View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1829_low_5 (Length: 265)

Name: NF1829_low_5
Description: NF1829
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1829_low_5
NF1829_low_5
[»] chr6 (85 HSPs)
chr6 (18-265)||(11983027-11983276)
chr6 (18-265)||(28241319-28241568)
chr6 (18-265)||(1230247-1230496)
chr6 (18-265)||(14458765-14459012)
chr6 (18-265)||(4816229-4816478)
chr6 (18-265)||(14507174-14507422)
chr6 (20-265)||(30967270-30967517)
chr6 (21-265)||(30034601-30034847)
chr6 (18-265)||(9019993-9020242)
chr6 (21-265)||(26065056-26065297)
chr6 (21-265)||(26085025-26085266)
chr6 (18-265)||(13057261-13057511)
chr6 (18-265)||(2628884-2629132)
chr6 (18-265)||(3631937-3632185)
chr6 (18-265)||(19704565-19704816)
chr6 (19-265)||(30728822-30729074)
chr6 (19-265)||(13039822-13040071)
chr6 (18-265)||(3629863-3630111)
chr6 (18-265)||(15532680-15532928)
chr6 (22-265)||(20915354-20915599)
chr6 (18-265)||(3390446-3390696)
chr6 (18-265)||(32280063-32280313)
chr6 (18-265)||(15541138-15541387)
chr6 (18-263)||(12195515-12195762)
chr6 (18-222)||(15530166-15530369)
chr6 (18-265)||(25477341-25477598)
chr6 (50-265)||(5273214-5273431)
chr6 (18-265)||(26932560-26932809)
chr6 (20-254)||(3233739-3233976)
chr6 (82-265)||(26066122-26066307)
chr6 (18-265)||(12161556-12161802)
chr6 (18-265)||(24338446-24338695)
chr6 (71-265)||(1069716-1069913)
chr6 (82-265)||(26068393-26068578)
chr6 (18-158)||(19227515-19227655)
chr6 (18-265)||(15719713-15719960)
chr6 (82-265)||(33308988-33309172)
chr6 (82-265)||(29754707-29754892)
chr6 (82-265)||(33311257-33311441)
chr6 (18-223)||(3027895-3028098)
chr6 (28-265)||(14466399-14466640)
chr6 (46-265)||(15367129-15367348)
chr6 (18-200)||(22490707-22490889)
chr6 (67-265)||(12186069-12186271)
chr6 (66-265)||(16455422-16455625)
chr6 (66-200)||(26945258-26945393)
chr6 (126-265)||(15346522-15346663)
chr6 (18-198)||(17012110-17012287)
chr6 (68-265)||(19696556-19696758)
chr6 (189-265)||(10584233-10584312)
chr6 (68-265)||(25078555-25078755)
chr6 (68-265)||(22857950-22858152)
chr6 (83-145)||(13878727-13878788)
chr6 (83-145)||(13883475-13883536)
chr6 (83-145)||(16785919-16785980)
chr6 (83-145)||(26887345-26887406)
chr6 (83-145)||(31248835-31248896)
chr6 (83-145)||(35201447-35201508)
chr6 (69-201)||(28037794-28037927)
chr6 (83-145)||(3577636-3577696)
chr6 (86-145)||(17036058-17036116)
chr6 (86-145)||(17694972-17695030)
chr6 (18-78)||(32447502-32447563)
chr6 (68-182)||(7542465-7542581)
chr6 (68-143)||(11138423-11138499)
chr6 (68-226)||(20526922-20527081)
chr6 (90-145)||(12166267-12166321)
chr6 (86-145)||(22351973-22352031)
chr6 (21-75)||(1072067-1072121)
chr6 (86-143)||(19701985-19702041)
chr6 (89-145)||(25941650-25941704)
chr6 (86-145)||(13467585-13467642)
chr6 (86-145)||(22342922-22342980)
chr6 (86-145)||(26643179-26643237)
chr6 (86-145)||(26749145-26749203)
chr6 (86-145)||(33215830-33215888)
chr6 (127-227)||(30445699-30445801)
chr6 (18-79)||(13870608-13870669)
chr6 (146-265)||(25465588-25465710)
chr6 (95-145)||(5165936-5165985)
chr6 (201-263)||(5572270-5572334)
chr6 (21-58)||(17852612-17852649)
chr6 (201-263)||(21356040-21356104)
chr6 (18-50)||(8995546-8995578)
chr6 (89-145)||(25466020-25466075)
[»] chr7 (107 HSPs)
chr7 (18-265)||(38394028-38394277)
chr7 (18-265)||(20626080-20626329)
chr7 (18-265)||(20629971-20630220)
chr7 (18-265)||(20642390-20642639)
chr7 (18-265)||(20299501-20299751)
chr7 (18-265)||(35671-35920)
chr7 (18-265)||(44724621-44724870)
chr7 (18-265)||(48457695-48457944)
chr7 (18-265)||(7470020-7470269)
chr7 (18-265)||(7471978-7472227)
chr7 (18-265)||(18345583-18345832)
chr7 (18-265)||(40836741-40836989)
chr7 (18-265)||(1046923-1047171)
chr7 (18-265)||(1850023-1850272)
chr7 (18-265)||(3878619-3878868)
chr7 (26-265)||(27306228-27306469)
chr7 (18-265)||(3035763-3036015)
chr7 (18-265)||(1049294-1049542)
chr7 (21-265)||(20137107-20137353)
chr7 (18-265)||(44606-44855)
chr7 (18-265)||(40946370-40946619)
chr7 (18-265)||(43253515-43253763)
chr7 (46-265)||(7092211-7092431)
chr7 (18-265)||(13099472-13099723)
chr7 (18-265)||(24748636-24748886)
chr7 (18-265)||(20297404-20297653)
chr7 (18-265)||(443637-443887)
chr7 (18-265)||(31435044-31435294)
chr7 (18-265)||(28485608-28485856)
chr7 (18-265)||(4295932-4296182)
chr7 (18-211)||(11757271-11757465)
chr7 (22-265)||(21592141-21592386)
chr7 (18-265)||(25542572-25542819)
chr7 (18-265)||(9679101-9679350)
chr7 (21-265)||(28487598-28487844)
chr7 (20-265)||(42330995-42331244)
chr7 (22-265)||(21990196-21990441)
chr7 (54-265)||(38396713-38396925)
chr7 (18-265)||(11355300-11355549)
chr7 (18-265)||(31155909-31156158)
chr7 (18-265)||(39145984-39146234)
chr7 (46-265)||(7094458-7094678)
chr7 (18-265)||(21678108-21678357)
chr7 (20-265)||(9680863-9681111)
chr7 (18-265)||(37412123-37412375)
chr7 (22-265)||(7351650-7351895)
chr7 (18-254)||(21680069-21680307)
chr7 (18-265)||(42223199-42223449)
chr7 (18-251)||(7349285-7349520)
chr7 (20-244)||(27832651-27832878)
chr7 (18-200)||(25276183-25276365)
chr7 (18-251)||(24258505-24258744)
chr7 (82-265)||(2935374-2935559)
chr7 (18-169)||(26804611-26804765)
chr7 (82-265)||(1606486-1606670)
chr7 (82-265)||(22137184-22137368)
chr7 (82-265)||(40552211-40552395)
chr7 (18-265)||(24813495-24813742)
chr7 (18-227)||(24817391-24817597)
chr7 (82-265)||(9027192-9027376)
chr7 (82-265)||(22108173-22108357)
chr7 (82-265)||(40549933-40550117)
chr7 (65-227)||(20091585-20091745)
chr7 (20-225)||(22828672-22828878)
chr7 (18-225)||(7188584-7188789)
chr7 (21-200)||(22251611-22251786)
chr7 (130-265)||(22393876-22394014)
chr7 (127-265)||(26295598-26295739)
chr7 (68-265)||(24465629-24465828)
chr7 (68-265)||(6332311-6332513)
chr7 (18-93)||(18567655-18567730)
chr7 (68-265)||(16297019-16297222)
chr7 (106-200)||(6348912-6349006)
chr7 (83-145)||(8378625-8378686)
chr7 (67-145)||(2120881-2120960)
chr7 (46-121)||(22392534-22392606)
chr7 (83-145)||(3320171-3320232)
chr7 (83-145)||(3324919-3324980)
chr7 (83-145)||(7069780-7069841)
chr7 (83-145)||(7074787-7074848)
chr7 (83-145)||(25351353-25351414)
chr7 (83-145)||(25357047-25357108)
chr7 (83-145)||(25405393-25405454)
chr7 (83-145)||(25410130-25410191)
chr7 (83-145)||(42006663-42006724)
chr7 (86-145)||(30246973-30247031)
chr7 (86-145)||(44512646-44512704)
chr7 (68-265)||(11081598-11081802)
chr7 (83-145)||(15541116-15541177)
chr7 (68-145)||(11084467-11084544)
chr7 (86-134)||(44143997-44144045)
chr7 (86-145)||(34546984-34547042)
chr7 (71-176)||(40281466-40281572)
chr7 (220-265)||(11759373-11759418)
chr7 (68-145)||(26210631-26210710)
chr7 (83-145)||(21369642-21369703)
chr7 (46-145)||(6048941-6049039)
chr7 (201-263)||(46516339-46516403)
chr7 (229-265)||(26804765-26804801)
chr7 (220-263)||(14379861-14379904)
chr7 (220-263)||(43864369-43864412)
chr7 (83-121)||(12310160-12310198)
chr7 (86-131)||(7464652-7464697)
chr7 (201-263)||(29159807-29159871)
chr7 (201-260)||(55955-56015)
chr7 (202-263)||(9190038-9190101)
chr7 (202-263)||(20284093-20284156)
[»] chr3 (143 HSPs)
chr3 (18-265)||(4308277-4308526)
chr3 (18-265)||(25533454-25533703)
chr3 (18-265)||(42990316-42990565)
chr3 (21-265)||(43226100-43226346)
chr3 (18-265)||(18099166-18099415)
chr3 (19-265)||(1321492-1321740)
chr3 (21-265)||(43228306-43228552)
chr3 (18-265)||(10084385-10084634)
chr3 (18-265)||(38890052-38890301)
chr3 (18-261)||(18096900-18097145)
chr3 (18-265)||(30005853-30006102)
chr3 (18-265)||(1313421-1313670)
chr3 (18-265)||(10956023-10956272)
chr3 (18-265)||(11170416-11170665)
chr3 (18-265)||(45882951-45883201)
chr3 (18-265)||(4103892-4104140)
chr3 (22-265)||(9604603-9604848)
chr3 (18-265)||(27101177-27101426)
chr3 (18-265)||(5191665-5191912)
chr3 (28-265)||(7606584-7606822)
chr3 (18-265)||(10958319-10958568)
chr3 (18-265)||(22114301-22114550)
chr3 (18-265)||(51727003-51727251)
chr3 (18-265)||(53917660-53917909)
chr3 (18-265)||(3859540-3859788)
chr3 (18-265)||(10191306-10191554)
chr3 (18-265)||(43423459-43423708)
chr3 (18-227)||(29956698-29956907)
chr3 (32-265)||(5522623-5522857)
chr3 (18-265)||(25388918-25389166)
chr3 (18-265)||(1626679-1626928)
chr3 (18-265)||(746769-747018)
chr3 (18-265)||(3314696-3314946)
chr3 (21-265)||(5926760-5927006)
chr3 (18-265)||(18162675-18162924)
chr3 (18-265)||(26720560-26720808)
chr3 (18-265)||(43421411-43421660)
chr3 (18-265)||(51943383-51943631)
chr3 (18-265)||(53915492-53915741)
chr3 (18-265)||(458296-458545)
chr3 (18-265)||(880447-880697)
chr3 (18-265)||(10621526-10621775)
chr3 (21-263)||(32264035-32264281)
chr3 (18-265)||(28101998-28102247)
chr3 (60-260)||(25688161-25688364)
chr3 (20-265)||(36011841-36012088)
chr3 (18-265)||(455919-456168)
chr3 (18-265)||(6065792-6066041)
chr3 (18-265)||(28413028-28413277)
chr3 (18-265)||(50494011-50494260)
chr3 (20-265)||(53468449-53468699)
chr3 (18-265)||(6063442-6063691)
chr3 (18-265)||(24979719-24979969)
chr3 (18-265)||(47148891-47149140)
chr3 (19-265)||(6484372-6484621)
chr3 (18-265)||(48361667-48361916)
chr3 (28-265)||(32219106-32219346)
chr3 (18-265)||(38210382-38210631)
chr3 (18-265)||(39715481-39715726)
chr3 (18-255)||(889779-890018)
chr3 (67-265)||(5899734-5899932)
chr3 (18-265)||(12267971-12268210)
chr3 (21-265)||(15780886-15781140)
chr3 (40-265)||(51674762-51674989)
chr3 (18-222)||(6561822-6562028)
chr3 (70-265)||(11168165-11168362)
chr3 (67-265)||(5886261-5886459)
chr3 (46-265)||(4666554-4666775)
chr3 (18-261)||(35917944-35918194)
chr3 (18-265)||(42992298-42992531)
chr3 (32-263)||(53591210-53591442)
chr3 (18-265)||(54691570-54691819)
chr3 (18-265)||(28761423-28761673)
chr3 (54-265)||(6231849-6232061)
chr3 (18-171)||(35777433-35777587)
chr3 (24-265)||(17795280-17795520)
chr3 (24-265)||(19103720-19103960)
chr3 (18-257)||(13420189-13420427)
chr3 (18-158)||(28100146-28100286)
chr3 (79-265)||(27635654-27635830)
chr3 (18-158)||(28181034-28181174)
chr3 (18-265)||(23633471-23633714)
chr3 (84-265)||(3306839-3307021)
chr3 (18-265)||(31151360-31151606)
chr3 (18-265)||(25635396-25635643)
chr3 (28-200)||(54884177-54884348)
chr3 (18-265)||(561770-562019)
chr3 (133-265)||(47701667-47701801)
chr3 (28-154)||(28137415-28137541)
chr3 (18-183)||(23637038-23637200)
chr3 (21-194)||(1673990-1674160)
chr3 (18-257)||(36871304-36871544)
chr3 (18-227)||(53597251-53597458)
chr3 (124-265)||(24181498-24181643)
chr3 (50-200)||(4560355-4560497)
chr3 (18-98)||(41849164-41849244)
chr3 (68-264)||(1620457-1620657)
chr3 (190-265)||(41849243-41849320)
chr3 (68-201)||(14634504-14634638)
chr3 (149-265)||(25634030-25634149)
chr3 (83-145)||(10094195-10094256)
chr3 (83-145)||(10201075-10201136)
chr3 (83-145)||(10208121-10208182)
chr3 (83-145)||(16462203-16462264)
chr3 (83-145)||(22626105-22626166)
chr3 (83-145)||(47883003-47883064)
chr3 (199-265)||(35919111-35919179)
chr3 (86-145)||(10612899-10612957)
chr3 (86-145)||(29914074-29914132)
chr3 (86-145)||(47878292-47878350)
chr3 (86-145)||(54193229-54193287)
chr3 (83-145)||(10100212-10100273)
chr3 (18-110)||(24177291-24177380)
chr3 (211-265)||(53894053-53894109)
chr3 (83-131)||(6303310-6303358)
chr3 (18-74)||(11163162-11163218)
chr3 (50-93)||(7606830-7606873)
chr3 (86-145)||(10897008-10897066)
chr3 (86-145)||(20031439-20031497)
chr3 (86-145)||(27762107-27762165)
chr3 (86-145)||(54188512-54188570)
chr3 (83-143)||(38002869-38002928)
chr3 (83-145)||(5858546-5858605)
chr3 (86-145)||(10595155-10595213)
chr3 (68-145)||(11066652-11066731)
chr3 (95-145)||(4535626-4535675)
chr3 (87-145)||(10949381-10949438)
chr3 (83-145)||(11079517-11079578)
chr3 (83-145)||(27544273-27544334)
chr3 (68-121)||(13419941-13419994)
chr3 (18-110)||(25633935-25634024)
chr3 (203-255)||(28181185-28181238)
chr3 (68-108)||(7768632-7768672)
chr3 (18-58)||(27635832-27635872)
chr3 (220-263)||(3716042-3716085)
chr3 (95-145)||(11007633-11007683)
chr3 (201-263)||(1736324-1736388)
chr3 (201-263)||(18552902-18552966)
chr3 (201-263)||(30709809-30709873)
chr3 (68-108)||(31021300-31021341)
chr3 (18-58)||(6231461-6231501)
chr3 (229-265)||(42992611-42992647)
chr3 (18-54)||(47701804-47701840)
[»] chr4 (127 HSPs)
chr4 (18-265)||(8631417-8631666)
chr4 (18-265)||(22044389-22044637)
chr4 (20-265)||(24348306-24348553)
chr4 (18-265)||(22046684-22046932)
chr4 (18-265)||(37089370-37089618)
chr4 (32-265)||(17662243-17662478)
chr4 (21-265)||(14633408-14633653)
chr4 (18-265)||(40637160-40637409)
chr4 (18-265)||(6764925-6765179)
chr4 (21-265)||(22800860-22801106)
chr4 (22-265)||(9148343-9148587)
chr4 (18-265)||(11435041-11435289)
chr4 (18-265)||(24888882-24889131)
chr4 (18-265)||(38409291-38409539)
chr4 (18-265)||(40091413-40091662)
chr4 (18-265)||(47868487-47868736)
chr4 (18-265)||(47274813-47275060)
chr4 (18-265)||(24880537-24880787)
chr4 (18-265)||(2484871-2485119)
chr4 (18-265)||(22802732-22802981)
chr4 (18-265)||(48486405-48486654)
chr4 (18-265)||(51015332-51015580)
chr4 (19-265)||(22132390-22132636)
chr4 (18-265)||(24879075-24879325)
chr4 (18-265)||(36921491-36921741)
chr4 (22-265)||(5198510-5198755)
chr4 (18-265)||(26085975-26086223)
chr4 (18-265)||(7941407-7941658)
chr4 (18-265)||(11006235-11006484)
chr4 (18-265)||(31849597-31849846)
chr4 (18-265)||(38928175-38928425)
chr4 (18-264)||(12400806-12401054)
chr4 (18-206)||(5637524-5637712)
chr4 (18-265)||(36919582-36919832)
chr4 (18-265)||(33415486-33415734)
chr4 (18-265)||(11008566-11008813)
chr4 (18-264)||(12395844-12396092)
chr4 (18-265)||(18847239-18847487)
chr4 (18-265)||(22134616-22134862)
chr4 (18-206)||(3824629-3824817)
chr4 (18-265)||(19095968-19096218)
chr4 (18-265)||(14787427-14787678)
chr4 (18-265)||(44599836-44600085)
chr4 (18-265)||(53405216-53405468)
chr4 (18-265)||(22780371-22780620)
chr4 (18-265)||(22782736-22782985)
chr4 (18-265)||(9176472-9176721)
chr4 (18-265)||(16934141-16934390)
chr4 (18-265)||(18709162-18709410)
chr4 (18-243)||(13544045-13544272)
chr4 (21-254)||(16453398-16453634)
chr4 (18-265)||(9174144-9174393)
chr4 (18-265)||(16931787-16932036)
chr4 (21-259)||(56030533-56030770)
chr4 (18-265)||(619446-619694)
chr4 (18-265)||(36378378-36378628)
chr4 (45-265)||(16455354-16455577)
chr4 (18-259)||(47210756-47210987)
chr4 (18-265)||(37313063-37313313)
chr4 (21-265)||(41997581-41997827)
chr4 (18-265)||(19322782-19323030)
chr4 (18-265)||(36380435-36380685)
chr4 (18-265)||(27499131-27499377)
chr4 (127-265)||(5635474-5635614)
chr4 (126-265)||(11437557-11437697)
chr4 (80-265)||(13547302-13547489)
chr4 (109-265)||(4215483-4215641)
chr4 (18-265)||(18409345-18409594)
chr4 (18-227)||(18537512-18537719)
chr4 (74-265)||(2891433-2891627)
chr4 (18-265)||(38890222-38890470)
chr4 (18-184)||(52942540-52942693)
chr4 (21-158)||(3937316-3937453)
chr4 (18-265)||(18534829-18535077)
chr4 (22-265)||(8756248-8756493)
chr4 (20-265)||(30136640-30136885)
chr4 (18-150)||(6132958-6133090)
chr4 (67-265)||(12102221-12102424)
chr4 (67-227)||(31983565-31983727)
chr4 (133-265)||(5101130-5101263)
chr4 (68-265)||(28453818-28454019)
chr4 (66-200)||(15032614-15032748)
chr4 (68-265)||(25357772-25357978)
chr4 (71-227)||(3982214-3982374)
chr4 (83-265)||(16185832-16186018)
chr4 (18-94)||(24446755-24446831)
chr4 (152-227)||(24446679-24446754)
chr4 (180-265)||(47563009-47563096)
chr4 (68-198)||(40999017-40999148)
chr4 (18-96)||(38270155-38270233)
chr4 (68-265)||(9863842-9864048)
chr4 (68-200)||(47150959-47151092)
chr4 (83-145)||(7050378-7050439)
chr4 (83-145)||(11853549-11853610)
chr4 (68-144)||(10113003-10113080)
chr4 (200-265)||(14789426-14789495)
chr4 (86-145)||(4556180-4556238)
chr4 (86-145)||(4558314-4558372)
chr4 (86-145)||(8529270-8529328)
chr4 (86-145)||(15316961-15317019)
chr4 (86-145)||(18586969-18587027)
chr4 (86-145)||(31300427-31300485)
chr4 (83-145)||(55822265-55822326)
chr4 (86-145)||(15831144-15831202)
chr4 (86-145)||(16489352-16489410)
chr4 (86-145)||(16689061-16689119)
chr4 (86-145)||(25699752-25699810)
chr4 (83-145)||(4570094-4570155)
chr4 (18-68)||(5101083-5101133)
chr4 (83-145)||(36771396-36771457)
chr4 (154-265)||(49088791-49088906)
chr4 (86-145)||(13072102-13072160)
chr4 (83-145)||(5336903-5336964)
chr4 (86-131)||(4884877-4884922)
chr4 (229-265)||(3937272-3937308)
chr4 (201-262)||(6743444-6743507)
chr4 (229-265)||(52942486-52942522)
chr4 (86-145)||(47566496-47566554)
chr4 (213-263)||(54867188-54867239)
chr4 (83-121)||(4874623-4874661)
chr4 (68-110)||(10114463-10114505)
chr4 (83-145)||(36769479-36769540)
chr4 (201-263)||(5396700-5396764)
chr4 (220-265)||(6133127-6133172)
chr4 (201-263)||(10047383-10047447)
chr4 (201-263)||(39245998-39246062)
chr4 (127-155)||(38270120-38270148)
[»] chr2 (86 HSPs)
chr2 (18-265)||(45279982-45280231)
chr2 (18-265)||(19502009-19502258)
chr2 (18-265)||(23452235-23452484)
chr2 (18-265)||(19504344-19504592)
chr2 (18-265)||(27104807-27105054)
chr2 (21-265)||(42452794-42453037)
chr2 (18-265)||(21520691-21520940)
chr2 (18-265)||(42064523-42064772)
chr2 (18-265)||(40032051-40032305)
chr2 (20-265)||(19007650-19007897)
chr2 (22-265)||(42923507-42923752)
chr2 (52-265)||(43623578-43623793)
chr2 (18-265)||(13910043-13910291)
chr2 (18-265)||(6258815-6259062)
chr2 (15-265)||(6264146-6264399)
chr2 (18-265)||(22287334-22287583)
chr2 (58-265)||(5375344-5375552)
chr2 (18-265)||(35215584-35215833)
chr2 (25-265)||(17849132-17849374)
chr2 (18-265)||(11739557-11739807)
chr2 (18-265)||(35217961-35218210)
chr2 (18-265)||(34979575-34979826)
chr2 (18-265)||(24162221-24162459)
chr2 (18-265)||(28196645-28196892)
chr2 (18-265)||(17848451-17848697)
chr2 (18-227)||(45239015-45239223)
chr2 (18-265)||(14837281-14837525)
chr2 (20-253)||(28459200-28459435)
chr2 (21-265)||(44289065-44289312)
chr2 (82-265)||(36558862-36559047)
chr2 (82-265)||(36561139-36561324)
chr2 (18-184)||(15539556-15539722)
chr2 (21-265)||(31732774-31733009)
chr2 (82-265)||(45332179-45332364)
chr2 (18-265)||(18800311-18800557)
chr2 (18-265)||(22874142-22874388)
chr2 (21-265)||(3022174-3022429)
chr2 (124-265)||(22407452-22407595)
chr2 (65-223)||(11578150-11578309)
chr2 (18-265)||(17897243-17897489)
chr2 (68-257)||(20146613-20146806)
chr2 (136-260)||(7462950-7463077)
chr2 (66-265)||(40699429-40699633)
chr2 (146-265)||(22707749-22707872)
chr2 (18-167)||(38020210-38020349)
chr2 (18-107)||(22163106-22163194)
chr2 (176-265)||(22163020-22163111)
chr2 (67-265)||(37962939-37963137)
chr2 (145-265)||(23870951-23871073)
chr2 (18-83)||(22407591-22407656)
chr2 (65-195)||(27136195-27136326)
chr2 (53-152)||(38414194-38414291)
chr2 (83-200)||(20589763-20589881)
chr2 (68-265)||(35107351-35107553)
chr2 (83-145)||(2736205-2736266)
chr2 (83-145)||(17462436-17462497)
chr2 (83-145)||(20054886-20054947)
chr2 (83-145)||(22712637-22712698)
chr2 (83-145)||(22717346-22717407)
chr2 (83-145)||(39686983-39687044)
chr2 (83-145)||(45567409-45567470)
chr2 (68-200)||(43139432-43139564)
chr2 (83-131)||(38190997-38191045)
chr2 (86-145)||(12781342-12781400)
chr2 (68-145)||(17921754-17921833)
chr2 (86-145)||(17932637-17932695)
chr2 (86-145)||(17943540-17943598)
chr2 (86-145)||(27517760-27517818)
chr2 (83-145)||(2740941-2741002)
chr2 (20-65)||(5377629-5377674)
chr2 (67-200)||(15693958-15694094)
chr2 (69-121)||(27583483-27583535)
chr2 (86-145)||(37170873-37170931)
chr2 (83-145)||(28458949-28459011)
chr2 (83-145)||(39680045-39680106)
chr2 (67-143)||(26345661-26345738)
chr2 (86-145)||(30478997-30479055)
chr2 (83-131)||(20050156-20050204)
chr2 (220-263)||(17057369-17057412)
chr2 (220-263)||(17085352-17085395)
chr2 (68-143)||(35028632-35028707)
chr2 (82-143)||(10942634-10942696)
chr2 (82-143)||(10948503-10948565)
chr2 (220-262)||(17490149-17490191)
chr2 (68-143)||(7502975-7503052)
chr2 (201-263)||(14699036-14699100)
[»] chr1 (104 HSPs)
chr1 (18-265)||(15294834-15295083)
chr1 (18-265)||(51750071-51750320)
chr1 (18-265)||(2617548-2617797)
chr1 (20-265)||(47906304-47906551)
chr1 (18-265)||(28840712-28840960)
chr1 (18-265)||(31735521-31735770)
chr1 (18-265)||(10399828-10400077)
chr1 (19-265)||(17324636-17324884)
chr1 (18-265)||(15823578-15823827)
chr1 (18-265)||(24325695-24325944)
chr1 (18-265)||(46431706-46431956)
chr1 (18-265)||(50307546-50307796)
chr1 (18-265)||(39462551-39462800)
chr1 (18-265)||(39932105-39932355)
chr1 (18-265)||(6995700-6995949)
chr1 (18-265)||(51752397-51752644)
chr1 (18-265)||(2510325-2510573)
chr1 (18-265)||(12302505-12302754)
chr1 (18-265)||(13761869-13762117)
chr1 (18-265)||(20302491-20302739)
chr1 (18-265)||(27336940-27337187)
chr1 (18-265)||(27339131-27339379)
chr1 (18-265)||(41646952-41647201)
chr1 (18-265)||(38925481-38925727)
chr1 (18-265)||(6823047-6823295)
chr1 (18-265)||(13215113-13215367)
chr1 (18-227)||(21948228-21948436)
chr1 (18-265)||(20291489-20291737)
chr1 (18-265)||(28842527-28842775)
chr1 (18-265)||(14097969-14098219)
chr1 (18-265)||(16226199-16226448)
chr1 (18-265)||(18839619-18839869)
chr1 (18-265)||(11457475-11457724)
chr1 (18-265)||(18307141-18307390)
chr1 (18-265)||(47179745-47179993)
chr1 (18-265)||(50076672-50076921)
chr1 (18-265)||(16428685-16428935)
chr1 (18-265)||(28998253-28998502)
chr1 (18-265)||(29003969-29004218)
chr1 (21-265)||(2949232-2949477)
chr1 (18-206)||(48665209-48665398)
chr1 (18-265)||(9459417-9459666)
chr1 (18-265)||(9463244-9463493)
chr1 (18-265)||(31425015-31425268)
chr1 (18-265)||(3579617-3579865)
chr1 (18-265)||(4131375-4131628)
chr1 (18-265)||(25127904-25128154)
chr1 (18-265)||(47177394-47177642)
chr1 (18-265)||(6756559-6756809)
chr1 (18-265)||(9241085-9241335)
chr1 (26-265)||(50248570-50248813)
chr1 (18-265)||(17186127-17186377)
chr1 (18-265)||(25251274-25251524)
chr1 (18-265)||(50078820-50079070)
chr1 (18-265)||(31489947-31490193)
chr1 (26-265)||(17324103-17324345)
chr1 (18-265)||(28207068-28207315)
chr1 (18-265)||(17318925-17319168)
chr1 (53-265)||(25248551-25248766)
chr1 (78-265)||(51757623-51757811)
chr1 (20-265)||(40133978-40134226)
chr1 (82-265)||(23785935-23786120)
chr1 (71-265)||(16429042-16429239)
chr1 (53-265)||(16231630-16231843)
chr1 (47-265)||(16432455-16432677)
chr1 (18-265)||(31422860-31423123)
chr1 (18-261)||(47451680-47451919)
chr1 (18-265)||(42922265-42922513)
chr1 (18-184)||(6823917-6824090)
chr1 (18-265)||(14183590-14183838)
chr1 (127-265)||(23816027-23816167)
chr1 (66-265)||(6115102-6115304)
chr1 (18-227)||(15669433-15669640)
chr1 (64-252)||(8347284-8347476)
chr1 (67-253)||(49495222-49495411)
chr1 (65-227)||(18800612-18800775)
chr1 (20-200)||(8349119-8349296)
chr1 (68-226)||(30738668-30738830)
chr1 (65-265)||(16561545-16561750)
chr1 (66-264)||(30790401-30790602)
chr1 (66-224)||(13125500-13125660)
chr1 (68-265)||(26613238-26613440)
chr1 (68-145)||(155788-155865)
chr1 (191-265)||(13358778-13358854)
chr1 (66-174)||(26520206-26520321)
chr1 (83-145)||(2232597-2232658)
chr1 (160-265)||(15916564-15916673)
chr1 (86-145)||(2401342-2401400)
chr1 (86-145)||(9526469-9526527)
chr1 (86-145)||(21353467-21353525)
chr1 (86-145)||(25134074-25134132)
chr1 (83-145)||(4144804-4144865)
chr1 (68-265)||(27916576-27916779)
chr1 (68-200)||(28279346-28279480)
chr1 (86-145)||(9521718-9521776)
chr1 (68-143)||(26332613-26332688)
chr1 (72-237)||(43104245-43104414)
chr1 (68-145)||(14353047-14353126)
chr1 (86-144)||(2393404-2393461)
chr1 (46-110)||(26332719-26332781)
chr1 (83-145)||(14997040-14997101)
chr1 (201-263)||(9476265-9476329)
chr1 (237-265)||(13447273-13447301)
chr1 (202-263)||(47102871-47102934)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (21-265)||(3874101-3874347)
chr8 (18-265)||(608822-609071)
chr8 (18-265)||(28251565-28251814)
chr8 (28-265)||(43530213-43530452)
chr8 (18-265)||(14807839-14808098)
chr8 (18-265)||(27829385-27829633)
chr8 (18-265)||(22684651-22684903)
chr8 (18-265)||(15809307-15809555)
chr8 (18-265)||(27827074-27827322)
chr8 (18-265)||(32339397-32339646)
chr8 (21-265)||(30480501-30480747)
chr8 (18-265)||(27106895-27107144)
chr8 (18-265)||(28283219-28283466)
chr8 (22-265)||(44720935-44721180)
chr8 (18-265)||(15068069-15068318)
chr8 (20-265)||(15072800-15073048)
chr8 (18-265)||(27911102-27911350)
chr8 (18-265)||(27957521-27957769)
chr8 (18-265)||(18810796-18811044)
chr8 (18-265)||(14419188-14419438)
chr8 (18-265)||(43079690-43079939)
chr8 (18-265)||(4424106-4424355)
chr8 (28-265)||(18812980-18813218)
chr8 (18-265)||(1225254-1225504)
chr8 (20-265)||(43082063-43082310)
chr8 (18-265)||(41384832-41385081)
chr8 (18-265)||(13858482-13858731)
chr8 (18-265)||(36865626-36865874)
chr8 (18-265)||(24873179-24873428)
chr8 (18-265)||(5372174-5372425)
chr8 (18-265)||(41382761-41382999)
chr8 (20-265)||(15956051-15956295)
chr8 (18-265)||(21482402-21482648)
chr8 (23-265)||(25952613-25952858)
chr8 (18-257)||(21480594-21480832)
chr8 (20-265)||(15185712-15185955)
chr8 (18-174)||(14477364-14477520)
chr8 (18-260)||(33541413-33541635)
chr8 (64-265)||(31162343-31162550)
chr8 (68-265)||(3005628-3005829)
chr8 (53-201)||(181622-181772)
chr8 (68-265)||(31578274-31578476)
chr8 (18-148)||(37214317-37214438)
chr8 (65-265)||(31035252-31035458)
chr8 (18-121)||(5622882-5622985)
chr8 (18-107)||(26775289-26775378)
chr8 (136-265)||(2468127-2468259)
chr8 (18-94)||(35872554-35872630)
chr8 (152-227)||(35872478-35872553)
chr8 (68-197)||(31573794-31573924)
chr8 (83-145)||(9021228-9021289)
chr8 (83-145)||(16752643-16752704)
chr8 (83-145)||(16757388-16757449)
chr8 (83-145)||(28327908-28327969)
chr8 (83-145)||(28895502-28895563)
chr8 (86-145)||(590797-590855)
chr8 (86-145)||(33032657-33032715)
chr8 (83-145)||(4812608-4812669)
chr8 (83-145)||(28332631-28332692)
chr8 (86-143)||(29554908-29554964)
chr8 (86-145)||(3276347-3276405)
chr8 (210-265)||(37214262-37214319)
chr8 (65-110)||(2468261-2468306)
chr8 (83-131)||(17799558-17799606)
chr8 (68-145)||(17847661-17847740)
chr8 (83-145)||(13985199-13985262)
chr8 (18-102)||(31035157-31035238)
chr8 (86-134)||(23179692-23179740)
chr8 (220-263)||(12702634-12702677)
chr8 (68-145)||(3895957-3896035)
chr8 (68-144)||(13985933-13986011)
chr8 (83-145)||(21033870-21033930)
chr8 (83-144)||(26268354-26268412)
chr8 (83-145)||(30423212-30423274)
chr8 (201-263)||(23799606-23799670)
chr8 (202-263)||(19752424-19752487)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (18-265)||(41481-41730)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (18-265)||(14380-14629)
scaffold0131 (18-265)||(15060-15309)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (18-265)||(69290-69538)
scaffold0025 (18-81)||(73207-73270)
scaffold0025 (42-92)||(73160-73210)
[»] chr5 (97 HSPs)
chr5 (18-265)||(6745101-6745349)
chr5 (18-265)||(658354-658600)
chr5 (18-265)||(2174951-2175199)
chr5 (26-265)||(10529097-10529338)
chr5 (18-265)||(21948058-21948307)
chr5 (18-265)||(38882138-38882386)
chr5 (18-255)||(4236661-4236900)
chr5 (18-265)||(18469043-18469290)
chr5 (18-265)||(18466716-18466965)
chr5 (18-265)||(25921471-25921720)
chr5 (18-265)||(27910482-27910731)
chr5 (18-265)||(39854515-39854764)
chr5 (18-265)||(25804057-25804305)
chr5 (18-265)||(18511210-18511459)
chr5 (18-265)||(16776190-16776438)
chr5 (18-265)||(27912568-27912817)
chr5 (21-265)||(6747341-6747585)
chr5 (20-265)||(2818333-2818581)
chr5 (18-265)||(10474321-10474570)
chr5 (18-265)||(18509316-18509565)
chr5 (18-265)||(34477051-34477301)
chr5 (18-265)||(40221554-40221804)
chr5 (18-262)||(18596677-18596924)
chr5 (20-265)||(1189605-1189854)
chr5 (18-265)||(16092197-16092447)
chr5 (18-265)||(26097765-26098012)
chr5 (64-265)||(20505841-20506042)
chr5 (18-265)||(34479416-34479666)
chr5 (18-265)||(31545112-31545361)
chr5 (18-265)||(21684450-21684698)
chr5 (18-265)||(25904135-25904384)
chr5 (32-265)||(695924-696159)
chr5 (21-265)||(17818490-17818734)
chr5 (18-265)||(17072915-17073165)
chr5 (18-265)||(31179369-31179618)
chr5 (18-265)||(24126888-24127137)
chr5 (18-265)||(15552277-15552526)
chr5 (18-265)||(31542767-31543015)
chr5 (53-265)||(4410090-4410303)
chr5 (18-265)||(36402326-36402575)
chr5 (28-265)||(10586873-10587113)
chr5 (18-265)||(31472610-31472860)
chr5 (53-265)||(41585742-41585956)
chr5 (18-265)||(37705778-37706027)
chr5 (18-260)||(39397996-39398240)
chr5 (20-264)||(6756528-6756772)
chr5 (18-265)||(2954448-2954697)
chr5 (65-265)||(39798126-39798328)
chr5 (82-265)||(10749796-10749981)
chr5 (48-265)||(2723964-2724174)
chr5 (18-265)||(31465987-31466225)
chr5 (18-200)||(34530731-34530913)
chr5 (18-265)||(21288796-21289042)
chr5 (82-265)||(23665140-23665324)
chr5 (82-265)||(23793263-23793447)
chr5 (82-265)||(3373135-3373320)
chr5 (82-265)||(10757273-10757457)
chr5 (82-265)||(15354573-15354757)
chr5 (67-265)||(36208656-36208857)
chr5 (21-265)||(12555921-12556167)
chr5 (82-265)||(15356849-15357033)
chr5 (82-265)||(38960130-38960314)
chr5 (18-148)||(20045042-20045172)
chr5 (67-228)||(9020299-9020461)
chr5 (99-265)||(23741857-23742023)
chr5 (18-144)||(20043082-20043208)
chr5 (18-265)||(6661182-6661430)
chr5 (18-121)||(26098395-26098498)
chr5 (68-227)||(17413204-17413365)
chr5 (68-265)||(15143547-15143749)
chr5 (66-265)||(20053923-20054118)
chr5 (176-265)||(26098286-26098378)
chr5 (112-201)||(42770936-42771025)
chr5 (82-265)||(23667415-23667599)
chr5 (83-145)||(1170811-1170872)
chr5 (83-145)||(35385573-35385634)
chr5 (86-145)||(25452498-25452556)
chr5 (83-145)||(2298122-2298183)
chr5 (88-145)||(25445501-25445557)
chr5 (160-265)||(15445264-15445372)
chr5 (86-200)||(4897828-4897943)
chr5 (86-145)||(28786407-28786465)
chr5 (83-145)||(1240428-1240489)
chr5 (65-154)||(42770847-42770934)
chr5 (86-145)||(11962554-11962612)
chr5 (86-145)||(17841370-17841428)
chr5 (86-145)||(22672837-22672895)
chr5 (68-145)||(4754235-4754312)
chr5 (83-144)||(16093413-16093473)
chr5 (68-227)||(2144600-2144763)
chr5 (229-265)||(20043235-20043271)
chr5 (20-68)||(20507659-20507707)
chr5 (82-145)||(32520533-32520597)
chr5 (68-145)||(35430259-35430338)
chr5 (83-145)||(31782578-31782639)
chr5 (68-121)||(34033714-34033768)
chr5 (89-143)||(40222769-40222822)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (18-265)||(79226-79475)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (21-265)||(183639-183884)
scaffold0005 (18-265)||(52052-52303)
scaffold0005 (200-265)||(50235-50304)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (18-265)||(4038-4285)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (18-265)||(11471-11720)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (44-265)||(1451-1673)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (18-264)||(2921-3168)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (18-265)||(6240-6489)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (18-265)||(29212-29460)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (18-265)||(82-331)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (18-227)||(2083-2291)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (18-265)||(79900-80149)
scaffold0004 (83-145)||(188363-188424)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (18-157)||(35680-35819)
scaffold0011 (200-265)||(35817-35884)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (18-265)||(15818-16066)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (82-265)||(22221-22405)
scaffold0140 (82-265)||(24496-24680)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (18-265)||(85271-85521)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (66-265)||(1639-1842)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (18-200)||(16716-16895)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (68-183)||(4901-5016)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (83-145)||(224819-224880)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (86-145)||(16328-16386)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (226-265)||(1449-1488)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (211-265)||(4677-4733)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (86-145)||(17107-17165)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (18-98)||(993-1078)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 85)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11983276 - 11983027
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11983276 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 11983177  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11983176 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 11983077  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983076 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 11983027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28241568 - 28241319
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28241568 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 28241469  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241468 agaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 28241369  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28241368 tgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaat 28241319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1230496 - 1230247
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  1230496 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattgga 1230397  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  1230396 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggc 1230297  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230296 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 1230247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14459012 - 14458765
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14459012 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 14458915  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14458914 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggc 14458815  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458814 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 14458765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4816478 - 4816229
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4816478 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 4816379  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  4816378 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggc 4816279  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816278 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 4816229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14507422 - 14507174
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14507422 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 14507323  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14507322 agaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggc 14507224  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507223 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 14507174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 30967270 - 30967517
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30967270 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 30967369  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctg 219  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30967370 aggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctg 30967469  T
Q  220 ctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967470 ctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 30967517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30034847 - 30034601
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  30034847 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaaga 30034748  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30034747 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgc 30034648  T
Q  221 tctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034647 tctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 30034601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 9019993 - 9020242
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  9019993 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatagga 9020092  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9020093 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggc 9020192  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020193 tgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 9020242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 26065056 - 26065297
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26065056 gtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 26065152  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  26065153 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgc 26065251  T
Q  221 tctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065252 tctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 26065297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 26085025 - 26085266
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26085025 gtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 26085121  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  26085122 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgc 26085220  T
Q  221 tctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085221 tctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 26085266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 13057261 - 13057511
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13057261 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacggga 13057360  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13057361 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaggg 13057460  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    || ||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13057461 ctactctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaat 13057511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2629132 - 2628884
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2629132 agggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 2629033  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2629032 agagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggc 2628934  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2628933 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaat 2628884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3632185 - 3631937
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  3632185 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaa 3632086  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3632085 agagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaggg 3631986  T
Q  217 ctgctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631985 ctgctctgtcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 3631937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19704816 - 19704565
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19704816 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 19704717  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct-tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagg 215  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || |||||    
T  19704716 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagg 19704617  T
Q  216 gctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704616 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 19704565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30729074 - 30728822
Alignment:
Q  19 gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaa 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30729074 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaa 30728975  T
Q  119 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga----tttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggag 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||| || |||||||||  ||||||| | ||||     
T  30728974 gaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaa 30728875  T
Q  215 ggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30728874 ggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 30728822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Original strand, 13039822 - 13040071
Alignment:
Q  19 gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaa 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13039822 gggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaa 13039921  T
Q  119 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||  || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13039922 gagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggc 13040021  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13040022 tgctctctcccctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaat 13040071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3630111 - 3629863
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3630111 agggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggga 3630012  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| || |||||||||| | ||||||    
T  3630011 agagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggc 3629912  T
Q  218 tgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629911 tgctctctccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 3629863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15532928 - 15532680
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  15532928 agggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatggga 15532829  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15532828 agagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 15532729  T
Q  218 tgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  15532728 tgctctatccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaat 15532680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20915599 - 20915354
Alignment:
Q  22 tttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaaga 120  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20915599 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaaga 20915500  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20915499 gattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 20915401  T
Q  221 tctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915400 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20915354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 3390446 - 3390696
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  3390446 agggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaa 3390545  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  3390546 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggaggg 3390645  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || | |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3390646 ctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaat 3390696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 32280063 - 32280313
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32280063 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 32280162  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatc-atatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||| || |||||||    
T  32280163 agagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggaggg 32280262  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32280263 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaat 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15541387 - 15541138
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  15541387 agggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgaga 15541288  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||  ||    
T  15541287 agagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagc 15541188  T
Q  218 tgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15541187 tgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaat 15541138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12195762 - 12195515
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12195762 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 12195663  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  12195662 aagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 12195564  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12195563 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15530369 - 15530166
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15530369 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 15530270  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15530269 agagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 15530171  T
Q  218 tgctc 222  Q
    |||||    
T  15530170 tgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 25477341 - 25477598
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  25477341 agggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaa 25477440  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaa-------cgttactcatca-tatagtgaat 209  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||       |||||||||||| |||||||||     
T  25477441 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaa 25477540  T
Q  210 cggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    | ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25477541 cagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaat 25477598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273214
Alignment:
Q  50 aacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 148  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  149 gagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttgga 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 5273233  T
Q  247 ccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5273232 ccgaactgggtcaacaaat 5273214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26932809 - 26932560
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26932809 agggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 26932710  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  26932709 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 26932611  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     ||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26932610 ttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 26932560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3233976 - 3233739
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaa 118  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3233976 ggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 3233877  T
Q  119 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggct 218  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  3233876 gagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggct 3233777  T
Q  219 gctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactg 254  Q
    |||||||  || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  3233776 gctctctcccccacactaggtcaattttgaccgaactg 3233739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066122
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26066209  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066208 tttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 26066122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12161802 - 12161556
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12161802 agggtttgtatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacggga 12161705  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || |||||| |||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||| |||    
T  12161704 agagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggc 12161605  T
Q  218 tgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  12161604 tgttctctccctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaat 12161556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24338695 - 24338446
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggt-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  24338695 agggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatgga 24338596  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagg 215  Q
    |||||  |  |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24338595 aagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagg 24338496  T
Q  216 gctgctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24338495 gctgctctcccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaat 24338446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 71 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069716
Alignment:
Q  71 attcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccat 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  171 tgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaat 1069716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068393
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26068480  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068479 tttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 26068393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19227655 - 19227515
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19227655 agggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 19227556  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 158  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227555 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 19227515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 15719713 - 15719960
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||   | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  15719713 agggtttgtatagagtttgctt-ttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatggga 15719808  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  15719809 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagag 15719908  T
Q  217 ctgctct---ctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     ||||||   | || | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15719909 ttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaat 15719960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309172
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 33309085  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33309086 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 33309172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754707
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc- 29754794  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29754793 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 29754707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311441
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 33311354  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc--tctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33311355 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 33311441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3028098 - 3027895
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  3028098 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtga 3028002  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  3028001 agagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggg 3027902  T
Q  217 ctgctct 223  Q
    |||||||    
T  3027901 ctgctct 3027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466640
Alignment:
Q  28 tagagtttgtttctttggaacaaacactagg-ttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 126  Q
    |||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgc--tct 223  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||||| |||| | ||||  | |    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgttt 14466598  T
Q  224 ctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14466599 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaat 14466640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 265
Target Start/End: Original strand, 15367129 - 15367348
Alignment:
Q  46 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||  ||  |||||||||| |||||      
T  15367129 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaat 15367225  T
Q  146 cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct---cctagactaggtcaatt 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||   || ||||||||||||||    
T  15367226 cgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtcaatt 15367325  T
Q  243 tggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  15367326 tggaccgaactgggtaaacaaat 15367348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 22490707 - 22490889
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22490707 agggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaa 22490806  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  22490807 agagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186069
Alignment:
Q  67 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  166 cccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct-cct-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 262  Q
    | ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  263 aat 265  Q
    |||    
T  12186071 aat 12186069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16455625 - 16455422
Alignment:
Q  66 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16455625 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 16455526  T
Q  166 cccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 261  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  || | ||||||||| | ||||||||||||| || |||    
T  16455525 ccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaac 16455426  T
Q  262 aaat 265  Q
    ||||    
T  16455425 aaat 16455422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 200
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945393
Alignment:
Q  66 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgta 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  165 acccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 26945393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346663
Alignment:
Q  126 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct 225  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctct 15346621  T
Q  226 --cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15346622 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaat 15346663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 17012110 - 17012287
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  17012110 agggtttgtataaagtttgct-cttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgaga 17012206  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatc 198  Q
    ||||  ||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  17012207 agagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 19696556 - 19696758
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || | |||||  || |||||||| ||||||||||   | ||||||||| ||||||     
T  19696556 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaat 19696655  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctg--ctctctcctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 262  Q
    || ||||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||| | | ||  ||||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  19696656 cctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 19696755  T
Q  263 aat 265  Q
    |||    
T  19696756 aat 19696758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 265
Target Start/End: Original strand, 10584233 - 10584312
Alignment:
Q  189 gttactcatcat-atagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10584233 gttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaat 10584312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078555
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||  || || |||  |||||||||||   || |||||||| |||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat-atagtgaatcggagggctgctctct-cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    || ||||| ||||||||| || ||||||| |||| | |||| | |||||| ||||| ||| || || |||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttcccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 25078557  T
Q  264 at 265  Q
    ||    
T  25078556 at 25078555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22858152 - 22857950
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||| |||||| |||||   | ||||| ||| |||||||    
T  22858152 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaac 22858053  T
Q  167 cc-attgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 261  Q
    ||  ||||| | || |||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||| || |||    
T  22858052 ccttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaac 22857954  T
Q  262 aaat 265  Q
    ||||    
T  22857953 aaat 22857950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878788
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13878788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883536
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13883536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16785980
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16785980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887345
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037794
Alignment:
Q  69 tgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttatttttgtaacc 167  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||| || ||  || |||||||||||||||||||    | | |||||| ||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  168 cattgatttctcttttgcaacgttactcatcata 201  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 28037794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694972
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 32447563 - 32447502
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactag-gttttgagggttgattcacct 78  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32447563 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542465
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaa 165  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  166 cccattgatttctcttt 182  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  7542481 ccctttgatatctcttt 7542465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527081
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  |  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||| |||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 20527021  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctc 226  Q
    |  ||||| |||| |||| || |||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  20527022 cttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  90 attaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 1072121 - 1072067
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattca 75  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  1072121 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701985
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941704
Alignment:
Q  89 tattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467585
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342922
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattagg 22342922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643237
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattagg 26643237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749203
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattagg 26749203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33215888
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33215830 cactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggac-ttggatagaattagg 33215888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 227
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445801
Alignment:
Q  127 gactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctc 224  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctc 30445798  T
Q  225 tcc 227  Q
    |||    
T  30445799 tcc 30445801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 13870669 - 13870608
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 79  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13870669 agggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465588
Alignment:
Q  146 cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat-atagtgaatcggagggctgctctctc--ctagactaggtcaat- 241  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||  | | |||| |||| |     
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  242 ttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaat 25465588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5165985 - 5165936
Alignment:
Q  95 gattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  5165985 gattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 5572270 - 5572334
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  5572270 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 58
Target Start/End: Original strand, 17852612 - 17852649
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactagg 58  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17852612 gtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagg 17852649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356040
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 8995546 - 8995578
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaa 50  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8995546 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25466075 - 25466020
Alignment:
Q  89 tattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||| |||||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25466075 tattaggattgagtctcttaatcacggaaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25466020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 107)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 38394028 - 38394277
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38394028 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 38394127  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38394128 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 38394227  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394228 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 38394277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 20626080 - 20626329
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20626080 agggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 20626179  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20626180 agaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 20626279  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626280 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20626329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 20629971 - 20630220
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20629971 agggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 20630070  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20630071 agaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 20630170  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630171 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20630220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 20642390 - 20642639
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20642390 agggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 20642489  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20642490 agaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 20642589  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642590 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20642639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 20299501 - 20299751
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactagg-ttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20299501 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 20299600  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20299601 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggg 20299700  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299701 ttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20299751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 35671 - 35920
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35671 agggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacggga 35770  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  35771 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagc 35870  T
Q  218 tgc--tctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35871 tgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaat 35920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 44724621 - 44724870
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  44724621 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaga 44724720  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44724721 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 44724820  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724821 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 44724870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 48457695 - 48457944
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48457695 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 48457794  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  48457795 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 48457894  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457895 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 48457944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7470269 - 7470020
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7470269 agggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 7470170  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7470169 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 7470070  T
Q  218 tgct--ctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470069 tgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 7470020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7472227 - 7471978
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7472227 agggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 7472128  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7472127 agaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggc 7472028  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472027 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 7471978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 18345583 - 18345832
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18345583 agggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtga 18345682  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18345683 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggc 18345782  T
Q  218 tg--ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18345783 tgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaat 18345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40836989 - 40836741
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40836989 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 40836890  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40836889 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggc 40836791  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836790 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 40836741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1047171 - 1046923
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1047171 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 1047072  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  1047071 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggc 1046973  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1046972 tgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 1046923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 1850023 - 1850272
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  1850023 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacggga 1850122  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1850123 agaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 1850222  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850223 tgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 1850272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 3878619 - 3878868
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3878619 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 3878718  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3878719 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 3878818  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3878819 tgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaat 3878868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27306469 - 27306228
Alignment:
Q  26 tatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctg 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306469 tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 27306370  T
Q  126 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27306369 ggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct 27306270  T
Q  226 --cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27306269 cccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 27306228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 3035763 - 3036015
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3035763 agggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 3035862  T
Q  118 ag---aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggag 214  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  3035863 agaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggag 3035962  T
Q  215 ggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035963 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 3036015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1049542 - 1049294
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1049542 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacggga 1049443  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  1049442 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggc 1049344  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049343 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 1049294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20137353 - 20137107
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20137353 gtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaaga 20137254  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20137253 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctg 20137154  T
Q  220 ctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137153 ctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20137107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 44606 - 44855
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44606 agggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacggga 44705  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  44706 agaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagc 44805  T
Q  218 tgc--tctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806 tgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 44855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 40946370 - 40946619
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40946370 agggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacggga 40946469  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40946470 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggc 40946569  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946570 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 40946619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43253763 - 43253515
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  43253763 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaa 43253665  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43253664 agaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggc 43253565  T
Q  218 tgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43253564 tgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaat 43253515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 46 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092211
Alignment:
Q  46 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  146 cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-cctagactaggtcaatttg 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttg 7092232  T
Q  245 gaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7092231 gaccgaactgggtcaacaaat 7092211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13099723 - 13099472
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099723 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 13099624  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-ttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagg 215  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13099623 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagg 13099524  T
Q  216 gctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099523 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 13099472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 24748636 - 24748886
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24748636 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccggga 24748735  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24748736 agagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaggg 24748835  T
Q  217 ctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24748836 ctgctctctcctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaat 24748886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 20297404 - 20297653
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20297404 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 20297503  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  20297504 agagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggc 20297603  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20297604 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaat 20297653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 443637 - 443887
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  443637 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggga 443736  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  443737 agagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggc 443836  T
Q  218 tgctctctccta---gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443837 tgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 443887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31435294 - 31435044
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31435294 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 31435195  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  31435194 agaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggg 31435095  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31435094 ctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaat 31435044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 28485608 - 28485856
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  28485608 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaga 28485707  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  28485708 agagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggt 28485807  T
Q  218 tgctctctcct-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485808 tgctctctcctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 28485856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4296182 - 4295932
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4296182 agggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 4296083  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  4296082 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagaggg 4295983  T
Q  217 ctgc--tctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4295982 ctgctatctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaat 4295932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 11757271 - 11757465
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactagg-ttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11757271 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 11757370  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11757371 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 11757465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21592386 - 21592141
Alignment:
Q  22 tttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21592386 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagag 21592287  T
Q  122 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 221  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21592286 attgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 21592187  T
Q  222 ctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592186 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 21592141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 25542572 - 25542819
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  25542572 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggttacagga 25542670  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25542671 agagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagc 25542769  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25542770 tgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaat 25542819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 9679101 - 9679350
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  9679101 agggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggttt-gaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtg 9679199  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||      
T  9679200 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagta 9679299  T
Q  217 ctgctctc--tcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9679300 ctgctctctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaat 9679350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 28487598 - 28487844
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28487598 gtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaaga 28487697  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28487698 gattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgc 28487797  T
Q  221 tctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28487798 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaat 28487844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 42331244 - 42330995
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtt--acggga 117  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  42331244 ggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacggga 42331145  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42331144 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggc 42331045  T
Q  218 --tgctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
      | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331044 tattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 42330995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 21990196 - 21990441
Alignment:
Q  22 tttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21990196 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagag 21990295  T
Q  122 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 221  Q
      || | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  21990296 attgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgct 21990395  T
Q  222 ctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990396 ctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 21990441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396925
Alignment:
Q  54 ctaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  154 ttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  252 ctgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaat 38396925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 11355300 - 11355549
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  11355300 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagga 11355399  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| | | ||| ||    
T  11355400 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagc 11355499  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355500 tgctctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 11355549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31156158 - 31155909
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31156158 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacggg 31156059  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  31156058 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcctatagtggattggaggg 31155960  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31155959 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 31155909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 39146234 - 39145984
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39146234 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacggga 39146135  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  39146134 agagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgggggg 39146035  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39146034 ctgctcttttccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaat 39145984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094458
Alignment:
Q  46 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  146 cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaattt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 7094480  T
Q  244 ggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  7094479 ggactgaactgggtcaataaat 7094458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 21678108 - 21678357
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21678108 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaga 21678207  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||||||||||| | | ||||    
T  21678208 agatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggc 21678307  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21678308 tgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaat 21678357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 9680863 - 9681111
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaa 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9680863 ggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 9680962  T
Q  119 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggct 218  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9680963 gagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggct 9681062  T
Q  219 gctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  9681063 gctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaat 9681111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37412375 - 37412123
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  37412375 agggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagg 37412276  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-ttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||     
T  37412275 aagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggat 37412176  T
Q  215 ggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37412175 ggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaat 37412123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7351895 - 7351650
Alignment:
Q  22 tttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaaga 120  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7351895 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 7351796  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7351795 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 7351697  T
Q  221 tctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||  || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7351696 tctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 7351650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 254
Target Start/End: Original strand, 21680069 - 21680307
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  21680069 agggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccgga 21680168  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  21680169 agagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagc 21680268  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactg 254  Q
    ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680269 tgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactg 21680307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 42223199 - 42223449
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42223199 agggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 42223298  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  |||  |||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  42223299 aagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatgg 42223398  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42223399 ctgctctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaat 42223449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7349520 - 7349285
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7349520 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 7349421  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  7349420 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 7349322  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaa 251  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||    
T  7349321 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27832878 - 27832651
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27832878 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 27832779  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggct 218  Q
    ||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  27832778 agattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggct 27832679  T
Q  219 gctctct--cctagactaggtcaatttg 244  Q
     ||||||  || ||||||||||||||||    
T  27832678 tctctctcccccagactaggtcaatttg 27832651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 25276183 - 25276365
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25276183 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 25276282  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  25276283 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 25276365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 24258505 - 24258744
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24258505 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 24258604  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca----tatagtgaatcgga 213  Q
    | ||  || |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    ||||||| | ||||    
T  24258605 aaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacgga 24258704  T
Q  214 gggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaa 251  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  24258705 gggctgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaa 24258744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935559
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 2935472  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2935473 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 2935559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 26804611 - 26804765
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactag---gttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26804611 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacg 26804710  T
Q  115 ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26804711 ggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606670
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 1606583  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1606584 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaat 1606670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137368
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 22137281  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22137282 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 22137368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552395
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 40552308  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40552309 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 40552395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24813742 - 24813495
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24813742 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtctcttggtgacggga 24813647  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| || ||||||||||| ||||||| | |||| ||    
T  24813646 agtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattatagtggagcggatgg 24813547  T
Q  217 ctgc--tctctcctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||  |||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  24813546 ctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 24813495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24817597 - 24817391
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24817597 agggtttgtatagagtttgct-ctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacggga 24817502  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| ||    
T  24817501 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgg 24817402  T
Q  217 ctgctctctcc 227  Q
    |||||||||||    
T  24817401 ctgctctctcc 24817391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027192
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 9027279  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9027278 tttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 9027192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108357
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 22108270  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22108271 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 22108357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550117
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 40550030  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40550031 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 40550117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20091745 - 20091585
Alignment:
Q  65 gggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20091745 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 20091646  T
Q  165 acccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 227  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  20091645 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctctcc 20091585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22828878 - 22828672
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||   ||||||||||||  ||||| ||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22828878 ggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaag 22828779  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggct 218  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| | ||||||||| | |||||||    
T  22828778 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggct 22828679  T
Q  219 gctctct 225  Q
    |||||||    
T  22828678 gctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 7188584 - 7188789
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7188584 agggtttgtatagggtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 7188680  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    | ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| ||||||| | |||| ||    
T  7188681 atagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaagg 7188780  T
Q  217 ctgctctct 225  Q
    |||||||||    
T  7188781 ctgctctct 7188789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22251786 - 22251611
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22251786 gtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaaga 22251695  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga----tttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    |  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  22251694 gattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcat 22251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 265
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394014
Alignment:
Q  130 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctg--ctctctc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||| |    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  227 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaat 22394014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 127 - 265
Target Start/End: Original strand, 26295598 - 26295739
Alignment:
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||    
T  26295598 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctct 26295697  T
Q  226 cct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  26295698 cctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaat 26295739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 24465629 - 24465828
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 167  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||     
T  24465629 ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaact 24465728  T
Q  168 cattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 264  Q
    ||||||| | ||||||| || | ||||||||| |||| |||| |||  | |||||||||  || ||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||    
T  24465729 cattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcccccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaa 24465827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332513
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-gggagacttatttttgtaac 166  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaac 6332410  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctg--ctctctcctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 262  Q
    || || || ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| | |||  ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  6332411 cctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 6332510  T
Q  263 aat 265  Q
    |||    
T  6332511 aat 6332513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Original strand, 18567655 - 18567730
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 93  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567655 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 18567730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297019
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag-gcgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||    | ||| | ||| |||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  167 cc-attgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 261  Q
    ||  || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||| || |||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  262 aaat 265  Q
    ||||    
T  16297022 aaat 16297019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 200
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349006
Alignment:
Q  106 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    ||||| ||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378625
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8378625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120960
Alignment:
Q  67 gttgattcaccttggg--aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2120960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 22392534 - 22392606
Alignment:
Q  46 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 121  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22392534 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22392606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320171
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324919
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069841
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7069841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074848
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7074848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351414
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25351414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357108
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25357108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405454
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25405454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410191
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25410191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512646
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 11081598 - 11081802
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | ||| |||| ||| |||||||   | ||||| ||| |||||||    
T  11081598 ttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaac 11081697  T
Q  167 cc--attgatttctcttttgcaacgttactcatc-atatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 260  Q
    ||   ||||| |||||| || || ||||||||||  || | || | |||| || ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11081698 cctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaa 11081797  T
Q  261 caaat 265  Q
    |||||    
T  11081798 caaat 11081802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541116
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattagg 15541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  | | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  71 attcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaaccca 169  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||| ||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  170 ttgattt 176  Q
    |||||||    
T  40281472 ttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 265
Target Start/End: Original strand, 11759373 - 11759418
Alignment:
Q  220 ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11759373 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 11759418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369703
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 145
Target Start/End: Original strand, 6048941 - 6049039
Alignment:
Q  46 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 144  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||   || |||||||| |||||||||    
T  6048941 aacaaacactaggtttgg--gattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattag 6049038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516403
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 265
Target Start/End: Original strand, 26804765 - 26804801
Alignment:
Q  229 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26804765 agactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaat 26804801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14379904 - 14379861
Alignment:
Q  220 ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14379904 ctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14379861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Original strand, 43864369 - 43864412
Alignment:
Q  220 ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43864369 ctctctcccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43864412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12310198 - 12310160
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12310198 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 12310160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7464697 - 7464652
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 131  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  7464697 cactattaggattgagtctctttgtcacggggagaggctgggactt 7464652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159807
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 56015 - 55955
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcct-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 260  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  56015 atagtggattggagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190101
Alignment:
Q  202 tagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284093
Alignment:
Q  202 tagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    ||||| || |||||||||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 143)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4308526 - 4308277
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4308526 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 4308427  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4308426 agaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 4308327  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308326 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 4308277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 25533454 - 25533703
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25533454 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacggga 25533553  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25533554 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 25533653  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25533654 tgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaat 25533703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 42990316 - 42990565
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42990316 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 42990415  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42990416 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggc 42990515  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990516 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 42990565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 43226100 - 43226346
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43226100 gtttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 43226199  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43226200 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 43226299  T
Q  221 tctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226300 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 43226346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18099415 - 18099166
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18099415 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 18099316  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18099315 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggc 18099216  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18099215 tgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaat 18099166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Original strand, 1321492 - 1321740
Alignment:
Q  19 gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaa 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1321492 gggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaa 1321591  T
Q  119 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggct 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1321592 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 1321691  T
Q  219 gctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321692 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 1321740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 43228306 - 43228552
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43228306 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 43228405  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43228406 ggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 43228505  T
Q  221 tctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43228506 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaat 43228552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10084634 - 10084385
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10084634 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacggga 10084535  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10084534 agaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 10084435  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084434 tgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 10084385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 38890052 - 38890301
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38890052 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 38890151  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38890152 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 38890251  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890252 tgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 38890301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18097145 - 18096900
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18097145 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 18097046  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  18097045 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagc 18096946  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 261  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18096945 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaac 18096900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 30005853 - 30006102
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  30005853 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgaga 30005952  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  30005953 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 30006052  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006053 tgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 30006102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 1313421 - 1313670
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1313421 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacggga 1313520  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1313521 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggc 1313620  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313621 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 1313670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10956272 - 10956023
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10956272 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacggga 10956173  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10956172 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 10956073  T
Q  218 tgctctctc--ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956072 tgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 10956023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 11170416 - 11170665
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11170416 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacggga 11170515  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11170516 agaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 11170615  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11170616 tgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaat 11170665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 45882951 - 45883201
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45882951 agggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 45883050  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  45883051 agaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 45883150  T
Q  218 tgctctct---cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883151 tgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 45883201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4104140 - 4103892
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4104140 agggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 4104041  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4104040 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggc 4103942  T
Q  218 tgc--tctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103941 tgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 4103892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9604848 - 9604603
Alignment:
Q  22 tttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 121  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9604848 tttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 9604749  T
Q  122 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 221  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9604748 gttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 9604649  T
Q  222 ctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9604648 ctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaat 9604603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27101426 - 27101177
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27101426 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagga 27101327  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  27101326 agagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggc 27101227  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27101226 tgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaat 27101177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 5191665 - 5191912
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5191665 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 5191764  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5191765 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggc 5191863  T
Q  218 tgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191864 tgttctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5191912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606584
Alignment:
Q  28 tagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 127  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  128 actttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-- 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||      
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttct-atttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  226 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 7606584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10958568 - 10958319
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10958568 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 10958469  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  10958468 agaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggc 10958369  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958368 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 10958319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22114550 - 22114301
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22114550 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 22114451  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22114450 agaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggaggga 22114351  T
Q  218 tgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    || |||||||   | || | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22114350 tgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 22114301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51727251 - 51727003
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  51727251 agggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggta 51727153  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  51727152 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggc 51727053  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51727052 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 51727003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 53917909 - 53917660
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53917909 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 53917810  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53917809 agagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 53917710  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  53917709 tgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 53917660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 3859540 - 3859788
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3859540 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 3859639  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  3859640 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggc 3859738  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859739 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 3859788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10191554 - 10191306
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  10191554 agggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacagga 10191455  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10191454 agaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 10191356  T
Q  218 tgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191355 tgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 10191306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43423708 - 43423459
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43423708 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 43423609  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  43423608 agagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagc 43423509  T
Q  218 tgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423508 tgctctctccctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 43423459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Original strand, 29956698 - 29956907
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  29956698 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgaga 29956797  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29956798 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 29956897  T
Q  218 tgctctctcc 227  Q
    ||||||||||    
T  29956898 tgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5522857 - 5522623
Alignment:
Q  32 gtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 131  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522857 gtttgtctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 5522758  T
Q  132 tgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc--ta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  5522757 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgca 5522659  T
Q  230 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522658 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5522623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 25388918 - 25389166
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25388918 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacggg 25389016  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25389017 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggg 25389115  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25389116 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 25389166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1626928 - 1626679
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  1626928 agggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggg 1626829  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1626828 agagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggc 1626729  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1626728 tgctctctcgcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaat 1626679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 746769 - 747018
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  746769 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 746868  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  746869 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagga 746967  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  746968 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 747018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 3314696 - 3314946
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  3314696 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagga 3314795  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  3314796 agagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggaggg 3314895  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314896 ctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 3314946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5927006 - 5926760
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5927006 gtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 5926907  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||||| |||| |||| | ||||    
T  5926906 gattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgc 5926807  T
Q  221 tctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926806 tctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5926760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 18162675 - 18162924
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18162675 agggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 18162774  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg-caacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18162775 agagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggaggg 18162874  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18162875 ctgctctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaat 18162924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 26720560 - 26720808
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26720560 agggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacggga 26720658  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| | |    
T  26720659 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgac 26720758  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26720759 tgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaat 26720808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43421660 - 43421411
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43421660 agggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacggga 43421561  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    | ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  43421560 aaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggc 43421461  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421460 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 43421411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 51943383 - 51943631
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  51943383 agggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaga 51943482  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  51943483 agagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggc 51943581  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943582 tgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 51943631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 53915741 - 53915492
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53915741 agggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacggga 53915642  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  53915641 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggc 53915542  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  53915541 tgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaat 53915492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 458296 - 458545
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  458296 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 458395  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  458396 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 458494  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  458495 ctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaat 458545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 880697 - 880447
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  880697 agggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacgga 880598  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  880597 aagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggaggg 880498  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  880497 ctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaat 880447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10621775 - 10621526
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10621775 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 10621676  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  10621675 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggaggg 10621577  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10621576 ctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaat 10621526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32264281 - 32264035
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  32264281 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaga 32264182  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-ttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggct 218  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  32264181 ggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggct 32264082  T
Q  219 gctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||||  || |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  32264081 gctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaacaa 32264035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28102247 - 28101998
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28102247 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacggga 28102148  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  28102147 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggc 28102048  T
Q  218 tgctctctcctaga--ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28102047 tgctctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaat 28101998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25688364 - 25688161
Alignment:
Q  60 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25688364 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 25688265  T
Q  160 ttgtaacccattgatttctcttttg-caacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactggg 256  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688264 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 25688165  T
Q  257 tcaa 260  Q
    ||||    
T  25688164 tcaa 25688161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 36011841 - 36012088
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  36011841 ggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaag 36011940  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctg 219  Q
    ||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  36011941 agattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctg 36012040  T
Q  220 ctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36012041 ctctcttcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaat 36012088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 455919 - 456168
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  455919 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 456018  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  456019 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 456117  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  456118 ctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaat 456168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6066041 - 6065792
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6066041 agggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 6065942  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||| ||    
T  6065941 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatgg 6065843  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  6065842 ctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaat 6065792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28413277 - 28413028
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattga-gtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28413277 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacggg 28413178  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  28413177 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 28413079  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||    
T  28413078 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaat 28413028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 50494011 - 50494260
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  50494011 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 50494110  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  50494111 aagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 50494209  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50494210 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 50494260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 53468699 - 53468449
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  53468699 ggtttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggag 53468600  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggct 218  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  53468599 agattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggct 53468500  T
Q  219 gctct--ctcctag--actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||  | || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468499 gctctaccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 53468449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6063691 - 6063442
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6063691 agggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 6063592  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  6063591 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 6063493  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  6063492 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaat 6063442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 24979719 - 24979969
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24979719 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaa 24979818  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg-caacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  24979819 agagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatgg 24979918  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24979919 ctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaat 24979969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47149140 - 47148891
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaa-caaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47149140 agggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacggg 47149042  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||     
T  47149041 aagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagagga 47148942  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  47148941 ctgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaat 47148891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484621
Alignment:
Q  19 gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 6484571  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484572 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 6484621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 48361916 - 48361667
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  48361916 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacggga 48361817  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||    
T  48361816 agagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagc 48361717  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48361716 tgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaat 48361667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 32219106 - 32219346
Alignment:
Q  28 tagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 127  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  32219106 tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattggg 32219205  T
Q  128 actttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg-caacgttactcatcatatagtgaatcggagggctg--ctctc 224  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||    
T  32219206 actttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 32219305  T
Q  225 tcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32219306 tcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaat 32219346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 38210382 - 38210631
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38210382 agggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 38210481  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || |||| |    
T  38210482 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagag 38210580  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38210581 ctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 38210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 39715481 - 39715726
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39715481 agggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 39715580  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||| | || ||     
T  39715581 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatggt 39715678  T
Q  218 tgctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||| || | ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  39715679 tgctctcccccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaat 39715726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 890018 - 889779
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  890018 agggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 889919  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  889918 aagagt-tggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggaggg 889820  T
Q  217 ctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgg 255  Q
    ||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  889819 ctgatttctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899932
Alignment:
Q  67 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctc-tttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12268210 - 12267971
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12268210 agggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 12268111  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||           |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12268110 aagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagaggg 12268022  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268021 ctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 12267971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 15780886 - 15781140
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15780886 gtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaga 15780985  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattg----atttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagg 215  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    |||||||||||| || |||| | |||| ||||||| | || |||    
T  15780986 ggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagg 15781085  T
Q  216 g---ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |   |||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15781086 gcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 15781140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51674989 - 51674762
Alignment:
Q  40 ctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaga 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||    
T  51674989 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggataga 51674890  T
Q  140 attaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggt 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  || | || ||||    
T  51674889 attaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctcccccataccaggt 51674790  T
Q  238 caatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  51674789 caatttggaccgaacttggtcaacaaat 51674762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Original strand, 6561822 - 6562028
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6561822 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 6561921  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-ttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagg 215  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| || || |||||||| ||||||| | ||||||    
T  6561922 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagg 6562021  T
Q  216 gctgctc 222  Q
    |||||||    
T  6562022 gctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 265
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168362
Alignment:
Q  70 gattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccca 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  170 ttgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaat 11168362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886459
Alignment:
Q  67 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 264  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 265
Target Start/End: Original strand, 4666554 - 4666775
Alignment:
Q  46 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  4666554 aacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 4666653  T
Q  146 cgggaga--cttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcctagactaggtcaatt 242  Q
    |||||||  |||||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4666654 cgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctc-cccagactaggtcaatt 4666752  T
Q  243 tggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  4666753 tggaccgaactggatcaacaaat 4666775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 35918194 - 35917944
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacac------taggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35918194 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggtt 35918095  T
Q  112 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcg 211  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||    
T  35918094 acgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacg 35917995  T
Q  212 gagggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 261  Q
    ||| ||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35917994 gagagctgctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 42992298 - 42992531
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42992298 agggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 42992397  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  | |||||||||||||               ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  42992398 agagagt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggc 42992481  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992482 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 42992531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 263
Target Start/End: Original strand, 53591210 - 53591442
Alignment:
Q  32 gtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 131  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| ||    
T  53591210 gtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattt 53591309  T
Q  132 tgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-cctag 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| || ||    
T  53591310 tgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctctccccag 53591409  T
Q  231 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53591410 actaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 54691819 - 54691570
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||    
T  54691819 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatggga 54691720  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  | || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  54691719 agagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggc 54691620  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  54691619 tgctctctcccctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaat 54691570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28761673 - 28761423
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28761673 agggtttgtatatagtttgct-cttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagga 28761575  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||   || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  28761574 agatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagga 28761475  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaa-tttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  28761474 ctgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaat 28761423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232061
Alignment:
Q  54 ctaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  154 ttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat-atagtgaatcggagggctgctctctccta--gactaggtcaatttggaccga 250  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    || ||||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtgaa-cggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  251 actgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaat 6232061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Original strand, 35777433 - 35777587
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35777433 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 35777532  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccatt 171  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  35777533 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 265
Target Start/End: Original strand, 17795280 - 17795520
Alignment:
Q  24 tgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggc 123  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||      
T  17795280 tgtatagagtttgctt-ttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 17795375  T
Q  124 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctc 222  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  17795376 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctc 17795475  T
Q  223 tct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||    
T  17795476 tctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaat 17795520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 265
Target Start/End: Original strand, 19103720 - 19103960
Alignment:
Q  24 tgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggc 123  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||      
T  19103720 tgtatagagtttgctt-ttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 19103815  T
Q  124 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctc 222  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  19103816 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctc 19103915  T
Q  223 tct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||    
T  19103916 tctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaat 19103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13420427 - 13420189
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||| | |||  | ||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13420427 agggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 13420332  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| | |||| || | ||||| |    
T  13420331 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagag 13420232  T
Q  217 ctgctctctc-ctagactaggtca-atttggaccgaactgggt 257  Q
    |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13420231 ctgctctctcaccagactaggtcagttttggaccgaaatgggt 13420189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28100286 - 28100146
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28100286 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacggga 28100187  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 158  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100186 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttatt 28100146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27635830 - 27635654
Alignment:
Q  79 tgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttct 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  |||    
T  27635830 tgggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatct 27635743  T
Q  179 cttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635742 cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 27635654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 158
Target Start/End: Original strand, 28181034 - 28181174
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28181034 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacggga 28181133  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 158  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28181134 agagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtatt 28181174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 23633471 - 23633714
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| || |  |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23633471 agggtttgtatagtgtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 23633565  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  23633566 agagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggaggg 23633664  T
Q  217 ctgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  23633665 ctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaat 23633714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307021
Alignment:
Q  84 aacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttt 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||   |||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  184 gcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    | || ||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaat 3307021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 31151360 - 31151606
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31151360 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 31151456  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactca-tcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||| || |||||||| |  ||||||| | |||||||    
T  31151457 aaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggaggg 31151554  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||    
T  31151555 ctgctctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaat 31151606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 25635396 - 25635643
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| || |  | ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  25635396 agggtttgtatatagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacggga 25635492  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  25635493 agagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaacagaggg 25635592  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     ||||||||  ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  25635593 ttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaat 25635643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 200
Target Start/End: Original strand, 54884177 - 54884348
Alignment:
Q  28 tagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||  ||      
T  54884177 tagagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaa 54884276  T
Q  128 actttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  54884277 actttgaatagaattaggagggagactta-ttttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 54884348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 562019 - 561770
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||| ||    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||    
T  562019 agggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--caggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtga 561923  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||| | || ||||    
T  561922 agagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaaggg 561823  T
Q  217 ctgctctctc---ctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   | |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  561822 ctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaat 561770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 133 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701667
Alignment:
Q  133 gggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctag 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  231 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaat 47701667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28137541 - 28137415
Alignment:
Q  28 tagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 127  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28137541 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggg 28137442  T
Q  128 actttgggtagaattaggcgggagact 154  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137441 gctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Original strand, 23637038 - 23637200
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||| || | ||| | ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||    
T  23637038 agggtttgtatagagtctgct-cttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatggga 23637134  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttt 183  Q
    |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23637135 agatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 1673990 - 1674160
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  1673990 gtttgtatatagtttgct-cttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaaga 1674086  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttact 194  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| || ||||||    
T  1674087 gattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact 1674160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36871544 - 36871304
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  36871544 agggcttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaa 36871448  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagg 215  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||| ||| | |||| |||| || |||| |||||| ||||||| | ||||||    
T  36871447 agagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagg 36871349  T
Q  216 gctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 257  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36871348 gctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggt 36871304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Original strand, 53597251 - 53597458
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||    
T  53597251 aggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgaga 53597347  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    | ||  || || |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||| |  ||||||    
T  53597348 atagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggaggg 53597447  T
Q  217 ctgctctctcc 227  Q
     ||||||||||    
T  53597448 ttgctctctcc 53597458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 265
Target Start/End: Original strand, 24181498 - 24181643
Alignment:
Q  124 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctc 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||    
T  24181498 tgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctc 24181597  T
Q  223 tctcct--agactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||  | |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  24181598 tctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaat 24181643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560355
Alignment:
Q  50 aacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggg 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||| |     
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggcag- 4560399  T
Q  150 agacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
            |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  4560398 -------cttttgtaacccattaatatctcttttgcaaagttactcatcat 4560355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 98
Target Start/End: Original strand, 41849164 - 41849244
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41849164 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | || ||  || |||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 262  Q
    || ||||| |||| |||| ||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||    
T  1620557 cctttgatatctc-tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaaca 1620459  T
Q  263 aa 264  Q
    ||    
T  1620458 aa 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 265
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849320
Alignment:
Q  190 ttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 41849320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634504
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||  || |||||||||||| ||||||   | ||||| ||| ||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatcata 201  Q
    || ||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 14634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 265
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634149
Alignment:
Q  149 gagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctc--ctagactaggtcaatttgg 245  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||  | |||||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  246 accgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||| ||| |||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaat 25634149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094195
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201075
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208121
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10208121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626105
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919111
Alignment:
Q  199 atatagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 35919111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10612957 - 10612899
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10612957 cactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10612899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29914074
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 29914074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878292
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47878292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193287
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54193287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100212
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 10100212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 110
Target Start/End: Original strand, 24177291 - 24177380
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24177291 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 53894109 - 53894053
Alignment:
Q  211 ggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53894109 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 53894053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 131
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303358
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 6303358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 11163162 - 11163218
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattc 74  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  11163162 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606830
Alignment:
Q  50 aacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 93  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 7606830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897066
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10897066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031439
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188570
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54188570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 143
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38002928
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858605
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5858546 aaacactattaggattgagtct--tggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 5858605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595155
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 10595155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 145
Target Start/End: Original strand, 4535626 - 4535675
Alignment:
Q  95 gattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  4535626 gattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949381
Alignment:
Q  87 actattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggaac-ttgggttgaattagg 10949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079578
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattagg 11079578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544334
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaac-ttgggtagaattagg 27544334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 121
Target Start/End: Original strand, 13419941 - 13419994
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||    
T  13419941 ttgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagag 13419994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 110
Target Start/End: Original strand, 25633935 - 25634024
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||  | |  | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25633935 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 255
Target Start/End: Original strand, 28181185 - 28181238
Alignment:
Q  203 agtgaatcggagggctgctctctcc-tagactaggtcaatttggaccgaactgg 255  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28181185 agtgaaacggaaggctgctctctccctagactaggtcaatttggactgaactgg 28181238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 108
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttg 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 27635872 - 27635832
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactagg 58  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27635872 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagg 27635832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Original strand, 3716042 - 3716085
Alignment:
Q  220 ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3716042 ctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 3716085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007633
Alignment:
Q  95 gattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 11007633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736388
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18552966
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30709873
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31021341 - 31021300
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttg 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31021341 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 58
Target Start/End: Original strand, 6231461 - 6231501
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactagg 58  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  6231461 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagg 6231501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 265
Target Start/End: Original strand, 42992611 - 42992647
Alignment:
Q  229 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42992611 agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaat 42992647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 47701840 - 47701804
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacac 54  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47701840 agggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacac 47701804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 127)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8631666 - 8631417
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8631666 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 8631567  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8631566 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 8631467  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631466 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 8631417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22044637 - 22044389
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22044637 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 22044538  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22044537 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 22044439  T
Q  218 tgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044438 tgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 22044389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 24348306 - 24348553
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24348306 ggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 24348405  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24348406 aggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 24348505  T
Q  220 ctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348506 ctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 24348553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22046932 - 22046684
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22046932 agggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 22046833  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22046832 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 22046734  T
Q  218 tgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046733 tgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 22046684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37089618 - 37089370
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37089618 agggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggga 37089519  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37089518 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 37089420  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089419 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 37089370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17662478 - 17662243
Alignment:
Q  32 gtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 131  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17662478 gtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactt 17662379  T
Q  132 tgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--ccta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |    
T  17662378 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 17662279  T
Q  230 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662278 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 17662243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 14633408 - 14633653
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14633408 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aaga 14633506  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14633507 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc 14633606  T
Q  221 tctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633607 tctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 14633653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 40637160 - 40637409
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40637160 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacggga 40637259  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  40637260 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggc 40637359  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637360 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 40637409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 6764925 - 6765179
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttc-----tttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtta 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6764925 agggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtta 6765024  T
Q  113 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcgg 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  6765025 tgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattgg 6765124  T
Q  213 agggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765125 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 6765179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22801106 - 22800860
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22801106 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaaga 22801007  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  22801006 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgc 22800907  T
Q  221 tctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22800906 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 22800860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 9148343 - 9148587
Alignment:
Q  22 tttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9148343 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 9148442  T
Q  122 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9148443 gctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 9148541  T
Q  222 ctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9148542 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 9148587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 11435041 - 11435289
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  11435041 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccgga 11435140  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11435141 agagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 11435239  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435240 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 11435289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 24888882 - 24889131
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24888882 agggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 24888981  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  24888982 agagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggc 24889081  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24889082 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 24889131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 38409291 - 38409539
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38409291 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 38409390  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38409391 agaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggc 38409489  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409490 tgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 38409539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40091662 - 40091413
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40091662 agggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacggga 40091563  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40091562 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggc 40091463  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091462 tgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 40091413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 47868487 - 47868736
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47868487 agggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 47868586  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||    
T  47868587 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggc 47868686  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47868687 tgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaat 47868736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 47274813 - 47275060
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47274813 agggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 47274911  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47274912 agaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 47275011  T
Q  218 tgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47275012 tgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaat 47275060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 24880537 - 24880787
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24880537 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 24880636  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg-caacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24880637 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggaggg 24880736  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880737 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 24880787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2485119 - 2484871
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2485119 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 2485020  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2485019 agaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 2484921  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2484920 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaat 2484871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22802981 - 22802732
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22802981 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 22802882  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||     
T  22802881 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggt 22802782  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22802781 ttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaat 22802732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 48486405 - 48486654
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48486405 agggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 48486504  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  48486505 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggc 48486604  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48486605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaat 48486654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 51015332 - 51015580
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51015332 agggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 51015431  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||||||| |    
T  51015432 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtc 51015530  T
Q  218 tgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015531 tgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 51015580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22132636 - 22132390
Alignment:
Q  19 gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaa 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22132636 gggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 22132538  T
Q  119 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggct 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  22132537 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggct 22132439  T
Q  219 gctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132438 gctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 22132390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 24879075 - 24879325
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24879075 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 24879174  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg-caacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  24879175 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggaggg 24879274  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879275 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 24879325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36921741 - 36921491
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36921741 agggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 36921642  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  36921641 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatgg 36921542  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36921541 ctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 36921491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 5198510 - 5198755
Alignment:
Q  22 tttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5198510 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagag 5198609  T
Q  122 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 221  Q
      |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5198610 attggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgct 5198709  T
Q  222 ctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5198710 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaat 5198755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26086223 - 26085975
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26086223 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 26086124  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  26086123 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggaaggc 26086025  T
Q  218 tgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26086024 tgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaat 26085975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 7941407 - 7941658
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaa--cactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgg 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7941407 agggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacag 7941506  T
Q  116 gaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||    
T  7941507 gaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagg 7941606  T
Q  216 gctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941607 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 7941658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11006484 - 11006235
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11006484 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 11006385  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||| |||||||||    
T  11006384 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatggtactcatcatatagtggatcggaggg 11006286  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  11006285 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaat 11006235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31849846 - 31849597
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacacta-ggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31849846 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacggg 31849747  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31849746 aagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggaggg 31849648  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31849647 ctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaat 31849597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38928425 - 38928175
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38928425 agggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 38928326  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38928325 aaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggaggg 38928226  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928225 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 38928175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12401054 - 12400806
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12401054 agggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 12400955  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12400954 agagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggc 12400855  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 264  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12400854 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaa 12400806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5637712 - 5637524
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5637712 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 5637613  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5637612 agaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36919832 - 36919582
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36919832 agggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 36919733  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |   || ||    
T  36919732 aagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatgg 36919633  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919632 ctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 36919582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33415734 - 33415486
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33415734 agggtttgtatagagtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacggga 33415636  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33415635 agagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 33415536  T
Q  218 tgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33415535 tgctctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaat 33415486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11008813 - 11008566
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11008813 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 11008714  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| || | |||||||||||||||| || ||||||    
T  11008713 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc---tttgtaatggtactcatcatatagtggattggaggg 11008617  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11008616 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 11008566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12396092 - 12395844
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12396092 agggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 12395993  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12395992 agagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggc 12395893  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 264  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12395892 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaa 12395844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 18847239 - 18847487
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  18847239 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacggg 18847338  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  18847339 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggaggg 18847437  T
Q  217 ctgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847438 ctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 18847487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22134862 - 22134616
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22134862 agggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 22134764  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  22134763 aaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggc 22134665  T
Q  218 tgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134664 tgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 22134616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3824817 - 3824629
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3824817 agggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacggga 3824718  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3824717 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 3824629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 19095968 - 19096218
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19095968 agggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 19096067  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  | |  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  19096068 aagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagag 19096167  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19096168 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 19096218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14787678 - 14787427
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14787678 agggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 14787579  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14787578 agagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggc 14787479  T
Q  218 tgctctct----cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14787478 tgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 14787427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44600085 - 44599836
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44600085 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 44599986  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  44599985 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 44599887  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44599886 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 44599836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 53405216 - 53405468
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53405216 agggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaa 53405314  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga------cttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcg 211  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |     
T  53405315 agaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaaca 53405414  T
Q  212 gagggctgctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53405415 gagagctgctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaat 53405468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22780620 - 22780371
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22780620 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacggg 22780521  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  22780520 aagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggaggg 22780422  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22780421 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 22780371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22782985 - 22782736
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22782985 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacggg 22782886  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  22782885 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggaggg 22782787  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22782786 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaat 22782736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9176721 - 9176472
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9176721 agggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 9176622  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  9176621 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggaggg 9176523  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9176522 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaat 9176472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16934390 - 16934141
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16934390 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 16934291  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  16934290 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 16934192  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16934191 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 16934141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18709410 - 18709162
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18709410 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacggga 18709311  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||| |    
T  18709310 agagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggac 18709212  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18709211 tgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 18709162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Original strand, 13544045 - 13544272
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13544045 agggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggttt-gaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtg 13544143  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||      
T  13544144 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagta 13544243  T
Q  217 ctgctctc--tcctagactaggtcaattt 243  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  13544244 ctgctctctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Original strand, 16453398 - 16453634
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16453398 gtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaaga 16453497  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctg 219  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || || ||    
T  16453498 gattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttg 16453597  T
Q  220 ctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactg 254  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16453598 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactg 16453634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9174393 - 9174144
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattga-gtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9174393 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacggg 9174294  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  9174293 aagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggaggg 9174195  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174194 ctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 9174144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16932036 - 16931787
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16932036 agggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 16931937  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  16931936 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 16931838  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16931837 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 16931787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 56030533 - 56030770
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  56030533 gtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaaga 56030632  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |  |||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||    
T  56030633 gattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgc 56030729  T
Q  221 tctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 259  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030730 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 619694 - 619446
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  619694 agggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaaggga 619595  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  619594 agagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgac 619495  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619494 tgctctctccccta-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 619446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 36378378 - 36378628
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  36378378 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacggga 36378477  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  36378478 agagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggaggg 36378577  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36378578 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaat 36378628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 265
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455577
Alignment:
Q  45 gaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 144  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  145 gcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaat 241  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||  || |||||||||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  242 ttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaacaaat 16455577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47210987 - 47210756
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |            |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47210987 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacggga 47210900  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47210899 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggc 47210800  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 259  Q
    ||||||||  || | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  47210799 tgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37313313 - 37313063
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37313313 agggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaa 37313214  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  37313213 agagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggg 37313114  T
Q  217 ctgctc--tctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||  || || |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  37313113 ctgctctttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaat 37313063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 41997581 - 41997827
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  41997581 gtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaa 41997680  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat-atagtgaatcggagggctg 219  Q
    |  || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  41997681 gattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccg 41997780  T
Q  220 ctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  41997781 ctctctccccagactaggttaatttggaccgaactggataaacaaat 41997827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 19322782 - 19323030
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19322782 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 19322878  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  19322879 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggg 19322978  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     ||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||    
T  19322979 atgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaat 19323030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 36380435 - 36380685
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  36380435 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttaccgga 36380534  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||| | | ||| |    
T  36380535 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtggaactgagtg 36380634  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36380635 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaat 36380685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 27499131 - 27499377
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  27499131 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacgata 27499230  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||||    
T  27499231 agagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaaggg 27499327  T
Q  217 ctgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27499328 ctgctctttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 27499377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 127 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635474
Alignment:
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct- 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  226 -cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5635474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437697
Alignment:
Q  126 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 11437655  T
Q  226 --cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437656 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 11437697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 265
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547489
Alignment:
Q  80 gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  180 ttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaat 13547489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215641
Alignment:
Q  109 gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaa 208  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  209 tcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 4215641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18409594 - 18409345
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||    
T  18409594 agggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttatagga 18409495  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| |    
T  18409494 agagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagag 18409396  T
Q  217 ctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     ||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  18409395 ttgctctctccctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaat 18409345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18537719 - 18537512
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18537719 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 18537623  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  18537622 agagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggg 18537523  T
Q  217 ctgctctctcc 227  Q
    |||||||||||    
T  18537522 ctgctctctcc 18537512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 265
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891627
Alignment:
Q  74 caccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga 173  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  174 tttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||  || |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaat 2891627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38890470 - 38890222
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||| |||| || |  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  38890470 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacggga 38890374  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | | |||||    
T  38890373 agagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaggg 38890274  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  38890273 ctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 38890222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 52942693 - 52942540
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  52942693 agggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg- 52942595  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 184  Q
                ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  52942594 ------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 52942540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3937453 - 3937316
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  3937453 gtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaaga 3937354  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 158  Q
    |  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3937353 gattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttatt 3937316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18535077 - 18534829
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18535077 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgaga 18534981  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||| | ||||||| | |||||||    
T  18534980 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggg 18534881  T
Q  217 ctgctct--ctcctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     ||||||  | || ||||||||| |  |||||||||||| |||| |||||||    
T  18534880 gtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaat 18534829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8756493 - 8756248
Alignment:
Q  22 tttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctctt-ggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8756493 tttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaaga 8756397  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctg 219  Q
    |  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||| | |||| || ||    
T  8756396 gattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttg 8756297  T
Q  220 ctctctcct--agactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  ||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||    
T  8756296 ctctctcctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaat 8756248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136885
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    ||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagtttact-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggct 218  Q
    |   || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||||| | || ||||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggct 30136836  T
Q  219 gctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  30136837 gctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaat 30136885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 150
Target Start/End: Original strand, 6132958 - 6133090
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||| ||||||||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6132958 agggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 6133057  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcggga 150  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  6133058 agagattgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102424
Alignment:
Q  67 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  166 cccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 261  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  || | |||||||||  ||||||||||||| ||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  262 aaat 265  Q
    ||||    
T  12102421 aaat 12102424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983565
Alignment:
Q  67 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  166 cccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcc 227  Q
    ||| ||||| ||| ||||| ||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 31983565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 133 - 265
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101263
Alignment:
Q  133 gggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-cctaga 231  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| || |||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctccccaga 5101229  T
Q  232 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101230 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5101263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 28453818 - 28454019
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||| |    
T  28453818 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaac 28453917  T
Q  168 cattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
      ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||  || ||||||  || ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  28453918 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaa 28454017  T
Q  264 at 265  Q
    ||    
T  28454018 at 28454019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15032748 - 15032614
Alignment:
Q  66 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 165  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15032748 ggttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 15032649  T
Q  166 cccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  15032648 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15032614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357978
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg----gtagaatt-aggcgggagacttatttttg 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||     ||||||| ||   | ||||||||| |||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  163 taacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtc 258  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||  | ||||  ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  259 aacaaat 265  Q
    |||||||    
T  25357972 aacaaat 25357978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982214
Alignment:
Q  71 attcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaatt-aggcgggagacttatttttgtaacc 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||   | ||||| ||| |||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  168 cattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcc 227  Q
    | ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 3982214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185832
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctctt 181  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||| ||||| | || |    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatc-t 16185920  T
Q  182 ttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  16185919 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 16185832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24446831 - 24446755
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaa 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446831 agggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaa 24446755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446679
Alignment:
Q  152 acttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 227  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 24446679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 265
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563096
Alignment:
Q  180 ttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 47563096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40999148 - 40999017
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||   |||||||   |||||||||    
T  40999148 ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaac 40999049  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatc 198  Q
    || ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  40999048 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatc 40999017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 38270233 - 38270155
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaaga 96  Q
    ||||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38270233 agggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaaga 38270155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 9863842 - 9864048
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt-aggcgggagacttatttttgtaac 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||   | ||||| ||| |||||||    
T  9863842 ttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaac 9863941  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca----tatagtgaatcggagggctgctctct----cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 257  Q
    |  ||||| |||| |||| || |||||||||||    ||||||| | ||||| ||||||||||    || |||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  9863942 cttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggt 9864040  T
Q  258 caacaaat 265  Q
     |||||||    
T  9864041 aaacaaat 9864048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150959
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || || ||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    || ||||| ||||||||  || ||| ||||||||    
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcat 47150959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050378
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7050378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853610
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 11853610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Original strand, 10113003 - 10113080
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttac-gggaagaggctgggactttgggtagaattag 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  10113003 ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattag 10113080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14789495 - 14789426
Alignment:
Q  200 tatagtgaatcggagggctgctctctc----ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789495 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 14789426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529328
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8529328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587027
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300485
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822326
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831202
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattagg 15831202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489410
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16689061
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16689061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570155
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 68
Target Start/End: Original strand, 5101083 - 5101133
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggt 68  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5101083 agggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 36771396 - 36771457
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36771396 aaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattagg 36771457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 265
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088906
Alignment:
Q  154 ttatttttgtaacccattgatttct-cttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcct---agactaggtcaatttggaccg 249  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||| |||||| || |||| ||||||||||||||| | |||  || ||||||||    ||||||||||||||||| |||    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccg 49088890  T
Q  250 aactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||    
T  49088891 aactgggtcaacaaat 49088906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13072160 - 13072102
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13072160 cactattatgattgagtctcttggtcactggaagaggctgtga-tttgggtagaattagg 13072102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336903
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5336903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 131
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4884922
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 4884922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3937308 - 3937272
Alignment:
Q  229 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3937308 agactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 3937272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 262
Target Start/End: Original strand, 6743444 - 6743507
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 262  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6743444 atagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 52942522 - 52942486
Alignment:
Q  229 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52942522 agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaat 52942486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagact-ggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 54867239 - 54867188
Alignment:
Q  213 agggctgctctctcct-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54867239 agggctgctctctccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 4874661 - 4874623
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4874661 aaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagag 4874623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 110
Target Start/End: Original strand, 10114463 - 10114505
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggt 110  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10114463 ttgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 10114505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 36769479 - 36769540
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  36769479 aaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtaaaattagg 36769540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396764
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5396700 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 265
Target Start/End: Original strand, 6133127 - 6133172
Alignment:
Q  220 ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6133127 ctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaat 6133172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047383
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39245998
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38270148 - 38270120
Alignment:
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagactt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270148 gactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 86)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45280231 - 45279982
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45280231 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacggga 45280132  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45280131 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 45280032  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45280031 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 45279982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19502258 - 19502009
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19502258 agggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 19502159  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  19502158 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggc 19502059  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502058 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 19502009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23452484 - 23452235
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23452484 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 23452385  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  23452384 agaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggc 23452285  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452284 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 23452235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19504592 - 19504344
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19504592 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-a 19504494  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19504493 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggc 19504394  T
Q  218 tgc--tctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504393 tgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 19504344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 27104807 - 27105054
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27104807 agggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 27104905  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27104906 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggc 27105004  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105005 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 27105054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 42452794 - 42453037
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42452794 gtttgtataaagtttgtctctgt--aacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 42452891  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42452892 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 42452991  T
Q  221 tctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452992 tctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 42453037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21520940 - 21520691
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  21520940 agggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacagga 21520841  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  21520840 agaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggc 21520741  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21520740 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaat 21520691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 42064523 - 42064772
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42064523 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 42064622  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42064623 agaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggc 42064721  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42064722 tgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 42064772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40032305 - 40032051
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40032305 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagga 40032206  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga----tttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcgg 212  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  40032205 agaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacgg 40032106  T
Q  213 agggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032105 agggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 40032051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 19007650 - 19007897
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  19007650 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaag 19007749  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctg 219  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19007750 agattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctg 19007849  T
Q  220 ctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19007850 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 19007897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 42923752 - 42923507
Alignment:
Q  22 tttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 121  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42923752 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 42923653  T
Q  122 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 221  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42923652 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgct 42923553  T
Q  222 ctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923552 ctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 42923507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 52 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43623793 - 43623578
Alignment:
Q  52 cactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623793 cactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 43623694  T
Q  152 acttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccg 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  43623693 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 43623594  T
Q  250 aactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||    
T  43623593 aactaggtcaacaaat 43623578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13910291 - 13910043
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13910291 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacggga 13910192  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||    
T  13910191 agagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggc 13910093  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910092 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 13910043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6259062 - 6258815
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6259062 agggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 6258963  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  6258962 aga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggaggg 6258865  T
Q  217 ctgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258864 ctgctctctccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 6258815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6264399 - 6264146
Alignment:
Q  15 caaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6264399 caaagggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacg 6264300  T
Q  115 ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcgga 213  Q
      || ||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6264299 ataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgga 6264200  T
Q  214 gggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264199 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 6264146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22287583 - 22287334
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22287583 agggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacggga 22287484  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22287483 agagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggc 22287384  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287383 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 22287334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 58 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5375552 - 5375344
Alignment:
Q  58 gttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5375552 gttttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttat 5375454  T
Q  158 ttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgg 255  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5375453 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgg 5375354  T
Q  256 gtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||    
T  5375353 gtcaacaaat 5375344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35215833 - 35215584
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35215833 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 35215734  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  35215733 aagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 35215635  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35215634 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 35215584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 265
Target Start/End: Original strand, 17849132 - 17849374
Alignment:
Q  25 gtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct 124  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  17849132 gtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagatt 17849231  T
Q  125 gggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctct 223  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  17849232 gagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctct 17849330  T
Q  224 ctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||   | |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  17849331 ctcccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaat 17849374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11739807 - 11739557
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  11739807 agggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttatagga 11739708  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |     
T  11739707 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatga 11739608  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11739607 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 11739557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35218210 - 35217961
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35218210 agggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 35218111  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  35218110 aagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 35218012  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35218011 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 35217961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34979826 - 34979575
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34979826 agggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 34979727  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| || ||| ||||||| ||||||| | || ||||    
T  34979726 agagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaaggg 34979627  T
Q  217 ctgctct---ctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    || ||||   | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34979626 ctactctccccccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaat 34979575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24162459 - 24162221
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  24162459 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtt------ 24162366  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||| || ||| |||    
T  24162365 ----gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggc 24162271  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24162270 tgctctctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaat 24162221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 28196645 - 28196892
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28196645 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 28196744  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || | |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | |||    
T  28196745 agagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggc 28196844  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28196845 tgctctctcccccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaat 28196892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 17848451 - 17848697
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17848451 agggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 17848550  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  || | |||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  17848551 aagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatga 17848646  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17848647 ctgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaat 17848697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45239223 - 45239015
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45239223 agggtttgtatagactttct--ctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 45239126  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45239125 aagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggaggg 45239026  T
Q  217 ctgctctctcc 227  Q
    |||||||||||    
T  45239025 ctgctctctcc 45239015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 14837281 - 14837525
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||    
T  14837281 agggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggga 14837374  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  14837375 agagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatgg 14837474  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14837475 atgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaat 14837525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459200
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggct 218  Q
    ||  |||| |||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  219 gctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaact 253  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28459235 tctctctacctagactaggtcaatttggatcgaact 28459200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44289312 - 44289065
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44289312 gtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaaga 44289213  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctg 219  Q
    |  |||||||| ||||||||||| | || | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| | || || ||    
T  44289212 gattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttg 44289113  T
Q  220 ctc--tctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||  || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289112 ctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 44289065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558862
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36558949  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36558948 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 36558862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561139
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36561226  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36561225 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 36561139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15539722 - 15539556
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15539722 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacggga 15539623  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 184  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  15539622 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttg 15539556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31733009 - 31732774
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||             
T  31733009 gtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt--------- 31732919  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctg 219  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||    
T  31732918 ---tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactg 31732822  T
Q  220 ctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31732821 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaat 31732774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332179
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc- 45332266  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45332265 tttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 45332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18800557 - 18800311
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  18800557 agggtttgtatagaggttgct-cttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacagga 18800462  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  18800461 agagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggaggg 18800362  T
Q  217 ctgctctct-cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    || |||||| || |||| ||||||  |||||||| |||||||| |||||||    
T  18800361 ctactctctccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaat 18800311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 22874142 - 22874388
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  22874142 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacggga 22874237  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  22874238 agagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagag 22874337  T
Q  217 ctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22874338 ctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaat 22874388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 3022174 - 3022429
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3022174 gtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaaga 3022273  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca----------tatagtgaatc 210  Q
    |  || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||  || |||||||||||          |||| |||| |    
T  3022274 gattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaac 3022372  T
Q  211 ggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022373 agatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 3022429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 124 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22407595 - 22407452
Alignment:
Q  124 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 223  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22407595 tgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 22407496  T
Q  224 ct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22407495 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 22407452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11578309 - 11578150
Alignment:
Q  65 gggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11578309 gggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 11578210  T
Q  165 acccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctct 223  Q
    || ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  11578209 actcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctct 11578150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17897489 - 17897243
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||    
T  17897489 agggtttgtatagagtttgct-cttcgcaacaaacactaggttgaga---ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgaga 17897394  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    | ||  || || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||  | |||| ||    
T  17897393 aaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatgg 17897294  T
Q  217 ctgctctct-cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||    
T  17897293 ctgctctctccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaat 17897243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20146806 - 20146613
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 167  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| ||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20146806 ttgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 20146707  T
Q  168 cattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 257  Q
    | ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  20146706 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggt 20146613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  136 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagact 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  234 aggtcaa-tttggaccgaactgggtcaa 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 265
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699633
Alignment:
Q  66 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgta 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  165 acccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctc--tctcctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 260  Q
    | || ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | | ||||| |||||  || || ||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  261 caaat 265  Q
    |||||    
T  40699629 caaat 40699633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707749
Alignment:
Q  146 cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctc----ctagactaggtcaat 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    | |||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  242 ttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaat 22707749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 38020210 - 38020349
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |       
T  38020210 agggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggtattg--- 38020306  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 167  Q
           ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020307 -------ggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22163194 - 22163106
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctctt 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  22163194 agggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt-aggttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163020
Alignment:
Q  176 tctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaat 22163020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37963137 - 37962939
Alignment:
Q  67 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||  || | |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||     
T  37963137 gttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaat 37963038  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctg--ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    ||||||||||   ||||| || |||| |||||| ||||||||| | | || |||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  37963037 ccattgattt---ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaa 37962941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 265
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871073
Alignment:
Q  145 gcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaatt 242  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  243 tggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| | |||| |||||||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaat 23871073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22407656 - 22407591
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggga 83  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22407656 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27136326 - 27136195
Alignment:
Q  65 gggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgt 163  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||   |||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  27136326 gggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgt 27136227  T
Q  164 aacccattgatttctcttttgcaacgttactc 195  Q
    ||| ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  27136226 aactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  53 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 152  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 200
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589881
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctctt 181  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  182 ttgcaacgttactcatcat 200  Q
    |||  | ||||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 35107351 - 35107553
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag--gcgggagacttatttttgtaa 165  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||     | ||||||||| ||||||    
T  35107351 ttgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa 35107450  T
Q  166 cccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctg--ctctctcctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 261  Q
     || ||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| || ||  |||| ||| ||||||||||| | |||||||||| | ||| |||    
T  35107451 -cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaac 35107549  T
Q  262 aaat 265  Q
    ||||    
T  35107550 aaat 35107553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736266
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 2736266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462497
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054886
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687044
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 39687044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 200
Target Start/End: Original strand, 43139432 - 43139564
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||   || |||||| |||||||||||| |   ||||| ||| |||||||    
T  43139432 ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaac 43139531  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    |  |||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  43139532 cttttgatttctc-tttgtaaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 131
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191045
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943598
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17943598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517760
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 27517760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741002
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 5377674 - 5377629
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgag 65  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5377674 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 200
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  67 gttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttatttttgt 163  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  164 aacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    ||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583483
Alignment:
Q  69 tgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27583483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680106
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 39680106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  67 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaatta 143  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  | | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479055
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 30479055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050156
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggctaggactt 20050156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17057412 - 17057369
Alignment:
Q  220 ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17057412 ctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17085395 - 17085352
Alignment:
Q  220 ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17085395 ctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 35028632 - 35028707
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 143  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  35028632 ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17490191 - 17490149
Alignment:
Q  220 ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 262  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17490191 ctctcccctagagtaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 17490149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaatta 143  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699100
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 104)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15295083 - 15294834
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15295083 agggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 15294984  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294983 agaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 15294884  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294883 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 15294834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 51750071 - 51750320
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51750071 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 51750170  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51750171 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 51750270  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750271 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 51750320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 2617548 - 2617797
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2617548 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 2617647  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2617648 agaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 2617747  T
Q  218 tgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2617748 tgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaat 2617797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 47906304 - 47906551
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47906304 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 47906403  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctg 219  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906404 agattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctg 47906503  T
Q  220 ctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906504 ctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 47906551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 28840712 - 28840960
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28840712 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 28840811  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28840812 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 28840910  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840911 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 28840960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31735770 - 31735521
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31735770 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacggga 31735671  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31735670 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggc 31735571  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735570 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 31735521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10400077 - 10399828
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10400077 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 10399978  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10399977 agagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 10399878  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399877 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 10399828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17324884 - 17324636
Alignment:
Q  19 gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaa 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17324884 gggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 17324785  T
Q  119 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggct 218  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17324784 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggct 17324685  T
Q  219 gctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324684 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 17324636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 15823578 - 15823827
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15823578 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacggga 15823677  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  15823678 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggc 15823777  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15823778 tgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaat 15823827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 24325695 - 24325944
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24325695 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 24325794  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24325795 agaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggc 24325894  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24325895 tgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaat 24325944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 46431956 - 46431706
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46431956 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 46431857  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46431856 agaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggatcggagggc 46431758  T
Q  218 tgctctctcct----agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431757 tgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 46431706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 50307796 - 50307546
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50307796 agggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 50307697  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50307696 aagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggg 50307597  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307596 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 50307546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 39462551 - 39462800
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39462551 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 39462650  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  39462651 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagc 39462750  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462751 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 39462800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 39932105 - 39932355
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39932105 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggga 39932204  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  39932205 agagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggc 39932304  T
Q  218 tgctctct---cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||   || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39932305 tgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaat 39932355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6995949 - 6995700
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6995949 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 6995850  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6995849 agagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggc 6995750  T
Q  218 tgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6995749 tgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 6995700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 51752397 - 51752644
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51752397 agggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacggga 51752495  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| || |||||||    
T  51752496 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggc 51752594  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752595 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 51752644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2510573 - 2510325
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2510573 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacggga 2510474  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2510473 agagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggc 2510375  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510374 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 2510325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12302754 - 12302505
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12302754 agggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 12302655  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12302654 agagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggc 12302555  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302554 tgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 12302505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 13761869 - 13762117
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13761869 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 13761968  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13761969 agagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggc 13762067  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    | ||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13762068 ttctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaat 13762117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 20302491 - 20302739
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20302491 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 20302590  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| |    
T  20302591 agagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggac 20302689  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20302690 tactctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 20302739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27337187 - 27336940
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27337187 agggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacggga 27337089  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27337088 agaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 27336990  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336989 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 27336940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27339379 - 27339131
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27339379 agggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacggga 27339280  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27339279 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 27339181  T
Q  218 tg--ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27339180 tgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 27339131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 41646952 - 41647201
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41646952 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacggga 41647051  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41647052 agagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggc 41647151  T
Q  218 tgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41647152 tgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 41647201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38925727 - 38925481
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38925727 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 38925628  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  38925627 agagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtaaaacggagggc 38925530  T
Q  218 tgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38925529 tgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaat 38925481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 6823047 - 6823295
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6823047 agggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatggga 6823145  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6823146 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggc 6823245  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823246 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 6823295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 13215113 - 13215367
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13215113 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacggga 13215212  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga----tttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcgg 212  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| | |||    
T  13215213 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacgg 13215312  T
Q  213 agggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13215313 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaat 13215367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21948436 - 21948228
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21948436 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacggga 21948338  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21948337 agacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 21948238  T
Q  218 tgctctctcc 227  Q
    ||||||||||    
T  21948237 tgctctctcc 21948228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 20291489 - 20291737
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20291489 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 20291588  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||     
T  20291589 agagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggt 20291687  T
Q  218 tg--ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||  ||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291688 tgttctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20291737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 28842527 - 28842775
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28842527 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacggga 28842626  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28842627 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 28842725  T
Q  218 t--gctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |   ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28842726 taatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaat 28842775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14098219 - 14097969
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14098219 agggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 14098120  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg-caacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  | |  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14098119 agagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggaggg 14098020  T
Q  217 ctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098019 ctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 14097969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 16226199 - 16226448
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16226199 agggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 16226298  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  16226299 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 16226397  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16226398 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 16226448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 18839619 - 18839869
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18839619 agggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaga 18839718  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  18839719 agagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagaggg 18839818  T
Q  217 ctgctc--tctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||  || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839819 ctgctctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 18839869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11457724 - 11457475
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  11457724 agggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcga 11457625  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | |    
T  11457624 agagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtc 11457525  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11457524 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 11457475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 18307141 - 18307390
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18307141 agggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 18307240  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  18307241 agagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatgg 18307340  T
Q  217 ctgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18307341 ctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaat 18307390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 47179745 - 47179993
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47179745 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 47179844  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  47179845 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 47179943  T
Q  217 ctgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  47179944 ctgctctctccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 47179993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 50076921 - 50076672
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50076921 agggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 50076822  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |     
T  50076821 agagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatga 50076722  T
Q  217 ctgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076721 ctgctctctccccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 50076672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 16428685 - 16428935
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16428685 agggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 16428784  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  16428785 agagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggaggg 16428884  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16428885 ctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaat 16428935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28998502 - 28998253
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28998502 agggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagga 28998403  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||     
T  28998402 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggt 28998303  T
Q  218 tg--ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998302 tgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 28998253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29004218 - 29003969
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  29004218 agggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagga 29004119  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||     
T  29004118 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggt 29004019  T
Q  218 tg--ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004018 tgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 29003969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2949477 - 2949232
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |    
T  2949477 gtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaata 2949378  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2949377 gattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgc 2949278  T
Q  221 tctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949277 tctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 2949232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 48665209 - 48665398
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttac-ggg 116  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  48665209 agggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccggg 48665308  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48665309 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 48665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9459666 - 9459417
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattga-gtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9459666 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacggg 9459567  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  9459566 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggaggg 9459468  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9459467 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 9459417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9463493 - 9463244
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattga-gtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9463493 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacggg 9463394  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  9463393 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggaggg 9463295  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9463294 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 9463244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31425268 - 31425015
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagt---ctcttggttac 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  31425268 agggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttac 31425169  T
Q  114 gggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcgg 212  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  31425168 ggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg 31425069  T
Q  213 agggctgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    | ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425068 aaggctgctctctccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 31425015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3579865 - 3579617
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |    
T  3579865 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaa 3579766  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |      
T  3579765 agagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgat 3579667  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579666 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 3579617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4131628 - 4131375
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  4131628 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagga 4131529  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattga----tttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcgg 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||    
T  4131528 agaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg 4131430  T
Q  213 agggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  4131429 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaat 4131375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 25127904 - 25128154
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25127904 agggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacggga 25128003  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  25128004 agagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggaggg 25128103  T
Q  217 ctg--ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25128104 ctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaat 25128154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 47177394 - 47177642
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  47177394 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacggg 47177493  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  47177494 aagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 47177592  T
Q  217 ctgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  47177593 ctgctctctccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaat 47177642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 6756559 - 6756809
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |    
T  6756559 agggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct--tgattacgag 6756656  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagg 215  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  6756657 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaag 6756756  T
Q  216 gctgctctct---cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     |||||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6756757 actgctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaat 6756809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9241335 - 9241085
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  9241335 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgaga 9241236  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  9241235 agagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggg 9241136  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9241135 ctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaat 9241085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 50248813 - 50248570
Alignment:
Q  26 tatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctg 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |    
T  50248813 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcg 50248714  T
Q  126 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctg----ct 221  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| | || || ||    ||    
T  50248713 agactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctct 50248614  T
Q  222 ctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  50248613 ctcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaat 50248570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17186377 - 17186127
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17186377 agggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacggga 17186278  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  | | |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||| || | ||||| |    
T  17186277 agagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtg 17186178  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17186177 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaat 17186127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25251524 - 25251274
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25251524 agggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacggga 25251425  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| || |||||| |||| ||||||||| | |||||    
T  25251424 agagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagaggg 25251325  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25251324 ttgctctctccccaatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 25251274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 50079070 - 50078820
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  50079070 agggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacggga 50078971  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||| | | || ||    
T  50078970 agagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatgg 50078871  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  50078870 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaat 50078820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 31489947 - 31490193
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  31489947 agggtttgtatag--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacggga 31490044  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  31490045 agagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggc 31490144  T
Q  218 tgctct-ctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  31490145 tgctctccccccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaat 31490193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Original strand, 17324103 - 17324345
Alignment:
Q  26 tatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctg 125  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||  ||    
T  17324103 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattg 17324202  T
Q  126 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctg--ctc 222  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||||| |||| |||||  |||    
T  17324203 gaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctc 17324302  T
Q  223 tctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17324303 tccccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 17324345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28207315 - 28207068
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  28207315 agggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacagga 28207216  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| |||||  || ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  28207215 agagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggc 28207118  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207117 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 28207068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 17318925 - 17319168
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  17318925 agggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaacag------gattgagtctcttggttacggga 17319018  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  17319019 acagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggaggg 17319118  T
Q  217 ctgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319119 ctgctctctccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 17319168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248551
Alignment:
Q  53 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 152  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  153 cttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgct--ctctcctagactaggtcaatttggaccg 249  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  250 aactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaat 25248551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 78 - 265
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757811
Alignment:
Q  78 ttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttc 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  178 tcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    || |||| |||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51757723 tc-tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 51757811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 40133978 - 40134226
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  40133978 ggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaag 40134077  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggct 218  Q
    ||  || |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  40134078 agattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggct 40134177  T
Q  219 gctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||  || | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  40134178 gctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaat 40134226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786120
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 23786033  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23786034 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 23786120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 71 - 265
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429239
Alignment:
Q  71 attcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccat 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  171 tgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaat 16429239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231843
Alignment:
Q  53 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 151  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  152 acttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccg 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 16231828  T
Q  250 aactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||    
T  16231829 aact-ggtcaacaaat 16231843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Original strand, 16432455 - 16432677
Alignment:
Q  47 acaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||| ||    
T  16432455 acaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgc 16432554  T
Q  147 gggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct---cctagactaggtcaatt 242  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||   || ||||||||||||||    
T  16432555 gggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatt 16432654  T
Q  243 tggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  16432655 tggaccgaacttggtcaacaaat 16432677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31423123 - 31422860
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaac-aaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31423123 agggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacggg 31423024  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tata------------ 203  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||                
T  31423023 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagg 31422924  T
Q  204 gtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31422923 gtgaaacagagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaat 31422860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Original strand, 47451680 - 47451919
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |         ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47451680 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt------ttaggattgagtctcttggttacggga 47451773  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | |    
T  47451774 agagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgac 47451873  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 261  Q
    ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451874 tgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 42922265 - 42922513
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42922265 agggtttgtatagagtttgctccta-gcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggga 42922361  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||| | ||||||     
T  42922362 agagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggagga 42922461  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  ||  |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  42922462 ctgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaat 42922513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 6823917 - 6824090
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctctt-------ggt 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||       |||    
T  6823917 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggt 6824016  T
Q  111 tacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 184  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6824017 tacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 6824090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14183838 - 14183590
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14183838 agggtttgtatagaggttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacggga 14183742  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  | | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| ||    
T  14183741 agagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgg 14183642  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  14183641 ctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 14183590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 127 - 265
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816167
Alignment:
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct- 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||     
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  226 -cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 23816167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115102
Alignment:
Q  66 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 165  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  166 cccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 262  Q
    || |||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  263 aat 265  Q
    |||    
T  6115104 aat 6115102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15669640 - 15669433
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15669640 agggtttgtataaagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 15669544  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | || | ||||||||| ||||||| | |||| ||    
T  15669543 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgg 15669444  T
Q  217 ctgctctctcc 227  Q
    |||||||||||    
T  15669443 ctgctctctcc 15669433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8347476 - 8347284
Alignment:
Q  64 agggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgt 163  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8347476 agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgt 8347377  T
Q  164 aacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctc--tctcctagactaggtca-atttggaccgaac 252  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||| | ||||||| |||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8347376 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaac 8347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 49495411 - 49495222
Alignment:
Q  67 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49495411 gttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaac 49495312  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggct--gctctctcctagactaggtcaatttggaccgaact 253  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||||||   ||||| || |||||| |||||||| |||||||||    
T  49495311 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaact 49495222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18800775 - 18800612
Alignment:
Q  65 gggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 164  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18800775 gggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgta 18800676  T
Q  165 acccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcc 227  Q
     ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18800675 tcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcc 18800612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8349296 - 8349119
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||    
T  8349296 ggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaag 8349200  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    ||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||||  | ||||||||||||    
T  8349199 agattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcat 8349119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738668
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca---tatagtgaatcggagggctgctctctc 226  Q
    || ||||| ||||||||| || |||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctc 30738668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561750
Alignment:
Q  65 gggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| || ||  || |||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  164 aacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 259  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||| | |  |||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  260 acaaat 265  Q
    ||||||    
T  16561745 acaaat 16561750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790401
Alignment:
Q  66 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttatttttgta 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  165 acccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctc-tcctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 261  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 30790404  T
Q  262 aaa 264  Q
    |||    
T  30790403 aaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13125660 - 13125500
Alignment:
Q  66 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgta 164  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  13125660 ggttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgta 13125561  T
Q  165 acccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctc 224  Q
    |||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||| | |||||||    
T  13125560 accctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctc 13125500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613238
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||  || | |||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 262  Q
    || ||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||| | | ||| ||| ||||||  || ||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  263 aat 265  Q
    |||    
T  26613240 aat 26613238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155865
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattagg 155865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 265
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358854
Alignment:
Q  191 tactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 13358854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26520321 - 26520206
Alignment:
Q  66 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttg------gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  26520321 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttatt 26520222  T
Q  159 tttgtaacccattgat 174  Q
     |||||||||||||||    
T  26520221 cttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232658
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 265
Target Start/End: Original strand, 15916564 - 15916673
Alignment:
Q  160 ttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaa-tttggaccgaactgg 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15916564 ttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaactgg 15916663  T
Q  256 gtcaacaaat 265  Q
    || |||||||    
T  15916664 gtaaacaaat 15916673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401342
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526527
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353467
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 21353467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 27916576 - 27916779
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||| ||||||||   | ||||| ||| || ||||    
T  27916576 ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaac 27916675  T
Q  167 c--cattgatttctcttttgcaacgttactcatc-atatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 260  Q
    |  | ||||| |||| |||| || ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||    
T  27916676 cttctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaa 27916774  T
Q  261 caaat 265  Q
    |||||    
T  27916775 caaat 27916779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 200
Target Start/End: Original strand, 28279346 - 28279480
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaa 165  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||| ||||||    
T  28279346 ttgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 28279445  T
Q  166 cccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    | |||||   ||||||||| || ||||||||||||    
T  28279446 ctcattggcatctcttttgtaaagttactcatcat 28279480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521776
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104414
Alignment:
Q  72 ttcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattt-ttgtaaccca 169  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||   ||  ||||||||||||||||||   | ||| || ||| |||||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  170 ttgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctct-ctcctagactaggt 237  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctcctcccagactaggt 43104414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||  | | |||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393404
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattag 2393404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26332781 - 26332719
Alignment:
Q  46 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggt 110  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26332781 aacaaacactaggtttgg--gtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476265
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9476329 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447273
Alignment:
Q  237 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 13447273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47102934
Alignment:
Q  202 tagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 3874101 - 3874347
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3874101 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaaga 3874200  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3874201 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 3874300  T
Q  221 tctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874301 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 3874347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 608822 - 609071
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  608822 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 608921  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  608922 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 609021  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  609022 tgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 609071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28251814 - 28251565
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28251814 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 28251715  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28251714 agaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggc 28251615  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251614 tgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 28251565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530452
Alignment:
Q  28 tagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctggg 43530312  T
Q  128 actttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc--tctct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  43530313 actttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctct 43530412  T
Q  226 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530413 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 43530452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 14807839 - 14808098
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14807839 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 14807938  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14807939 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 14808038  T
Q  218 tgctctct------------cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808039 tgctctctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 14808098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 27829385 - 27829633
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27829385 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 27829484  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27829485 agaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggc 27829583  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829584 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 27829633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22684903 - 22684651
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22684903 agggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 22684804  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc---attgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22684803 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggag 22684704  T
Q  215 ggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684703 ggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 22684651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 15809307 - 15809555
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15809307 agggtttgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 15809405  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15809406 agaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggc 15809505  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809506 tgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 15809555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 27827074 - 27827322
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27827074 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagga 27827173  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27827174 agaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggc 27827272  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827273 tgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 27827322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 32339397 - 32339646
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32339397 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 32339496  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32339497 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggc 32339596  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32339597 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaat 32339646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30480747 - 30480501
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  30480747 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 30480648  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||    
T  30480647 gattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgc 30480548  T
Q  221 tctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480547 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 30480501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27107144 - 27106895
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27107144 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 27107045  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27107044 agagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggc 27106945  T
Q  218 tgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27106944 tgctatctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 27106895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28283466 - 28283219
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28283466 agggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggga 28283367  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28283366 agagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 28283268  T
Q  218 tgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283267 tgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 28283219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 44720935 - 44721180
Alignment:
Q  22 tttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa-cactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44720935 tttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 44721034  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || |||| |||||    
T  44721035 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgc 44721133  T
Q  221 tctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44721134 tctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 44721180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 15068069 - 15068318
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  15068069 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaa 15068168  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  15068169 agaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggc 15068268  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15068269 tgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaat 15068318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 15072800 - 15073048
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15072800 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 15072899  T
Q  120 a-ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggct 218  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  15072900 agggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggct 15072999  T
Q  219 gctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15073000 gctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaat 15073048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 27911102 - 27911350
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27911102 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 27911201  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||     
T  27911202 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggt 27911301  T
Q  218 tgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27911302 tgctctctccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaat 27911350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 27957521 - 27957769
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27957521 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 27957620  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||     
T  27957621 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggt 27957720  T
Q  218 tgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27957721 tgctctctccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaat 27957769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 18810796 - 18811044
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18810796 agggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 18810895  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  18810896 ataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggc 18810994  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18810995 tgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaat 18811044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14419438 - 14419188
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419438 agggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 14419339  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||    
T  14419338 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgg 14419239  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419238 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 14419188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 43079690 - 43079939
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  43079690 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 43079789  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  43079790 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 43079888  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43079889 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 43079939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 4424106 - 4424355
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4424106 agggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 4424205  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4424206 agagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggc 4424305  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424306 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 4424355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 18812980 - 18813218
Alignment:
Q  28 tagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 127  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18812980 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtg 18813079  T
Q  128 actttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18813080 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 18813178  T
Q  228 t--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
       | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18813179 cccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 18813218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 1225254 - 1225504
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1225254 agggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 1225353  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-ttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  1225354 agagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgg 1225453  T
Q  217 ctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    | |||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1225454 ccgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 1225504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 43082063 - 43082310
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaa 118  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  43082063 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaa 43082162  T
Q  119 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggct 218  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  43082163 gagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 43082261  T
Q  219 gctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43082262 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 43082310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 41384832 - 41385081
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41384832 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacggga 41384931  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||  |||| |||||||||||| |||||| || || ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41384932 agagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggc 41385031  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41385032 tgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 41385081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13858731 - 13858482
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13858731 agggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacggga 13858632  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  13858631 agagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagaggg 13858533  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13858532 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaat 13858482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 36865626 - 36865874
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||    
T  36865626 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacggga 36865722  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||  |    
T  36865723 agagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatg 36865822  T
Q  217 ctgctctct---cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36865823 ctgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaat 36865874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24873428 - 24873179
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  24873428 agggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacgga 24873329  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  24873328 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 24873230  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || | |||||||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  24873229 ctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaat 24873179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5372425 - 5372174
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5372425 agggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 5372326  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5372325 agagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaggg 5372226  T
Q  217 ctgctctct---cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     | ||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5372225 ttactctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaat 5372174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 41382761 - 41382999
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||           |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41382761 agggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtctcttggttacggga 41382849  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41382850 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggc 41382949  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41382950 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 41382999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956295
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggct 218  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  219 gctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     ||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaat 15956295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 21482402 - 21482648
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21482402 agggtttgtataaagtttgct-cttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatggga 21482497  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  21482498 agagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggaggg 21482597  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21482598 ctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaat 21482648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 265
Target Start/End: Original strand, 25952613 - 25952858
Alignment:
Q  23 ttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagg 122  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||      
T  25952613 ttgtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaa 25952712  T
Q  123 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgct 221  Q
     || ||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  25952713 ttgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgct 25952812  T
Q  222 ctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25952813 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaat 25952858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 21480594 - 21480832
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21480594 agggtttgtatggagtttgct-cttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacggga 21480689  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||   ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  21480690 agatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagaggg 21480789  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 257  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21480790 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15185955 - 15185712
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctct--tggttacggga 117  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  15185955 ggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacggga 15185856  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||        |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  15185855 agaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggagga 15185763  T
Q  217 ctg--ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15185762 ctgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 15185712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 14477364 - 14477520
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14477364 agggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacggga 14477463  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgat 174  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14477464 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33541635 - 33541413
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33541635 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacggga 33541536  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||                      ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  33541535 agagattgggacttttggtagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggc 33541458  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 260  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33541457 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaa 33541413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Original strand, 31162343 - 31162550
Alignment:
Q  64 agggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  31162343 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgt 31162442  T
Q  164 aacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat-atagtgaatcggagggctgctctctcct----agactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 257  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||     ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31162443 aactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggt 31162542  T
Q  258 caacaaat 265  Q
     |||||||    
T  31162543 aaacaaat 31162550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3005829 - 3005628
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 167  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3005829 ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatc 3005730  T
Q  168 cattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||  || |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  3005729 cattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaa 3005630  T
Q  264 at 265  Q
    ||    
T  3005629 at 3005628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181772
Alignment:
Q  53 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaag-attgagtctcttggttacg--ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggg 149  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  150 agacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcata 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578274
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 262  Q
    |  ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||  |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  263 aat 265  Q
    |||    
T  31578276 aat 31578274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 37214438 - 37214317
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  37214438 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacggga 37214348  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgg 148  Q
    || |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  37214347 agcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035458
Alignment:
Q  65 gggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  164 aacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagac--taggtcaat-ttggaccgaactgggt 257  Q
    ||||| ||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  258 caacaaat 265  Q
     |||||||    
T  31035451 aaacaaat 31035458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5622985 - 5622882
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  5622985 agggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacggga 5622886  T
Q  118 agag 121  Q
    ||||    
T  5622885 agag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Original strand, 26775289 - 26775378
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctctt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  26775289 agggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468127
Alignment:
Q  136 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctg--ctctctcctagac 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||   ||||||||  |||||||| |||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  233 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaat 2468127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 35872630 - 35872554
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaa 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872630 agggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaa 35872554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872478
Alignment:
Q  152 acttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 227  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 35872478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31573924 - 31573794
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||     
T  31573924 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 31573825  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcat 197  Q
     | ||||| ||||||||| || |||||||||    
T  31573824 tctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021228
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757388
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327969
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28327969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895563
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590855
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812608
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332692
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554908
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 29554908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37214319 - 37214262
Alignment:
Q  210 cggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214319 cggatggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 37214262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 2468306 - 2468261
Alignment:
Q  65 gggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2468306 gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799558
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 17799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847740
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg--gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 17847740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985199
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 13985199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 102
Target Start/End: Original strand, 31035157 - 31035238
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagt 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31035157 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179692
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23179740 cactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg 23179692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12702677 - 12702634
Alignment:
Q  220 ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12702677 ctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12702634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 3895957 - 3896035
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||| |||||||    
T  3895957 ttgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattagg 3896035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattag 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21033930
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  21033870 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag-ggctgggac-ttgggtagaaatagg 21033930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26268412 - 26268354
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 144  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26268412 aaacactattaagattga--ctcttggtcacggaaagaggatgggac-ttgggtagaattag 26268354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 23799606 - 23799670
Alignment:
Q  201 atagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23799606 atagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Original strand, 19752424 - 19752487
Alignment:
Q  202 tagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19752424 tagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41730 - 41481
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41730 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 41631  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41630 agaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 41531  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41530 tgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaat 41481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14629 - 14380
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14629 agggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacggga 14530  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14529 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 14430  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14429 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 14380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 15060 - 15309
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  15060 agggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaa 15159  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||    
T  15160 agagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggc 15259  T
Q  218 tgctctctcctaga--ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||   |  |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15260 tgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaat 15309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 69538 - 69290
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  69538 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 69439  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  69438 agaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagc 69340  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69339 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 69290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 73270 - 73207
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgg 81  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  73270 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73160
Alignment:
Q  42 ttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 92  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 97)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 6745101 - 6745349
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6745101 agggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactaggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 6745199  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6745200 agaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 6745299  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745300 tgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 6745349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 658600 - 658354
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  658600 agggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttggttacggga 658501  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  658500 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggc 658401  T
Q  218 tgctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658400 tgctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 658354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 2174951 - 2175199
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2174951 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacggga 2175050  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2175051 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggc 2175149  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175150 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 2175199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10529338 - 10529097
Alignment:
Q  26 tatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctg 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10529338 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 10529239  T
Q  126 ggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10529238 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctct 10529139  T
Q  226 --cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529138 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 10529097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 21948058 - 21948307
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21948058 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 21948157  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21948158 agaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggc 21948257  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21948258 tgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaat 21948307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 38882138 - 38882386
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38882138 agggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 38882237  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38882238 agaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 38882336  T
Q  218 tgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882337 tgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 38882386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Original strand, 4236661 - 4236900
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4236661 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 4236760  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4236761 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 4236860  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgg 255  Q
    ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||    
T  4236861 tgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgg 4236900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 18469043 - 18469290
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18469043 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 18469142  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | || || ||    
T  18469143 agaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagc 18469242  T
Q  218 tgctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18469243 tgctctctcccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaat 18469290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 18466716 - 18466965
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18466716 agggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaa 18466815  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | ||||| ||    
T  18466816 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagc 18466915  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466916 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 18466965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25921720 - 25921471
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25921720 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 25921621  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  25921620 agaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagc 25921521  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921520 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 25921471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 27910482 - 27910731
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27910482 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggga 27910581  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | ||||| ||    
T  27910582 agaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagc 27910681  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910682 tgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 27910731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 39854515 - 39854764
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39854515 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacggga 39854614  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39854615 agagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggc 39854714  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39854715 tgctctctcccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 39854764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 25804057 - 25804305
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25804057 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgaga 25804156  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25804157 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 25804256  T
Q  218 tgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25804257 tgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaat 25804305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18511459 - 18511210
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18511459 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 18511360  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18511359 agagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 18511260  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18511259 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 18511210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 16776190 - 16776438
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16776190 agggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 16776289  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16776290 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggc 16776388  T
Q  218 tgc--tctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||  |||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776389 tgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaat 16776438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 27912568 - 27912817
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27912568 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtga 27912667  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | | |||  |    
T  27912668 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaac 27912767  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912768 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 27912817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 6747341 - 6747585
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6747341 gtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactaggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 6747439  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6747440 gactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgc 6747538  T
Q  221 tctctc-ct-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747539 tctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 6747585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2818581 - 2818333
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggtt-gattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaa 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2818581 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaa 2818482  T
Q  119 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggct 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  2818481 aaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggact 2818382  T
Q  219 gctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2818381 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 2818333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10474570 - 10474321
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  10474570 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacagga 10474471  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  10474470 agagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggc 10474371  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10474370 tgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 10474321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18509565 - 18509316
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18509565 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 18509466  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18509465 agagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggc 18509366  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18509365 tgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaat 18509316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34477301 - 34477051
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34477301 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacggg 34477202  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagg 215  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34477201 aagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagg 34477103  T
Q  216 gctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477102 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 34477051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 40221554 - 40221804
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40221554 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagga 40221653  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| ||    
T  40221654 agagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgg 40221753  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221754 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 40221804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Original strand, 18596677 - 18596924
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18596677 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacggga 18596776  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| ||    
T  18596777 agagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgg 18596876  T
Q  217 ctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 262  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18596877 ctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 18596924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1189854 - 1189605
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1189854 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaag 1189755  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggct 218  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||| | ||||||| |    
T  1189754 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggat 1189655  T
Q  219 gctctctcct---agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189654 gctctctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 1189605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16092447 - 16092197
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16092447 agggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 16092348  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16092347 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaggg 16092248  T
Q  217 ctgctctctc--ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  16092247 ttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaat 16092197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 26097765 - 26098012
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26097765 agggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacggga 26097863  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |||    
T  26097864 aaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggc 26097962  T
Q  218 tgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26097963 tgctctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaat 26098012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505841
Alignment:
Q  64 agggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  164 aacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20505843  T
Q  264 at 265  Q
    ||    
T  20505842 at 20505841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34479666 - 34479416
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  34479666 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacagg 34479567  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagg 215  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34479566 aagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagg 34479468  T
Q  216 gctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479467 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 34479416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 31545112 - 31545361
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31545112 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacggg 31545211  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  31545212 aagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggaggg 31545310  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31545311 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 31545361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21684698 - 21684450
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21684698 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacggga 21684599  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21684598 agaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggc 21684500  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684499 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 21684450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 25904135 - 25904384
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25904135 agggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 25904234  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  | || ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  25904235 agagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgac 25904334  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25904335 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 25904384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 265
Target Start/End: Original strand, 695924 - 696159
Alignment:
Q  32 gtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  695924 gtttgtatctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 696022  T
Q  132 tgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||     
T  696023 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccccc 696122  T
Q  229 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696123 agacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 696159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17818734 - 17818490
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17818734 gtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaaga 17818635  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| | | ||||||| |    
T  17818634 gattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggcttc 17818535  T
Q  221 tctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818534 tctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 17818490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 17072915 - 17073165
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  17072915 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttagggga 17073014  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  17073015 agagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggaggg 17073114  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17073115 ctgctctctcccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 17073165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31179618 - 31179369
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31179618 agggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 31179519  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  31179518 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 31179420  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31179419 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 31179369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 24126888 - 24127137
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24126888 agggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacggga 24126987  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24126988 agagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggc 24127087  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24127088 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 24127137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 15552277 - 15552526
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  15552277 agggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacggg 15552376  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  15552377 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 15552475  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15552476 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 15552526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 31542767 - 31543015
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31542767 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 31542866  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  31542867 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggaggg 31542964  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31542965 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 31543015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410303
Alignment:
Q  53 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 152  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  153 cttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccga 250  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||  || |||||||||||  |||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  251 actgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaat 4410303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36402575 - 36402326
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36402575 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacggga 36402476  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
     |||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |    
T  36402475 ggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtc 36402376  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  36402375 tgctctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaat 36402326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 10586873 - 10587113
Alignment:
Q  28 tagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 126  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||  ||     
T  10586873 tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattga 10586972  T
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct- 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  10586973 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 10587071  T
Q  226 --cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
      || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10587072 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 10587113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31472860 - 31472610
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31472860 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 31472761  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||  | | || || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31472760 agagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggg 31472661  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31472660 ttgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 31472610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585742
Alignment:
Q  53 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  153 cttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccga 250  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  251 actgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||    
T  41585756 actgggtcaacaaat 41585742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37706027 - 37705778
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  37706027 agggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtga 37705928  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  | ||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||    
T  37705927 agagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggc 37705828  T
Q  218 --tgctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
      | ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37705827 tattctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 37705778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39398240 - 39397996
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  39398240 agggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgga 39398142  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||  || ||||||| || |||| ||    
T  39398141 aagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatgg 39398042  T
Q  217 ctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 260  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39398041 ctgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 39397996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Original strand, 6756528 - 6756772
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6756528 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaag 6756627  T
Q  120 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggct 218  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  6756628 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggct 6756724  T
Q  219 gctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 264  Q
    |||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6756725 gctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 6756772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 2954448 - 2954697
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  2954448 agggtttgtgtataatttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgag 2954547  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2954548 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggaggg 2954646  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
     ||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2954647 atgctctctcccccaaactaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaat 2954697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798328
Alignment:
Q  65 gggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  165 acccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 262  Q
    |||||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  263 aat 265  Q
    |||    
T  39798326 aat 39798328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749981
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 10749894  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10749895 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 10749981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 265
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724174
Alignment:
Q  48 caaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg 147  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  148 ggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttgg 245  Q
    || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  246 accgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaat 2724174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31466225 - 31465987
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31466225 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacggga 31466126  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||          |||||    
T  31466125 agagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat----------agggc 31466037  T
Q  218 tgctct--ctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31466036 tgctctcacccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 31465987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34530913 - 34530731
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34530913 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacggga 34530814  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    ||||  | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||    
T  34530813 agagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcat 34530731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 21288796 - 21289042
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttt------tgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21288796 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggtt 21288894  T
Q  112 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcg 211  Q
    ||||||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||| |||        |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21288895 acgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat--------cttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacg 21288986  T
Q  212 gagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21288987 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaat 21289042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665324
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 23665237  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23665238 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 23665324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793263
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 23793350  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23793349 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 23793263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373135
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattga-gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 3373222  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3373221 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 3373135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757457
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc- 10757370  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  10757371 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaat 10757457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354573
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 15354660  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15354659 tttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 15354573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208857
Alignment:
Q  67 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  166 cccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 263  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaa 36208855  T
Q  264 at 265  Q
    ||    
T  36208856 at 36208857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12556167 - 12555921
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12556167 gtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaaga 12556068  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-ttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctg 219  Q
     | | ||| ||| ||||||||||| |  ||||||| || ||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  12556067 -gattggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctg 12555969  T
Q  220 c--tctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |  |||| || | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12555968 ctatctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaat 12555921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356849
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 15356936  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15356935 tttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 15356849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960130
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 38960217  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38960216 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 38960130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 20045042 - 20045172
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20045042 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccggga 20045141  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgg 148  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20045142 agagattgggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 228
Target Start/End: Original strand, 9020299 - 9020461
Alignment:
Q  67 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9020299 gttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 9020398  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcct 228  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9020399 ccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcct 9020461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23742023 - 23741857
Alignment:
Q  99 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatc 198  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23742023 gagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 23741926  T
Q  199 atatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23741925 aaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 23741857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 20043082 - 20043208
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20043082 agggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 20043181  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattag 144  Q
    ||||  || |||||||| |||||||||    
T  20043182 agagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6661430 - 6661182
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6661430 agggtatgtatagagtttg-ttcttggcaacaaacactagagtt--ggggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 6661334  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||   || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||| | ||||||| | |||| |     
T  6661333 agaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatga 6661234  T
Q  217 ctgctctctcc--tagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  6661233 ctgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaat 6661182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 26098498 - 26098395
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26098498 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaa 26098399  T
Q  118 agag 121  Q
    ||||    
T  26098398 agag 26098395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17413365 - 17413204
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  || |||||| ||||||||||||   | | ||||||| |||||||    
T  17413365 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaac 17413266  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcc 227  Q
    || ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  17413265 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcc 17413204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143749
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaac 166  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  167 ccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgc--tctctcctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 262  Q
    || ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||| | |||||  |||| |||||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaaca 15143746  T
Q  263 aat 265  Q
    |||    
T  15143747 aat 15143749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 265
Target Start/End: Original strand, 20053923 - 20054118
Alignment:
Q  66 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||      |||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20053923 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtttggagat-----tgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 20054017  T
Q  166 cccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcct--agactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 261  Q
    |||   ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||| || |||    
T  20054018 ccc---gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaac 20054114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26098378 - 26098286
Alignment:
Q  176 tctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcct---agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26098378 tctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaat 26098286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 201
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771025
Alignment:
Q  112 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcata 201  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667599
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||| | ||||| | ||||||| |||| | |||||  |||||||||||  |||||||||||  | ||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    || | ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||  || |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  23667514 tt-gtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaat 23667599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170872
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 1170872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385573
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452556
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445557
Alignment:
Q  88 ctattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25445557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15445372 - 15445264
Alignment:
Q  160 ttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctc-tcctagactaggtcaat-ttggaccgaactggg 256  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15445372 ttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctcttcccagactaggtcagtattggactgaactggg 15445273  T
Q  257 tcaacaaat 265  Q
    | |||||||    
T  15445272 taaacaaat 15445264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 200
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897943
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-gggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttg 184  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  185 caacgttactcatcat 200  Q
     || ||||||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcat 4897943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786465
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattagg 28786465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240489
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattagg 1240489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 154
Target Start/End: Original strand, 42770847 - 42770934
Alignment:
Q  65 gggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagact 154  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770847 gggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962554
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841370
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17841428 cactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaattagg 17841370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22672895
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 22672895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 4754235 - 4754312
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||| || |||||||  || |||||||| ||||||||||    
T  4754235 ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093413
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2144763 - 2144600
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgta 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||   | ||||| ||| |||||    
T  2144763 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgta 2144664  T
Q  165 acc-cattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcc 227  Q
    |||   || || |||| |||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2144663 accttttttatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 2144600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 265
Target Start/End: Original strand, 20043235 - 20043271
Alignment:
Q  229 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20043235 agactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaat 20043271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20507707 - 20507659
Alignment:
Q  20 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggt 68  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  20507707 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520597
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |   |||||||||||||||||||    
T  32520533 gaaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430338
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattagg 35430338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782578
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033714
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgg-gaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagag 34033714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 143
Target Start/End: Original strand, 40222769 - 40222822
Alignment:
Q  89 tattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 143  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  40222769 tattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaatta 40222822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 79226 - 79475
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  79226 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 79325  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  79326 agaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 79425  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  79426 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 79475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 183884 - 183639
Alignment:
Q  21 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaaga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  183884 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aaga 183786  T
Q  121 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  183785 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc 183686  T
Q  221 tctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183685 tctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 183639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 52052 - 52303
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52052 agggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 52151  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52152 agagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggc 52251  T
Q  218 tgctctct----cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52252 tgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 52303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 265
Target Start/End: Original strand, 50235 - 50304
Alignment:
Q  200 tatagtgaatcggagggctgctctctc----ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50235 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaat 50304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 4038 - 4285
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4038 agggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 4136  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4137 agaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 4236  T
Q  218 tgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4237 tgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaat 4285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11720 - 11471
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11720 agggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 11621  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  11620 agagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagc 11521  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11520 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaat 11471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1451
Alignment:
Q  44 ggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 143  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  144 ggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaat 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  242 ttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaat 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 264
Target Start/End: Original strand, 2921 - 3168
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2921 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 3020  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||    
T  3021 agaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggc 3119  T
Q  218 tgc--tctctcctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 264  Q
    |||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3120 tgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 3168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 6240 - 6489
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattga-gtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6240 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacggg 6339  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6340 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggaggg 6438  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  6439 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaat 6489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 29212 - 29460
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29212 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacggga 29311  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29312 agaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggc 29410  T
Q  218 tgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29411 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 29460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 82 - 331
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  82 agggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtg 181  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  182 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 280  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  281 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Original strand, 2083 - 2291
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2083 agggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 2181  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2182 aaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggc 2281  T
Q  218 tgctctctcc 227  Q
    | ||||||||    
T  2282 tactctctcc 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 79900 - 80149
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  79900 agggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacggg 79999  T
Q  117 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 216  Q
    |||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  80000 aagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggg 80098  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  80099 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaat 80149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Original strand, 35680 - 35819
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35680 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacggga 35779  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35780 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 265
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35884
Alignment:
Q  200 tatagtgaatcggagggctgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaat 35884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16066 - 15818
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16066 agggtttgtatagagtttgctccta-gcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggga 15970  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||| | ||||||     
T  15969 agagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggagga 15870  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  ||  |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  15869 ctgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaat 15818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22405
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||     
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc- 22318  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22319 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 22405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24680
Alignment:
Q  82 gaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||     
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc- 24593  T
Q  181 tttgcaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24594 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 24680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 85271 - 85521
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||    
T  85271 agggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgaga 85370  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 216  Q
    ||||  || ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||| | |||| |     
T  85371 agagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatga 85470  T
Q  217 ctgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||    
T  85471 ctgctctctcccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaat 85521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1842 - 1639
Alignment:
Q  66 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1842 ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaa 1743  T
Q  166 cccattgatttctcttttgcaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct--cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 261  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||  || | |||||||||  ||| ||||||||||||| |||    
T  1742 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgggtaaac 1643  T
Q  262 aaat 265  Q
    ||||    
T  1642 aaat 1639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16895 - 16716
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggga 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  16895 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacggga 16799  T
Q  118 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttttgcaacgttactcatcat 200  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  16798 agagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 183
Target Start/End: Original strand, 4901 - 5016
Alignment:
Q  68 ttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 167  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||  ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4901 ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 5000  T
Q  168 cattgatttctctttt 183  Q
    ||||||| ||||||||    
T  5001 cattgatatctctttt 5016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  83 aaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16386
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1488 - 1449
Alignment:
Q  226 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1488 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 1449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4677
Alignment:
Q  211 ggagggctgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaat 4677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17107
Alignment:
Q  86 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggac-ttgggtagaattagg 17107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 1078 - 993
Alignment:
Q  18 agggtttgtatagagtttgtttc-----tttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  1078 agggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University