View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18249_low_3 (Length: 470)

Name: NF18249_low_3
Description: NF18249
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18249_low_3
NF18249_low_3
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (11-455)||(10500906-10501350)
chr3 (11-455)||(11781275-11781719)
chr3 (49-455)||(10517817-10518223)
chr3 (11-455)||(10089122-10089566)
chr3 (57-451)||(13333240-13333634)
chr3 (11-455)||(10196005-10196449)
chr3 (57-451)||(13344425-13344819)
chr3 (52-334)||(10261151-10261433)
chr3 (57-451)||(13171367-13171761)
chr3 (11-334)||(10127381-10127704)
chr3 (52-455)||(10363132-10363535)
chr3 (52-334)||(10032456-10032738)
chr3 (52-334)||(10663979-10664261)
chr3 (11-455)||(10433337-10433781)
chr3 (52-343)||(9839305-9839596)
chr3 (52-334)||(10672135-10672417)
chr3 (52-343)||(9850183-9850474)
chr3 (52-343)||(10527802-10528093)
chr3 (57-451)||(13161316-13161710)
chr3 (57-451)||(13290001-13290395)
chr3 (60-343)||(10375187-10375470)
chr3 (49-343)||(10077713-10078007)
chr3 (52-455)||(11769566-11769969)
chr3 (49-343)||(10184686-10184980)
chr3 (52-221)||(10581176-10581345)
chr3 (49-454)||(11159348-11159753)
chr3 (57-454)||(8861619-8862016)
chr3 (57-454)||(11130365-11130762)
chr3 (57-454)||(11148193-11148590)
chr3 (59-327)||(10889766-10890034)
chr3 (57-177)||(11245960-11246080)
chr3 (52-153)||(13854014-13854115)
chr3 (57-231)||(13396045-13396219)
chr3 (273-343)||(10581045-10581115)
chr3 (384-455)||(9839193-9839264)
chr3 (384-455)||(9850071-9850142)
chr3 (384-455)||(10663858-10663929)
chr3 (63-169)||(11153418-11153524)
chr3 (384-455)||(10032335-10032406)
chr3 (384-455)||(10077601-10077672)
chr3 (384-455)||(10527690-10527761)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (11-453)||(11485372-11485814)
chr8 (23-455)||(44956994-44957425)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (57-455)||(17852262-17852660)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (57-451)||(145278-145672)
scaffold0002 (57-451)||(153583-153977)
scaffold0002 (57-451)||(135227-135621)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (57-454)||(26907230-26907627)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (57-451)||(31679072-31679466)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (63-246)||(29837181-29837364)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (52-221)||(57745-57914)
scaffold0083 (52-148)||(56936-57032)
scaffold0083 (273-343)||(57975-58045)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (57-449)||(826249-826632)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10501350 - 10500906
Alignment:
Q  11 atcatcaccgaattcctccaccactttttggccatgacaataatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaa 110  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10501350 atcatcaccgacttcctccgccgttttttcgccttgagaataatcaaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaatttcttcctatccagtgggtaa 10501251  T
Q  111 tcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttctta 210  Q
    || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10501250 tcttttgggaaaatagaacaataggcaaagcatctttttaaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttctta 10501151  T
Q  211 agttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccacc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10501150 agttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaaccgcctttgaacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccacc 10501051  T
Q  311 acactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtatttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10501050 acactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtatttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaa 10500951  T
Q  411 caatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10500950 caatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 10500906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 455
Target Start/End: Original strand, 11781275 - 11781719
Alignment:
Q  11 atcatcaccgaattcctccaccactttttggccatgacaataatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaa 110  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  11781275 atcatcaccaacttcctccaccacattttcgccttgagaataatcaaggaggccttctgccatccacaacaaaaccagttttttcctctcaagtgggtaa 11781374  T
Q  111 tcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttctta 210  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| ||    
T  11781375 tcctttggaaaaatagaacaataggcgaaacatcttttcaaatgagaaggaagatattgataactcaaatgcaaagcaggcaaaactttatcatttcgta 11781474  T
Q  211 agttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccacc 310  Q
    |||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    
T  11781475 agttccatatattgctgttgagaattgaagtccactccttttcaactacctttgaacgcataagtcctccaagtgtcttggcagctattggcaatccacc 11781574  T
Q  311 acactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtatttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaa 410  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || |||| | |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11781575 acattttttagcaatcttcctgccaatctcttctaggtttgggtatttacggcgatcacagtccttactaccaaatgcatgtttcgagagtaaagaccaa 11781674  T
Q  411 caatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11781675 caatcttcatgagatagaggttctaatgcatgaataggaaatgtg 11781719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 49 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10518223 - 10517817
Alignment:
Q  49 aataatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttt 148  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10518223 aataatcaaggaaaccttctgccatccacaacaaaaccaattttttcctctcaagtgggtaatcctttggaaaaatagaacaataggcgaaacatctttt 10518124  T
Q  149 taaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactct 248  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||||     
T  10518123 caaatgagaaggaagatattgataactcaaatgcaaagcaggcaaaattttatcatttcgtaagttccatatgttgctgtttagaattgaagaccactcc 10518024  T
Q  249 ttttcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagct 348  Q
    ||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  10518023 ttttcaactacctttgaacgcataagtcctccaagtgttttggcagctattggtaacccaccacattttttagcaatcttcctgccaatctcttcaagat 10517924  T
Q  349 ttgggtatttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaatagg 448  Q
    ||||||||||||   || ||  ||| | |  |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  10517923 ttgggtatttactgtgatcactgtccttactaccaaatgcatgttttgagagtaaagaccaacaatcttcatgagatagaggttctaattcctgaatagg 10517824  T
Q  449 aaatgtg 455  Q
    |||||||    
T  10517823 aaatgtg 10517817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10089566 - 10089122
Alignment:
Q  11 atcatcaccgaattcctccaccactttttggccatgacaataatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaa 110  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||   |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10089566 atcatcacctaattcctccatcgcttttcccccatgagaacaatcaaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctatcaagtgggtaa 10089467  T
Q  111 tcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttctta 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||    
T  10089466 tcctttggaaaaattgaacaatatgcaaaacatcttttcaaatgacagggaagatattgataactcaaatgcaaagcaggaagaatattatcatttgata 10089367  T
Q  211 agttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccacc 310  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||    |  |||||| ||| |  |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||    
T  10089366 agttccatatgtcgctgttcaaaattgaagtccactctgttatttctacctttgaacgtagaagtcctcctagtgttttggcagctattggcaatcctcc 10089267  T
Q  311 acactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtatttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaa 410  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||  |||| ||  ||| || | ||| | |   | | |  ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10089266 acacttccttgcaatcttccggccaattgcttcaagggttgtgtttgtactatggggaaacttatcattgcccaatgcatgctttgagagtaaagtccaa 10089167  T
Q  411 caatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    ||||| ||||  || ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10089166 caatcttcatttgacagaagttctaatttatgtataggaaatgtg 10089122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 13333634 - 13333240
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  13333634 aggaagccttctgccatccataacaaaatcaattccttcttgtcaagtggaaaatccttcggaaaaattgagcaataggcaaaacatcttttcaaatgtg 13333535  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  13333534 agggaagatattgataacttagacgcaaagcaggtaaaattgtatcatttggtaagttccatatgtcactatttagaattgcagtccactcttttgcatc 13333435  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
      |||||| |||||| | |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||     
T  13333434 tacctttgaacgcaaaattcctccgagtgttttagcagctatgggcaatccaccacactttttggcaatctttctaccaatttcttctagatttgggtac 13333335  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaa 451  Q
    || | ||    |  |||||||   || ||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  13333334 tttctacctcgacggtcttcacttccgaatgcatgctttgaaagtaacgaccaacagtcatcatctgatagaggatctactttgtgaataggaaa 13333240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10196449 - 10196005
Alignment:
Q  11 atcatcaccgaattcctccaccactttttggccatgacaataatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaa 110  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||   |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10196449 atcatcacctaattcctccatcgcttttcccccatgagaacaatcaaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctatcaagtgggtaa 10196350  T
Q  111 tcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttctta 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||    
T  10196349 tcctttggaaaaattgaacaatatgcaaaacatcttttcaaatgacagggaagatattgataactcaaatgcaaagcaggaagaatattatcatttgata 10196250  T
Q  211 agttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccacc 310  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||    |  |||||| ||| |  |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||    
T  10196249 agttccatatgtcgctgttcaaaattgaagtccactctgttatttctacctttgaacgtagaagtcctcctagtgttttagcagctattggcaatcctcc 10196150  T
Q  311 acactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtatttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaa 410  Q
    |||||| || |||||||||  ||||||  |||| ||  ||| || | ||| | |   | | |  ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10196149 acacttccttgcaatcttcaggccaattgcttcaagggttgtgtttgtactatggggaaacttatcattgcccaatgcatgctttgagagtaaagtccaa 10196050  T
Q  411 caatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    ||||| ||||  || ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10196049 caatcttcatttgacagaagttctaatttatgtataggaaatgtg 10196005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 57 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 13344819 - 13344425
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  13344819 aggaagccttctgccatccataacaaaatcaattccttcttgtccagtggaaaatcctttggaaaaattgagcaataggcaaaacatcttttcaaatgtg 13344720  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||||||||||||||| | |   ||||  || |||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  13344719 agggaagatattgataacttagacgtaaagcaggtaaaatattatcatttggtaagttccatatgtcactatttagaattgcagtccactcttttgcatc 13344620  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
      |||||| |||||| | |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||     
T  13344619 tacctttgaacgcaaaattcctccgagtgttttagcagctatgggcaatccaccacactttttggcaatctttctaccaatttcttctagatttgggtac 13344520  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaa 451  Q
    || | ||    |  |||||||   || ||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  13344519 tttctacctcgacggtcttcacttccgaatgcatgctttgaaagtaacgaccaacagtcatcatctgatagaggatctactttgtgaataggaaa 13344425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10261433 - 10261151
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  10261433 aatcaaggaagccttctgccatccacagcaaaaccaatgtcttcctttcaagtggataatcctttggaaaaattgaacaatatgcaaaacatcttttcaa 10261334  T
Q  152 atgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||    
T  10261333 atgagagggaagatattgataactcaaatgcaaagcaggaagaatattatcatttgataagttccatatgtcgctgttcaaaattgaagtccactctgtt 10261234  T
Q  252 tcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgcc 334  Q
        |  |||||| ||| |  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10261233 atgtctacctttgaacgtagaagtcctccaagtgttttggcagctattggcaatcctccacactttcttgcaatcttcctgcc 10261151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 13171761 - 13171367
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| | || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  13171761 aggaagccttctgccatccataacaaaatcaattccttcttgtccagtggaaaatccttcggaaaaattgagcaataggcaaaacatcttttcaaatgtg 13171662  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||  || |||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  13171661 agggaagatattgataacttagacgcaaagcaggtaaaatattatcatttggtaagttccatatgtcactatttagaattgcagtccactcttttgcatc 13171562  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
      |||||| |||||| | |||||| |||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||     
T  13171561 tacctttgaacgcaaaattcctccgagtgttttaggagctatgggcaatccaccacactttttggcaatctttctaccaatttcttctagatttgggtac 13171462  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaa 451  Q
    || | ||    |  |||||||   || ||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  13171461 tttctacctcgacggtcttcacttccgaatgcatgctttgaaagtaacgaccaacagtcatcatctgatagaggatctactttgtgaataggaaa 13171367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10127704 - 10127381
Alignment:
Q  11 atcatcaccgaattcctccaccactttttggccatgacaataatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaa 110  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||   || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  10127704 atcatcacctaattcctccaactcttttcccccttgagaacaatcaaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaatgtcttcttatcaagtgggaaa 10127605  T
Q  111 tcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttctta 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || | |||  |||||||||  |    
T  10127604 tcctttggaaaaattgaacaatatgcaaaacatcttttcaaatgagagggaagatattgataactcaaatgcaatgcaggaagaatattatcatttcgca 10127505  T
Q  211 agttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccacc 310  Q
    |||||||||||| | | |||| ||||| |||||||||| ||    |  |||||| ||| |  |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||    
T  10127504 agttccatatgttgttgttcaaaattgaagtccactctgttatgtctacctttgaacgtagaagtcctcctagtgttttagcagctattggcaatcctcc 10127405  T
Q  311 acactttctagcaatcttcctgcc 334  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  10127404 acactttcttgcaatcttcctgcc 10127381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 455
Target Start/End: Original strand, 10363132 - 10363535
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  10363132 aatcaaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctatcgagtgggcaatcctttggaaaaattgaacaatatgcaaagcatcttttcaa 10363231  T
Q  152 atgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttt 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||  |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||    
T  10363232 gtgagagggaagatattgataactcaaatgcaaagcaggaagaatattatcatttcgcaagttccatatgttgctgttcaaaattgaagtccactctgtt 10363331  T
Q  252 tcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttg 351  Q
        |  |||||| ||| |  |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  |||    
T  10363332 atgtctacctttgaacggagaagtcctcctagtgttttagcagcaattggcaatcctccacactttcttgcaatcttcctgcctatttcttcaagggttg 10363431  T
Q  352 ggtatttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaa 451  Q
     || | ||| |     | | || ||||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  10363432 tgtttgtactattgtgaaactcatcatttcccagtgcatgctttgagagtaaagtccaacaatcttcatttgatagaagatctaatttatgtataggaaa 10363531  T
Q  452 tgtg 455  Q
    ||||    
T  10363532 tgtg 10363535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10032738 - 10032456
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  10032738 aatcaaggaagccttctgccatccacagcaaaaccaatgtcttcctttcaagtggataatcctttggaaaaattgaacaatatgcaaaacatcttttcaa 10032639  T
Q  152 atgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||    
T  10032638 atgagagggaagatattgataactcaaatgcaatgcaggaagaatattatcatttgataagttccatatgtcgctgttcaaaattgaagtccactctgtt 10032539  T
Q  252 tcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgcc 334  Q
        |  |||||| ||| |  || |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10032538 atgtctacctttgaacgtagaagccctccaagtgttttggcagctattggcaatcctccacactttcttgcaatcttcctgcc 10032456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10664261 - 10663979
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||    
T  10664261 aatcaaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgaacaatatgcaaaacatctcttcaa 10664162  T
Q  152 atgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || | |||  ||||||| |  ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||    
T  10664161 atgagagggaagatattgataactcaaatgcaatgcaggaagaatattatcattgcgcaagttccatatgttgctgttcaaaattgaagtccactctgtt 10664062  T
Q  252 tcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgcc 334  Q
        |  |||||| ||| |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10664061 atgtctacctttgaacgtagaagtcctcctaatgttttagcagctattggcaatcctccacactttcttgcaatcttcctgcc 10663979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 455
Target Start/End: Original strand, 10433337 - 10433781
Alignment:
Q  11 atcatcaccgaattcctccaccactttttggccatgacaataatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaa 110  Q
    ||||| ||| |||||||||| | |||||   || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  10433337 atcattacctaattcctccaactcttttcccccttgagaacaatcaaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctatcgagtgggcaa 10433436  T
Q  111 tcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttctta 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || | |||  ||||||||  ||    
T  10433437 tcctttggaaaaattgaacaatatgcaaagcatcttttcaaacgagagggaagatattgataactcaaatgcaatgcaggaagaatattatcatttgata 10433536  T
Q  211 agttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccacc 310  Q
    ||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||| ||  | |  |||||| ||| || |||||||| | || ||| ||||| || |||||||| ||    
T  10433537 agttccatacgttgctgttcaaaattgaagtccactctgttatatctacctttgaacgtaaaagtcctcctattgttttagcagcaattggcaatcctcc 10433636  T
Q  311 acactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtatttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaa 410  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||  ||| || | ||    |   | | || |||   || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10433637 acactttcttgcaatctccctgcctatttcttcaagggttgtgtttgtattgaggtgaaactcatcactgcccaatgcatgcttcgagagtaaagaccaa 10433736  T
Q  411 caatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    ||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10433737 caatcttcatttgatagaagttctaatttatgtataggaaatgtg 10433781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9839596 - 9839305
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  9839596 aatcaaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaattccttcctatcgagtgggcaatcctttggaaaaattgaacaatatgcaaagcatcttttcaa 9839497  T
Q  152 atgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  ||    
T  9839496 atgagagggaagatattgataactcaaatgcaatgcaggaagaatattatcatttgataagttccatatgtcgctgttcaaaattgaagtccactcactt 9839397  T
Q  252 tcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttc 343  Q
        |  |||||| ||| |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  9839396 atgtctacctttgaacgtagaagtcctcctattgttttagcagctattggcaatcctccacactttcttgcaatcttcctgcctatttcttc 9839305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10672417 - 10672135
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  10672417 aatcgaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaatgtcttcttatcaagtgggaaatcctttggaaaaattgaacaatatgcaaaacatcttttcaa 10672318  T
Q  152 atgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||  |||||||||  ||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||  ||    
T  10672317 atgagagggaagatattgataactcaaatgcaaagcaggaagaatattatcatttcgcaagtttcatatgttgctgttcaaaattgaagtccactcagtt 10672218  T
Q  252 tcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgcc 334  Q
        |  |||||| ||| |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10672217 atgtctacctttgaacgtagaagtcctcctattgttttagcagctattggcaatcctccacactttcttgcaatcttcctgcc 10672135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9850474 - 9850183
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  9850474 aatcaaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctatcgagtgggcaatcctttggaaaaattgaacaatatgcaaagcatcttttcaa 9850375  T
Q  152 atgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || | |||  ||||||||  ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||  ||    
T  9850374 atgagagggaagatattgataactcaaatgcaatgcaggaagaatattatcatttgataagttccatatgtcactgttcaaaattgaagtccactcactt 9850275  T
Q  252 tcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttc 343  Q
        |  |||||| ||| |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  9850274 atgtctacctttgaacgtagaagtcctcctattgttttagcagctattggcaatcctccacactttcttgcaatcttcctgcctatttcttc 9850183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10528093 - 10527802
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  10528093 aatcgaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaatgtcttcttatcaagtgggaaatcctttggaaaaattgaacaatatgcaaaacatcttttcaa 10527994  T
Q  152 atgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||| ||    
T  10527993 atgagagggaagatattgataactcaaatgcaaagcaggaagaatattatcatttgataagttccatacgttgctgttcaaaattgaagtccactctgtt 10527894  T
Q  252 tcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttc 343  Q
        |  |||||| ||| |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  10527893 atgtctacctttgaacgtagaagtcctcctattgttttagcagctattggcaatcctccatactttcttgcaatctttctgcctatttcttc 10527802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 13161710 - 13161316
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  13161710 aggaagccttctgccatccataacaaaatcaattccttcttgtcaagtggaaaatccttcggaaaaattgagcaataggcaaaacatcttttcaaatgtg 13161611  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||  || |||||   |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||  || |    
T  13161610 agggaagatattgataacttagacgcaaagcaggtaaaatatgatcatttggtaagttccatatgtcactatttagaattgtactccactctttagcatc 13161511  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
      |||||| |||||| | ||| || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| || ||||| ||||| || |||||| ||    
T  13161510 tacctttgaacgcaaaattccaccgagcgttttagcagctatgggcaacccaccacattttttggcgatctttctaccaatttcttccagatttgggcat 13161411  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaa 451  Q
    |||| || | ||  | |||||   |||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  13161410 ttactaccaccacggacttcacttccaaatgcatgctttgaaagtaacgaccaacagtcatcatctgatagaggatctactttgtgaataggaaa 13161316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 13290395 - 13290001
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| | |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  13290395 aggaagccttctgccatccataacaaaatcaattccttcttgtcaagtgaaaaatccttcggaaaaattgagcaataggcaaaacatcttttcaaatgtg 13290296  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||  || |||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||  || |    
T  13290295 agggaagatattgataacttagacgcaaagcaggtaaaatattatcatttggtaagttccatatgtcactatttagaattgtactccactctttagcatc 13290196  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
      |||||| |||||| | ||| || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| || ||||| ||||| || |||||| ||    
T  13290195 tacctttgaacgcaaaattccaccgagcgttttagcagctatgggcaacccaccacattttttggcgatctttctaccaatttcttccagatttgggcat 13290096  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaa 451  Q
    |||| || | ||  | |||||   |||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  13290095 ttactaccaccacggacttcacttccaaatgcatgctttgaaagtaacgaccaacagtcatcatctgatagaggatctactttgtgaataggaaa 13290001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 343
Target Start/End: Original strand, 10375187 - 10375470
Alignment:
Q  60 aagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagagg 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  10375187 aagccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctatcaagtgggcaatccttgggaaaaattgaacaatatgcaaaacatcttttcaaatgagagg 10375286  T
Q  160 gaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaaccgc 259  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || | |||   ||||||   |||||||||||  | ||| |||| ||| |  ||||||||| || || |  |    
T  10375287 gaagatattgataactcaaatgcaaagcaggaagaatgtaatcattaggtaagttccatacattgctgttcaaaatggatgtccactctgttacatctac 10375386  T
Q  260 ctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttc 343  Q
    ||||| ||| |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  10375387 ctttgaacgtagaagtcctcctattgttttagcagctattggcaatcctccacactttcttgcaatcttcctgcctatttcttc 10375470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10078007 - 10077713
Alignment:
Q  49 aataatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttt 148  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  10078007 aataatcaagaaagccttctgccatccacagcaaaaccaatttcttcctgtcaagtgtgtgaccctttggaaaaattgaacaatatgcaaaacatatttt 10077908  T
Q  149 taaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactct 248  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || | |||| ||||||||  |||||||||||  |  ||||||| |||||  |||||||||    
T  10077907 caaatgagagggaagacattgataactcaaatgcaaagcaggaagaattttatcatttggtaagttccatacattactattcaaaattgttgtccactct 10077808  T
Q  249 ttttcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttc 343  Q
     ||  | |  |||||| ||  |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  10077807 attatatctacctttgaacctagaagtcctcctattgttttagcagctattggcaatcctccacactttcttgcaatcttcctgcctatttcttc 10077713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 11769969 - 11769566
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaa 151  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  11769969 aatcaaggaatccttctgccatccacaacaaaatcaatttcttcctatcaagtgggtagtcctttggaaaaattgaacaatatgcaaaacatcttttcaa 11769870  T
Q  152 atgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttt 251  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||||||  | || | |||||||||||||||| ||    
T  11769869 gtgagatggaagatattgataacttaaatgcaaagcaggaagaatattatcatttgataagttccatatgtcattgtttaaaattgcagtccactctgtt 11769770  T
Q  252 tcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttg 351  Q
      | |  |||||| ||| |  || ||||| | || | | || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||  |||    
T  11769769 atatctacctttgaacgtagaagccctcctattgttatagcggcaattggcaatcctccacactttcttgcaatcttccttcctatttcttcaagggttg 11769670  T
Q  352 ggtatttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaa 451  Q
     || | ||| | |   | | || |||   || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||||||||    
T  11769669 tgtttgtactatggtgaaactcatcacttcccaatgcatgctttgagagtaaagaccaacaatcttcatttgatagaagttttaattcatgtataggaaa 11769570  T
Q  452 tgtg 455  Q
    ||||    
T  11769569 tgtg 11769566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10184980 - 10184686
Alignment:
Q  49 aataatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttt 148  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| || | ||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  10184980 aataatcaagaaagccttctgccatccacagcaaaaccaatttcttcctgtcatgtgtgtgaccctttggaaaaatagaacaatatgcaaaacatatttt 10184881  T
Q  149 taaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactct 248  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | |||| ||||||||  |||||||||||  | |||||||| |||||  |||||||||    
T  10184880 caaatgagagggaagacattgataactcaaatgcaaagtaggaagaattttatcatttggtaagttccatacattgctattcaaaattgttgtccactct 10184781  T
Q  249 ttttcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttc 343  Q
     ||  | |  |||| | ||  |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  10184780 attatatctaccttcgaacctagaagtcctcctattgttttagcagctattggcaatcctccacactttcttgcaatcttcctgcctatttcttc 10184686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10581345 - 10581176
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  10581345 aatcaaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctatcgagtgggcaatcctttggaaaaattgaacaatatgcaaagcatcttttcaa 10581246  T
Q  152 atgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || | |||  |||||||||  ||||||||||||    
T  10581245 atgagagggaagatattgataactcaaatgcaatgcaggaagaatattatcatttcgcaagttccatatg 10581176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 454
Target Start/End: Original strand, 11159348 - 11159753
Alignment:
Q  49 aataatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttt 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||    
T  11159348 aataatcaaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctatcaagtgtatagtcctttggaaaaatggaacaatatgaaaaacatctttt 11159447  T
Q  149 taaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactct 248  Q
     || || |||||||||||||||||||||| |  ||| |  || ||||   | ||||||  |||||||||||| | | | |||| || | |||||||||||    
T  11159448 caattgggagggaagatattgataactcagaagcaatgcaggtaaaacattgtcatttggtaagttccatattttgttgttcaaaacttcagtccactct 11159547  T
Q  249 ttttcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagct 348  Q
    ||  || |    || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||  || |||||  ||||||| |    
T  11159548 ttggcatctcttttcgaacgcaatactcctccaagtgtttttgcagctatgggcaacccagcacactttcttgcaatctgtctaccaattgcttctaggt 11159647  T
Q  349 ttgggtatttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaatagg 448  Q
    ||| |  ||||     |  | ||| ||||   |||||||||||||| |||||||||| |||   ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  11159648 ttgagcctttattgtcacaaaagttttcacttccaaatgcatgctttgagagtaaagaccatgtatcttcattagataaaacttctaatttatgaatagg 11159747  T
Q  449 aaatgt 454  Q
    ||||||    
T  11159748 aaatgt 11159753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8862016 - 8861619
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| || || |    
T  8862016 aggaagccttctgccatccacaacaataccaattgcttcctattaagtgaatagtcctttggaaaaatggaacaatatgaaaaacatcttttcaattggg 8861917  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| |  || ||||   | ||||||  |||||||||||| | | | |||| || | |||||||||||||  || |    
T  8861916 agggaagatattgataactcagaagcaatgcaggtaaaacattgtcatttggtaagttccatattttgttgttcaaaacttcagtccactctttggcatc 8861817  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
        || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| |||| | ||    
T  8861816 tcttttcgaacgcaatactcctccaagtgtttttgcagctatgggcaacccagcacactttcttgcaatctttctaccaattgcttctaggtttgagcat 8861717  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgt 454  Q
    |||     |  | ||| ||||   |||||||||||||| |||||||||| |||   ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  8861716 ttattgtcacaaaagttttcacttccaaatgcatgctttgagagtaaagaccatgtatcttcattagataaaacttctaatttatgaataggaaatgt 8861619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 454
Target Start/End: Original strand, 11130365 - 11130762
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| || || |    
T  11130365 aggaagccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctataaagtgtatagtcctttggaaaaatggaacaatatgaaaaacatcttttcaattggg 11130464  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| |  || || |   | ||||||  |||||||||||| | | | | || || | |||||||||||||  || |    
T  11130465 agggaagatattgataactcagaagcaatgcaggtaacacattgtcatttggtaagttccatattttgttgtccaaaacttcagtccactctttagcatc 11130564  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
        || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| |||| | ||    
T  11130565 tcttttcgaacgcaatactcctccaagtgtttttgcagctatgggcaacccagcacactttcttgcaatctttctaccaattgcttctaggtttgagcat 11130664  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgt 454  Q
    |||     |  | ||| ||||   |||||||||||||| |||||||||| |||   ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  11130665 ttattgtcacaaaagttttcacttccaaatgcatgctttgagagtaaagaccatgtatcttcattagataaaacttctaatttatgaataggaaatgt 11130762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 454
Target Start/End: Original strand, 11148193 - 11148590
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||  || |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| || || |    
T  11148193 aggaagccttctgccatccacaacaataccaattgattcctattaagtgaatagtcctttggaaaaatggaacaatatgaaaaacatcttttcaattggg 11148292  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| |  || || |   | ||||||  |||||||||||| | | | |||| || | |||||||||||||  || |    
T  11148293 agggaagatattgataactcagaagcaatgcaggtaacacattgtcatttggtaagttccatattttgttgttcaaaacttcagtccactctttggcatc 11148392  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
        |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| |||| | ||    
T  11148393 tctttttgaacgcaatactcctccaagtgtttttgcagctatgggcaacccaacacactttcttgcaatctttctaccaattgcttctaggtttgagcat 11148492  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgt 454  Q
    |||     |  | ||| ||||   |||||||||||||| |||||||||| |||   ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  11148493 ttattgtcacaaaagttttcacttccaaatgcatgctttgagagtaaagaccatgtatcttcattagataaaacttctaatttatgaataggaaatgt 11148590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10890034 - 10889766
Alignment:
Q  59 gaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagag 158  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || |||    
T  10890034 gaagccttctgccatccacaacaaaaccaatttcttcctatcaagtgtatagtcctttggaaaaatggaacagtatgaaaaacatcttttcaattgggag 10889935  T
Q  159 ggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaaccg 258  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| |  || ||||   | ||||||  |||||||||||| | | | |||| || | ||||||| |||||  || |      
T  10889934 ggaagatattgataactcagaagcaatgcaggtaaaacattgtcatttggtaagttccatattttgttgttcaaaacttcagtccattctttggcatctc 10889835  T
Q  259 cctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatct 327  Q
      || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  10889834 ttttcgaacgcaatactcctccaagtgtttttgcagctatgggcaacccagcacactttcttgcaatct 10889766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 177
Target Start/End: Original strand, 11245960 - 11246080
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  11245960 aggaagccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctatcaagtggatagtccttcggaaaaatcgaacaataggcaaaacatcttttcaattgag 11246059  T
Q  157 agggaagatattgataactca 177  Q
    ||| |||||||||||| ||||    
T  11246060 aggaaagatattgatagctca 11246080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 153
Target Start/End: Original strand, 13854014 - 13854115
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  13854014 aatcaaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctatcaagtgggtagtcctttggaaaaattgaacaatatgcaaaacatcttttcaa 13854113  T
Q  152 at 153  Q
    ||    
T  13854114 at 13854115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13396219 - 13396045
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  || ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  13396219 aggaagccttctgccatccacaacaaaatcaatttcttcctattaaagggatagccctttggaaaaatcgagcaataggcaaaacatcttttcaaatggg 13396120  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattca 231  Q
    | ||||||| ||||||  ||| | ||||||  |||| |||  ||||||||  || |||||||||||| |||||||    
T  13396119 aaggaagatgttgatatgtcagaaacaaagaaggcataatattatcatttggtatgttccatatgtcactattca 13396045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10581115 - 10581045
Alignment:
Q  273 agtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttc 343  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10581115 agtcctcctagtgttttagcagctattggcaatcccccacaccttcttgcaatcttcctgccaatttcttc 10581045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 9839264 - 9839193
Alignment:
Q  384 aatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  9839264 aatgcatgctttgagagtaaagaccaacaatcttcatttgatagaagatctaatttatgtattggaaatgtg 9839193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 9850142 - 9850071
Alignment:
Q  384 aatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  9850142 aatgcatgctttgagagtaaagaccaacaatcttcatttgatagaagatctaatttatgtattggaaatgtg 9850071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10663929 - 10663858
Alignment:
Q  384 aatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10663929 aatgcatgctttgaaagtaaggaccaacaatcttcatttgatagaagttctaatttatgtataggaaatgtg 10663858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 169
Target Start/End: Original strand, 11153418 - 11153524
Alignment:
Q  63 ccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagagggaa 162  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||   || ||||| ||||||||||  ||||| |  ||| |  |||| |||||||||||||    
T  11153418 ccttcagccatccacaacaaaaccaactgcttcctatcaagttcatagtccttcggaaaaattggacaataagaaaaatacattttcaaatgagagggaa 11153517  T
Q  163 gatattg 169  Q
    |||||||    
T  11153518 gatattg 11153524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10032406 - 10032335
Alignment:
Q  384 aatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||| || || ||| ||||||||||||    
T  10032406 aatgcatgctttgagagtaaagaccaacaatcttcatttgatagaagttttagttcatgtataggaaatgtg 10032335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10077672 - 10077601
Alignment:
Q  384 aatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10077672 aatgcatgctttgaaagtaaataccaacaatcttcatttgataaaggttctaatatatgtataggaaatgtg 10077601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10527761 - 10527690
Alignment:
Q  384 aatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||| | ||| || |||||| ||||||||||||    
T  10527761 aatgcatgctttgagagtaaagaccaacaatcttcatttgataaaagttttagtttatgtataggaaatgtg 10527690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 11485814 - 11485372
Alignment:
Q  11 atcatcaccgaattcctccaccactttttggccatgacaataatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11485814 atcatcgccgaattcctccaccactttttggccatgacaataatccaggaagccttctgccatccacaacaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaa 11485715  T
Q  111 tcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttctta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||| |||    
T  11485714 tcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagagggaagatattgataactcaaatgcaaagctggcaggattgtatcatttttta 11485615  T
Q  211 agttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccacc 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11485614 agttccatatgtcgctatgcagaattgtagtccactccttttcaactacctttgaatgcattagtcctccaagtgcttttgcagcaattggcaatccacc 11485515  T
Q  311 acactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtatttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaa 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11485514 acactttctagcaatcttcctgccaatctcttctaggtttgggtatttaccccgaagaaattcttcaccgccaaatgcatgcttcgagagtaaagaccaa 11485415  T
Q  411 caatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatg 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11485414 caatcttcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatg 11485372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 455
Target Start/End: Original strand, 44956994 - 44957425
Alignment:
Q  23 ttcctccaccactttttggccatgacaataatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaa 122  Q
    ||||||| |||||||||  || ||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| || ||||  ||||| |||||||||||    
T  44956994 ttcctccgccactttttcaccttgagaaatatcaaggaagccttctgccatccataacaaaaccatttttttcttagcaagcaggtaaccctttggaaaa 44957093  T
Q  123 attgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgt 222  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44957094 atagaacaataggcgaaacatcttttcaaatgagaaggaagatattgataactcaaatgcaaagcaggcaaaattgtatcatttcgttagttccatatgt 44957193  T
Q  223 cgctattcagaattgcagtccactctttttcaaccgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagc 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| |||||  |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  44957194 cgctattcagaattgaagtccactccttttcaactatctttgaacgcataagtcctcccagtgttttggcagctattggcaatccaccacattttttagc 44957293  T
Q  323 aatcttcctgccaatctcttctagctttgggtatttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||||     ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  44957294 aatcttcctgccaatctcttctaggtttgggta-ttaccttgaacacggtcttcgctgtcaaatgcatgctttgagagtaaagaccaacaatcttcatca 44957392  T
Q  423 gatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44957393 gatagaggttctaatttatgaatcggaaatgtg 44957425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 57 - 455
Target Start/End: Original strand, 17852262 - 17852660
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||    
T  17852262 aggaatccttctgccatccacaacaaaaccaatttcttcctatcaaatgagtaatcctttgagaaaattgaacaatatgcaaaacatattttcaaatgag 17852361  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||  || | |||| ||||||||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17852362 acggaagatattgataactcaaatgcaaagccgggagaattttatcattttgtaattgccatatatcgctattcagaattgcagtccactcattttcatc 17852461  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
      |||| |  |||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||    
T  17852462 taccttcgagcgcattagtccaccgagtgctttggcagctattggcaagccatcacactttctagatatcttcctgccaattgcttctaaatttgagtat 17852561  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgtg 455  Q
    ||||   || ||  ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17852562 ttactgtgaccaaggtcttcacctccaaatgcatgctttgagagcaaagaccaacaatcttcatcggatataggttctaatttatgaattggaaatgtg 17852660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 451
Target Start/End: Original strand, 145278 - 145672
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  145278 aggaagccttctgccatccataacaaaatcaattccttcttgtcaagtggaaaatccttcggaaaaattgagcaataggcaaaacatcttttcaaatgtg 145377  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  145378 agggaagatattgataacttagacgcaaagcaggtaaaattgtatcatttggtaagttccatatgtcactatttagaattgcagtccactcttttgcatc 145477  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
      |||||| |||||| | |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||     
T  145478 tacctttgaacgcaaaattcctccgagtgttttagcagctatgggcaatccaccacactttttggcaatctttctaccaatttcttctagatttgggtac 145577  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaa 451  Q
    || | ||    |  |||||||   || ||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  145578 tttctacctcgacggtcttcacttccgaatgcatgctttgaaagtaacgaccaacagtcatcatctgatagaggatctactttgtgaataggaaa 145672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 451
Target Start/End: Original strand, 153583 - 153977
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  153583 aggaagccttctgccatccataacaaaatcaattccttcttgtcaagtggaaaatccttcggaaaaattgagcaataggcaaaacatcttttcaaatgtg 153682  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  153683 agggaagatattgataacttagacgcaaagcaggtaaaattgtatcatttggtaagttccatatgtcactatttagaattgcagtccactcttttgcatc 153782  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
      |||||| |||||| | |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||     
T  153783 tacctttgaacgcaaaattcctccgagtgttttagcagctatgggcaatccaccacactttttggcaatctttctaccaatttcttctagatttgggtac 153882  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaa 451  Q
    || | ||    |  |||||||   || ||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  153883 tttctacctcgacggtcttcacttccgaatgcatgctttgaaagtaacgaccaacagtcatcatctgatagaggatctactttgtgaataggaaa 153977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 451
Target Start/End: Original strand, 135227 - 135621
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| | || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  135227 aggaagccttctgccatccataacaaaatcaattccttcttgtccagtggaaaatccttcggaaaaattgagcaataggcaaaacatcttttcaaatgtg 135326  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||  || |||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  135327 agggaagatattgataacttagacgcaaagcaggtaaaatattatcatttggtaagttccatatgtcactatttagaattgcagtccactcttttgcatc 135426  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
      |||||| |||||| | |||||| |||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||     
T  135427 tacctttgaacgcaaaattcctccgagtgttttaggagctatgggcaatccaccacactttttggcaatctttctaccaatttcttctagatttgggtac 135526  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaa 451  Q
    || | ||    |  |||||||   || ||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  135527 tttctacctcgacggtcttcacttccgaatgcatgctttgaaagtaacgaccaacagtcatcatctgatagaggatctactttgtgaataggaaa 135621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26907627 - 26907230
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||||    
T  26907627 aggaagccttctgccatccacaacaagaccaattgctttctatcaagtggataatcctttggaaaaagtgaacaatatgcaaaacatcttttcaaatgag 26907528  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||  || | |||  ||||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||| ||    |    
T  26907527 agggaaggtattgataactcaaatgcaaagctggaagaatattatcatttcgtaagttccatacgtcgttgttcaaaattgaagtccactctgttatgtc 26907428  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
      |||||| ||| |  | |||||| |||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||      
T  26907427 tacctttgaacgtagaattcctcctagtgttttagcagcaattggcaatcctccacactttcttgcaatcttcctgccaatttcttcgagggttgtgtta 26907328  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaatgt 454  Q
     ||| | |   | | |||| |   || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26907327 atactatggtgaaactctttacttcccaatgcatgctttgagagtaaagaccaacaatcttcagttgatagaggttctaatttatgtataggaaatgt 26907230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 451
Target Start/End: Original strand, 31679072 - 31679466
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  31679072 aggaagccttcagccatccacagcaaaaccatttgcttcctatcaagaggataatcctttgggaaaattgaacaataagcgaaacatgttttcaaatgag 31679171  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||| |  || | ||   ||||||||   || |||||||||||  | || | ||||||| ||||||||||  || |    
T  31679172 aaggaagatattgataactcaaaagcaaggcagggagaacattatcatttggaaaattccatatgtcattgtttaaaattgcactccactctttcgcatc 31679271  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
    | | ||||  || |  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||    
T  31679272 cacttttgagcgtagaagtcctccaagtgttttggcagctattggcaatccgcaacacttttttgcaatcttcctaccaattgcttctaggcttgggtat 31679371  T
Q  357 ttaccacgaacatag-tcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaataggaaa 451  Q
    ||||  |  ||| || ||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31679372 ttacggc-cacaaagttcttcacttccaaatgcatgctttgagagtaaagaccagcaatcatcatctgatagaggttctaatttatagataggaaa 31679466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29837364 - 29837181
Alignment:
Q  63 ccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgagagggaa 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  29837364 ccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcctatcaagttgataatcctttggaaaaattgaacaataggcgaaacatcttttcaagtgacaaggaa 29837265  T
Q  163 gatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccact 246  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |  ||||  | | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29837264 gatcttgataactcaaatgcaatgcaggcatgactttatcatttgataagttccatatgtcactattcagaattgcattccact 29837181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Original strand, 57745 - 57914
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaa 151  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  57745 aatcaaggaaaccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcttatcgagtgggcaatcctttggaaaaattgaacaatatgcaaagcatcttttcaa 57844  T
Q  152 atgagagggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||  |||||||||  ||||||||||||    
T  57845 atgagagggaagatattgataactcaaatgcaaagcaggaagaatattatcatttcgcaagttccatatg 57914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 148
Target Start/End: Original strand, 56936 - 57032
Alignment:
Q  52 aatccaggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttt 148  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  56936 aatcaaggaaaccttctgccatccacaacaaaaccaattgcttcttatcgagtgggcaatcctttggaaaaattgaacaatatgcaaagcatctttt 57032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 343
Target Start/End: Original strand, 57975 - 58045
Alignment:
Q  273 agtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttc 343  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  57975 agtcctcctagtgttttagcagctattggcaatcccccacaccttcttgcaatcttcctgccaatttcttc 58045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 826632 - 826249
Alignment:
Q  57 aggaagccttctgccatccacaagaaaaccaatttcttcctatcaagtgggtaatcctttggaaaaattgagcaataggcgaaacatctttttaaatgag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  826632 aggaagccttctgccatccacaacaaaaccaaatgctttttttcaaggggataacccttgggaaaaattgagcaatagacgaaacatcttttcaaatgag 826533  T
Q  157 agggaagatattgataactcaaatacaaagtgggcaaaattgtatcatttcttaagttccatatgtcgctattcagaattgcagtccactctttttcaac 256  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  |||||  |||| |||  ||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||  ||| | |||||||| ||| ||      
T  826532 agggaaggtatagataactcaaaagcaaagcaggcagaatgttattatttggtatgttccatatgttgctgttcaagatttcggtccactcctttgcatt 826433  T
Q  257 cgcctttggacgcaatagtcctccaagtgcttttgcagctatcggcaatccaccacactttctagcaatcttcctgccaatctcttctagctttgggtat 356  Q
       |||||  | ||| || ||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||  ||||||   ||||||||    
T  826432 taactttgagctcaaaagccctcctagcgttttggcagctattggcaatccaccacacttttttgcaatcttcttcccaattgcttctaaggttgggtat 826333  T
Q  357 ttaccacgaacatagtcttcatcaccaaatgcatgcttcgagagtaaagtccaacaatcatcatcagatagaggttctaatttatgaatagga 449  Q
    |||        || |||  ||   |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  826332 tta--------at-gtcaccacttccaaatgcatacttggagagtaaagaccaacaatgttcgtccgatagaggttccaatttatgaatagga 826249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University