View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18265_high_3 (Length: 357)

Name: NF18265_high_3
Description: NF18265
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18265_high_3
NF18265_high_3
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-304)||(20274-20567)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (11-269)||(19807-20065)
scaffold0122 (11-269)||(24111-24369)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (11-357)||(1427-1775)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (11-343)||(7283913-7284244)
chr7 (54-343)||(3895088-3895376)
chr7 (54-343)||(44865293-44865582)
chr7 (54-343)||(15822327-15822615)
chr7 (54-342)||(143703-143991)
chr7 (54-332)||(35094890-35095166)
chr7 (50-345)||(47289842-47290138)
chr7 (54-343)||(39046523-39046807)
chr7 (54-357)||(45452063-45452367)
chr7 (54-343)||(12369735-12370024)
chr7 (54-343)||(11287480-11287768)
chr7 (54-343)||(12759050-12759340)
chr7 (54-343)||(13862828-13863114)
chr7 (54-343)||(12248015-12248305)
chr7 (54-343)||(26070161-26070448)
chr7 (54-343)||(26093948-26094235)
chr7 (55-343)||(16569902-16570190)
chr7 (55-343)||(16595472-16595760)
chr7 (21-343)||(17223797-17224122)
chr7 (13-343)||(13377592-13377924)
chr7 (54-343)||(49047569-49047858)
chr7 (11-85)||(111126-111200)
chr7 (95-343)||(16914866-16915112)
chr7 (50-343)||(9838942-9839236)
chr7 (21-269)||(14271760-14272009)
chr7 (11-85)||(32493903-32493977)
chr7 (54-343)||(13274850-13275129)
chr7 (50-343)||(48356707-48357001)
chr7 (272-343)||(3049646-3049717)
chr7 (11-85)||(1936874-1936948)
chr7 (50-343)||(9611370-9611665)
chr7 (54-343)||(31501236-31501526)
chr7 (11-85)||(126739-126813)
chr7 (13-85)||(3060272-3060344)
chr7 (16-269)||(34241063-34241317)
chr7 (272-343)||(42056410-42056481)
chr7 (272-341)||(2028986-2029055)
chr7 (272-340)||(2190307-2190375)
chr7 (272-343)||(111390-111461)
chr7 (272-343)||(126478-126549)
chr7 (54-314)||(28722202-28722464)
chr7 (272-343)||(32494167-32494238)
chr7 (13-70)||(13389693-13389750)
chr7 (279-343)||(9723927-9723991)
chr7 (279-343)||(46474064-46474128)
chr7 (257-343)||(16919622-16919708)
chr7 (54-127)||(25124407-25124482)
chr7 (207-343)||(17947641-17947776)
chr7 (13-69)||(16919870-16919926)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (11-343)||(15324-15655)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (11-342)||(6261-6591)
scaffold0310 (45-343)||(1-298)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (11-343)||(11584114-11584448)
chr5 (54-342)||(21397156-21397444)
chr5 (54-343)||(28261584-28261867)
chr5 (54-356)||(24183027-24183332)
chr5 (54-339)||(4865330-4865613)
chr5 (54-343)||(11337081-11337370)
chr5 (54-343)||(1168100-1168388)
chr5 (54-343)||(20712139-20712428)
chr5 (54-343)||(21646636-21646923)
chr5 (121-357)||(24475629-24475861)
chr5 (54-342)||(19405601-19405891)
chr5 (93-357)||(21906766-21907011)
chr5 (13-343)||(19862272-19862604)
chr5 (54-343)||(3673925-3674215)
chr5 (76-245)||(23981433-23981603)
chr5 (54-343)||(23493982-23494272)
chr5 (13-343)||(21222462-21222792)
chr5 (13-343)||(5450695-5451027)
chr5 (54-338)||(16595576-16595860)
chr5 (54-343)||(432526-432815)
chr5 (54-343)||(7728483-7728774)
chr5 (54-269)||(21310603-21310819)
chr5 (54-343)||(28902254-28902545)
chr5 (54-343)||(28938649-28938940)
chr5 (50-343)||(21617079-21617374)
chr5 (272-343)||(21650758-21650829)
chr5 (54-269)||(21297069-21297285)
chr5 (54-223)||(23466619-23466787)
chr5 (272-343)||(2031873-2031944)
chr5 (272-343)||(11342748-11342819)
chr5 (272-332)||(21205000-21205060)
chr5 (114-255)||(22885792-22885932)
chr5 (279-343)||(23417304-23417368)
chr5 (274-345)||(22053963-22054034)
chr5 (304-343)||(23466520-23466559)
chr5 (89-174)||(6456852-6456937)
chr5 (13-171)||(37983598-37983758)
chr5 (277-345)||(18531200-18531268)
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (54-357)||(13817561-13817862)
chr3 (54-343)||(19570586-19570872)
chr3 (54-343)||(317405-317692)
chr3 (54-343)||(16181842-16182129)
chr3 (54-343)||(22144167-22144456)
chr3 (54-343)||(50111946-50112235)
chr3 (54-343)||(16995956-16996243)
chr3 (54-342)||(54424076-54424364)
chr3 (54-343)||(12349434-12349723)
chr3 (54-342)||(6154226-6154514)
chr3 (54-342)||(14298485-14298773)
chr3 (54-342)||(14304112-14304400)
chr3 (54-339)||(17100720-17101004)
chr3 (54-339)||(17101405-17101689)
chr3 (54-294)||(38527841-38528079)
chr3 (54-343)||(8631853-8632142)
chr3 (54-343)||(35123759-35124047)
chr3 (54-343)||(14295501-14295790)
chr3 (54-343)||(14301128-14301417)
chr3 (54-329)||(34439237-34439513)
chr3 (54-343)||(17938637-17938925)
chr3 (49-343)||(17522780-17523073)
chr3 (113-343)||(55440803-55441033)
chr3 (143-343)||(53898440-53898639)
chr3 (54-357)||(3578135-3578440)
chr3 (54-343)||(11060902-11061190)
chr3 (158-343)||(19260839-19261023)
chr3 (175-343)||(6146763-6146930)
chr3 (54-343)||(11328859-11329145)
chr3 (54-158)||(6146664-6146769)
chr3 (54-343)||(17139571-17139861)
chr3 (54-188)||(14527975-14528110)
chr3 (130-304)||(11196291-11196457)
chr3 (11-85)||(7854306-7854380)
chr3 (58-357)||(14059112-14059414)
chr3 (11-85)||(54037981-54038055)
chr3 (54-339)||(16880190-16880477)
chr3 (113-343)||(39656589-39656817)
chr3 (54-343)||(12560131-12560420)
chr3 (11-85)||(3992874-3992948)
chr3 (13-340)||(17191607-17191936)
chr3 (11-85)||(55513194-55513268)
chr3 (93-343)||(12488662-12488910)
chr3 (21-343)||(3576298-3576622)
chr3 (11-85)||(2844515-2844589)
chr3 (266-343)||(14528118-14528196)
chr3 (11-85)||(15857120-15857194)
chr3 (13-245)||(17204841-17205076)
chr3 (263-343)||(12349834-12349914)
chr3 (272-343)||(3992613-3992684)
chr3 (272-343)||(38167977-38168048)
chr3 (11-85)||(19232090-19232164)
chr3 (132-343)||(15876131-15876341)
chr3 (272-343)||(2844254-2844325)
chr3 (54-343)||(14814658-14814949)
chr3 (272-343)||(16261516-16261587)
chr3 (272-343)||(53771104-53771175)
chr3 (11-85)||(17955837-17955915)
chr3 (54-343)||(30207279-30207570)
chr3 (272-343)||(30153005-30153076)
chr3 (272-343)||(54685422-54685493)
chr3 (11-85)||(16743998-16744072)
chr3 (13-180)||(13301323-13301491)
chr3 (13-180)||(13311979-13312147)
chr3 (13-90)||(38810868-38810945)
chr3 (54-245)||(14080669-14080863)
chr3 (21-88)||(15550919-15550986)
chr3 (272-343)||(23492436-23492507)
chr3 (272-343)||(33341944-33342015)
chr3 (11-85)||(45581955-45582029)
chr3 (159-245)||(47784767-47784853)
chr3 (159-343)||(12953027-12953210)
chr3 (55-255)||(33368822-33369024)
chr3 (279-343)||(11638420-11638484)
chr3 (54-180)||(11882113-11882240)
chr3 (272-343)||(7854045-7854116)
chr3 (13-68)||(12031849-12031904)
chr3 (276-343)||(17956109-17956176)
chr3 (272-343)||(45581694-45581765)
chr3 (54-127)||(51961031-51961106)
chr3 (114-188)||(15517848-15517921)
chr3 (54-188)||(9590648-9590784)
chr3 (207-343)||(43427565-43427700)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (54-357)||(11548-11852)
scaffold0359 (54-343)||(1380-1667)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (54-357)||(14923-15224)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (54-343)||(55376494-55376781)
chr4 (54-343)||(23269829-23270118)
chr4 (54-343)||(53704629-53704917)
chr4 (54-357)||(34395303-34395609)
chr4 (54-343)||(44346890-44347177)
chr4 (58-343)||(8872372-8872655)
chr4 (54-343)||(44055978-44056266)
chr4 (54-343)||(30457966-30458255)
chr4 (54-357)||(53907604-53907897)
chr4 (54-343)||(12837096-12837384)
chr4 (54-357)||(16732215-16732520)
chr4 (54-343)||(21959359-21959647)
chr4 (73-343)||(45458769-45459039)
chr4 (54-357)||(819826-820114)
chr4 (54-245)||(20813442-20813634)
chr4 (54-343)||(52265403-52265692)
chr4 (54-343)||(27961034-27961324)
chr4 (54-343)||(30232391-30232680)
chr4 (54-343)||(13809405-13809694)
chr4 (54-343)||(15044891-15045181)
chr4 (50-343)||(7185735-7186028)
chr4 (54-343)||(18494224-18494512)
chr4 (135-343)||(47535042-47535249)
chr4 (54-343)||(15109243-15109533)
chr4 (13-343)||(41165808-41166130)
chr4 (11-85)||(5682385-5682459)
chr4 (11-85)||(54118125-54118199)
chr4 (54-343)||(41256263-41256553)
chr4 (11-85)||(25119064-25119138)
chr4 (13-343)||(15013137-15013466)
chr4 (95-343)||(18276497-18276743)
chr4 (272-343)||(14951825-14951896)
chr4 (272-343)||(15272433-15272504)
chr4 (54-343)||(14901295-14901584)
chr4 (274-343)||(10104380-10104449)
chr4 (272-328)||(5682648-5682704)
chr4 (279-343)||(13590194-13590258)
chr4 (54-242)||(7964606-7964796)
chr4 (272-343)||(25119328-25119399)
chr4 (274-339)||(15675219-15675284)
chr4 (266-343)||(40885676-40885753)
chr4 (13-70)||(47534933-47534990)
chr4 (207-343)||(50219989-50220124)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (54-343)||(254710-254998)
scaffold0011 (54-343)||(261316-261604)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (54-343)||(37611731-37612020)
chr8 (54-343)||(22234700-22234987)
chr8 (54-343)||(20573087-20573376)
chr8 (54-343)||(19992952-19993238)
chr8 (54-343)||(41246721-41247009)
chr8 (54-343)||(20481668-20481955)
chr8 (54-338)||(20561526-20561810)
chr8 (54-229)||(25122618-25122793)
chr8 (54-342)||(21681066-21681356)
chr8 (13-343)||(21198005-21198336)
chr8 (45-343)||(23837261-23837561)
chr8 (58-158)||(7000524-7000624)
chr8 (54-343)||(39446660-39446950)
chr8 (197-357)||(20653944-20654106)
chr8 (54-328)||(22981351-22981622)
chr8 (211-357)||(20647882-20648030)
chr8 (13-245)||(17285364-17285600)
chr8 (13-343)||(29306480-29306813)
chr8 (13-343)||(5854677-5855007)
chr8 (54-148)||(20529748-20529843)
chr8 (13-343)||(33528488-33528819)
chr8 (11-85)||(16404857-16404931)
chr8 (11-85)||(24716719-24716793)
chr8 (11-85)||(39115599-39115673)
chr8 (11-85)||(274767-274841)
chr8 (11-85)||(641008-641082)
chr8 (11-85)||(826814-826888)
chr8 (50-343)||(26011557-26011848)
chr8 (50-343)||(15933361-15933655)
chr8 (132-343)||(38533712-38533922)
chr8 (272-343)||(16039002-16039073)
chr8 (272-342)||(274507-274577)
chr8 (272-342)||(641272-641342)
chr8 (272-342)||(827078-827148)
chr8 (272-343)||(41506930-41507001)
chr8 (50-343)||(22742827-22743122)
chr8 (272-343)||(39115338-39115409)
chr8 (279-343)||(22497329-22497393)
chr8 (235-342)||(22735914-22736021)
chr8 (137-269)||(25296295-25296426)
chr8 (137-269)||(25758315-25758446)
chr8 (272-343)||(24716983-24717054)
chr8 (54-174)||(31194217-31194340)
chr8 (135-253)||(23151810-23151928)
chr8 (114-188)||(27233047-27233120)
chr8 (54-241)||(38635541-38635731)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (54-343)||(5143-5430)
scaffold0480 (54-343)||(8776-9066)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (54-343)||(23836601-23836889)
chr2 (54-342)||(25875816-25876102)
chr2 (54-343)||(32465921-32466207)
chr2 (54-343)||(271233-271521)
chr2 (54-343)||(4448028-4448317)
chr2 (54-343)||(36890581-36890869)
chr2 (54-357)||(25602070-25602377)
chr2 (54-343)||(28974112-28974400)
chr2 (54-295)||(27261915-27262156)
chr2 (54-343)||(24571188-24571476)
chr2 (54-345)||(22579758-22580045)
chr2 (49-343)||(68055-68351)
chr2 (13-343)||(43645956-43646289)
chr2 (11-88)||(15633535-15633612)
chr2 (54-339)||(31146073-31146360)
chr2 (11-85)||(19794586-19794660)
chr2 (11-85)||(20627195-20627269)
chr2 (11-85)||(22275046-22275120)
chr2 (11-85)||(22284279-22284353)
chr2 (241-343)||(6879500-6879601)
chr2 (13-187)||(19660098-19660273)
chr2 (11-85)||(43642838-43642912)
chr2 (13-245)||(19666688-19666921)
chr2 (21-202)||(25305634-25305818)
chr2 (54-266)||(722531-722742)
chr2 (54-232)||(23821534-23821713)
chr2 (54-232)||(23830613-23830792)
chr2 (276-343)||(21274174-21274241)
chr2 (272-343)||(22274785-22274856)
chr2 (207-343)||(9636808-9636943)
chr2 (54-150)||(19669003-19669101)
chr2 (279-343)||(25305508-25305573)
chr2 (279-343)||(19433452-19433516)
chr2 (272-332)||(22284029-22284089)
chr2 (285-343)||(22775331-22775389)
chr2 (285-343)||(22780709-22780767)
chr2 (274-339)||(24341519-24341584)
chr2 (274-343)||(25265520-25265589)
chr2 (276-340)||(9653021-9653085)
chr2 (279-343)||(16292921-16292985)
chr2 (279-343)||(25595083-25595147)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (54-343)||(207-496)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (54-343)||(22403005-22403294)
chr1 (54-343)||(49967713-49968002)
chr1 (61-343)||(41212135-41212415)
chr1 (54-343)||(9783959-9784245)
chr1 (54-343)||(35054819-35055108)
chr1 (95-343)||(21718291-21718537)
chr1 (54-232)||(35522247-35522426)
chr1 (13-343)||(20177238-20177570)
chr1 (159-343)||(27329757-27329939)
chr1 (272-343)||(35522432-35522503)
chr1 (11-85)||(41218729-41218803)
chr1 (54-343)||(16645975-16646266)
chr1 (13-222)||(13376711-13376923)
chr1 (54-343)||(16656701-16656992)
chr1 (54-343)||(51627558-51627848)
chr1 (11-85)||(21860335-21860409)
chr1 (50-343)||(37233750-37234044)
chr1 (12-85)||(44034829-44034902)
chr1 (13-343)||(17608991-17609322)
chr1 (11-85)||(41394528-41394602)
chr1 (54-265)||(19603238-19603449)
chr1 (13-343)||(21195077-21195408)
chr1 (54-245)||(22143256-22143448)
chr1 (272-342)||(15861547-15861617)
chr1 (272-343)||(21860074-21860145)
chr1 (272-343)||(44035092-44035163)
chr1 (54-255)||(8537803-8538007)
chr1 (54-255)||(8603042-8603246)
chr1 (297-343)||(9784238-9784284)
chr1 (274-339)||(20445747-20445812)
chr1 (274-339)||(20531512-20531577)
chr1 (272-343)||(22367082-22367152)
chr1 (13-84)||(27675120-27675191)
chr1 (279-343)||(25093922-25093986)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (54-343)||(11603-11892)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (54-343)||(22754-23043)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (54-340)||(4351-4635)
[»] scaffold0016 (6 HSPs)
scaffold0016 (54-343)||(164278-164565)
scaffold0016 (11-85)||(166121-166195)
scaffold0016 (12-85)||(162036-162109)
scaffold0016 (13-90)||(116410-116487)
scaffold0016 (272-343)||(162299-162370)
scaffold0016 (272-343)||(166385-166456)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (54-343)||(717-1006)
scaffold0673 (63-343)||(6749-7029)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (54-343)||(10000-10289)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (54-343)||(25274-25563)
scaffold0158 (153-343)||(25021-25210)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (54-332)||(18570353-18570630)
chr6 (54-343)||(32898853-32899142)
chr6 (54-343)||(22440997-22441285)
chr6 (54-340)||(13014603-13014890)
chr6 (54-343)||(16106579-16106868)
chr6 (54-343)||(16086080-16086369)
chr6 (54-343)||(18432706-18432994)
chr6 (121-343)||(31628331-31628552)
chr6 (54-343)||(18777209-18777481)
chr6 (54-343)||(18399001-18399290)
chr6 (13-343)||(21623231-21623563)
chr6 (13-343)||(22361619-22361949)
chr6 (11-85)||(18583641-18583715)
chr6 (54-343)||(25367130-25367421)
chr6 (54-343)||(17083093-17083381)
chr6 (11-85)||(19983149-19983223)
chr6 (11-85)||(35015014-35015088)
chr6 (21-245)||(18629469-18629695)
chr6 (54-223)||(33324874-33325046)
chr6 (272-343)||(18583380-18583451)
chr6 (54-307)||(21410944-21411197)
chr6 (272-343)||(26089798-26089869)
chr6 (50-245)||(17556909-17557104)
chr6 (159-343)||(18381684-18381867)
chr6 (54-223)||(35135906-35136078)
chr6 (272-343)||(15742341-15742412)
chr6 (272-343)||(23994986-23995057)
chr6 (272-343)||(18002617-18002688)
chr6 (272-343)||(35015278-35015349)
chr6 (54-247)||(16887685-16887881)
chr6 (207-343)||(25651300-25651435)
chr6 (54-247)||(15079606-15079797)
chr6 (277-343)||(25744331-25744397)
chr6 (114-223)||(29605632-29605739)
chr6 (207-343)||(34966930-34967065)
chr6 (166-343)||(28195101-28195278)
chr6 (13-172)||(33538223-33538384)
chr6 (274-347)||(27740898-27740971)
chr6 (274-343)||(35009569-35009638)
chr6 (13-85)||(14152632-14152704)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (54-334)||(48219-48496)
scaffold0068 (54-334)||(61667-61944)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (54-343)||(4626-4913)
scaffold0447 (54-343)||(9240-9527)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (54-343)||(84-370)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (54-343)||(132144-132434)
scaffold0021 (50-340)||(88341-88631)
scaffold0021 (54-343)||(11750-12041)
scaffold0021 (54-283)||(16022-16253)
scaffold0021 (54-283)||(25553-25784)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (54-343)||(7234-7522)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (54-343)||(60869-61159)
scaffold0001 (89-343)||(70552-70806)
scaffold0001 (54-193)||(79785-79925)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (54-343)||(7632-7922)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (54-343)||(24623-24912)
scaffold0037 (272-343)||(95038-95109)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (54-343)||(85395-85683)
scaffold0014 (54-343)||(159362-159651)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (54-345)||(70674-70964)
scaffold0031 (95-345)||(31105-31352)
scaffold0031 (50-343)||(97088-97382)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (54-343)||(11464-11752)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (54-343)||(117857-118147)
scaffold0035 (54-343)||(109356-109646)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (54-343)||(112441-112729)
scaffold0022 (54-339)||(102815-103102)
scaffold0022 (259-343)||(109653-109737)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (54-343)||(9050-9339)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (54-343)||(38361-38650)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (73-342)||(252903-253172)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (15-171)||(8-164)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (54-343)||(21575-21862)
scaffold0120 (54-357)||(31257-31561)
scaffold0120 (54-163)||(47445-47554)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (54-343)||(33725-34014)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (54-343)||(471-760)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (58-343)||(1979-2263)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (50-343)||(46228-46521)
scaffold0034 (54-343)||(40721-41010)
scaffold0034 (11-85)||(80188-80262)
scaffold0034 (272-343)||(79927-79998)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (115-343)||(5004-5231)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (54-208)||(2961-3115)
[»] scaffold0342 (3 HSPs)
scaffold0342 (95-343)||(6003-6251)
scaffold0342 (11-85)||(309-383)
scaffold0342 (272-343)||(572-643)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (158-343)||(146664-146848)
scaffold0025 (118-255)||(85683-85818)
scaffold0025 (50-343)||(53409-53703)
scaffold0025 (274-347)||(8909-8982)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (13-343)||(76699-77031)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (54-343)||(33622-33912)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (54-340)||(3385-3671)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (13-343)||(197107-197437)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (135-343)||(2588-2795)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (258-343)||(617-702)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (21-343)||(69520-69843)
scaffold0009 (272-316)||(244923-244967)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (21-345)||(6885-7211)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (13-339)||(35545-35873)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (235-343)||(32266-32373)
scaffold0091 (235-343)||(41930-42037)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (54-285)||(7927-8157)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (11-85)||(30418-30492)
[»] scaffold0686 (3 HSPs)
scaffold0686 (12-85)||(5735-5808)
scaffold0686 (12-85)||(5941-6014)
scaffold0686 (272-343)||(6204-6275)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (54-343)||(2211-2500)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (54-245)||(8170-8363)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (274-343)||(89584-89653)
scaffold0028 (54-188)||(79756-79891)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (54-223)||(1440-1611)
scaffold0456 (54-223)||(8585-8756)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (13-343)||(31083-31414)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (11-85)||(31137-31211)
scaffold0184 (272-343)||(31401-31472)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (11-85)||(41633-41707)
scaffold0078 (272-343)||(41372-41443)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (54-247)||(89760-89952)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (159-342)||(6725-6907)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (54-269)||(1242-1458)
scaffold0409 (54-269)||(9497-9713)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (160-343)||(28599-28781)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (272-343)||(17525-17596)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (272-343)||(55644-55715)
scaffold0032 (13-188)||(104477-104653)
scaffold0032 (113-342)||(93728-93955)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (272-343)||(1099-1170)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (272-343)||(13507-13578)
scaffold0251 (272-343)||(21481-21552)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (272-343)||(15012-15083)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (279-343)||(10094-10158)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (54-247)||(22323-22518)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (11-85)||(42678-42749)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (13-269)||(43651-43908)
scaffold0080 (50-343)||(23562-23856)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (54-150)||(70201-70298)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (272-343)||(6664-6735)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (272-343)||(9628-9699)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (54-188)||(10879-11014)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (279-343)||(372-436)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (21-85)||(1371-1435)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (272-343)||(186647-186717)
scaffold0004 (272-343)||(193609-193679)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (54-255)||(855-1059)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (298-343)||(3362-3407)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (207-343)||(7724-7859)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (272-343)||(12641-12712)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (13-70)||(442-499)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (207-343)||(11157-11292)


Alignment Details
Target: scaffold0049 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20567 - 20274
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20567 cataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 20468  T
Q  111 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20467 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 20368  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20367 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggttaattatgctttgttgttg 20274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Original strand, 19807 - 20065
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19807 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 19906  T
Q  111 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19907 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 20006  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20007 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 20065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Original strand, 24111 - 24369
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24111 cataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 24210  T
Q  111 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24211 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 24310  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24311 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 24369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1775 - 1427
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1775 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgga 1676  T
Q  111 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1675 tgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcctatgtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 1576  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgat 309  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| |||     
T  1575 ttgaattgttgttggttgaattatatgttcaaa--gtatgagaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgttgaattatgttatgtgattgatgaa 1478  T
Q  310 ttgtggtaagtttcatgatcaat---tgatgttgttgctatgtcatgttgt 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||    
T  1477 ttgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgt 1427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Original strand, 7283913 - 7284244
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7283913 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttata 7284012  T
Q  111 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  7284013 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtgtgaagttatggatga 7284112  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgat 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7284113 ttgaattgttattagttgaattgtatgttcaaagt--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatcctttgttgttgttgaa 7284210  T
Q  310 ttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7284211 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 7284244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3895376 - 3895088
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3895376 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataatt 3895277  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    
T  3895276 gatgaaattcatgctctaattctgatgaaatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaa--gtatgaaa 3895179  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3895178 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 3895088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 44865582 - 44865293
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44865582 taaggtaagggggttaga-ttcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 44865484  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44865483 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 44865384  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44865383 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttg 44865293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 15822327 - 15822615
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  15822327 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcagttatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 15822426  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  15822427 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatg-ttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaaatgtatgaa 15822525  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822526 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 15822615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 143991 - 143703
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  143991 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtataaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 143892  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  143891 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 143793  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  143792 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgtt 143703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35095166 - 35094890
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35095166 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 35095067  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  35095066 gatgaaattcatgctctaattgtgataacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtatatgaaa 35094968  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||   | ||||||||||||||    
T  35094967 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaat 35094890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 50 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 47290138 - 47289842
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 147  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47290138 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaaatgcttaattggatgaattgattaattgttc 47290039  T
Q  148 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  47290038 ataaatgatgaaattcgagctctaattatgatgccatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgt 47289940  T
Q  248 atgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgct 345  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||    
T  47289939 atgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgct 47289842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 39046523 - 39046807
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046523 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 39046622  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||||    
T  39046623 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattattgttagttgaattgtatgttcaa-----ttgaa 39046717  T
Q  253 aataga-tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  39046718 aaatgagtatatg-tgaaaatat-ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttg 39046807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 45452063 - 45452367
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  45452063 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 45452162  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  45452163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 45452260  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaatt---gatgttgttgctatg 348  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||   | |||||||| ||||    
T  45452261 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaatttgtga--catgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatg 45452358  T
Q  349 tcatgttgt 357  Q
    |||||||||    
T  45452359 tcatgttgt 45452367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 12369735 - 12370024
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  12369735 taaggtaagggggttagatttcatcattatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 12369834  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  12369835 tgattaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttacggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 12369932  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12369933 aaatgggtatctgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttg 12370024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11287768 - 11287480
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||      
T  11287768 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 11287670  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||     
T  11287669 tgatgaaattagtgctctgattatgttgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgag 11287572  T
Q  253 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11287571 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttg 11287480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12759340 - 12759050
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  12759340 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataa 12759241  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||   |    
T  12759240 atgatgaaatttgtgctccaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaaatgt-gaa 12759142  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12759141 aaaggggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttg 12759050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 13862828 - 13863114
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||| |||||||||| ||||      
T  13862828 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaa----gcttaattgggtgaatagattaattgtccataaa 13862923  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  13862924 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 13863021  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  13863022 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgttg 13863114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 12248015 - 12248305
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12248015 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aattgattacttgttcata 12248112  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |  |    
T  12248113 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgtttaaagtatgag 12248212  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12248213 aaaatag-tatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttg 12248305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 26070161 - 26070448
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  26070161 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26070257  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||    
T  26070258 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26070357  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070358 aaat-ggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 26070448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 26093948 - 26094235
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  26093948 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26094044  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||    
T  26094045 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26094144  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26094145 aaat-ggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 26094235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 343
Target Start/End: Original strand, 16569902 - 16570190
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16569902 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16569999  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  16570000 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16570099  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16570100 aat-ggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttg 16570190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16595760 - 16595472
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16595760 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16595663  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  16595662 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16595563  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16595562 aat-ggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttg 16595472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Original strand, 17223797 - 17224122
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaatttt-caattatttgtatgat- 114  Q
    ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||     
T  17223797 aaagtgaagcttgggctaagaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaatttttcaattattt-tatgatt 17223895  T
Q  115 aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattga 214  Q
    |||||||||||||  | |||  |||||||||||| |  || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| | |||||| || ||||||||    
T  17223896 aagtgcttaattgagtaaata-attaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcacgaagttgtggataattga 17223994  T
Q  215 attgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgt 313  Q
    ||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17223995 attgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat-tatactcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgt 17224092  T
Q  314 ggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  17224093 tgtaagagtcatgttcaattgatgttgttg 17224122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377592
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-g 13377826  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    ||||| |||||| || ||||  | ||| |||||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  13377825 tatgaataagtgattcattgagt-aatcgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttga 13377727  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||  ||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  13377726 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat-tatactcaaattgattaattatgctatgttgttgtt 13377629  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13377628 gaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 13377592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 49047569 - 49047858
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  49047569 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtta-tatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcaga 49047666  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || |  |||| |||||| |||| | |||||||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |    
T  49047667 attgttagaatttgtgctccaattataatgacatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 49047766  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | | | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49047767 agagtgg-tatatgttgaaa-tatgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 49047858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 111126 - 111200
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  111126 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 111200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 343
Target Start/End: Original strand, 16914866 - 16915112
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatg 193  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||    
T  16914866 ttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatg 16914963  T
Q  194 tatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaatta 291  Q
     ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||||| | | ||||||||| || ||||||| ||  | ||||||     
T  16914964 catgaaattgatg-ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaacgttgaattg 16915060  T
Q  292 tgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| |||||||||||| || || | || |||||| ||||||||||||||||    
T  16915061 tgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 16915112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9839236 - 9838942
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  |||||||||||    
T  9839236 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9839139  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  9839138 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9839039  T
Q  246 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     | ||||| | | ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| || || | || |||||| ||||||||||||||||    
T  9839038 atgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 9838942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 269
Target Start/End: Original strand, 14271760 - 14272009
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-ta 115  Q
    ||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  14271760 aaagtgaagcttaggttaggaattggtgataattaaggtaagggaattagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaata 14271858  T
Q  116 agtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaa 215  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||| ||    
T  14271859 agtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagttg-tcaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaa 14271956  T
Q  216 ttgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  14271957 ttgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaaat-gatatatgttgaa 14272009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 32493903 - 32493977
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32493903 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 32493977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13275129 - 13274850
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  13275129 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 13275032  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| | |||||| |   |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||  |||    
T  13275031 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttggtaattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagt--atg 13274934  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | || ||     || |    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13274933 agaa-ag-----tggt----atatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 13274850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48357001 - 48356707
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 146  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| || ||||||||||  | || ||||||||||||    
T  48357001 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcattcgttgtatgattaaatgcttaattgagt-aagtgattaattgtt 48356903  T
Q  147 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtg 246  Q
    ||||  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||     
T  48356902 catagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagta 48356803  T
Q  247 tatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||||| | | ||||||||| || ||||||| || || |||||| || | |||||||||||| || || | || |||||| ||||||||||||||||    
T  48356802 tgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 48356707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3049717 - 3049646
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3049717 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 3049646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 1936874 - 1936948
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  1936874 catagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatca 1936948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9611665 - 9611370
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  |||||||||||    
T  9611665 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9611568  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  9611567 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9611468  T
Q  246 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgct--caattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     | ||||| | | ||||||||| || ||||||   || || |||||| |||| |||||||||||| || || | || |||||| ||||||||||||||||    
T  9611467 atgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgcttctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 9611370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31501526 - 31501236
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatca-taatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |||||| ||  |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||    
T  31501526 taaggtaagggggttagaattcaacaataatcaattagttgtaattttca-ttaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcat 31501429  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  |||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| ||  ||||| ||    |||||||||||||| || ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  31501428 agttgatgaaattagtgatctaattatgaagatatgtttaaatacatgaaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagtatgt 31501329  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||| |||||||  |||| | |||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||    
T  31501328 gaaaat-gatatattgtgaata-atgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 31501236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 126813 - 126739
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  126813 cataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 126739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3060272
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatca 3060272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Original strand, 34241063 - 34241317
Alignment:
Q  16 gagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga 113  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | || ||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||    
T  34241063 gagctaaagtgaagcttgggttaagaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatga 34241162  T
Q  114 -taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataatt 212  Q
     |||||| |||||| ||  || ||||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||| |||||  ||||||  ||| ||||| ||    ||||||    
T  34241163 ttaagtgattaatt-gagtaagtgattaattgttcatagttgataaaattcgtgttataattatgatgttatgtttgaatgcatgaaattggtgataatt 34241261  T
Q  213 gaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||    
T  34241262 gaattgttgttggtgaaattgcatgttaaaagtatgtgaaagta-atatatgttgaa 34241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 42056410 - 42056481
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  42056410 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 42056481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 272 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2029055 - 2028986
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2029055 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgt 2028986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 340
Target Start/End: Original strand, 2190307 - 2190375
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  2190307 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttg 2190375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 111390 - 111461
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  111390 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 111461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 126549 - 126478
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  126549 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 126478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28722464 - 28722202
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| || |||||||||| || || ||| |  ||||||||    
T  28722464 taaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaaatgcttaattgaat-aagtgaatctttgttcat 28722366  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  28722365 agttgttgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 28722266  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtg 314  Q
    |||||| |||||||  || || ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  28722265 gaaaat-gatatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtg 28722202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 32494167 - 32494238
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||||    
T  32494167 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttg 32494238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 13389750 - 13389693
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13389750 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13389693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Original strand, 9723927 - 9723991
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  9723927 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 9723991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 46474128 - 46474064
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  46474128 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 46474064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16919708 - 16919622
Alignment:
Q  257 gatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  || || | ||||||||||||||    
T  16919708 gatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcgtgtttaattgatgttgttg 16919622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124407
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 25124407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 343
Target Start/End: Original strand, 17947641 - 17947776
Alignment:
Q  207 ataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgt 305  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || |||| || ||| | ||||||| |||||||  | ||| | ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||    
T  17947641 ataattgaattgttgttggttaaactgaatgtgcatagtatgtgaaaat-gatatattgt-aaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgt 17947738  T
Q  306 tgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||    
T  17947739 tgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 17947776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16919926 - 16919870
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggtta 69  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16919926 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggtta 16919870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Original strand, 15324 - 15655
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15324 cataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatcacttttgtaattttaaattatttgta 15423  T
Q  111 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  15424 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggacaa 15523  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  15524 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtataaaaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaat 15622  T
Q  311 tgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  15623 tgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttg 15655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Original strand, 6261 - 6591
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6261 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 6360  T
Q  111 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6361 tgataagtgcttaattggatgaattgattaactgttcataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataa 6460  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgat 309  Q
    ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| || | | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  6461 ttggattgttgttagttgaaatacatgttcaaagt--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaa 6558  T
Q  310 ttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6559 ttgtgataagtttaatgatcaattgatgttgtt 6591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 1 - 298
Alignment:
Q  45 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaaatg 100  T
Q  145 ttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaag 244  Q
    || |||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  101 ttaataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaag 200  T
Q  245 tgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |  |||| || | | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  201 t--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttg 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584114
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 11584349  T
Q  111 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11584348 tgataagtgcttaattggatgaattaattaattgttcatgagtggtgaaattcgtgctctatttatgatgacatatttggatgtatgaagttatgaataa 11584249  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct---ttgttgttgttg 307  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  11584248 ttgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtatgaaaa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttg 11584150  T
Q  308 atttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  11584149 aattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 11584114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 54 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21397444 - 21397156
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21397444 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 21397345  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21397344 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 21397246  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21397245 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 21397156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28261867 - 28261584
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28261867 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 28261768  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28261767 ggtgaaattcgtgctctagttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt--atgaaa 28261670  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  28261669 a---atatgtgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttg 28261584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 356
Target Start/End: Original strand, 24183027 - 24183332
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  24183027 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 24183126  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  24183127 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtcatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttcaaagtgtatgaa 24183226  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattga---tgttgttgctatgt 349  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  24183227 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgt 24183325  T
Q  350 catgttg 356  Q
    |||||||    
T  24183326 catgttg 24183332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4865613 - 4865330
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4865613 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 4865514  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  4865513 ggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaa 4865416  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgtt 339  Q
    ||| | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  4865415 aatgggtat-gggtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgtt 4865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 11337081 - 11337370
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11337081 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattggttaattgttcataa 11337179  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  11337180 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatga 11337277  T
Q  252 aaata-gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11337278 gaatatggtaaatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 11337370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 1168100 - 1168388
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||||||||      
T  1168100 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaaatgcttattttggtgaattgattaattgttcataaa 1168198  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  1168199 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataatagaatggttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 1168298  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168299 aat-gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 1168388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20712428 - 20712139
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  20712428 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttgcaattttcaattacttgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataa 20712329  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg- 250  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||  |||||     
T  20712328 -tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataactgaattgttgttgattgaattacatgttcaaa--gtatga 20712232  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20712231 aaaatgggtatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttg 20712139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 21646636 - 21646923
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21646636 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttattgcaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaaatgttcatatg 21646734  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  21646735 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttaaaagtgtatgaa 21646833  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||    
T  21646834 aatgggtatgt-atgaaaatatgttcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttg 21646923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 121 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24475861 - 24475629
Alignment:
Q  121 ttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24475861 ttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-t 24475763  T
Q  221 gttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagt 320  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  || ||    
T  24475762 gttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgt 24475666  T
Q  321 ttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatgttgt 357  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  24475665 ttcatgatcaattgttgttgttgtttagtcatgttgt 24475629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19405891 - 19405601
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19405891 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 19405793  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |    
T  19405792 aatgatgaaatttatgctctaattatgatgacatatttgaatgtatgaagttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 19405693  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19405692 aaaa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattagttgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgtt 19405601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21907011 - 21906766
Alignment:
Q  93 aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagat 192  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21907011 aattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagac 21906912  T
Q  193 gtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattat 292  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||                    |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21906911 atatgaagttatggataattgaattgatgttggttgaattacatgttcaaagt-------------------atgaaaatatgttcaattgatgaattat 21906831  T
Q  293 gctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatgttgt 357  Q
    ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21906830 gctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttaagtcatgttgt 21906766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19862604 - 19862272
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||| ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||    
T  19862604 taggagctaaagtgaagtttaggctaaaaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgt 19862505  T
Q  110 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    |||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||    
T  19862504 atgaataagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgat 19862406  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19862405 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 19862308  T
Q  308 atttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||    
T  19862307 aattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttg 19862272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3674215 - 3673925
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3674215 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 3674118  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||  || ||||| |  |||||||||||||||||||   ||||  ||| ||||||| |      
T  3674117 aattgttagaattcgtgctcaaattatgatgatatgtttgaatacattaagttgttgataattgaattgttgttagggaaatttcatgatcaaagtatga 3674018  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3674017 gaaagtgg-tatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 3673925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 245
Target Start/End: Original strand, 23981433 - 23981603
Alignment:
Q  76 atcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaatt 174  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23981433 atcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaatttagtgcattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaatt 23981532  T
Q  175 gtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
     |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  23981533 atgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagt 23981603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23494272 - 23493982
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||  |||||||||||||    
T  23494272 taaggtaagggggttagaaatcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aatcaattaattgttcat 23494175  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||||||| || | ||||||||||||   ||| |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||    
T  23494174 aattgttagaattcgtgctccaactatgatgacatgttcgaatgcatgaagttgtggaaaattgaattgttattagtggaattttatgttcaaagt--at 23494077  T
Q  250 gaa-aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| ||||| |||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23494076 gaagaataggtatatgttgaga-tatgcgaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 23493982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 21222462 - 21222792
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  21222462 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtatgggggttagagttcaatcataattatttagtgtaatttttcaatta-ttgt 21222560  T
Q  110 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    |||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||    
T  21222561 atgattaagtgcttaattg--agtattgattaattgttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgat 21222658  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    |||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || ||||||| || || | |||| |||| |||||||||||    
T  21222659 aattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgtttaattgtgctatgttgttgttg 21222756  T
Q  308 atttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  21222757 aattgtgataagattcatgttcaattaatgttgttg 21222792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 5450695 - 5451027
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |    
T  5450695 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgataataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-g 5450793  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
     || | ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||  || |  ||||| ||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  5450794 cataaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcataattgttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttga 5450892  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5450893 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgtt 5450990  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || ||||| |||  |||||| |||| |||||||||||    
T  5450991 gaattgtgataaaattcatgttcaactgatgttgttg 5451027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16595860 - 16595576
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  16595860 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcat 16595763  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||   ||||  ||||||||||| |      
T  16595762 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgatagagaaatttcatgttcaaagtatga 16595663  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgt 338  Q
    |||| | | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||| || || | || |||||| |||||||||||    
T  16595662 gaaagtgg-tatatgttgaaa-tatgctcaaattgtgaattatgttatgttgatgttgaattatgttgagattcatgttcaattgatgt 16595576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 432815 - 432526
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||    
T  432815 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttactgcaatttttcaattgtt-gcatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgatcata 432718  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || | ||||||| |||| |||| |||||| ||||||  ||| ||| |||| |  ||||||||||||||||| ||  || |  ||||||||||| |  |    
T  432717 attgttaaaattcgcgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgtagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgag 432618  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  432617 aaaat-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatactatgttgttgttggattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttg 432526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7728774 - 7728483
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||   ||| |||  |||  |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7728774 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgtaaattttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 7728676  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||| ||| |||| ||| |  || |||  ||| ||||| ||    |||||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||| |      
T  7728675 aattgttagaattcgtactccaattatgaagttatatttgaatggatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 7728576  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7728575 gaaagt-gatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 7728483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 269
Target Start/End: Original strand, 21310603 - 21310819
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  21310603 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 21310701  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||    
T  21310702 aatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21310801  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  21310802 aaaat-gatatatgttgaa 21310819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28902545 - 28902254
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  28902545 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28902448  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||  || |   |||||||||| |     
T  28902447 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 28902348  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
T  28902347 agaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttg 28902254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28938940 - 28938649
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  28938940 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28938843  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||  || |   |||||||||| |     
T  28938842 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 28938743  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
T  28938742 agaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttg 28938649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21617374 - 21617079
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||  ||||||||||    
T  21617374 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagggattaattgt 21617277  T
Q  146 tcatatgtgatga-aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaag 244  Q
    ||||  ||  | | |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| |||    
T  21617276 tcattagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttagtgaaattgcatgttccaag 21617177  T
Q  245 tgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||||||| | | |||||||||||  ||||||| || || |||||| | || |||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  21617176 tatatgaaagt-gttatatgttgaac-tatgctctaaatgttgaattgttctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 21617079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21650829 - 21650758
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21650829 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 21650758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 269
Target Start/End: Original strand, 21297069 - 21297285
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  21297069 taaggtaagggggttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcata 21297167  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || | |||||||| |||||| | |||||| ||||||  | | ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||    
T  21297168 aatgttaaaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21297267  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  21297268 aaaat-gatatatgttgaa 21297285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23466787 - 23466619
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||     
T  23466787 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattattgcaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattgtgt-aattgattaattgttcataa 23466690  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 223  Q
     |  |  ||||||||||| |||| ||   ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23466689 ttattagaattcgtgctccaattatggcaacatgtttgtatgtaagaagttatg-ataattgaattgttgtt 23466619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2031944 - 2031873
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  2031944 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 2031873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11342819 - 11342748
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  11342819 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 11342748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21205060 - 21205000
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21205060 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 21205000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22885932 - 22885792
Alignment:
Q  114 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattg 213  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | ||||||||   || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    |||||||    
T  22885932 taagtgcttaattgaat-aattgataatttgttcatggttgttgaaattcgtgctttaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattg 22885834  T
Q  214 aattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaat 255  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  22885833 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 22885792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23417368 - 23417304
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  23417368 aattgctgaattgtgctatgttgttgttgatttgtggtgacattcatgtttaattgatgttgttg 23417304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 345
Target Start/End: Original strand, 22053963 - 22054034
Alignment:
Q  274 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgct 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || | |||||| |||||||||||| |||||    
T  22053963 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgct 22054034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 304 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23466559 - 23466520
Alignment:
Q  304 gttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23466559 gttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 23466520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6456937 - 6456852
Alignment:
Q  89 ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaatt 174  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  6456937 ttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaatt 6456852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 37983758 - 37983598
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  37983758 taggagctaaagtgaagcttgggctagaaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 37983659  T
Q  111 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 171  Q
    |||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||    
T  37983658 tgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaatttgtgctcta 37983598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 345
Target Start/End: Original strand, 18531200 - 18531268
Alignment:
Q  277 tcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgct 345  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || | |||||| |||||||||||| |||||    
T  18531200 tcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgct 18531268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13817862 - 13817561
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13817862 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgtacatatgt 13817763  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13817762 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 13817664  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatg 353  Q
    || | |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  13817663 atgggtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgtttagtcatg 13817565  T
Q  354 ttgt 357  Q
    ||||    
T  13817564 ttgt 13817561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 19570586 - 19570872
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19570586 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaatttttcatatgt 19570684  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19570685 gatgaaatttgtgctctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 19570783  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19570784 atgagtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttg 19570872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 317405 - 317692
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  317405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 317504  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  317505 gatgaaattcgtgctctaagtatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaa 317602  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  317603 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttg 317692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 16181842 - 16182129
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16181842 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 16181941  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  16181942 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttaaattacatgttcaaagtgtatgaaa 16182040  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || | ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16182041 atgggtatgtg-tgaaaatatgccaaattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttg 16182129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 22144167 - 22144456
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||      
T  22144167 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactttttgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaactgttcataac 22144266  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22144267 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 22144365  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22144366 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttg 22144456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 50111946 - 50112235
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  50111946 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 50112045  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  50112046 tgatgaaattcatgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 50112143  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50112144 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 50112235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 16995956 - 16996243
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16995956 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattattcataagt 16996055  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  16996056 ggtgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttacttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaa 16996153  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  16996154 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttg 16996243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 54424364 - 54424076
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt-aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  54424364 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 54424265  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||     
T  54424264 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 54424167  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54424166 aaattgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 54424076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 12349434 - 12349723
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||      
T  12349434 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgtccataaa 12349533  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |    
T  12349534 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtataaatttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtgag-a 12349632  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12349633 agttgttatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 12349723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 342
Target Start/End: Original strand, 6154226 - 6154514
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6154226 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttctatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6154325  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    | ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  6154326 tcatgaaattcgtcctctaattataatgacatgtttagatgtatgaaattatgaatagttgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtttatgaa 6154424  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6154425 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 6154514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14298773 - 14298485
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  14298773 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14298674  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  14298673 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-a 14298575  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14298574 tatggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 14298485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14304400 - 14304112
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  14304400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14304301  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  14304300 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-a 14304202  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14304201 tatggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 14304112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17101004 - 17100720
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  17101004 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17100906  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  17100905 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 17100808  T
Q  253 a-atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgtt 339  Q
    | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17100807 acatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 17100720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17101689 - 17101405
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  17101689 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17101591  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  17101590 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 17101493  T
Q  253 a-atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgtt 339  Q
    | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17101492 acatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 17101405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38528079 - 38527841
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  38528079 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaactatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 38527980  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38527979 gatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 38527881  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 294  Q
    || | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38527880 atgggtatgtg-ggaaaatatgctcaattggtgaattatgc 38527841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8632142 - 8631853
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  8632142 taaggtaagggggttaggattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattaattaattgttcttaag 8632043  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  | |    
T  8632042 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtttgag-a 8631944  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | | | ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  8631943 agttggtatatgttgaaaatatgcttatttagtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttg 8631853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35124047 - 35123759
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  35124047 taaggtaaaggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35123948  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||    
T  35123947 tgatgaaattcgtactttaattatgatgacgtgtttggatgtatgaaattatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgtt-aaagtgtatgaa 35123849  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35123848 aa-gggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 35123759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14295790 - 14295501
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||      
T  14295790 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14295692  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  |||    
T  14295691 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14295592  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14295591 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 14295501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14301417 - 14301128
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||      
T  14301417 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14301319  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  |||    
T  14301318 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14301219  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14301218 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 14301128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 54 - 329
Target Start/End: Original strand, 34439237 - 34439513
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34439237 taaggtaaggagattagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 34439336  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttta-gatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | | |    
T  34439337 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttatgaggtatgaagttatggataaatgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgt-a 34439435  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatc 329  Q
    |||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  34439436 aaatgggtatgtgtttaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17938925 - 17938637
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |    
T  17938925 taagataagggggttagggttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcttgag 17938826  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||  |||  |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  17938825 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttggatgtataaag-catggttaagcgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaa--gtatgag 17938729  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17938728 aagttgatatatgttgaaaatatgcttaattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttg 17938637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 343
Target Start/End: Original strand, 17522780 - 17523073
Alignment:
Q  49 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 147  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17522780 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgagaagtgcttatttgggtgaattgattatttgttc 17522878  T
Q  148 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  17522879 ataaatgatgaacttcgtgctctaattatgatgacagttttggatgtatgaagatgtggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtat 17522978  T
Q  248 atgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17522979 aacaaaat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttg 17523073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 113 - 343
Target Start/End: Original strand, 55440803 - 55441033
Alignment:
Q  113 ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataatt 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  55440803 ataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatt 55440902  T
Q  213 gaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgattt 311  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||||| ||    
T  55440903 gaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatgagaaaat-gatatatgatgaaaatatgctcaactggttgaattatactatgttgtggttgaatt 55441001  T
Q  312 gtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55441002 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 55441033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 143 - 343
Target Start/End: Original strand, 53898440 - 53898639
Alignment:
Q  143 tgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaa 242  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  53898440 tgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatctatgaagttatgaataattgaattgt-gttagttgcattaaatgttcaa 53898538  T
Q  243 agtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  53898539 agtgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgtt 53898638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3578440 - 3578135
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  3578440 taaggtaagcgggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtaggaataagtgcttaattgggtaaattgattaattgttcataa 3578342  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||| |||| | |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |  ||    
T  3578341 atgatgatattcattctctaattatgatgacatgttga-atgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgttcaaagtatgaga 3578243  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattga--tgttgttgctatg 348  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  3578242 aaatag-tatatgttgaaaatatgctcaactggttgaattacgctatgttgtggttgaattgcgataagtttcatgatcaattgatttgttgttgctaag 3578144  T
Q  349 tcatgttgt 357  Q
    |||||||||    
T  3578143 tcatgttgt 3578135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 11060902 - 11061190
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||      
T  11060902 taaggtaagggggttggaattcatcataatcataattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattaattatttgttaatgg 11060999  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| |  ||    
T  11061000 atgatgaaattcgtgctctaattatgatca-atttttaaatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagttgaatttcaggttcaaagtatgaga 11061098  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||||||||||||||    
T  11061099 aaat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatagtcatgttcaattgatgttgttg 11061190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 158 - 343
Target Start/End: Original strand, 19260839 - 19261023
Alignment:
Q  158 aaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aaaata 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||     
T  19260839 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaaaaatg 19260936  T
Q  257 gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19260937 ggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 19261023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 175 - 343
Target Start/End: Original strand, 6146763 - 6146930
Alignment:
Q  175 gtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  6146763 gtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgta-ttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatat 6146861  T
Q  275 gctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |||||    
T  6146862 gctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttg 6146930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 11328859 - 11329145
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  11328859 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 11328956  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| ||||||||||||     | || ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |     
T  11328957 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtt-----gcataaagttgttaataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 11329051  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     |||| | | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11329052 agaaagtgg-tatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 11329145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 158
Target Start/End: Original strand, 6146664 - 6146769
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6146664 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6146763  T
Q  153 tgatga 158  Q
    ||||||    
T  6146764 tgatga 6146769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17139861 - 17139571
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||    
T  17139861 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattcttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaagtgttcat 17139764  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||| |   |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||| | |      
T  17139763 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaactatga 17139664  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17139663 gaaaatgg-tatatgttgaaa-tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 17139571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Original strand, 14527975 - 14528110
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  14527975 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgttcataa 14528073  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14528074 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 14528110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 304
Target Start/End: Original strand, 11196291 - 11196457
Alignment:
Q  130 tgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttga 229  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11196291 tgaattgattaattgttcatggatgatgaaatttgtgctctaataatgatgatatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 11196390  T
Q  230 attgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttg 304  Q
    ||| |||||| |        |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11196391 attttatgttga--------gaaaat-ggtatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgatttgttgttg 11196457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7854380 - 7854306
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7854380 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7854306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 357
Target Start/End: Original strand, 14059112 - 14059414
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtg 154  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||   ||    
T  14059112 gtaagggggttataattcatcataatcattttagtgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgact-aattgactaattgttcatgattg 14059209  T
Q  155 atgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa 254  Q
     |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||   ||||  ||||||||||| |  |||||    
T  14059210 ttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgtttttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaa 14059309  T
Q  255 tagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatg---ttgttgctatgtc 350  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||   ||||||||||||     
T  14059310 t-gacatatgttgaaa-tatgctcaatttgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtg 14059407  T
Q  351 atgttgt 357  Q
    |||||||    
T  14059408 atgttgt 14059414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 54037981 - 54038055
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  54037981 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 54038055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16880477 - 16880190
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  16880477 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaacaagtgtttaattgagt-aattgattaattgttca 16880380  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |     
T  16880379 taattgtttgaattcgtgctccaattacgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatg 16880280  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaa-ttatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgtt 339  Q
     |||| | | |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  16880279 agaaagtgg-tatatgtt-agaatatgctcaatttgtgaaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgtt 16880190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39656817 - 39656589
Alignment:
Q  113 ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataatt 212  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  || | |||| ||||||| |||| |||||  ||||||  || |||||| ||    ||||||    
T  39656817 ataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaatccgtgctccaattatgatgttatgtttgaatttatgaaattggtgataatt 39656719  T
Q  213 gaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgattt 311  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  39656718 gaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaatt 39656621  T
Q  312 gtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  39656620 gttgtaagattcatgttcaattgatgtggttg 39656589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 12560131 - 12560420
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  12560131 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcatttattgcaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcata 12560228  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||  ||| ||  |||  |||||||||  ||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  12560229 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgattgaatgcttgaagttattgatacttgaatttttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 12560328  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||    
T  12560329 aaagt-ggtatatg-tgaaaatatgcccaactggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttg 12560420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3992948 - 3992874
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3992948 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 3992874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191607
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||  ||||||||| ||||| || |    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcacaatcattttagtgtaatttttcaattgtt-g 17191838  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    |||||  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |    
T  17191837 tatgaacaattgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttga 17191739  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |    
T  17191738 taatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatttatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgttatgttgttgct 17191641  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttg 340  Q
    || ||||| ||||  ||||| | |||||||||||    
T  17191640 gaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttg 17191607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 55513268 - 55513194
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  55513268 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 55513194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 343
Target Start/End: Original strand, 12488662 - 12488910
Alignment:
Q  93 aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttaga 191  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | | || ||||||||||||||  || |  ||||| |||||||||| ||||    ||||| ||    
T  12488662 aattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtca-ttaattaattgttcataattgttagaattcatgctctaattatgatattgtgtttgga 12488759  T
Q  192 tgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaatt 290  Q
    || |||||||| |  |||||||||||||||||  |  ||||  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  12488760 tgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaatt 12488857  T
Q  291 atgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12488858 atgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 12488910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Original strand, 3576298 - 3576622
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ata 115  Q
    ||||||||||||| | ||  | || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| | |||    
T  3576298 aaagtgaagcttgggctaggaatttgtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaatt-gttgtacgaata 3576396  T
Q  116 agtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaa 215  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||||| |  || |  ||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||    
T  3576397 agtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttcaaagttgttataattcgtactctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaa 3576495  T
Q  216 ttgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgt 313  Q
    |||||||| ||  ||||  ||||||||  ||||||| |||  ||||||| ||| || ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  3576496 ttgttgttggtgaaatttcatgttcaa--tgtatgagaaagtgatatatattg-aattatgctcaaattgatggattatgctatgttgttgttgaattgt 3576592  T
Q  314 ggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||||  ||||| |  |||||||||||||    
T  3576593 gataagagtcatgtttgattgatgttgttg 3576622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2844589 - 2844515
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2844589 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 2844515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 343
Target Start/End: Original strand, 14528118 - 14528196
Alignment:
Q  266 tgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14528118 tgaaaatatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 14528196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857194
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 15857194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17205076 - 17204841
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||| |  |    
T  17205076 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattccatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtg-g 17204978  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    || ||  |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |    
T  17204977 tacgaacaagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttga 17204879  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||  |||||||||||    
T  17204878 taatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 17204841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 343
Target Start/End: Original strand, 12349834 - 12349914
Alignment:
Q  263 tgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12349834 tgttgataatatgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttg 12349914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3992684 - 3992613
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3992684 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 3992613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38168048 - 38167977
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38168048 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttg 38167977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 19232164 - 19232090
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  19232164 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatca 19232090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15876341 - 15876131
Alignment:
Q  132 aattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaat 231  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||| ||| |  |||| ||||||||||||  |  |||    
T  15876341 aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgataatatgtttaaatgcatgatgttgttgataactgaattgttgttgatgaaat 15876242  T
Q  232 tgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatca 330  Q
    | ||||||| |||| |  |||| | ||||||| ||| ||  || ||| ||||| || |||||  |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  15876241 tttatgttccaagtatgagaaagt-gatatatcttg-aatgatactcaaattgttggattatcataagttgttgttgaattgtgataagattcatgttca 15876144  T
Q  331 attgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||    
T  15876143 attgatgttgttg 15876131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2844325 - 2844254
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2844325 tatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 2844254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 14814658 - 14814949
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| ||| ||||    
T  14814658 taaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgctcat 14814756  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  14814757 agttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 14814856  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||| |||||||  || || | ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  14814857 gaaaat-gatatattgtg-aattgtgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgttg 14814949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16261587 - 16261516
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  16261587 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 16261516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 53771175 - 53771104
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  53771175 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 53771104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 17955837 - 17955915
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttg----agttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| |    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17955837 cataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 17955915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30207570 - 30207279
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  30207570 taaggtaagggggttataattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattattca 30207473  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||   | |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  || |  ||||||||||| |     
T  30207472 tactggttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatg 30207373  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgc-tcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     |||| | ||||||||||| || ||||| | ||||| |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||| |||| | |||||||| |||||||    
T  30207372 agaaagt-gatatatgttg-aattatgcttaaattgatgaattgtgctatgttgttgttcaattgtgataagattcaagttcaattgaagttgttg 30207279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30153076 - 30153005
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  30153076 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 30153005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 54685422 - 54685493
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  54685422 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 54685493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 16743998 - 16744072
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  16743998 cataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatca 16744072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Original strand, 13301323 - 13301491
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||||  |||  ||||||    
T  13301323 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtgatttttcatttgttgtat 13301422  T
Q  112 ga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatg 180  Q
    || |||||||||||||| || || |||||| | |||| ||  || |||| |||||||||||||| |||||    
T  13301423 gattaagtgcttaattgaat-aagtgattattggttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatg 13301491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Original strand, 13311979 - 13312147
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||||  |||  ||||||    
T  13311979 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtgatttttcatttgttgtat 13312078  T
Q  112 ga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatg 180  Q
    || |||||||||||||| || || |||||| | |||| ||  || |||| |||||||||||||| |||||    
T  13312079 gattaagtgcttaattgaat-aagtgattattggttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatg 13312147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 90
Target Start/End: Original strand, 38810868 - 38810945
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 90  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  38810868 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttt 38810945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14080863 - 14080669
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  14080863 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaactatg-gtatgaataagtgtttaattggataaat-gattaattgtgca 14080766  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||  || | |||||||||||| || | |||||| ||||||  ||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||    
T  14080765 tagatgttaaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatga-taattgaattgtggttagtgaatttgcatgttcaaagt 14080669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15550986 - 15550919
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 88  Q
    ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15550986 aaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatcactt 15550919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23492507 - 23492436
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  23492507 tatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 23492436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33342015 - 33341944
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || || || |||||||||||||| | ||||||||    
T  33342015 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 33341944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 45582029 - 45581955
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag-ggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  45582029 cataggagaaaaa-tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatca 45581955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784853
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 47784853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12953210 - 12953027
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaataga 258  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||  ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||| | |     
T  12953210 aattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattagattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagt-gt 12953112  T
Q  259 tatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| ||||| | || || ||| | ||||||||||||||    
T  12953111 tatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagatttatgtttaattgatgttgttg 12953027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Original strand, 33368822 - 33369024
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  33368822 aaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaattttca-ttaattgcatgattaagtgcttatttgaat-aattaattatttgttcata 33368919  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||| | ||    
T  33368920 gttgttgaaattcgtgctttaattgtggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgtggttggtgaaattgcatgttcatagtatgtg 33369019  T
Q  251 aaaat 255  Q
    |||||    
T  33369020 aaaat 33369024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11638484 - 11638420
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  11638484 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 11638420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 11882113 - 11882240
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || || |||||| |||||| ||     
T  11882113 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaacttttaatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcttag 11882211  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatg 180  Q
     || |||| ||| |||||||||| |||||    
T  11882212 atgttgaatttcatgctctaattatgatg 11882240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7854116 - 7854045
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  7854116 tatgttcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 7854045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 12031904 - 12031849
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggtt 68  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12031904 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggtt 12031849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 276 - 343
Target Start/End: Original strand, 17956109 - 17956176
Alignment:
Q  276 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  17956109 ctcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 17956176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 45581765 - 45581694
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||||    
T  45581765 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttg 45581694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961106
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 51961106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15517921 - 15517848
Alignment:
Q  114 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15517921 taagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcataaatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgttt 15517848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Original strand, 9590648 - 9590784
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  9590648 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaaattgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtggttaattgttcata 9590746  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
      || | |||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  9590747 gttgttaaaatccgtgctctaactatgatgatatgttt 9590784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 343
Target Start/End: Original strand, 43427565 - 43427700
Alignment:
Q  207 ataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgt 305  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||  | ||| | ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||    
T  43427565 ataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgt-aaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgt 43427662  T
Q  306 tgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| ||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  43427663 tgagttgtgatgagaatcatgattaattgatgttgttg 43427700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 11548 - 11852
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11548 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 11647  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11648 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttcttggttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 11747  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcat 352  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11748 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttaagtcat 11847  T
Q  353 gttgt 357  Q
    |||||    
T  11848 gttgt 11852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1667 - 1380
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||      
T  1667 taaggcaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatt--caattatttgtatgaaaagtggttaattgaatgaattgattaattgtgtataaa 1570  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  1569 tgatgaaattcgtgctctaatcatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttggtggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 1472  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1471 aaatgggtatgtgatgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 1380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15224 - 14923
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatatgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 15125  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  15124 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttagattacatgttcaaagtgtatgaaa 15026  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatg 353  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  15025 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgtttagtcatg 14927  T
Q  354 ttgt 357  Q
    ||||    
T  14926 ttgt 14923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 55376494 - 55376781
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55376494 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttttgaaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 55376593  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  55376594 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttctaa--gtatgaaa 55376691  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55376692 aatgggtatgtg-tgaaaatatactcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttg 55376781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 23269829 - 23270118
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23269829 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 23269928  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23269929 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 23270027  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23270028 aatgggtatgtgttgaaaatatactcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttg 23270118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 53704629 - 53704917
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53704629 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 53704728  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  53704729 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaa 53704826  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  53704827 aaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttg 53704917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34395609 - 34395303
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||      
T  34395609 taaggtaagggggttagaattcatcattatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaactgattaattgttcataaa 34395510  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34395509 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtaatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 34395411  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattga---tgttgttgctatgt 349  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  34395410 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgt 34395311  T
Q  350 catgttgt 357  Q
    ||||||||    
T  34395310 catgttgt 34395303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 44347177 - 44346890
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44347177 taaggtaagggagttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 44347078  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  44347077 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtaagaaa 44346979  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||||    
T  44346978 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttg 44346890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 58 - 343
Target Start/End: Original strand, 8872372 - 8872655
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 157  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8872372 gtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtg 8872471  T
Q  158 aaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aaaata 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||     
T  8872472 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagctatgaatgattgaagtgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaaaatg 8872569  T
Q  257 gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  8872570 ggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttg 8872655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 44056266 - 44055978
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44056266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 44056167  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  44056166 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat-tttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 44056070  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44056069 aaatgaatatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 44055978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30458255 - 30457966
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  30458255 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttgaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 30458156  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||| | | ||    
T  30458155 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatggataattaaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgt-aa 30458057  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30458056 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttg 30457966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 53907604 - 53907897
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  53907604 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtagttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggat--------taattgttcatatgt 53907695  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||    
T  53907696 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttattagttggattgtatgttcaaa--gtatgaaa 53907793  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcat 352  Q
    ||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||| |||||||| |  |||||    
T  53907794 aatgggtatgtg-tgaaaatatgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaattgttgttgttgattagtcat 53907892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 12837096 - 12837384
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  12837096 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgaatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 12837194  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||     
T  12837195 tgatgatattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 12837292  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12837293 aaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttg 12837384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16732520 - 16732215
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttc-aattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  16732520 taaggtaaagaggttagaattcatcataatcattattgcaattttttaattagt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 16732422  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||     
T  16732421 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgag 16732324  T
Q  253 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgat---gttgttgctatg 348  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  16732323 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaag 16732224  T
Q  349 tcatgttgt 357  Q
    |||||||||    
T  16732223 tcatgttgt 16732215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 21959359 - 21959647
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||      
T  21959359 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattaattgattgttcataaa 21959458  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||  ||  |||||  ||||| |    
T  21959459 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttaaatgtatgaagttatggatatttgaattgttgttgattgaattacat-ctcaaa--gtatgaa 21959555  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21959556 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 21959647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 73 - 343
Target Start/End: Original strand, 45458769 - 45459039
Alignment:
Q  73 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 171  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45458769 ttcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataagtgatgaaatttgtgctcta 45458868  T
Q  172 attgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaa 271  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |  |||  | | |||||||| || |    
T  45458869 attatgatgacatgtttagatgtatgaagtgatagataattgaattgttgttagttgaattacatgctcaaaatatgagaagtttg-tatatgttaaaga 45458967  T
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  45458968 tatgttcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttg 45459039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 819826 - 820114
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  819826 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 819925  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||               || | ||||    
T  819926 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt-gttg---------------gtttgtgaa 820009  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcat 352  Q
    |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  820010 aatgtgtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttaagtcat 820109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Original strand, 20813442 - 20813634
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20813442 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttaaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20813541  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  20813542 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagt 20813634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 52265403 - 52265692
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  52265403 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgtttaattgggt-aattgattaattgttcata 52265500  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |  |    
T  52265501 gatgatgaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgag 52265600  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  52265601 aaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 52265692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27961324 - 27961034
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  27961324 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattgttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 27961227  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||    
T  27961226 aattgttagaatccgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttatgaataattgaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagt--at 27961129  T
Q  250 gaa-aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| ||  | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | | |||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27961128 gaagaagtggtatatgttgaaa-tatgctaaattggttgaattatgttatattgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttg 27961034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 30232391 - 30232680
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  30232391 taaggtaagagggttagaattcatcataatcacttattgcaattttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcat 30232488  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |  ||| ||||||| | |    
T  30232489 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatga-taattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgt 30232587  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||  |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30232588 gaaaagtgggttatgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttg 30232680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 13809405 - 13809694
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  13809405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcata 13809502  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |   |||||||||||||||| ||   |||  ||||||||||| |  |    
T  13809503 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaagtatgag 13809602  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13809603 aaaat-ggtatatgttg-aaatatgctcaattagttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 13809694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15045181 - 15044891
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  15045181 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 15045084  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |      
T  15045083 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15044984  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15044983 gaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 15044891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Original strand, 7185735 - 7186028
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 147  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  7185735 taattaaggtaaggaggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttc 7185833  T
Q  148 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    |||  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |    
T  7185834 atagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtat 7185933  T
Q  248 atgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     ||||||| ||||||||||| || | ||| | || || |||||| |||| |||||||||||| ||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  7185934 gtgaaaat-gatatatgttg-aattgtgcactaaatgatgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 7186028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 18494224 - 18494512
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||  | ||||||| |||||||||||     
T  18494224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatg-gtatgaataggtgcttaattgtgt-aattgatcaattgttcataa 18494321  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     || |  ||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |  ||| ||||||| |  ||    
T  18494322 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgttcgtatgtatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgaga 18494420  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||  | ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||||    
T  18494421 aaaatggtatatgttg-aaatgtgctcaattggttggatgatgctatgttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttg 18494512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 343
Target Start/End: Original strand, 47535042 - 47535249
Alignment:
Q  135 tgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgt 234  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||      
T  47535042 tgattaattgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 47535141  T
Q  235 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaatt 333  Q
    | ||||||||| |  |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||    
T  47535142 aagttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagaatcatgttcaatt 47535239  T
Q  334 gatgttgttg 343  Q
    || |||||||    
T  47535240 gacgttgttg 47535249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 15109243 - 15109533
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| |||||    
T  15109243 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattattcat 15109340  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |   | |  ||||| ||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |      
T  15109341 aatagttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15109440  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | |||||||||||||  ||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15109441 gaaagt-gatatatgttgaat-tatactcaaattgataaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 15109533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 41165808 - 41166130
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| |  |    
T  41165808 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtg-g 41165906  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||            |||| |||||| |||| |||| | || |||  ||| |||||||| |  |    
T  41165907 tatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttag----------aatttgtgctccaattatgataatatatttgaatgcatgaagttgttga 41165995  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41165996 taattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgtt 41166093  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||    
T  41166094 gaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttg 41166130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 5682385 - 5682459
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  5682385 cataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatca 5682459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 54118125 - 54118199
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54118125 cataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 54118199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 41256263 - 41256553
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  41256263 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 41256361  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  41256362 agttgttgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgttga-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 41256460  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||| |||||||  || || ||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||| | ||   |||| | ||||||||||||||    
T  41256461 gaaaat-gatatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaaccatgtttaattgatgttgttg 41256553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 25119064 - 25119138
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  25119064 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatca 25119138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 15013137 - 15013466
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||| || ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||||| || || ||    
T  15013137 taggagctaaagtgaagcttgagctaggatttg-tgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaattttcatttgtt-gt 15013234  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaa 207  Q
    ||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| || ||| |    
T  15013235 atgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgtttaaattcgtgctctaattatgatgatatgttga-atgcatgaaattgatg-a 15013331  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | ||||||| || ||||  || || ||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  15013332 taattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gacatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgtt 15013429  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || ||||| | ||  ||||| | ||||||| ||||||    
T  15013430 gaattgtgatgagaatcatgtttaattgatattgttg 15013466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18276743 - 18276497
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatg 193  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | |  ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||    
T  18276743 ttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-atgtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgaatg 18276646  T
Q  194 tatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattat 292  Q
     ||||| ||    |||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||||| | | |||||||||||  ||||||| || || |||||| |    
T  18276645 catgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagcatgtgaaagt-gttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgt 18276548  T
Q  293 gctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | |||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  18276547 gctatattgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 18276497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14951896 - 14951825
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  14951896 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 14951825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 15272433 - 15272504
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15272433 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttg 15272504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14901584 - 14901295
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14901584 taaggtaagggggttaaatttcatcataatcattttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcat 14901487  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    || || |  |||||||||||||||| |||  | ||||||  ||||||||| || |  | ||||| ||||||||| ||  ||||  |||||  |||| |      
T  14901486 atttgttataattcgtgctctaattatgacaatatgtttgaatgtatgaaattgttgaaaattg-attgttgttggtgaaatttcatgtttgaagtatga 14901388  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||||||||||  |||||||||| || || ||||||||| | |||| || |||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  14901387 gaaagt-gatatatgtt-taaatatgctcaaaatgttgaattatgatatgttattattgaattgtggtaagaatcatattcaattgatgttgttg 14901295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 343
Target Start/End: Original strand, 10104380 - 10104449
Alignment:
Q  274 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || | |||||| ||||||||||||||||    
T  10104380 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 10104449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Original strand, 5682648 - 5682704
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  5682648 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 5682704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Original strand, 13590194 - 13590258
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  13590194 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 13590258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 242
Target Start/End: Original strand, 7964606 - 7964796
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || ||| ||||||||||||    
T  7964606 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgttcata 7964704  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaa 242  Q
      || | |||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  7964705 gttgttaaaatccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 7964796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 25119328 - 25119399
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  25119328 tatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 25119399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 339
Target Start/End: Original strand, 15675219 - 15675284
Alignment:
Q  274 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgtt 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || | |||||| ||||||||||||    
T  15675219 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 15675284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 343
Target Start/End: Original strand, 40885676 - 40885753
Alignment:
Q  266 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||| ||| | || | |||||| ||||||||||||||||    
T  40885676 tgaaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 47534933 - 47534990
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47534933 taggagctaaagtgaagcttgggcgaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 47534990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 343
Target Start/End: Original strand, 50219989 - 50220124
Alignment:
Q  207 ataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgt 305  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||||  | ||||| || || |||||| || | |||||||||    
T  50219989 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattttgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgttgtgttgttgt 50220086  T
Q  306 tgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||    
T  50220087 tgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 50220124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 254710 - 254998
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  254710 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 254808  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  254809 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttg-tagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 254907  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  254908 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 254998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 261316 - 261604
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  261316 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 261414  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  261415 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtag-tagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 261513  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  261514 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 261604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37612020 - 37611731
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  37612020 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataag 37611921  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37611920 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 37611822  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37611821 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttg 37611731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 22234700 - 22234987
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22234700 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgaatgaattgattaattgttcataagt 22234799  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  22234800 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacgtgtttagatgtatgaagttatgaataatttaattg-tgttagttgaattacatgctcaaagtgtatgaaa 22234898  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  22234899 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttg 22234987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 20573087 - 20573376
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20573087 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20573186  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20573187 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 20573286  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573287 aa-gggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 20573376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 19992952 - 19993238
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19992952 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttttgtaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 19993050  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19993051 gatgaaatccgtactctaattatgatgacatgtttagatgtacgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacttgttcaaagtgtatgaaa 19993149  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  19993150 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttg 19993238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41247009 - 41246721
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  41247009 taaggtaagggggttagagttcatcataatcacttattgtaattttcaattagttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataaa 41246910  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt-gtatga 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||| | |  |    
T  41246909 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaattgttgttggttgaattacatgttaaaagtagga--a 41246812  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41246811 aaatgggtatatgatg-aaatatgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 41246721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20481955 - 20481668
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||       
T  20481955 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaat-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgttcatgga 20481858  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  20481857 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 20481760  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20481759 aaatggatatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttg 20481668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 338
Target Start/End: Original strand, 20561526 - 20561810
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20561526 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20561625  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||     
T  20561626 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 20561723  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgt 338  Q
    |||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20561724 aaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 20561810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25122793 - 25122618
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25122793 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 25122694  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttga 229  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25122693 gatcaaattcgtgctccaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgctagttga 25122618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21681356 - 21681066
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21681356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaatttgttgaattgattaattgttcata 21681258  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |  |    
T  21681257 aatgataaaattcgtgatctaattatgatgacatatttgaatgtataagtttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgtttaaagtatgag 21681158  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    | ||  | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21681157 agaa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgtt 21681066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 21198005 - 21198336
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||    
T  21198005 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcattataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gt 21198103  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||    
T  21198104 atgattaagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagat 21198202  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  21198203 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgttatgttgttgttg 21198300  T
Q  308 atttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  21198301 aattgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttg 21198336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23837561 - 23837261
Alignment:
Q  45 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgta---attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgatt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||   |||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  23837561 ggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttaatatagattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gatt 23837464  T
Q  140 aattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgtt 239  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |  ||||  |||||    
T  23837463 aattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttattgaaatttcatgtt 23837364  T
Q  240 caaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgt 338  Q
    |||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23837363 caaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aactatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgt 23837266  T
Q  339 tgttg 343  Q
    |||||    
T  23837265 tgttg 23837261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 158
Target Start/End: Original strand, 7000524 - 7000624
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7000524 gtaagggggttagttttcatcataatcacttttttaattttcaattatttgtatgataagtgcttaataggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 7000623  T
Q  158 a 158  Q
    |    
T  7000624 a 7000624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 39446660 - 39446950
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  39446660 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 39446757  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||||    
T  39446758 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaa--gtat 39446855  T
Q  250 gaa-aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| ||  | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39446856 gaagaagtgttatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 39446950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Original strand, 20653944 - 20654106
Alignment:
Q  197 gaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20653944 gaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgagaaattggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgct 20654041  T
Q  296 ttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgat---gttgttgctatgtcatgttgt 357  Q
      ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  20654042 aagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgt 20654106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22981622 - 22981351
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  22981622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatt--ttgtatgaataagtgcttaattgggt-aattgattaattgttcaga 22981526  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  22981525 tg--atgaaatttgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 22981428  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgat 328  Q
    ||| | | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22981427 aaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgat 22981351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 211 - 357
Target Start/End: Original strand, 20647882 - 20648030
Alignment:
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgat 309  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  20647882 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgagaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaa 20647979  T
Q  310 ttgtggtaagtttcatgatcaattgat---gttgttgctatgtcatgttgt 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  20647980 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgt 20648030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17285600 - 17285364
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactttt-gt---aattttcaattattt 107  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||    
T  17285600 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaaattttcaatt-gtt 17285502  T
Q  108 gtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatga 206  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |      
T  17285501 gtatgattaagtgcttaattgaat-aattgaataattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttg 17285403  T
Q  207 ataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||    
T  17285402 ataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 17285364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29306813 - 29306480
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag-ggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||  | || ||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  |||    
T  29306813 taggagctaaactgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagaggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttg 29306714  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||  || | | ||||||||||||| | |||||| |||||   ||| ||||| |||   |    
T  29306713 tatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattgattgttcatagatgttaatattcgtgctctaactatgatgatatgttctaatgcatgaaattagtga 29306615  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  29306614 taattgaattgttgttggtgaatttgtatgttcaaagtttgtgaaaat-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 29306517  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || ||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  29306516 gaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 29306480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5855007 - 5854677
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| || |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||    
T  5855007 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattg-tgctaattaaggtaaggaggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gt 5854910  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    ||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||    
T  5854909 atgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggcgat 5854811  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || ||||||| || || ||| || |||| |||||||||||    
T  5854810 aattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgagttgtgctatgttgttgttg 5854713  T
Q  308 atttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  5854712 aattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 5854677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Original strand, 20529748 - 20529843
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20529748 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 20529843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33528819 - 33528488
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  33528819 taggagctaaagtgaagtttgagctaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 33528720  T
Q  111 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaata 209  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||||||||||| ||  || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||    
T  33528719 tgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcttagatgttgaattccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgata 33528621  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttga 308  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||    
T  33528620 attgaattgttgttgatgaaattgtatcttcttagtatatgaaaat-gatatatgttgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttga 33528523  T
Q  309 tttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     ||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  33528522 attgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 33528488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 16404857 - 16404931
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16404857 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 16404931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 24716719 - 24716793
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24716719 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 24716793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 39115673 - 39115599
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39115673 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatca 39115599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 274841 - 274767
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  274841 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 274767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 641008 - 641082
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  641008 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 641082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 826814 - 826888
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  826814 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 826888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26011848 - 26011557
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||  | || |||||||||||    
T  26011848 taattaaggtaagggggtta---ttcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgtttaattgagt-aagtgattaattgt 26011754  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||    
T  26011753 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagt 26011654  T
Q  246 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     | ||||| | | ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| ||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  26011653 atgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttg 26011557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15933655 - 15933361
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgtt-catcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  15933655 taattaaggtaagggggttagaattaaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 15933558  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  15933557 tcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 15933458  T
Q  246 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     | ||||| | | || |||||| || ||||||| || || |||||| || | |||||||||||| || || | || |||||| ||||||||||||||||    
T  15933457 atgtgaaagt-gttaaatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 15933361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38533922 - 38533712
Alignment:
Q  132 aattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaat 231  Q
    |||||| ||||||||||||  || |  ||||||| ||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||    
T  38533922 aattgactaattgttcataattgttagaattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaat 38533823  T
Q  232 tgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatca 330  Q
       ||||||||||| |  |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| | || |||||| |||    
T  38533822 ctcatgttcaaagtatgagaaaatgg-tatatgttgaaa-tatgctcaaattattgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttca 38533725  T
Q  331 attgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||    
T  38533724 attgatgttgttg 38533712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 16039002 - 16039073
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16039002 tatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 16039073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 274577 - 274507
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  274577 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 274507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 641272 - 641342
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  641272 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 641342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 827078 - 827148
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  827078 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 827148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 41506930 - 41507001
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  41506930 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 41507001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22743122 - 22742827
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  22743122 taattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgt 22743024  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || ||||||||||||| | ||| || ||| ||||||   || ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||    
T  22743023 tcatagttgttgaaattcgtgctttgattatggtgatatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 22742924  T
Q  246 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     | ||||||| |||||||  || || | ||||| || || |||||| |||| |||||||||||| || || | ||  ||||| | ||||||||||||||    
T  22742923 atgtgaaaat-gatatattgtg-aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 22742827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39115409 - 39115338
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  39115409 tatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 39115338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Original strand, 22497329 - 22497393
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  22497329 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 22497393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 342
Target Start/End: Original strand, 22735914 - 22736021
Alignment:
Q  235 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaatt 333  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||    
T  22735914 atgttcaaagtataaaaaaaatgatatatgttgaat-tatgatcaaattgatgaattatactatgttgttgttggattgtgataagattcatgttcaatt 22736012  T
Q  334 gatgttgtt 342  Q
    |||||||||    
T  22736013 gatgttgtt 22736021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25296426 - 25296295
Alignment:
Q  137 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtat 236  Q
    ||||||||||||||  || | |||||||||| |||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||| |||| ||  ||||| ||    
T  25296426 attaattgttcatacatgttaaaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcat 25296327  T
Q  237 gttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  25296326 gttcaaagcttgtgaaaat-gatatatgttgaa 25296295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25758446 - 25758315
Alignment:
Q  137 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtat 236  Q
    ||||||||||||||  || | |||||||||| |||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||| |||| ||  ||||| ||    
T  25758446 attaattgttcatacatgttaaaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcat 25758347  T
Q  237 gttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  25758346 gttcaaagcttttgaaaat-gatatatgttgaa 25758315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 24716983 - 24717054
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  24716983 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttg 24717054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Original strand, 31194217 - 31194340
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  31194217 taaggtaagggggttagttttcatcataatcatttttagtgcaaattttcaatt-gttgtatgaataattgcttaatt-gagtaattgattaattgttca 31194314  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaatt 174  Q
    |   || |  ||||||||||||||||    
T  31194315 tgattgttagaattcgtgctctaatt 31194340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 253
Target Start/End: Original strand, 23151810 - 23151928
Alignment:
Q  135 tgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgt 234  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||| |||||| || |||  ||| |||||  ||   ||||||||||||||||| ||  ||||      
T  23151810 tgattaattgttcatatttgttaaaattcgtgttccaattatgatgatatatttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 23151909  T
Q  235 atgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  23151910 atgttcaaattgtatgaaa 23151928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Original strand, 27233047 - 27233120
Alignment:
Q  114 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27233047 taagtgcttaattgaat-aagtgattattagttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttt 27233120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Original strand, 38635541 - 38635731
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || ||| |  ||||||||    
T  38635541 taaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgaatctttgttcat 38635639  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttca 241  Q
    |  || |||||||||||||||| || | |||| ||||||  ||  ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||    
T  38635640 agttgttgaaattcgtgctctagttatcatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 38635731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 5143 - 5430
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5143 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttctaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 5242  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5243 gatgaaattcgtgctcttattatgatgagatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 5341  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5342 ataggtatgtg-cgaaaatatgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttg 5430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 8776 - 9066
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8776 taaggtaagggggttagagttcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggaaaattgattaattgttcata 8874  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |    
T  8875 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 8974  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8975 aaaat-gatatatgttg-atatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 9066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 23836601 - 23836889
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  23836601 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgaatgataagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataagt 23836700  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23836701 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattg-tgttagtggaattacatgttcaaagtgtatgaaa 23836799  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  23836800 atgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttg 23836889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 342
Target Start/End: Original strand, 25875816 - 25876102
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25875816 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataagt 25875915  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25875916 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 25876014  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || | ||||||||||| || |||||||    
T  25876015 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgtt 25876102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32466207 - 32465921
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32466207 taaggtaagggg-ttagtcttcatcataatcacttttgaaaattttaattatttgtacgataagtgcttatttgaatgaattgattaattgttcatatgt 32466109  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  32466108 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaa 32466011  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32466010 aatggatatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 32465921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 271521 - 271233
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||      
T  271521 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattattcataaa 271423  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  271422 tgaagaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-a 271324  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  271323 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 271233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 4448028 - 4448317
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||      
T  4448028 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttatatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataaa 4448127  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  4448128 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-a 4448226  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | | | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4448227 aatgggtttgtgttgaaaatatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 4448317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 36890581 - 36890869
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||      
T  36890581 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgttattttcaattatg-gtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 36890679  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  36890680 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatggcatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 36890779  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36890780 aatgga-atatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttg 36890869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25602377 - 25602070
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  25602377 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatg 25602279  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||    
T  25602278 gatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatg 25602181  T
Q  251 a-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattga---tgttgttgcta 346  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  25602180 agaaattgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgcta 25602081  T
Q  347 tgtcatgttgt 357  Q
    |||||||||||    
T  25602080 tgtcatgttgt 25602070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28974400 - 28974112
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  28974400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattatttcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 28974302  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |  |||    
T  28974301 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgagaa 28974202  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28974201 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 28974112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27262156 - 27261915
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27262156 taaggtaagggagttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatg 27262058  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||    
T  27262057 gatgatgaaatttgtgccctaattatgatgacatgtttggatgtataaagttatggataattgaattgttgttagttcaattacatgttcaaa--gtatg 27261960  T
Q  251 a-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 295  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27261959 agaaattggtatatgttgaaaatatgctc-attggtgaattatgct 27261915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 24571188 - 24571476
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaat-tttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  24571188 taaggttagggggttagaattcatcataatcattattgcaatgtttcaattatt-gtatgaataaatgcttaattgggt-aattgattaattgttcatag 24571285  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||   ||||  |||||||| || |  ||    
T  24571286 atgatgaaattcgtgctctaattttgatgacacgtttgaatgcatgaagttgtggatacttgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaggtatgaga 24571385  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24571386 aaat-gatatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttg 24571476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 345
Target Start/End: Original strand, 22579758 - 22580045
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  22579758 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 22579855  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | |||| |||| || |  ||    
T  22579856 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatgtatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaactttatgatcaaggtatgaga 22579954  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgct 345  Q
    |||  | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22579955 aaaatgttatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgct---ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgct 22580045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 68351 - 68055
Alignment:
Q  49 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaatt 143  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  68351 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataaattttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaatagattaatt 68254  T
Q  144 gttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa 243  Q
    |||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||    
T  68253 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 68154  T
Q  244 gtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    || |  |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  68153 gtatgagaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgtt 68056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43646289 - 43645956
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaattttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||| |||| | |  |||    
T  43646289 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcagtcataatcatttttagtgtaaatttccaattgttg 43646190  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    ||||| |||||| |||||||  | ||| ||||||||||||| |  || |  |||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  43646189 tatgaataagtgtttaattgagtaaat-gattaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttga 43646091  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||  ||||| ||||| |  |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43646090 taattggattgttgttggtgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgtt 43645993  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  43645992 gaactgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttg 43645956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15633612 - 15633535
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 88  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  15633612 cataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatcactt 15633535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Original strand, 31146073 - 31146360
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||    
T  31146073 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatcttttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaataagtgcttaactgagt-aattgattaattgtcca 31146171  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  |||||||| || |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |     
T  31146172 taattgttagaattcgtgttccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatg 31146271  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgtt 339  Q
     |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||  |||| ||| || ||||||||||||    
T  31146272 agaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatg-tgttgttgaattgtaataagattcctgttcaattgatgtt 31146360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 19794586 - 19794660
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19794586 cataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 19794660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 20627195 - 20627269
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  20627195 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatca 20627269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22275120 - 22275046
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22275120 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatca 22275046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22284353 - 22284279
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22284353 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 22284279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6879601 - 6879500
Alignment:
Q  241 aaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttg 340  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||    
T  6879601 aaagtgtatgaaaatgggtatgtgt-gaaaatatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttg 6879503  T
Q  341 ttg 343  Q
    |||    
T  6879502 ttg 6879500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660098
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||  |||  |||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaa-ggggttagaattcatcataatcactttagtgtaatttttcatttgttgta 19660175  T
Q  111 tga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtt 187  Q
    ||| |||||| |||| ||||  || |||||| |||||| ||  || |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  19660174 tgattaagtgtttaa-tggaataagtgattatttgttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatgatatgtt 19660098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 43642838 - 43642912
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  43642838 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatca 43642912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19666921 - 19666688
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||    
T  19666921 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgta 19666823  T
Q  111 tg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaata 209  Q
    || |||| |||||||||| || || ||||||||||||||||  || | |||||| |||||||| | | |||| ||||||  ||| ||||| ||    |||    
T  19666822 tgaataaatgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcatgctctaactataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgata 19666724  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||||||||||| || ||  | ||| |||||||||||    
T  19666723 attgaattgtttttggtgaatttgcatgttcaaagt 19666688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25305818 - 25305634
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatg-ata 115  Q
    ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  | ||||||| |||||  ||||||| |||    
T  25305818 aaagtgaagcttgggctatgaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtataattttacaatt-gttgtatgaata 25305720  T
Q  116 agtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt 202  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||||| |  || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  25305719 agtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtt 25305634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 722742 - 722531
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||  || ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||     
T  722742 taaggtaaaggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttgcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataa 722645  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     || | |||||||||||| |||| ||||   ||||||  ||||||||| ||    |||||||| |||||||| ||  ||||| ||| ||||||| |||||    
T  722644 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatattatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatga 722545  T
Q  252 aaatagatatatgtt 266  Q
    |||| ||||||||||    
T  722544 aaat-gatatatgtt 722531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 23821534 - 23821713
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  23821534 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23821631  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatt 232  Q
      || | ||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||| | |||||| |  |||||||||||||||||  |||||||    
T  23821632 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttgattgaatt 23821713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 23830613 - 23830792
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  23830613 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23830710  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatt 232  Q
      || | ||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||| | |||||| |  |||||||||||||||||  |||||||    
T  23830711 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttgattgaatt 23830792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 343
Target Start/End: Original strand, 21274174 - 21274241
Alignment:
Q  276 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||    
T  21274174 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 21274241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22274856 - 22274785
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||||||||||||| | ||||||||    
T  22274856 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttg 22274785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9636943 - 9636808
Alignment:
Q  207 ataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgt 305  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||  ||||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||    
T  9636943 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat-tatgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgt 9636846  T
Q  306 tgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| ||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||    
T  9636845 tgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 9636808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Original strand, 19669003 - 19669101
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  19669003 taaggtaacggggttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aaatgattaattgttcat 19669100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25305573 - 25305508
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttg-ttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  25305573 aattgttgaattatgctatgttgattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttg 25305508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Original strand, 19433452 - 19433516
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  19433452 aattgttgaattatgctatgttgttattgaattgttgtaagaatcatgttcaattgatgttgttg 19433516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22284089 - 22284029
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  22284089 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaat 22284029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 343
Target Start/End: Original strand, 22775331 - 22775389
Alignment:
Q  285 tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
T  22775331 tgaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttg 22775389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 343
Target Start/End: Original strand, 22780709 - 22780767
Alignment:
Q  285 tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
T  22780709 tgaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttg 22780767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 339
Target Start/End: Original strand, 24341519 - 24341584
Alignment:
Q  274 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgtt 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || | |||||| ||||||||||||    
T  24341519 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 24341584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 343
Target Start/End: Original strand, 25265520 - 25265589
Alignment:
Q  274 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || | ||   |||| ||||||||||||||||    
T  25265520 tgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 25265589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 340
Target Start/End: Original strand, 9653021 - 9653085
Alignment:
Q  276 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttg 340  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| | ||  ||||||||||||| |||||||    
T  9653021 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttg 9653085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Original strand, 16292921 - 16292985
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  16292921 aattgttgaattgtactatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 16292985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25595147 - 25595083
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  25595147 aattgttgaattgtgctatgttgtttttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 25595083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 496 - 207
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  496 taaggtaagggggttagaattaatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 397  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||  |||||||||||    
T  396 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaaattcatgtttcaagtgtatgaa 297  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  296 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 22403005 - 22403294
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22403005 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 22403104  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22403105 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtctagatgtatgaagttatgaataattaaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 22403203  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  22403204 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttg 22403294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 49968002 - 49967713
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  49968002 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcacttattgtaattttcaattatttgcatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcaaaaa 49967903  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||  ||    
T  49967902 tcatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaattata-aaa 49967804  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  49967803 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttg 49967713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 61 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41212415 - 41212135
Alignment:
Q  61 agggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaa 160  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41212415 agggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaa 41212316  T
Q  161 ttcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aaaatagat 259  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| | |    
T  41212315 ttcgtgctctaattatgatgacctgtttagaggtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaactgtatgttcaaa--gtatgaaaaatgggt 41212218  T
Q  260 atatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  41212217 atgtg-taaaaatatgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttg 41212135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 9783959 - 9784245
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  9783959 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttactgcaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgataaattgttcataag 9784058  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||     
T  9784059 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagt--atgag 9784156  T
Q  253 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784157 aagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgct---ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 9784245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35055108 - 35054819
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta-attttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||      
T  35055108 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttatttctattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattggttaattgttcataaa 35055009  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  35055008 tgatttaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 35054911  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35054910 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttg 35054819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 95 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21718537 - 21718291
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21718537 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatggatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgt 21718439  T
Q  195 atgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21718438 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgagaaattggtatgtgttcaaaatatgctcaattggtgaattatg 21718341  T
Q  294 ctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21718340 ctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 21718291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 35522247 - 35522426
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  35522247 taaggtaagggagttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagggcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35522346  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35522347 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatt 35522426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20177570 - 20177238
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |    
T  20177570 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-g 20177472  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    |||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| | |||||| |  |    
T  20177471 tatgtttaagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttga 20177373  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20177372 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgtt 20177275  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || |||||||||   ||| | ||||||||||||||||    
T  20177274 gaattgtggtaaaagtcaagttcaattgatgttgttg 20177238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 343
Target Start/End: Original strand, 27329757 - 27329939
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaataga 258  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |  ||| ||||||| | ||||||  |     
T  27329757 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatga-taattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgtgaaaagtgg 27329855  T
Q  259 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27329856 gttatgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttg 27329939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522503
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 35522503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41218803 - 41218729
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41218803 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatca 41218729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16646266 - 16645975
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  16646266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16646169  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||| ||||| |||| ||  ||||  ||||||||||| |     
T  16646168 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataatttaattgatgttggtaaaatttcatgttcaaagtatg 16646069  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     |||| | |||||||||||||  ||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16646068 agaaagt-gatatatgttgaat-tattctcaaattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 16645975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376923
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-g 13376809  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||   | |||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  13376810 tatgattaagtgcttaatttagt-aattgattaattgttcatagatgatgagaatcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttga 13376908  T
Q  208 taattgaattgttgt 222  Q
    ||||| |||||||||    
T  13376909 taattaaattgttgt 13376923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16656992 - 16656701
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  16656992 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16656895  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||  || |   |||||||||| |     
T  16656894 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 16656795  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
T  16656794 agaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttg 16656701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 51627558 - 51627848
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  51627558 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gcatgaataagtgcttaattgagt-aattgattatttgttcat 51627655  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |   | |  |||| |||||| |||| |||||| ||| ||  ||| ||||| || |  || |||||||||||||||||  || |  ||||||||||| |      
T  51627656 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgatatgcttgaatgcatgaatttgttgatgattgaattgttgttagtgaaacttcatgttcaaagtatga 51627755  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  51627756 gaaaatgg-tatatgttgaaa-tatgttcaattggttgaattatgatatggtgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 51627848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21860409 - 21860335
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21860409 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 21860335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Original strand, 37233750 - 37234044
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | || ||| |||||||    
T  37233750 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtattattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgt 37233847  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    | |||  || |  |||||||||| || || |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  37233848 taatagttgttagaattcgtgctttagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcaaagt 37233947  T
Q  246 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     ||||||| | |||||||||||||  ||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  37233948 atatgaaagt-gatatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 37234044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034902
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 44034902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17609322 - 17608991
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||    
T  17609322 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gt 17609224  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    ||||| |||||||||||||  | || |||||| ||| |||||  || |  |||||||||||||||| |||||| || |||  ||| ||||| ||    ||    
T  17609223 atgattaagtgcttaattgagt-aagtgattagttgatcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgat 17609125  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||| |||||||||||    
T  17609124 aattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttg 17609027  T
Q  308 atttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | || || | || |||||| ||||||| ||||||||    
T  17609026 aattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttg 17608991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41394602 - 41394528
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41394602 cataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 41394528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19603449 - 19603238
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  19603449 taaggtaagggggctagaattcatcataatca-tttagtgcaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 19603353  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || | |||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||||||||| ||    |||||||| |||||||| ||  ||||| ||| ||||||| |||    
T  19603352 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatat 19603253  T
Q  250 gaaaatagatatatgt 265  Q
    |||||| |||||||||    
T  19603252 gaaaat-gatatatgt 19603238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21195408 - 21195077
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| || ||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||    
T  21195408 taggagctaaagtgaagcttgggctaggatttg-tgctaactaaggtaaggggtttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgt 21195310  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    ||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||| ||    ||    
T  21195309 atgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgat 21195211  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||  || || ||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  21195210 aattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttg 21195113  T
Q  308 atttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||||| | ||  ||||| | |||| |||||||||    
T  21195112 aattgtgatgagaatcatgtttaattaatgttgttg 21195077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Original strand, 22143256 - 22143448
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22143256 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 22143352  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |  || | ||||||||||||||| | ||||||  |||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  22143353 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagt 22143448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 15861547 - 15861617
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  15861547 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 15861617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21860145 - 21860074
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||||    
T  21860145 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttg 21860074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 44035092 - 44035163
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  44035092 tatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 44035163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 8537803 - 8538007
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||    
T  8537803 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8537901  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
       || ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  8537902 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 8538001  T
Q  250 gaaaat 255  Q
    ||||||    
T  8538002 gaaaat 8538007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 8603042 - 8603246
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||    
T  8603042 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8603140  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
       || ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  8603141 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 8603240  T
Q  250 gaaaat 255  Q
    ||||||    
T  8603241 gaaaat 8603246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 343
Target Start/End: Original strand, 9784238 - 9784284
Alignment:
Q  297 tgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9784238 tgttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttg 9784284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20445812 - 20445747
Alignment:
Q  274 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgtt 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  20445812 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgtt 20445747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20531577 - 20531512
Alignment:
Q  274 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgtt 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  20531577 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgtt 20531512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22367152 - 22367082
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  22367152 tatgctcaattggtgaat-atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 22367082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675120
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatc 84  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatc 27675120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25093986 - 25093922
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  25093986 aattgttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 25093922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 11603 - 11892
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11603 taagctaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 11702  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  |||||    
T  11703 tgatgaaatttgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggatgaattacatgttcaaagt--atgaa 11800  T
Q  253 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11801 aaatgggtattagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 11892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23043 - 22754
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23043 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatcaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 22944  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  22943 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttttgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 22846  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22845 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 22754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4635 - 4351
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4635 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacgtttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 4536  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4535 gatgaaattcgtgctctaattataatgacatgtttagatgtatcaaattatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 4437  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttg 340  Q
    || | ||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  4436 atgggtatgtg-tgaaaatatgttcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 6)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 164565 - 164278
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  164565 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaattgtatggtaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataagt 164466  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  164465 gatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 164367  T
Q  254 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||||    
T  164366 atgggtatgtg-tgaagatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttg 164278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 166121 - 166195
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  166121 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 166195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162109
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 162109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 90
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116487
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 90  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcattttt 116487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 162299 - 162370
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  162299 tatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 162370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 166385 - 166456
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  166385 tatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 166456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 717 - 1006
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  717 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattgattgttcatatg 816  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||    
T  817 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagatgaattacatgttcaaagt--atgaa 914  T
Q  253 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  915 aaatgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttg 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 63 - 343
Target Start/End: Original strand, 6749 - 7029
Alignment:
Q  63 ggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaat 161  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6749 ggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgatcagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatatgtgatgaaat 6848  T
Q  162 tcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatat 261  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||    
T  6849 tcgtgctctaattacgaggacatgtttagatgtatgaagttatgaatagttgaattgttgttggttgaattacatgttcagagtgtatgaaaatgggtat 6948  T
Q  262 atgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6949 gtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttg 7029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10289 - 10000
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  10289 taaggtaagggggttagaattcataataatcattattgcaaattttcaattctttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 10190  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  10189 tgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagagtatgaa 10090  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10089 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 10000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25563 - 25274
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25563 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 25464  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||| |||    
T  25463 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25364  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25363 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttg 25274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 153 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25210 - 25021
Alignment:
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||| |||    
T  25210 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25111  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25110 aaggg-tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttg 25021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18570630 - 18570353
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18570630 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 18570531  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||  ||||| ||    
T  18570530 gatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgatgttatggataattgaattgttattagttaaattacatgttcaaa--gtatgaaa 18570433  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaat 332  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18570432 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 18570353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32899142 - 32898853
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  32899142 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 32899043  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  32899042 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 32898945  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32898944 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttg 32898853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22441285 - 22440997
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  22441285 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcatatat 22441186  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||  ||||| |||  ||||| ||    
T  22441185 gatgaaattcgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtgatggggtgaattacatgttaaaa--gtatgaaa 22441088  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22441087 aatgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttg 22440997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 340
Target Start/End: Original strand, 13014603 - 13014890
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattat--ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13014603 taaggtaagggggttagaatttatcataatcacttattgtaattttcaattatgtttgtatgaaaagtgctaaattgggtgaattgattaattgttcata 13014702  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||    
T  13014703 agtgatgaaattcgtgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttgaa---gtatg 13014799  T
Q  251 -aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttg 340  Q
     ||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  13014800 aaaaatgggtatgagttggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttg 13014890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16106868 - 16106579
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||      
T  16106868 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattaattaattgttcgtaaa 16106769  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||    
T  16106768 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 16106671  T
Q  253 aataga-tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16106670 aaatgagtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttg 16106579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16086369 - 16086080
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  16086369 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 16086270  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  | |||    
T  16086269 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattacatgttcaaagt--acgaa 16086172  T
Q  253 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || | | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16086171 aaatgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttg 16086080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18432994 - 18432706
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  18432994 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaaattttcaattatt-gtatgaaaagagcttaattgggtgaattgattatttgttcataaa 18432896  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||| |||  ||||| |    
T  18432895 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatacttgaattgttgttgattgaattacatgttaaaa--gtatgaa 18432798  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18432797 aaatgggtgtatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttg 18432706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31628552 - 31628331
Alignment:
Q  121 ttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtt 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31628552 ttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtattcgaattatgattacatgtttagatgtatgaagttattgataattgaattgtt 31628453  T
Q  221 gttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaag 319  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31628452 gttagttgaattacatgttcaaagt--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataag 31628355  T
Q  320 tttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31628354 tttcatgatcaattgatgttgttg 31628331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18777481 - 18777209
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||                 ||||||      
T  18777481 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattggaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattg-----------------ttcataaa 18777399  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  18777398 agatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 18777301  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  18777300 aaatgggtatgtgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttg 18777209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18399290 - 18399001
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  18399290 taaggtaagggggttagaattcttcataatcattttagtgtaaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcata 18399193  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  18399192 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 18399093  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  18399092 aaaatag-tatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 18399001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21623563 - 21623231
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattt-tcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||| || |    
T  21623563 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttctcaattgtt-g 21623465  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  21623464 tatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcataaatgttagaattcgtgctccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttga 21623366  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21623365 taattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgtt 21623268  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  21623267 gaattgtggtaagaatcatgttctattgatgttgttg 21623231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 22361619 - 22361949
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgtaatttt-caattatttgta 110  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||    
T  22361619 taggagctaaagtgaagcttggcctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtaatttttcaattgtt-gta 22361717  T
Q  111 tga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaata 209  Q
    ||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||    
T  22361718 tgaataagtgcttaattg-agcaaatgattaattgttcatagatgataaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgata 22361816  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttga 308  Q
    ||||||||||||||  |  ||||  ||||||||||| |  |||| | || ||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22361817 attgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gacataagttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttga 22361914  T
Q  309 tttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     ||||| | |  |||||| ||||||||||||||||    
T  22361915 attgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttg 22361949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18583715 - 18583641
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18583715 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 18583641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 25367130 - 25367421
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  25367130 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagcaattgattaattgttcat 25367227  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaag-ttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  |||||||||| || |  ||||| |||||||||||||   ||||  ||||||||||| |     
T  25367228 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaagttttttgataatggaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatg 25367327  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     |||| | | | ||||||| |||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25367328 agaaagt-ggtttatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 25367421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 17083093 - 17083381
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||     
T  17083093 taaggtaagggggttagaattcattttaatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatag 17083191  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     || | | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| |  ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | |||    
T  17083192 ttgttaatattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtga-taattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtga 17083290  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| |||||||||||||  | ||||| || || |||||| |||| |||||||||||| ||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  17083291 aaat-gatatatgttgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 17083381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 19983149 - 19983223
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19983149 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 19983223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 35015014 - 35015088
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  35015014 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 35015088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 18629469 - 18629695
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aag 117  Q
    ||||||||||||| | ||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||    
T  18629469 aaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaattttttatttgttgtatgattaag 18629568  T
Q  118 tgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaat 216  Q
    || ||||||| || || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  18629569 tgtttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatg-ataattgaat 18629666  T
Q  217 tgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  18629667 tgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 18629695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33325046 - 33324874
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatt--ttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||  |||||||| | |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33325046 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattatttcaattaat-gtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttca 33324949  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 223  Q
    ||  || | ||||||||||||||| |  ||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||||||||||||||    
T  33324948 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgataattgaattgttgtt 33324874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18583451 - 18583380
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18583451 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttg 18583380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 307
Target Start/End: Original strand, 21410944 - 21411197
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  21410944 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gaggaattgactaattgttcat 21411041  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |   | |  |||| |||||| |||| |||||  |||| |  ||| |||||||| |  |||||||||| |||||||  | ||||  ||||||||||| |      
T  21411042 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgttatgtatgaatgcatgaagttgttgataattgaatggttgttaaataaatttcatgttcaaagtatga 21411141  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    |||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||    
T  21411142 gaaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatgctatgttgatgttg 21411197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26089869 - 26089798
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26089869 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 26089798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 245
Target Start/End: Original strand, 17556909 - 17557104
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatca-cttttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 146  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| || || ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  17556909 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatctagtgtaatttttcattaattgcattattaagtgcttaattgaat-aattgattatttgtt 17557007  T
Q  147 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  17557008 catagttgtt-aaattcgtgctctaattatgatgatatgttt-gatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 17557104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 343
Target Start/End: Original strand, 18381684 - 18381867
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaataga 258  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || |||  ||  |||||||| |  |||||||||| |||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||    
T  18381684 aatttgtgctctaattatgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-ga 18381782  T
Q  259 tatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  18381783 tatatgttgaat-tatgcttaaattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttg 18381867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 35135906 - 35136078
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35135906 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattagat-aattgattaattgttca 35136003  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgtt 223  Q
    ||  || | ||||||||||||||| |  ||||| ||||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  35136004 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgtt 35136078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 15742341 - 15742412
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  15742341 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 15742412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23995057 - 23994986
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  23995057 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 23994986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 18002617 - 18002688
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  18002617 tatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 18002688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 35015278 - 35015349
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  35015278 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 35015349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Original strand, 16887685 - 16887881
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||||    
T  16887685 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattgaat-aaatgattaattgttca 16887782  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    ||  || | ||||||||||||||| | |||| | ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  16887783 tagatgttaaaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtgt 16887881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25651435 - 25651300
Alignment:
Q  207 ataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgt 305  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||||| | | |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||| |||||||||    
T  25651435 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagt-gttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgt 25651338  T
Q  306 tgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| || || | || |||||| ||||||||||||||||    
T  25651337 tgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 25651300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Original strand, 15079606 - 15079797
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15079606 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattattt-tatgaataagggattaattggat-aattgattaattattcat 15079702  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    |  || | ||||||||||||||| |  ||||| |||||   ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  15079703 agatgtt-aaattcgtgctctaactaggatgatatgttgt-atgcatgaagttgaggataattgaattgttgtt-gtgaaattgcatgttcaaagtgt 15079797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 343
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744397
Alignment:
Q  277 tcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttg 25744397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29605739 - 29605632
Alignment:
Q  114 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattg 213  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||    
T  29605739 taagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaa-ttagtgataattg 29605642  T
Q  214 aattgttgtt 223  Q
    ||||||||||    
T  29605641 aattgttgtt 29605632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34967065 - 34966930
Alignment:
Q  207 ataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgt 305  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||  ||||  | | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34967065 ataattgaattgttgttcgtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaa-agatatattgtgaat-tgtactctaattgttgaattatgctatgttgttgt 34966968  T
Q  306 tgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||    
T  34966967 tgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 34966930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 343
Target Start/End: Original strand, 28195101 - 28195278
Alignment:
Q  166 gctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgt 265  Q
    |||| |||| |||||| ||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| |  |||||| | ||||||     
T  28195101 gctccaattatgatgatatgtttgaatgtatgaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcatagtatgagaaaat-ggtatatga 28195199  T
Q  266 tgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaag-tttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || |||| ||||||||| | ||||||||||  || ||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  28195200 tg-aaatgtgctcaattagttgaattatgccatgatgttgttgaattgtgatgagattttatgatcaattgttgtggttg 28195278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Original strand, 33538223 - 33538384
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || |||  || |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  33538223 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgcgaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 33538322  T
Q  111 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaa 172  Q
    |||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  33538323 tgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaa 33538384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27740971 - 27740898
Alignment:
Q  274 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgctat 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| | || | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27740971 tgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctat 27740898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 343
Target Start/End: Original strand, 35009569 - 35009638
Alignment:
Q  274 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || | ||   |||| ||||||||||||||||    
T  35009569 tgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 35009638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 14152704 - 14152632
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  14152704 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggcaagggggttattcttcatcataatca 14152632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48496 - 48219
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48496 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 48398  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  48397 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagt--atgaaa 48300  T
Q  254 a-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattg 334  Q
    | | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  48299 aatgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattg 48219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 61944 - 61667
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  61944 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 61846  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  61845 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagt--atgaaa 61748  T
Q  254 a-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattg 334  Q
    | | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  61747 aatgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattg 61667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4913 - 4626
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4913 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 4816  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| ||    
T  4815 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaaa 4718  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||  |||||  ||||||||||||||||    
T  4717 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttg 4626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9527 - 9240
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9527 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 9430  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| ||    
T  9429 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaaa 9332  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||  |||||  ||||||||||||||||    
T  9331 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttg 9240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 370 - 84
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 271  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||     
T  270 tgatgaaattcgtgctctaat---gatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattgcatgttcaaa--gtatgag 176  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  175 aaattggtatatgttgaaaatatgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 84  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 132144 - 132434
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  132144 taaggtaagggggttggaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttctatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 132243  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg- 250  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||     
T  132244 atgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattatatgttcaaa--gtatga 132341  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  132342 aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 132434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 88631 - 88341
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  88631 taataaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgtcca 88532  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||  |||    
T  88531 taaatgatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaaatgttgttagttgaattacatgttcaaa--gta 88434  T
Q  249 tg-aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttg 340  Q
    || ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  88433 tgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgatcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttg 88341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12041 - 11750
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12041 taaggtaaggtggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtcaattgattaattgttcata 11943  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |    
T  11942 aatgatgaatttcgtgctctaattatgatgacatgtttcaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 11843  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11842 aaaa-agatatgagttgaaaacatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 11750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16253 - 16022
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaatt-gttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16253 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 16155  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |      
T  16154 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 16055  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattg 283  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  16054 gaaaat-gatatgagttgaaaatatgctccattg 16022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25784 - 25553
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaatt-gttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25784 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 25686  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |      
T  25685 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgttttaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 25586  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattg 283  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  25585 gaaaat-gatatgagttgaaaatatgctccattg 25553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7234
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7522 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 7425  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| ||    
T  7424 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaaa 7327  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaatt-gatgttgttg 343  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||  |||||  |||||| ||||||||||    
T  7326 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattggatgttgttg 7234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 61159 - 60869
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  61159 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 61060  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg- 250  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||     
T  61059 atgatgaaattcgtgctctaattatgataacatgtttagatgtatgatgttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatga 60962  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| | ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  60961 aaaatgggtatgtgttaaaaatatacttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 60869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 70552 - 70806
Alignment:
Q  89 ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  70552 ttgtaattttcaattatttgtaagaaaagtgcttatttggatgagttgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 70651  T
Q  189 agatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtg 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70652 agatgtatgaagttaatgaataattgatttattgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaaaagtaggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtg 70749  T
Q  287 aattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  70750 aattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttg 70806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 193
Target Start/End: Original strand, 79785 - 79925
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  79785 taagctaagggggttagaattgatcataatcactcattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 79884  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatg 193  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  79885 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatg 79925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7922 - 7632
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  7922 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 7823  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgac-atgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg- 250  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||     
T  7822 tgatgaaattcatgatctaattatgatgcctatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatga 7725  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7724 aaaatgggtatatgatgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 7632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 24623 - 24912
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||      
T  24623 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgaaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgtccataaa 24722  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  24723 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttattgataattaaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 24820  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24821 aaatgggtatgtgttgaacatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 24912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 95109 - 95038
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  95109 tatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 95038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 85683 - 85395
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      
T  85683 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtttataaa 85585  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||     
T  85584 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 85487  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  85486 aaattggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 85395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 159651 - 159362
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  159651 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtacgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 159553  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  159552 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatggcattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 159453  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  159452 aat-gatatgagttgaaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 159362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 70964 - 70674
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||      
T  70964 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgtaattttcagttatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaatagtttataaa 70866  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  70865 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatt-catgttcaaagtatgagaa 70767  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgct 345  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70766 aatgga-atatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct 70674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 95 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31352 - 31105
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31352 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattatttgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgt 31254  T
Q  195 atgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaa-ttatg 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  31253 atgaagttatggataattgaattgtggttagttgaatt-catgttcaaagtataagaaaat-ggtatatgttgaaaatatgctcaatttgttaagttatg 31156  T
Q  294 ctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgct 345  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31155 -tttgtagttgttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgct 31105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Original strand, 97088 - 97382
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgata-agtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||||  ||| | ||||||||||    
T  97088 taatgaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgatttagtgtttaattgagtgagt-gattaattgt 97185  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| || || ||    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  97186 tcatagttgttaagattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcataaaattggtgataattgaattgttgttggtggaattgcatgttcaaagt 97285  T
Q  246 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     | ||||| | | ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||| || || | || |||||| ||||||||| ||||||    
T  97286 atgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttggtgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatattgttg 97382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11752
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||      
T  11464 taaggtatgggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaagtgtttaattgt-tgaattgattaattgttcataaa 11562  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||  ||||| |    
T  11563 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaa--gtatgaa 11660  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  11661 aaatgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttg 11752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 117857 - 118147
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  117857 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 117955  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  117956 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atg 118053  T
Q  251 aaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | || | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  118054 agaagttggtatatgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttg 118147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 109356 - 109646
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  109356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 109454  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||    
T  109455 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatg 109552  T
Q  251 a-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | |||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  109553 agaaattggtatatattgaaaatatgataaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 109646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 112441 - 112729
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||      
T  112441 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtacttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 112539  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga- 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||     
T  112540 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaacaattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 112637  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  112638 aaattggtatatgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttg 112729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Original strand, 102815 - 103102
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  102815 taaggtaaggggtttataattcatcataatcattttttgtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 102912  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgta 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |     
T  102913 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtttttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 103012  T
Q  249 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgtt 339  Q
     |||| | | |||||| ||  |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  103013 agaaagt-ggtatatggtg-gaatatgctaaatttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataacattcatgttcaattgatgtt 103102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 109737 - 109653
Alignment:
Q  259 tatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  109737 tatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattttgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttg 109653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9339 - 9050
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt--caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| | ||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||     
T  9339 taaggtaagggggttagaatttatcataatcattattgcaattttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaatttttcataa 9241  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  9240 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atga 9143  T
Q  252 aaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9142 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttg 9050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38650 - 38361
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  38650 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 38551  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| | |   |    
T  38550 tgatgaaatacgcgctctaattatgatgacatgtttagatttatgaatttatgaataattgaatttttgttggttgaattacatgttcaaag-gaagaga 38452  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38451 aatgggtatatgttgaaaatatgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttg 38361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 73 - 342
Target Start/End: Original strand, 252903 - 253172
Alignment:
Q  73 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 171  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| |     
T  252903 ttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtgcataaatgataaaattcgtgctttg 253002  T
Q  172 attgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaa 270  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||| |||| | ||||||||||||    
T  253003 attatgatgacatgtttggatgtatgaagttagggataattgaattgttgttagttgaattacattttcaaa--gtatgagaaattggtatatgttgaaa 253100  T
Q  271 atatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  253101 atatgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 253172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 8
Alignment:
Q  15 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgat 65  T
Q  115 aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  64 aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctcta 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21862 - 21575
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  21862 taaggtaagggggttataattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaaaggcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 21764  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  21763 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 21665  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21664 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttg 21575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31561 - 31257
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  31561 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 31463  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 252  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  31462 tgatgaaattcatgatctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattaaatgttcaaagtatgagaa 31364  T
Q  253 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatg---ttgttgctatgt 349  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||    
T  31363 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagt 31265  T
Q  350 catgttgt 357  Q
    ||||||||    
T  31264 catgttgt 31257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Original strand, 47445 - 47554
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  47445 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 47543  T
Q  153 tgatgaaattc 163  Q
    |||||||||||    
T  47544 tgatgaaattc 47554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34014 - 33725
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 151  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  34014 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattact-gtatgattaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcgtaa 33916  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  33915 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatga 33818  T
Q  252 -aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     |||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33817 gaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 33725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 471 - 760
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  471 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcatttattgctatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 568  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |  |    
T  569 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaaattatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgag 668  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  669 aaaat-ggtatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2263 - 1979
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgat 156  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  2263 gtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgctcataaatgat 2165  T
Q  157 gaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaata 256  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||     
T  2164 gaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgcgaaaat- 2066  T
Q  257 gatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2065 ggtatatgatgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatg-tgttgttgatttgttataagattcatgatcaattgatgttgttg 1979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 46521 - 46228
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 148  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46521 taattaaggtaagagggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 46423  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttg-aattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||| |    
T  46422 taaatgatgaaattcgtactctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtat 46323  T
Q  248 atgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     ||||||  |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46322 gtgaaaagtgggttatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttg 46228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41010 - 40721
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  41010 taaggtaagggggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaatagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 40912  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttg-aattgtatgttcaaagtgtatga 251  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||| | |||    
T  40911 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtatgtga 40812  T
Q  252 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||  |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40811 aaagtgggttatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttg 40721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 80262 - 80188
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  80262 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 80188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 79998 - 79927
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||||    
T  79998 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttg 79927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 115 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5231 - 5004
Alignment:
Q  115 aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattga 214  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5231 aagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattga 5132  T
Q  215 attgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgt 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5131 attgttgttagttgaattacatgttcaca--gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgt 5034  T
Q  314 ggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5033 gataagtttcatgatcaattgatgttgttg 5004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 208
Target Start/End: Original strand, 2961 - 3115
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2961 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataaatgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 3060  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3061 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 3115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 95 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6251 - 6003
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  6251 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgacgacatgtttgaatgt 6153  T
Q  195 atgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatg 293  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6152 atgaagttatggataattggattgttgttggtagaatttcatgttcaaagtatgagaaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatg 6053  T
Q  294 ctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || ||| |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  6052 ctatgtggttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttgttg 6003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 309 - 383
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  309 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatca 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 572 - 643
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  572 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 158 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 146848 - 146664
Alignment:
Q  158 aaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-aaaata 256  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||     
T  146848 aaattcatgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgtataattgaactgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaaaaatg 146751  T
Q  257 gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  146750 ggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 85818 - 85683
Alignment:
Q  118 tgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt 217  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||    |||||||||||    
T  85818 tgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttta-atgcatgaaattggtgataattgaatt 85721  T
Q  218 gttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaat 255  Q
    |||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  85720 gttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 85683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 53703 - 53409
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  53703 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 53606  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || |  ||||| |||||||||  |||||| ||||||  ||| ||||  ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  53605 tcatagttgttagaattcatgctctaataatgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 53506  T
Q  246 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     | ||||  | | ||||||||| || ||||||| || || | ||||||||| | |||||| ||| ||||| | || |||||| ||||| ||||||||||    
T  53505 atgtgaaggt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttcaattatgctattttgttgatgaattgtgatgagattcatgttcaatggatgttgttg 53409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8982 - 8909
Alignment:
Q  274 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgctat 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || | || ||| |||||||||||| |||||||    
T  8982 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctat 8909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 76699 - 77031
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |    
T  76699 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-g 76797  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    |||||| |||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |    
T  76798 tatgattaagtacttaattgagt-aattgagtaattgttcatagatgatgaaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttga 76896  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  76897 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgttcaaattgttgaattatgctatgttgttgtt 76994  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    || ||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  76995 gaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttg 77031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 33622 - 33912
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  33622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 33719  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||||    
T  33720 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaa--gtat 33817  T
Q  250 gaa-aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| ||  | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33818 gaagaagtgttatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 33912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3671 - 3385
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  3671 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 3574  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  3573 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttaatgttcaaagtatgag 3474  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttg 340  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3473 aaagt-ggtatatg-tgaaaatatgctcaattggtccaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttg 3385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 197107 - 197437
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  197107 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattg-tgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 197205  T
Q  111 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaata 209  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  || |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| || |  |||    
T  197206 tgattaagtgcttaattggat-aagtgattaattgttcttagatgttgaatttcgggctctaattatgatgatatgtttgaatgtatgaaattgttgata 197304  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttga 308  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||| | ||||| | | |||| |||| || ||||||| || || |||||| | || ||||||||||||    
T  197305 attgaattgttgttggtgaaattgcaagttcaaagtatgtgaaagt-gttataagttg-aattatgctctaaatgttgaattgtcctatgttgttgttga 197402  T
Q  309 tttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
     ||||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  197403 attgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 197437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2795 - 2588
Alignment:
Q  135 tgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgt 234  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||||     
T  2795 tgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgc 2696  T
Q  235 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaatt 333  Q
    ||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || || | || |||||| ||||||    
T  2695 atgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaatt 2598  T
Q  334 gatgttgttg 343  Q
    ||||||||||    
T  2597 gatgttgttg 2588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 617 - 702
Alignment:
Q  258 atatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  617 atatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 69843 - 69520
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aa 116  Q
    ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  69843 aaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaagataagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaa 69745  T
Q  117 gtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaat 216  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||    ||||||||||    
T  69744 gtgcttaattg-agaaagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaaattggttataattgaat 69646  T
Q  217 tgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtgg 315  Q
    ||||||  ||  ||||| ||||| ||||| | ||||| | | ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| |||||     
T  69645 tgttgtaggtgaaattgcatgtttaaagtatgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtga 69548  T
Q  316 taagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||    
T  69547 tgagattcatgttcaattgatgttgttg 69520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 316
Target Start/End: Original strand, 244923 - 244967
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggt 316  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  244923 tatgctcaattgatgaattatgacatgttgttgttgatttgtggt 244967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 345
Target Start/End: Original strand, 6885 - 7211
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taa 116  Q
    ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| |||  |||||||||  | |  |||||||| |||    
T  6885 aaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaattataatcattttaatgtaatttttcaatcgttgtatgaataa 6984  T
Q  117 gtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaat 216  Q
    |||||||||||  | ||| ||||  |||||||||  ||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||    
T  6985 gtgcttaattgagtaaat-gatttgttgttcataattgtcaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaat 7083  T
Q  217 tgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtgg 315  Q
    ||||||||||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||  |||||     
T  7084 tgttgttagtgaaatttaatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgtttaattatgttatgttgttattggattgtga 7181  T
Q  316 taagtttcatgatcaattgatgttgttgct 345  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  7182 taagaatcatgttcaattgatgttgttgct 7211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 35873 - 35545
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||| || |    
T  35873 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtt-g 35775  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 207  Q
    ||||| || |||||||||||  | ||  ||||||||||||| |  |  |  ||||||||||| |||  |||||| ||||||  ||| ||||||||||  |    
T  35774 tatgaataggtgcttaattgagtaaaa-gattaattgttcaaagttcttataattcgtgctccaatcatgatgatatgtttgaatgcatgaagttattga 35676  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  35675 taattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatactcaaattgttgatttatgctatgttgttgtt 35578  T
Q  307 gatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgtt 339  Q
    ||  |||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  35577 gaaatgtggtaagagtcatgttcaattgatgtt 35545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 235 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32373 - 32266
Alignment:
Q  235 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattg 334  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  32373 atgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgt-ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattg 32275  T
Q  335 atgttgttg 343  Q
     ||||||||    
T  32274 ttgttgttg 32266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 235 - 343
Target Start/End: Original strand, 41930 - 42037
Alignment:
Q  235 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattg 334  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  41930 atgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgt-ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattg 42028  T
Q  335 atgttgttg 343  Q
     ||||||||    
T  42029 ttgttgttg 42037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8157 - 7927
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  8157 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 8060  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
    | || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  8059 tttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 7960  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt 285  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7959 aaagt-ggtatatg-tgaaaatatgctcaattggt 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 30492 - 30418
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30492 catagaagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatca 30418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5808
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 5808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6014
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 6204 - 6275
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  6204 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 6275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 2211 - 2500
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||    
T  2211 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgcaatttttaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattaatcata 2308  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 250  Q
      |  |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |    
T  2309 attattagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 2408  T
Q  251 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| | || ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  2409 aaagt-gacatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttg 2500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8363 - 8170
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8363 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttaatgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttcat 8266  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 245  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  8265 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagt 8170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 343
Target Start/End: Original strand, 89584 - 89653
Alignment:
Q  274 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  89584 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttg 89653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 79891 - 79756
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  79891 taaggtaagggg-ttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttcat 79795  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
    |  || | |||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  79794 agatgctaaaattcgtgcactaactatgatgatatgttt 79756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 1440 - 1611
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1440 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 1537  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 223  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  1538 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 8585 - 8756
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8585 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 8682  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 223  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  8683 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 8756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31414 - 31083
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  31414 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgt 31316  T
Q  110 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| |||||| || |||  ||| ||||| ||    ||    
T  31315 atgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgat 31217  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgc-tcaattggtgaattatgctttgttgttgttg 307  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | ||||| | | ||||||||| || ||||| | || || |||||| |||| |||| ||||||    
T  31216 aattggattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaagt-gttatatgttg-aattatgctttaaatgttgaattgtgctatgttcttgttg 31119  T
Q  308 atttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  31118 aattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 31083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 31137 - 31211
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  31137 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatca 31211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 31401 - 31472
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  31401 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 31472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41707 - 41633
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  41707 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatca 41633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41443 - 41372
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  41443 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 41372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Original strand, 89760 - 89952
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  89760 taaggtaagggggttagaattcatcataatctttttagtgtaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttcata 89857  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
      || | |||||||||||| || | |||||| ||||||  ||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  89858 gatg-ttaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatg-atacttgaattgttgtt-gtgaatttgtatgttcaaagtgt 89952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6907 - 6725
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaataga 258  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |||| | ||    
T  6907 aattcgtgctataattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-ga 6809  T
Q  259 tatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||| || | ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  6808 tatatgttgaattt-tgctcaaattgttgaattatgctatgctattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgtt 6725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 269
Target Start/End: Original strand, 1242 - 1458
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1242 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 1339  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| || || ||    ||||||| ||||||||| ||  ||||| ||| ||||||| | |    
T  1340 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgt 1439  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  1440 gaaaat-gatatatgatgaa 1458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 269
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9713
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9497 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 9594  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| || || ||    ||||||| ||||||||| ||  ||||| ||| ||||||| | |    
T  9595 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgt 9694  T
Q  250 gaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  9695 gaaaat-gatatatgatgaa 9713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28781 - 28599
Alignment:
Q  160 attcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagat 259  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |  |||| | |||    
T  28781 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaagtatgagaaagt-gat 28683  T
Q  260 atatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  28682 atatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatggtatgttgttgttgaattgtagtaagaattatgttcaattgatgttgttg 28599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 17525 - 17596
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17525 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 17596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 55715 - 55644
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55715 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 55644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Original strand, 104477 - 104653
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||| | || ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||  |||||    
T  104477 taggagctaaagtgaagcttgggctaagaatttgtgctaattaaggtaagtgggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaatt-gttgta 104575  T
Q  111 tg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
    || |||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||  || | |||||| |||||||| | |||||| ||||||    
T  104576 tgaataattgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcatagatgttaaaattcatgctctaactatgatgatatgttt 104653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Original strand, 93728 - 93955
Alignment:
Q  113 ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgat-gaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataat 211  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||| |||||| |||| |  ||| |||||||| |  |||||    
T  93728 ataagtgcttaattgggtaaatt-attaattgttcataactgttagaaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataat 93826  T
Q  212 tgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatt 310  Q
    ||||| ||||||||   ||||  ||||||||||| |  |||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||  |||| |||||| || ||||||| | |    
T  93827 tgaatggttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaat-ggtatttgttg-aaatatgctcaaattattgaagtatgctatg-tgttgttaaat 93923  T
Q  311 tgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgtt 342  Q
    |||| | |  |||||| |||||||||||||||    
T  93924 tgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgtt 93955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 1099 - 1170
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  1099 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 13507 - 13578
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  13507 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 13578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 21481 - 21552
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  21481 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 21552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15083 - 15012
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  15083 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 15012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10158
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10094 aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttg 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Original strand, 22323 - 22518
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22323 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgttattttttaatta-ttgtatgaataagtgattaattggatg-attgattgattgttcat 22420  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 247  Q
    |  || | ||||||||||||||| |  ||| | ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  22421 agatgttaaaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtgt 22518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42749 - 42678
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42749 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatca 42678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 43651 - 43908
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||  ||||    
T  43651 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatt-gttgt 43749  T
Q  110 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 208  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||  || | |||||  |||||||||| |||||  ||||||  ||| ||||| ||    ||    
T  43750 atgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaattaatgctctaattatgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgat 43848  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 269  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  43849 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaaggatatgaaagt-gatatatgttgaa 43908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Original strand, 23562 - 23856
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| | |  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  23562 taattaagataagggggttagaattcaatcataatgattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgtt 23660  T
Q  147 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtg 246  Q
    ||||  || ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||  ||  ||||| || |  ||||||||||||||||| |   ||||| ||||||| |||     
T  23661 catagttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgtatacatgaaatttttgataattgaattgttgttggagaaattgcatgttcatagta 23760  T
Q  247 tatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    | ||||||| |||||||  || || | ||||| || || |||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||  ||||| | |||||| |||||||    
T  23761 tgtgaaaat-gatatattgtg-aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgacgttgttg 23856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Original strand, 70201 - 70298
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || || |||||||||||||||||||    
T  70201 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttgtgaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaaatgtat-aattgattaattgttcata 70298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 6664 - 6735
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  6664 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttg 6735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 9628 - 9699
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9628 tatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttg 9699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11014 - 10879
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  11014 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtataattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aaataattaattgttcata 10917  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 188  Q
      || |  |||||||||||||  | |||||| ||||||    
T  10916 gatgttataattcgtgctctatctatgatgatatgttt 10879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 436 - 372
Alignment:
Q  279 aattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  436 aattgttgaattatgctatgttattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttg 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Original strand, 1371 - 1435
Alignment:
Q  21 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1371 aaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatca 1435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 186647 - 186717
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  186647 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 186717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 193609 - 193679
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  193609 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttg 193679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 855 - 1059
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||  || || |||||| ||||||||    
T  855 taaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattaaat-aagtgattatttgttcat 953  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtat 249  Q
    |  || | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | |    
T  954 agttgttaaaattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 1053  T
Q  250 gaaaat 255  Q
    ||||||    
T  1054 gaaaat 1059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3362
Alignment:
Q  298 gttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 3362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 343
Target Start/End: Original strand, 7724 - 7859
Alignment:
Q  207 ataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgt 305  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||  ||||  | ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||    
T  7724 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat-tgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgt 7821  T
Q  306 tgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||    
T  7822 tgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 7859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 12641 - 12712
Alignment:
Q  272 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||||    
T  12641 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttg 12712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 442
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| | |||||||||||||||    
T  499 taggagctaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataactgaggtaagggggttag 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11292 - 11157
Alignment:
Q  207 ataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgt 305  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||||| ||| | |||| |||||| | |||||||    
T  11292 ataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtgtgtgaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaatagttgaaatatgctatcttgttgt 11195  T
Q  306 tgatttgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttg 343  Q
    ||| || || | ||   |||| ||||||||||||||||    
T  11194 tgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 11157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University