View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18304_high_1 (Length: 802)

Name: NF18304_high_1
Description: NF18304
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18304_high_1
NF18304_high_1
[»] chr1 (120 HSPs)
chr1 (301-755)||(29257066-29257506)
chr1 (19-196)||(29257605-29257782)
chr1 (609-755)||(37199164-37199311)
chr1 (624-754)||(24590469-24590600)
chr1 (620-755)||(10654272-10654408)
chr1 (603-754)||(23281254-23281406)
chr1 (618-755)||(34028726-34028864)
chr1 (624-754)||(29256843-29256974)
chr1 (613-755)||(42607522-42607665)
chr1 (618-755)||(14775978-14776116)
chr1 (610-755)||(30293010-30293156)
chr1 (609-754)||(33753221-33753367)
chr1 (618-755)||(34028964-34029102)
chr1 (609-754)||(45305654-45305799)
chr1 (618-755)||(51691879-51692017)
chr1 (619-755)||(22584357-22584494)
chr1 (618-738)||(34279501-34279622)
chr1 (618-754)||(52412842-52412979)
chr1 (609-755)||(14118526-14118673)
chr1 (618-755)||(19986365-19986503)
chr1 (618-755)||(51810142-51810280)
chr1 (618-754)||(18793696-18793833)
chr1 (619-755)||(50574760-50574897)
chr1 (623-755)||(52412608-52412741)
chr1 (600-755)||(10654017-10654172)
chr1 (618-754)||(46738968-46739104)
chr1 (609-755)||(25088012-25088159)
chr1 (618-755)||(16267720-16267858)
chr1 (618-755)||(21035990-21036128)
chr1 (624-741)||(22584609-22584727)
chr1 (618-755)||(28970424-28970562)
chr1 (611-755)||(30611218-30611363)
chr1 (618-749)||(32563964-32564096)
chr1 (609-755)||(4045095-4045242)
chr1 (613-755)||(6181616-6181759)
chr1 (613-755)||(30293256-30293398)
chr1 (618-748)||(32564200-32564330)
chr1 (636-755)||(33753459-33753578)
chr1 (613-755)||(50118347-50118490)
chr1 (618-755)||(9881557-9881694)
chr1 (618-755)||(10923606-10923744)
chr1 (618-755)||(13944754-13944892)
chr1 (618-755)||(16267933-16268070)
chr1 (618-755)||(35986237-35986375)
chr1 (618-755)||(51692114-51692251)
chr1 (618-754)||(11394904-11395041)
chr1 (618-754)||(49291227-49291364)
chr1 (623-740)||(50574525-50574642)
chr1 (618-754)||(50921065-50921202)
chr1 (618-755)||(4045342-4045480)
chr1 (657-755)||(28112795-28112893)
chr1 (618-755)||(37198937-37199075)
chr1 (633-754)||(11787761-11787882)
chr1 (611-755)||(13944509-13944654)
chr1 (618-754)||(36657745-36657882)
chr1 (667-755)||(46949979-46950067)
chr1 (635-750)||(21384960-21385074)
chr1 (613-755)||(24655586-24655729)
chr1 (633-755)||(21385179-21385301)
chr1 (618-751)||(30792445-30792579)
chr1 (618-755)||(34279245-34279383)
chr1 (625-753)||(34621880-34622009)
chr1 (635-751)||(46949779-46949895)
chr1 (621-755)||(5463361-5463496)
chr1 (657-755)||(5118096-5118194)
chr1 (618-751)||(6181863-6181997)
chr1 (604-753)||(25088261-25088410)
chr1 (618-754)||(45305414-45305552)
chr1 (662-755)||(13831265-13831358)
chr1 (612-754)||(32517757-32517898)
chr1 (611-754)||(44222190-44222334)
chr1 (635-755)||(49291016-49291136)
chr1 (618-740)||(1831669-1831792)
chr1 (625-755)||(27209181-27209312)
chr1 (633-755)||(30611463-30611586)
chr1 (633-755)||(14775766-14775888)
chr1 (618-755)||(24655829-24655967)
chr1 (618-755)||(40533930-40534068)
chr1 (618-723)||(50921366-50921472)
chr1 (636-741)||(32517629-32517734)
chr1 (618-722)||(36077276-36077381)
chr1 (634-754)||(24590248-24590368)
chr1 (613-755)||(1831907-1832050)
chr1 (672-755)||(9119535-9119618)
chr1 (624-753)||(10923373-10923504)
chr1 (612-718)||(19885981-19886088)
chr1 (680-755)||(30792683-30792758)
chr1 (618-754)||(11787985-11788121)
chr1 (633-754)||(42607746-42607867)
chr1 (633-751)||(4054569-4054688)
chr1 (618-755)||(4550843-4550981)
chr1 (667-753)||(19886132-19886216)
chr1 (657-755)||(11797220-11797318)
chr1 (609-755)||(18793935-18794083)
chr1 (612-733)||(36884721-36884843)
chr1 (618-755)||(21036225-21036362)
chr1 (625-755)||(3569388-3569520)
chr1 (625-720)||(20260440-20260536)
chr1 (667-755)||(36884947-36885035)
chr1 (684-755)||(50921303-50921374)
chr1 (624-754)||(51810382-51810513)
chr1 (618-755)||(5463123-5463261)
chr1 (633-754)||(9119313-9119434)
chr1 (618-692)||(11797151-11797226)
chr1 (618-754)||(31125941-31126071)
chr1 (618-754)||(40703109-40703246)
chr1 (613-698)||(19886214-19886300)
chr1 (618-689)||(28112726-28112798)
chr1 (602-755)||(2125452-2125599)
chr1 (668-755)||(40702921-40703008)
chr1 (618-754)||(48702125-48702261)
chr1 (618-755)||(36657505-36657644)
chr1 (618-692)||(5117998-5118073)
chr1 (618-755)||(27209392-27209530)
chr1 (667-754)||(31126173-31126260)
chr1 (618-753)||(20260624-20260760)
chr1 (682-754)||(38961145-38961218)
chr1 (618-689)||(11394698-11394769)
chr1 (618-707)||(19269365-19269455)
chr1 (709-755)||(34621718-34621764)
[»] chr2 (97 HSPs)
chr2 (605-751)||(32933583-32933730)
chr2 (618-755)||(28203103-28203241)
chr2 (602-755)||(39454440-39454594)
chr2 (618-755)||(41377360-41377497)
chr2 (618-755)||(16655611-16655749)
chr2 (618-755)||(41377597-41377735)
chr2 (618-754)||(37412822-37412959)
chr2 (618-755)||(38275698-38275838)
chr2 (618-755)||(20908754-20908892)
chr2 (618-754)||(18565071-18565208)
chr2 (611-755)||(43183826-43183971)
chr2 (618-753)||(34820284-34820420)
chr2 (609-755)||(21470291-21470438)
chr2 (618-755)||(31450671-31450809)
chr2 (606-755)||(37744631-37744781)
chr2 (608-755)||(39912869-39913019)
chr2 (612-755)||(28631517-28631661)
chr2 (618-755)||(44612726-44612865)
chr2 (618-748)||(4104164-4104295)
chr2 (618-755)||(5961674-5961812)
chr2 (633-755)||(13354198-13354320)
chr2 (633-755)||(25642511-25642633)
chr2 (618-755)||(27883473-27883611)
chr2 (618-755)||(31450909-31451047)
chr2 (618-754)||(4104403-4104540)
chr2 (618-754)||(27476611-27476748)
chr2 (618-754)||(34127571-34127708)
chr2 (626-753)||(15829733-15829861)
chr2 (618-748)||(39912632-39912764)
chr2 (618-755)||(12303790-12303928)
chr2 (618-755)||(12304397-12304535)
chr2 (633-755)||(13354420-13354542)
chr2 (618-755)||(15137047-15137185)
chr2 (618-755)||(16736106-16736244)
chr2 (633-755)||(17856220-17856342)
chr2 (618-755)||(27132753-27132891)
chr2 (640-754)||(27883701-27883815)
chr2 (618-755)||(28631279-28631417)
chr2 (618-755)||(32933834-32933972)
chr2 (609-754)||(34820523-34820669)
chr2 (611-755)||(27132509-27132654)
chr2 (620-755)||(12304028-12304164)
chr2 (613-751)||(4121010-4121149)
chr2 (618-751)||(14877488-14877620)
chr2 (612-754)||(32503781-32503924)
chr2 (618-755)||(28202865-28203003)
chr2 (612-755)||(40694418-40694557)
chr2 (618-741)||(17856446-17856570)
chr2 (616-755)||(21470538-21470677)
chr2 (624-755)||(36442377-36442509)
chr2 (633-753)||(43183604-43183724)
chr2 (618-748)||(4120769-4120900)
chr2 (618-755)||(10833277-10833416)
chr2 (622-755)||(16260880-16261013)
chr2 (618-755)||(16736341-16736479)
chr2 (625-754)||(35408765-35408895)
chr2 (618-755)||(36211355-36211493)
chr2 (633-755)||(41659766-41659888)
chr2 (611-755)||(16655849-16655994)
chr2 (609-753)||(44915736-44915880)
chr2 (618-755)||(27476371-27476510)
chr2 (618-755)||(39150068-39150206)
chr2 (633-754)||(38275498-38275619)
chr2 (633-753)||(34127810-34127929)
chr2 (633-741)||(34484303-34484411)
chr2 (618-733)||(37744454-37744570)
chr2 (635-755)||(39149867-39149987)
chr2 (624-755)||(40694206-40694338)
chr2 (612-754)||(41659980-41660123)
chr2 (633-752)||(5921632-5921751)
chr2 (618-748)||(45389136-45389267)
chr2 (618-755)||(16261113-16261251)
chr2 (618-755)||(20908516-20908654)
chr2 (633-755)||(25642289-25642411)
chr2 (618-755)||(37412598-37412736)
chr2 (635-754)||(32503569-32503688)
chr2 (609-755)||(33819393-33819539)
chr2 (636-755)||(33819639-33819757)
chr2 (618-723)||(18565278-18565384)
chr2 (657-755)||(36211584-36211682)
chr2 (618-719)||(39454712-39454814)
chr2 (657-751)||(44915986-44916080)
chr2 (633-754)||(36442154-36442276)
chr2 (618-755)||(16350082-16350220)
chr2 (618-755)||(27246226-27246364)
chr2 (632-755)||(27913914-27914037)
chr2 (611-755)||(5720140-5720285)
chr2 (612-677)||(34484234-34484300)
chr2 (637-722)||(11943764-11943849)
chr2 (695-755)||(27246066-27246126)
chr2 (633-755)||(27914136-27914258)
chr2 (618-692)||(20297415-20297490)
chr2 (618-692)||(36211705-36211780)
chr2 (657-755)||(16350314-16350412)
chr2 (605-677)||(44610854-44610926)
chr2 (703-755)||(29078010-29078062)
chr2 (669-723)||(44612548-44612602)
[»] chr8 (87 HSPs)
chr8 (618-755)||(37393720-37393858)
chr8 (607-754)||(18017784-18017932)
chr8 (609-755)||(24456895-24457042)
chr8 (618-755)||(119122-119259)
chr8 (618-754)||(35224011-35224148)
chr8 (611-755)||(6843493-6843640)
chr8 (611-754)||(37393475-37393619)
chr8 (613-755)||(26736125-26736268)
chr8 (623-753)||(31230623-31230754)
chr8 (602-754)||(40094463-40094617)
chr8 (618-755)||(1826034-1826172)
chr8 (618-755)||(1860479-1860617)
chr8 (618-755)||(18018029-18018167)
chr8 (618-755)||(31230856-31230994)
chr8 (618-755)||(39240035-39240173)
chr8 (612-754)||(39912163-39912306)
chr8 (618-755)||(14920654-14920792)
chr8 (618-755)||(18621990-18622128)
chr8 (618-755)||(40040167-40040305)
chr8 (618-754)||(5416817-5416954)
chr8 (618-754)||(35223779-35223916)
chr8 (613-753)||(39240264-39240405)
chr8 (612-755)||(758343-758487)
chr8 (603-754)||(14920401-14920553)
chr8 (618-754)||(36343967-36344103)
chr8 (609-755)||(30650186-30650333)
chr8 (610-755)||(23244758-23244904)
chr8 (618-754)||(3869193-3869330)
chr8 (618-754)||(18914495-18914632)
chr8 (618-741)||(30872788-30872912)
chr8 (613-755)||(23244515-23244658)
chr8 (618-755)||(8653941-8654079)
chr8 (618-755)||(9495266-9495404)
chr8 (635-753)||(21515445-21515563)
chr8 (618-755)||(44254870-44255008)
chr8 (618-753)||(758589-758725)
chr8 (633-733)||(40032693-40032793)
chr8 (633-752)||(26736371-26736490)
chr8 (612-755)||(29026967-29027115)
chr8 (612-753)||(8654181-8654323)
chr8 (618-755)||(11198448-11198586)
chr8 (624-754)||(29027216-29027343)
chr8 (618-755)||(30568519-30568657)
chr8 (635-753)||(44255107-44255225)
chr8 (618-748)||(16645795-16645929)
chr8 (618-755)||(40032431-40032570)
chr8 (657-755)||(44678427-44678525)
chr8 (633-754)||(12873078-12873199)
chr8 (621-755)||(5417056-5417191)
chr8 (618-753)||(40094720-40094856)
chr8 (633-748)||(119366-119481)
chr8 (618-748)||(1825815-1825945)
chr8 (618-748)||(1860260-1860390)
chr8 (633-755)||(3868965-3869090)
chr8 (636-755)||(7041653-7041772)
chr8 (620-754)||(39911924-39912059)
chr8 (602-755)||(7041872-7042021)
chr8 (633-747)||(11639073-11639187)
chr8 (618-755)||(30873021-30873159)
chr8 (618-741)||(6844697-6844821)
chr8 (667-751)||(30568331-30568415)
chr8 (672-755)||(18914320-18914403)
chr8 (625-752)||(26217082-26217209)
chr8 (633-755)||(5525892-5526012)
chr8 (618-754)||(33542389-33542526)
chr8 (609-755)||(28206996-28207143)
chr8 (683-755)||(40040405-40040477)
chr8 (618-692)||(24456739-24456814)
chr8 (633-755)||(410605-410727)
chr8 (618-692)||(44678519-44678593)
chr8 (694-754)||(11639294-11639354)
chr8 (609-755)||(12873291-12873436)
chr8 (667-753)||(32733766-32733852)
chr8 (667-752)||(26217315-26217400)
chr8 (662-755)||(35485921-35486014)
chr8 (686-754)||(9495106-9495174)
chr8 (618-691)||(44678322-44678396)
chr8 (667-755)||(410424-410512)
chr8 (619-754)||(35486107-35486243)
chr8 (667-755)||(33542627-33542715)
chr8 (618-749)||(36344210-36344342)
chr8 (701-752)||(19302274-19302325)
chr8 (607-692)||(15740607-15740693)
chr8 (700-733)||(45436424-45436457)
chr8 (715-755)||(16645648-16645688)
chr8 (668-719)||(18623668-18623719)
chr8 (633-723)||(21512434-21512523)
[»] chr4 (89 HSPs)
chr4 (618-755)||(33625869-33626007)
chr4 (611-754)||(27347841-27347985)
chr4 (609-755)||(46620923-46621070)
chr4 (618-755)||(9010510-9010648)
chr4 (618-755)||(54136096-54136234)
chr4 (618-754)||(21218091-21218228)
chr4 (613-755)||(45911579-45911722)
chr4 (627-755)||(4965885-4966014)
chr4 (618-754)||(29864419-29864556)
chr4 (618-738)||(46200489-46200610)
chr4 (634-754)||(25218328-25218448)
chr4 (618-753)||(28570666-28570802)
chr4 (607-755)||(43316874-43317022)
chr4 (612-755)||(46621170-46621314)
chr4 (618-755)||(33626107-33626245)
chr4 (618-755)||(52914957-52915095)
chr4 (610-754)||(25058830-25058975)
chr4 (618-754)||(45911818-45911955)
chr4 (633-754)||(53645472-53645593)
chr4 (613-755)||(25218084-25218227)
chr4 (618-755)||(29970198-29970335)
chr4 (618-755)||(32384658-32384796)
chr4 (618-755)||(33882192-33882330)
chr4 (612-755)||(34959074-34959218)
chr4 (633-753)||(40067369-40067489)
chr4 (618-753)||(48209953-48210089)
chr4 (613-755)||(1157449-1157592)
chr4 (640-755)||(4793842-4793957)
chr4 (616-754)||(12381298-12381437)
chr4 (612-754)||(24504184-24504327)
chr4 (618-755)||(10014470-10014607)
chr4 (618-755)||(10021611-10021748)
chr4 (618-755)||(21217852-21217990)
chr4 (633-755)||(40067591-40067713)
chr4 (618-755)||(43317122-43317260)
chr4 (618-751)||(44432871-44433005)
chr4 (618-755)||(18862683-18862822)
chr4 (633-755)||(4966111-4966233)
chr4 (624-749)||(9010754-9010880)
chr4 (633-755)||(25593334-25593456)
chr4 (633-755)||(29864197-29864319)
chr4 (618-755)||(34958837-34958974)
chr4 (618-755)||(8246774-8246910)
chr4 (618-754)||(8751292-8751429)
chr4 (633-754)||(37515697-37515818)
chr4 (618-741)||(1205383-1205506)
chr4 (613-748)||(2738880-2739016)
chr4 (618-755)||(46200728-46200866)
chr4 (633-755)||(52915186-52915308)
chr4 (618-753)||(1205622-1205758)
chr4 (624-755)||(27347608-27347740)
chr4 (620-754)||(10014708-10014842)
chr4 (620-754)||(10021849-10021983)
chr4 (625-755)||(25977781-25977912)
chr4 (618-755)||(8246989-8247127)
chr4 (618-755)||(44710408-44710546)
chr4 (618-755)||(45683360-45683498)
chr4 (618-755)||(46535765-46535903)
chr4 (611-755)||(32385055-32385199)
chr4 (609-749)||(38866394-38866535)
chr4 (618-754)||(44710647-44710784)
chr4 (613-755)||(1157203-1157349)
chr4 (633-755)||(21051380-21051502)
chr4 (657-755)||(21051590-21051688)
chr4 (633-754)||(24503960-24504082)
chr4 (657-755)||(44428616-44428714)
chr4 (618-755)||(45683122-45683260)
chr4 (612-755)||(15985465-15985610)
chr4 (612-755)||(22831040-22831185)
chr4 (632-740)||(38866657-38866766)
chr4 (662-755)||(54191638-54191731)
chr4 (635-755)||(43969770-43969890)
chr4 (633-755)||(9657890-9658012)
chr4 (610-754)||(11102218-11102364)
chr4 (618-755)||(46535528-46535665)
chr4 (612-729)||(37515528-37515645)
chr4 (618-755)||(9657672-9657810)
chr4 (618-755)||(11242712-11242845)
chr4 (601-753)||(44169967-44170121)
chr4 (618-755)||(22830801-22830940)
chr4 (667-754)||(42779575-42779662)
chr4 (618-755)||(54136334-54136468)
chr4 (618-754)||(54191829-54191965)
chr4 (667-749)||(21885073-21885155)
chr4 (695-753)||(29970437-29970495)
chr4 (618-754)||(44170223-44170362)
chr4 (618-654)||(29970517-29970553)
chr4 (618-692)||(44428518-44428593)
chr4 (703-753)||(40681417-40681467)
[»] chr3 (118 HSPs)
chr3 (618-755)||(4846839-4846977)
chr3 (618-755)||(54107674-54107812)
chr3 (604-755)||(40410703-40410855)
chr3 (618-755)||(26332324-26332462)
chr3 (618-755)||(26332561-26332703)
chr3 (601-742)||(35580205-35580347)
chr3 (618-754)||(8846320-8846457)
chr3 (618-754)||(34521271-34521408)
chr3 (618-752)||(7274889-7275023)
chr3 (603-753)||(34629972-34630123)
chr3 (609-755)||(41208397-41208544)
chr3 (618-755)||(15862418-15862556)
chr3 (624-754)||(19124416-19124546)
chr3 (618-755)||(41997824-41997962)
chr3 (618-755)||(44069366-44069504)
chr3 (611-755)||(12123322-12123467)
chr3 (618-753)||(7937808-7937944)
chr3 (618-753)||(52268349-52268484)
chr3 (616-755)||(53841269-53841409)
chr3 (605-754)||(7743009-7743160)
chr3 (618-755)||(12123095-12123233)
chr3 (618-755)||(45871702-45871840)
chr3 (611-755)||(40926009-40926154)
chr3 (609-753)||(50819216-50819361)
chr3 (609-753)||(50856503-50856648)
chr3 (639-755)||(28688017-28688133)
chr3 (605-755)||(54108363-54108514)
chr3 (618-755)||(7950280-7950418)
chr3 (618-755)||(8846081-8846219)
chr3 (618-755)||(10756723-10756861)
chr3 (618-755)||(31513868-31514006)
chr3 (618-755)||(43899317-43899455)
chr3 (618-755)||(45171310-45171448)
chr3 (618-755)||(52606134-52606271)
chr3 (633-753)||(45171089-45171209)
chr3 (618-755)||(14353291-14353428)
chr3 (618-755)||(27940277-27940415)
chr3 (618-755)||(31514106-31514243)
chr3 (618-755)||(34521500-34521638)
chr3 (618-755)||(40926254-40926391)
chr3 (618-755)||(44069128-44069266)
chr3 (618-754)||(10756952-10757089)
chr3 (633-754)||(28688234-28688355)
chr3 (618-734)||(43899116-43899233)
chr3 (618-749)||(41208649-41208781)
chr3 (609-747)||(28691364-28691503)
chr3 (618-755)||(54081526-54081665)
chr3 (633-755)||(15862203-15862325)
chr3 (618-755)||(19124194-19124332)
chr3 (618-755)||(21169671-21169809)
chr3 (618-755)||(2829651-2829788)
chr3 (618-753)||(51170625-51170762)
chr3 (621-755)||(17273785-17273920)
chr3 (618-755)||(9028434-9028572)
chr3 (610-755)||(14353043-14353189)
chr3 (618-755)||(17102389-17102527)
chr3 (640-754)||(17102621-17102735)
chr3 (635-753)||(29248342-29248460)
chr3 (613-754)||(54081284-54081425)
chr3 (611-755)||(35753674-35753819)
chr3 (618-754)||(50819461-50819598)
chr3 (618-754)||(50856266-50856403)
chr3 (635-755)||(27254007-27254127)
chr3 (625-755)||(40639360-40639491)
chr3 (610-755)||(46766619-46766766)
chr3 (624-741)||(45871946-45872064)
chr3 (657-754)||(35753477-35753574)
chr3 (667-755)||(53841082-53841170)
chr3 (618-755)||(40969260-40969398)
chr3 (618-755)||(9028196-9028334)
chr3 (633-747)||(22354963-22355077)
chr3 (633-755)||(29248551-29248673)
chr3 (611-754)||(5348577-5348721)
chr3 (619-755)||(7742781-7742918)
chr3 (635-755)||(5348811-5348931)
chr3 (610-755)||(47891756-47891902)
chr3 (618-721)||(52609639-52609743)
chr3 (618-755)||(2829412-2829551)
chr3 (625-755)||(37133289-37133420)
chr3 (625-755)||(53678445-53678576)
chr3 (611-755)||(20963531-20963677)
chr3 (612-733)||(33812723-33812845)
chr3 (603-754)||(40639107-40639259)
chr3 (618-741)||(46766870-46766995)
chr3 (625-754)||(33773034-33773165)
chr3 (618-755)||(17274019-17274157)
chr3 (625-737)||(43844359-43844473)
chr3 (633-755)||(47891534-47891656)
chr3 (686-754)||(43527068-43527136)
chr3 (618-724)||(49222041-49222148)
chr3 (611-755)||(40969497-40969642)
chr3 (618-719)||(53310001-53310103)
chr3 (618-692)||(35753408-35753483)
chr3 (618-739)||(49529078-49529201)
chr3 (633-755)||(53678676-53678798)
chr3 (609-722)||(38911494-38911608)
chr3 (683-752)||(4846667-4846735)
chr3 (657-754)||(22444430-22444527)
chr3 (618-754)||(28691119-28691256)
chr3 (609-677)||(41998135-41998204)
chr3 (657-733)||(50393362-50393439)
chr3 (618-741)||(33771996-33772120)
chr3 (685-741)||(52268176-52268232)
chr3 (700-755)||(588393-588448)
chr3 (612-753)||(2078717-2078859)
chr3 (618-688)||(7937648-7937719)
chr3 (618-692)||(13866970-13867045)
chr3 (612-753)||(21918496-21918637)
chr3 (707-754)||(51311685-51311732)
chr3 (704-754)||(21169909-21169959)
chr3 (695-741)||(43527242-43527287)
chr3 (633-738)||(51883880-51883985)
chr3 (696-755)||(41998062-41998126)
chr3 (695-754)||(7274726-7274785)
chr3 (709-755)||(2078580-2078626)
chr3 (684-733)||(12991413-12991463)
chr3 (618-739)||(44316632-44316754)
chr3 (618-719)||(54247277-54247378)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (612-755)||(24604874-24605017)
chr6 (612-755)||(33544821-33544965)
chr6 (612-755)||(31029523-31029667)
chr6 (635-755)||(33545065-33545185)
chr6 (618-755)||(9173906-9174044)
chr6 (618-755)||(35132606-35132744)
chr6 (618-753)||(3338482-3338618)
chr6 (616-755)||(24605117-24605256)
chr6 (612-755)||(25551579-25551723)
chr6 (618-755)||(11525009-11525146)
chr6 (618-755)||(12903226-12903364)
chr6 (618-755)||(14336907-14337045)
chr6 (635-755)||(33346501-33346621)
chr6 (618-752)||(19135692-19135827)
chr6 (657-752)||(33972452-33972547)
chr6 (616-754)||(1158591-1158732)
chr6 (633-755)||(6220299-6220421)
chr6 (618-755)||(29009959-29010097)
chr6 (618-755)||(33329211-33329349)
chr6 (618-753)||(1860731-1860866)
chr6 (618-754)||(14337146-14337282)
chr6 (635-755)||(35119054-35119174)
chr6 (618-755)||(3288935-3289073)
chr6 (618-755)||(3289153-3289291)
chr6 (624-755)||(3338720-3338850)
chr6 (618-749)||(25551352-25551484)
chr6 (609-755)||(2949292-2949434)
chr6 (633-748)||(11524786-11524901)
chr6 (618-755)||(31029767-31029905)
chr6 (624-755)||(13155850-13155982)
chr6 (624-755)||(13160706-13160838)
chr6 (608-753)||(6220051-6220197)
chr6 (625-754)||(24548485-24548615)
chr6 (613-755)||(13156082-13156220)
chr6 (613-755)||(13160938-13161076)
chr6 (607-752)||(1158837-1158981)
chr6 (633-755)||(7537848-7537970)
chr6 (657-755)||(2949534-2949632)
chr6 (625-749)||(2814560-2814685)
chr6 (624-727)||(32283037-32283141)
chr6 (618-692)||(11524710-11524785)
chr6 (679-755)||(35132844-35132920)
chr6 (640-754)||(12903455-12903569)
chr6 (618-755)||(29010197-29010335)
chr6 (634-748)||(29999653-29999767)
chr6 (694-755)||(33329449-33329510)
chr6 (700-752)||(33972292-33972344)
chr6 (634-752)||(2315601-2315719)
chr6 (618-754)||(24548246-24548383)
chr6 (667-753)||(31754259-31754345)
chr6 (618-739)||(17245582-17245705)
chr6 (612-677)||(33971927-33971993)
chr6 (611-755)||(17544696-17544840)
chr6 (703-753)||(12260538-12260588)
chr6 (709-755)||(29999510-29999556)
[»] scaffold0809 (2 HSPs)
scaffold0809 (606-755)||(4561-4711)
scaffold0809 (603-755)||(4328-4481)
[»] scaffold0236 (2 HSPs)
scaffold0236 (633-755)||(11457-11579)
scaffold0236 (633-755)||(11234-11356)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (618-755)||(47250789-47250927)
chr7 (603-755)||(31715623-31715776)
chr7 (618-753)||(10625329-10625465)
chr7 (618-754)||(18731024-18731161)
chr7 (618-754)||(31715866-31716002)
chr7 (618-753)||(8769527-8769663)
chr7 (624-753)||(9230922-9231052)
chr7 (618-755)||(23437157-23437295)
chr7 (618-755)||(23472799-23472937)
chr7 (620-754)||(47250565-47250699)
chr7 (618-753)||(5238456-5238592)
chr7 (608-755)||(8769277-8769425)
chr7 (608-755)||(35085734-35085882)
chr7 (640-755)||(34568827-34568942)
chr7 (618-739)||(11678961-11679083)
chr7 (633-755)||(41758700-41758822)
chr7 (618-754)||(43726486-43726623)
chr7 (618-753)||(47251142-47251277)
chr7 (618-755)||(11678708-11678846)
chr7 (619-755)||(21522226-21522361)
chr7 (613-754)||(39118010-39118152)
chr7 (618-754)||(23472598-23472735)
chr7 (633-753)||(2357300-2357420)
chr7 (612-755)||(21522461-21522603)
chr7 (633-753)||(26920162-26920282)
chr7 (618-753)||(35085985-35086121)
chr7 (612-747)||(43140697-43140833)
chr7 (618-755)||(2357072-2357210)
chr7 (657-755)||(9230721-9230819)
chr7 (618-755)||(34568588-34568726)
chr7 (618-754)||(9034559-9034696)
chr7 (618-754)||(44486176-44486313)
chr7 (609-755)||(32706728-32706875)
chr7 (625-755)||(36507052-36507183)
chr7 (618-755)||(24119719-24119857)
chr7 (618-755)||(44448155-44448293)
chr7 (618-755)||(44485575-44485713)
chr7 (618-754)||(44447919-44448055)
chr7 (635-755)||(473423-473543)
chr7 (632-754)||(38842266-38842387)
chr7 (600-755)||(32706975-32707130)
chr7 (635-755)||(47305370-47305490)
chr7 (625-754)||(22338284-22338415)
chr7 (632-755)||(38842053-38842174)
chr7 (625-754)||(28349625-28349754)
chr7 (618-754)||(473197-473331)
chr7 (655-753)||(47250940-47251038)
chr7 (611-755)||(37144006-37144151)
chr7 (657-755)||(48703854-48703952)
chr7 (624-701)||(48704105-48704183)
chr7 (625-749)||(37143776-37143900)
chr7 (618-755)||(47305132-47305270)
chr7 (657-755)||(23437395-23437493)
chr7 (618-755)||(31623667-31623805)
chr7 (608-753)||(43726239-43726383)
chr7 (709-755)||(10625180-10625226)
chr7 (607-738)||(15326866-15326998)
chr7 (680-755)||(38676126-38676201)
chr7 (618-687)||(10625111-10625181)
chr7 (703-753)||(17279358-17279408)
chr7 (625-737)||(43050396-43050510)
[»] chr5 (76 HSPs)
chr5 (618-755)||(7210688-7210826)
chr5 (618-755)||(9692924-9693061)
chr5 (618-748)||(9693168-9693299)
chr5 (618-755)||(7399082-7399220)
chr5 (605-754)||(40589298-40589448)
chr5 (605-754)||(40589901-40590051)
chr5 (624-755)||(28392012-28392145)
chr5 (618-755)||(31908933-31909073)
chr5 (618-754)||(40589059-40589196)
chr5 (618-754)||(40589662-40589799)
chr5 (617-755)||(7210460-7210599)
chr5 (609-755)||(12593699-12593846)
chr5 (625-755)||(31656370-31656501)
chr5 (612-755)||(41859920-41860066)
chr5 (618-755)||(15267483-15267621)
chr5 (609-754)||(18514284-18514430)
chr5 (618-755)||(35263737-35263875)
chr5 (618-755)||(36751907-36752045)
chr5 (618-754)||(33699280-33699417)
chr5 (618-753)||(25923364-25923499)
chr5 (618-752)||(39706297-39706432)
chr5 (618-755)||(334301-334439)
chr5 (618-755)||(3878486-3878624)
chr5 (618-755)||(5087812-5087950)
chr5 (618-755)||(10656099-10656237)
chr5 (618-755)||(12694929-12695067)
chr5 (618-755)||(35263499-35263637)
chr5 (609-754)||(15476503-15476648)
chr5 (618-754)||(42710594-42710731)
chr5 (612-755)||(19205186-19205330)
chr5 (618-740)||(5088386-5088509)
chr5 (618-748)||(8418206-8418336)
chr5 (618-755)||(16353397-16353535)
chr5 (618-755)||(31656601-31656739)
chr5 (638-755)||(16353180-16353297)
chr5 (609-748)||(38416139-38416279)
chr5 (618-755)||(5624384-5624522)
chr5 (633-755)||(7399321-7399443)
chr5 (618-755)||(10656337-10656475)
chr5 (618-755)||(32272083-32272221)
chr5 (618-755)||(38416377-38416515)
chr5 (633-754)||(40774359-40774479)
chr5 (618-755)||(29023942-29024077)
chr5 (625-755)||(5152858-5152989)
chr5 (624-754)||(26289031-26289162)
chr5 (625-755)||(41372401-41372532)
chr5 (633-755)||(25923139-25923261)
chr5 (618-754)||(12593461-12593598)
chr5 (618-741)||(8418441-8418565)
chr5 (618-741)||(14143762-14143886)
chr5 (624-723)||(15476277-15476377)
chr5 (612-755)||(31909173-31909317)
chr5 (618-753)||(33763153-33763288)
chr5 (618-755)||(19204949-19205086)
chr5 (633-755)||(33762923-33763048)
chr5 (618-755)||(40774580-40774718)
chr5 (618-755)||(39706060-39706194)
chr5 (605-755)||(17861281-17861424)
chr5 (618-755)||(28391773-28391912)
chr5 (624-753)||(17861050-17861179)
chr5 (610-746)||(15267239-15267375)
chr5 (609-755)||(14051885-14052032)
chr5 (612-754)||(15670395-15670538)
chr5 (633-724)||(17736521-17736612)
chr5 (618-748)||(42710355-42710486)
chr5 (618-755)||(36752145-36752282)
chr5 (608-703)||(21750805-21750901)
chr5 (633-753)||(43570016-43570136)
chr5 (695-755)||(14143591-14143651)
chr5 (601-755)||(26289263-26289418)
chr5 (680-755)||(2597327-2597402)
chr5 (704-754)||(5624622-5624672)
chr5 (618-705)||(3879305-3879393)
chr5 (618-688)||(5460193-5460264)
chr5 (611-656)||(19615420-19615466)
chr5 (601-635)||(20266439-20266473)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (618-755)||(11730-11868)
scaffold0168 (618-754)||(11493-11630)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (618-755)||(13547-13684)
scaffold0188 (613-752)||(13787-13927)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (618-754)||(40596-40733)
scaffold0051 (618-753)||(40357-40493)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (618-755)||(177308-177446)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (618-755)||(45079-45217)
[»] scaffold0045 (4 HSPs)
scaffold0045 (621-755)||(65747-65882)
scaffold0045 (621-755)||(73079-73214)
scaffold0045 (618-755)||(65982-66120)
scaffold0045 (618-755)||(73314-73452)
[»] scaffold1436 (2 HSPs)
scaffold1436 (620-754)||(1483-1617)
scaffold1436 (657-755)||(1718-1815)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (619-747)||(90811-90940)
scaffold0016 (662-747)||(91759-91844)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (671-755)||(11727-11811)
scaffold0444 (618-692)||(11644-11719)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (618-755)||(93193-93333)
scaffold0022 (708-755)||(93432-93479)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (609-755)||(9778-9926)
scaffold0225 (612-755)||(10862-11007)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (612-692)||(25966-26047)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 120)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 301 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 29257506 - 29257066
Alignment:
Q  301 tcagaagtattgaaattacagaaagtaaagtaaagtggtttaccagattgcttgctagcttttacagatctcctctcctcctctcatttttctatccttt 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29257506 tcagaagcattgaaattacagaaagtaaagtaaagtggtttaccagattgcttgctagcttttacagatctcctttcctcctctcatttttctatccttt 29257407  T
Q  401 ttaacccgtaaacctcctatttacatttgatattgagttaggattttaggaaacaaaaagatcatactattattcattcatacaaatatcctattattac 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29257406 ttaacccgtaaacctcctatttacatttgatattgagtcagtattttaggaaacaaaaa-atca---tattatttattcatacaaatatcccattattac 29257311  T
Q  501 taattatagtt-nnnnnnngtagatggagtttcattaatgtctttggagtgacgtaaacaaaatgtgaatcatttaacaaaaacaattcaacccaaatgg 599  Q
    |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29257310 taattatagttaaaaaaaagtagatggagtttcattaatgtctttggagtgac-----------gtgaatcatttaacaaaaacaattcaacccaaat-g 29257223  T
Q  600 ttaataaaatttaggtttaattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaa 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  29257222 ttaataaaatttaggtttaattgcatttttggtctcttaactatttagctagtattaattttgtcccctaattaaaattcaatttattttggtccattaa 29257123  T
Q  699 cttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29257122 cttctctccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 29257066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29257782 - 29257605
Alignment:
Q  19 agctgcctcatttaaaactgtgagagaccttaaacctagacctccctcatcagttggtttgttaaaatacttcaaacattggatatgaacaaacagaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29257782 agctgcctcatttaaaactgtgagagaccttaaacctaaacctccctcatcagttggtttgttaaaatacttcaaacattggatatgaacaaacagaaat 29257683  T
Q  119 tggtattgagataaatcatttgaactgctaaaaatgggattttattacttagcacagtggtttaatgtaatcatacat 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29257682 tggtattgagataaatcctttgaactgctaaaaatgggattttattacttagcacagtggtttaatgtaatcatacat 29257605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 37199311 - 37199164
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  37199311 tttaggttaaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattctggtcccttaacttctctcc 37199212  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37199211 gttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 37199164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 624 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 24590600 - 24590469
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24590600 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtctcttaacttctctctgttacacattttggt 24590501  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24590500 catttccgttagttttaattcaaaaacgttag 24590469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 620 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 10654408 - 10654272
Alignment:
Q  620 ttgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattt 718  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10654408 ttgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattt 10654309  T
Q  719 tggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10654308 tggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 10654272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 603 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 23281406 - 23281254
Alignment:
Q  603 ataaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt 701  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||    
T  23281406 ataaattttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccataactt 23281307  T
Q  702 ctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23281306 ctctctgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 23281254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 34028726 - 34028864
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  34028726 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaactaaaattcaatttattttggtcccttaacttctatttgttacacat 34028825  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34028826 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 34028864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 624 - 754
Target Start/End: Original strand, 29256843 - 29256974
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29256843 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggt 29256942  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  29256943 cctttctgttagttttaattcaaaaacgttag 29256974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Original strand, 42607522 - 42607665
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42607522 ggttaaattgcatttttggtcccttaactatttagataatatcgttttggtcccttaatttaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgtta 42607621  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42607622 cacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 42607665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 14776116 - 14775978
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  14776116 aattgcatttttggtcacttaactatttaggtagtatcgttttgttcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaaattctccctgttacacat 14776017  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14776016 tttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttagg 14775978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 610 - 755
Target Start/End: Original strand, 30293010 - 30293156
Alignment:
Q  610 ttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg 708  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || | | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  30293010 ttaggttaaattgcatttttggtccattaactatttaggtagtatcgctttggtctctttattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctatg 30293109  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30293110 ttatacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 30293156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 609 - 754
Target Start/End: Original strand, 33753221 - 33753367
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  33753221 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctccca 33753320  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33753321 gttacacatttttgtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttag 33753367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 34029102 - 34028964
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  34029102 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttatacat 34029003  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34029002 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 34028964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 609 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 45305799 - 45305654
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  45305799 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaac-tctctct 45305701  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  45305700 gttacacattttggtcatttacgttagttttaattaaaaaacgttag 45305654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 51691879 - 51692017
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  51691879 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatctattttggtccattaacttctctctattacacat 51691978  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  51691979 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 51692017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 619 - 755
Target Start/End: Original strand, 22584357 - 22584494
Alignment:
Q  619 attgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22584357 attgcattttttgtctcttaactatttaggtagtatcacattggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacatt 22584456  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22584457 ttggtcctttccgttagttttaaatcaaaaacgttagg 22584494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 34279622 - 34279501
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34279622 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 34279523  T
Q  717 tttggtcatttccgttagtttt 738  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  34279522 tttggtcctttccgttagtttt 34279501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 52412979 - 52412842
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52412979 aattacatttttggtcccttaactatttaggtggtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 52412880  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  52412879 tttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttag 52412842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Original strand, 14118526 - 14118673
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||     
T  14118526 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggttccttaattaaaattcgatttattttggtactttaacttttctcc 14118625  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14118626 gttacacattttagtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 14118673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 19986503 - 19986365
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  19986503 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtctcttaaataaaatttgatttattttggtcctttaacttctttctcttacacat 19986404  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19986403 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 19986365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 51810142 - 51810280
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  51810142 aattgcatttttagtctcttaactatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttttctccgttacacat 51810241  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51810242 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacattagg 51810280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 18793696 - 18793833
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  18793696 aatttcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctattacacat 18793795  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18793796 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 18793833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 619 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 50574897 - 50574760
Alignment:
Q  619 attgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  50574897 attgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacatt 50574798  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  50574797 ttggtcctttcggttagttttaattaaaaaacgttagg 50574760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 623 - 755
Target Start/End: Original strand, 52412608 - 52412741
Alignment:
Q  623 catttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttgg 721  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52412608 catttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctttgttacacattttgg 52412707  T
Q  722 tcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  52412708 tcctttccattagttttaattccaaaacgttagg 52412741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 600 - 755
Target Start/End: Original strand, 10654017 - 10654172
Alignment:
Q  600 ttaataaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaa 698  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10654017 ttaataaaatataggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagta-cgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaa 10654115  T
Q  699 cttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10654116 cttctgtccgttacacattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttagg 10654172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 46739104 - 46738968
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46739104 aattgtatttttgtcccctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttactttggtcgcttaacttctctctgttacacatt 46739005  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  46739004 ttagtcatttccgttagttttaattcaaaaacattag 46738968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Original strand, 25088012 - 25088159
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  25088012 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctct 25088111  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  25088112 gttacacattttggtcctttcggttagttttaattcaaaaacattagg 25088159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 16267720 - 16267858
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16267720 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacat 16267819  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16267820 tttggtcattaccgttggttttaattcaaaaacgttagg 16267858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 21035990 - 21036128
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21035990 aattgcatttttgattccttaactatttagatagtatcactttggtccattaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 21036089  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  21036090 tttggtcctttaagttagttttaattaaaaaacgttagg 21036128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 624 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 22584727 - 22584609
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22584727 atttttggtcccttaactaattaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggt 22584628  T
Q  723 catttccgttagttttaat 741  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22584627 catttccgttagttttaat 22584609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 28970424 - 28970562
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  28970424 aattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccatgaacttctctctgttacacat 28970523  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  28970524 tttggtcttttccgttagttttaattaaaaaacattagg 28970562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Original strand, 30611218 - 30611363
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgt 709  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  30611218 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttagatattatcactttgatcccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttctctctgt 30611317  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| | ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  30611318 tacataatttggtcatttctattagttttaattaaaaaacgttagg 30611363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 618 - 749
Target Start/End: Original strand, 32563964 - 32564096
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  32563964 aattgcatttttggtcccttaactatttaggctgtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttctgttacacat 32564063  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaac 749  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32564064 tttggtcatttccgttaattttaattcaaaaac 32564096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Original strand, 4045095 - 4045242
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  4045095 tttaggttaaattgtatttttagccccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttgatcccttaaattctctct 4045194  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  4045195 gttacacattttggtcatttccattgattttaattcaaaaacgttagg 4045242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Original strand, 6181616 - 6181759
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||  |||| | || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  6181616 ggttaaattgcatttttgatcccttaattatttagttagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctccatta 6181715  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6181716 catattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 6181759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30293398 - 30293256
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  30293398 ggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcctttaattaaaattcgatttattttggtc-cttaacttctctatgtta 30293300  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  30293299 cacattttggtattttccattagttttaattcaaaaatgttagg 30293256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 32564330 - 32564200
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  32564330 aattgcatttttagtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctatc-gttacacat 32564232  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32564231 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 32564200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 636 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 33753578 - 33753459
Alignment:
Q  636 taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagt 735  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33753578 taactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttagtcttttccgttagt 33753479  T
Q  736 tttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  33753478 tttaattcaaaaacgttagg 33753459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Original strand, 50118347 - 50118490
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  50118347 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattacaattcgatttattttggtctcttaatttctctctgtta 50118446  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  50118447 cacattttgatcattttcgttagttttaattcaaaaatgttagg 50118490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 9881557 - 9881694
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9881557 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccctaaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctc-gttacacat 9881655  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  9881656 tttggtcttttccattaattttaattcaaaaacgttagg 9881694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 10923744 - 10923606
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  10923744 aattgcatttttggtcccttaactatttaagtggtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgttacacat 10923645  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10923644 tttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 10923606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 13944892 - 13944754
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||    
T  13944892 aattgtatttttggtcccttaatcatttaggtagtatcgttttgatcccttaattagaattcgatttattttggtcccttaacttttctccgttacaaat 13944793  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13944792 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 13944754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 16268070 - 16267933
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  16268070 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctt-aacttctctccgttacacat 16267972  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16267971 tttggttctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 16267933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 35986237 - 35986375
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | | |||||||    
T  35986237 aattgcatttttgttcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctcgccgatacacat 35986336  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  35986337 tttggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 35986375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 51692251 - 51692114
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  51692251 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgttttggtccattaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctc-gttacacat 51692153  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  51692152 tttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttagg 51692114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 11395041 - 11394904
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  11395041 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagttttgttttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacat 11394942  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11394941 tatggttatttccgttagttttaattcaaaaatgttag 11394904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 49291364 - 49291227
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  49291364 aattgcatttttcgtcccttaactatttagatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaatttctctatgttacacat 49291265  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  49291264 tttggtcatttcggttagttttgattcaaaaacgttag 49291227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 623 - 740
Target Start/End: Original strand, 50574525 - 50574642
Alignment:
Q  623 catttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50574525 catttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtctattaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggt 50574624  T
Q  723 catttccgttagttttaa 740  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50574625 catttccgttagttttaa 50574642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 50921065 - 50921202
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | |||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  50921065 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatccgatttattttggtcccttgatttctctctgttacacat 50921164  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  50921165 tttagtttttttcgttagttttaattcaaaaacgttag 50921202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 4045480 - 4045342
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  4045480 aattgcatgtttggtcccttaactatttaagtagtatcactttggtctcttaattaaaattcgatttattttagtcctttaacttttctctgctacacat 4045381  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4045380 tttagtcctttccattagttttaattcaaaaacgttagg 4045342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Original strand, 28112795 - 28112893
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28112795 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctattacacattttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 28112893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 37198937 - 37199075
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  37198937 aattgtatttttggtttcttaactatttaggcaatatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctatctgttacacat 37199036  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37199037 tttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 37199075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 633 - 754
Target Start/End: Original strand, 11787761 - 11787882
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  | |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  11787761 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgaattattttggtcccttaacttctctccgttatacattttggtcctttccgtt 11787860  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  11787861 agttttaattcaaaaacgttag 11787882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Original strand, 13944509 - 13944654
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgt 709  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||  |    
T  13944509 taggttaaattgcatttttggtcctttaactatttagctagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttatattggtcccttaacttctctccat 13944608  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  13944609 taaacattttggtcatttccattagttttaattcaaaaatgttagg 13944654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 36657882 - 36657745
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||    
T  36657882 aattgtatttttggtcccttaactatttatgcagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttctgtctattacacat 36657783  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36657782 tttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttag 36657745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 667 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 46950067 - 46949979
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46950067 taattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctcagttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 46949979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 635 - 750
Target Start/End: Original strand, 21384960 - 21385074
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21384960 ttaactatttatgtagtatcgcttttatcccttaattaaaattcgatttattttggtc-tttaacttctctccattacatattttggtcatttccgttag 21385058  T
Q  735 ttttaatacaaaaacg 750  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21385059 ttttaattcaaaaacg 21385074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Original strand, 24655586 - 24655729
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||  |||| || | |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  24655586 ggttaaattgcatatttggtcccttaagtatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgattcattttggtctcttaacttctctttgtta 24655685  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24655686 cacattttgggcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 24655729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 21385301 - 21385179
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21385301 ccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttgatcccttaacttctctatgtaacacattttggtcatttccgtt 21385202  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
      ||||||| |||||||||||||    
T  21385201 gattttaattcaaaaacgttagg 21385179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 751
Target Start/End: Original strand, 30792445 - 30792579
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  30792445 aattgcatttttggtcccctaactatttaggtactgtcgctttgatcccttaaataaaattcgatttattttggtcccttatcttttctctgttacacat 30792544  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgt 751  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  30792545 tttggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgt 30792579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 34279245 - 34279383
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||| |||    
T  34279245 aattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtaacgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaacttcttttcgttacgcat 34279344  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34279345 tttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgttagg 34279383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 625 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 34622009 - 34621880
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34622009 tttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctttccgttacacattttggtc 34621910  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34621909 atttcagttagttttaattcaaaaacgtta 34621880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 635 - 751
Target Start/End: Original strand, 46949779 - 46949895
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  46949779 ttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctattcgttacacattttgatcctttccgttag 46949878  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgt 751  Q
    ||||||| |||||||||    
T  46949879 ttttaattcaaaaacgt 46949895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 621 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 5463496 - 5463361
Alignment:
Q  621 tgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatttt 719  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5463496 tgcatttttagtcccttaactatttagctagtatcgctttggtccgttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacatttt 5463397  T
Q  720 ggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| | || |||||||||||| |||||| ||||||    
T  5463396 ggtcctctctgttagttttaattcaaaaatgttagg 5463361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Original strand, 5118096 - 5118194
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  5118096 tttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttatacattttggtcatttctgttagttttaattcaaaaacattagg 5118194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 6181997 - 6181863
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||  |||  |||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6181997 aattgtatttttggtctcataactatttatgtagtatcgctttagtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 6181898  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgt 751  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  6181897 tttggtcctttcaattagttttaattcaaaaacgt 6181863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 604 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 25088410 - 25088261
Alignment:
Q  604 taaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttc 702  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||| ||||| || ||||  ||||||||    
T  25088410 taaaatataggttaaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcct-taactaaaattcgatttagttcggtcccttaacttc 25088312  T
Q  703 tctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25088311 tccatgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtta 25088261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 45305414 - 45305552
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctctgttacaca 715  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||     
T  45305414 aattgcatttttggtcagttaactatttaggtagtattgctttggtcctttaattaagattcgatttattttggtcctttaactttctctctgttatacc 45305513  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  45305514 ttttggtcttttccgttacttttaattcaaaaacgttag 45305552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 662 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 13831358 - 13831265
Alignment:
Q  662 tcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  13831358 tcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggtcatttctgttagttttaattcaaaaatgttagg 13831265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 612 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 32517898 - 32517757
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |    |||||||||||  |||||||||| ||  | ||||||||||  ||    
T  32517898 aggttaaattgcatttttgatcccttatctatttaggtagtatcactttggttt--taattaaaatttgatttattttgatccctcaacttctctcattt 32517801  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32517800 acacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttag 32517757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 611 - 754
Target Start/End: Original strand, 44222190 - 44222334
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgt 709  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||    
T  44222190 taggttaaattgcatttttggtcctttaattatttatgtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctccgt 44222289  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  44222290 tacacattttgattctttctgttagttttaattcaaaaacattag 44222334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 635 - 755
Target Start/End: Original strand, 49291016 - 49291136
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||| ||   |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49291016 ttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatttttgttccttaacttctcttcattacacattttcgtcatttccgttag 49291115  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  49291116 ttttaattcaaaaacgttagg 49291136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 618 - 740
Target Start/End: Original strand, 1831669 - 1831792
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||    
T  1831669 aattgaattttcggtctcttaactatttaggtagtatcactttggtcttttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttctttacacat 1831768  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaa 740  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  1831769 tttggtcctttccgttagttttaa 1831792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 625 - 755
Target Start/End: Original strand, 27209181 - 27209312
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| |||||||||||  || ||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  27209181 tttttggtcccttaactatttaattaatatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttatcttcgttacacattttggtc 27209280  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27209281 atttccgttagttttaattcaaaaccgttagg 27209312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30611586 - 30611463
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttatttt-ggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgt 731  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  30611586 ccttaactatttaggttgtatcgctttggtccctaaattaaaattcgatttatttttggtcccttatcttttctttgttacacattttggtcattttcgt 30611487  T
Q  732 tagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  30611486 tagttttaattcaaaaacgttagg 30611463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 14775766 - 14775888
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||| | |  |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14775766 ccttaattatttaggtagtattgttttgcttctttaattaaaattcgatttattttgctcccttaacttatctctgttacacattttggtccttttcgtt 14775865  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  14775866 agttttaattcaaaaacgttagg 14775888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 24655967 - 24655829
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |||| || | |||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| || |||||||||    
T  24655967 aattgcatttttagtctcttaactatttaagtagtatcgctttggtctcgtaattaaaattcgatttattttgagccattaacttctatccgttacacat 24655868  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  24655867 tttggtccttccggttagttttaattcaaaaacgttagg 24655829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 40533930 - 40534068
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||  |||||||| | |   ||||||| ||||  ||||||||    
T  40533930 aattgcatttttagtctcttaactatttaattagtatcgctttgatcccttaattaaaatttgatttatttcgctatcttaacttttctccattacacat 40534029  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40534030 tttggtcatttccgttagttttaatttaaaaacgttagg 40534068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 50921472 - 50921366
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  50921472 aattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaagtaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctcagttacacat 50921373  T
Q  717 tttggtc 723  Q
    |||||||    
T  50921372 tttggtc 50921366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 636 - 741
Target Start/End: Original strand, 32517629 - 32517734
Alignment:
Q  636 taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagt 735  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  32517629 taactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgattccttaacttctctctgttacacattttggttatttttgttagt 32517728  T
Q  736 tttaat 741  Q
    ||||||    
T  32517729 tttaat 32517734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 722
Target Start/End: Original strand, 36077276 - 36077381
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||| ||    
T  36077276 aattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaagttctcttcgttacaaat 36077375  T
Q  717 tttggt 722  Q
    ||||||    
T  36077376 tttggt 36077381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 634 - 754
Target Start/End: Original strand, 24590248 - 24590368
Alignment:
Q  634 cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtta 733  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||| ||| |||  ||||    
T  24590248 cttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctattaatttgtctatgttacacattttagtcctttatgtta 24590347  T
Q  734 gttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  24590348 gttttaattcaaaaacgttag 24590368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 1832050 - 1831907
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||  |||  |||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||| ||||    
T  1832050 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatatatgtagtatcgttttagtcctttaattaaaattcgatttattttcgtctcttaacttttctccgtta 1831951  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1831950 tatattatggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 1831907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 672 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 9119618 - 9119535
Alignment:
Q  672 aaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9119618 aaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacattttggtcctttcagttagttttaattcaaaaacgttagg 9119535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 624 - 753
Target Start/End: Original strand, 10923373 - 10923504
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10923373 atttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaagtaaaatttgatttattttgatcccttaacttttctccgttacacattttggt 10923472  T
Q  723 catttccgttagt-tttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  10923473 catttcggttagtatttaattcaaaaacgtta 10923504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 612 - 718
Target Start/End: Original strand, 19885981 - 19886088
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| | || |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19885981 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttttgtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctctgtt 19886080  T
Q  711 acacattt 718  Q
    ||||||||    
T  19886081 acacattt 19886088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 680 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30792758 - 30792683
Alignment:
Q  680 atttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30792758 atttattttggtcccttaacttctctccgttacatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 30792683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 11788121 - 11787985
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||| || || |||||| | ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||    
T  11788121 aattgcatttttggtcttttaattatttaagcagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttatctccattacacat 11788022  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11788021 tttgctc-tttctgttagttttaattcaaaaacgttag 11787985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 633 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 42607867 - 42607746
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||| ||||||| |||||||  |||| || | |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42607867 ccttaattatttagatagtatcgttttggtctcttaattaaaatttgatttatttcggtcctttaattactctctgttacaaattttggtcctttccgtt 42607768  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  42607767 agttttaattcaaaaaggttag 42607746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 633 - 751
Target Start/End: Original strand, 4054569 - 4054688
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc-atttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgt 731  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||    
T  4054569 ccttaactatttagatagtatcgatttaattctttaattaaaattcgatttattttggtctctttactttctctccgttacacattttagtcttttacgt 4054668  T
Q  732 tagttttaatacaaaaacgt 751  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  4054669 tagttttaattcaaaaacgt 4054688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 4550981 - 4550843
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacaca 715  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||  |||||||    
T  4550981 aattgcatttttggtctcttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctctccttacaca 4550883  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  4550882 ttttggtcctttccgttaggttaaattcaaaaacgttagg 4550843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 667 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 19886216 - 19886132
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19886216 taattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctc--tcacacatttttgtcatttccgttagttttaatttaaaaacgtta 19886132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Original strand, 11797220 - 11797318
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  11797220 tttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacctctctccgttatacattttggtcctttccgttagttttaattcaagaatgttagg 11797318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 18794083 - 18793935
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtat--caatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctct 705  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |    
T  18794083 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttcttt 18793984  T
Q  706 ctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
      |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18793983 tcgttacaca-tttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgttagg 18793935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 612 - 733
Target Start/End: Original strand, 36884721 - 36884843
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||  ||    
T  36884721 aggttaaattgtatttttgttcctttaactatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttccctccatt 36884820  T
Q  711 acacattttggtcatttccgtta 733  Q
    ||| ||||||||| |||||||||    
T  36884821 acatattttggtcctttccgtta 36884843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 21036362 - 21036225
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||  |||| |||| | |  |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||   |    
T  21036362 aattgcattttttatctttaactatttaggtaccatcactttggttctttaattaaaatttgatttattttggtctcttaacttttctctgttacattgt 21036263  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  21036262 ttgatcatttccgttagttttaattcaagaactttagg 21036225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 625 - 755
Target Start/End: Original strand, 3569388 - 3569520
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctctgttacacattttggt 722  Q
    |||||||||| |||| ||||||  |||||||  |||| | || |||||||||||  || |||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||    
T  3569388 tttttggtcccttaattatttaattagtatcgttttggttccttaattaaaatttgatatattttggtatcttaattttctctctgttacacattttggt 3569487  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3569488 aatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 3569520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 625 - 720
Target Start/End: Original strand, 20260440 - 20260536
Alignment:
Q  625 tttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttg 720  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20260440 tttttggtctcttaactatttaattagtatcattttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtattttaacttctctccgttacacattttg 20260536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 667 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 36885035 - 36884947
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  36885035 taattaaaattcgatttattttggttccttaacttatctctgttacacatttttgtcatttccgttaattttaattaaaaaatgttagg 36884947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 684 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 50921374 - 50921303
Alignment:
Q  684 attttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  50921374 attttggtcccttaacttctctcagttacacattttggtcatttcaattagttttaattcaaaaacgttagg 50921303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 624 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 51810513 - 51810382
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  | ||  |||||||| |  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  51810513 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcttttgttcctgaattaaaaattgatttattttggtcccttaatttctctctgttacacattttggt 51810414  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    | ||   |||||||||||| |||||| |||||    
T  51810413 ccttcttgttagttttaattcaaaaatgttag 51810382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 5463123 - 5463261
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    |||| |||||| | || |||| ||||||| || ||||  |||| || | |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||    
T  5463123 aattacattttggttctttaattatttagataatatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctcaggtacatatt 5463222  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaa-tacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  5463223 ttggtcctttccgtcagttttaattaaaaaaacgttagg 5463261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 633 - 754
Target Start/End: Original strand, 9119313 - 9119434
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||| |   ||| |||||||| | |||||||||    
T  9119313 ccttaactacttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctatacattatacattttgtttatttccgtt 9119412  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  9119413 agtttcaattcaaaaacgttag 9119434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 692
Target Start/End: Original strand, 11797151 - 11797226
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11797151 aattgcatttttggtcctttaattatttaggtagtatcgcttttgtcccttaattaaaattcaatttattttggtc 11797226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 31125941 - 31126071
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||       |||||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||  ||||||||    
T  31125941 aattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgcttt-------taattaaaattcgatttattttgattccttaacttctctccattacacat 31126033  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  31126034 tttgatcatttccgttaattttaattaaaaaatgttag 31126071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 40703246 - 40703109
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcat-ttaacttctctctg-ttacac 714  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| || ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||    
T  40703246 aattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttagttaaaatttgatttattttgg-catcttaactt-tctctccttacac 40703149  T
Q  715 attttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  40703148 attttggtccttttcgttagttttaatttaaaaacgttag 40703109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 613 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 19886300 - 19886214
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaa 698  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19886300 ggttaaattgtatttttggtcctttaattatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcctttaa 19886214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 618 - 689
Target Start/End: Original strand, 28112726 - 28112798
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttg 689  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  28112726 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggttccttaattaaaattcaatttattttg 28112798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 2125599 - 2125452
Alignment:
Q  602 aataaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaact 700  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||       |||||  |||||||||||||  ||||||    
T  2125599 aataaaattaaggtcaaattacatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtccct------aaatttgatttattttggtcccttaact 2125506  T
Q  701 tctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  2125505 tctcttcgtta-acattttggtcctttctgttagttttaattaaaaaacgttagg 2125452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 755
Target Start/End: Original strand, 40702921 - 40703008
Alignment:
Q  668 aattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40702921 aattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctctgagttacacattttgatctttttcgttagttttaattcaaaaatgttagg 40703008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 48702261 - 48702125
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct-gttacaca 715  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||  |||| |||  |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||    
T  48702261 aattgcatttttagtcccttaattattttgttagtatcgttttggtcctttaattaaaattggatttattttggtattttaactt-tctatcgttacaca 48702163  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||    
T  48702162 ttttggtcattt-cgttggttttaattcaaaaacattag 48702125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 36657505 - 36657644
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct--gttacac 714  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | | |||  || | |||| |||||||||||  |||||||||| ||  |||||| ||||||  ||||||     
T  36657505 aattgcatttttcgtcccctaactatttagtttgcatctcttgggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaactcctctctccgttacat 36657604  T
Q  715 attttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36657605 attttg-tcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 36657644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 618 - 692
Target Start/End: Original strand, 5117998 - 5118073
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  5117998 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtc 5118073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 27209530 - 27209392
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacaca 715  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||  |||||||  |||| |||  |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||  || ||||    
T  27209530 aattgcatttttggtcccttgacaatttaattagtatcgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctctccttgcaca 27209432  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  27209431 ttttggtcctttccgttaattttaattaaaaaacgttagg 27209392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 667 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 31126260 - 31126173
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||| ||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31126260 taattaaaatttgatttattttagtcccttaacttttctatgtcacacattttagttcttttcgttagttttaattcaaaaacgttag 31126173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 20260760 - 20260624
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacaca 715  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||  |||| |||| ||||||||||   ||||||||||||   |||||| ||||||  ||||| |    
T  20260760 aattgcatttttagtcccttaattatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatctgatttattttggtatcttaact-ctctctccttacata 20260662  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  20260661 ttttggtcatttttgttagttttaatttaaaaacgtta 20260624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 682 - 754
Target Start/End: Original strand, 38961145 - 38961218
Alignment:
Q  682 ttattttggtcatttaactt-ctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  38961145 ttattttggtcccttaactttctctccgttatacattttggtcatttccgttaaatttaattaaaaaacgttag 38961218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 689
Target Start/End: Original strand, 11394698 - 11394769
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttg 689  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  11394698 aattgcatttttgtctcttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttcttttg 11394769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 618 - 707
Target Start/End: Original strand, 19269365 - 19269455
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||| || | || |||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||    
T  19269365 aattgcatttttggtcccttaactatttatccagtatcactttggtctcttagttaaaattcggtttattttggtccttgaacttttctct 19269455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 709 - 755
Target Start/End: Original strand, 34621718 - 34621764
Alignment:
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  34621718 ttacacattttggtcctttcgattagttttaattcaaaaacgttagg 34621764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 97)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 605 - 751
Target Start/End: Original strand, 32933583 - 32933730
Alignment:
Q  605 aaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttct 703  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32933583 aaaatataggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttgatcccttaactaaaattccatttattttggtcttttaacttct 32933682  T
Q  704 ctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgt 751  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32933683 ctttgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgt 32933730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 28203241 - 28203103
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28203241 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtcgtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctctgttacacat 28203142  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28203141 tttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttagg 28203103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 602 - 755
Target Start/End: Original strand, 39454440 - 39454594
Alignment:
Q  602 aataaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaact 700  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||    
T  39454440 aataaaatataggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaact 39454539  T
Q  701 tctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39454540 tctctccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 39454594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 41377360 - 41377497
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  41377360 aattgtatttttggtccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacagatt 41377459  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41377460 ttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 41377497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 16655611 - 16655749
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16655611 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctctgttgcacat 16655710  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16655711 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 16655749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 41377735 - 41377597
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  41377735 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccgtaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacat 41377636  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41377635 tttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttagg 41377597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 37412959 - 37412822
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37412959 aattgcatttttggccccttaactatttaagtagtatcgcattggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccattaacttctctctgttacacat 37412860  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37412859 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttag 37412822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 38275838 - 38275698
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaact--tctctctgttacac 714  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||  ||||||||||||||    
T  38275838 aattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcactttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccgtaactcttctctctgttacac 38275739  T
Q  715 attttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38275738 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 38275698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 20908892 - 20908754
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20908892 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctttctgttacacat 20908793  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  20908792 tttggtcatttctgttagttttaattcaaaaactttagg 20908754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 18565071 - 18565208
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  18565071 aattgcatttttggtctcttaactatttaggcagtatcgctttagtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacat 18565170  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18565171 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttag 18565208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 43183971 - 43183826
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgt 709  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  43183971 taggttaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgt 43183872  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43183871 tacacattttggtcatttccgttagatttaattcaaaaacgttagg 43183826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Original strand, 34820284 - 34820420
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34820284 aattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggttccttaattaaaattagatttattttggtcctttaacttctctctgttacacat 34820383  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34820384 tttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgtta 34820420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Original strand, 21470291 - 21470438
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||    
T  21470291 tttaggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggcagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctcaacttctctct 21470390  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  21470391 gttacacattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacattagg 21470438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 31450671 - 31450809
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31450671 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 31450770  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31450771 tttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 31450809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 606 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 37744781 - 37744631
Alignment:
Q  606 aaatttaggtttaattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctc 704  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37744781 aaattaaggttaaattgcatttttgattccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctc 37744682  T
Q  705 tctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37744681 tctcttatagattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 37744631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 608 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 39913019 - 39912869
Alignment:
Q  608 atttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactattt-aggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctc 704  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||    
T  39913019 atttaggctaaattgcatttttggtcccttaactattttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattagatttattttggtcccttaactttctc 39912920  T
Q  705 tctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39912919 tctgttacaccttttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 39912869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 28631661 - 28631517
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||| || | |||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  28631661 aggttaaattgtatttttggtcccttaactatttgggtagtatcgctttgctctcttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttctctctgtt 28631562  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28631561 acacattttcgtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 28631517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 44612865 - 44612726
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggta--gtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacaca 715  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  44612865 aattgcatgtttggtccttaactatttacgtatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctatgttacaca 44612766  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44612765 ttttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 44612726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 618 - 748
Target Start/End: Original strand, 4104164 - 4104295
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  4104164 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtatcttaacttctctctgttatacat 4104263  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4104264 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaa 4104295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 5961674 - 5961812
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5961674 aattgcatttttggccccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccataattaaaaattgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 5961773  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  5961774 tttggtcctttctgttagttttaattcaaaaatgttagg 5961812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 13354198 - 13354320
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  13354198 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccattacatattttggtcatttccgtt 13354297  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  13354298 agttttaattcaaaaacgttagg 13354320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 25642633 - 25642511
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25642633 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttccgttacacattttggtcatttccgtt 25642534  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  25642533 agttttaattcaaaaacgttagg 25642511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 27883473 - 27883611
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  27883473 aattgcattttttgtcccttaactatttaagtaatatcgctttggtcccttaagtaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacat 27883572  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27883573 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 27883611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31451047 - 31450909
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  31451047 aattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaactaaaattcgatttattttgatcctttaacttctctacgttacacat 31450948  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31450947 tttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 31450909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 4104540 - 4104403
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||    
T  4104540 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttctctccgttatacat 4104441  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4104440 ttgggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 4104403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 27476748 - 27476611
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  27476748 aattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacatat 27476649  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    | ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  27476648 tatggtcctttccgttagttttaaatcaagaacgttag 27476611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 34127571 - 34127708
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||  ||||||||    
T  34127571 aattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttatttttgtcgcttaacttctatccattacacat 34127670  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34127671 tttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacgttag 34127708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 626 - 753
Target Start/End: Original strand, 15829733 - 15829861
Alignment:
Q  626 ttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtca 724  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  15829733 ttttggtctcttagctatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctatccgttacacatcttggtca 15829832  T
Q  725 tttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15829833 tttccgttagttttaattcaaaaatgtta 15829861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 618 - 748
Target Start/End: Original strand, 39912632 - 39912764
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaac-ttctctctgttacaca 715  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  39912632 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccgttaactttctctctgttacaca 39912731  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  39912732 ttttggtcttttacgttagttttaattcaaaaa 39912764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 12303790 - 12303928
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  12303790 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcacttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactcatctctgttacacat 12303889  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  12303890 tttggtcctttccgttagttttatttcaaaaacattagg 12303928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 12304535 - 12304397
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  12304535 aattgcattttttgtcccttaacaatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctccgttacacat 12304436  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12304435 tttggccatttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 12304397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 13354542 - 13354420
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |||    
T  13354542 ccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgttacacatattggtcctttctgtt 13354443  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  13354442 agttttaattcaaaaacgttagg 13354420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 15137185 - 15137047
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  15137185 aattacatttttggtcacataactatttaggtagtaccgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttttctctgttgcacat 15137086  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15137085 ttgggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 15137047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 16736106 - 16736244
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16736106 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctcagttacacat 16736205  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||   |||||||||||    
T  16736206 tttggtcctttccagtagttttaatttgaaaacgttagg 16736244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 17856220 - 17856342
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17856220 ccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctccttgttacacattttggtcttttccgtt 17856319  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  17856320 agttttaattcaaaaacgttagg 17856342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 27132891 - 27132753
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||    
T  27132891 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtgtcgatttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccattaacttctatccgttacatat 27132792  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27132791 tttagtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 27132753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 640 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 27883815 - 27883701
Alignment:
Q  640 tatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagtttta 739  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27883815 tatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtgacttaacttctctccgttacacattttggtcatttccgttagtttta 27883716  T
Q  740 atacaaaaacgttag 754  Q
    || ||||||||||||    
T  27883715 attcaaaaacgttag 27883701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 28631279 - 28631417
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||    
T  28631279 aattacatttttggtcccttaactatttaggtagcatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttctctcctttacacat 28631378  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28631379 tttggtcatttccgatagttttaattcaaaaacgttagg 28631417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 32933972 - 32933834
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  32933972 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcctttaaataaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacat 32933873  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32933872 tttggtcctttccgttagttttaattaaaaaacgttagg 32933834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 609 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 34820669 - 34820523
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||     
T  34820669 tttaggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtctcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctcc 34820570  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34820569 gttacacattttggtcctttccgttagttttaatttaaaaacgttag 34820523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Original strand, 27132509 - 27132654
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgt 709  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||  ||    
T  27132509 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctcttcgt 27132608  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  27132609 tacacattttggtcctttccgatagttttaattcaaaaacattagg 27132654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 620 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 12304164 - 12304028
Alignment:
Q  620 ttgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattt 718  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  12304164 ttgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttcgtcctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctcttcgttacacattt 12304065  T
Q  719 tggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12304064 tggccatttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 12304028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 613 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 4121149 - 4121010
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  4121149 ggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctatta 4121050  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgt 751  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  4121049 cacactttgttcattttcgttagttttaagtcaaaaacgt 4121010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 618 - 751
Target Start/End: Original strand, 14877488 - 14877620
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaa-ctatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  14877488 aattgcatttttggtcccaaaactatttaggtagtatcgatttggtccattaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctc--ttacacat 14877585  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgt 751  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14877586 tttggtaatttccgttagttttaattcaaaaacgt 14877620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 612 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 32503924 - 32503781
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| || |||    
T  32503924 aggttaaattgcattcttagtcctttaactatttaggtagtattgatttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttccgtt 32503825  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32503824 acacattttggtcatttccgttagttttaattcgaaaacgttag 32503781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 28202865 - 28203003
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  28202865 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttatattggtcctttaacttctatccgttacacat 28202964  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28202965 tttggttcttttcgttagttttaattcaataacgttagg 28203003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 40694557 - 40694418
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  40694557 aggttaaattgcatttttg----ttaattatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattagatttattttggtcccttaatttctctccgtta 40694462  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40694461 cacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 40694418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 618 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 17856570 - 17856446
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  17856570 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattggtttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaacttctctctgttatacat 17856471  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaat 741  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  17856470 tttagttatttccgttagttttaat 17856446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 616 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 21470677 - 21470538
Alignment:
Q  616 ttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacac 714  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || | |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  21470677 ttaattccatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgcttgg-tcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctacgttacac 21470579  T
Q  715 attttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21470578 attttggtcctttccgttagttttaattaaaaaacgttagg 21470538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 624 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 36442509 - 36442377
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  36442509 atttttggtcccttaactatttagatagtattgctttgatcctttaattaaaatttaatttattttgatcctttaacttctttctgttacacattttagt 36442410  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  36442409 catttctgttagttttaattcaaaaacattagg 36442377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 633 - 753
Target Start/End: Original strand, 43183604 - 43183724
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  43183604 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattagatttattttggtcccataacatctctctgttacacattttggtcctttctgtt 43183703  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  43183704 agttttaattcaaaaacgtta 43183724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 618 - 748
Target Start/End: Original strand, 4120769 - 4120900
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||    
T  4120769 aattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaatcaaaattcgatttattttggtcctttaatttctctccgttacatat 4120868  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  4120869 tttggtcgtttccattagttttaattcaaaaa 4120900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 10833416 - 10833277
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  10833416 aattgcatttttggtcccttagctatttaggtagtatcgctttagtccctcaattaaaattcgatttattttggtccattaacttctctctgttatacat 10833317  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaa-tacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  10833316 tttggtcatttcgattagttttaattaaaaaaacgttagg 10833277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 622 - 755
Target Start/End: Original strand, 16260880 - 16261013
Alignment:
Q  622 gcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttg 720  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16260880 gcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgattt-ttttggtcctttaacttctctccgttaaacattttg 16260978  T
Q  721 gtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| |||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16260979 gtcctttttgttagttttaattcaaaaacgttagg 16261013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 16736479 - 16736341
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||  | |  |||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16736479 aattgcacttttggtcccttaactgtttaggttgtatcgctgtagtcccttaattaaaattcgatttatttcggtcccttaacttctctctgttacacat 16736380  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16736379 tttggtcctttccgttagttttaattcagaaacgttagg 16736341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 625 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 35408895 - 35408765
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| | || |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35408895 tttttggtccattaactatttaattagtatcgctttggttccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctctctgttacacattttggtc 35408796  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35408795 ctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 35408765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 36211355 - 36211493
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||   |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  36211355 aattgcatttttggtcacttaactgtttaggttgtattgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttctgttcgttacacat 36211454  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36211455 tttggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 36211493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 41659766 - 41659888
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41659766 ccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctctctgttacacattttgggcctttccgtt 41659865  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  41659866 agttttaattcaaaaacgttagg 41659888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 16655994 - 16655849
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgt 709  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  16655994 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgt 16655895  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  16655894 tacacattttggtcctttccactagttttaattaaaaaacgttagg 16655849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 609 - 753
Target Start/End: Original strand, 44915736 - 44915880
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| ||||     
T  44915736 tttaggttaaattgcatttttagtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttatctcc 44915835  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44915836 -ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtta 44915880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 27476371 - 27476510
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctta-actatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacaca- 715  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||  |||||||     
T  27476371 aattgtatttttggtccctagactatttaggtagtatcgctttgttcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaaattctctcctttacacat 27476470  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27476471 ttttggtcctatccgttagttttaattcaaaaacgttagg 27476510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 39150206 - 39150068
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  | || |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  39150206 aattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgcttttgtaccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctttccgttacacat 39150107  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||| || | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  39150106 tttagtccttcctgttaattttaattcaaaaacgttagg 39150068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 633 - 754
Target Start/End: Original strand, 38275498 - 38275619
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38275498 ccttaactatttatgtagtattgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggttctttaacttccctctattacacattttggtcctttccgtt 38275597  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  38275598 agttttaattcaaagacgttag 38275619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 633 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 34127929 - 34127810
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34127929 ccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaactaaagttcgatttattttgatcccttaacttctctctgttacaca-tttggtcctttccgtt 34127831  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  34127830 agttttaattcaaaaacgtta 34127810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 633 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 34484411 - 34484303
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||| |  | |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34484411 ccttaattatttaggtagtatcgctttggtatcttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttatctccgttacacattttggtcatttccgtt 34484312  T
Q  733 agttttaat 741  Q
    |||||||||    
T  34484311 agttttaat 34484303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 733
Target Start/End: Original strand, 37744454 - 37744570
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||    
T  37744454 aattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctcttcgttacacat 37744553  T
Q  717 tttggtcatttccgtta 733  Q
    |||||||| ||||||||    
T  37744554 tttggtcaattccgtta 37744570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 635 - 755
Target Start/End: Original strand, 39149867 - 39149987
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    |||||||||||  |||||||| |||  |||  ||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39149867 ttaactatttaaatagtatcactttagtcctttaactaaaattcgatttattttgatcccttaacttctatttgttacacattttggtcatttccgttag 39149966  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  39149967 ttttaattcaaaaacgttagg 39149987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 624 - 755
Target Start/End: Original strand, 40694206 - 40694338
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||     
T  40694206 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttagtcccttaattaacattcgatttattttagtcccttaacttctctcagttgcacattttggc 40694305  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  40694306 catttccattacttttaattcaaaaacgttagg 40694338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 612 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 41660123 - 41659980
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-t 709  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| || | ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||| |    
T  41660123 aggttaaattgcatttttggtcctttaactatttaattagtatcactttggtctcttaattaaaatttaatttattttggtatcttaactt-tctctgct 41660025  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  41660024 tacacattttggttctttctgttagttttaattcaaaaacgttag 41659980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 633 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 5921751 - 5921632
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||| || | |||||||||||| |||| |||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5921751 ccttaactatttatatagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttttttttgttccttaacttctctttgttacacattttggtcatttccgtt 5921652  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgtt 752  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  5921651 agttttaattcaaaaacgtt 5921632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 618 - 748
Target Start/End: Original strand, 45389136 - 45389267
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||    
T  45389136 aattgcatttttggtccctgaactatttaggtagtgtcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccattaacttttcttcgttacacat 45389235  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  45389236 tttggtcctttccgttaattttaattcaaaaa 45389267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 16261251 - 16261113
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||  ||||||||| |||  ||| ||| |||| |||||||||    
T  16261251 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttatttttgtcccttagcttatctccgttacacat 16261152  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  16261151 tttggtcattttggttagttttaattcaaaaacattagg 16261113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 20908516 - 20908654
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||| ||||||||| ||   |||||||||  | |||||||||    
T  20908516 aattgtatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttagttccttaacttcttcccgttacacat 20908615  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20908616 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 20908654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 25642289 - 25642411
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| | || |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| || |||| |||    
T  25642289 ccttaactatttaagtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttttatctgttacacattttgatcctttcagtt 25642388  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||| ||||||    
T  25642389 agttttaattcaaaaatgttagg 25642411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 37412598 - 37412736
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| || | |||||||||||| |||||||||||||  || |||||| || |||||||||    
T  37412598 aattgcatttttggtcccttaactatttagttagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtcccttgacttctttccgttacacat 37412697  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37412698 tttagttcttttcgttagttttaattcaaaagcgttagg 37412736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 635 - 754
Target Start/End: Original strand, 32503569 - 32503688
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| | || ||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  32503569 ttaattatttaggtagtatcgttttgcttccttaactaaaattcgatttattttggttccttaacttctctctgttacacattttgatcatttcctttaa 32503668  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  32503669 ttttaagtcaaaaacgttag 32503688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Original strand, 33819393 - 33819539
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| || | |||||||||||  |||||||| ||||  ||||||| |||      
T  33819393 tttaggttaaattgcacttttggtccattaactatttaggtagtaccgttttggtctcttaattaaaatttgatttattt-ggtcccttaacttttcttc 33819491  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33819492 gttacagattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaatgttagg 33819539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 636 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 33819757 - 33819639
Alignment:
Q  636 taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagt 735  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  33819757 taactgtttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtcctt-aacttctctccgttacatattttggctatttccgttagt 33819659  T
Q  736 tttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| |||||| ||||||    
T  33819658 tttaattcaaaaatgttagg 33819639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 618 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 18565384 - 18565278
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||| || |||||||| ||    
T  18565384 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcttgggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttttccctgttacatat 18565285  T
Q  717 tttggtc 723  Q
    |||||||    
T  18565284 tttggtc 18565278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 36211682 - 36211584
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  36211682 tttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggtcctttccgttagctttaattcaaaaatgttagg 36211584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 618 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 39454814 - 39454712
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  39454814 aattgcatttttggtcccttgactattcaggtagtatcgctttgattccttaattaaaattcgatttatttttgtcccttaatttctctctgttacacat 39454715  T
Q  717 ttt 719  Q
    |||    
T  39454714 ttt 39454712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 657 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 44916080 - 44915986
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgt 751  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44916080 tttggtcccttaattaaaatttcatttattttggtatcttaacttctctccgttacatattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgt 44915986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 633 - 754
Target Start/End: Original strand, 36442154 - 36442276
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| ||   |||| ||||||  ||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  36442154 ccttcactatttaggtagtatcgttttggtctattaataaaaatttgatttattttggttcattaacttctccccgttacacattttggtcctttccgtt 36442253  T
Q  733 agttttaa-tacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  36442254 agttttaattaaaaaaacgttag 36442276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 16350082 - 16350220
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacaca 715  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||   ||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||  |||||||    
T  16350082 aattgcatttttggtctcttgactatttaattagtatcgtattggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctctccttacaca 16350180  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  16350181 ttttggtcatttccatttgttttaattcaaaaatgttagg 16350220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 27246364 - 27246226
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacaca 715  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| || |||||  |||||||    
T  27246364 aattgcatttttggtcccttaactatttaattaggatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaattt-tctctccttacaca 27246266  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  27246265 ttttggtcctttcggttatttttaattcaaaaacgttagg 27246226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 632 - 755
Target Start/End: Original strand, 27913914 - 27914037
Alignment:
Q  632 tccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgt 731  Q
    ||||||||||||||  |||||||  |||  |||| | ||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| |||||| ||||||||| |||  ||    
T  27913914 tccttaactatttaattagtatcgctttagtccctttattaaaatttaatttattttgctatcttaacttctctccgttacatattttggtcttttatgt 27914013  T
Q  732 tagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||| ||||||| |||||    
T  27914014 tagttttaattcaaaaacattagg 27914037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Original strand, 5720140 - 5720285
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg- 708  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||   |||| | |  |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||      
T  5720140 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaattaatattgttttggttctttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctctcc 5720238  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5720239 tttcacattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 5720285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 612 - 677
Target Start/End: Original strand, 34484234 - 34484300
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaatt 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  34484234 aggttaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatt 34484300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 637 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 11943849 - 11943764
Alignment:
Q  637 aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |  |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11943849 aactatttaggtagtatcgctttggtactttaattaaaattcgatttattttggttcattaacttctctccgttacacattttggt 11943764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 695 - 755
Target Start/End: Original strand, 27246066 - 27246126
Alignment:
Q  695 ttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  27246066 ttaacttctctctgttacacatttttgtcatttctattagttttaattaaaaaacgttagg 27246126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 27914258 - 27914136
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcat-ttaactt-ctctctgttacacattttggtcatttccg 730  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||| | || || ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27914258 ccttaactatttaattagtatcgttttggttccttagttaaaatttgatttattttgg-catcttaactttctctct-ttacacattttggtcctttccg 27914161  T
Q  731 ttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27914160 ttaattttaattcaaaaacgttagg 27914136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 692
Target Start/End: Original strand, 20297415 - 20297490
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20297415 aatttcatttttggtcccttaactattcaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtc 20297490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 36211780 - 36211705
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  36211780 aattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttcgtcccttaattaaaattcgatttattttggtc 36211705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 16350412 - 16350314
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||||||||||  ||||||||||||    
T  16350412 tttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtatcttaacttctctctgttgcacattttagtcattcatgttagttttaattaaaaaacgttagg 16350314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 605 - 677
Target Start/End: Original strand, 44610854 - 44610926
Alignment:
Q  605 aaaatttaggtttaattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaatt 677  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||    
T  44610854 aaaatttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttg-tcccttaattaaaatt 44610926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 703 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 29078062 - 29078010
Alignment:
Q  703 tctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||    
T  29078062 tctctgttacacattttggtcattttcattagttttaattcaaaaatgttagg 29078010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 669 - 723
Target Start/End: Original strand, 44612548 - 44612602
Alignment:
Q  669 attaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||  |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44612548 attaaaatttgatttattttggtcccttaacttctatccgttacacattttggtc 44612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 95; Significance: 5e-46; HSPs: 87)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 37393858 - 37393720
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  37393858 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacat 37393759  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37393758 tttggtcatttccgtaagttttaattcaaaaacgttagg 37393720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 607 - 754
Target Start/End: Original strand, 18017784 - 18017932
Alignment:
Q  607 aatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctct 705  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18017784 aatttaggctaaattgcatatttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcacttaattaaaattcaatttattttggtcctttaacttctct 18017883  T
Q  706 ctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18017884 ctgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 18017932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 24457042 - 24456895
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||     
T  24457042 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgccttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctcc 24456943  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24456942 gttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 24456895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 119122 - 119259
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  119122 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattactttggtcccttgattaaaattcgatttattttggtcctt-aacttctctctgttacacat 119220  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  119221 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 119259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 35224148 - 35224011
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  35224148 aattgcatttttggtcccttaactatttagttagtatcgttttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacat 35224049  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35224048 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttag 35224011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Original strand, 6843493 - 6843640
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcattta--acttctctct 707  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||  ||||||||||    
T  6843493 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactatgatcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttataacttctctct 6843592  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  6843593 gttacacattttggtcatttctgttagttttaattaaaaaacgttagg 6843640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 611 - 754
Target Start/End: Original strand, 37393475 - 37393619
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgt 709  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |    
T  37393475 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctcaat 37393574  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37393575 tacatattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 37393619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Original strand, 26736125 - 26736268
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  26736125 ggttaaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttttttaaaatttaatttattttggtcccttaccttctctctgtta 26736224  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26736225 cacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 26736268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 623 - 753
Target Start/End: Original strand, 31230623 - 31230754
Alignment:
Q  623 catttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttgg 721  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31230623 catttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttgg 31230722  T
Q  722 tcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31230723 tcctttccgttagttttaattcaaaaacgtta 31230754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 602 - 754
Target Start/End: Original strand, 40094463 - 40094617
Alignment:
Q  602 aataaaatttaggtttaattgcattttt--ggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaac 699  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  40094463 aataaaataaaggttaaattgcatttttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggttccttaac 40094562  T
Q  700 ttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  40094563 ttctctccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaagaacgttag 40094617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 1826172 - 1826034
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1826172 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 1826073  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  1826072 tttggtcctttacattagttttaattcaaaaacgttagg 1826034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 1860617 - 1860479
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1860617 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 1860518  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  1860517 tttggtcctttacattagttttaattcaaaaacgttagg 1860479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 18018167 - 18018029
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  18018167 aattgcatttttggtcccttaactatttaggaagtattgctttgctcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctccgttacacat 18018068  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18018067 tttggtcctttccgttagttttaatttaaaaacgttagg 18018029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31230994 - 31230856
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  31230994 aattacatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttgatcccttaacttctctttgttacacat 31230895  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31230894 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 31230856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 39240035 - 39240173
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||  |||||||||    
T  39240035 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttgattccttaacttctcttcgttacacat 39240134  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39240135 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 39240173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 612 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 39912306 - 39912163
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||  ||    
T  39912306 aggttaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccatt 39912207  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39912206 acacattttagtcatttccgttagttttaattcaaaaacattag 39912163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 14920792 - 14920654
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14920792 aattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 14920693  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  14920692 tttggtcatttctgttacttttaattcgaaaacgttagg 14920654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 18622128 - 18621990
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  18622128 aattgcacttttggtctcttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctatctgttacacat 18622029  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18622028 tttgctcttttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 18621990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 40040167 - 40040305
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  40040167 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtaccttaattaaaattcgatttattttgttcccttaacttctctccgttacacat 40040266  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40040267 tttggccctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 40040305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 5416817 - 5416954
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5416817 aattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgttttggtcctctaattaaaattcgattgattttggtcttttaacttctttctgttacacat 5416916  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5416917 tttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttag 5416954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 35223779 - 35223916
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| |||| | | |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  35223779 aattgcatttttggtccctttactatttaggtagtatcgctttggtcccttgactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacat 35223878  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35223879 tttggtcatttccgtttgttttaattcaaaaacgttag 35223916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 613 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 39240405 - 39240264
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  39240405 ggttaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgttttggtctcttaattaaaatttaatttattttggtctcttaacttctttccgtta 39240306  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39240305 cacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtta 39240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Original strand, 758343 - 758487
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  758343 aggttaaattgcatttttggccccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattaaatttattttgatcccttaaattctctctgtt 758442  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  758443 acacattttggtcatttccattgattttaattcaaaaacgttagg 758487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 603 - 754
Target Start/End: Original strand, 14920401 - 14920553
Alignment:
Q  603 ataaaatttaggtttaattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt 701  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| ||   |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  14920401 ataaaaataaggcttaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtattgttttggtcatttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 14920500  T
Q  702 ctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14920501 ctccctgttacatattttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgttag 14920553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 36343967 - 36344103
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  36343967 aattgtatttttggttcttaattatttaggtagtattattttggtcccttaattaaaattcgattaattttggtcctttaacttttctatgttacacatt 36344066  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36344067 ttggtctttttcgttagttttaattcaaaaacgttag 36344103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Original strand, 30650186 - 30650333
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||     
T  30650186 tttaggctaaattgcatttttagtcctctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggttccttaacttctctcc 30650285  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  30650286 gttacacattttggtcctttccgttagttttaattaaaaaaccttagg 30650333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 610 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 23244904 - 23244758
Alignment:
Q  610 ttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg 708  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||| || ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||    
T  23244904 ttaggttagattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttagttaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctatg 23244805  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23244804 ttacatattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 23244758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 3869330 - 3869193
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||  |||||||||||| ||||||| |    
T  3869330 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttttttttgtcccttaacttctctccgttacactt 3869231  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3869230 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 3869193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 18914632 - 18914495
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  | |  |||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18914632 aattgcatttttggtcccctaactatttaggtagcatcgctcttgtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 18914533  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18914532 tttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttag 18914495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 618 - 741
Target Start/End: Original strand, 30872788 - 30872912
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  30872788 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgtaacacat 30872887  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaat 741  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  30872888 tttggtcatttctgttagttttaat 30872912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Original strand, 23244515 - 23244658
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||  |||| | |  |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23244515 ggttaaattgcatttttggtccactaaccatttatgtagtatcgctttggttctttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctgtta 23244614  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23244615 cacattttggtcgtttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 23244658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 8653941 - 8654079
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||   | ||||||| ||    
T  8653941 aattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaactttcatttgttacatat 8654040  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8654041 tttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 8654079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 9495404 - 9495266
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||  |||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||    
T  9495404 aattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtattgctttggtccgttaattaaagtttgatttattttggtcccttaacttctctccgttactcat 9495305  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9495304 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 9495266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 635 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 21515563 - 21515445
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21515563 ttaactatttacgtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacatattttggtcatttccgttag 21515464  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgtta 753  Q
     |||||| |||||||||||    
T  21515463 ctttaattcaaaaacgtta 21515445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 44254870 - 44255008
Alignment:
Q  618 aattgcatttttgg-tccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  44254870 aattgcatttttggatccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttctgttacacat 44254969  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44254970 tttagtgttttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 44255008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 758725 - 758589
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||   ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  758725 aattgcatgtttggtcccttaactatttaagtagtatcactttggtccttaaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttttctctgctacacat 758626  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  758625 tttagtcatttccattagttttaattcaaaaacgtta 758589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 633 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 40032793 - 40032693
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40032793 ccttagctatttatgtagtatcattttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctctgttacacattttgatcatttccgtt 40032694  T
Q  733 a 733  Q
    |    
T  40032693 a 40032693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 633 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 26736490 - 26736371
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  26736490 ccttaactatttagatagtattgatttggtcctttaattaaaattcgatttattgtggtcctttaacttctcttcgatacacattttggtcatttccgtt 26736391  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgtt 752  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  26736390 agttttaattcaaaaacgtt 26736371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Original strand, 29026967 - 29027115
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaacta----tttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctc 706  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |    
T  29026967 aggttaaattgcatttttggtcccttaactagctatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctacc 29027066  T
Q  707 tgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  29027067 cgttacacaatttggtcatttctgttagttttaattctaaaacgttagg 29027115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 612 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 8654323 - 8654181
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||| |||  |||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||| |||    
T  8654323 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatattgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttgctcccttaacttctctccgtt 8654224  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8654223 acacattttggtactttccgttagttttaattcaaaaacgtta 8654181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 11198586 - 11198448
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  11198586 aattgcatttttggtcccttaactatttagacagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctccgttacacat 11198487  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  11198486 tttggtcctttccattagttttaattaaaaaacgttagg 11198448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 624 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 29027343 - 29027216
Alignment:
Q  624 atttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||     
T  29027343 atttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttgg- 29027245  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29027244 ---tttcgttagttttaattcaaaaacgttag 29027216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30568657 - 30568519
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||  |||| || |||| |||||||||    
T  30568657 aattgtatttttggtcccttaactatttagttagtatcgatttggtcccttatttaaaatttgatttattttggtcccttaatttttctccgttacacat 30568558  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30568557 tttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacattagg 30568519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 635 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 44255225 - 44255107
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    |||||||||||||| | ||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44255225 ttaactatttaggtgggattgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaacttatctctgttacacattttggtcatttacgttag 44255126  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  44255125 ttttaattcaaaaatgtta 44255107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 618 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 16645929 - 16645795
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctc---tctgttaca 713  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   || ||||||    
T  16645929 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctcatcagttaca 16645830  T
Q  714 cattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  16645829 cattttgttcctttccattagttttaattcaaaaa 16645795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 40032431 - 40032570
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaa-ttaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacaca 715  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  40032431 aattgcatttttggtcacttaattatttaggtagtatcgctttggtctcttaaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctgtctgttacaca 40032530  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  40032531 ttttggtcctttctgttagttttaattaaaaaacattagg 40032570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 44678525 - 44678427
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44678525 tttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctttctgttacacgttttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 44678427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 633 - 754
Target Start/End: Original strand, 12873078 - 12873199
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  12873078 ccttaactatttaattagtatcactttggtcctttaattaaaatttaatttattttggtttcttaacttctctccgttacacattttgatcctttccgtt 12873177  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  12873178 agttttaattcaaaaatgttag 12873199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 621 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 5417191 - 5417056
Alignment:
Q  621 tgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct-gttacacattt 718  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  5417191 tgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggttccttaacttct-tctcgttgcacattt 5417093  T
Q  719 tggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5417092 tggtcatttccgttagttttatttcaaaaacgttagg 5417056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 40094856 - 40094720
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||    |||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |    
T  40094856 aattacatttttggtcccttaactatttaattagtactgttttggtcctttaattaaaattcgatttatttttgtcccttaacttctctccgttacactt 40094757  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40094756 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtta 40094720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 633 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 119481 - 119366
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||   ||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  119481 ccttaactatttaggtagtatcgctttagtcccttaattaaaatttgctttattttggtcccttaacttctcaccggtacacattttggtcatttccgtt 119382  T
Q  733 agttttaatacaaaaa 748  Q
    ||||||||| ||||||    
T  119381 agttttaattcaaaaa 119366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 618 - 748
Target Start/End: Original strand, 1825815 - 1825945
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||  ||||||| | |||||||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  1825815 aattgtatttttggtcccttaactatttaaggagcatcgttttgatctcttaattaaaatttgatt-attttagtcccttaacttctctctgttacacat 1825913  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1825914 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 1825945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 618 - 748
Target Start/End: Original strand, 1860260 - 1860390
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||  ||||||| | |||||||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  1860260 aattgtatttttggtcccttaactatttaaggagcatcgttttgatctcttaattaaaatttgatt-attttagtcccttaacttctctctgttacacat 1860358  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1860359 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 1860390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 3868965 - 3869090
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttac---acattttggtcatttcc 729  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||     
T  3868965 ccttaactatttatgtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtctcttaacttctctccgttacagtacattttggtcttttct 3869064  T
Q  730 gttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||    
T  3869065 gttagttttaattcaaaaacattagg 3869090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 636 - 755
Target Start/End: Original strand, 7041653 - 7041772
Alignment:
Q  636 taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagt 735  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||    
T  7041653 taactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctattacacattttggtccttttcgaaagt 7041752  T
Q  736 tttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  |||||| |||||    
T  7041753 tttaattgaaaaacattagg 7041772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 620 - 754
Target Start/End: Original strand, 39911924 - 39912059
Alignment:
Q  620 ttgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattt 718  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||  |||| || | ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||    
T  39911924 ttgcattttttgtcccttaattatttagatattatctctttggtcgcttaattaaaattcggtttattttggtcctttaacttctctccgttatatattt 39912023  T
Q  719 tggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39912024 tggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 39912059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 602 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 7042021 - 7041872
Alignment:
Q  602 aataaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaact 700  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| |||     |||  |||||||||||||  ||||||    
T  7042021 aataaaatataggctaaattgcatttttggtcccttaactatttatatagtatcgctttggtcccttaa-----atttgatttattttggtcccttaact 7041927  T
Q  701 tctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7041926 tctctttgttacacattttggtcctttccgttaattttaattcaaaaacgttagg 7041872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 633 - 747
Target Start/End: Original strand, 11639073 - 11639187
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  11639073 ccttaactatttaggtagcgtcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttcgtctcttaacttctctccgttacacattttggtcattttcgta 11639172  T
Q  733 agttttaatacaaaa 747  Q
    ||||||||| |||||    
T  11639173 agttttaattcaaaa 11639187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30873159 - 30873021
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||| || |||||||||    
T  30873159 aattgcattttttgtcccttaattattttggtagtattagtttgattccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctatccgttacacat 30873060  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  30873059 tttagtcattttcgttagttttagttcaaaaacgttagg 30873021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 618 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 6844821 - 6844697
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  6844821 aattgcatttttggtctcttaactatttaggtagcatcgctttgatctcttaattaaaaatcgatttatcttggtcccttaacttctctccattacacat 6844722  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaat 741  Q
    ||||||| || || |||||||||||    
T  6844721 tttggtctttcccattagttttaat 6844697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 667 - 751
Target Start/End: Original strand, 30568331 - 30568415
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgt 751  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30568331 taattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctatttgttacacattttggtcatttccgtttgttttaattcaaaaacgt 30568415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 672 - 755
Target Start/End: Original strand, 18914320 - 18914403
Alignment:
Q  672 aaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  18914320 aaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggtcatttcagttagttttaattcaaaaatgttagg 18914403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 625 - 752
Target Start/End: Original strand, 26217082 - 26217209
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||| |||    
T  26217082 tttttggtcccttaactatttaagtagtatcattttggccctttaattaaaatttaatttattttggtcccttaactcctctttgttacaca-tttcgtc 26217180  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgtt 752  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||    
T  26217181 ctttccgttagttttaatttaaaaacgtt 26217209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 5525892 - 5526012
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||  ||||||||| |||  || |||| ||||  ||| ||||||||| ||||||| ||    
T  5525892 ccttaactatttaggtagtatcgatttggtcctttaattaaaatttgatttattttagtccctttacttatctc--ttatacattttggccatttccttt 5525989  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  5525990 agttttaattcaaaaacgttagg 5526012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 33542389 - 33542526
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacaca 715  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||| ||||||||||   ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||    
T  33542389 aattgtatttttggtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatctgatttattttggtattttaact-ctctctccttacaca 33542487  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  33542488 ttttggtcatttttgttagttttaattcaaaaacgttag 33542526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 28207143 - 28206996
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||  ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| ||| |    
T  28207143 tttaggctaaattgcatttttgatcccttaattattttgctagtatcgctttgaccccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctat 28207045  T
Q  708 -gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28207044 cgttacaaattttggtcatttacgttagttttaattcaaaaacgttagg 28206996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 683 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 40040477 - 40040405
Alignment:
Q  683 tattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||    
T  40040477 tattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggtcattttcattagttttaattcaaaaatgttagg 40040405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 618 - 692
Target Start/End: Original strand, 24456739 - 24456814
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24456739 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtc 24456814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 410727 - 410605
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||| | || |||||||||||  ||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  410727 ccttaactattttattagtatcgttttggttccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaccttctctctattacacattttggtccttttcgtt 410628  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     |||||||| |||||||||||||    
T  410627 tgttttaattcaaaaacgttagg 410605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 618 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 44678593 - 44678519
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44678593 aattgtatttttgttccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtc 44678519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 694 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 11639354 - 11639294
Alignment:
Q  694 tttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11639354 tttaacttctctccgttacatattttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttag 11639294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 12873436 - 12873291
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| ||||||||||   ||||||||||||   |||||| |||||     
T  12873436 tttaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatctgatttattttggtatcttaact-ctctcc 12873338  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  12873337 -ttacacattttggtcattttttttagttttaattcaaaaacgttagg 12873291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 667 - 753
Target Start/End: Original strand, 32733766 - 32733852
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  32733766 taattaaaatttgatttattttggtcctttaacttctatacgttacacattttgctcctttccgttaattttaattcaaaaatgtta 32733852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 667 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 26217400 - 26217315
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtt 752  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |  |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26217400 taattaaaatttgatttattttgtacccttaacttctcttcgttacacattttcgtcatttccattagttttaattcaaaaacgtt 26217315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 755
Target Start/End: Original strand, 35485921 - 35486014
Alignment:
Q  662 tcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||   ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  35485921 tcccttaattaaaatttgttttattttggtatattaacttctctttgtcaaacattttggtcattttcattagttttaattcaaaaacgttagg 35486014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 686 - 754
Target Start/End: Original strand, 9495106 - 9495174
Alignment:
Q  686 tttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9495106 tttggtctcttaacttctctctcttataaattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 9495174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 691
Target Start/End: Original strand, 44678322 - 44678396
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggt 691  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  44678322 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggt 44678396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 667 - 755
Target Start/End: Original strand, 410424 - 410512
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  410424 taattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctctccttacatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 410512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 619 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 35486243 - 35486107
Alignment:
Q  619 attgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaac-ttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||   ||||| |||||||  |||||| |    
T  35486243 attgcatttttggtcccctaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttagtatcttaactttctctc-cttacacct 35486145  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    | || || |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35486144 tgtgctcctttctgttagttttaattcaaaaacgttag 35486107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 667 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 33542715 - 33542627
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||  |||||||||| |   |||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  33542715 taattaaaatttgatttattttgatttcttaacttctctccgttacatattttggtcctttatgttagttttaattcaaaaatgttagg 33542627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 36344342 - 36344210
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||   |||| ||   |||||||||||  |||||||||| || |||||||| | || || ||||||    
T  36344342 aattgcattttttatcctttaactatttaggtagtattgctttggtcttttaattaaaatttgatttattttgatcctttaacttatttccgtcacacat 36344243  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaac 749  Q
    |||||||| |||| ||| |||| || |||||||    
T  36344242 tttggtcaattcctttaattttgattcaaaaac 36344210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 701 - 752
Target Start/End: Original strand, 19302274 - 19302325
Alignment:
Q  701 tctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtt 752  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19302274 tctctctgttacacattgtggtcttttgcgttagttttaattcaaaaacgtt 19302325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 692
Target Start/End: Original strand, 15740607 - 15740693
Alignment:
Q  607 aatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  15740607 aattttggcttaattgcctttttggtccattaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtc 15740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 700 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 45436457 - 45436424
Alignment:
Q  700 ttctctctgttacacattttggtcatttccgtta 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45436457 ttctctctgttacacattttggtcatttccgtta 45436424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 715 - 755
Target Start/End: Original strand, 16645648 - 16645688
Alignment:
Q  715 attttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16645648 attttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 16645688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 668 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 18623719 - 18623668
Alignment:
Q  668 aattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatttt 719  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18623719 aattaaaattcgatttattttgcttctttaatttctctctgttacacatttt 18623668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 633 - 723
Target Start/End: Original strand, 21512434 - 21512523
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||  |||  |||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21512434 ccttaactatttagg-agtatcgctttagtccattaattaaaatttgatttattttggccccttaacttctctccgctacacattttggtc 21512523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 95; Significance: 5e-46; HSPs: 89)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 33625869 - 33626007
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33625869 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttatctctgttacacat 33625968  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33625969 tttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttagg 33626007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 611 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 27347985 - 27347841
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttt-tggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgt 709  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  27347985 taggcttaattgcattttatgttccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgt 27347886  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27347885 tacacattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttag 27347841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Original strand, 46620923 - 46621070
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  46620923 tttaggtcaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctcc 46621022  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  46621023 gttacacattttggtcatttccgttatttttaattcaaaaacgttagg 46621070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 9010510 - 9010648
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9010510 aattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctttgttacacat 9010609  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9010610 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacattagg 9010648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 54136096 - 54136234
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  54136096 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcctttaatttctctctgttacacat 54136195  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  54136196 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 54136234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 21218228 - 21218091
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21218228 aattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 21218129  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21218128 tttggtcatttcagttagttttaattcaaaaacgttag 21218091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Original strand, 45911579 - 45911722
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  45911579 ggttaaattgcatttttggttcattaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgtta 45911678  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45911679 cacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 45911722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 627 - 755
Target Start/End: Original strand, 4965885 - 4966014
Alignment:
Q  627 tttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcat 725  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4965885 tttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttgctcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctctgttacacattttggtcat 4965984  T
Q  726 ttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4965985 ttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 4966014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 29864556 - 29864419
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  29864556 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctatctgttacacat 29864457  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29864456 tttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttag 29864419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 738
Target Start/End: Original strand, 46200489 - 46200610
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46200489 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 46200588  T
Q  717 tttggtcatttccgttagtttt 738  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  46200589 tttggtcctttccgttagtttt 46200610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 634 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 25218448 - 25218328
Alignment:
Q  634 cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtta 733  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218448 cttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccattaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtta 25218349  T
Q  734 gttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  25218348 gttttaattcaaaaacgttag 25218328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 28570802 - 28570666
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28570802 aattgcatttttgatcacttaactatttaggtggtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttctatctgttacacat 28570703  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28570702 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaaagtta 28570666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 607 - 755
Target Start/End: Original strand, 43316874 - 43317022
Alignment:
Q  607 aatttaggtttaattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctc 706  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||     
T  43316874 aatttaggctaaattgtatttttggtccttaactattaaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattttatttattttggtcccttaacttatctt 43316973  T
Q  707 tgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43316974 tgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 43317022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 46621314 - 46621170
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  46621314 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcctttaatttctctctgtt 46621215  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46621214 acacattttggtcctttccgttagttttaattaaaaaacgttagg 46621170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 33626245 - 33626107
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33626245 aatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 33626146  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33626145 tttggtcttttccgttagttttaattaaaaaacgttagg 33626107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 52914957 - 52915095
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52914957 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 52915056  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  52915057 tttggtcctttcggttaattttaattcaaaaacgttagg 52915095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 610 - 754
Target Start/End: Original strand, 25058830 - 25058975
Alignment:
Q  610 ttaggtttaattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg 708  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  25058830 ttaggttaaattgcattttttgtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaacttctctatg 25058929  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25058930 ttacacattttgctcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 25058975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 45911955 - 45911818
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  45911955 aattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttatcttctctctgttacacat 45911856  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45911855 tttggtcttttccgttagttttaatttaaaaacgttag 45911818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 633 - 754
Target Start/End: Original strand, 53645472 - 53645593
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53645472 ccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcggtttattttggtcctttaacttctctccgttacacattttggtcatttccgtt 53645571  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  53645572 agttttaattcaaaaacgttag 53645593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Original strand, 25218084 - 25218227
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  25218084 ggttaaatttcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttctctctgtta 25218183  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25218184 cacattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 25218227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 29970198 - 29970335
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  29970198 aattgcatttttggtcccataactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtcatt-aacttatctccgttacacat 29970296  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29970297 tttggtcttatccgttagttttaattcaaaaacgttagg 29970335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 32384658 - 32384796
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  32384658 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggttctttaacctctttctgttacacat 32384757  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  32384758 tttggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 32384796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 33882330 - 33882192
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  33882330 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttttctccgttacacat 33882231  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33882230 tttggtcctttccgttagtcttaattcaaaaacgttagg 33882192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 34959218 - 34959074
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| | || |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||    
T  34959218 aggttaaattgcaattttggtcccttaactatttaggtattatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggttctttaatttctttctgtt 34959119  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34959118 acacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 34959074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 633 - 753
Target Start/End: Original strand, 40067369 - 40067489
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  40067369 ccttaactatttaggtaatatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctttctgttacacattttggtcctttctgtt 40067468  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  40067469 agttttaattcaaaaacgtta 40067489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Original strand, 48209953 - 48210089
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  48209953 aattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcctttaacttctctcccttacacat 48210052  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48210053 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaaggtta 48210089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 1157592 - 1157449
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  1157592 ggttaaattgtatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttttctccgtta 1157493  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1157492 cacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttagg 1157449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 640 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 4793957 - 4793842
Alignment:
Q  640 tatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagtttta 739  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793957 tatttaggtagtatcgttttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggtcatttccgttagtttta 4793858  T
Q  740 atacaaaaacgttagg 755  Q
    || |||||||||||||    
T  4793857 attcaaaaacgttagg 4793842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 616 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 12381437 - 12381298
Alignment:
Q  616 ttaattgcatttttggtccttaa-ctatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacac 714  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  12381437 ttaattgtatttttggtccctaaactatttaggcaatatcgctttcatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacac 12381338  T
Q  715 attttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12381337 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 12381298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 612 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 24504327 - 24504184
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  24504327 aggttaaattacatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgttttagtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgtt 24504228  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24504227 acacattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttag 24504184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 10014470 - 10014607
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  10014470 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaat-cgatttattttgatccattaacttctctctgttacacat 10014568  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  10014569 tttggtcatttcggttaattttaattcaaaaacgttagg 10014607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 10021611 - 10021748
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  10021611 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaat-cgatttattttgatccattaacttctctctgttacacat 10021709  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  10021710 tttggtcatttcggttaattttaattcaaaaacgttagg 10021748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 21217852 - 21217990
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  21217852 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctttccgttacacat 21217951  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21217952 tttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgttagg 21217990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 40067713 - 40067591
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  40067713 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcaatttattttggttccttaacttcttcctgttacacattttggtcattttcgtt 40067614  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  40067613 agttttaattcaaaaacgttagg 40067591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 43317260 - 43317122
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43317260 aattgcatttttagtctcctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttctctctattacacat 43317161  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  43317160 tttggtcctttccgttaattttaattgaaaaacgttagg 43317122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 44433005 - 44432871
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  44433005 aattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcactttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacat 44432906  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgt 751  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44432905 tttggtcctttccgttaattttaattcaaaaacgt 44432871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 18862822 - 18862683
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctctgttacaca 715  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||     
T  18862822 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttgctctctgttacacc 18862723  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18862722 tttttgtccattccgttagttttaattaaaaaacgttagg 18862683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 4966233 - 4966111
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  4966233 ccttaactatttaggtggtatcgttttgattccttaattaaaattcgatttatttttgtctcttaacttctctccattatacattttggtcatttccgtt 4966134  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  4966133 agttttaattcaaaaacgttagg 4966111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 624 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 9010880 - 9010754
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9010880 atttttggtcccttaactatttaggtagtatctctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacatattttggt 9010781  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaac 749  Q
     | |||||||||||||||| |||||||    
T  9010780 tacttccgttagttttaattcaaaaac 9010754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 25593456 - 25593334
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25593456 ccttaactatttagggagtattgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctttccgttacacattttggtcatttccgtt 25593357  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||  ||||||||||||    
T  25593356 agttttaatttaaaaacgttagg 25593334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 29864197 - 29864319
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  29864197 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttttctctgttacacatgttggtcctttctgtt 29864296  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||| ||||||    
T  29864297 agttttaattcaaaaaggttagg 29864319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 34958837 - 34958974
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||| || || ||||| |||||||||||||     
T  34958837 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgttcctt-aacttatctctgttacacaa 34958935  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34958936 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 34958974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 8246774 - 8246910
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  8246774 aattgtatttttggtccttaattatttagataatatcattttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctc-gttacacatt 8246872  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8246873 ttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 8246910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 8751292 - 8751429
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  8751292 aattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtataattttggtcccttaactaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctccgttacacat 8751391  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  8751392 tttgatcctttctgttagttttaattaaaaaacgttag 8751429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 633 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 37515818 - 37515697
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||    
T  37515818 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctatttgttacacattttggtcaattccatt 37515719  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  37515718 agttttaattaaaaaacgttag 37515697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 618 - 741
Target Start/End: Original strand, 1205383 - 1205506
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1205383 aattgcacttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaactt-tctctgttacacat 1205481  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaat 741  Q
    || | ||||| ||||||||||||||    
T  1205482 ttcgatcattgccgttagttttaat 1205506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 613 - 748
Target Start/End: Original strand, 2738880 - 2739016
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  2738880 ggttaaattgcatttttgatcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctatta 2738979  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  2738980 cacattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaa 2739016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 46200866 - 46200728
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||| |||    
T  46200866 aattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtaacgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaacttcttttcgttacgcat 46200767  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  46200766 tttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgttagg 46200728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 52915308 - 52915186
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||    
T  52915308 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggtcctttttgtt 52915209  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  52915208 agttttaattcaaaaacgttagg 52915186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 1205758 - 1205622
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||| || |||||||||    
T  1205758 aattgcatttttggtcccttaactatttaggcagtatcgcttttctcccttaattaaaattcgatttatttttgtcccttaccttctttccgttacacat 1205659  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1205658 tttggtcttttccattagttttaattcaaaaacgtta 1205622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 624 - 755
Target Start/End: Original strand, 27347608 - 27347740
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  27347608 atttttggtcccttgactatttagatagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgttacacattttggt 27347707  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27347708 cctttccattagttttaattcaaaaacgttagg 27347740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 620 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 10014842 - 10014708
Alignment:
Q  620 ttgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattt 718  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||    
T  10014842 ttgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgtattggtcccttaattaaaatttgatttattttgatctcttaacttctctttgttacaca-tt 10014744  T
Q  719 tggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10014743 tggtcatttccgttagttttaattcaaacacgttag 10014708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 620 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 10021983 - 10021849
Alignment:
Q  620 ttgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattt 718  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||    
T  10021983 ttgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgtattggtcccttaattaaaatttgatttattttgatctcttaacttctctttgttacaca-tt 10021885  T
Q  719 tggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10021884 tggtcatttccgttagttttaattcaaacacgttag 10021849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 625 - 755
Target Start/End: Original strand, 25977781 - 25977912
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||| || |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25977781 tttttggtcccttaactatctaggtactatcgctttggtctctcaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctccgttacatattttggtc 25977880  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25977881 ttttccattagttttaattcaaaaacgttagg 25977912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 8247127 - 8246989
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||    
T  8247127 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtaatatttctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctcccttaaacat 8247028  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  8247027 tttcgtcatttctgttatttttaattcaaaaacgttagg 8246989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 44710408 - 44710546
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || | |||  ||||||  |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  44710408 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtctcttaacaaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctccgttacacat 44710507  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  44710508 tttggtcctttctgttaattttaattcaaaaacgttagg 44710546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 45683498 - 45683360
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||| | || ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45683498 aattgtatttttggttccttaactatttaggtaatattgctttggttccttaactaaaatttgatttattttggtcctttaacttatctccgttacacat 45683399  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  45683398 tttggtcctttcggttagttttaattcaaaaacgttagg 45683360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 46535903 - 46535765
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||    
T  46535903 aattgtatttttggtcacttaactatttaggtagtattgttttggtcctctaattaaaattctatttatcttggtcctttaacttctttctggtatacat 46535804  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  46535803 tttggtcctttctgttagttttaattaaaaaacattagg 46535765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 32385199 - 32385055
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgt 709  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||   |||||||||  | ||    
T  32385199 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcttt-atcccttaactaaaatttgatttattttggttccttaacttcttcccgt 32385101  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  32385100 tacacattttggtcctttccgttagttttaattaaaaaatgttagg 32385055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 609 - 749
Target Start/End: Original strand, 38866394 - 38866535
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||  ||||||||||||   |||||||||  |     
T  38866394 tttaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaactaaaatttgatttattttggttccttaacttcttccc 38866493  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaac 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38866494 gttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaac 38866535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 44710784 - 44710647
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||  |||| | || |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44710784 aattgcatttttgatcccttaagtatttatgtagtatcgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 44710685  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||| ||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||    
T  44710684 tttagtccttttcgttggttttaattcaaaaaagttag 44710647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Original strand, 1157203 - 1157349
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaa---cttctctctg 708  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||   ||||||||||    
T  1157203 ggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtaatatcgctttggttccttaattaaaatttaatttattttggtcccttaagtacttctctctg 1157302  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  1157303 ttacacattttggtcctttctgttaattttaattcaaaaatgttagg 1157349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 21051380 - 21051502
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||| ||||||||||| |||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21051380 ccttaattatttaggtagcatcgctttgatctcttaactaaaatttgatttattttggtccattaacttctatccgttacacattttggtcatttccgtt 21051479  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |  |||||| |||||||||||||    
T  21051480 aaatttaattcaaaaacgttagg 21051502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 21051688 - 21051590
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21051688 tttggtcccttaattaaaattagatttattttggtcccttaacttctctttattacacattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttagg 21051590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 633 - 754
Target Start/End: Original strand, 24503960 - 24504082
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt-catttccgt 731  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||| | |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  24503960 ccttaattatttaggtagtattgttttggttctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctctgttacacatcttggtccttttccgt 24504059  T
Q  732 tagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  24504060 tagttttaattcaaaaacgttag 24504082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Original strand, 44428616 - 44428714
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44428616 tttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 44428714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 45683122 - 45683260
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  45683122 aattacatttttgatctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaagtaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctctgttacacat 45683221  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  45683222 tttggtcctttttgttagttttaattcaaaaacattagg 45683260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Original strand, 15985465 - 15985610
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttct-ctctgt 709  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| | ||||      
T  15985465 aggttaaattgcatttttggtctcttaactattttgctagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttttctctaa 15985564  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15985565 tacacattttggtcctttacgttagttttaattcaaaaacgttagg 15985610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 22831185 - 22831040
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctctgt 709  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| || ||  |    
T  22831185 aggttaaattggatttttggtcccttaactattttgctagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctatccat 22831086  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22831085 tacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 22831040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 632 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 38866766 - 38866657
Alignment:
Q  632 tccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttgg-tcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccg 730  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  38866766 tccttaactatttaggtagtatcgctttggtactctaattaaaattcgatttatttttgatcctttaacttctttctgttacacattttggtcatttatg 38866667  T
Q  731 ttagttttaa 740  Q
    ||||||||||    
T  38866666 ttagttttaa 38866657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 662 - 755
Target Start/End: Original strand, 54191638 - 54191731
Alignment:
Q  662 tcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  54191638 tcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttgatcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 54191731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 635 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 43969890 - 43969770
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  43969890 ttaactatttatgtagtatcgttttgatcccttgattaaaattcgatttactttggtcccttaacttctttttgttatacattttgatcctttccgttag 43969791  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  43969790 ttttaattcaaaaatgttagg 43969770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 9658012 - 9657890
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacacattttggtcatttccgt 731  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  9658012 ccttaactatttaattagtatcgttttggtcccctaattaaaatttaatttattttggtatcttaactt-tctctccttacacattttggttctttccgt 9657914  T
Q  732 tagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  9657913 tagttttaattcaaaaacgttagg 9657890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 11102364 - 11102218
Alignment:
Q  610 ttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctct 707  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||   |||| |||| |||||||||||  ||||||||| ||   ||||||| |||||     
T  11102364 ttaggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtattggtttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtatcttaactttctctcc 11102265  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  11102264 gttacacattttggtcatttacgttagttttaattcaaaaatgttag 11102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 46535528 - 46535665
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||   |||  |||| |||  | |||||    
T  46535528 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggttccttagtttct-tctcgttcacat 46535626  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46535627 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 46535665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 612 - 729
Target Start/End: Original strand, 37515528 - 37515645
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||  ||||    
T  37515528 aggttaaattgcatttttgtttcttaactatttaggtagtatcccgttgatcctttaattaaaatttaatttatttttgtcccttaacttctcttcgtta 37515627  T
Q  712 cacattttggtcatttcc 729  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  37515628 cacatttggatcatttcc 37515645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 9657672 - 9657810
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacaca 715  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||| |   ||||||| |||||  |||||||    
T  9657672 aattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatatcttaactt-tctctccttacaca 9657770  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9657771 ttttagtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 9657810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 11242845 - 11242712
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| || |||| | ||    
T  11242845 aattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttgattaaaattcgatttattttggtcccttaatttctttccgttatatat 11242746  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| ||||||     ||||||| |||||||||||||    
T  11242745 tttggttatttcc-----ttttaattcaaaaacgttagg 11242712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 601 - 753
Target Start/End: Original strand, 44169967 - 44170121
Alignment:
Q  601 taataaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaac 699  Q
    |||||||||  ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| | |||||||||  ||||||||| ||   |||||    
T  44169967 taataaaataaaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttgattaaaatttgatttattttagtatcttaac 44170066  T
Q  700 tt-ctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44170067 tttctatccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgtta 44170121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 22830801 - 22830940
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctctgttacaca 715  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||   |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||    
T  22830801 aattggatttttggtcccttaactattttgctagtatagctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctccgttacaca 22830900  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  22830901 ttttggtcctttatgttagttttaattcaaaaatgttagg 22830940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 667 - 754
Target Start/End: Original strand, 42779575 - 42779662
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||  |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42779575 taattaaaattcgatttattttaatccgttaatttatctttgttacacattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttag 42779662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 54136468 - 54136334
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||   ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||   ||||||    |||||| || ||    
T  54136468 aattgcaatttttgtcctttaactatttaggtagaattgttttgatcctttaattaaaatttgatttattttggttccttaact----tctgttgcatat 54136373  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  54136372 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacattagg 54136334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 54191965 - 54191829
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| |  ||||||||    
T  54191965 aattgtatttttggtcccttaactatttagatagcatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttcattaacttctccccattacacat 54191866  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||  ||||| |||||    
T  54191865 tttggtcctttcc-ttagtttcaattaaaaaatgttag 54191829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 667 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 21885155 - 21885073
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaac 749  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||| |||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  21885155 taattaaaatttgatttattttggtcccttaatttctatccgttaaacattttggtcctttccgttacttttaattcaaaaac 21885073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 695 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 29970495 - 29970437
Alignment:
Q  695 ttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29970495 ttaacttctctctgttacacattttggagctttccgttagttttaattcaaaatcgtta 29970437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 44170362 - 44170223
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaac-ttctctctgttacaca 715  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||   ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||| || | |||| |    
T  44170362 aattgcatttttgatcccttaactatttaattagtattgctttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtattttaactttctatccg-tacata 44170264  T
Q  716 --ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
      |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44170263 ttttttggtcctttccgttagttttaatttaaaaacgttag 44170223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 29970553 - 29970517
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatc 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29970553 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatc 29970517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 692
Target Start/End: Original strand, 44428518 - 44428593
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  44428518 aattgcatttttgataccttaactatttaggtattatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtc 44428593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 703 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 40681467 - 40681417
Alignment:
Q  703 tctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40681467 tctctgttacatgttttggtcccttccgttagttttaataaaaaaacgtta 40681417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 95; Significance: 5e-46; HSPs: 118)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 4846977 - 4846839
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  4846977 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtctcataacttctctctgttacacat 4846878  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4846877 tttggccatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 4846839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 54107674 - 54107812
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  54107674 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctccgttacacat 54107773  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  54107774 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacattagg 54107812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 604 - 755
Target Start/End: Original strand, 40410703 - 40410855
Alignment:
Q  604 taaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttc 702  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  40410703 taaaattaaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 40410802  T
Q  703 tctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40410803 tctttgttacacattttggttatttccgttagttttaattaaaaaacgttagg 40410855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 26332324 - 26332462
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26332324 aattgcatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaatttcaatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 26332423  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26332424 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacattagg 26332462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 26332703 - 26332561
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc-----atttaacttctctctgttac 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||     | ||||||||||||||||||    
T  26332703 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttaacttctctctgttac 26332604  T
Q  713 acattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26332603 acattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacattagg 26332561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 35580347 - 35580205
Alignment:
Q  601 taataaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaac 699  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  35580347 taatagaattaaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaac 35580248  T
Q  700 ttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaata 742  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35580247 ttctctccgttacacattttggtcattttcgttagtttcaata 35580205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 8846457 - 8846320
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8846457 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcacttaactaaaattccatttattttggtcttttaacttctctttgttacacat 8846358  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8846357 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttag 8846320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 34521271 - 34521408
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34521271 aattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 34521370  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34521371 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaatgttag 34521408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 7275023 - 7274889
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  7275023 aattgcatttttggtccgttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctct-tgttacacat 7274925  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtt 752  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  7274924 tttggtcatttcttttagttttaattcaaaaacgtt 7274889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 603 - 753
Target Start/End: Original strand, 34629972 - 34630123
Alignment:
Q  603 ataaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt 701  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  34629972 ataaaattaaggttaaattatatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaactt 34630071  T
Q  702 ctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34630072 ctctccgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtta 34630123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Original strand, 41208397 - 41208544
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||     
T  41208397 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctcc 41208496  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41208497 gttgcacattttggtcatttccgttagatttaattcaaaaacgttagg 41208544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 15862556 - 15862418
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||  |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15862556 aattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatctcttttgtccctttattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctttgttacacat 15862457  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15862456 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 15862418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 624 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 19124546 - 19124416
Alignment:
Q  624 atttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||     
T  19124546 atttttggtccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttgacttttctctgttacacattttggtt 19124447  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19124446 atttccgttagttttaattcaaaaacgttag 19124416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 41997824 - 41997962
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  41997824 aattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtcccttaacttctctctattacacat 41997923  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  41997924 tttggtcatttttgttagttttaattcaaaaacgttagg 41997962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 44069504 - 44069366
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44069504 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctttctgttacacat 44069405  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  44069404 tttggtcctttctattagttttaattcaaaaacgttagg 44069366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 12123467 - 12123322
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgt 709  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| || ||    
T  12123467 taggttaaatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttccgt 12123368  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12123367 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaagcgttagg 12123322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 7937944 - 7937808
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  7937944 aatttcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgaattattttggtctcttaacttctctccgttacacat 7937845  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7937844 tttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgtta 7937808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 52268484 - 52268349
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  52268484 aattgcatttttggtccattaactatttagttagtatcgttttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtc-tttaacttctcttcgttacacat 52268386  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52268385 tttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgtta 52268349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 616 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 53841409 - 53841269
Alignment:
Q  616 ttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacac 714  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||| || | |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  53841409 ttaattgcatttttggtcccttaactatttagctagtattgctttggtctcgtaattaaaattcgatttattttggtcccttaatttctctccgttacac 53841310  T
Q  715 attttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53841309 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 53841269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 605 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 7743160 - 7743009
Alignment:
Q  605 aaaatttaggtttaattgcattttt-ggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttc 702  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||     
T  7743160 aaaatgtaggttaaattacattttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtctcataactta 7743061  T
Q  703 tctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7743060 tctctgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 7743009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 12123095 - 12123233
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||  |||||||||    
T  12123095 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttctcttcgttacacat 12123194  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12123195 tttggttctttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 12123233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 45871702 - 45871840
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  45871702 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaaattctctctgttatacat 45871801  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  45871802 ttgggtcatttccgttagttttaattaaaaatcgttagg 45871840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Original strand, 40926009 - 40926154
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgt 709  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||| ||    
T  40926009 taggttaaattgcatttttggtcttttaactatttatgtagtatcgctttgatctcttaattaaaatttgatttattttgatccattaacttctctccgt 40926108  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40926109 tacacattttggtcatttccgttagttttaattgaaaaacgttagg 40926154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 609 - 753
Target Start/End: Original strand, 50819216 - 50819361
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||  || | |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  50819216 tttaggcttaattgcatttttggtcccttaactatttacgtagcatcgctttcgtcgcttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttatctct 50819315  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  50819316 gttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgtta 50819361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 609 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 50856648 - 50856503
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||  || | |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  50856648 tttaggcttaattgcatttttggtcccttaactatttacgtagcatcgctttcgtcgcttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttatctct 50856549  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  50856548 gttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgtta 50856503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 639 - 755
Target Start/End: Original strand, 28688017 - 28688133
Alignment:
Q  639 ctatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagtttt 738  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28688017 ctatttaggtagtatcactttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccggtacacattttggtcatttccattagtttt 28688116  T
Q  739 aatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| |||||||||||||    
T  28688117 aattcaaaaacgttagg 28688133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 605 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 54108514 - 54108363
Alignment:
Q  605 aaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttct 703  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  54108514 aaaattaaggctaaattgcatttttggtcccttaattatttagctagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactttt 54108415  T
Q  704 ctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  54108414 ctctgttatacattttggttatttccgttagttttaattcaaaaacattagg 54108363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 7950280 - 7950418
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||   |||| || | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7950280 aattgcatttttagtcccttaactatttatgtagtattgttttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttttctctgttacacat 7950379  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7950380 tttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 7950418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 8846081 - 8846219
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || | ||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  8846081 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtctcttaactaaaattcgattaattttggtcccttaacttctctttgttacacat 8846180  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8846181 tttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttagg 8846219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 10756723 - 10756861
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10756723 aattgtatttttggtcccttagctatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 10756822  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10756823 tttgttgctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 10756861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 31513868 - 31514006
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31513868 aattgcatttttggtccattaactatttaggtagtatcgctttgattctttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttctctatgttacacat 31513967  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| || | |||||||||||| |||||| ||||||    
T  31513968 tttggtccttccagttagttttaattcaaaaatgttagg 31514006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 43899455 - 43899317
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||    
T  43899455 aattgcatttttggttccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccctaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacatat 43899356  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||    
T  43899355 tttggtccttaccgttagttttaattaaacaacgttagg 43899317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 45171448 - 45171310
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||||    
T  45171448 aattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaattaaaattcgatttattttggtcccttaatttctttccattacacat 45171349  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45171348 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 45171310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 52606134 - 52606271
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  52606134 aattgcattttggtcccttaactatttatgtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacatt 52606233  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  52606234 ttggtcatttccgttagttttaaataaaaaacgttagg 52606271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 633 - 753
Target Start/End: Original strand, 45171089 - 45171209
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45171089 ccttaactatttaggtagtattgctttggccccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctaagttacacattttggtcatttccgtt 45171188  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  45171189 agttttaattcaaaaacgtta 45171209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 14353428 - 14353291
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  14353428 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcattggtcccttaaataaaattcgatttatcttggtcctttaacttctctccgttacaca- 14353330  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14353329 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 14353291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 27940277 - 27940415
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||  |||||||||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  27940277 aatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaatttaaatttgatttattttggtccctaaacttctctccgttacacat 27940376  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27940377 tttggtcatttccgttaggttcaattcaaaaacattagg 27940415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31514243 - 31514106
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||     
T  31514243 aattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttttctccgttacacag 31514144  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31514143 tttggtc-tttccgttagctttaattcaaaaacgttagg 31514106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 34521638 - 34521500
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| || |||||||||    
T  34521638 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaatttctttccgttacacat 34521539  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34521538 tttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgttagg 34521500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 40926391 - 40926254
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  40926391 aattgcatttttagtcccctaactatttaggtagtatcactttggtccattaattaaaatttgatttattttggtcctt-aacttcactctgttacacat 40926293  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  40926292 tttggtcatttccgttaattttaattgaaaaacgttagg 40926254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 44069128 - 44069266
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||  | |||||||||    
T  44069128 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaactaaaattcgatttattttggttccttaacttcttcccgttacacat 44069227  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44069228 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacattagg 44069266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 10757089 - 10756952
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  10757089 aattgtattttttgtcctttaactatttaggcagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaatttctctccgttacacat 10756990  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10756989 tttgatcttttccgttaattttaattcaaaaacgttag 10756952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 633 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 28688355 - 28688234
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28688355 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacgttttggtcctttccgtt 28688256  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    | ||||||| ||||||||||||    
T  28688255 aattttaattcaaaaacgttag 28688234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 734
Target Start/End: Original strand, 43899116 - 43899233
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43899116 aattgcatttttggtcctttaactatttaggtaacatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 43899215  T
Q  717 tttggtcatttccgttag 734  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  43899216 tttggtcctttccgttag 43899233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 618 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 41208781 - 41208649
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||    
T  41208781 aattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtcccttaacatctctctgttacacat 41208682  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaac 749  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  41208681 tttggtcctttccgttaattttaattcaaaaac 41208649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 609 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 28691503 - 28691364
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||  ||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  28691503 tttaggttaaattgtattttttgtcccttaattatttaggtagtatcgcttttgtccctaaattaaaatttgatttattttgatcatttaacttctctct 28691404  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaa 747  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  28691403 gttacacattttggtcttttctgttagttttaattcaaaa 28691364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 54081665 - 54081526
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacaca- 715  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  54081665 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttctctctgttacacat 54081566  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  54081565 ttttggtcattttcgttatttttaattcaaaaatgttagg 54081526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 15862203 - 15862325
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  15862203 ccttaattatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacattttggtcatttctatt 15862302  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    
T  15862303 agttttaattcaaaaacattagg 15862325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 19124194 - 19124332
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||    
T  19124194 aattgcatttttggtcccttaactatttaagtaatattgctttggtcccctaattaaaattcgatctattttgatctcttaacttctcttcgttacacat 19124293  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19124294 tttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 19124332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 21169671 - 21169809
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||   ||    
T  21169671 aattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttatcaat 21169770  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21169771 tttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttagg 21169809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 2829788 - 2829651
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||||| ||   |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||    
T  2829788 aattgcatttttgatccttaactatttatgtattattgatttggtcttttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttttctccgttacatatt 2829689  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2829688 ttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttagg 2829651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 51170762 - 51170625
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  51170762 aattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgttttgatcatttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctatgttacacat 51170663  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaa-tacaaaaacgtta 753  Q
    ||| ||| ||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  51170662 tttagtcttttcaattagttttaattaaaaaaacgtta 51170625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 621 - 755
Target Start/End: Original strand, 17273785 - 17273920
Alignment:
Q  621 tgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatttt 719  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||    
T  17273785 tgcatttttggtcccttaactatttaggccgtatcgttttgattccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctcttcattacatatttt 17273884  T
Q  720 ggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  17273885 ggtctttttcgttagttttaattaaaaaacgttagg 17273920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 9028572 - 9028434
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||    
T  9028572 aattgcatttttggttcattaactattaagctagtattgttttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtcctttaacttctcttcgttatacat 9028473  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9028472 tttagttttttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 9028434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 610 - 755
Target Start/End: Original strand, 14353043 - 14353189
Alignment:
Q  610 ttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg 708  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||| |||  |||||||  |||||    
T  14353043 ttaggttaaattgcatttttgatcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtcccttaactttcctctg 14353142  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  14353143 tgacacattttggccatttccgtcagttttaattcaaaaatgttagg 14353189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 17102389 - 17102527
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||   |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  17102389 aattgcatttttggtttcttaattatttaggtaatattgttttcttcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctccctgttacatat 17102488  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17102489 tttgggcatttccgttaattttaattcaaaaacgttagg 17102527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 640 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 17102735 - 17102621
Alignment:
Q  640 tatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagtttta 739  Q
    |||||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  17102735 tatttaggtagtatcgctttggtccattaaataaaattcgatttattttggtcctttaacttctctctcttatagattttggtcctttccgttagtttta 17102636  T
Q  740 atacaaaaacgttag 754  Q
    || ||||||||||||    
T  17102635 attcaaaaacgttag 17102621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 635 - 753
Target Start/End: Original strand, 29248342 - 29248460
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    |||||||||||||| |||||  |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  29248342 ttaactatttaggtggtatcgttttagtcccttaattaaaatttaatttattttggttccttaacttctctctgttacacattttggtccttttcattag 29248441  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  29248442 ttttaattcaaaaacgtta 29248460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 613 - 754
Target Start/End: Original strand, 54081284 - 54081425
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  54081284 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggcagtatcgctttggtcct-taattaaaattcgatttattttagtcccttaacttctctctgtta 54081382  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  54081383 catattttggtcttttctgttagttttaatttaaaaacgttag 54081425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 35753819 - 35753674
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgt 709  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |    
T  35753819 taggttaaattacatttttggtaccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaatttaaattcgatttattttgatcccttaacttctctccat 35753720  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  35753719 cacatattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 35753674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 50819598 - 50819461
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  50819598 aattgcatttttggtctcttaactgttaaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttacttctatgtgttacacat 50819499  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  50819498 tttcgtcctttttgttagttttaattcaaaaacgttag 50819461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 50856266 - 50856403
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  50856266 aattgcatttttggtctcttaactgttaaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttacttctatgtgttacacat 50856365  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  50856366 tttcgtcctttttgttagttttaattcaaaaacgttag 50856403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 635 - 755
Target Start/End: Original strand, 27254007 - 27254127
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  27254007 ttaactatttaggcagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggttccttaacttctctccgttacacattttgattatttccgttag 27254106  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  27254107 ttttaattcaaaaatgttagg 27254127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 625 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 40639491 - 40639360
Alignment:
Q  625 tttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40639491 tttttggtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatattggtatcttaacttctctctgttacatattttggtc 40639392  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  40639391 atttccgtgtgttttaattcaaaaacgttagg 40639360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 610 - 755
Target Start/End: Original strand, 46766619 - 46766766
Alignment:
Q  610 ttaggtttaattgcatttttggtcctta-actatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctct 707  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| || ||     
T  46766619 ttaggttaaattgcatttttggtccttttactattttgctaatatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctatcc 46766718  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46766719 gttacacattttggtcatttccgttagttttaattaaaaaacgttagg 46766766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 624 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 45872064 - 45871946
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| |||| |||||| |||    
T  45872064 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaaattctctccgttatacatttgggt 45871965  T
Q  723 catttccgttagttttaat 741  Q
    | |||||||||||||||||    
T  45871964 cctttccgttagttttaat 45871946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 657 - 754
Target Start/End: Original strand, 35753477 - 35753574
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35753477 tttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctacgtgacacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttag 35753574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 667 - 755
Target Start/End: Original strand, 53841082 - 53841170
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  53841082 taattaaaattcaatttattttggtcccttaacttatctctgttgcacattttgatcctttccgttaattttaattcaaaaacgttagg 53841170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 40969260 - 40969398
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacaca 715  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||  |||||||    
T  40969260 aattgcatttttagtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctcttcttacaca 40969358  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40969359 ttttggtcatttccgtcagttttaattcaaaaacgttagg 40969398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 9028196 - 9028334
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||||||||  |||||||||| ||  |||||| ||  ||| |||||||    
T  9028196 aattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtccctaagttaaaatttgatttattttgttctcttaactccttcctgctacacat 9028295  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9028296 tttggtatttttcgttagttttaattcaaaaacgttagg 9028334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 633 - 747
Target Start/End: Original strand, 22354963 - 22355077
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | |  |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22354963 ccttaactatttaggtagtatcgttttggttctttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttttctgtgttacacattttggtcctttccgtt 22355062  T
Q  733 agttttaatacaaaa 747  Q
    | ||||||| |||||    
T  22355063 aattttaattcaaaa 22355077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 29248673 - 29248551
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||  |||  |||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  29248673 ccttaactatttagatagtattactttagtcctttaattaaaatttgatctattttggtcccttaacttctctccgttacacaatttggtcaatttcgtt 29248574  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  29248573 agttttaattcaaaaacgttagg 29248551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 611 - 754
Target Start/End: Original strand, 5348577 - 5348721
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg- 708  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||  |||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||      
T  5348577 taggttaaattgcatttttagtcccttaactatttaattagtatcgctttggtccctcaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctctcc 5348675  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5348676 ttacacattttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttag 5348721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 619 - 755
Target Start/End: Original strand, 7742781 - 7742918
Alignment:
Q  619 attgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||  || | |||| |  | |||||||||||  |||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  7742781 attgcatttttagtcccttaactatttaggtaacattattttggttacttaattaaaatttgatttattttgttctcttatcttctctctgttgcacatt 7742880  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7742881 ttggtcttttccgttaattttaattcaaaaacgttagg 7742918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 635 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 5348931 - 5348811
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    |||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||  |    
T  5348931 ttaactatttaattagtatcgctttggtcccgtaattaaaatttgatttattttggtattttaacttttctccgttacatattttggtcctttccgtgtg 5348832  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  5348831 ttttaattcaaaaacgttagg 5348811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 610 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 47891902 - 47891756
Alignment:
Q  610 ttaggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcat-ttaacttctctct 707  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  47891902 ttaggttaaattccatttttgttcctttaactatttaattagtattgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttgg-catcttaactt-tctct 47891805  T
Q  708 g-ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47891804 ccttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 47891756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 618 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 52609743 - 52609639
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  52609743 aattccatttttggtcccttaactatttaggtactatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaatttctctctgttacatat 52609644  T
Q  717 tttgg 721  Q
    |||||    
T  52609643 tttgg 52609639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 2829412 - 2829551
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcat-ttaacttctctctgttacaca 715  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || | ||||||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||    
T  2829412 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtctcttaattaacatttgatttattttggttttcttaacttctctctgttaaaca 2829511  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||    
T  2829512 ttttggtcttttctgctagttttaattcaaaaacattagg 2829551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 625 - 755
Target Start/End: Original strand, 37133289 - 37133420
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| ||| |||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37133289 tttttggtcccttagctatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctcttcgttacacattttggtc 37133388  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     ||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37133389 cttttcgtaagttttaattcaaaaacgttagg 37133420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 625 - 755
Target Start/End: Original strand, 53678445 - 53678576
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| |||| ||||||  |||||||  |||| |||  |||||||||||  ||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  53678445 tttttggtcccttaattatttaaatagtatcgctttggtcctttaattaaaatttgatttattttagtatcttaacttctctccgttacacattttgatc 53678544  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53678545 atttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 53678576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 20963677 - 20963531
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaa-cttctctctg 708  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  20963677 taggcttaattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctctctg 20963578  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||   |||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  20963577 ttacttcttttagtcctttccgttagttttattaaaaaaaagttagg 20963531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 612 - 733
Target Start/End: Original strand, 33812723 - 33812845
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| | |  |||||||||||  |||||||||| || |||||||||| || |||    
T  33812723 aggttaaatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggttctttaattaaaatttgatttattttgatcctttaacttctatccgtt 33812822  T
Q  711 acacattttggtcatttccgtta 733  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  33812823 acacattttcgtcatttccgtta 33812845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 603 - 754
Target Start/End: Original strand, 40639107 - 40639259
Alignment:
Q  603 ataaaatttaggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt 701  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||    
T  40639107 ataaaataaaggttaaattgcatttttagttctttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 40639206  T
Q  702 ctctctg-ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
     |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40639207 -tctctccttacaaattttggtcatttccgttggttttaattcaaaaacgttag 40639259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 618 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 46766995 - 46766870
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctctgttacaca 715  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||| ||   ||||||| ||||| ||||||||    
T  46766995 aattgtatttttggtcccttaactattttgctagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatttttgtatcttaactttctctccgttacaca 46766896  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaat 741  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  46766895 ttttggtcatttacgttagttttaat 46766870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 625 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 33773165 - 33773034
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctctgttacacattttggt 722  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||||||   |||| || ||||||||| || ||||||||    
T  33773165 tttttggtcccttaactatttaattagtatcactttgatcccttgattaaaatttgatttattttggtatcttaattttctctctgttccatattttggt 33773066  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    | |||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  33773065 cgtttccgttggttttaatttaaaaacgttag 33773034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 17274157 - 17274019
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||   |||||||||    
T  17274157 aattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcttttaattaaaattcgaattattttggtctcttaatttctcatcgttacacat 17274058  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||   |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  17274057 tttggttcattccgttatttttaattcaaaaatgttagg 17274019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 625 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 43844473 - 43844359
Alignment:
Q  625 tttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctctgttacacattttggt 722  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||||||| ||||| |  ||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  43844473 tttttggtcctttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaaattgatttatttttgtcctttaaatttctctccgttacacattttggt 43844374  T
Q  723 catttccgttagttt 737  Q
    |||||||||||||||    
T  43844373 catttccgttagttt 43844359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 47891534 - 47891656
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||| |||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||||||| |||  |||    
T  47891534 ccttaacaatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctattcgttacacattttggtcctttttgtt 47891633  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  47891634 agttttaattcaaaaacgttagg 47891656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 686 - 754
Target Start/End: Original strand, 43527068 - 43527136
Alignment:
Q  686 tttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  43527068 tttggtcccttaacttctctctggtacacattttggtcatttccgttagttttgattcaaaaacattag 43527136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 724
Target Start/End: Original strand, 49222041 - 49222148
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || | ||   |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  49222041 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgcttcggtcttttaattaaaattcgatttatttcggttcttcaacttctctctgttacacat 49222140  T
Q  717 tttggtca 724  Q
    ||||||||    
T  49222141 tttggtca 49222148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 40969642 - 40969497
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg- 708  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||  || | |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||      
T  40969642 taggttaaattatatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttagtctcttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctcttc 40969544  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40969543 ttacacattttggtcctttccgtcagttttaattcaaaaacgttagg 40969497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 618 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 53310103 - 53310001
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  53310103 aattgcatttttagtctcctaattatttaggtagtatcactttggtctcttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccattacacat 53310004  T
Q  717 ttt 719  Q
    |||    
T  53310003 ttt 53310001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 692
Target Start/End: Original strand, 35753408 - 35753483
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  35753408 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtttcttaattaaaattcgatttattttggtc 35753483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 49529201 - 49529078
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggt-catttaacttctctctgttacaca 715  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||       
T  49529201 aattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactac 49529102  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagtttta 739  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||    
T  49529101 ttttagtcctttccgttaatttta 49529078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 53678798 - 53678676
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacacattttggtcatttccgt 731  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  53678798 ccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctctccttacacattttggttctttccgt 53678700  T
Q  732 tagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    | |||||| | |||||||||||||    
T  53678699 tggttttagttcaaaaacgttagg 53678676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 38911608 - 38911494
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||| || |||||||||| |||   |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||    
T  38911608 tttaggctaaattgtattttttgtcctttaattatttaggtaatattgttttggtcctttaattaaaattcgatttattttggttcattaacttttctct 38911509  T
Q  708 gttacacattttggt 722  Q
    |||||||||||||||    
T  38911508 gttacacattttggt 38911494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 683 - 752
Target Start/End: Original strand, 4846667 - 4846735
Alignment:
Q  683 tattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtt 752  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  4846667 tattttggtcccttaacttctctctcttacacattttggtcctttccattag-tttaattcaaaaacgtt 4846735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 657 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 22444527 - 22444430
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||| | ||||| ||||    
T  22444527 tttggtcccttaattaaaattcgatttatttcggttccttaacttctctctgttacatattttggtccttttgtttagttttaattcgaaaacattag 22444430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 28691119 - 28691256
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||   |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||    
T  28691119 aattgtatttttggtcccttaattatttaggtggtattgctttgttcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttttctgcattacacat 28691218  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||| || |||  |||| |||||||  |||||||||||    
T  28691219 tttgatcctttatgttaattttaatttaaaaacgttag 28691256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 41998204 - 41998135
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaatt 677  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  41998204 tttaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatt 41998135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 657 - 733
Target Start/End: Original strand, 50393362 - 50393439
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctctgttacacattttggtcatttccgtta 733  Q
    ||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50393362 tttgatcccttaactaaattttgatttattttggtcccttaactttctctctgttacacgttttggtcatttccgtta 50393439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 741
Target Start/End: Original strand, 33771996 - 33772120
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttc-tctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||   |||  |  | |||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||  | || |||||||||    
T  33771996 aattgcatttttgatccttaactatttaattagtattgcttttctttcttaattaaaattttatttattctggtattttaactttatttccgttacacat 33772095  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaat 741  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  33772096 tttggtcttttccgttagttttaat 33772120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 685 - 741
Target Start/End: Original strand, 52268176 - 52268232
Alignment:
Q  685 ttttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaat 741  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52268176 ttttggtcccttaacttctctcacttacacattttggtcattttcgttagttttaat 52268232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 700 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 588448 - 588393
Alignment:
Q  700 ttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  588448 ttctctctgttacacattttggtcctttacgttagttttaattaaaaaatgttagg 588393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 2078859 - 2078717
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-t 709  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||  || ||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||  |    
T  2078859 aggttaaattgtatttttagtcccttaactatttaattaatatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctcttct 2078761  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  2078760 tacacattttagtcttttctgttagttttaattcaaacacgtta 2078717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 618 - 688
Target Start/End: Original strand, 7937648 - 7937719
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttatttt 688  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||| |||||    
T  7937648 aattgcatttttggttgcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgattcatttt 7937719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 618 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 13867045 - 13866970
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  13867045 aattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtc 13866970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 753
Target Start/End: Original strand, 21918496 - 21918637
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaac-ttctctctgt 709  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||  |||| |||| ||   ||||| || ||||  |    
T  21918496 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcactttggtccctaaattaaaatttgatttttttttgtatcttaactttatctc-ct 21918594  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21918595 tacacattttgatccttt-cgttagttttaattcaaaaacgtta 21918637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 707 - 754
Target Start/End: Original strand, 51311685 - 51311732
Alignment:
Q  707 tgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51311685 tgttacgcattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttag 51311732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 704 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 21169959 - 21169909
Alignment:
Q  704 ctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21169959 ctctgttacacattttggttctttccgttagttttaattcaaaaaagttag 21169909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 695 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 43527287 - 43527242
Alignment:
Q  695 ttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaat 741  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43527287 ttaacttctct-tgttacacattttggtcctttccgttagttttaat 43527242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 633 - 738
Target Start/End: Original strand, 51883880 - 51883985
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaac-ttctctctgttacacattttggtcatttccgt 731  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||  ||    
T  51883880 ccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtatcttaactttctct-tcttacacattttggtcttttatgt 51883978  T
Q  732 tagtttt 738  Q
    |||||||    
T  51883979 tagtttt 51883985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 696 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 41998126 - 41998062
Alignment:
Q  696 taacttctctctgttacacattttggtcatttcc-----gttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||    
T  41998126 taacttctctccattacacattttggtcatttccgttacgttagttttaattcaaaaacgttagg 41998062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 695 - 754
Target Start/End: Original strand, 7274726 - 7274785
Alignment:
Q  695 ttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  7274726 ttaacttctctccgttacagattttgttcatttccattagctttaattcaaaaacattag 7274785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 709 - 755
Target Start/End: Original strand, 2078580 - 2078626
Alignment:
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  2078580 ttacacattttggtcctttccattagttttgattcaaaaacgttagg 2078626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 684 - 733
Target Start/End: Original strand, 12991413 - 12991463
Alignment:
Q  684 attttggtcatttaactt-ctctctgttacacattttggtcatttccgtta 733  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12991413 attttggtctcttaactttctctctgttacacattttgatcatttccgtta 12991463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 618 - 739
Target Start/End: Original strand, 44316632 - 44316754
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||  |||||||| |||||||  |||||||| |  | || || |||||||||||||   |    
T  44316632 aattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttagtcccctaactaaaatttgatttatttggtcccttaaatttctctctgttactact 44316731  T
Q  717 tttggtcatttccgttagtttta 739  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||    
T  44316732 tttagtcctttccgttaatttta 44316754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 719
Target Start/End: Original strand, 54247277 - 54247378
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||  |||||||  |||| |||  | |||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||    
T  54247277 aattgcatttttatcccttaactatttaaatagtatcgctttggtccattgattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttccattacacatt 54247376  T
Q  718 tt 719  Q
    ||    
T  54247377 tt 54247378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Original strand, 24604874 - 24605017
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24604874 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctta-cttctctctgtt 24604972  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24604973 acacgttttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 24605017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Original strand, 33544821 - 33544965
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33544821 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctatctgtt 33544920  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33544921 acacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaaggttagg 33544965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Original strand, 31029523 - 31029667
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  31029523 aggttaaattgcatttttgatcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctgcgtt 31029622  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31029623 acacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttagg 31029667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 635 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 33545185 - 33545065
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33545185 ttaactatttaggtagtatcactttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgttacacattttggtcctttccgttag 33545086  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  33545085 ttttaattcaaaaacgttagg 33545065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 9173906 - 9174044
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9173906 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctttctgttacacat 9174005  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  9174006 tttggtcctttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 9174044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 35132606 - 35132744
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35132606 aattgcatttttggtccattaactatttaggtagtatcgctttggtcccataattaaaattagatttattttggtcctttaacttctctctgttgcacat 35132705  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  35132706 tttgatcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 35132744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Original strand, 3338482 - 3338618
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  3338482 aattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgttacacat 3338581  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3338582 tttgctcatttccgttagttttaattcaaaaacgtta 3338618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 616 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 24605256 - 24605117
Alignment:
Q  616 ttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacac 714  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  24605256 ttaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctctgttacac 24605157  T
Q  715 attttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24605156 atttt-gtcattttcgttagttttaattcaaaaacattagg 24605117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 25551723 - 25551579
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  25551723 aggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccctaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgtt 25551624  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25551623 acacatttaggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 25551579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 11525146 - 11525009
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||    
T  11525146 aattgcatttttggtcccttaacaatttaggtagtatcggtttggtcccttatttaaaattcaatttattttggtctcttaactttcct-tgttacacat 11525048  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11525047 tttggtcatttccgttagttttaattaaaaaacgttagg 11525009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 12903226 - 12903364
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||    
T  12903226 aattgtatttttggttctttaattatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttatctccattacacat 12903325  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12903326 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 12903364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 14336907 - 14337045
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  14336907 aattgcatttttgatcccttaattatttagctagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctttgttatacat 14337006  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14337007 tttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 14337045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 635 - 755
Target Start/End: Original strand, 33346501 - 33346621
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||     
T  33346501 ttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttgatcctttccgttaa 33346600  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  33346601 ttttaattcaaaaacgttagg 33346621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 618 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 19135827 - 19135692
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19135827 aattgcatttttggtccattaagtatttaggtagtatcgttttgatctcttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctccgttacacat 19135728  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtt 752  Q
     |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  19135727 gttggtcctttccattagttttaattaaaaaacgtt 19135692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 657 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 33972547 - 33972452
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtt 752  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33972547 tttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 33972452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 616 - 754
Target Start/End: Original strand, 1158591 - 1158732
Alignment:
Q  616 ttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacac 714  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  1158591 ttaattacatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacac 1158690  T
Q  715 attttggtcatttcc--gttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    || |||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  1158691 atgttggtcctttccgtgttagttttaattcaaaaacgttag 1158732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 6220421 - 6220299
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||   ||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6220421 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtccatcaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggtcctttccgtt 6220322  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  6220321 agttttaattcaaaaacgttagg 6220299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 29009959 - 29010097
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||| | |||||||    
T  29009959 aattgaatttttggtcccttaactatttacgtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgaattatttcggtcccttaacttctctccgctacacat 29010058  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29010059 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 29010097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 33329211 - 33329349
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  33329211 aattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctccccgttacacat 33329310  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  33329311 tttggtcctttctattagttttaattcaaaaacgttagg 33329349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 1860866 - 1860731
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||  |||||||||    
T  1860866 aattgcatttttggtcccttaactatttaggt-gtatctctttggtcccttaattaaaattcgatttatttgggttccttaacttctcttcgttacacat 1860768  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1860767 tttggtcatttccgttagtcttaattcaaaaacgtta 1860731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 14337282 - 14337146
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||  |||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||    
T  14337282 aattgcatttttatcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttagttaaaatttgatttattttggtcccttaaattctttccgttacacatt 14337183  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14337182 ttggtcttttccgttaattttaattcaaaaacgttag 14337146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 635 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 35119174 - 35119054
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||     
T  35119174 ttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaatttctctccgttacacattttggtcctttctgttaa 35119075  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  35119074 ttttaattcaaaaacgttagg 35119054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 3288935 - 3289073
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||  ||||||||    
T  3288935 aattgcatttatggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccctaacttctctccattacacat 3289034  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3289035 tttgatcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 3289073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 3289291 - 3289153
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaa-ctatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||| | || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  3289291 aattgcatttttggtccctaaactatttaggtaatatcgctttggtgccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacat 3289192  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3289191 tttggtgttttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 3289153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 624 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 3338850 - 3338720
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3338850 atttttggtcccttaactatttaagtagtatcgttttgatcccttaattaaaattcgatttattttggttctttaacttctatctgttacacattttggt 3338751  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |  || ||||||||||||| | |||| ||||||    
T  3338750 c--tttcgttagttttaattcgaaaaggttagg 3338720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 618 - 749
Target Start/End: Original strand, 25551352 - 25551484
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| ||||| |||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  25551352 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattgaaatttgatttattttagtcccttaacttttctctgttacacat 25551451  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaac 749  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25551452 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaac 25551484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Original strand, 2949292 - 2949434
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     |    
T  2949292 tttaggctaaattgcattttttgtccgttaactatttaagtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaactt-----t 2949386  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  2949387 gttacacattttggtcctttccagtagttttaattcaaaaacgttagg 2949434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 633 - 748
Target Start/End: Original strand, 11524786 - 11524901
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| |||    
T  11524786 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacctctctccgttacacattttagtcctttctgtt 11524885  T
Q  733 agttttaatacaaaaa 748  Q
     |||||||| ||||||    
T  11524886 ggttttaattcaaaaa 11524901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31029905 - 31029767
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||   |||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  31029905 aattgcatttttggtcccttaaccatttaaatagtattgttttagtcccttaactaaaattcgatttattttggtcctttatcttttctctgttacacat 31029806  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31029805 tttgatcatttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 31029767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 624 - 755
Target Start/End: Original strand, 13155850 - 13155982
Alignment:
Q  624 atttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||      
T  13155850 atttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcgcttaacttctttccgttacacattttgac 13155949  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  |||||||    
T  13155950 catttccgtttgttttaattcaaattcgttagg 13155982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 624 - 755
Target Start/End: Original strand, 13160706 - 13160838
Alignment:
Q  624 atttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||      
T  13160706 atttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcgcttaacttctttccgttacacattttgac 13160805  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  |||||||    
T  13160806 catttccgtttgttttaattcaaattcgttagg 13160838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 608 - 753
Target Start/End: Original strand, 6220051 - 6220197
Alignment:
Q  608 atttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctc 706  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||  |||  || | |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |    
T  6220051 atttagtttaaattgtatttttggtcccttaactatttaattaatatcgctttcgtctcttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctccc 6220150  T
Q  707 tgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  6220151 tgttacacattttggtcctttccgttagttttcattcaaaaacgtta 6220197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 625 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 24548615 - 24548485
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| |||  |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24548615 tttttggtcccttaactatttaattagtatcactttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctctgagttacacattttggtc 24548516  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24548515 cttttcgttagttttaattcaaaaacgttag 24548485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 13156220 - 13156082
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||     || |||| |||||||||||| |||||||||| ||  |||| || |||  ||||    
T  13156220 ggttaaattacattttttgtcccttaactatttaggtagtat-----tggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaatttttcttcgtta 13156126  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13156125 catattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 13156082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 613 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 13161076 - 13160938
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||     || |||| |||||||||||| |||||||||| ||  |||| || |||  ||||    
T  13161076 ggttaaattacattttttgtcccttaactatttaggtagtat-----tggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaatttttcttcgtta 13160982  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13160981 catattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 13160938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 607 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 1158981 - 1158837
Alignment:
Q  607 aatttaggtttaattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctct 705  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||| || | ||||||||||||  |||| || |||    
T  1158981 aatttaggctaacttgcatttttggtaccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaatttga-tttattttggtcccttaa-ttatct 1158884  T
Q  706 ctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtt 752  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1158883 ccgttatacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgtt 1158837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 7537970 - 7537848
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||| || |||||  |||  |||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  7537970 ccttaactatttaagtggtatcgcttttgtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccataacttctctcggttacacattttggtcctttctgtt 7537871  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    
T  7537870 agttttaattcaaaaacattagg 7537848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 2949632 - 2949534
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||| |||||||||    
T  2949632 tttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaacttctctctgttacacattttggtccttatggttagttttaattcaacaacgttagg 2949534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 625 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 2814685 - 2814560
Alignment:
Q  625 tttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| | |  |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |     
T  2814685 tttttggtctcttaactatttaattagtatcgctttggttctttaattaaaatttgatttattttggtttcttaacttctctctgttacacattttgatt 2814586  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaac 749  Q
     ||||||||||||||||| |||||||    
T  2814585 ctttccgttagttttaattcaaaaac 2814560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 624 - 727
Target Start/End: Original strand, 32283037 - 32283141
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  32283037 atttttggtcccttaactatttaattagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctctccgttacacattttgat 32283136  T
Q  723 cattt 727  Q
    |||||    
T  32283137 cattt 32283141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 618 - 692
Target Start/End: Original strand, 11524710 - 11524785
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11524710 aattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtc 11524785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 679 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 35132920 - 35132844
Alignment:
Q  679 aatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  35132920 aatttattttggtcccttaacttctctccgttatacattttggtcctttctattagttttaattcaaaaacgttagg 35132844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 12903569 - 12903455
Alignment:
Q  640 tatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagtttta 739  Q
    |||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| | |||||||| |   |||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12903569 tatttaggtagtatccctttggtcctttaattaaaattcgaattattttgattccttaacttctctccgtaatacattttagtcctttccgttagtttta 12903470  T
Q  740 atacaaaaacgttag 754  Q
    || |||||| |||||    
T  12903469 attcaaaaatgttag 12903455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 29010335 - 29010197
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  | || |||| ||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||  ||  ||||||||    
T  29010335 aattgcatttttggttccttgactatttatgtagtatcgctgtggtcccttaactaaaattcgatttattttggccccttaacttccatccattacacat 29010236  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||  ||| |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  29010235 tttggtccattctgttaattttaattcaaaaacattagg 29010197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 634 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 29999767 - 29999653
Alignment:
Q  634 cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtta 733  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||  |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  29999767 cttaactatttaattagtatcgctttagtcccgtaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctatctgttacacattttagtcctttctgtta 29999668  T
Q  734 gttttaatacaaaaa 748  Q
     ||||||| ||||||    
T  29999667 cttttaattcaaaaa 29999653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 694 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 33329510 - 33329449
Alignment:
Q  694 tttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33329510 tttaacttctctctgttgcacattttgatcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 33329449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 700 - 752
Target Start/End: Original strand, 33972292 - 33972344
Alignment:
Q  700 ttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtt 752  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33972292 ttctctctgttacacattttagtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 33972344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 634 - 752
Target Start/End: Original strand, 2315601 - 2315719
Alignment:
Q  634 cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||| || | |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  2315601 cttaactatttaattagtatcgctttggtcgcttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctctccttacatattttggtcctttccgtt 2315699  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgtt 752  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  2315700 agttttaattcaaaaacgtt 2315719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 24548246 - 24548383
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg-ttacaca 715  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||    || || ||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||  |||||||    
T  24548246 aattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcgcttttgagccttagttaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tctctccttacaca 24548344  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24548345 ttttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttag 24548383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 667 - 753
Target Start/End: Original strand, 31754259 - 31754345
Alignment:
Q  667 taattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31754259 taattaaaattctatttattttaatctcttaacttctctccgttacttattttggacctttccattagttttaattcaaaaacgtta 31754345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 618 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 17245705 - 17245582
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggt-catttaacttctctctgttacaca 715  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||       
T  17245705 aattgcatttttggtcccttaattatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactac 17245606  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagtttta 739  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||    
T  17245605 ttttagtcttttccgttaatttta 17245582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 612 - 677
Target Start/End: Original strand, 33971927 - 33971993
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaatt 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||    
T  33971927 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgtttttatcccttaattaaaatt 33971993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 17544840 - 17544696
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggt-catttaacttctctctgt 709  Q
    |||||| |||||||||||||  || ||||||||| | || ||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   || |  |||| || ||    
T  17544840 taggttaaattgcatttttgtcccgtaactattttgctaatatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttgattttctatc-gt 17544742  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  17544741 tacatattttgatcctttctgttagttttaattcaaaaacattagg 17544696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 703 - 753
Target Start/End: Original strand, 12260538 - 12260588
Alignment:
Q  703 tctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12260538 tctctgttacatgttttggtcccttccgttagttttaataaaaaaacgtta 12260588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 709 - 755
Target Start/End: Original strand, 29999510 - 29999556
Alignment:
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  29999510 ttacatattttggtcattttcgttagttttaattaaaaaacgttagg 29999556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 606 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 4711 - 4561
Alignment:
Q  606 aaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctc 704  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||    
T  4711 aaatttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctc 4612  T
Q  705 tctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4611 tctgtcacagattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 4561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 603 - 755
Target Start/End: Original strand, 4328 - 4481
Alignment:
Q  603 ataaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt 701  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | || ||||| |||||  |||||||||||||  |||||||    
T  4328 ataaatttaaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtactatcactttggttccttaattgaaatttgatttattttggtctcttaactt 4427  T
Q  702 ctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4428 cactccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 4481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 11579 - 11457
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11579 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggtcctttccatt 11480  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  11479 agttttaattcaaaaacgttagg 11457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 11234 - 11356
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||||||||||   |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11234 ccttaactatttaggtagtattgctttcgtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggtcctttccgtt 11333  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  11334 agttttaattcaaaaacgttagg 11356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 47250927 - 47250789
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||    
T  47250927 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacatat 47250828  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  47250827 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttagg 47250789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 603 - 755
Target Start/End: Original strand, 31715623 - 31715776
Alignment:
Q  603 ataaaatttaggtttaattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt 701  Q
    ||||||| |||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  31715623 ataaaatgtaggctaaattgtattttttgtctcttaactatttaggtagtatcgctttgaccccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 31715722  T
Q  702 ctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31715723 ttctctgttacagattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 31715776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 10625465 - 10625329
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10625465 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 10625366  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10625365 tttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgtta 10625329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 18731024 - 18731161
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||    
T  18731024 aattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttatcttcgttacacat 18731123  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18731124 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 18731161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 31716002 - 31715866
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  31716002 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctataacttctctccgttacacat 31715903  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31715902 tttggtcattt-cgttagttttaattcaaaaacgttag 31715866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 8769663 - 8769527
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  8769663 aattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacatctctctgttacacat 8769564  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8769563 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtta 8769527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 624 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 9231052 - 9230922
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9231052 atttttggtcccttaacgatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaagatttgatttattttggtcacttaacttctctctgttacacattttggt 9230953  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9230952 cctttccgttagttttaattcaaaaacgtta 9230922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 23437157 - 23437295
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||    
T  23437157 aattgcatttttgattccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacctctctcggttacatat 23437256  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23437257 tttggtcctttccattagttttaattcaaaaacgttagg 23437295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 23472937 - 23472799
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  23472937 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtttcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttattacacat 23472838  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23472837 tttggtcttttccgttagttttaatttaaaaacgttagg 23472799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 620 - 754
Target Start/End: Original strand, 47250565 - 47250699
Alignment:
Q  620 ttgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatttt 719  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||| |||||    
T  47250565 ttgcatttttgtcccttaattatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctccccattacatatttt 47250664  T
Q  720 ggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47250665 ggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 47250699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Original strand, 5238456 - 5238592
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  5238456 aattgcatttttgatccattaactgtttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaagttctctctgttacacat 5238555  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5238556 tttagtcctttccgttagttttacttcaaaaacgtta 5238592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 608 - 755
Target Start/End: Original strand, 8769277 - 8769425
Alignment:
Q  608 atttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctc 706  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||  ||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  8769277 atttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtccctgaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctc 8769376  T
Q  707 tgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8769377 cgttacacattttggtcctttccgttagatttaattcaaaaacgttagg 8769425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 608 - 755
Target Start/End: Original strand, 35085734 - 35085882
Alignment:
Q  608 atttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctc 706  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||     
T  35085734 atttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctt 35085833  T
Q  707 tgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  35085834 tgttacacattttgatcctttcagttagttttaattcaaaaatgttagg 35085882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 640 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 34568942 - 34568827
Alignment:
Q  640 tatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagtttta 739  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34568942 tatttatgtagtatcactttgatcccttaattaaaatttgatttatttttgtcccttaacttctctctgttatacattttggtcatttccgttagtttta 34568843  T
Q  740 atacaaaaacgttagg 755  Q
    || |||||||||||||    
T  34568842 attcaaaaacgttagg 34568827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 11679083 - 11678961
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  11679083 aattgtatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcctttaacttctatctgttacacat 11678984  T
Q  717 tttggtcatttccgttagtttta 739  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11678983 tttggtcatttccgttagtttta 11678961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 41758700 - 41758822
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41758700 ccttaactatttaaatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctccgttacacattttggtcatttccgtt 41758799  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||| ||||||    
T  41758800 agttttaattcaaaaatgttagg 41758822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 43726623 - 43726486
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||  | || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  43726623 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtggtattgttttagttccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctattacacat 43726524  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43726523 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttag 43726486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 47251277 - 47251142
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  47251277 aattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtattgctttggtctcttaattaaaatttaatttattttggtcccttaacttttctc-gttacacat 47251179  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47251178 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtta 47251142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 11678708 - 11678846
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||    
T  11678708 aattgcatttttggtcctttaaatatttagataatatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgttatacat 11678807  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11678808 tttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 11678846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 619 - 755
Target Start/End: Original strand, 21522226 - 21522361
Alignment:
Q  619 attgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  21522226 attgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattc--tttattttggtctcttaacttctctctgttacatatt 21522323  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  21522324 ttggtcttttctgttaattttaattcaaaaacgttagg 21522361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 613 - 754
Target Start/End: Original strand, 39118010 - 39118152
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |    |||||||| |||||||    
T  39118010 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttgatcccttaattaaatttcgatttattttgattccctaacttctatctgtta 39118109  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  39118110 cacattttggtcatttctgttaattttaattcaaaaacgttag 39118152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 23472598 - 23472735
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  23472598 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcttttaattaaaattcgattcattttggttctttaacttctctccgttacatat 23472697  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23472698 tttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttag 23472735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 633 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 2357420 - 2357300
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  2357420 ccttaactatttaggtagtatcgttttgggcccttaactaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggtcctttttgtt 2357321  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  2357320 agttttaattcaaaaatgtta 2357300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 21522603 - 21522461
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  21522603 aggttaaattgtgtttttggtcccttaactatttaggtagcatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctt-aacttctctccgtt 21522505  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21522504 a-acattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 21522461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 633 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 26920282 - 26920162
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||| |||||| ||| |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26920282 ccttatctatttcggttgtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacattttggtcatttccatt 26920183  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  26920182 agttttaattcaaaaacgtta 26920162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 35086121 - 35085985
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||  ||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  35086121 aattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattgtggtcccttaacttctctttgttacatat 35086022  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35086021 tttggacctttccgttagttttaattcaaaaacgtta 35085985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 612 - 747
Target Start/End: Original strand, 43140697 - 43140833
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  43140697 aggttaaattgcatttttagtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaactcctctctgtt 43140796  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaa 747  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43140797 acatattttggtcatttctgttagttttaattcaaaa 43140833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 2357072 - 2357210
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||    
T  2357072 aattgcatttttgatctcttaactatttaaatagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctccattacacat 2357171  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2357172 tttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 2357210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Original strand, 9230721 - 9230819
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9230721 tttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttgatcatttccgttaattttaattcaaaaacgttagg 9230819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 34568588 - 34568726
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||    
T  34568588 aattgtattttttgtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctcttcgttacacat 34568687  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34568688 tttggtccttttcgttagttttaattcaaaaatgttagg 34568726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 9034696 - 9034559
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  9034696 aattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttccctctgttacagat 9034597  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  9034596 tttggtccttttcgttagttttaaatcaaaaacgttag 9034559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 44486313 - 44486176
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  44486313 aattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaatatttaatttattttggtcccttaatttctctctgttacatat 44486214  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  44486213 tttggtcctttctgttagtttaaattccaaaacgttag 44486176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Original strand, 32706728 - 32706875
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||   ||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||     
T  32706728 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgtttttgacccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttctctca 32706827  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32706828 attacacattttagtcctttccgttagttctaattcaaaaacgttagg 32706875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 625 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 36507183 - 36507052
Alignment:
Q  625 tttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36507183 tttttggtctcttaactatttaattagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttatttcggtatcttaacttctttctgttacacattttggtc 36507084  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  36507083 atttctgttagttttaattcaaaaacattagg 36507052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 24119719 - 24119857
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||||||| |||||| ||    
T  24119719 aattacatttttggtttcttaactatttagatagtatcactttggtctcttaattaaaatttgatttcttttgatcccttaacttctctccgttacaaat 24119818  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24119819 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacattagg 24119857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 44448293 - 44448155
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  44448293 aattggatttttagtcctttaattatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtcccttaacttttctctgttacacat 44448194  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  44448193 tttggtcctttatgttagttttaattcaaaaatgttagg 44448155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 44485713 - 44485575
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  44485713 aattgcatttttggtcctttaactatttaagtattatcgctttggtcctttaattaatattcaatttattttgatcccttaacttctctccgttacacat 44485614  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  44485613 tttggtcctttccgttagtttaaattccaaaacattagg 44485575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 44447919 - 44448055
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  44447919 aattgcatttttggtccgttaactatttagatagtattgttttggtcct-taattaaaatttgatttattttggtcccttaacttttctcttttacacat 44448017  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44448018 tttggccatttctgttagttttaattcaaaaacgttag 44448055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 635 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 473543 - 473423
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  473543 ttaactatttaggtagtatcgctttggtcttttaattaaaatttgatttattttcgtcccttaacttctctcaattacacattttggtcctttccgttag 473444  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  473443 ttttaattcaaaaacgttagg 473423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 632 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 38842387 - 38842266
Alignment:
Q  632 tccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgt 731  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  38842387 tccttaactatttaggtagcatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtc-tctaacttctacccgttacacatattggtcatttctgt 38842289  T
Q  732 tagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  38842288 tagttttaattcaaaaacgttag 38842266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 600 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 32707130 - 32706975
Alignment:
Q  600 ttaataaaatttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaa 698  Q
    ||||||||  ||||| | ||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||  ||||    
T  32707130 ttaataaatgttaggctaaattgtatttttagtcccttaattatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaactcgatttcttttggtccattaa 32707031  T
Q  699 cttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  32707030 cttctctctgttacatattttggtcctttctgtt-gttttaattcaaaaacgttagg 32706975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 635 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 47305490 - 47305370
Alignment:
Q  635 ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 734  Q
    |||||||||||  |||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47305490 ttaactatttaattagtatcgttttgctcccttaattaaaatttaatttattttggtatcttaacttcactccattacacattttggtcatttccattag 47305391  T
Q  735 ttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  47305390 ttttaattcaaaaatgttagg 47305370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 625 - 754
Target Start/End: Original strand, 22338284 - 22338415
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctctgttacacattttggt 722  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||   |||| | || |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22338284 tttttggtcccttaactatttaattagtattgctttggtaccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctatctgttacacattttggt 22338383  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22338384 catttccgttagttttaattcaaaaacgttag 22338415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 632 - 755
Target Start/End: Original strand, 38842053 - 38842174
Alignment:
Q  632 tccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgt 731  Q
    ||||||||||||| | || | ||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  38842053 tccttaactattttgataatgtcattttg-tcccttaattaaaattcgatttattttgatcctt-aacttctctctgttacacattttggtcctttctgt 38842150  T
Q  732 tagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    || ||||||| |||||||||||||    
T  38842151 taattttaattcaaaaacgttagg 38842174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 625 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 28349754 - 28349625
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28349754 tttttggtcccttaactatttaattagtattgttttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtatcttaacttttctct-ttacacattttggtc 28349656  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28349655 cttttcgttagttttaattcaaaaacgttag 28349625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 473197 - 473331
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  473197 aattgcatttttgatcgcttaactatttaggcagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggttccttaacttttctctgttacacat 473296  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |   ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  473297 t---gtcctttcctttagttttaagtcaaaaacgttag 473331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 655 - 753
Target Start/End: Original strand, 47250940 - 47251038
Alignment:
Q  655 aatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttct-ctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47250940 aatttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcccccgttacacattttggtcctttccgttagttttaat-caaaaacgtta 47251038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 611 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 37144151 - 37144006
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaa-cttctctctg 708  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||  |||||||      
T  37144151 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaattttctctc-c 37144053  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  37144052 ttacacattttgatcatttccgttagttttaatttaaatacgttagg 37144006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Original strand, 48703854 - 48703952
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  || |  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48703854 tttgatcacttaattaaaattcgatttattttggtttttaattttctctctgttacaacttttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 48703952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 624 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 48704183 - 48704105
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt 701  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48704183 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcctttaactt 48704105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 625 - 749
Target Start/End: Original strand, 37143776 - 37143900
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37143776 tttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattt-ggtatcttaacttttctctgttacacattttgatc 37143874  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaac 749  Q
     ||||||||||||||||| |||||||    
T  37143875 ctttccgttagttttaattcaaaaac 37143900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 47305132 - 47305270
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttc-tctctgttacaca 715  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||  ||||  |||||||    
T  47305132 aattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttatctcc-ttacaca 47305230  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  47305231 ttttgatcatttccgttagttttaattcaaagacgttagg 47305270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 23437493 - 23437395
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23437493 tttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcgtaacttatctttgttacacattttggtccttcccgttagttttaattcaaaaatgttagg 23437395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31623805 - 31623667
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||  ||||  |||  || |||||||  |||||||||||||   |||||| |||| |||||||||    
T  31623805 aattgcatttttagtaccttaattattcaggtagtatcgttttggaccctcaagtaaaatttgatttattttggtcccataacttttctccgttacacat 31623706  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  31623705 tttggtcctttcgattagttttaattcaaaaacgttagg 31623667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 608 - 753
Target Start/End: Original strand, 43726239 - 43726383
Alignment:
Q  608 atttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctc 706  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||||||  |||||||| | || || ||||||||||    
T  43726239 atttaggttaaattgtatttttggtcccttaattatttaagtagtctcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatttggttcctt-aacttctctc 43726337  T
Q  707 tgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||| ||||    
T  43726338 tgttacacattttgatc-ttttcattagttttaattcaaaaatgtta 43726383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 709 - 755
Target Start/End: Original strand, 10625180 - 10625226
Alignment:
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10625180 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 10625226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 15326866 - 15326998
Alignment:
Q  607 aatttaggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctct 705  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||  || |||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||    
T  15326866 aatttaggctaaattgcatttttagttttttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt-tct 15326964  T
Q  706 ctg-ttacacattttggtcatttccgttagtttt 738  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15326965 ctccttacacattttggtcctttccgttagtttt 15326998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 755
Target Start/End: Original strand, 38676126 - 38676201
Alignment:
Q  680 atttattttggtcatttaactt-ctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  38676126 atttattttggtctcttaactttctctctgttacacgttttggtcatttccgttaaatttaat-taaaaacgttagg 38676201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 618 - 687
Target Start/End: Original strand, 10625111 - 10625181
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattt 687  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  10625111 aattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgtgttggtcccttaactaaaattcgatttattt 10625181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 703 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 17279408 - 17279358
Alignment:
Q  703 tctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17279408 tctctattacatgttttggtcatttccgttagttttaatcaaaaaacgtta 17279358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 625 - 737
Target Start/End: Original strand, 43050396 - 43050510
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctctgttacacattttggt 722  Q
    |||||||||| |||||||||||  || |||   |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||  |||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  43050396 tttttggtcccttaactatttaattaatattggtttggtcccctaattaaaaattgatttattttggtcccttaaatttctctttgttacatattttggt 43050495  T
Q  723 catttccgttagttt 737  Q
      |||||||||||||    
T  43050496 gctttccgttagttt 43050510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 76)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 7210826 - 7210688
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  7210826 aattgcattcttggtcacttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcttttaacttctttatgttacacat 7210727  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7210726 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 7210688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 9692924 - 9693061
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||    
T  9692924 aattgtatttttggtccctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttgacttctctccgttacacatt 9693023  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9693024 ttggtcatttccgttagttttaattcaataacgttagg 9693061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 9693299 - 9693168
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9693299 aattgcatttttggtcccttaacgatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaaatcgatttatattggtcccttaacttctctctgttacacat 9693200  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9693199 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 9693168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 7399082 - 7399220
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  7399082 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacat 7399181  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7399182 tttggtccttttcgttatttttaattcaaaaacgttagg 7399220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 605 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 40589448 - 40589298
Alignment:
Q  605 aaaatttaggtttaattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttct 703  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40589448 aaaatttaggctaaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttct 40589349  T
Q  704 ctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  40589348 ctccgttacatattctggtcctttccattagttttaattcaaaaatgttag 40589298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 605 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 40590051 - 40589901
Alignment:
Q  605 aaaatttaggtttaattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttct 703  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40590051 aaaatttaggctaaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttct 40589952  T
Q  704 ctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  40589951 ctccgttacatattctggtcctttccattagttttaattcaaaaatgttag 40589901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 624 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 28392145 - 28392012
Alignment:
Q  624 atttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaac-ttctctctgttacacattttgg 721  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28392145 atttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaaccttctctccgttacacattttgg 28392046  T
Q  722 tcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28392045 tcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 28392012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 31908933 - 31909073
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggt-ccttaactat--ttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacac 714  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||    
T  31908933 aattgtatttttggtgccttaactatatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctctattgcac 31909032  T
Q  715 attttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31909033 attttggtcatttccgttagtttcaattcaaaaacgttagg 31909073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 40589059 - 40589196
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||    
T  40589059 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtttcactttggtctccaaattaaaattcgatttattttggtcccttgacttctctttgttacacat 40589158  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40589159 tttggtcatttctgttagttttaattcaaaaacgttag 40589196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 40589662 - 40589799
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||    
T  40589662 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtttcactttggtctccaaattaaaattcgatttattttggtcccttgacttctctttgttacacat 40589761  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40589762 tttggtcatttctgttagttttaattcaaaaacgttag 40589799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 617 - 755
Target Start/End: Original strand, 7210460 - 7210599
Alignment:
Q  617 taattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacaca 715  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||| |||| | |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7210460 taattgcatttttggtcccttaaatatttaggtactatcgttttggtcccttgattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacaca 7210559  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7210560 ttttgatcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 7210599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 12593846 - 12593699
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  12593846 tttaggttaaattacatttttagtcctttaactatttaggtagtattgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctct 12593747  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12593746 gttacacattttggtcctttccgttagttttaatttaaaaacgttagg 12593699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 625 - 755
Target Start/End: Original strand, 31656370 - 31656501
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31656370 tttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcctttaacttctctctgatacacattttggtc 31656469  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  31656470 atttccattagttttaattcaaaaacattagg 31656501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 41860066 - 41859920
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtc-cttaactatttaggta--gtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg 708  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  41860066 aggttaaattgcatttttggtctcttaactatttaggtatagtatcactttggtcccttaattaaaattcaatttattttgatcccttaacttctttctg 41859967  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  41859966 ttacacattttggtcctttccgttagtattaattcaaaaaggttagg 41859920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 15267621 - 15267483
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15267621 aattgcatttttgatcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctccgttacacat 15267522  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15267521 tttggtcctttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 15267483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 609 - 754
Target Start/End: Original strand, 18514284 - 18514430
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| || | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  18514284 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggaagtatccctttggtcgcttagttaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctat 18514383  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18514384 gttacacattttggtcgtttccattagttttaattcaaaaacgttag 18514430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 35263875 - 35263737
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  35263875 aattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatgactttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtccattaaattctctttgttacacat 35263776  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35263775 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 35263737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 36751907 - 36752045
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  36751907 aattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtcccttaacttctctctgttaaacat 36752006  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36752007 tttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 36752045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 33699280 - 33699417
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33699280 aattgcatttatggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaattcggtttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 33699379  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33699380 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 33699417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 25923499 - 25923364
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||    
T  25923499 aattgcatttttggttcaaaactatttatgtagtattgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaatttctctccgttacatatt 25923400  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25923399 ttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtta 25923364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 39706432 - 39706297
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  39706432 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattcttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacat 39706333  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtt 752  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  39706332 tttggtcatttttgttagtttcaattcaaaaacgtt 39706297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 334301 - 334439
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  334301 aattgcatttttagtcctttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctcctttacacat 334400  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  334401 tttggtccttcccattagttttaattcaaaaacgttagg 334439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 3878486 - 3878624
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  3878486 aattgtatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcgtttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctctattgcacat 3878585  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3878586 tttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 3878624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 5087812 - 5087950
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||    
T  5087812 aattgaatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcaatttattttggttccttaacttcttcccgttacacat 5087911  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5087912 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 5087950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 10656099 - 10656237
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||  |||||||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  10656099 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttgctcctttaacttatctccgttacacat 10656198  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10656199 tttggtcatttcggttagttttaattcaaaaacgttagg 10656237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 12695067 - 12694929
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||    
T  12695067 aattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttccattacacat 12694968  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12694967 tttggttatttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 12694929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 35263499 - 35263637
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  35263499 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctttgttacatat 35263598  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  35263599 tttggtcctttccgttaattttaattaaaaaacattagg 35263637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 609 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 15476648 - 15476503
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg 708  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||  |    
T  15476648 tttaggttaaattgcattttagtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaacttctcttcg 15476549  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15476548 ttacacattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaatgttag 15476503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 42710731 - 42710594
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||    
T  42710731 aattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctttgttataaat 42710632  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42710631 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttag 42710594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 19205330 - 19205186
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  19205330 aggttaaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttgaccccttaacttctctccgtt 19205231  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19205230 acacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaactttagg 19205186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 618 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 5088509 - 5088386
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  5088509 aattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctttttgttacacat 5088410  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaa 740  Q
    ||||||| |||| |||||||||||    
T  5088409 tttggtcctttctgttagttttaa 5088386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 618 - 748
Target Start/End: Original strand, 8418206 - 8418336
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| || | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  8418206 aattgcatttttggtccattaattatttaggtagtatcgttttggtcacttaattaaaattcgatttattttggttctt-aacttctctctgttacacat 8418304  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8418305 ttttgtcatttccgttagttttaattcaaaaa 8418336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 16353535 - 16353397
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  16353535 aattgcatttttgatcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccctaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgttacacat 16353436  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  16353435 tttggtcctttttgttagttttaattaaaaaacgttagg 16353397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31656739 - 31656601
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  31656739 aattacatttttggtcccttaacttattaggcagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccataacttctctctgttacacat 31656640  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31656639 tttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 31656601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 638 - 755
Target Start/End: Original strand, 16353180 - 16353297
Alignment:
Q  638 actatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttt 737  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16353180 actatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttttctatgttactcatttcggtcatttccgttagttt 16353279  T
Q  738 taatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||||||||||||    
T  16353280 taattcaaaaacgttagg 16353297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 609 - 748
Target Start/End: Original strand, 38416139 - 38416279
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||| | ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||     
T  38416139 tttaggctaaattgcatttttaatctcttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttgttttcttaacttctctcg 38416238  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38416239 gttacacattttgatcatttccgttagttttaattcaaaaa 38416279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 5624384 - 5624522
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||   ||    
T  5624384 aattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttatcaat 5624483  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5624484 tttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttagg 5624522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 7399443 - 7399321
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7399443 ccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggtcctttccgtt 7399344  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| || |||| | ||||||    
T  7399343 agtttttattcaaacaagttagg 7399321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 10656475 - 10656337
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  10656475 aattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaagtaaaatttgatttattttagtcccttaacttctctctgttacacat 10656376  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  10656375 tttggtcctttttgttagttttaattcaaaaacgttagg 10656337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 32272221 - 32272083
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||    
T  32272221 aattgcatttttggtctcttaactatttagataatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctatgttatatat 32272122  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  32272121 tttgttcattttcgttagttttaatttaaaaacgttagg 32272083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 38416515 - 38416377
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| || | |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| || |||||||||    
T  38416515 aattgtatttttggtctcttaattatttaggtagtatcgctttgctcacttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttctttccgttacacat 38416416  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38416415 tttgatcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 38416377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 633 - 754
Target Start/End: Original strand, 40774359 - 40774479
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||||||||||   |||  |||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40774359 ccttaactatttaggtagtattgttttagtcccttaattaaaat-cgatttattttggtcccttaacttctctctcttacacattttggtcatttccgtt 40774457  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||| ||||||| ||||    
T  40774458 agttttaattcaaaaacattag 40774479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 29023942 - 29024077
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| ||||   ||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  29023942 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgattt---ttggtcccttaatttctctctgttacatat 29024038  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  29024039 tttggtcatttccgttaattttaattcaaaaatgttagg 29024077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 625 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 5152989 - 5152858
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5152989 tttttggtcccttaactatttatttagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaatttctctttgttacacattttggtc 5152890  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5152889 atttccgttggttttaattcaaaaacgttagg 5152858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 624 - 754
Target Start/End: Original strand, 26289031 - 26289162
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| ||    
T  26289031 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttcgtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttctatatgtcacacattttcgt 26289130  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26289131 cctttccgttagttttaatttaaaaacgttag 26289162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 625 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 41372532 - 41372401
Alignment:
Q  625 tttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtc 723  Q
    |||||||||| |||||||||||  || ||||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41372532 tttttggtcccttaactatttaattaatatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctctctattacacattttggtc 41372433  T
Q  724 atttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41372432 attttcgttagttttaattcaaaaacgttagg 41372401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 25923139 - 25923261
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||   |||||| |||    
T  25923139 ccttaactatttaggtagtatcggtttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctccgttatacatttttaccatttctgtt 25923238  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  25923239 agttttaattcaaaaacgttagg 25923261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 12593461 - 12593598
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||   |||| ||| |||||||| |||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  12593461 aattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgcttcagtcccttaactaaaattcgatttatattggttccttaacttctttctgttacacat 12593560  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  12593561 tttggtcatttcctttagttttaagtcaaaaacgttag 12593598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 8418565 - 8418441
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  8418565 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccgttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttttctctgttatacat 8418466  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaat 741  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||    
T  8418465 tttggttctttctgttagttttaat 8418441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 14143886 - 14143762
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| || | | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14143886 aattgcatttttggtcctttaactatttaagtagtattactttggtctcttcattaaaatttaatttattttggtctcttaacttctctctgttacacat 14143787  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaat 741  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||    
T  14143786 tttggtcacttttgttaattttaat 14143762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 624 - 723
Target Start/End: Original strand, 15476277 - 15476377
Alignment:
Q  624 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15476277 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattttatttattttggtctcttaacttctctccgttacacattttggt 15476376  T
Q  723 c 723  Q
    |    
T  15476377 c 15476377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31909317 - 31909173
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||  |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||| ||    
T  31909317 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgttttcgtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctatctttt 31909218  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  31909217 acatattttggtcattttcgttaattttaattaaaaaatgttagg 31909173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 33763288 - 33763153
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| | || |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  33763288 aattgcatttttggtcccttaactatttag-tagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttatttcggtcccttaacttctctccgttacacat 33763190  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  33763189 tttgtacatttcctttggttttaattcaaaaacgtta 33763153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 19204949 - 19205086
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  ||   ||     | || |||||||||||| |||||||    
T  19204949 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatggcttaaatacctt-aacttctctctggtacacat 19205047  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19205048 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 19205086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 633 - 755
Target Start/End: Original strand, 33762923 - 33763048
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaa-ttaaaattcaatttattttggtcattta--acttctctctgttacacattttggtcatttcc 729  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33762923 ccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaaattaaaattcgatttattttgatcccttataacttctctctgttacatattttggtcatttcc 33763022  T
Q  730 gttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||    
T  33763023 gttagttttaattcaaaaatgttagg 33763048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 40774718 - 40774580
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||  |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||  || ||||||    
T  40774718 aattgcatttttgattccttaattatttagctagtatcgctttagtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttatttctctacgtcacacat 40774619  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40774618 tttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttagg 40774580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 39706060 - 39706194
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||    |  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||    
T  39706060 aattgcatttttggtctcttaactatttatgta----cgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctcagttagatat 39706155  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39706156 tttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 39706194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 605 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 17861424 - 17861281
Alignment:
Q  605 aaaatttaggtttaattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctc 704  Q
    |||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||      |||||||||||| | |||||||||    
T  17861424 aaaaattaggctaaattgtatttttggtccctaattatttaggtagtatcactttggtcct-taattaaa------tttattttggtcctgtaacttctc 17861332  T
Q  705 tctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  17861331 tccgttacacattttggtccttttcgttggttttaattcaaaaacgttagg 17861281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 28391773 - 28391912
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaac-ttctctctgttacaca 715  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||  |||||||    
T  28391773 aattgcatttttggtcccttaactatttaggcagtattactttggtcccttaattaaagttcgatttattttgatcccttaactttctctccattacaca 28391872  T
Q  716 ttttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  28391873 ttttggtccttttagttagttttaattcaaaaatgttagg 28391912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 624 - 753
Target Start/End: Original strand, 17861050 - 17861179
Alignment:
Q  624 atttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggt 722  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  | |||||||||||||    
T  17861050 atttttggtcctttaactatttaggtaatgttgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctt-aacttctcttcggtacacattttggt 17861148  T
Q  723 catttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17861149 ccattccgttagttttaattcaaaaacgtta 17861179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 610 - 746
Target Start/End: Original strand, 15267239 - 15267375
Alignment:
Q  610 ttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctg 708  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||  |||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||      
T  15267239 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatt-aggtagtatcgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttggccccttaacttctctcaa 15267337  T
Q  709 ttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaa 746  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  15267338 ttacacattttgctcatttctattagttttaattcaaa 15267375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Original strand, 14051885 - 14052032
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctct 707  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||   |||| |    |||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||     
T  14051885 tttaggttaaattgtatttttggtctcttaactatttaggtaatattgttttggttttttaattaaaattcgatttattttggttcctgaacttttctcc 14051984  T
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  14051985 gttacacattttggtcctttcaattagttttaattcaaaaacgttagg 14052032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 612 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 15670538 - 15670395
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtt 710  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |    |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  15670538 aggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggttatttaattaaaattttatttattttggtcccttaacttctctgcatt 15670439  T
Q  711 acacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  15670438 acacatgttggtcctttcgattagttttaattcaaaaacgttag 15670395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 633 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 17736612 - 17736521
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtca 724  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17736612 ccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaattaaaattcgatttattttggtctcttaaattctctctgttacacatgttggtca 17736521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 618 - 748
Target Start/End: Original strand, 42710355 - 42710486
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||  |||  | |  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  42710355 aattgcatttttagtcatttaactatttcggtagtatcgctttagttctttaattaaaattcgatttattttggtccattaacttctctatgttacacat 42710454  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaa 748  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  42710455 tttggtcctttatgttagttttaattcaaaaa 42710486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 36752282 - 36752145
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  36752282 aattgcatttttggtcccttaactatttatgtagtatcgcttcaatcct-taattaaaattcgatttattttggtccattaacttctctttgttgcacat 36752184  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||  ||||| ||||||    
T  36752183 tttggtccttttcattggttttaatttaaaaaagttagg 36752145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 608 - 703
Target Start/End: Original strand, 21750805 - 21750901
Alignment:
Q  608 atttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttct 703  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  21750805 atttaggctaaattgcctttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttct 21750901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 633 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 43570136 - 43570016
Alignment:
Q  633 ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 732  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||| |||| |||||||||||  ||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||    
T  43570136 ccttaactatttagatagcatcgctttgttcccttaattaaaatttgatttattttgtcccattaacttctctccgttacacattttgatcatttcgatt 43570037  T
Q  733 agttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  43570036 agttttgattcaaaaacgtta 43570016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 695 - 755
Target Start/End: Original strand, 14143591 - 14143651
Alignment:
Q  695 ttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14143591 ttaacttctctccgttacacattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacattagg 14143651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 601 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 26289418 - 26289263
Alignment:
Q  601 taataaaatttaggtttaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaac 699  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||    
T  26289418 taataaaattaaggctagattgcatttttggtcctttaactatttaaatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgattcattttgatc-cttaac 26289320  T
Q  700 ttctctctgttacacattttggtcatttccgttag-ttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||  || |||||||| ||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  26289319 ttctctccattgcacatttttgtccttttcgttggtttttaattcaaaaacgttagg 26289263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 2597402 - 2597327
Alignment:
Q  680 atttattttggtcatttaactt-ctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  2597402 atttattttggtcctttaactttctctttgttacacgttttggtcatttccgttaaatttaat-taaaaacgttagg 2597327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 704 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 5624672 - 5624622
Alignment:
Q  704 ctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  5624672 ctctgttacacattttggttctttccgttagttttaattcaaaaaagttag 5624622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 618 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 3879393 - 3879305
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctct 705  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| | |  || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  3879393 aattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatgactttggttcattatttaaaatttgatttattttggtctcttaacttctct 3879305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 688
Target Start/End: Original strand, 5460193 - 5460264
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttatttt 688  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  5460193 aattgtatttttggtcccttaactatttagacagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttatttt 5460264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 611 - 656
Target Start/End: Original strand, 19615420 - 19615466
Alignment:
Q  611 taggtttaattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaa 656  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19615420 taggttaaattgcatttttggtcccttgactatttaggtagtatcaa 19615466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 601 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20266473 - 20266439
Alignment:
Q  601 taataaaatttaggtttaattgcatttttggtcct 635  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20266473 taataaaatttaggtttaattgcacttttggtcct 20266439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 83; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 11868 - 11730
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||    
T  11868 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttatatat 11769  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11768 tttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 11730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Original strand, 11493 - 11630
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||| ||| || ||    
T  11493 aattgcatttttggtcccttaactatttagaaagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttctctccgttgcatat 11592  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  11593 tttggtctttttcgttagttttaatttaaaaacgttag 11630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 13547 - 13684
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   |||| |||| || ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13547 aattgcatttttggtccttaactatttagttagaattgctttggtcccttagttaaaatccgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacatt 13646  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13647 ttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttagg 13684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 613 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 13927 - 13787
Alignment:
Q  613 ggtttaattgcatttttggtcct-taactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgtta 711  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13927 ggttaaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgtta 13828  T
Q  712 cacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtt 752  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  13827 cacattttggttatttccgttgattttaattcaaaaacgtt 13787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 618 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 40733 - 40596
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||    
T  40733 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttcattaacttctctccgttacacat 40634  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40633 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 40596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 618 - 753
Target Start/End: Original strand, 40357 - 40493
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||  |||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||  |||| | ||||  |||||| ||    
T  40357 aattgtatttttggtcccttaattatttagatagtatcgctttagtcccttaattaaaatttgatttatttcggtcccttaattactctacgttacagat 40456  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgtta 753  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40457 tttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgtta 40493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 177446 - 177308
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  177446 aattgcatttttggtcccttaattatttaggtattatcagatcgatcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctatgttacacat 177347  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  177346 tttgttcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 177308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 45217 - 45079
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||||||||| |  ||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  45217 aattgcatttttagtcccttaactatttaggtattatcgctttgctcccttaattaaaaattgatttattgtggtcccttaacttctctttgttacacat 45118  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45117 tttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttagg 45079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 621 - 755
Target Start/End: Original strand, 65747 - 65882
Alignment:
Q  621 tgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatttt 719  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||| || | |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  65747 tgcatttttggtctcttaactatttaggtaatattgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctccattacacatttt 65846  T
Q  720 ggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  65847 ggtcatttccgttagttttaattccaaaacgttagg 65882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 621 - 755
Target Start/End: Original strand, 73079 - 73214
Alignment:
Q  621 tgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatttt 719  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||| || | |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  73079 tgcatttttggtctcttaactatttaggtaatattgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctccattacacatttt 73178  T
Q  720 ggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  73179 ggtcatttccgttagttttaattccaaaacgttagg 73214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 66120 - 65982
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  | || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  66120 aattacatttttggtcgcttaactatttaggtagtatcgttttagttccttaattaaaattcaatttattttagtcccttaacttctctttgttacatat 66021  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||   ||||||||||| |||||| ||||||    
T  66020 tttggtcctttttattagttttaattcaaaaatgttagg 65982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 73452 - 73314
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacat 716  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  | || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  73452 aattacatttttggtcgcttaactatttaggtagtatcgttttagttccttaattaaaattcaatttattttagtcccttaacttctctttgttacatat 73353  T
Q  717 tttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||| |||   ||||||||||| |||||| ||||||    
T  73352 tttggtcctttttattagttttaattcaaaaatgttagg 73314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold1436
Description:

Target: scaffold1436; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 620 - 754
Target Start/End: Original strand, 1483 - 1617
Alignment:
Q  620 ttgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattt 718  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||    
T  1483 ttgcattttttgtcacttaactatttaggtagtatcgcattggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctttgttacaca-tt 1581  T
Q  719 tggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttag 754  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1582 tggtcatttccgttagttttaattcaaacacgttag 1617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 657 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 1815 - 1718
Alignment:
Q  657 tttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  1815 tttggtcccttaattaaaat-cgatttattttgatccattaacttctctctgttacacattttggtcatttcggttaattttaattcaaaaacgttagg 1718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 619 - 747
Target Start/End: Original strand, 90811 - 90940
Alignment:
Q  619 attgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacatt 717  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  90811 attgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgcttttgtcccttaattgaaatttgatttattttggtaacttaacttctttctcttacacatt 90910  T
Q  718 ttggtcatttccgttagttttaatacaaaa 747  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  90911 ttggtcctttccgttagttttaattcaaaa 90940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 662 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 91844 - 91759
Alignment:
Q  662 tcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaa 747  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  91844 tcccttaattaaaatttgatttattttggtaacttaacttctttctcttgcacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaa 91759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 671 - 755
Target Start/End: Original strand, 11727 - 11811
Alignment:
Q  671 taaaattcaatttattttggtcatttaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11727 taaaatttgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 11811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 692
Target Start/End: Original strand, 11644 - 11719
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggt-ccttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  11644 aattgcatttttgataccttaactatttaggtattatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtc 11719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 93193 - 93333
Alignment:
Q  618 aattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctctgtt-acac 714  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||  || | |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||    
T  93193 aattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttagtcacttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctctgtttacac 93292  T
Q  715 attttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  93293 attttggtcctttacgttagttttaattcaaaaacgttagg 93333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 708 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 93479 - 93432
Alignment:
Q  708 gttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  93479 gttacacattttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacggtagg 93432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 609 - 755
Target Start/End: Original strand, 9778 - 9926
Alignment:
Q  609 tttaggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaactt-ctctc 706  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||||  |||| ||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||| || || ||    
T  9778 tttaggcttaattgcctttttggtcccttaactatttaattggtatcggtttgctcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctatc 9877  T
Q  707 tgttacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
     |||||   |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9878 cgttactacttttagtcctttccgttagttttattaaaaaaacgttagg 9926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 11007 - 10862
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtcatttaa-cttctctctgt 709  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||  |||| |||||    
T  11007 aggtttaattgtctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctttctgt 10908  T
Q  710 tacacattttggtcatttccgttagttttaatacaaaaacgttagg 755  Q
    |||   |||| ||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  10907 taccacttttagttctttccgttaattttattaaaaaaacgttagg 10862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 612 - 692
Target Start/End: Original strand, 25966 - 26047
Alignment:
Q  612 aggtttaattgcatttttggtc-cttaactatttaggtagtatcaatttgatcccctaattaaaattcaatttattttggtc 692  Q
    ||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  25966 aggttaaattgcacttttggtctcctaactatgtagttggtatcactttgatcccttaattaaaactcgatttattttggtc 26047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University