View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18310_high_6 (Length: 331)

Name: NF18310_high_6
Description: NF18310
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18310_high_6
NF18310_high_6
[»] chr5 (89 HSPs)
chr5 (31-312)||(37705861-37706142)
chr5 (38-285)||(25904047-25904294)
chr5 (31-285)||(17072827-17073081)
chr5 (31-312)||(17818571-17818851)
chr5 (31-285)||(34530747-34531001)
chr5 (31-291)||(40221460-40221720)
chr5 (31-245)||(18511293-18511507)
chr5 (31-245)||(25804009-25804223)
chr5 (31-288)||(10529180-10529437)
chr5 (32-279)||(10474405-10474652)
chr5 (31-285)||(24126800-24127054)
chr5 (31-285)||(31472694-31472948)
chr5 (31-288)||(39854425-39854681)
chr5 (44-286)||(31179464-31179707)
chr5 (31-285)||(39398074-39398327)
chr5 (31-245)||(16092281-16092495)
chr5 (41-286)||(31545023-31545269)
chr5 (31-287)||(4236571-4236827)
chr5 (31-287)||(21947969-21948224)
chr5 (31-287)||(25921554-25921810)
chr5 (31-287)||(26097675-26097930)
chr5 (41-286)||(31542678-31542923)
chr5 (41-286)||(38882048-38882294)
chr5 (41-245)||(2174903-2175107)
chr5 (32-287)||(12556006-12556260)
chr5 (31-285)||(1189690-1189949)
chr5 (31-245)||(18466668-18466882)
chr5 (31-245)||(18468995-18469209)
chr5 (38-286)||(31466067-31466314)
chr5 (31-245)||(6745053-6745266)
chr5 (38-279)||(18509406-18509648)
chr5 (71-285)||(20042994-20043208)
chr5 (67-285)||(20044954-20045172)
chr5 (31-245)||(27912520-27912734)
chr5 (31-287)||(2818416-2818673)
chr5 (31-252)||(16776135-16776355)
chr5 (31-287)||(18596589-18596843)
chr5 (49-253)||(6756470-6756674)
chr5 (41-245)||(15552229-15552434)
chr5 (41-245)||(6747290-6747493)
chr5 (31-287)||(36402409-36402665)
chr5 (81-287)||(26098382-26098588)
chr5 (31-245)||(27910435-27910648)
chr5 (41-245)||(34477143-34477349)
chr5 (31-285)||(695833-696075)
chr5 (41-245)||(21684542-21684746)
chr5 (33-277)||(2954368-2954613)
chr5 (41-245)||(34479508-34479714)
chr5 (31-207)||(658434-658610)
chr5 (49-278)||(21288715-21288949)
chr5 (31-279)||(6661267-6661511)
chr5 (31-255)||(9020197-9020416)
chr5 (32-150)||(39798126-39798244)
chr5 (31-151)||(20505922-20506042)
chr5 (31-162)||(41585825-41585956)
chr5 (41-162)||(4410090-4410211)
chr5 (41-187)||(10586873-10587020)
chr5 (31-167)||(2723964-2724091)
chr5 (47-242)||(20053834-20054020)
chr5 (147-287)||(20507659-20507799)
chr5 (41-133)||(10749796-10749889)
chr5 (31-187)||(17413248-17413402)
chr5 (41-133)||(3373227-3373320)
chr5 (41-133)||(10757273-10757365)
chr5 (31-285)||(36208524-36208774)
chr5 (31-147)||(15143547-15143664)
chr5 (41-133)||(15354665-15354757)
chr5 (41-133)||(15356941-15357033)
chr5 (41-133)||(23665140-23665232)
chr5 (41-133)||(23793355-23793447)
chr5 (61-312)||(42770691-42770934)
chr5 (41-133)||(38960222-38960314)
chr5 (70-199)||(4754188-4754312)
chr5 (72-178)||(34033691-34033797)
chr5 (41-126)||(23741949-23742034)
chr5 (91-199)||(2144706-2144811)
chr5 (189-245)||(4410045-4410101)
chr5 (91-210)||(29748370-29748485)
chr5 (235-285)||(2723911-2723961)
chr5 (31-85)||(42770954-42771008)
chr5 (190-287)||(41585946-41586043)
chr5 (91-178)||(15224911-15224997)
chr5 (70-178)||(31782578-31782690)
chr5 (70-147)||(35430259-35430338)
chr5 (94-132)||(1170811-1170849)
chr5 (94-132)||(2298145-2298183)
chr5 (94-132)||(35385596-35385634)
chr5 (91-132)||(10627364-10627405)
chr5 (38-129)||(4897828-4897920)
[»] chr1 (97 HSPs)
chr1 (31-305)||(18307033-18307307)
chr1 (31-312)||(6756444-6756724)
chr1 (31-285)||(11457558-11457812)
chr1 (31-312)||(9241169-9241450)
chr1 (39-287)||(13215023-13215271)
chr1 (31-312)||(31422956-31423238)
chr1 (31-285)||(50076755-50077009)
chr1 (31-285)||(50078904-50079158)
chr1 (31-287)||(16428595-16428851)
chr1 (31-287)||(38925561-38925817)
chr1 (31-278)||(17186211-17186458)
chr1 (31-288)||(12302588-12302850)
chr1 (41-278)||(20302410-20302647)
chr1 (31-254)||(50307629-50307853)
chr1 (31-286)||(51749982-51750237)
chr1 (31-285)||(18839531-18839785)
chr1 (39-284)||(25251366-25251611)
chr1 (31-279)||(39462469-39462717)
chr1 (31-287)||(41646862-41647118)
chr1 (32-287)||(6995784-6996039)
chr1 (31-286)||(10399911-10400166)
chr1 (31-287)||(17324719-17324975)
chr1 (31-287)||(28998336-28998592)
chr1 (31-287)||(29004052-29004308)
chr1 (31-287)||(3579699-3579957)
chr1 (31-285)||(31489859-31490111)
chr1 (41-286)||(16226110-16226356)
chr1 (31-245)||(47906254-47906468)
chr1 (31-285)||(50248655-50248909)
chr1 (31-279)||(14098053-14098301)
chr1 (31-286)||(6822958-6823212)
chr1 (38-287)||(15823488-15823737)
chr1 (41-286)||(20291400-20291645)
chr1 (31-279)||(2617466-2617714)
chr1 (31-287)||(2949314-2949570)
chr1 (31-260)||(31425098-31425331)
chr1 (31-245)||(15294917-15295131)
chr1 (41-287)||(28840620-28840868)
chr1 (41-245)||(47179697-47179902)
chr1 (31-287)||(48665113-48665376)
chr1 (31-245)||(25127856-25128070)
chr1 (31-245)||(21948271-21948484)
chr1 (31-245)||(39932057-39932271)
chr1 (41-286)||(13761780-13762025)
chr1 (41-287)||(28842435-28842683)
chr1 (31-287)||(28207149-28207405)
chr1 (41-237)||(46431800-46431996)
chr1 (31-287)||(31735604-31735864)
chr1 (31-245)||(24325648-24325861)
chr1 (41-245)||(9463336-9463541)
chr1 (41-245)||(47177346-47177551)
chr1 (31-254)||(17318868-17319085)
chr1 (31-278)||(17324016-17324261)
chr1 (41-287)||(2510418-2510667)
chr1 (31-286)||(6823827-6824090)
chr1 (41-245)||(9459509-9459714)
chr1 (31-236)||(40133937-40134142)
chr1 (38-259)||(4131470-4131692)
chr1 (31-312)||(42922151-42922428)
chr1 (41-286)||(51752308-51752552)
chr1 (41-245)||(27337032-27337235)
chr1 (31-285)||(14183675-14183923)
chr1 (41-245)||(27339223-27339427)
chr1 (31-287)||(47451590-47451840)
chr1 (31-312)||(8347356-8347633)
chr1 (31-312)||(18800656-18800932)
chr1 (38-198)||(15669484-15669641)
chr1 (31-301)||(49495294-49495552)
chr1 (31-252)||(8349135-8349352)
chr1 (31-183)||(16432440-16432592)
chr1 (41-162)||(16231630-16231752)
chr1 (31-162)||(25248635-25248766)
chr1 (31-144)||(16429042-16429155)
chr1 (40-279)||(26520205-26520449)
chr1 (31-260)||(13125541-13125768)
chr1 (31-149)||(6115186-6115304)
chr1 (41-133)||(23785935-23786028)
chr1 (48-137)||(51757623-51757712)
chr1 (190-284)||(25248756-25248850)
chr1 (30-147)||(26613322-26613440)
chr1 (91-199)||(27916529-27916632)
chr1 (70-147)||(155788-155865)
chr1 (31-147)||(30738713-30738830)
chr1 (31-287)||(30790484-30790733)
chr1 (105-187)||(26332719-26332798)
chr1 (31-150)||(16561545-16561665)
chr1 (31-85)||(23816030-23816084)
chr1 (189-286)||(16231544-16231641)
chr1 (91-147)||(26332632-26332688)
chr1 (70-187)||(28279309-28279424)
chr1 (105-279)||(13127790-13127959)
chr1 (38-147)||(49959129-49959240)
chr1 (91-147)||(14353047-14353104)
chr1 (213-253)||(6115344-6115384)
chr1 (93-132)||(4144826-4144865)
chr1 (94-132)||(2232597-2232635)
chr1 (91-132)||(14997040-14997081)
[»] chr3 (122 HSPs)
chr3 (31-312)||(39715367-39715647)
chr3 (31-285)||(3314608-3314862)
chr3 (31-285)||(43423542-43423796)
chr3 (31-284)||(43421494-43421747)
chr3 (31-287)||(53917743-53917999)
chr3 (32-279)||(6561740-6561987)
chr3 (31-254)||(28102081-28102304)
chr3 (31-285)||(1626762-1627016)
chr3 (31-287)||(1313332-1313587)
chr3 (31-288)||(4308360-4308617)
chr3 (31-285)||(880530-880785)
chr3 (39-285)||(5926851-5927097)
chr3 (42-287)||(51943293-51943537)
chr3 (31-287)||(45882861-45883117)
chr3 (31-287)||(53915575-53915831)
chr3 (44-286)||(35777344-35777587)
chr3 (31-245)||(38890004-38890218)
chr3 (31-286)||(11170327-11170582)
chr3 (31-286)||(22114384-22114639)
chr3 (54-285)||(28100143-28100374)
chr3 (41-287)||(455825-456076)
chr3 (41-287)||(458202-458453)
chr3 (31-245)||(18099249-18099463)
chr3 (41-286)||(3859451-3859696)
chr3 (49-285)||(28180948-28181182)
chr3 (31-288)||(43228212-43228469)
chr3 (49-287)||(12268061-12268301)
chr3 (31-286)||(18096979-18097235)
chr3 (31-287)||(28761508-28761763)
chr3 (41-286)||(6065884-6066131)
chr3 (31-245)||(27101260-27101474)
chr3 (31-245)||(30005805-30006019)
chr3 (31-285)||(53468535-53468788)
chr3 (41-245)||(746721-746926)
chr3 (41-287)||(4103984-4104234)
chr3 (41-286)||(5191576-5191821)
chr3 (31-284)||(10956106-10956359)
chr3 (31-288)||(43226007-43226263)
chr3 (39-287)||(18162586-18162833)
chr3 (49-279)||(24979637-24979867)
chr3 (31-245)||(25533406-25533620)
chr3 (31-245)||(42990268-42990482)
chr3 (41-286)||(6063534-6063782)
chr3 (41-245)||(10621618-10621823)
chr3 (31-284)||(10958402-10958655)
chr3 (41-245)||(50493963-50494168)
chr3 (31-288)||(51727086-51727342)
chr3 (31-285)||(889852-890104)
chr3 (31-287)||(48361750-48362005)
chr3 (31-245)||(47148974-47149188)
chr3 (32-287)||(32264119-32264378)
chr3 (31-285)||(36011751-36012005)
chr3 (31-285)||(54691653-54691906)
chr3 (41-245)||(38210334-38210539)
chr3 (31-287)||(26720470-26720725)
chr3 (31-245)||(9604686-9604899)
chr3 (41-219)||(28413120-28413299)
chr3 (31-284)||(51674845-51675087)
chr3 (31-245)||(10084468-10084682)
chr3 (31-245)||(29956650-29956864)
chr3 (32-313)||(23636923-23637200)
chr3 (41-233)||(25388882-25389074)
chr3 (31-288)||(35918022-35918285)
chr3 (39-287)||(15780782-15781041)
chr3 (31-205)||(1321483-1321657)
chr3 (31-285)||(31151271-31151521)
chr3 (38-285)||(53591119-53591355)
chr3 (38-196)||(6484372-6484531)
chr3 (33-313)||(23633356-23633630)
chr3 (41-286)||(5522715-5522949)
chr3 (47-245)||(10191405-10191602)
chr3 (93-245)||(42992250-42992402)
chr3 (61-285)||(28137415-28137628)
chr3 (39-302)||(53597148-53597406)
chr3 (41-187)||(7606676-7606822)
chr3 (31-199)||(13420265-13420429)
chr3 (38-278)||(32219026-32219255)
chr3 (31-277)||(54884089-54884332)
chr3 (31-161)||(6231849-6231978)
chr3 (31-158)||(25688240-25688367)
chr3 (117-244)||(41849117-41849244)
chr3 (31-188)||(4666535-4666694)
chr3 (38-199)||(561863-562021)
chr3 (31-191)||(17795280-17795436)
chr3 (31-191)||(19103720-19103876)
chr3 (38-199)||(25635394-25635552)
chr3 (156-284)||(6231374-6231502)
chr3 (39-209)||(1673975-1674142)
chr3 (155-285)||(47701798-47701928)
chr3 (141-286)||(11163073-11163218)
chr3 (41-148)||(5886261-5886367)
chr3 (41-148)||(5899734-5899840)
chr3 (105-287)||(24177201-24177380)
chr3 (31-145)||(11168165-11168279)
chr3 (155-284)||(27635830-27635959)
chr3 (33-237)||(36871382-36871583)
chr3 (227-312)||(6484282-6484367)
chr3 (31-131)||(3306839-3306939)
chr3 (173-284)||(3306724-3306835)
chr3 (69-165)||(4560401-4560497)
chr3 (105-199)||(25633933-25634024)
chr3 (91-210)||(13419883-13419997)
chr3 (31-177)||(14634521-14634665)
chr3 (88-170)||(31021281-31021362)
chr3 (31-79)||(47701750-47701798)
chr3 (213-287)||(1321363-1321437)
chr3 (39-85)||(24181504-24181550)
chr3 (70-147)||(1620580-1620657)
chr3 (120-165)||(7606828-7606873)
chr3 (107-147)||(7768632-7768672)
chr3 (70-147)||(11066652-11066731)
chr3 (94-132)||(6303310-6303348)
chr3 (94-132)||(10094218-10094256)
chr3 (94-132)||(10100235-10100273)
chr3 (94-132)||(10201098-10201136)
chr3 (94-132)||(16462203-16462241)
chr3 (94-132)||(22626128-22626166)
chr3 (94-132)||(27544273-27544311)
chr3 (31-85)||(27635737-27635791)
chr3 (94-132)||(47883026-47883064)
chr3 (201-254)||(4560514-4560567)
chr3 (213-245)||(6719358-6719390)
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (32-312)||(1225139-1225419)
chr8 (38-312)||(27910988-27911261)
chr8 (38-312)||(27957407-27957680)
chr8 (31-285)||(27106978-27107232)
chr8 (39-287)||(14419280-14419528)
chr8 (31-285)||(30480584-30480838)
chr8 (31-287)||(13858566-13858821)
chr8 (31-287)||(14807749-14808005)
chr8 (31-287)||(32339303-32339563)
chr8 (39-285)||(14477276-14477522)
chr8 (31-284)||(36865538-36865789)
chr8 (41-287)||(4424016-4424262)
chr8 (31-287)||(15072708-15072965)
chr8 (41-287)||(27829295-27829541)
chr8 (38-285)||(5372266-5372512)
chr8 (41-287)||(27826984-27827230)
chr8 (41-286)||(18810707-18810952)
chr8 (69-285)||(33541507-33541723)
chr8 (31-287)||(15809213-15809472)
chr8 (31-245)||(608774-608988)
chr8 (41-286)||(44720842-44721088)
chr8 (41-237)||(43079650-43079847)
chr8 (31-287)||(15067979-15068235)
chr8 (31-287)||(28251648-28251904)
chr8 (41-245)||(24873271-24873476)
chr8 (41-245)||(43082013-43082218)
chr8 (41-245)||(28283310-28283514)
chr8 (31-287)||(3874004-3874264)
chr8 (46-245)||(22684752-22684951)
chr8 (31-285)||(25952521-25952774)
chr8 (31-287)||(41384743-41384998)
chr8 (32-313)||(15185797-15186073)
chr8 (108-310)||(26775176-26775378)
chr8 (31-312)||(31162186-31162463)
chr8 (91-253)||(5622879-5623041)
chr8 (31-287)||(41382671-41382916)
chr8 (31-254)||(21480545-21480756)
chr8 (122-285)||(35872555-35872713)
chr8 (31-285)||(21482322-21482564)
chr8 (41-286)||(18812892-18813126)
chr8 (31-195)||(15956051-15956211)
chr8 (31-187)||(43530213-43530369)
chr8 (31-255)||(3005713-3005932)
chr8 (33-162)||(181622-181754)
chr8 (67-257)||(37214317-37214517)
chr8 (185-287)||(3886153-3886255)
chr8 (113-210)||(31035144-31035238)
chr8 (174-245)||(12517248-12517319)
chr8 (237-304)||(14419784-14419851)
chr8 (105-189)||(2468261-2468341)
chr8 (70-187)||(31573847-31573961)
chr8 (31-147)||(31578359-31578476)
chr8 (33-150)||(31035252-31035370)
chr8 (190-287)||(181535-181632)
chr8 (31-80)||(2468211-2468260)
chr8 (47-132)||(13985176-13985262)
chr8 (88-132)||(2267161-2267205)
chr8 (105-147)||(33839077-33839120)
chr8 (213-287)||(2468361-2468435)
chr8 (94-132)||(9021251-9021289)
chr8 (94-132)||(16752666-16752704)
chr8 (94-132)||(16757411-16757449)
chr8 (94-132)||(17799568-17799606)
chr8 (94-132)||(28327908-28327946)
chr8 (94-132)||(28332631-28332669)
chr8 (94-132)||(28895502-28895540)
chr8 (70-132)||(30423212-30423274)
chr8 (204-287)||(43530122-43530209)
chr8 (91-147)||(13985954-13986011)
chr8 (242-314)||(6375960-6376032)
chr8 (70-147)||(17847661-17847740)
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (31-285)||(13057173-13057427)
chr6 (31-285)||(25477253-25477507)
chr6 (31-298)||(3390345-3390612)
chr6 (31-285)||(3629945-3630199)
chr6 (31-279)||(3632019-3632267)
chr6 (31-287)||(32279974-32280229)
chr6 (31-286)||(11983110-11983365)
chr6 (31-285)||(13039733-13039987)
chr6 (31-278)||(14458848-14459093)
chr6 (31-287)||(15530204-15530459)
chr6 (31-286)||(15541221-15541476)
chr6 (31-287)||(9019903-9020159)
chr6 (31-285)||(3233811-3234065)
chr6 (41-287)||(14507266-14507512)
chr6 (31-288)||(28241402-28241659)
chr6 (38-287)||(30728916-30729165)
chr6 (31-287)||(15532762-15533018)
chr6 (41-287)||(12195605-12195852)
chr6 (31-285)||(24338528-24338783)
chr6 (31-245)||(4816312-4816526)
chr6 (31-288)||(1230330-1230587)
chr6 (41-245)||(20915446-20915651)
chr6 (41-245)||(19704659-19704864)
chr6 (31-277)||(22490626-22490873)
chr6 (31-245)||(30967220-30967434)
chr6 (42-245)||(26065005-26065205)
chr6 (42-245)||(26084974-26085174)
chr6 (41-245)||(2628976-2629179)
chr6 (41-245)||(26932652-26932857)
chr6 (31-285)||(12161638-12161889)
chr6 (31-287)||(30034684-30034944)
chr6 (56-286)||(19227514-19227744)
chr6 (31-287)||(3027935-3028187)
chr6 (31-253)||(15719665-15719875)
chr6 (31-279)||(17012029-17012273)
chr6 (137-285)||(32447502-32447651)
chr6 (41-165)||(5273306-5273431)
chr6 (31-187)||(14466399-14466556)
chr6 (136-278)||(13870608-13870749)
chr6 (140-287)||(1072067-1072214)
chr6 (31-144)||(1069800-1069913)
chr6 (31-199)||(16455507-16455672)
chr6 (156-287)||(17852519-17852650)
chr6 (119-287)||(15346368-15346524)
chr6 (38-198)||(15367101-15367257)
chr6 (31-252)||(19696453-19696673)
chr6 (41-133)||(26066214-26066307)
chr6 (173-287)||(8995456-8995570)
chr6 (31-148)||(12186153-12186271)
chr6 (172-285)||(10584105-10584213)
chr6 (41-133)||(33308988-33309080)
chr6 (41-133)||(33311257-33311349)
chr6 (31-149)||(26945258-26945377)
chr6 (41-133)||(26068485-26068578)
chr6 (41-133)||(29754799-29754892)
chr6 (33-187)||(20526885-20527037)
chr6 (91-178)||(22858096-22858181)
chr6 (33-147)||(7542465-7542581)
chr6 (31-253)||(25078639-25078856)
chr6 (92-147)||(11138423-11138479)
chr6 (228-287)||(15367013-15367079)
chr6 (31-146)||(28037811-28037927)
chr6 (94-132)||(3577658-3577696)
chr6 (154-211)||(4595048-4595102)
chr6 (94-132)||(13878727-13878765)
chr6 (94-132)||(13883475-13883513)
chr6 (38-76)||(15346535-15346573)
chr6 (94-132)||(16785919-16785957)
chr6 (94-132)||(26887368-26887406)
chr6 (94-132)||(31248858-31248896)
chr6 (94-132)||(35201470-35201508)
chr6 (105-176)||(6843217-6843287)
chr6 (118-178)||(30445602-30445661)
[»] chr4 (106 HSPs)
chr4 (31-285)||(19095880-19096135)
chr4 (31-310)||(16453282-16453561)
chr4 (38-312)||(36378263-36378537)
chr4 (31-285)||(12395926-12396180)
chr4 (31-287)||(22802815-22803071)
chr4 (31-287)||(48486315-48486571)
chr4 (31-285)||(38928258-38928513)
chr4 (31-285)||(12400888-12401142)
chr4 (31-287)||(24888792-24889048)
chr4 (31-254)||(37313147-37313370)
chr4 (31-288)||(14633315-14633570)
chr4 (31-260)||(33415569-33415797)
chr4 (31-288)||(40637069-40637326)
chr4 (31-287)||(5198416-5198672)
chr4 (31-287)||(24878985-24879241)
chr4 (31-287)||(24880447-24880703)
chr4 (41-287)||(51015242-51015488)
chr4 (41-286)||(11434952-11435197)
chr4 (31-287)||(619528-619784)
chr4 (31-287)||(22800943-22801199)
chr4 (31-287)||(40091496-40091752)
chr4 (31-287)||(47274723-47274978)
chr4 (41-287)||(44599928-44600175)
chr4 (31-245)||(8631500-8631714)
chr4 (42-284)||(56030443-56030685)
chr4 (31-287)||(36919665-36919924)
chr4 (31-279)||(41997496-41997744)
chr4 (41-287)||(22044481-22044727)
chr4 (41-287)||(22046776-22047022)
chr4 (31-287)||(36921574-36921832)
chr4 (31-245)||(13543997-13544211)
chr4 (31-245)||(5637546-5637760)
chr4 (41-286)||(16934233-16934479)
chr4 (41-286)||(18847150-18847396)
chr4 (31-245)||(24348256-24348470)
chr4 (41-287)||(9148247-9148495)
chr4 (41-245)||(11006327-11006532)
chr4 (41-245)||(11008656-11008861)
chr4 (31-288)||(47868396-47868653)
chr4 (41-245)||(18709254-18709458)
chr4 (41-245)||(37089462-37089666)
chr4 (41-245)||(38409243-38409447)
chr4 (31-245)||(3824651-3824863)
chr4 (31-287)||(14787512-14787770)
chr4 (43-210)||(26086069-26086236)
chr4 (31-279)||(19322701-19322945)
chr4 (41-245)||(22782828-22783033)
chr4 (41-279)||(9176564-9176803)
chr4 (31-285)||(18409428-18409681)
chr4 (55-285)||(3937314-3937543)
chr4 (41-286)||(16931879-16932125)
chr4 (41-245)||(22780463-22780668)
chr4 (41-288)||(2484963-2485211)
chr4 (41-245)||(22132482-22132684)
chr4 (31-288)||(6764834-6765096)
chr4 (41-286)||(9174236-9174482)
chr4 (31-245)||(7941359-7941575)
chr4 (65-285)||(6132871-6133090)
chr4 (31-279)||(52942540-52942776)
chr4 (31-259)||(18534914-18535138)
chr4 (31-285)||(18537556-18537806)
chr4 (41-245)||(31849689-31849894)
chr4 (41-245)||(22134707-22134909)
chr4 (39-207)||(36380425-36380593)
chr4 (122-285)||(38270158-38270321)
chr4 (31-287)||(17662326-17662575)
chr4 (122-285)||(24446756-24446914)
chr4 (31-287)||(8756333-8756587)
chr4 (31-245)||(47210833-47211035)
chr4 (48-199)||(27499129-27499280)
chr4 (31-169)||(16455355-16455493)
chr4 (54-287)||(53405123-53405358)
chr4 (31-199)||(38890307-38890472)
chr4 (31-312)||(15032630-15032898)
chr4 (147-287)||(5100993-5101133)
chr4 (31-141)||(2891433-2891543)
chr4 (173-285)||(2891314-2891427)
chr4 (31-195)||(30136640-30136801)
chr4 (39-135)||(13547302-13547398)
chr4 (31-186)||(28453782-28453934)
chr4 (71-278)||(10112876-10113080)
chr4 (32-189)||(47150976-47151131)
chr4 (31-148)||(12102221-12102339)
chr4 (92-289)||(40999093-40999286)
chr4 (91-199)||(9863795-9863898)
chr4 (91-177)||(10114435-10114519)
chr4 (31-79)||(4215510-4215558)
chr4 (31-147)||(25357772-25357893)
chr4 (38-148)||(31983616-31983727)
chr4 (31-85)||(5635557-5635611)
chr4 (41-85)||(11437561-11437605)
chr4 (31-178)||(3982258-3982411)
chr4 (214-312)||(16455258-16455356)
chr4 (240-312)||(36380345-36380417)
chr4 (91-178)||(38208825-38208911)
chr4 (91-210)||(9022380-9022495)
chr4 (39-132)||(16185924-16186018)
chr4 (39-79)||(5101133-5101173)
chr4 (70-132)||(5336903-5336964)
chr4 (94-132)||(7050401-7050439)
chr4 (94-132)||(11853549-11853587)
chr4 (191-312)||(16186079-16186199)
chr4 (94-132)||(55822265-55822303)
chr4 (91-147)||(54906722-54906779)
chr4 (93-129)||(16489352-16489388)
chr4 (93-129)||(25699752-25699788)
[»] chr7 (96 HSPs)
chr7 (31-285)||(44724533-44724787)
chr7 (38-285)||(11355212-11355459)
chr7 (31-285)||(20137190-20137444)
chr7 (39-285)||(21678020-21678266)
chr7 (31-285)||(21679981-21680235)
chr7 (31-285)||(4296015-4296271)
chr7 (32-287)||(443547-443802)
chr7 (32-287)||(13099558-13099813)
chr7 (31-285)||(39146068-39146322)
chr7 (32-284)||(37412209-37412462)
chr7 (31-287)||(27306311-27306566)
chr7 (31-278)||(24748555-24748802)
chr7 (31-287)||(42331078-42331336)
chr7 (31-285)||(25276095-25276349)
chr7 (31-260)||(24258442-24258671)
chr7 (31-287)||(31435128-31435384)
chr7 (31-287)||(38393934-38394194)
chr7 (31-245)||(20297356-20297570)
chr7 (41-286)||(1049386-1049631)
chr7 (31-260)||(21592224-21592453)
chr7 (31-298)||(42223097-42223366)
chr7 (31-287)||(35581-35837)
chr7 (31-245)||(18345535-18345749)
chr7 (31-245)||(48457647-48457861)
chr7 (41-286)||(40836833-40837078)
chr7 (31-287)||(44516-44772)
chr7 (41-245)||(1047015-1047219)
chr7 (31-245)||(9679053-9679267)
chr7 (41-287)||(31156001-31156248)
chr7 (41-245)||(7351742-7351947)
chr7 (39-285)||(9680768-9681020)
chr7 (38-252)||(27832721-27832936)
chr7 (31-245)||(7470103-7470317)
chr7 (31-245)||(7472061-7472275)
chr7 (31-245)||(20626032-20626246)
chr7 (31-245)||(20629923-20630137)
chr7 (31-245)||(20642342-20642556)
chr7 (31-313)||(22828714-22828996)
chr7 (31-245)||(28487547-28487761)
chr7 (41-245)||(7349363-7349568)
chr7 (31-287)||(11757176-11757438)
chr7 (31-287)||(20299406-20299668)
chr7 (31-284)||(21990106-21990358)
chr7 (31-287)||(28485514-28485774)
chr7 (31-245)||(1849975-1850189)
chr7 (41-286)||(25542484-25542727)
chr7 (46-254)||(26804554-26804765)
chr7 (31-287)||(3035669-3035932)
chr7 (31-245)||(3878571-3878785)
chr7 (38-286)||(22251638-22251878)
chr7 (31-240)||(40946327-40946536)
chr7 (31-313)||(20091626-20091904)
chr7 (39-312)||(7188470-7188739)
chr7 (31-235)||(43253598-43253801)
chr7 (31-170)||(7092293-7092432)
chr7 (31-312)||(24817435-24817710)
chr7 (121-287)||(18567565-18567731)
chr7 (38-210)||(24813587-24813755)
chr7 (31-170)||(7094541-7094679)
chr7 (39-284)||(24465503-24465737)
chr7 (82-287)||(22392425-22392618)
chr7 (41-161)||(38396713-38396833)
chr7 (41-133)||(2935374-2935467)
chr7 (82-210)||(11081540-11081663)
chr7 (41-133)||(1606486-1606578)
chr7 (33-210)||(6048903-6049077)
chr7 (41-133)||(9027284-9027376)
chr7 (41-133)||(22137184-22137276)
chr7 (41-133)||(40552211-40552303)
chr7 (91-178)||(11084438-11084523)
chr7 (41-133)||(22108173-22108265)
chr7 (31-88)||(22393873-22393930)
chr7 (41-133)||(40549933-40550025)
chr7 (91-147)||(16297166-16297222)
chr7 (31-177)||(6332283-6332428)
chr7 (31-85)||(6348936-6348990)
chr7 (31-85)||(26295601-26295655)
chr7 (162-287)||(30906264-30906387)
chr7 (178-239)||(38396316-38396377)
chr7 (91-171)||(12310157-12310236)
chr7 (91-178)||(26210603-26210688)
chr7 (94-148)||(2120881-2120937)
chr7 (91-132)||(21369642-21369683)
chr7 (91-144)||(40281519-40281572)
chr7 (190-245)||(7094662-7094717)
chr7 (94-132)||(3320194-3320232)
chr7 (94-132)||(3324942-3324980)
chr7 (94-132)||(7069780-7069818)
chr7 (94-132)||(7074787-7074825)
chr7 (94-132)||(15541139-15541177)
chr7 (94-132)||(25351353-25351391)
chr7 (94-132)||(25357047-25357085)
chr7 (94-132)||(25405393-25405431)
chr7 (94-132)||(25410130-25410168)
chr7 (94-132)||(42006663-42006701)
chr7 (154-199)||(6348859-6348903)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (38-287)||(40032146-40032395)
chr2 (39-284)||(15539564-15539809)
chr2 (31-285)||(28196557-28196811)
chr2 (31-287)||(42923590-42923848)
chr2 (33-279)||(3022089-3022335)
chr2 (31-285)||(19007560-19007814)
chr2 (31-284)||(6264230-6264479)
chr2 (31-277)||(34979660-34979906)
chr2 (41-287)||(42064433-42064679)
chr2 (41-286)||(13910135-13910380)
chr2 (41-286)||(27104718-27104962)
chr2 (31-286)||(19504427-19504681)
chr2 (31-285)||(11739641-11739895)
chr2 (31-285)||(17849037-17849291)
chr2 (31-285)||(45239058-45239316)
chr2 (31-287)||(21520774-21521032)
chr2 (31-287)||(23452318-23452578)
chr2 (31-288)||(45280065-45280323)
chr2 (31-287)||(6258898-6259152)
chr2 (31-284)||(19502092-19502345)
chr2 (31-287)||(42452701-42452955)
chr2 (41-245)||(35215676-35215881)
chr2 (41-245)||(35218053-35218258)
chr2 (31-252)||(44289149-44289370)
chr2 (31-287)||(22287417-22287673)
chr2 (31-254)||(17848394-17848614)
chr2 (41-286)||(24162313-24162548)
chr2 (31-285)||(31732858-31733100)
chr2 (31-285)||(11578190-11578439)
chr2 (31-285)||(14837193-14837441)
chr2 (31-287)||(43623661-43623905)
chr2 (31-287)||(18800395-18800639)
chr2 (108-285)||(22163106-22163282)
chr2 (31-312)||(22874035-22874304)
chr2 (105-245)||(38020162-38020302)
chr2 (32-195)||(28459272-28459435)
chr2 (132-287)||(22407591-22407746)
chr2 (38-210)||(17897334-17897502)
chr2 (31-210)||(20146690-20146866)
chr2 (31-155)||(5375427-5375550)
chr2 (41-312)||(37963030-37963289)
chr2 (41-133)||(36558954-36559047)
chr2 (41-133)||(36561231-36561324)
chr2 (41-133)||(45332271-45332364)
chr2 (31-195)||(27136206-27136368)
chr2 (150-245)||(5377629-5377724)
chr2 (31-149)||(40699429-40699548)
chr2 (91-287)||(35107218-35107407)
chr2 (63-162)||(38414194-38414291)
chr2 (191-284)||(38020064-38020157)
chr2 (95-187)||(43139395-43139484)
chr2 (31-132)||(20589763-20589865)
chr2 (91-187)||(27583480-27583573)
chr2 (221-287)||(12342681-12342747)
chr2 (31-79)||(22407535-22407583)
chr2 (70-147)||(17921754-17921833)
chr2 (91-148)||(26345661-26345718)
chr2 (31-79)||(7463029-7463077)
chr2 (91-187)||(35028595-35028688)
chr2 (31-69)||(22707834-22707872)
chr2 (31-148)||(15693958-15694078)
chr2 (105-147)||(34575265-34575308)
chr2 (237-312)||(40699203-40699278)
chr2 (94-132)||(2736205-2736243)
chr2 (94-132)||(2740941-2740979)
chr2 (94-132)||(17462436-17462474)
chr2 (94-132)||(20054909-20054947)
chr2 (94-132)||(22712660-22712698)
chr2 (94-132)||(22717369-22717407)
chr2 (70-132)||(28458949-28459011)
chr2 (94-132)||(39680045-39680083)
chr2 (94-132)||(39686983-39687021)
chr2 (94-132)||(45567409-45567447)
chr2 (91-147)||(7502975-7503032)
chr2 (91-147)||(30720754-30720811)
chr2 (48-85)||(38020312-38020349)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (31-288)||(183722-183977)
scaffold0005 (31-287)||(51960-52218)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (41-287)||(69382-69632)
scaffold0025 (134-245)||(73207-73318)
scaffold0025 (123-166)||(73160-73203)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (31-279)||(79144-79392)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (31-287)||(3948-4203)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (31-287)||(14970-15226)
scaffold0131 (31-245)||(14463-14677)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (41-286)||(6151-6397)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (41-286)||(2832-3077)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (31-288)||(41564-41821)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (31-287)||(11554-11810)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (41-245)||(34-239)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (31-285)||(79812-80066)
scaffold0004 (94-132)||(188386-188424)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (41-245)||(29164-29368)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (31-312)||(15903-16180)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (58-285)||(35593-35819)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (31-244)||(2036-2248)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (31-278)||(16732-16975)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (33-285)||(85184-85435)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (41-169)||(1543-1671)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (31-276)||(1724-1958)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (32-279)||(4773-5016)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (117-288)||(993-1169)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (41-133)||(22221-22313)
scaffold0140 (41-133)||(24496-24588)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (94-132)||(224819-224857)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 89)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 37705861 - 37706142
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705861 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 37705960  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37705961 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaagtctatacaaaccctagatttgtcgttgcctttctaaacctttatttc 37706060  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706061 agccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 37706142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 38 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25904294 - 25904047
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25904294 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagccctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 25904195  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  25904194 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccc 25904095  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  25904094 tctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 25904047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17073081 - 17072827
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17073081 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaagagattcaatcctaatagtgt 17072982  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  17072981 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 17072882  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  17072881 agccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 17072827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 17818571 - 17818851
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17818571 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcagtcttaatagtgt 17818670  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  17818671 ttcccaaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacgaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttc 17818770  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17818771 ag-cccctctttctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttataacaaaagtaactcccataaaattgtaacaaatct 17818851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 34530747 - 34531001
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34530747 caaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctaatagtgt 34530846  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  34530847 ttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacacttgtttc 34530946  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| || |||||    
T  34530947 agccccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttacagtaaaag 34531001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40221720 - 40221460
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221720 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 40221621  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  40221620 tttccaaggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 40221521  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactc 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40221520 agccccctctatctcaaggtttactctgagtcaatgtctatatttatagtaaaagtaactc 40221460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 18511293 - 18511507
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511293 caaaagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 18511392  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  18511393 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttc 18511492  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  18511493 agccccctctatctc 18511507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25804223 - 25804009
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804223 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 25804124  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||     
T  25804123 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttg 25804024  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  25804023 agccccctctatctc 25804009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Original strand, 10529180 - 10529437
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529180 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 10529279  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  10529280 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 10529379  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    | ||| ||||||||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  10529380 aacccactctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 10529437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 279
Target Start/End: Original strand, 10474405 - 10474652
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10474405 aaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtt 10474504  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||    
T  10474505 tcccaaggtgtatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaatccttgtttca 10474604  T
Q  232 gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10474605 gccccctctatttcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatag 10474652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24127054 - 24126800
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24127054 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgt 24126955  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  || ||||    
T  24126954 ttcccaaggtcaatcaatcttcaaaccctagtatttgttgacaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttc 24126855  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24126854 agccccatctatctcaaggtttacactgatataatgtctatatttatagtaaaag 24126800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 31472694 - 31472948
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||| | |||  || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31472694 caaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 31472793  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||     
T  31472794 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 31472893  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||    
T  31472894 agccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 31472948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39854681 - 39854425
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39854681 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgt 39854582  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  39854581 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 39854482  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    || |||||||||||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  39854481 ag-cccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 39854425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 286
Target Start/End: Original strand, 31179464 - 31179707
Alignment:
Q  44 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31179464 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31179563  T
Q  143 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31179564 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctat 31179663  T
Q  243 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||| |||| |  ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  31179664 ctcaaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 31179707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 39398074 - 39398327
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||   | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398074 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 39398173  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||    
T  39398174 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 39398272  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||| |||||    
T  39398273 cag-cccctctatctcaaggtttacaccggtacaatgtttatatttatagtaaaag 39398327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 16092281 - 16092495
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092281 caaaagagatctcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 16092380  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  16092381 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcaaagagacagactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 16092480  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    | |||||||||||||    
T  16092481 aaccccctctatctc 16092495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31545269 - 31545023
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31545269 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtttcccaagg 31545170  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||     
T  31545169 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctt 31545070  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||||| |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  31545069 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 31545023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4236827 - 4236571
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236827 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 4236728  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  4236727 tttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttc 4236628  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| |||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  4236627 agccccctttatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 4236571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21948224 - 21947969
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  || |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948224 caaaagagatatcaaggggttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgt 21948125  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  21948124 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 21948025  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    || ||||||||||||||  ||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  21948024 ag-cccctctatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 21947969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 25921554 - 25921810
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921554 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 25921653  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  25921654 ttcacaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 25921753  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  25921754 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 25921810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26097930 - 26097675
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |   | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26097930 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaaccaagagactcattcctaatagtgt 26097831  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26097830 ttcc-aaggtgaatcaaccctctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgccattctaaacctttatttc 26097732  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  26097731 agccccctctatctcaaagtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 26097675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31542923 - 31542678
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31542923 atcaatgggtt-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 31542825  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  31542824 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 31542725  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||||| |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  31542724 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 31542678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 38882294 - 38882048
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882294 atcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 38882195  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagc-cccctc 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||    
T  38882194 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccctc 38882095  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  38882094 tatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 38882048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2175107 - 2174903
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2175107 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggt 2175008  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  2175007 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 2174908  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  2174907 atctc 2174903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 287
Target Start/End: Original strand, 12556006 - 12556260
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12556006 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcttgtctaattcta-ccaaaactccaatctcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtt 12556104  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  12556105 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttatttca 12556204  T
Q  232 gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  12556205 gccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 12556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 1189690 - 1189949
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1189690 caaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcataatagtgt 1189789  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  1189790 ttcccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccgtagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttc 1189889  T
Q  231 agccccctcta----tctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||    |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||    
T  1189890 agccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 1189949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18466882 - 18466668
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466882 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 18466783  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  18466782 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 18466683  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  18466682 agccccctctatctc 18466668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18469209 - 18468995
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469209 caaaagagaaatcaatgggttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 18469110  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  18469109 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 18469010  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  18469009 agccccctctatctc 18468995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 286
Target Start/End: Original strand, 31466067 - 31466314
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31466067 gatatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatactgtttctcaa 31466165  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||     
T  31466166 ggtgaatcaaccgtcaaaccctggtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtcgttacttttttaaacctttgtttcagcccct 31466265  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    | |||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  31466266 tttatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 31466314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6745266 - 6745053
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745266 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 6745167  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  6745166 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacacttgtttc 6745068  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||| ||||||    
T  6745067 agccccctttatctc 6745053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Original strand, 18509406 - 18509648
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509406 gatatcaacgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 18509505  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagcccc- 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||     
T  18509506 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcccct 18509605  T
Q  237 ctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    || | |||||| |||||  |||||  || ||||||||||||||    
T  18509606 ctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatag 18509648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20043208 - 20042994
Alignment:
Q  71 ctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 170  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20043208 ctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttt 20043109  T
Q  171 ccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtcta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||  || | |||    
T  20043108 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacacttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctatgatacaaagccta 20043009  T
Q  271 tatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||| |||||    
T  20043008 tatttatagtaaaag 20042994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20045172 - 20044954
Alignment:
Q  67 ccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 166  Q
    ||||||||||||| |||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045172 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 20045073  T
Q  167 gttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  || |    
T  20045072 gttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttcctaaacccttgtttcagccccctctgtctcaaggtttgctctgatacaaag 20044973  T
Q  267 tctatatttatagcaaaag 285  Q
     |||||||||||| |||||    
T  20044972 cctatatttatagtaaaag 20044954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27912734 - 27912520
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912734 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 27912635  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  27912634 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctattatttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 27912535  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    ||| |||||||||||    
T  27912534 agcaccctctatctc 27912520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 2818416 - 2818673
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || |  || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2818416 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgt 2818515  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaa-ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| || |||    
T  2818516 tttccaaggtgaatcaaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttacctttctaaacccttgttt 2818615  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  2818616 cagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 2818673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16776355 - 16776135
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776355 caaaagagaaatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 16776257  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||    
T  16776256 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttgtaaacccttgtttc 16776157  T
Q  231 agccccctctatctcaaggttt 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  16776156 agccccctctatctcaaagttt 16776135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18596843 - 18596589
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18596843 caaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgt 18596744  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || | || ||| || ||||    
T  18596743 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccatattgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtt--gtctttatacccttgtttc 18596646  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  18596645 agccccctctatcccaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 18596589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6756674 - 6756470
Alignment:
Q  49 gttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6756674 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggagaatcaac 6756575  T
Q  149 cctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaag 248  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||     
T  6756574 cctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcagctccctctatctcaaa 6756475  T
Q  249 gttta 253  Q
    |||||    
T  6756474 gttta 6756470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15552434 - 15552229
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15552434 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 15552335  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||    
T  15552334 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagtcccctc 15552235  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  15552234 tatctc 15552229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6747493 - 6747290
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747493 atcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 6747394  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  6747393 gaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgtttcaaagagacaaattttatacaaactctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctct 6747295  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  6747294 atctc 6747290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 36402409 - 36402665
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||   | |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  36402409 caaaagagatatcaatggattacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtat 36402508  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||   ||||||||| || ||||    
T  36402509 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttcgtgattgtcattctaaacccttgtttc 36402608  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  36402609 agccccctctatctcaacgtttactctgatataaggtctatatttatagtaaaagta 36402665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 81 - 287
Target Start/End: Original strand, 26098382 - 26098588
Alignment:
Q  81 ccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagaca 180  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26098382 ccaaaaccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagaca 26098481  T
Q  181 aactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagc 280  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||||||||     
T  26098482 aactctatacaaaccctagtcttcttgttgccattctaaacccttatttcagccccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagt 26098581  T
Q  281 aaaagta 287  Q
    |||||||    
T  26098582 aaaagta 26098588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27910648 - 27910435
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27910648 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgt 27910549  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||    
T  27910548 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacc-ttgtttc 27910450  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    ||||||| |||||||    
T  27910449 agcccccgctatctc 27910435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 34477143 - 34477349
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34477143 atcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaag 34477242  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  34477243 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 34477342  T
Q  239 ctatctc 245  Q
    |||||||    
T  34477343 ctatctc 34477349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 696075 - 695833
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696075 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 695976  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||           ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  695975 tt-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaag-----------atacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 695888  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| |||||    
T  695887 atccccctttatctcaaggtttacactcatacaatgtctatattcatagtaaaag 695833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 21684542 - 21684746
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21684542 atcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggc 21684641  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  21684642 gaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctct 21684741  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  21684742 atctc 21684746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2954613 - 2954368
Alignment:
Q  33 aaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2954613 aaagagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtaactaagagactcaatcctaatagtgttt 2954514  T
Q  133 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 231  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||    
T  2954513 tccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaattatacacaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttca 2954414  T
Q  232 gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttat 277  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||    
T  2954413 tactcctctatctcaaagtttacactgatacaaagcctatatttat 2954368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 34479508 - 34479714
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||  |  |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34479508 atcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaag 34479607  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  34479608 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 34479707  T
Q  239 ctatctc 245  Q
    |||||||    
T  34479708 ctatctc 34479714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 658434 - 658610
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  658434 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgt 658533  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttg 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  658534 ttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 658610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21288949 - 21288715
Alignment:
Q  49 gttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 148  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21288949 gttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgttt-tcaaggtgaatcaac 21288851  T
Q  149 cctca------aaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 242  Q
    |||||      |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21288850 cctcaaaccctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctatttttattgttgctattctaaacccttatttcaaccccctctat 21288751  T
Q  243 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 278  Q
    |||||||||||| || ||  || |||||||||||||    
T  21288750 ctcaaggtttactctaattcaaggtctatatttata 21288715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Original strand, 6661267 - 6661511
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6661267 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 6661366  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||   ||||||||| || ||||    
T  6661367 ttcccatggtgaatcaacc--ccaactctagtgtttgttgccaaga-acaaactctatacataccctaattttcttgttg-acttctaaacccttgtttc 6661462  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  6661463 aaccctctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 6661511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9020416 - 9020197
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  9020416 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtgt 9020317  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||| |||||| |  | || ||||  ||||    
T  9020316 tttccaaggtgaatcaa--cttcaaccctagtgtttgttgccaagag--caactctatacaaaccctacttttg-tgttgcctcccaaacccttgttttc 9020222  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttaca 255  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||    
T  9020221 agctccctctagcacaaggtttaca 9020197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39798244 - 39798126
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798244 aaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 39798145  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccc 150  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39798144 tcccaaggtgaatcaaccc 39798126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 151
Target Start/End: Original strand, 20505922 - 20506042
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505922 caaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 20506021  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccct 151  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20506022 ttcccaaggtgaatcaaccct 20506042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 41585825 - 41585956
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  41585825 caaaagagatatcaatgacttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgt 41585924  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41585925 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 41585956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4410211 - 4410090
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410211 atcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 4410112  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagt 162  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  4410111 gaatcaacccacaaaccctagt 4410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10587020 - 10586873
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10587020 atcaatgggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgtttcccaaggt 10586921  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactcta 187  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||    
T  10586920 gaatcaaccctcaaaccctatcgtttgttcccaaagagacaaactcta 10586873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2724091 - 2723964
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2724091 caaaagagatatcaatgggttacaagaataaatcacccgcctaattctacc---------aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgt 2724001  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttg 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2724000 ttcccaaggtgaatcatccctcaaaccctagtgtttg 2723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20054020 - 20053834
Alignment:
Q  47 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||  || ||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054020 gggttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatctc--ca---aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 20053926  T
Q  147 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 242  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||| |||  ||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  20053925 a-cctc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatataaactctagtttttgtgttgc-cttctaaacccttgtttcagcgccctctat 20053834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 287
Target Start/End: Original strand, 20507659 - 20507799
Alignment:
Q  147 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctca 246  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20507659 acccttaaacccttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttaatttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 20507758  T
Q  247 aggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    | |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  20507759 aagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagta 20507799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10749889 - 10749796
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10749889 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 187
Target Start/End: Original strand, 17413248 - 17413402
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |   |||||||||| | |||  |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  17413248 caaaagagatatcaaagggttacaagaataagttttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtg 17413347  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 187  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17413348 tttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactcta 17413402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 3373227 - 3373320
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3373227 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtttc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10757365 - 10757273
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10757365 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc-cgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10757273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36208774 - 36208524
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||||||| || || ||    
T  36208774 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgttaccaagagactcaatcttagtaatg 36208675  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaa-cctttatt 228  Q
    ||||||||||||||||||  |   ||||||||| | |   ||  ||||| || |||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||  ||    
T  36208674 tttcccaaggtgaatcaa--caacaaccctagtttctcccgcttagaga-aatctctcta-aaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttt 36208581  T
Q  229 tcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||    
T  36208580 tcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 36208524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15143664 - 15143547
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15143664 caaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtg 15143565  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaa 147  Q
     |||| ||||||||||||    
T  15143564 cttccaaaggtgaatcaa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 15354665 - 15354757
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15354665 atcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 15356941 - 15357033
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15356941 atcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23665232 - 23665140
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23665232 atcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 23793355 - 23793447
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23793355 atcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42770934 - 42770691
Alignment:
Q  61 agtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 160  Q
    |||||| || ||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||   |||| ||    
T  42770934 agtctctcgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaatagt--ttcccatggtgaatgaacccc--aacctta 42770839  T
Q  161 gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgat 260  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||| || | || ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  42770838 gtgtttgttgccaagag-caaattctatataaacc-taattttgt-gttgccttccaaacccttgttttcagtcccctctatctcaaggtttactc-gat 42770743  T
Q  261 gtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
      || || ||||||||||| ||||||| | | |||||||||| || ||||||    
T  42770742 acaaagtttatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatct 42770691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 38960222 - 38960314
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38960222 atcaatgggttacaagaata-gtctcccgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4754312 - 4754188
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||  |  |||||||||  || |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  4754312 cctaattctatccaaagtcacaatctcttccagtgaccaagaggctcaattctaatagtgtttttcaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgtt 4754215  T
Q  170 gccaagagacaaactctatacaaaccctag 199  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4754214 gccaagag-caaactc--tacaaaccctag 4754188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 178
Target Start/End: Original strand, 34033691 - 34033797
Alignment:
Q  72 taattctatccaaaaccct-aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 169  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||    
T  34033691 taattctacccaaaatcctgaatctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtaaatcaatc--ccaacgctagtgtttgtt 34033788  T
Q  170 gccaagaga 178  Q
    |||||||||    
T  34033789 gccaagaga 34033797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 126
Target Start/End: Original strand, 23741949 - 23742034
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaata 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23741949 atcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaagagactccaatcctaata 23742034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Original strand, 2144706 - 2144811
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt-ttgttgccaagagacaaactctat 188  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |    
T  2144706 aatctcttcccgcgaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtgttgttgccaagag-caaactc--t 2144800  T
Q  189 acaaaccctag 199  Q
    |||||||||||    
T  2144801 acaaaccctag 2144811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4410101 - 4410045
Alignment:
Q  189 acaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4410101 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 4410045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29748485 - 29748370
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctata 189  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||   || ||| ||    
T  29748485 aatctattcccgtgaccaagagactcaatcctattagtgtttctccaagacgaatcaatcct--aaccctactgtttgttgccaagag---aattctcta 29748391  T
Q  190 caaaccctagatttgttgttg 210  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  29748390 caaaccctagttttcttgttg 29748370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2723961 - 2723911
Alignment:
Q  235 ccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2723961 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 2723911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42771008 - 42770954
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 85  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  42771008 caaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaa 42770954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 287
Target Start/End: Original strand, 41585946 - 41586043
Alignment:
Q  190 caaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||| |||||| |||   ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||   |||||||||||| |||||||    
T  41585946 caaaccctagttttgttcttgttattctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttactctgatacaaaacctatatttatagtaaaagta 41586043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Original strand, 15224911 - 15224997
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc-caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagaga 178  Q
    ||||||||| | | ||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  15224911 aatctcttcccatgaccaaaagactttatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaatcat--aaccctagtgtttgttgccaagaga 15224997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 178
Target Start/End: Original strand, 31782578 - 31782690
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt--cccaaggtgaatcaaccc---tcaaaccctagtgt 164  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||  |    | |||||||||||    
T  31782578 cctaattctacccaattccc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttttgttcaaggtgaatcaaaacaatcccaaccctagtgt 31782676  T
Q  165 ttgttgccaagaga 178  Q
    ||||||||||||||    
T  31782677 ttgttgccaagaga 31782690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35430338 - 35430259
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaa-accctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 147  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |   |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35430338 cctaattctacccaaagacccgaatctcttccctagaccaagagactcaattgtaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 35430259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1170849 - 1170811
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170849 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 2298145 - 2298183
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2298145 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2298183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 35385596 - 35385634
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35385596 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35385634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10627405 - 10627364
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10627405 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 10627364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 4897920 - 4897828
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctccc-gcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  4897920 gatatcaaatggttacaagaatcagtcttcaagcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagatactcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 97)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18307307 - 18307033
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307307 caaaagagatatcaatgcgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 18307208  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  18307207 ttcccgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 18307108  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaa 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18307107 agccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaaatagctcccataaaattgtaa 18307033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6756724 - 6756444
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  6756724 caaaagagatatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaaga--ctcaatcctaatagtgt 6756627  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || |||    
T  6756626 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgttt 6756527  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6756526 cagtcccctctatttcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagcaaaagtaactctcataaaattgtaacaaatct 6756444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 11457558 - 11457812
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11457558 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctcttcgcgtaaccaagagactcaatcataatagtgt 11457657  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  11457658 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtaattgttgccaagaatcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttc 11457757  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  11457758 agccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 11457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 9241169 - 9241450
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9241169 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaataatgt 9241268  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  9241269 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc-ttgtttc 9241367  T
Q  231 ag-ccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    || |||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  9241368 agcccccctctatcttaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaagtaacccccataaaattggaacaaatct 9241450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13215271 - 13215023
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13215271 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaag 13215172  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  13215171 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 13215072  T
Q  239 ctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||  ||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  13215071 ctatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 13215023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 31422956 - 31423238
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31422956 caaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgt 31423055  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||    
T  31423056 ttcccaaggtgaatcaactttcaaaccctagtgtttaatgccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 31423155  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  31423156 cagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcttatatttatagtaaaagtatctcccataaaattggaacaaatct 31423238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 50076755 - 50077009
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076755 caaaagagatatcaatggattacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 50076854  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | || ||||    
T  50076855 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttc 50076954  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  50076955 agccctttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 50077009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 50078904 - 50079158
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50078904 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgt 50079003  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  |||||||||| || ||||    
T  50079004 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttc 50079103  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  50079104 agccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 50079158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16428851 - 16428595
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428851 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 16428752  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  16428751 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 16428652  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||| | ||||| | ||||| |||   |||||||||||| |||||||    
T  16428651 agccccctctatctaatggtttgctctgatataaaacctatatttatagtaaaagta 16428595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 38925561 - 38925817
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925561 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 38925660  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  || ||||    
T  38925661 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaactcttgtttc 38925760  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  38925761 agccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 38925817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 278
Target Start/End: Original strand, 17186211 - 17186458
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17186211 caaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgt 17186310  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17186311 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttc 17186410  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 278  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||||||||    
T  17186411 agccccctctatctcaaggtttgctctgatacaaaatctatatttata 17186458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Original strand, 12302588 - 12302850
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302588 caaaagagatgtcaatgagttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 12302687  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  12302688 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttc 12302787  T
Q  231 agccccctcta----tctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    |||||||||||    |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  12302788 agccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtaa 12302850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20302647 - 20302410
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302647 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 20302548  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  20302547 gaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 20302448  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 278  Q
    ||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||    
T  20302447 atctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 20302410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Original strand, 50307629 - 50307853
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307629 caaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 50307728  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || |||    
T  50307729 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaaccctttttt 50307828  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttac 254  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
T  50307829 cagccccatatatctcaaggtttac 50307853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 51750237 - 51749982
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750237 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 51750138  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  51750137 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 51750038  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||||||||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  51750037 agccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 51749982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18839785 - 18839531
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839785 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcattctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 18839686  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || ||||    
T  18839685 ttcccaaggtgaatcaaccctaaaaccctactgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctatctaaacccttgtttc 18839586  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  18839585 agccccctctatctcatggtttacaataatacaatgtctatatttatagtaaaag 18839531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Original strand, 25251366 - 25251611
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25251366 atatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcctaag 25251465  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25251466 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaacgttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacctttgtttcagccccct 25251565  T
Q  239 ctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  25251566 ctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 25251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39462717 - 39462469
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462717 caaaagagatatcaaagggttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 39462618  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  39462617 ttcccaaggtgaatcaaccctaaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcatttctaaacctttgtttc 39462518  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  39462517 agccttctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatag 39462469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41647118 - 41646862
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41647118 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgt 41647019  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41647018 ttcccaaggtgaatcaaccataaaaaccaagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttc 41646919  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  41646918 agccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 41646862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 287
Target Start/End: Original strand, 6995784 - 6996039
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6995784 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtt 6995883  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||     
T  6995884 tcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgttgtttcg 6995983  T
Q  232 gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  || |||||||||||||  |||||||    
T  6995984 gccccctctatctcaagatttactctgattcaaggtctatatttataataaaagta 6996039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Original strand, 10399911 - 10400166
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399911 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 10400010  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  10400011 ttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttc 10400110  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||||||||||||   |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  10400111 agccccctctatctcccagtttgctctgatacaaggtctatatttatagaaaaagt 10400166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 17324719 - 17324975
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324719 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 17324818  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| || |||     
T  17324819 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccatagagacaaactctatacaaaccccagttttgttgttgccattctaaacccttgtttt 17324918  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| |||||  |||||||| ||| |  || |||||||||||||| |||||||    
T  17324919 agccccctgtatcttcaggtttactctggttcaaggtctatatttatagtaaaagta 17324975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 28998336 - 28998592
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998336 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 28998435  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  28998436 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttc 28998535  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  28998536 agcctcctctatctcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagta 28998592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 29004052 - 29004308
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004052 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 29004151  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  29004152 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttc 29004251  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  29004252 agcctcctctatctcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagta 29004308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 3579699 - 3579957
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3579699 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaagagactcaatcctaattgtgt 3579798  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| || ||||    
T  3579799 ttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgctgcctttctgaacccttgtttc 3579898  T
Q  231 ag--ccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||| |||||  || ||||||||||| || |||||||    
T  3579899 agccccccctctatctcaaattttacgctgatacaaggtctatatttaaagtaaaagta 3579957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31490111 - 31489859
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31490111 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgt 31490012  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||    
T  31490011 ttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaa--ctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttc 31489914  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  31489913 aaccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 31489859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16226356 - 16226110
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16226356 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 16226257  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||||    
T  16226256 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttttagacccctc 16226157  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||||| |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  16226156 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 16226110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47906468 - 47906254
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906468 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 47906369  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  47906368 ttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 47906269  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  47906268 agccccctctatctc 47906254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 50248655 - 50248909
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50248655 caaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 50248754  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  50248755 ttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaatcatagttttgttgttgtctttttaaacctttgtttc 50248854  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  50248855 agctccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 50248909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Original strand, 14098053 - 14098301
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098053 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 14098152  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || ||||    
T  14098153 tttccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgcctttttaaaccattgtttc 14098252  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    || |||||||||||||| |||||   ||||  || ||||||||||||||    
T  14098253 agtcccctctatctcaaagtttagtttgatacaaggtctatatttatag 14098301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6823212 - 6822958
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  6823212 caaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtat 6823113  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  6823112 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 6823014  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  || ||||||||  |||| ||||||    
T  6823013 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagt 6822958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15823737 - 15823488
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15823737 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatattaatagtgtttcccaa 15823638  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  15823637 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 15823538  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    | |||||| | ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15823537 tttatctctaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 15823488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20291645 - 20291400
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291645 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 20291546  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| | ||||||    
T  20291545 gaatcaaccctcaaaacttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatctccctct 20291446  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||||  ||| | || ||  || |||||||||||||| ||||||    
T  20291445 atctcaaaatttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 20291400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2617714 - 2617466
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617714 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 2617615  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  2617614 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 2617515  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    |||| |||||||||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||    
T  2617514 agcctcctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatag 2617466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 2949314 - 2949570
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2949314 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattctcgtaaacaagagactcaatcctaatagtgt 2949413  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  2949414 ttcccaaggtgaatcaaccatcaacccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttc 2949513  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||  ||| ||||||||||| | |||||||    
T  2949514 agccccctctatctcaaggttttctcggattcaatatctatatttattgtaaaagta 2949570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 260
Target Start/End: Original strand, 31425098 - 31425331
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagaga---ctcaatcctaatag 127  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  31425098 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagatcactcaatcctaatag 31425197  T
Q  128 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaaccttta 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||     
T  31425198 tgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 31425297  T
Q  227 tttcagccccctctatctcaaggtttacactgat 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31425298 tttcagccccctttatctcaaggtttacattgat 31425331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 15294917 - 15295131
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294917 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 15295016  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  15295017 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 15295116  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    ||||| |||||||||    
T  15295117 agccctctctatctc 15295131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28840868 - 28840620
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840868 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 28840769  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||| |||||| |    
T  28840768 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttcctttctaaacccttgtttcatccccctgt 28840669  T
Q  241 a--tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |  |||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  28840668 atctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 28840620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47179902 - 47179697
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47179902 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 47179803  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  47179802 tgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 47179703  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  47179702 tatctc 47179697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48665376 - 48665113
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacg-taaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  48665376 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccggtaaccaagagactcaatcctaatagtg 48665277  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||    
T  48665276 tttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 48665177  T
Q  230 ca------gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||       |||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  48665176 caaccccctccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 48665113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25128070 - 25127856
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct-aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25128070 caaaagagatatcaatgaattacaagaataagtctcccgcctaattcta-ccaaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtg 25127972  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||    
T  25127971 tttcacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagacacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 25127872  T
Q  230 cagccccctctatctc 245  Q
    ||| ||||||||||||    
T  25127871 caggcccctctatctc 25127856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 21948271 - 21948484
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948271 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcgtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 21948370  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  21948371 ttcc-aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 21948469  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  21948470 agccccctctatctc 21948484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39932271 - 39932057
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39932271 caaaagagaaatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagtctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgt 39932172  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  39932171 ttcccaaggttaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 39932072  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  39932071 agccccctctatctc 39932057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13762025 - 13761780
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13762025 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagtt 13761926  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||    
T  13761925 gaatcaacccccaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttatgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccctctct 13761826  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  13761825 atctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 13761780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28842683 - 28842435
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28842683 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttcccaatgt 28842584  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  28842583 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 28842484  T
Q  241 a--tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |  |||||| |||| | |||||  || || ||||||||||| |||||||    
T  28842483 atctctcaaagtttgctctgatacaaggtttatatttatagtaaaagta 28842435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 28207149 - 28207405
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28207149 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgt 28207248  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  28207249 ttcccaaggtgaataaactctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttacacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 28207348  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  28207349 agccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 28207405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 237
Target Start/End: Original strand, 46431800 - 46431996
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431800 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccatcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 46431899  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  46431900 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctacttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 46431996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 31735604 - 31735864
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31735604 caaaagagaaatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaaccttaatagtgt 31735703  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||     
T  31735704 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 31735803  T
Q  231 agccccctctatctca----aggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||    | |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  31735804 agccccctctatctcattcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 31735864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24325861 - 24325648
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325861 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 24325762  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| || ||||    
T  24325761 ttcctaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttct-aacccttgtttc 24325663  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  24325662 agccccctctatctc 24325648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 9463336 - 9463541
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9463336 atcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaagg 9463435  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  9463436 tgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 9463535  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  9463536 tatctc 9463541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47177551 - 47177346
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactca-atcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47177551 atcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcccatcctaatagtgtttcccaagg 47177452  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  47177451 tgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 47177352  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  47177351 tatctc 47177346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17319085 - 17318868
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||      ||    
T  17319085 caaaagagatatcaataagttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctgttcccgtaaccaagagactcaatcct------gt 17318992  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  17318991 ttcccaaggtgaatcaaccttccaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctaaacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 17318892  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttac 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17318891 agccccctctatctcaaggtttac 17318868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17324261 - 17324016
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   | ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17324261 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccatattcaagagactcaatcctaatagtgt 17324162  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||| || ||||| |||| || |||     
T  17324161 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataaaaatc--agttttgttgtggcctttctgaacccttgtttt 17324064  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 278  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||  || |||||||||||||    
T  17324063 agccctctctatctcaaggtttactctaatacaaagtctatatttata 17324016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Original strand, 2510418 - 2510667
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2510418 atcaatgggttacaagaataagtctct-gcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttccaaaggt 2510516  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  2510517 gaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtggttgcctttataaacccttgtttcagccccctct 2510616  T
Q  241 atctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  2510617 atctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 2510667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6824090 - 6823827
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaacc-------aagagactcaatccta 123  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||       |||||| |||||| ||    
T  6824090 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgta 6823991  T
Q  124 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  6823990 atagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 6823891  T
Q  224 ttatttcagc-cccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||  || ||||||||  |||| ||||||    
T  6823890 ttgtttcagcccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagt 6823827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 9459509 - 9459714
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9459509 atcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaagg 9459608  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||    
T  9459609 tgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgactttctaaacccttgtttcagccccctc 9459708  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  9459709 tatctc 9459714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40134142 - 40133937
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  40134142 caaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctagtagtat 40134043  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  40134042 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaattctatacaaaccttcgttttgttgttgtcattctaaacccttgtttc 40133943  T
Q  231 agcccc 236  Q
    ||||||    
T  40133942 agcccc 40133937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 259
Target Start/End: Original strand, 4131470 - 4131692
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131470 gatatcaatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 4131568  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | || |||||||||||    
T  4131569 ggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaatccttgtttcagccccc 4131668  T
Q  238 tcta--tctcaaggtttacactga 259  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||    
T  4131669 tctatctctcaaggtttactctga 4131692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42922428 - 42922151
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  42922428 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagttt 42922329  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| |||||||    
T  42922328 ttcgcaaggtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-acttctaaacccttatttc 42922233  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||| ||||||| | | |||||| ||| || ||||||    
T  42922232 aaccccctctatcttaaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaacaaatct 42922151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 51752552 - 51752308
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  51752552 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatc-taatagtgtttcacaaggt 51752454  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||    
T  51752453 gaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaagccctaattttgttgttacctttctaaactcttgtttcagccccctct 51752354  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  51752353 atctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 51752308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 27337032 - 27337235
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |  |  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27337032 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttcccaaggt 27337131  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  27337132 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaa-tctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 27337230  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  27337231 atctc 27337235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 14183675 - 14183923
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14183675 caaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaaccaagagactcaattataatagtgt 14183774  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| || ||||    
T  14183775 tttccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctag-tttg-tgttgc-attctaaacccttgtttc 14183868  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||| |||||    
T  14183869 agccctctctatctcaaggtttactctgatacatggtctatatttatagtaaaag 14183923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 27339223 - 27339427
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27339223 atcaatgggttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaactaagagactcaatcgtaatagtatttcccaaggt 27339322  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||||    
T  27339323 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaagcccttgtttcagccccctct 27339422  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  27339423 atctc 27339427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47451840 - 47451590
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||          
T  47451840 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaaaca--- 47451744  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
       | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| || |||     
T  47451743 ---ctaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattccaaacccttgttta 47451647  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  47451646 agccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 47451590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 8347356 - 8347633
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  8347356 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcataatagtgt 8347455  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| || ||||    
T  8347456 ttcctaaggtgaatcaaccct--aaccttggtgtttgttgccaagag-caatctctatacaaaccctagttttcttgttg-acttctaaacccttgtttc 8347551  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||| ||||||| ||||||| | | |||||||||| || ||||||    
T  8347552 aaccccctctatctcaaggtttacatctgatacaaggtctat-tttatagtaaaagtacccctcataaaattggaacaaatct 8347633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 18800656 - 18800932
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   | ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18800656 caaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttcaaatctctacccgtgacctagagactcaatcctaatagtgt 18800755  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||| || ||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||   |||||||||||| ||||    
T  18800756 ttctcagggtgaatcaacc--ccaaccctagtatttgtggccaagag-caaactctatacaaaccgtagttttcttgttg-acttctaaacctttgtttc 18800851  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||    
T  18800852 agccccttgtatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatc-ctcataaaattggaaaaaatct 18800932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 198
Target Start/End: Original strand, 15669484 - 15669641
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669484 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 15669583  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 198  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15669584 ggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaacccta 15669641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 301
Target Start/End: Original strand, 49495294 - 49495552
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||  || ||||||    
T  49495294 caaaagagatatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaaaagactcaattttattagtgt 49495393  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||        ||| |||||| || ||||    
T  49495394 ttcccaaggtgaatcaactc---aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactatatgcaaaccctag-tttg-------atttataaacccttgtttc 49495481  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaatt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  49495482 agccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaatt 49495552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 252
Target Start/End: Original strand, 8349135 - 8349352
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||    
T  8349135 caaaagagataccaatgagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaatctcttcccgtgaccatcaaactcaatcctaatagtgt 8349234  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||   ||||||||| || ||||    
T  8349235 ttcccaaggtgaataaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccttaattttcttgttg-acttctaaacccttgtttc 8349330  T
Q  231 agccccctctatctcaaggttt 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  8349331 agccctctctatctcaaggttt 8349352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16432592 - 16432440
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||     ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16432592 caaaagagatatcaatgggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttcccataaccaagagattcaatcctaataatgt 16432493  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaac 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16432492 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtcgccaagagacaaac 16432440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16231752 - 16231630
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16231752 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaggctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 16231653  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagt 162  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  16231652 tgaatcaacccacaaaccctagt 16231630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 25248635 - 25248766
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct-aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25248635 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta-ccaaaagtctcaatctcttcctgtaaccgagagacttaatcctaatagtg 25248733  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 162  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248734 ttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 25248766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16429155 - 16429042
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16429155 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgt 16429056  T
Q  131 ttcccaaggtgaat 144  Q
    |||||||| |||||    
T  16429055 ttcccaagttgaat 16429042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 279
Target Start/End: Original strand, 26520205 - 26520449
Alignment:
Q  40 tatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaac------caagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||  || ||||||||| ||| ||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  26520205 tatcaatgggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 26520304  T
Q  133 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacc-tttatttca 231  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||   ||||||||| ||  |||||    
T  26520305 cccaaggtgaatcaa-cctc-aatcttagtgtttgttgccaagag-caaactctatagaaaccctagttttcttgttg-acttctaaaccgttgttttca 26520400  T
Q  232 g-ccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  26520401 gcccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatag 26520449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 260
Target Start/End: Original strand, 13125541 - 13125768
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||  || ||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || |    
T  13125541 caaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccttgaccaagagcctcaatcctaacagcg 13125640  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctata-caaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatt 228  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||| | |||| |||| || ||    
T  13125641 tttcccaatgtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgtcgccaagag-caaactctataccaaaccctagtttccttgttg-gcttcttaacccttgtt 13125736  T
Q  229 tcagccccctctatctcaaggtttacactgat 260  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  13125737 tcagccccctttctctcaagttttactctgat 13125768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 149
Target Start/End: Original strand, 6115186 - 6115304
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6115186 caaaagagatatcaattggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 6115285  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaacc 149  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  6115286 ttttcaaggtgaatcaacc 6115304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23786028 - 23785935
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23786028 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 51757712 - 51757623
Alignment:
Q  48 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51757712 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 51757623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 284
Target Start/End: Original strand, 25248756 - 25248850
Alignment:
Q  190 caaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||| ||| ||||    
T  25248756 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttctagaaaaa 25248850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Original strand, 26613322 - 26613440
Alignment:
Q  30 ccaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagt 128  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||| ||  |||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||    
T  26613322 ccaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaagtgactcaatccgaatagt 26613421  T
Q  129 gtttcccaaggtgaatcaa 147  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26613422 gtttcccaaggtgaatcaa 26613440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27916632 - 27916529
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatac 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  27916632 aatctcttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaatcaa--ttccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tac 27916538  T
Q  191 aaaccctag 199  Q
    |||||||||    
T  27916537 aaaccctag 27916529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 155865 - 155788
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 147  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155865 cctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 30738713 - 30738830
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||| || |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  30738713 caaaagagacatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaagagactcaatcctaatagtg 30738812  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaa 147  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  30738813 ttttccaaggtgaatcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 30790484 - 30790733
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||  |   |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  30790484 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtctccatctcttcgcgtaaccaaaagactca-tcctaacagtg 30790582  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac-ctttatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||| |    |  ||||| || |||||   ||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||  ||    
T  30790583 tttcccaaggtaaatcaaccac--aaccctagtgtctccctcttagaga-aatctcta---aaaccctag-tttattgttt-gtttctaaactcttgttt 30790674  T
Q  229 tcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  30790675 tcagctccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 30790733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Original strand, 26332719 - 26332798
Alignment:
Q  105 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26332719 accaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaacc-caaa-cctagtgtttgttgccaagag-caaactcta 26332798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16561665 - 16561545
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| ||||| |||||  |  ||||| ||  |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16561665 caaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctatttctacccaaagtctcaatctatttccgtggccaagagacttaatcctaatagtg 16561566  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccc 150  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16561565 tttcccaaggtgaatcaaccc 16561545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23816084 - 23816030
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 85  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23816084 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 23816030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16231641 - 16231544
Alignment:
Q  189 acaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  16231641 acaaaccctagttttcttgttgcttttctagacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 16231544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 147
Target Start/End: Original strand, 26332632 - 26332688
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 147  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26332632 aatctcttctcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28279424 - 28279309
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 168  Q
    |||||||||| | |||  || ||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  | |||||||||||||||    
T  28279424 cctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaagctcaatcctaatagtgtttctccaaggggaatcaatc--ccaaccctagtgtttgt 28279327  T
Q  169 tgccaagagacaaactcta 187  Q
    || |||||| |||||||||    
T  28279326 tgtcaagag-caaactcta 28279309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 279
Target Start/End: Original strand, 13127790 - 13127959
Alignment:
Q  105 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttg 204  Q
    ||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||  |||     
T  13127790 accaagagacttaattccaacaatgtttcccaaggtgaatctatc--ccaaccctagtgtttgttgccaaaag-gaaactctatataaaccctacttttc 13127886  T
Q  205 ttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    |||||| | ||||||||| || |||||  ||||||| ||| ||||||||| | |||  || || |||||||||||    
T  13127887 ttgttg-gcttctaaacccttgtttca-acccctctctctaaaggtttactccgatacaaggtttatatttatag 13127959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 49959240 - 49959129
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaacc-ctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-cc 135  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||   ||||||| ||||||||  | | ||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  49959240 gatatcaaagggttaaaagaatcagtttcaaacctaattttatccaaagtctcgaatctcttctcatgaccaagagactcattcctaatagtgtttctcc 49959141  T
Q  136 aaggtgaatcaa 147  Q
    ||||||||||||    
T  49959140 aaggtgaatcaa 49959129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14353104 - 14353047
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 147  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14353104 aatctctttccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 14353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 6115344 - 6115384
Alignment:
Q  213 tttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggttta 253  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6115344 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggttta 6115384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 132
Target Start/End: Original strand, 4144826 - 4144865
Alignment:
Q  93 tctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4144826 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 4144865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2232635 - 2232597
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2232635 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2232597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14997081 - 14997040
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14997081 aatctcttccagtaaccaagagactcaatcctaacagtgttt 14997040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 122)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 39715647 - 39715367
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715647 caaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 39715548  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| |||||||    
T  39715547 ttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaatagacaaactctatacaaaccctagttttggtgttgcctctctaaacccttatttc 39715448  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  39715447 ag-cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccatgaaattgtaacaaatct 39715367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3314862 - 3314608
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314862 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 3314763  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  3314762 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttatttc 3314663  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  3314662 agccccctctatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaag 3314608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 43423542 - 43423796
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423542 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 43423641  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  43423642 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 43423741  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  43423742 agccccctctttctcaaggtttacagtgatacaatgtctatatttatagtaaaag 43423796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 284
Target Start/End: Original strand, 43421494 - 43421747
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43421494 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgt 43421593  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  43421594 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 43421693  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  43421694 aaccccttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 43421747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 53917743 - 53917999
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917743 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 53917842  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  53917843 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccattgtttc 53917942  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  53917943 agccccctccatctcaaggtttaatctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 53917999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6561987 - 6561740
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561987 aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 6561888  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  6561887 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 6561788  T
Q  232 gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  6561787 gccccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 6561740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Original strand, 28102081 - 28102304
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28102081 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgt 28102180  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  28102181 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 28102280  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttac 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  28102281 agccccctctatctcaagggttac 28102304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 1626762 - 1627016
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1626762 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 1626861  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  1626862 tttccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 1626961  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  1626962 agccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 1627016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1313587 - 1313332
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1313587 caaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgt 1313488  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||| || ||||    
T  1313487 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattgtaaacc-ttgtttc 1313389  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  1313388 agccccctctatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 1313332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Original strand, 4308360 - 4308617
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308360 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 4308459  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  4308460 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 4308559  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  4308560 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 4308617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 880530 - 880785
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  880530 caaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatgctaatagtgt 880629  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  || |||    
T  880630 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacgaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaactcttgttt 880729  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  880730 cagacccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 880785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 39 - 285
Target Start/End: Original strand, 5926851 - 5927097
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926851 atataaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 5926950  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||    
T  5926951 gcgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccctct 5927050  T
Q  239 ctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  5927051 ctatctcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaag 5927097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 51943537 - 51943293
Alignment:
Q  42 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 141  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943537 tcaatgagttacaagaa-aagtctcccgcctaattctacctaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 51943439  T
Q  142 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  51943438 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagcaccctcta 51943339  T
Q  242 tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||| |||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  51943338 tctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 51943293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45883117 - 45882861
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883117 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 45883018  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  45883017 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttattgtttgttccaaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 45882918  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  45882917 agccccctctatctcatagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 45882861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 53915575 - 53915831
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53915575 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgt 53915674  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||| || ||||    
T  53915675 ttcacaaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgtcatcctaaacccttgtttc 53915774  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  53915775 agccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 53915831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35777587 - 35777344
Alignment:
Q  44 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35777587 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 35777488  T
Q  143 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35777487 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 35777388  T
Q  243 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||| |||| |  ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  35777387 ctcaaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 35777344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38890218 - 38890004
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890218 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 38890119  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  38890118 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 38890019  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  38890018 agccccctctatctc 38890004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11170582 - 11170327
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11170582 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgt 11170483  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  11170482 ttcccaaggtgaatcaatccgcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 11170383  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  11170382 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 11170327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Original strand, 22114384 - 22114639
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114384 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 22114483  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || ||||    
T  22114484 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttc 22114583  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||| |||||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  22114584 agccccttctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 22114639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 285
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100374
Alignment:
Q  54 aagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctca 28100242  T
Q  154 aaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggttta 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28100243 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaagggtta 28100342  T
Q  254 cactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    | |||||  || |  ||||||||||| |||||    
T  28100343 ctctgatacaacgcttatatttatagtaaaag 28100374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 456076 - 455825
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  456076 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 455977  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  455976 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 455877  T
Q  240 ta----tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||    ||||||||||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  455876 tatctctctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 455825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 458453 - 458202
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  458453 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 458354  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  458353 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 458254  T
Q  240 ta----tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||    ||||||||||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  458253 tatctctctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 458202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 18099249 - 18099463
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099249 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 18099348  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  18099349 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 18099448  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  18099449 agccccctctatctc 18099463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3859696 - 3859451
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859696 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 3859597  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  3859596 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 3859497  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  3859496 atctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3859451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28181182 - 28180948
Alignment:
Q  49 gttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 148  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28181182 gttataagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatcaac 28181083  T
Q  149 cctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaag 248  Q
    ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28181082 cctcaaatcccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacc--tatttcagccccctctatctcaag 28180985  T
Q  249 gtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  28180984 gtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 28180948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43228469 - 43228212
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228469 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 43228370  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  43228369 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacgctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttc 43228270  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    ||||||||||||||| | |||| | |||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  43228269 agccccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaagtaa 43228212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 287
Target Start/End: Original strand, 12268061 - 12268301
Alignment:
Q  49 gttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12268061 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaac 12268160  T
Q  149 cctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctag-atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||  || ||||||| ||||||||||||    
T  12268161 cctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagctccctctatctca 12268260  T
Q  247 aggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    | |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  12268261 aagtttactctgatacaagttctatatttatagtaaaagta 12268301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Original strand, 18096979 - 18097235
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18096979 caaaagggaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 18097078  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||     
T  18097079 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttg 18097178  T
Q  231 agccccctctatctc-aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||||||||||||  | ||||||  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  18097179 agccccctctatctctcaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18097235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 28761508 - 28761763
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28761508 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctcaatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 28761607  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  28761608 tttccaaggtgaatcaactctcaaacccttgtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 28761706  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  28761707 aaccccctctatctcaaggtttactctgatgcaaagtctatatttatagtaaaagta 28761763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Original strand, 6065884 - 6066131
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6065884 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 6065983  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcag-ccccct 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||    
T  6065984 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccct 6066083  T
Q  239 ctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||||| |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  6066084 ctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 6066131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 27101260 - 27101474
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101260 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccattctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 27101359  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  27101360 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 27101459  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||| ||||||||||    
T  27101460 agcctcctctatctc 27101474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30006019 - 30005805
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30006019 caaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgt 30005920  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  30005919 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 30005820  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  30005819 agccccctctatctc 30005805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 53468535 - 53468788
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53468535 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgt 53468634  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  53468635 ttcccaaggtgaatcaatgctcaaaccctagtgtttcttccaaagagacaaactctatacaaa-cctggttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 53468733  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  53468734 agccccctttatctaaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 53468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 746926 - 746721
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  746926 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 746827  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  746826 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 746727  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  746726 tatctc 746721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Original strand, 4103984 - 4104234
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103984 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 4104083  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  4104084 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaagctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 4104183  T
Q  241 atctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  4104184 atctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 4104234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5191821 - 5191576
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191821 atcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 5191722  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  5191721 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 5191622  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||| | |||| |   |||  || |||||||||||||| ||||||    
T  5191621 atctccaagtttgcttagatacaaggtctatatttatagtaaaagt 5191576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 284
Target Start/End: Original strand, 10956106 - 10956359
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10956106 caaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgt 10956205  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  10956206 ttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 10956305  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    ||||||||||||||  | |||||| |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  10956306 agccccctctatcttcatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 10956359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43226263 - 43226007
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226263 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 43226164  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  43226163 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaacgagacaaactctatacaaa-cgtagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 43226065  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    ||||||||||||||| | |||| | |||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  43226064 agccccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaagtaa 43226007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18162833 - 18162586
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162833 atatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 18162734  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||   ||||    
T  18162733 gtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttcaaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca--tccct 18162636  T
Q  239 ctatctcaaggtttacac-tgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||| | |||||| | ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  18162635 ctatctccaagtttactcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 18162586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24979867 - 24979637
Alignment:
Q  49 gttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24979867 gttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaac 24979768  T
Q  149 cctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaag 248  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  24979767 cctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaa 24979668  T
Q  249 gtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    |||||| |||||  || || |||||||||||    
T  24979667 gtttactctgatacaaggtatatatttatag 24979637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25533620 - 25533406
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25533620 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgt 25533521  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  25533520 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 25533421  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  25533420 agccccctctatctc 25533406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42990482 - 42990268
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990482 caaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 42990383  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  42990382 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 42990283  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  42990282 agccccctctatctc 42990268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Original strand, 6063534 - 6063782
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6063534 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 6063633  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  6063634 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 6063733  T
Q  240 tatctc--aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||  || |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  6063734 tatctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 6063782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 10621618 - 10621823
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10621618 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 10621717  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||    
T  10621718 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagcaccctc 10621817  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  10621818 tatctc 10621823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 284
Target Start/End: Original strand, 10958402 - 10958655
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958402 caaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgt 10958501  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  10958502 ttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 10958601  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    ||||||||||||||  | |||||| |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  10958602 agccccctctatctttatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 10958655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50494168 - 50493963
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50494168 atcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 50494069  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  50494068 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 50493969  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  50493968 tatctc 50493963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Original strand, 51727086 - 51727342
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727086 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttaccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 51727185  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  51727186 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc-agtgtttgttccaaagagacaaactctatacataccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 51727284  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    |||||||| |||||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  51727285 agccccctttatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 51727342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 889852 - 890104
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  889852 caaaagagatatcagtgggttacaagaataactctcctgcctaattctacccaaagccccaa-ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 889950  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||| || |||    
T  889951 ttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccccagtgtttgttgccaaatagacaaactctatacaaaccctaggtt--ttgttgccattctaaacccttgttt 890048  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  890049 cagcttcctctatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaag 890104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 48361750 - 48362005
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48361750 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgt 48361849  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  48361850 ttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacc-ttgtttc 48361948  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  48361949 agccccctgtatctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 48362005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 47148974 - 47149188
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47148974 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgt 47149073  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    || |||||||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||    
T  47149074 tt-ccaaggtgaatcaaccatcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 47149172  T
Q  230 cagccccctctatctc 245  Q
    ||||||||||||||||    
T  47149173 cagccccctctatctc 47149188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 287
Target Start/End: Original strand, 32264119 - 32264378
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   | |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264119 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtt 32264218  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |    
T  32264219 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttga 32264318  T
Q  232 gccccctctatctcaagg----tttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||| |    ||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  32264319 gccccctctatctcaaagttaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 32264378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36012005 - 36011751
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36012005 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagatattcaatcctaatagtgt 36011906  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||| | || ||||    
T  36011905 ttcccaacgtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccttagtttcgttgttgtctttctaaatccttgtttc 36011806  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  36011805 agccccctttatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 36011751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 54691653 - 54691906
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  54691653 caaaagagatatcaatgaaatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaatctcttcccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgt 54691752  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||     
T  54691753 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtcgcctttctaaaaccttgtttt 54691852  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||||||||||| |||||    
T  54691853 a-ccccctctatcttaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 54691906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38210539 - 38210334
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38210539 atcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 38210440  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  38210439 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 38210340  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  38210339 tatctc 38210334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26720725 - 26720470
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26720725 caaaagagaaatcaaagggttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagt-t 26720627  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26720626 aacccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttc 26720527  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  26720526 agccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 26720470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 9604686 - 9604899
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604686 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 9604785  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  9604786 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttctttcaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacc-ttgtttc 9604884  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  9604885 agccccctctatctc 9604899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Original strand, 28413120 - 28413299
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28413120 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaagg 28413219  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaa 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28413220 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaa 28413299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 284
Target Start/End: Original strand, 51674845 - 51675087
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51674845 caaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 51674944  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |           ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  51674945 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaaggg-----------acaaaccttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 51675033  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  51675034 agccccctctatctcaacgtttacattgatacaacgtctatatttatagtaaaa 51675087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 10084468 - 10084682
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10084468 caaaagagaaatcaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgt 10084567  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || || |    
T  10084568 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttcc 10084667  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  10084668 agccccctctatctc 10084682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29956864 - 29956650
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29956864 caaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgt 29956765  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  29956764 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgaatttctaaacccttgtttc 29956665  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  29956664 agccccctctatctc 29956650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23637200 - 23636923
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  23637200 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaatagtgtt 23637101  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 231  Q
    || |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| || ||| |    
T  23637100 tctcaaggtaaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactctatacaaaccctagttttcttgttg-gcttctaaacccttgtttta 23637005  T
Q  232 gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatcta 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||  |||| || | | |||||||||| || |||||||    
T  23637004 gcctcctctatctcaaggtttactctgatacaaagtatatatttatattaaaattatccctcataaaattgaaacaaatcta 23636923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25389074 - 25388882
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25389074 atcaatgggttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc-aagg 25388976  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  25388975 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 25388882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Original strand, 35918022 - 35918285
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35918022 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgt 35918121  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta------gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctt 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||      ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  35918122 ttcgcaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 35918221  T
Q  225 tatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||| |  ||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  35918222 tgtttcagccccctctatctcaaaatttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 35918285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15781041 - 15780782
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15781041 atatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccaag 15780942  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagaca-----------aactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |    
T  15780941 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgt 15780842  T
Q  228 ttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15780841 ttcagccccctctatctccaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 15780782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1321657 - 1321483
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321657 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 1321558  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgt 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1321557 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccgagttttgt 1321483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31151521 - 31151271
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31151521 caaaagagatatca--gggttacaagaataagtcacccgcctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 31151424  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaa-cctttattt 229  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||  |||    
T  31151423 ttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-atttctaaacccttgtttt 31151328  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||    
T  31151327 cagccccctctatctcgaggtttacatctgatacaaagtctatatttatagtaaaag 31151271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 53591355 - 53591119
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  53591355 gatatcaatggattagaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattctcgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaa 53591256  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||           ||||||||| ||||||||||  |||||||||  || |||||||| ||    
T  53591255 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagac-----------aaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagcctcc 53591167  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  53591166 tctatctcaaggtttacacttatacaatgtctatatttatagtaaaag 53591119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6484531 - 6484372
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6484531 gatatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttcccaa 6484432  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccc 196  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6484431 ggtgaatcaaccctcaaaccccggtatttgttgccgaagagacaaactctacacaaaccc 6484372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23633630 - 23633356
Alignment:
Q  33 aaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23633630 aaagagatatcatcgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 23633531  T
Q  133 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcag 232  Q
    |||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| | || ||| ||    
T  23633530 ccc--ggtaaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacactatacaaaccctagttttcttgttg-gcttctaaatccttgttttag 23633437  T
Q  233 ccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatcta 313  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| || |||||||    
T  23633436 ccctctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatcta 23633356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Original strand, 5522715 - 5522949
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522715 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 5522814  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||           ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  5522815 aaatcaacccacaaacccgagtgtttgttccgaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 5522903  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  5522904 atctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 5522949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 245
Target Start/End: Original strand, 10191405 - 10191602
Alignment:
Q  47 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191405 gggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 10191503  T
Q  147 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 245  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  10191504 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagccccctttatctc 10191602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42992402 - 42992250
Alignment:
Q  93 tctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaa 192  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42992402 tctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaa 42992303  T
Q  193 accctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  42992302 accctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctc 42992250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 28137415 - 28137628
Alignment:
Q  61 agtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 160  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28137415 agtcttccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacccta 28137514  T
Q  161 gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgat 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||           |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28137515 gtgtttgttcccaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgat 28137603  T
Q  261 gtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
      || |  ||||||||||| |||||    
T  28137604 acaacgcatatatttatagtaaaag 28137628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 53597406 - 53597148
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |  ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53597406 atatcaacgggttacaagaataagtctcttgcctaattctactcaaaatctcaatctattctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 53597307  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||   || |||||| || |||||  |||||    
T  53597306 gtgaatcaa--cttcaaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaacccctagttttcttgttg-acttataaacccttgtttca-tcccct 53597212  T
Q  239 ctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattg 302  Q
    |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||    
T  53597211 ctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattg 53597148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 7606676 - 7606822
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606676 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 7606775  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7606776 gaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 7606822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Original strand, 13420265 - 13420429
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13420265 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 13420364  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 199  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13420365 ttcccaaggtgaatcaactc---aaccctagtgtttgttgcctagaga-aaactctatacaaaccctag 13420429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32219255 - 32219026
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32219255 gatatcaatgggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtcccaatctcttcccgcaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaa 32219156  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||           |||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||    
T  32219155 ggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttacaaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccc 32219067  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 278  Q
    |||||||||| |||||  | |||  || |||||||||||||    
T  32219066 tctatctcaaagtttagtcagatacaaggtctatatttata 32219026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 54884332 - 54884089
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||     ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54884332 caaaagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 54884234  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  ||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| || ||      
T  54884233 tttccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagaaacaaactc--tacaaattctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttcg 54884136  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttat 277  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  54884135 agctccctctatctcaaggtttacaatgatccaatgtttatatttat 54884089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6231978 - 6231849
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6231978 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaatccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaacactaatagtgt 6231880  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231879 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 6231849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Original strand, 25688240 - 25688367
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688240 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 25688339  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688340 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 117 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41849117
Alignment:
Q  117 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttc 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgttattc 41849145  T
Q  217 taaacctttatttcagccccctctatct 244  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||    
T  41849144 taaacccttgtttcagccccctctatct 41849117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4666694 - 4666535
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataag--tctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagt 128  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4666694 caaaagagatatcaatggattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaacctagagactcaatcataatagt 4666595  T
Q  129 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctat 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  4666594 gtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtctgttgtcaagagacaaaccctat 4666535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 199
Target Start/End: Original strand, 561863 - 562021
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  561863 gatatcaatgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaa 561962  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 199  Q
     |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  561963 tgtgaatcaacc--tgaaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaaaccctag 562021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17795436 - 17795280
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17795436 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagttt 17795337  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataca 191  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17795336 ttcccaaagtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctataca 17795280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19103876 - 19103720
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19103876 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagttt 19103777  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataca 191  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19103776 ttcccaaagtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctataca 19103720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25635552 - 25635394
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25635552 gatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaa 25635453  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 199  Q
    |||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25635452 ggtgaaccaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctag 25635394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6231502 - 6231374
Alignment:
Q  156 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6231502 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcccgctctatctcaagatttaca 6231403  T
Q  256 ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  6231402 ctgatacaatgtctatatttatagtaaaa 6231374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1674142 - 1673975
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||  || ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1674142 atatcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccatg 1674043  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgtt 209  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  1674042 gtgaatcaatcct--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaacactagttttcttgtt 1673975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 285
Target Start/End: Original strand, 47701798 - 47701928
Alignment:
Q  155 accctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttac 254  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  47701798 accctggtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttac 47701897  T
Q  255 actgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  47701898 actgatacaatgtctatatttatagtaaaag 47701928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11163218 - 11163073
Alignment:
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  11163218 gaatcaatccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 11163119  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||| |||| | |||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  11163118 atctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatcgtaaaagt 11163073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 5886367 - 5886261
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5886367 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggt 5886269  T
Q  141 gaatcaac 148  Q
    ||||||||    
T  5886268 gaatcaac 5886261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 5899840 - 5899734
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5899840 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggt 5899742  T
Q  141 gaatcaac 148  Q
    ||||||||    
T  5899741 gaatcaac 5899734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24177380 - 24177201
Alignment:
Q  105 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  24177380 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccttagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttc 24177284  T
Q  205 ttgttgcgtttctaaac-ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||    ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||  |||||||    
T  24177283 ttgttg-acatctaaactcttgttttcagccccctctagctcaatgtttactatgatacaaggtctatatttataataaaagta 24177201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11168279 - 11168165
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11168279 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgt 11168180  T
Q  131 ttcccaaggtgaatc 145  Q
    |||||||||||||||    
T  11168179 ttcccaaggtgaatc 11168165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 284
Target Start/End: Original strand, 27635830 - 27635959
Alignment:
Q  155 accctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttac 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635830 accctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttgcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttac 27635929  T
Q  255 actgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
     || ||  || |||||||||| ||| ||||    
T  27635930 tctaattcaaggtctatatttgtagtaaaa 27635959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 36871382 - 36871583
Alignment:
Q  33 aaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |   |||||||||| |||||  || ||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36871382 aaagagataacaaagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacagtgtt 36871481  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 231  Q
    | |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | || |||||| || |||||    
T  36871482 ttccaaggtgaatcaatcct--aaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaagccctagttttcttgttg-gcttgtaaacccttgtttca 36871577  T
Q  232 gccccc 237  Q
    ||||||    
T  36871578 gccccc 36871583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6484367 - 6484282
Alignment:
Q  227 tttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6484367 tttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagcaaaagtaactcccataaaaatgtaacaaatct 6484282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3306939 - 3306839
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306939 caaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 3306840  T
Q  131 t 131  Q
    |    
T  3306839 t 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3306835 - 3306724
Alignment:
Q  173 aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctata 272  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  3306835 aagagacaaactctattcaaatcctagttttgttgttgtatttctaaacccttgtttcagccccctatatctctaggtttacactgatacaatgtctata 3306736  T
Q  273 tttatagcaaaa 284  Q
    ||||||| ||||    
T  3306735 tttatagtaaaa 3306724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 165
Target Start/End: Original strand, 4560401 - 4560497
Alignment:
Q  69 gcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 165  Q
    ||||||||||| ||||| | | |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4560401 gcctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaacaggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 4560497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25634024 - 25633933
Alignment:
Q  105 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25634024 accaagagactcaatcctaataatgtctcccaaggtgaatcaatc--ccagccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag 25633933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13419997 - 13419883
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatac 190  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  13419997 aatctctttccgtgaccaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tac 13419903  T
Q  191 aaaccctagatttgttgttg 210  Q
    ||||||||| ||| ||||||    
T  13419902 aaaccctagttttcttgttg 13419883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 177
Target Start/End: Original strand, 14634521 - 14634665
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||| ||||| |   |||||| ||| |||||  |  ||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  14634521 caaaagagatatcaaaggtttacaagaatcagtcttcaaacctaatgctacccaaagtctcaatctcttctcgtgactaagagacacaatcctaatagtg 14634620  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagag 177  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||||||||    
T  14634621 tttcccaaggtgaatcaa-tctcaa--cccagtgtttgttgccaagag 14634665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 170
Target Start/End: Original strand, 31021281 - 31021362
Alignment:
Q  88 cctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 170  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  31021281 cctaatctcttcatgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttg 31021362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Original strand, 47701750 - 47701798
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 79  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701750 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1321437 - 1321363
Alignment:
Q  213 tttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  1321437 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagta 1321363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 24181550 - 24181504
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24181550 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaa 24181504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 1620580 - 1620657
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 147  Q
    |||||||||| |||||  || ||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1620580 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 165
Target Start/End: Original strand, 7606828 - 7606873
Alignment:
Q  120 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7606828 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctactgtt 7606873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7768672 - 7768632
Alignment:
Q  107 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7768672 caagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 7768632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11066731 - 11066652
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaaa-ccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 147  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11066731 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcccgtgatcaaaagattcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11066652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6303348 - 6303310
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6303348 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6303310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 10094218 - 10094256
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10094218 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 10100235 - 10100273
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100235 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10100273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 10201098 - 10201136
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10201098 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10201136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16462241 - 16462203
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16462241 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16462203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 22626128 - 22626166
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626128 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22626166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27544311 - 27544273
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27544311 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 27544273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Original strand, 27635737 - 27635791
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 85  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  27635737 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattttacccaaa 27635791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 47883026 - 47883064
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47883026 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 47883064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Original strand, 4560514 - 4560567
Alignment:
Q  201 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttac 254  Q
    ||||||||| | ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4560514 tttgttgttacctttataaaccattgtttcagccccctctatctcaatgtttac 4560567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 245
Target Start/End: Original strand, 6719358 - 6719390
Alignment:
Q  213 tttctaaacctttatttcagccccctctatctc 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6719358 tttctaaacccttatttcagccccctctatctc 6719390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1225419 - 1225139
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225419 aaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 1225320  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||    
T  1225319 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttccaaagagacaaactctttacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttca 1225220  T
Q  232 gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1225219 gccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagtaaaagtaactcccataaaattgtaacaaatct 1225139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 38 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27911261 - 27910988
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911261 gatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27911162  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  27911161 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc-cttctaaacccttgtttcagccccc 27911063  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  27911062 tctatctcaaggtttacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagtatctcccataaaattggaacaaatct 27910988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 38 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27957680 - 27957407
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957680 gatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27957581  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  27957580 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc-cttctaaacccttgtttcagccccc 27957482  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  27957481 tctatctcaaggtttacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagtatctcccataaaattggaacaaatct 27957407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 27106978 - 27107232
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27106978 caaaagagatatctatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 27107077  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  27107078 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 27107177  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  27107178 agccccctctatctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 27107232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 287
Target Start/End: Original strand, 14419280 - 14419528
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14419280 atattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaag 14419379  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  14419380 gtgaatcaaccctcaaaccccaatgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 14419479  T
Q  239 ctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  14419480 ctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 14419528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 30480584 - 30480838
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30480584 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 30480683  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  30480684 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 30480783  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  30480784 aaccccttctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 30480838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 13858566 - 13858821
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13858566 caaaagagatat-aatgggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgt 13858664  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  13858665 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 13858764  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  13858765 atccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagta 13858821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14808005 - 14807749
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808005 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 14807906  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  14807905 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 14807806  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  14807805 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 14807749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32339563 - 32339303
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339563 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 32339464  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  32339463 ttaccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 32339364  T
Q  231 agccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  32339363 agccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 32339303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 39 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14477522 - 14477276
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14477522 atatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaag 14477423  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  14477422 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccct 14477323  T
Q  239 ctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||| | |||||  || | |||||||||||| |||||    
T  14477322 ctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 14477276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36865789 - 36865538
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  36865789 caaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgt---gaagagactcaatcctaatagtgt 36865693  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  36865692 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 36865593  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  36865592 agccccctctatcttaaggtttacatctgatacaatgtctatatttatagtaaaa 36865538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4424262 - 4424016
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4424262 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccacggt 4424163  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||    
T  4424162 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagcgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccctct 4424063  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||| |||| | |||||  || |||| ||||||||| |||||||    
T  4424062 atctcaaagtttgctctgatacaaggtctgtatttatagtaaaagta 4424016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15072965 - 15072708
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatc-tcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072965 caaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaaccctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 15072866  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||    
T  15072865 ttttccaaggtgaatcaaccctaaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 15072766  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15072765 cagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 15072708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27829541 - 27829295
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829541 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 27829442  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  27829441 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 27829342  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||| | |||| | |||||  || | |||||||||||| |||||||    
T  27829341 atctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagta 27829295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 285
Target Start/End: Original strand, 5372266 - 5372512
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||  || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5372266 gatatcaatgagttacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 5372365  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||    
T  5372366 ggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctatataaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccc 5372464  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  5372465 tctatctcaagatttacactgatacaatgtctataattatagtaaaag 5372512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27827230 - 27826984
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827230 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 27827131  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  27827130 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 27827031  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||| | |||| | |||||  || | |||||||||||| |||||||    
T  27827030 atctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagta 27826984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18810952 - 18810707
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810952 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctattcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 18810853  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  18810852 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 18810753  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||| | |||| | |||||  ||  ||||||||||||| ||||||    
T  18810752 atctccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagt 18810707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 69 - 285
Target Start/End: Original strand, 33541507 - 33541723
Alignment:
Q  69 gcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 168  Q
    ||||||||||| | |||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541507 gcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 33541606  T
Q  169 tgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtc 268  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  33541607 tccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaatgtttacactgatacaatgtc 33541706  T
Q  269 tatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||| |||||    
T  33541707 tatatttatagtaaaag 33541723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15809472 - 15809213
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809472 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 15809373  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  15809372 tttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 15809274  T
Q  231 agccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| ||||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15809273 agccccctttatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 15809213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 608988 - 608774
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  608988 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgt 608889  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  608888 ttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcatttctaaacccttgtttc 608789  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  608788 agccccctctatctc 608774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 44721088 - 44720842
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-cccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44721088 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcccaagg 44720989  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  44720988 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacagactctatacaaaacatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 44720889  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||||| |||| |  |||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  44720888 tatctcaaagtttgctttgatataaggtctatatttatagtaaaagt 44720842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43079847 - 43079650
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43079847 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 43079748  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  43079747 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccc 43079650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15068235 - 15067979
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15068235 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtat 15068136  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  15068135 ttcccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctggttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 15068036  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||| |||||||||| |||||   ||||  || || ||||||||||| |||||||    
T  15068035 agccccttctatctcaaagtttaggttgatacaaggtttatatttatagtaaaagta 15067979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 28251648 - 28251904
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251648 caaaagagaaatcaatgggttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 28251747  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  28251748 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 28251847  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  28251848 aacccactctatctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 28251904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 24873271 - 24873476
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24873271 atcaatcggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaagg 24873370  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  24873371 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 24873470  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  24873471 tatctc 24873476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43082218 - 43082013
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43082218 atcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtttcccaagg 43082119  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  43082118 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 43082019  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  43082018 tatctc 43082013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 28283310 - 28283514
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28283310 atcaatgggttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaatgt 28283409  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  28283410 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagtcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctct 28283509  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  28283510 atctc 28283514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3874264 - 3874004
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3874264 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgt 3874165  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  3874164 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 3874065  T
Q  231 agccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||| |||||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  3874064 agcccccgctatctctctcaaagtttagcctgatacaaagtctatatttatagtaaaagta 3874004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 245
Target Start/End: Original strand, 22684752 - 22684951
Alignment:
Q  46 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684752 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 22684851  T
Q  146 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  22684852 aaccttcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctc 22684951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25952774 - 25952521
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25952774 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatattgt 25952675  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||| || ||||    
T  25952674 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactatatac-aaccctaattttattgttgcctttctaaacccttgtttc 25952576  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||  || |  ||||||||||| |||||    
T  25952575 agccccctctatctcaaggtttcctctgatacaaagcttatatttatagtaaaag 25952521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41384998 - 41384743
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| | ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41384998 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgt 41384899  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  41384898 ttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttc 41384799  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    || ||||||||||||||  |||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  41384798 ag-cccctctatctcaatttttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 41384743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 313
Target Start/End: Original strand, 15185797 - 15186073
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagag--actcaatcctaatagtg 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||       ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  15185797 aaaagagatatcaatgggttacaagaataggtctctcgcctaattctacccaaa-------tctcttcccgtaaccaagagagactcaattctaatagtg 15185889  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||   |||||||||| || |||    
T  15185890 ttttacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccatagttttgttattttctttctaaacccttgttt 15185989  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatcta 313  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||| ||||||| | | |||||||||| || |||||||    
T  15185990 cagtcacctttatctcaaggtttactctgatacaaagtttatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatcta 15186073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775176
Alignment:
Q  108 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttg 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatatacaaaccctagtattgttg 26775279  T
Q  208 ttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaa 307  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||  || | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |    
T  26775278 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaagtaaccctcataaaattgtaaca 26775179  T
Q  308 aat 310  Q
    |||    
T  26775178 aat 26775176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31162463 - 31162186
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||  || |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31162463 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 31162364  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaaccttt-attt 229  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||  |||    
T  31162363 ttcccaaggtgaatcaaccct--aacgttagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaacacta-atttgttgct-tgtttctaaacctttgtttt 31162269  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| || ||||||    
T  31162268 tagccccctctttctcaaggtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatct 31162186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Original strand, 5622879 - 5623041
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatac 190  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5622879 aatctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaatagacaaactctatac 5622978  T
Q  191 aaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggttta 253  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5622979 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggttta 5623041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41382916 - 41382671
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||       
T  41382916 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag--- 41382820  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| || |||     
T  41382819 --------gtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaattctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 41382728  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  41382727 agccccatctatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 41382671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21480756 - 21480545
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21480756 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcacccgcctaattctaccaaaaaccccaatatcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgt 21480657  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||        |||||||||| || ||||    
T  21480656 ttcccaaggtgaatcaaccc---aaacctagtgtttgttgccaagag-caaactccatacaaaccctag-tttg-------atttctaaacccttgtttc 21480569  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttac 254  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  21480568 agccccatctatctcaaggtttac 21480545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 122 - 285
Target Start/End: Original strand, 35872555 - 35872713
Alignment:
Q  122 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||    
T  35872555 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaacccta-----gttgttgcctttctaaac 35872649  T
Q  222 ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  35872650 ccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 35872713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21482564 - 21482322
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21482564 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcttaatagtgt 21482465  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||        |||||||||| || ||||    
T  21482464 ttcccaaggtgactcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctag-tttg-------atttctaaacccttgtttc 21482377  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||    
T  21482376 agtccactctatctcaaagtttactctgatacaaattctatatttatagtaaaag 21482322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18813126 - 18812892
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813126 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtacccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 18813027  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||           |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||    
T  18813026 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctct 18812938  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||| | |||| | |||||  ||  ||||||||||||| ||||||    
T  18812937 atctccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagt 18812892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15956211 - 15956051
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  15956211 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagattcaatcctaacagtgt 15956112  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacc 195  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15956111 ttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaacc 15956051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43530369 - 43530213
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43530369 caaaagagaaatcaatgggttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgt 43530270  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 187  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  43530269 ttcccaaggtgaatcaaccttcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactcta 43530213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 3005713 - 3005932
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3005713 caaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatgctaatagtgt 3005812  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt- 229  Q
    || |||| |||||||||   || ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||| || |||     
T  3005813 tttccaaagtgaatcaa---tccaaccctattgtttgttgttaagag-caaactctatacaaactctag-tttgttatt-tgtttctaaacccttgtttc 3005906  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttaca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3005907 cagccccctctatctcaaggtttaca 3005932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 181754 - 181622
Alignment:
Q  33 aaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt--cacgtaaccaagagactcaatcct-aatagtg 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || | ||||||  | |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  181754 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccattctcttcccgcgtaactaagagacttaatcctaaatagtg 181655  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  181654 tttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagt 181622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 257
Target Start/End: Original strand, 37214317 - 37214517
Alignment:
Q  67 ccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 166  Q
    ||||||||||||| |||||   | |||| |||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214317 ccgcctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 37214407  T
Q  167 gttgccaagagacaaactctatacaaaccct-------------------agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaa 247  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||                   || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37214408 gttccaaagagacaaactctatacaaaccctcaatctcttcccgtaaccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 37214507  T
Q  248 ggtttacact 257  Q
    ||||||||||    
T  37214508 ggtttacact 37214517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 287
Target Start/End: Original strand, 3886153 - 3886255
Alignment:
Q  185 ctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  3886153 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 3886252  T
Q  285 gta 287  Q
    |||    
T  3886253 gta 3886255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31035238 - 31035144
Alignment:
Q  113 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttg 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31035238 actcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg 31035144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 245
Target Start/End: Original strand, 12517248 - 12517319
Alignment:
Q  174 agagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12517248 agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 12517319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 304
Target Start/End: Original strand, 14419784 - 14419851
Alignment:
Q  237 ctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgta 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419784 ctctatctcaaggtttaccctgatacaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgta 14419851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Original strand, 2468261 - 2468341
Alignment:
Q  105 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctata 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  2468261 accaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtatttgttgccaagag-caaactctata 2468341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Original strand, 31573847 - 31573961
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 169  Q
    |||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||    
T  31573847 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgtt 31573944  T
Q  170 gccaagagacaaactcta 187  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  31573945 gccaagaga-aaactcta 31573961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 31578359 - 31578476
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |   |||||||||| |||||  || ||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  31578359 caaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcataacagtg 31578458  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaa 147  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31578459 tttcccaaggtgaatcaa 31578476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31035370 - 31035252
Alignment:
Q  33 aaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | |||  |  |||||||||  || |||||||||||||||| |||  |||||    
T  31035370 aaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgtt 31035271  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccc 150  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31035270 tcccaaggtgaatcaaccc 31035252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 181632 - 181535
Alignment:
Q  190 caaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||| ||| |||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  181632 caaaccctagttttattgttgccattctaagcccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagta 181535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 2468211 - 2468260
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctat 80  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2468211 caaaagagatatcaatgggctacaagaataagtctcccgtctaattctat 2468260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 13985176 - 13985262
Alignment:
Q  47 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaa-ccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    ||||||||||||| ||| ||   |||||||||| |||||  ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13985176 gggttacaagaatcagtttcaaacctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 132
Target Start/End: Original strand, 2267161 - 2267205
Alignment:
Q  88 cctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2267161 cctaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 2267205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 147
Target Start/End: Original strand, 33839077 - 33839120
Alignment:
Q  105 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33839077 accaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 33839120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 287
Target Start/End: Original strand, 2468361 - 2468435
Alignment:
Q  213 tttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  2468361 tttctaaatccttgtttcagctccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 2468435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 9021251 - 9021289
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9021251 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 9021289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 16752666 - 16752704
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752666 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 16757411 - 16757449
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16757411 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16757449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 17799568 - 17799606
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17799568 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28327946 - 28327908
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28327946 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28332669 - 28332631
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28332669 ctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28332631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28895540 - 28895502
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28895540 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30423274 - 30423212
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30423274 cctaattctatccaaagttccaatctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaaaagtgttt 30423212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43530209 - 43530122
Alignment:
Q  204 gttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    || |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  43530209 gttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 43530122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 147
Target Start/End: Original strand, 13985954 - 13986011
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 147  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13985954 aatctcttcccgtgattaagagtctcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 13986011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6376032 - 6375960
Alignment:
Q  242 tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatctaa 314  Q
    |||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| || ||||||||    
T  6376032 tctcaatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcccgcataaaattggaataaatctaa 6375960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17847740 - 17847661
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc--ccaaggtgaatcaa 147  Q
    |||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  17847740 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagattcaatcctaatagtgtttcgttcaaggtgaatcaa 17847661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13057427 - 13057173
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13057427 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgt 13057328  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || ||||    
T  13057327 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttc 13057228  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  13057227 agccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 13057173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25477507 - 25477253
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25477507 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 25477408  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  25477407 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 25477308  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  25477307 agccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaag 25477253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3390612 - 3390345
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390612 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 3390513  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  3390512 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagaaaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 3390413  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaa 298  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  3390412 agccccgtctatctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatctctcataaa 3390345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 3629945 - 3630199
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3629945 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgt 3630044  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||    
T  3630045 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgatgtttc 3630144  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  3630145 agccccctctatctcaagttttacattgatacaatgtctatatttatagtaaaag 3630199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Original strand, 3632019 - 3632267
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3632019 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgt 3632118  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  3632119 ttcccaagatgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 3632218  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3632219 aactccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatag 3632267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32280229 - 32279974
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280229 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 32280130  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||    
T  32280129 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttttaaacccttgtttc 32280030  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    || |||||||||||| | ||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||    
T  32280029 ag-cccctctatctccaagtttactatgatacaaggtctatatatataggaaaagta 32279974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Original strand, 11983110 - 11983365
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983110 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 11983209  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  11983210 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcctttgtttc 11983309  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||||||||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  11983310 agccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 11983365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13039987 - 13039733
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13039987 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgt 13039888  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| || ||||    
T  13039887 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttc 13039788  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  13039787 agcctcctatatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaag 13039733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 278
Target Start/End: Original strand, 14458848 - 14459093
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458848 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 14458947  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14458948 ttcccaagg--aatcagccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttc 14459045  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 278  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||    
T  14459046 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 14459093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 15530204 - 15530459
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530204 caaaagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 15530302  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || ||  |||    
T  15530303 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaagcccttgcttc 15530402  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||   |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15530403 agccccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 15530459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Original strand, 15541221 - 15541476
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  || ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15541221 caaaagagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaattctaatagtgt 15541320  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || ||||    
T  15541321 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttc 15541420  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  15541421 agccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15541476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9020159 - 9019903
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020159 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagactcaatcctaatagtgt 9020060  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||     
T  9020059 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgattgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 9019960  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||   |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  9019959 agccccctctatctctcagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagta 9019903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 3233811 - 3234065
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233811 caaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 3233910  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| | || |||    
T  3233911 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaaagagacaaactatatacaaaccttagttttgttgttgtctttctaaatccttgttt 3234010  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||    
T  3234011 cagccccctctatcttaaggtttacactgatacaa-gtctatatttatagtaaaag 3234065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Original strand, 14507266 - 14507512
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507266 atcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 14507365  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  14507366 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctct 14507465  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||| |||| | || ||  || |||||||||||||| |||||||    
T  14507466 atctcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagta 14507512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Original strand, 28241402 - 28241659
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241402 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 28241501  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  28241502 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 28241601  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    ||||||||||||||| | |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  28241602 agccccctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 28241659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 287
Target Start/End: Original strand, 30728916 - 30729165
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30728916 gatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctcttcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaa 30729015  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| | ||| || |||||||||||    
T  30729016 ggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgtctttcgatacccttgtttcagccccc 30729115  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  30729116 tctatctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagta 30729165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 15532762 - 15533018
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  || ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15532762 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgt 15532861  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||    
T  15532862 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctattgtttgttccaaagaaacaaactttatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttc 15532961  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15532962 agccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 15533018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Original strand, 12195605 - 12195852
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12195605 atcaatgggttacaagaataagtctcccgattaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 12195704  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  12195705 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 12195804  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| |||| |  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  12195805 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 12195852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 24338528 - 24338783
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||  | |||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24338528 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtcttaatctctttccataaccaaaagactcaatcttaatagtgt 24338627  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc-tagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||    
T  24338628 tttccaaggtaaatcaaccctcaaacccctagtgtttgttgctaagacacaaactttatgcaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 24338727  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  24338728 cagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 24338783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 4816312 - 4816526
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816312 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 4816411  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  4816412 tttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 4816511  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  4816512 agccccctctatctc 4816526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Original strand, 1230330 - 1230587
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1230330 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccaataaccaagagagtcaatcctaatagtgt 1230429  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  1230430 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 1230529  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    | ||| ||||||||||| |||| |  ||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  1230530 aaccctctctatctcaaagtttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 1230587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 20915446 - 20915651
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20915446 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 20915545  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  20915546 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 20915645  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  20915646 tatctc 20915651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 19704659 - 19704864
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19704659 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 19704758  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  19704759 tgaatcaacccacaaactctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 19704858  T
Q  240 tatctc 245  Q
     |||||    
T  19704859 catctc 19704864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22490873 - 22490626
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490873 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 22490774  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttc-taaacctttattt 229  Q
    ||| ||||||| ||    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| || |||    
T  22490773 ttcgcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgttccaaagaggcaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctttcaaaaacccttgttt 22490674  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22490673 cagccccctctatctcaaggtttacactaattcaatgtctatatttat 22490626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30967434 - 30967220
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967434 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 30967335  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  30967334 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 30967235  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  30967234 agccccctctatctc 30967220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26065205 - 26065005
Alignment:
Q  42 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065205 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 26065106  T
Q  142 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  26065105 aatcaaccctcaaaccctagtgtttc---caaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta 26065009  T
Q  242 tctc 245  Q
    ||||    
T  26065008 tctc 26065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26085174 - 26084974
Alignment:
Q  42 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085174 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 26085075  T
Q  142 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  26085074 aatcaaccctcaaaccctagtgtttc---caaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta 26084978  T
Q  242 tctc 245  Q
    ||||    
T  26084977 tctc 26084974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 2628976 - 2629179
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2628976 atcaatgggttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 2629075  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||    
T  2629076 gaatcaacccttaaaacctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctct 2629174  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  2629175 atctc 2629179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 26932652 - 26932857
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26932652 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaagg 26932751  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || || ||||| |||||||    
T  26932752 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgcttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcttttctaagcccttgtttcaaccccctc 26932851  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  26932852 tatctc 26932857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 12161638 - 12161889
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || | |||  |  ||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  12161638 caaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttcccgtaaccaatagactcgatcttaatagtgt 12161737  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  12161738 ttcccaacgtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgtt--ccagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttc 12161835  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||    
T  12161836 ag-cccctttatctcaaggtttacaatgatacaatgtctatatttaaagtaaaag 12161889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 30034684 - 30034944
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  30034684 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccttaaccaattgactcaatcctaatagtgt 30034783  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| || |||     
T  30034784 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaactctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 30034883  T
Q  231 agccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||| |||||||||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  30034884 agctccctctatctctcttaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 30034944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 286
Target Start/End: Original strand, 19227514 - 19227744
Alignment:
Q  56 gaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19227514 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 19227613  T
Q  156 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca 255  Q
    |||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||| |     
T  19227614 ccctagtgtttgatccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctttatctcaaagtttgct 19227713  T
Q  256 ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||  ||  ||||||||||||| ||||||    
T  19227714 ctgatacaagatctatatttatagtaaaagt 19227744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 3027935 - 3028187
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3027935 caaaagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcctaattctactcaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 3028034  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||||  ||||    
T  3028035 ttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgccttccaaacccttgttttc 3028130  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||| | ||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  3028131 agccccttttatctcatggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 3028187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15719875 - 15719665
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15719875 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgt 15719776  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||| || ||||    
T  15719775 tttccaaggtgaatcaactc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacaaaccctag-tttg-------atttctaaacccttgtttc 15719688  T
Q  231 agccccctctatctcaaggttta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15719687 agccccctctatctcaaggttta 15719665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17012273 - 17012029
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct-aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  17012273 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattcta-ccaaaagcatcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatattg 17012175  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaa-cctttatt 228  Q
    ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    ||||||| |||||  |    
T  17012174 tttcagaaggtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctag-tttgttgtt-tacttctaaacccttttat 17012080  T
Q  229 tcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||    
T  17012079 tcagacccctctatctcaaggtttactccgatacaaggtctatatttatag 17012029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 285
Target Start/End: Original strand, 32447502 - 32447651
Alignment:
Q  137 aggtgaatcaaccctcaaacc-ctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccc 235  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  32447502 aggtgaatcaaccctcaaaactctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 32447601  T
Q  236 cctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||| |||||    
T  32447602 cctctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 32447651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 165
Target Start/End: Original strand, 5273306 - 5273431
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5273306 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 5273405  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5273406 tgaatcaacccacaaaccctagtgtt 5273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14466556 - 14466399
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14466556 caaaagagatatcaatgagttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 14466457  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctc-aaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 187  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14466456 ttcccaagatgaatcaatcctcaaaaccctagtgtttgttgccaatagacaaactcta 14466399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 278
Target Start/End: Original strand, 13870608 - 13870749
Alignment:
Q  136 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  13870608 aaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcag-cc 13870706  T
Q  236 cctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 278  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  || | |||||||||||    
T  13870707 cctctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttata 13870749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 1072067 - 1072214
Alignment:
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| || ||    
T  1072067 tgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacactagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccttc 1072166  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  1072167 tatctcaaagtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 1072214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 1069800 - 1069913
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069800 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 1069899  T
Q  131 ttcccaaggtgaat 144  Q
    ||||||||||||||    
T  1069900 ttcccaaggtgaat 1069913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Original strand, 16455507 - 16455672
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||  ||| | ||||||||| |||||||| |||||    
T  16455507 caaaagagatatcaaagggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgt 16455606  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 199  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16455607 ttcccaaggtgaatcaacc--acaaccctagtgttcgttgccaagaga-aaactctgtacaaaccctag 16455672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17852650 - 17852519
Alignment:
Q  156 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca 255  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17852650 ccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttact 17852551  T
Q  256 ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  17852550 ctgattcaaagtctatatttatagtaaaagta 17852519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15346524 - 15346368
Alignment:
Q  119 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttcta 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||         |||||    
T  15346524 tcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaattttatacaaaccctag-tttgaa-------ttcta 15346437  T
Q  219 aacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  15346436 aacccttggttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 15346368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15367257 - 15367101
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||     ||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15367257 gatattaatgggttacaagaataagtctcccgattaattttacccaaagtttcaatctcttcccgcgacgaagagactcaatcctaagagtgtttcccaa 15367158  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 198  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  15367157 ggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaacacaatacaaccccta 15367101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19696673 - 19696453
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||| |   |||||||||| |||||  |  ||||||||   || || ||||||||||||||||| ||||    
T  19696673 caaaagagatatcaaaggattacaagaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctctttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtg 19696574  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaa-cctttatt 228  Q
    ||||||||||||||||||   |  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||  ||    
T  19696573 tttcccaaggtgaatcaat--ttgaaccctagtgattgttgccaagag-caaactctatacaaacccta-atttgttgtt-tgtttctaaacccttgttt 19696479  T
Q  229 tcagcc--ccctctatctcaaggttt 252  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||    
T  19696478 tcagccctccctctctctcaaggttt 19696453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 26066214 - 26066307
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26066214 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8995570 - 8995456
Alignment:
Q  173 aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctata 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||   |||||| |||||  ||  ||||||    
T  8995570 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctcagtttactctgatacaagatctata 8995471  T
Q  273 tttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||| |||||||    
T  8995470 tttatagtaaaagta 8995456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Original strand, 12186153 - 12186271
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  |  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  12186153 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattgtacccaaagtctcaatctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtg 12186252  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaac 148  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12186253 tttcccaaggtgaatcaac 12186271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10584213 - 10584105
Alignment:
Q  172 caagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  10584213 caagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcttttataaacctttgttt-----ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttat 10584119  T
Q  272 atttatagcaaaag 285  Q
    |||||||| |||||    
T  10584118 atttatagtaaaag 10584105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33309080 - 33308988
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33309080 atcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33311349 - 33311257
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33311349 atcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26945377 - 26945258
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||  || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26945377 caaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtg 26945278  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaacc 149  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  26945277 tttcccaaggtgactcaacc 26945258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 26068485 - 26068578
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  || ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26068485 atcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtttc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 29754799 - 29754892
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29754799 atcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20527037 - 20526885
Alignment:
Q  33 aaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |   |||||||||| | |||  | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20527037 aaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcttaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtt 20526938  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 187  Q
    | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20526937 ttccaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttgtcaagag-caaactcta 20526885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Original strand, 22858096 - 22858181
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagaga 178  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22858096 aatctcttcttgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttaccaagaga 22858181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 147
Target Start/End: Original strand, 7542465 - 7542581
Alignment:
Q  33 aaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaa-ccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7542465 aaagagatatcaaagggttacaaaaattagtcttcaaacctaattctatccaaattcccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgt 7542564  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaa 147  Q
    ||| | | |||||||||    
T  7542565 ttctccaagtgaatcaa 7542581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 253
Target Start/End: Original strand, 25078639 - 25078856
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||   ||| | | ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||  |||    
T  25078639 caaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacttaaatctc-aatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacggtg 25078737  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaaccttt-att 228  Q
    ||| ||||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||  ||    
T  25078738 tttaccaaggtgaatcaa--tttcaaccctaatgtttgttgccaagag-taaactc--tacaaaccctaga-ttgttg-tatgtttctaaacctttgttt 25078830  T
Q  229 tcagcccc-ctctatctcaaggttta 253  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||    
T  25078831 tcggcccctctctctctcaaggttta 25078856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11138479 - 11138423
Alignment:
Q  92 atctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 147  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11138479 atctcttcccgtgaccaagtgactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11138423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15367079 - 15367013
Alignment:
Q  228 ttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgt-------aatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||| |||||||    
T  15367079 ttcagccccctctatctcaaggtttacaccgatgtctgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 15367013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 28037811 - 28037927
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataag-tctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |    |||||||||| |||||  |  ||||| ||  ||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  28037811 caaaagagatatcaaagggttacaagaataagattttaaacctaattctacccaaagtctcaatctatttccgtgaacaagggactcaatcctaacagtg 28037910  T
Q  130 tttcccaaggtgaatca 146  Q
    |||||||||||||||||    
T  28037911 tttcccaaggtgaatca 28037927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 3577658 - 3577696
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3577658 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4595102 - 4595048
Alignment:
Q  154 aaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 211  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  4595102 aaccctagtgtttgttgccaagtga-aaactc--tacaaaccctagttttgttgttgc 4595048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13878765 - 13878727
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13878765 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13878727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13883513 - 13883475
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883513 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13883475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15346573 - 15346535
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatt 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15346573 gatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcttaatt 15346535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16785957 - 16785919
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16785957 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16785919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 26887368 - 26887406
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26887368 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 26887406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 31248858 - 31248896
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31248858 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31248896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 35201470 - 35201508
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35201470 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35201508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6843287 - 6843217
Alignment:
Q  105 accaagagactcaatcctaatagtgtttcc-caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaga 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |   |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  6843287 accaagagactcaatcctaatggtgtgtgttcaaggtgattcaatcct--aaccctagtgtttgttgccaaga 6843217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30445661 - 30445602
Alignment:
Q  118 atcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagaga 178  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||    
T  30445661 atcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc-tcaa-ccgtagtgtttgttgccaagaga 30445602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 106)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19096135 - 19095880
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19096135 caaaagagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 19096036  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| || |||    
T  19096035 ttcacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgttt 19095936  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  19095935 cagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 19095880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16453561 - 16453282
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453561 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 16453462  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||    
T  16453461 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttgtacaaactctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttc 16453362  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaat 310  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16453361 agccccctctatctctcggtttgctctgatacaaagcctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaacaaat 16453282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 38 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36378537 - 36378263
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36378537 gatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttaatcctaatagtgttttccaa 36378438  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||     
T  36378437 ggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccg 36378338  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    ||||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  36378337 tctatctcaaggtttattctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtaaccctcataaaattgtaacaaatct 36378263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 12395926 - 12396180
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12395926 caaaagagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 12396025  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  12396026 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggctagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttc 12396125  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  12396126 agccccatctatctcaaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaag 12396180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 22802815 - 22803071
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802815 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 22802914  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  22802915 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 22803014  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  22803015 agccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 22803071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48486571 - 48486315
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486571 caaaagagatttcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 48486472  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  48486471 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 48486372  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  48486371 agccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 48486315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 38928258 - 38928513
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928258 caaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 38928357  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||    
T  38928358 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgttt 38928457  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  || | |||||||||||| |||||    
T  38928458 cagccccctctatctcaaggtttactctaatacaaagcctatatttatagtaaaag 38928513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 12400888 - 12401142
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12400888 caaaagagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgt 12400987  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  12400988 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggccagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttc 12401087  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  12401088 agccccatctatctcaaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaag 12401142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24889048 - 24888792
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24889048 caaaagagatatcaatgggttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 24888949  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  24888948 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaagcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 24888849  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  24888848 agccccctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 24888792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Original strand, 37313147 - 37313370
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313147 caaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 37313246  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  37313247 ttctcaaggtgaatcaactctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 37313346  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttac 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37313347 agccccctctatctcaaggtttac 37313370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14633570 - 14633315
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633570 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc-cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 14633472  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14633471 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttc 14633372  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    || ||| |||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  14633371 ag-cccttctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 14633315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 260
Target Start/End: Original strand, 33415569 - 33415797
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33415569 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcttaatagtgt 33415668  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||    
T  33415669 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtt-ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttc 33415767  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgat 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33415768 agccccctctatctcaaggtttactctgat 33415797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 40637326 - 40637069
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40637326 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgt 40637227  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  40637226 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 40637127  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    ||||||||||||||| | |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  40637126 agccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 40637069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5198672 - 5198416
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5198672 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgt 5198573  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  5198572 ttcccaaagtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 5198473  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  5198472 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 5198416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24879241 - 24878985
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879241 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 24879142  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |  ||||    
T  24879141 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctggtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctagtttc 24879042  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||| | |||||| | |||  || |||||||||||||| |||||||    
T  24879041 agccccctctatctccaagtttactcggatacaaggtctatatttatagtaaaagta 24878985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24880703 - 24880447
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880703 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 24880604  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||     
T  24880603 ttcccaaggtgaaccaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctagttta 24880504  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
     |||||||||||||| | |||||| | |||  || |||||||||||||| |||||||    
T  24880503 cgccccctctatctccaagtttactccgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 24880447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 51015488 - 51015242
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015488 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 51015389  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  51015388 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 51015289  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  51015288 atctccaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagta 51015242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11435197 - 11434952
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435197 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactcttccggtaaccaggagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 11435098  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  11435097 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 11434998  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  11434997 atctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 11434952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 619528 - 619784
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||  || ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  619528 caaaagagatatcaatgggttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccttaaccaagacagtcaatcctaatagtgt 619627  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| |||||| || ||||    
T  619628 ttcccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgttgtctttataaacccttgtttc 619727  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  619728 agccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 619784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 22800943 - 22801199
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22800943 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgt 22801042  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  22801043 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttc 22801142  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  22801143 agccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 22801199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 40091496 - 40091752
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40091496 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgt 40091595  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  40091596 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttccaaagagacaaactctaaacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 40091695  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  40091696 agccccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 40091752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47274978 - 47274723
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274978 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 47274879  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  47274878 ttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 47274780  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  47274779 agccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 47274723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Original strand, 44599928 - 44600175
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44599928 atcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 44600027  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  44600028 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 44600127  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| |||| |  | ||  || |||||||||||||| |||||||    
T  44600128 tatctcaaagtttgctttaatacaaggtctatatttatagtaaaagta 44600175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 8631500 - 8631714
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631500 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 8631599  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  8631600 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 8631699  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  8631700 agccccctctatctc 8631714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 56030685 - 56030443
Alignment:
Q  42 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 141  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030685 tcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 56030586  T
Q  142 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||| || |||||||||| ||||    
T  56030585 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccttcta 56030486  T
Q  242 tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    ||||||||||||| |||||  || | |||||||||||| ||||    
T  56030485 tctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 56030443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 36919665 - 36919924
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919665 caaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 36919764  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||    
T  36919765 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactttatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 36919864  T
Q  230 cagccccctctatc--tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  36919865 cagccccctatatctatcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 36919924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41997744 - 41997496
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41997744 caaaagagatattaaagggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgt 41997645  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||  || ||||    
T  41997644 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgtttcctttctgaacacttgtttc 41997545  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  41997544 agccccctttatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatag 41997496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Original strand, 22044481 - 22044727
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22044481 atcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggg 22044580  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  22044581 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 22044680  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||| | |||| | |||||  || | |||||||||||| |||||||    
T  22044681 atctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagta 22044727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Original strand, 22046776 - 22047022
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046776 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 22046875  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  22046876 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 22046975  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||| | |||| | | |||  || | |||||||||||| |||||||    
T  22046976 atctccaagtttgctccgatacaaggcctatatttatagtaaaagta 22047022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 36921574 - 36921832
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921574 caaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 36921673  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || |||    
T  36921674 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgttt 36921773  T
Q  230 cagccccctcta--tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    || |||||||||  |||||| |||||| |||||  || |||||||||||| | |||||||    
T  36921774 ca-ccccctctatctctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttattgtaaaagta 36921832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13544211 - 13543997
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544211 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 13544112  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| | | || |||    
T  13544111 ttcccaaggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgttt 13544013  T
Q  230 cagccccctctatctc 245  Q
    ||||||||||||||||    
T  13544012 cagccccctctatctc 13543997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 5637546 - 5637760
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637546 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 5637645  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  5637646 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttc 5637745  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  5637746 agccccctctatctc 5637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Original strand, 16934233 - 16934479
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16934233 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaagg 16934332  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  16934333 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagccccctc 16934432  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||||| |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  16934433 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 16934479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18847396 - 18847150
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18847396 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatgctaatagtgtttcccaagg 18847297  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||    
T  18847296 tgaatcaacccacaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctc 18847197  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||||| ||||    ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  18847196 tatctcaaagtttgttttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18847150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24348470 - 24348256
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348470 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 24348371  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  24348370 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 24348271  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  24348270 agccccctctatctc 24348256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9148495 - 9148247
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148495 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 9148396  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||    
T  9148395 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgcttcagccccctct 9148296  T
Q  241 a--tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |  |||||| |||| | |||||  || | |||||||||||| |||||||    
T  9148295 atctctcaaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagta 9148247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 11006327 - 11006532
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11006327 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 11006426  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  11006427 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 11006526  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  11006527 tatctc 11006532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 11008656 - 11008861
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11008656 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 11008755  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  11008756 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 11008855  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  11008856 tatctc 11008861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 47868653 - 47868396
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868653 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 47868554  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  47868553 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttc 47868454  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    ||||| ||||||||| | |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  47868453 agccctctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 47868396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 18709254 - 18709458
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18709254 atcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcccaaggt 18709353  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  18709354 gaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 18709453  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  18709454 atctc 18709458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 37089462 - 37089666
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089462 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 37089561  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  37089562 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctct 37089661  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  37089662 atctc 37089666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38409447 - 38409243
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409447 atcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 38409348  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  38409347 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaaccattgtttcagccccctct 38409248  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  38409247 atctc 38409243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 3824651 - 3824863
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3824651 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgt 3824750  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||    
T  3824751 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacc--tgtttc 3824848  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  3824849 agccccctctatctc 3824863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 14787512 - 14787770
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787512 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 14787611  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  14787612 ttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 14787711  T
Q  231 agccccctctatctc--aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||  || |||||   ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  14787712 agccccctctatctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 14787770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 26086069 - 26086236
Alignment:
Q  43 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086069 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 26086168  T
Q  143 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26086169 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 26086236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19322945 - 19322701
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19322945 caaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 19322846  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| || ||||    
T  19322845 ttcccaaggtgaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-acttctaaacccttgtttc 19322750  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||||    
T  19322749 atccccctctatctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatag 19322701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 22782828 - 22783033
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22782828 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaagg 22782927  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  22782928 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctc 22783027  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  22783028 tatctc 22783033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 279
Target Start/End: Original strand, 9176564 - 9176803
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9176564 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 9176663  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  9176664 tgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 9176763  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    |||||| | |||| |  ||||  || ||||||||||||||    
T  9176764 tatctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 9176803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 18409428 - 18409681
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct-aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18409428 caaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattcta-ccaaaagtctcaatctcttcctataactaagagactcaatcctaatagtg 18409526  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||    
T  18409527 ttcccgaaggttaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18409626  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||| || ||||||||||  ||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||    
T  18409627 cag-cctctctatctcattgtttacactgatacaaattctatatttatagtaaaag 18409681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 55 - 285
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937543
Alignment:
Q  55 agaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 3937413  T
Q  155 accctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttac 254  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3937414 accctagtgtttgttcccaagaaacaaactctatacaaactctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctcaaggtttac 3937513  T
Q  255 actgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
     |||||  || |||||||||||||| |||||    
T  3937514 tctgat-aaaagtctatatttatagtaaaag 3937543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Original strand, 16931879 - 16932125
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16931879 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaagg 16931978  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  16931979 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagccccctc 16932078  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||||| |||| |  ||||  || || ||||||||||| ||||||    
T  16932079 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtttatatttatagtaaaagt 16932125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 22780463 - 22780668
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22780463 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaagg 22780562  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  22780563 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctc 22780662  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  22780663 tatctc 22780668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 288
Target Start/End: Original strand, 2484963 - 2485211
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2484963 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 2485062  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc-tc 239  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  2485063 gaatcaacccagaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcccccttc 2485162  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    || ||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  2485163 tagctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 2485211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 22132482 - 22132684
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132482 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 22132581  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||    
T  22132582 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-cgaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctct 22132679  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  22132680 atctc 22132684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6765096 - 6764834
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |  |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6765096 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaacagtgt 6764997  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgc-----caagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaaccttt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  6764996 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 6764897  T
Q  226 atttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
     |||||||||| |||||||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  6764896 gtttcagccccttctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 6764834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Original strand, 9174236 - 9174482
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9174236 atcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaagg 9174335  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  9174336 tgaatcaactcacgaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 9174435  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||| | |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  9174436 tatctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 9174482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7941575 - 7941359
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941575 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 7941476  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtg--tttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatt 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||    
T  7941475 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcatttgctcgtaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 7941376  T
Q  229 tcagccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||||    
T  7941375 tcagccccctctatctc 7941359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6133090 - 6132871
Alignment:
Q  65 tcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 164  Q
    ||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6133090 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctagtgt 6132991  T
Q  165 ttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaa 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||    
T  6132990 ttgttgccaatagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctgaaccctt-gttcagcctcctctatctcaatgtttacaccgatacaa 6132892  T
Q  265 tgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  6132891 tgtctatatttatagtaaaag 6132871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Original strand, 52942540 - 52942776
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||             |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942540 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaccc-------------gtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 52942626  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  52942627 ttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 52942726  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgt--aatgtctatatttatag 279  Q
    || |||||||||||||| |||||  ||||| |  || ||||||||||||||    
T  52942727 ag-cccctctatctcaaagtttagtctgatatacaaggtctatatttatag 52942776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 259
Target Start/End: Original strand, 18534914 - 18535138
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18534914 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 18535013  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac-ctttattt 229  Q
    ||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||  |||    
T  18535014 ttctcaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttttaaacacttgtttt 18535108  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactga 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18535109 cagccccctctatctcaaggtttactctga 18535138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 18537556 - 18537806
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct-aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18537556 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta-ccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 18537654  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaa-cctttatt 228  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||  ||    
T  18537655 tttcctaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtggttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttt 18537749  T
Q  229 tcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||    
T  18537750 tcagccccctctatctcaatgtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaag 18537806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 31849689 - 31849894
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |  |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849689 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaagcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 31849788  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccct-agtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  31849789 gaatcaacccacaaaaccttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 31849888  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  31849889 tatctc 31849894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 22134707 - 22134909
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |  || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134707 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 22134806  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||    
T  22134807 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-tgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctct 22134904  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  22134905 atctc 22134909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36380593 - 36380425
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36380593 atatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaag 36380494  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttg 207  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36380493 gtgaatcaaccctcaaaccctaatggtttttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 36380425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 122 - 285
Target Start/End: Original strand, 38270158 - 38270321
Alignment:
Q  122 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38270158 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaaagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 38270257  T
Q  222 ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    | || |||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  38270258 ccttgtttcagcctcttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 38270321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 17662326 - 17662575
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662326 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 17662425  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||           ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  17662426 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 17662514  T
Q  231 agccccctcta----tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||    |||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  17662515 agccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 17662575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 122 - 285
Target Start/End: Original strand, 24446756 - 24446914
Alignment:
Q  122 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||    
T  24446756 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaacccta-----gttgttgcctttctaaac 24446850  T
Q  222 ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  24446851 ccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 24446914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 8756333 - 8756587
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaa-gagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |  ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  8756333 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaagagactcaatcctagtagtg 8756432  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaa-cctttatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||   ||||||| ||||  ||    
T  8756433 tttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaatcctaattttcttgttg-acttctaaacccttgttt 8756528  T
Q  229 tcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  8756529 tcagccccttctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 8756587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 47210833 - 47211035
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47210833 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgt 47210932  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||            | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  47210933 ttcccaa------------cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 47211020  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  47211021 agccccctctatctc 47211035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27499280 - 27499129
Alignment:
Q  48 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  27499280 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcctcaatctcttatcgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttctcaggatgaatcaa 27499181  T
Q  148 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499180 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 27499129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16455493 - 16455355
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455493 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 16455394  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16455393 ttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgtt 16455355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 53405358 - 53405123
Alignment:
Q  54 aagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  |  |  |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53405358 aagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctctttccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctca 53405259  T
Q  154 aaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagcccc---ctctatctcaaggt 250  Q
    || |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    ||| |||||| ||    
T  53405258 aaacctagt-tttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctctatctctctcaaagt 53405160  T
Q  251 ttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  53405159 ttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 53405123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Original strand, 38890307 - 38890472
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38890307 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgt 38890406  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 199  Q
    |||||||  ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38890407 ttcccaatatgaatcaacc--ccaaccctaatgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag 38890472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 15032630 - 15032898
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  || ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15032630 caaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgtccaagagactcaatcctaatagtgt 15032729  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||| ||  |||||||| |||||          |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| || ||||    
T  15032730 ttccaaatatgaatcaa-cctca----------tttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-acttctaaacccttgtttc 15032816  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |   | |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| || ||||||    
T  15032817 agccccctttatctcaaggtttactctggtaccaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatct 15032898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5101133 - 5100993
Alignment:
Q  147 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctca 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5101133 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacctttgtttcagtcccctctatctca 5101034  T
Q  247 aggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  5101033 aggtttaccctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 5100993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2891543 - 2891433
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891543 caaaagagatatcaatgggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 2891444  T
Q  131 ttcccaaggtg 141  Q
    |||||||||||    
T  2891443 ttcccaaggtg 2891433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2891427 - 2891314
Alignment:
Q  173 aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactga-tgtaatgtctat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  2891427 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatcttaaggtttacactgattacaatgtctat 2891328  T
Q  272 atttatagcaaaag 285  Q
    |||||||| |||||    
T  2891327 atttatagtaaaag 2891314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30136801 - 30136640
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  ||| ||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  30136801 caaaagagatatcgatgagtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttcttctcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgt 30136702  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacc 195  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30136701 ttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-taaactctatacaaacc 30136640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 13547398 - 13547302
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 135  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547398 atatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28453934 - 28453782
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||  | |||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28453934 caaaagagatatcaaaagtttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgt 28453835  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactct 186  Q
    ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28453834 ttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttcttgccaagag-caaactct 28453782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10113080 - 10112876
Alignment:
Q  71 ctaattctatccaaaaccctaatctcttcac-gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 169  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  10113080 ctaattctacccaaagtcctaatctcttccccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgtt 10112983  T
Q  170 gccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaa-cctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca-ctgatgtaatgt 267  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||| |||  ||||| | ||||||| ||||  ||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||  |||||    
T  10112982 gccaagag-caaactc--tacaaaccctagtttttgtgttg-gcttctaaacccttgttttcaactccctctctctcgaggtttacatctgatacaatgt 10112887  T
Q  268 ctatatttata 278  Q
    |||||||||||    
T  10112886 ctatatttata 10112876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 189
Target Start/End: Original strand, 47150976 - 47151131
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||  |  |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  47150976 aaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgt 47151075  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctata 189  Q
    |||||||||||||||||   |  |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  47151076 ttcccaaggtgaatcaa--tttcaaccctagtgttggttaccaagag-caaactctata 47151131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12102339 - 12102221
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||   | ||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  12102339 caaaagagatatcagtgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttccaatcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtg 12102240  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaac 148  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12102239 tttcccaaggtgaatcaac 12102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 289
Target Start/End: Original strand, 40999093 - 40999286
Alignment:
Q  92 atctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataca 191  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  40999093 atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgttttcctaggtgaatcaa-tctc-aatcctagtgtttgttgtcaagag-caaactctataca 40999189  T
Q  192 aaccctagatttgttgttg-cgtttctaaa-cctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaac 289  Q
    | |||||| ||| |||||| ||  |||||| ||||  ||||||  | ||||| |||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  40999190 acccctagttttcttgttgacg--tctaaacccttgttttcag-actctctacctcaaggtttactctgatataaggtttatatttatagtaaaaataac 40999286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9863898 - 9863795
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatac 190  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  9863898 aatctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaaggtgaatcaaac--ccaaccttagtgtttgttgccaaga-acaaactc--tac 9863804  T
Q  191 aaaccctag 199  Q
    |||||||||    
T  9863803 aaaccctag 9863795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10114519 - 10114435
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagag 177  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  10114519 aatctcttatcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaagtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag 10114435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 4215558 - 4215510
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 79  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215558 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 4215510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25357893 - 25357772
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct-aattctat----ccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaat 125  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   || ||||||||    |||||  || ||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  25357893 caaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacttaattctatatatccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaat 25357794  T
Q  126 agtgtttcccaaggtgaatcaa 147  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  25357793 agtatttcccaaggtgaatcaa 25357772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 31983616 - 31983727
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 136  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||  |  ||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31983616 gatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttccca 31983715  T
Q  137 aggtgaatcaac 148  Q
    ||||||||||||    
T  31983716 aggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Original strand, 5635557 - 5635611
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 85  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5635557 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 5635611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11437605 - 11437561
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11437605 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 11437561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 178
Target Start/End: Original strand, 3982258 - 3982411
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct-aattctatccaaaa-ccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagt 128  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |   || ||||||| |||||  ||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3982258 caaaagagatatcaaagtgttacaagaatcagtcttcaaacttaattctacccaaagtcccaaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaatagt 3982357  T
Q  129 gtttc-ccaaggtgaat--caaccctc-aaaccctagtgtttgttgccaagaga 178  Q
    ||||| |||||||||||   |||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3982358 gtttctccaaggtgaataaaaacaatctcaaccctagtgtttgttgccaagaga 3982411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16455356 - 16455258
Alignment:
Q  214 ttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||  ||||| | |||||  || | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16455356 ttctaaacccttgtttcagccccctttatctctcggtttgctctgatacaaagcctatattaatagcaaaagtaactaccattaaattgtaacaaatct 16455258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36380417 - 36380345
Alignment:
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    ||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  36380417 tatctcaaggtttactctgatacaaagtccatatttatagtaaaagtaaccctcataaaattgtaacaaatct 36380345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Original strand, 38208825 - 38208911
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagaga 178  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38208825 aatctcttcttgtgaccaaaagactcaatcttaatagtgtttctccaagatgaatcaatc-tcaa-ccctagtgtttgttgccaagaga 38208911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9022495 - 9022380
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctata 189  Q
    ||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||   || ||| ||    
T  9022495 aatctcttcccgtgaccaagaaattctatcctaatactgtttctccaaggtgaatcaatccc--aaccatagtgtttgttgccaagag---aattctcta 9022401  T
Q  190 caaaccctagatttgttgttg 210  Q
    |||||||||| |||| |||||    
T  9022400 caaaccctagttttgatgttg 9022380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Original strand, 16185924 - 16186018
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |   |||||||||| |||||   | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16185924 atatcaaagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 5101173 - 5101133
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5101173 atatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaagtcta 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 5336903 - 5336964
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5336903 cctaattctacccaagtccc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 5336964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 7050401 - 7050439
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050401 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7050439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11853587 - 11853549
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11853587 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 11853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 312
Target Start/End: Original strand, 16186079 - 16186199
Alignment:
Q  191 aaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc-agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaac 289  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||  || || ||||||||||| ||||||| |    
T  16186079 aaaccctag-tttgttgttt-gtttctaaacccttgtttttagccccctctctctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatc 16186176  T
Q  290 tcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
     | | |||||||| || ||||||    
T  16186177 cctcctaaaattggaacaaatct 16186199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 55822303 - 55822265
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55822303 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 55822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 54906779 - 54906722
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 147  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54906779 aatctcttccagtgaccaagagactcaattctaatagtgtttctccatggtgaatcaa 54906722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16489388 - 16489352
Alignment:
Q  93 tctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16489388 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16489352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25699788 - 25699752
Alignment:
Q  93 tctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25699788 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25699752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 96)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44724787 - 44724533
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724787 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 44724688  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  44724687 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 44724588  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  44724587 agccccctatatctccaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 44724533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 38 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11355459 - 11355212
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355459 gatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 11355360  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  11355359 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 11355260  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| |||||    
T  11355259 tctatctcaaggtttacactgatacaaagcctatatttatagtaaaag 11355212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 20137190 - 20137444
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20137190 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcttaatagtgt 20137289  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  20137290 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 20137389  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  || | | |||||||||| |||||    
T  20137390 agccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagccaatatttatagtaaaag 20137444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 39 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21678266 - 21678020
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678266 atatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 21678167  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  21678166 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgatgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 21678067  T
Q  239 ctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  21678066 ctatctcaaggtttacattgatacaatatctatatttatagtaaaag 21678020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21680235 - 21679981
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680235 caaaagagatatcattgggttacaagaataaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 21680136  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  21680135 ttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 21680036  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  21680035 agccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 21679981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 4296015 - 4296271
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296015 caaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 4296114  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| || |||    
T  4296115 ttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 4296214  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgat-gtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  4296215 cagccccctctatctcaaggtttacactgatacaaatgtctatatttatagtaaaag 4296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 443802 - 443547
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  443802 aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtt 443703  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||| |    
T  443702 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaaccattgtttta 443603  T
Q  232 gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  443602 gctccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagta 443547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 287
Target Start/End: Original strand, 13099558 - 13099813
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13099558 aaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtt 13099657  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||    
T  13099658 tcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttca 13099757  T
Q  232 gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  13099758 accccctctatctcaaggtttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 13099813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 39146068 - 39146322
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39146068 caaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgt 39146167  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| || ||||    
T  39146168 tttccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctatctaaacccttgtttc 39146267  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  39146268 agccccctccatctcaaggtttacactgatacagtgtctatatttatagtaaaag 39146322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 284
Target Start/End: Original strand, 37412209 - 37412462
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412209 aaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 37412308  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgc-caagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  37412309 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 37412408  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  37412409 agccccctatatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 37412462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 27306311 - 27306566
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306311 caaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 27306410  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  27306411 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgttccaaagagacaaactctata-aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 27306509  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  27306510 agccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 27306566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24748802 - 24748555
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24748802 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgt 24748703  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| || ||||    
T  24748702 ttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttc 24748603  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 278  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24748602 agccccctctaagtcaaagtttacactgatacaatgtctatatttata 24748555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 42331078 - 42331336
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgt--aaccaagagactcaatcctaatagt 128  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42331078 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgtaaccaagagactcaatcctaatagt 42331177  T
Q  129 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| || ||    
T  42331178 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtt 42331277  T
Q  229 tcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  42331278 tcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagta 42331336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25276349 - 25276095
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276349 caaaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 25276250  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   || |||     
T  25276249 ttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaattattgtttt 25276150  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  || |  ||||||||||| |||||    
T  25276149 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagcatatatttatagtaaaag 25276095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24258671 - 24258442
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24258671 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 24258572  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  24258571 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 24258472  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgat 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24258471 agccccctctatctcaatgtttactctgat 24258442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 31435128 - 31435384
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||   | |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435128 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 31435227  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  31435228 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 31435327  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  31435328 agccccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagta 31435384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38394194 - 38393934
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394194 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 38394095  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  38394094 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 38393995  T
Q  231 agccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  38393994 agccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 38393934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20297570 - 20297356
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297570 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctatttctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 20297471  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| || ||||    
T  20297470 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctactgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgccattctaaacccttgtttc 20297371  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  20297370 agccccctctatctc 20297356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Original strand, 1049386 - 1049631
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1049386 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggt 1049485  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  1049486 gaatcaacccacaaaccctagtgtttattccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 1049585  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||| |||| | || ||  || |||||||||||||| ||||||    
T  1049586 atctcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 1049631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 260
Target Start/End: Original strand, 21592224 - 21592453
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  21592224 caaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcgcgtaaccaagagactaaatcctaatagtgc 21592323  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21592324 ttgccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctacttttgttgttgcatttctaaacctttgtttc 21592423  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgat 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21592424 agccccctctatctcaaagtttacactgat 21592453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 42223366 - 42223097
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42223366 caaaagagatatcaataggtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 42223267  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||    
T  42223266 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 42223167  T
Q  230 cagccc-cctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaa 298  Q
    || ||| | ||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  42223166 catcccacatctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaagaaaccctcataaa 42223097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35837 - 35581
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35837 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgt 35738  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| || ||||    
T  35737 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgtctttctgaacccttgtttc 35638  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  35637 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 35581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18345749 - 18345535
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345749 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 18345650  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  18345649 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtatttgttgcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 18345550  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    | |||||||||||||    
T  18345549 aaccccctctatctc 18345535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48457861 - 48457647
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457861 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 48457762  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  48457761 ttccctaggtgaatgaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 48457662  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  48457661 agccccctctatctc 48457647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Original strand, 40836833 - 40837078
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836833 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 40836932  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  40836933 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagccccctca 40837032  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||| |  ||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  40837033 atctccaaatttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 40837078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44772 - 44516
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||  || || |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44772 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaaaagactcaatcataatagtgt 44673  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  44672 ttcctaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 44573  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  44572 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 44516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 1047015 - 1047219
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047015 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 1047114  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  1047115 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctct 1047214  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  1047215 atctc 1047219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9679267 - 9679053
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679267 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 9679168  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| | | || |||    
T  9679167 ttcccaaggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgttt 9679069  T
Q  230 cagccccctctatctc 245  Q
    ||||||||||||||||    
T  9679068 cagccccctctatctc 9679053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Original strand, 31156001 - 31156248
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31156001 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 31156100  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  31156101 tgaatcaacccacaaatcctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 31156200  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| |||| |  ||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  31156201 tatctcaaagtttgccttgatacaagctctatatttatagtaaaagta 31156248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 7351742 - 7351947
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7351742 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 7351841  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  7351842 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaagcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 7351941  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  7351942 tatctc 7351947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9681020 - 9680768
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9681020 atatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgag 9680921  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||    
T  9680920 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcccttctaaacccttgtttcaaccccc 9680821  T
Q  238 tcta----tctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||    |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||    
T  9680820 tctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 9680768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 252
Target Start/End: Original strand, 27832721 - 27832936
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27832721 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27832820  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagc-ccc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||     
T  27832821 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtatgttgccaagagacaaactctatacaaaccttagttctgttgttgcctttttaaacccttgtttcagctcca 27832920  T
Q  237 ctctatctcaaggttt 252  Q
    ||||||| ||||||||    
T  27832921 ctctatcacaaggttt 27832936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 7470103 - 7470317
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470103 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 7470202  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  7470203 ttcacaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 7470302  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  7470303 agccccctctatctc 7470317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 7472061 - 7472275
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   | |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472061 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 7472160  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  7472161 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttc 7472260  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  7472261 agccccctctatctc 7472275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20626246 - 20626032
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626246 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 20626147  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  20626146 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 20626047  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  20626046 agccccctctatctc 20626032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20630137 - 20629923
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630137 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 20630038  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  20630037 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 20629938  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  20629937 agccccctctatctc 20629923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20642556 - 20642342
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642556 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 20642457  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  20642456 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 20642357  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  20642356 agccccctctatctc 20642342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Original strand, 22828714 - 22828996
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828714 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgt 22828813  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || | ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  22828814 tttctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgttttcaagagataaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttc 22828913  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatcta 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||  || | |||||||||||| ||||||| | | ||||||| || || |||||||    
T  22828914 agccccctctatctcaaggtttactcggatacaaagcctatatttatagtaaaagtatccctcataaaactggaacaaatcta 22828996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28487761 - 28487547
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487761 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 28487662  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| || ||||    
T  28487661 ttccaaaggtgaatcaacccacgaaccctagtgttagtttcgaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttc 28487562  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  28487561 agccccctctatctc 28487547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 7349363 - 7349568
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7349363 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 7349462  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  7349463 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccctgtttcagccccctc 7349562  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  7349563 tatctc 7349568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11757438 - 11757176
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757438 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 11757339  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacct-ttatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||  || ||    
T  11757338 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccccttgtt 11757239  T
Q  229 tcagccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  11757238 tcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 11757176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20299668 - 20299406
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299668 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 20299569  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacct-ttatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||  || ||    
T  20299568 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccccttgtt 20299469  T
Q  229 tcagccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  20299468 tcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 20299406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21990358 - 21990106
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21990358 caaaagagatatcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgt 21990259  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  21990258 ttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcatagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttc 21990159  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  21990158 ag-cccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 21990106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28485774 - 28485514
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485774 caaaagagaaatcaatggattacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 28485675  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  28485674 ttccaaaggtgaatcaacccgcaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 28485575  T
Q  231 agccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    | |||| ||||||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  28485574 aaccccttctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 28485514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1850189 - 1849975
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1850189 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcctcttcccgtaagcaagaaactcaatcctaatagtgt 1850090  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || ||||    
T  1850089 tttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttc 1849990  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  1849989 agccccctctatctc 1849975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25542727 - 25542484
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25542727 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtctttcc-aaggt 25542629  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25542628 gaatcaacccacaaaccctagtgttttttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacctttgtttcag-cccctct 25542530  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  25542529 atctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 25542484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26804765 - 26804554
Alignment:
Q  46 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804765 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 26804666  T
Q  146 aaccctcaaacccta---gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 242  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26804665 aaccctcaaaccctactagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 26804566  T
Q  243 ctcaaggtttac 254  Q
    ||||| ||||||    
T  26804565 ctcaaagtttac 26804554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3035932 - 3035669
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca---cgtaaccaagagactcaatcctaatag 127  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |  ||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3035932 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 3035833  T
Q  128 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |    
T  3035832 tgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 3035733  T
Q  228 ttcagccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  3035732 ttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 3035669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3878785 - 3878571
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878785 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 3878686  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  3878685 ttaccaaggtgaatcaacccacaagccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 3878586  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    |||||||||||||||    
T  3878585 agccccctctatctc 3878571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 286
Target Start/End: Original strand, 22251638 - 22251878
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  22251638 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta--------tcccaa 22251729  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||| ||    
T  22251730 ggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcctcc 22251829  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||||||| |||||| |||||  || || ||||||||||| ||||||    
T  22251830 tctatctcaaagtttactctgattcaaggtttatatttatagtaaaagt 22251878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40946536 - 40946327
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40946536 caaaagagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgt 40946437  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  40946436 tttccaaagtaaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 40946337  T
Q  231 agccccctct 240  Q
    ||||||||||    
T  40946336 agccccctct 40946327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Original strand, 20091626 - 20091904
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  20091626 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagatttaatcctaatagtgt 20091725  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    || ||||  ||||    
T  20091726 ttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctaatctttgttgccaatag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgcctccgaaacccttgttttc 20091821  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatcta 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| || |||||||    
T  20091822 agccccctctatctcaaggtttactctgataaaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatcta 20091904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7188739 - 7188470
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  |  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7188739 atatcaatgggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaag 7188640  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||   ||||||||| || ||||||||||||    
T  7188639 gtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaaccctatacaaaccctatttttattgttg-acttctaaacccttgtttcagccccct 7188544  T
Q  239 ctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| || ||||||    
T  7188543 ctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatct 7188470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 43253598 - 43253801
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43253598 caaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgt 43253697  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| | || ||||    
T  43253698 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaaccttgtttc 43253796  T
Q  231 agccc 235  Q
    |||||    
T  43253797 agccc 43253801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 170
Target Start/End: Original strand, 7092293 - 7092432
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7092293 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtat 7092392  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092393 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 7092432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 24817435 - 24817710
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  24817435 caaaagagacatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatactgc 24817534  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||   ||||||||| || ||||    
T  24817535 tttccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttctcttgttg-acttctaaacccttgtttc 24817629  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||   |||||| | | ||||||||||||| ||||||    
T  24817630 ag-cccctctatctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttata-ttaaagtatccctcataaaattgtaacaaatct 24817710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18567731 - 18567565
Alignment:
Q  121 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18567731 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 18567632  T
Q  221 cctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    || || |||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  18567631 cccttgtttcagccccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagta 18567565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 24813587 - 24813755
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24813587 gatataaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcaccaagagactcaatcctaatagtgcttcccaa 24813686  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttg 210  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24813687 ggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttcttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg 24813755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 170
Target Start/End: Original strand, 7094541 - 7094679
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7094541 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaattaagagactcaatcctaatagtgt 7094640  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7094641 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta-tgtttgttg 7094679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24465737 - 24465503
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24465737 atatcaatgagttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaag 24465638  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    |||||||||   |  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||        |||||||||| || ||||||||||||    
T  24465637 gtgaatcaa---ttcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacgctatacaaaccctag-tttg-------atttctaaacccttgtttcagccccct 24465550  T
Q  239 ctatctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||| ||||    
T  24465549 ctatctcaaggtttacatctgatacaaagtctatatctatagtaaaa 24465503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22392618 - 22392425
Alignment:
Q  82 caaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaa 181  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||    
T  22392618 caaaaccctcatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaatag-caa 22392523  T
Q  182 actctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagca 281  Q
    | |||||||||||||||| ||||        ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |    
T  22392522 attctatacaaaccctag-tttg-------atttataaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagta 22392431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38396833 - 38396713
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38396833 atcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaacagtgtttcccaaggt 38396734  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctag 161  Q
    |||||||||| |||| |||||    
T  38396733 gaatcaacccacaaaacctag 38396713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2935467 - 2935374
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2935467 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11081663 - 11081540
Alignment:
Q  82 caaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaa 181  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  11081663 caaaatcctaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttgccaagag---a 11081569  T
Q  182 actctatacaaaccctagatttgttgttg 210  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11081568 attctctacaaaccctagttttgttgttg 11081540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1606578 - 1606486
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1606578 atcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6049077 - 6048903
Alignment:
Q  33 aaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |   ||||||||||||||||  |  ||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6049077 aaagggatatcaaagggttataagaatacgtcttcaaacctaattctatccaaagtctcaatatcttctcgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtt 6048978  T
Q  132 tc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttg 210  Q
    ||  ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  6048977 tcttcaaggtgaatcaatcc-caaa-cctagtgtttgttgccaagag---aattctttacaaaccctagttttgatgttg 6048903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 9027284 - 9027376
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9027284 atcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22137276 - 22137184
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22137276 atcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 40552303 - 40552211
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40552303 atcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11084523 - 11084438
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagaga 178  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11084523 aatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaa-tctc-aaccctattgtttgttgccaagaga 11084438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22108265 - 22108173
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22108265 atcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22393930 - 22393873
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaacc 88  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22393930 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaacc 22393873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 40550025 - 40549933
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40550025 atcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 147
Target Start/End: Original strand, 16297166 - 16297222
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 147  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16297166 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6332428 - 6332283
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctccc-gcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||  |  |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  6332428 caaaagagatattaaagggttacaagaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtg 6332329  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagag 177  Q
    ||| ||||  ||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  6332328 ttttccaaactgaatcaa-tctc-aatcctagtgtttgttgccaagag 6332283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 6348990 - 6348936
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 85  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6348990 caaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaa 6348936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26295655 - 26295601
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26295655 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaa 26295601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 287
Target Start/End: Original strand, 30906264 - 30906387
Alignment:
Q  162 tgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac-ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgat 260  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  30906264 tgtttgttgctaagag-caaactctatacaaactctag-tttgttattt-gtttctaaattcttgttttcagccccctctatctcaagatttactcttat 30906360  T
Q  261 gtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
      || ||||||||||||||||||||||    
T  30906361 acaaggtctatatttatagcaaaagta 30906387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 38396377 - 38396316
Alignment:
Q  178 acaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  38396377 acaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 38396316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 171
Target Start/End: Original strand, 12310157 - 12310236
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgc 171  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  12310157 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgttcaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgc 12310236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26210688 - 26210603
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctca-aaccctagtgtttgttgccaagaga 178  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26210688 aatctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaa---tcacaaccctagtg-ttgttgccaagaga 26210603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2120937 - 2120881
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt--cccaaggtgaatcaac 148  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  2120937 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttgtccaaggtgaatcaac 2120881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21369683 - 21369642
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21369683 aatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21369642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 40281519 - 40281572
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 144  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40281519 aatctcttcccgtgaccaacagactcaatcctaacggtgtttcccaaggtgaat 40281572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 245
Target Start/End: Original strand, 7094662 - 7094717
Alignment:
Q  190 caaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 245  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7094662 caaaccctatgtttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 7094717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 3320194 - 3320232
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3320194 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 3324942 - 3324980
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3324942 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3324980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7069818 - 7069780
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7069818 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7074825 - 7074787
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7074825 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7074787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 15541139 - 15541177
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541139 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15541177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25351391 - 25351353
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25351391 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25357085 - 25357047
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357085 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25357047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25405431 - 25405393
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25405431 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25405393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25410168 - 25410130
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25410168 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25410130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 42006701 - 42006663
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42006701 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6348903 - 6348859
Alignment:
Q  154 aaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6348903 aaccctaatgtttgttgccaagag-caaactcgatacaaaccctag 6348859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 38 - 287
Target Start/End: Original strand, 40032146 - 40032395
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032146 gatatcaatgggttacaagaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 40032245  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  40032246 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 40032345  T
Q  238 tctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  40032346 tctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 40032395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Original strand, 15539564 - 15539809
Alignment:
Q  39 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15539564 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaatagtgtttcccaag 15539663  T
Q  139 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| || ||||| ||||||    
T  15539664 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcaaccccct 15539763  T
Q  239 ctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  15539764 atatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 15539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28196811 - 28196557
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196811 caaaagagatatcaatgggttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgt 28196712  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28196711 ttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttc 28196612  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || |  ||||||||||| |||||    
T  28196611 agccccctctatctcaatgtttactctgatacaaagcatatatttatagtaaaag 28196557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 42923590 - 42923848
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923590 caaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgt 42923689  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  42923690 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 42923789  T
Q  231 agccccctcta--tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  42923790 agcctcctctatctctcaaggtttactatgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 42923848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 33 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3022335 - 3022089
Alignment:
Q  33 aaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022335 aaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3022236  T
Q  133 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcag 232  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  3022235 cctaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttataaacccttgtttcag 3022136  T
Q  233 ccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  3022135 cctcctatatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatag 3022089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19007814 - 19007560
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19007814 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagaaactcaattctaatagtgt 19007715  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  19007714 ttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccataattttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 19007615  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  || | |||||||||||| |||||    
T  19007614 agccccctctatctcaaggtttactatgatacaaagcctatatttatagtaaaag 19007560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 284
Target Start/End: Original strand, 6264230 - 6264479
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6264230 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatcgtaaccaagagacttaatcctaatagtgt 6264329  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6264330 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtaccaaagagacaaactctatacaaaccc----tttgttgttgcctttctaaacctttgtttc 6264425  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  6264426 agccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 6264479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 277
Target Start/End: Original strand, 34979660 - 34979906
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34979660 caaaagagatataaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgt 34979759  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||  || ||||    
T  34979760 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagtttttttgttacctttctaaacgcttgtttc 34979859  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  34979860 agccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttat 34979906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42064679 - 42064433
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064679 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 42064580  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||    
T  42064579 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctct 42064480  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  42064479 atctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 42064433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Original strand, 13910135 - 13910380
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13910135 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggt 13910234  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  13910235 gaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 13910334  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  13910335 atctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 13910380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27104962 - 27104718
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104962 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 27104863  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  27104862 gaatcaacccacaaaccctagt-tttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccctct 27104764  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  27104763 atctcaaagttttctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27104718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Original strand, 19504427 - 19504681
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504427 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 19504525  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  19504526 ttcccaaggtgaatcaaccaacaaacccttgtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 19504625  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||||||||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  19504626 agccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 19504681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 11739641 - 11739895
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11739641 caaaagagatatcaatggattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagaatcaatcctaatagtgt 11739740  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| || || |    
T  11739741 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactccatacaaaccctaattttgttgttgtctttctaaacccttgttcc 11739840  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  11739841 agccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 11739895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17849291 - 17849037
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17849291 caaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttaccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgt 17849192  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||   |||||||||| || ||||    
T  17849191 ttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttcttccaaagaggcaaactctatacgaactctagttttgttgttatctttctaaacccttgtttc 17849092  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  17849091 agccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttatatttatagtaaaag 17849037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 45239058 - 45239316
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239058 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcttaattctaccaaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 45239157  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| | || ||||    
T  45239158 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-agagaaagtctatacaaaccctagttttgtttttgtctttctaaatcattgtttc 45239256  T
Q  231 agccccctcta----tctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||    |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  45239257 agccccctctatctctctcaaggtttacatctgatgaatggtctatatttatagtaaaag 45239316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 21520774 - 21521032
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520774 caaaagagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 21520873  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  21520874 ttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 21520973  T
Q  231 agccccctcta--tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||| ||||  |||||| |||||  |||||  || || ||||||||||| |||||||    
T  21520974 agccccatctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtttatatttatagtaaaagta 21521032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 23452318 - 23452578
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452318 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 23452417  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  23452418 ttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 23452517  T
Q  231 agccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||| ||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  23452518 agccccctctgtctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 23452578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Original strand, 45280065 - 45280323
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280065 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 45280164  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc-gtttctaaacctttattt 229  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||    
T  45280165 atcccaaggtgaatcaaccctctaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttttctaaacccttgttt 45280264  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||  || || |||||||||||  |||||||    
T  45280265 cagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtatatatttatagtgaaagtaa 45280323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 6258898 - 6259152
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258898 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagccccaatct--tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 6258995  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || ||||    
T  6258996 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaaactcttgtttc 6259095  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    | || |||||||||||| |||||  || ||  || |||||||||||||| |||||||    
T  6259096 atcctcctctatctcaaagtttagtctaatacaaggtctatatttatagtaaaagta 6259152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 284
Target Start/End: Original strand, 19502092 - 19502345
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502092 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 19502191  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  19502192 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttc 19502291  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    |||||||| |||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  19502292 agccccctttatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 19502345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42452955 - 42452701
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452955 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 42452856  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  42452855 ttcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgttac--agagacaaactttatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 42452758  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||| | |||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  42452757 agccccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttataataaaagta 42452701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 35215676 - 35215881
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35215676 atcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaaactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 35215775  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  35215776 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 35215875  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  35215876 tatctc 35215881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Original strand, 35218053 - 35218258
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35218053 atcaacgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 35218152  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  35218153 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 35218252  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  35218253 tatctc 35218258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 252
Target Start/End: Original strand, 44289149 - 44289370
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | || | |||||||| || ||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44289149 caaaagagatatcaacgggttacaagaataagttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgt 44289248  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| |||     
T  44289249 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacagactctatacaaactctagttttgttgttgccttcctaaacctttgtttt 44289348  T
Q  231 agccccctctatctcaaggttt 252  Q
    || ||||||||| |||||||||    
T  44289349 agtcccctctatatcaaggttt 44289370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 22287417 - 22287673
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||     ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  22287417 caaaagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtcaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgt 22287516  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  22287517 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 22287616  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | ||  || |||||||||||||| |||||||    
T  22287617 agccccctatatctcaaagtttactttaatacaaggtctatatttatagtaaaagta 22287673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17848614 - 17848394
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848614 caaaagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcct---tctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 17848519  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |  |||    
T  17848518 ttcccaaagtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctcgttt 17848419  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttac 254  Q
     ||||||||||||||||||| ||||    
T  17848418 gagccccctctatctcaaggattac 17848394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Original strand, 24162313 - 24162548
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |          | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24162313 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca----------gcaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggt 24162402  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  24162403 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 24162502  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  24162503 atctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24162548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 31732858 - 31733100
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||            |||||||||||||||||||| |||||    
T  31732858 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaa------------accaagagactcaatcctaacagtgt 31732945  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  31732946 ttcccaacgtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 31733045  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |  || |||||||||||||| |||||    
T  31733046 agccccctctatctcaatgtttactctgttacaaagtctatatttatagtaaaag 31733100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Original strand, 11578190 - 11578439
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11578190 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 11578289  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||| |||||||||||||  | |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| || ||||    
T  11578290 ttcccgaggtgaatcaacc--ccaacccta--gtttgttgccaagagaaaaattctatacaaaccctagtttttttgttg-acttctaaacccttgtttc 11578384  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  11578385 agcccactctatctcaagatttaccctgatataaggtctatatttatagtaaaag 11578439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14837441 - 14837193
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||  |  |||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  14837441 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttc------ccaagagactcaatcctaatagtgt 14837348  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||| | |||| || ||||    
T  14837347 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatgtacaaaccctagttttgttgttgtcttttttaacccttgtttc 14837248  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  14837247 agctccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaag 14837193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 43623661 - 43623905
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43623661 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgt 43623760  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||            ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  43623761 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagt------------gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttc 43623848  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    | |||||||||||||   |||||| |||||  || |||||| ||||||| |||||||    
T  43623849 acccccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatttttatagtaaaagta 43623905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 18800395 - 18800639
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18800395 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 18800494  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||          |||||||||| || ||||    
T  18800495 ttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctagctt--------gatttctaaacccttgtttc 18800582  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||| |||||| | |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  18800583 agccccctatatctccatgtttaccctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 18800639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 108 - 285
Target Start/End: Original strand, 22163106 - 22163282
Alignment:
Q  108 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttg 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22163106 aagagactcaa-cctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagtgttgttg 22163204  T
Q  208 ttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22163205 ttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctatctcaaagtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 22163282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22874304 - 22874035
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  22874304 caaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtgactaagagactcaatcctaatactgt 22874205  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    || |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||| || ||||    
T  22874204 tttccaaggtgaatcaaccc---aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttg-------atttctaaacccttgtttc 22874117  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||  || | || ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  22874116 agccccctctatctccaggtttgctctgatacaaagcctgtatttatagcaaaagtaaccctcataaaattgaaacaaatct 22874035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 105 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38020302 - 38020162
Alignment:
Q  105 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38020302 accaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctacacaaaccctagttttg 38020203  T
Q  205 ttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 245  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38020202 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 38020162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Original strand, 28459272 - 28459435
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  || ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459272 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 28459371  T
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacc 195  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28459372 tgccaaggtgaatccaccctcaaatcctagtttttgttgccaagagacaagctctatacaaacc 28459435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 287
Target Start/End: Original strand, 22407591 - 22407746
Alignment:
Q  132 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  22407591 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 22407690  T
Q  232 gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    || |||| |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  22407691 gcaccctatatctcacagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 22407746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 17897334 - 17897502
Alignment:
Q  38 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897334 gatatcaaagggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctcaatcttttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 17897433  T
Q  138 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttg 210  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17897434 ggtgaatcaa-tctcaa--cctagtgtttgttgcgaagag-caaactctatacaaaccctagttttattgttg 17897502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Original strand, 20146690 - 20146866
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  20146690 caaaagagatatcaaagagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgt 20146789  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttg 210  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20146790 ttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaag-ggcaaactctatacaaaccctagttttcttgttg 20146866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 5375427 - 5375550
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375427 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcc-gcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 5375525  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaa 155  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  5375526 ttcctaaggtgaatcaaccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 312
Target Start/End: Original strand, 37963030 - 37963289
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||     
T  37963030 atcaatggattacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcaggtgaccaagagactcaatctcaataatgttttctaaggg 37963129  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||| |   |||| | |||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||        |||||||||| || ||||||||||||||    
T  37963130 gaatcaacac---aaccatggtgtttgttgtcaagag-caaactatacacaaaccctag-tttg-------atttctaaacccttgtttcagccccctct 37963217  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    |||||||||||||| || ||  || |||||||||||||| ||||||| |   |||||||||| || ||||||    
T  37963218 atctcaaggtttactcttatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccatcataaaattggaacaaatct 37963289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 36558954 - 36559047
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36558954 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 36561231 - 36561324
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36561231 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 45332271 - 45332364
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45332271 atcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Original strand, 27136206 - 27136368
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||  || ||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27136206 caaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattcaatcctaatagtg 27136305  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacc 195  Q
    ||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  27136306 ttttccaagatgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caagctctatataaacc 27136368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 245
Target Start/End: Original strand, 5377629 - 5377724
Alignment:
Q  150 ctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 245  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  5377629 ctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagtcccctctatctc 5377724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 40699548 - 40699429
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| |||||||| || |||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40699548 caaaagagatatcaaaggattacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 40699449  T
Q  130 tttcccaaggtgaatcaacc 149  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40699448 tttcccaaggtgaatcaacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35107407 - 35107218
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatac 190  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35107407 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttctcaaggtgaatcaatcc-caaccc----tgtttgttgccaagag-caaactctatac 35107314  T
Q  191 aaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac-ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||| ||| ||||||   |||||||| |||  ||| ||  | ||||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  35107313 aaaccctagttttcttgttg-acttctaaactcttggttttag-actctctacctcaaggtttactatgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 35107218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 162
Target Start/End: Original strand, 38414194 - 38414291
Alignment:
Q  63 tctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 162  Q
    ||||||||||||||||| | |||  || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38414194 tctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttc-cgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctcaaaccctagt 38414291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38020157 - 38020064
Alignment:
Q  191 aaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 284  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  38020157 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttccaaccccctctatctccaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaa 38020064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43139484 - 43139395
Alignment:
Q  95 tcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 187  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43139484 tcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactcta 43139395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20589865 - 20589763
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 129  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20589865 caaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtg 20589766  T
Q  130 ttt 132  Q
    |||    
T  20589765 ttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 187
Target Start/End: Original strand, 27583480 - 27583573
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 187  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27583480 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca--ctcccaaccttagtgttcgttgccaagaga-aaactcta 27583573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 287
Target Start/End: Original strand, 12342681 - 12342747
Alignment:
Q  221 cctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  12342681 cctttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtgtatatttatagtaaaagta 12342747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Original strand, 22407535 - 22407583
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 79  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22407535 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccccctaattcta 22407583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17921833 - 17921754
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaaa-ccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 147  Q
    |||||||||| |||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17921833 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 17921754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26345718 - 26345661
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 148  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26345718 aatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgctaaggtgaatcaac 26345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Original strand, 7463029 - 7463077
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 79  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7463029 caaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35028688 - 35028595
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 187  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35028688 aatctcttctcgtgatcaagagactcaatcataatagtgttttccaatgcgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttaccaagag-caaactcta 35028595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Original strand, 22707834 - 22707872
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 69  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22707834 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 22707872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15694078 - 15693958
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaa-ccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagt 128  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |   |||||||||| |||||  ||| |||||||||  || |||||||||||  |||||||||||    
T  15694078 caaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaaatctcttcctgtgaccaagagactttatcctaatagt 15693979  T
Q  129 gtttc-ccaaggtgaatcaac 148  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  15693978 gtttctccacggtgaatcaac 15693958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 147
Target Start/End: Original strand, 34575265 - 34575308
Alignment:
Q  105 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34575265 accaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 34575308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40699278 - 40699203
Alignment:
Q  237 ctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| | | || ||||||| || ||||||    
T  40699278 ctctctctcaaggtttactctgatgcaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcagaaaattggaacaaatct 40699203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2736243 - 2736205
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2736243 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2736205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2740979 - 2740941
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740979 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17462474 - 17462436
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462474 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17462436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 20054909 - 20054947
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054909 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20054947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 22712660 - 22712698
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22712660 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22712698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 22717369 - 22717407
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22717369 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 28458949 - 28459011
Alignment:
Q  70 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||||||| |||||  || ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28458949 cctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 39680083 - 39680045
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39680083 ctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39680045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 39687021 - 39686983
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39687021 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39686983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45567447 - 45567409
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45567447 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45567409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7503032 - 7502975
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 147  Q
    ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7503032 aatctcttcccttgaccaagatactcaatcctaatagtgtttctccaaggtggatcaa 7502975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 147
Target Start/End: Original strand, 30720754 - 30720811
Alignment:
Q  91 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 147  Q
    ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30720754 aatctcttctcgtgccaaagagactcaatcctaatagtgtttctccaagatgaatcaa 30720811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 38020349 - 38020312
Alignment:
Q  48 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 85  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38020349 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaa 38020312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Original strand, 183722 - 183977
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183722 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc-cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 183820  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  183821 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttc 183920  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    || ||| |||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  183921 ag-cccttctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 183977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 52218 - 51960
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52218 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 52119  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  52118 ttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 52019  T
Q  231 agccccctctatctc--aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |||||||||||||||  || |||||   ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  52018 agccccctctatctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 51960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Original strand, 69382 - 69632
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69382 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 69481  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  69482 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 69581  T
Q  241 a----tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    |    |||||| |||| | ||||| ||| |||||||||||| | |||||||    
T  69582 atctctctcaaagtttgctctgatataaggtctatatttattgtaaaagta 69632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 134 - 245
Target Start/End: Original strand, 73207 - 73318
Alignment:
Q  134 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  73207 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 73306  T
Q  234 cccctctatctc 245  Q
    ||||||||||||    
T  73307 cccctctatctc 73318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 166
Target Start/End: Original strand, 73160 - 73203
Alignment:
Q  123 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73160 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 73203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 79392 - 79144
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79392 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 79293  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||     
T  79292 ttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 79193  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  79192 agccccctctatctcaagttttactctgattcaaggtctatatttatag 79144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4203 - 3948
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4203 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 4104  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  4103 ttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 4005  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  4004 agccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 3948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15226 - 14970
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15226 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 15127  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  15126 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactttataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatcattgtttc 15027  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15026 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 14970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 14463 - 14677
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14463 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgt 14562  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  14563 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttc 14662  T
Q  231 agccccctctatctc 245  Q
    | |||||||||||||    
T  14663 atccccctctatctc 14677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6397 - 6151
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6397 atcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaagg 6298  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  6297 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 6198  T
Q  240 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    |||||||| |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  6197 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 6151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3077 - 2832
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3077 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggt 2978  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  2977 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 2878  T
Q  241 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 286  Q
    ||||||| |||| | |||||  ||  ||||||||||||| ||||||    
T  2877 atctcaaagtttgctctgatacaagttctatatttatagtaaaagt 2832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Original strand, 41564 - 41821
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 41663  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  41664 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 41763  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
    ||||||||||||||| | |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  41764 agccccctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 41821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 11554 - 11810
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11554 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 11653  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |  | ||||    
T  11654 ttcccaaggaaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaatccctgtttc 11753  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  11754 agccccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 239 - 34
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  239 atcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaagg 140  T
Q  140 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  139 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctc 40  T
Q  240 tatctc 245  Q
    ||||||    
T  39 tatctc 34  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 80066 - 79812
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  80066 caaaagagatgtcaatgagttacaggaataagtctcctgcctaat-ctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgt 79968  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||    
T  79967 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatttttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgttt 79868  T
Q  230 cagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||| |||||    
T  79867 cagccccctctatctcaaggtttacactgatacaaaaactatatttatagtaaaag 79812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 188386 - 188424
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  188386 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29368 - 29164
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29368 atcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggc 29269  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 240  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  29268 gaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctct 29169  T
Q  241 atctc 245  Q
    |||||    
T  29168 atctc 29164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 15903 - 16180
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15903 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagttt 16002  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| |||||||    
T  16003 ttcgcaaggtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-acttctaaacccttatttc 16098  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 312  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||| ||||||| | | |||||| ||| || ||||||    
T  16099 aaccccctctatcttaaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaacaaatct 16180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35593
Alignment:
Q  58 ataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 157  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaacc 35720  T
Q  158 ctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacact 257  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||||| |  |||||  |||    
T  35719 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cgcctctatcacccggtttgtact 35621  T
Q  258 gatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  35620 gatacaatgtctatatttatagtaaaag 35593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2248 - 2036
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2248 caaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 2149  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  2148 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttattccgaagagacaaactctgtacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 2050  T
Q  231 agccccctctatct 244  Q
    |||||||| |||||    
T  2049 agccccctatatct 2036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 278
Target Start/End: Original strand, 16732 - 16975
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16732 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcaccaagtgactcaatcctaatagtgt 16831  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||| || ||||  ||||    
T  16832 ttcctaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgtctttcaaacccttgttttc 16927  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||    
T  16928 agcctcctctatctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttata 16975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 85435 - 85184
Alignment:
Q  33 aaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  85435 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctgattctactcaaagtcacaatctcttctcgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgttt 85336  T
Q  133 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcag 232  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| | || ||||      
T  85335 tccaaggtgaatcaaccctcaaactttagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttttaaatccttgtttc-t 85237  T
Q  233 ccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 285  Q
    || | |||||||||||||||||  ||||  || | |||||||||||| |||||    
T  85236 cctcttctatctcaaggtttactttgatacaaagcctatatttatagtaaaag 85184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 169
Target Start/End: Original strand, 1543 - 1671
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 1642  T
Q  141 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1643 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 1671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 276
Target Start/End: Original strand, 1724 - 1958
Alignment:
Q  31 caaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1724 caaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgt 1823  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc 230  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| || ||||    
T  1824 ttcccaaggtgaatcaacc--acaaccctagtgtttgttg---------aaactctatacaaaccctagttttcttgttg-acttctaaacccttgtttc 1911  T
Q  231 agccccctctatctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatattta 276  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||    
T  1912 agccacctctatctctaggtttacatctgatacaaggtctatattta 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5016 - 4773
Alignment:
Q  32 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct-aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5016 aaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattcta-ccaaaagcttcaatctcttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgt 4918  T
Q  131 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttg-ttgcgtttctaaa-cctttatt 228  Q
    |||||||  ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| || |  ||||||| ||||| ||    
T  4917 ttcccaacatgaatcaa-actc-aactctagtgtttgttgctgagaga-aaacgctatataaaccctag-tttgttgcttac--ttctaaatcctttttt 4824  T
Q  229 tcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 279  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  4823 tcagacccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 4773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 993 - 1169
Alignment:
Q  117 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-----gagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 211  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||||| | ||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  993 aatcctaaaagtatttcgcaaggtggatcaaccctccaaacgtagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 1092  T
Q  212 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 288  Q
     |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  1093 ctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22313 - 22221
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22313 atcaatgagttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24588 - 24496
Alignment:
Q  41 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 133  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24588 atcaatgagttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 224857 - 224819
Alignment:
Q  94 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  224857 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 224819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University