View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18270_high_4 (Length: 348)

Name: NF18270_high_4
Description: NF18270
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18270_high_4
NF18270_high_4
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (136-335)||(6311097-6311299)
chr8 (4-139)||(38613622-38613757)
chr8 (138-335)||(7290009-7290211)
chr8 (139-328)||(4760177-4760366)
chr8 (139-335)||(36979184-36979379)
chr8 (139-326)||(30655448-30655635)
chr8 (139-335)||(18870657-18870849)
chr8 (130-335)||(10689238-10689442)
chr8 (139-335)||(18853263-18853457)
chr8 (175-335)||(33037901-33038063)
chr8 (160-280)||(39784963-39785086)
chr8 (160-280)||(25328418-25328540)
chr8 (160-296)||(35745213-35745353)
chr8 (160-234)||(10684452-10684528)
chr8 (137-213)||(19752609-19752683)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (138-335)||(1457245-1457446)
chr5 (139-335)||(27444771-27444972)
chr5 (139-335)||(43592080-43592281)
chr5 (139-335)||(43598525-43598726)
chr5 (139-335)||(43604017-43604218)
chr5 (139-335)||(43609509-43609710)
chr5 (139-335)||(27449615-27449816)
chr5 (156-335)||(30631227-30631408)
chr5 (160-306)||(28807687-28807837)
chr5 (160-335)||(15044512-15044688)
chr5 (160-306)||(37556737-37556887)
chr5 (160-306)||(37561559-37561709)
chr5 (160-296)||(2785197-2785337)
chr5 (258-335)||(31180138-31180216)
chr5 (139-325)||(38191983-38192164)
chr5 (139-325)||(38219208-38219389)
chr5 (160-296)||(31401973-31402113)
chr5 (139-204)||(31180079-31180142)
chr5 (160-296)||(31397116-31397256)
chr5 (178-296)||(33791158-33791278)
chr5 (178-296)||(33768021-33768141)
chr5 (139-195)||(35387474-35387527)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (160-330)||(3813846-3814020)
chr4 (138-335)||(51520257-51520459)
chr4 (138-335)||(56146794-56146996)
chr4 (160-335)||(9224490-9224668)
chr4 (160-335)||(9229277-9229455)
chr4 (160-306)||(18855549-18855697)
chr4 (139-335)||(24741748-24741942)
chr4 (139-335)||(29760449-29760643)
chr4 (160-280)||(45347957-45348079)
chr4 (160-280)||(45357436-45357558)
chr4 (160-291)||(5732486-5732618)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (160-326)||(24024420-24024589)
chr7 (160-335)||(12396735-12396913)
chr7 (160-335)||(12406155-12406333)
chr7 (160-332)||(31109670-31109844)
chr7 (160-306)||(19992135-19992283)
chr7 (160-335)||(4866553-4866732)
chr7 (160-306)||(21812353-21812501)
chr7 (139-335)||(20357642-20357837)
chr7 (137-335)||(2057763-2057967)
chr7 (139-264)||(1533608-1533730)
chr7 (139-325)||(21645818-21645997)
chr7 (139-214)||(2479148-2479221)
chr7 (296-325)||(21639770-21639799)
chr7 (135-214)||(47263485-47263562)
chr7 (160-234)||(16879894-16879970)
chr7 (160-234)||(16884750-16884826)
chr7 (160-234)||(24261511-24261587)
chr7 (160-234)||(24266390-24266466)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (137-335)||(7167049-7167246)
chr3 (160-335)||(22173278-22173456)
chr3 (139-335)||(2671681-2671876)
chr3 (160-291)||(18656256-18656388)
chr3 (139-335)||(8739158-8739354)
chr3 (139-335)||(9091396-9091592)
chr3 (139-303)||(28503982-28504145)
chr3 (160-306)||(2677202-2677351)
chr3 (139-242)||(40372986-40373085)
chr3 (160-306)||(2673046-2673195)
chr3 (160-306)||(10207755-10207904)
chr3 (138-270)||(8477170-8477301)
chr3 (160-243)||(8512037-8512122)
chr3 (160-243)||(8516917-8517002)
chr3 (186-296)||(24967957-24968069)
chr3 (296-335)||(40372890-40372929)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (160-335)||(9725-9902)
scaffold0355 (160-308)||(1-143)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (160-306)||(6438324-6438471)
chr6 (160-335)||(22010780-22010958)
chr6 (160-335)||(14742519-14742697)
chr6 (160-284)||(11856795-11856921)
chr6 (160-335)||(14737659-14737838)
chr6 (160-335)||(28184325-28184507)
chr6 (160-306)||(28155684-28155832)
chr6 (139-284)||(30125940-30126084)
chr6 (139-264)||(5674934-5675057)
chr6 (160-296)||(6005239-6005379)
chr6 (160-296)||(16838566-16838706)
chr6 (178-306)||(33330560-33330690)
chr6 (160-306)||(33336057-33336207)
chr6 (178-296)||(5343322-5343443)
chr6 (139-214)||(31936398-31936470)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (160-335)||(35145-35323)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (160-335)||(44312707-44312885)
chr2 (137-335)||(11099022-11099219)
chr2 (139-335)||(14291295-14291490)
chr2 (160-332)||(32246607-32246786)
chr2 (139-335)||(9296496-9296691)
chr2 (160-335)||(39812071-39812250)
chr2 (160-296)||(19344243-19344382)
chr2 (160-296)||(19349101-19349240)
chr2 (139-325)||(25403443-25403624)
chr2 (139-325)||(25398305-25398486)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (160-306)||(39445322-39445470)
chr1 (160-306)||(44023987-44024135)
chr1 (160-306)||(25445204-25445352)
chr1 (160-306)||(1055126-1055274)
chr1 (160-335)||(41398060-41398238)
chr1 (160-238)||(41386571-41386650)
chr1 (175-335)||(24787459-24787624)
chr1 (178-296)||(43988589-43988709)
chr1 (139-325)||(24202875-24203054)
chr1 (139-195)||(19359079-19359132)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (160-306)||(185-333)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (138-335)||(331-528)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (160-238)||(34132-34211)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (160-296)||(19288-19428)
scaffold0197 (160-234)||(14497-14573)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (160-296)||(149079-149219)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (160-296)||(2374-2514)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (160-221)||(13171-13233)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (139-264)||(24208-24331)
scaffold0188 (139-325)||(18058-18238)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (139-214)||(44174-44247)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (160-234)||(182152-182228)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Original strand, 6311097 - 6311299
Alignment:
Q  136 ttctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311097 ttctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca 6311196  T
Q  236 aacaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccga 332  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311197 aacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccga 6311296  T
Q  333 gaa 335  Q
    |||    
T  6311297 gaa 6311299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 38613622 - 38613757
Alignment:
Q  4 tctctggtcccaggtttcaaaattatgagtaattttaaacttgatactcattgtaatctccgttttcacctgcagggtcttaaatacattgcacaaacac 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38613622 tctctggtcccagctttcaaaattatgagtaattttaaacttgatactcattgtaatctccgttttcacctgcagggtcttaaatacattgcacaaacac 38613721  T
Q  104 cgttgccaaggtttgaatctgctgaattttgcttct 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  38613722 cgttgccaaggtttgaatcagctcgattttgcttct 38613757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7290211 - 7290009
Alignment:
Q  138 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 236  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7290211 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaa 7290112  T
Q  237 acaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccga 332  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  7290111 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccga 7290012  T
Q  333 gaa 335  Q
    |||    
T  7290011 gaa 7290009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 139 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4760366 - 4760177
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||      
T  4760366 tgttgtgaatccggttgaaactcacatcaatgaaa--aacaaagatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaagcaaca 4760270  T
Q  237 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaca 328  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760269 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaca 4760177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Original strand, 36979184 - 36979379
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||      
T  36979184 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaaca 36979280  T
Q  237 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36979281 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaa 36979379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 326
Target Start/End: Original strand, 30655448 - 30655635
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||      
T  30655448 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaaca 30655543  T
Q  237 acaacaaaac-cagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaa 326  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655544 acaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaa 30655635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18870849 - 18870657
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  18870849 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgagtt-aaatggtttccaagcaaac 18870754  T
Q  239 aacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    |||||||   |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18870753 aacaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaa 18870657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10689442 - 10689238
Alignment:
Q  130 ttttgcttctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttc 229  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||    
T  10689442 ttttgattgtgttgtgttttcggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-ctaatggtttc 10689346  T
Q  230 caagcaa--acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaa 326  Q
    |||||||  ||||||||| || ||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10689345 caagcaacaacaacaaaaacaaccctagtgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaaggaagaacaaaa 10689247  T
Q  327 caccgagaa 335  Q
    |||| ||||    
T  10689246 caccaagaa 10689238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18853457 - 18853263
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18853457 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaacgaaacaaa----gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaac 18853363  T
Q  239 aacaaaacca---gccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 334  Q
    |||||||  |   |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18853362 aacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaaga 18853264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33038063 - 33037901
Alignment:
Q  175 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca--aacaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaa 271  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||    
T  33038063 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagcaacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaa 33037965  T
Q  272 agcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    | ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33037964 accacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaagaagaacaaaacaccaagaa 33037901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39785086 - 39784963
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||      
T  39785086 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagccctaag 39784987  T
Q  257 ctagtgtataacaaaagcacacaa 280  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  39784986 ctagtgtatagcaaaaccacacaa 39784963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25328540 - 25328418
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctaga 256  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| || ||||| |    
T  25328540 tcacaacaatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacccta-a 25328442  T
Q  257 ctagtgtataacaaaagcacacaa 280  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  25328441 ctagtgtatagcaaaaccacacaa 25328418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Original strand, 35745213 - 35745353
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  35745213 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 35745312  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcata 296  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35745313 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata 35745353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10684528 - 10684452
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagc 234  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  |||||||    
T  10684528 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagc 10684452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19752683 - 19752609
Alignment:
Q  137 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaat 213  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  19752683 tctgttgtgaatccggtaaaaa-tcacaccaatgaaa-aaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaat 19752609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 138 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1457446 - 1457245
Alignment:
Q  138 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 236  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1457446 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaa 1457347  T
Q  237 acaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1457346 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaaggaagaacaaaacaccgag 1457247  T
Q  334 aa 335  Q
    ||    
T  1457246 aa 1457245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Original strand, 27444771 - 27444972
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 237  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27444771 tgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaa 27444870  T
Q  238 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
    |||||  | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  27444871 caacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 27444970  T
Q  334 aa 335  Q
    ||    
T  27444971 aa 27444972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Original strand, 43592080 - 43592281
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 237  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43592080 tgttgtgaatccggttccaaagtcacatcaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa 43592179  T
Q  238 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  43592180 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 43592279  T
Q  334 aa 335  Q
    ||    
T  43592280 aa 43592281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Original strand, 43598525 - 43598726
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 237  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43598525 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43598624  T
Q  238 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  43598625 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 43598724  T
Q  334 aa 335  Q
    ||    
T  43598725 aa 43598726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Original strand, 43604017 - 43604218
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 237  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43604017 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43604116  T
Q  238 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  43604117 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 43604216  T
Q  334 aa 335  Q
    ||    
T  43604217 aa 43604218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Original strand, 43609509 - 43609710
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 237  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43609509 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43609608  T
Q  238 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  43609609 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 43609708  T
Q  334 aa 335  Q
    ||    
T  43609709 aa 43609710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Original strand, 27449615 - 27449816
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 237  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27449615 tgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaa 27449714  T
Q  238 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
    |||||  | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  27449715 caacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 27449814  T
Q  334 aa 335  Q
    ||    
T  27449815 aa 27449816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 335
Target Start/End: Original strand, 30631227 - 30631408
Alignment:
Q  156 aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca--aacaacaaaaccagccct 253  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  30631227 aaactcacacaaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagcaacaacaacaaaa-cagccct 30631325  T
Q  254 agactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | | || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30631326 agactagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaaggaagaacaaaacaccaagaa 30631408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28807837 - 28807687
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  28807837 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 28807738  T
Q  258 tagtgtata--acaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    |||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807737 tagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataa 28807687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Original strand, 15044512 - 15044688
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||    
T  15044512 tcacaccaatgaaata--caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagccctagac 15044609  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaag-aaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15044610 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaa 15044688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37556887 - 37556737
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||   |    
T  37556887 tcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctatg 37556788  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37556787 acttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataa 37556737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37561709 - 37561559
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||   |    
T  37561709 tcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctatg 37561610  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37561609 acttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataa 37561559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Original strand, 2785197 - 2785337
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  2785197 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 2785296  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcata 296  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2785297 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata 2785337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 335
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180216
Alignment:
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaagaaagaacaaaacaccaagaa 31180216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 325
Target Start/End: Original strand, 38191983 - 38192164
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca--a 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| |   |||  || ||||||||  |    
T  38191983 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtg--taaagtgtctccaagcaaca 38192077  T
Q  237 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaa-agagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192078 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagaga-atacaaagc--aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 38192164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 325
Target Start/End: Original strand, 38219208 - 38219389
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca--a 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| |   |||  || ||||||||  |    
T  38219208 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtg--taaagtgtctccaagcaaca 38219302  T
Q  237 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaa-agagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219303 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagaga-atacaaagc--aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 38219389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31402113 - 31401973
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  31402113 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 31402014  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcata 296  Q
     ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31402013 cctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata 31401973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Original strand, 31180079 - 31180142
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtg 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31180079 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa--taacaatgatgtgtggagcaagagatagtg 31180142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31397256 - 31397116
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| || ||  ||    
T  31397256 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacatcctaag 31397157  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcata 296  Q
     ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31397156 cctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata 31397116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 296
Target Start/End: Original strand, 33791158 - 33791278
Alignment:
Q  178 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  || ||| |||||| ||||| ||    
T  33791158 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 33791257  T
Q  276 cacaaagagctaacaagcata 296  Q
    || | ||||||||||||||||    
T  33791258 catatagagctaacaagcata 33791278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 296
Target Start/End: Original strand, 33768021 - 33768141
Alignment:
Q  178 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||   ||||||| |||||||  ||| |||||  || ||| |||||| ||||| ||    
T  33768021 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 33768120  T
Q  276 cacaaagagctaacaagcata 296  Q
    || | ||||||||||||||||    
T  33768121 catatagagctaacaagcata 33768141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 195
Target Start/End: Original strand, 35387474 - 35387527
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 195  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  35387474 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 35387527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 160 - 330
Target Start/End: Original strand, 3813846 - 3814020
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||    
T  3813846 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctaga 3813945  T
Q  257 ctagtgtataac-aaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacacc 330  Q
    |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3813946 ctagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacacc 3814020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 335
Target Start/End: Original strand, 51520257 - 51520459
Alignment:
Q  138 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 236  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51520257 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaa 51520356  T
Q  237 acaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccga 332  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  51520357 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccga 51520456  T
Q  333 gaa 335  Q
    |||    
T  51520457 gaa 51520459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 138 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 56146996 - 56146794
Alignment:
Q  138 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 236  Q
    ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  56146996 ctgttgtgaatccggttccaaattcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaa 56146897  T
Q  237 acaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccga 332  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  56146896 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccga 56146797  T
Q  333 gaa 335  Q
    |||    
T  56146796 gaa 56146794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9224668 - 9224490
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9224668 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 9224569  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  9224568 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaa 9224490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9229455 - 9229277
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9229455 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 9229356  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  9229355 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaa 9229277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Original strand, 18855549 - 18855697
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  18855549 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 18855648  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855649 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 18855697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Original strand, 24741748 - 24741942
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||      
T  24741748 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaaca 24741843  T
Q  237 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24741844 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaa 24741942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Original strand, 29760449 - 29760643
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||      
T  29760449 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaataaaca-aaatggtttccaagcaaca 29760545  T
Q  237 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29760546 acaacaaaacaa-ccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaa 29760643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45348079 - 45347957
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||| ||| |||||||    
T  45348079 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagac 45347980  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaa 280  Q
    ||||||| | ||||| |||||||    
T  45347979 tagtgtaaagcaaaaccacacaa 45347957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45357558 - 45357436
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||| ||| |||||||    
T  45357558 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagac 45357459  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaa 280  Q
    ||||||| | ||||| |||||||    
T  45357458 tagtgtaaagcaaaaccacacaa 45357436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Original strand, 5732486 - 5732618
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||  |    
T  5732486 tcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagc 5732584  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa 291  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  5732585 tagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaa 5732618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 160 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24024589 - 24024420
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||   |||    
T  24024589 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcctatgac 24024490  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaag-aaaggaagaacaaaa 326  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24024489 tagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaa 24024420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Original strand, 12396735 - 12396913
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  12396735 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 12396834  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  12396835 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaaaacaccgagaa 12396913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Original strand, 12406155 - 12406333
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  12406155 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 12406254  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||    
T  12406255 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaa 12406333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31109844 - 31109670
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||| ||    
T  31109844 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-ac 31109746  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaag-aaaggaagaacaaaacaccga 332  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |  | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31109745 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaaaacaccga 31109670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Original strand, 19992135 - 19992283
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||  |    
T  19992135 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcttacaacaacaaacagccctaagc 19992234  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992235 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 19992283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Original strand, 4866553 - 4866732
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  4866553 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagac 4866652  T
Q  258 tagtgtataac-aaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| || || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  4866653 tagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaa 4866732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21812501 - 21812353
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |    
T  21812501 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagc 21812402  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21812401 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataa 21812353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20357837 - 20357642
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||    
T  20357837 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaac 20357742  T
Q  239 aacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaag-aaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
    |||||   || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  20357741 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagc--aaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaataccaag 20357644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 335
Target Start/End: Original strand, 2057763 - 2057967
Alignment:
Q  137 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca- 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||     
T  2057763 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgag-tcaaatggtttccaagcaa 2057859  T
Q  236 --aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagc----ataaacaagataagcaa-gaaaggaagaacaaaac 327  Q
      |||||||||| | |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| || | ||||    | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2057860 acaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaagaacaaaac 2057959  T
Q  328 accgagaa 335  Q
    ||| ||||    
T  2057960 accaagaa 2057967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1533730 - 1533608
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca--a 236  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |    
T  1533730 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaa--gtttccaagcaaca 1533636  T
Q  237 acaacaaaaccagccctagactagtgta 264  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||    
T  1533635 acaacaaaaccagccccagtctagtgta 1533608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 325
Target Start/End: Original strand, 21645818 - 21645997
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca--a 236  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||   |||  || ||||||||  |    
T  21645818 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgag--taaagtgtctccaagcaaca 21645912  T
Q  237 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 325  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| | |||   |||||   ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645913 acaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccac---aagagaatacaa-aacaaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 21645997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 2479148 - 2479221
Alignment:
Q  139 tgttgtga-ttccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 214  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  2479148 tgttgtgagttccggttgataatcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatg 2479221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 325
Target Start/End: Original strand, 21639770 - 21639799
Alignment:
Q  296 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639770 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 21639799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 214
Target Start/End: Original strand, 47263485 - 47263562
Alignment:
Q  135 cttctgttgtga-ttccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 214  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  47263485 cttctgttgtgagttccggttgataatcacaccaatgaa--aaacaaagatgcgtggagcaaagga-agtggtaatcaatg 47263562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Original strand, 16879894 - 16879970
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagc 234  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  |||||||    
T  16879894 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagc 16879970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Original strand, 16884750 - 16884826
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagc 234  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  |||||||    
T  16884750 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagc 16884826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24261587 - 24261511
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagc 234  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  |||||||    
T  24261587 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagc 24261511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24266466 - 24266390
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagc 234  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  |||||||    
T  24266466 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagc 24266390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 335
Target Start/End: Original strand, 7167049 - 7167246
Alignment:
Q  137 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  7167049 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaa 7167145  T
Q  237 --acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7167146 caacaacaaaac-agccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaag 7167244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22173456 - 22173278
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  22173456 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 22173357  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  22173356 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaa 22173278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2671876 - 2671681
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 238  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  2671876 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaac 2671781  T
Q  239 aacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 334  Q
    |||||   || ||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2671780 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaaga 2671682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Original strand, 18656256 - 18656388
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||  |    
T  18656256 tcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagc 18656354  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa 291  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  18656355 tagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaa 18656388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8739354 - 8739158
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa- 237  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  8739354 tgttgtgaattcggttgagactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaat 8739259  T
Q  238 --caacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagc-acacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
      |||||||| | |||||||||| || || ||||||| | |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8739258 aacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaag 8739160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9091592 - 9091396
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa- 237  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  9091592 tgttgtgaattcggttgagactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaat 9091497  T
Q  238 --caacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagc-acacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
      |||||||| | |||||||||| || || ||||||| | |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9091496 aacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaag 9091398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28504145 - 28503982
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 236  Q
    |||||||| ||||||   ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||      
T  28504145 tgttgtgaatccggtcttaactcacaccaatgaat--aacaatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagcaaca 28504049  T
Q  237 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaaga 303  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28504048 acaacaaaac-agcccttgactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaaga 28503982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2677351 - 2677202
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  2677351 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 2677252  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2677251 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcat-aacaagataa 2677202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40373085 - 40372986
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 238  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  40373085 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaac 40372990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2673195 - 2673046
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  2673195 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 2673096  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2673095 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcat-aacaagataa 2673046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Original strand, 10207755 - 10207904
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  10207755 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 10207854  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10207855 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcat-aacaagataa 10207904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 270
Target Start/End: Original strand, 8477170 - 8477301
Alignment:
Q  138 ctgttgtgattccggt-tgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 236  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||||||    
T  8477170 ctgttgtgaatccggtataaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaa-gtttcccaagcaa 8477265  T
Q  237 --acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaa 270  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8477266 caacaacaaaaccagccctagactagtgtagaacaa 8477301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 243
Target Start/End: Original strand, 8512037 - 8512122
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa 243  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  8512037 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaa 8512122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 243
Target Start/End: Original strand, 8516917 - 8517002
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa 243  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  8516917 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaa 8517002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 296
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968069
Alignment:
Q  186 tgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaaga 283  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  || ||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaaga 24968056  T
Q  284 gctaacaagcata 296  Q
    |||||||||||||    
T  24968057 gctaacaagcata 24968069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40372929 - 40372890
Alignment:
Q  296 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40372929 aaacaagataagcaagataggaagaacaaaacaccaagaa 40372890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9902 - 9725
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||      
T  9902 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagccctaag 9803  T
Q  257 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9802 ctagtatatagcaaaaccacacaa-gagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 9725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 1
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 256  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||      
T  143 tcacaccaattaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagccctaag 50  T
Q  257 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 308  Q
    |||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  49 ctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcataaacaagataagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Original strand, 6438324 - 6438471
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagact 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  ||    
T  6438324 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagct 6438423  T
Q  259 agtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438424 agtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 6438471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22010958 - 22010780
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  22010958 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagac 22010859  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  22010858 aagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaa 22010780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14742697 - 14742519
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  14742697 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagccctagac 14742598  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||    
T  14742597 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaa 14742519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 160 - 284
Target Start/End: Original strand, 11856795 - 11856921
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  11856795 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 11856894  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagag 284  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11856895 tagtgtatagcaaaaccacacaaagag 11856921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14737838 - 14737659
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  14737838 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 14737739  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacac-aaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| || | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||    
T  14737738 tagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaa 14737659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Original strand, 28184325 - 28184507
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaac--aaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagcccta 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  28184325 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta 28184424  T
Q  255 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc--aagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||    
T  28184425 gactagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaaaacaccgagaa 28184507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28155832 - 28155684
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||  ||| |||||   |||    
T  28155832 tcacaccaatgcaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagcctatgac 28155733  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    | ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28155732 ttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataa 28155684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30126084 - 30125940
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 238  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| |||    
T  30126084 tgttgtgaatccggttgaaaatcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgagc-caaatggtctccaagctaac 30125989  T
Q  239 ---aacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagag 284  Q
       ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  30125988 tacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagag 30125940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5675057 - 5674934
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca--a 236  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | || |||||||  |    
T  5675057 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatga---aaacaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagta-aaaagtttcccaagcaaca 5674962  T
Q  237 acaacaaaaccagccctagactagtgta 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5674961 acaacaaaaccagccctagtctagtgta 5674934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Original strand, 6005239 - 6005379
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  6005239 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 6005338  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcata 296  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6005339 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata 6005379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Original strand, 16838566 - 16838706
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  | ||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  16838566 tcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaag 16838665  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcata 296  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16838666 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata 16838706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33330690 - 33330560
Alignment:
Q  178 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagactagtgtataac-aaaagc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  || ||| |||||| | |||| |    
T  33330690 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaacc 33330591  T
Q  275 acacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33330590 acactaagagctaacaagcat-aacaagataa 33330560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33336207 - 33336057
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||| | |||||||  ||| |||||  ||    
T  33336207 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaactaacaacaacaaaacagcctaag 33336108  T
Q  256 actagtgtata-acaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
     ||| ||||||   |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33336107 cctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcat-aacaagataa 33336057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 296
Target Start/End: Original strand, 5343322 - 5343443
Alignment:
Q  178 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagactagtgtataac-aaaagc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  || |||  ||||| | |||| |    
T  5343322 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaaagtatagcaaaaacc 5343421  T
Q  275 acacaaagagctaacaagcata 296  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5343422 acactaagagctaacaagcata 5343443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 31936398 - 31936470
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 214  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  31936398 tgttgtgaatccggttaaaa-tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatg 31936470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35323 - 35145
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  35323 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 35224  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  35223 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaa 35145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44312885 - 44312707
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  44312885 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagac 44312786  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  44312785 aagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaa 44312707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11099219 - 11099022
Alignment:
Q  137 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  11099219 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa 11099123  T
Q  237 --acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11099122 caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataaggaagaaaggaagaacaaaacaccaag 11099024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Original strand, 14291295 - 14291490
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 238  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  14291295 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaac 14291390  T
Q  239 aacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 334  Q
    |||||   || ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14291391 aacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaaga 14291489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 332
Target Start/End: Original strand, 32246607 - 32246786
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||| ||||||    
T  32246607 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagtcctaga 32246706  T
Q  257 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaag----aaaggaagaacaaaacaccga 332  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |  | ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  32246707 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccga 32246786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9296691 - 9296496
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 238  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  9296691 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaac 9296596  T
Q  239 aacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 334  Q
    |||||   || ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9296595 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaaggaagaacaaaacaccaaga 9296497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39812250 - 39812071
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||      
T  39812250 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 39812151  T
Q  257 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |  | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||    
T  39812150 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaa 39812071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Original strand, 19344243 - 19344382
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||     
T  19344243 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagc 19344342  T
Q  257 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcata 296  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19344343 ctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata 19344382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Original strand, 19349101 - 19349240
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||     
T  19349101 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagc 19349200  T
Q  257 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcata 296  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19349201 ctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata 19349240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 325
Target Start/End: Original strand, 25403443 - 25403624
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca--a 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| |   |||  || ||||||||  |    
T  25403443 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtg--taaagtgtctccaagcaaca 25403537  T
Q  237 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaa-agagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403538 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagaga-atacaaagc--aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 25403624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 325
Target Start/End: Original strand, 25398305 - 25398486
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca--a 236  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| |   |||  || ||||||||  |    
T  25398305 tgttgtgaatctggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtg--taaagtgtctccaagcaaca 25398399  T
Q  237 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaa-agagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398400 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagaga-atacaaagc--aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 25398486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Original strand, 39445322 - 39445470
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  39445322 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 39445421  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445422 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 39445470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44024135 - 44023987
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  44024135 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 44024036  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44024035 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 44023987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25445352 - 25445204
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  25445352 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 25445253  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25445252 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataa 25445204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1055274 - 1055126
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| || ||||||||  |    
T  1055274 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtcttccaagcttacaacaacaaacagccctaagc 1055175  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055174 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 1055126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Original strand, 41398060 - 41398238
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca-----aaaccagccct 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||     ||| |||||||    
T  41398060 tcacaccaatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaacaaaacagccct 41398159  T
Q  254 agactagtgtata--acaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    | |||||||||||  | |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  41398160 a-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-----aaggaagaacaaaacaccgagaa 41398238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 238
Target Start/End: Original strand, 41386571 - 41386650
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41386571 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 41386650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24787624 - 24787459
Alignment:
Q  175 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca--aacaac----aaaaccagccctagactagtgtataac 268  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||||    |||| ||||||||||||  |||| | |    
T  24787624 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagc 24787526  T
Q  269 aaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaag-aaaggaagaacaaaacaccgagaa 335  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24787525 aaaaccacacaaagagataacaaagc--aaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaa 24787459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 43988709 - 43988589
Alignment:
Q  178 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||  || ||| |||||| || || ||    
T  43988709 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 43988610  T
Q  276 cacaaagagctaacaagcata 296  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  43988609 cactaagagctaacaagcata 43988589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24203054 - 24202875
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 238  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| |   |||  || |||||||||||    
T  24203054 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatga---aaacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgtg--taaagtgtctccaagcaaac 24202960  T
Q  239 aaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 325  Q
    ||||  ||| |||||||| ||||||||| | ||| | |||| | |||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202959 aacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca-agaga-atacaaagc--aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 24202875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19359132 - 19359079
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 195  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  19359132 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 19359079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Original strand, 185 - 333
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 257  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  185 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 284  T
Q  258 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 306  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  285 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 528 - 331
Alignment:
Q  138 ctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca-- 235  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||      
T  528 ctgttgtgaatccatttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagcaac 432  T
Q  236 aacaac-aaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaa-caagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 333  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  431 aacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaagaaagaacaaaacaccaag 333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34211 - 34132
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34211 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 34132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19428 - 19288
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  19428 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 19329  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcata 296  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19328 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata 19288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14573 - 14497
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagc 234  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  |||||||    
T  14573 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagc 14497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 149219 - 149079
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  149219 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 149120  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcata 296  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  149119 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata 149079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2514 - 2374
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 255  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  2514 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 2415  T
Q  256 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcata 296  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2414 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata 2374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 221
Target Start/End: Original strand, 13171 - 13233
Alignment:
Q  160 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13171 tcacaccaatgaaataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24331 - 24208
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca--a 236  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| |   |||  || ||||||||  |    
T  24331 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtg--taaagtgtctccaagcaaca 24237  T
Q  237 acaac-aaaaccagccctagactagtgta 264  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24236 acaacaaaaaccagccctagactagtgta 24208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18238 - 18058
Alignment:
Q  139 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 236  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  18238 tgttgtgaatccggttaaaactcaaaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 18144  T
Q  237 acaacaaaa-ccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||| | |||  ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18143 acaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca-agagaa-tacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaa 18058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44247 - 44174
Alignment:
Q  139 tgttgtga-ttccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 214  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  44247 tgttgtgagttccggttgataatcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatg 44174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 182228 - 182152
Alignment:
Q  160 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagc 234  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  |||||||    
T  182228 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagc 182152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University