View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1829_low_3 (Length: 362)

Name: NF1829_low_3
Description: NF1829
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1829_low_3
NF1829_low_3
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (1-336)||(3813929-3814266)
chr4 (1-354)||(9224231-9224586)
chr4 (1-354)||(9229018-9229373)
chr4 (1-351)||(51520362-51520715)
chr4 (1-336)||(45357138-45357476)
chr4 (1-336)||(45347658-45347997)
chr4 (5-323)||(18855635-18855956)
chr4 (1-336)||(5732567-5732907)
chr4 (4-272)||(24741850-24742121)
chr4 (1-225)||(56146664-56146891)
chr4 (1-270)||(29760548-29760821)
chr4 (60-177)||(28468542-28468660)
chr4 (266-354)||(18712590-18712677)
chr4 (61-190)||(31985634-31985764)
chr4 (272-352)||(24742174-24742253)
chr4 (272-352)||(29760874-29760954)
chr4 (95-219)||(10047379-10047505)
chr4 (95-219)||(5396643-5396768)
chr4 (95-190)||(39245994-39246092)
chr4 (95-190)||(36315229-36315326)
chr4 (95-190)||(36329438-36329535)
chr4 (95-206)||(3796502-3796616)
chr4 (95-190)||(16623292-16623390)
chr4 (95-180)||(38152449-38152536)
chr4 (96-219)||(5147678-5147803)
chr4 (96-179)||(5143260-5143345)
chr4 (95-177)||(5269204-5269288)
chr4 (95-180)||(24333809-24333896)
chr4 (127-219)||(16630651-16630744)
chr4 (96-219)||(3777550-3777674)
chr4 (100-180)||(6743425-6743507)
chr4 (272-334)||(28468342-28468404)
chr4 (272-331)||(5112466-5112523)
chr4 (99-158)||(16931789-16931849)
chr4 (99-158)||(16934143-16934203)
chr4 (99-158)||(22780373-22780433)
chr4 (116-190)||(39774304-39774380)
chr4 (99-158)||(44599838-44599898)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (1-354)||(1456986-1457341)
chr5 (1-354)||(15044592-15044947)
chr5 (1-354)||(43592184-43592540)
chr5 (12-354)||(27449730-27450075)
chr5 (1-354)||(43598629-43598985)
chr5 (1-354)||(43604121-43604477)
chr5 (1-354)||(43609613-43609969)
chr5 (12-354)||(27444886-27445231)
chr5 (5-323)||(28807429-28807751)
chr5 (16-323)||(37556478-37556788)
chr5 (16-323)||(37561300-37561610)
chr5 (1-271)||(30631312-30631586)
chr5 (1-323)||(2785281-2785608)
chr5 (1-323)||(33791222-33791549)
chr5 (19-272)||(31180138-31180394)
chr5 (22-323)||(31396843-31397151)
chr5 (1-323)||(31401700-31402029)
chr5 (1-323)||(33768085-33768417)
chr5 (57-272)||(38192135-38192353)
chr5 (57-272)||(38219360-38219578)
chr5 (57-272)||(24135809-24136028)
chr5 (57-272)||(35387624-35387842)
chr5 (272-352)||(30631640-30631719)
chr5 (272-352)||(31180447-31180526)
chr5 (272-352)||(24136080-24136159)
chr5 (95-219)||(10281751-10281877)
chr5 (95-219)||(9353304-9353429)
chr5 (95-190)||(36932350-36932447)
chr5 (95-190)||(15464532-15464629)
chr5 (96-219)||(11916943-11917068)
chr5 (95-219)||(14520230-14520355)
chr5 (272-334)||(35387893-35387955)
chr5 (116-219)||(3880321-3880425)
chr5 (95-180)||(17003970-17004057)
chr5 (125-190)||(12084175-12084241)
chr5 (95-190)||(19588746-19588844)
chr5 (272-334)||(38219629-38219691)
chr5 (95-190)||(28832259-28832356)
chr5 (95-190)||(42127410-42127507)
chr5 (99-158)||(4410241-4410301)
chr5 (99-158)||(15552464-15552524)
chr5 (99-158)||(31179371-31179431)
chr5 (99-158)||(31542953-31543013)
chr5 (99-158)||(31545299-31545359)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (1-307)||(9514-9819)
scaffold0355 (181-354)||(3672-3845)
scaffold0355 (1-69)||(1-66)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (1-354)||(41398146-41398497)
chr1 (1-354)||(41390491-41390842)
chr1 (5-336)||(25444931-25445266)
chr1 (5-336)||(44023716-44024049)
chr1 (5-336)||(39445408-39445742)
chr1 (5-336)||(1054854-1055188)
chr1 (1-323)||(43988314-43988645)
chr1 (4-272)||(24787280-24787551)
chr1 (57-272)||(24202686-24202904)
chr1 (199-336)||(25439738-25439875)
chr1 (60-272)||(19358760-19358975)
chr1 (60-272)||(19361349-19361564)
chr1 (60-272)||(19379989-19380204)
chr1 (273-352)||(24787148-24787226)
chr1 (95-219)||(26644869-26644994)
chr1 (95-219)||(47703907-47704033)
chr1 (272-334)||(24202573-24202635)
chr1 (95-219)||(3281708-3281833)
chr1 (95-190)||(19072928-19073026)
chr1 (95-190)||(19120818-19120916)
chr1 (95-219)||(9476261-9476387)
chr1 (125-219)||(21536541-21536635)
chr1 (125-190)||(27104371-27104438)
chr1 (95-190)||(16124515-16124613)
chr1 (95-180)||(13598398-13598485)
chr1 (95-180)||(29651811-29651898)
chr1 (95-187)||(37069770-37069864)
chr1 (95-180)||(775672-775759)
chr1 (125-190)||(13604623-13604689)
chr1 (95-190)||(47098824-47098921)
chr1 (272-334)||(19366112-19366174)
chr1 (272-334)||(21536378-21536438)
chr1 (116-190)||(32889461-32889536)
chr1 (272-334)||(19361237-19361298)
chr1 (99-158)||(9459419-9459479)
chr1 (99-158)||(9463246-9463306)
chr1 (99-158)||(16226386-16226446)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (16-354)||(24024151-24024492)
chr7 (1-354)||(31109407-31109762)
chr7 (1-354)||(12396817-12397172)
chr7 (1-337)||(12406237-12406576)
chr7 (5-323)||(19992221-19992544)
chr7 (5-323)||(21812092-21812415)
chr7 (35-323)||(24266054-24266348)
chr7 (35-323)||(24261175-24261469)
chr7 (4-272)||(20357463-20357734)
chr7 (35-323)||(16884868-16885162)
chr7 (1-184)||(4866635-4866820)
chr7 (35-323)||(16880012-16880306)
chr7 (57-272)||(2057927-2058147)
chr7 (57-272)||(1533359-1533579)
chr7 (57-272)||(21639770-21639988)
chr7 (57-272)||(21645968-21646186)
chr7 (57-272)||(18408726-18408943)
chr7 (60-272)||(18413606-18413819)
chr7 (272-352)||(20357331-20357410)
chr7 (274-352)||(4873310-4873387)
chr7 (272-352)||(1533228-1533307)
chr7 (272-352)||(2058202-2058281)
chr7 (95-219)||(29159803-29159929)
chr7 (96-219)||(21983285-21983411)
chr7 (95-219)||(46516281-46516407)
chr7 (95-190)||(49091661-49091759)
chr7 (95-190)||(44848684-44848781)
chr7 (95-219)||(2647667-2647793)
chr7 (95-219)||(2580390-2580515)
chr7 (272-334)||(21640039-21640101)
chr7 (272-334)||(21646237-21646299)
chr7 (95-190)||(33332449-33332547)
chr7 (95-190)||(9190008-9190105)
chr7 (95-190)||(20284089-20284186)
chr7 (95-219)||(55948-56073)
chr7 (272-334)||(18408993-18409055)
chr7 (61-158)||(28617258-28617356)
chr7 (95-219)||(4796638-4796764)
chr7 (95-219)||(2479337-2479461)
chr7 (272-334)||(18413869-18413931)
chr7 (125-178)||(35960847-35960901)
chr7 (95-177)||(9185178-9185262)
chr7 (95-174)||(47263678-47263757)
chr7 (99-158)||(31155911-31155971)
[»] chr8 (47 HSPs)
chr8 (1-354)||(7289750-7290106)
chr8 (17-336)||(25328120-25328442)
chr8 (1-336)||(39784665-39785003)
chr8 (1-272)||(6311203-6311477)
chr8 (1-323)||(35745297-35745624)
chr8 (4-272)||(36979287-36979558)
chr8 (4-272)||(30655551-30655827)
chr8 (35-323)||(10684116-10684410)
chr8 (5-271)||(33037724-33037992)
chr8 (4-272)||(4759991-4760263)
chr8 (12-272)||(18853083-18853347)
chr8 (12-272)||(18870477-18870741)
chr8 (19-272)||(10689058-10689315)
chr8 (57-272)||(1261871-1262089)
chr8 (60-177)||(26287866-26287985)
chr8 (60-177)||(26301123-26301242)
chr8 (60-177)||(26313117-26313236)
chr8 (60-272)||(31071146-31071362)
chr8 (272-354)||(6311532-6311613)
chr8 (272-352)||(18870345-18870424)
chr8 (260-336)||(25327994-25328070)
chr8 (272-352)||(30655880-30655959)
chr8 (272-352)||(10688924-10689003)
chr8 (272-352)||(18852951-18853030)
chr8 (272-352)||(33037592-33037671)
chr8 (116-219)||(4456050-4456153)
chr8 (272-352)||(36979611-36979689)
chr8 (95-180)||(26403240-26403327)
chr8 (272-334)||(1261758-1261820)
chr8 (61-219)||(7412305-7412466)
chr8 (95-219)||(23799548-23799674)
chr8 (272-353)||(4759857-4759938)
chr8 (95-190)||(19175754-19175851)
chr8 (95-177)||(4696609-4696693)
chr8 (116-190)||(6127243-6127319)
chr8 (95-190)||(5702482-5702580)
chr8 (97-158)||(9765852-9765914)
chr8 (272-332)||(31071035-31071095)
chr8 (272-334)||(26288121-26288183)
chr8 (272-334)||(26301378-26301440)
chr8 (272-334)||(26313372-26313434)
chr8 (95-190)||(19752394-19752491)
chr8 (272-334)||(7412569-7412629)
chr8 (134-205)||(6813723-6813796)
chr8 (125-158)||(18810982-18811015)
chr8 (99-158)||(43079877-43079937)
chr8 (99-158)||(43082248-43082308)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-354)||(39811812-39812167)
chr2 (1-336)||(32246690-32247031)
chr2 (1-323)||(19344326-19344655)
chr2 (1-323)||(19349184-19349513)
chr2 (4-272)||(11098843-11099114)
chr2 (12-238)||(44312563-44312792)
chr2 (4-272)||(14291398-14291669)
chr2 (4-272)||(9296317-9296588)
chr2 (60-272)||(3491716-3491930)
chr2 (57-272)||(25398457-25398675)
chr2 (57-272)||(25403595-25403813)
chr2 (61-177)||(40738810-40738926)
chr2 (272-352)||(11098711-11098790)
chr2 (95-219)||(8040060-8040188)
chr2 (125-272)||(25407653-25407802)
chr2 (95-219)||(28259149-28259274)
chr2 (272-352)||(9296186-9296265)
chr2 (98-219)||(13569331-13569454)
chr2 (272-352)||(14291722-14291801)
chr2 (95-190)||(21629944-21630041)
chr2 (95-219)||(10445415-10445541)
chr2 (95-219)||(17865203-17865329)
chr2 (95-219)||(34682305-34682431)
chr2 (96-219)||(10707223-10707348)
chr2 (95-190)||(20522220-20522318)
chr2 (96-190)||(34388859-34388956)
chr2 (125-206)||(8390133-8390216)
chr2 (95-219)||(14698979-14699104)
chr2 (272-334)||(25409860-25409922)
chr2 (95-219)||(23078442-23078567)
chr2 (125-180)||(31056075-31056131)
chr2 (95-225)||(36757728-36757859)
chr2 (95-219)||(39482931-39483057)
chr2 (116-190)||(42039669-42039744)
chr2 (272-334)||(3491981-3492043)
chr2 (95-190)||(33528620-33528718)
chr2 (116-219)||(33118158-33118262)
chr2 (95-180)||(16940219-16940306)
chr2 (95-180)||(17010884-17010971)
chr2 (99-158)||(35215586-35215646)
chr2 (99-158)||(35217963-35218023)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (1-352)||(14737403-14737756)
chr6 (12-354)||(22010521-22010865)
chr6 (1-352)||(14742263-14742615)
chr6 (16-336)||(28155412-28155735)
chr6 (1-354)||(11856877-11857235)
chr6 (1-339)||(28184410-28184754)
chr6 (5-336)||(6438409-6438743)
chr6 (1-323)||(16838650-16838977)
chr6 (1-323)||(6005323-6005650)
chr6 (1-323)||(33330297-33330626)
chr6 (1-323)||(33335794-33336123)
chr6 (57-272)||(5674685-5674905)
chr6 (272-352)||(5674554-5674633)
chr6 (95-206)||(5757462-5757575)
chr6 (23-140)||(5343408-5343527)
chr6 (61-177)||(22708984-22709102)
chr6 (95-190)||(21356036-21356133)
chr6 (95-219)||(5572212-5572338)
chr6 (95-179)||(10077176-10077262)
chr6 (95-190)||(31086472-31086570)
chr6 (95-179)||(4629954-4630040)
chr6 (252-323)||(5343637-5343710)
chr6 (107-190)||(21801343-21801429)
chr6 (95-190)||(31979513-31979611)
chr6 (116-190)||(18232867-18232943)
chr6 (134-190)||(22963739-22963797)
chr6 (134-190)||(23824596-23824654)
chr6 (4-45)||(30125940-30125981)
chr6 (95-177)||(5017482-5017566)
chr6 (99-158)||(12195515-12195575)
chr6 (271-334)||(31086282-31086343)
chr6 (95-158)||(31936587-31936651)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-354)||(34886-35241)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (1-354)||(22173019-22173374)
chr3 (1-336)||(18656337-18656677)
chr3 (1-272)||(7167150-7167425)
chr3 (1-323)||(2676939-2677267)
chr3 (1-323)||(2672783-2673111)
chr3 (1-272)||(28503780-28504046)
chr3 (1-323)||(24968013-24968340)
chr3 (80-323)||(8512202-8512450)
chr3 (80-323)||(8517082-8517330)
chr3 (4-272)||(2671502-2671773)
chr3 (57-269)||(8738982-8739197)
chr3 (57-269)||(9091220-9091435)
chr3 (35-323)||(32475424-32475717)
chr3 (35-323)||(32480282-32480575)
chr3 (57-272)||(40372712-40372929)
chr3 (57-272)||(8477324-8477545)
chr3 (138-272)||(28501613-28501750)
chr3 (61-272)||(26928507-26928721)
chr3 (60-190)||(1305914-1306045)
chr3 (61-272)||(32143287-32143501)
chr3 (272-352)||(28501480-28501560)
chr3 (272-352)||(28503647-28503727)
chr3 (272-352)||(2671370-2671449)
chr3 (272-352)||(40372580-40372659)
chr3 (272-352)||(7167478-7167558)
chr3 (272-349)||(8477598-8477674)
chr3 (272-353)||(8738846-8738926)
chr3 (272-352)||(9091085-9091164)
chr3 (61-190)||(27452924-27453055)
chr3 (1-143)||(10207839-10207983)
chr3 (61-177)||(27986449-27986567)
chr3 (95-219)||(8370448-8370573)
chr3 (95-206)||(16264350-16264463)
chr3 (95-190)||(27974942-27975039)
chr3 (95-219)||(18552844-18552970)
chr3 (96-219)||(36029094-36029219)
chr3 (95-190)||(21711223-21711320)
chr3 (95-220)||(40592742-40592869)
chr3 (98-190)||(1736294-1736389)
chr3 (95-190)||(30709779-30709877)
chr3 (95-177)||(33386669-33386753)
chr3 (116-190)||(48438236-48438312)
chr3 (95-219)||(3715963-3716089)
chr3 (116-190)||(6794703-6794778)
chr3 (95-190)||(25795781-25795879)
chr3 (95-190)||(26298988-26299086)
chr3 (272-332)||(1306179-1306239)
chr3 (60-119)||(1309819-1309878)
chr3 (95-177)||(1417493-1417577)
chr3 (95-190)||(47923895-47923993)
chr3 (95-190)||(37466291-37466388)
chr3 (116-219)||(40844674-40844777)
chr3 (125-161)||(4386947-4386983)
chr3 (95-177)||(39039995-39040079)
chr3 (95-190)||(3328346-3328443)
chr3 (125-162)||(53894082-53894119)
chr3 (275-334)||(4386774-4386831)
chr3 (99-158)||(38210569-38210629)
chr3 (99-158)||(50494198-50494258)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (5-336)||(271-605)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-323)||(2103-2430)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-323)||(148808-149135)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (35-323)||(14161-14455)
scaffold0197 (1-323)||(19017-19344)
[»] scaffold0188 (4 HSPs)
scaffold0188 (57-272)||(17869-18087)
scaffold0188 (57-272)||(23962-24180)
scaffold0188 (272-334)||(17756-17818)
scaffold0188 (272-334)||(23849-23911)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (35-163)||(181980-182110)
scaffold0009 (218-323)||(176829-176936)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (95-190)||(8419-8516)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (4-127)||(300-423)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (95-206)||(43945-44058)
scaffold0087 (95-219)||(36804-36929)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (96-190)||(85684-85780)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (95-219)||(10729-10855)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (95-180)||(5683-5770)
scaffold0006 (95-180)||(2492-2579)
scaffold0006 (125-190)||(133280-133346)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (125-177)||(45284-45337)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (125-158)||(11500-11533)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (99-158)||(269-329)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (125-219)||(17294-17389)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 3813929 - 3814266
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaac-acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  3813929 aacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccatgcaaga 3814028  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt 198  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3814029 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt 3814128  T
Q  199 tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814129 tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc 3814228  T
Q  299 aacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||    
T  3814229 aacctaagaaacactctcatcaaagacacacaccccat 3814266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9224586 - 9224231
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9224586 aacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 9224488  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  9224487 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagcc 9224388  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9224387 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttcc 9224288  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9224287 caaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 9224231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9229373 - 9229018
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9229373 aacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 9229275  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  9229274 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagcc 9229175  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9229174 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttcc 9229075  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9229074 caaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 9229018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 51520362 - 51520715
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  51520362 aacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 51520461  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  51520462 ttgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcc 51520561  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520562 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 51520661  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctccttt 351  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  51520662 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctccttt 51520715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 45357476 - 45357138
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgagaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  45357476 aacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaag 45357378  T
Q  98 attgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagct 197  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45357377 attgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagct 45357278  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45357277 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaccccaaggtgattacaatgtttttc 45357178  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  45357177 ccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 45357138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 45347997 - 45347658
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgagaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  45347997 aacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaag 45347899  T
Q  98 attgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga-atctagc 196  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  45347898 attgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagacctctagc 45347799  T
Q  197 tttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttt 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45347798 cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaccccaaggtgattacaatgttttt 45347699  T
Q  296 cccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  45347698 cccaacctaagagacactctcatcaaaggcacacaccccat 45347658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Original strand, 18855635 - 18855956
Alignment:
Q  5 aaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattg 101  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  18855635 aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattg 18855734  T
Q  102 ttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tc 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18855735 ttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagactctagcttatc 18855833  T
Q  201 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855834 aagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccacaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 18855933  T
Q  301 cctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||| || |||||| |||||    
T  18855934 cctaagaaactctctcatcaaag 18855956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 5732567 - 5732907
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaa----caccgag 94  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |   ||||||| ||||||||    ||| ||     
T  5732567 aacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaa 5732664  T
Q  95 -aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatct 193  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5732665 caagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactct 5732764  T
Q  194 agctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5732765 agctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactataaacccttaatcccaaggtgattacaatgttt 5732864  T
Q  294 ttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  5732865 ttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 5732907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Original strand, 24741850 - 24742121
Alignment:
Q  4 aaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgt 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24741850 aaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgt 24741948  T
Q  103 tcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagcttt 199  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||    
T  24741949 tgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctt 24742048  T
Q  200 caagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24742049 caagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 24742121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 56146891 - 56146664
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  56146891 aacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 56146792  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  56146791 ttgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcc 56146692  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaacccta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146691 ttcaagctttacacatgaacaaacccta 56146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 29760548 - 29760821
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagat 99  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29760548 aacaaaacaaccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagat 29760646  T
Q  100 tgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagc 196  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  29760647 tgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagc 29760746  T
Q  197 tttcaagctttacacatg-aacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaa 270  Q
     | ||||| ||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  29760747 ctgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaa 29760821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28468660 - 28468542
Alignment:
Q  60 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28468660 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatcca 28468562  T
Q  159 atatga-gaaagtgttacaa 177  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  28468561 ctatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18712677 - 18712590
Alignment:
Q  266 cctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18712677 cctaaaacccaaggtgataacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 18712590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31985764 - 31985634
Alignment:
Q  61 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31985764 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatcca 31985667  T
Q  159 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31985666 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 31985634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Original strand, 24742174 - 24742253
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24742174 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 24742253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Original strand, 29760874 - 29760954
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttt-tcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29760874 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 29760954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 10047379 - 10047505
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  10047379 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 10047478  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  10047479 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 10047505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396643
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||      
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaagaaaa 5396669  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  5396668 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 5396643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 39245994 - 39246092
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39245994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 39246092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36315326 - 36315229
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  36315326 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 36315229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36329535 - 36329438
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  36329535 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 36329438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796502
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 3796517  T
Q  192 ctagctttcaagctt 206  Q
     |||||| |||||||    
T  3796516 ttagcttacaagctt 3796502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16623390 - 16623292
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16623390 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16623292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38152536 - 38152449
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gagaaagtgttacaaaag 180  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  38152536 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 219
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147803
Alignment:
Q  96 agattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaagaatc 192  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||      
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaaa 5147777  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  5147778 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 5147803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143345
Alignment:
Q  96 agattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 179  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5269288 - 5269204
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 177  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5269288 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Original strand, 24333809 - 24333896
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 180  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24333809 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16630744 - 16630651
Alignment:
Q  127 taatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  16630744 taatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagc-ttacacaagaacaa 16630651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 219
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777674
Alignment:
Q  96 agattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatct 193  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaat 3777649  T
Q  194 agctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  3777650 agcttgcaaac-ttacacaagaacaa 3777674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743425
Alignment:
Q  100 tgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 180  Q
    |||| ||||||||| | ||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28468404 - 28468342
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||| |||||    
T  28468404 acccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacacttaaccc 28468342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 331
Target Start/End: Original strand, 5112466 - 5112523
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaa 331  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  5112466 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcacaacaaagacactcaa 5112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931849
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16931849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934203
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16934203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780433
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22780433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39774380 - 39774304
Alignment:
Q  116 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa-aggttacaagaa 190  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  39774380 ccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaagaa 39774304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599898
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 44599898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1457341 - 1456986
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagat 99  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457341 aacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagat 1457242  T
Q  100 tgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  1457241 tgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct 1457142  T
Q  199 tcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457141 tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcc 1457042  T
Q  298 caacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1457041 caacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 1456986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 15044592 - 15044947
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15044592 aacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaaga 15044690  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt 198  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15044691 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt 15044790  T
Q  199 tcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044791 tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcc 15044890  T
Q  298 c-aacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15044891 caaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 15044947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 43592184 - 43592540
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43592184 aacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 43592283  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  43592284 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcc 43592383  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592384 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 43592483  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43592484 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 43592540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 354
Target Start/End: Original strand, 27449730 - 27450075
Alignment:
Q  12 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcaccca 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27449730 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgaccca 27449829  T
Q  110 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagcttta 208  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27449830 gttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagcttta 27449929  T
Q  209 cacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27449930 cacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 27450029  T
Q  308 gacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27450030 gacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 27450075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 43598629 - 43598985
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43598629 aacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 43598728  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  43598729 ttgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcc 43598828  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598829 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 43598928  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43598929 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 43598985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 43604121 - 43604477
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43604121 aacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 43604220  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  43604221 ttgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcc 43604320  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604321 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 43604420  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43604421 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 43604477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 43609613 - 43609969
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43609613 aacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 43609712  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  43609713 ttgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcc 43609812  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609813 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 43609912  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43609913 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 43609969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 354
Target Start/End: Original strand, 27444886 - 27445231
Alignment:
Q  12 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcaccca 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27444886 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgaccca 27444985  T
Q  110 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagcttta 208  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27444986 gttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagcttta 27445085  T
Q  209 cacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27445086 cacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 27445185  T
Q  308 gacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27445186 gacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 27445231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28807751 - 28807429
Alignment:
Q  5 aaacagtcctagactagtgtatagcaaaaa--cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagat 99  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  28807751 aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagat 28807652  T
Q  100 tgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagcttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807651 tgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagaatctagcttt 28807553  T
Q  200 caagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28807552 caagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccca 28807453  T
Q  300 acctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  28807452 acctaagaaacactctcatcaaag 28807429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37556788 - 37556478
Alignment:
Q  16 gactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagtt 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37556788 gacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 37556689  T
Q  113 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagctttacac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37556688 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagctttacac 37556589  T
Q  212 atgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagaca 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  37556588 atgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatg-ttttcccaacctaagaaaca 37556490  T
Q  312 ctctcaacaaag 323  Q
    ||| || |||||    
T  37556489 ctcacatcaaag 37556478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37561610 - 37561300
Alignment:
Q  16 gactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagtt 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37561610 gacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 37561511  T
Q  113 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagctttacac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37561510 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagctttacac 37561411  T
Q  212 atgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagaca 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  37561410 atgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatg-ttttcccaacctaagaaaca 37561312  T
Q  312 ctctcaacaaag 323  Q
    ||| || |||||    
T  37561311 ctcacatcaaag 37561300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 30631312 - 30631586
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagat 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | | || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30631312 aacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagat 30631411  T
Q  100 tgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagct 197  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  30631412 tgttgactcagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagcc 30631511  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  30631512 ttcaagctttacacatgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 30631586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 2785281 - 2785608
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||    
T  2785281 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaa 2785377  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2785378 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 2785477  T
Q  196 c-tttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--t 292  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |    
T  2785478 cttttcaagctttactcatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgt 2785577  T
Q  293 tttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2785578 tttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 2785608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 33791222 - 33791549
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||    
T  33791222 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaa 33791318  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33791319 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 33791418  T
Q  196 cttt-caagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--t 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |    
T  33791419 cttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgt 33791518  T
Q  293 tttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33791519 tttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33791549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180394
Alignment:
Q  19 tagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcagcc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaagaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagcc 31180237  T
Q  118 aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagctttcaagctttacacatga 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |     
T  31180238 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaag- 31180336  T
Q  216 acaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  31180337 acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaa 31180394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31397151 - 31396843
Alignment:
Q  22 tgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa---acaccgag-aagattgttcacccagttcagcc 117  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| ||| ||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31397151 tgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaa-aacaaacaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 31397055  T
Q  118 aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagctttacacatg- 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  31397054 aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 31396955  T
Q  215 -aacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagaca 311  Q
     || |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  31396954 caaaaaaccctagatctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagataca 31396855  T
Q  312 ctctcaacaaag 323  Q
    |||||| |||||    
T  31396854 ctctcatcaaag 31396843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31402029 - 31401700
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||    
T  31402029 aacaaaacagcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaa 31401933  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31401932 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 31401833  T
Q  196 ctt-tcaagctttacacatg--aacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt- 291  Q
    ||| |||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||     
T  31401832 cttatcaagctttacacaagacaaaaaactctagatctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgtt 31401733  T
Q  292 -ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31401732 gttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 31401700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 33768085 - 33768417
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  || ||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||    
T  33768085 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcata--caggataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaa 33768181  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33768182 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 33768281  T
Q  196 c-tttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctacccttt--ggtatgttccc-actc--tcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaat 289  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||| || |   |||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  33768282 cttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttcggttattttccctacccctccacactatgaaccaataatcccaaggtgattacaat 33768381  T
Q  290 gt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33768382 gttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33768417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Original strand, 38192135 - 38192353
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192135 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 38192234  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||| || || | | |||||||    
T  38192235 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactc 38192333  T
Q  253 tcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  38192334 tcacaatatgaaccctaaaa 38192353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Original strand, 38219360 - 38219578
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219360 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 38219459  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||| || || | | |||||||    
T  38219460 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactc 38219558  T
Q  253 tcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  38219559 tcacaatatgaaccctaaaa 38219578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Original strand, 24135809 - 24136028
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 154  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24135809 aaacaagataagctagaaaaggaagaacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaa 24135908  T
Q  155 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccact 251  Q
    | || || || |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| | | ||||||    
T  24135909 tgcactaagatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccact 24136007  T
Q  252 ctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  24136008 ctcacaatgtgaaccctaaaa 24136028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Original strand, 35387624 - 35387842
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387624 aaacgagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 35387723  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    | | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||| ||  |||||  ||||||| || || | | |||||||    
T  35387724 ctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactc 35387822  T
Q  253 tcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  35387823 tcacaatatgaaccctaaaa 35387842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Original strand, 30631640 - 30631719
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30631640 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttg 30631719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Original strand, 31180447 - 31180526
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31180447 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 31180526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Original strand, 24136080 - 24136159
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24136080 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactttctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 24136159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281877
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 10281850  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  10281851 ttagcttacaagc-ttacacaagaacaa 10281877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353304
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 9353330  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9353329 aagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 9353304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932350
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 36932350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464629
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 15464629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916943
Alignment:
Q  96 agattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatc 192  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||      
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaaa 11916969  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    ||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  11916968 tagtttgcaagc-ttacacaagaacaa 11916943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520355
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 14520329  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  14520330 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 14520355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 35387893 - 35387955
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35387893 acccaaggtgattacaatgttttttccaacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccc 35387955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Original strand, 3880321 - 3880425
Alignment:
Q  116 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacat 213  Q
    ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||| |||||||     
T  3880321 ccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttacaagc-ttacacaa 3880419  T
Q  214 gaacaa 219  Q
    ||||||    
T  3880420 gaacaa 3880425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17004057 - 17003970
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 180  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  17004057 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaag 17003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12084241 - 12084175
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12084241 cctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 12084175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588844
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| ||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 19588844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 38219629 - 38219691
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  38219629 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 38219691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 28832259 - 28832356
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  28832259 aagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 28832356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42127507 - 42127410
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | | ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  42127507 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 42127410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410241
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552464
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 15552464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179431
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31179431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542953
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31542953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545299
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31545299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9819 - 9514
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagatt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9819 aacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaa-gagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagatt 9721  T
Q  101 gttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttc 200  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9720 gttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttc 9621  T
Q  201 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9620 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 9521  T
Q  301 cctaaga 307  Q
    |||||||    
T  9520 cctaaga 9514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 3845 - 3672
Alignment:
Q  181 gttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 280  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3845 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 3746  T
Q  281 gattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3745 gattacaatgtttttcctaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgct 3672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 66 - 1
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 69  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  66 aacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcataaacaagataagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 41398146 - 41398497
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaa--cacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaag 97  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  41398146 aacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-----aaggaagaacaaaacaccgagaag 41398239  T
Q  98 attgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagct 197  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  41398240 attgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcc 41398339  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398340 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 41398439  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41398440 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgct 41398497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 41390491 - 41390842
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaa--cacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaag 97  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||||||    
T  41390491 aacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag-----aaggaagaacaaaacatcgagaag 41390584  T
Q  98 attgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagct 197  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  41390585 attgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcc 41390684  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390685 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 41390784  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41390785 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaatccatttggttccctcctttgct 41390842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25445266 - 25444931
Alignment:
Q  5 aaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattg 101  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  25445266 aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattg 25445167  T
Q  102 ttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tc 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25445166 ttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatc 25445067  T
Q  201 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445066 aagctttacacatgaacaaaccctagagctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 25444967  T
Q  301 cctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  25444966 cctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 25444931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 44024049 - 44023716
Alignment:
Q  5 aaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccgag-aagattgt 102  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44024049 aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgt 44023950  T
Q  103 tcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tca 201  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  44023949 tgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttgtca 44023851  T
Q  202 agctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023850 agctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaac 44023751  T
Q  302 ctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  44023750 ctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 44023716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 39445408 - 39445742
Alignment:
Q  5 aaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattg 101  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  39445408 aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattg 39445507  T
Q  102 ttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tc 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  39445508 ttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagactctagcttatc 39445606  T
Q  201 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445607 aagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 39445706  T
Q  301 cctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39445707 cctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 39445742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1055188 - 1054854
Alignment:
Q  5 aaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattg 101  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  1055188 aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattg 1055089  T
Q  102 ttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tc 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1055088 ttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagactctagcttatc 1054990  T
Q  201 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1054989 aagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 1054890  T
Q  301 cctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  1054889 cctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 1054854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43988645 - 43988314
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aag 97  Q
    |||||||||| |  || ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  | | || || |||| |||  |||||||||||| || |||    
T  43988645 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaag 43988546  T
Q  98 attgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagc 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43988545 attgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagc 43988446  T
Q  197 tt-tcaagctttacacatg--aacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt-- 291  Q
    || |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||      
T  43988445 ttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctagatctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttg 43988346  T
Q  292 ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43988345 ttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 43988314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24787551 - 24787280
Alignment:
Q  4 aaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattg 101  Q
    ||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24787551 aaaacagccctagacttatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaagattg 24787454  T
Q  102 ttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagcttt 199  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||    
T  24787453 ttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctt 24787354  T
Q  200 caagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||    
T  24787353 caagcattacacaagaacaaatcctagattctaccctttggtgtttcccaactctcacaatatgaaccctaaaa 24787280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24202904 - 24202686
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202904 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24202805  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||    
T  24202804 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 24202706  T
Q  253 tcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  24202705 tcacaatatgaaccctaaaa 24202686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25439875 - 25439738
Alignment:
Q  199 tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25439875 tcaagctttacacatgaacaaaccctagagctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc 25439776  T
Q  299 aacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  25439775 aacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 25439738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19358975 - 19358760
Alignment:
Q  60 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19358975 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacatcaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19358877  T
Q  158 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctc 254  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||||    
T  19358876 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 19358778  T
Q  255 acactatgaaccctaaaa 272  Q
     || ||||||||||||||    
T  19358777 tcaatatgaaccctaaaa 19358760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19361564 - 19361349
Alignment:
Q  60 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19361564 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19361466  T
Q  158 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctc 254  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||| || ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||||    
T  19361465 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 19361367  T
Q  255 acactatgaaccctaaaa 272  Q
     || ||||||||||||||    
T  19361366 tcaatatgaaccctaaaa 19361349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19380204 - 19379989
Alignment:
Q  60 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19380204 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19380106  T
Q  158 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctc 254  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||| || ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||||    
T  19380105 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 19380007  T
Q  255 acactatgaaccctaaaa 272  Q
     || ||||||||||||||    
T  19380006 tcaatatgaaccctaaaa 19379989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 273 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24787226 - 24787148
Alignment:
Q  273 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24787226 cccaaggtgattataatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 24787148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644869
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 26644895  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  26644894 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 26644869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47704033 - 47703907
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  47704033 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaa 47703934  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  47703933 ttagcttacaagc-ttacacaagaacaa 47703907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24202635 - 24202573
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24202635 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc 24202573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281833
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 3281807  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  3281808 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 3281833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073026
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 19073026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120916
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 19120916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 9476261 - 9476387
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||     
T  9476261 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaagagttataagaaa 9476360  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9476361 ttagcttacaagc-ttacacaagaacaa 9476387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21536635 - 21536541
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21536635 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 21536541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27104438 - 27104371
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27104438 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 27104371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16124613 - 16124515
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16124613 aagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16124515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Original strand, 13598398 - 13598485
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 180  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13598398 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Original strand, 29651811 - 29651898
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 180  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29651811 aagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 187
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069864
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 187  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa 37069864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Original strand, 775672 - 775759
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 180  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  775672 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13604689 - 13604623
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  13604689 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaa 13604623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 47098921 - 47098824
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  47098921 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 47098824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19366174 - 19366112
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  19366174 acccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 19366112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21536438 - 21536378
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  21536438 acccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacctaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 21536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Original strand, 32889461 - 32889536
Alignment:
Q  116 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  32889461 ccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 32889536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19361298 - 19361237
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  19361298 acccaaggtgtttacaatgtttt-cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 19361237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459479
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9459479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463306
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9463306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226386
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16226386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24024492 - 24024151
Alignment:
Q  16 gactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaa-caccgag-aagattgttcacccagtt 112  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  24024492 gactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaaacaccgaacaagattgttgacccagtt 24024393  T
Q  113 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacaca 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24024392 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaatgttacaagactctagccttcaagctttacaca 24024293  T
Q  213 tgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagaca 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24024292 tgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacgatgaaccctaaaacccacggtgattacaatgtttttccaaacccaagagaca 24024193  T
Q  312 ctctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24024192 ctctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 24024151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31109762 - 31109407
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgag-aag 97  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  31109762 aacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaaaacaccgaacaag 31109665  T
Q  98 attgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagct 197  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31109664 attgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcc 31109565  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109564 ttcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 31109465  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31109464 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatatggttccctcctttgct 31109407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 12396817 - 12397172
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12396817 aacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaaaacaccgagaaga 12396915  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12396916 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcc 12397015  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397016 tttaatctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 12397115  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12397116 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 12397172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 12406237 - 12406576
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||    
T  12406237 aacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaaga 12406335  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12406336 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcc 12406435  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12406436 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagccaaggtgattacaatgtttttc 12406535  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406536 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 12406576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Original strand, 19992221 - 19992544
Alignment:
Q  5 aaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattg 101  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  19992221 aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattg 19992320  T
Q  102 ttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tc 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19992321 ttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatc 19992420  T
Q  201 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttt-ccca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19992421 aagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccca 19992520  T
Q  300 acctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||| |||||| || |||||    
T  19992521 acctaagaaacactcacatcaaag 19992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21812415 - 21812092
Alignment:
Q  5 aaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattg 101  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||| |||  ||||||||||||||| |||||||    
T  21812415 aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattg 21812316  T
Q  102 ttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tc 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  21812315 ttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtgaa-gtcttacaaaaggttccaagactctagcttgtc 21812217  T
Q  201 aa-gctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttt-ccc 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21812216 aaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgtttttcccc 21812117  T
Q  299 aacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||    
T  21812116 aacctaagaaacactctcatcaaag 21812092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24266348 - 24266054
Alignment:
Q  35 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaat 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24266348 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 24266251  T
Q  131 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||     
T  24266250 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagac 24266151  T
Q  229 ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24266150 ctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 24266054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24261469 - 24261175
Alignment:
Q  35 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaat 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24261469 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 24261372  T
Q  131 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||     
T  24261371 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagac 24261272  T
Q  229 ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  24261271 ctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 24261175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20357734 - 20357463
Alignment:
Q  4 aaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  20357734 aaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaataccaagaagattg 20357637  T
Q  102 ttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagcttt 199  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||    
T  20357636 ttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctt 20357537  T
Q  200 caagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |  || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20357536 caagctttacacaagaacatgccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 20357463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 323
Target Start/End: Original strand, 16884868 - 16885162
Alignment:
Q  35 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaat 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16884868 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 16884965  T
Q  131 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |    
T  16884966 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacc 16885065  T
Q  230 taccctttggt-atgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||| | |  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  16885066 taccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 16885162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 4866635 - 4866820
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaa-cacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  4866635 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaag 4866733  T
Q  98 attgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 184  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866734 attgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 4866820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 323
Target Start/End: Original strand, 16880012 - 16880306
Alignment:
Q  35 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaat 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16880012 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 16880109  T
Q  131 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |    
T  16880110 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacc 16880209  T
Q  230 taccctttggt-atgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||| | |  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||| |||||    
T  16880210 taccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgtttttccaacctaagattcactctcatcaaag 16880306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Original strand, 2057927 - 2058147
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057927 aaacaagataagcaataaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 2058026  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccc-tttggtatgttcccac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| | || | | | |||||    
T  2058027 ccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccac 2058125  T
Q  251 tctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  2058126 tctcacaatatgaaccctaaaa 2058147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1533579 - 1533359
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1533579 aaacaatataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaataagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaat 1533480  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatg-aacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1533479 ccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccac 1533381  T
Q  251 tctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  1533380 tctcacaatatgaaccctaaaa 1533359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Original strand, 21639770 - 21639988
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639770 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 21639869  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    ||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||    
T  21639870 ccactataatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 21639968  T
Q  253 tcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  21639969 tcacaatatgaaccctaaaa 21639988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Original strand, 21645968 - 21646186
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21645968 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaat 21646067  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||    
T  21646068 ccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 21646166  T
Q  253 tcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  21646167 tcacaatatgaaccctaaaa 21646186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Original strand, 18408726 - 18408943
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408726 aaacaagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 18408824  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  || ||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||| || || | | |||||||    
T  18408825 ccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaataacttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactc 18408923  T
Q  253 tcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  18408924 tcacaatatgaaccctaaaa 18408943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Original strand, 18413606 - 18413819
Alignment:
Q  60 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18413606 caagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaatcca 18413703  T
Q  159 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccactctca 255  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||| || ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||| || || | | ||||||||||    
T  18413704 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagattgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctca 18413802  T
Q  256 cactatgaaccctaaaa 272  Q
    || ||||||||||||||    
T  18413803 caatatgaaccctaaaa 18413819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20357410 - 20357331
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20357410 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 20357331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 352
Target Start/End: Original strand, 4873310 - 4873387
Alignment:
Q  274 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4873310 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttg 4873387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1533307 - 1533228
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1533307 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 1533228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Original strand, 2058202 - 2058281
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2058202 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 2058281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 29159803 - 29159929
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  29159803 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 29159902  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  29159903 ttagcttacaagc-ttacacaagaacaa 29159929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 219
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983411
Alignment:
Q  96 agattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa--ggttacaagaat 191  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||||     
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaa 21983384  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21983385 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 21983411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 46516407 - 46516281
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  46516407 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 46516308  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  46516307 ttagcttaaaagc-ttacacaagaacaa 46516281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 49091661 - 49091759
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49091661 aagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 49091759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848684
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 44848684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2647793 - 2647667
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcagcc-aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  2647793 aagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 2647694  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  2647693 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 2647667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 2580390 - 2580515
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||      
T  2580390 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaa 2580489  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  2580490 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 2580515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 21640039 - 21640101
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21640039 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 21640101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 21646237 - 21646299
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21646237 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 21646299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33332547 - 33332449
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33332547 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 33332449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9190105 - 9190008
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  9190105 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 9190008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 20284089 - 20284186
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  20284089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgcgttacaagaa 20284186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 55948 - 56073
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  55948 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 56046  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  56047 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 56073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 18408993 - 18409055
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  18408993 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 18409055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28617356 - 28617258
Alignment:
Q  61 aagataagcaagaaaggaagaa--caaa-acaccgagaagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||   || |||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28617356 aagataagcaagaaaggaagaaaacaaacacacc---aatattgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatc 28617260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4796764 - 4796638
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||  || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||     
T  4796764 aagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaa 4796665  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  4796664 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 4796638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479461
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||      
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttataagaaaa 2479435  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  2479436 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 2479461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 18413869 - 18413931
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  18413869 acccaaggtgtttacattgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 18413931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 178
Target Start/End: Original strand, 35960847 - 35960901
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35960847 cctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9185262 - 9185178
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 177  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9185262 aagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 174
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263757
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 174  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga--gcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 47263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155971
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7290106 - 7289750
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagc-ataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7290106 aacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 7290007  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  7290006 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcc 7289907  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289906 ttcaagctttacacatgaacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 7289807  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7289806 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 7289750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25328442 - 25328120
Alignment:
Q  17 actagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaag-cataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttc 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||||| |||||| |   |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25328442 actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttc 25328344  T
Q  114 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacat 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25328343 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacat 25328244  T
Q  214 gaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacac 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25328243 gaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacac 25328144  T
Q  313 tctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    
T  25328143 tctcatcaaagacacacaacccat 25328120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39785003 - 39784665
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  39785003 aacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaa 39784905  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagc 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39784904 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagactctagc 39784806  T
Q  197 tt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttt 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  39784805 ttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgttttt 39784706  T
Q  296 cccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39784705 cccaacctaagagactctctcatcaaaggcacacaccccat 39784665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 6311203 - 6311477
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagat 99  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311203 aacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagat 6311302  T
Q  100 tgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagct 197  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  6311303 tgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagcc 6311402  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  6311403 ttcaagctttacacaag-acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 6311477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 35745297 - 35745624
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||    
T  35745297 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaa 35745393  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  35745394 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 35745493  T
Q  196 c-tttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--t 292  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |    
T  35745494 cttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgt 35745593  T
Q  293 tttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35745594 tttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 35745624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Original strand, 36979287 - 36979558
Alignment:
Q  4 aaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgt 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36979287 aaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgt 36979385  T
Q  103 tcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagcttt 199  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||    
T  36979386 tgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctt 36979485  T
Q  200 caagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36979486 caagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 36979558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Original strand, 30655551 - 30655827
Alignment:
Q  4 aaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaa----caccgagaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    
T  30655551 aaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaaaaacaccaagaaga 30655650  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tag 195  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||    
T  30655651 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 30655750  T
Q  196 ctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30655751 ccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 30655827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10684410 - 10684116
Alignment:
Q  35 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaat 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10684410 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 10684313  T
Q  131 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||     
T  10684312 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagac 10684213  T
Q  229 ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10684212 ctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 10684116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33037992 - 33037724
Alignment:
Q  5 aaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgtt 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33037992 aaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaagaagaacaaaacaccaagaagattgtt 33037894  T
Q  104 cacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttca 201  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||    
T  33037893 gacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttca 33037794  T
Q  202 agctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaa 271  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |  || | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  33037793 agc-ttacacaagaacaaaccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 33037724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4760263 - 4759991
Alignment:
Q  4 aaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgt 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4760263 aaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacatcaagaagattgt 4760164  T
Q  103 tcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagcttt 199  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||    
T  4760163 tgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctt 4760064  T
Q  200 caagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4760063 caagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 4759991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18853347 - 18853083
Alignment:
Q  12 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccag 110  Q
    |||||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18853347 cctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccag 18853249  T
Q  111 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaagaatc--tagctttcaagctt 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| |    
T  18853248 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-t 18853150  T
Q  207 tacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18853149 tacacaagaacaaaccctagattttaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18853083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18870741 - 18870477
Alignment:
Q  12 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccag 110  Q
    |||||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18870741 cctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccag 18870643  T
Q  111 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaagaatc--tagctttcaagctt 206  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| |    
T  18870642 ttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-t 18870544  T
Q  207 tacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18870543 tacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18870477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10689315 - 10689058
Alignment:
Q  19 tagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcagcc 117  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10689315 tagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagcc 10689217  T
Q  118 aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatg 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |    
T  10689216 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaag 10689118  T
Q  215 aacaaaccctaga-tctaccc-tttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | || | | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10689117 aacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 10689058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1262089 - 1261871
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262089 aaacaagataagatagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 1261990  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| | ||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||    
T  1261989 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 1261891  T
Q  253 tcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  1261890 tcacaatatgaaccctaaaa 1261871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 26287866 - 26287985
Alignment:
Q  60 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287866 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26287965  T
Q  159 atatga-gaaagtgttacaa 177  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26287966 ctatgatgaaagtgttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 26301123 - 26301242
Alignment:
Q  60 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301123 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26301222  T
Q  159 atatga-gaaagtgttacaa 177  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26301223 ctatgatgaaagtgttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 26313117 - 26313236
Alignment:
Q  60 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313117 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26313216  T
Q  159 atatga-gaaagtgttacaa 177  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26313217 ctatgatgaaagtgttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31071362 - 31071146
Alignment:
Q  60 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31071362 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 31071263  T
Q  158 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccactctc 254  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||| || || | | |||||||||    
T  31071262 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctc 31071164  T
Q  255 acactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  31071163 acaatatgaaccctaaaa 31071146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 272 - 354
Target Start/End: Original strand, 6311532 - 6311613
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6311532 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttgct 6311613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18870424 - 18870345
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18870424 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 18870345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25328070 - 25327994
Alignment:
Q  260 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25328070 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccat 25327994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Original strand, 30655880 - 30655959
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30655880 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 30655959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 10689003 - 10688924
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10689003 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 10688924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18853030 - 18852951
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18853030 acccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 18852951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 33037671 - 33037592
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  33037671 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacgaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 33037592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Original strand, 4456050 - 4456153
Alignment:
Q  116 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatg 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||  ||||| ||||||| |    
T  4456050 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagctggcaagc-ttacacaag 4456148  T
Q  215 aacaa 219  Q
    |||||    
T  4456149 aacaa 4456153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Original strand, 36979611 - 36979689
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  36979611 acccaaggtgattacaatgtttt-cccaacctaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttcccttctttg 36979689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26403327 - 26403240
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 180  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26403327 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1261820 - 1261758
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1261820 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccc 1261758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Original strand, 7412305 - 7412466
Alignment:
Q  61 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 157  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7412305 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 7412404  T
Q  158 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  || ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  7412405 actatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagc-ttacacaagaacaa 7412466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23799674 - 23799548
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  23799674 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 23799575  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23799574 ttagcttacaagc-ttacacaagaacaa 23799548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4759938 - 4759857
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgttttt-cccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  4759938 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagactctctctacaaagacactcaaccc-tttggttacctcctttgc 4759857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175754
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 19175754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4696693 - 4696609
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 177  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4696693 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Original strand, 6127243 - 6127319
Alignment:
Q  116 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6127243 ccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 6127319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5702580 - 5702482
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5702580 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 5702482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  97 gattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31071095 - 31071035
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaac 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  31071095 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 31071035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 26288121 - 26288183
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26288121 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26288183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 26301378 - 26301440
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26301378 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26301440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 26313372 - 26313434
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26313372 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26313434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19752491 - 19752394
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  19752491 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 19752394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 7412569 - 7412629
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  7412569 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 7412629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 205
Target Start/End: Original strand, 6813723 - 6813796
Alignment:
Q  134 ggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa-aggttacaagaatctagctttcaagct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||  |||||||||||  |||||| ||||||    
T  6813723 ggggagagagcagctctccaatccaataagatgaaagtgacacaaaggggttacaagaaattagcttgcaagct 6813796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18811015 - 18810982
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18811015 cctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 18810982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079877
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082248
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43082248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 39812167 - 39811812
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39812167 aacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaaga 39812069  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt 198  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  39812068 ttgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct 39811969  T
Q  199 tcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39811968 tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttct 39811869  T
Q  298 caacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39811868 caacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgct 39811812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 32246690 - 32247031
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa----ggaagaacaaaacaccgag- 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||      
T  32246690 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaac 32246788  T
Q  95 aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatcta 194  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32246789 aagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactcta 32246888  T
Q  195 gctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32246889 gctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttt 32246988  T
Q  294 ttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  32246989 ttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 32247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 19344326 - 19344655
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||||||||||| ||    
T  19344326 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaa 19344423  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19344424 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 19344523  T
Q  196 cttt-caagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa---tgt 291  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||   |||    
T  19344524 cttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgt 19344623  T
Q  292 ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19344624 ttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19344655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 19349184 - 19349513
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||||||||||| ||    
T  19349184 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaa 19349281  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19349282 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 19349381  T
Q  196 cttt-caagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa---tgt 291  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||   |||    
T  19349382 cttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgt 19349481  T
Q  292 ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19349482 ttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19349513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11099114 - 11098843
Alignment:
Q  4 aaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgt 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11099114 aaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataaggaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgt 11099016  T
Q  103 tcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagcttt 199  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||     
T  11099015 tgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttg 11098916  T
Q  200 caagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11098915 caagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 11098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44312792 - 44312563
Alignment:
Q  12 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcaccca 109  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44312792 cctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgaccca 44312694  T
Q  110 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagcttta 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44312693 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagcttta 44312594  T
Q  209 cacatgaacaaaccctaga-tctaccctttg 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44312593 cacatgaacaaaccctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Original strand, 14291398 - 14291669
Alignment:
Q  4 aaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgt 102  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14291398 aaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgt 14291496  T
Q  103 tcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagcttt 199  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||    
T  14291497 tgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctt 14291596  T
Q  200 caagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14291597 caagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 14291669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9296588 - 9296317
Alignment:
Q  4 aaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgt 102  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9296588 aaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgt 9296490  T
Q  103 tcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagcttt 199  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||    
T  9296489 tgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctt 9296390  T
Q  200 caagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||||| |  || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9296389 caagc-ttatacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 9296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Original strand, 3491716 - 3491930
Alignment:
Q  60 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491716 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 3491814  T
Q  159 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctca 255  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | ||||||||||    
T  3491815 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctca 3491913  T
Q  256 cactatgaaccctaaaa 272  Q
    || ||||||||||||||    
T  3491914 caatatgaaccctaaaa 3491930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Original strand, 25398457 - 25398675
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398457 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 25398556  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||| || || | |  ||||||    
T  25398557 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactc 25398655  T
Q  253 tcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  25398656 tcacaatatgaaccctaaaa 25398675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Original strand, 25403595 - 25403813
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403595 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 25403694  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||| || || | |  ||||||    
T  25403695 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactc 25403793  T
Q  253 tcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  25403794 tcacaatatgaaccctaaaa 25403813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Original strand, 40738810 - 40738926
Alignment:
Q  61 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  40738810 aagataagctagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccac 40738907  T
Q  160 tatga-gaaagtgttacaa 177  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  40738908 tatgatgaaagtgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11098790 - 11098711
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11098790 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 11098711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040188
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag---gttacaaga 189  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagagttacaaga 8040159  T
Q  190 atctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |  |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  8040160 aattagcttacaagc-ttacacaagaacaa 8040188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 272
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407802
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaacc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtc 25407751  T
Q  223 ctag-atctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||  ||||||| || || | |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25407752 ctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25407802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259149
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 28259175  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  28259174 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 28259149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9296265 - 9296186
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9296265 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaatagacactttctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 9296186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569454
Alignment:
Q  98 attgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatcta 194  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatta 13569430  T
Q  195 gctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    ||||  ||| |||||||| ||||||    
T  13569431 gcttataag-tttacacaagaacaa 13569454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Original strand, 14291722 - 14291801
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  14291722 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactatctacaaagacgctcaaccc-tttggttccctcctttg 14291801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 21629944 - 21630041
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21629944 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 21630041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10445541 - 10445415
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| | ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||     
T  10445541 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 10445442  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     |||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  10445441 ttagcttacaatc-ttacacaagaacaa 10445415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 17865203 - 17865329
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcagcc-aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  17865203 aagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 17865302  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  17865303 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 17865329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34682431 - 34682305
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||     
T  34682431 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 34682332  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     |||||| || || ||||||| ||||||    
T  34682331 ttagcttacaggc-ttacacaagaacaa 34682305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707223
Alignment:
Q  96 agattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatc 192  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||      
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 10707249  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  10707248 tagcttacaagc-ttacacaagaacaa 10707223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 20522220 - 20522318
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20522220 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaagaa 20522318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388956
Alignment:
Q  96 agattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    |||||||| ||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 34388956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8390216 - 8390133
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||    
T  8390216 cctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaaattagcttacaagctt 8390133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14699104 - 14698979
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||     
T  14699104 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaagaaa 14699006  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  14699005 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 14698979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 25409860 - 25409922
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  25409860 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 25409922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23078567 - 23078442
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||      
T  23078567 aagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaagaaaa 23078468  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23078467 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 23078442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 180
Target Start/End: Original strand, 31056075 - 31056131
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 180  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31056075 cctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36757859 - 36757728
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||| |||||      
T  36757859 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaagagttataagaaaa 36757760  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaaacccta 225  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  36757759 aagctttcaagc-ttacacaagaacaaaaccta 36757728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 39482931 - 39483057
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||     
T  39482931 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaagaaa 39483030  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  39483031 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 39483057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42039744 - 42039669
Alignment:
Q  116 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  42039744 ccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaagaa 42039669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 3491981 - 3492043
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3491981 acccaaggtgtttacaatgttttttccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 3492043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33528718 - 33528620
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33528718 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 33528620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Original strand, 33118158 - 33118262
Alignment:
Q  116 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaagaatctagctttcaagctttacacat 213  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||  |||| |||||||     
T  33118158 ccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaatagttacaagaaattagcttataagc-ttacacaa 33118256  T
Q  214 gaacaa 219  Q
    ||||||    
T  33118257 gaacaa 33118262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16940306 - 16940219
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 180  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16940306 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16940219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17010971 - 17010884
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 180  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17010971 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215646
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218023
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35218023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14737756 - 14737403
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaa-gagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccgagaag 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14737756 aacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaag 14737658  T
Q  98 attgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagct 197  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  14737657 attgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcc 14737558  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737557 ttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 14737458  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14737457 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttg 14737403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22010865 - 22010521
Alignment:
Q  12 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcaccca 109  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22010865 cctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgaccca 22010767  T
Q  110 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagcttta 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22010766 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagcttta 22010667  T
Q  209 cacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22010666 cacatgaacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 22010567  T
Q  308 gacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22010566 gacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 22010521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14742615 - 14742263
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||    
T  14742615 aacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaaga 14742517  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt 198  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  14742516 ttgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct 14742417  T
Q  199 tcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcc 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14742416 tcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaagtgattacaatgtttttcc 14742317  T
Q  298 caacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  14742316 caacccaagagacactctcaacaaagacacttaaccca-ttggttccctcctttg 14742263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28155735 - 28155412
Alignment:
Q  16 gactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagtt 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  28155735 gacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagtt 28155636  T
Q  113 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28155635 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatttagctttcaagctttacaca 28155536  T
Q  213 tgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28155535 tgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacac 28155436  T
Q  313 tctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    ||||| ||||| ||| || |||||    
T  28155435 tctcatcaaaggcacacaccccat 28155412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 11856877 - 11857235
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaa---caccgaga 95  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||| |||| | ||| ||||||||||||   |||| |||    
T  11856877 aacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaaaaaaacaccaaga 11856975  T
Q  96 agattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tcta 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11856976 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactcta 11857075  T
Q  195 gctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttt 293  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857076 gccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttt 11857175  T
Q  294 ttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11857176 ttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 11857235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 28184410 - 28184754
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagca--agaaaggaagaacaaaacaccgagaag 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||    
T  28184410 aacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaaaacaccgagaag 28184508  T
Q  98 attgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagct 197  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  28184509 attgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaacactctagcc 28184608  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttt- 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28184609 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattactatgtttttt 28184708  T
Q  296 --cccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttg 339  Q
      || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28184709 tcccaaacccaagagacactctcaacaaagaccctcaacccatttg 28184754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 6438409 - 6438743
Alignment:
Q  5 aaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattg 101  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  6438409 aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattg 6438508  T
Q  102 ttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tc 200  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  6438509 ttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagactctagcttgtc 6438607  T
Q  201 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438608 aagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 6438707  T
Q  301 cctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  6438708 cctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 6438743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 16838650 - 16838977
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||    
T  16838650 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaa 16838746  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16838747 gattgttgacccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 16838846  T
Q  196 ct-ttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--t 292  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  16838847 ctattcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgt 16838946  T
Q  293 tttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16838947 tttcccaacctaagatacactctcatcaaag 16838977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 6005323 - 6005650
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||    
T  6005323 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaa 6005419  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6005420 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 6005519  T
Q  196 c-tttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--t 292  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |    
T  6005520 cttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgt 6005619  T
Q  293 tttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6005620 tttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 6005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33330626 - 33330297
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaac-acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-a 95  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || |    
T  33330626 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagca 33330529  T
Q  96 agattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatcta 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33330528 agattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatcta 33330429  T
Q  195 gctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt-- 291  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  33330428 gcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttg 33330329  T
Q  292 ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33330328 ttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33330297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33336123 - 33335794
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaac-acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-a 95  Q
    |||||||||| |  || ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || |    
T  33336123 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagca 33336026  T
Q  96 agattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatcta 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33336025 agattgttgacccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatcta 33335926  T
Q  195 gctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt-- 291  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  33335925 gcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttg 33335826  T
Q  292 ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33335825 ttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33335794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5674905 - 5674685
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674905 aaacaatataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaaagagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 5674806  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatg-aacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||| | | |||||    
T  5674805 ccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccac 5674707  T
Q  251 tctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  5674706 tctcacaatatgaaccctaaaa 5674685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5674633 - 5674554
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5674633 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 5674554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757462
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 5757476  T
Q  193 tagctttcaagctt 206  Q
    |||||| |||||||    
T  5757475 tagcttgcaagctt 5757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Original strand, 5343408 - 5343527
Alignment:
Q  23 gtatagcaaaaac-acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcagcc 117  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5343408 gtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagcc 5343504  T
Q  118 aatgtggcctaatctgggggaga 140  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  5343505 aatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Original strand, 22708984 - 22709102
Alignment:
Q  61 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||| ||||| |  |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22708984 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaa-attgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 22709082  T
Q  159 atatga-gaaagtgttacaa 177  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  22709083 ctatgatgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356133
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttactaagagttacaagaa 21356133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5572338 - 5572212
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  5572338 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 5572239  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  5572238 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 5572212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10077262 - 10077176
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 179  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10077262 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31086570 - 31086472
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  31086570 aagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaggagttacaagaa 31086472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 179
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 179  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 323
Target Start/End: Original strand, 5343637 - 5343710
Alignment:
Q  252 ctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  5343637 ctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 5343710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801343
Alignment:
Q  107 ccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaagaa 21801343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 31979513 - 31979611
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31979513 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaagaa 31979611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18232943
Alignment:
Q  116 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 18232943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Original strand, 22963739 - 22963797
Alignment:
Q  134 ggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22963739 ggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 22963797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23824654 - 23824596
Alignment:
Q  134 ggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23824654 ggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 23824596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 30125981 - 30125940
Alignment:
Q  4 aaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagag 45  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30125981 aaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagag 30125940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5017566 - 5017482
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcagccaa-tgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 177  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| | || |||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5017566 aagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195575
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 12195575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31086343 - 31086282
Alignment:
Q  271 aacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  31086343 aacccaaggtgtttacaatgtttctc--aacctaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 31086282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 158
Target Start/End: Original strand, 31936587 - 31936651
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31936587 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 35241 - 34886
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35241 aacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 35143  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  35142 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagcc 35043  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35042 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttcc 34943  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34942 caaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 34886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22173374 - 22173019
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaaga 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22173374 aacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 22173276  T
Q  99 ttgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagct 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22173275 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcc 22173176  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173175 ttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcctaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttc 22173076  T
Q  297 ccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgct 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  22173075 ccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctactttgct 22173019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 18656337 - 18656677
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaa----caccgag 94  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |   ||||||| ||||||||    ||| ||     
T  18656337 aacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaa 18656434  T
Q  95 -aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatct 193  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18656435 caagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactct 18656534  T
Q  194 agctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttt 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18656535 agcattcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactataaacccttaatcccaaggtgattacaatgttt 18656634  T
Q  294 ttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  18656635 ttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 18656677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 7167150 - 7167425
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagat 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7167150 aacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagat 7167249  T
Q  100 tgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagc 196  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  7167250 tgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagc 7167349  T
Q  197 tttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7167350 cttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 7167425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2677267 - 2676939
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || ||    
T  2677267 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaa 2677170  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2677169 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 2677070  T
Q  196 ctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--t 292  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  2677069 cttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgt 2676970  T
Q  293 tttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2676969 tttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 2676939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2673111 - 2672783
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || ||    
T  2673111 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaa 2673014  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2673013 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 2672914  T
Q  196 ctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--t 292  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |    
T  2672913 cttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccttaaatcccaaggtgattacaatgttgt 2672814  T
Q  293 tttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2672813 tttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 2672783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28504046 - 28503780
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagat 99  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  28504046 aacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaaga---------aaggaagaacaaaacaccgagaagat 28503956  T
Q  100 tgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagct 197  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  28503955 tgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagcc 28503856  T
Q  198 ttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28503855 ttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 28503780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 24968013 - 24968340
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||    
T  24968013 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaa 24968109  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24968110 gattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 24968209  T
Q  196 ct-ttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--t 292  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  24968210 ctattcaagctttacacatgaacaaacccgagatctaccctttggtactttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgt 24968309  T
Q  293 tttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24968310 tttcccaacctaagatacactctcatcaaag 24968340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 80 - 323
Target Start/End: Original strand, 8512202 - 8512450
Alignment:
Q  80 gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8512202 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 8512301  T
Q  179 ag-gttacaagaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccca 276  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || ||||    
T  8512302 agagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccca 8512401  T
Q  277 aggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8512402 aggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 8512450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 80 - 323
Target Start/End: Original strand, 8517082 - 8517330
Alignment:
Q  80 gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8517082 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 8517181  T
Q  179 ag-gttacaagaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccca 276  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || ||||    
T  8517182 agagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccca 8517281  T
Q  277 aggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8517282 aggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 8517330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2671773 - 2671502
Alignment:
Q  4 aaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgt 102  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2671773 aaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgt 2671675  T
Q  103 tcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagcttt 199  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||     
T  2671674 tgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagattg 2671575  T
Q  200 caagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||| |  || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2671574 caagc-ttacacaagaccaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 2671502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8739197 - 8738982
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739197 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 8739098  T
Q  157 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  |||| | |||||||    
T  8739097 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactc 8738999  T
Q  253 tcacactatgaacccta 269  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8738998 tcacaatatgaacccta 8738982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9091435 - 9091220
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091435 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 9091336  T
Q  157 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  |||| | |||||||    
T  9091335 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactc 9091237  T
Q  253 tcacactatgaacccta 269  Q
    ||||| |||||||||||    
T  9091236 tcacaatatgaacccta 9091220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 323
Target Start/End: Original strand, 32475424 - 32475717
Alignment:
Q  35 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaat 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32475424 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 32475521  T
Q  131 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |    
T  32475522 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacc 32475620  T
Q  230 taccctttggt-atgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||| | |  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  32475621 taccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 32475717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 323
Target Start/End: Original strand, 32480282 - 32480575
Alignment:
Q  35 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaat 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32480282 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 32480379  T
Q  131 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |    
T  32480380 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacc 32480478  T
Q  230 taccctttggt-atgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||| | |  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  32480479 taccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 32480575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40372929 - 40372712
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372929 aaacaagataagcaagataggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 40372830  T
Q  157 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactct 253  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || | | ||||||||    
T  40372829 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactct 40372731  T
Q  254 cacactatgaaccctaaaa 272  Q
    || | ||||||||||||||    
T  40372730 cataatatgaaccctaaaa 40372712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Original strand, 8477324 - 8477545
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477324 aaacaagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 8477423  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacac-atgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgt-tccca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| |||||| || |||||  |||||| ||||||||||||| | |  ||||    
T  8477424 ccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaataaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccca 8477522  T
Q  250 ctctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  8477523 ctctcacaatatgaaccctaaaa 8477545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501613
Alignment:
Q  138 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  235 tttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    |||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28501650 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 28501613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26928721 - 26928507
Alignment:
Q  61 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 159  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  26928721 aagataagctagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccac 26928623  T
Q  160 tatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctca 255  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | ||||||||||    
T  26928622 tatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctca 26928524  T
Q  256 cactatgaaccctaaaa 272  Q
    || ||||||||||||||    
T  26928523 caatatgaaccctaaaa 26928507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Original strand, 1305914 - 1306045
Alignment:
Q  60 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1305914 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatcca 1306012  T
Q  159 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  1306013 ctacgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 1306045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 272
Target Start/End: Original strand, 32143287 - 32143501
Alignment:
Q  61 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32143287 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 32143385  T
Q  159 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctca 255  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||||     
T  32143386 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctct 32143484  T
Q  256 cactatgaaccctaaaa 272  Q
    || ||||||||||||||    
T  32143485 caatatgaaccctaaaa 32143501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28501560 - 28501480
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  28501560 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcatcccttttggttccctcctttg 28501480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28503727 - 28503647
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28503727 acccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccttttggttccctcctttg 28503647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 2671449 - 2671370
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2671449 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 2671370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 40372659 - 40372580
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40372659 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 40372580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Original strand, 7167478 - 7167558
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttt-tcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7167478 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 7167558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 272 - 349
Target Start/End: Original strand, 8477598 - 8477674
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcct 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8477598 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 8477674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 272 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 8738926 - 8738846
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttgc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8738926 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgc 8738846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9091164 - 9091085
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttctctcctttg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9091164 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttg 9091085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 190
Target Start/End: Original strand, 27452924 - 27453055
Alignment:
Q  61 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27452924 aagataagcaagaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatcca 27453022  T
Q  159 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27453023 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 27453055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 10207839 - 10207983
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || ||    
T  10207839 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaa 10207936  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10207937 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27986567 - 27986449
Alignment:
Q  61 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986567 aagataagcaagaaagaatgaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 27986469  T
Q  159 atatga-gaaagtgttacaa 177  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  27986468 ctatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370448
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaat 8370474  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  8370473 tagcttaaaagc-ttacacaagaacaa 8370448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 206
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264463
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 16264449  T
Q  193 tagctttcaagctt 206  Q
    |||||| |||||||    
T  16264450 tagcttgcaagctt 16264463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974942
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 27974942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18552970 - 18552844
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  18552970 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 18552871  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  18552870 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 18552844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 219
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029219
Alignment:
Q  96 agattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatc 192  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||      
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 36029193  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  36029194 tagcttacaaac-ttacacaagaacaa 36029219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 21711223 - 21711320
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21711223 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 21711320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40592869 - 40592742
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  40592869 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 40592770  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaaa 220  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  40592769 ttagcttacaagc-ttacacaagaacaaa 40592742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736294
Alignment:
Q  98 attgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 1736294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709779
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaa 30709779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 177  Q
    ||||||||| | ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Original strand, 48438236 - 48438312
Alignment:
Q  116 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48438236 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 48438312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3716089 - 3715963
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  3716089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 3715990  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     |||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  3715989 ttagcttacaaac-ttacacaagaacaa 3715963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6794778 - 6794703
Alignment:
Q  116 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  6794778 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 6794703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795879
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaagaa 25795879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 26298988 - 26299086
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26298988 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 26299086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 1306179 - 1306239
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaac 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  1306179 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 1306239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Original strand, 1309819 - 1309878
Alignment:
Q  60 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  1309819 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaagattgttgacccagttcagccaa 1309878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1417577 - 1417493
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-agaaagtgttacaa 177  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  1417577 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaa 1417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 47923993 - 47923895
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  47923993 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaagaa 47923895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 37466291 - 37466388
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  37466291 aagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 37466388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Original strand, 40844674 - 40844777
Alignment:
Q  116 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacat 213  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||     
T  40844674 ccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagc-ttacacaa 40844771  T
Q  214 gaacaa 219  Q
    ||||||    
T  40844772 gaacaa 40844777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4386983 - 4386947
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4386983 cctactctgggggagagagcagctctccaatccaata 4386947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39039995
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 177  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3328443 - 3328346
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||| | |||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  3328443 aagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 3328346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 162
Target Start/End: Original strand, 53894082 - 53894119
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 162  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53894082 cctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatat 53894119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4386831 - 4386774
Alignment:
Q  275 caaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  4386831 caaggtgattacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 4386774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210569
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatcca 38210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494198
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 50494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 271 - 605
Alignment:
Q  5 aaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattg 101  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  271 aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattg 370  T
Q  102 ttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tc 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  371 ttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagactctagcttatc 469  T
Q  201 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  470 aagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 569  T
Q  301 cctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 336  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  570 cctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2430 - 2103
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||| ||    
T  2430 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaa 2334  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2333 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 2234  T
Q  196 ctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--t 292  Q
    ||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |    
T  2233 cttatcaagctttacacaagacaaaaccatagatctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgt 2134  T
Q  293 tttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2133 tttcccaacctaagatacactctcatcaaag 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 149135 - 148808
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||| ||    
T  149135 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaa 149039  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  149038 gattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctag 148939  T
Q  196 ctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--t 292  Q
    ||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |    
T  148938 cttatcaagctttacacaagacaaaaccatagatctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgt 148839  T
Q  293 tttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  148838 tttcccaacctaagatacactctcatcaaag 148808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14455 - 14161
Alignment:
Q  35 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaat 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14455 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 14358  T
Q  131 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||     
T  14357 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagac 14258  T
Q  229 ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14257 ctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 14161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19344 - 19017
Alignment:
Q  1 aacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aa 96  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||    
T  19344 aacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaa 19248  T
Q  97 gattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctag 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19247 gattgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaaaagagttacaagaatctag 19148  T
Q  196 ctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--t 292  Q
    ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||  |    
T  19147 cttatcaagctttacacaagacaaaaccctagatctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataattccaaggtgattacaatgttgt 19048  T
Q  293 tttcccaacctaagagacactctcaacaaag 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19047 tttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18087 - 17869
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18087 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 17988  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||  ||||||| || || | | |||||||    
T  17987 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactc 17889  T
Q  253 tcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  17888 tcacaatatgaaccctaaaa 17869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24180 - 23962
Alignment:
Q  57 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24180 aaacaagataagaaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24081  T
Q  156 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccactc 252  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||  ||||||| || || | | |||||||    
T  24080 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactc 23982  T
Q  253 tcacactatgaaccctaaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  23981 tcacaatatgaaccctaaaa 23962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17818 - 17756
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  17818 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 17756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23911 - 23849
Alignment:
Q  272 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23911 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 23849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 182110 - 181980
Alignment:
Q  35 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcagccaatgtggcctaat 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  182110 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 182013  T
Q  131 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182012 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 176936 - 176829
Alignment:
Q  218 aaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactct 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  176936 aaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactct 176837  T
Q  316 caacaaag 323  Q
    || |||||    
T  176836 catcaaag 176829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8419
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 8419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 423 - 300
Alignment:
Q  4 aaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgt 102  Q
    ||||||| |||| |||||||   ||||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  423 aaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaagaaagaacaaaacaccaagaagattgt 325  T
Q  103 tcacccagttcagccaatgtggcct 127  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||    
T  324 tgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43945
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 43959  T
Q  193 tagctttcaagctt 206  Q
    |||||| |||||||    
T  43958 tagcttgcaagctt 43945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36929 - 36804
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 192  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  36929 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 36830  T
Q  193 tagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  36829 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 36804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85780
Alignment:
Q  96 agattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 85780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 10729 - 10855
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 191  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||     
T  10729 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 10828  T
Q  192 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
     ||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  10829 ttagtttacaagc-ttacacaagaacaa 10855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Original strand, 5683 - 5770
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 180  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5683 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Original strand, 2492 - 2579
Alignment:
Q  95 aagattgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 180  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2492 aagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 133346 - 133280
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  133346 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaa 133280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Original strand, 45284 - 45337
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45284 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 158
Target Start/End: Original strand, 11500 - 11533
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500 cctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 269
Alignment:
Q  99 ttgttcacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 158  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 219
Target Start/End: Original strand, 17294 - 17389
Alignment:
Q  125 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaa 219  Q
    |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  17294 cctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagc-ttacacaagaacaa 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University