View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18309_low_36 (Length: 328)

Name: NF18309_low_36
Description: NF18309
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18309_low_36
NF18309_low_36
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (24-312)||(5631197-5631488)
chr6 (24-312)||(5258761-5259053)
chr6 (24-312)||(9706155-9706447)
chr6 (24-312)||(20428247-20428539)
chr6 (35-309)||(30670279-30670556)
chr6 (66-312)||(33495629-33495878)
chr6 (102-312)||(10100468-10100682)
chr6 (35-259)||(2208069-2208293)
chr6 (24-148)||(6082780-6082904)
chr6 (40-276)||(2680697-2680937)
chr6 (40-259)||(27790552-27790771)
chr6 (24-249)||(26291162-26291387)
chr6 (53-181)||(9369145-9369274)
chr6 (40-110)||(3629626-3629696)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (24-312)||(3394091-3394381)
chr5 (28-312)||(3301233-3301520)
chr5 (35-312)||(1274656-1274936)
chr5 (24-312)||(2076085-2076376)
chr5 (24-312)||(20318371-20318662)
chr5 (24-312)||(24177904-24178195)
chr5 (35-312)||(10638689-10638968)
chr5 (24-312)||(1288200-1288491)
chr5 (58-312)||(28977468-28977725)
chr5 (24-168)||(12493120-12493264)
chr5 (64-312)||(27350-27601)
chr5 (68-179)||(43558553-43558664)
chr5 (242-312)||(16348013-16348086)
chr5 (75-310)||(3096625-3096851)
chr5 (225-312)||(12492998-12493088)
chr5 (96-168)||(25937531-25937603)
chr5 (92-181)||(16134781-16134870)
chr5 (197-312)||(17341812-17341930)
chr5 (58-129)||(40383870-40383941)
chr5 (75-129)||(14099757-14099811)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (24-312)||(32629988-32630278)
chr7 (24-312)||(33350417-33350708)
chr7 (24-312)||(36651374-36651665)
chr7 (24-312)||(46356462-46356753)
chr7 (42-312)||(36869900-36870173)
chr7 (24-312)||(39906990-39907281)
chr7 (40-312)||(24177806-24178081)
chr7 (24-312)||(11593333-11593631)
chr7 (91-312)||(31004671-31004895)
chr7 (24-312)||(49028661-49028938)
chr7 (101-312)||(37616373-37616587)
chr7 (24-231)||(38896991-38897198)
chr7 (168-312)||(38606530-38606676)
chr7 (24-132)||(38606418-38606526)
chr7 (40-181)||(21520180-21520318)
chr7 (24-181)||(20499489-20499640)
chr7 (50-258)||(43793708-43793909)
chr7 (24-181)||(48055568-48055719)
chr7 (71-179)||(23087862-23087970)
chr7 (35-132)||(24426283-24426380)
chr7 (64-309)||(48918818-48919056)
chr7 (108-178)||(17101234-17101304)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (24-312)||(45368234-45368527)
chr2 (24-312)||(2609908-2610199)
chr2 (24-311)||(24584218-24584508)
chr2 (24-291)||(452248-452518)
chr2 (46-312)||(12475032-12475301)
chr2 (110-312)||(41763660-41763865)
chr2 (24-312)||(38453231-38453520)
chr2 (40-312)||(8180191-8180451)
chr2 (91-308)||(30743070-30743290)
chr2 (114-312)||(11992717-11992897)
chr2 (182-312)||(4807130-4807263)
chr2 (40-110)||(16292109-16292179)
chr2 (35-258)||(14769689-14769913)
chr2 (49-257)||(37281509-37281720)
chr2 (35-127)||(876545-876637)
chr2 (89-181)||(7292438-7292530)
chr2 (64-188)||(13148742-13148866)
chr2 (51-152)||(7135445-7135546)
chr2 (115-250)||(33594945-33595080)
chr2 (265-310)||(3244259-3244304)
chr2 (233-309)||(3865661-3865740)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (54-312)||(32083356-32083617)
chr1 (24-312)||(51441375-51441666)
chr1 (35-312)||(8671312-8671591)
chr1 (24-312)||(43240992-43241283)
chr1 (40-312)||(51601454-51601729)
chr1 (24-312)||(49348005-49348296)
chr1 (24-312)||(37463476-37463764)
chr1 (35-259)||(46226979-46227195)
chr1 (58-258)||(7813910-7814108)
chr1 (71-312)||(35829004-35829248)
chr1 (44-258)||(40419081-40419295)
chr1 (210-312)||(1210311-1210416)
chr1 (142-259)||(34827769-34827886)
chr1 (73-251)||(28528010-28528188)
chr1 (94-139)||(13820549-13820594)
chr1 (198-258)||(21275457-21275517)
chr1 (224-312)||(32066879-32066970)
chr1 (51-162)||(38205415-38205526)
chr1 (259-313)||(52421048-52421102)
chr1 (64-125)||(34827887-34827948)
chr1 (95-179)||(32405252-32405336)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (24-312)||(27450784-27451075)
chr4 (24-312)||(435612-435900)
chr4 (24-312)||(23906912-23907204)
chr4 (24-312)||(1777626-1777917)
chr4 (24-312)||(48623138-48623429)
chr4 (92-312)||(56374738-56374961)
chr4 (84-259)||(16002354-16002529)
chr4 (40-309)||(39707858-39708125)
chr4 (92-312)||(53707242-53707465)
chr4 (152-312)||(31960425-31960588)
chr4 (24-218)||(1212015-1212209)
chr4 (141-312)||(48174704-48174878)
chr4 (24-258)||(10776087-10776321)
chr4 (73-258)||(35555989-35556173)
chr4 (27-259)||(30852809-30853031)
chr4 (56-168)||(17666783-17666895)
chr4 (24-96)||(53703990-53704062)
chr4 (30-131)||(32911621-32911722)
chr4 (43-258)||(55769045-55769260)
chr4 (26-181)||(3272811-3272966)
chr4 (243-312)||(47265815-47265887)
chr4 (57-139)||(21060186-21060268)
chr4 (243-312)||(33226808-33226880)
chr4 (43-258)||(55833301-55833516)
chr4 (50-145)||(15183461-15183556)
chr4 (64-136)||(45482959-45483033)
chr4 (71-145)||(42037335-42037409)
chr4 (56-241)||(17668008-17668193)
chr4 (260-312)||(16002548-16002600)
chr4 (94-130)||(37250669-37250705)
chr4 (64-259)||(54787913-54788109)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (24-312)||(42854615-42854915)
chr8 (24-312)||(36565852-36566143)
chr8 (24-312)||(15215881-15216174)
chr8 (24-312)||(36544532-36544823)
chr8 (24-312)||(12492453-12492744)
chr8 (46-259)||(13984034-13984245)
chr8 (25-259)||(18849782-18850019)
chr8 (24-311)||(13588820-13589110)
chr8 (40-258)||(41444972-41445190)
chr8 (216-312)||(4033105-4033204)
chr8 (64-181)||(30578973-30579091)
chr8 (35-189)||(3284884-3285042)
chr8 (202-255)||(5057259-5057312)
chr8 (229-312)||(8880045-8880131)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (24-312)||(30848-31139)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (24-312)||(51448320-51448611)
chr3 (92-312)||(25190827-25191050)
chr3 (35-312)||(52138219-52138499)
chr3 (51-312)||(38849501-38849765)
chr3 (64-312)||(19736589-19736837)
chr3 (64-298)||(19757407-19757641)
chr3 (116-312)||(47542322-47542521)
chr3 (35-312)||(29816896-29817176)
chr3 (45-280)||(9258287-9258522)
chr3 (64-312)||(48221201-48221455)
chr3 (25-181)||(50630066-50630222)
chr3 (96-312)||(27917023-27917243)
chr3 (33-239)||(26592123-26592333)
chr3 (227-312)||(19757651-19757739)
chr3 (71-139)||(805378-805446)
chr3 (225-312)||(43111627-43111717)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (61-312)||(12209-12456)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (26-296)||(88550-88834)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (35-259)||(168-392)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (43-189)||(48647-48795)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (35-128)||(25011-25104)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (225-312)||(5780-5863)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (236-312)||(2881-2960)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 5631197 - 5631488
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5631197 caataagactacacctagggtcaatcttaagtccttatctttttactttagttttggatgtactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgcat 5631296  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5631297 gttttttgcatatgatctagtctttcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctggagacctgtaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 5631396  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5631397 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 5631488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5259053 - 5258761
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatcctttt-actttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgta 122  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5259053 caataggattgcaccaagggtaaaccctaagtccttatcttttttactttagttttggatgtactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgta 5258954  T
Q  123 tgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccg 222  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  5258953 tgctttttgcagatgatgaagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggcttccg 5258854  T
Q  223 catgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  5258853 cctgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtgggtctaccttggaagtgaaagttggagatcatatcat 5258761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 9706155 - 9706447
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9706155 caatatgactgcaccaagggtcaaccttaagtccttatctttttactttagttttggatgtactgacgaaacacatccaagagttagcaccgagttgtat 9706254  T
Q  124 gctttttgc-atatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccg 222  Q
    ||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9706255 gctttttcccaaatgatgtagtcttgcttggtgagtcgagggagaagttaaatgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagagtatggttcccg 9706354  T
Q  223 catgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    | |||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  9706355 cctgagtagaagcaagatggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtgggtataccttggagatgaaagttggagatcatatcat 9706447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20428539 - 20428247
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20428539 caataggactgcaccaagggtcaaccctaagtttttatcttattactttagctttggatgtacttacggaacacattcaagagttagcaccgagatgtat 20428440  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccg- 222  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  20428439 gctttttgcagatgatgtagtcttgcttggtgagtcaagggaggagttaaatgggaggctagatatctagaggcaagccttagaagcgtatggttttcgc 20428340  T
Q  223 catgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  20428339 catgagtggaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaattaggtctacctaggaggtgaaagttggagatcatatcat 20428247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 309
Target Start/End: Original strand, 30670279 - 30670556
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcat 134  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  30670279 caccaagggtcaaccataaatccttgtctttttactttagttttgggtgtactgacggaatacatccaagagttagcattgagatgtatgctttttgcag 30670378  T
Q  135 atgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaag 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||    
T  30670379 atgatgtagtcttgcttggtgagtcgagggaggaattgaacgggaggttagagacctagaggcaagccttataagcgtatggttttcgcttgagaagaag 30670478  T
Q  235 caagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatat 309  Q
    ||||||  ||||||| ||||||| |   ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30670479 caagacggagtatatagaatgtatctttagcaaaaggagaagtaggtataccttggaggtgaaagttggagatcatat 30670556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 66 - 312
Target Start/End: Original strand, 33495629 - 33495878
Alignment:
Q  66 ttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgaggga 165  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33495629 ttactttagttttgaatgtactgacggaacacatccaagatttagcatcgagatgtatgctttttgcatatgatgtagtcttgcttggtgagttgaggga 33495728  T
Q  166 ggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagc 262  Q
    ||| || ||  ||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || |    
T  33495729 ggaattgaacaggaggctagagacttggagtcaaaccttaaaagcgtatggtttccgcctgagtagaagcaagacagagtatatggaatgtaacttcatc 33495828  T
Q  263 aaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  33495829 aaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcat 33495878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 102 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10100682 - 10100468
Alignment:
Q  102 aagagttagcaccgagatgtatgcttttt-gcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||  ||||  ||    
T  10100682 aagagttagcaccgagatgtatgtttttttgcagatgatgtagtattgcttagtgagtcgaggaaggaattaaactggaggctagagaccaggaggtgag 10100583  T
Q  201 ccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagt 297  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10100582 ccttagaagcatatggtttccgcctgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaactttagcaaaatgagaagtaggtctaccttggaggtgaaagt 10100483  T
Q  298 tagagatcatatcat 312  Q
    | |||||||||||||    
T  10100482 tggagatcatatcat 10100468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2208293 - 2208069
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcat 134  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||     
T  2208293 caccaagggtcaatcctaagcccttacctttttactttagttttggatgtacttacggaacacatccaagagttagcaccaagatgtacgactttggcaa 2208194  T
Q  135 atgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaag 234  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||| ||||||| | ||| | || |||||| | ||||   |||||| ||||||||||    
T  2208193 atgatgtagtcttgcttggaaaatcgagggaggaattgaatggaaggttagagacttggagactagtcttagatgcgtataacttccgcctgagtagaag 2208094  T
Q  235 caagacaaagtatatggaatgtaac 259  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  2208093 taagacaaaatatatggaatgtaac 2208069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 148
Target Start/End: Original strand, 6082780 - 6082904
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6082780 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagttcttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 6082879  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttg 148  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||    
T  6082880 gctttttgcagatgatgtagtcttg 6082904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2680937 - 2680697
Alignment:
Q  40 agggtcaaccctaagtccttatcctttt-actttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatga 138  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||  ||||    
T  2680937 agggtcaaccgtaagtccttatcttttttactttagttttggatgtacttacataacacatccaagtgttagcatcgagatgtatacattttgcggatga 2680838  T
Q  139 tctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaag 238  Q
      |||||||||||| ||||||||| |||||  | || |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||| |   || |||||||||||    
T  2680837 cgtagtcttgcttgatgagtcgagtgaggaactgaacgggatgctagagacttggagacaagccttagaagcgtatgattttcatctgcgtagaagcaag 2680738  T
Q  239 acaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgg 276  Q
    ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  2680737 acagagtatatgaaatgtaatttcagcaaaaggagaagtgg 2680697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 259
Target Start/End: Original strand, 27790552 - 27790771
Alignment:
Q  40 agggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgat 139  Q
    ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| ||  ||| | | ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  27790552 agggtcaaccctaaacccttacctttttactttagttttgaatgcacttatgaaacacatccaaaagttagcatcaagatgtatgcttttcacatatgat 27790651  T
Q  140 ctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaaga 239  Q
     ||||| || |||| | |||||||||||| || ||||||||| |||| || | ||  |||||||| |||| ||||   || ||| || ||||||||||||    
T  27790652 gtagtcatgtttggagtgtcgagggaggaattgaatgggaggttagatactttgatacaagcctttgaagtgtataactttcgcctgggtagaagcaaga 27790751  T
Q  240 caaagtatatggaatgtaac 259  Q
    ||  ||||||||| ||||||    
T  27790752 cagggtatatggagtgtaac 27790771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 249
Target Start/End: Original strand, 26291162 - 26291387
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| || | |||||||||||| || || ||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26291162 caataggattgcaccaagtgccaaccctaagtc-ttgtcgtttcactttaattttggatgtatttacggaacacatccaagagttaacaccgtgatgtat 26291260  T
Q  124 gc-tttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccg 222  Q
    || ||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||  ||| | ||   ||| |||||||| |||||  || ||    
T  26291261 gcttttttacagatgatgtagtcctgcttggaaagtcgagggaggaattgcatgggaggttaatgacttggatagaagtcttagaagcgtatgaatttcg 26291360  T
Q  223 catgagtagaagcaagacaaagtatat 249  Q
      ||||||||| |||||||||||||||    
T  26291361 tctgagtagaaacaagacaaagtatat 26291387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9369274 - 9369145
Alignment:
Q  53 agtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatg-ctttttgcatatgatctagtcttgctt 151  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||    
T  9369274 agtccttatcttttcaccttagttttggatgtacttacgaaacacatccaaaagcgagcaccaagatgtatgtttttttgcaaatgatatagtcttactt 9369175  T
Q  152 ggtgagtcgagggaggagttaaatgggagg 181  Q
    || | ||||| ||| || |||||| |||||    
T  9369174 ggagtgtcgaaggaagaattaaataggagg 9369145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 110
Target Start/End: Original strand, 3629626 - 3629696
Alignment:
Q  40 agggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttag 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  3629626 agggtcaaccttaagcccttatctttttactttagttttggatgtacttatggaacacattcaagatttag 3629696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 3394091 - 3394381
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394091 caataggattgcaccaagggtaaaccctaagtccttatctctttactctagttttggatgtactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 3394190  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3394191 gctttttgcagatgatgcagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggtttccgc 3394290  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa--cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3394291 ctgagtagaagcaagacagagtatatggaatgtaattcagcaaaaggagaagtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 3394381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 312
Target Start/End: Original strand, 3301233 - 3301520
Alignment:
Q  28 aggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctt 127  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3301233 aggactccaccaagggtaaaccctaagtccttatctctttactctagttttggatgtactgacagaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctt 3301332  T
Q  128 tttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatga 227  Q
    |||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3301333 tttgcagatgatgcaatcttgcttggtgagttgagggaggaattaaatgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagagtatggtttccgcctga 3301432  T
Q  228 gtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3301433 gtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 3301520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 312
Target Start/End: Original strand, 1274656 - 1274936
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcat 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1274656 caccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcag 1274755  T
Q  135 atgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaag 234  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  1274756 atgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacatgaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccggttgagtagaag 1274855  T
Q  235 caagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||  ||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  1274856 caagacggagtatatggaatgtaacttcagcgaaaggagaagtaggtctaccttggagatgaaagttggagatcatatcat 1274936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2076376 - 2076085
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2076376 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 2076277  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2076276 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcaagggaggaagtgaacgggaggctagagagctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgc 2076177  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||  |||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2076176 ttgagtagaagcaagacagagtacatggaatgtaacttcagcggaaggagaagcagttctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 2076085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 20318371 - 20318662
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20318371 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacgaaacacattcaagagttagcaccgagatgtat 20318470  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20318471 gctttttgcagatgatgtagtcttcatgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgc 20318570  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20318571 ttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtagttctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 20318662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 24177904 - 24178195
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177904 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtcctaatctttttactttagtttgggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 24178003  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24178004 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgagtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctgaaggcaagccttagaagtgtatggattccgc 24178103  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  24178104 ttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaagtgaaagttggagatcatatcat 24178195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 312
Target Start/End: Original strand, 10638689 - 10638968
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcat 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10638689 caccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcag 10638788  T
Q  135 atgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaag 234  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  10638789 atgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacggtaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggatt-cgcttgagtagaag 10638887  T
Q  235 caagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     |||||  ||||||||||||||||   |||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  10638888 aaagacggagtatatggaatgtaacttcagtggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggaaatcatatcat 10638968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1288491 - 1288200
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1288491 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatatttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 1288392  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| | |||||| | ||||| |||||||||||  | || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  1288391 gctttttgcagatgatgtggtcttggtgggtgattcgagggaggaagtgaacgggagactagagacctggagacaagccttagaagcgtatggattctgc 1288292  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1288291 ttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaagtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 1288200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 58 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28977725 - 28977468
Alignment:
Q  58 ttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgag 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| |    
T  28977725 ttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtggg 28977626  T
Q  158 tcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgta 257  Q
    || ||||||||  | || ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28977625 tcaagggaggaagtgaacgggaggctataggcctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgta 28977526  T
Q  258 acagcaa---aaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||  |||   |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  28977525 acttcaacggaaggagaagtaggtctaccttagaggtgaaagttggagatcatatcat 28977468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12493264 - 12493120
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12493264 caataggattgcaccaagggtcaaccctaactccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccaagatgtat 12493165  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggagga 168  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||    
T  12493164 gctttttgcagatgatgtaatcttggtgggtgagtcgagggagga 12493120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 312
Target Start/End: Original strand, 27350 - 27601
Alignment:
Q  64 ttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagg 163  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || |||| ||| |||||    
T  27350 ttttatttttgttttggatgtacttgcggaccatatccaagagttagcaacgagatgtatgttttttgtcgatgatgtagtcctgtttggagagacgagg 27449  T
Q  164 gaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---ca 260  Q
    ||||| || ||||||| | | ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| |  |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||   ||    
T  27450 gaggaattgaatgggaagttggagacttagatacaagcgttagaagcgtaggacttccgcttgagtaaaagcaagacagagtatagggaatgtaacttca 27549  T
Q  261 gcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||| ||| ||||| | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27550 acaataggcgaagtagttatgccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 27601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43558664 - 43558553
Alignment:
Q  68 actttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggagg 167  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||    
T  43558664 actttagttttggatgtacttacggaacacatccaagagctaacaccgagatatatgcgttttgtagatgatgtagtccttcttggagagttgagggagg 43558565  T
Q  168 agttaaatggga 179  Q
    | || |||||||    
T  43558564 aatttaatggga 43558553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16348086 - 16348013
Alignment:
Q  242 aagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16348086 aagtatatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 16348013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 310
Target Start/End: Original strand, 3096625 - 3096851
Alignment:
Q  75 ttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaa 174  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||   ||||||| ||| || |||||    
T  3096625 ttttggatgtacttacagaacacatccaaaagcgagcaccaagatgtatgcgttttgcatatgatatagtcatacttaaagagtcgaaggaagaattaaa 3096724  T
Q  175 tgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaacagcaaaaggagaagt 274  Q
    ||||||| | ||||        |||| |||||||   ||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||| ||||||||     
T  3096725 tgggaggttggaga--------caagtcttagaaacatatgactttcgcttgagtagaagcaagataaagtatatataatgt-atagcaagaggagaagc 3096815  T
Q  275 gggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatc 310  Q
    |  |||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  3096816 gtttctatcgtagaggtgaaagttagagatcatatc 3096851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12493088 - 12492998
Alignment:
Q  225 tgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||  |||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  12493088 tgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtagctctaccttggaggtaaaagttggagatcatatcat 12492998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 168
Target Start/End: Original strand, 25937531 - 25937603
Alignment:
Q  96 acatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggagga 168  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   |||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25937531 acatccaagtgttagcaccgagatgtaacttttttgtagatgatatagttttgcttggagagtcgagggagga 25937603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16134870 - 16134781
Alignment:
Q  92 gaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggagg 181  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||  |||||||| ||||  || || | ||||||||||| || ||||||||||||    
T  16134870 gaacacatccaagagtgagcatcaagatgtttgcttttcacatatgatatagtgctgatttgagagtcgagggaagaattaaatgggagg 16134781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17341930 - 17341812
Alignment:
Q  197 caagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtga 293  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||||||   || ||||||  || ||| ||||||||| |||||     
T  17341930 caagcctcataagtgtatggttttcgcctgaatagaagcaaaattgagtatatggaatgtaactttagaaaaaggccaaatggttctaccttggaggtgg 17341831  T
Q  294 aagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  17341830 aagttggagatcatatcat 17341812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 129
Target Start/End: Original strand, 40383870 - 40383941
Alignment:
Q  58 ttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttt 129  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  |||| || |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40383870 ttatctttttactttagtcttggatgtacttacataacatattcaagagctagcactgagatgtatgctttt 40383941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 129
Target Start/End: Original strand, 14099757 - 14099811
Alignment:
Q  75 ttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttt 129  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14099757 ttttggatatacttatgaaacacatgcaagagctagcaccgagatgtatgttttt 14099811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 32629988 - 32630278
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32629988 caataggactgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactctagttttggatgtactaacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 32630087  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32630088 gctttttgcagatgatgtagtcttgctaggtgagtctagggaggagttaaat-ggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggtttccgc 32630186  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32630187 ctgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 32630278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 33350708 - 33350417
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33350708 caataggattgcaccaagggtcaaccctaactccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 33350609  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33350608 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgc 33350509  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33350508 ttgagtagaagcaagacgaagtatatggaatgtaacttcagcggaagaagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 33350417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 36651374 - 36651665
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36651374 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttagatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 36651473  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36651474 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgc 36651573  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||   ||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36651574 ttgagtagaagcaagacggagtatatggaatggaacttcagcggaagaagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 36651665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46356753 - 46356462
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46356753 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 46356654  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  46356653 gctttttgcagatgatgtagccttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaagctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggataccgc 46356554  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  46356553 ttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 46356462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36870173 - 36869900
Alignment:
Q  42 ggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatct 141  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  36870173 ggtcaaccttaagtccttatctttttactttagttttggatgtactgacggaacacatccaagagctagcaccgagatgtatgctttttgcagatgatgt 36870074  T
Q  142 agtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagaca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36870073 agtcttgcttggtgagtcgagggaggaattgaacgggaggctagaggcctggaggcaagctttagaagcgtatggtttccgcttgagtagaagcaagaca 36869974  T
Q  242 aagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||   ||| ||||||  ||||  ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  36869973 tagtatatggaatgtaacttcaggaaaagggaaagtatgtctaccctggaggtgaaagttggagagcatatcat 36869900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 39907281 - 39906990
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39907281 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatcttttcactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 39907182  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||| ||||||    
T  39907181 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaaatcttagaagcatatggattccgc 39907082  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  39907081 ttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 39906990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24178081 - 24177806
Alignment:
Q  40 agggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgat 139  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  24178081 agggtcaaccctaagttcttatctttttattttagttttggatgtactgacggaacacgcccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcaaatgac 24177982  T
Q  140 ctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaaga 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||||    
T  24177981 gtagtcttgcttggtgagtcgagggaggatttaaacgggagactagagacctggaggcaagccttagaaacgtatggtttctgcatgagtagcatcaaga 24177882  T
Q  240 caaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
       ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  24177881 tggagtatatggaatgtaacttcagcaaaagaagaagtaggtctagcttgtagatgaaggttggagatcatatcat 24177806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 11593333 - 11593631
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11593333 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 11593432  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  11593433 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagtcttagaagcgtatggattccgc 11593532  T
Q  224 atgagtagaagca------agacaaagtatatggaatgtaacagca----aaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||      ||||  |||||||| ||||||||  ||    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  11593533 ttgagtagaagcaagacggagacggagtatatgaaatgtaacttcagcggaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcat 11593631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 91 - 312
Target Start/End: Original strand, 31004671 - 31004895
Alignment:
Q  91 ggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  31004671 ggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacc 31004770  T
Q  191 tagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgc 287  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||||  |||||||||| |||||||||||     
T  31004771 tggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacagagtatatggaatgttacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttgg 31004870  T
Q  288 aggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  31004871 aggtgaaagttggagatcatatcat 31004895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 49028661 - 49028938
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49028661 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccaagatgtat 49028760  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  49028761 gctttttgcagatgatgtagtcttggtaggtgagtcg--------------tgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgc 49028846  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  49028847 ttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcaggggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcagatcat 49028938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 101 - 312
Target Start/End: Original strand, 37616373 - 37616587
Alignment:
Q  101 caagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  37616373 caagagttagcaccgagatgtatgctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaag 37616472  T
Q  201 ccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagt 297  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  37616473 ccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcagaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagg 37616572  T
Q  298 tagagatcatatcat 312  Q
    | |||||||||||||    
T  37616573 tggagatcatatcat 37616587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Original strand, 38896991 - 38897198
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38896991 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttgctttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 38897090  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
     | ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  38897091 tcattttgcagatgatgtagtcttggttggttagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacttggaggcaagccttcgaagtgtatggattccgc 38897190  T
Q  224 atgagtag 231  Q
     |||||||    
T  38897191 ttgagtag 38897198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 168 - 312
Target Start/End: Original strand, 38606530 - 38606676
Alignment:
Q  168 agttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaa 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||     ||||    
T  38606530 agttaaatgagaggctagagacctggaggcaagccttagaagtgtatggtttccgcctgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaatttttgcaa 38606629  T
Q  265 aaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38606630 aaggagaagtgggtctaccttg-aggtgaaagttggagatcatatcat 38606676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Original strand, 38606418 - 38606526
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38606418 caataggactgcaccaagggtcaacccttagtccttatctttttgctttagttttggatgtactgacagaacacatccaagagttagcaccaagatgtat 38606517  T
Q  124 gctttttgc 132  Q
    |||||||||    
T  38606518 gctttttgc 38606526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21520318 - 21520180
Alignment:
Q  40 agggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgat 139  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21520318 agggtcaaccctaagtgcttata-ttttaatttagttttggatgtatttacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgcttttt--atatgat 21520222  T
Q  140 ctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggagg 181  Q
     ||||  ||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  21520221 gtagttctgcttggagagtcgaggaatgagttgaatgagagg 21520180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 20499489 - 20499640
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||| | |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    ||    
T  20499489 caataggattgcaccaaggttgaaccataagcccttatctttttactttacttttggatgtacttgcggaacacatccaagagctagcaccgag----at 20499584  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggagg 181  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||  ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  20499585 gctttttgcttatgatatagtcatgtttg--gagtcgatggagaaattaaatgggagg 20499640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43793909 - 43793708
Alignment:
Q  50 ctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgct-ttttgcatatgatctagtcttg 148  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |     
T  43793909 ctaagcccttatcttttcaccttagtgttggatgtacttacaaaacacatccaagagcgagcaccaagatgtatgcttttttgcaaatgatatagtccta 43793810  T
Q  149 cttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtata 248  Q
    ||||| ||||| | ||| || |||||||||||| | ||||        ||||||| ||||   ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||    
T  43793809 cttggagagtcaaaggaagaattaaatgggaggttggaga--------caagcctcagaaacatatggtttttgcttgagtagaagcaagacagagtata 43793718  T
Q  249 tggaatgtaa 258  Q
     |||||||||    
T  43793717 cggaatgtaa 43793708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 48055719 - 48055568
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||| | |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||   |||| |||||||||||| ||||||||||    ||    
T  48055719 caataggattgcaccaaggctgaaccataagcccttatctttttactttacttttggatgtacctgcggagcacatccaagagctagcaccgag----at 48055624  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggagg 181  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||  |||| || |||| | ||||||||||||    
T  48055623 gctttttgcatatgatatagtcatgtttg--gagttgaaggagaaattaaatgggagg 48055568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23087970 - 23087862
Alignment:
Q  71 ttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||  |||| |||| || |||||| |    
T  23087970 ttagttttggatatacttacaaaacacatccaacagatagcactgagatgtatgtattttgcagatgatgtagtcttaattggcgagttgacggaggaat 23087871  T
Q  171 taaatggga 179  Q
    | |||||||    
T  23087870 tgaatggga 23087862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24426380 - 24426283
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgc 132  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||| | | |||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  24426380 caccaagggtcaaccataagtgcttatctttttactataattttggatgtacttatgcaacacatttaagagttagcatcgagatgtatattttttgc 24426283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 309
Target Start/End: Original strand, 48918818 - 48919056
Alignment:
Q  64 ttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgcttttt-----gcatatgatctagtcttgcttggtgagt 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||     ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  48918818 ttttactttagttttggatgtatcgacggaacacattcaagagttaacactgagatgtatttttttttttttgcagatgatgtagtcttacttggtgagt 48918917  T
Q  159 cgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa 258  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |               ||  ||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  48918918 cgaaggaagaattaaacgggagac---------------aattcttagaagcatatggttttcgcctaagtagaagcaagacggagtatatggaatgtga 48919002  T
Q  259 ---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatat 309  Q
       ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||    
T  48919003 cttcagcaaatggagaagtaggtctacattgaaggtaaaagtaggagatcatat 48919056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17101304 - 17101234
Alignment:
Q  108 tagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatggg 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||| || ||||||    
T  17101304 tagcaccgagatgtaggctttttgaagatgatttagtcttacttggggagtcgatagaggaattgaatggg 17101234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 45368527 - 45368234
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45368527 caataggactgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagaattagcaccgagatgtat 45368428  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  45368427 gctttttgcagatgatgtagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggttttcgc 45368328  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaa--gtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  45368327 ctgagtagaagcaagacggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 45368234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 2609908 - 2610199
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2609908 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 2610007  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2610008 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagaaacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgc 2610107  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| |||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2610108 ttgagtagaagcaagacggagtatatgaaatgtaacttcagcagaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 2610199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24584508 - 24584218
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24584508 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtactaacggaacacatccaagagttatcaccgagatgtat 24584409  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  24584408 gttttttgcagatgatgtagtcttgcttggtgagtcaagggaggaattgaacgggaggctagagacccaaaggccagtcttagaagcgtatgatttccgc 24584309  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatca 311  Q
     ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24584308 ttgagtagaaacaagacggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaattatgtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatca 24584218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 452518 - 452248
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  452518 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 452419  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  452418 gctttttacagatgatgtagtcttggtgggtgagttgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccac 452319  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggt 291  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  452318 ttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggt 452248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 46 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12475301 - 12475032
Alignment:
Q  46 aaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtc 145  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12475301 aaccttaagtccttttctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcagatgatgtagtc 12475202  T
Q  146 ttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagt 245  Q
    ||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||||||||  |||    
T  12475201 ttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattcctcttgagtataagcaagacggagt 12475102  T
Q  246 atatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  12475101 atatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttagaggtgaaagttggagatcatatcat 12475032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 110 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41763865 - 41763660
Alignment:
Q  110 gcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  41763865 gcaccgagatgtatgctttttgcagatgatgtagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctggaggcaagccttagtag 41763766  T
Q  210 agtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatca 306  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  41763765 cgtatggtttccgcctgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatta 41763666  T
Q  307 tatcat 312  Q
    ||||||    
T  41763665 tatcat 41763660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38453520 - 38453231
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38453520 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtcctcatctctttactttagttttggatgtattgacaaaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 38453421  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |  ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || ||||||||||||| || ||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  38453420 gtattttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagaga-ctggaggcaaaccatagaagcgtatggattccgc 38453322  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     | ||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38453321 ttaagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacatcagcggaaggagaagt-agtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 38453231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 312
Target Start/End: Original strand, 8180191 - 8180451
Alignment:
Q  40 agggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgat 139  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8180191 agggtcaaccataagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacgaaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcagatgat 8180290  T
Q  140 ctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaaga 239  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||               || |||| | |||||||||||||||    
T  8180291 gtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaa---------------ggattccacttgagtagaagcaaga 8180375  T
Q  240 caaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    || ||||||||||||||||   |||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8180376 cagagtatatggaatgtaatttcagtggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 8180451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 308
Target Start/End: Original strand, 30743070 - 30743290
Alignment:
Q  91 ggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacc 190  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||  |||||||||     
T  30743070 ggaacacatccaagaattagtaccgagatgtatgaattttgcagatgatgtagttttgcttggtgagtcgagggaggaattgaactggtcgctagagact 30743169  T
Q  191 tagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgc 287  Q
    | ||| ||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||     
T  30743170 tggagacaaaccttagaagcatatggtttccgcctgggtagaagaaagacagagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaaattggtctaccttgg 30743269  T
Q  288 aggtgaaagttagagatcata 308  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  30743270 aggtgaaagttggagatcata 30743290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11992897 - 11992717
Alignment:
Q  114 cgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagta 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||                     |||    
T  11992897 cgagatgtatgctttttgcagatgatgtagtcttgcttggtgagtcgatgaaggagttaaatgggaagctagagac---------------------gta 11992819  T
Q  214 tggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatc 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  11992818 tggtttccgcctgagtagaagcaagacgaagtatatggaatgtaacttcagtaaaaagagaagtgggtctaccttagaggtgaaagttggagatcatatc 11992719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 182 - 312
Target Start/End: Original strand, 4807130 - 4807263
Alignment:
Q  182 ctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggt 278  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||   |||||||||| |||    
T  4807130 ctagagacttggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagtggaaggagaagtaggt 4807229  T
Q  279 ctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4807230 ctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 4807263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 110
Target Start/End: Original strand, 16292109 - 16292179
Alignment:
Q  40 agggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16292109 agggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttag 16292179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 258
Target Start/End: Original strand, 14769689 - 14769913
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtcct-tatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgca 133  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| |||| ||   |||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||       
T  14769689 caccaagggtcaaccctaagccctgtatctttttactttaattttggatgtacttacatcacacattcaagagctagcaccaatatgtatgtttttttgc 14769788  T
Q  134 tatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaa 233  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || || |||| |||| | ||||| |  || ||||||||||||| ||  || ||  || ||| |||||    
T  14769789 gatgatgtagtcatgcttggagagtcgagggacgaattcaatgagaggttggagacttgaagacaagccttagaagtgtccggcttttgcgtgaatagaa 14769888  T
Q  234 gcaagacaaagtatatggaatgtaa 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  14769889 gcaagacagagtatatggaatgtaa 14769913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 257
Target Start/End: Original strand, 37281509 - 37281720
Alignment:
Q  49 cctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttg 148  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||||| ||    
T  37281509 cctaagcccttatctttttactttaggtttagatgtacttacgaaacacatccatgggttagcaccaaggtgtatgctttttgtagatgatttagtcgtg 37281608  T
Q  149 cttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagcc---ttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagt 245  Q
     | ||  |||||||  | || || |||| ||||  || ||| | |||   || |   |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37281609 ttgggatagtcgagatatgaattgaatgagaggtcagggacttggagatgagtcatgttagaagtttatggcttccgcttgagtagaagcaagacaaagt 37281708  T
Q  246 atatggaatgta 257  Q
    ||||| ||||||    
T  37281709 atatgaaatgta 37281720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Original strand, 876545 - 876637
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctt 127  Q
    |||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  876545 caccaaggttcaacactaagcccttatcttttcaccttcgttttggatgtacttacggaacacatccaagagcgagcaccaagatgtatgctt 876637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 181
Target Start/End: Original strand, 7292438 - 7292530
Alignment:
Q  89 acggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggagg 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||   |||| || |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  7292438 acggaacacatccaagagcgagcatcaagatgtatgatttttgcatatgacagagtcctgtttggagagtcgagggaagaattaaatgggagg 7292530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 188
Target Start/End: Original strand, 13148742 - 13148866
Alignment:
Q  64 ttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagg 163  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| | |||||  |||   |||||| |||||||      
T  13148742 ttttactttagttttggatgtacttacagaacacatccaagagctagcactaagatgtatgcattttgtagatgatgcagttccgcttggagagtcgaat 13148841  T
Q  164 gaggagttaaatgggaggctagaga 188  Q
    ||| | || ||||||||| ||||||    
T  13148842 gagaaattgaatgggaggttagaga 13148866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 7135546 - 7135445
Alignment:
Q  51 taagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgct 150  Q
    |||| ||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||  |||||| ||||||| || ||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  7135546 taagcccttatagttttactttaattttggatgtacttaccaaacacaaccaagagctaccattgagatgtatgcattttgcaaatgatgtagtcctgct 7135447  T
Q  151 tg 152  Q
    ||    
T  7135446 tg 7135445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33595080 - 33594945
Alignment:
Q  115 gagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtat 214  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |  |||| ||||||| |||  | |||||||||| | |||| |  | ||| |||||||||||  | |||    
T  33595080 gagatgtatgcattttgcataagatatagtcctagttggagagtcgaaggaataattaaatgggaagttagacaattggagacaagccttagagaaatat 33594981  T
Q  215 ggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatg 250  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  33594980 ggttttcgcttgactagaagcaagatagagtatatg 33594945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3244304 - 3244259
Alignment:
Q  265 aaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatc 310  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  3244304 aaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatc 3244259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 309
Target Start/End: Original strand, 3865661 - 3865740
Alignment:
Q  233 agcaagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatat 309  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||   |||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3865661 agcaagacggagtatatgaaatgtaacttcagcggaaggagaagtacgtctaccttggaggtgaaagttggagatcatat 3865740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32083617 - 32083356
Alignment:
Q  54 gtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttgg 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  32083617 gtccttatctttttactttagttttggatgtactgacagaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcaaatgatgtaatcttgcttgg 32083518  T
Q  154 tgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32083517 tgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctggaggcaagcctcagaagcgtatggtttccgcctgagtagaagcaagacggagtatatggaa 32083418  T
Q  254 tgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32083417 tgtaacttcagcaaaaggagaagtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 32083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 51441666 - 51441375
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51441666 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatcttttttctttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 51441567  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51441566 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagagtatggattccgc 51441467  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  51441466 ttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttgaaggtgaaagttggagatcatatcat 51441375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 312
Target Start/End: Original strand, 8671312 - 8671591
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8671312 cacctagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttg-atgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcag 8671410  T
Q  135 atgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaag 234  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  8671411 atgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacttggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaag 8671510  T
Q  235 caagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||  ||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8671511 caagacggagtatatggaatgtaacttcagcagaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 8671591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43241283 - 43240992
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43241283 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 43241184  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |    
T  43241183 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggtaagccttagaagcgtatggattccac 43241084  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43241083 ttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtagatctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 43240992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 40 - 312
Target Start/End: Original strand, 51601454 - 51601729
Alignment:
Q  40 agggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgat 139  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51601454 agggtcaaccctaagtccatatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcagatgat 51601553  T
Q  140 ctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaaga 239  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  51601554 gtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtaaaagcaaga 51601653  T
Q  240 caaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  51601654 cggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 51601729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 49348296 - 49348005
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49348296 caataggattgcaccaagggtcagccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 49348197  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||| | ||||| |||||| | | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  49348196 gctttttgtagatgatgtagtctcggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattctgc 49348097  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  49348096 ttgagtagaagcaagacggagtatatcgaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 49348005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37463764 - 37463476
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37463764 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagcccttacctttttactttagttttggatgttcttacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 37463665  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||||  |||||||||| |||  | ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  37463664 gctttttgcagatgacgtagtcctgcttgaagagtcgagggtggaaatgaatgggaggttagagactttgagacaagccttagaagtgtatggcttctgc 37463565  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||  | |||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  37463564 ttttgtagaaacaagacagagtatatggaatgtaacttcagcaaaagccggagt---tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 37463476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 46227195 - 46226979
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcat 134  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  46227195 caccaaggatcaaccctaagcccttacctttttactttagttttggatgtacttacgaaacacgtccaagagttagcaccaagatgtatgccttttgcat 46227096  T
Q  135 atgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaag 234  Q
    ||||| ||| | |  |||| |||||||||||| | || ||| ||||| ||||||        ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  46227095 atgatgtagccctatttggagagtcgagggagaaattgaataggaggttagaga--------caagttttagaagcgtatggtttccgcctgagtagaag 46227004  T
Q  235 caagacaaagtatatggaatgtaac 259  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  46227003 caaaacaaagtttatgaaatgtaac 46226979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 258
Target Start/End: Original strand, 7813910 - 7814108
Alignment:
Q  58 ttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgag 157  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |   |||| |||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||    
T  7813910 ttatctttttattttagttttggatgtacttaaaaaaca-atccaagaattaacattgagatgtatgttttttgcagatgatgtagtcatgcttcgagag 7814008  T
Q  158 tcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgta 257  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||| | ||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7814009 tcgagggaggaattgaatgggaggtt-gagacttggagacaagccttataagtgtatggcttccgcttgagtagaagcaagacagagtatatgaaatgta 7814107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35829248 - 35829004
Alignment:
Q  71 ttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagt 170  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||| | ||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  35829248 ttagttttggatgtacttacagaacacatccaagagctagcaccgatatgtatgctttgtgcacaagatgtcgtcctgcttggagagtcgagagaggaat 35829149  T
Q  171 taaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaag 267  Q
    | ||||||||| | ||||| | ||| |||| | ||||||  |||||  |   | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||    
T  35829148 tgaatgggaggttggagactttgagacaagtcctagaagcatatggcattttcttgagtacaagcaagacaaagtatatgaaatgtaattttagcaaaag 35829049  T
Q  268 gagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
        ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35829048 acatagtagttctaccttggaggtgaaagctagagatcatatcat 35829004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 40419081 - 40419295
Alignment:
Q  44 tcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctag 143  Q
    ||||| |||||  |||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| || |||||||||  |||||| |||    
T  40419081 tcaacactaagcacttatcttttcaccttagttttggatgtacttacggaacacatccaagagtgatcaccaagacgtgtgctttttg-ttatgatgtag 40419179  T
Q  144 tcttgcttggtgagtcgagggaggagtt-aaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaa 242  Q
    || | ||||  ||||||| ||| || || |||||||||| | ||||||| |||  |||||||||||  |||||| || |||  ||||||||||| ||||     
T  40419180 tcctacttgaagagtcgaaggaagaattaaaatgggaggttggagacctggagataagccttagaaacgtatggatttcgctcgagtagaagcacgacat 40419279  T
Q  243 agtatatggaatgtaa 258  Q
    ||||||||||||||||    
T  40419280 agtatatggaatgtaa 40419295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 312
Target Start/End: Original strand, 1210311 - 1210416
Alignment:
Q  210 agtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatca 306  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1210311 agtatggattccgcttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatca 1210410  T
Q  307 tatcat 312  Q
    ||||||    
T  1210411 tatcat 1210416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34827886 - 34827769
Alignment:
Q  142 agtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagaca 241  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||  || ||  | |||||||  ||||||    
T  34827886 agtcttgcttggagagtcgagagaggaattgaatgggaggttagagacttagagacaagccttagaagcctatgactttcgactaagtagaactaagaca 34827787  T
Q  242 aagtatatggaatgtaac 259  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34827786 aagtatatggaatgtaac 34827769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Original strand, 28528010 - 28528188
Alignment:
Q  73 agttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagtta 172  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||| ||||| |  |  | ||||  |||  |||||| || |||    
T  28528010 agttttggatgtacttacggaacacatccaagattgagcaccaagatgcatgctgtttgcagatgatatcattctacttgtagagatgagggaagaatta 28528109  T
Q  173 aatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatgg 251  Q
    ||||||||| | ||||| | ||| |||| |||||||   ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28528110 aatgggaggttggagacttggagacaagtcttagaaacatatgacttttgcctgagtagaagcaagacaaagtatatgg 28528188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 139
Target Start/End: Original strand, 13820549 - 13820594
Alignment:
Q  94 acacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13820549 acacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcagatgat 13820594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 258
Target Start/End: Original strand, 21275457 - 21275517
Alignment:
Q  198 aagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21275457 aagccttagaagagtatggtttctgtctgaacataagcaagacaaagtatatggaatgtaa 21275517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32066970 - 32066879
Alignment:
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    ||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||| || |||||||||||||    
T  32066970 atgagtagaagcatgacatagtatatgtaatgtaattttagcaaaaggtgaagtagttctaccttagaggtgaaaattggagatcatatcat 32066879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 38205526 - 38205415
Alignment:
Q  51 taagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgct 150  Q
    |||| |||| || ||||| | ||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||| |||||| | ||||| ||||| | ||    
T  38205526 taagaccttgtctttttattgtagttttggatgtagttacgtaacatatccaagagtttgaaccgagatatatgttttttgtaaatgatatagtcctact 38205427  T
Q  151 tggtgagtcgag 162  Q
    || |||||||||    
T  38205426 tgatgagtcgag 38205415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 313
Target Start/End: Original strand, 52421048 - 52421102
Alignment:
Q  259 cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcatg 313  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  52421048 cagcaaaaggtgaagtatctctaccttataggtgaaagttagagatcatatcatg 52421102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 34827948 - 34827887
Alignment:
Q  64 ttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgc 125  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  34827948 ttttactttagttttggatgttcttacataacacatccaagagttagcatcaagatttatgc 34827887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32405336 - 32405252
Alignment:
Q  95 cacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatggga 179  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||| |||||| | ||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||| | || |||||||    
T  32405336 cacaaccaagagttagcacctaggtgtatgttttttgtagatgatgtagtcatgcgtggagagtcgaaggagaaattgaatggga 32405252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27451075 - 27450784
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27451075 caatagaactgcaccaagggtcaaccctaagtccttctctttttactttagttttggatgtactaacgaaacacatccaagagttaacaccgagatgtat 27450976  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27450975 gctttttgccgatgatgtagtcttgcttggtgagtcgagggaggagtcaaatgggaggctagagacctcgaggcaagccttagaagcgtatggtttccgc 27450876  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27450875 ttgagtagaagcaagacggagtatttggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtgggtataccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 27450784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 435612 - 435900
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  435612 caataggagtgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 435711  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    ||||||||||   ||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  435712 gctttttgca---gatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgc 435808  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  435809 ttgagtagaagcacgacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 435900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23907204 - 23906912
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23907204 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacaaccaagagttagcaccgagatgtat 23907105  T
Q  124 gctttttgc-atatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccg 222  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23907104 gctttttgcaagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgaggaaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccg 23907005  T
Q  223 catgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaacagcaa---aaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23907004 cttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcaacggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 23906912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1777917 - 1777626
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1777917 caataggattgcaccaagggtcaaccctaaatccttatcttttaactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 1777818  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  1777817 gctttatgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaaaccttagaagcgtatggattccgc 1777718  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  1777717 ttgagtagaagcaatacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggaaatcatatcat 1777626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 48623429 - 48623138
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48623429 caataggattgcaccaaggttcaaccctaagttcttatctttttactttagttttggatgtattgacgtaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 48623330  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | | |||||||||||||||  | || ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  48623329 gctttttgcagatgatgtagtcttggtggatgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctatagatctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgc 48623230  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  48623229 ttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagagcatatcat 48623138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 92 - 312
Target Start/End: Original strand, 56374738 - 56374961
Alignment:
Q  92 gaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacct 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  56374738 gaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacct 56374837  T
Q  192 agaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgca 288  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  56374838 ggaggcaagccttagaagtgtatggattccgcttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttgga 56374937  T
Q  289 ggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||||    
T  56374938 ggtgaaagttggagagcatatcat 56374961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 259
Target Start/End: Original strand, 16002354 - 16002529
Alignment:
Q  84 tactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggct 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||    
T  16002354 tacttacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgttttttgcatatgacgtagtcttgcttggtgagttgagggaggaattgaacgggaggct 16002453  T
Q  184 agagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16002454 agagacctagagacaagccttagaagcgtatggtttgcgcttgagtagaagcaagacaaagtatatggaatataac 16002529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 309
Target Start/End: Original strand, 39707858 - 39708125
Alignment:
Q  40 agggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgat 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  39707858 agggttaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtacttacagaacacatccaagagtttgcaccgatatgtatgttttttgcagatgat 39707957  T
Q  140 ctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaaga 239  Q
     |||||||| |||||||||||||||||      || |||||||||||||| | | | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  39707958 gtagtcttgtttggtgagtcgagggag-----caacgggaggctagagacatggtgacaagccttagaagcgtatggtttctgcctgagtagaagcaaga 39708052  T
Q  240 caaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatat 309  Q
    |  |||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  39708053 cggagtatatggaatataacttcagcaaaaggagaattaggtctatcttggaggtgaaatttggagatcatat 39708125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 312
Target Start/End: Original strand, 53707242 - 53707465
Alignment:
Q  92 gaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacct 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  53707242 gaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacct 53707341  T
Q  192 agaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgca 288  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||   |||   |||||||||| ||||||||||| |    
T  53707342 ggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacggagtatatcgaatgtaacttcagtggaaggagaagtaggtctaccttgga 53707441  T
Q  289 ggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||||||  ||||||||||||    
T  53707442 ggtgaaagttgaagatcatatcat 53707465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31960588 - 31960425
Alignment:
Q  152 ggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatgg 251  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31960588 ggtgagtcgagggaggaactaaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacagagtatatgg 31960489  T
Q  252 aatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31960488 aatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 31960425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1212209 - 1212015
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1212209 caataggattgcaccaaggttcaaccctaagtccttatcttttcactttagttttggatgtacttacataacacatctaagagttagcaccgagatgtat 1212110  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtt 218  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  1212109 gctttttggagatgatgtagtcttgattggcgagtcgagggagaaattgaacgggaggctagaaacctagagacatgcctcagaagggtatggtt 1212015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 48174878 - 48174704
Alignment:
Q  141 tagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagac 240  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  48174878 tagtcttggtgggtgagtcgagagaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatgaattccgcttgagtagaagcaagac 48174779  T
Q  241 aaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
      ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  48174778 ggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 48174704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10776321 - 10776087
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||| | ||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    |||| ||||||||    
T  10776321 caataggattgcaccaaggttcaacaccaagcccttatcttttcattttagttttggatgtacttacggaacacattcaagagcggacaccaagatgtat 10776222  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||   || || | ||| ||||||||||||  |||||| ||||||    
T  10776221 gctttttgcagatgatatagtcctacatggagagtcgagagaggaattaaatgggaggtaggacacttggagacaagccttagaaatgtatggcttccgc 10776122  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa 258  Q
     |||| ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  10776121 ctgagcagaagcacgacatactatatggaatgtaa 10776087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35556173 - 35555989
Alignment:
Q  73 agttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagtta 172  Q
    |||||||||| |||| || |||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||| ||||||| ||| |  |||    
T  35556173 agttttggatgtacttacagaacacctccaagagcgagcaccaa-atgtatgctttttgtagatgatatagtcctacttggagagtcgaaggaaggatta 35556075  T
Q  173 aatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa 258  Q
    ||||||||| | ||| | | ||| ||||||||||||   |||||||| | | ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35556074 aatgggaggttggagtcttggagacaagccttagaaacatatggttttcacttgagtagaagcaagacagagcatatggaatgtaa 35555989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 30852809 - 30853031
Alignment:
Q  27 taggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgct 126  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |   ||| |||||| |||||||||||  | |||||||||| || ||    
T  30852809 taggactgcaccaagggtcaactctaagcccttatctttttactttagttttgaacgcacttacggaatacatccaagagccatcaccgagatgcatact 30852908  T
Q  127 ttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatg 226  Q
    ||||||  || ||  |||| | || || |||||||||||||||||||||| |||| |  |||        |||||||||||||  ||||| |||||| ||    
T  30852909 ttttgcggattatacagtcctactcggagagtcgagggaggagttaaatgtgaggttgaaga--------caagccttagaagcatatggcttccgcctg 30853000  T
Q  227 agtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac 259  Q
    ||||||||||||  | | |||||||||||||||    
T  30853001 agtagaagcaag--agattatatggaatgtaac 30853031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17666895 - 17666783
Alignment:
Q  56 ccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtg 155  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||| |    
T  17666895 ccttatctttttacattagttttggatgtacttacataacacatccaacaactagcaccgagatgtatgcattttgaatatgatgtagtcttaattggag 17666796  T
Q  156 agtcgagggagga 168  Q
     ||||||| ||||    
T  17666795 tgtcgaggaagga 17666783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Original strand, 53703990 - 53704062
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaaca 96  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  53703990 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgatggaaca 53704062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32911722 - 32911621
Alignment:
Q  30 gactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttt 129  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||||  | |||| ||||| ||||||||    
T  32911722 gactacaccaagtgtcaactctaagtccttatctttttgctttagttttggacatacttatggaacaaaaccaagagccaacaccaagatgcatgctttt 32911623  T
Q  130 tg 131  Q
    ||    
T  32911622 tg 32911621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 55769260 - 55769045
Alignment:
Q  43 gtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgc-tttttgcatatgatct 141  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||  || | ||||| | ||||| |||||||| || || |    
T  55769260 gtcaaccctgaacccttatctttttactttagttttggatgtatttatggaacacatccaagacctaactccgagttctatgcttttttgcagataatgt 55769161  T
Q  142 agtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagaca 241  Q
    |||| || |||| || ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || || ||||||||||| | |||||| |||||| | ||||||| ||| | |    
T  55769160 agtcctgtttggagattcgagagaggaattgaatgggagattggagactta-agacaagccttagaggtgtatggcttccgcctaagtagaaacaataaa 55769062  T
Q  242 aagtatatggaatgtaa 258  Q
     |||||||  |||||||    
T  55769061 gagtatataaaatgtaa 55769045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 181
Target Start/End: Original strand, 3272811 - 3272966
Alignment:
Q  26 ataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgc 125  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||| || | |  ||||  ||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  3272811 ataggattgcaccaaggatcaaccctaagtctttatatttttacattagttttggatctatttatagaacgaatctaagcgttagcattgagatgtatgc 3272910  T
Q  126 tttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggagg 181  Q
    |||||| | || || |||| |||||| | |||||||||||||| || |||| ||||    
T  3272911 tttttgtagataatatagtattgcttagagagtcgagggaggaattgaatgagagg 3272966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 47265887 - 47265815
Alignment:
Q  243 agtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  47265887 agtatatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggaggtcatatcat 47265815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 139
Target Start/End: Original strand, 21060186 - 21060268
Alignment:
Q  57 cttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| || |  | | |||||||  |||||||||||||    
T  21060186 cttatccttttactttagttttggatgtacttacataacacatccaagagataacttccaaatgtatgtattttgcatatgat 21060268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 312
Target Start/End: Original strand, 33226808 - 33226880
Alignment:
Q  243 agtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||||||||||||   |||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33226808 agtatatggaatgtaacttcagcggaaggacaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 33226880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 55833516 - 55833301
Alignment:
Q  43 gtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgc-tttttgcatatgatct 141  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||  || | ||||| | ||||| |||||||  || || |    
T  55833516 gtcaaccctgaacccttatctttttactttagttttggatgtgtttatggaacacatccaagacctaactccgagttctatgcttttttgcggataatgt 55833417  T
Q  142 agtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagaca 241  Q
    |||| || |||| || ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || || ||||||||||| | |||||| |||||| | ||||||| ||| | |    
T  55833416 agtcctgtttggagattcgagagaggaattgaatgggagattggagactta-agacaagccttagaggtgtatggcttccgcctaagtagaaacaataaa 55833318  T
Q  242 aagtatatggaatgtaa 258  Q
     |||||||  |||||||    
T  55833317 gagtatataaaatgtaa 55833301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 145
Target Start/End: Original strand, 15183461 - 15183556
Alignment:
Q  50 ctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtc 145  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||  || |||||||||||  |||||| | || |||| |||||||||||||| |||||    
T  15183461 ctaagcccttatcttttcactttagttttggatgtatttacataatacatccaagagcgagcaccaatatatatgttttttgcatatgatatagtc 15183556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 136
Target Start/End: Original strand, 45482959 - 45483033
Alignment:
Q  64 ttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccg--agatgtatgctttttgcatat 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || | |||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  45482959 ttttactttagttttggatgtacttacgaaacacatcaaaaaattagcaccgaaagatatatgttttttgcatat 45483033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 145
Target Start/End: Original strand, 42037335 - 42037409
Alignment:
Q  71 ttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtc 145  Q
    |||||||||||| |||| |   ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  42037335 ttagttttggatgtacttagaaaacacatccaagagcgagcaccgagatgtattttttttgcagatgatatagtc 42037409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17668193 - 17668008
Alignment:
Q  56 ccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtg 155  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| | |||| ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |    
T  17668193 ccttatctttttacatttgttttgggtgtacttacgaaacacatccaacaactagcaccaagatgtatgtgttttgaagatgatgtagtcttaatttgag 17668094  T
Q  156 agtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagaca 241  Q
     ||| |||||||  || ||||||| | | ||||| | ||| |||| |||||||| |||||  ||  |  |||||||||||||||||    
T  17668093 tgtcaagggagggattgaatgggatgttggagacttggagacaagtcttagaagcgtatgacttttgtctgagtagaagcaagaca 17668008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 312
Target Start/End: Original strand, 16002548 - 16002600
Alignment:
Q  260 agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  16002548 agcaaaaggagaagttagtctaccttggaggtaaaagttggaaatcatatcat 16002600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 130
Target Start/End: Original strand, 37250669 - 37250705
Alignment:
Q  94 acacatccaagagttagcaccgagatgtatgcttttt 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37250669 acacatccaagagttagcgccgagatgtatacttttt 37250705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 54788109 - 54787913
Alignment:
Q  64 ttttactttagtttt-ggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgag 162  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||  |||| || ||| ||||| ||| ||||| ||  || |||||| ||||| ||||| | ||||  || |||||    
T  54788109 ttttactttagtttttggatttacttacataacatatacaaaagttaacactgagatatacactctttgcagatgatgtagtccttcttgaagactcgag 54788010  T
Q  163 ggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac 259  Q
    |||  | || ||||| ||| ||| ||| | ||| ||| ||||||||| |||||  ||  || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  54788009 ggataaatttaatggaaggttagggacttggagacaaaccttagaagtgtatgacttatgcgtgagtggaagcaagacagagtgtatggaatgtaac 54787913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42854915 - 42854615
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42854915 caataggactgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtcctgatagaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 42854816  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42854815 gctttttgcagatgatgtagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctggaggcaagccttaaaagcgtatggtttccgc 42854716  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac------------agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatca 311  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  42854715 ctgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagcaaaaggagaagtgggtctaccttggaggtgaaaggtggagatcatatca 42854616  T
Q  312 t 312  Q
    |    
T  42854615 t 42854615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36566143 - 36565852
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566143 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 36566044  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36566043 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgc 36565944  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaacagcaa---aaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36565943 ttgagtagaagcaagatagagtatatgaaatgtaacttcaacggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 36565852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15216174 - 15215881
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15216174 caataggactgcaccaaggatcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtactgacagaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 15216075  T
Q  124 g--ctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttcc 221  Q
    |   |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||    
T  15216074 gttttttttgcagacgatgtagtcttgtttggtgagtcgagggaggacttaagtgggaggctagagacctggaggcaaaacttagaagcatatggtttcc 15215975  T
Q  222 gcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    || ||||||||||||||||  |||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  15215974 gcctgagtagaagcaagacggagtacatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagtgggtctaccatggaggtgaaagttggagatcatatcat 15215881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 36544532 - 36544823
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36544532 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagttcttatctttttactttagttttggatgtattgatgcaacacatccaagagttagcactgagatgtat 36544631  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |    
T  36544632 gcttttttcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctagaggcaagccttagaaccgtatggattccac 36544731  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36544732 ttgagtagaagcaagacagagtatatggaatgtaactttagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 36544823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12492744 - 12492453
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492744 caataggattgcaccaagggtcaatcttaagttcttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 12492645  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  12492644 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaactggaggctagagacctggaggtaagccttagaagcgtatggattccgc 12492545  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12492544 ttgagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggataagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 12492453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 259
Target Start/End: Original strand, 13984034 - 13984245
Alignment:
Q  46 aaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtc 145  Q
    |||||||||  |||| ||||||| || | ||||| || |||| ||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||    
T  13984034 aaccctaagcacttacccttttaattaa-ttttgaatgtacttacgaaacatatccaagatttagaaccaagatgtatg-tttttgcagatgaagtagtc 13984131  T
Q  146 ttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagt 245  Q
     ||||| | |||||||||||| | || ||||| | | ||||||| | ||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  13984132 ctgctttgagagtcgagggagaaattgaatggaaagttagagacttggagacaagccttagaagtgtatgacttccgcatgagtagaagcaagacagagt 13984231  T
Q  246 atatggaatgtaac 259  Q
    ||||||||||||||    
T  13984232 atatggaatgtaac 13984245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18850019 - 18849782
Alignment:
Q  25 aataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatg 124  Q
    ||||||| | |||| | |||||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||    
T  18850019 aataggattgcaccaacggtcaaccttaattctttatctttttattttagttttagatatatttacggaacacacccaacaattagcaccaagatgtatg 18849920  T
Q  125 cttttt---gcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttcc 221  Q
     |||||   ||| ||||| |||||||| |||| |||| || |||||| || || || ||||||||||| | ||| |||| |||| ||| |||  ||||||    
T  18849919 tttttttttgcagatgatgtagtcttgtttggagagttgaaggaggaatttaacggtaggctagagacttggagacaagtcttacaagcgtaatgtttcc 18849820  T
Q  222 gcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac 259  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18849819 acttgagtagaaccaagacaaagtatatggaatataac 18849782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 311
Target Start/End: Original strand, 13588820 - 13589110
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||  | ||| ||||  |||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13588820 caataggattgcaccaagggtcaaccataatccattacccttaaacttcagttttggatatgtttacggaacatatccaagagtttgcaccaagatgtat 13588919  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    ||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| || | || | ||| ||| ||| ||||| |   || ||||||    
T  13588920 gctttttggtgatgatgtagtcttgcttggagagtcgatggaggaattgaatgggaggttaaacacttggagacaaccctaagaagggagaggcttccgc 13589019  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatca 311  Q
     |||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||   ||| ||||||||||||   || |   || |||||||||| |||||||||||||    
T  13589020 ctgagtacaagcaagatagagtttatggaatgcaacttcagtaaaaggagaagtatttccatgatggaggtgaaagtgagagatcatatca 13589110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41445190 - 41444972
Alignment:
Q  40 agggtcaaccctaagtccttatcct-tttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatga 138  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||| | ||||    
T  41445190 agggttaaccctaagcccttattttgtttactttaattttggatgtaattacgaaacacatccaaaagctagcaccgagatgtctattttttgtagatga 41445091  T
Q  139 tctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaag 238  Q
    | ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| || |  || | | ||| | ||||||| |||  ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  41445090 tgtagtcctacttggagagtcgagggaggaattaaatggg-ggtttaaggcttggagacgagccttataaggatattgcttccgcatgagtaaaagcaag 41444992  T
Q  239 acaaagtatatggaatgtaa 258  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  41444991 ataaagtatatggaatgtaa 41444972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4033204 - 4033105
Alignment:
Q  216 gtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  4033204 gtttccgcctgagtagaaacaagacggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagtagaaggtctaccttggagatgaaagttggagatcatatcat 4033105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30579091 - 30578973
Alignment:
Q  64 ttttactttagttttg-gatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgag 162  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| || |||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||| | ||| | ||||| | ||||  ||||||||    
T  30579091 ttttactttagttttttgatgtacttacagaacacatacaagagctagcactgagatgtttgctttttgaagatggtgtagtccttcttgaagagtcgag 30578992  T
Q  163 ggaggagttaaatgggagg 181  Q
    |||||| || ||| |||||    
T  30578991 ggaggaattgaattggagg 30578973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 3284884 - 3285042
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatac----tgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgcttttt 130  Q
    |||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||||| |||    | ||||||||||| |||||   |||| | |||| ||||||||||    
T  3284884 caccaaggttcaacactaagcccttatcttttcaccttagttttggatgtacttaattacggaacacatacaagaaagagcatcaagatttatgcttttt 3284983  T
Q  131 gcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagac 189  Q
    ||| ||||  ||||| |  | || ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  3284984 gcagatgacatagtcctattcggagagtcgaaggaagaattaaatgggaggctggagac 3285042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 255
Target Start/End: Original strand, 5057259 - 5057312
Alignment:
Q  202 cttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatg 255  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  5057259 cttagaagtgtatggcttccgcctgagtagaagcaaaccaaagtatattgaatg 5057312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8880131 - 8880045
Alignment:
Q  229 tagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||  | ||||||||||    
T  8880131 tagaagcaagacggagtacatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagtaggtcgaccgtgaaggtgaaagttgaaaatcatatcat 8880045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 30848 - 31139
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30848 caataggactgcaccaagggtcaatcctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 30947  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30948 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagtgtatggattccgc 31047  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  31048 ttgagtagaagcaagactgagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaagtgaaagttggagatcatatcat 31139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 51448611 - 51448320
Alignment:
Q  24 caataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtat 123  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51448611 caataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcatcgagatgtat 51448512  T
Q  124 gctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgc 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||  | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  51448511 gctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagttgagggaggaagtgaacgggacgctagagacctagaggcaagtcttagaagcgtatggattccgc 51448412  T
Q  224 atgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| |||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  51448411 ttgagtagaagcaagacggagtatatgaaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 51448320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 92 - 312
Target Start/End: Original strand, 25190827 - 25191050
Alignment:
Q  92 gaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacct 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25190827 gaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcagatgatgtagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacct 25190926  T
Q  192 agaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgca 288  Q
    ||||||| |||||||||| || || ||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25190927 agaggcacgccttagaagtgtgtgatttccgattaagtagaagcaagacggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtgggtctaccttgga 25191026  T
Q  289 ggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  25191027 ggtgaaagttggagatcatatcat 25191050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 312
Target Start/End: Original strand, 52138219 - 52138499
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcat 134  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  52138219 caccaaggatcaaccctaagtccttatctttttactttagttttggatgtattgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttacac 52138318  T
Q  135 atgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaag 234  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||    
T  52138319 atgatgtagtcttggtgggtgagtcaagggaggaagggaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattctgtttgagtagaag 52138418  T
Q  235 caagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  52138419 caagacggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 52138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 312
Target Start/End: Original strand, 38849501 - 38849765
Alignment:
Q  51 taagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgct 150  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  38849501 taagtccttatcttttttatttagttttggatgtacgggcggaacacgtccaagagtaagcaccgagatgtatgctttttgtagatgatgtagtcttgct 38849600  T
Q  151 tggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatg 250  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||| || |||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||  ||||||||    
T  38849601 tggtgagtcgaaggaggaattgaataggaggctagagatctggaggcaagccctataatcgtatggtttccgcttgagtaaaagtaagacggagtatatg 38849700  T
Q  251 gaatgta---acagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38849701 gaatgtaactacatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 38849765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 312
Target Start/End: Original strand, 19736589 - 19736837
Alignment:
Q  64 ttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagg 163  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| |||| ||||    
T  19736589 ttttactttagttttggatgt---gacggaacacatccaagagttagcaccaagatgtatgctttttgcagatgatgcagtcctgcttggagagttgagg 19736685  T
Q  164 gaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac---a 260  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  19736686 gaggaattgaatgggagattagagacttagagacaagccttagaagtgtatggcatccgccttagtagaagcaagacagagtatatggaatgtaacttca 19736785  T
Q  261 gcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||||   ||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19736786 gcaaaaggcagagtagtcctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 19736837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 298
Target Start/End: Original strand, 19757407 - 19757641
Alignment:
Q  64 ttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagg 163  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| |||| ||||    
T  19757407 ttttactttagttttggatgt---gacggaacacatccaagagttagcaccaagatgtatgctttttgcagatgatgcagtcctgcttggagagttgagg 19757503  T
Q  164 gaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac---a 260  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  19757504 gaggaattgaatgggaggttagagacttggagacaagccttagaagcgtatggcatccgccttagtagaagcaagacagagtatatggaatgtaacttta 19757603  T
Q  261 gcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagtt 298  Q
    ||||||||  |||| |  |||||||| |||||||||||    
T  19757604 gcaaaaggcaaagtagtcctaccttggaggtgaaagtt 19757641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 47542521 - 47542322
Alignment:
Q  116 agatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatg 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  47542521 agatgtatgctttttgcagatgatgtagtcttggtgggtgagtcgagggaggaagtgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatg 47542422  T
Q  216 gtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    | |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  47542421 gattccgcttgagtagaagcaagacggagtgtatggaatgtaacttcagcagaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatttcat 47542322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 312
Target Start/End: Original strand, 29816896 - 29817176
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcat 134  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  29816896 caccaaggctcaaccctaagcccttacctttttaccttaggtttggatgtacttacaaaacacatcctagagttagcaccgagatgtatgttttttgaag 29816995  T
Q  135 atgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaag 234  Q
    |||||  |||| | ||||| ||||| ||||| || || || | |||  || |||| ||||| ||||||||||||| || ||| ||| || ||| |||||     
T  29816996 atgatacagtcctacttggagagtcaagggatgaattgaacgcgagcttatagacttagagacaagccttagaagtgtgtggcttctgcctgaatagaat 29817095  T
Q  235 caagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29817096 caagacagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggtgaagttgttctatcttggaggtgaaagttggagatcatatcat 29817176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 280
Target Start/End: Original strand, 9258287 - 9258522
Alignment:
Q  45 caaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatcta-g 143  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||       || | |    
T  9258287 caaccccaagtccttatctttttactttagttttggatgtacttacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgttttctg-------tcgacg 9258379  T
Q  144 tcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctaga----ggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaaga 239  Q
    || |||||||||||||||||| | | || |  | |||||||||||||||||    | ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  9258380 tcatgcttggtgagtcgaggg-gaaattgaccgagaggctagagacctagaaattgacaagccttaaaagcgtgtggtttccgcctgagtagaagcaaga 9258478  T
Q  240 caaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtct 280  Q
    |  ||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||    
T  9258479 cggagtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtaggtct 9258522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 312
Target Start/End: Original strand, 48221201 - 48221455
Alignment:
Q  64 ttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagg 163  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||  ||| | | ||||||||     
T  48221201 ttttactttagttttagatgtacttgcaaaacacatccaagagttagcatcgagatgtacactctttgcatatgatgtagttctgcattgagagtcgaga 48221300  T
Q  164 gaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaag---agtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa-- 258  Q
    ||||| || ||||||||| |  |||| | ||| |||||||||||||   | |||||||||| | | |||||||| |||||| |||||||| |||||||      
T  48221301 gaggaattgaatgggaggttgaagacttggagacaagccttagaagcacattatggtttccacttaagtagaagtaagacatagtatatgtaatgtaatt 48221400  T
Q  259 -cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     |||||||||| | ||| | |||| |||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  48221401 tcagcaaaaggtgtagtagttctatcttagaggtgaaagttgaagatcatatcat 48221455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 50630222 - 50630066
Alignment:
Q  25 aataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatg 124  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| || || |||    
T  50630222 aataggattaccccaaggttcaaccctaagcccttatctttttactttagttttggatttacttacggaacacatccaagtgctagcaccaaggtgcatg 50630123  T
Q  125 ctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggagg 181  Q
     |||||||| | ||| ||||  | ||||| |||| || |||||| |||||| |||||    
T  50630122 atttttgcaaacgatatagttctacttggagagttgaaggaggaattaaataggagg 50630066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 312
Target Start/End: Original strand, 27917023 - 27917243
Alignment:
Q  96 acatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatct-agtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctaga 194  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | ||||| | |||| ||||| | ||  |||||||||| || |||| |||| || |||| |  |    
T  27917023 acatccaaaagttagtaccgagatgtatgagttttgaagatgatgttagtcctgcttagagacacgagggaggaattgaatgagaggttaaagacttgaa 27917122  T
Q  195 ggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggt 291  Q
    | ||||||||| ||| |||||  ||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   || |||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  27917123 gacaagccttataagcgtatgacttctgccagagtagaatcaagataaattatatggattgtaacttcagtaaaaggagaactagttctaccttgaaggt 27917222  T
Q  292 gaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  27917223 gaaagttggagatcatatcat 27917243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26592333 - 26592123
Alignment:
Q  33 tacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgc 132  Q
    ||||||||| || ||| |||||| |||||  |||||||||| ||| |||| |||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||      
T  26592333 tacacctagagttaactctaagttcttataattttactttactttgggatgtacttacagaacacgtccaagagttagcattgtgatgtatgtttttttt 26592234  T
Q  133 at----atgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgag 228  Q
     |    | ||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||||||  || | ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  26592233 ttcgagaagatgtagtcatggttggagagtcgagggaggaattaaataagaagttagagactttgagacaagccttagaagtgtataacttccgcatgag 26592134  T
Q  229 tagaagcaaga 239  Q
    ||||| |||||    
T  26592133 tagaaacaaga 26592123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 19757651 - 19757739
Alignment:
Q  227 agtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||  |||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19757651 agtagaagcaagacagagtatatggaatgtaactttagcaaaaggcaaagtagtcctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcat 19757739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 139
Target Start/End: Original strand, 805378 - 805446
Alignment:
Q  71 ttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgat 139  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  805378 ttagtttgggatgtgcttacggaacacatccaagagcaagcgccaagatgtatactttttgcatatgat 805446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43111717 - 43111627
Alignment:
Q  225 tgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||| |||||| | | ||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  43111717 tgagtagaagtaagacatagtatatgtaatgtaatttcagcaaaagaagaagtagttgtaccttagaggtgacagttggagatcatatcat 43111627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12456 - 12209
Alignment:
Q  61 tccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcg 160  Q
    |||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12456 tccttttaatttagttt-ggatgtattgacagaacacattcaagagttagcaccgagatgtatgctttttgaagatgatgtagtcttgcttggtgagtcg 12358  T
Q  161 agggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaa-- 258  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||| ||||||||      
T  12357 agggaggga------gggaggctagagacctagaggcaagccttagaagcgtatggtttccgcttgagtagaagtaagacggattatatagaatgtaact 12264  T
Q  259 -cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  12263 tcagcaaaaggagaagtaggtctaccttcgcggtgaaagttggagatcatatcat 12209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 88834 - 88550
Alignment:
Q  26 ataggactacacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagtta----gcaccgagatgt 121  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||    |||| |||||||    
T  88834 ataggattgcaccaagggtcaaccctaagtccttaactttttacattacttttggatgtactaaaggaacacatctaagggttaattagcactgagatgt 88735  T
Q  122 atgctttttgcatatgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttcc 221  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | | |||||||||||| || || || |||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  88734 atgctttttgcagatgatgtagtcttgttagatgagtcgagggatgaattgaacgggaggctagagatttggaggcaagccttagaagcgtatggtttcc 88635  T
Q  222 gcatgagta-------gaagcaagacaaagtatatggaatgtaa---cagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaag 296  Q
     ||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||    
T  88634 acatgagtacgtagaggaagcaagacagagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtaggtttaccttggagatgaaag 88550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 392 - 168
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcat 134  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||     
T  392 caccaagggtcaatcctaagcccttacctttttactttagttttggatgtacttacggaacacatccaagagttagcaccaagatgtacgactttggcaa 293  T
Q  135 atgatctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagacctagaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaag 234  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||| ||||||| | ||| | || |||||| | ||||   |||||| ||||||||||    
T  292 atgatgtagtcttgcttggaaaatcgagggaggaattgaatggaaggttagagacttggagactagtcttagatgcgtataacttccgcctgagtagaag 193  T
Q  235 caagacaaagtatatggaatgtaac 259  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  192 taagacaaaatatatggaatgtaac 168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 48795 - 48647
Alignment:
Q  43 gtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgctttttg---catatgat 139  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||| ||  | || || |||||||||||| ||| |||||||||||||    || |||||    
T  48795 gtcaaccctaagttcttatctttttcctttagttttg-atgtacttacaaagcatatgcaagagttagcatcgaaatgtatgctttttttttcagatgat 48697  T
Q  140 ctagtcttgcttggtgagtcgagggaggagttaaatgggaggctagagac 189  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  48696 gtagttttgcttggagagtcgagggaggaattgaatgggaggttagagac 48647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25104 - 25011
Alignment:
Q  35 cacctagggtcaaccctaagtccttatccttttactttagttttggatatactgacggaacacatccaagagttagcaccgagatgtatgcttt 128  Q
    |||| |||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||| || | || | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25104 caccaagggtcaagcctaaacctttatctttttactttagttttgaatgttcttatggaacacatctaagagttagcaccgagatctattcttt 25011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 312
Target Start/End: Original strand, 5780 - 5863
Alignment:
Q  225 tgagtagaagcaagacaaagtatatggaatgtaacagcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    ||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5780 tgagtagaagcaatacagagtttatggaatgta----caaaaggagaagtagttatatcttggaggtgaaagttggagatcatatcat 5863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2960 - 2881
Alignment:
Q  236 aagacaaagtatatggaatgtaac---agcaaaaggagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcat 312  Q
    ||||| || |||||||||||||||   |||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2960 aagacgaaatatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtcagtctacattggaggtgaaagttggagatcatatcat 2881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University