View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18309_low_34 (Length: 338)

Name: NF18309_low_34
Description: NF18309
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18309_low_34
NF18309_low_34
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (1-323)||(8405703-8406028)
chr2 (1-323)||(8395544-8395869)
chr2 (1-320)||(8375861-8376180)
chr2 (1-323)||(8411823-8412145)
chr2 (1-323)||(8433921-8434243)
chr2 (1-323)||(8430974-8431284)
chr2 (31-323)||(8416907-8417196)
chr2 (1-158)||(8439085-8439242)
chr2 (1-161)||(8417203-8417363)
chr2 (203-296)||(8368101-8368194)
chr2 (203-296)||(8401216-8401309)
chr2 (203-296)||(8422793-8422886)
chr2 (229-279)||(8403791-8403841)
chr2 (94-150)||(8368247-8368303)
chr2 (94-150)||(8401107-8401163)
chr2 (94-150)||(8422684-8422740)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (1-149)||(55336242-55336390)
chr4 (1-279)||(55330674-55330952)
chr4 (215-279)||(55336106-55336170)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8406028 - 8405703
Alignment:
Q  1 tggagtgaagaattggaaatggaaatgagagaagttgttgacgtggtaaaaagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaatatagctttgaagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8406028 tggagtgaagaattggaaatggaaatgagggaagttgttgacgtggtaaaacgaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaacatagctttgaagg 8405929  T
Q  101 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagctattggatctacttttataggcaa---tagttctttggctgcatttgttcc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  8405928 taaacaagagtttggcaattgcagggccattgctcacaggaattgcagctattggatctacatttattggcaatggtagttctttggctgcatttgttcc 8405829  T
Q  198 tctcttggctggttcattggcttctgcaatcaatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggtttcttc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8405828 tctcttggctggttcattggcttctgcaatcaatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggttttttc 8405729  T
Q  298 aacttgttagaaacttcaattgaatc 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8405728 aacttgttagaaacttcaattgaatc 8405703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 8395544 - 8395869
Alignment:
Q  1 tggagtgaagaattggaaatggaaatgagagaagttgttgacgtggtaaaaagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaatatagctttgaagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8395544 tggagtgaagaattggaaatggaaatgagggaagttgttgacgtggtaaaacgaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaacatagctttgaagg 8395643  T
Q  101 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagctattggatctacttttataggcaa---tagttctttggctgcatttgttcc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  8395644 taaacaagagtttggcaattgcagggccattgctcacaggaattgcagctattggatctacatttattggcaatggtagttctttggctgcatttgttcc 8395743  T
Q  198 tctcttggctggttcattggcttctgcaatcaatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggtttcttc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8395744 tctcttggctggttcattggcttctgcaataaatacttttgaacatggtggacaaattggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgatggtttattc 8395843  T
Q  298 aacttgttagaaacttcaattgaatc 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  8395844 aacttgatagaaacttcaattgaatc 8395869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 8375861 - 8376180
Alignment:
Q  1 tggagtgaagaattggaaatggaaatgagagaagttgttgacgtggtaaaaagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaatatagctttgaagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8375861 tggagtaaagaattggaaatggaaatgagggaagttgttgaagtgataaagagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaacatagcattgaagg 8375960  T
Q  101 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagctattggatctacttttataggcaatagttctttggctgcatttgttcctct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| | | ||||||||||||| |||||||||||    
T  8375961 taaacaagagtttggcaattgcagggccattgctcacaggaattgcagctattggatcgacatttgtaggtagtggttctttggctgcttttgttcctct 8376060  T
Q  201 cttggctggttcattggcttctgcaatcaatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggtttcttcaac 300  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8376061 tttggctggttcattggcttctgtaattaatacttttgagcatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctggtggtttcttcaac 8376160  T
Q  301 ttgttagaaacttcaattga 320  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  8376161 ttgatagaaacttcaattga 8376180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8412145 - 8411823
Alignment:
Q  1 tggagtgaagaattggaaatggaaatgagagaagttgttgacgtggtaaaaagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaatatagctttgaagg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||| ||| | || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8412145 tggagtgaagaattagaaatggaaatgcaggaagtcgctgaagtgatcaagagaaaagattctgaagattatgacagacttggaaacatagcgttgaagg 8412046  T
Q  101 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagctattggatctacttttataggcaatagttctttggctgcatttgttcctct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8412045 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagcaattggatctacatttgtaggcaatagttctttggctgcatttgttcctct 8411946  T
Q  201 cttggctggttcattggcttctgcaatcaatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggtttcttcaac 300  Q
     ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8411945 attgactggttcattggcttctgctgttaatacttttgagcatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggttttttcaac 8411846  T
Q  301 ttgttagaaacttcaattgaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8411845 ttgttagaaacttcaattgaatc 8411823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8434243 - 8433921
Alignment:
Q  1 tggagtgaagaattggaaatggaaatgagagaagttgttgacgtggtaaaaagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaatatagctttgaagg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||| ||| | || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8434243 tggagtgaagaattagaaatggaaatgcaggaagtcgctgaagtgatcaagagaaaagattctgaagattatgacagacttggaaacatagcgttgaagg 8434144  T
Q  101 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagctattggatctacttttataggcaatagttctttggctgcatttgttcctct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8434143 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagcaattggatctacatttgtaggcaatagttctttggctgcatttgttcctct 8434044  T
Q  201 cttggctggttcattggcttctgcaatcaatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggtttcttcaac 300  Q
     ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8434043 attgactggttcattggcttctgctgttaatacttttgagcatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggttttttcaac 8433944  T
Q  301 ttgttagaaacttcaattgaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8433943 ttgttagaaacttcaattgaatc 8433921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8431284 - 8430974
Alignment:
Q  1 tggagtgaagaattggaaatggaaatgagagaagttgttgacgtggtaaaaagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaatatagctttgaagg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  8431284 tggagtgaagaattagaaatggaaatgagggatgttgttgaagtgataaagagaaaagacgttgaagattatgatagacttggaaacatagcattgaagg 8431185  T
Q  101 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagctattggatctacttttataggcaatagttctttggctgcatttgttcctct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8431184 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactctcaggaattgcagctataggatctacatttattggcaatagttctttggctgcttttgttcctct 8431085  T
Q  201 cttggctggttcattggcttctgcaatcaatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggtttcttcaac 300  Q
                ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8431084 ------------attggcttctgtaattaatacttttgagcatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggttttttcaac 8430997  T
Q  301 ttgttagaaacttcaattgaatc 323  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  8430996 ttgatagaaacttcaattgaatc 8430974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8417196 - 8416907
Alignment:
Q  31 gaagttgttgacgtggtaaaaagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaatatagctttgaaggtaaacaagagtttggcaattgcagggccat 130  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8417196 gaagttgttgaagtgataaagagaaaagatgctgaagattataacaggcttggaaacatagctttgaaggtagacaagagtttagcaattgcagggccat 8417097  T
Q  131 tactcacaggaattgcagctattggatctacttttataggcaatagttctttggctgcatttgttcctctcttggctggttcattggcttctgcaatcaa 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8417096 tactcacaggaattgccgctattggatctacatttataggcaatggctctttggctgcctttgttcctctattggctggttcattggcttctgcagttaa 8416997  T
Q  231 tacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggtttcttcaacttgttagaaacttcaattgaatc 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8416996 tacttttgagcatggtggacaagttggcatggtttttgaaatg--tagagcttctggtggttt-ttcaacttgttagaaacttcaattgaatc 8416907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8439242 - 8439085
Alignment:
Q  1 tggagtgaagaattggaaatggaaatgagagaagttgttgacgtggtaaaaagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaatatagctttgaagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8439242 tggagtaaagaattggaaatggaaatgagggaagttgttgaagtgataaagagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaacatagcattgaagg 8439143  T
Q  101 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagctattggatc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8439142 taaacaagagtttggcaattgcagggccattgctcacaggaattgcagctattggatc 8439085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8417363 - 8417203
Alignment:
Q  1 tggagtgaagaattggaaatggaaatgagagaagttgttgacgtggtaaaaagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaatatagctttgaagg 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||   ||||| | ||| ||| | || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8417363 tggagtaaagaattagaaatggaaatgcaggaagtcgctgaagtgatcaagagaaaagattctgaagattatgacagacttggaaacatagcgttgaagg 8417264  T
Q  101 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagctattggatctac 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8417263 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagcaattggatctac 8417203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8368194 - 8368101
Alignment:
Q  203 tggctggttcattggcttctgcaatcaatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggtttctt 296  Q
    |||||||  |||||||| ||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  8368194 tggctggagcattggctactgctgttaattcttttgagcatggtggacaagttggtatggtttctgaaatgtatagagcttgtggtggattctt 8368101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 296
Target Start/End: Original strand, 8401216 - 8401309
Alignment:
Q  203 tggctggttcattggcttctgcaatcaatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggtttctt 296  Q
    |||||||  |||||||| ||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  8401216 tggctggagcattggctactgctgttaattcttttgagcatggtggacaagttggtatggtttctgaaatgtatagagcttgtggtggattctt 8401309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 296
Target Start/End: Original strand, 8422793 - 8422886
Alignment:
Q  203 tggctggttcattggcttctgcaatcaatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtatagagcttctgctggtttctt 296  Q
    |||||||  |||||||| ||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  8422793 tggctggagcattggctactgctgttaattcttttgagcatggtggacaagttggtatggtttctgaaatgtatagagcttgtggtggattctt 8422886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8403841 - 8403791
Alignment:
Q  229 aatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtataga 279  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  8403841 aatacttttgagcatggaggacaagttggtatggtgtttgagatgtataga 8403791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8368303 - 8368247
Alignment:
Q  94 ttgaaggtaaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagct 150  Q
    |||||| |||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8368303 ttgaagataaataagacattggctattgcaggaccattactcactggaattgcagct 8368247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 150
Target Start/End: Original strand, 8401107 - 8401163
Alignment:
Q  94 ttgaaggtaaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagct 150  Q
    |||||| |||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8401107 ttgaagataaataagacattggctattgcaggaccattactcactggaattgcagct 8401163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 150
Target Start/End: Original strand, 8422684 - 8422740
Alignment:
Q  94 ttgaaggtaaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagct 150  Q
    |||||| |||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8422684 ttgaagataaataagacattggctattgcaggaccattactcactggaattgcagct 8422740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 55336390 - 55336242
Alignment:
Q  1 tggagtgaagaattggaaatggaaatgagagaagttgttgacgtggtaaaaagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaatatagctttgaagg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  55336390 tggagtgaagaattagaaatggaaatgagggaagttattgaagttgtaaagagtaaagacattgaagactatgagagacttggaaatatagcattgaaga 55336291  T
Q  101 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagc 149  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  55336290 ttaacaagagtatggcaatagcaggtccattactcactggaattgcagc 55336242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 55330952 - 55330674
Alignment:
Q  1 tggagtgaagaattggaaatggaaatgagagaagttgttgacgtggtaaaaagaaaagacgctgaagattatgacagacttggaaatatagctttgaagg 100  Q
    |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||| || || ||||  |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  55330952 tggagtgaggaattagaaaaggaattgagagaagttattgaagttgtgaaaatgaaagatattgaagattatgaaagacttggaaatatagcattaaagg 55330853  T
Q  101 taaacaagagtttggcaattgcagggccattactcacaggaattgcagctattggatctacttttataggcaatagttctttggctgcatttgttcctct 200  Q
    | || |||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||| || | |||| | || ||  | ||| || |    
T  55330852 ttaataagagtttagcaactgctggtccattactcactggaattgcagctataggttctgcatttgtaggaaacaattctgttgcagctatagttgcttt 55330753  T
Q  201 cttggctggttcattggcttctgcaatcaatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtataga 279  Q
      ||||||||||||| | | ||| | | ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  55330752 aatggctggttcattaggtgctgtagtgaatgcttttgaacatggtggacaaattggtatggtatttgaaatgtataga 55330674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 55336170 - 55336106
Alignment:
Q  215 tggcttctgcaatcaatacttttgaacatggtggacaagttggcatggtttttgaaatgtataga 279  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  55336170 tggcttgtgcaatcaatggttttgagcatggtggacaagttggtatggtgtttgaaatgtataga 55336106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University