaaaactataagagaaactactaataaagatccagagattaatgagttggatagaaatatggtatattatagaacattatgg 47372875  T
Q  320 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 359  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47372876 agtcgtttgatccatgtagcccatcccacttagtgggata 47372915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 377
Target Start/End: Original strand, 49987531 - 49987690
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || ||| | |||||| ||||||||| | ||||  |||||||| || |||    
T  49987531 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagacttggagataaatgagatggatccaactatggttcatgatagagcattat 49987630  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| |||| |||| | |||  || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  49987631 ggcgtaattttatccttctagttgaccccacttagttggataaggtttggttgttgttgt 49987690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17666294 - 17666053
Alignment:
Q  126 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 225  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| ||| | |||||  ||| ||||| ||     
T  17666294 aaaataggtttaggtggtttggacatgtagagggaaaacatgtagattatgtagtaagaagagtagatgaaatagagaatagtcatattacaagagatat 17666195  T
Q  226 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 325  Q
    | |||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| || | |||||||| |||  |||       |||||||||||| |||| |||  |    
T  17666194 atgaagacttagaaaaaatataagagaaactattagaaaagatttatagattaatgagttagatgaaaa-------tatgatagaacaatatgacgtatt 17666102  T
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  17666101 tcgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataatgtttggttattgt 17666053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 2588905 - 2589120
Alignment:
Q  19 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg----------tagcacctat 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| | |||          ||| ||||||    
T  2588905 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaagggataggattagaaatgacaacattagggagggagggagggagggttggggtagtacctat 2589004  T
Q  109 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 208  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2589005 agt-gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaaaacttgtggattctgtagttaggagagtagatcagatggaggggagt 2589103  T
Q  209 caagttaaaagaggtag 225  Q
     || |||  ||||||||    
T  2589104 taaattactagaggtag 2589120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15661939 - 15661870
Alignment:
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15661939 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgtcgttg 15661870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31403382 - 31403234
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga----gtgtgggtagcacctatag 110  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    ||  |||||||||||||||    
T  31403382 cagagatgatgatgttgagttgaatgtgtggtgagattagacgggataggattagaaatgacaacattagagacagatagagttggggtagcacctatag 31403283  T
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 161  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31403282 tagaaaa-atggtggaaactaggcttaggtgg-ttgggcatgtaaagagaa 31403234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 32339766 - 32339843
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339766 tatgatagaaaattatggcgtcgtttgatccatgtagtctattctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32339843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36255603 - 36255526
Alignment:
Q  296 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36255603 ttggtgaatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttg 36255526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40932999 - 40932922
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40932999 tatgatagaacattatggcggcgtttgatgcatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgttgttg 40932922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Original strand, 51438628 - 51438729
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||   |||| |||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51438628 aatgagttggaatgaaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgt 51438727  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  51438728 tg 51438729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 55388310 - 55388213
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||| |||| |||| || | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55388310 aatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 283 - 375
Target Start/End: Original strand, 1095633 - 1095725
Alignment:
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1095633 gttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataaggcttggttgttgtt 1095725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 378
Target Start/End: Original strand, 15665324 - 15665384
Alignment:
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15665324 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 15665384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Original strand, 41192244 - 41192344
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41192244 aatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccgacccgacatagttggataaggcttggttgttgttgt 41192343  T
Q  378 t 378  Q
    |    
T  41192344 t 41192344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 379
Target Start/End: Original strand, 46153940 - 46153992
Alignment:
Q  327 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46153940 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 46153992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1427589 - 1427466
Alignment:
Q  72 atgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga 171  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  1427589 atgacaacattagagagagagccagggtagaacatatagtagaaaacatggtggaaactaggcttagatggtttgagcatgtagagagaggacctgtgga 1427490  T
Q  172 tgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    |  ||||||||| ||||| |||||    
T  1427489 ttttgtggtaaggagagtagatca 1427466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 381
Target Start/End: Original strand, 3979127 - 3979206
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 381  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3979127 tatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgttggtgca 3979206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Original strand, 8284346 - 8284421
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  8284346 tatgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctacttagtgggattaggcttgattgatgttgt 8284421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29209274 - 29209175
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  29209274 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagagcattatggcgttgtttgatcaatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgtttttgt 29209175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 49738625 - 49738550
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49738625 tatgacagaacattatggcggtgtttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49738550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10775784 - 10775654
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||  ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  10775784 cagagatgatgatgttgtgttggatgcgtggcaggaccagacaggaaagaattagaaatgacaacattagagagagtgttggggtaacacctatagtaga 10775685  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggttt 145  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  10775684 aaagatggtagaaactagacataggtggttt 10775654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 374
Target Start/End: Original strand, 13296566 - 13296712
Alignment:
Q  228 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 327  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||||| ||  | ||||||||||| | ||||  |||||||| |  |||| ||| |||| ||||    
T  13296566 gaagacctaggaaagctattagagatactattagacaagatttggaaattaatgagttggaccgaaatacggtgtatggttaaacattatagcgtaattt 13296665  T
Q  328 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  13296666 gatgcatgcagccgacctcacttagtgggaaaatgcttggttgttgt 13296712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 379
Target Start/End: Original strand, 56130404 - 56130454
Alignment:
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56130404 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 56130454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22420993 - 22420716
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 197  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| |||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||   | ||||  |||  |||||||||| ||| | |    
T  22420993 gtagcaactgtagtggaaaagatggtggaagctaggcttaggtgatttggacatgtagagagaagatctgaagattttgtaataagaagagtagataaga 22420894  T
Q  198 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 297  Q
    ||||| | | |||| | |  ||||| |  ||||||  ||| |||||||| |||  ||| || |||||| || ||||| | ||||||||||||  | || |    
T  22420893 tggagaatattcaaatcactagaggcaagggaagatttagaaaaactataaga--aactataagaaag-atctagagattaatgagttggatagagatat 22420797  T
Q  298 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||  |||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22420796 ggtaaatgatagagcattatggcgttgtttgatctatgtagttgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 22420716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22873698 - 22873601
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22873698 aatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataaggcttggtagttgtt 22873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 43070126 - 43070053
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 88  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43070126 cagagatgatcatgttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacattagagag 43070053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44719432 - 44719359
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44719432 atagagcattatggtgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 44719359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809075
Alignment:
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatcca 55809075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 30621501 - 30621409
Alignment:
Q  80 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 172  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  30621501 attagagagggagttggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaagatttgtagat 30621409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 38017319 - 38017371
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38017319 tttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttgggtgttgttgt 38017371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1328667 - 1328612
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1328667 atttgatccatgtatccgatcctacctagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1328612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4879162 - 4879107
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4879162 atttgatccatgtagccgacctcacttactgggataaggcttggttgttgttgttg 4879107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 25967623 - 25967552
Alignment:
Q  21 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 92  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  25967623 tgaggatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgactacattagagagagag 25967552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40018477 - 40018189
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||     
T  40018477 agagagagaattggggtagcacctatcgtaaaaaagatggtagaaacttggcttatgtggtttgggcatgccgagagaagacttgtatattctatagta- 40018379  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
         || ||||| ||| |||  |||||| | |  ||||| | |  ||||| ||| |||||||| ||| ||||  |||  || ||| ||||| |||||||    
T  40018378 -----gtagatcagatgaagggtagtcaaatcactagaggcaaataaagacttagaaaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagatcaatga 40018284  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||    || || | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||    
T  40018283 gttggatagggatatgatatatgatagaacattacggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaaacttgtttgctgttgt 40018189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Original strand, 45175930 - 45176083
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||  | |||||| ||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||||||    
T  45175930 gagatgaggatgttgtcttggatgtgtggtagtactagacaagataatattagaaatgacaatgtta-agagagagttggggtagtgcctattgtagaaa 45176028  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 172  Q
    || |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45176029 agattcta-aaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagat 45176083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 46236708 - 46236771
Alignment:
Q  314 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  46236708 ctatggcgtactttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggtggttgttgt 46236771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Original strand, 49686900 - 49686971
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49686900 tatgatggaatattatggcgtcgtttgaaccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttg 49686971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6958310 - 6958237
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  6958310 gatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgggataa-cattggttgttgttgttg 6958237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21359293 - 21359227
Alignment:
Q  309 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21359293 gaacattatggcgtaatttgattcatgcagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgtt 21359227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21945846 - 21945644
Alignment:
Q  169 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 268  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |  |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||    
T  21945846 agattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcacatcactagaggctgaggaagacctagaaaaactatcatagaaactattaggaaagat 21945747  T
Q  269 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 368  Q
    || ||  | |||||||||||   |||| |||| |||||||||||   |||||||  |||||||||||||||| | |||    ||||||| || |||||||    
T  21945746 ttggaaattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaac---atggcgtattttgatccatgtagccaacccc----agtgggaaaaagcttggt 21945654  T
Q  369 tgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||    
T  21945653 tgttgttgtt 21945644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41009361 - 41009283
Alignment:
Q  235 taggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||    
T  41009361 taggtaaactataagagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgatataaca 41009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 46715678 - 46715585
Alignment:
Q  66 ttaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |     ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  46715678 ttagaaatgacaacattagagagagagag-----agcacctattgtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtgtgggcatgtagagagaagac 46715585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 56439714 - 56439568
Alignment:
Q  234 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 333  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||  | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  56439714 ctagaaaaactatcagagaaactattatgaaagatttggaaattaattagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatagcgtaatttaatcca 56439615  T
Q  334 tgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgttg 379  Q
    | ||||| | ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  56439614 tatagccaaccccacttagtgcgaaaaggctttgcttgttgttgttg 56439568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7544605 - 7544537
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7544605 tatgatagaacattatagcga-atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagccttggttgt 7544537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8599090 - 8598957
Alignment:
Q  228 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 327  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| || | || |||||||| ||   ||||  ||| | |||||||||| ||||||||| |||    
T  8599090 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctaaatgttaatgagttagaaagaaataaggtatttgatagaacattatggcgtcgttt 8598991  T
Q  328 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 361  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8598990 gattcatgtagccgacgccacttagtgggataag 8598957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729494
Alignment:
Q  276 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtagtttgatcca 41729494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Original strand, 50471453 - 50471595
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 119  Q
    ||||| |||||| ||||||||  || ||||| | ||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||   |  |||||||||  ||||||||||||     
T  50471453 atgagaatgttgtgttggatgtttgctaagacttgacgtaataggattagagatgacaacattagagagac--tcggggtagcactaatagtagaaaaga 50471550  T
Q  120 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||| |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50471551 tggtggaaactaggtttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 50471595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50967108 - 50967027
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| ||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  50967108 tggtatatgaaagaaaattatgtcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtggaataaagcttggttgttgttgtt 50967027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 28348287 - 28348339
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28348287 tttgaaccatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28348339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31403186 - 31403034
Alignment:
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 324  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||  || ||| ||||| | ||| ||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||| ||      
T  31403186 gaggaagatctagagaaactataagaaaaactattatgaaagatctagagattaattagttggatagaaatgtggtatatgatagagcattatggtgttg 31403087  T
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  31403086 cttgatccatgtagacgaccccacttagtaggataaaacttggttgttgttgt 31403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 18966474 - 18966541
Alignment:
Q  16 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatta 83  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||    
T  18966474 agagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagattagacaaaataggattataaatgacaacatta 18966541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 379
Target Start/End: Original strand, 20999129 - 20999284
Alignment:
Q  224 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 323  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | |||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  | || |||  |||| |||| || |||| ||||    
T  20999129 agaggaagacctagaaaaactataatataaactattaagaaagatctagagtttaatgagttgaataaatatatggcatatggtagagcattatgacgtc 20999228  T
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20999229 gtttgatccttgtagccgaccccactcagtgggataaagcttgattgttattgttg 20999284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35622749 - 35622674
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| ||| ||| || |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35622749 tgatagaacgctagggcatcgtttgattcaggtagctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttg 35622674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36556833 - 36556758
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36556833 tgataggacactatggcgttgtttgattcgtgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttg 36556758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39446983 - 39446908
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  39446983 tgattgaacactatggcgttgtttaattcatgtaaccgaccccacttaatgggataaggcttggttgtggttgttg 39446908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 44047422 - 44047367
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44047422 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttgc 44047367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45184291 - 45184135
Alignment:
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||  || |||  |||| | ||||||||| ||  |    |||| ||| ||| |||| ||    
T  45184291 aagaggtagaggaagacctagaaaaactataaga--aactattatgaaagataaagagattaatgagttgaatttactcatggtttataataaaacatta 45184194  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    || ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45184193 tgacgtaattcgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgtt 45184135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 377
Target Start/End: Original strand, 47372915 - 47372986
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||| |||| | || | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47372915 atagaacattatgacatcgtctgatccatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 47372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 164
Target Start/End: Original strand, 47611741 - 47611796
Alignment:
Q  109 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47611741 agtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 47611796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 337 - 379
Target Start/End: Original strand, 8327143 - 8327185
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8327143 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 8327185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 304 - 374
Target Start/End: Original strand, 13262421 - 13262491
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13262421 tgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgt 13262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36557347 - 36557246
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    ||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  36557347 gatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag-tggtttgggaatgtagaga 36557249  T
Q  159 gaa 161  Q
    |||    
T  36557248 gaa 36557246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Original strand, 813147 - 813200
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  813147 atttgatccatgtagcagaccccgcttagtggaataaggcttggttgttgttgt 813200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1965708 - 1965639
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  1965708 tatgatagaataatatggcgtaatttgatccacgtagccgatcccatttagtgggaaaagatttggttgt 1965639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6478706 - 6478662
Alignment:
Q  333 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6478706 atgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 6478662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 375
Target Start/End: Original strand, 17900691 - 17900760
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17900691 atagagcactatggcgttgtttgattcatttagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 17900760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Original strand, 32613643 - 32613712
Alignment:
Q  308 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  32613643 agaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccaatcacacttaatgggatatggcttgattgttgttgt 32613712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Original strand, 54529647 - 54529700
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54529647 atttgatccatgtagccggacccatttagtgggataagacttggttgttgttgt 54529700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20131274 - 20131167
Alignment:
Q  102 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg-gcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 200  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||   ||||||| |||||||||| ||||| |   | ||| ||||||| ||||||||||    
T  20131274 cacctatagtagaaaaat-ggtagaaaatagacttagatgtttttttgcatgtaaagagaagactcgtagaagtcatagtatgaagagtagatcaaatgg 20131176  T
Q  201 aggagagtc 209  Q
    |||||||||    
T  20131175 aggagagtc 20131167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26275078 - 26275014
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26275078 tatggcctaatttgatccatgtatccgaccccatttagttggaaaaggcttggttgttgttgttg 26275014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36799737 - 36799657
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| |||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  36799737 tggtttatgattgaacaatatcgcataatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggataaagcttaattgttgttgt 36799657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38585313 - 38585249
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  38585313 tatggcgtaatttgatccatttagctgagcccacttagtggaataaggcttagttgttattgttg 38585249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 38904036 - 38903925
Alignment:
Q  60 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 159  Q
    |||||||||||||| |||  ||||  |||||| | ||||||||||| ||  |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  38904036 ataggattaggaat-acaatattaccgagagactctgggtagcaccgatcatagaaaagatggtggaaactcggcttagttggtttgagcatgtggagag 38903938  T
Q  160 aagactagtagat 172  Q
    |||||| ||||||    
T  38903937 aagacttgtagat 38903925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45185295 - 45185215
Alignment:
Q  109 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 189  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  45185295 agtagaaaagatggtggataataggcttaggtgatttgggcatatagagacaagacttgtagattttgtagtaagaagagt 45185215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Original strand, 49416949 - 49416989
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49416949 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49416989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 50471757 - 50471809
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50471757 tttgatccatgtaatcgaccccacttagtgggataacgcttggttgttgttgt 50471809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 56200153 - 56200234
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatcc----atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  56200153 tatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatccatgtagccgaacccaatcaatgggataaggcttgtttgttgttgttg 56200234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 883433 - 883358
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||| |||||||| |||||||||    
T  883433 tgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccactcagggatataatgcttggttattgttgttg 883358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26772570 - 26772535
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772570 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 26772535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Original strand, 38266134 - 38266261
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||| | | |||| |||| || |||||| |||||||  ||||| |||| ||| || |||||||| ||| |||    
T  38266134 agagagagagttagggtagcacctataatagagaggatggtggaaactaagcttaggtggtttgaccatgttgagataagtcttgtagatgccgtgataa 38266233  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    | ||||| ||||  |||||||| |||||    
T  38266234 ggagagtagatcgtatggaggatagtca 38266261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Original strand, 45423537 - 45423681
Alignment:
Q  13 aacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 112  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| ||||    | |||||   ||||||||||||| ||    
T  45423537 aacaaagatgaggatgttgtgttggttgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacatt----atagagttgaggtagcacctataata 45423632  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 161  Q
    |||||| ||||||||| | | ||||  |||||| | |||||||| ||||    
T  45423633 gaaaagatggtagaaacttgacttacgtggttttgacatgtagaaagaa 45423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 372
Target Start/End: Original strand, 47147496 - 47147648
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  | || || | |||||||||||| |||    
T  47147496 agaggcagaggaagacctagaaaaactatagaagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggat--agatatgatatatgatagaacattat 47147593  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    ||| |  ||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  47147594 ggcattgtttgatccatgtaaccatccccaattagtgggataaggcccggttgtt 47147648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 49454512 - 49454477
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49454512 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 49454477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 50288099 - 50287988
Alignment:
Q  221 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 320  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| || | ||||||| || |||||| |    
T  50288099 ggtagaggaagacttagaaaaactataagataaattattaaaaaagatttagaggtcaatgaattgaatgcaaatatgttttatgatataatactatgtc 50288000  T
Q  321 gtcatttgatcc 332  Q
    || |||| ||||    
T  50287999 gtaatttaatcc 50287988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 379
Target Start/End: Original strand, 54963648 - 54963734
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  54963648 aaatatggtatatgatagaaca-tatggcctaattttatccatgtacctgacccaacttagtgggataagacttagttgttgttgttg 54963734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8598948 - 8598898
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  8598948 tttgattcatgtagccgatcccacttaatgggataagactttgttgttgtt 8598898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 205
Target Start/End: Original strand, 20605241 - 20605307
Alignment:
Q  139 atggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  20605241 atggtttgggcatgtagagagaagagctgtagattctgtggtaaggagagtatatcaagtggaggag 20605307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Original strand, 54935351 - 54935433
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||    
T  54935351 tggtttatgatagaacattataacataatttgatccatgtagcctaccccacttggtgggacagggcttggttgttattgttg 54935433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 934793 - 934649
Alignment:
Q  19 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 118  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||| || |||  ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||  ||||| |||||||  | ||||||    
T  934793 gatgaggttgttgcgttggctgtgtggtatgactaggtatgatagaattagaaatgataatattagagagagggttggggtatcacctatcat-gaaaag 934695  T
Q  119 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
     ||||||||| |   ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  934694 atggtagaaactcatcttaggtggtttgggcaagtagagaggagac 934649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Original strand, 1380296 - 1380433
Alignment:
Q  24 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 123  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||   |||| ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||  || || ||||||  ||||||||  || |    
T  1380296 ggatgttgcattggatgtgttgttagacctgacacgatagaattagaatggacaacattagagagagagttgggataacacctaccgtagaaaacatgat 1380395  T
Q  124 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 161  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1380396 agaaactcggcttaggtggtttgggcacgtagagagaa 1380433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14623292 - 14623243
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 364  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  14623292 tatggtgtcatttgatccatgtagccaatcccacctagtggaataaggct 14623243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 26357008 - 26357041
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26357008 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 26357041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 359
Target Start/End: Original strand, 28486092 - 28486185
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 359  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||| || | |  |||||||||||    
T  28486092 gatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagctgacctcggttagtgggata 28486185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 329 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32630540 - 32630495
Alignment:
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32630540 atccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgt 32630495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Original strand, 34379586 - 34379682
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||| ||||    
T  34379586 aatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaacttgat-catgtagccgaccccactttgttggaaaaggcgtggttgctgtt 34379682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38789656 - 38789623
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38789656 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38789623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42293320 - 42293263
Alignment:
Q  322 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42293320 tcatttaatctatgtagccggccccacttagtggaataaggcctggttgttgttgttg 42293263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48451108 - 48451071
Alignment:
Q  342 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48451108 atcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttg 48451071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 52360012 - 52359963
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  52360012 atttgatccatgtagcagaccccactttgtggggtaaggcttggttgttg 52359963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 55768798 - 55768717
Alignment:
Q  80 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 161  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  55768798 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 55833054 - 55832973
Alignment:
Q  80 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 161  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  55833054 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 375
Target Start/End: Original strand, 20047670 - 20047714
Alignment:
Q  331 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20047670 ccatgtagccggccccacttagtgggataagacttggttgttgtt 20047714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25959281 - 25959225
Alignment:
Q  323 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25959281 catttgatccttgtagccaacctcacctagtgggataagacttggttgttgttgttg 25959225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 374
Target Start/End: Original strand, 32745831 - 32745867
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32745831 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 32745867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 163
Target Start/End: Original strand, 44860862 - 44860914
Alignment:
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44860862 tagaaaagatggtggaaaccaggcttagatggtttgggcatgtatagagaaga 44860914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 49738885 - 49738817
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| || |||| || |||| |||||||||    
T  49738885 gggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagac 49738817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3601452 - 3601417
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3601452 cccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgttg 3601417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4136795 - 4136744
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  4136795 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgagataaaacttggttgttgttg 4136744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8459103 - 8459056
Alignment:
Q  328 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8459103 gatccatgtagccaaccccatttagtgggataagacttggttgttgtt 8459056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 371
Target Start/End: Original strand, 10536580 - 10536615
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10536580 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgt 10536615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11400507 - 11400444
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11400507 tatggtgtaatttcatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggctttggttgtcgttgt 11400444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11410234 - 11410171
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11410234 tatggtgtaatttcatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggctttggttgtcgttgt 11410171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 379
Target Start/End: Original strand, 23294023 - 23294066
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23294023 tagccgaccctacttagtgggataaggcgtggttgttgttgttg 23294066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27338462 - 27338387
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  27338462 tatgatagaacattatgacgtagttggatccatgtagccgaccctccttagtgggatgagactttgttgttgttgt 27338387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 357
Target Start/End: Original strand, 28467649 - 28467700
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 357  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  28467649 atagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcggaccccgcttagtggga 28467700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Original strand, 35585854 - 35585889
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35585854 cccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35585889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 379
Target Start/End: Original strand, 43774098 - 43774141
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43774098 tagccgaccccatttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 43774141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 46539164 - 46539109
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  46539164 atttgattcatgtaggcaaccccacttagtgggataaggtttgcttgttgttgttg 46539109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Original strand, 49370043 - 49370078
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49370043 cccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttg 49370078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 51051488 - 51051453
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51051488 cccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 51051453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51550322 - 51550251
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   |||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51550322 tgatagaacattatgtcgtcatttgatttttgtagctgactgcacttagtgggataaggcttagttgttgtt 51550251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 379
Target Start/End: Original strand, 52357924 - 52357967
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52357924 tagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgctgttgttg 52357967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 363
Target Start/End: Original strand, 1380600 - 1380638
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 363  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1380600 tttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggc 1380638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Original strand, 1989785 - 1989867
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  1989785 tggtttatgataaaacattttggcgtaatttgattcatgcaatcgaccccacttattgcgataaggcttggtggttgttgttg 1989867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #233
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6931780 - 6931722
Alignment:
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6931780 gcgtcgtttgatccttgtagatgatcccgcttagtgggataaagcttcgttgttgttgt 6931722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #234
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10775515 - 10775473
Alignment:
Q  333 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10775515 atgtcgccgaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 10775473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #235
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 379
Target Start/End: Original strand, 20654868 - 20654922
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  20654868 tttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttagttgttgttgttg 20654922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #236
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30621331 - 30621241
Alignment:
Q  247 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 337  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||| | |||| |||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||    
T  30621331 tagagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgta 30621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #237
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42293528 - 42293470
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 156  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  42293528 gtagcacctatagtagaaaagatgatggaaactcggcttaggtggtttgggtatgtaga 42293470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #238
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 379
Target Start/End: Original strand, 44940738 - 44940780
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44940738 agccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgtggttg 44940780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #239
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Original strand, 49416204 - 49416238
Alignment:
Q  345 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49416204 ccacgtagtgggataaggcttggttgttgttgttg 49416238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #240
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 379
Target Start/End: Original strand, 51176784 - 51176858
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||||   |||||||||| || |||||||    
T  51176784 gatagaacattatggcataatttgatccatgtagcggaccacacttagtggtgaaaggcttggtggtggttgttg 51176858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #241
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 51879781 - 51879747
Alignment:
Q  347 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51879781 acttagtgggataaggcttggtttttgttgttgca 51879747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #242
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Original strand, 53413941 - 53413975
Alignment:
Q  345 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53413941 ccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 53413975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #243
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 373
Target Start/End: Original strand, 53517725 - 53517783
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  53517725 tatggtgtcgtttaatccatgtagccgaccctacttagtggaataagacttggttgttg 53517783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #244
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Original strand, 26510559 - 26510671
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||| || | | |||| |||||| ||| || ||| | ||||||||| |||    
T  26510559 gatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgcgatagaacattatggtgtaagtagatcaatgtagtcga-cctactgaatgggataagactt 26510657  T
Q  366 ggttgttgttgttg 379  Q
      ||||||||||||    
T  26510658 cattgttgttgttg 26510671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #245
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28764419 - 28764374
Alignment:
Q  332 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28764419 catgtagccgacctcatttggtgggataaggcttggttgttgttgt 28764374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #246
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 40933255 - 40933198
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatga 75  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||||| |||||    
T  40933255 agatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagacaatacatgatagaattagaaatga 40933198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #247
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 51841273 - 51841196
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||| |||||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  51841273 tatgatacaacattatggcggtgtttgatccatatagctgaccccgcttagtgggatgaagcttggttgttgctgttg 51841196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #248
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 55768600 - 55768500
Alignment:
Q  276 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||| | || || ||| || ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  55768600 tcaatgagttggatcaaagtatggtgtatgatagaacattatagcgcaatttaatcaacgtggctgataccgctt-gtgggacaatgcttggttgttgtt 55768502  T
Q  376 gt 377  Q
    ||    
T  55768501 gt 55768500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #249
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 55832856 - 55832756
Alignment:
Q  276 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||| | || || ||| || ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  55832856 tcaatgagttggatcaaagtatggtgtatgatagaacattatagcggaatttaatcaacgtggctgataccgctt-gtgggacaatgcttggttgttgtt 55832758  T
Q  376 gt 377  Q
    ||    
T  55832757 gt 55832756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #250
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21214824 - 21214792
Alignment:
Q  133 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagact 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21214824 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaagact 21214792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #251
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 183
Target Start/End: Original strand, 29182498 - 29182570
Alignment:
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 183  Q
    |||||||| || || ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  29182498 tagaaaagatgctacaaactaagcttaggtggtttaggcatgtagagagaaaaccggtagattctgtggtaag 29182570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #252
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29283861 - 29283829
Alignment:
Q  347 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29283861 acttagtggaataaggcttggttgttgttgttg 29283829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #253
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30662098 - 30662042
Alignment:
Q  322 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||| ||||| || || || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30662098 tcatttaatccaagtggctgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 30662042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #254
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 360
Target Start/End: Original strand, 34809232 - 34809287
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 360  Q
    |||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34809232 tatgatagaacattatggcgac---tgatccatgtagccgaccccacttagcgggataa 34809287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #255
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 52227965 - 52227893
Alignment:
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | || ||||||  ||||  |||||||||||| ||||    
T  52227965 tagaacactatggcgtcgtttgatttatgtagccgacctcatttagtgcaataatacttggttgttgtagttg 52227893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 207)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 52138720 - 52139084
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52138720 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 52138819  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  52138820 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaagtt 52138919  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52138920 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 52139019  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139020 tatgacgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 52139084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 28245360 - 28245721
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28245360 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 28245459  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28245460 gttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaa 28245559  T
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28245560 agaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaacactat 28245659  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28245660 gacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgagataaggcttgattgctgttgttg 28245721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 54278940 - 54279303
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54278940 cagagatgaggatgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagtaga 54279039  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54279040 aaagttggtagaaaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 54279139  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54279140 aaaagaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 54279239  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||    
T  54279240 tatggcgtcatttgatcaatgtagccgatcccacttaataagataagacttggtt-ttgttgttg 54279303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 51448071 - 51447715
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  51448071 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagta-gggtagcacctatagtaga 51447973  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51447972 aaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 51447873  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51447872 aaaaga-------gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 51447780  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51447779 tatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 51447715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 21995 - 22356
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21995 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 22094  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||    
T  22095 agttggtagaaa-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggttaa 22193  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  22194 aagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 22293  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22294 tggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 22356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 5168750 - 5169116
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagta 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |||    
T  5168750 gagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggta 5168849  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5168850 gaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctag 5168949  T
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  5168950 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 5169049  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5169050 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 5169116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 47233955 - 47233596
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  47233955 agatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggaggtagcacctatagtagaaaa 47233856  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  47233855 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 47233756  T
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  47233755 agatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttttgatagaacactat 47233656  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47233655 ggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 47233596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 377
Target Start/End: Original strand, 25191299 - 25191659
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  25191299 cagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtaga 25191396  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||    
T  25191397 aaaattggaagaaaatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccggtt 25191496  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||| | |||||||||||    
T  25191497 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaacac 25191596  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25191597 tatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 25191659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 78 - 377
Target Start/End: Original strand, 35033129 - 35033428
Alignment:
Q  78 ccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgt 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |    
T  35033129 ccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccat 35033228  T
Q  178 ggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtc 277  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35033229 tgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtc 35033328  T
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35033329 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttgttgt 35033428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 378
Target Start/End: Original strand, 54128298 - 54128662
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  54128298 cagagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagcacctatagtaga 54128397  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||  ||| | ||||| ||||| |||||||  |||||  |     
T  54128398 aaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcagatc 54128497  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatt-agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  54128498 gaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaaca 54128597  T
Q  314 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
     |||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54128598 ttatggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 54128662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508519
Alignment:
Q  128 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  228 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 327  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  328 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 48508519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33272390 - 33272122
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctata--- 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||       
T  33272390 cagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatatat 33272291  T
Q  110 -gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 208  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  33272290 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggagagt 33272192  T
Q  209 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33272191 caagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Original strand, 53519511 - 53519864
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata------gtag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||      ||||    
T  53519511 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtag 53519610  T
Q  114 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  53519611 aaaagttggtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgt 53519710  T
Q  214 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||            |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  53519711 taaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaaca 53519798  T
Q  314 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53519799 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttg 53519864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 83 - 377
Target Start/End: Original strand, 38850108 - 38850403
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  || ||||    
T  38850108 agagagagagagagagtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaa 38850207  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattag-aaaggatttagaggtcaatg 281  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  38850208 gaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatg 38850307  T
Q  282 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  38850308 aattgaattcaaatttggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgttgt 38850403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43695129 - 43694769
Alignment:
Q  13 aacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatga-----taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg-tagcacct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||     |||||||||||||||||      ||||||||||| ||| ||||||||    
T  43695129 aacagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaccagacatgacatgataggattaggaatgaca------gagagagagtggggggtagcacct 43695036  T
Q  107 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||| | ||||||||| ||||      
T  43695035 atagtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagatcaaatgaagga-- 43694938  T
Q  207 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 306  Q
        |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||| |||||    
T  43694937 ----agttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaaactaggtttatga 43694842  T
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| || | |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43694841 tagaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataaagctgggttgttgttgttg 43694769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 207 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12096875 - 12096703
Alignment:
Q  207 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12096875 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 12096776  T
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12096775 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12096703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19676447 - 19676079
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag--------tgt--gggtagcacctata 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||||        |||  ||||||||||||||    
T  19676447 atgaggatgttgcattggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacaccattagagagagagagagagagtgttggggtagcacctata 19676348  T
Q  110 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 209  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||  ||||| || ||||||||||    
T  19676347 gtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatcagatagaggagagtc 19676248  T
Q  210 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 309  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19676247 agatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatgctgtatgatag 19676149  T
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19676148 agcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgttg 19676079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 45289434 - 45289091
Alignment:
Q  37 gatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaatag 132  Q
    |||| ||| ||||| |||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  45289434 gatgtgtgataagactagacgggataagattagaaatgacac-attagagagagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaatag 45289336  T
Q  133 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 232  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||| ||||| ||||||||||    
T  45289335 gcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaaga 45289236  T
Q  233 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 332  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  45289235 tctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatcc 45289136  T
Q  333 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45289135 atgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45289091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 49503897 - 49503566
Alignment:
Q  34 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49503897 ttggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagg 49503798  T
Q  134 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||  || ||| ||||| ||||||| |||||   ||| |||| ||||||||||||    
T  49503797 cttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaagac 49503698  T
Q  234 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 333  Q
    ||||  |||||||||| ||||           ||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||| |  |||| || | |||||||| ||||||||||    
T  49503697 ctag--aaactattag-gaaa-----------gatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatcca 49503612  T
Q  334 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49503611 tgtagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 49503566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39601016 - 39600683
Alignment:
Q  42 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 141  Q
    ||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||    
T  39601016 gtggtaagactagatgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtg 39600917  T
Q  142 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 241  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||| |||| |  || ||||| ||||| || ||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  39600916 gttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaa 39600817  T
Q  242 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 341  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||     
T  39600816 actataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaacca 39600717  T
Q  342 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  39600716 accccactttgtgggataagacttggtttttgtt 39600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50960914 - 50960636
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||| ||| | ||||||||| |||||    
T  50960914 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacct----atgttgtagaaagaagagtagatca 50960819  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 295  Q
     |||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| || | ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50960818 gatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaat 50960719  T
Q  296 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50960718 atggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgctgtt 50960636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 269
Target Start/End: Original strand, 45728066 - 45728324
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt-agagagagagtgtgggtagcacctatagtag 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||   |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45728066 cagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcatttagagagagagtgggggtagcacatatagtag 45728165  T
Q  114 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag-aagactagtagatgctgtggtaagaagag--tggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||| | ||||||||||| || ||   ||||||  || ||||||||||  |  |||||||||||||||||||    
T  45728166 aaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagtca 45728265  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatt 269  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45728266 tgttaaaagagatagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 371
Target Start/End: Original strand, 38430807 - 38431129
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  38430807 gataggattaggaatgacaccattagagcgtttagagcgttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgt 38430906  T
Q  154 agagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaa 253  Q
    ||||||| |||  | ||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  38430907 agagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaa 38431006  T
Q  254 acaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca-----ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 347  Q
    || |||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||      || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  38431007 actattgtggaagg-tttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattacgttacggcgtaatttgatccatgtagtcgacccca 38431105  T
Q  348 cttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    || ||| |||| ||||||||||||    
T  38431106 ctaagtaggatgaggcttggttgt 38431129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 234 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 52156227 - 52156082
Alignment:
Q  234 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 333  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52156227 ctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatcca 52156128  T
Q  334 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52156127 tgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 52156082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48734481 - 48734147
Alignment:
Q  29 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  48734481 ttgcgttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattagagagtg--ttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaa 48734384  T
Q  129 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||   ||| |  | ||||||||||||||    
T  48734383 ataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagagg 48734284  T
Q  229 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 328  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||            |||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||| | |||    
T  48734283 aaggccttgaaaaactattagagaa------------gatttaaaggtcaacgagttgggtccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttg 48734196  T
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48734195 atccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 48734147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 19736918 - 19737255
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  19736918 gagatgatgatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaa 19737017  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |     
T  19737018 aagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatc 19737116  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||            |||||||| | |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||| |    
T  19737117 aaaaaggttgaggaagacctagaaaaactattag-gaaa-----------tatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgataaaacatt 19737204  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 367  Q
    ||||  | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19737205 atggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19737255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 367
Target Start/End: Original strand, 19757829 - 19758158
Alignment:
Q  25 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19757829 gatgttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggt 19757928  T
Q  124 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 223  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  || | ||| ||||    
T  19757929 agaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatcaaaaaggt 19758027  T
Q  224 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||            |||||||| | |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||  |     
T  19758028 agaggaagacctagaaaaactattag-gaaa-----------tatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggtata 19758115  T
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 367  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19758116 atttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19758158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 38060419 - 38060580
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||    
T  38060419 agagagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaa 38060518  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact 244  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38060519 gaagagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaact 38060580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  102 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa-gactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| |||  | ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  201 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagga--tttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 298  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |  | || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcattaaaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatatg 48953498  T
Q  299 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 342  Q
     | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  48953497 atttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 111 - 368
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235409
Alignment:
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 310  Q
      | |||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  311 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 368  Q
    ||| |||| ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga-ccctcttagtaggataaggcttggt 39235409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 26490239 - 26490596
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||| ||||||  ||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||    
T  26490239 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagag--ttgaggtagcacctatagtagaaa 26490336  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||   | |||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| |||  |||     
T  26490337 agatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattag 26490436  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    | |||| || ||||||  ||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||| || | |   |||||| | ||    
T  26490437 atgaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatgtgatttcatatagaatatta 26490536  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||    
T  26490537 tggcgtaatttgatccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42510292 - 42510014
Alignment:
Q  99 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaat 198  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||   |||||  ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  42510292 tagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagat 42510195  T
Q  199 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 298  Q
    |||||| |||||  | |  ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | |||| ||    
T  42510194 ggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatg 42510095  T
Q  299 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42510094 gtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgttgttg 42510014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 313
Target Start/End: Original strand, 27917492 - 27917788
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||  ||||||||||||| |||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||    
T  27917492 cagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattagagaaag--ttggggtagcacctatagtaga 27917589  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  |||| | |||||||||||||| | |||  |     
T  27917590 aaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacttgtagatgttgtattagaaagaatagatcaaatggaggacaatcagatc 27917689  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    | || ||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| |||||| |||||  |||| |||   ||||||| |||| |||| || |||||||||    
T  27917690 ataataggtagacgaagacctataaaaactataagagagacaactagaaaagattttaaggttaattcattggatctaaatatggtttacgatagaaca 27917788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 239 - 377
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060996
Alignment:
Q  239 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtag 38060957  T
Q  339 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38060958 ccgaccccacttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 273 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555330
Alignment:
Q  273 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  373 gttgttg 379  Q
    |||||||    
T  47555336 gttgttg 47555330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262425
Alignment:
Q  249 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 348  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccac 53262394  T
Q  349 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53262395 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 53262425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 300
Target Start/End: Original strand, 3186707 - 3186973
Alignment:
Q  33 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 132  Q
    |||||||||| ||||||| | | |  |||| ||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3186707 gttggatgagcggtaagacttggcgggataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaatag 3186806  T
Q  133 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 232  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||   | ||||||| | | ||||| || ||| | ||||| || ||||||||| ||| || |    
T  3186807 gc-tagatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaata 3186905  T
Q  233 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 300  Q
    |||| ||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3186906 cctaagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaatatggt 3186973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31454537 - 31454224
Alignment:
Q  65 attaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||     
T  31454537 attagaaatgacaacattagagagagtgt-tggttagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgg-tggtttgtgcatgtagagagaagaa 31454440  T
Q  165 tagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt--taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattaga 262  Q
      |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||| |  | | ||| |||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||      
T  31454439 atgcggattctgtagttaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatctttagagatgtaggggatgacctagaaaaactataagggaaactattaat 31454340  T
Q  263 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 362  Q
     ||||| ||||  | ||||| |||||   | |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31454339 taggatctagatattaatgaattggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataagg 31454240  T
Q  363 cttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||    
T  31454239 cttggttgttgttgtt 31454224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 54365268 - 54364976
Alignment:
Q  85 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga--agactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||  |||||| || |  |||    
T  54365268 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataa 54365170  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
    | ||||| ||||||||| |||| |||||    |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | ||||     
T  54365169 ggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgt 54365070  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||| || | |||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  54365069 gttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccacac-tagtgggataaggcttggctgttgttgt 54364976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30294418 - 30294125
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat---gtagagagaagactagtagatgctgtgg 179  Q
    |||||||||| | | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||    |    
T  30294418 agagagagagagagagtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccg 30294319  T
Q  180 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaa 279  Q
    ||||||||||  || | ||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  30294318 taagaagagtaaattagattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaa 30294219  T
Q  280 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||| || | || | ||||||| |||||||||||   ||||| || ||||| || | |  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30294218 tgagttggatctaagtatgatttatgataaaacactatggc--aatttgttctatgtaaccaaccttacttagtgggataaaacttggttgttgtt 30294125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 377
Target Start/End: Original strand, 49042081 - 49042219
Alignment:
Q  240 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt-atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49042081 aaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtag 49042180  T
Q  339 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49042181 ccgaccccacttggtgagataaggcttggttgttgttgt 49042219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 54425289 - 54424959
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||| ||    
T  54425289 gataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgagg-tatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtaggga 54425191  T
Q  159 gaagactagtagatgctgtggtaagaag-------agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 251  Q
    ||||||  | |||||| || ||||| ||       ||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  54425190 gaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagag 54425091  T
Q  252 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt------catttgatccatgtagccgatcc 345  Q
      || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| | |       ||||||||||| |||| || ||    
T  54425090 ggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgaccc 54424991  T
Q  346 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  54424990 cacttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54424959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 311420 - 311307
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  311420 gatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 311321  T
Q  366 ggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||    
T  311320 ggttgttgttgttg 311307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895878
Alignment:
Q  288 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 7895878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 52679212 - 52678892
Alignment:
Q  13 aacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatag 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| | || |   ||||  ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||   ||||| ||||||    
T  52679212 aacagagatggggatgttgcattggatcagcggtaaaactatatgagataatattaaaaatgacaccattagaaagagagagtggaaatagcatctatag 52679113  T
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| | | ||||  |||||||||||||     
T  52679112 cagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgtagatg--ttggtaagaaaaatagatcggatggaggagagtcg 52679015  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 310  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||| || ||||| || |  |||||| |    
T  52679014 ggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaacta--agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgaattcaaatatgattcatgatata 52678917  T
Q  311 acactatggcgtcatttgatccatg 335  Q
    | | ||| |||| ||||||||||||    
T  52678916 atattatagcgtaatttgatccatg 52678892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 264 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2133725 - 2133610
Alignment:
Q  264 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 363  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  2133725 aggatgtagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggc 2133626  T
Q  364 ttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||    
T  2133625 ttggttgttgttgttg 2133610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 229 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17022820 - 17022684
Alignment:
Q  229 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 328  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||| |||||||     
T  17022820 aagacctaggaaagctattagagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcattta 17022721  T
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    || ||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  17022720 attcatgtagccgacctcatttagtgggataaggctt 17022684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 289 - 379
Target Start/End: Original strand, 48532151 - 48532242
Alignment:
Q  289 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca-tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48532151 tccaaattttgtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 48532242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 377
Target Start/End: Original strand, 15296060 - 15296189
Alignment:
Q  248 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 347  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| || | |  ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  15296060 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgacccca 15296159  T
Q  348 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15296160 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15296189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 374
Target Start/End: Original strand, 49841534 - 49841895
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--------tagcacctata 109  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  | || |||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||        |||||||||||    
T  49841534 agatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgaggtaagattagaaatgacaacattagtgagagagagttggggtagccgtagcacctata 49841633  T
Q  110 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 209  Q
     |||||||| |||| |||| ||| || || |||||||||| |||||||||||||| | |   | || | ||||| |||||  |||| ||| |||  ||||    
T  49841634 ttagaaaagatggtggaaactagactaaggtggtttgggcgtgtagagagaagac-attgacttctttagtaaggagagtaaatcagatgaagggtagtc 49841732  T
Q  210 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 309  Q
    || |||  |||||||||||||||||   |||||  || |||||||| ||||  || ||| || || | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  49841733 aaattactagaggtagaggaagacca--gaaaaaaataagagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatatgatag 49841830  T
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  49841831 aacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacatagcgaggtaaggcttggttgttgt 49841895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19162842 - 19162650
Alignment:
Q  120 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 219  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| || | ||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  19162842 tggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacacgcagatagaa-acttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaag 19162745  T
Q  220 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||    
T  19162744 agttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaagtatggt-aatgatagaacact 19162650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 304 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31566234 - 31566161
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31566234 tgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31566161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2341074 - 2340717
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | ||  ||||||||||  | |||||||    
T  2341074 gagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagagggtgttggggtagcaccattcgtagaaa 2340975  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    || |||| ||||||   ||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||  ||| ||    ||||| || ||||| ||||  |||||| | |    
T  2340974 agatggtggaaaatcatcttacgtggtttgagcatgtagagaaaagatcta-tagattatgtagt---gagagtagagcaaatagagggtagtcaaatca 2340879  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
      | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||| |||        || | |||||||||||| |    
T  2340878 ctaaagctagagaaagacctaggaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtcggagagggtaatgatatatgatagaacatt 2340779  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  2340778 atggcgttgtttgatccatgaagccaaccccacttagttgtataaggattggttgttgttgt 2340717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40273278 - 40273203
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40273278 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgttg 40273203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 360
Target Start/End: Original strand, 37351418 - 37351672
Alignment:
Q  106 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||   |||||||||||||| |||||||| |  ||  |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |    
T  37351418 tatagtagaaaagatggtagaaactagacttgagtggtttgggcatgtggagagaagtcatgtgaatgcggtagtaaggagagtagatcagatggaaggg 37351517  T
Q  206 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 305  Q
    || ||| | |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||| ||||| | |||||| ||||   | || |||| | ||    
T  37351518 aggcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaacaatcaagaaagatctagagattaatgagatggagaaagatatggtttttg 37351617  T
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 360  Q
     |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37351618 ttagaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggaataa 37351672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 282 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797822
Alignment:
Q  282 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 30797822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106620
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834598
Alignment:
Q  312 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 45834598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45487000 - 45486848
Alignment:
Q  229 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt---tggtgtatgatagaacactatggcgtcat 325  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || ||| | ||||| ||||| ||||||    |||| |||||||||||| |||||| | ||    
T  45487000 aagacctagaaaaactataagagaaactattatgaaagactttgagattaatgacttggaaccaaataatatggtttatgatagaacattatggcataat 45486901  T
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45486900 ttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 45486848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 50249303 - 50249529
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggat---taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||  ||||||||   ||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  50249303 gagatgatgatgtttcgttggatgtgtggtaggactagacgagataggatgattagaaatgataacattagagagagagttggggtagcgcgtatagtag 50249402  T
Q  114 aaaagttggtagaaaataggctta---gatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    ||||| |||| |||| ||| ||||   | |||||||||||||||||| ||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  50249403 aaaagatggtggaaactagacttaggtggtggtttgggcatgtagagtgaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatcagatgggggatagtca 50249502  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctag 237  Q
      | |  ||||||||||||||||||||    
T  50249503 tatcaccagaggtagaggaagacctag 50249529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 345065 - 344928
Alignment:
Q  23 aggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttgg 122  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||     
T  345065 aggatgttatgttggatttgtggtaagactagacgagataggattagaaatgatgacattagagagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgt 344966  T
Q  123 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 160  Q
    |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  344965 tagaaaataggcttaagtagtttggtcatgtagagaga 344928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Original strand, 29601063 - 29601176
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  29601063 gatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggatacggctt 29601162  T
Q  366 ggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||||||    
T  29601163 ggttcttgttgttg 29601176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 377
Target Start/End: Original strand, 36303994 - 36304248
Alignment:
Q  110 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 209  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||| | ||||| || ||||  ||||    
T  36303994 gtagaaaagatggtggaaactagg-ttagatgggttgggcatgtagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagaatagatcagatagagggtagtc 36304092  T
Q  210 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 309  Q
    |  |||  ||||| ||  | |||||||| ||||||||||           |||||| || ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  36304093 agattactagaggcagttgtagacctagtaaaactatta-----------agaaag-atctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatag 36304180  T
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || || |||||| ||||||||||||    
T  36304181 gacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactcaatgtgacaaggctcggttgttgttgt 36304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208892
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttgt 39208890  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  39208891 tg 39208892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 309 - 374
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530040
Alignment:
Q  309 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 379
Target Start/End: Original strand, 27893213 - 27893373
Alignment:
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 318  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||| |||||||||||    
T  27893213 gaggtagaggaagacctagaaagactataagagaaactattaaaaaggacctagagattaatgagttggagaaagacatgatttttgaaagaacactatg 27893312  T
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  27893313 gcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctttgttgatgctgttg 27893373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Original strand, 46148235 - 46148311
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46148235 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgtt 46148311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 336
Target Start/End: Original strand, 21200551 - 21200787
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||| ||||| |||||    
T  21200551 gggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaaggagagtagatca 21200648  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 294  Q
     ||||||   |||||| | |  || || |||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||  |||    
T  21200649 catggagagtagtcaaatcactagggggagaggaagacctagaaaaactattagacaaactatttagaaa-gatctagatattaatgagttggatagaaa 21200747  T
Q  295 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 336  Q
    | ||  |||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||    
T  21200748 tatg--gtattatagagcattatggcgtcgtttgatgcatgt 21200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271908
Alignment:
Q  288 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgttgttg 33271908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36820318 - 36820174
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||| |||    
T  36820318 agataaggttgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattagag--agagttggggtagcacctatattagcaaa 36820221  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    | |||| |||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||    
T  36820220 gatggtggaaactaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagac 36820174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 284 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45374570 - 45374475
Alignment:
Q  284 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45374570 ttggatccaactatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 45374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 289 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927846
Alignment:
Q  289 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||| || || |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgatgttg 52927846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 172
Target Start/End: Original strand, 3987011 - 3987124
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    ||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  3987011 gatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagaga 3987110  T
Q  159 gaagactagtagat 172  Q
    ||||||| ||||||    
T  3987111 gaagactggtagat 3987124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 304 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24778682 - 24778609
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24778682 tgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 24778609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Original strand, 38850014 - 38850091
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38850014 cagagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagagagag 38850091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40116449 - 40116348
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  40116449 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataaggctt 40116350  T
Q  366 gg 367  Q
    ||    
T  40116349 gg 40116348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41842806 - 41842678
Alignment:
Q  81 ttagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggt 180  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| ||    
T  41842806 ttagagagaaagt-tgggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagt 41842708  T
Q  181 aagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  41842707 aatgagagtagatcaaatggaggatagtca 41842678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 375
Target Start/End: Original strand, 659541 - 659805
Alignment:
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    |||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||||| || || | ||||   ||| |    
T  659541 tagaaaagatagtagaaacttagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatttgtagattctgtagtaagcagagttgaccagagggagagtagtga 659640  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 310  Q
    | | |  ||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||| || |  | | ||||| || | ||||||||||||    || |  | |||||||||    
T  659641 aatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactgtaagagaaaccatcaagatgtatttacagattaatgagttggatagggatattatatatgataga 659740  T
Q  311 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  659741 acattatggcagtgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgtt 659805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37083367 - 37083291
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37083367 tatgatcgaacattatggcgtaatttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 37083291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 46432031 - 46431684
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||  ||| ||| |||   |  ||||||| | | | |||||||    
T  46432031 gagatggggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacaggatagggttagaaatgactacatcagatagac--ttggggtagcgcttcttgtagaaa 46431934  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||    | |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||   |||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||| | |||| | |     
T  46431933 agacaatggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagag--gatctgtagattctgtagtaaggagagtagataagatggaggatactcaaatcac 46431836  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
     ||||| |||| |    |||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||  | || |  | |||||| ||||| |     
T  46431835 tagaggcagagaa----ctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttggatagagatattatatatgatggaacattg 46431740  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
     |||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431739 aggcgtcgtttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 46431684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415260
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23534929 - 23534576
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  || ||| | ||||   |||| |||||| |||||||  |||||||||||  || ||||||||  ||||||| |||    
T  23534929 gagaagaggatgttgcgttagatgtttgataaaactagatcagataagattagaaatgacaatattagagagagt-tgggggtagcatttatagtaaaaa 23534831  T
Q  117 agttggtagaaaatag--gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    || ||||||| ||||   |||||||||||||||  |||||||||  ||||  || | |  ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |  |     
T  23534830 agatggtagataatataagcttagatggtttggatatgtagaga--agacccgtgggttatgtagtaaggagagtagatcagatggatgatagttagatc 23534733  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| | |||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||    ||| || | ||||||||||||     
T  23534732 actagaggtagaggaagacccaaaaaaattataacagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggactgtaatatgatttatgatagaacat 23534633  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  23534632 tatggcgtaatttgatccatgtagtcgacctcactttgt-ggataaggcttggttgtt 23534576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 377
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991713
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgttgt 40991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 377
Target Start/End: Original strand, 11284120 - 11284270
Alignment:
Q  222 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||     ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| ||| ||     
T  11284120 gtagaggaagacctag-aaaactataagagaaactattaa----gatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgca 11284214  T
Q  322 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    || |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11284215 tcgtttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataaggcttgcttgttgttgt 11284270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541343
Alignment:
Q  288 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttg 24541343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 279 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48712173 - 48712075
Alignment:
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||| | | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48712173 atgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 48712075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Original strand, 11581432 - 11581609
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||  ||  ||| ||||    
T  11581432 agagagagagttagggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagacatgtgaattatgtagtaa 11581531  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 260  Q
    |||||||  |||| ||| ||| ||||||| | |  |||||||   |||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11581532 gaagagtacatcagatgtaggtgagtcaaatcactagaggtatgagaagacctagaaaaactataagagaaactatta 11581609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42026817 - 42026536
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    |||||||||  | ||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||  | | ||||| ||||| |||||    
T  42026817 gggtagcactcacagtagaaaagagggtggaaactaggcttaggtggtttgagcttgtagagagaaaacttgtagattatttagtaaggagagtagatca 42026718  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 295  Q
     | |||||| | |||  |    ||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||  |  ||| ||| | | |||||||| |||  ||||    
T  42026717 gacggaggataatcacatccctagaggcagaggaagaccaatcaaagctataagagaaactattaagattgatatagggattaatgagttagatagaaat 42026618  T
Q  296 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||||| ||||||| |||||||    
T  42026617 atggtatatgatagaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataagacttggttcttgttgt 42026536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 377
Target Start/End: Original strand, 29475811 - 29475968
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||  ||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| | || |||||||||| |||||    
T  29475811 agaggcagaggaagacctagaaaagctataaga--aactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatattgtttatgatagaaaactat 29475908  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29475909 ggcgtaatttgacccatctagccaactccagttagtgggataaggtttggttgttgttgt 29475968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41482298 - 41482141
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaagga-tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| ||| | ||||||||| | | |||| |||| |||||||||||| |    
T  41482298 agaggcagaggaagacctagaaaaacttttaagagaaactattaggaaagactttggagattaatgagttgaaccaaaatctggtttatgatagaacatt 41482199  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| ||||||||      ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41482198 atggcgtaatttgatc------gccaaccccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttg 41482141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 306 - 377
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278746
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgt 7278746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 305 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21862813 - 21862742
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21862813 gatagaagaatatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgttg 21862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31337884 - 31337751
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||   ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31337884 gagataaggatcttgtgttggatgtgtgataagactagatgggataggattaa-aatgacagcattagagagaaagt-tgggtagcacctatagtagaaa 31337787  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 152  Q
    || |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  31337786 agatggttgaaactaggcttaagtggtttgagcatg 31337751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 52882724 - 52882662
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52882724 tatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggagaaggcttggttgttgttgt 52882662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 388337 - 388260
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  388337 tatgatagagcattatgacgtaatttgatcaatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtcgttgttg 388260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 163
Target Start/End: Original strand, 29600863 - 29600968
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagag 157  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    ||| | | ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29600863 gatatgattagaaatgacaacattagagagagagttgtcgtaacgcttatagtaaaaaagatggtagaaaataggttttagatggtttgggcatgtagag 29600962  T
Q  158 agaaga 163  Q
    ||||||    
T  29600963 agaaga 29600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 31146907 - 31146983
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31146907 tatgataaaaca-tatggtgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 31146983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 378
Target Start/End: Original strand, 39512777 - 39512826
Alignment:
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39512777 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 39512826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39782009 - 39781917
Alignment:
Q  285 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39782009 tggatccaaatacggtttatgataga-cattatggcgtaatttgatcaatgtggccgaccccactcagtgggataaggcttgggtgttgttgtt 39781917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 376
Target Start/End: Original strand, 45468795 - 45468856
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45468795 tatggcgtcgtttgatctatgtaaccgatcccacttagtggaataaggcttggttgttgttg 45468856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 374
Target Start/End: Original strand, 32170592 - 32170684
Alignment:
Q  282 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32170592 agttggatagaaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 45236778 - 45236850
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 89  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45236778 gagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattagagaga 45236850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Original strand, 3987543 - 3987618
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3987543 tgataggacactatggcgttgtttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttg 3987618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Original strand, 20208207 - 20208282
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  20208207 tgatagaactttatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataacgcttggttaatgttgttg 20208282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Original strand, 30345445 - 30345520
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 92  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  30345445 gagatgaggatgttgtgttggatgagcggtaagattggacatgatagaattatgaatgacactatttaagagagag 30345520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 379
Target Start/End: Original strand, 35420455 - 35420552
Alignment:
Q  283 gttggatccaaatttggtgt--atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| |||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35420455 gttggatcgaaatatggtgtgcacgatagaacattatggcgtaatttggtccatgtagc-gaccccatttagtgggataaggcttggttgttattgttg 35420552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 374
Target Start/End: Original strand, 49045023 - 49045114
Alignment:
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||   |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  49045023 gttggatccaaatatagtttatgacagaacattatggccgaatttaatccatgtagccgaccccactcagtgggacaaggcttggttgttgt 49045114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 54422963 - 54422837
Alignment:
Q  257 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt------catttgatccatgtagccgatcccactt 350  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| | |       ||||||||||| |||| || |||||||    
T  54422963 attaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgaccccactt 54422864  T
Q  351 agtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||| | ||||| || |||||||    
T  54422863 agtgggatgatgcttgattattgttgt 54422837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Original strand, 29817427 - 29817565
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || | | |||||||||  ||||||||||||||   |||| | ||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  29817427 agatgaggatgttgcgttggataagtgacaaaactggacatgatataattaggaatgacactgatagaaatagaattggtgtagcacctatagtagaaaa 29817526  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 156  Q
    | | ||||||| || | |||| |||||||| ||||||||    
T  29817527 gattgtagaaagtaagtttaggtggtttggacatgtaga 29817565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31453025 - 31452963
Alignment:
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31453025 actatggcgtcgtttgattcatgtagcagaccccacttagtggaataaggcttggttgttgtt 31452963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40116619 - 40116505
Alignment:
Q  226 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 325  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  40116619 aggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattgtggcgtaat 40116520  T
Q  326 ttgatccatgtagcc 340  Q
    | |||| | ||||||    
T  40116519 tcgatctacgtagcc 40116505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 379
Target Start/End: Original strand, 50249607 - 50249661
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50249607 tttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggatacggcttggttgttgttgttg 50249661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45493851 - 45493695
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| ||||| | ||||||  ||||||| | |||||| ||||  || |||  |||||| |||||| |||||  |||  |||| ||||||||| || |||    
T  45493851 agaggcagagggatacctagataaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattat 45493752  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  45493751 ggcgccattcaatccatgtagccgaccccacttagtaggataaagcgtggttgttgt 45493695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 46367462 - 46367390
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  46367462 tatgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaagcttggttgttgt 46367390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 53214931 - 53214871
Alignment:
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53214931 tggcgtaatttgatccatgcagccgaccccatttagtcggataaggcttggttgttgttgt 53214871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4472481 - 4472386
Alignment:
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||   ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  4472481 gttggattcaaatatgatttataatagaacactatggtgtaacttgatccatgtagccgactacacttagttcgataaagcttggttgttgttgtt 4472386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30332633 - 30332558
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| | |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30332633 tgatagaacattatggcataatttgatccaggcagcctaccccacctagtgggatacggcttggttgttgttgttg 30332558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 47542074 - 47542031
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47542074 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacat 47542031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 317 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21427644 - 21427586
Alignment:
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21427644 tggcgtcgtttgatccatgtagtcaatcctacttagtgggataagacttggttgttgtt 21427586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Original strand, 48259947 - 48259989
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48259947 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 48259989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 48953756 - 48953694
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacacc 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  48953756 gagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagattggatgagataggattaagaatgacacc 48953694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 288
Target Start/End: Original strand, 26990337 - 26990406
Alignment:
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 288  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  26990337 gaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctagagatcaatgagttgga 26990406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 31261040 - 31260964
Alignment:
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31261040 atgatagaacactgtgacatcatttgattcatgc-gccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgtttttgttgc 31260964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 375
Target Start/End: Original strand, 35481143 - 35481208
Alignment:
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35481143 aacattatgacgtaatttgattcatttagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgtt 35481208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39535475 - 39535399
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39535475 tatgatagaacattatggtggcgtttgatccatgtaaccgg-cccacttagtgggataaagcatggttgttgttgttg 39535399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 44103002 - 44102953
Alignment:
Q  331 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44103002 ccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttattgc 44102953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Original strand, 46568036 - 46568113
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 92  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  46568036 cagagatgaggatgttgtgttggatgtgtgttaagactagaccagattgaattagaaatgacaacattagagagagag 46568113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 375
Target Start/End: Original strand, 49888402 - 49888467
Alignment:
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  49888402 aacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagttggaaaaggtttggttgttgtt 49888467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 344834 - 344770
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  344834 tatggtgtaatttcatcgatgtagccgacccaacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 344770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31453242 - 31453151
Alignment:
Q  73 tgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  31453242 tgacaacattaga-agagagttggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33755501 - 33755348
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||| | ||||||||||| | | || |||| |  ||  ||||| |||    
T  33755501 agaggcagaggaaaacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaaacttagagattaatgagttggaccaagatatggttt--gagtgaacattat 33755404  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    | ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  33755403 gacgtaatttgatcgatgtagccaaccccacttagtgagatagggctcggttgttg 33755348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 34844721 - 34844569
Alignment:
Q  229 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 328  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || ||| | |||||| |||| |  |||   || |||||||||||| |||||  | || ||    
T  34844721 aagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaaacttggagattaatgaggtggaccagaatactgtttatgatagaacattatggtataatatg 34844622  T
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34844621 atccatgtagccgaccccactaagtaggataaggctttggttgttattgttgc 34844569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 379
Target Start/End: Original strand, 35701093 - 35701133
Alignment:
Q  339 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701093 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35701133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 38054696 - 38054624
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 90  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  38054696 agatgagaatgttgcgttgaatgggtggtaagactagacgggataggattagaaatgataacattagagagag 38054624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 49933492 - 49933436
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 381  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49933492 tttggtccatgtagccgacctcacttagtgggataaagcttgattgttgttgttgca 49933436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Original strand, 7120790 - 7120865
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| || | |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7120790 tatgataaaatattatgacgtaatttgatccatataaccgataccacttagtgggatatggcctggttgttgttgt 7120865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23610965 - 23610930
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23610965 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 23610930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 377
Target Start/End: Original strand, 27192466 - 27192505
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192466 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 27192505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 332 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35032811 - 35032764
Alignment:
Q  332 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35032811 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgatgttg 35032764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36049401 - 36049309
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    ||||| ||||||| |||| |||  ||||||  |||||||| |||| |||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36049401 aatgaattggatcaaaatatggcctatgattaaacactatagcgtaatttgat--atgtagccggccccacttagtgggatagggcttggttgtt 36049309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37102870 - 37102807
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  37102870 tatggtgtaatttgatccatgtagcctaccccacttcgtgggataaggcatgtttgttgttgtt 37102807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40672429 - 40672366
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40672429 tatggcataatttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataaggcttggttatagttgtt 40672366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 380
Target Start/End: Original strand, 43308696 - 43308847
Alignment:
Q  229 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 328  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| ||||  ||  || ||||| | ||| ||||||||  | || || | ||||||||||||  || ||| |  |||    
T  43308696 aagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaaaatctagagattaatcagttggatagagatatgatatatgatagaacataattgcgccggttg 43308795  T
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43308796 atccatgtagccaaccccactttgtgggatgaggcttggtttttgttgttgc 43308847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Original strand, 43529295 - 43529330
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43529295 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43529330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 237336 - 237294
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  237336 agccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 237294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 372
Target Start/End: Original strand, 6988113 - 6988179
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  6988113 atagatcattatggcgtcatttgatcaatgtagccgactccttttagtgggataaggcttagttgtt 6988179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21428065 - 21427995
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  21428065 atagaacattatggcgtaatttgatccatgtagtcgactccatttattgggataaggattggtagttgttg 21427995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Original strand, 26388414 - 26388540
Alignment:
Q  28 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 127  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||    ||| |||||| ||| | ||||||||| | |||||   | | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26388414 gttgcgttggatgtgtggttagactagattatatatgattagaaattaaaccattagacatagagttgagatggcacctataatagaaaagatggtagaa 26388513  T
Q  128 aataggcttagatggtttgggcatgta 154  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||    
T  26388514 aataggtttaggtgatttgggcatgta 26388540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34719155 - 34719081
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||||||| || |||||| || |||||| | ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34719155 tatgatagagcattatggcttcgtttgattcttgtggctgaccccacttagggggataaggcttggttgttgttg 34719081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 37534483 - 37534429
Alignment:
Q  100 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 154  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37534483 agcaccgatagtagaaaagatggtggaaaataggcttacctggtttgggcatgta 37534429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39535715 - 39535653
Alignment:
Q  102 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  39535715 cacctatagtagaaaagatggtagaaacccggcttaggtggtttaggcaagtagagagaagac 39535653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Original strand, 53266893 - 53266975
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||||   ||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  53266893 tggtttatgatagaatgttatggtgtaatttaatccatgtagccgatctcacttagtgagataagggttggtggttattgttg 53266975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 379
Target Start/End: Original strand, 829149 - 829186
Alignment:
Q  342 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  829149 atcccacttagttggataaggcttggttgttgttgttg 829186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3870698 - 3870649
Alignment:
Q  123 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 172  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3870698 tagaaacttggcttagatggttttggcatgtagagagaagacttgtagat 3870649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Original strand, 8566670 - 8566711
Alignment:
Q  332 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8566670 catgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttg 8566711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 374
Target Start/End: Original strand, 26990442 - 26990491
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26990442 tttgattcacgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgt 26990491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27796065 - 27795996
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 361  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||| | |||||||    
T  27796065 aaatttggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatgtacccaaccccacttattaggataag 27795996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31337741 - 31337560
Alignment:
Q  191 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 290  Q
    ||||||||| |||  |||||||| |  ||||  ||||||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||| || |||||    |||||||||||     
T  31337741 gatcaaatgaagggcagtcaagtgactagagtcagaggaaaacctagaaaaactataacagaaactataagaaag-atctagag----atgagttggata 31337647  T
Q  291 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     |||| |||| | |||||||||| |||| | |  ||||||| || || |||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31337646 gaaatatggtatttgatagaacattatgacattgtttgatctatttaaccgacctcacttagtggtataaagcttggttgttgttgt 31337560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 116
Target Start/End: Original strand, 33307087 - 33307165
Alignment:
Q  36 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||||| || |||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33307087 ggatgtgtggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacatt--agagagagttggggtagcacctatagtagaaa 33307165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 373
Target Start/End: Original strand, 34253689 - 34253738
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  34253689 atttgatccatgtagccgaccccatttagtgggacagggcttggttgttg 34253738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Original strand, 35465758 - 35465811
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  35465758 atttgatccatgtagctgacctcacttaatgggataaggattggttgttgttgt 35465811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41842630 - 41842529
Alignment:
Q  270 tagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
    ||||||| |||||||| |||  |||| |||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | | || |||||| | ||||||||||||    
T  41842630 tagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagtcaacctcatttagtgagctaaggcttggtt 41842531  T
Q  370 gt 371  Q
    ||    
T  41842530 gt 41842529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 374
Target Start/End: Original strand, 46140617 - 46140686
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  46140617 gatagaacattatggagttgtttgatccatgtagtcgaccccactttgtgagataaggtttggttgttgt 46140686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 374
Target Start/End: Original strand, 54485767 - 54485816
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  54485767 tttgatctatgtagccgatcccgcctagtcggataaggcttggttgttgt 54485816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 365
Target Start/End: Original strand, 7942864 - 7942924
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| ||||| ||  || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7942864 gatagaacattatggtgttgttcgatccatgtagtcgataccacttagtgggataaggctt 7942924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24084368 - 24084320
Alignment:
Q  331 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24084368 ccatgtaaccgactccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 24084320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43396122 - 43396082
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43396122 agccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 43396082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 52077509 - 52077473
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52077509 agccgatcccacttagtgggacaaggcttggttgttg 52077473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 7446274 - 7446329
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  7446274 atttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaaggctcggttgctgttgttg 7446329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 7454416 - 7454471
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  7454416 atttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaaggctcggttgctgttgttg 7454471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Original strand, 21000720 - 21000755
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21000720 cccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 21000755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Original strand, 36764934 - 36764969
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36764934 cccacttagtggtataaggcttggttgttgttgttg 36764969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 377
Target Start/End: Original strand, 40122645 - 40122696
Alignment:
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  40122645 ttgatccatgtagccgaccccacttagttggataaaacttggttgtcgttgt 40122696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41230548 - 41230513
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41230548 cccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 41230513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44134111 - 44134044
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||    
T  44134111 gggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44443250 - 44443208
Alignment:
Q  332 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44443250 catgtagctgatcccactta-tgggataaggcttggttgttgtt 44443208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48328231 - 48328200
Alignment:
Q  347 acttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48328231 acttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 48328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 50631954 - 50631879
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| |||| | |  |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50631954 tgatagaacattatgccattgtttgattcatgcagccaaccccacttagtgggataaagattggttgttgttgttg 50631879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Original strand, 55244461 - 55244565
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag----ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||    || | ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  55244461 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgaagctgaccaaccccgcttagtgggataagacttggctgttg 55244560  T
Q  374 ttgtt 378  Q
     ||||    
T  55244561 ctgtt 55244565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 944501 - 944467
Alignment:
Q  334 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 368  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  944501 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggt 944467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4660211 - 4660165
Alignment:
Q  333 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4660211 atgtagccgactccaattagtggaataaggcttggttgttgttgttg 4660165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Original strand, 21506270 - 21506304
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21506270 cccacttagtgggatatggcttggttgttgttgtt 21506304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 379
Target Start/End: Original strand, 34067137 - 34067183
Alignment:
Q  333 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34067137 atgtagccaaccccacgtagtggaataaggcttggttgttgttgttg 34067183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36868503 - 36868437
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||| || | |||||||    
T  36868503 gtagcacctatggtagagaagatggtggaaagtaggcttaggtggtttgggcatatataaagaagac 36868437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37598245 - 37598171
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc-cacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | | || || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37598245 tatgatagaacattatggcgtcatttgactcatgtagtcaaccctcatttagtgggataaagcttgattgttgtt 37598171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 44133918 - 44133845
Alignment:
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  44133918 atgatagagcattatggcgt-atttgatccatgtagtcgatcttatttagtggtataaagtttggttgttgttgt 44133845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 366
Target Start/End: Original strand, 53951956 - 53952026
Alignment:
Q  296 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    ||||| |||||||||| | || || | | |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53951956 ttggtatatgatagaatattacggtgccgtttgatccatatagccgaccccacatagtgggataaggcttg 53952026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21513099 - 21513070
Alignment:
Q  349 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21513099 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21513070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24103457 - 24103420
Alignment:
Q  321 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 358  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24103457 gtcatttgatccatgtaaccgatcccacttagagggat 24103420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26874886 - 26874857
Alignment:
Q  349 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26874886 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 26874857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32052472 - 32052395
Alignment:
Q  300 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||   | |||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||    
T  32052472 tgtatgatagaacattattgcgtcatttggtccatgtagttcaccccacttagcaggacaagacttggttggtgttgt 32052395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 379
Target Start/End: Original strand, 34812775 - 34812828
Alignment:
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34812775 ttgatccatgtaactgactccacttagtgggataaagcttggttggtgttgttg 34812828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37103026 - 37102989
Alignment:
Q  333 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37103026 atgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttg 37102989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Original strand, 41965819 - 41965860
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41965819 tagccgactccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 41965860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41971345 - 41971277
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41971345 tatgatagaacattatgacgttgtttgatccatgtagccaactccacttagt-ggataaggctttgttgt 41971277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47804738 - 47804666
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  47804738 tatgatagaacattatggcattgtttcatccttgttgccgatcccactttgtaggataa-gcttggttgttgtt 47804666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Original strand, 49090632 - 49090673
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49090632 tagccgaccccacttaatgggaaaaggcttggttgttgttgt 49090673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 50621720 - 50621647
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 90  Q
    |||||||| ||||||| || |||  ||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50621720 gagatgagaatgttgcatttgatatgtggtaagactatgaatgataggattagaaatgacaacattagagagag 50621647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 53266871 - 53266818
Alignment:
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  53266871 ttgatccatgtagccggtctcacttagtgagatgaggcttggtggttattgttg 53266818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 360
Target Start/End: Original strand, 1512046 - 1512090
Alignment:
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataa 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1512046 tggcgtaatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataa 1512090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6780755 - 6780663
Alignment:
Q  285 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| || | |  ||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  6780755 tggatccaaatatgatttcagatagaacgttatgacgtaatttgatccctgtagccgaccacacttagtgagaaaaggtttggctgttgttgt 6780663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Original strand, 30305256 - 30305296
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30305256 agccgaccccacttaatgtgataaggcttggttgttgttgt 30305296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 32052594 - 32052538
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32052594 atttgattcatgtagccgacgtgacttagtgtgataaggtttggttgttgttgttgc 32052538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 378
Target Start/End: Original strand, 33034848 - 33034880
Alignment:
Q  346 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33034848 cacttagtgggataaggcttggtggttgttgtt 33034880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 42510373 - 42510333
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattaga 55  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  42510373 cagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 42510333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 311
Target Start/End: Original strand, 44571599 - 44571643
Alignment:
Q  267 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 311  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44571599 atttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 44571643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 377
Target Start/End: Original strand, 50891993 - 50892025
Alignment:
Q  345 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50891993 ccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 50892025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 225)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Original strand, 37617864 - 37618230
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37617864 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 37617963  T
Q  115 aaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37617964 aaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 37618063  T
Q  214 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618064 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 37618163  T
Q  314 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618164 ctatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 37618230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Original strand, 34869341 - 34869702
Alignment:
Q  16 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34869341 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 34869440  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  34869441 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagtta 34869540  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869541 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 34869640  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869641 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 34869702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 11593880 - 11594244
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11593880 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcacctatagtaga 11593979  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11593980 aaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 11594079  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594080 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 11594179  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594180 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 11594244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12841637 - 12841273
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12841637 cagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccattagagagagagtggaggtagcacctatagtaga 12841538  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12841537 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 12841438  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12841437 aaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaacac 12841338  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12841337 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12841273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 49029196 - 49029559
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49029196 cagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 49029295  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  49029296 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaagtt 49029395  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49029396 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 49029495  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  49029496 tatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatacggc-tggttgttgttgttg 49029559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 35906563 - 35906208
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35906563 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtaga 35906464  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  35906463 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaagtt 35906364  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906363 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 35906264  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35906263 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 35906208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39906730 - 39906370
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39906730 gagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaa 39906631  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  39906630 agttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggag--tcaagttaa 39906533  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906532 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 39906433  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906432 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 39906370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33350168 - 33349804
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33350168 cagagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtaga 33350069  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33350068 aaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 33349969  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33349968 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaacac 33349869  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33349868 tatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 33349804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44855534 - 44855172
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  44855534 cagagatcaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagtaga 44855435  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44855434 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 44855335  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  44855334 aaaagaagtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgat--aacac 44855237  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44855236 tatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44855172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46356217 - 46355858
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  46356217 cagagatg-ggatgttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatgggggtagcacctatagtaga 46356119  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46356118 aaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 46356019  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46356018 aaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaacac 46355919  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46355918 tatgccatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45836840 - 45836480
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45836840 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 45836741  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||      
T  45836740 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaggtt-- 45836643  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  45836642 atgaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacacta 45836543  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45836542 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 45836480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13859370 - 13859061
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13859370 cagagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 13859271  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13859270 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 13859171  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13859170 agaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacac 13859071  T
Q  315 tatggcgtca 324  Q
    ||||||||||    
T  13859070 tatggcgtca 13859061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 60 - 379
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375152
Alignment:
Q  60 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagag 6374932  T
Q  160 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6374933 aagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccatt 6375032  T
Q  260 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 359  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6375033 agaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 6375132  T
Q  360 aggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  6375133 aggcttggttgttgtcgttg 6375152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 379
Target Start/End: Original strand, 36651912 - 36652276
Alignment:
Q  13 aacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |  |||| ||| | ||||||    
T  36651912 aacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaggg--taggggtggcatccatagta 36652009  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  36652010 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaag 36652109  T
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36652110 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 36652209  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36652210 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgctgttgttg 36652276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 379
Target Start/End: Original strand, 43281600 - 43281958
Alignment:
Q  19 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  43281600 gatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaag 43281697  T
Q  119 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  43281698 ttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaa 43281797  T
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  43281798 gaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 43281897  T
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43281898 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttg 43281958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 31005143 - 31005489
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31005143 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 31005242  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31005243 aaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 31005342  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||                
T  31005343 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagttggatccaaatttggtgt------------ 31005430  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31005431 ------gtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31005489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35559353 - 35558994
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacct-atagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35559353 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcaccttatagtagaaa 35559254  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||   ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35559253 agttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaa 35559154  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||    
T  35559153 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttagtttatggtagaacatta 35559054  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    | || |||||||||||||||||| || | || |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  35559053 tagcatcatttgatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgttg 35558994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 95 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31682884 - 31682600
Alignment:
Q  95 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  31682884 tgggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatc 31682785  T
Q  195 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31682784 aaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccata 31682685  T
Q  295 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31682684 tttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31682600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 60 - 379
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650668
Alignment:
Q  60 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 29650448  T
Q  160 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 259  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||    
T  29650449 aagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccatt 29650548  T
Q  260 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 359  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29650549 agaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 29650648  T
Q  360 aggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29650649 aggcttggttgttgttgttg 29650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 43491230 - 43491592
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||| |||    
T  43491230 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtaggggtaacacctatagtataaa 43491329  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  43491330 aattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcaggtcaa 43491429  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  43491430 aagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacacta 43491529  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491530 tgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43491592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 38606927 - 38607276
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38606927 gagatgataatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacatta-agagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 38607025  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  38607026 ggttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcacgttag 38607125  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||| ||||||||||||| ||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  38607126 aagagggagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 38607213  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38607214 tggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 38607276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 81 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2886018 - 2885720
Alignment:
Q  81 ttagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggt 180  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||    
T  2886018 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgt 2885919  T
Q  181 aagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaat 280  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  2885918 acgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaat 2885819  T
Q  281 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2885818 gagttggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 2885720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 98 - 379
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349904
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||   ||||||||||||| |||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  198 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  298 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 22349904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 96 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36869525 - 36869235
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| |||||    
T  36869525 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagatca 36869426  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 295  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  36869425 aatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaaat 36869326  T
Q  296 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc-------catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36869325 ttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 36869235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Original strand, 33072874 - 33073108
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  33072874 cagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtaga 33072971  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33072972 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaagtt 33073071  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33073072 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatcagag 33073108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 376
Target Start/End: Original strand, 23404343 - 23404697
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  23404343 atgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagt 23404442  T
Q  120 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 219  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||||| |||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  23404443 tgggagaaaataggcttagacagttt-ggcatgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaag 23404541  T
Q  220 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||   ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23404542 aggtagaagaagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacattatgg 23404641  T
Q  320 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
     || |||| |||| | ||||||| |||||||  | |||||||| || ||||||||||    
T  23404642 tgtaattttatccgtatagccga-cccacttgataggataaggtttagttgttgttg 23404697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Original strand, 36136687 - 36137046
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36136687 agatgagaatgttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 36136786  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
    | ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| ||   |||||| ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||  | | |    
T  36136787 gatggtagaaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcaga 36136886  T
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  36136887 agaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacattat 36136986  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     | || |||||||  || || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36136987 agggtaatttgatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36137046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 208 - 379
Target Start/End: Original strand, 38900070 - 38900240
Alignment:
Q  208 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38900070 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 38900169  T
Q  308 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38900170 tgaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 38900240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 379
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682458
Alignment:
Q  105 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  205 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 304  Q
     |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaagcttggtagttgttgttg 15682458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28628284 - 28627936
Alignment:
Q  26 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 125  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||  | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||| | |||| |    
T  28628284 atgttgccttggatgtatggtaagaccatacgggatgggattagaaattacaacattagagagggagttggagtagcacctagagtagaaatgatggtgg 28628185  T
Q  126 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 225  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||| | | |||||||||    
T  28628184 aaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaagaggtag 28628085  T
Q  226 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 325  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  28628084 aggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaat 28627985  T
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28627984 ttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979928
Alignment:
Q  212 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  312 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40979928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631848
Alignment:
Q  134 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  234 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 333  Q
    ||| |||||| |||||| ||            |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  32631715 ctaagaaaaccattagaaaa------------gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  334 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32631803 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32631848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 168 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681022
Alignment:
Q  168 tagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagga 267  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  268 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 367  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttgg 31681030  T
Q  368 ttgttgtt 375  Q
    ||||||||    
T  31681029 ttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 378
Target Start/End: Original strand, 7273151 - 7273383
Alignment:
Q  146 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 245  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| || ||| | ||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7273151 gggcatgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaacta 7273250  T
Q  246 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 345  Q
    | |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7273251 taagagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccc 7273350  T
Q  346 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7273351 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 7273383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 334
Target Start/End: Original strand, 47848596 - 47848912
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| || | ||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  47848596 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataacattagagagagagttggggtagcgcctatagtagaaa 47848695  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||||   | |     
T  47848696 agatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaaggagagtagatcagatggaggatagtctgatcac 47848795  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
     ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  47848796 tagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactattggaaa-gatttggggattaatgagctggatccaaatatggtttatgatagaacatta 47848894  T
Q  317 tggcgtcatttgatccat 334  Q
    |||  | |||||||||||    
T  47848895 tggtttaatttgatccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598186
Alignment:
Q  153 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 252  Q
    ||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  253 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttag 352  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||| | || |||     
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccga-ctcatttaa 24598213  T
Q  353 tgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24598212 tgggataagacttggttgttgttgttg 24598186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 230 - 377
Target Start/End: Original strand, 48919247 - 48919394
Alignment:
Q  230 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48919247 agacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttga 48919346  T
Q  330 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48919347 tccatgtagtcgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 48919394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649063
Alignment:
Q  252 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 351  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T
Q  352 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27649037 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 27649063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8492580 - 8492236
Alignment:
Q  30 tgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8492580 tgcgttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaa 8492481  T
Q  130 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 229  Q
    |||||| || |||||||  | |||||||| |||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||||||||| || |  ||| ||||||||||| |    
T  8492480 taggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagaggtagagaa 8492381  T
Q  230 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 329  Q
    ||||| | |||||  |||| |  |||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| | ||||||    
T  8492380 agacc-acgaaaa--attataataactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttga 8492284  T
Q  330 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    || ||||| |  | ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  8492283 tcaatgtaactaaccccacttagtgagataaggctcgactgttgttgt 8492236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 246 - 378
Target Start/End: Original strand, 21078068 - 21078200
Alignment:
Q  246 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 345  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       
T  21078068 ttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgactt 21078167  T
Q  346 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21078168 catttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Original strand, 7272961 - 7273151
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | | ||| |||||||||||||||    
T  7272961 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaacgggagtatcacctatagtagaaa 7273060  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  7273061 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagatcagatggaggagag 7273151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 217 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210702
Alignment:
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgttg 9210702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 378
Target Start/End: Original strand, 1011103 - 1011329
Alignment:
Q  151 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 250  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  1011103 tgtagagagaagacatctagatgttgtagtacgaagagtagatcagataaaggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgaga 1011202  T
Q  251 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 350  Q
    ||||  ||||| ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| | |||| || ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  1011203 gaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatccaa-tatggtttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccactt 1011301  T
Q  351 agtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1011302 agtgggataaggcttggttgttgttgtt 1011329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 113 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38135476 - 38135211
Alignment:
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 212  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||      
T  38135476 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaaggaga-tagatcagatggaggatagtcaga 38135378  T
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    | |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||  ||||||||||     
T  38135377 tcattagaggcagatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaat 38135278  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38135277 attatggcgtaatttgatccatctagctgaccccacttggtgggacaaggcttggttgttattgttg 38135211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 137
Target Start/End: Original strand, 32630517 - 32630636
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32630517 gagatgaggatgttgagctggatgagtggtaagactagacatgataggattagga-tgataccattggagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 32630615  T
Q  117 agttggtagaaaataggctta 137  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32630616 agttggtagaaaataggctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 271 - 378
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073212
Alignment:
Q  271 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  371 ttgttgtt 378  Q
    || |||||    
T  33073205 ttattgtt 33073212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 379
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966300
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 197  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||| ||||||     
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaag 12966124  T
Q  198 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 297  Q
    || ||   |||||| | |       ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  |||||||| | ||||| ||||||  |||| |    
T  12966125 tgaagactagtcaaatcac------tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatat 12966218  T
Q  298 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||| ||||||| | || |||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12966219 ggtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12966300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 282 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208326
Alignment:
Q  282 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28208326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 267 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035155
Alignment:
Q  267 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  367 gttgttgttg 376  Q
    ||||||||||    
T  34035164 gttgttgttg 34035155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25579431 - 25579205
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||     ||||||||| ||||||  |||||||||||| | | | |||||||| |||| |||||    
T  25579431 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaatactaga-----taggattagaaatgaccacattagagagagtggg-gagtagcacccatagcagaaa 25579338  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    |  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | |     
T  25579337 aaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggaggatagtcaaatcac 25579238  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 249  Q
    ||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  25579237 aagagttaaatgaagacctagaaaaactattag 25579205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 260
Target Start/End: Original strand, 43282330 - 43282574
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt---agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43282330 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatttagagagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 43282429  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||| ||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| ||| | |||||||| |||||  | |     
T  43282430 agtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagacttgcagattctgtaggaaggagagtagat-agatggaggatagtcagatcac 43282528  T
Q  217 aagag--gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 260  Q
    |||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43282529 aagaggtgtagaggatgacctagaaaaactataagagaaactatta 43282574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 218 - 374
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601755
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    || || |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgt 45601755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 46014498 - 46014359
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46014498 gataagattagaaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg-ttggacatgtagaga 46014400  T
Q  159 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatg 199  Q
    ||||||   ||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  46014399 gaagacccatagatgccgtcctaagaagagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36514567 - 36514371
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||    
T  36514567 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattagagagag--ttggggtagcacctatagtaga 36514470  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 213  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||| | ||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  36514469 aaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagacgacttgtggattctgtagtatggagagtagatcagatagaggggagtcaagt 36514371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7189593 - 7189296
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga--------gtgtgggtagcacctat 108  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||        ||  |||| ||||||||    
T  7189593 gagatgaggatgttgtgttgaatgaccggtaagattagacgagataggat-atgaatgacaccattagagagagaaagagagagttggggtcgcacctat 7189495  T
Q  109 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat------gctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 202  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||      | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  7189494 agtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatcgatagatgttgtagttgtagtatgaagagtagatcagatggag 7189395  T
Q  203 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 300  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||| ||  |||||||||    
T  7189394 gagagtcatattagaagatgtagaggaagacctagaaaaactataagggaagctaattagaaaagatttagaggttaaggagttgaatataaatttggt 7189296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36102127 - 36101775
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||| ||||   |||  |||||| ||||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  36102127 cagagatgaaaatgttgagttcgatgtgtggtaagactagatgggatgagattagaaatgacaacatttgaggaagagtgaaggtagcacctataataga 36102028  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||   | | ||||| ||||| |||||| | |||||  |     
T  36102027 aaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacctatagattttgtaacagggagagtagatcatatggagaatagtcagatc 36101928  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |  ||||| |||||||||||||| |||| |||||            ||||| ||||| || | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||     
T  36101927 actagaggcagaggaagacctagaaaaattattat-----------gaaag-atttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacat 36101840  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36101839 tatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 36101775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48736256 - 48735899
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||  ||||| ||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||     
T  48736256 atgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagatgagataaaattagaaatgacgacattatagagagagttggggtagcacctacagtagaaaaga 48736157  T
Q  120 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 219  Q
    ||| ||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||  || |||  ||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||  | |  ||    
T  48736156 tgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttaggagagtagatcaaatggagg-gagtcagatcactag 48736058  T
Q  220 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 319  Q
    |||||| |  |||||| | |||||||| |||||  | ||||| | || | ||||| | |||||||| ||   | |  |||| ||||| |||| |||||||    
T  48736057 aggtagggctagaccttgaaaaactataagagaggctattagtagggttctagagataaatgagtttgagaaagacatggtttatga-agaatactatgg 48735959  T
Q  320 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48735958 cgtcgtttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 48735899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26742215 - 26741892
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 157  Q
    ||||||||||| ||||| |  || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  26742215 gataggattagaaatgataatatcagagagtgagagttgggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagag 26742116  T
Q  158 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga--aac 255  Q
    | | |||   |||||  ||||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | |  ||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||    
T  26742115 aaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaac 26742016  T
Q  256 aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgg 355  Q
     ||||| ||  |||| ||  | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||     
T  26742015 tattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtgc 26741916  T
Q  356 gataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     | || ||||||||||||||||||    
T  26741915 aaaaatgcttggttgttgttgttg 26741892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 39811882 - 39812066
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 119  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||      
T  39811882 atgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagagagagttggggcagcacctatcatagaaaaaa 39811981  T
Q  120 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 204  Q
    ||||  ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||||| || | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  39811982 tggtgaaaactcggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagagatgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagga 39812066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 379
Target Start/End: Original strand, 42187572 - 42187725
Alignment:
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact-atggcgtc 323  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||| ||  |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||     
T  42187572 gaggaagacctaa-aaaattataagagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaatt-ggtttatgatagaacatttatggcgta 42187669  T
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42187670 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgttgttg 42187725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 5335842 - 5336193
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||   ||||| ||||| | ||||  |||||||||  |||||||| |||||||||     
T  5335842 cagagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagacagaatgcaattagaaatgataacatt--agagagagttggggtagcatctatagtagg 5335939  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||| |||| || || ||||| ||| | ||||||| ||||||| |     
T  5335940 aaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaagaactgtggattctgtagttaggagagtagattagatggaggggagtcaaatc 5336039  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |   ||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| || ||||  || ||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |||| ||| ||    
T  5336040 actcgaggtaggggaaaaccttgaaaaactat--gagatactattaagaatgatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgattgaatac 5336137  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5336138 tatggcgtcgtttgattcatgtagccga-cccacatagtgggataagacttggttgt 5336193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 374
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852366
Alignment:
Q  273 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttggctgtt 47852364  T
Q  373 gt 374  Q
    ||    
T  47852365 gt 47852366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 376
Target Start/End: Original strand, 14057625 - 14057759
Alignment:
Q  242 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 341  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  14057625 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcca 14057724  T
Q  342 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14057725 accccacttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 376
Target Start/End: Original strand, 14367653 - 14367787
Alignment:
Q  242 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 341  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  14367653 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcca 14367752  T
Q  342 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14367753 accccacttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 304 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31869175 - 31869101
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31869175 tgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31869101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 36869651 - 36869574
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 92  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36869651 cagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 36869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 42187393 - 42187537
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  ||||  ||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  42187393 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgggatat-attagaaatggcagcattagaaagagagtcggggtagcacctataatagaaa 42187491  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 162  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42187492 agatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaag 42187537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19262791 - 19262609
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||| |||  |||  ||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  19262791 gagatgaggatgttacgtgtgatatgtggtaatactagacatgatagagttagaaatgacaatattagagagag--ttggggtagcacctattgtagaaa 19262694  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 202  Q
    || ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  19262693 agatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaagaagagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 376
Target Start/End: Original strand, 34745882 - 34746028
Alignment:
Q  230 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 329  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| || || | |||||||||||   |||  |||| | ||||||||| |||||||||  |||||    
T  34745882 agacctagaaaaaccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttga 34745981  T
Q  330 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34745982 ttcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 34746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 379
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969982
Alignment:
Q  267 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttt 42969969  T
Q  367 gttgttgttgttg 379  Q
    ||| ||| |||||    
T  42969970 gttattgatgttg 42969982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 270 - 378
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652830
Alignment:
Q  270 tagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  370 gttgttgtt 378  Q
    |||||||||    
T  47652822 gttgttgtt 47652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 24777166 - 24777241
Alignment:
Q  300 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24777166 tgtatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgtt 24777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 282 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24177721 - 24177628
Alignment:
Q  282 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24177721 agttgggtccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatt-gatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgttg 24177628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24598508 - 24598409
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt----agagagagagtgtgggtagcacctatag 110  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||| ||||| |||||||||    
T  24598508 cagagacgaggatgttgtgttggatgagtggtaagtttagacatgataggattaggaatgacaccattatagaaagagagagtgggggtatcacctatag 24598409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 313 - 379
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630718
Alignment:
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 40630718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 14593681 - 14594036
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtg----ggtagcacctatag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |  | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |    |||  |||||||||    
T  14593681 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccgaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctatag 14593780  T
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||       | ||| ||||| || |||  ||||||    
T  14593781 tagaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacctgtggattctgtat-----atagtagatcagatagagaggagtca 14593875  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 310  Q
    | | |  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||| |  ||||| |    |||  |||  ||    |||| | |||||||    
T  14593876 aatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaagaacctagagattg--gagaagga--ca----tggtttttgataga 14593967  T
Q  311 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| || ||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14593968 acactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14594036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27021986 - 27021906
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27021986 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 163
Target Start/End: Original strand, 28020884 - 28021032
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||| | ||||||||| |||||  ||||||||| ||| |||||    
T  28020884 cagagaggaagatgttgcattagatgtgtgataagactggacatgatatgattcgaaatgataacattagagaaagagttggggtagcacttatcgtaga 28020983  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    |||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28020984 aaagatggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 28021032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355450
Alignment:
Q  252 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc-gatcccactt 350  Q
    |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||| | || |||||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  351 agtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgttg 28355450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30200321 - 30200176
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||    |||| |||||||||||||    
T  30200321 cagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattagagagttag----ggtaacacctatagtaga 30200226  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| || ||| |||||||| | |||||||    
T  30200225 aaagatggtggaaactaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagac 30200176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 377
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732114
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||  |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Original strand, 40169650 - 40169758
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||  ||| ||||| |||||    
T  40169650 gggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagattttgtgtgaaggagagtagatca 40169749  T
Q  196 aatggagga 204  Q
    |||||||||    
T  40169750 aatggagga 40169758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 349
Target Start/End: Original strand, 1569063 - 1569270
Alignment:
Q  142 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 241  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| | ||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||   ||||| ||||| || ||||| |||    
T  1569063 gtttgagcatgtagagagaagtcgtgtagatgttgtagaaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattgctagaggcagaggtagtcctagaaaa 1569162  T
Q  242 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 341  Q
    ||||| |||| ||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||    
T  1569163 actataagagtaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatcgatgtagtcg 1569262  T
Q  342 atcccact 349  Q
    | ||||||    
T  1569263 accccact 1569270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 239 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40149150 - 40149016
Alignment:
Q  239 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    |||||||| |||||||| | ||| || || || |||  |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  40149150 aaaactataagagaaactactaggaaagacttggagagcaatgagttggaccaaaatatggt-tatgatagaacattatggcgcaatttgatctatgtag 40149052  T
Q  339 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149051 ccgaatccacttagtgggataaggcttggttgttgt 40149016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 269 - 379
Target Start/End: Original strand, 33103100 - 33103210
Alignment:
Q  269 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 368  Q
    |||||| | ||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  33103100 ttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggc 33103199  T
Q  369 tgttgttgttg 379  Q
    || ||||||||    
T  33103200 tgatgttgttg 33103210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27893674 - 27893561
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| | |||||| |||| | |||| || | |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  27893674 gatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataaggctt 27893575  T
Q  366 ggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||    
T  27893574 ggttgttgttgttg 27893561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 310 - 379
Target Start/End: Original strand, 28708596 - 28708665
Alignment:
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28708596 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgttg 28708665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 307 - 380
Target Start/End: Original strand, 31840442 - 31840515
Alignment:
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31840442 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagcctaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 31840515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Original strand, 37976368 - 37976517
Alignment:
Q  228 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 327  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| | ||  || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||     
T  37976368 gaagacctagaaaaactataagtgaaactaatatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaatta 37976467  T
Q  328 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  37976468 gatccatgtagccaaccccgcttagcaagataaggtttggttgttgttgt 37976517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 379
Target Start/End: Original strand, 44951274 - 44951439
Alignment:
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||  |||||||  ||||| | |||||| | || ||| ||||| |  | ||||||||||||    
T  44951274 aaaagaggtagaggaagatctaggaaaattacaaagagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaaca 44951373  T
Q  314 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44951374 ctatgacgtaatttgatccatgtagccgacaatacttagtggtataaggtttggttgttgttgttg 44951439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48202949 - 48202701
Alignment:
Q  130 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 229  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||| | |  | ||| ||||||    
T  48202949 taggcttaggtggtttgcgcatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggtggatagtcaaatcattataggcagagga 48202850  T
Q  230 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 329  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |   |||  || | | ||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| | ||| |  ||||||    
T  48202849 aggcctagaaaaactataagagagatcgttaagaaagttgtagagtttaatgagttggattgaaatatggtttatgttagaacattgtggtgcaatttga 48202750  T
Q  330 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| || | | ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  48202749 tccatgcagtc-aacccccttggttggataaggtttggttgttgttgttg 48202701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341395
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgttgt 34341395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 377
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415295
Alignment:
Q  257 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc------actt 350  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| || | |||||| |||| |||| || | ||||||||||||||||||| |||      ||||    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttatactt 40415268  T
Q  351 agtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  40415269 agtgggataaggcttggttgttgttgt 40415295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19119608 - 19119423
Alignment:
Q  192 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 291  Q
    |||| ||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  | |||| ||||| |||||||||| ||       
T  19119608 atcagatggaggagagtcaaatcactagaggtagtggaagacctag-aaaactattagagaaactatcaagatggatctagagatcaatgagtttgagaa 19119510  T
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    | |  |||  | ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  19119509 agacatggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaaaatttgttgttgttgtt 19119423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Original strand, 25891090 - 25891172
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25891090 tggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgttg 25891172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 4604754 - 4604831
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4604754 tatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagacttggttcttgttgttg 4604831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36239934 - 36239833
Alignment:
Q  239 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||| | || ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36239934 aaaactataagagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 36239835  T
Q  339 cc 340  Q
    ||    
T  36239834 cc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 48515482 - 48515559
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48515482 tatgatagtacactatgacgtaatttgatccgtgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttg 48515559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 379
Target Start/End: Original strand, 5418294 - 5418358
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5418294 tatggcgtaatttgatccatgtagtcgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 5418358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 375
Target Start/End: Original strand, 6263479 - 6263539
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6263479 tatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 6263539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 16013204 - 16013357
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtg----tgggtagcacctatag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |    ||||| ||||||| ||||||||||||||||     ||||  |||||||||    
T  16013204 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccaaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctatag 16013303  T
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    || ||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  16013304 tacaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagac 16013357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34029749 - 34029677
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34029749 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataaggcttggttgttgttg 34029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926538
Alignment:
Q  281 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 361  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagcgggataag 34926538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38103762 - 38103616
Alignment:
Q  228 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 327  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||| || ||||    
T  38103762 gaaggcctagaaaaactataagagagactattaggaaatactaagagattaatgagttggatccaaatattgtttatgata-aacattatggtgtaattt 38103664  T
Q  328 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38103663 gatcc-tgtagccgaccccagttagtgggataagacttggttgttgttg 38103616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 1740717 - 1740909
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt----agagagagagtgtgggtagcacctatag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    | || |||||| ||||| | ||||    ||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  1740717 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtagtaagactaggtggggtaagattagaaatgagaacattagagagagagagagtttgggtagcatctacag 1740816  T
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 203  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| | || |||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  1740817 tagaaaatatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtatgtagataggagaattgtggattttgtagtaaggagagtagatcagatggagg 1740909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 378
Target Start/End: Original strand, 7220750 - 7221039
Alignment:
Q  101 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac------tagtagatgctgtggtaaga------agag 188  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||      | |||||| |||| |||  |      ||||    
T  7220750 gcacctattgtagaaaagatgatagaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacgtgtacttgtagattctgtagtattagtatggagag 7220849  T
Q  189 tggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 288  Q
    | ||| | |||||||| |||||| |||  ||||| |||| ||||||||  ||||| || || ||||  ||||  || ||||||||| | |||| ||||||    
T  7220850 tagattagatggaggatagtcaaattactagaggcagagtaagacctataaaaaccataagtgaaattattaacaaagatttagagattaatgtgttgga 7220949  T
Q  289 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |  | || |  | | |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7220950 taaagatataatatgtgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggtgtaaggcttggttgttgttgtt 7221039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8519157 - 8519046
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||||||     
T  8519157 gatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttagtgagataaggctc 8519058  T
Q  366 ggttgttgttgt 377  Q
    | ||||||||||    
T  8519057 gattgttgttgt 8519046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Original strand, 16013484 - 16013559
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||| || ||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16013484 tgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 16013559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814125
Alignment:
Q  282 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaagaggcttggtagttgttgt 30814125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 167
Target Start/End: Original strand, 38920795 - 38920866
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactag 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38920795 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagagatgactag 38920866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1531587 - 1531372
Alignment:
Q  151 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 250  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||| ||| ||| ||| ||||| ||  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||     
T  1531587 tgtagagagaagacctctagatgttgtagtacgaatagtagatcagataaaggagagccagatcaaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagc 1531488  T
Q  251 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 350  Q
     |||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||| ||||| |            ||||||||| |||||||    
T  1531487 aaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggtttgggatagaacattatggtg------------tgtagccgaccccactt 1531400  T
Q  351 agtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1531399 agtgggattaggcttggttgttgttgtt 1531372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6420749 - 6420615
Alignment:
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| | || |||||  | |      
T  6420749 gttggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatcagatgaatgatagtcagatcact 6420650  T
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 252  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  6420649 agaggcagaggtagacctataaaaactataagaga 6420615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24549847 - 24549686
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||||||| ||||||||   | |||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||   |||    
T  24549847 agaggtagaagaagacctgaaagaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatatggtatttgatagaatcttat 24549748  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
     ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  24549747 tgcgtcgttt-atccatgtagcagatcccacttagtaggattaggcatggttgttgttgttgc 24549686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 379
Target Start/End: Original strand, 33281097 - 33281170
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33281097 gatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccggacc-acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 33281170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2882835 - 2882734
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| || | ||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  2882835 aatgagttggatcgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatttagctgacctcacttagtgagaaaaggcttggtggttgttgt 2882736  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  2882735 tg 2882734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 41483694 - 41483771
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41483694 tatggtagaactttatggtgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgttg 41483771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 164
Target Start/End: Original strand, 41948480 - 41948585
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  | ||||||| || | |||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41948480 gatacgattagaaatgacaacattagagtgagagttggcgtagcacttacaatagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagaga 41948579  T
Q  159 gaagac 164  Q
    ||||||    
T  41948580 gaagac 41948585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20158743 - 20158671
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20158743 gatagaacactatcaagtaatttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 20158671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28542055 - 28541943
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc-acttagtgggataaggct 364  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||| |  |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  28542055 gatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccccacttagttggataaggct 28541956  T
Q  365 tggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||    
T  28541955 tggttgttgttgt 28541943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 379
Target Start/End: Original strand, 29312209 - 29312273
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29312209 tatggcgtaatttgatccatgaagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29312273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29318853 - 29318793
Alignment:
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29318853 gcgtaatttgatccatgtagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29318793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47700117 - 47700054
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  47700117 tatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccacttggtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 47700054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20525105 - 20525050
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20525105 atttgatccatgtagccgaccccacttagcgggataaggctcggttgttgttgttg 20525050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47796301 - 47796150
Alignment:
Q  228 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 327  Q
    ||||||| || |||| ||| |||||| | ||||| || ||||||||  | ||| |||||||   |||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||    
T  47796301 gaagaccgagaaaaattataagagaacctattaggaaagatttagaaattaataagttggactgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaattt 47796202  T
Q  328 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||||||||    
T  47796201 gatccatgcagccgatcccgcttagtcggaaaagccttctttgttgttgttg 47796150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605237
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18605328  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 286  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18605327 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaactacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18605237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21244328 - 21244282
Alignment:
Q  332 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21244328 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21244282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 379
Target Start/End: Original strand, 33139208 - 33139437
Alignment:
Q  149 catgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 248  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| || ||||||| |||  | || |||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |  |    
T  33139208 catgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaagagttaagtcaaaagagatagagtaagacataggaaaaccacaa 33139307  T
Q  249 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 348  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||  || |  ||||| | || ||||||| | || ||||  || |||||||||||||| | |||||||     
T  33139308 gagaaacacttaaaaatgatttcgaggttaatgaactgaagtcaaatatagtttatgatacaccattatgatgtaatttgatccatgtaactgatcccat 33139407  T
Q  349 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
      |||||||||| | || |||||||||||||    
T  33139408 gaagtgggataa-gatttgttgttgttgttg 33139437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 194
Target Start/End: Original strand, 35713696 - 35713794
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 194  Q
    |||||| || |||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||| ||||    
T  35713696 gggtaggacatatagttgaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtacattttgtagtaaggagagtagatc 35713794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36245336 - 36245259
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  36245336 tggtatatgatagaacattatgacgtcgtttgatccacgtagtcgatcccacatagttggataaggcttgtttgttgt 36245259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 377
Target Start/End: Original strand, 45558539 - 45558611
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45558539 tgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagttgaccccgcttagt-ggataaggtttggttgttgttgt 45558611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 365
Target Start/End: Original strand, 17759483 - 17759543
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17759483 gatagaacactatggtgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 17759543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 375
Target Start/End: Original strand, 30144975 - 30145035
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30144975 tatggtgtcatttgatccatgcagccaatcccacttagtgtgataaggcttggttgctgtt 30145035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38921161 - 38921086
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag--ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38921161 tgatagaaggctatggcgtcatttgattcatgtaggaccgaccccacttagggggaaaaggcttggttgttgttgt 38921086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Original strand, 39812145 - 39812217
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812145 tatgatagaacattatgatgtcgtttgatccatgtagttggccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 39812217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 40830148 - 40830292
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||  || ||| | |||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||    |||||||||||||| | |||    
T  40830148 cagagataaggatgttgtgttgaatg--tgctaaaagtagacatgatagaattagaaatgacaatattagaaagagt---tgggtagcacctattgaaga 40830242  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||| ||||||||| |   ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40830243 aaagatggtagaaactctacttaggtggtttgggcatgaagagagaagac 40830292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 161
Target Start/End: Original strand, 45558352 - 45558428
Alignment:
Q  85 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 161  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  45558352 agagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttaggtggtttgtgcacgtagagagaa 45558428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 379
Target Start/End: Original strand, 1523856 - 1523927
Alignment:
Q  308 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1523856 agaacactatgacgtaatttgattcatgtagccaacctcacttagggagataaggcttggttgttgttgttg 1523927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Original strand, 6807700 - 6807775
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| |||||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6807700 tgatagaacattatggcgtcgtatgattcatgtaggtgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgttg 6807775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21517529 - 21517426
Alignment:
Q  228 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 327  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||  |||||||| | ||| |||||||||||||| || | ||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  21517529 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaattt 21517430  T
Q  328 gatc 331  Q
    ||||    
T  21517429 gatc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Original strand, 35865912 - 35865987
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  35865912 tgataaaacactatggcgtcgtttggttcatgtagccaaccccacttagtgggacagggcttgcttgttgttgttg 35865987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39738497 - 39738446
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39738497 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 39738446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40139023 - 40138948
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  40139023 tatgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgcgataagacttggctgttattgt 40138948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40139278 - 40139124
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| || |||| ||||||||||||     ||||  |||||||||||||    
T  40139278 cagagacgaggatgttgtgtgggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaaagacaacattagagagagtc---gggtttcacctatagtaga 40139182  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 172  Q
    |||  |||| |||| | ||||||| || | ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  40139181 aaatatggtggaaactgggcttaggtgatctgggcatgtagggagaagatttgtagat 40139124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 41461318 - 41461393
Alignment:
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41461318 atgatagaccattatggcgtcggttgatccatgcagccaaccccggttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 41461393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 357
Target Start/End: Original strand, 43281958 - 43282092
Alignment:
Q  222 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 321  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||   | ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||| |||||||    
T  43281958 gtagaggatgacctagaaaaaccgtaagagaaacaattaagtaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgacaaaaca-tatggcg 43282056  T
Q  322 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 357  Q
    | |||||||| || ||||||| | ||||||||||||    
T  43282057 taatttgatctatctagccgacctcacttagtggga 43282092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 47796473 - 47796359
Alignment:
Q  42 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 139  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||  |||||| |||||| || ||  || || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||     
T  47796473 gtggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattagatagagagagttggagtaccaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcgtagg 47796374  T
Q  140 tggtttgggcatgta 154  Q
    |||||||||||||||    
T  47796373 tggtttgggcatgta 47796359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 92
Target Start/End: Original strand, 1523747 - 1523813
Alignment:
Q  26 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 92  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1523747 atgttgcgttgcatgagtgacaagactagacgtgataggattattaatgacaccattagagagagag 1523813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 286
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637753
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18637662  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 286  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18637663 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaaatacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18637753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 286
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651187
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18651096  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 286  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18651097 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaaatacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18651187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 297 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24376103 - 24376025
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| || |||||||||    
T  24376103 tggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcgcttagtgggacaaggttttgttgttgtt 24376025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Original strand, 48515373 - 48515455
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  48515373 tggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgggataaggctcggtggttattgttg 48515455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17907783 - 17907722
Alignment:
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  17907783 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagcaggataagacttggttgttgttgttg 17907722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25731585 - 25731472
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    |||||| |||| ||| | |||||||||||| |||| |   |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || | |  ||| ||||||||| |||    
T  25731585 gatttacaggttaataaattggatccaaatatggtttcgaatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagcagacctcgtttaatgggataagactt 25731486  T
Q  366 ggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||    
T  25731485 ggttgttgttgttg 25731472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 379
Target Start/End: Original strand, 28021146 - 28021219
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021146 atagaacattatgaggtcgtttgacccatgtagcctactccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttg 28021219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40008506 - 40008429
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| || | |||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  40008506 tatgatagaacattatgtcgttgtttgatccatgtagctgacctcacttaatgagataagacttggttgttgttgttg 40008429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 210
Target Start/End: Original strand, 5418071 - 5418195
Alignment:
Q  87 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc-ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaa 185  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||  || ||| |||| ||||| |    
T  5418071 agagagttggggtagcacctcttgtagaaaatatggtggaaaataggctttagattgtttgtgcatgtagaaagaagacctgttgattctgtagtaagta 5418170  T
Q  186 gagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    |||| |||||  ||||||| |||||    
T  5418171 gagtagatcaggtggaggatagtca 5418195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 369
Target Start/End: Original strand, 6682583 - 6682627
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6682583 tttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 6682627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 379
Target Start/End: Original strand, 20899411 - 20899455
Alignment:
Q  335 gtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20899411 gtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 20899455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 27022063 - 27021991
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 92  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27022063 atgagaatgttgcattggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattagagagagag 27021991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28562647 - 28562443
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    |||||||| || ||||| |||||   || |||||||| ||||| |||| || ||||  |||||||||||  | ||||  ||| ||||||||| | |||||    
T  28562647 gggtagcatctctagtaaaaaagaatgtggaaaatagacttaggtggtatgcgcatacagagagaagacatgcagattttgtagtaagaagattagatca 28562548  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 295  Q
     || ||| | ||| |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||| | || ||||||||||| |||    
T  28562547 gatagagaatagttagattacaagaggtagaggatgacctagaaaaaatataagagaaactattatgaaagatttagagattaacgagttggatcctaat 28562448  T
Q  296 ttggt 300  Q
     ||||    
T  28562447 atggt 28562443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30200017 - 30199965
Alignment:
Q  327 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30200017 tgatctatgtagccggccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30199965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32879292 - 32879192
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtat-gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  ||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32879292 aatgagttggatccaaatatggttaaaagatggaacattagggcgtaatttgatccttgtagccgaccctgcttagttggataaggcttggttggtgttg 32879193  T
Q  377 t 377  Q
    |    
T  32879192 t 32879192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43424029 - 43423989
Alignment:
Q  339 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43424029 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43423989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 338
Target Start/End: Original strand, 6807388 - 6807447
Alignment:
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6807388 atgagttagatagaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtag 6807447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 349
Target Start/End: Original strand, 22174123 - 22174254
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||| || |  || ||| ||||| | ||||| || |||  |||| |||| | |||||||||| |||    
T  22174123 agaggcagaggaaaacgtagaaaaactataagagaaactataaacaaagatctagagattaatgaattagatagaaatatggtatgtgatagaacattat 22174222  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  22174223 ggcgttgtttgatccatgtagccgaccccact 22174254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 337
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 337  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35725604 - 35725569
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35725604 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35725569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40391952 - 40391845
Alignment:
Q  248 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 347  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||  | ||| ||||||| | |||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  40391952 agagaaactagtaggaatgatttagaaattaataagttggaccgaaatatggcttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctaaccgacccca 40391853  T
Q  348 cttagtgg 355  Q
    ||||||||    
T  40391852 cttagtgg 40391845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 375
Target Start/End: Original strand, 40830331 - 40830481
Alignment:
Q  224 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 323  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||| ||   | | || | |||||||||||| || || | |    
T  40830331 agaggaagacctagaaaatctataagagaaactattaagaaggatctagaaattaatgagttgtatatga-tatgatatatgatagaacattacggaggc 40830429  T
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
     |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40830430 gtttgatccatgtagccaacccctcctagtgggataaggcttgattgttgtt 40830481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44401284 - 44401164
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||| | || |||||  ||| |||| || | |||||||||||| |||    
T  44401284 agaggtggaggatgacctagaaaaattataagagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgatagaacattat 44401187  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagcc 340  Q
    | ||| |||||||||||||||||    
T  44401186 gacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45054378 - 45054311
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  45054378 tatgatagaatattatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttggttggataatgcttggtt 45054311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 45841332 - 45841206
Alignment:
Q  25 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 124  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| |||||   |||| | |||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||  |||     
T  45841332 gatgttgtgttgaatgtgtggtaagcttagaagagatacggttagaaatgacaacattagatagagagt-tgagtaacacctataatagaaaagacggtg 45841234  T
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatg 152  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  45841233 gaaactaggtttagttggtttgggcatg 45841206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47413748 - 47413713
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47413748 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 47413713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 380
Target Start/End: Original strand, 3457544 - 3457645
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| |||| | || ||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||   ||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3457544 aatgagttggatcaaaatattgtttatgataaaacattatggcataatttgatcaatgtgagcga-cctacttagtgggataaggctttgttgttgctgt 3457642  T
Q  378 tgc 380  Q
    |||    
T  3457643 tgc 3457645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24550049 - 24549906
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |  ||| |||||| ||||| | |||||||| ||||     |||| |||||||          
T  24550049 cagagatgaggatgttgtgttggatgtgttgtaagactagatagaatatgattagaaatgataacattagagtgagatctatggtatcacctat------ 24549956  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||| || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24549955 aaagatgatggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 24549906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Original strand, 26925264 - 26925342
Alignment:
Q  149 catgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 227  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  26925264 catgcagagagaagactcgtagatgatgtagtaagaagagtagattagatagaggatagtcgaattaaaagaggtagag 26925342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 203
Target Start/End: Original strand, 30144793 - 30144883
Alignment:
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 203  Q
    |||||| |||||||||   ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30144793 gaaaagatggtagaaatccggcttaggtagtttgggcaggtagagagaagacttgtagattctatagtacgaagagtagatcagatggagg 30144883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30914577 - 30914503
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||||||  ||||||  | |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30914577 tatgatagaactttatggcagcgtttgatccatattgccaaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 30914503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33650903 - 33650869
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33650903 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 33650869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 372
Target Start/End: Original strand, 33871479 - 33871549
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33871479 tatgatagaacattatggcgtaatttcatccatgtaattgagcccagttagtgggataagacttggttgtt 33871549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45841048 - 45840994
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45841048 tttgatccatgtagctgaccccaattagtggtataagacttggttgttgttgttg 45840994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12241728 - 12241684
Alignment:
Q  334 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12241728 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt-ttgttgttg 12241684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 377
Target Start/End: Original strand, 25578069 - 25578142
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||| | ||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25578069 tgataaaacactatggcgttgttagattcgtgtagccaaacctacttagtgggataaggattggttgttgttgt 25578142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25579156 - 25579103
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25579156 atttgatccatgtcgccgaccccactcagtggtataaggcttagttgttgttgt 25579103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 162
Target Start/End: Original strand, 30632958 - 30633035
Alignment:
Q  85 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 162  Q
    |||||||||  |||||||||||||  || ||||  |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30632958 agagagagtcggggtagcacctatcataaaaaaaatggtggaagctcggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 30633035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Original strand, 45903916 - 45903997
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt-agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45903916 tggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatcaatgtaagtcagcgccacttagtggggtaaggcttggttgtggttgt 45903997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 379
Target Start/End: Original strand, 475987 - 476059
Alignment:
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  475987 tagaacattatggcgctgtttgatccaagtagtggattctacttagtgggataaggcttggttgtttttgttg 476059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Original strand, 3457368 - 3457471
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 197  Q
    ||||||| |||||||||||||   || |||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||||| |    
T  3457368 gtagcacttatagtagaaaagactgt-gaaactaggtttaggtggtttgggcattcagagagaagacatgtagatgttgtagtaatgagagtggatcaga 3457466  T
Q  198 tggag 202  Q
    |||||    
T  3457467 tggag 3457471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3928380 - 3928344
Alignment:
Q  343 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3928380 tcccacttagtgggataaggcttggatgttgttgttg 3928344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19262533 - 19262457
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||| |||||| ||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19262533 tatgatagaacattatggcggtgtttgattcatgtaaccgacgccacttggtgggatatggcttagttgttgttgtt 19262457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 381
Target Start/End: Original strand, 26847836 - 26847892
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 381  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  26847836 tttgatccacgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggctgttttcgttgca 26847892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27021795 - 27021723
Alignment:
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||||||    
T  27021795 tagaacattatggcacaatttgatccatgttgccgaccccacttagtgggataggacttggttgatattgttg 27021723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35734731 - 35734691
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35734731 agccgaccccacttagcgggataaggcttggttgttgttgt 35734691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Original strand, 41157897 - 41157937
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41157897 agccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 41157937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42177177 - 42177018
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||||| | ||||  || ||| ||||| | ||||||||  ||  |||| |||| |||||| ||||| |||    
T  42177177 agaggtggaggaagacgtagaaaacctataagagaatctattaagaaagatctagagataaatgagtttcataaaaatatggtatatgattgaacattat 42177078  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    | |||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  42177077 gacgtcgtttgatctatgtaatcga-cccacttagtgggatatagtttgattgttgttgtt 42177018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9797956 - 9797909
Alignment:
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 172  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9797956 gaaaattggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 9797909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27893828 - 27893769
Alignment:
Q  97 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 156  Q
    |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27893828 ggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30914749 - 30914674
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga 171  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  30914749 gggtagtacctattgtagaaaaaatggtagaaactcggctttggtggtttgggcatgtaacgagaagacttgtaga 30914674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 92
Target Start/End: Original strand, 35713617 - 35713676
Alignment:
Q  33 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 92  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  35713617 gttggatgtgtggtaaggttagatatgataggattagaaatgaaaatattagagagagag 35713676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 372
Target Start/End: Original strand, 35922407 - 35922530
Alignment:
Q  249 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 348  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||| ||| |||| || | |||||||||||| |||| | | ||||||||||| || ||  ||| |     
T  35922407 gagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacattatgacctaatttgatccatataaccattcctat 35922506  T
Q  349 ttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    ||||||||||| |  |||||||||    
T  35922507 ttagtgggatatgatttggttgtt 35922530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37439647 - 37439580
Alignment:
Q  71 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||    
T  37439647 aatgacaacattagagagagagttggagtagcacctatggtagaaaagatgatgtaaaataggcttag 37439580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 635347 - 635309
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  635347 gccgaccccacttagtgggataaggcttggatgttgttg 635309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5577532 - 5577498
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5577532 cccacttagtcggataaggcttggttgttgttgtt 5577498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 374
Target Start/End: Original strand, 30188512 - 30188542
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30188512 cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 30188542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35066805 - 35066744
Alignment:
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35066805 tggcgtaatttgatccatgttgccaaccacacttagtgagataaggcttggtt-ttgttgttg 35066744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 378
Target Start/End: Original strand, 38504695 - 38504737
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38504695 tagccgaccccacttagcgggataaggcttggctgttgttgtt 38504737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40008777 - 40008636
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggt-agcacctatagtagaa 115  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||  | || ||||| ||||||| ||||||||||||  || || | | |||||||   ||||    
T  40008777 gagatgaagatgttgcgtaggatgtgtggtaaaactagacaaaaaagaattagaaatgacaacattagagagag-ttggggataaacacctatcaaagaa 40008679  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    ||| |||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||    
T  40008678 aagatggtggaaactcggattaggtggtttgggcatgtagaga 40008636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 41948724 - 41948778
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  41948724 atttcatccatgtagccaaccccacttagtggggtaatgtttggttgttgttgtt 41948778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48735721 - 48735683
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48735721 agccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 48735683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6429225 - 6429156
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagtt-ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||  |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  6429225 gggtagcacctatagtagaaaaggcaggtgaaaaataggtttaggtggtttgggcatgccgagagaagac 6429156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 152
Target Start/End: Original strand, 23720829 - 23720898
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 152  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  || | ||| ||||| |||||||||||||    
T  23720829 agagagagagttagggttgcacctatagtagaaaagatggcggagactagccttaggtggtttgggcatg 23720898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25731696 - 25731639
Alignment:
Q  34 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga 91  Q
    |||||||| |||||||| |||||  || ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25731696 ttggatgaatggtaagactagacgagaaaggattaagaatgacacctttagagagaga 25731639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25826788 - 25826683
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||   ||| | | |||| ||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  25826788 gataggattagaaatgaaaacattagagagggagttgcggttgaaactattgtagaaaagatggtagaaactcggcttgggtggtttgcgaatgtggaga 25826689  T
Q  159 gaagac 164  Q
    ||||||    
T  25826688 gaagac 25826683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 351
Target Start/End: Original strand, 37595891 - 37595932
Alignment:
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 351  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37595891 aacattatggcgtcatttgatccatgtagtcgatcctactta 37595932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 42177328 - 42177255
Alignment:
Q  64 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 137  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  42177328 gattagaaatgacaatattagagagagagttgaggtatcacctatagtagaaaagatggtgaaaactaggctta 42177255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43653217 - 43653184
Alignment:
Q  342 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43653217 atcccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 43653184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 373
Target Start/End: Original strand, 44930960 - 44930989
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44930960 cccacttagtgggataaggcttggttgttg 44930989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 47155224 - 47155183
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  47155224 tttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttg 47155183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #219
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47185883 - 47185807
Alignment:
Q  301 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||| |||| | |  ||||||| || ||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  47185883 gtatgatagaacattatgacattgtttgatctat-tagccgaccccacttaatgagataagacttggttgttgttgtt 47185807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Original strand, 28359495 - 28359535
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28359495 agccgaccccaattagtgggataaggctaggttgttgttgt 28359535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 28858012 - 28858138
Alignment:
Q  61 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 160  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |    |||| ||||||||||||||||| |||    
T  28858012 taggattagaaatgacaacattagtgagaga-tg-gggtggcacctattgtagaaaacatggtagaaactcaagttaggtggtttgggcatgtagaaaga 28858109  T
Q  161 agactagtagatgctgtggtaagaagagt 189  Q
     |||  || ||| || | |||||||||||    
T  28858110 tgacctgtggattctatagtaagaagagt 28858138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #222
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29012367 - 29012335
Alignment:
Q  347 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29012367 acttagtgggataagacttggttgttgttgttg 29012335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #223
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29013217 - 29013153
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||| |  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29013217 tatggctttatttgatccatgtagtcgaccatatttagtgtgataaggtttggttgttgttgttg 29013153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #224
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 29653904 - 29653844
Alignment:
Q  27 tgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagaga 87  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  29653904 tgttgcgttggatgtgtggtaacactagacgggatagaattagaaatgacatcattagaga 29653844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30425174 - 30425134
Alignment:
Q  334 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30425174 tgtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgt 30425134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 204)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 36565603 - 36565238
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36565603 cagagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 36565504  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36565503 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagtt 36565404  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36565403 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 36565304  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36565303 tatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgc 36565238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 36545067 - 36545433
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagta 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  36545067 cagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtaacacctatagta 36545166  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  36545167 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaag 36545266  T
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36545267 ttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 36545366  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36545367 actatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 36545433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 61 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523721
Alignment:
Q  61 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagag 11523941  T
Q  160 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 259  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11523940 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 11523841  T
Q  260 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11523840 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 11523741  T
Q  360 aggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11523740 aggcttggttgttgttgttg 11523721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36395312 - 36394949
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36395312 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 36395213  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36395212 aaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaagt 36395113  T
Q  214 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36395112 taaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaaca 36395013  T
Q  314 ctatggcgtca-tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36395012 ctattgtggcattttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttg 36394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 40813242 - 40813608
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagta 112  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  40813242 cagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagta 40813341  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40813342 gaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 40813441  T
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40813442 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgatagaac 40813541  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40813542 actatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgttg 40813608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 39946777 - 39947132
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  39946777 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagtaga 39946876  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  39946877 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaagtt 39946976  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  39946977 agaagaggtagaggacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaacgc 39947076  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39947077 tatggcgtcatttg--------agccga-cccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 39947132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42854364 - 42854002
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  42854364 gagatgacgatgttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcagaga 42854265  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42854264 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 42854165  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  42854164 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacacta 42854065  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42854064 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggtttggtggttgttgttg 42854002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 97 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491141
Alignment:
Q  97 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  197 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 296  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Original strand, 2796478 - 2796838
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatta--gacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2796478 agatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcgcctatagtagaa 2796577  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  2796578 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga---ct-gtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcatgtta 2796673  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||||||||| |    
T  2796674 aaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgatagaacagt 2796773  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa----ggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  2796774 atggcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgggataaggatggcttggttgttgttg 2796838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 18125097 - 18125454
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  18125097 gagatgagcatgttgcgctggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 18125194  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |    
T  18125195 agttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-a 18125293  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  18125294 aagaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatacta 18125393  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||| || |||||||| |||||| | | || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18125394 tggtgt-atttgatcaatgtagtcaacccgacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 18125454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 379
Target Start/End: Original strand, 21121105 - 21121429
Alignment:
Q  42 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 141  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||            |||| |||||||    
T  21121105 gtggtaagactagacgggataggattagaaatggcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtacaaaa------------taggtttagatg 21121192  T
Q  142 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21121193 gtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtagagggagacctaagaaa 21121292  T
Q  242 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 341  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21121293 tctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccg 21121391  T
Q  342 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21121392 accccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 21121429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Original strand, 45419161 - 45419517
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  45419161 gagatgaagatgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagaga-attg-gggtagcacctatagtagaaa 45419258  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |       
T  45419259 agatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc--tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctg 45419356  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||| |    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45419357 aagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacatta 45419456  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45419457 tggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45419517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 37077687 - 37078033
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||            |||    
T  37077687 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccattcggaagagagtgagggtag------------aaa 37077774  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||    
T  37077775 agttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcgggtcaa 37077872  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || | ||||||||||      
T  37077873 aataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatagaacac-- 37077970  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || ||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  37077971 tgacgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataaaacttggttgttgttgttg 37078033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 169 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469725
Alignment:
Q  169 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 268  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  269 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggt 42469736  T
Q  369 tgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||    
T  42469735 tgttgttgttg 42469725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 67 - 374
Target Start/End: Original strand, 8932676 - 8932982
Alignment:
Q  67 taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||       
T  8932676 taggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatcc 8932773  T
Q  167 gt-agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaag 265  Q
    || | ||||  | |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  8932774 gttaaatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaa 8932873  T
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||    
T  8932874 gatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgaaataaagctt 8932973  T
Q  366 ggttgttgt 374  Q
    |||||||||    
T  8932974 ggttgttgt 8932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Original strand, 29520583 - 29520931
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa- 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||     
T  29520583 agatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagagagagttggggtggcatctatagtagaaat 29520682  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    |  |||| ||||           |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |     
T  29520683 aaatggtggaaa-----------tggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcac 29520771  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  29520772 aagaggtagaggaag-cctagaaaaactataagagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta 29520870  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29520871 tggcgtaatttgatccatgtagcccaccccatttagtgggataatgcttggttgttgttgt 29520931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8879800 - 8879446
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||| |||||||  | ||| |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  8879800 gagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaattagagagagaatgggggaagcacctatagtagaaa 8879701  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  |    ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||  |    
T  8879700 agttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagacccg----tgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtcgggtcca 8879605  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||      
T  8879604 aagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatataacac-- 8879507  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  8879506 tgacgtaatttaatccatgtagccgactccacttattaggataaagcttggttgttgttgt 8879446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 196 - 379
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027814
Alignment:
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  296 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 2027814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25473535 - 25473402
Alignment:
Q  245 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  25473535 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacc 25473436  T
Q  345 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25473435 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 25473402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 379
Target Start/End: Original strand, 32043522 - 32043871
Alignment:
Q  27 tgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  32043522 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtaga 32043621  T
Q  127 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 226  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| ||| | ||||| ||||||| | ||||| | |  ||||||||     
T  32043622 aactagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtagg 32043721  T
Q  227 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 326  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || |  |||||| || || |||||||||||||   | |  |||| | |||||||||||||||||  | ||    
T  32043722 ggaagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggc--cgtt 32043819  T
Q  327 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32043820 tgattcatgta-ctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 32043871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 115 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904908
Alignment:
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||  || |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||  ||| ||| |||||| |||| |||||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccatatagtcgaccccgtttaatggaataaggtttgg-tgttgttgt 26904908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 222 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742080
Alignment:
Q  222 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 321  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |   ||||||||||||||||||    
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaatatttt---tgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  322 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14742080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18752233 - 18751998
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18752233 gagatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaa 18752136  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||||| || || | ||||||||||||||||||  | ||| |  ||||    
T  18752135 agttggtagaaaata-gcttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagttagattaa 18752037  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 255  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||    
T  18752036 aagaggtagaggaatacctaaaaaaaccattagcgaaac 18751998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39953626 - 39953263
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||| |   |||||||||||||||  || |||||||||||  |||    
T  39953626 cagagatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaagattaaacatgatataattagaaataatgacattagagagagagttgggatagcacctatatgaga 39953527  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| ||||||||| |||  |||| |||||| |||||||||||||  |||   | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||| ||| || |||  |     
T  39953526 aaagatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaaggagagtagatcagatgaaggcgaatcagatc 39953427  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |  |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||| ||   |||  |||| | |||| | ||||    
T  39953426 actagaggtaggggtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttgatgggacac 39953327  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39953326 tatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 39953263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 377
Target Start/End: Original strand, 44529396 - 44529507
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44529396 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 44529495  T
Q  366 ggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||    
T  44529496 ggttgttgttgt 44529507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 268 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047530
Alignment:
Q  268 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  368 ttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||    
T  44047541 ttgttgttgttg 44047530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43904947 - 43904700
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag---gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 194  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  43904947 gtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatc 43904848  T
Q  195 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 294  Q
    | |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||  |||  |  ||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  43904847 agatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaa 43904748  T
Q  295 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 342  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43904747 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 120 - 379
Target Start/End: Original strand, 30559718 - 30559982
Alignment:
Q  120 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 219  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||   | |  ||    
T  30559718 tggtcgaaaataggcttaggtggtttgggcatttagagagaagacatgtagattttgtagtaaggacagtggatcagatggaggatagtcggatcactag 30559817  T
Q  220 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 319  Q
    || |||| |||||| ||  |||||||| |||||||| || || || ||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||     
T  30559818 agatagatgaagacttaaaaaaactataagagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatga 30559917  T
Q  320 cgtcatttgatcc-----atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||| |||||||||     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30559918 cgtaatttgatccatgtaatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30559982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 379
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931244
Alignment:
Q  104 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 202  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| || ||||| |||||||| |||| | ||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||    
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatcta-tagattctgtagtaaggagactagatcagatggag 32931068  T
Q  203 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 302  Q
    || |||||  | |  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  32931069 gatagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgt 32931167  T
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  32931168 atgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttgatgttg 32931244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 353
Target Start/End: Original strand, 29700268 - 29700534
Alignment:
Q  87 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 186  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | | ||| |||| ||||| ||    
T  29700268 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggaggaaagttggcttaggtggtttgggcatatagagaaaagaccattggattctgtagtaaggag 29700367  T
Q  187 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 286  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||  | |  |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||| || || || ||| | ||||||| |    
T  29700368 agtagattagatggaggatagtcatatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactaaaagagaaactaataggaaagacttggagataaatgagtcg 29700467  T
Q  287 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt 353  Q
    || | |||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29700468 gaccaaaattttgtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgactccacttagt 29700534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 257 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15215532 - 15215410
Alignment:
Q  257 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 356  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15215532 attagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtagg 15215433  T
Q  357 ataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15215432 ataaggcttggttgttgttgttg 15215410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Original strand, 490506 - 490619
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  490506 gatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 490605  T
Q  366 ggttgttgttgttg 379  Q
    | ||||||||||||    
T  490606 gtttgttgttgttg 490619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10080264 - 10079995
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||    
T  10080264 agatgatgatgttgcgttgggtgtttggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagagagttgaggtagcatcta-agtagaaaa 10080166  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
    | |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |  |||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| | |      
T  10080165 gatggtggaaactaggcct-gatggtttgggcatgtagagagaagacctgaggattttgtagtaaggagagtagatcaaatgaaggggagtcaaatcact 10080067  T
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 289  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||  |||  || ||| ||||| | ||||||||||||    
T  10080066 agaggtagaggaagacctagagaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagattaatgagttggat 10079995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 185 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35362842 - 35362651
Alignment:
Q  185 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 284  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |    | ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||    
T  35362842 agagtagatcaaatggaggatagtcaaatccctataggcagaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 35362743  T
Q  285 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35362742 tggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35643872 - 35643606
Alignment:
Q  106 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa----tgga 201  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||         |||| ||| | ||||||     ||||    
T  35643872 tatagtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtag---------taaggagaatagatcaatcagctgga 35643782  T
Q  202 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 301  Q
    ||| |||||  |||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||     
T  35643781 ggatagtcagattactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtt 35643682  T
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||  | | |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35643681 tatgatagaacact--gccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttg 35643606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 373
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026058
Alignment:
Q  153 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 252  Q
    |||||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| |    
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaaccattagaaa 12025946  T
Q  253 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat---ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 349  Q
    |            ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||| || |||    
T  12025947 a------------gatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctact 12026034  T
Q  350 tagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  12026035 tagtggaataaggtttggttgttg 12026058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Original strand, 16917104 - 16917462
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||| | | |  ||||||||||  ||||||| |||||| || | |||  |||||| ||| | ||||||    
T  16917104 cagagatgagaatgttgcgttgactttgtggtaagactcggctggataggattaaaaatgacaacattagtgataaagttggggtagtaccgaaagtaga 16917203  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |     
T  16917204 aaagatggtgcaaactaggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcttgtagat-ttgtagtaaggagagtagatcagattgaggatagtcaaatc 16917302  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |  | ||||||| |||||||||| ||| ||||  | ||||| || |   | ||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||     
T  16917303 actacaggtagaagaagacctagaaaagctataggtgaaactatcaaggaagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaaca- 16917401  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    | || |  | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16917402 tttgactgcttttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataagacttggttattgtt 16917462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 247 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45041445 - 45041315
Alignment:
Q  247 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc 346  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  45041445 tagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccc 45041347  T
Q  347 acttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45041346 acttagtgggataaggcttggttgttgatgtt 45041315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13172011 - 13171865
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || |||||| |||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  13172011 cagagatgagaatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagtaga 13171912  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 161  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13171911 aaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatataaagagaa 13171865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 371
Target Start/End: Original strand, 16351312 - 16351653
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||   ||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  16351312 gagatgaagatgttgcgttggatatgtggtaagactagacggaatagagttagaaatgacaacattagagagagaattagggtagcacctatagtagaaa 16351411  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
                 ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||  | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |     
T  16351412 c------------tagacttgggtggtttaggcatgtagagagaaaacttttggatcatgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaagtcac 16351499  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
      ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||| ||   | |  |||| | | |||||||||||    
T  16351500 ttgagataggagaagacctagaaaaactattagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagtt-gagaaagacatggtttttaatagaacacta 16351598  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    |||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16351599 tggcatcgtttgattcatgtagacgaccccacttagtggaataaggcttggttgt 16351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 379
Target Start/End: Original strand, 23492163 - 23492318
Alignment:
Q  223 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 321  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| || ||| | | ||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||| |    
T  23492163 tagaggaagacctag-aaaactattagagaaactactcagaaag-atgtagcgattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtg 23492260  T
Q  322 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23492261 tcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgttgttg 23492318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 243 - 376
Target Start/End: Original strand, 25288912 - 25289045
Alignment:
Q  243 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 342  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| || |||| ||    
T  25288912 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctga 25289011  T
Q  343 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25289012 ccccacctagtggtataaggcttggttgttgttg 25289045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 243 - 376
Target Start/End: Original strand, 25300247 - 25300380
Alignment:
Q  243 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 342  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | | |||||||| ||||||| ||    
T  25300247 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctga 25300346  T
Q  343 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
     ||||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  25300347 ccccacctagtggaacaaggcttggtggttgttg 25300380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35914754 - 35914601
Alignment:
Q  224 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 323  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||  || | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||     
T  35914754 agaggaagacatagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgta 35914655  T
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35914654 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgt 35914601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45512856 - 45512558
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| | | |||| |||| ||||| |  |||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  45512856 gagatgagaatgtttcgttggatgtgtggtaagactagatagg-tagggttagaaatgaaaatattaaagagagggagttggggtagcacctatagtaga 45512758  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    ||||| | || ||||| ||||| ||| | ||||  || |||||| |     
T  45512757 aaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaagatctctagattcggtagtaagcagagtagattagatggcagatagtcaaatc 45512658  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  45512657 actagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaaatatggtttatgatagaaca 45512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 377
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216568
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| |||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactattaagaag-atttagagatcaatgagttggatcctaatatgtt-tatgatagaacattat 2216508  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     | || ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2216509 agtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgttgt 2216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6510784 - 6510616
Alignment:
Q  19 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 118  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  6510784 gatgatgatgttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccattgaagagagagagcg--tagcacctataatagaaaag 6510687  T
Q  119 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 189  Q
    ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||||||||    
T  6510686 ttggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagagt 6510616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Original strand, 30748379 - 30748560
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||  |||||||    
T  30748379 cagatatgaggatgtttcgttggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacattacagagag-ttgt-ggtcgcaccagtagtaga 30748476  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaat 198  Q
    |||| |||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||| | ||| ||||||||    
T  30748477 aaagatggtggaatcaaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctatagtaagcaaagtagatcaaat 30748560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 5908564 - 5908930
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| ||   |||| |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  5908564 gagatgaggctgctgccttggatgtgtttcaagactagacgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacctatagtagaaa 5908663  T
Q  117 agttggtagaaaa------taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    || |||| ||||       ||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||  ||||||  ||| ||||| ||||| |||||  |||||||  ||||    
T  5908664 agatggttgaaatggaaactagacttagttggtttgg--atatagagagaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcaggtggaggatggtca 5908761  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 310  Q
      | |  ||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||  |  | | ||||||||||||| |||| || | |||||||||    
T  5908762 gatcactagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatccaaggattaatgagttggatcaaaatatgatttatgataga 5908861  T
Q  311 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||  ||| |||| ||| |||||||||||  |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5908862 accttattgcgtaattggatccatgtagttggacccaattagtggaataaggcttggttgttgttgttg 5908930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Original strand, 7046285 - 7046434
Alignment:
Q  46 taagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||| |||  | ||||||| ||||||    
T  7046285 taagactagacatgataggattagaaatgacaacattagagagagaggctgggtagcaccaatcgtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggttt 7046384  T
Q  146 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| | |||| ||||| ||||| |||||    
T  7046385 gggcatgtagagagaaaacacgtagcttctgtagtaaggagagtagatca 7046434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Original strand, 43733330 - 43733490
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||    |||||| ||||| | ||||||||||||  |||| || | |  |||||||||||||    
T  43733330 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactatcgagaaggatctagagattaatgagttggataaaaatgtgttttg-gatagaacactat 43733428  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43733429 ggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtggctgttgttg 43733490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 288 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10668586 - 10668494
Alignment:
Q  288 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10668586 atccatatttggtgtacgatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 10668494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928584
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 1928584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 12492204 - 12492130
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 89  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12492204 cagatatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattagagaga 12492130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 379
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169675
Alignment:
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| || | ||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgataaaatatta 28169613  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||| || |||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28169614 tggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagt-ggataaggcttggttgatgttgttg 28169675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 379
Target Start/End: Original strand, 42584407 - 42584642
Alignment:
Q  131 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaa 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||| |||   ||||  | ||||||||||||  ||    
T  42584407 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatgaaggtttgtcagatcaaaagaggtagataaa 42584506  T
Q  231 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 330  Q
    ||||||| |||||||| ||           ||||| || || |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  42584507 gacctagaaaaactataag-----------gaaag-atctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42584594  T
Q  331 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  42584595 ct-tgtagccgaccccacttagtgggataagacttgattgttgttgttg 42584642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7531842 - 7531646
Alignment:
Q  179 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 278  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  | |  |||||||  || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  7531842 gtaaggagagtagatcagatggaggggagtcagatcactagaggtaagggtagacctagaaaaactatacgagaaactattaggaaggatctagagataa 7531743  T
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||   | |  |||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7531742 atgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgtt 7531646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9905132 - 9904940
Alignment:
Q  126 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 225  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || | | |||||   | ||||||||||| | |||||||||||    
T  9905132 aaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgttgtagtaaaaaaa-tagatcacgggaaggagagtcaaatcaaaagaggtag 9905034  T
Q  226 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 319  Q
    | |||||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||||||||  | ||||| ||||||| ||||  ||| ||||||| |||| |||||    
T  9905033 atgaagacctagaaaaactacaagagaaactattaataaagatttagaaattaatgatttggatcaaaataaggtttatgataaaacattatgg 9904940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30198425 - 30198264
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| | ||| | |||||||||||||  ||| |||| |||||||||| | |||    
T  30198425 agaggcagaggtagacttagaaaaactataagagaaattattaagaaagatattgagattaatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattat 30198326  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || ||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30198325 ggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30198264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30812975 - 30812814
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||  |||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||||||||||    
T  30812975 agaggtaggggtagacctagaaaaactatacaagaaactgttaggaaggatctagagataaatgagttggaaaaagacatggtttttgatagaacactat 30812876  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30812875 ggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgttg 30812814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 379
Target Start/End: Original strand, 32276893 - 32276969
Alignment:
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32276893 atgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 32276969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 299 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32569788 - 32569708
Alignment:
Q  299 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32569788 gtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgttgttg 32569708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 374
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699745
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 162
Target Start/End: Original strand, 9695583 - 9695698
Alignment:
Q  47 aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg 146  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||    
T  9695583 aagactagacaggatagaattagaaatgacaacattatagagatatttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttg 9695682  T
Q  147 ggcatgtagagagaag 162  Q
    ||||||||||||||||    
T  9695683 ggcatgtagagagaag 9695698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 379
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716106
Alignment:
Q  267 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc--cgatcccacttagtgggataaggct 364  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |    ||||||||||||||||||||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcgtcaccaccacttagtgggataaggct 31716091  T
Q  365 tggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||    
T  31716092 tggttgttgttgttg 31716106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44681387 - 44681252
Alignment:
Q  29 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 128  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  44681387 ttgcattggatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagacagttgtggtagcacctataatagaaaagatggtggaaa 44681288  T
Q  129 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  44681287 ataagcttagaaggtttggaaatctagagagaagac 44681252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12797011 - 12796912
Alignment:
Q  64 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  12797011 gattaggaataacaccattagaaagag--tggaggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaaga 12796914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 377
Target Start/End: Original strand, 26363660 - 26363768
Alignment:
Q  267 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  26363660 atttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataagacttg 26363757  T
Q  367 gttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||    
T  26363758 gttgttgttgt 26363768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39967643 - 39967497
Alignment:
Q  233 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 332  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||  | || | || |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  39967643 cctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggattgagatatagtttatgttagaacattatggcgtagtttgatcc 39967544  T
Q  333 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  39967543 atgtagccgatcccacttattgtgataatgcttggttgttgttgttg 39967497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2518749 - 2518597
Alignment:
Q  19 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 118  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||    
T  2518749 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcacctcaagtagaaaag 2518651  T
Q  119 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 172  Q
     |||| ||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  2518650 atggtggaaaataggtttaggtggtttgattatgtagagagaagacttgtagat 2518597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27556377 - 27556300
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27556377 tatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgttgttg 27556300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 30113557 - 30113416
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||| |||||| | | ||||  || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  30113557 gagatgagaatgttgtgctagatgtttgttaagaatagatatgataagattatgaatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaa 30113458  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    || |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  30113457 agatggtagaaaataggtttaattggtttgggcatatagaga 30113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39760786 - 39760572
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||  || |||||||||| |||||    
T  39760786 cagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaggattagacaagataggagtagaaatgataacattagagacagagttgggttagcacctatcgtaga 39760687  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||   || |||| |    |||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||| | ||  |||| ||||| ||||| |||||||  |||||| |     
T  39760686 aaagaatgtggaaact----ttaggtggtttgggcatatagagaaaagagttgtagattccgtaataaggagagtagatcatatggagggtagtcaaatc 39760591  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagac 233  Q
       ||||||||||||||||    
T  39760590 gctagaggtagaggaagac 39760572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 376
Target Start/End: Original strand, 3801995 - 3802154
Alignment:
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||||| |  ||||| || ||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||    
T  3801995 aagatgtagaggaagacatacaaaaacaacaagagagactattatgaaagatttaaaggttaatgagttggattcaaacatggtatatgatcgaacacta 3802094  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||| || |||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3802095 tggagtaatttgattaatgtagtcgaacccatttagtgggataaggctttgttgttgttg 3802154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Original strand, 12611704 - 12611779
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611704 tatgttagaactttatggtgtcgtttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 12611779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15215631 - 15215556
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 92  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15215631 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagagagag 15215556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255529
Alignment:
Q  288 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc--gatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 8255529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 376
Target Start/End: Original strand, 14459043 - 14459177
Alignment:
Q  243 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 342  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| || | |||| |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  14459043 ctataagagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 14459142  T
Q  343 -tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14459143 cccccactttgtgggataagccttggttgttgttg 14459177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 109
Target Start/End: Original strand, 25288822 - 25288916
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 109  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25288822 cagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25288916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 109
Target Start/End: Original strand, 25300157 - 25300251
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 109  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25300157 cagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Original strand, 3473753 - 3473854
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||| ||| | |||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3473753 aatgagttggaccggaatttggtttatgattgaatattatggcgaaatttaatccatttagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgttgt 3473852  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  3473853 tg 3473854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 378
Target Start/End: Original strand, 13589474 - 13589762
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||   |||||| |||||| |||||||  |||||||||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||| |||     
T  13589474 agagagagagttgaggtagcgcctataatagaaaatatggtagaaaatatgattaggtggtttgaacatgttgagagaagaccgatagatgttgtagtac 13589573  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
    ||||||| ||| | |||||||| | |        |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| || | |||||    
T  13589574 gaagagtagattatatggaggacaat-------gaagaggtagatgaagacttagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaagattaatga 13589666  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| ||| |||| || | |   |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| | || || |  || |||||| |||| |||||||||||    
T  13589667 gttgaatcaaaatatgattttaaatagaacaatatggcgcaatttgatctatgtagccaaccctacattatgagataagacttgattgttgttgtt 13589762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 380
Target Start/End: Original strand, 35323993 - 35324058
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35323993 tatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 35324058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 325 - 373
Target Start/End: Original strand, 26055651 - 26055699
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26055651 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 26055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143622
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgttgttg 36143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35647005 - 35646930
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  35647005 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtgtaacaaggcttggttgttgttgt 35646930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 38392046 - 38391919
Alignment:
Q  224 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||| || || | ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||     
T  38392046 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgta 38391947  T
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccactta 351  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38391946 atttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41031473 - 41031418
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41031473 atttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 41031418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41031579 - 41031524
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41031579 atttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 41031524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 306
Target Start/End: Original strand, 5266027 - 5266140
Alignment:
Q  192 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 291  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||  |||| || |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5266027 atcaaacggaggagagt-aagtcagaagaggtagagaaagacctagaaaaactatcatagaaatcattataatggatttggaggtcaatgagttgaatcc 5266125  T
Q  292 aaatttggtgtatga 306  Q
    |||||| || |||||    
T  5266126 aaatttagtttatga 5266140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10824441 - 10824331
Alignment:
Q  100 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatg 199  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||  |||||  ||| ||| | ||||| |||||||||    
T  10824441 agcacctaaagtagaaaagatggtcgaaaataggcttaggtggtttgggtatttagagaaaagactcatagattttgtagtatggagagtagatcaaatg 10824342  T
Q  200 gaggagagtca 210  Q
    ||||| |||||    
T  10824341 gaggatagtca 10824331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 36143289 - 36143480
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||   ||||||||||| || || |  |||||||||    |   |||||||||||||| |||    
T  36143289 cagagatgaggatgttgtgttggtcgtgtggtaagactagatgagataggattagaaaggaaaagattagagag----tcgaggtagcacctatagcaga 36143384  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    | || |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||   ||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||    
T  36143385 atagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaaatggaggatagtca 36143480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 158
Target Start/End: Original strand, 39051059 - 39051205
Alignment:
Q  12 gaacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||  || || |||||||  |    
T  39051059 gaacatagatgaggatgttgtgttagatgtgtggtaagacaagacatgatagaattagaaatgacaatattcgagagagagttgggataacacctatcat 39051158  T
Q  112 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
     |||||| ||| ||||| | || |||| ||||||||| |||||||||    
T  39051159 tgaaaagatggcagaaactcggtttaggtggtttgggtatgtagaga 39051205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 42493663 - 42493536
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||| |||||   ||||||| ||||   ||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  42493663 agatgaggatgttgcgttggttgtgtggtaagattagtcaagattggattgtaaatgacaacatt--ggagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 42493566  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgg 147  Q
    | | || |||| ||||||||| ||||||||    
T  42493565 gattgtggaaactaggcttaggtggtttgg 42493536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 330 - 379
Target Start/End: Original strand, 1064955 - 1065004
Alignment:
Q  330 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1064955 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1065004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Original strand, 21425229 - 21425330
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| |||| || | ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| || || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  21425229 aatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtggaatatggcttggttattgttgt 21425328  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  21425329 tg 21425330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30456573 - 30456441
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |   ||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||  | || ||||||||||||||    
T  30456573 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagacca-atgggatagaattagaaatgacgacattagagagatagttcgagttgcacctatagtaga 30456475  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 148  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  30456474 aaagatggtagaaactagacttatgtggtttggg 30456441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 30689942 - 30690019
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  30689942 tatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggtttttattgttg 30690019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30783400 - 30783041
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagca-cctatag 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||     |||||||  || ||||| |||||||    
T  30783400 gagatgaggatcttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagaggggagagagagttgggatagcaacctatag 30783301  T
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    ||||||| | ||| ||||   ||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||||||  ||| ||||  ||||| |||     |||||| |||||    
T  30783300 tagaaaaat-ggtggaaac--ggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattttgtagtaaagagagtagat-----ggaggatagtca 30783209  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 309  Q
      | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||| ||| |||     
T  30783208 gatcactagaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaag-atctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataa 30783110  T
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| ||||  ||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  30783109 aacattatgaggtagtttgatccatgtagccgaccccatctagtgggataaaacttgactgttgttgtt 30783041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 39651090 - 39651025
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39651090 tatggtgtaatttgatccatatacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 39651025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Original strand, 1313771 - 1313843
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1313771 tatgatagaacattatggcgtaattttatccatgtagttgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 1313843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 137
Target Start/End: Original strand, 13986416 - 13986536
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||  ||||  ||||||||||||| ||||| |||| || |  ||||||||||||||||| |||    
T  13986416 gagatgaggatgttacactggatgagtggtaatactagacgagatataattaggaatgacatcattaaagagggatttggggtagcacctatagtacaaa 13986515  T
Q  117 agttggtagaaaataggctta 137  Q
    |  ||||||||||||| ||||    
T  13986516 atatggtagaaaatagactta 13986536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 379
Target Start/End: Original strand, 14903689 - 14903845
Alignment:
Q  223 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||  |||||||    |||||||| || | ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  14903689 tagaggaagacctagaaaaactataagagagactattgggaaatatttagaaagtaatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgt 14903788  T
Q  323 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  14903789 aatttgatccatgtagcttaccccacttagtggggaaaaacttggttgttgttgttg 14903845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 41212068 - 41212147
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta--gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41212068 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttg 41212147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43350827 - 43350728
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||    ||| || |||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  43350827 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaact---tggtgtaatttgatccaagtagccgaccccgctaagtgggataaggcttggttgttgttgt 43350731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Original strand, 36042407 - 36042482
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  36042407 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcggaccccaattaatgggaaaagatttggttgttgttgttg 36042482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38901892 - 38901817
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38901892 tgatataacactatggcggcatttgattcatgtagcggaccccatatagtgggataaggcttgattgttgttgttg 38901817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2776524 - 2776442
Alignment:
Q  83 agagagagag-tgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2776524 agagagagagctgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagac 2776442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18474239 - 18474173
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18474239 gtagcacctatagtagaaatgatggtggaaactaggcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 18474173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Original strand, 25985462 - 25985668
Alignment:
Q  36 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 135  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  25985462 ggatgtgtggtaagacaagacaggatagaattagaaacgacaacattagagagag--ttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagact 25985559  T
Q  136 tagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacct 235  Q
    |   || ||| ||||||| ||||||||||  ||  ||  ||  ||||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  25985560 tgcgtgattttggcatgt-gagagaagacatgtgaattttgaagtaaggagactagatcagatgtaggggagtcaaatcactagaggtagaggaagacct 25985658  T
Q  236 aggaaaacta 245  Q
    || |||||||    
T  25985659 agaaaaacta 25985668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28269840 - 28269759
Alignment:
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 297  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28269840 aaaagaggtatatgaagacctagaaaaattataagagaaactattagcaag-atttagaggttaatgagttggatccaaattt 28269759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 371
Target Start/End: Original strand, 18741843 - 18741908
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18741843 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 18741908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 371
Target Start/End: Original strand, 18746807 - 18746872
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18746807 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 18746872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 376
Target Start/End: Original strand, 36069774 - 36069883
Alignment:
Q  267 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    |||||||| | |||||||||| |  |||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||| |||||    
T  36069774 atttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacccacttactggaataatgcttg 36069873  T
Q  367 gttgttgttg 376  Q
     |||||||||    
T  36069874 attgttgttg 36069883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 379
Target Start/End: Original strand, 39388907 - 39389070
Alignment:
Q  220 aggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg---tgtatgatagaacact 315  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||| ||||| | ||||||||||||  ||||  |    | | || ||||| | |    
T  39388907 aggtagaggaggacctagaaaaactataaagagaaactattaggaaagatctagagattaatgagttggatagaaataagaaactatttggtagaagatt 39389006  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39389007 atggcgtcgtttgatccatgtggccaaccccacttagtgggataaagcttggtttttgttgttg 39389070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41444501 - 41444337
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctag--gaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| | |||| ||| |||| |||| |||| ||||||| ||||     
T  41444501 agaggcagaggaagacctagaaaaaaactataagagaaactattaagaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacat 41444402  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||   ||| |||||| |||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  41444401 tacaacgtaatttgaaccatgtagccaaacccacttaatggaataatgcttggtcgttgttgttg 41444337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4558259 - 4558207
Alignment:
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4558259 ttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 4558207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16994602 - 16994442
Alignment:
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 318  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||||||||| | | ||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||    
T  16994602 gaggaagaggaagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaatgatttagagattattgagttggattgagatatgatgtataatagaacgttatg 16994503  T
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
      ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||    
T  16994502 atgttgtttggtacatgtagccgaacccacttagtcagataaagcttggttgtcgttgttg 16994442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17491805 - 17491689
Alignment:
Q  226 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 325  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||  || || || ||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||       
T  17491805 aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaagacttggagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtatg 17491706  T
Q  326 ttgatccatgtagccga 342  Q
    |||||||||||||||||    
T  17491705 ttgatccatgtagccga 17491689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18474045 - 18473973
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||||| |||| | || |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18474045 tgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 379
Target Start/End: Original strand, 79156 - 79310
Alignment:
Q  224 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 323  Q
    |||||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||  |||| |||  | ||||||||||  ||||||||    
T  79156 agaggaaggcttagaaacactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatagaaatatggcctgtgatagaacataatggcgtc 79255  T
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  79256 gtttgatccatgtacccgaccccacttagtgtactaaggctt-gttgttgttgttg 79310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 12985919 - 12985974
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12985919 atttgatccatgaagccgagcccatttagcgggataaggcttggttgttgttgttg 12985974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 377
Target Start/End: Original strand, 23023351 - 23023509
Alignment:
Q  221 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||  || ||| || || | ||||||||||||   ||  || | |||||||||| | |||| |    
T  23023351 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagttggataggaacatgatatatgatagaatattatgac 23023450  T
Q  321 gtcatttgatccatgtagccgatcccact--tagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| || ||||||| ||||||    
T  23023451 gtcgtttgatccatgtaaccgaccccacttatagtgggatatggtttggttgatgttgt 23023509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 380
Target Start/End: Original strand, 31309583 - 31309638
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31309583 tttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgc 31309638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35085186 - 35085135
Alignment:
Q  328 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35085186 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataagggttagttgttgttgttg 35085135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40982949 - 40982894
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40982949 atttgatccatgttgccgaccccatttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 40982894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 44373740 - 44373891
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  44373740 gataggattagaaatgaaaatattagagtgagagttggagtagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggcttgagtggtttgagcatgtagagt 44373839  T
Q  159 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
     |||||   |||||  ||| ||||  ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  44373840 aaagacctatagattttgtagtaaagagagtagatcaaatagaggatagtca 44373891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45512506 - 45512443
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45512506 tatggcataatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggatgaggcttggttgttgctgtt 45512443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 164
Target Start/End: Original strand, 78988 - 79112
Alignment:
Q  43 tggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata---ggcttaga 139  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||  |  ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||   |||||||     
T  78988 tggtaagactagacgggataggattagaaacaacaacattagagagagcattcgggtaacacctacagtagaaatgatggtagaaattactaggcttagg 79087  T
Q  140 tggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  79088 tggtttgggcatgtatagagaagac 79112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10824288 - 10824186
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| ||||| | |||| |||| | |||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10824288 aatgaattggaccaaaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgaccccgcctagtcggaaaaggcttggttgttgttgt 10824189  T
Q  378 tgc 380  Q
    |||    
T  10824188 tgc 10824186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16035822 - 16035744
Alignment:
Q  282 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 360  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  16035822 agttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggataa 16035744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Original strand, 24837934 - 24837975
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24837934 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 24837975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Original strand, 30980058 - 30980099
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30980058 tagccgatcccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgt 30980099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 377
Target Start/End: Original strand, 4061897 - 4061945
Alignment:
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4061897 atccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgt 4061945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 9695815 - 9695867
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9695815 tttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9695867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 379
Target Start/End: Original strand, 16921451 - 16921503
Alignment:
Q  327 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16921451 tgatccatgtagccgaccgtacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 16921503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25985880 - 25985813
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  25985880 gggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta-ttggtttgtgcatttagagagaagac 25985813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41444607 - 41444547
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  41444607 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 41972134 - 41971991
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||   | ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  |  ||||| |||||| ||||||||    
T  41972134 gagatgaggatgttgtattggatgtgtgataagattaatga-gatagaattagaaatgagaatattagagagag--ttagggtaacaccta-agtagaaa 41972039  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    || |||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41972038 agatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagac 41971991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2518471 - 2518400
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  2518471 tgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagtaagataaggtttggttgttgtt 2518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3464274 - 3464172
Alignment:
Q  273 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||| |||||  |  |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  3464274 aggtcaatgagttgga-ccaaatataatttatgatagaacattatggtatagtttgatccatatagtcgattccacttaatgggataagacttgattgtt 3464176  T
Q  373 gttg 376  Q
    ||||    
T  3464175 gttg 3464172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 380
Target Start/End: Original strand, 5057596 - 5057651
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5057596 tttgatccatgtaactgatcctacttagtgggataaggcttgattgttattgttgc 5057651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 379
Target Start/End: Original strand, 9842361 - 9842404
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9842361 tagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgttgttg 9842404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12692310 - 12692239
Alignment:
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12692310 tagaacattatgccgtcgtttaatccacgcagccgattccaattagtgggataaggcttggttgtttttgtt 12692239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14742890 - 14742847
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 368  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14742890 tttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggt 14742847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16918529 - 16918494
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16918529 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 16918494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 300
Target Start/End: Original strand, 25439471 - 25439530
Alignment:
Q  241 aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 300  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  25439471 aactataagagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatggt 25439530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 379
Target Start/End: Original strand, 32978115 - 32978158
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32978115 tagccgacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32978158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1549443 - 1549389
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1549443 tttgatccatgtaacggaccccacttagtgggatatggcttggtggttgttgttg 1549389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 377
Target Start/End: Original strand, 4955335 - 4955473
Alignment:
Q  239 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||| || |||||  | |||||||| |||  |||| || | ||| ||| |||| || | ||| |||||||  ||||||    
T  4955335 aaaattattagagaaactattaaaaaagacttagaaattaatgagtttgatttaaatatgatttataataaaacattacgacgtaatttgatttatgtag 4955434  T
Q  339 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4955435 tcgatctcacttagtgagataaggtttggttgttgttgt 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 16252860 - 16252930
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 90  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16252860 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgagataaaattagaaatgacaacattagagagag 16252930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24399965 - 24399788
Alignment:
Q  201 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 300  Q
    |||| |||||| |||  ||||| |||| || || ||| |||| ||| |||||||| ||||  |||||| | ||| | ||||||||||||  |||| ||||    
T  24399965 aggatagtcaaattactagaggcagagcaaaacttagaaaaattataagagaaactattaagaaggatctcgagattaatgagttggattgaaatatggt 24399866  T
Q  301 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     |||||||||| | ||||  |||||||| || |||||||| | | |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  24399865 ttatgatagaatattatgatgtcatttgttctatgtagccaaccacacttagtggaataa-gtttggttgttgtagttg 24399788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 380
Target Start/End: Original strand, 30748646 - 30748748
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||  |||| || | ||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||| ||| |||||||||||    
T  30748646 aatgagttggatagaaatatgatatataattgaacattatgatgtcatttgatccatgtagctgaccccactaagcgggttaagacttagttgttgttgt 30748745  T
Q  378 tgc 380  Q
    |||    
T  30748746 tgc 30748748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38178479 - 38178377
Alignment:
Q  158 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 257  Q
    |||||||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  38178479 agaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcgctagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaacta 38178380  T
Q  258 tta 260  Q
    |||    
T  38178379 tta 38178377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3079850 - 3079609
Alignment:
Q  129 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 228  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   | |||  |||| |||| | ||| ||||| ||| ||| |||| || | |  ||||||| |||    
T  3079850 ataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctat-gattttgtgataaggaaagtagatcagatgaaggggagtgaaatcactagaggtaaagg 3079752  T
Q  229 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 328  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| ||||  || ||| | | | |  ||||||||||| || || |||| | ||||||| || ||||  ||  ||||    
T  3079751 aagacctag-ataactataagagaaactattaagaaagatctggggattgatgagttggatacacatatggtatttgataga-cattatgaagtggtttg 3079654  T
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  3079653 atccatgtagccga-cccacttaatgggacatggcttggttgttgt 3079609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5030451 - 5030418
Alignment:
Q  342 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5030451 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 5030418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33666814 - 33666726
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca 150  Q
    |||||||||| ||||||||   | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||    
T  33666814 gataggattaagaatgaca---taagagagagagttggggtagcacctatcgtagaaaagatggtagaaactctacttaaatggtttgggca 33666726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35320472 - 35320399
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||| |||||| | |||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35320472 gatagaacattatggcttaatttaattaatgtagctgaccccacttagtgggataaagcttggttattgttgtt 35320399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Original strand, 39702163 - 39702232
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||||    
T  39702163 tgatagaacattatggtatcatttgatctatgtagccgaccacatttagtgggataaaacttggttgttg 39702232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42493501 - 42493428
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| |||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  42493501 atagaaaactatggcatcgtttgatctatgtagccaaccccatttagtaggacaaggcttggttgttggtgttg 42493428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 379
Target Start/End: Original strand, 1070279 - 1070343
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1070279 tatggcatcatttgatccatgtagctaatctcacctggtgggataagacttgattgttgttgttg 1070343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3638387 - 3638335
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3638387 tttgttccatggagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgt 3638335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5810353 - 5810277
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||  |||| | || || ||||||||||||| | | |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5810353 tatgatagaactttatgtcatcgttcgatccatgtagccaacctcacttaatgggatgaggcttggttgttgttgtt 5810277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16971824 - 16971772
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16971824 tttgatccatgtagccgacccaatttagtgggattaggcttcgttgttgttgt 16971772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18742122 - 18742034
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  18742122 aatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggatatggcttg 18742034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18747086 - 18746998
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  18747086 aatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggatatggcttg 18746998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Original strand, 29735728 - 29735804
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacacca-ttagagagagag 92  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||  || || |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  29735728 gagatgaggatgttgtgttggatgaatggtaagactagacgagaaagaattaagaataacaccatttagagagagag 29735804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33828116 - 33827816
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||| | |||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||  ||||| || ||||||||  |||    
T  33828116 agatgaggatgttgtgttggatgtctagtaaaactagataagataagactagaaatgacaacattatagagatagttggggtaacaactatagtattaaa 33828017  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 217  Q
      | || ||||| | |||||| || |||| |||| |||||| |||||  ||||||    | |||||| |||| |||||||| || || |   |  ||| |    
T  33828016 tattgtggaaaacatgcttaggtgatttgagcatatagagataagacgtgtagatttcatagtaagatgagtagatcaaatagaagataaaaagattaca 33827917  T
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||||  ||||||| ||  |||||||| |||||||| |||| |||  ||||| || | ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  33827916 agaggtacgggaagacgtataaaaactataagagaaactattaaaaaatatttatagattaatgaattggatctaaatatggtttatgatagaacaatat 33827817  T
Q  318 g 318  Q
    |    
T  33827816 g 33827816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 90
Target Start/End: Original strand, 36069570 - 36069638
Alignment:
Q  22 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 90  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  36069570 gaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaacgacaacattagagagag 36069638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 1335555 - 1335606
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  1335555 atttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataggacttagttgttgtt 1335606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 162
Target Start/End: Original strand, 6483245 - 6483324
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 162  Q
    |||||||||||  |||||||   |||||||||||||  ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6483245 agagagagagttggggtagctggtatagtagaaaagagggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagggaag 6483324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 138
Target Start/End: Original strand, 7103274 - 7103313
Alignment:
Q  99 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7103274 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactaggcttag 7103313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 11733711 - 11733862
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  || || |||||||  ||||| || |||| |||| |||  |||  |||||||  | ||| ||||    
T  11733711 gataggattagaaatgacaacattagagaaagagttgggataacacctatgatagaatagatggtggaaactagagttaagtggtttgatcttgttgaga 11733810  T
Q  159 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    ||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| |||||  ||||||| |||||    
T  11733811 gaagatttgtagatgttgtagtaaggagagtagatcacgtggaggatagtca 11733862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16008428 - 16008393
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16008428 cccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 16008393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Original strand, 16715480 - 16715551
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16715480 tatgatagaacattatggcggtgtttgatccacgtagccgaccctgcttagtgggattaggcttgattgttg 16715551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 376
Target Start/End: Original strand, 27037761 - 27037915
Alignment:
Q  221 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 320  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || |||| ||||| || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||| | ||||||    
T  27037761 ggtagagaaagacctagtaaaactatacgataaactattaggaaagatataaagattaatgagttggatagaaatatggtatttgatagaatattatggc 27037860  T
Q  321 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||  |||||||||||  | |   ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  27037861 gttttttgatccatg-ggacagccccacttagtgagatagggctttgttgttgttg 27037915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 34196064 - 34196135
Alignment:
Q  87 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  34196064 agagagttggggtagcacctatagtagaaaaaacagtagaaactagacttatgtggtttgggcatgtagaga 34196135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 379
Target Start/End: Original strand, 4011484 - 4011530
Alignment:
Q  333 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4011484 atgtagccgaccccactaagtgggataaggcttagttgtttttgttg 4011530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5127377 - 5127299
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |  | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5127377 tatgatagaacattacggcgtaatttgacccatgtaactaaccccacttggtgggataaggctttggtggttgttgttg 5127299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Original strand, 5205413 - 5205455
Alignment:
Q  333 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5205413 atgtaggcgaccccacttagtgggataagacttggttgttgtt 5205455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Original strand, 14744522 - 14744564
Alignment:
Q  336 tagccgatcccactt-agtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14744522 tagccgaccccactttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14744564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Original strand, 25439394 - 25439460
Alignment:
Q  22 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 88  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   ||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  25439394 gaggatgttgcgctggattagtggtaagactagatgagataggaataggaacgataccattagagag 25439460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 372
Target Start/End: Original strand, 26639233 - 26639303
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||||||||||    
T  26639233 tatgatagatcattatggtgtcgtttgatccatgtatccgacccaacttagtgagatatgacttggttgtt 26639303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 164
Target Start/End: Original strand, 29645044 - 29645106
Alignment:
Q  102 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  29645044 cacctatagtataaaagatggtggaaaataggtttaattggtttggacatgtaaagagaagac 29645106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30456367 - 30456329
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30456367 tgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccga 30456329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 379
Target Start/End: Original strand, 39049825 - 39049871
Alignment:
Q  333 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  39049825 atgtagccgaccccacttagtgggataaagctttattgttgttgttg 39049871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 2938342 - 2938375
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2938342 cccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgt 2938375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 23023231 - 23023312
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| | |||||   |||||||||||||||    
T  23023231 agagagagagttcgggtagcacttattgtagaaaagatgggggaaactaggcttaggtagtttgattatgtagagagaagac 23023312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 25439552 - 25439585
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25439552 cccacttagtgggatatggcttggttgttgttgt 25439585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27449224 - 27449183
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27449224 tagccgaccccacttagtgggataaagcttggctgttgttgt 27449183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32838924 - 32838891
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32838924 cccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 32838891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Original strand, 33076295 - 33076408
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| | ||||||||| | | |||| |||| ||| |||||| | ||||  || |||||||||||||||     ||||||||||||||||||  ||    
T  33076295 gatttagagattaatgagttgtaccaaaatatggtttataatagaatattatgatgtaatttgatccatgtagttatccccacttagtgggataagattt 33076394  T
Q  366 ggttgttgttgttg 379  Q
    | ||||||||||||    
T  33076395 gattgttgttgttg 33076408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40640650 - 40640609
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40640650 tagccgagcccacttagttggataagtcttggttgttgttgt 40640609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41604697 - 41604656
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41604697 agccgaccccgcttagtggggtaaggcttggttgttgttgtt 41604656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 379
Target Start/End: Original strand, 1489753 - 1489793
Alignment:
Q  339 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1489753 ccgaccccacttagtgggataagacttggttgttattgttg 1489793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18627025 - 18626977
Alignment:
Q  331 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||    
T  18627025 ccatgtagctgatcccacttagagggaaaatgcttggtggttgttgttg 18626977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18737237 - 18737149
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  18737237 aatgagttggattaaaatatggtttatgatcgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcggccccaattagtgggatatggcttg 18737149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 215 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28255054 - 28255022
Alignment:
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28255054 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatt 28255022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 255
Target Start/End: Original strand, 29709821 - 29709857
Alignment:
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 255  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29709821 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaac 29709857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 338
Target Start/End: Original strand, 29735834 - 29736050
Alignment:
Q  122 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 221  Q
    |||||||||| | |||| | |||| | |||||| |||||| ||   |||||||| |  || ||||||||||||| || || ||||||||  | | |||||    
T  29735834 gtagaaaatatgtttaggtagtttcgacatgtacagagaataccgatagatgctataatacgaagagtggatcagatagacgagagtcagatcagaagag 29735933  T
Q  222 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 321  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||| || | |||||||| || |||  | | ||  ||||| |||||||| || | |||||| ||||  |||| ||    
T  29735934 atagaggaagatctagaaaaactataagaaaagctattagaaaagacttaatgattaacaagttgaatccaaatatgatttatgattgaactttatgacg 29736033  T
Q  322 tcatttgatccatgtag 338  Q
    | ||||||| |||||||    
T  29736034 taatttgattcatgtag 29736050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 172
Target Start/End: Original strand, 38689547 - 38689615
Alignment:
Q  104 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 172  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  38689547 cctattgtagaaaagatggtagaaactcagcttaggtggttttgacatctagagagaagacttgtagat 38689615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 373
Target Start/End: Original strand, 39051372 - 39051420
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||||||||    
T  39051372 tttgatccatgtagtcgaccccacttagtaggataaagcctggttgttg 39051420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43903949 - 43903921
Alignment:
Q  346 cacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43903949 cacttagtgggataaggcttggttgttgt 43903921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 329 - 377
Target Start/End: Original strand, 44456991 - 44457039
Alignment:
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44456991 atccatgtagctggccccacttagtgggataaggtttggatgttgttgt 44457039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 114)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 28085296 - 28085660
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28085296 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 28085395  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28085396 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaagtt 28085495  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085496 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 28085595  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085596 tatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28085660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 32755839 - 32756205
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagta 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  32755839 cagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagta 32755938  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32755939 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 32756038  T
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32756039 ttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 32756138  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  32756139 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgttg 32756205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 374
Target Start/End: Original strand, 30031178 - 30031535
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30031178 gagatgaggttgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaa 30031277  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30031278 agttggtagaaaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 30031377  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  30031378 aagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacacta 30031477  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30031478 tggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5258506 - 5258146
Alignment:
Q  21 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaag 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  5258506 tgagaatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 5258407  T
Q  119 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5258406 ttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaa 5258307  T
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 318  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||  |||||||||    
T  5258306 gaggtagagaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaatatggtttttgattaaacactatg 5258207  T
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5258206 gcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgttg 5258146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35043801 - 35043441
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  35043801 gagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaa 35043702  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  35043701 agttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaa 35043602  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  35043601 aagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 35043502  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    || |||||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  35043501 tgacgtcatttgatcaatgtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgttgt 35043441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 608081 - 608442
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  608081 gagatgaggatgttccgttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtatcacctatagtagaaa 608178  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  608179 agttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaa 608278  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctag----gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    ||||||| || |||||||||     |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||     
T  608279 aagaggttgatgaagacctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaat 608378  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  608379 actatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Original strand, 9706698 - 9707052
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  9706698 gagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctattgtagaaa 9706797  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||   |||| || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  9706798 agttggtagaaaataggcttagatggtttg------tagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtagatcaaatggagaagagtcaggttaa 9706891  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||  |||||  ||| | |||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  9706892 aagaggtacgggaagggctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 9706991  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9706992 tggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9707052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20427996 - 20427634
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20427996 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 20427897  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||     
T  20427896 agttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttac 20427797  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||    
T  20427796 aagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaa-aatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaatacta 20427698  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat-aaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20427697 tggcgacatttaatcaatgtagccgacccgacttagtgggataaagacttggttgttgttgttg 20427634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 67 - 379
Target Start/End: Original strand, 12890556 - 12890859
Alignment:
Q  67 taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |            
T  12890556 taggaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgtaccca-------- 12890647  T
Q  167 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 266  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12890648 -tagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaagg 12890746  T
Q  267 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12890747 atttagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 12890846  T
Q  367 gttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||    
T  12890847 gttgttgttgttg 12890859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9594072 - 9593709
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtg------ggtagcacctatag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |      |||||||||  |||    
T  9594072 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccattag 9593973  T
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9593972 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtca 9593873  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 310  Q
    | |   ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  9593872 aat--caagaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgataga 9593775  T
Q  311 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||| ||||  || ||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9593774 acattatg--gtaatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgttgtt 9593709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 337
Target Start/End: Original strand, 5631741 - 5632064
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagtag 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5631741 agatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtag 5631840  T
Q  114 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |    
T  5631841 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagat 5631940  T
Q  214 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    ||||||||  | |||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  5631941 taaaagagacaaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataaca 5632040  T
Q  314 ctatggcgtcatttgatccatgta 337  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  5632041 ctatgacgtcatttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 14030726 - 14031079
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggt-aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14030726 cagagatgaggatgttgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagtag 14030825  T
Q  114 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||   |    
T  14030826 aaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcggat 14030925  T
Q  214 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || | | |||||||| |    
T  14030926 taaaagaggtagaggaagaccta-----------agaaaaac-attagaaaagatttagaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaata 14031013  T
Q  314 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||  ||||||||||||||| || |||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14031014 ctataacgtcatttgatccatataaccgaccctatttagtgggataaagtttggttgttgttgttg 14031079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21352171 - 21351837
Alignment:
Q  41 agtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagat 140  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21352171 agtggtaagactagatatgataggattaggaataacatcgttagagagag--tggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagat 21352074  T
Q  141 ggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaa 240  Q
    | ||||| ||||||||||||||||  || |||||  | || |||||| | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21352073 gatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaa 21351974  T
Q  241 aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 340  Q
    ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21351973 aaccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagcc 21351874  T
Q  341 gatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    || | || |||||| |||||| ||| || ||||||||    
T  21351873 gacctcagttagtgagataagacttcgtcgttgttgt 21351837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10100217 - 10099987
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||||||    
T  10100217 gagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtcgcacatatagtagaaa 10100120  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||    
T  10100119 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaa 10100020  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100019 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 10099987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 379
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679680
Alignment:
Q  106 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||  || ||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  206 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 305  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||          |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaagac----------tattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgttgttg 30679680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143763
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttg 34143763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156379
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttg 34156379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 334
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  97 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||  |||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 295  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33497062 aatgaaggag--tcaagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  296 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 334  Q
     || | ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28027187 - 28026827
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  28027187 cagagacgaggatgttatgttggatgagtggtaagactagatggcataggattaggaatgacgtcgttagatagagaatg-gggtagcacctatagtaga 28027089  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||  |||||||| || ||| |||||||  |||| ||||||||||||||  ||    
T  28027088 aaatgtggtagaaaataggcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcagatt 28026990  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||  || |||||| |||| ||||| ||| || ||||| |||| ||||||  ||||     
T  28026989 agaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaatatggtttatgat--aacat 28026892  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt-gggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || ||||| |||||| | |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28026891 tacggcgtaatttga-caatgtagccgaccccacttattgggggtaaggcttgcttgttgttgttg 28026827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 265 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34934942 - 34934830
Alignment:
Q  265 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34934942 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 34934843  T
Q  365 tggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||    
T  34934842 tggttgttgttgt 34934830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 263 - 379
Target Start/End: Original strand, 31818999 - 31819115
Alignment:
Q  263 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 362  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31818999 aagggtttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatg 31819098  T
Q  363 cttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| |||||||    
T  31819099 cttggttgtggttgttg 31819115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 217 - 377
Target Start/End: Original strand, 5095956 - 5096116
Alignment:
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||    
T  5095956 aagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacatta 5096055  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5096056 tggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 5096116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6056123 - 6055806
Alignment:
Q  24 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt-tgg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||   |      
T  6056123 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaaatta 6056026  T
Q  123 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagagg 222  Q
    ||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||   || ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||| |||    
T  6056025 taggaaataggttttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtgcaaatagtagatcagatggaagagagtcaaataaaaaaagg 6055926  T
Q  223 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 322  Q
    ||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | |||    
T  6055925 tagaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgt 6055826  T
Q  323 catttgatccatgtagccga 342  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  6055825 aatttgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Original strand, 7133795 - 7133923
Alignment:
Q  144 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 243  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7133795 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7133894  T
Q  244 tattagagaaacaattagaaaggatttag 272  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7133895 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Original strand, 7136718 - 7136846
Alignment:
Q  144 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 243  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7136718 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7136817  T
Q  244 tattagagaaacaattagaaaggatttag 272  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7136818 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 167 - 338
Target Start/End: Original strand, 5080912 - 5081083
Alignment:
Q  167 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 266  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||      
T  5080912 gtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcattcaaaatt 5081011  T
Q  267 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5081012 atttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 258 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206457
Alignment:
Q  258 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  358 taaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  3206478 taagacttggttattgttgttg 3206457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34503
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 34503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 377
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689915
Alignment:
Q  101 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||| || |    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  201 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 300  Q
    || ||||||| || |||||||||      |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| ||||| | ||    
T  2689746 agtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcagcgaattggatgcaaatattgt 2689839  T
Q  301 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     ||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  ||| |  |||||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  2689840 ttat-atagaatactatgacgtaatttgattcatataatcgaccttacttagtatgataatgtttggttgttgttgt 2689915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 5080777 - 5080888
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5080777 gagatgaggatgttgcgctggataactggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagtgggggtatcacctatagtagaaa 5080876  T
Q  117 agttggtagaaa 128  Q
    ||||||||||||    
T  5080877 agttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 246 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10099025 - 10098894
Alignment:
Q  246 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 345  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  10099025 ttagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccc 10098928  T
Q  346 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10098927 cacttagtgggataagacttgattgttgttgttg 10098894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 377
Target Start/End: Original strand, 31818533 - 31818813
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||||||||||  || ||| |||  ||||| | ||| |||||    
T  31818533 gggtagcacctatagtacaaaaaatggtggaaaatagacttaggtggttttg-catgatgagagaagacctgttgattctgcagtaaggaaagtagatca 31818631  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 295  Q
     |||||||  ||| |  | |  | ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||| | ||||||||||||| || |    
T  31818632 tatggagggtagtgagatcactaaaggtaggagaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagt 31818731  T
Q  296 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  31818732 atggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagcgggaaaaagcttggttgttgttgt 31818813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10617586 - 10617232
Alignment:
Q  16 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||   |||| ||||| |||||||     |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  10617586 agagatgaggat-ttgcgttggatgtgtgttaagactagacgaaatagaattagaaatgaca-----agagcgagagttggggtagcacttatagtagaa 10617493  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    |||  | |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  || | | |||   |||| |||||  |||||||||||| ||||||| | |    
T  10617492 aagacg-tagaaactagacttaggtggtttgagcatgtagaaagaagacctgtggtttctgcattaaggagagt--atcaaatggaggggagtcaaatca 10617396  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
      ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||||||||    
T  10617395 ctagaggtagaagaaaacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacact 10617296  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  10617295 ttggcgttgtttgatttatgtagccggccccacttagtgggatccggcttggtggttgttgttg 10617232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 33083978 - 33084127
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  33083978 cagaaatgaggatgctgcgttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagttggggtagcacctatggtaga 33084077  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33084078 aaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 33084127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 26291700 - 26291917
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtag-cacctatagtag 113  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||  |||||| |||||||| |||    
T  26291700 gagatgatgatgttgtgttgaatgtgtggtaagtctagacttgatagtattaggaatgatactattagagatagagagttagggtagacacctataatag 26291799  T
Q  114 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 213  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||| |||| ||||| ||||||||||||    |    
T  26291800 aaaatatggtagaaaatagacttaggtggttt--gcatgtagagagaagacttatagatgttgcagtaagatgagtagatcagatggaggagagtgtgat 26291897  T
Q  214 taaaagaggtagaggaagac 233  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  26291898 caaaagacgtagaggaagac 26291917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 342
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24666058
Alignment:
Q  103 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga-tgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 201  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| ||| |    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaa 24665917  T
Q  202 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 301  Q
    | | ||||   | |  ||||| |||||||| | ||| | |||||  |||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  24665918 gcatagtcggatcaccagaggcagaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtt 24666017  T
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 342  Q
    |||||||||||| |||| | | ||||||||  |||||||||    
T  24666018 tatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccga 24666058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30789147 - 30789076
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30789147 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 30789076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 257 - 379
Target Start/End: Original strand, 5897619 - 5897741
Alignment:
Q  257 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 356  Q
    |||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||| |||| |||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5897619 attagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtggg 5897718  T
Q  357 ataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  5897719 ataaggcttgattgttgttgttg 5897741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 183
Target Start/End: Original strand, 9568588 - 9568750
Alignment:
Q  23 aggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagtt 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |  |||||   |||||||| ||||||||||||| |    
T  9568588 aggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgatagaattataaatgacaacattagagcgccagtgttgaggtagcacttatagtagaaaagat 9568687  T
Q  121 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 183  Q
    | | |||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||  |||||||||    
T  9568688 gatggaaaatggacttagatggtttgggcaactagagggaagacatgtagattatgtggtaag 9568750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1615301 - 1615223
Alignment:
Q  299 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1615301 gtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgt 1615223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 378
Target Start/End: Original strand, 8364679 - 8364839
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||  | ||| |||||||   |||  |||| |||||||||||| |||    
T  8364679 agaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattat 8364778  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  8364779 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaggctttattgttgttgtt 8364839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 379
Target Start/End: Original strand, 579465 - 579702
Alignment:
Q  142 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 241  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  | | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||   | |  ||||| |||| |||||||   |||    
T  579465 gtttgagcatgtagagagaaggcttgtagattatatagtaaggagagttgatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagagaaagacctcaaaaa 579564  T
Q  242 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 341  Q
    ||| | |||||||| ||||  || ||| ||||  | | ||| ||| ||| |||| |||| | |||  ||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  579565 actgtaagagaaactattaagaaagatatagaaattagtgacttgaatcaaaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgtagccg 579664  T
Q  342 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  579665 atcccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 579702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7513683 - 7513387
Alignment:
Q  85 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctagtagatgctgtggtaag 183  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| | |||||| | |  || |||  ||| |||||    
T  7513683 agagagagttcggggagcacctataatagaaaagatggtagaacctagacttaggtggtttgggcatgcaaagagaaaaacccgtggattatgtagtaag 7513584  T
Q  184 aagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg-aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
    ||||||  |||| || |||| ||||||| | |  ||||| || || ||||||| |  ||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||| | |||||    
T  7513583 aagagtcaatcagattgaggggagtcaaatcactagaggcagggggaagacctggataaactataagagaaacttttaggaaggatctagagatgaatga 7513484  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||   | |  |||| | |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  7513483 gttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagctgatctcacttggcaggacaaggcttggttgtttttgttg 7513387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 375
Target Start/End: Original strand, 7492551 - 7492669
Alignment:
Q  257 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 356  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |  ||||||||| ||| |||| |||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  7492551 attaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtggg 7492650  T
Q  357 ataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  7492651 ataaggattggttgttgtt 7492669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 283 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4245966 - 4245870
Alignment:
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||  |||| |||| | |||||||||| |||| | || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4245966 gttggataaaaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgttg 4245870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12119714 - 12119642
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc-acttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12119714 atagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 12119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12134001 - 12133901
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| |||| || |  || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12134001 aatgagttggatcgaaatgtgattcataatagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgttgt 12133902  T
Q  378 t 378  Q
    |    
T  12133901 t 12133901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Original strand, 38980 - 39055
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38980 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgagtccactaagtgggataaggctcggttgttgttgttg 39055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25494210 - 25493972
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggt-aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   |||| |||||| |||| || ||||  || || |||  ||||||||||||||||| ||    
T  25494210 gagatggggatgttgcgttggatgtgtggtgaatattagatgggataagattagaaatggcaacattgtagggatagttggggtagcacctatagtataa 25494111  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    |  || || ||||||| | |||| |||||||| |||||| |||||| ||  |||||| || | |||| | |||| |||||||| ||||| |||||  |||    
T  25494110 atatt-gtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagattctatagtaaaacgagtagatcaaatagaggatagtcatatta 25494012  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 255  Q
     |||||||| | |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25494011 caagaggtacaagaagacctagaagaactataagagaaac 25493972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Original strand, 2079317 - 2079434
Alignment:
Q  71 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 170  Q
    |||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| | ||||    
T  2079317 aatgacaatattagagagggagt-tgggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaagatttgtag 2079415  T
Q  171 atgctgtggtaagaagagt 189  Q
    ||  ||| ||||| |||||    
T  2079416 attatgtagtaaggagagt 2079434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 33998366 - 33998288
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt 93  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  33998366 cagagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagagagagt 33998288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6293660 - 6293390
Alignment:
Q  103 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 202  Q
    |||||||||| ||||  |||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||  |||| |||||  |||| ||| ||    
T  6293660 acctatagtacaaaatatggtggaaactaggttcaggtggtttgggcatgtagagagaacacctgtagattatgtaataaggagagtaaatcagatgaag 6293561  T
Q  203 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 302  Q
    || |||||| | |       |||||||||| |||| |||||||  | |||||| ||||| ||  || ||||  | |||||||| |||  |||| |||| |    
T  6293560 gatagtcaaatcac------tagaggaagatctagaaaaactaaaatagaaactattaggaaatatctagatattaatgagttagatagaaatatggtat 6293467  T
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| || ||||||  | |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6293466 atgatagagcattatggcaacgtttggtcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgcggttgttg 6293390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 374
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886383
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataaggcttagttgttgt 21886383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 379
Target Start/End: Original strand, 30642980 - 30643053
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30642980 atagaacattatggagtaatttgatctatgtagccgaccccacttagcgggttaaggcttggttgttgttgttg 30643053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Original strand, 33730194 - 33730247
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730194 atttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33730247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 158
Target Start/End: Original strand, 8364575 - 8364635
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8364575 gtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Original strand, 21089604 - 21089676
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21089604 tatgatagaacattatggcattgtttgatccatgtagctgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 21089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1008124 - 1008050
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1008124 tgatagaacattatggcgtaatttgatccaggtagca-accccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 1008050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 379
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568982
Alignment:
Q  280 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagcc-aacccacttaatgggatagagcttgtttgttgttgttg 9568982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18130885 - 18130814
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  18130885 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgt 18130814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33997703 - 33997545
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta-gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| |  | |||| | ||||||||||||  |||| ||||  ||||| ||||| ||    
T  33997703 agaggcagaggaagaccttggaaaactataagagaaactattaagaaaagcct-agagattaatgagttggatagaaatatggtacatgattgaacatta 33997605  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||||||||||||| |||   || | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33997604 tggcgtcatttgatctatgcgaccaaccacacttagtgggataatgcttgattgttgttg 33997545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6641764 - 6641628
Alignment:
Q  22 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 121  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||||| ||||   |||| |||| | |||||||  |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6641764 gaggatgttgcgttcgatgttttgtaagactagatgggataagattggaaatgacaatattagagatagagttggggtatcacctatagtagaaaagatg 6641665  T
Q  122 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    ||||||| ||| ||| | | |||||||||| ||||||    
T  6641664 gtagaaactagacttgggttgtttgggcatctagaga 6641628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Original strand, 32945455 - 32945531
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  32945455 tatgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacatcacttagttgaataaggcttggttgtcgttgtt 32945531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 33496106 - 33496194
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacc 105  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  33496106 gagatgatgatgttgcattggatgaatggtaagattaaataggataagattagaaatgacaccattacagagatagtaggggtagcacc 33496194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5129198 - 5129123
Alignment:
Q  16 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga 91  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  5129198 agagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagattcgatgtgatcggattagaaatgacaatattagagagaga 5129123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 369
Target Start/End: Original strand, 5983814 - 5983905
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| |  |||||||||  || |||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5983814 aatgaattggatcgaaatatggtttgcgatagaacatgatagcgtaatttgatccacgtagccgaccccactcagtgggataaggcttggtt 5983905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7337270 - 7337192
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt--agtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||||||||    
T  7337270 tatgatagaatattatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagagggggataaagcttggttgttgttgtt 7337192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23888549 - 23888478
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  23888549 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagcagaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgt 23888478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24698897 - 24698854
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24698897 agccgatcccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 24698854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 369
Target Start/End: Original strand, 32068635 - 32068694
Alignment:
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32068635 aacattatggcgtaatttgatacatgtagccgatcccacttagtgggataaagtttggtt 32068694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9109584 - 9109506
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  9109584 tatgatagaatactatgaagtagtttgatccatgtagccgaccccagttagtgagataatgcttagttgttgttgttgc 9109506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 29900275 - 29900329
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29900275 atttgatccatgtagccgacccctcttagtgggataaggattggttcttgttgtt 29900329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 586057 - 586134
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  586057 tatgatagaacattatgacgtcatttgattcatggagccgacctcacttaatgggataaaccttgattgttgttgttg 586134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1748084 - 1747944
Alignment:
Q  238 gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 337  Q
    |||||||||||||||||| | ||  ||  |||||||| | ||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  1748084 gaaaactattagagaaactactaagaaaaatttagagattaatgagttggatagaaatatagtatatgatagaacattacgacgtcgtttgatccatgta 1747985  T
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |  || || |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  1747984 gttga-cctacttggtgcgataagacttggttgctgttgttg 1747944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 2065116 - 2065018
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattag----agagagagtgtgggtagcacctatagt 111  Q
    |||||||||||| | |  |||||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2065116 gagatgaggatgctaccctggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacaccattagaaaaagagagagtgggggaagcacctatagt 2065018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 376
Target Start/End: Original strand, 5053750 - 5053807
Alignment:
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5053750 gcgtcgtttgatcaatgtagccgaccccatttagtaggataaggcttggttgttgttg 5053807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Original strand, 5095816 - 5095913
Alignment:
Q  38 atgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 135  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5095816 atgagtggtaagactggaagggataggattaggaatgactacattagagggagtgttgggatatcacctatagtagaatagatggtagaaaataggct 5095913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12134263 - 12134115
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||  |||    |||| ||||| |||||||  |||||||||||| |   ||||  ||||||||||||    
T  12134263 cagagatgagaatgttgtgttggatgtgtggcaagacaagatgatatagaattagaaatgacaatattagagagagaattgaggtacgacctatagtaga 12134164  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    |||| |||| |||||||||||||   ||||| |||| ||||||| ||||    
T  12134163 aaagatggtggaaaataggcttacggggtttcggcacgtagagaaaaga 12134115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21870363 - 21870299
Alignment:
Q  87 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 151  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  21870363 agagagttggggtagcacctgtagtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcat 21870299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 367
Target Start/End: Original strand, 10453272 - 10453335
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |   |||| |||||||||||||||    
T  10453272 tgatagaacactatggcgtcttttgattcatgtagccgaccatgcttactgggataaggcttgg 10453335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 378
Target Start/End: Original strand, 29931068 - 29931119
Alignment:
Q  327 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29931068 tgatccatgtagccgaccccgcttagtaggataaggcttggttcttgttgtt 29931119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 357
Target Start/End: Original strand, 32080676 - 32080731
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 357  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32080676 tatgatataacattatggcgtaatttgatacatgtagtcgatcccacttagtggga 32080731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 369
Target Start/End: Original strand, 32097944 - 32098011
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  32097944 tatgatataacattatggcgtaaattgatacatgtagccgattccacttagtgggataaagtttggtt 32098011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43326 - 43049
Alignment:
Q  103 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 202  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |  |||||  ||| |  |||||||| |||||  || ||    
T  43326 acctataatagaaaaaatggtggaaactaggcttaggtggtctggccatgtagagagaagatttatagattttgtagcgagaagagtagatcaggtg-ag 43228  T
Q  203 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 301  Q
    || |||||  |    ||||| || ||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||  || ||| |||||   ||||||||||||| |||| | ||     
T  43227 gatagtcagatctctagaggcagcggaagacctagaacaacttttaagagaaactattaataaagatctagagagtaatgagttggatcaaaatatagtt 43128  T
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||||||  | ||||| || |||| ||||||||| ||   | |||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  43127 tatgatagagtattatggtgtaattttatccatgtatccagcctcacttagtgggataagacttggtttttattgttgc 43049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 338
Target Start/End: Original strand, 1911577 - 1911623
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1911577 aaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 1911623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6692749 - 6692696
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6692749 atttgattcatgtagtcgaccccacttggtgggaaaaggcttggttgttgttgt 6692696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21870118 - 21870069
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21870118 tttgatccatgcagccgacctcacttagtgggataaggtttggttgttgt 21870069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 331 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29354782 - 29354741
Alignment:
Q  331 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29354782 ccatgtagcctatctcacttagtgggataaggcttggttgtt 29354741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 361
Target Start/End: Original strand, 33084138 - 33084195
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 361  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  33084138 tgatagaatactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataag 33084195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 2689578 - 2689642
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccat 81  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  |||||| || | | |||||||||||||||||||||||    
T  2689578 gagatgaggatgttgtgatggatgagcagtaagactaaataggataggattaggaatgacaccat 2689642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3127310 - 3127274
Alignment:
Q  343 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3127310 tcccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgttg 3127274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 7150669 - 7150526
Alignment:
Q  26 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 125  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||    |||||| | |||||  || ||||  |||| |    
T  7150669 atgttgctttggatgtgtggtaagactagacgagataggatttggaacgaaaacattagagagagt---tgggtaactcctatcataaaaaatatggtgg 7150573  T
Q  126 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 172  Q
    ||| | || |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  7150572 aaactcggattaggtggtttgggcatggggagagaagacttgtagat 7150526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 351
Target Start/End: Original strand, 413280 - 413339
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 351  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  413280 aaatatggtatatgatagaagattatagtgtcatttgatcaatgtagccgatcccactta 413339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 2307854 - 2307909
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  2307854 atttgatcaatatagccgatcccacttaatggaataagactttgttgttgttgttg 2307909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4878330 - 4878295
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4878330 cccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgttg 4878295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7150362 - 7150311
Alignment:
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7150362 ttgatccatgtagccgagcctatgtagtgggattaggcttggttgttgttgt 7150311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7513075 - 7513008
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 359  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  7513075 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtagttgaccccacttagtgggata 7513008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31832139 - 31831857
Alignment:
Q  97 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 196  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |  | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||    | ||||  | | | ||| ||||| |||||     
T  31832139 ggtagcacctatagtaaaatagatggtgggtattaggcttaagtggtttggacatgtagagagaaggtccggagattatatagcaagtagagtagatcag 31832040  T
Q  197 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 296  Q
    |||||||| |||||  | |  |||  ||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | | |||||||||||||||      
T  31832039 atggaggatagtcagatcatcagaaatagaggaaagcctagaaaaactatcagagaaactattaagaaagatctagagattactgagttggatccaaaca 31831940  T
Q  297 tgg-tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||| | |||||||||||| | | | |  ||||||| |||| || ||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  31831939 tggttttatgatagaacattgtaggggaatttgattcatgcagtcgaccctacttagtgagataagg-ttggttgtttttgttg 31831857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 451989 - 451947
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  451989 agccgaccccacttggtgggataaggcttggttgttgtcgttg 451947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 372
Target Start/End: Original strand, 2079488 - 2079558
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||||||||    
T  2079488 tatgatagagcattatagcgtaatttaatccatgtagccgactcgacttagtggggtaaggtttggttgtt 2079558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14389272 - 14389202
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 336  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  14389272 gatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Original strand, 21531802 - 21531836
Alignment:
Q  345 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21531802 ccacttagtgggataaggcttggttgttattgttg 21531836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27840090 - 27840048
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27840090 agccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgttg 27840048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31434475 - 31434441
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31434475 cccacttagtgggataagtcttggttgttgttgtt 31434441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 246
Target Start/End: Original strand, 3963889 - 3963950
Alignment:
Q  185 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 246  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3963889 agagtggatcagaaggaggggagtcaaatcaccagaggtagaggaagacctagaaaaactat 3963950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 6293731 - 6293690
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagac 56  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  6293731 cagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaaaattagac 6293690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 288
Target Start/End: Original strand, 38900 - 38956
Alignment:
Q  232 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 288  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  38900 acctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttgga 38956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 655493 - 655397
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||| ||||| | |||| |||| ||||| |||||| | ||| |  |||||||||||||||  || | ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  655493 aatgaattggaccgaaatatggtttatgacagaacattgtggtgcaatttgatccatgtaggtgacctcacttagtgggataaagtttggttgttgt 655397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 373
Target Start/End: Original strand, 4240386 - 4240433
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4240386 tttgatccatgtagc-gatcttacttagtgggataaggcttggatgttg 4240433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8021321 - 8021265
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 361  Q
    ||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8021321 gatagcacattatgacgtaatttcatccatgtagtcgatcctacttagtgggataag 8021265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9749497 - 9749353
Alignment:
Q  104 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 203  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||| | || |||| |||||| || ||||||||||||| |  ||||||  | | ||||||||||| |||||||  ||||    
T  9749497 cctatcgtagaaaagaaggtggaaacttggtttaggtggtttagggatgtagagagaagtcatgtagattttatagtaagaagagtagatcaaacagagg 9749398  T
Q  204 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 248  Q
      |||||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  9749397 gtagtcaaatcattagaggcagaggaagatctagaaaaactatta 9749353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10422736 - 10422704
Alignment:
Q  347 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10422736 acttagtgggataagacttggttgttgttgttg 10422704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 318 - 378
Target Start/End: Original strand, 30537218 - 30537278
Alignment:
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  30537218 ggcgtaatttgatccatgcagccgacgccaattagttgggcaaggcttggttgttgttgtt 30537278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30856810 - 30856726
Alignment:
Q  295 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||   ||||||| ||| |||| || |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  30856810 tttggtttatgatagaaaattatggcaaaatttgatgcatttagcagaccccactaagtgggataaggcttgaatgttgtggttg 30856726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 178)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 379
Target Start/End: Original strand, 4496308 - 4496668
Alignment:
Q  21 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacat--gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4496308 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 4496407  T
Q  119 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496408 ctggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 4496507  T
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496508 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 4496607  T
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496608 gcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 4496668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12492749 - 12492382
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcaccta---tagt 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||    
T  12492749 cagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctactatagt 12492650  T
Q  112 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12492649 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaa 12492550  T
Q  212 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492549 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 12492450  T
Q  312 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492449 cactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12492382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 378
Target Start/End: Original strand, 24178430 - 24178793
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24178430 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 24178529  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24178530 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 24178629  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24178630 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacac 24178729  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  24178730 tatggcatcatttgatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgtt 24178793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1287951 - 1287578
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----------tgtgggtagcac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          || |||||||||    
T  1287951 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagagagagagagagagtgggggtagcac 1287852  T
Q  105 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1287851 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagga 1287752  T
Q  205 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1287751 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 1287652  T
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1287651 gatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgatgtt 1287578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28977219 - 28976857
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  28977219 cagagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtaga 28977122  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28977121 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagtt 28977022  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28977021 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 28976922  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28976921 tatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28976857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2075836 - 2075475
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  2075836 cagagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagtaga 2075737  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2075736 aaagttggtagacaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 2075637  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattag-aaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2075636 aaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaata 2075537  T
Q  314 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2075536 ctatggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 10639217 - 10639586
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatag---- 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||        
T  10639217 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacctatagacta 10639316  T
Q  111 ---tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagag 207  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||      
T  10639317 tagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggaggag-- 10639414  T
Q  208 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10639415 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 10639514  T
Q  308 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10639515 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgttg 10639586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 1275185 - 1275548
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1275185 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtg-gggtagcacctatagtaga 1275283  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1275284 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 1275383  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  1275384 aacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaacat 1275483  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1275484 tatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgttgttgttg 1275548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 60 - 370
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685242
Alignment:
Q  60 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 38685031  T
Q  160 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 259  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38685032 aagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 38685131  T
Q  260 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38685132 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 38685231  T
Q  360 aggcttggttg 370  Q
    |||||||||||    
T  38685232 aggcttggttg 38685242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Original strand, 3301766 - 3302126
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3301766 gagatggggatgttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagcccctatagtagaaa 3301865  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  3301866 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaa 3301965  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  3301966 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 3302065  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3302066 cggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3302126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16347738 - 16347380
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16347738 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcgggggtagcacctatagtagaaa 16347639  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16347638 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 16347539  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||      
T  16347538 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacac-- 16347441  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16347440 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgt 16347380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 98 - 376
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457054
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  198 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  298 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 43 - 379
Target Start/End: Original strand, 14665658 - 14665996
Alignment:
Q  43 tggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 138  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14665658 tggtaagcctagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttag 14665757  T
Q  139 atggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagg 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14665758 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctagg 14665857  T
Q  239 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  14665858 aaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgataga--actctggcgtaatttgatctatgtag 14665955  T
Q  339 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665956 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14665996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 34272942 - 34273297
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----------tgtgggtagcac 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||          || |||||||||    
T  34272942 cagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagaca-----ggattaggaatgacaccattagagagagagagagagagagtgggggtagcac 34273036  T
Q  105 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||              ||    
T  34273037 ctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaagaagag--------------ga 34273122  T
Q  205 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34273123 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 34273222  T
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34273223 gatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgttg 34273297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 153 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915494
Alignment:
Q  153 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 252  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  253 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttag 352  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt-tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  353 tgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2915520 tgggataaggcttggttattgttgttg 2915494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26885040 - 26884687
Alignment:
Q  26 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag-aaaagttggta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26885040 atgttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 26884941  T
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 224  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  26884940 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 26884841  T
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 323  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| || |||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||      
T  26884840 gaggatgagctaggaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgca 26884743  T
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26884742 atttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgttgttg 26884687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 226 - 379
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816666
Alignment:
Q  226 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29816666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561383
Alignment:
Q  184 aagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgag 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  284 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttgc 13561383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38501668 - 38501422
Alignment:
Q  127 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 226  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||   | ||||||| | ||    
T  38501668 aaataggtttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatgga 38501569  T
Q  227 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 326  Q
     |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||| | || ||     
T  38501568 tgaagacctaggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaata 38501469  T
Q  327 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38501468 tgatcgatgtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 375
Target Start/End: Original strand, 14911268 - 14911452
Alignment:
Q  191 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 290  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14911268 gatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggatc 14911367  T
Q  291 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  14911368 caaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgtt 14911452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Original strand, 14749271 - 14749542
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14749271 gataggattagaaatgaaaacattagagagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagaga 14749370  T
Q  159 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 258  Q
    ||||||  || ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14749371 gaagacctgtggattctgttgtaaggagagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 14749470  T
Q  259 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 330  Q
     |  |||||| ||||| | || |||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14749471 caagaaggatctagagattaacgagttggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 239 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913882
Alignment:
Q  239 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtag 16913922  T
Q  339 ccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16913921 ccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16913882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 27816 - 28165
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||| |||| ||||| ||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||    
T  27816 gagatgaggatgttgcattagatgagtggtaaaacta-acaagatatgattatgaatgacaccatttgaaaaagagttagggtagcacctatagtagaaa 27914  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    || || | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||  || ||| | ||||         || ||||||| ||||| |||   ||||||||  | ||    
T  27915 agatgatggaaaataggcttaggtggtttgagc--gtaggtaggagatttgtag---------tacgaagagtagatcagatgcgtgagagtcagatcaa 28003  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  28004 aagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacacta 28103  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| | ||||||| |||||||| || |||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  28104 tggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgtt 28165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 379
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213859
Alignment:
Q  275 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttt 30213854  T
Q  375 tgttg 379  Q
    |||||    
T  30213855 tgttg 30213859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 379
Target Start/End: Original strand, 79501 - 79797
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |   |||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| ||||    
T  79501 agagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaa 79600  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||   | | ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||    
T  79601 ggagagtcgatcaaatggaggatggtcggatcacaagaggctgaggaagacctagaaaaactatcagataaactattaggaatgatttggaaattaatga 79700  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | |||| | |||| ||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  79701 gctggaccgaaatatggtgcatgatagaccattatggcgtgatttcatccatgtagctggccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgttg 79797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 36215420 - 36215730
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||  |||| | |||| |||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  36215420 cagagatgagtatgttgcgctagatgagcagtaaaactagatatgatatgattatgaatgac--cattagggagagagtggaggtagcatctatagtaga 36215517  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| |||  || | ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||     
T  36215518 aaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcaggtc 36215617  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||||||          ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||  ||   |||||||||||||    
T  36215618 aaaagaggtag----------aggaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaattgaatccaaacatgacttatgatagaacac 36215707  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgta 337  Q
    ||||  || ||||||| ||||||    
T  36215708 tatgatgtgatttgattcatgta 36215730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7359577 - 7359258
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    ||||| ||||| |||||||   |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  7359577 gatagaattagaaatgacaatgttagagagagagttcaggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagaga 7359479  T
Q  159 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 258  Q
    |||||   |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |  ||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  7359478 gaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactat 7359379  T
Q  259 t-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 357  Q
    | |||||  || ||||| | ||| ||||||||| |||| |||| || |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7359378 ttagaaaa-atctagagattaataagttggatcgaaatatggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtggga 7359281  T
Q  358 taaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  7359280 caagacttggttgttgttgttgc 7359258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 379
Target Start/End: Original strand, 6859345 - 6859665
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||    
T  6859345 gatatgattagaaatgacaatattagacagagagttggggtagcacctatagtgaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtagaga 6859444  T
Q  159 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 258  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||  || |  || | |||||||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  6859445 gaagacttgtggattctgtagtaaggggaataaattagatggaggatagtcaaaccactagaggaagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 6859544  T
Q  259 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 358  Q
    ||| || |||||| || | | | | ||||  | |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  6859545 taggaaagatttacagattagttacttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagtgggat 6859644  T
Q  359 aaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  6859645 aaggcttggtagttgttgttg 6859665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 372
Target Start/End: Original strand, 2712936 - 2713213
Alignment:
Q  87 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 186  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||   ||| ||    
T  2712936 agagagttggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtggattctgtatgaaggag 2713035  T
Q  187 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 286  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| | |  ||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||    
T  2713036 agtagatcagatggaggagagtcaaatcactagagtcaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagatgaatgagttg 2713135  T
Q  287 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    ||   |||      |   |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713136 ga--gaaa------gacagatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccacttagtgggataaggcttggttgtt 2713213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 268 - 378
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558424
Alignment:
Q  268 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 367  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  368 ttgttgttgtt 378  Q
    |||| ||||||    
T  5558414 ttgtcgttgtt 5558424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Original strand, 6888931 - 6889267
Alignment:
Q  33 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 132  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   |||| |||||| |||||||  |||| ||| |||||  ||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  6888931 gttggatgtgtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaatattacagaaagagttggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaatag 6889030  T
Q  133 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 232  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||| | | |  || | |||||||| ||||||   |   |||| ||||||||     
T  6889031 gcttaagtggtttggacatgtagagagaagacttgtggattatgtggtaaggacaataaattagatggaggatagtcaaaccacttgaggaagaggaagg 6889130  T
Q  233 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 332  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||  | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  6889131 cctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcc 6889230  T
Q  333 atgtagccgatcccactt-agtgggataaggcttggt 368  Q
    ||||||| || | || || |||||||||| |||||||    
T  6889231 atgtagctgaactcatttaagtgggataaagcttggt 6889267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 379
Target Start/End: Original strand, 14667751 - 14668055
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg--------catgtagagagaagactagtagatgc 174  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||        ||||||||||||||||  ||| ||      
T  14667751 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggggctttgggcatgtagagagaagacatgtacatta 14667850  T
Q  175 tgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagag 274  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||| |  | |  ||||| || ||||  ||||| |||||||| |||||| | | ||  || ||| |||||    
T  14667851 tgtagtaaggagagtagatcagatggattatagttatatcactagaggcagcggaaatcctagaaaaactataagagaagctactaagaaagatctagag 14667950  T
Q  275 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
     | |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14667951 attaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgtagt 14668050  T
Q  375 tgttg 379  Q
    |||||    
T  14668051 tgttg 14668055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31636253 - 31636009
Alignment:
Q  42 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 141  Q
    ||||||||| |||||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||    
T  31636253 gtggtaagactagactggatagaattataaatgacagcattagagaaag--ttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtg 31636156  T
Q  142 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| ||||| ||| | |||| || ||||||| | |  |||| ||| |||||| |||| |||    
T  31636155 gtttgggcatgtagagagaagacccgtggatgttgtagtaaggagagtagattagatggtggggagtcaaatcactagagataggggaagatctagaaaa 31636056  T
Q  242 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 288  Q
    |||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  31636055 actattagagaaactatcaagaaggatatagagatcaatgagttgga 31636009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 345
Target Start/End: Original strand, 32516480 - 32516805
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||  |  | ||| ||| |||||||||||    
T  32516480 gagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattagagagag--ttggagtaacacttatagtagaaa 32516577  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||| | | |||| ||| || ||  |||||| |||| ||| | ||||| ||||  ||| |||| | |||  |||     
T  32516578 agatggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattac 32516677  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||   ||||||||| | ||  |||||||| ||||| |||| |||||||||| | ||    
T  32516678 aagaggtagaggaagaccta-aaaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatatta 32516776  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 345  Q
    || ||| |||||||| || || |||||||    
T  32516777 tgacgtaatttgatcgatataaccgatcc 32516805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 248 - 379
Target Start/End: Original strand, 28276391 - 28276522
Alignment:
Q  248 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 347  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |  |||    
T  28276391 agagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactcca 28276490  T
Q  348 cttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28276491 cttagcgggataaggcttggttgttgttgttg 28276522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17340798 - 17340500
Alignment:
Q  16 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacct-atagtaga 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   | || ||| | ||||||||    
T  17340798 agagataaggatgttgcgttggatgagtggtaaaactagaagaaatgtgattaggaatgacaccattagagagagggttgagataacactttatagtaga 17340699  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||  ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  17340698 aacattattagaaaataggcttaggtggttttgacatgttaagagaaaactcgcagatgatgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtc 17340599  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    ||||  |||||| |||||| ||| |||| ||| |  | ||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  17340598 aaaaagggtagatgaagacttagaaaaattataattgtaactattaagaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43558133 - 43557833
Alignment:
Q  73 tgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 170  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43558133 tgacaacattagagagagagagttagggtagcatctataatagaaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtag 43558034  T
Q  171 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattt 270  Q
    ||||||  ||||||||||| ||| | ||  | ||  ||||  | |  |||  | || || ||||||| |||||||| ||||||||     | || |||||    
T  43558033 atgctgcagtaagaagagtagattagataaatgatggtcatatcactaga--tggatgatgacctagaaaaactataagagaaac----cgtaaagattt 43557940  T
Q  271 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
     ||| | | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| | | | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43557939 ggagattattgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcctggttg 43557840  T
Q  371 ttgttgt 377  Q
    |||||||    
T  43557839 ttgttgt 43557833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 418145 - 418032
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  418145 gatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtgggatatggctt 418046  T
Q  366 ggttgttgttgttg 379  Q
    |  |||||||||||    
T  418045 gaatgttgttgttg 418032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 7678402 - 7678760
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagca-cctatag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||     |||||||  || ||||| |||||||    
T  7678402 gagatgaggatgttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagaggggagagagagttgggatagcaacctatag 7678501  T
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    ||||||| | ||| ||||   ||||||| | |||||||| |||||||| |||||  |||||| |||| ||||| ||||| |||     |||||| |||||    
T  7678502 tagaaaaat-ggtggaaac--ggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagat-----ggaggatagtca 7678593  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 309  Q
      | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||| ||| |||     
T  7678594 gatcactagaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaag-atctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata- 7678691  T
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| ||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7678692 aacattatgaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 7678760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 379
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475523
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  198 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 297  Q
    ||||||| |||||  | |  | ||| | | | | || ||| |||||| | |||||||| ||||  || |||  |||| | ||||||||||||| |||| |    
T  43475343 tggaggatagtcagatcactataggaaaaagtaaacatagaaaaact-taagagaaactattaagaaagatccagagattaatgagttggatcgaaatat 43475441  T
Q  298 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | | |||| ||||||  ||||| || |||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43475442 gatttatggtagaacgttatggtgtaatttgatccacgtagccaactccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 43475523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 377
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525923
Alignment:
Q  102 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 201  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||  || |||  || || ||||| ||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  202 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 301  Q
    |||||||||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||  |||| | |||||||||||   | |  ||||     
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtt 1525850  T
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    | ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1525851 tttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga--cca-ttagtgagataaggcttggttgttgttgt 1525923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 224 - 379
Target Start/End: Original strand, 11675658 - 11675814
Alignment:
Q  224 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 322  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11675658 agaggaagacctgtaaaaactataagagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgt 11675757  T
Q  323 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11675758 agtttaatccatgtagccgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgttg 11675814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 306 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408490
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 381  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 408490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11002783 - 11002424
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||   ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||    
T  11002783 cagagatgaggatgttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttcgggtagcacctacagtaga 11002686  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg--taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 212  Q
    |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||   || ||  |||| |  | ||  |||| ||||| ||| ||| ||||||      
T  11002685 aaacatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtaggtagaagatctgtggactctgtagttttaggggagtagatcagatgtaggggagtcaga 11002586  T
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    | |  |||||| | || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||| ||||| | |||||||||||   |    | || | |||||||||    
T  11002585 tcactagaggttggggtagacctagaaaaactataagacaaactattagtaacgatctagagataaatgagttggagaaaggcatagtttttgatagaac 11002486  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||| |  |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11002485 actatggcattgtttgattcatgtagtcgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgt 11002424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 360
Target Start/End: Original strand, 30588460 - 30588712
Alignment:
Q  106 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 205  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||| |   ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||  |||||||||     
T  30588460 tataatagaaaagatggtggaaaataggtttaagtggtttgggcatattcggagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagat--aatggaggat 30588557  T
Q  206 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 305  Q
    ||||| || |  ||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||   |||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||     
T  30588558 agtcaggtcacgagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaattgttaagaaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttata 30588657  T
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 360  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30588658 atagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 365
Target Start/End: Original strand, 9235172 - 9235316
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  9235172 agaggcagaggaagacctagaaaaacta--agagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 9235269  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9235270 ggcataatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt 9235316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Original strand, 15168721 - 15168855
Alignment:
Q  26 atgttgcgttggatgagtggta--agattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 123  Q
    |||||||||| ||||||||| |  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15168721 atgttgcgttagatgagtggcacaagattagacgagataggattaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggt 15168820  T
Q  124 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  15168821 agaaaataggctaaggtggtttggacatgttgaga 15168855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 246
Target Start/End: Original strand, 21952274 - 21952508
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcac----ctatagt 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| |||    |||||||    
T  21952274 agatgaggatgttgcgttgcatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacagcattaaagagagagggttggggtaacacacacctatagt 21952373  T
Q  112 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 211  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||| |  || ||| || | ||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||    
T  21952374 agaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaagtcctgtggattctatagtaaggagaatagatcagatggaggggagtcaa 21952473  T
Q  212 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 246  Q
     | |  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21952474 atcactagaggtaggggaagacctagaaaaactat 21952508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10083096 - 10082747
Alignment:
Q  19 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 118  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||  |  ||||| |||||||||||||||||    
T  10083096 gatgaggatgttgctttg-atgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgagaacattagggagagcattggggtatcacctatagtagaaaag 10082998  T
Q  119 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 218  Q
     ||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||| |||      |||| ||||||| | |  |    
T  10082997 atggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagtaaagagagtagat------gaggggagtcaaatcacca 10082904  T
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 318  Q
    ||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||| | ||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | || ||  ||||||||    
T  10082903 gagatagggtaagacctagaaaaactataagagaaactagtaacaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgttaacacactatg 10082804  T
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
     |||| | |||| |||||||| || ||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  10082803 acgtcgtctgattcatgtagctgaccctgcttattgtgataaggcttggttgttgtt 10082747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 289 - 378
Target Start/End: Original strand, 38132531 - 38132619
Alignment:
Q  289 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38132531 tccaaatgtggt-tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 38132619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 378
Target Start/End: Original strand, 2090556 - 2090696
Alignment:
Q  238 gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 337  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2090556 gaaaactataagagaaaatattaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgta 2090655  T
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
     |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2090656 cccgaccccattgagtgggataaggctttgttgttgttgtt 2090696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 378
Target Start/End: Original strand, 18855798 - 18855890
Alignment:
Q  286 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18855798 ggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 18855890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 299 - 379
Target Start/End: Original strand, 42576214 - 42576294
Alignment:
Q  299 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42576214 gtgtatgatagaacataatggcgtaatttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 42576294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411960
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28411960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 379
Target Start/End: Original strand, 29922409 - 29922568
Alignment:
Q  220 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 319  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| | ||  |||||||   |||  |||| || ||||||||| |||||    
T  29922409 aggtagaggaagatctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaacaagttggactgaaacctggtttacgatagaacattatgg 29922508  T
Q  320 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29922509 cgtaatttgatccatgtagccaacctcacttggtgggataagccttggttgttgttgttg 29922568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 379
Target Start/End: Original strand, 39040917 - 39041040
Alignment:
Q  256 aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgg 355  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  39040917 aattagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgg 39041016  T
Q  356 gataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||    
T  39041017 gataagacttgattgttgtagttg 39041040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 257 - 379
Target Start/End: Original strand, 2393039 - 2393160
Alignment:
Q  257 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| | || | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2393039 attagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 2393138  T
Q  357 ataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  2393139 ataaagctt-gttgttgttgttg 2393160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640510
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataaggctcggttgttgt 7640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12577019 - 12576861
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||| || |||    
T  12577019 agaggcagaggaagacctagaaaaactacaagataaactattaagaaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattat 12576920  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    || ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12576919 ggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaagcttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15588546 - 15588399
Alignment:
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 318  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||   ||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||| ||||    
T  15588546 gaggcagaggacgacctagaaaaactataagagaaactattataa--gatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatg 15588449  T
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 368  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15588448 gcgtcgtttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttggt 15588399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442124
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataa-gcttggttattgttgt 32442126  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  32442125 tg 32442124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 380
Target Start/End: Original strand, 9400708 - 9400796
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9400708 aaatttggtttatgatataatactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccatttagtgggattaggcttggttattgttgttgc 9400796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15489789 - 15489609
Alignment:
Q  80 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg 179  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||      
T  15489789 attagagagagagttggggtagtacctattgtagaaaagatggttgaaactcagcttagatggtttgggcatgtagagagaagatttgtagattttgtat 15489690  T
Q  180 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 260  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||| |||  | | |  ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  15489689 taaggagagtagattagatggaggatagttgaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaacaataagagaaactatta 15489609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 379
Target Start/End: Original strand, 20367061 - 20367177
Alignment:
Q  263 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 362  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||    
T  20367061 aaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccacttggtaggataagg 20367160  T
Q  363 cttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||    
T  20367161 cttggttgttgttgttg 20367177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 378
Target Start/End: Original strand, 38684471 - 38684763
Alignment:
Q  86 gagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaa 185  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||| |||||||  |||||||||||||||||  ||  || || | ||||| |    
T  38684471 gagagagtcagggtagcacctatagtataatagatggtggaaactaaacttaaatggtttcagcatgtagagagaagacctgtgtattctatagtaagga 38684570  T
Q  186 gagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 285  Q
    ||||  || | ||||||| || || | | |  ||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||  |||  || ||| ||||| | ||| ||||    
T  38684571 gagtatattagatggaggggattccaatcactagatgtaaaggaagacctagaaaaactacaagagaaacttttaagaaagatctagagattaattagtt 38684670  T
Q  286 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||  |||| ||||   |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38684671 ggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtagttgaccccacttagtggaataaagcttggttgttgttgtt 38684763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3442944 - 3442873
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3442944 tgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 3442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 315
Target Start/End: Original strand, 2552932 - 2553002
Alignment:
Q  245 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2552932 attagagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Original strand, 42199243 - 42199446
Alignment:
Q  50 attagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggc 149  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||  | ||| ||||||| |  ||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  42199243 attagacgggataggattagaaatgacgacgttacagagagaattggggtagcactta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggc 42199340  T
Q  150 atgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 249  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||   |||||| | |  || || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42199341 atgtagagagaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagatcacatggagagtagtcaaatcactagggggagagaaagacctagaaaaactattag 42199440  T
Q  250 agaaac 255  Q
    | ||||    
T  42199441 acaaac 42199446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 305 - 378
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272760
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctaagttgttgttgtt 42272760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 418318 - 418190
Alignment:
Q  44 ggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga--tg 141  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||    
T  418318 ggtaagacgagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttggggtagcacctatggtagaaaagatggcagaaatttggcttagacctg 418221  T
Q  142 gtttgggcatgtagagagaagactagtagat 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  418220 gtttgggcatgtagagagaatacttgtagat 418190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9917695 - 9917458
Alignment:
Q  132 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 231  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||||||||  || |||  ||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||| | | |||||  |||||| |    
T  9917695 ggcttagttggtttgtgcgtgtaaagagaagacatgttgattttgtagtaaagagagtcgatcagatggaggatagtcaaatcacaagagacagaggatg 9917596  T
Q  232 acctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | |       |||||||||||| |||  | || |||||     
T  9917595 acctagaaaaactattagagaaactatttagaaag-atatagagatcaatgagttggatagaga-------tatgatagaacagtataacatcgtttga- 9917505  T
Q  331 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
      |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9917504 --atgtagccgaccccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 9917458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 309 - 377
Target Start/End: Original strand, 27386554 - 27386622
Alignment:
Q  309 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27386554 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgt 27386622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Original strand, 33667217 - 33667285
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33667217 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 33667285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 102
Target Start/End: Original strand, 20318907 - 20318989
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20318907 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggta-----agactggataggattaggaatgacaccattagagaaagagtgggggtagc 20318989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Original strand, 5860036 - 5860118
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5860036 tggtttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 5860118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11069242 - 11069160
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11069242 tggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatatagctgaccccacatagtgggatatggcttggttgttgttgttg 11069160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 378
Target Start/End: Original strand, 5303582 - 5303730
Alignment:
Q  233 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt--ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga- 329  Q
    ||||| |||||| | |||||||| |||  ||| ||||||||| | ||||||||||||  |||| |  ||| |||||||||| | ||||||||  ||| |     
T  5303582 cctagaaaaactgtaagagaaactattgaaaaagatttagagtttaatgagttggatagaaatatatggtatatgatagaatattatggcgttgttttaa 5303681  T
Q  330 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5303682 tccatgtagccgatcccacttagtgggataagtcctggttgttgttgtt 5303730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18351189 - 18350900
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca-tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||   |||| ||||| ||||    
T  18351189 gggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagattatgcaataaggagagtagatc 18351090  T
Q  195 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaa------aggatttagaggtcaatgagttgg 287  Q
    ||| |||||  | |||| | |  ||||| ||||||| | ||| |||| |||| |||||||| ||| ||||      ||  | ||||| | ||||||||||    
T  18351089 aaaaggagggtaatcaaatcactagagg-agaggaacatcta-gaaagctataagagaaactattaagaaaaatctagactatagagattaatgagttgg 18350992  T
Q  288 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||  |||| |||| | || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  18350991 atagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccgacctcacatggtgggatgagacttggatgttgttgttg 18350900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676760
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||   || ||  ||| ||||| | | |  || |    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctttaaattatgtcgtaaggataatatatta 28676695  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 260  Q
     ||||||||  ||||  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  28676696 gatggaggattgtcagattacaagaggtagaagaagacctataaaaactataagagaaacaatta 28676760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 303 - 379
Target Start/End: Original strand, 32366186 - 32366262
Alignment:
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366186 atgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32366262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 379
Target Start/End: Original strand, 38830504 - 38830603
Alignment:
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38830504 atgagttggaccgaaatatgatgtatgatagaacattatagcgtaatt-gatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgtt 38830602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28186857 - 28186782
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28186857 tatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccgaccctactcaatgggataaggcttggttgttgttgt 28186782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 378
Target Start/End: Original strand, 2645175 - 2645273
Alignment:
Q  280 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||  |||| |||| | ||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645175 tgagttggatagaaatgtggtatttgataaaacattatagcatcgtttgatccatgtagccggccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 2645273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 28187030 - 28186956
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 89  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28187030 cagagatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgacaacattagagaga 28186956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 36551375 - 36551429
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36551375 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgtt 36551429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Original strand, 41894237 - 41894357
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga-------tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 358  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||       || |||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41894237 gatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgaattatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggat 41894336  T
Q  359 aaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  41894337 aagactttgttgttgttgttg 41894357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42504393 - 42504247
Alignment:
Q  231 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 330  Q
    ||||||| |||||||| ||||||   | || |||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  42504393 gacctagaaaaactataagagaagtcaataaaaaggatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42504294  T
Q  331 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    | | ||||  |||  ||| ||||||  || |||||||||||||||||    
T  42504293 caacgtagttgatttcacctagtggtctagggcttggttgttgttgt 42504247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9121147 - 9121078
Alignment:
Q  308 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9121147 agaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgtcgttgt 9121078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15986992 - 15986879
Alignment:
Q  122 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||   |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||  | | |||||    
T  15986992 gtagaaaataggtttaggtggtttgggcgtgtagagagaagatatgtagattctatagtaaggagagtggatcaaatggaggatagtcagatcacaagag 15986893  T
Q  222 gtagaggaagacct 235  Q
    ||| | ||||||||    
T  15986892 gtaaatgaagacct 15986879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 375
Target Start/End: Original strand, 33667562 - 33667715
Alignment:
Q  222 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 321  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||   ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |||||||||||| |||||    
T  33667562 gtaggggaagacctagaaaaactataagagaagttattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactttggcg 33667661  T
Q  322 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |  |||||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33667662 ttgtttgattcgtgtagccaaccccacttattgggataaggcttggttgttgtt 33667715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36123257 - 36123180
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36123257 tatgatagaacattatggtggcgtttgatccatgtaatcggtcccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 36123180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41200421 - 41200344
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  41200421 tatgatagaacgttatggcatcatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataaggccttgctgttgttgttg 41200344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 219812 - 219692
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||  |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  219812 agatgagaatgttgcgttggatgcgtgttaagacaagacgagataagattacgaatgacaacattggagagagagttggggtagcacctatcgttgaaaa 219713  T
Q  118 gttggtagaaaataggcttag 138  Q
    | |||| |||| | |||||||    
T  219712 ggtggtggaaacttggcttag 219692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 360
Target Start/End: Original strand, 23979976 - 23980209
Alignment:
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  |  |||||| || | ||||||||||| ||||| || ||  | |||||  ||| ||||||||    
T  23979976 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagagaaaccctgtagattctatagtaagaagagtagatcagataga--aaagtcatattacaagaggta 23980073  T
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 324  Q
     ||| |||||||| | ||| || |||||||| |||   || |||||| || | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| | |      
T  23980074 taggcagacctagaagaacaataagagaaactattgagaatgatttatagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgacatat 23980173  T
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 360  Q
    ||  |||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  23980174 ttcaatccatgtaatcaaccccacttagtgggataa 23980209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 377
Target Start/End: Original strand, 27998567 - 27998723
Alignment:
Q  221 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||  || ||| || || | |||||||| |||   ||  || | |||||||||| | |||| |    
T  27998567 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagttagataggaacatgatatatgatagaatattatgac 27998666  T
Q  321 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  27998667 gtcgtttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggatatggtttggttgatgttgt 27998723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 372
Target Start/End: Original strand, 28985292 - 28985360
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28985292 tgatagaacattatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 28985360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 359
Target Start/End: Original strand, 29938126 - 29938374
Alignment:
Q  106 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 205  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||  |||||| | |||||||| | ||| |||   ||| ||||     
T  29938126 tataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttaagcctatagagagaagacctgtagattcggtggtaaggacagtagattggatgaaggat 29938225  T
Q  206 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 305  Q
    |||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||||| || ||||||  | | ||||||||||||  |||| || | ||||    
T  29938226 agtcagatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaact----gagaaactattaggaatgatttaatgattaatgagttggattgaaatatgatttatg 29938321  T
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 359  Q
     ||||||| | ||| || | ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  29938322 -tagaacattttggtgtaagttggtccatgtagccgaccccactcagttggata 29938374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39322141 - 39322077
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  39322141 tatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagactggctagttgttgttg 39322077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 376
Target Start/End: Original strand, 25938091 - 25938250
Alignment:
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||| ||||| ||||||   |||||| |||||||| ||||||||   ||||||| ||| ||||||| || ||||| | || ||||| | |||||||    
T  25938091 aagaggtaaaggaatacctagactaactataagagaaactattagaaattttttagagatcactgagttgaattcaaatatagtttatgacataacacta 25938190  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
     |  || ||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25938191 cgttgtaatttgattcatgtagccgactccacatagtgagataagacttggttgttgttg 25938250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Original strand, 27800037 - 27800108
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27800037 tgatagaacattatggtataatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 27800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 218114 - 218052
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  218114 tatggcgtcattagatccatgtagccgaccccacctagtgggataagacttggttgttattgt 218052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 311
Target Start/End: Original strand, 15168873 - 15168987
Alignment:
Q  197 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 296  Q
    |||||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||     
T  15168873 atggaggagagtgagattagaagaggtagaggacaacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaaaatttagaggttaataagttggatccagata 15168972  T
Q  297 tggtgtatgatagaa 311  Q
    |||| ||||||||||    
T  15168973 tggtttatgatagaa 15168987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 248
Target Start/End: Original strand, 36200769 - 36200894
Alignment:
Q  122 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 221  Q
    |||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||  | ||||     
T  36200769 gtagaaaatatgattaggtggttttagcatgtagagagaaaaccagtaaatgatgtagtatgaagagtagatcagatagaggagagtaaag-aagaagat 36200867  T
Q  222 gtagaggaagacctaggaaaactatta 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36200868 gtagaggaagacctagaaaaactatta 36200894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Original strand, 3000968 - 3001021
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3000968 atttgatggatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3001021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Original strand, 9234115 - 9234168
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9234115 atttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9234168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 163
Target Start/End: Original strand, 31906592 - 31906729
Alignment:
Q  26 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 125  Q
    |||||||||| |||||  ||||| | |||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||  |||||| | ||||||||||||| |    
T  31906592 atgttgcgttcgatgaacggtaaaactagacggaataggattaggaatgacatcattagggagagagtgagagtgacacctacaatagaaaagttggtcg 31906691  T
Q  126 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
     |||||  ||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  31906692 gaaatattcttagatagtttagacatgtagatagaaga 31906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41108803 - 41108727
Alignment:
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta--gtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41108803 atgatagtacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgtgggataaggcttgattgttgttgt 41108727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 92
Target Start/End: Original strand, 5305545 - 5305613
Alignment:
Q  24 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 92  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  5305545 ggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaagatagaattagaaataacaacattagagagagag 5305613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 378
Target Start/End: Original strand, 6788190 - 6788349
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||| || || || ||  | |||||||||||   |||| || | |||||||||||| |||    
T  6788190 agaggcagaggaagacctagaaaaactatcaaaggaactattaggaaagacttggaaattaatgagttggactgaaatatgatttatgatagaacattat 6788289  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  6788290 agcgtaatttgattcatgtagccgacctcacttagtagga-aagacttggtggttgttgtt 6788349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 236
Target Start/End: Original strand, 11675547 - 11675651
Alignment:
Q  132 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 231  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||  | |||||| ||||||||||    
T  11675547 ggcttaggtggtttgggcatgttgagagaaggcctgtagattctgtagtaaggagagtagatcatagggaggatagtcagatcaaaagatgtagaggaag 11675646  T
Q  232 accta 236  Q
    |||||    
T  11675647 accta 11675651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 43423563 - 43423492
Alignment:
Q  309 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 381  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43423563 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccttttagtgggataaggctt-gttgttgttgttgca 43423492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 10668569 - 10668620
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10668569 atttgatcaatgtagccgaccccacttattgggataaggcttggttgttgtt 10668620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Original strand, 21093772 - 21093867
Alignment:
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21093772 aaagttggtggaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagggaagacttggagattttgtagtaaagagagtagatcagatggaggatagtca 21093867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32006232 - 32006161
Alignment:
Q  309 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt-agtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32006232 gaacattaaggcgtaatttgatccatgtagccaaacccagttcagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32006161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33158057 - 33157918
Alignment:
Q  151 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 250  Q
    ||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||| |||| |||    
T  33158057 tgtagagagaaaacatgtagattctgtagtaagaagagtagatcaaatataagatagtcatgttacaagaggtataagaagacctagaaaacctataaga 33157958  T
Q  251 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 290  Q
    ||||| | || |||  ||||| || | |||||||||||||    
T  33157957 gaaactactaaaaaatatttatagattaatgagttggatc 33157918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 117
Target Start/End: Original strand, 34039960 - 34040059
Alignment:
Q  18 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||   ||||||  ||||||||||||    
T  34039960 agatgaggatgtcgcgttggatgaatgataaaactagatatgataggattaaaaattacaccattagagagagaatgaatgtagcatgtatagtagaaaa 34040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 336
Target Start/End: Original strand, 43035039 - 43035222
Alignment:
Q  153 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 252  Q
    ||||||||||||   ||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  43035039 tagagagaagacgtctagattctgtagtagggagagtagatcaaatcgaggatagtcaactcactagaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgaga 43035138  T
Q  253 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 336  Q
    ||| ||||| ||  |||| ||  |  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  43035139 aactattaggaaaaatttggaaatttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgttttttaatccatgt 43035222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8082017 - 8081967
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatccc-acttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8082017 atttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttg 8081967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21193748 - 21193650
Alignment:
Q  281 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||| | | ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21193748 gagttggatagaaatatggtttatgatagatcattatgacataatttgattcatgtatccgaccccacgtagtggaataaggcttggttattgttgttg 21193650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30639787 - 30639717
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30639787 atagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggattggtagttgttg 30639717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 36200702 - 36200764
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgaca 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | | |||| ||||||||||||||    
T  36200702 cagagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagactaaataggataagattaggaatgaca 36200764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 683796 - 683699
Alignment:
Q  282 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  683796 agttgtatcaaaatatggtttatgatagaacattatgttgtagtttgatccatgtagccaaccccacttagcgggataagactttgtttttgttgttg 683699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4026395 - 4026326
Alignment:
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4026395 aacattatgacgtcgtttgatccatgtagccgagttcactttgtgggatcaggcttggttgttgttgttg 4026326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10989126 - 10989085
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989126 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10989085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13607036 - 13606995
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13607036 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 13606995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15252840 - 15252755
Alignment:
Q  281 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||  ||  ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15252840 gagttggatcgaaatagggtttatgatagaacattatgatgtagtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 15252755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7367220 - 7367172
Alignment:
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7367220 atccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttattgt 7367172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 313
Target Start/End: Original strand, 14725640 - 14725736
Alignment:
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 313  Q
    |||||||||||||| | |||| |||| ||| ||| |||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  14725640 aagaggtagaggaaaagctagaaaaattataagataaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatcgaaca 14725736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 163
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  99 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808197
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| | ||||||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatctgacttagtaggataggacttggttg 41808197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 4653481 - 4653536
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4653481 atttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgttg 4653536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10124427 - 10124388
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10124427 gccgaacccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10124388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16014532 - 16014485
Alignment:
Q  329 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16014532 atccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagggttggttgttgttg 16014485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Original strand, 29929303 - 29929338
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29929303 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29929338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 377
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220664
Alignment:
Q  258 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 357  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | | |||||||  | ||||  |||||||||||||| ||| |||||| | ||| || ||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgatagat-attatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  358 taaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  31220645 taaggtttggttgttgttgt 31220664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35118380 - 35118321
Alignment:
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35118380 gcgtaatttgatccatgtacccgacctcatttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 35118321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 42504501 - 42504446
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42504501 gatatgattaggaatgacatcatcagagagagagtgggggtagcacttatagtaga 42504446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 366
Target Start/End: Original strand, 1935402 - 1935464
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1935402 tgatagaacactctggcgttgtttgattcatatagccgaccccacttagtggaataaggcttg 1935464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24391080 - 24391022
Alignment:
Q  321 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24391080 gtcatttaatccaagtagcagaccccacttagtgggataaggcttgcttgctgttgttg 24391022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 57
Target Start/End: Original strand, 27998343 - 27998385
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagaca 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27998343 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaca 27998385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 374
Target Start/End: Original strand, 2049271 - 2049339
Alignment:
Q  305 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||| || |||||| | |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2049271 gatagaccattatggcatgatttgatccatgtagccgactgcactta-tgggataaggcttggttgttgt 2049339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19137960 - 19137907
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19137960 atttgatccatgcagccaaccccacttagtgggataagggttggttgtcgttgt 19137907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 32489295 - 32489328
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32489295 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 32489328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 379
Target Start/End: Original strand, 34119859 - 34119904
Alignment:
Q  334 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34119859 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgatttttgttgttg 34119904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 379
Target Start/End: Original strand, 37065632 - 37065761
Alignment:
Q  251 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca-ct 349  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  37065632 gaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatagagcactatgaagtcgtttgattcatgtagccgaccccagct 37065731  T
Q  350 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  37065732 tagtgggataagactaggtcgttgttgttg 37065761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38578802 - 38578625
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  38578802 gggtagcacctctattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtaaagagaagacatgtagattatatagttagcagattagatca 38578703  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga 273  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||| || |||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||| ||||    
T  38578702 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattatgaaggatctaga 38578625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42408739 - 42408698
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42408739 gccgatcctacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 42408698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 369
Target Start/End: Original strand, 12534414 - 12534486
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  12534414 tggtttataatagaacattatggcgtaatttgatccatttagttgaccccagttagtgggatacggcttggtt 12534486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 377
Target Start/End: Original strand, 21952600 - 21952644
Alignment:
Q  333 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21952600 atgtagccgaccccacttagtgggaaaaggctcggttgttgttgt 21952644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 248
Target Start/End: Original strand, 27799892 - 27799996
Alignment:
Q  144 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 243  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||   | |  ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27799892 ttgggcatgtagagagaagagatgtagatgttgtagtaagaagattagatcatatggaggatagtcggatcactagaggcagagtaagacctagaaaaac 27799991  T
Q  244 tatta 248  Q
    |||||    
T  27799992 tatta 27799996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 377
Target Start/End: Original strand, 39012776 - 39012860
Alignment:
Q  293 aatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |  ||||||| ||| | ||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  39012776 aatttagtttatgatagaacactatggtgcaatttgattcatattgccgacctcacttagtgaaataagggttggttgttgttgt 39012860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 41833874 - 41833795
Alignment:
Q  87 agagagtgtgggtagcacctatagta--gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||  |||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41833874 agagagttggggtagcacctatggtatagaaaagatggtggaacatatgcttaggtggtttgggcatgtagagacaagac 41833795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3563448 - 3563413
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3563448 cccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 3563413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3775119 - 3775072
Alignment:
Q  332 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  3775119 catgtagccgaccccacttagtgggataaagcctgattgttgttgttg 3775072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 34194850 - 34194783
Alignment:
Q  23 aggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 90  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  34194850 aggatgttgtgttggatgtgtggtaaaactagacaggataggattagaaatgtaaacattagagagag 34194783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1104787 - 1104706
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| || ||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  1104787 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcaatg-agtcgaccccacttagtggattaaggctagattgttgttgttg 1104706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4026627 - 4026529
Alignment:
Q  85 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 183  Q
    |||||||||  ||||| ||| || |||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||    
T  4026627 agagagagttggggtaacacgtaaagtaaaaaagatggtggaaactagtcttaggtggtttggacatgtagagaggagacctgtagattctgtagtaag 4026529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 6368282 - 6368220
Alignment:
Q  20 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt 82  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  6368282 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagaatagacgagatagaattagaaatgacaacatt 6368220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15584290 - 15584252
Alignment:
Q  339 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15584290 ccgatcccacttggtggtataaggcttggttgttgttgt 15584252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30639351 - 30639301
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||||||||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30639351 tttgatccatgtagtcaaccctacttagtgggataagacttggttgttgtt 30639301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 379
Target Start/End: Original strand, 32925105 - 32925147
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32925105 agccgaccccgcttagtgggacaaggcttggttgttgttgttg 32925147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34191001 - 34190971
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34191001 cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 34190971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 379
Target Start/End: Original strand, 39668904 - 39668991
Alignment:
Q  296 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc----atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    |||||| | | ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39668904 ttggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtatgtagactaccccgcatagtgggataatgcttggttgtttttgttg 39668991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41833742 - 41833656
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| |||| |||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  41833742 aaatatggtttatgatagaacattttggtgtaatttaatccatgtagctgaccccgcttagtgggattatgcctggttattgttgtt 41833656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3448817 - 3448776
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3448817 tttgatccatgttgccgaccccactgagtgggataaggcttg 3448776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Original strand, 7090314 - 7090355
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7090314 gccgaccccacttagtgggatagggcttggttgtcgttgttg 7090355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 375
Target Start/End: Original strand, 10668648 - 10668685
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10668648 gccgaccccacttattgggataaggcttggttgttgtt 10668685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18741260 - 18741227
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18741260 gccgatcccacttagtgggataagacttggttgt 18741227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 163
Target Start/End: Original strand, 27553842 - 27553899
Alignment:
Q  106 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    ||||||||||||  || || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27553842 tatagtagaaaatatgatataaaataagcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 27553899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31635960 - 31635927
Alignment:
Q  346 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31635960 cacttggtgggataaggcttggttgttgttgttg 31635927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38341698 - 38341641
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgt 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38341698 gggtagcagctatagtagaaaagacagtggaaaataggcttaggtggtttgggtatgt 38341641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Original strand, 39128269 - 39128342
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  39128269 tatgatacaacattatggcgccgtttgatacatgtagccgacctaacttagtgggatatggtttgattgttgtt 39128342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 376
Target Start/End: Original strand, 39766741 - 39766802
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || || |||| |||||||||||||    
T  39766741 tatggcgtaattttatccatgtagccgacctcacttactgagaaaagggttggttgttgttg 39766802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 43558172 - 43558135
Alignment:
Q  19 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagac 56  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43558172 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagac 43558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 90
Target Start/End: Original strand, 2788583 - 2788623
Alignment:
Q  50 attagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  2788583 attagacatgatagaattaggaatgataacattagagagag 2788623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 356
Target Start/End: Original strand, 11753216 - 11753256
Alignment:
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 356  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11753216 atggcatcatttgatctatgtagccgatcgcacttagtggg 11753256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 49
Target Start/End: Original strand, 14748998 - 14749034
Alignment:
Q  13 aacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaag 49  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14748998 aacagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaag 14749034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35720658 - 35720626
Alignment:
Q  347 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35720658 acttagtgggataagacttggttgttgttgttg 35720626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 31388 - 31752
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31388 cagagattaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 31487  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31488 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 31587  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31588 aaaagatgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 31687  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31688 tgtgaagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44158 - 44081
Alignment:
Q  87 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44158 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 186)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Original strand, 8180700 - 8181060
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8180700 cagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 8180799  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8180800 aaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 8180899  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8180900 aaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 8180999  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8181000 tatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 3865992 - 3866356
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3865992 cagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagcacctatagtaaa 3866091  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  3866092 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaatt 3866191  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3866192 aaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 3866291  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3866292 tatgacatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 3866356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 377
Target Start/End: Original strand, 36183371 - 36183733
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36183371 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggtagcacctatagtaga 36183470  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  36183471 aaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagtt 36183570  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36183571 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacac 36183670  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36183671 tatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 36183733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38453051 - 38452686
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctatag 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||    
T  38453051 cagacatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctatag 38452952  T
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  38452951 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaaga-tagatcaaatggaggaaagtca 38452853  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38452852 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaa 38452753  T
Q  311 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38452752 acactatggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38452686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3244013 - 3243654
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |    
T  3244013 cagagataaggatgttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtaaa 3243916  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3243915 aaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagtt 3243816  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3243815 aaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaacac 3243716  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3243715 tatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 4807512 - 4807879
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctatag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||||||    
T  4807512 cagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagagagagtgggggtagcacctatag 4807611  T
Q  111 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4807612 tagaaaagttggtagaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtca 4807710  T
Q  211 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4807711 agttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgataga 4807810  T
Q  311 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807811 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 4807879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 38429806 - 38430167
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38429806 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatagtagaaa 38429905  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38429906 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 38430005  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  38430006 aagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 38430105  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38430106 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgg-tgttgttgttg 38430167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 12734623 - 12734984
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  12734623 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 12734720  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12734721 aattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 12734820  T
Q  217 aagagg-tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12734821 aagagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacact 12734920  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12734921 atggtgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12734984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 83 - 379
Target Start/End: Original strand, 2610576 - 2610872
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||    
T  2610576 agagagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaa 2610675  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2610676 gaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatga 2610775  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2610776 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttg 2610872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41197588 - 41197225
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41197588 gagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataatagaaa 41197489  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  41197488 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 41197389  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |    
T  41197388 aaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacatt 41197289  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41197288 atggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgttgttgttg 41197225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11992466 - 11992108
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  11992466 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaa 11992369  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11992368 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaa 11992269  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | | |||||||||| ||    
T  11992268 aagaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacatta 11992169  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11992168 tggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 11992108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41763401 - 41763043
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41763401 gagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtg-gggtaacacctatagtagaaa 41763303  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41763302 agttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 41763203  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||      
T  41763202 aaaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaatatgttttttgatagaacaccc 41763104  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41763103 gggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 66 - 379
Target Start/End: Original strand, 25834650 - 25834962
Alignment:
Q  66 ttaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25834650 ttaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga 25834749  T
Q  164 ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaa 263  Q
    |  || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  25834750 cctgtggatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggag--ttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaa 25834846  T
Q  264 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25834847 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 25834946  T
Q  364 ttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||    
T  25834947 ttggttgttgttgttg 25834962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 116 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451646
Alignment:
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttg 451646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45367984 - 45367623
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  45367984 gagatgatgatgttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggg-gggtagcacctatagtagaaa 45367886  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  45367885 agttggtagaaaataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaa 45367786  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  45367785 aagaggtagaggaagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacacta 45367686  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  45367685 tgacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataaaacttgtttgttgttgttg 45367623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 137 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7326400 - 7326158
Alignment:
Q  137 agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7326400 agatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacata 7326301  T
Q  237 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7326300 ggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 7326201  T
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7326200 agccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 7326158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 24 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18424728 - 18424378
Alignment:
Q  24 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18424728 ggatgttacgtcggatgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccattagagagagtgggtg--tagcatctatagtagaaaagttggt 18424631  T
Q  124 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |  ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  18424630 agaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggt 18424531  T
Q  224 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 323  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18424530 agaggaagacataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtc 18424431  T
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18424430 atttgatccatgta-ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18424378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 167 - 378
Target Start/End: Original strand, 28508750 - 28508961
Alignment:
Q  167 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 266  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28508750 gtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagg 28508849  T
Q  267 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28508850 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 28508949  T
Q  367 gttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||    
T  28508950 gttgttgttgtt 28508961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 102 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583630
Alignment:
Q  102 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  202 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-- 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc-aaatttgagt 24583709  T
Q  300 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    | | |||||| |||||||| ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24583708 tttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgttgtt 24583630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 351
Target Start/End: Original strand, 23997539 - 23997858
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||   |||    
T  23997539 gagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccattagagatagagtgggtgtagcacctatag---aaa 23997635  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23997636 atttggtagaaaatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 23997735  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||||| || ||||||||| ||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  23997736 aagaggtggaagaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacacta 23997823  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 351  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  23997824 tggcgttatttgattcatgtatccgaccccactta 23997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Original strand, 38434873 - 38435234
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||  || | |||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  38434873 gagatgaggatgttgcattggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctatagtagaaa 38434972  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttaga-tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 215  Q
    || |||| |||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |    
T  38434973 agatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtcagatca 38435072  T
Q  216 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 315  Q
      ||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |    
T  38435073 ctagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgattgaacatt 38435172  T
Q  316 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38435173 atggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 379
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643232
Alignment:
Q  212 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  312 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35643232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9556724 - 9556367
Alignment:
Q  21 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagtt 120  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| |     
T  9556724 tgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatagtagaaaaat- 9556626  T
Q  121 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 220  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||  |||| |||||||| ||||||  ||  |||    
T  9556625 ggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaactactaga 9556526  T
Q  221 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 320  Q
    || | |||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||| | || |||| |||||||||||| || ||     
T  9556525 ggcaaaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgatagaacattagggt 9556426  T
Q  321 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9556425 gtaatttgatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgttg 9556367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 379
Target Start/End: Original strand, 12141545 - 12141828
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||| || | ||||| ||||| |||||    
T  12141545 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatca 12141644  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 295  Q
     || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| || || |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  12141645 gattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaat 12141744  T
Q  296 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     |||| |||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12141745 atggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgttg 12141828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 377
Target Start/End: Original strand, 31959625 - 31959803
Alignment:
Q  199 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 298  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31959625 ggaggagagtcaggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 31959724  T
Q  299 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31959725 gtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 31959803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 375
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029867
Alignment:
Q  152 gtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 251  Q
    |||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  252 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca------tgtagccgatcc 345  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||| ||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccc 39029837  T
Q  346 cacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39029838 cacttagtgggataaggcttggttgttgtt 39029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6238110 - 6237751
Alignment:
Q  21 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta--gaaaag 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||    ||||||||| |  |  || |||    
T  6238110 tgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgacaccaatgg-gagagagtggacatagcacctaaaaaaaagataag 6238012  T
Q  119 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 218  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  6238011 ttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtcaaaa 6237912  T
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 318  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||    
T  6237911 gaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacactatg 6237812  T
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |  | |||||||| || ||| ||| |||||||| ||| | || ||||  ||||||||||||    
T  6237811 ggatgatttgatctatatagtcgaccccacttaatggaagaaagcttaattgttgttgttg 6237751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 264 - 379
Target Start/End: Original strand, 227358 - 227473
Alignment:
Q  264 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  227358 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 227457  T
Q  364 ttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||    
T  227458 ttggttgttgttgttg 227473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 257 - 379
Target Start/End: Original strand, 30306194 - 30306316
Alignment:
Q  257 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30306194 attagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 30306293  T
Q  357 ataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30306294 ataaggcttggttgttgttgttg 30306316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 376
Target Start/End: Original strand, 18958908 - 18959192
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg----gcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtgg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||  | || |  ||| ||||| ||||| |    
T  18958908 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagtag 18959007  T
Q  192 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 291  Q
    |||| |||||||| |||||  | |  ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| || || || || || ||| | |||||||||||||     
T  18959008 atcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatca 18959107  T
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18959108 aaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43752244 - 43751945
Alignment:
Q  80 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg 179  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||   |||||  ||| |    
T  43752244 attagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtag 43752145  T
Q  180 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaa 279  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| | |||  | |   |||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||    
T  43752144 tagggagagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaa 43752045  T
Q  280 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  43752044 tgagttggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccgacctcacttagttggaaaaggctcagttgttgttgttg 43751945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 257 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38328488 - 38328368
Alignment:
Q  257 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38328488 attagaaaggatttagaggtcaatgaa--ggatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 38328391  T
Q  357 ataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38328390 ataaggcttggttgttgttgttg 38328368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 215 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543074
Alignment:
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgttg 45543074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 219 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573128
Alignment:
Q  219 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 318  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43573188 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43573128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44437994 - 44437719
Alignment:
Q  104 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||  |||| ||  | ||| | |||||||    
T  44437994 cctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtatagatgagatggagg 44437895  T
Q  204 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgta 303  Q
     ||||||  | |  |||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   |||  |||| |     
T  44437894 ggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaaaacatggtttt 44437795  T
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44437794 tgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44437719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 275 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635321
Alignment:
Q  275 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T
Q  375 tgttg 379  Q
    |||||    
T  3635325 tgttg 3635321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12882317 - 12882043
Alignment:
Q  100 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga---gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 196  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||   | |||   ||||||||||| ||  ||||||| |||||     
T  12882317 agcacctatactagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggca-gaggagacctgtagat--gtagatgctgtcgttcgaagagtagatcag 12882221  T
Q  197 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 296  Q
    |||||||||| || |  ||||||   | ||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  12882220 atggaggagattcta--taaaag---ttgaggaagacctataaaagctataagagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaata 12882126  T
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12882125 tggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12882043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4598926 - 4598569
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagta 112  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||   ||||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  4598926 cagaaatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattagagagagagagttggggtagcacctatagta 4598827  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 212  Q
    | |||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||  ||| ||||| | |   ||| ||||||||| |||||| |    
T  4598826 gtaaagatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagacttgtgaattttgtagtaagtataacagataaaatggaggggagtcagg 4598727  T
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
    | |  |||||||| || | |||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  | |  | |||||||||    
T  4598726 tcactagaggtagtggtaaacctagaaaaactatacgagaagctattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatagattttgatagaac 4598627  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4598626 actatggcgtcatttgattcatgtaaccgattccacttagcgggataaggcttggttg 4598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9996766 - 9996623
Alignment:
Q  237 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 336  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  9996766 ggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgt 9996667  T
Q  337 agccgatcccactt---agtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| |||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  9996666 agccgaccccacttagaagagggataaggcttggttgttgttgt 9996623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Original strand, 42543274 - 42543519
Alignment:
Q  134 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 233  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||  | |  |||||||| || ||||    
T  42543274 cttaggtggtttgggcatgtacagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagac 42543373  T
Q  234 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 333  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  42543374 ctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacgtgctttttgatagaacgctatggcgttgtttgattca 42543473  T
Q  334 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42543474 tgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 42543519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16097350 - 16097199
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag----agtgtgggtagcacctatagta 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    |||| |||||||||||||| ||    
T  16097350 gagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagagagttagagtgggggtagcacctataata 16097251  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16097250 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagac 16097199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Original strand, 9496037 - 9496150
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  9496037 gatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggacaaggctt 9496136  T
Q  366 ggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||    
T  9496137 ggttgttgttgttg 9496150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37481930 - 37481618
Alignment:
Q  64 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37481930 gattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagttcctatagtaaaaaagatggttgaacctaggcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 37481831  T
Q  164 ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaa 263  Q
    || ||  ||  ||| || || ||||| ||||| ||||||| |||| |  | |   |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  37481830 cttgtgaattttgtagttaggagagtagatcagatggaggggagttagatcactggaggtagatgaagaccaagaaaaactattagagaaactattaaga 37481731  T
Q  264 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 363  Q
    | ||| ||| | | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||| | ||||| ||| |||||| ||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  37481730 aagatctagcgataaatgagttggataaaaatatggtatttgatagaaaattatggtgtcttttgattcatctagtcgaccccacgtagtcggataaggc 37481631  T
Q  364 ttggttgttgttg 376  Q
     ||||||||||||    
T  37481630 gtggttgttgttg 37481618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12475009 - 12474927
Alignment:
Q  295 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12475009 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12474927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35755434 - 35755247
Alignment:
Q  192 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga----gttgg 287  Q
    |||| |||||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||| |    |||||    
T  35755434 atcagatggaggaaagtcatatcaaaagagggagaggaaggcctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttgg 35755335  T
Q  288 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35755334 atccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 35755247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 375
Target Start/End: Original strand, 13149319 - 13149612
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||   |||||| || |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |       
T  13149319 agagagtgagttggggtagcacctataaacgaaaagatgatagaaaatagacttcggtggtctggccatgtagagagaagacatgtaaatgatgtagctc 13149418  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt-agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatg 281  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||  | | |||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||    
T  13149419 gaagagtagataagatggaggaaagtcagatcagaagatgttagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatg 13149518  T
Q  282 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||| | |||||||| | ||  ||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||| || ||| || |||||| |||||||||||||    
T  13149519 agtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacataatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 377
Target Start/End: Original strand, 11412697 - 11412992
Alignment:
Q  71 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||   ||||    
T  11412697 aatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataagaactgtag 11412796  T
Q  171 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag-agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatt 269  Q
    || |||| |||   ||||| ||||| ||||||| | |||||  | |  ||||  ||||||| |||||| |||||||||||           |||||   |    
T  11412797 attctgtagtag--agagtagatcagatggaggggtagtcagatcactagagccagaggaaaacctagaaaaactattag-----------gaaaga--t 11412881  T
Q  270 tagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag---aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||   |||| ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  11412882 tagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttg 11412981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 7825278 - 7825475
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagta 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  7825278 cagagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagagagagtgttggagtagcacctatagtt 7825377  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 210  Q
    | |||  ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| || | || || ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  7825378 gtaaatatggtgaaaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattctatagtcaggagagtagatgagatggaggatagtca 7825475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 41545326 - 41545670
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt-ag 113  Q
    |||||||  |||||||  |||||||||  |||| |||||||   | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| | |     
T  41545326 cagagatcgggatgttatgttggatgaacggtatgattagatgaggtaggattaagaatgacaccattagggagagagcgagggtaacacctataataaa 41545425  T
Q  114 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-agtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||  || ||   ||||||  |||| ||||||||  ||||||    
T  41545426 aaaagttggtagaaaatatgcttaaatagtttgagcatgtagaaagaagtctctgtagatgtcgttgt---aagagtatatcagatggaggattgtcaag 41545522  T
Q  213 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 312  Q
      |||||||     |||||| | || |||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  41545523 ccaaaagagacgacggaagagcaagaaaaactataagagaaaccattataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaac 41545622  T
Q  313 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 360  Q
    |||||| | | |||||||  || ||||||||| |||||| || |||||    
T  41545623 actatgacttaatttgatttatttagccgatctcacttaatgagataa 41545670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 307 - 379
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670752
Alignment:
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 17670752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 266 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19337004 - 19336896
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19337004 gatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaagctt 19336905  T
Q  366 ggttgttgt 374  Q
    |||||||||    
T  19336904 ggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709202
Alignment:
Q  280 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 379
Target Start/End: Original strand, 6218968 - 6219249
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||||  ||| ||||| ||||  |||||    
T  6218968 gggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagaggagatatgtagattatgtagtaaggagaggtgatca 6219067  T
Q  196 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 295  Q
    ||||||||| |||    | |   |||| |||| |||||||  |||| |||| | | ||||| |||| || ||||||||| | | ||||||||| | ||||    
T  6219068 aatggaggatagtgggatcactggaggcagagaaagaccttagaaa-ctataatataaaca-ttaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaat 6219165  T
Q  296 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
     |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  6219166 atggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttggataaggcttggttgttattgttg 6219249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13444094 - 13443907
Alignment:
Q  191 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 290  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||  |||  |||   ||||||  | |||||| |||  |    
T  13444094 gatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaaaacttagaaaatctatgagagaaattattgaaaaaattttagatattaatgagatgggcc 13443995  T
Q  291 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13443994 caaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttagttattgttgtt 13443907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 289 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531598
Alignment:
Q  289 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 9531598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12520142 - 12520060
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12520142 tggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12520060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12489949 - 12489800
Alignment:
Q  230 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 329  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||| |||||| ||||||| |||||    
T  12489949 agacctagaaaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttga 12489850  T
Q  330 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12489849 ttcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12489800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23714620 - 23714384
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||    |||||||||| |||||||||    
T  23714620 cagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagt---tgggtagcacatatagtaga 23714524  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||| |     
T  23714523 aaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaatc 23714424  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa 254  Q
    |  ||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23714423 actagacgtagatgaagacttagaaaaactataagagaaa 23714384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24102292 - 24102056
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||    |||||||||| |||||||||    
T  24102292 cagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagt---tgggtagcacatatagtaga 24102196  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||| |     
T  24102195 aaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaatc 24102096  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa 254  Q
    |  ||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24102095 actagacgtagatgaagacttagaaaaactataagagaaa 24102056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 43238379 - 43238306
Alignment:
Q  91 agtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43238379 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagac 43238306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 373
Target Start/End: Original strand, 33504346 - 33504502
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtc-aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    ||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| |  ||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||    
T  33504346 agaggcagagaaaaacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagatttaataagttggattgaaatatggtatatgatagaacatta 33504445  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33504446 tggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Original strand, 2610448 - 2610525
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2610448 cagagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagagagag 2610525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 379
Target Start/End: Original strand, 3481145 - 3481438
Alignment:
Q  96 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 195  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| | ||| ||||| |||||    
T  3481145 gggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaaggagagtagatca 3481241  T
Q  196 aatggaggagagtca-------agttaaa-----agaggtagaggaagacctaggaaaactatt-agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
     |||||||| |||||       ||| | |     ||||| |||||||||||||| ||||  | | |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||  |    
T  3481242 gatggaggatagtcagatggacagtcagatcactagaggaagaggaagacctagaaaaaaaaatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaacaa 3481341  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||   |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3481342 gttggacagaaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttg 3481438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 374
Target Start/End: Original strand, 42092439 - 42092796
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||  |||| |||||| |||||||   ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||    
T  42092439 cagagatgatgatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgacaatgttagagagag--ttggggtagcgcctatactaga 42092536  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 214  Q
    |||| ||||||||| || | |||| || | |||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||| ||||| ||| | |||||||  |||||| |     
T  42092537 aaagatggtagaaactaagattaggtgatctgggcatgtagagagaaggcttgtagattttgtagtaaggagagtagattagatggagggtagtcaattc 42092636  T
Q  215 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 314  Q
    |  | ||  | ||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| ||| ||||| | ||| ||||||||    ||  | | |||||||||  |     
T  42092637 actatagagacaggtagacctagaaaaactataggagaaactattaaaaaagatgtagagattaattagttggatagtgatacgatatatgatagaggat 42092736  T
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    | ||||||  ||||||||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42092737 tgtggcgttgtttgatccatgtagctgaccctacttagtaggattaggcttggttgttgt 42092796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 379
Target Start/End: Original strand, 43832087 - 43832382
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 182  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||  || | |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||  || |||  ||| || |    
T  43832087 agagagagagttggggtatcacctatagtaaaaaatatg-tggaaactaggcttaggtgatttgggcatgtacagagaaaacatgtggattatgtagtta 43832185  T
Q  183 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 282  Q
    | ||||| ||||| ||||||   | |||| | |  ||| | |||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||    
T  43832186 ggagagtagatcagatggagagtaatcaaatcagtagacgcagaggaagacctaaacaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatga 43832285  T
Q  283 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||    || || ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43832286 gttggataaggatatgatgtattatagaacattatgacggcatttgatccatgtagctgacccaacttagtttgataaggcttggttgttgttgttg 43832382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470146
Alignment:
Q  221 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 320  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |  ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||     
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggt 37470190  T
Q  321 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 364  Q
    ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37470189 gtagtttgatccatgtagctaatcccacttagtgggataaggct 37470146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8197640 - 8197539
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8197640 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8197541  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  8197540 tg 8197539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8202400 - 8202299
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8202400 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8202301  T
Q  378 tg 379  Q
    ||    
T  8202300 tg 8202299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19235176 - 19234988
Alignment:
Q  185 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgag 283  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| || ||||| | |||||     
T  19235176 agagtagatcagatggaggggagtcaaatcactagagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattgagaaag-atctagagattaatgat 19235078  T
Q  284 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    ||||||  |||| |||| | |||||||||| | || |||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19235077 ttggatagaaatatggtatttgatagaacattctgtcgtcgtttaatccatgtagccaactccacttagtgggataaggcttagttgttg 19234988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5759187 - 5758995
Alignment:
Q  185 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 284  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||| | |  |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |  |  |||||| ||||| |||||||||    
T  5759187 agagtagatcagatggaggggaatcaaatcactagaggtagggaaatacctagaaaaactattagagaaactaccaagaaggatctagagatcaatgagt 5759088  T
Q  285 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||   | |  |||| | |||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5759087 tggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggtagctgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 5758995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 379
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626356
Alignment:
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttg 17626356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 379
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287705
Alignment:
Q  223 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||  | |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||| | |    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  323 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
      |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttg 33287705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7432042 - 7431887
Alignment:
Q  224 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 323  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||| ||| ||||| ||  |||| |||    
T  7432042 agaggaaaacctagaaaaactattggagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttgaataaaaatatggtatataatagatcataatggtgtc 7431943  T
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7431942 atttgatccatgcaaccgacctcacttagtgggataaagcttagttgttgttgttg 7431887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Original strand, 15025703 - 15025778
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15025703 tgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 15025778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743812
Alignment:
Q  252 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 351  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| |||| | | ||||||||| || || ||| | ||||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaactcactta 30743785  T
Q  352 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30743786 gtgagataaggctttgttgttgttgtt 30743812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13241063 - 13240763
Alignment:
Q  59 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 158  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||||||  |||  |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13241063 gataggattagaaatgacaacattagagagagaattggagtagcaagtatgttagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaga 13240964  T
Q  159 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 258  Q
    ||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||||      | || || || || |  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||        
T  13240963 gaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatc------atgatagccaggtcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatta-agaaa---- 13240875  T
Q  259 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 358  Q
           ||| ||||| | || |||||| ||| ||||||||| ||||||| | || |||| |||  |||||||| ||| ||||| ||  |||||||||||    
T  13240874 -------gatctagagattaacgagttgaatcgaaatttggtttatgataaaccattatgccgttgtttgatccgtgtcgccgacccagcttagtgggat 13240782  T
Q  359 aaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  13240781 aaggcttggttattgttgt 13240763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 378
Target Start/End: Original strand, 19863436 - 19863517
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19863436 tggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19863517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 378
Target Start/End: Original strand, 19867768 - 19867849
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19867768 tggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19867849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 378
Target Start/End: Original strand, 19872669 - 19872750
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19872669 tggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 306 - 379
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384753
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataaggcttggtggttgttgttg 25384753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 375
Target Start/End: Original strand, 26670891 - 26671048
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||  || ||||||||| | ||||||||||| | |||| || | |||||||||| |  ||    
T  26670891 agaggtagaggaagacctacaaaaactataaaagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccaaaatatgatttatgatagaatataat 26670990  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    || || |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26670991 ggtgtaatttgatccatgtagccgacactgcttagtgggataagacttggttattgtt 26671048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 45077670 - 45077870
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||  | | ||||||    ||||||| || |||||| ||||||||    
T  45077670 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactagatagaattagaaatgtgaactttagagggagagagagtttgagtagcatctatagta 45077769  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggctt---agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 209  Q
    |||||| |||| || | ||| |||   || |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  45077770 gaaaagatggtggagagtagacttgggaggtggttttggcatgtagagagaaaacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtc 45077869  T
Q  210 a 210  Q
    |    
T  45077870 a 45077870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42549919 - 42549835
Alignment:
Q  295 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42549919 tttggtttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 42549835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10516824 - 10516749
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10516824 tatgataaaatattatggcgtaatttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10516749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 377
Target Start/End: Original strand, 19855585 - 19855744
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||  || |||  |||||| |||||| |||||  |||  |||| ||||||||| || |||    
T  19855585 agaggcagaggaagacctagataaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattat 19855684  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  19855685 ggcgccattcaatccatgtagccgaccccacttagtaggataaagcgtggttgttgttgt 19855744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Original strand, 30743545 - 30743675
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  30743545 gagatgaggatgttgcgcatgatgagtgctaagactagacgggataggattgggaatgtcaccgttaggaagagagtg-gggtagcacttatggtagaaa 30743643  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttggg 148  Q
    | |||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  30743644 aattggtagaaattagaattagatggtttggg 30743675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19337209 - 19337069
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga-ttagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||  ||||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |    
T  19337209 gagatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaacattagagagag--ttggggtagcacctatagtagta 19337112  T
Q  116 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 162  Q
    ||| |||| ||||||| |||||    | |||||||||||||||||||    
T  19337111 aagatggtggaaaataagctta----ggttgggcatgtagagagaag 19337069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 174
Target Start/End: Original strand, 40759049 - 40759179
Alignment:
Q  45 gtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggt-agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggt 143  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||| |||  |||| ||||    
T  40759049 gtaagactagacaagataagattagaaatgacaacattagagagagaggttgggttagcacttatagtagaaaaaatggtggaaactagagttaggtggt 40759148  T
Q  144 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgc 174  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  40759149 ttgtgcatgtagagagaagacttttagatgc 40759179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 522445 - 522509
Alignment:
Q  311 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  522445 acactatggcgtcatttgatccatgtagcagatcacacttaatgggataaggctttgttgttgtt 522509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 282 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720426
Alignment:
Q  282 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggagaaggcttg 3720426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Original strand, 17429252 - 17429332
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| |||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17429252 tggtatatgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 17429332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13592656 - 13592411
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||   |||| |||||| |||| || ||||  || || |||  ||||||||||||||||| |||    
T  13592656 gagatggggatgttgtgttggatgtgtggtgatattagatgggataagattagaaatggcaacattgtagggatagttggggtagcacctatagtataaa 13592557  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
      ||| | ||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||  ||||||  | | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||      
T  13592556 tattg-tggaaaatagt-ttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagatattatagtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcatatttc 13592459  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaa 264  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||    
T  13592458 aagaggtataggaagacctagaagaactataagagaaactatcagaaa 13592411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26784592 - 26784350
Alignment:
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 224  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||   || |||  ||| ||||| || || ||| | |||||||  |||||| | |  ||||| |    
T  26784592 gaaactaggcttaggttgtttgtgcatttagagagaagatatgtggattttgtagtaaggagggtagataagatggagggtagtcaaatcactagaggca 26784493  T
Q  225 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 324  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||| ||||||| |||| | |||  | |    
T  26784492 gagaaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgataaaacattttggtttaa 26784393  T
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  26784392 tttgatccatgtagccaatctcacttagtaggataagacttgg 26784350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 887138 - 887065
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa-ggcttggttgttgttg 376  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  887138 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgggataatggcttggttgttgttg 887065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16521060 - 16521007
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16521060 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 16521007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 374
Target Start/End: Original strand, 45077915 - 45078008
Alignment:
Q  281 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45077915 gagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 45078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 379
Target Start/End: Original strand, 14444889 - 14444953
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14444889 tatggcgtactttgatccatgtagccatccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14444953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28960350 - 28960210
Alignment:
Q  239 aaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 337  Q
    |||||||||| |||||||  |||  |||||| ||||| | |||||||||||   | || |||| | ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  28960350 aaaactattaagagaaactgttaagaaggatctagagataaatgagttggagaaagatatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgta 28960251  T
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28960250 gtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 28960210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Original strand, 32402683 - 32402783
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32402683 aatgagttggatagaaataaggtatatgatagaacattatggtttcatttgatccacgtagacgatcctgcttagtgggataagacttggctgttgttgt 32402782  T
Q  378 t 378  Q
    |    
T  32402783 t 32402783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 242
Target Start/End: Original strand, 32443668 - 32443812
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 197  Q
    ||||||||||||  || |||  || ||||||||| |||| | |||||||   |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| | |    
T  32443668 gtagcacctataaaaggaaatatgatagaaaatatgctttggtggtttgaaaatgtagagagaaaacttgtagatgttgtagtacgaagagtggataaga 32443767  T
Q  198 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa 242  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  32443768 tggaggatagtcagattaaaagaggtagtggaagatctagaaaaa 32443812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12470962 - 12470895
Alignment:
Q  312 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12470962 cactatggcgtcgtttgcttcatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggtggttgttgttg 12470895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14398032 - 14397957
Alignment:
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14398032 atgatagaacattatggtgtcatttgttccacatagctgatcctacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 14397957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15775898 - 15775843
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15775898 atttggtccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgttg 15775843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21281545 - 21281462
Alignment:
Q  295 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21281545 tttggtttacgatagaacattatggcttaatttgatccatgcagccaaccccaattagtgggataaggcttggtagttgttgtt 21281462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 451984 - 451930
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattag 69  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  451984 cagagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggattag 451930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9394739 - 9394629
Alignment:
Q  268 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 367  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| || |||||| | |||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||| |    
T  9394739 tttaaaggttaatgagttggatccgaatatggtttataatagagcattatggcttaattttatccatgtagccaaccccacttggtaggataagactttg 9394640  T
Q  368 ttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||    
T  9394639 ttgttgttgtt 9394629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 375
Target Start/End: Original strand, 34931634 - 34931712
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34931634 tggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 34931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 133
Target Start/End: Original strand, 227307 - 227360
Alignment:
Q  80 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  227307 attagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatagg 227360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 154
Target Start/End: Original strand, 19024150 - 19024239
Alignment:
Q  65 attaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 154  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||    
T  19024150 attagaaatgacaacattagagagagggtttgggtagcacctatatttgaaaagatggtggaaagtaagcttaggtggtttggacatgta 19024239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45483038 - 45482989
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 373  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45483038 atttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 45482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 624759 - 624687
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    ||||||||| ||||||  |  |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  624759 tgatagaacgctatggtatagtttgattcatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttg 624687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3305879 - 3305807
Alignment:
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3305879 tagaacattatggcgtcgtttgatccatatagtggatcccactttgtgggataaggcttggttattgatgttg 3305807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9579053 - 9578916
Alignment:
Q  25 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||  ||   |||||||||  ||||  ||| |||||||| |||| || |     
T  9579053 gatgttgcgttggatgtgtggtaagaatagatatgatagaattaaaaatgaca--atgttagagagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatg 9578956  T
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
     ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9578955 taaaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagac 9578916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9647967 - 9647822
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||| |||| || ||||    | |||||  ||| || ||||||||||||    
T  9647967 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataagattagaaatgtcaacatt----atagagttggggcagtacctatagtaga 9647872  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    || | |||| |||| |||  |||| |||||||| |||||| | |||||||    
T  9647871 aatgatggtggaaactagctttaggtggtttggacatgtaaaaagaagac 9647822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Original strand, 21834638 - 21834806
Alignment:
Q  179 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 278  Q
    |||||||||||  ||||||| || || || ||  ||| |||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||| || | |    
T  21834638 gtaagaagagtaaatcaaatagaagatagacatattacaagaggtatagaaagatctagaaaaactataagataaactattaggaaatatttatagatta 21834737  T
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 347  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| ||| ||||    
T  21834738 atgagttggatctaaatttggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcgacccca 21834806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 164
Target Start/End: Original strand, 38860158 - 38860242
Alignment:
Q  80 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||    
T  38860158 attagatagagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagac 38860242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10403934 - 10403891
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10403934 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 10403891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Original strand, 15015154 - 15015229
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15015154 tgatagaacactctggtttcgtttgattcatgtagccgacgcaacttagtgggataaggcttggttgctgttgttg 15015229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 380
Target Start/End: Original strand, 33971534 - 33971589
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33971534 tttgatccatgtagccgaccccacctagtgggatatggcatggttgttgttgttgc 33971589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Original strand, 36993742 - 36993816
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36993742 tatgatatcacattatgacgtaatttgatccatgtagccta-ccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36993816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Original strand, 11017316 - 11017422
Alignment:
Q  97 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||| || ||||| || ||||||    
T  11017316 ggtagcacctatagtagaaaagatcgtggaaactcggcttaagtggtttgggtatgtggagagaagacccgtagattttgtagttagaagggtagatcaa 11017415  T
Q  197 atggagg 203  Q
    |||||||    
T  11017416 atggagg 11017422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14197437 - 14197367
Alignment:
Q  103 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 172  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14197437 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggctttaggtggtttgggcatgtagagtgaagacttgtagat 14197367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 29968682 - 29968624
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 364  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29968682 atagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgactccacttagtgggataaggct 29968624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 325 - 379
Target Start/End: Original strand, 33393339 - 33393393
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33393339 tttgatccatgtaaccgaccccacttactgggataaagcttggttgttgttgttg 33393393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 337 - 379
Target Start/End: Original strand, 38429651 - 38429693
Alignment:
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38429651 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 38429693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2073348 - 2073307
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2073348 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2073307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 377
Target Start/End: Original strand, 3030864 - 3030960
Alignment:
Q  280 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||| ||| | |  ||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3030864 tgagttggatcccaatatagattatgatacaacattatggcataattttatccatgtagc-gaccccacttagtgggataagccttggtcgttgttgt 3030960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 369
Target Start/End: Original strand, 19024387 - 19024452
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 369  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19024387 tgatagaactttatggcgtcgtttgatctatatagccgaccccactcagtgggataaggcttggtt 19024452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Original strand, 19224988 - 19225061
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt-gggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  19224988 tatgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtcggaaaaaggctcggttgttgt 19225061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23915773 - 23915708
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 362  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||    
T  23915773 tggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacatggtcggataagg 23915708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Original strand, 37520689 - 37520730
Alignment:
Q  338 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37520689 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 37520730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8560852 - 8560804
Alignment:
Q  331 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8560852 ccatgtagccgacccaacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 8560804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 378
Target Start/End: Original strand, 15222472 - 15222528
Alignment:
Q  322 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15222472 tcatttgatccatgtagccaaccccacctagtaggataagacttggttgttgttgtt 15222528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 379
Target Start/End: Original strand, 17581543 - 17581743
Alignment:
Q  179 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 278  Q
    ||||||| |||  ||||||| ||||| |||||  ||  |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| || ||||  || |||||| |  |      
T  17581543 gtaagaaaagtatatcaaatagaggatagtcatattttaagaggtatagaaagacctagaaaaactataagagagactattacgaaagatttacatattt 17581642  T
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||| ||| |||| || | |||||||||||| |||| | |  || | || |||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  17581643 atgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacaatatgacatatttcggtctatgtagtcgatcccacttagtaggataaagtttggtggttgttgtt 17581742  T
Q  379 g 379  Q
    |    
T  17581743 g 17581743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32364999 - 32364923
Alignment:
Q  299 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| || | |||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  32364999 gtgtatgatagaacattatggtgtaatttgatcaatgtagctgacctcacttaataggaaaaggcttggttgttgtt 32364923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 164
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  108 tagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 164  Q
    ||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 186230 - 186135
Alignment:
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||||||  ||| | | ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  186230 atgagttggatccaaataaagtttaagatagaacatcatgtcataatttgattcatgtggccgacctcacttagtgggataaagcttggttgttgt 186135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 172
Target Start/End: Original strand, 907710 - 907757
Alignment:
Q  125 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  907710 gaaaatagccttagatggtttgggcatgtagagagaagagttgtagat 907757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Original strand, 1648113 - 1648148
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648113 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1648148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2515242 - 2515171
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2515242 atagaatattatggcgtactttgatctatctagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgtcgttgt 2515171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 376
Target Start/End: Original strand, 7615471 - 7615550
Alignment:
Q  297 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  7615471 tggtatatgataaaacattatgtcgtcatttgatccgtctatccgataccaattagtgggataaggcctgattgttgttg 7615550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9647686 - 9647611
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||| |||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9647686 tatgatggaacattatggcatcgtttgattcatgcaaccgatcccatttaatgagataaggcttggttgttgttgt 9647611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12026069 - 12026014
Alignment:
Q  320 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12026069 cgtcgtttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaagtttggttgttgtt 12026014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Original strand, 13188391 - 13188426
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13188391 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 13188426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13474313 - 13474214
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||||  ||| |||||| | |||||||| ||  || |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13474313 aatgagttggatcggaatatggtttatgataatacattatggcataatttgatctattgagtcgactccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 13474214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19334225 - 19334174
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgg 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  19334225 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgactccacttagtgg 19334174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 332 - 379
Target Start/End: Original strand, 26566292 - 26566339
Alignment:
Q  332 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26566292 catgtagccaaccccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 26566339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 377
Target Start/End: Original strand, 26850419 - 26850517
Alignment:
Q  279 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt-agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||| | |||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| || |||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26850419 atgagttgga-cgaaatatggtttatgataaaacattatggcgtaatttgttcgatgttagccaaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgt 26850517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18790231 - 18790105
Alignment:
Q  252 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 351  Q
    |||| ||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||||||| || | ||||||| | ||  ||| |||  ||| |||||||| ||||| |||| |||    
T  18790231 aaaccattagaatggattcataggtcaatgaaatagatccaaatatgatttatgatataccatcatgtcgtactttcatccatgtcgccgaccccattta 18790132  T
Q  352 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18790131 gtgggagaaggcttagttgttgttgtt 18790105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 379
Target Start/End: Original strand, 36819406 - 36819459
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36819406 tttgatccatatagccga-cccacttagtgggataaagcttggttattgttgttg 36819459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Original strand, 45436965 - 45437124
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||| | |  || || ||||||||| | ||||  |||||||||||| |||| | |||||||||| ||     
T  45436965 agaggcagaggaagacctataaaaattataagagaatctagcaggaaagatttagagattaatgcattggatccaaatatggtatttgatagaacattac 45437064  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || || |||||||| |||||||| | | |||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  45437065 ggtgtaatttgatctatgtagccaacctcactcagtggg--aaggcatggttgctgttgttg 45437124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 335787 - 335710
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  335787 tatgatagaacattacggcataatttgatccatatagcaggccccacttagtaggatatagcttggttgttgttgttg 335710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Original strand, 32706472 - 32706525
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32706472 atttgatggatgtagtcgattccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 32706525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Original strand, 36366819 - 36366916
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || | |||| ||||||| |  | ||||||||||||||    
T  36366819 aatgagttggaccgaaatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtatccaaccccatttagtggtaataagcttggttgttgtt 36366916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 367
Target Start/End: Original strand, 440924 - 440988
Alignment:
Q  303 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 367  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||||    
T  440924 atgatacaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgactccacttagagggataagacttgg 440988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2902028 - 2901960
Alignment:
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagcc-gatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2902028 aacattatggtgtaatttgatccttgtagcccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgt 2901960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 379
Target Start/End: Original strand, 24214010 - 24214070
Alignment:
Q  319 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24214010 gcgtaatttaatccatgtagccgaccccaccttgtgggataagatttggttgttgttgttg 24214070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24583968 - 24583904
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacacc 79  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24583968 cagagatgaagatgttgtgcgggatgagtggtaagactaaacatgatatgattaagaatgacacc 24583904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 32443851 - 32443919
Alignment:
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt-gggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  32443851 aacattatggcataatttgatccatgtagccgactccacttagtggggataagacttagttgttgttgt 32443919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 161
Target Start/End: Original strand, 41330131 - 41330195
Alignment:
Q  97 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41330131 ggtaacacctttagtagaaaagatgatcaaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaa 41330195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 44415853 - 44415905
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44415853 tttgatccatgttgccaaccctgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44415905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 374
Target Start/End: Original strand, 11414571 - 11414610
Alignment:
Q  335 gtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11414571 gtagccgacaccacttagtgggataaggcttggttgttgt 11414610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 379
Target Start/End: Original strand, 14530529 - 14530564
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14530529 cccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttg 14530564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 18188701 - 18188848
Alignment:
Q  13 aacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 112  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||  |||| ||| || ||||||| |||| |||||||  |  ||||||||||| |  ||    
T  18188701 aacaaagatgaggatgttgtgttggatgtgtg-taaggctagacgggatatgatcagaaatgacaacattggagagag--ttggggtagcacctcttcta 18188797  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    |||||| |||| |||  | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18188798 gaaaagatggtggaagctcgacttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 18188848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 379
Target Start/End: Original strand, 23354105 - 23354164
Alignment:
Q  321 gtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  23354105 gtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaagattgattgttggtgttg 23354164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25284997 - 25284954
Alignment:
Q  336 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25284997 tagccgactccacttactgggataaggcttggttgttgttgttg 25284954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 379
Target Start/End: Original strand, 32395594 - 32395653
Alignment:
Q  320 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  32395594 cgtcgtttgatgcatgtagccgaccccatttagttggataaagtttggttgttgttgttg 32395653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 374
Target Start/End: Original strand, 43970020 - 43970059
Alignment:
Q  335 gtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43970020 gtagccgatctcacttagttggataaggcttggttgttgt 43970059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 376
Target Start/End: Original strand, 9078804 - 9078858
Alignment:
Q  322 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  9078804 tcatatgatccatgtagccgagcccacttagtgggattagatttggttgtcgttg 9078858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14520978 - 14520948
Alignment:
Q  349 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520978 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14520948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44877486 - 44877440
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44877486 atttggtccatgtagccgaccccacttcgtgggataaggcttagttg 44877440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Original strand, 13149231 - 13149300
Alignment:
Q  13 aacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt 82  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| || |   |||| |||||||||||||||||||    
T  13149231 aacagagatgagggtgttgtgttggacaagtggtaagactaaaagggataagattaggaatgacaccatt 13149300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 112
Target Start/End: Original strand, 17581392 - 17581485
Alignment:
Q  19 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 112  Q
    |||| |||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||   ||||||||||||||||    
T  17581392 gatggggatgttttgttggatgtgtggtaagactagatatgataagattaaaaatgacaacattgtagagatagttaaggtagcacctatagta 17581485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 371
Target Start/End: Original strand, 19015946 - 19016015
Alignment:
Q  302 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    |||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||    
T  19015946 tatgattgaacaatatgacatcgtttgatccatgtagccgacctcacttagcgggataaaacttggttgt 19016015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32541861 - 32541792
Alignment:
Q  310 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||  ||| ||||||||||||    
T  32541861 aacactatggggtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataagataagaattgattgttgttgttg 32541792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Original strand, 36650625 - 36650721
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  36650625 aatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagctgactccatttagt-ggataagacttggtttttgtt 36650721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 203
Target Start/End: Original strand, 43260439 - 43260512
Alignment:
Q  130 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| |||||| || | ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  43260439 taggcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagg 43260512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1765661 - 1765609
Alignment:
Q  327 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  1765661 tgatccatgtagtcgacctcacttagtaggataaagctcggttgttgttgttg 1765609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Original strand, 12905082 - 12905162
Alignment:
Q  83 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||  |||| | |||||  |||||||||||||||    
T  12905082 agagagagagttggggtagcacctatagcagaaaagattgtagaagctagaattaggtagtttgaacatgtagagagaaga 12905162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 377
Target Start/End: Original strand, 14255807 - 14255835
Alignment:
Q  349 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14255807 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14255835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 361
Target Start/End: Original strand, 15836170 - 15836206
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 361  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15836170 tttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataag 15836206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 16113674 - 16113726
Alignment:
Q  325 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16113674 tttgatctatgtagccgactccatttagtgggagaagacttggttgttgttgt 16113726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25721396 - 25721364
Alignment:
Q  345 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25721396 ccacttagtgggataaggcttggttattgttgt 25721364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Original strand, 44411715 - 44411787
Alignment:
Q  98 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 170  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||   |||||| | |||||  |||||||||| ||||    
T  44411715 gtagcacctatagtaggaaagatggtggaaaataggcttccgtggttttgacatgtttagagaagacttgtag 44411787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 380
Target Start/End: Original strand, 44527792 - 44527828
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 380  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44527792 cccacttggtgggataaagcttggttgttgttgttgc 44527828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45653498 - 45653470
Alignment:
Q  344 cccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45653498 cccacttagtgggataaggcttggttgtt 45653470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 52 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1271 - 946
Alignment:
Q  52 tagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 151  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1271 tagacaggataggattatgaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccat 1174  T
Q  152 gtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 251  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1173 gtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 1074  T
Q  252 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 351  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  1073 aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccattta 974  T
Q  352 gtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  973 gtgggataaggcttggttgttgttgttg 946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Original strand, 82643 - 83000
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  82643 gagatgaggatgttgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 82742  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||    ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||   |||||    
T  82743 agttggtagaaaatgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt--ggttaa 82840  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  82841 gagaggtagaggaagacctaggaaaacta-tagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacacta 82939  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  82940 tgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgt 83000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48207 - 48119
Alignment:
Q  286 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 374  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  48207 ggattcaaatatggtgtatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtaggattaggcttagttgttgt 48119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19000 - 18943
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 372  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  19000 tatggtgtcgtttgatccatataaccgatgccaactagtgggataaggcttggttgtt 18943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4636 - 4278
Alignment:
Q  13 aacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg-tagcacctatagt 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  4636 aacagatatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagt 4537  T
Q  112 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4536 agaaaagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaa 4437  T
Q  212 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 311  Q
    |||||||||||||          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  4436 gttaaaagaggta----------taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaa 4347  T
Q  312 cactatggcgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4346 cactatgacgttatttgatccatgtaggcgacccccatttaatgggataaggcttggttcttgttgttg 4278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 86967 - 86607
Alignment:
Q  17 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | | | || |   | ||||||||    
T  86967 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattagagagagagagagag-ag-agagagagtagaaa 86870  T
Q  117 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  86869 agttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 86770  T
Q  217 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 316  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  86769 aagaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgatagaacacta 86670  T
Q  317 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  86669 tgacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggatacgacttgtttgttgttgttg 86607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 223 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25530
Alignment:
Q  223 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  323 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 25530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 25807 - 25683
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 114  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25807 cagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 25708  T
Q  115 aaagttggtagaaaataggcttaga 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25707 aaagttggtagaaaataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 204 - 377
Target Start/End: Original strand, 16687 - 16860
Alignment:
Q  204 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgta 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  16687 agagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttt 16786  T
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16787 tgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 137 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11547
Alignment:
Q  137 agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 236  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  237 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 336  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttg--gtttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  337 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  11589 agccgaccccacttagtaggataaggtttggttgctgttgttg 11547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 11960 - 11810
Alignment:
Q  15 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga--gtgtgggtagcacctatagta 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  11960 cagagatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagagagatagtgggggtagcacctatagta 11861  T
Q  113 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11860 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 167 - 379
Target Start/End: Original strand, 4708 - 4920
Alignment:
Q  167 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 266  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||| | ||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  4708 gtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaagg 4807  T
Q  267 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  4808 atttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacgcttg 4907  T
Q  367 gttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||    
T  4908 gttgttgttgttg 4920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 378
Target Start/End: Original strand, 481 - 614
Alignment:
Q  245 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  481 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacc 580  T
Q  345 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  581 ccacttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 375
Target Start/End: Original strand, 7431 - 7720
Alignment:
Q  85 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaaga 184  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||   |  |||||    
T  7431 agagagagtctgggtagcacgtaaagtacaaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatgtcttcataaga 7530  T
Q  185 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 284  Q
    |||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||| |  |  ||||| || ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||| | |||    
T  7531 agagtatatcagatggaggagagtgaagtcaaaagag-tgtatcaagacataagaaaactataagataaactattagaaaagattcagaggtcatttagt 7629  T
Q  285 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc-ccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7630 tggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagcc-atctccacttagtgggataaagcttggttgttgtt 7720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 234 - 379
Target Start/End: Original strand, 14722 - 14867
Alignment:
Q  234 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 333  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14722 ctaggaaaactttaagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatcca 14821  T
Q  334 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14822 tgtagccaaccccacgtagtgggataaatcttggttgttgttgttg 14867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 163
Target Start/End: Original strand, 14626 - 14678
Alignment:
Q  110 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14626 gtagaaaagtaggtagaaaata-gcttagatggtcggggtatgtagagagaaga 14678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 287 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28887
Alignment:
Q  287 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58224
Alignment:
Q  218 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 317  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||  | || ||| ||||||||||||| | | || |||| |||||||||||| |||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattat 58286  T
Q  318 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  58285 gtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggcttcattattgttgttg 58224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45514 - 45447
Alignment:
Q  307 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||| || ||||||||||||||    
T  45514 tagaacattatagcgtaatttgatccatgtagccga-cctatttagcgggaaaaagcttggttgttgtt 45447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 239 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 160462 - 160325
Alignment:
Q  239 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 338  Q
    |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||  | |||||||| || | |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  160462 aaaactacaagagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtag 160363  T
Q  339 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 376  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  160362 ccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25554 - 25443
Alignment:
Q  266 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 365  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  ||||  | | ||||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  25554 gatttagagattaatgagttggatagaaataagttatatgataaaacattatggcttcgtttgatctatgtagtcaatcccactttgtgggataaggctt 25455  T
Q  366 ggttgttgttgt 377  Q
    ||||||||||||    
T  25454 ggttgttgttgt 25443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1665 - 1520
Alignment:
Q  231 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 330  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||  |   |||| |  ||||||||| |||| ||| |||||||    
T  1665 gacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgagttagatctga---tggtatgagatagaacattatgacgtaatttgat 1569  T
Q  331 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    | ||||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  1568 caatgtagctgaccccacttattaagataaagcttggttgttgttgttg 1520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6771
Alignment:
Q  292 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 378  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6857 aaatatggtatatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggctgttattgtt 6771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16438
Alignment:
Q  289 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 371
Target Start/End: Original strand, 3648 - 3713
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 371  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3648 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 3713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3927 - 3839
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 366  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  3927 aatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggatatggcttg 3839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 99357 - 99284
Alignment:
Q  306 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  99357 atagaacgctatggtgtcgtttgaatcatgtagccgacaccacatagtgggataaggcttggttgttgttgttg 99284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 163
Target Start/End: Original strand, 11802 - 11866
Alignment:
Q  99 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 163  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11802 tagcacctattgtagaaaagatggtaggaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 337
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39561
Alignment:
Q  257 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 337  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  39481 attaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacatgatggcgtaatttaatccatgta 39561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 364
Target Start/End: Original strand, 194086 - 194135
Alignment:
Q  315 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 364  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  194086 tatggtgtcatttgatccatgtagccaatcccacctagtggaataaggct 194135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 379
Target Start/End: Original strand, 19149 - 19201
Alignment:
Q  327 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  19149 tgatccacgtagccgaccccacttagtgagataaagtttggttgttgttgttg 19201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 26049 - 26100
Alignment:
Q  324 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 375  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  26049 atttgagccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttgcttgttgtt 26100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 163267 - 163192
Alignment:
Q  304 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  163267 tgatagaacactatgacgtcgtttgattcatatagccgactccatttagtggaataaaacttgattgttgttgttg 163192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40663 - 40610
Alignment:
Q  326 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  40663 ttgattcatgtagccgatctcatttagtgggataatgtttggttgtcgttgttg 40610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1858 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1858
Description:

Target: scaffold1858; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 974 - 883
Alignment:
Q  278 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 370  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||| ||| |||| |||||| | ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  974 aatgagttggaccgaaatatggtttataataaaacattatggcataatttgttc-aggtagccgaccccacttagtgggataacacttggttg 883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University