View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18284_low_5 (Length: 430)

Name: NF18284_low_5
Description: NF18284
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18284_low_5
NF18284_low_5
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (17-312)||(2671383-2671678)
chr3 (17-312)||(40372593-40372887)
chr3 (17-312)||(9091098-9091393)
chr3 (21-312)||(8738864-8739155)
chr3 (17-312)||(7167249-7167545)
chr3 (17-312)||(8477367-8477664)
chr3 (18-312)||(28503662-28503956)
chr3 (20-312)||(26928395-26928683)
chr3 (18-273)||(28501495-28501750)
chr3 (23-312)||(1305953-1306239)
chr3 (20-312)||(32143325-32143613)
chr3 (20-312)||(27452962-27453248)
chr3 (20-312)||(27974748-27975035)
chr3 (20-312)||(27986252-27986529)
chr3 (20-312)||(16264354-16264639)
chr3 (20-312)||(8370285-8370569)
chr3 (136-312)||(22173100-22173275)
chr3 (20-312)||(33386471-33386749)
chr3 (20-295)||(6794511-6794778)
chr3 (20-312)||(36029097-36029383)
chr3 (20-312)||(21711227-21711512)
chr3 (20-312)||(40592578-40592865)
chr3 (140-312)||(18656440-18656609)
chr3 (20-268)||(35925529-35925768)
chr3 (20-312)||(3715796-3716085)
chr3 (20-312)||(1736100-1736388)
chr3 (172-312)||(18552826-18552966)
chr3 (220-312)||(2672919-2673011)
chr3 (220-312)||(2677075-2677167)
chr3 (220-312)||(8512222-8512314)
chr3 (220-312)||(8517102-8517194)
chr3 (220-312)||(32475490-32475580)
chr3 (220-312)||(32480348-32480438)
chr3 (21-83)||(22173038-22173100)
chr3 (172-312)||(30709733-30709873)
chr3 (20-295)||(48438236-48438505)
chr3 (172-312)||(25795785-25795925)
chr3 (172-295)||(40844674-40844795)
chr3 (172-312)||(3328300-3328439)
chr3 (220-312)||(24968112-24968204)
chr3 (20-229)||(39032351-39032551)
chr3 (172-295)||(3323634-3323755)
chr3 (172-312)||(26298992-26299132)
chr3 (172-312)||(1417434-1417573)
chr3 (20-89)||(4386773-4386840)
chr3 (219-312)||(37466295-37466389)
chr3 (20-89)||(3323487-3323554)
chr3 (20-89)||(3328153-3328220)
chr3 (20-89)||(24694962-24695029)
chr3 (20-89)||(26299211-26299278)
chr3 (24-89)||(47923704-47923767)
chr3 (219-291)||(4386915-4386988)
chr3 (268-312)||(10207939-10207983)
chr3 (20-83)||(23392106-23392167)
chr3 (233-312)||(39039995-39040075)
chr3 (23-89)||(8126853-8126917)
chr3 (39-82)||(18656614-18656657)
chr3 (219-312)||(47923894-47923989)
chr3 (20-80)||(23410529-23410587)
chr3 (387-418)||(1305851-1305882)
chr3 (387-418)||(1309756-1309787)
chr3 (172-312)||(24695107-24695247)
chr3 (20-208)||(47649677-47649862)
chr3 (20-89)||(1417287-1417354)
chr3 (387-417)||(2671753-2671783)
chr3 (20-89)||(25929192-25929258)
chr3 (20-89)||(27026929-27026996)
chr3 (20-89)||(27038274-27038341)
chr3 (20-89)||(37725898-37725965)
chr3 (48-89)||(10274605-10274646)
chr3 (20-89)||(25796003-25796072)
chr3 (253-312)||(38210569-38210629)
chr3 (253-312)||(50494198-50494258)
chr3 (249-312)||(53894055-53894119)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (17-312)||(14291493-14291788)
chr2 (17-312)||(11098724-11099019)
chr2 (17-312)||(9296199-9296493)
chr2 (20-312)||(3491755-3492044)
chr2 (100-312)||(25398500-25398711)
chr2 (100-312)||(25403638-25403849)
chr2 (100-286)||(25407653-25407838)
chr2 (20-312)||(40738848-40739124)
chr2 (20-312)||(28258984-28259270)
chr2 (20-312)||(36757569-36757855)
chr2 (21-311)||(23078279-23078562)
chr2 (136-312)||(39811894-39812068)
chr2 (137-312)||(32246793-32246966)
chr2 (22-312)||(8040064-8040354)
chr2 (174-312)||(44312567-44312704)
chr2 (20-312)||(13569332-13569619)
chr2 (23-312)||(21629948-21630232)
chr2 (113-312)||(10707149-10707345)
chr2 (20-312)||(34388862-34389141)
chr2 (113-312)||(8390046-8390243)
chr2 (20-312)||(14698816-14699100)
chr2 (138-295)||(42039588-42039744)
chr2 (172-312)||(10445397-10445537)
chr2 (141-312)||(19344426-19344596)
chr2 (141-312)||(19349284-19349454)
chr2 (20-312)||(34682138-34682427)
chr2 (20-89)||(25409854-25409923)
chr2 (189-312)||(17865207-17865330)
chr2 (219-312)||(20522224-20522319)
chr2 (21-83)||(39811832-39811894)
chr2 (172-312)||(39482935-39483075)
chr2 (20-294)||(31056067-31056335)
chr2 (20-295)||(33118158-33118425)
chr2 (20-312)||(33528431-33528714)
chr2 (20-89)||(17865428-17865495)
chr2 (20-89)||(20522445-20522512)
chr2 (219-312)||(2869691-2869786)
chr2 (39-82)||(32246968-32247011)
chr2 (20-89)||(10445274-10445341)
chr2 (229-295)||(27149303-27149369)
chr2 (20-89)||(39483156-39483223)
chr2 (232-312)||(16940221-16940302)
chr2 (232-312)||(17010886-17010967)
chr2 (22-89)||(2869501-2869566)
chr2 (219-312)||(2838028-2838123)
chr2 (387-418)||(3491653-3491684)
chr2 (20-89)||(41586357-41586425)
chr2 (387-417)||(9296568-9296598)
chr2 (20-89)||(35397732-35397799)
chr2 (20-89)||(2837834-2837903)
chr2 (253-312)||(35215586-35215646)
chr2 (253-312)||(35217963-35218023)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (17-312)||(4759871-4760167)
chr8 (17-312)||(10688937-10689235)
chr8 (17-312)||(30655651-30655946)
chr8 (17-312)||(33037605-33037898)
chr8 (17-312)||(36979382-36979676)
chr8 (17-312)||(18870358-18870654)
chr8 (17-312)||(18852964-18853260)
chr8 (20-312)||(1261757-1262046)
chr8 (17-312)||(6311302-6311598)
chr8 (23-312)||(31071035-31071322)
chr8 (20-312)||(26287906-26288184)
chr8 (20-312)||(26301163-26301441)
chr8 (20-312)||(26313157-26313435)
chr8 (20-312)||(7412345-7412630)
chr8 (20-312)||(19175561-19175847)
chr8 (20-295)||(4456050-4456318)
chr8 (136-312)||(7289831-7290006)
chr8 (136-312)||(25328184-25328358)
chr8 (20-312)||(23799383-23799670)
chr8 (20-312)||(26403034-26403323)
chr8 (141-312)||(39784734-39784902)
chr8 (172-312)||(19752347-19752487)
chr8 (141-312)||(35745396-35745566)
chr8 (220-312)||(10684252-10684344)
chr8 (21-83)||(7289769-7289831)
chr8 (172-312)||(6127225-6127365)
chr8 (21-83)||(25327996-25328058)
chr8 (21-83)||(25328122-25328184)
chr8 (20-312)||(5702287-5702576)
chr8 (233-312)||(4696609-4696689)
chr8 (20-89)||(4696415-4696482)
chr8 (253-312)||(9765852-9765912)
chr8 (39-82)||(39784685-39784728)
chr8 (24-89)||(9054231-9054294)
chr8 (20-89)||(19752201-19752268)
chr8 (219-295)||(9054835-9054912)
chr8 (219-274)||(6813726-6813782)
chr8 (387-418)||(1262117-1262148)
chr8 (387-418)||(26287803-26287834)
chr8 (387-418)||(26313054-26313085)
chr8 (387-418)||(31071394-31071425)
chr8 (20-89)||(3051343-3051410)
chr8 (253-312)||(43079877-43079937)
chr8 (253-312)||(43082248-43082308)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (17-312)||(24741945-24742240)
chr4 (17-312)||(29760646-29760941)
chr4 (20-312)||(28468341-28468621)
chr4 (20-312)||(31985440-31985726)
chr4 (20-312)||(5396478-5396764)
chr4 (136-312)||(9224312-9224487)
chr4 (136-312)||(51520462-51520637)
chr4 (136-312)||(3814029-3814202)
chr4 (136-312)||(9229099-9229274)
chr4 (137-312)||(45357203-45357376)
chr4 (20-312)||(16623100-16623386)
chr4 (137-312)||(45347723-45347897)
chr4 (20-311)||(36315037-36315321)
chr4 (20-311)||(36329246-36329530)
chr4 (20-312)||(3777553-3777839)
chr4 (140-312)||(5732670-5732839)
chr4 (20-312)||(5143263-5143550)
chr4 (20-312)||(5147681-5147968)
chr4 (141-312)||(18855732-18855900)
chr4 (20-312)||(10047383-10047671)
chr4 (184-304)||(56146664-56146783)
chr4 (20-312)||(38152245-38152532)
chr4 (20-234)||(8689303-8689509)
chr4 (21-83)||(51520637-51520699)
chr4 (172-312)||(3796472-3796612)
chr4 (21-83)||(18712609-18712671)
chr4 (20-312)||(5269007-5269284)
chr4 (20-162)||(16628679-16628815)
chr4 (219-312)||(39245998-39246093)
chr4 (21-83)||(9224250-9224312)
chr4 (21-83)||(9229037-9229099)
chr4 (20-295)||(24333831-24334103)
chr4 (24-311)||(6743226-6743507)
chr4 (189-312)||(16630650-16630773)
chr4 (28-83)||(3814202-3814257)
chr4 (39-82)||(45347678-45347721)
chr4 (20-89)||(25861840-25861907)
chr4 (39-82)||(5732844-5732887)
chr4 (24-89)||(5112460-5112523)
chr4 (172-312)||(42599526-42599667)
chr4 (20-83)||(6542378-6542439)
chr4 (233-312)||(25862035-25862115)
chr4 (22-89)||(42599383-42599448)
chr4 (20-83)||(51336974-51337035)
chr4 (39-82)||(18855906-18855949)
chr4 (387-418)||(28468692-28468723)
chr4 (39-82)||(45357158-45357201)
chr4 (172-312)||(54867188-54867327)
chr4 (219-272)||(5112282-5112336)
chr4 (220-281)||(34495822-34495884)
chr4 (219-295)||(1983298-1983375)
chr4 (20-89)||(3793885-3793954)
chr4 (219-295)||(39774303-39774380)
chr4 (253-312)||(16931789-16931849)
chr4 (253-312)||(16934143-16934203)
chr4 (253-312)||(22780373-22780433)
chr4 (253-312)||(44599838-44599898)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (17-312)||(2057970-2058268)
chr7 (17-312)||(20357344-20357639)
chr7 (17-312)||(1533241-1533536)
chr7 (20-312)||(21639813-21640102)
chr7 (20-312)||(21646011-21646300)
chr7 (20-312)||(18408768-18409056)
chr7 (20-312)||(18413645-18413932)
chr7 (135-312)||(12406336-12406512)
chr7 (20-312)||(2479341-2479626)
chr7 (62-312)||(21983288-21983536)
chr7 (136-312)||(12396916-12397091)
chr7 (21-312)||(29159807-29160096)
chr7 (136-312)||(24024232-24024406)
chr7 (101-312)||(44848568-44848777)
chr7 (136-312)||(31109489-31109663)
chr7 (141-312)||(19992318-19992487)
chr7 (172-312)||(9189961-9190101)
chr7 (172-312)||(2580394-2580533)
chr7 (226-312)||(4866735-4866820)
chr7 (20-312)||(47263682-47263956)
chr7 (220-312)||(16880078-16880169)
chr7 (220-312)||(16884934-16885025)
chr7 (24-312)||(21988912-21989194)
chr7 (220-312)||(24261311-24261403)
chr7 (220-312)||(24266190-24266282)
chr7 (20-312)||(20284093-20284379)
chr7 (21-83)||(12397091-12397153)
chr7 (21-83)||(31109427-31109489)
chr7 (172-309)||(55955-56091)
chr7 (20-312)||(2647504-2647789)
chr7 (21-81)||(4873310-4873370)
chr7 (21-81)||(12406513-12406573)
chr7 (172-312)||(46516263-46516403)
chr7 (172-312)||(49091665-49091805)
chr7 (247-312)||(21812253-21812318)
chr7 (21-83)||(24024170-24024232)
chr7 (184-312)||(33332415-33332543)
chr7 (20-89)||(23402820-23402887)
chr7 (22-89)||(4796477-4796542)
chr7 (172-294)||(35960839-35960960)
chr7 (219-312)||(28617223-28617318)
chr7 (189-312)||(4796637-4796760)
chr7 (172-312)||(9185128-9185258)
chr7 (172-293)||(23402967-23403086)
chr7 (20-89)||(44847932-44847999)
chr7 (20-89)||(46516112-46516179)
chr7 (20-89)||(2580613-2580679)
chr7 (20-89)||(3047477-3047544)
chr7 (20-89)||(9184981-9185048)
chr7 (219-295)||(5817268-5817344)
chr7 (20-89)||(9189813-9189881)
chr7 (387-418)||(18413543-18413574)
chr7 (387-418)||(21639710-21639741)
chr7 (387-418)||(21645908-21645939)
chr7 (39-82)||(21812099-21812143)
chr7 (253-312)||(31155911-31155971)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (17-312)||(5674567-5674862)
chr6 (20-294)||(22709041-22709300)
chr6 (20-312)||(5757285-5757571)
chr6 (136-312)||(11856979-11857154)
chr6 (29-312)||(21356040-21356318)
chr6 (136-312)||(22010602-22010777)
chr6 (136-312)||(14737482-14737656)
chr6 (136-312)||(28184510-28184684)
chr6 (137-312)||(28155477-28155649)
chr6 (136-312)||(14742342-14742516)
chr6 (141-312)||(6438506-6438674)
chr6 (20-312)||(5572050-5572334)
chr6 (141-312)||(6005422-6005592)
chr6 (137-312)||(16838749-16838923)
chr6 (220-312)||(33330433-33330525)
chr6 (172-312)||(31086426-31086566)
chr6 (20-312)||(31979517-31979802)
chr6 (21-83)||(11857154-11857216)
chr6 (21-83)||(14737420-14737482)
chr6 (21-83)||(22010540-22010602)
chr6 (220-312)||(33335930-33336022)
chr6 (172-312)||(10077118-10077258)
chr6 (21-83)||(14742280-14742342)
chr6 (62-295)||(18232867-18233096)
chr6 (20-304)||(21801149-21801429)
chr6 (232-312)||(4629958-4630039)
chr6 (219-312)||(22963704-22963798)
chr6 (219-312)||(23824595-23824689)
chr6 (20-89)||(5017303-5017370)
chr6 (20-89)||(31936798-31936865)
chr6 (233-312)||(31936591-31936671)
chr6 (39-82)||(28155432-28155475)
chr6 (21-83)||(28184684-28184749)
chr6 (20-89)||(22963922-22963989)
chr6 (20-89)||(23824404-23824471)
chr6 (233-312)||(5017482-5017562)
chr6 (39-82)||(6438680-6438723)
chr6 (20-89)||(24435779-24435845)
chr6 (20-89)||(31086281-31086348)
chr6 (279-312)||(5343486-5343519)
chr6 (253-312)||(12195515-12195575)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (17-312)||(31180219-31180513)
chr5 (17-312)||(24135853-24136146)
chr5 (20-312)||(38219403-38219692)
chr5 (20-312)||(35387667-35387956)
chr5 (21-312)||(30631411-30631702)
chr5 (120-312)||(38192178-38192369)
chr5 (20-312)||(15464536-15464824)
chr5 (20-312)||(36932155-36932443)
chr5 (20-312)||(9353139-9353425)
chr5 (20-312)||(14520234-14520520)
chr5 (136-312)||(1457067-1457242)
chr5 (136-312)||(43592284-43592459)
chr5 (136-312)||(27449819-27449994)
chr5 (136-312)||(15044691-15044865)
chr5 (136-312)||(27444975-27445150)
chr5 (136-304)||(43598737-43598904)
chr5 (136-304)||(43604229-43604396)
chr5 (136-304)||(43609721-43609888)
chr5 (20-312)||(11916779-11917065)
chr5 (20-312)||(12083984-12084268)
chr5 (141-312)||(28807485-28807652)
chr5 (20-312)||(10281755-10282044)
chr5 (141-312)||(37556533-37556702)
chr5 (141-312)||(37561355-37561524)
chr5 (20-312)||(17003766-17004053)
chr5 (220-312)||(2785380-2785472)
chr5 (220-312)||(31396981-31397073)
chr5 (139-295)||(3880321-3880476)
chr5 (141-312)||(33791321-33791491)
chr5 (21-83)||(1457005-1457067)
chr5 (21-83)||(27445150-27445212)
chr5 (21-83)||(27449994-27450056)
chr5 (182-312)||(33768184-33768314)
chr5 (21-83)||(43592459-43592521)
chr5 (21-83)||(43598904-43598966)
chr5 (21-83)||(43604396-43604458)
chr5 (21-83)||(43609888-43609950)
chr5 (220-312)||(31401838-31401930)
chr5 (21-83)||(15044865-15044928)
chr5 (172-312)||(42127364-42127503)
chr5 (172-312)||(31300549-31300689)
chr5 (219-312)||(28832263-28832357)
chr5 (174-312)||(19588750-19588888)
chr5 (19-89)||(24553333-24553401)
chr5 (22-88)||(11181641-11181705)
chr5 (23-89)||(28832480-28832544)
chr5 (22-89)||(31300404-31300469)
chr5 (39-82)||(28807436-28807479)
chr5 (20-81)||(7160711-7160770)
chr5 (20-89)||(19588968-19589035)
chr5 (253-312)||(4410241-4410301)
chr5 (219-312)||(24553506-24553599)
chr5 (253-312)||(15552464-15552524)
chr5 (253-312)||(31179371-31179431)
chr5 (253-312)||(31542953-31543013)
chr5 (253-312)||(31545299-31545359)
chr5 (22-89)||(42127179-42127244)
[»] chr1 (45 HSPs)
chr1 (20-312)||(24202572-24202861)
chr1 (17-312)||(24787161-24787456)
chr1 (20-312)||(19358647-19358935)
chr1 (20-312)||(19361236-19361524)
chr1 (61-312)||(19379916-19380164)
chr1 (22-309)||(3281715-3281995)
chr1 (20-208)||(19366111-19366297)
chr1 (20-312)||(26644705-26644990)
chr1 (20-294)||(13604429-13604697)
chr1 (20-286)||(21536377-21536635)
chr1 (136-312)||(41390586-41390760)
chr1 (136-312)||(41398241-41398415)
chr1 (22-312)||(37069774-37070055)
chr1 (20-312)||(47703740-47704029)
chr1 (137-312)||(25444996-25445169)
chr1 (141-312)||(39445505-39445673)
chr1 (141-312)||(44023785-44023953)
chr1 (141-312)||(1054923-1055091)
chr1 (172-295)||(32889461-32889583)
chr1 (20-309)||(29651818-29652103)
chr1 (21-312)||(9476265-9476551)
chr1 (22-312)||(13598402-13598688)
chr1 (20-312)||(19072932-19073220)
chr1 (20-312)||(19120822-19121110)
chr1 (21-83)||(41398415-41398477)
chr1 (220-312)||(43988452-43988544)
chr1 (172-312)||(16124469-16124609)
chr1 (24-83)||(41390760-41390819)
chr1 (20-312)||(47098632-47098917)
chr1 (219-312)||(27104370-27104465)
chr1 (20-89)||(47102646-47102713)
chr1 (232-312)||(775676-775757)
chr1 (219-312)||(47102840-47102934)
chr1 (22-89)||(27104211-27104275)
chr1 (20-89)||(32889661-32889728)
chr1 (20-89)||(40816621-40816690)
chr1 (27-86)||(22819657-22819714)
chr1 (39-82)||(1054874-1054917)
chr1 (39-82)||(25439758-25439801)
chr1 (39-82)||(25444951-25444994)
chr1 (39-82)||(39445679-39445722)
chr1 (39-82)||(44023736-44023779)
chr1 (253-312)||(9459419-9459479)
chr1 (253-312)||(9463246-9463306)
chr1 (253-312)||(16226386-16226446)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (20-312)||(17755-18044)
scaffold0188 (20-312)||(23848-24137)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (20-312)||(8224-8512)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (20-294)||(133086-133354)
scaffold0006 (22-312)||(5687-5973)
scaffold0006 (20-312)||(2496-2784)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (20-312)||(36639-36925)
scaffold0087 (20-312)||(43768-44054)
[»] scaffold0135 (2 HSPs)
scaffold0135 (136-312)||(34967-35142)
scaffold0135 (21-83)||(34905-34967)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (20-312)||(85687-85973)
[»] scaffold0355 (4 HSPs)
scaffold0355 (136-312)||(9549-9722)
scaffold0355 (21-83)||(3692-3754)
scaffold0355 (48-83)||(9514-9549)
scaffold0355 (136-215)||(3754-3833)
[»] scaffold0464 (2 HSPs)
scaffold0464 (141-312)||(368-536)
scaffold0464 (39-82)||(542-585)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (220-312)||(14297-14389)
scaffold0197 (247-312)||(19180-19245)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (220-312)||(2239-2331)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (220-312)||(148944-149036)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (247-312)||(181979-182044)
[»] scaffold0148 (2 HSPs)
scaffold0148 (184-309)||(10736-10861)
scaffold0148 (22-89)||(10954-11021)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (175-312)||(17267-17404)
scaffold0176 (22-89)||(17474-17539)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (233-294)||(45276-45337)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (253-312)||(269-329)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (22-89)||(23755-23820)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 2671383 - 2671678
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2671383 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 2671482  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  2671483 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttggtcttgtgtaagcttgcaatctat 2671582  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671583 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 2671678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 40372593 - 40372887
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40372593 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 40372692  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40372693 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattatgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgcaagctat 40372792  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372793 t-tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 40372887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 9091098 - 9091393
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9091098 caaagggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgaaaggatctaaag 9091197  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9091198 cttcctctagtgtcttctcttctagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaagcttgaaggctat 9091297  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091298 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 9091393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 8738864 - 8739155
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagcttc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8738864 gggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgaaaggatctaaagcttc 8738963  T
Q  121 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtt 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8738964 ctctagtgtcttctcttctagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaagcttgaaggctattgtt 8739063  T
Q  221 tcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739064 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 8739155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7167545 - 7167249
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaa-cattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7167545 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 7167446  T
Q  116 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagcta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7167445 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaaggcta 7167346  T
Q  216 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167345 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 7167249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8477664 - 8477367
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8477664 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 8477565  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagt-ggggaaacacatatgggtagaatctagggcttg-ttcttgtgtaagcttgaaagct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||    
T  8477564 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttattgtgtaagcttgcaagct 8477465  T
Q  215 attgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477464 attgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 8477367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 312
Target Start/End: Original strand, 28503662 - 28503956
Alignment:
Q  18 aaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28503662 aaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaatattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagc 28503761  T
Q  118 ttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgaaagctat 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||     
T  28503762 ttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctag 28503861  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503862 agtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 28503956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 26928395 - 26928683
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  26928395 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtaatgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 26928490  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26928491 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 26928590  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26928591 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaa 26928683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 28501495 - 28501750
Alignment:
Q  18 aaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagc 117  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28501495 aaagggatgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagc 28501594  T
Q  118 ttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgaaagctat 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||     
T  28501595 ttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctag 28501694  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctct 273  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28501695 agtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1306239 - 1305953
Alignment:
Q  23 gttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagcttcct 122  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| | |||||||||    
T  1306239 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcttaagcttcct 1306142  T
Q  123 ctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttc 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1306141 cttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaagcttgcaaactatt-tttc 1306043  T
Q  223 ttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306042 ttgtaaccctttgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 1305953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32143613 - 32143325
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  32143613 agggttgagtgtctttgtagtgatgatctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 32143518  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  32143517 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 32143419  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  32143418 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27453248 - 27452962
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    ||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  27453248 agggttgagtgtct--gtagtgaggatctcttgggttggcaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 27453155  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27453154 ccttttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaaataggaattgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 27453056  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||    
T  27453055 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 27452962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 27974748 - 27975035
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  27974748 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtcgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 27974843  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27974844 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagaatggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt- 27974940  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  27974941 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 27986252 - 27986529
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  27986252 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 27986347  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  27986348 ccttttgtgtcttctcttttagggttgatattgagagagt-gggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 27986445  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||          |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  27986446 ttc----------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16264639 - 16264354
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  16264639 agggttgagtgtctttgtaatgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 16264544  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  16264543 ccttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgggtaa-cacaaatgtgtagaaattaggtcttgttcttgtggaagcttgcaagctatt- 16264448  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  16264447 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 8370285 - 8370569
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||| ||    
T  8370285 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagttt 8370380  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||| | |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||  |||||| |      
T  8370381 ccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtga-cacaaatgggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaagcttttaagctaat-- 8370475  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  8370476 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 22173100 - 22173275
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||    
T  22173100 ttttagggttcatattaggagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 22173198  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173199 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 22173275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 33386471 - 33386749
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  33386471 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgagaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 33386566  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  33386567 ccttttgtgtcttctcttttagggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaaactatt- 33386664  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||          |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||    
T  33386665 tttc----------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Original strand, 6794511 - 6794778
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||| ||   |||||||    
T  6794511 agggttgagtgtcattgtagtgaggttctcttgagttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaatgaacaaaagctt 6794606  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||| | || | |||||||  |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  6794607 ccttttgtattttctctt--agggttcatattgtgagagtgggtga-cacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctaat-t 6794702  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  6794703 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 6794778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36029383 - 36029097
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  36029383 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 36029288  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | |||| |||||||  ||| |||||||| |||||||| | || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |     
T  36029287 ccttttgtgttttctctt--aggattcatattttgagagtgagtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagtttgtaagctaat- 36029192  T
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  36029191 -ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaa 36029097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21711512 - 21711227
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  21711512 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgagtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 21711417  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtg-gggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | |||| |||||||  ||| |||||  | |||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||| |     
T  21711416 ccttttgtgttttctctt--aggattcattat-tgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagcttttaagctaat- 21711321  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  21711320 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 40592578 - 40592865
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  40592578 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagct 40592673  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctatt 217  Q
    |||| | |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||   ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  40592674 tccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaa-atgggtagaaattagattttgttcttgtgtaagcttgtaagctaat 40592770  T
Q  218 gtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
      |||||||||| |||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  40592771 --ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 40592865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18656609 - 18656440
Alignment:
Q  140 agggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaa 238  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||    
T  18656609 agggtttatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatgctagagt--cttgtaaccttttgtaa 18656513  T
Q  239 cactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656512 cactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18656440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35925768 - 35925529
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  35925768 agggttgaatgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 35925673  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||| | |||| |||||||  ||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||  || |||   |    
T  35925672 ccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagt-gggtgacacaaatgggtagaaattaggttttgttctagtgtaagcttataaacta--at 35925578  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgc 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  35925577 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagaactgc 35925529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 3715796 - 3716085
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-g 116  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |    
T  3715796 agggttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaag 3715891  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagcta 215  Q
    ||| || | |||| |||||||  ||| |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||  || | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3715892 ctttcttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgaaagtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagtttgtaagcta 3715988  T
Q  216 ttgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  3715989 at--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 3716085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 1736100 - 1736388
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  1736100 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctattgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagct 1736195  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    || | | |||| |||||||  ||| ||||| |||| ||| || || || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||| ||     
T  1736196 tctttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgttggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagtta- 1736291  T
Q  217 tgtttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
      ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  1736292 -atttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 18552826 - 18552966
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  18552826 atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctc 18552923  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  18552924 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 2672919 - 2673011
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2672919 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 2673011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 2677075 - 2677167
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2677075 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 2677167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8512314 - 8512222
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8512314 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 8512222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8517194 - 8517102
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8517194 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 8517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32475580 - 32475490
Alignment:
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32475580 ttcttgtaactctttgtaa-acattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 32475490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32480438 - 32480348
Alignment:
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32480438 ttcttgtaactctttgtaa-acattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 32480348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 22173038 - 22173100
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173038 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 22173100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 30709733 - 30709873
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  30709733 atgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctc 30709830  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  30709831 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48438505 - 48438236
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||| |||  ||| |||    
T  48438505 agggttgagtgtctttgtagtaaggatctcttgg-ttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaatgatcaaaaagct 48438411  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||| | |||| |||||||  ||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  | ||||     
T  48438410 tccttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttatatgcta- 48438315  T
Q  217 tgtttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
      ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  48438314 -atttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 48438236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25795925 - 25795785
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  25795925 atgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctc 25795828  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  25795827 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40844795 - 40844674
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||    
T  40844795 atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctc 40844698  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg 295  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  40844697 tctc-cccagattaggtcatattgg 40844674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 3328300 - 3328439
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctct 271  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||| | |||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||    
T  3328300 atgggtagaaattaggacttgttcttttgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctct 3328397  T
Q  272 ctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||  | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  3328398 ctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaa 3328439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24968204 - 24968112
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24968204 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctactctctccccaaaattaagccacattggctgaactgggtcaacaa 24968112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 39032351 - 39032551
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  39032351 agggttgagtgtctttgtagtgaga-tctcttgggttggtaaa--cattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 39032445  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| | |||||| | |||| |||||  |||  |||| ||||| ||||||||| |||||||      
T  39032446 ccttttgtgtcttctc--ttagggttcatcattgagagagt-gagaaacataaatggatagaaattagatcttgctcttgcgtaagcttgcaagctat-- 39032540  T
Q  219 tttcttgtaac 229  Q
    |||||||||||    
T  39032541 tttcttgtaac 39032551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Original strand, 3323634 - 3323755
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctct 271  Q
    ||||||||||  || | ||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||    
T  3323634 atgggtagaaattatgacttgttcttttgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgttct 3323731  T
Q  272 ctcacccagattaggccatattgg 295  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  3323732 ctctcccagattaggtcatattgg 3323755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26299132 - 26298992
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| | |||||||| |||||||    
T  26299132 atgggtagaaattaggtcttgttcttgtctaagtttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctc 26299035  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| ||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||    
T  26299034 tctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 1417434 - 1417573
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctct 271  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||| ||  |||||| |  ||||| |||| | |||||||||||||  | || |||||||||| | ||||||    
T  1417434 atgggtagaaattaggacttgttcttttgtaagtttataagctaat--ttcttataactcattgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctct 1417531  T
Q  272 ctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  1417532 ctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 4386773 - 4386840
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4386773 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaatcaccttgagtagtgag 4386840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37466389 - 37466295
Alignment:
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  37466389 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 3323487 - 3323554
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3323487 agggttgagtgtctttatagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 3323554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 3328153 - 3328220
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3328153 agggttgaatgtctttgtagtgagcttctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 3328220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 24694962 - 24695029
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24694962 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtggtgag 24695029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 26299278 - 26299211
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26299278 agggttgaatgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 26299211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 89
Target Start/End: Original strand, 47923704 - 47923767
Alignment:
Q  24 ttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47923704 ttgagtgtctttgtagtgagaatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 47923767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 291
Target Start/End: Original strand, 4386915 - 4386988
Alignment:
Q  219 tttcttgtaaccc-tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccata 291  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4386915 tttcttgtaacccatttgtatcacttttatcttattggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcata 4386988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10207983 - 10207939
Alignment:
Q  268 ctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10207983 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 10207939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 23392167 - 23392106
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23392167 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 23392106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 312
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040075
Alignment:
Q  233 ttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39040075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 8126917 - 8126853
Alignment:
Q  23 gttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    ||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  8126917 gttgagtgtctttgtagtgaggttttcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 8126853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18656657 - 18656614
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656657 gagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 18656614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 47923894 - 47923989
Alignment:
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| | ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  47923894 tttcttgtaactcttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 47923989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23410587 - 23410529
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttg 80  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  23410587 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttg 23410529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 1305882 - 1305851
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1305882 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 1305851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 1309787 - 1309756
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1309787 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 1309756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 24695107 - 24695247
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||| ||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||||    
T  24695107 atgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagtttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctc 24695204  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| |  |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  24695205 tctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 24695247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 47649862 - 47649677
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggat-ttaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | || ||||  | || |||||||   ||||    
T  47649862 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtta-gatttcacca-tttgaaggatcaaaaag 47649767  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttg 208  Q
    |||||| | |||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  47649766 cttccttttgtgttttctc--ttaggattcatattgcgagagtgggtgacaca-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtggaagcttg 47649677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 1417287 - 1417354
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||    
T  1417287 agggttgagtgtctttgtagtgaggttatcttgggttggg--aaacattgtaaacactttaggtagtgag 1417354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 417
Target Start/End: Original strand, 2671753 - 2671783
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgtt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671753 acactagactagggctgtttttgttgttgtt 2671783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 25929192 - 25929258
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  25929192 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagttgg--aaaacattgtaaaca-cttgggtagtgag 25929258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27026996 - 27026929
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||||| | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  27026996 agggttgagtgtctttgtactgaggatctcttggatagggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 27026929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27038341 - 27038274
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27038341 agggttgagtgcctttgtagtgaggatctcttgggtaggg--aaacattgtaaacaccttgggtggtgag 27038274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 37725965 - 37725898
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  37725965 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtgggg--aaacattataaacaccttggatagtgag 37725898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 10274646 - 10274605
Alignment:
Q  48 tcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  10274646 tcttgggttgggaaacacattatattcaccttgggtagtgag 10274605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 25796072 - 25796003
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctctt--gggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25796072 agggttgagtgtctttgtagtgaggctctcttgagggttggg--aaacaatgtaaacaccttgggtagtgag 25796003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Original strand, 38210569 - 38210629
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38210569 tggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 38210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Original strand, 50494198 - 50494258
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  50494198 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 50494258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 53894119 - 53894055
Alignment:
Q  249 atattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  53894119 atattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 53894055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14291788 - 14291493
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14291788 caaagggttgagcgtctttgtagatagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 14291689  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14291688 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaggctat 14291589  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291588 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 14291493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 11098724 - 11099019
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11098724 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagtacattagttggaaggatctaaag 11098823  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11098824 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgcaagctat 11098923  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11098924 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 11099019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 9296199 - 9296493
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||    
T  9296199 caaagggttgagtgtctttgtagaaagtgtctattgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacca-ttggaaggatctaaag 9296297  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9296298 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtataagcttgaaggctat 9296397  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296398 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 9296493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3492044 - 3491755
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||  | |||||||||| | ||||||    
T  3492044 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggaaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-attccacca-ttggaaggatcttaagctt 3491947  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3491946 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 3491848  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491847 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 3491755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25398711 - 25398500
Alignment:
Q  100 gttggaaggatttaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgt 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25398711 gttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgt 25398612  T
Q  200 gtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctga 299  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25398611 gtaagcttgcaagctatt-tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctga 25398513  T
Q  300 actgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||    
T  25398512 actgggtcaacaa 25398500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25403849 - 25403638
Alignment:
Q  100 gttggaaggatttaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgt 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25403849 gttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgt 25403750  T
Q  200 gtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctga 299  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25403749 gtaagcttgcaagctatt-tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctga 25403651  T
Q  300 actgggtcaacaa 312  Q
    |||| ||||||||    
T  25403650 actgagtcaacaa 25403638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25407838 - 25407653
Alignment:
Q  100 gttggaaggatttaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgt 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25407838 gttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgt 25407739  T
Q  200 gtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattagg 286  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25407738 gtaagcttgcaagctatt-tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40739124 - 40738848
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  40739124 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtaatgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 40739029  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  40739028 actattgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaagacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 40738930  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||          |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40738929 ttc----------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaa 40738848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 28258984 - 28259270
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  28258984 agggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 28259079  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28259080 ccttttgtgtcttctcttt-aggggtcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattagatcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt- 28259176  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  28259177 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 36757569 - 36757855
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  36757569 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 36757664  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  36757665 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcatcattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggttttgttcttgtgtaagcttgaaagctttt- 36757761  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     ||||| |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  36757762 -ttcttataactctttgaaacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 36757855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 23078279 - 23078562
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagcttc 120  Q
    |||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||  ||||||||    
T  23078279 gggttgagtgtctttgtgatgagaatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcatca-ttggaaggatcaaaagcttc 23078374  T
Q  121 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtg-gggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    || | ||||||||||||  |||||||||  | |||||||| ||| |||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||      
T  23078375 cttttgtgtcttctctt--agggttcatcat-tgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-- 23078469  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggct-gaactgggtcaaca 311  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  23078470 ttcttgtaactctttctaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaaca 23078562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 39811894 - 39812068
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||    
T  39811894 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 39811991  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39811992 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaa 39812068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 137 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32246966 - 32246793
Alignment:
Q  137 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttg 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  32246966 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtataatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttg 32246869  T
Q  236 taacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32246868 taacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaa 32246793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8040354 - 8040064
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  8040354 ggttgagtgtctttgtagtgaagttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagct 8040259  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctatt 217  Q
    |||| |  ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  8040258 tccttttatgtttt-tctcttaggattcatattgtgagagtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaat 8040161  T
Q  218 gtttcttgtaaccct---ttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
      |||||||||| ||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8040160 --ttcttgtaactctcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 312
Target Start/End: Original strand, 44312567 - 44312704
Alignment:
Q  174 gggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctc 272  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  44312567 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaaccttttgtaacactttct-catattggattggagagctgctctc 44312664  T
Q  273 tcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312665 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 44312704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13569619 - 13569332
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  13569619 agggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattataaacaccttggatagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagct 13569524  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctatt 217  Q
    |||| | |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||  |||||| |    
T  13569523 tccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacaaacaaa-gggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaaacttataagctaat 13569427  T
Q  218 gtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
      |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  13569426 --ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21630232 - 21629948
Alignment:
Q  23 gttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gcttcc 121  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| ||||||    
T  21630232 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagcttcc 21630137  T
Q  122 tctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    | | |||| |||||||  ||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| | ||||||||||  || | |||||||||||||||||||  || |||   |    
T  21630136 ttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcttataaacta--at 21630042  T
Q  220 ttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21630041 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctc-cccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 21629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 312
Target Start/End: Original strand, 10707149 - 10707345
Alignment:
Q  113 aaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaag 212  Q
    |||||||||| | |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10707149 aaagcttccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtga-cacagatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaag 10707245  T
Q  213 ctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaac 310  Q
    ||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  10707246 ctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaac 10707343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34389141 - 34388862
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  34389141 agggttgtgtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagct 34389046  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctatt 217  Q
    |||| | |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||   ||          
T  34389045 tccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagct---aa------ 34388958  T
Q  218 gtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  34388957 -tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 34388862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 312
Target Start/End: Original strand, 8390046 - 8390243
Alignment:
Q  113 aaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaa 211  Q
    |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  8390046 aaagcttcctcttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgcaagcttgtaa 8390142  T
Q  212 gctattgtttcttgtaaccctttgt-aacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaa 309  Q
    |||| |  |||||||||| |||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||    
T  8390143 gctaat--ttcttgtaactcttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaa 8390240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 14698816 - 14699100
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||  ||| |||    
T  14698816 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctctcgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacta-ttggaaggatcaaaaagct 14698911  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctatt 217  Q
    |||| | |||| |||||||  ||| |||||  || ||| ||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| |    
T  14698912 tccttttgtgttttctctt--aggattcat--tgagagtgtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat 14699006  T
Q  218 gtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
      |||||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  14699007 --ttcttgtaactcttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 295
Target Start/End: Original strand, 42039588 - 42039744
Alignment:
Q  138 ttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgt 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||| ||    
T  42039588 ttaggattcatattgtgagagtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgtttttgtgtaagcttgcaagctaat-tttcttgtaactcttcgt 42039685  T
Q  237 aacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  42039686 aacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattgg 42039744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 10445397 - 10445537
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  10445397 atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagattgtaagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctc 10445494  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||    
T  10445495 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19344596 - 19344426
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaa-gctattgtttcttgtaacccttt-gta 237  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||    
T  19344596 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagcta--gattcttgtaactcttttgta 19344500  T
Q  238 acactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19344499 acacattca-catattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 19344426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19349454 - 19349284
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaa-gctattgtttcttgtaacccttt-gta 237  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||    
T  19349454 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagcta--gattcttgtaactcttttgta 19349358  T
Q  238 acactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19349357 acacattca-catattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 19349284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 34682138 - 34682427
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |    | |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||| ||||||  ||| | |    
T  34682138 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagagttggaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccacttg-aaggatcaaaatgtt 34682235  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctatt 217  Q
    |||| | |||| |||||||  ||| ||||  ||||||||||||| || ||| | ||||||||||  || | ||||||||||||||||| || |||||| |    
T  34682236 tccttttgtgttttctctt--aggattcaccttgtgagagtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcctgtaagctaat 34682332  T
Q  218 gtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
      |||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||    
T  34682333 --ttcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 25409923 - 25409854
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25409923 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 25409854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17865330 - 17865207
Alignment:
Q  189 cttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggc 287  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||     
T  17865330 cttgttcttgtgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggt 17865233  T
Q  288 catatt-ggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||| | |||||||||||||||||    
T  17865232 catattcgactgaactgggtcaacaa 17865207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20522319 - 20522224
Alignment:
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  20522319 tttcttgtaacccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 39811832 - 39811894
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39811832 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttaggttgagaaaaacattgtaatcaccttgggt 39811894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 39483075 - 39482935
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||    
T  39483075 atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagcta--atttcttgtaactcttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctc 39482978  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  39482977 tctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39482935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31056335 - 31056067
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggat-ttaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||  | ||| ||||||   ||||    
T  31056335 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcacca-ttgaaaggatcaaaaag 31056240  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagcta 215  Q
    |||||| | |||| |||||  ||||| |||  |||| ||| ||||| || ||| | ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  ||||||    
T  31056239 cttccttttgtgttttctc--ttaggattc--attgagagtgtgggtgacaca-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagcta 31056145  T
Q  216 ttgtttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattg 294  Q
       ||| ||||||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  31056144 --atttattgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattg 31056067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33118425 - 33118158
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggat-ttaaagct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| || |||   | ||||||||||   ||||||    
T  33118425 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--gaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcgcca-ttggaaggatcaaaaagct 33118330  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtg-gggaaacac-atatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||| | |||| |||||  ||| | |||||    |||||||| |||  |||| | ||||||||||  || | |||||||||||||||||||  ||||||     
T  33118329 tccttttgtgttttctc--ttaagattcat----tgagagtgagggtgacacaaaatgggtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcttataagcta- 33118237  T
Q  217 tgtttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
      |||||||||||   |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  33118236 -atttcttgtaactattttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattgg 33118158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 33528431 - 33528714
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  33528431 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacacattgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagct 33528526  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||| | |||| |||||||  ||| ||||| |||| |||  |||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||     |||||  ||||||     
T  33528527 tccttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtttgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttctt-----agcttataagctaa 33528618  T
Q  217 tgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  33528619 t--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 33528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 17865495 - 17865428
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17865495 agggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 17865428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 20522512 - 20522445
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||    
T  20522512 agggttgagtgtctttgtagtgagtatctcttgggttggg--aagcattgtaaacaacttgggtagtgag 20522445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 2869691 - 2869786
Alignment:
Q  219 tttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||| || ||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||    
T  2869691 tttcttgtaactcctttgtatcactttcatcttagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 2869786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 32247011 - 32246968
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32247011 gagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 32246968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 10445274 - 10445341
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  10445274 agggttgaatgtctttgtagtgaggttctctcgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 10445341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Original strand, 27149303 - 27149369
Alignment:
Q  229 ccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||    
T  27149303 ccctttgtatcactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattgg 27149369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 39483223 - 39483156
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39483223 agggttgagtgtctttgttgtgaggatctcttgggttggg--aaatattgtaaacaccttgggtagtgag 39483156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 312
Target Start/End: Original strand, 16940221 - 16940302
Alignment:
Q  232 tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| || ||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||    
T  16940221 tttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaa 16940302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 312
Target Start/End: Original strand, 17010886 - 17010967
Alignment:
Q  232 tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| || ||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||    
T  17010886 tttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaa 17010967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Original strand, 2869501 - 2869566
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2869501 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagttgg--aaaacattgtaaacacattgggtagtgag 2869566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 2838028 - 2838123
Alignment:
Q  219 tttcttgtaaccc-tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||   || |||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  2838028 tttcttgtaactcatttgtatcactttcattttagtggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 2838123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 3491684 - 3491653
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491684 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 3491653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 41586357 - 41586425
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaaca-ttgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41586357 agggttgagtgtctttggtgagagcttctcttgggttgg--aaaacagttgtaaacaccttgggtagtgag 41586425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 417
Target Start/End: Original strand, 9296568 - 9296598
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgtt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296568 acactagactagggctgtttttgttgttgtt 9296598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 35397799 - 35397732
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35397799 agggttgattgtctttgtagtgaggttcttctgggttgg--aaaacattgtaattaccttgggtagtgag 35397732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 2837834 - 2837903
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctctt--gggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2837834 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg--aaacattgtaaacaccttggatagtgag 2837903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35215646 - 35215586
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35215646 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35215586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35218023 - 35217963
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35218023 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35217963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 4759871 - 4760167
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaa-acattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4759871 caaagggttgagtgtctttgtagagagagtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 4759970  T
Q  116 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagcta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4759971 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaggcta 4760070  T
Q  216 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760071 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 4760167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 10688937 - 10689235
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgga--aggatttaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||    
T  10688937 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgggggaggatctaa 10689036  T
Q  115 agcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaaca-catatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10689037 agcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaggc 10689136  T
Q  214 tattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689137 tattgtttcttgtaaccctctgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 10689235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30655946 - 30655651
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30655946 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 30655847  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30655846 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaaggctat 30655747  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655746 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 30655651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 33037605 - 33037898
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33037605 caaagggttgagtgtcttcgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 33037704  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33037705 cttcctctagtgtcttctc-tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaaggctat 33037803  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037804 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 33037898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36979676 - 36979382
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36979676 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttaggttgggaaaa-cattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 36979578  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36979577 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaaggctat 36979478  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979477 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 36979382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 18870358 - 18870654
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18870358 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 18870457  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18870458 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaatgctat 18870557  T
Q  217 tgtttcttgtaaccc-tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18870558 tgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaa 18870654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 18852964 - 18853260
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18852964 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaatattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 18853063  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18853064 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtaaaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaatgctat 18853163  T
Q  217 tgtttcttgtaaccc-tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853164 tgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18853260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 1261757 - 1262046
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||    
T  1261757 agggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagctt 1261854  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  1261855 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgtacttgtgtaagcttgcaagctatt-t 1261953  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  1261954 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaa 1262046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6311598 - 6311302
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6311598 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatcaaaag 6311499  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctc--ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgaaagc 213  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||    
T  6311498 cttcctctagtgacttctcttttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttg-tcttgtgtaaagcttgaaggc 6311400  T
Q  214 tattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311399 tagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 6311302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 312
Target Start/End: Original strand, 31071035 - 31071322
Alignment:
Q  23 gttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagcttcct 122  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| | |||||||||    
T  31071035 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcttaagcttcct 31071132  T
Q  123 ctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttc 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31071133 cttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-tttc 31071231  T
Q  223 ttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  31071232 ttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26288184 - 26287906
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||    
T  26288184 agggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagctt 26288087  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26288086 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggg-aacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 26287989  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||          |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287988 ttc----------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 26287906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26301441 - 26301163
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||    
T  26301441 agggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagctt 26301344  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26301343 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggg-aacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 26301246  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||          |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301245 ttc----------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 26301163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26313435 - 26313157
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||    
T  26313435 agggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagctt 26313338  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26313337 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggg-aacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 26313240  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||          |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313239 ttc----------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 26313157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7412630 - 7412345
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||| ||||||  |||||||    
T  7412630 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttgaaaggatcaaaagctt 7412535  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| |  |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  7412534 ccttttatgtcttctctt--agggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt- 7412439  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  7412438 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 19175561 - 19175847
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||  |||| ||    
T  19175561 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggattgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacta-ttggaaggatcaaaagttt 19175656  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| | ||||||     
T  19175657 ccttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtggg-aaacacaaatgtgtagaagttaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaggctatt- 19175752  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  19175753 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4456318 - 4456050
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | || |||||||  |||||||    
T  4456318 agggttgagtgtctctgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttagaaggatcaaaagctt 4456223  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||||  |||||||     
T  4456222 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcatcattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaagcttgccagctatt- 4456126  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4456125 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 4456050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 7289831 - 7290006
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||    
T  7289831 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 7289929  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289930 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 7290006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 25328184 - 25328358
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||    
T  25328184 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 25328281  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328282 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 25328358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 23799383 - 23799670
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||| ||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  23799383 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggggaa--cattgtaaacaccttgagtagggag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagct 23799478  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctatt 217  Q
    |||| | |||| ||| |||  ||| |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23799479 tccttttgtgttttccctt--aggattcatattgtgacagtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaat 23799575  T
Q  218 gtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
      |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  23799576 --ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 26403034 - 26403323
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-g 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |    
T  26403034 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaag 26403129  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagcta 215  Q
    |||||| | |||| ||||||| |  | ||||||||||||||||| | || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26403130 cttccttttgtgttttctcttat--gattcatattgtgagagtgagtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgcaagcttgtaagcta 26403226  T
Q  216 ttgtttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
       |||| | |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  26403227 --atttcctataactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Original strand, 39784734 - 39784902
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga-aagctattgtttcttgtaaccctttgtaa 238  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  ||  ||||||||| |||||||    
T  39784734 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 39784830  T
Q  239 cactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784831 cacttc--acatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 39784902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 19752347 - 19752487
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctct 271  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  19752347 atgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctct 19752445  T
Q  272 ctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||| || ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  19752446 ctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35745566 - 35745396
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaa-gctattgtttcttgtaacccttt-gta 237  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||    
T  35745566 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagcta--gattcttgtaactcttttgta 35745470  T
Q  238 acactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35745469 acacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 35745396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 10684252 - 10684344
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10684252 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 10684344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 7289769 - 7289831
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289769 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 7289831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6127365 - 6127225
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6127365 atgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctc 6127268  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||  |||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  6127267 tcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 6127225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 25327996 - 25328058
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25327996 gggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 25328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 25328122 - 25328184
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328122 gggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 25328184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 5702287 - 5702576
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||| |||  ||| |||    
T  5702287 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaata--ttgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaatgatcaaaaagct 5702382  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||| | |||| || ||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||  || | ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||  ||||||     
T  5702383 tccttttgtgtttt-tctcttaggattcattattgagagtgtgggtgactcaaa-atgggtagaaattaggttttgctcttgtgtaagcttataagctaa 5702480  T
Q  217 tgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |  |||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  5702481 t--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 312
Target Start/End: Original strand, 4696609 - 4696689
Alignment:
Q  233 ttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  4696609 ttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 4696415 - 4696482
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4696415 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 4696482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765912
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 39784685 - 39784728
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784685 gagagagtctcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 39784728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 89
Target Start/End: Original strand, 9054231 - 9054294
Alignment:
Q  24 ttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9054231 ttgagtgtttttgtagtgagattctcttgggttgg--aaaacattataatcaccttgggtagtgag 9054294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 19752201 - 19752268
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19752201 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgtg--aaatattgtaaacaccttgggtagtgag 19752268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 9054835 - 9054912
Alignment:
Q  219 tttcttgtaacc-ctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  9054835 tttcttgtaaccactttgtatcactttcatcttagtggattagagagctgctctctcctccagagtaggtcatattgg 9054912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6813782 - 6813726
Alignment:
Q  219 tttcttgtaaccc-tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctc 274  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6813782 tttcttgtaacccctttgtgtcactttcatcttattggattggagagctgctctctc 6813726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 418
Target Start/End: Original strand, 1262117 - 1262148
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262117 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 1262148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26287834 - 26287803
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287834 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 26287803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26313085 - 26313054
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313085 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 26313054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 418
Target Start/End: Original strand, 31071394 - 31071425
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31071394 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 31071425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 3051410 - 3051343
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  3051410 agggttgagtgtctttgtagtggggttctcttgagttggg--aaacattgtaaacatcttgggtagtgag 3051343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Original strand, 43079877 - 43079937
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43079877 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43079937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Original strand, 43082248 - 43082308
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43082248 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43082308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24742240 - 24741945
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24742240 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 24742141  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24742140 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaaggctat 24742041  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24742040 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 24741945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29760941 - 29760646
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaa-cattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29760941 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 29760842  T
Q  116 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgtt-cttgtgtaagcttgaaagct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||    
T  29760841 gcttcctctagtgtcttctctt--agggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaagcttgcaggct 29760744  T
Q  215 attgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760743 attgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 29760646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 28468341 - 28468621
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||    
T  28468341 agggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaatattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagctt 28468438  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||| |    
T  28468439 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttattgtgtaagcttgcaaactatttt 28468538  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||          |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28468539 ttc----------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaa 28468621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 31985440 - 31985726
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  | ||||  | | ||||||||  |||||||    
T  31985440 agggttgagtgtttttgtattgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgaa-atttcacca-tgggaaggatcaaaagctt 31985535  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31985536 ccttttgtgtcttctcttttagggttcacattgtgagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 31985633  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  31985634 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctc-cccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 5396478 - 5396764
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||| ||  |||||||    
T  5396478 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaagaatcaaaagctt 5396573  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
     || | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | || |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  5396574 tcttttgtgtcttctcttt-agggttcatcattgagagagtgagtaa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt- 5396670  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  5396671 -ttcttgtaactctttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 9224312 - 9224487
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||| ||||| |||    
T  9224312 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttctaacctttt 9224410  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224411 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 9224487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 51520637 - 51520462
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||    
T  51520637 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 51520539  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51520538 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaa 51520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3814202 - 3814029
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||    
T  3814202 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaacctttt 3814106  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814105 gtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 3814029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 9229099 - 9229274
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||| ||||| |||    
T  9229099 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttctaacctttt 9229197  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9229198 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaa 9229274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 137 - 312
Target Start/End: Original strand, 45357203 - 45357376
Alignment:
Q  137 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttg 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  45357203 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttg 45357300  T
Q  236 taacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45357301 taacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaa 45357376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 16623100 - 16623386
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  16623100 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 16623195  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||   |||||       
T  16623196 ccttttgtgttttct--tttaggattcatattgtgagagtgggtgacaca-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttctgtaagcttattagcta--a 16623290  T
Q  219 tttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  16623291 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 16623386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 312
Target Start/End: Original strand, 45347723 - 45347897
Alignment:
Q  137 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttg 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  | | ||||||||| ||||    
T  45347723 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggt-cttgtaaccttttg 45347821  T
Q  236 taacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45347822 taacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaa 45347897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Original strand, 36315037 - 36315321
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| | || |  | ||||||||||  |||||||    
T  36315037 agggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacacattgggtagtgag-atttaacca-ttggaaggatcaaaagctt 36315132  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtg-gggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | |||| || || |  ||| |||||  | |||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||| |     
T  36315133 ccttttgtgttttttcgt--aggattcattat-tgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagcttctaagctaat- 36315228  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 311  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  36315229 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Original strand, 36329246 - 36329530
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| | || |  | ||||||||||  |||||||    
T  36329246 agggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacacattgggtagtgag-atttaacca-ttggaaggatcaaaagctt 36329341  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtg-gggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | |||| || || |  ||| |||||  | |||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||| |     
T  36329342 ccttttgtgttttttcgt--aggattcattat-tgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagcttctaagctaat- 36329437  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 311  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  36329438 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3777839 - 3777553
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||| |||  ||| |||    
T  3777839 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaatgatcaaaaagct 3777744  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctatt 217  Q
    |||| | || | |||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3777743 tccttttgtattttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaa-atgggtagaaattagatcttgttcttgtgtaagtttgcaagctatt 3777647  T
Q  218 gtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
      |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  3777646 --ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 3777553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5732839 - 5732670
Alignment:
Q  140 agggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaa 238  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||    
T  5732839 agggtttatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 5732743  T
Q  239 cactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732742 cactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 5732670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5143550 - 5143263
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||  | |||||| |||||| ||||||||| | ||||  | ||||||||||   ||||||    
T  5143550 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggattgggaaa--ctttgtaaacaccttaggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcataagctt 5143455  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||| | ||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  5143454 ccttttgtgttttctcttt-agggttcatattctgagagtggctgacacaaa-atgagtagaaattaggtcttgttcttgtgtatgcttgcaagctatt- 5143358  T
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||   ||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  5143357 -ttcttgtaaattttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5147968 - 5147681
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||| |||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||| |||| || |||| | ||||  | ||||||||||   ||||||    
T  5147968 agggtttagtgtctttgtagtaaggatctcttgagttgggaaa--cattgtaaacacattggataatgag-atttcacca-ttggaaggatcataagctt 5147873  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  5147872 ccttttgtgttttctcttt-agggttcatattgtgagaatgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggccttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt- 5147776  T
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  5147775 -ttcttgtaactattttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5147681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18855900 - 18855732
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga-aagctattgtttcttgtaaccctttgtaa 238  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  ||  ||||||||| |||||||    
T  18855900 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 18855804  T
Q  239 cactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855803 cacttc--acatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18855732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10047671 - 10047383
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag-ct 118  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||  ||    
T  10047671 agggttgagtgtctttgtaatgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaaact 10047576  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||| | |||| || ||||  ||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  10047575 tccttttgtgttttgtctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaa 10047479  T
Q  217 tgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  10047478 t--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 304
Target Start/End: Original strand, 56146664 - 56146783
Alignment:
Q  184 tagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagat 282  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56146664 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaaccttttgtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagat 56146761  T
Q  283 taggccatattggctgaactgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  56146762 taggccatattggctgaactgg 56146783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 38152245 - 38152532
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||  | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  38152245 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggatgggaaata--ttgtaaacaccttgggtagtgacaa-ttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 38152340  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctatt 217  Q
    ||  | |||| |||||||  ||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| | || |||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| |    
T  38152341 ccatttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaa-attggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat 38152437  T
Q  218 gtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
      ||||| |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||    
T  38152438 --ttcttataactcttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 8689303 - 8689509
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||||  | ||||||||||  |||| ||    
T  8689303 agggtttagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattttaaacaccttggatagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagttt 8689398  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||      
T  8689399 ccttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtggg-aaacacaaattggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctat-- 8689493  T
Q  219 tttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||| ||||    
T  8689494 tttcttgtaacacttt 8689509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 51520699 - 51520637
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520699 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 51520637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 3796472 - 3796612
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  3796472 atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgcaagcttgtaagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctc 3796569  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  3796570 tctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaa 3796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 18712609 - 18712671
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18712609 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgttatcaccttgggt 18712671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 5269007 - 5269284
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  5269007 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttggatagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagct 5269102  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||| | |||| |||||||  ||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  5269103 tccttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaca-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaa 5269199  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |  |||||||          |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  5269200 t--ttcttgt----------aacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Original strand, 16628679 - 16628815
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  16628679 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 16628774  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg 162  Q
    ||| |  ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16628775 ccttt--tgtgttttcttttaggattcatattgtgagagtggg 16628815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 39246093 - 39245998
Alignment:
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  39246093 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 9224250 - 9224312
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9224250 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaacattgtaatcaccttgggt 9224312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 9229037 - 9229099
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9229037 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaacattgtaatcaccttgggt 9229099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24334103 - 24333831
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-g 116  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |    
T  24334103 agggttgagagtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaag 24334008  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgtt-cttgtgtaagcttgaaagct 214  Q
    |||||| | |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||  || ||| | ||||||||||  ||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  24334007 cttccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtggctgacacaaa-atgggtagaaattaggttttttttcttgtgtaagcttgtaagct 24333911  T
Q  215 attgtttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
    |   ||| || |||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  24333910 a--attttttataactcttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattgg 24333831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 311
Target Start/End: Original strand, 6743226 - 6743507
Alignment:
Q  24 ttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagcttcctc 123  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| | ||||  | ||||||||||  ||| ||||||     
T  6743226 ttgagtgtctttgtagcgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtaatgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaacttcctt 6743321  T
Q  124 tagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgttt 221  Q
    | |||| |||||||  ||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| | ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||  || |||| | |||    
T  6743322 ttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagctataa-gctaattttt 6743417  T
Q  222 cttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 311  Q
      |||| | |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6743418 --tgtagctcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 312
Target Start/End: Original strand, 16630650 - 16630773
Alignment:
Q  189 cttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggc 287  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |     
T  16630650 cttgttcttgtgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgt 16630747  T
Q  288 catattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||    
T  16630748 catattggaccgaactaggtcaacaa 16630773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 3814257 - 3814202
Alignment:
Q  28 gtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814257 gtgtctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 3814202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 45347678 - 45347721
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347678 gagagtgtctcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 45347721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 25861840 - 25861907
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25861840 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgagtagtgag 25861907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 5732887 - 5732844
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732887 gagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 5732844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 5112523 - 5112460
Alignment:
Q  24 ttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  5112523 ttgagtgtctttgttgtgaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 5112460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 42599526 - 42599667
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctg--ct 269  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||| | |||||||| ||||| | || |||||||||| | ||  ||    
T  42599526 atgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcattgtaacattttcatcttagtggattggagggttgctct 42599623  T
Q  270 ctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||| |||| |||| | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  42599624 ctctcccccatattatgtcatattggactgaattgggtcaacaa 42599667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6542439 - 6542378
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  6542439 agggttgagtgtctttgtaatgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 6542378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 312
Target Start/End: Original strand, 25862035 - 25862115
Alignment:
Q  233 ttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  25862035 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 25862115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Original strand, 42599383 - 42599448
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42599383 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttcggttggg--aaacattctaaacaccttgggtagtgag 42599448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Original strand, 51336974 - 51337035
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  51336974 agggttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggt 51337035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18855949 - 18855906
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855949 gagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 18855906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 418
Target Start/End: Original strand, 28468692 - 28468723
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28468692 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 28468723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 45357158 - 45357201
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357158 gagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 45357201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 54867327 - 54867188
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||  ||||||   |||||| ||||   ||||||||| ||||| |||| | ||||| || |||||||    
T  54867327 atgggtagaaattaggtattgttcttgtgtaagcttataagcta--atttcttataactattttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctc 54867230  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  54867229 tctc-cccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5112336 - 5112282
Alignment:
Q  219 tttcttgtaaccc-tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctc 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||    
T  5112336 tttcttgtaacccatttgtaacactttcatattagtggattggagagctgctctc 5112282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 281
Target Start/End: Original strand, 34495822 - 34495884
Alignment:
Q  220 ttcttgtaaccc-tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccaga 281  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34495822 ttcttgtaacccatttgtatcactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccaga 34495884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 1983298 - 1983375
Alignment:
Q  219 tttcttgtaaccc-tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | | || ||||||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||    
T  1983298 tttcttgtaacccctttgtatcactttgatcctagtggattggagagctgctatctcccccatagtaggtcatattgg 1983375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 3793885 - 3793954
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3793885 agggttgagtgtctttatagtgaggttctcttgagggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 3793954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 39774303 - 39774380
Alignment:
Q  219 tttcttgtaaccc-tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  39774303 tttcttgtaacctatttgtatcactttcattttagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattgg 39774380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16931849 - 16931789
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16931849 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16931789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16934203 - 16934143
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16934203 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16934143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22780433 - 22780373
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22780433 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22780373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 44599898 - 44599838
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  44599898 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 44599838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2058268 - 2057970
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgga--aggatttaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||    
T  2058268 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgggggaggatctaa 2058169  T
Q  115 agcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaaca-catatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2058168 agcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaatgc 2058069  T
Q  214 tattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2058068 tattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 2057970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 20357344 - 20357639
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20357344 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 20357443  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgaaagcta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20357444 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 20357543  T
Q  216 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357544 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 20357639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 1533241 - 1533536
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||    
T  1533241 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacca-ttggaaggatctaaag 1533339  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgtt-cttgtgtaagcttgaaagcta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1533340 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggaaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaagcttgcaagcta 1533439  T
Q  216 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533440 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 1533536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21640102 - 21639813
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||    
T  21640102 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagctt 21640005  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21640004 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 21639906  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639905 ttcttgtaaccctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 21639813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21646300 - 21646011
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| |||| |||    
T  21646300 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaatctt 21646203  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21646202 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 21646104  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21646103 ttcttgtaaccctttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 21646011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18409056 - 18408768
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||  |||||| | ||||||    
T  18409056 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttaaaaggatcttaagctt 18408959  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  18408958 cctcttgtgtcttc-cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt-t 18408861  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408860 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18408768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18413932 - 18413645
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| | ||||||    
T  18413932 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacaatgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcttaagctt 18413835  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  18413834 cctcttgtgtcttc-cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaatctatt-t 18413737  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413736 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctc-cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18413645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 135 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12406512 - 12406336
Alignment:
Q  135 cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaaccctt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||    
T  12406512 cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaaccttt 12406414  T
Q  234 tgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406413 tgtaacactttct-catattggattggagagctattctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 12406336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2479626 - 2479341
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  2479626 agggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 2479531  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| |  | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||      
T  2479530 ccttttatatcttctcttt-agggttcattattgagagagtggg-aaacacacatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctat-- 2479435  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  2479434 tttcttataactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 2479341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21983536 - 21983288
Alignment:
Q  62 aaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgg 161  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21983536 aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcataagcttccttttgtgttttctcttt-agggttcatattttgagagtgg 21983440  T
Q  162 g-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt--gtaacactttcaacatattggatt 258  Q
    | || ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  21983439 gtgacacaaa-atgggtagaaactaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt--ttcttgtaactctttttgtaacactttcatcatagtggatt 21983343  T
Q  259 ggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  21983342 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12397091 - 12396916
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| | || || ||||  ||| ||||||||| |||    
T  12397091 ttttagggttcatattgtgatagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagattaaaggctagagtt-cttgtaacctttt 12396993  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396992 gtaacactttct-catattggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 12396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29160096 - 29159807
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gc 117  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| ||    
T  29160096 gggttgagtgtctttatagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaaca-ttggaaggatcaaaaagc 29160001  T
Q  118 ttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    ||||| | |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  29160000 ttccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaa 29159903  T
Q  217 tgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  29159902 t--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 24024232 - 24024406
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||  |||    
T  24024232 ttttagggttcatcgtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacatttt 24024329  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024330 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 24024406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 312
Target Start/End: Original strand, 44848568 - 44848777
Alignment:
Q  101 ttggaaggatttaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgt 199  Q
    ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  44848568 ttggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctcttt-agagttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttattcttgt 44848665  T
Q  200 gtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattg-gctg 298  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  | |    
T  44848666 gtaagcttgcaagctttt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccg 44848763  T
Q  299 aactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||    
T  44848764 aactgggtcaacaa 44848777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 31109489 - 31109663
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |   | ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||    
T  31109489 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 31109586  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109587 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 31109663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19992487 - 19992318
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga-aagctattgtttcttgtaaccctttgtaa 238  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  ||  ||||||||| |||||||    
T  19992487 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 19992391  T
Q  239 cactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992390 cactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 19992318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 9189961 - 9190101
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctct 271  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  9189961 atgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctct 9190059  T
Q  272 ctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  9190060 ctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2580533 - 2580394
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctct 271  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  2580533 atgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt--ttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctct 2580436  T
Q  272 ctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  2580435 ctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4866820 - 4866735
Alignment:
Q  226 taaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866820 taaccttttgtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 4866735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 47263956 - 47263682
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  47263956 agggttgagtgtctttgtagtgagaatctcttcggttgggaaa--cattgtaaataccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 47263861  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||      
T  47263860 ccttttgtgtcttctattt-agggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatggatagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctat-- 47263765  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||          || ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  47263764 tttc----------ttataacactttcatcatagtggattggagagctg--ctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47263682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16880169 - 16880078
Alignment:
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16880169 ttcttgtaactctttgtaaaacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 16880078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16885025 - 16884934
Alignment:
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16885025 ttcttgtaactctttgtaaaacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 16884934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21989194 - 21988912
Alignment:
Q  24 ttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagcttcctc 123  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |  | ||||||||||   |||||||||     
T  21989194 ttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-attttacca-ttggaaggatcataagcttcctt 21989099  T
Q  124 tagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttc 222  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||| | |||||||||| |||||  || ||||||| |||||||| || |||||  |||    
T  21989098 tattgttttctcttt-agggttcatatttttagagtgggtgacacaaa-atgggtagaaactaggttttattcttgtataagcttgcaatctatt--ttc 21989003  T
Q  223 ttgtaacccttt--gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||  |||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  21989002 ttgtaactctttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttg--ctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21988912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 24261311 - 24261403
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24261311 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 24261403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 24266190 - 24266282
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24266190 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 24266282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20284379 - 20284093
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  20284379 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagct 20284284  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaac-acatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||| | |||| |||||||  ||| |||||  || ||| ||||| || |  | | | ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  ||||||     
T  20284283 tccttttgtgttttctctt--aggattcat--tgagagtgtgggtgatatgaaaaaagggtagaaattaggacttgttcttttgtaagcttataagctaa 20284188  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |  |||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  20284187 t--ttcttgtaacgcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12397153 - 12397091
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397153 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 12397091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 31109427 - 31109489
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109427 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 31109489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 56091 - 55955
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  56091 atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctc 55994  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaa 309  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  55993 tctc-cccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 2647504 - 2647789
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag-ct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||  ||    
T  2647504 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--catggtaagcaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaaact 2647599  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctatt 217  Q
    || | | |||| |||||||  ||| |||||  || ||| ||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| |    
T  2647600 tcattttgtgttttctctt--aggattcat--tgagagtgtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat 2647694  T
Q  218 gtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaa 312  Q
      |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  2647695 --ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4873370 - 4873310
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 81  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4873370 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 4873310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12406573 - 12406513
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 81  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406573 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 12406513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 46516263 - 46516403
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  46516263 atgggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaagcttttaagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctc 46516360  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  46516361 tctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 49091805 - 49091665
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||| ||   ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  49091805 atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataaggta--atttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctc 49091708  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  49091707 tcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaa 49091665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 312
Target Start/End: Original strand, 21812253 - 21812318
Alignment:
Q  247 acatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21812253 acatattggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 21812318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 24024170 - 24024232
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24024170 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttggaaaaacattgtaatcaccgtgggt 24024232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 312
Target Start/End: Original strand, 33332415 - 33332543
Alignment:
Q  184 tagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagat 282  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33332415 taggtcttgttcttttgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagat 33332512  T
Q  283 taggccatattggct-gaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||    
T  33332513 taggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 23402820 - 23402887
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23402820 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 23402887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Original strand, 4796477 - 4796542
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4796477 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 4796542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35960960 - 35960839
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccc-tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  35960960 atgggtagaaattaggtattgttcttttgtaagcttataagctaat--ttcttctaactcatttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctc 35960863  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattg 294  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  35960862 tctcccccagattaggtcatattg 35960839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 28617223 - 28617318
Alignment:
Q  219 tttcttgtaaccct-ttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||    
T  28617223 tttcttgtaaccccattgtatcactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 312
Target Start/End: Original strand, 4796637 - 4796760
Alignment:
Q  189 cttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggc 287  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||     
T  4796637 cttgttcttgtgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggt 4796734  T
Q  288 catattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||| |||| | ||||||||| |||||    
T  4796735 cattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 9185128 - 9185258
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctct 271  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||          |||||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  9185128 atgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-tttcttgt----------aacactttcatcttagtggattggagagcttctct 9185216  T
Q  272 ctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||| |||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  9185217 ctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Original strand, 23402967 - 23403086
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctct 271  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||| | |||||||||||||| | || | |||||||| |||||||     
T  23402967 atgggtagaaattaggacttgttcttttgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtagattggagggctgctca 23403064  T
Q  272 ctcacccagattaggccatatt 293  Q
    ||| | ||||||||| ||||||    
T  23403065 ctccctcagattaggtcatatt 23403086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 44847932 - 44847999
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44847932 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttggatagtgag 44847999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 46516112 - 46516179
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46516112 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgagttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 46516179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 2580679 - 2580613
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2580679 agggttgagtgtctttgt-gtgaggttctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 2580613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 3047544 - 3047477
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  3047544 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacactataatcatcttgggtagtgag 3047477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 9184981 - 9185048
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  9184981 agggttgagtatctttgtagtaaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 9185048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 5817268 - 5817344
Alignment:
Q  219 tttcttgtaaccc-tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  5817268 tttcttgtaacccctttgtatcactttcatattagtggattggagagctgctctctc-cccagagtaggtcatattgg 5817344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 9189813 - 9189881
Alignment:
Q  20 agggttgagtgt-ctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  9189813 agggttgagtgttctttgtagtaaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 9189881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18413574 - 18413543
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413574 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 18413543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 21639741 - 21639710
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639741 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 21639710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 21645939 - 21645908
Alignment:
Q  387 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645939 acactagactagggctgtttttgttgttgttg 21645908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 21812099 - 21812143
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21812099 gagagtgtttcttaggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 21812143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31155971 - 31155911
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31155971 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31155911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 5674567 - 5674862
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||    
T  5674567 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacca-ttggaaggatctaaag 5674665  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgtt-cttgtgtaagcttgaaagcta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5674666 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaagcttgcaagcta 5674765  T
Q  216 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674766 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 5674862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22709300 - 22709041
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  22709300 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttggatagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaactt 22709205  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22709204 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 22709106  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattg 294  Q
    |||          |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  22709105 ttc----------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattg 22709041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 5757285 - 5757571
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  5757285 agggttgagtgtctttgtatttaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 5757380  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| | |||| |||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  5757381 ccttccgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagagtggaa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtataagcttgcaagctatt- 5757477  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  5757478 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11857154 - 11856979
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||    
T  11857154 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 11857056  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857055 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 11856979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21356318 - 21356040
Alignment:
Q  29 tgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagcttcctctagtg 128  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||| ||  |||||||||| | |||    
T  21356318 tgtctttgtagtgaggatctcttgggttaggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcatca-ttggaagaatcaaaagcttccttttgtg 21356223  T
Q  129 tcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgta 227  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  21356222 tcttttcttt-agggttcattattgagagagtgag-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt-tttcttgta 21356126  T
Q  228 accctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    || ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  21356125 actcttagtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 22010602 - 22010777
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||    
T  22010602 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 22010700  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010701 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 22010777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 14737482 - 14737656
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||    
T  14737482 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 14737579  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14737580 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaa 14737656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28184684 - 28184510
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||  |  | |||||||| |||    
T  28184684 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggcta--gagtgttgtaacctttt 28184587  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184586 gtaacactttc-tcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 28184510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 137 - 312
Target Start/End: Original strand, 28155477 - 28155649
Alignment:
Q  137 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttg 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    ||||||||||| ||||    
T  28155477 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaa--ttcttgtaaccttttg 28155573  T
Q  236 taacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28155574 taacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 28155649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 14742342 - 14742516
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||    
T  14742342 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 14742439  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14742440 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaa 14742516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6438674 - 6438506
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga-aagctattgtttcttgtaaccctttgtaa 238  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  ||  ||||||||| |||||||    
T  6438674 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 6438578  T
Q  239 cactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6438577 cacttc--acatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggacaacaa 6438506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 5572050 - 5572334
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| || |||||| |||  |||||||    
T  5572050 agggttgggtgtctttgtagtggggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacta-ttggaatgatcaaaagctt 5572145  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | |||| |||||||  ||| |||||  || ||| ||||| || ||| | ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| |     
T  5572146 ccttttgtgttttctctt--aggattcat--tgagagtgtgggtgacacaaa-atgcgtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat- 5572239  T
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  5572240 -ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6005592 - 6005422
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaa-gctattgtttcttgtaacccttt-gta 237  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||    
T  6005592 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagcta--gattcttgtaactcttttgta 6005496  T
Q  238 acactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6005495 acacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 6005422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16838923 - 16838749
Alignment:
Q  137 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaa-agctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||  | |||||||||| ||||    
T  16838923 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 16838827  T
Q  235 -gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16838826 tgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaagccacattggctgaactgggtcaacaa 16838749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 33330433 - 33330525
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33330433 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 33330525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 31086426 - 31086566
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  31086426 atgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctc 31086523  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  31086524 tctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaa 31086566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31979802 - 31979517
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  31979802 agggttgagtgtctttgtagtgaggttcttttgggttgagaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 31979707  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | |||| |||||||  ||| |||||  || ||| ||||| || ||| | ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  ||| || |     
T  31979706 ccttttgtgttttctctt--aggattcat--tgagagtgtgggtgacacaaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagttaat- 31979612  T
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||| | |||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||    
T  31979611 -ttcttgtaactcttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11857216 - 11857154
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857216 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 11857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 14737420 - 14737482
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737420 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 14737482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 22010540 - 22010602
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010540 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 22010602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 33335930 - 33336022
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33335930 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattggctgaactgggtcaacaa 33336022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 10077118 - 10077258
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  10077118 atgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagctaat--ttcttgtaacttttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctc 10077215  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  10077216 tctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 14742280 - 14742342
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14742280 gggttaagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcactttgggt 14742342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18233096 - 18232867
Alignment:
Q  62 aaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtg 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||  ||| ||||| |||| ||| |||    
T  18233096 aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttccttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtg 18233001  T
Q  161 gg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggatt 258  Q
    || || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||    
T  18233000 ggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagc--tgatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtgaatt 18232904  T
Q  259 ggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18232903 ggagggttgctctctcccccagattaggtcatattgg 18232867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Original strand, 21801149 - 21801429
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-g 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |    
T  21801149 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaaca-ttggaaggatcaaaaag 21801244  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagcta 215  Q
    |||||| | |||| |||||||  ||||||||| ||| ||| ||||| || ||| | ||||||||||  || | ||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  21801245 cttccttttgtgttttctctt--agggttcat-ttgagagtgtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaagtcttgttcttttgtaagcttataagata 21801340  T
Q  216 ttgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgg 304  Q
     |  |||||||||| |||| |||||||||| | | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21801341 at--ttcttgtaactcttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4630039 - 4629958
Alignment:
Q  232 tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  4630039 tttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaa 4629958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22963798 - 22963704
Alignment:
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  | |||||||||||||||    
T  22963798 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctc-cccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 22963704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 23824595 - 23824689
Alignment:
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  | |||||||||||||||    
T  23824595 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctc-cccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 23824689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 5017303 - 5017370
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5017303 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtaatgag 5017370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 31936865 - 31936798
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31936865 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctattgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 31936798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31936671 - 31936591
Alignment:
Q  233 ttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  31936671 ttgtaacactttcatattagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 28155432 - 28155475
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155432 gagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 28155475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 28184749 - 28184684
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggg---aaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||||    
T  28184749 gggttgagggtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaaaacatagtaatcaccttgggt 28184684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22963989 - 22963922
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  22963989 agggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttggattgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 22963922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 23824404 - 23824471
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  23824404 agggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttggattgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 23824471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 312
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017562
Alignment:
Q  233 ttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccata-ttggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaa 5017562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 6438723 - 6438680
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438723 gagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 6438680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 24435779 - 24435845
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  24435779 agggttgagtgtctttgt-gtgaggttctcttgagttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 24435845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 31086281 - 31086348
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31086281 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttaggtt--gagaaacattgtaaacaccttgggttgtgag 31086348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5343519 - 5343486
Alignment:
Q  279 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5343519 agattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 5343486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12195575 - 12195515
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  12195575 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31180513 - 31180219
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31180513 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 31180414  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgaaagcta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  31180413 cttcctctagtgtcttctcttttatggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttg-tcttgtgtaaagcttgaaggcta 31180315  T
Q  216 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180314 gagtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 31180219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24136146 - 24135853
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||    
T  24136146 caaagggttgagtgtctttgtagaaagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacca-ttggaaggatctaaag 24136048  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24136047 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcacattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctat 24135948  T
Q  217 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24135947 t-tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 24135853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38219692 - 38219403
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||    
T  38219692 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagctt 38219595  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  38219594 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 38219496  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219495 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 38219403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35387956 - 35387667
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| |||| |||    
T  35387956 agggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggttggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaaactt 35387859  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  35387858 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttattcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 35387760  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35387759 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaa 35387667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30631702 - 30631411
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt-gaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30631702 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtggaggagttcattagttggaaggatctaaagctt 30631603  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgaaagctattg 218  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||  |    
T  30631602 cctctagtgacttctc-tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag 30631504  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30631503 tttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaa 30631411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38192369 - 38192178
Alignment:
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  38192369 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 38192271  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192270 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 38192178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15464824 - 15464536
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  15464824 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--catcgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 15464729  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15464728 ccttttgtgtcttctcttttagggttcattattgtgagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt- 15464631  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  15464630 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 36932155 - 36932443
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  36932155 agggttgagtgtctttatagtgatgatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 36932250  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  36932251 cctcttgtgtcttctgttttagggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaagtcttgttcttatgtaaacttgcaagctatt- 36932348  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  36932349 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 9353139 - 9353425
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  9353139 agggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 9353234  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  9353235 ccttttgtgtcttctctttaagg-ttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattagatcttgttcttgtgtaagcttgcaagctttt- 9353331  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  9353332 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14520520 - 14520234
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  14520520 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttggatagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 14520425  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcata-ttgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14520424 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcataattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt- 14520328  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  14520327 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14520234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 1457067 - 1457242
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||    
T  1457067 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 1457165  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1457166 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 1457242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43592459 - 43592284
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||    
T  43592459 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 43592361  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592360 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 43592284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27449994 - 27449819
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||    
T  27449994 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 27449896  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27449895 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaa 27449819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15044865 - 15044691
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||    
T  15044865 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaacctttt 15044768  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044767 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 15044691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27445150 - 27444975
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||    
T  27445150 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 27445052  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27445051 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaa 27444975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43598904 - 43598737
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||    
T  43598904 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 43598806  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgg 304  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598805 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgg 43598737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43604396 - 43604229
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||    
T  43604396 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 43604298  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgg 304  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604297 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgg 43604229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43609888 - 43609721
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||    
T  43609888 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 43609790  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgg 304  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609789 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgg 43609721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 11916779 - 11917065
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  11916779 agggttgagtttctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaactt 11916874  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | |||| |||||||  |||||||||  | |||||||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  11916875 ccttttgtgttttctctt--agggttcatcgtttgagagtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaaactatt- 11916970  T
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  11916971 -ttcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 12083984 - 12084268
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  12083984 agggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttggtaaa--cattttaaacaccttgggtagtgagaa-ttcaccatttggaaggata-aaagctt 12084079  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||| | |||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||| ||   |    
T  12084080 ccttttgtgttttttctt--aggattcatattgtgagagtgggtga-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttttaagtta--at 12084174  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  12084175 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaa 12084268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Original strand, 28807485 - 28807652
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaac 239  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  28807485 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagcta--gattcttgtaaccttttgtaac 28807581  T
Q  240 actttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28807582 acttc--acatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 28807652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10282044 - 10281755
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-g 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |    
T  10282044 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgtgaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaag 10281949  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagcta 215  Q
    ||| || | |||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10281948 ctttcttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagtgtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagcta 10281852  T
Q  216 ttgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  10281851 at--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Original strand, 37556533 - 37556702
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga-aagctattgtttcttgtaaccctttgtaa 238  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  | | ||||||||| |||||||    
T  37556533 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagcta--gatacttgtaaccttttgtaa 37556629  T
Q  239 cactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37556630 cactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 37556702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Original strand, 37561355 - 37561524
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga-aagctattgtttcttgtaaccctttgtaa 238  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  | | ||||||||| |||||||    
T  37561355 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagcta--gatacttgtaaccttttgtaa 37561451  T
Q  239 cactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37561452 cactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 37561524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 17003766 - 17004053
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  17003766 agggttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgggtttggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagct 17003861  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    |||| | |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |  ||   | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| || |     
T  17003862 tccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgagtgaaattaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagttaatt 17003959  T
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||  |||||| |||| | || ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  17003960 ttt--tgtaactcttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2785472 - 2785380
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2785472 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 2785380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 31396981 - 31397073
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31396981 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 31397073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3880476 - 3880321
Alignment:
Q  139 tagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gt 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||| |||| ||    
T  3880476 taggattcatattgtgagagtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaaactaat--ttcttgtaactcttttgt 3880380  T
Q  237 aacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg 295  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  3880379 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattgg 3880321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 33791491 - 33791321
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaa-gctattgtttcttgtaacccttt-gta 237  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||    
T  33791491 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagcta--gattcttgtaactcttttgta 33791395  T
Q  238 acactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33791394 acacattca-catattggattggagagctgctctttcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 33791321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 1457005 - 1457067
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457005 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 1457067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27445212 - 27445150
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445212 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 27445150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27450056 - 27449994
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450056 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 27449994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 33768314 - 33768184
Alignment:
Q  182 tctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaa-gctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcaccc 278  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33768314 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagcta--gattcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctccccccc 33768218  T
Q  279 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33768217 agattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 33768184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 43592521 - 43592459
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592521 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43592459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 43598966 - 43598904
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598966 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43598904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 43604458 - 43604396
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604458 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43604396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 43609950 - 43609888
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609950 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43609888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 31401838 - 31401930
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31401838 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 31401930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15044928 - 15044865
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044928 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 15044865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 42127364 - 42127503
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctct 271  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||| | ||||||||    
T  42127364 atgggtagaaagtaggacttgttcttttgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctct 42127461  T
Q  272 ctcacccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaa 312  Q
    ||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||    
T  42127462 ctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 42127503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 31300549 - 31300689
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctct 271  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| | || ||||||||||| | || |||||||||||| | ||||    
T  31300549 atgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaaactatt-tttcttgcaactcattataacactttcatcttagtggattggagagtttctct 31300647  T
Q  272 ctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||| | |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  31300648 ctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28832357 - 28832263
Alignment:
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||    
T  28832357 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19588888 - 19588750
Alignment:
Q  174 gggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaac-cctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctc 272  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||| ||   ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  19588888 gggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataaggta--atttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctc 19588791  T
Q  273 tcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    || |  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  19588790 tccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaa 19588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 24553333 - 24553401
Alignment:
Q  19 aagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24553333 aagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 24553401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Original strand, 11181641 - 11181705
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtga 88  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11181641 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtga 11181705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 28832544 - 28832480
Alignment:
Q  23 gttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28832544 gttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 28832480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Original strand, 31300404 - 31300469
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31300404 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggtt--gagaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 31300469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 28807436 - 28807479
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807436 gagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 28807479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 7160711 - 7160770
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 81  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7160711 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttggattggg--aaacattgtaatcaccttgg 7160770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19589035 - 19588968
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  19589035 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacatcttgggcagtgag 19588968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Original strand, 4410241 - 4410301
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4410241 tggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 4410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 24553506 - 24553599
Alignment:
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||| | ||||||| |||||||    
T  24553506 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggagtggag-gctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 24553599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Original strand, 15552464 - 15552524
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15552464 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15552524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31179431 - 31179371
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31179431 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31179371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Original strand, 31542953 - 31543013
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31542953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31543013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Original strand, 31545299 - 31545359
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31545299 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31545359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Original strand, 42127179 - 42127244
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||  || ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  42127179 ggttgagtatctttgtagtgaggttctcttgggtt--gagaaacattgtatacaccttgggtagtgag 42127244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 45)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 24202572 - 24202861
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  | |||||||||| ||||||||    
T  24202572 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atctcacca-ttggaaggatctaaagctt 24202669  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24202670 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 24202768  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202769 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 24202861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 24787161 - 24787456
Alignment:
Q  17 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24787161 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattataatcaccttgggcagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 24787260  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagcta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24787261 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagttgggaaacaccaaagggtagaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaaggcta 24787360  T
Q  216 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787361 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 24787456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 19358647 - 19358935
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||    
T  19358647 agggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaaa-cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagctt 19358743  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19358744 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 19358842  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19358843 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaa 19358935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 19361236 - 19361524
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||    
T  19361236 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaa-cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagctt 19361332  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  19361333 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaaactatt-t 19361431  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19361432 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaa 19361524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 61 - 312
Target Start/End: Original strand, 19379916 - 19380164
Alignment:
Q  61 aaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtg 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19379916 aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtg 19380013  T
Q  161 gggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattgg 260  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19380014 gggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaaactatt-tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattgg 19380112  T
Q  261 agagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19380113 agagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaa 19380164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3281995 - 3281715
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagcttcc 121  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  3281995 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttcc 3281900  T
Q  122 tctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtt 220  Q
    | | ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  3281899 ttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt--t 3281805  T
Q  221 tcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaa 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  3281804 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 19366111 - 19366297
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||    
T  19366111 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaatattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagctt 19366208  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttg 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19366209 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttg 19366297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 26644705 - 26644990
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  26644705 agggttgagtgtctttgtagtgaagatcttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgagtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 26644800  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26644801 ccttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgag-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt- 26644896  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  26644897 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Original strand, 13604429 - 13604697
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  13604429 agggttgagtatctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 13604524  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  13604525 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagtttgcaagctatt- 13604621  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattg 294  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  13604622 tttcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 13604697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 286
Target Start/End: Original strand, 21536377 - 21536635
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  21536377 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttaggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtaag-atttcacca-ttggaaggatcgaaagctt 21536472  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||| | ||||||||  || |  ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21536473 ccttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgggtaa-cacaaacgggtagaaattaagtattgttcttgtgtaagcttgcaagctatt- 21536568  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattagg 286  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21536569 -ttcttgtaactctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 21536635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41390760 - 41390586
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||    
T  41390760 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 41390663  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41390662 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaa 41390586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41398415 - 41398241
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||    
T  41398415 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 41398318  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41398317 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaa 41398241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37070055 - 37069774
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagcttcc 121  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||| | ||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  37070055 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttggataatgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttcc 37069960  T
Q  122 tctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtt 220  Q
    | | ||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| || |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||       
T  37069959 ttttgtgtcttctcttt-atggttcattattgagtgagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaaactatt--- 37069865  T
Q  221 tcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
      ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  37069864 --ttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 47703740 - 47704029
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaag- 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||| |||  |||      
T  47703740 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaatgataaaaaaa 47703835  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagcta 215  Q
    |||||| | |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  47703836 cttccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagcta 47703932  T
Q  216 ttgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |  |||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  47703933 at--ttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 312
Target Start/End: Original strand, 25444996 - 25445169
Alignment:
Q  137 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga-aagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  ||  ||||||||| |||    
T  25444996 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagc-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaacctttt 25445092  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445093 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 25445169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 39445673 - 39445505
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga-aagctattgtttcttgtaaccctttgtaa 238  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  ||  ||||||||| |||||||    
T  39445673 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 39445577  T
Q  239 cactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445576 cacttc--acatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 39445505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Original strand, 44023785 - 44023953
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga-aagctattgtttcttgtaaccctttgtaa 238  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  ||  ||||||||| |||||||    
T  44023785 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 44023881  T
Q  239 cactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023882 cacttc--acatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 44023953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Original strand, 1054923 - 1055091
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga-aagctattgtttcttgtaaccctttgtaa 238  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  ||  ||||||||| |||||||    
T  1054923 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 1055019  T
Q  239 cactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055020 cacttc--acatattggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 1055091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32889583 - 32889461
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctct 271  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  32889583 atgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctct 32889485  T
Q  272 ctcacccagattaggccatattgg 295  Q
     || |||||| |||| ||||||||    
T  32889484 atcccccagactaggtcatattgg 32889461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29652103 - 29651818
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| | |    
T  29652103 agggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagtt 29652008  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||| | |||| |||||||  ||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||| ||     
T  29652007 tccttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaa-atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagtta- 29651912  T
Q  217 tgtttcttgtaa-ccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaa 309  Q
      ||||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  29651911 -atttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9476551 - 9476265
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gctt 119  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| | ||||  | ||| ||||||  ||| ||||    
T  9476551 gggttgaatgtctttgtagtgaggttctctttggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtgag-atttcaccatttg-aaggatcaaaaagctt 9476456  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | |||| |||||||  | | |||| |||||||||||| | || ||| | |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |     
T  9476455 ccttttgtgttttctctt--aagattcacattgtgagagtgagtgacacaaa-atggatagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaat- 9476360  T
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     ||||| |||| |||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  9476359 -ttcttataactcttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13598688 - 13598402
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gcttc 120  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||||    
T  13598688 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggcaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagcttc 13598593  T
Q  121 ctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    || | |||| |||||||  ||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| | ||| ||||||  || | |||||||||||||||||||  |||||| |     
T  13598592 cttttgtgttttctctt--aggattcatcattgagagtgtgggtgacacaaa-atgagtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat- 13598497  T
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  13598496 -ttcttgtatctcttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19073220 - 19072932
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-g 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |    
T  19073220 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttggatagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaag 19073125  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagcta 215  Q
    |||||| | |||| |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| | || ||| | ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||  ||||||    
T  19073124 cttccttttgtgttttctctt--agggttcat-ttgagagtgtgagtgacacaaa-atgggtagaaattaggtattgttcttttgtaagcttataagcta 19073029  T
Q  216 ttgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |  |||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  19073028 at--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19121110 - 19120822
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-g 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |    
T  19121110 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttggatagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaag 19121015  T
Q  117 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagcta 215  Q
    |||||| | |||| |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| | || ||| | ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||  ||||||    
T  19121014 cttccttttgtgttttctctt--agggttcat-ttgagagtgtgagtgacacaaa-atgggtagaaattaggtattgttcttttgtaagcttataagcta 19120919  T
Q  216 ttgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |  |||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  19120918 at--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 41398477 - 41398415
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398477 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 41398415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 43988452 - 43988544
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43988452 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtaaacaa 43988544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 16124469 - 16124609
Alignment:
Q  172 atgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctc 270  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  16124469 atgggtagaaattaggtcttgttcttatgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctc 16124566  T
Q  271 tctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  16124567 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 41390819 - 41390760
Alignment:
Q  24 ttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390819 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 41390760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 47098632 - 47098917
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  47098632 agggttgagtgtctttgtagcgaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagct 47098727  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctatt 217  Q
    |||| | |||| || ||||  ||| |||||  || ||| ||||| ||     | ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  47098728 tccttttgtgttttttctt--aggtttcat--tgagagtgtgggtgatgtgaaaatgggtagaaattaggacttgttcttttgtaagcttataagctaat 47098823  T
Q  218 gtttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
      |||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||    
T  47098824 --ttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 27104370 - 27104465
Alignment:
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||    
T  27104370 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaa 27104465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 47102646 - 47102713
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47102646 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 47102713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 775757 - 775676
Alignment:
Q  232 tttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  775757 tttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 775676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 47102840 - 47102934
Alignment:
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| | || |||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  47102840 tttcttgtaactcattgtaacattttcatcttagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Original strand, 27104211 - 27104275
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  27104211 ggttgagtgtctttgtagtgag-gtctcttgggttgggaaa--cattataagcaccttgggtagtgag 27104275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 32889728 - 32889661
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  32889728 agggttgagtgtctttgtagtgaggtttttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 32889661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 40816621 - 40816690
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  40816621 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 40816690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22819714 - 22819657
Alignment:
Q  27 agtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 86  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  22819714 agtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagt 22819657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 1054874 - 1054917
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1054874 gagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 1054917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 25439758 - 25439801
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25439758 gagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 25439801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 25444951 - 25444994
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25444951 gagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 25444994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 39445722 - 39445679
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445722 gagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 39445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 44023736 - 44023779
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023736 gagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 44023779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9459479 - 9459419
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9459479 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9459419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9463306 - 9463246
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9463306 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9463246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Original strand, 16226386 - 16226446
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16226386 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16226446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 17755 - 18044
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||    
T  17755 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagctt 17852  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17853 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 17951  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17952 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 23848 - 24137
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||    
T  23848 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagctt 23945  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23946 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt-t 24044  T
Q  220 ttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24045 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 24137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 8224 - 8512
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||| |||||||    
T  8224 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggattaaaagctt 8319  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8320 ccttttgtgtcttctcttttagggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatacgtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt- 8417  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  8418 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Original strand, 133086 - 133354
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  133086 agggttgagtttctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 133181  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  133182 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagtttgcaagctatt- 133278  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattg 294  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  133279 tttcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 133354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5973 - 5687
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gcttc 120  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||||    
T  5973 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggcaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagcttc 5878  T
Q  121 ctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    || | |||| |||||||  ||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| | ||| ||||||  || | |||||||||||||||||||  |||||| |     
T  5877 cttttgtgttttctctt--aggattcatcattgagagtgtgggtgacacaaa-atgagtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat- 5782  T
Q  219 tttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  5781 -ttcttgtatctcttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2496
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaa-gct 118  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  2784 agggttaagtttctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgcgtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaagct 2689  T
Q  119 tcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggg-gaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctat 216  Q
    |||| | |||| || ||||  ||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| | ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||  ||||||     
T  2688 tccttttgtgttttatctt--aggattcatcattgagagtgtgggtgacacaaa-atgggtagaaattagttcttgttcttgtgtaagcttataagcta- 2593  T
Q  217 tgtttcttgtaa-ccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
      |||||| |||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  2592 -atttcttataattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 36639 - 36925
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  36639 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 36734  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||   | | |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  36735 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaatcatgtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt- 36831  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||  || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  36832 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 43768 - 44054
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||    
T  43768 agggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctt 43863  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| | |||| |||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  43864 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagagtggaa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtataagcttgcaagctatt- 43960  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  43961 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 34967 - 35142
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||| ||||| |||    
T  34967 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttctaacctttt 35065  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35066 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaa 35142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 34905 - 34967
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34905 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaacattgtaatcaccttgggt 34967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 85973 - 85687
Alignment:
Q  20 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatttaaagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| | ||||  | ||||||||||  ||| |||    
T  85973 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacactttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaactt 85878  T
Q  120 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacata-tgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattg 218  Q
    ||| | |||| || ||| ||||  ||||||||||| ||||||| | ||||| | |||||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||| |     
T  85877 ccttttgtgtttt-tctcttagaattcatattgtgggagtggg-agacacaaaatgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagcttttaagctaat- 85781  T
Q  219 tttcttgtaaccctttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  85780 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 85687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9722
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||    
T  9549 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 9645  T
Q  235 gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9646 gtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 9722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 3692 - 3754
Alignment:
Q  21 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3692 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttaggttaggaaaaacattgtaatcaccttgggt 3754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 83
Target Start/End: Original strand, 9514 - 9549
Alignment:
Q  48 tcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9514 tcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 9549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Original strand, 3754 - 3833
Alignment:
Q  136 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgaaagcta 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  3754 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggcta 3833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 536 - 368
Alignment:
Q  141 gggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga-aagctattgtttcttgtaaccctttgtaa 238  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  ||  ||||||||| |||||||    
T  536 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 440  T
Q  239 cactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  439 cacttc--acatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 585 - 542
Alignment:
Q  39 gagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 82  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  585 gagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 14297 - 14389
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14297 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 14389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 312
Target Start/End: Original strand, 19180 - 19245
Alignment:
Q  247 acatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19180 acatattgtattggagagctgctctctcccccagattaggccacaatggctgaactgggtcaacaa 19245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 2239 - 2331
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2239 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 2331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 148944 - 149036
Alignment:
Q  220 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  148944 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 149036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 312
Target Start/End: Original strand, 181979 - 182044
Alignment:
Q  247 acatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  181979 acatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 182044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10861 - 10736
Alignment:
Q  184 tagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagat 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10861 taggtcttgttcttgtgtaagcttgtaaactaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaat 10764  T
Q  283 taggccatattgg-ctgaactgggtcaa 309  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||    
T  10763 taggtcatattggaccgaactgggtcaa 10736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 11021 - 10954
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  11021 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 10954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17404 - 17267
Alignment:
Q  175 ggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaagctattgtttcttgtaacccttt-gtaacactttcaacatattggattggagagctgctctct 273  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||    
T  17404 ggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat--ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctct 17307  T
Q  274 cacccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaa 312  Q
      |||| |||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  17306 ttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 17267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 17539 - 17474
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    |||||||||||||||||| |    |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  17539 ggttgagtgtctttgtagtggagatctcttggattgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 17474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45276
Alignment:
Q  233 ttgtaacactttcaacatattggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattg 294  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattg 45276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Original strand, 269 - 329
Alignment:
Q  253 tggattggagagctgctctctcacccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  269 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 23820 - 23755
Alignment:
Q  22 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 89  Q
    ||||||| |||||| ||| |||  ||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23820 ggttgagcgtctttatagtgaggttctattgggttggaaaaaa--ttgtaatcaccttgggtagtgag 23755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University