View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18314_low_1 (Length: 1006)

Name: NF18314_low_1
Description: NF18314
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18314_low_1
NF18314_low_1
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (11-982)||(26382-27360)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (11-982)||(14999603-15000588)
chr4 (11-982)||(15289495-15290473)
chr4 (725-962)||(12339916-12340162)
chr4 (284-465)||(12339484-12339665)
chr4 (98-380)||(18272652-18272934)
chr4 (220-289)||(28266083-28266152)
chr4 (874-911)||(3262001-3262038)
chr4 (874-911)||(7357295-7357332)
chr4 (874-911)||(11204439-11204476)
chr4 (874-911)||(29450744-29450781)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (14-981)||(15943174-15944148)
chr3 (11-982)||(6149429-6150407)
chr3 (92-982)||(30149943-30150840)
chr3 (11-982)||(8270975-8271953)
chr3 (92-982)||(13964012-13964909)
chr3 (19-982)||(17201221-17202192)
chr3 (92-982)||(22149403-22150291)
chr3 (11-367)||(25768423-25768779)
chr3 (261-461)||(17321420-17321620)
chr3 (11-71)||(5224953-5225013)
chr3 (874-911)||(10408625-10408662)
chr3 (874-911)||(12509918-12509955)
chr3 (874-911)||(28756976-28757013)
chr3 (874-911)||(47126601-47126638)
[»] chr2 (5 HSPs)
chr2 (14-982)||(22280693-22281668)
chr2 (552-981)||(22739072-22739508)
chr2 (884-982)||(24567425-24567523)
chr2 (293-694)||(25131342-25131743)
chr2 (874-982)||(25131197-25131305)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (11-982)||(21847117-21848095)
chr8 (11-982)||(20649135-20650113)
chr8 (166-982)||(16415109-16415931)
chr8 (11-982)||(21193332-21194310)
chr8 (722-982)||(22437313-22437580)
chr8 (752-982)||(23903185-23903421)
chr8 (874-911)||(16268874-16268911)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (14-982)||(20928026-20929001)
chr1 (15-982)||(20528025-20528999)
chr1 (92-982)||(20827882-20828779)
chr1 (11-871)||(22128847-22129708)
chr1 (255-982)||(41214514-41215247)
chr1 (354-637)||(23312571-23312854)
chr1 (874-982)||(22133031-22133139)
chr1 (822-969)||(20172147-20172302)
chr1 (874-911)||(20074988-20075025)
chr1 (312-449)||(20172643-20172780)
chr1 (874-911)||(20297455-20297492)
chr1 (874-911)||(31537276-31537313)
chr1 (874-911)||(38910105-38910142)
chr1 (874-911)||(48425947-48425984)
chr1 (874-911)||(52988815-52988852)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (14-982)||(6200-7180)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (14-982)||(130829-131807)
scaffold0008 (11-982)||(26762-27740)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (11-957)||(12671-13624)
scaffold0467 (51-982)||(1-939)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (35-981)||(315-1269)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (11-982)||(23508555-23509524)
chr5 (11-982)||(24584081-24585049)
chr5 (281-464)||(21828203-21828385)
chr5 (920-982)||(21934623-21934685)
chr5 (268-339)||(33314011-33314082)
chr5 (740-778)||(17327922-17327960)
chr5 (874-911)||(14884380-14884417)
chr5 (874-911)||(20345224-20345261)
chr5 (874-911)||(22505621-22505658)
chr5 (874-911)||(25851014-25851051)
chr5 (874-939)||(26056562-26056627)
[»] scaffold0465 (2 HSPs)
scaffold0465 (170-982)||(12124-12943)
scaffold0465 (11-133)||(11999-12121)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (11-982)||(25164-26142)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (92-982)||(27104201-27105098)
chr7 (92-982)||(27173227-27174124)
chr7 (92-982)||(7826846-7827743)
chr7 (255-982)||(4442873-4443603)
chr7 (730-971)||(13458990-13459238)
chr7 (765-953)||(22034972-22035167)
chr7 (797-971)||(14207278-14207456)
chr7 (797-971)||(14215968-14216146)
chr7 (755-938)||(17142392-17142582)
chr7 (282-462)||(13459484-13459664)
chr7 (11-112)||(16575119-16575220)
chr7 (11-112)||(16590442-16590543)
chr7 (758-939)||(17131661-17131855)
chr7 (725-791)||(14218206-14218272)
chr7 (874-911)||(13965862-13965899)
chr7 (874-911)||(26091992-26092029)
chr7 (874-911)||(40925011-40925048)
chr7 (874-911)||(49155319-49155356)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (92-982)||(16378936-16379833)
chr6 (92-982)||(16646532-16647429)
chr6 (11-468)||(1660325-1660782)
chr6 (11-822)||(21412008-21412819)
chr6 (11-510)||(16103605-16104104)
chr6 (521-982)||(16100836-16101304)
chr6 (11-317)||(17786689-17786996)
chr6 (17-654)||(22364852-22365489)
chr6 (122-894)||(14149316-14150085)
chr6 (11-273)||(18421101-18421363)
chr6 (874-982)||(18401466-18401574)
chr6 (889-982)||(14133902-14133995)
chr6 (311-462)||(19982383-19982534)
chr6 (947-982)||(1646239-1646274)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (11-964)||(2701-3675)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (91-982)||(4226-5123)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (153-982)||(90488-91324)
scaffold0021 (11-982)||(8143-9121)
scaffold0021 (98-982)||(20303-21193)
scaffold0021 (98-982)||(29879-30769)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (285-982)||(23949-24653)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (11-562)||(4-555)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (11-864)||(96637-97489)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (416-982)||(1197-1770)
scaffold0302 (11-214)||(3171-3374)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (14-873)||(8732-9574)
[»] scaffold0011 (8 HSPs)
scaffold0011 (352-982)||(181976-182613)
scaffold0011 (531-982)||(73457-73915)
scaffold0011 (531-982)||(77838-78296)
scaffold0011 (11-197)||(73065-73251)
scaffold0011 (11-197)||(77446-77632)
scaffold0011 (321-486)||(73284-73449)
scaffold0011 (321-486)||(77665-77830)
scaffold0011 (874-971)||(175723-175820)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (11-646)||(4711-5345)
scaffold0673 (730-982)||(5363-5622)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (168-971)||(25197-26008)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (11-427)||(7776-8192)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (11-608)||(3266-3863)
scaffold0610 (630-982)||(3862-4220)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (240-982)||(15896-16636)
scaffold0162 (11-127)||(16637-16753)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (360-982)||(35071-35691)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (255-982)||(5597-6322)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (726-982)||(2559-2820)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-696)||(35513-36197)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (255-549)||(32459-32752)
[»] scaffold0112 (2 HSPs)
scaffold0112 (726-982)||(3485-3748)
scaffold0112 (305-478)||(3987-4160)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (730-952)||(77446-77675)
scaffold0058 (293-470)||(77926-78103)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (752-953)||(20807-21015)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (255-369)||(2182-2296)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (293-471)||(49163-49341)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (874-911)||(29991-30028)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (874-911)||(67318-67355)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (874-911)||(41792-41829)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (874-911)||(39543-39580)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (874-911)||(514563-514600)


Alignment Details
Target: scaffold0225 (Bit Score: 761; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 761; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 27360 - 26382
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27360 ggaggacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagattagcgactcatatgctagctgagg 27261  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27260 aagcagagtactggtggaccaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaagtttgaattcttgaggaattattt 27161  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27160 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttct 27061  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27060 aggttttgtccctacatcaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 26961  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||     
T  26960 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgttgatgctggaaaagctaagtctaattactacaaggcttagaatgagaagaa 26861  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26860 atgaaaaggccatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctcaaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 26761  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26760 tataggtgtggaaccttaggtcactatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggctgatttcagag 26661  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26660 gtgttgcaagagagattacttgctacaattgtcgagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 26561  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26560 gaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcat 26461  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26460 tcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 26382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 748; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 748; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 15000588 - 14999603
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15000588 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgactagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 15000489  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15000488 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggggggtgatgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatt- 15000390  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15000389 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatacggcgaagtttgaggaactttcg 15000290  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15000289 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 15000190  T
Q  411 aggagatccgagactttaatacttta--------gtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggt 502  Q
    ||||||||||||||||| |||||||         |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15000189 aggagatccgagactttgatactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctggaaaggctaagtctaattactacaaggctcagggt 15000090  T
Q  503 gagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatg 602  Q
    || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000089 gaaaagagaggaagaggacatggtgctggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatg 14999990  T
Q  603 tcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctga 702  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  14999989 tcaagtgctttaagtgtggaactttgggtcactatgctaatgattgcaagaatgatttgaattgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccga 14999890  T
Q  703 ttgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtg 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999889 ttgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtg 14999790  T
Q  803 tttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtg 895  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  14999789 tttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccagataatcttatccgaggtatgcgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtg 14999690  T
Q  896 ctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999689 ctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 14999603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Original strand, 15289495 - 15290473
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||| ||||| ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| ||  | ||||| || ||||| ||  | || ||||| ||||| |||||||    
T  15289495 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 15289594  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    | || ||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||| | | |||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  15289595 aggctgagtattggcggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 15289694  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
     ||  | || |||||||| | ||||||  | |||||  ||||| ||||  ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |     
T  15289695 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaatttgaagtaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 15289794  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15289795 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagaatgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 15289894  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||     
T  15289895 aggagatctgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaggctaagtctaattactacaaggctcagaatgaaaggaa 15289994  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    ||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15289995 agggaagggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaagccaagtttggaggatgtcaagtgc 15290094  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    | || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||      
T  15290095 tttaagtgtggagctatgggtcattatgctagtgattgcaagactgatatcaagtgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttttgaatgcagga 15290194  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15290195 gtgctgcaagagagattacttgctacaattatggagagaagggtcatattagtaccaagtgtacccaaccgaagaaggcggcgagaaaggtgttttcttt 15290294  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15290295 gaacgcggaggaagtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcat 15290394  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15290395 tcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 15290473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 725 - 962
Target Start/End: Original strand, 12339916 - 12340162
Alignment:
Q  725 attacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggagg 824  Q
    |||||||||||||| || ||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12339916 attacttgttacaactgcggagagtcaggtcatatcagtactaagtgtaccaaaccgaagaaggcgtcgggtaaggtgtttgatttgaatgcggatgagg 12340015  T
Q  825 tggagcagccggataattttatcagaggtatgtgtttt--atcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcg 915  Q
    | || || |  |||||| | ||| ||||||||| ||||  |||||||||||       ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12340016 tcgaacaacaagataatctcatccgaggtatgtattttttatcaatagtactcctttgattgcgattattgatattggtcctactcattcttttatctcg 12340115  T
Q  916 gttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcg 962  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12340116 gttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtgactccgttgttgcg 12340162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 284 - 465
Target Start/End: Original strand, 12339484 - 12339665
Alignment:
Q  284 tatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggt 383  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||     
T  12339484 tatgcagctaagttcgagaaactttcgaggttttgtccttacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaaatgtgtgaagtttgagagtggtttgaggc 12339583  T
Q  384 cggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgc 465  Q
    | || ||  |  |||| |||||||||||||||||| | || ||  |||| || |||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  12339584 cagagattcactagtatatgtgtgttcaggagatcagggatttcgataccttggtgcctaagtttcgtatgtttgatgatgc 12339665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 18272934 - 18272652
Alignment:
Q  98 atgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattct 197  Q
    ||||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||||| |||||||| | ||| || |    
T  18272934 atgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaagttcaaagctgagtttt 18272835  T
Q  198 tgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtt 297  Q
    ||||||||||||| ||  |||| || ||||| | |||| |  | |||||  ||||  |||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  18272834 tgaggaagtattttccagaagatttaaggactaggaagaaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccatagctgagtatgcggcgacgtt 18272735  T
Q  298 cgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggctta 380  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |    |||||||||||||||||  |||||||||    
T  18272734 tgaggagctatcgaggttttgttcgtacattaatgctgaggatgcaatggtgcccaagtgtgtgaagtttgaaggtgggctta 18272652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 289
Target Start/End: Original strand, 28266083 - 28266152
Alignment:
Q  220 cttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcg 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28266083 cttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtctgtagccgagtatgcg 28266152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 3262001 - 3262038
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3262001 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 3262038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 7357332 - 7357295
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7357332 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 7357295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 11204439 - 11204476
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11204439 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 11204476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 29450744 - 29450781
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29450744 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 29450781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 745; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 745; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 981
Target Start/End: Original strand, 15943174 - 15944148
Alignment:
Q  14 gcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaag 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  15943174 gcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaag 15943273  T
Q  114 cagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15943274 cggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttaaggaagtatttccc 15943373  T
Q  214 gaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgagg 313  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15943374 ggaagacttgaggaccaagaatgagattgagtttctgaatctaaagcaaggaatcttgtcagtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgagg 15943473  T
Q  314 ttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcagg 413  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15943474 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgcgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcagg 15943573  T
Q  414 agatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagagg 513  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15943574 agatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactataaggctcagggtgagaagagagg 15943673  T
Q  514 aagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctat 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15943674 aagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctat 15943773  T
Q  614 aggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtg 713  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||   |||    
T  15943774 aggtgtggaactttgggtcattatgccaatgattgcaagcatgatgtgaattgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaaggcggctgattgcaagagtg 15943873  T
Q  714 ttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15943874 ttgcaagagagattacttgttacaattgcggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttaaa 15943973  T
Q  814 tgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattct 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15943974 tgcggaggaggtggagcagccggataatcttatacgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattct 15944073  T
Q  907 tttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacacc 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15944074 tttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaacttctttgttgcagggaatggttattgacacc 15944148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 597; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Original strand, 6149429 - 6150407
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  6149429 ggagcacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggtgacaggaggtgaccagaaggtcaggctagcgactcatatgcttgctgagg 6149528  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6149529 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggcgaagtttaaggttgaattcttgaggaagtattt 6149628  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6149629 ccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttcg 6149728  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  6149729 aggttttgcccctacatcaatgctgaggatgctatggttttgaagtatgtgaagtttgagagtgggcttaggccgaatatctatcagtacatgtgtgttc 6149828  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  6149829 aggagatccgagactttgatactttggtgcattagtgttgtatgtttgatgatgttgggaaagctaagactagttactacaaggctcagaatgataagag 6149928  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| | |||||||||||     
T  6149929 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatttgtcagatgtcaagtgt 6150028  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    |  | |||||||| | ||||||||||||| ||| |||| || || ||| | | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||   ||| ||||       
T  6150029 ttcaagtgtggaaatatgggtcattatgccaattattgtaaaaaggatatcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttatgaatgcaaga 6150128  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6150129 gtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgcttt 6150228  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6150229 gaatgcggaggaggtggagcaaccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcatttgattgcaattattgatattggtgctactcat 6150328  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150329 tcttttatatcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcccttgttgcggggaatggttattgacaccc 6150407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 30150840 - 30149943
Alignment:
Q  92 actcatatgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||| | | |||||||| ||    
T  30150840 actcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctg 30150741  T
Q  192 aattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggc 291  Q
    | || ||||||||||| || ||  | || |||||||| | ||||||  | ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  30150740 agtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggc 30150641  T
Q  292 gaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatc 391  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30150640 gaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatc 30150541  T
Q  392 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattaca 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30150540 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactaca 30150441  T
Q  492 aggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaag 591  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30150440 aggctcagggtgaaaagagaggaagaggacatggggctggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaggccaag 30150341  T
Q  592 tttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcac 691  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  30150340 tttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcac 30150241  T
Q  692 aaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 791  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30150240 aaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcgg 30150141  T
Q  792 cgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattat 884  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  30150140 cgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattat 30150041  T
Q  885 tgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30150040 tgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 30149943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 517; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Original strand, 8270975 - 8271953
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||| ||||| ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| ||  | ||||| |||||||| ||  | || ||||  ||||| |||||||    
T  8270975 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcaaaaggtgaggttggctactcgcatgcttgctgagg 8271074  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    | || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||| | | |||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  8271075 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 8271174  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
     ||  | || |||||||| | ||||||  | ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |     
T  8271175 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 8271274  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8271275 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcaaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 8271374  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||     
T  8271375 aggagatccgagactttgatactttggtgaataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaggttaagtctaattactacaaggctcagaatgagaagaa 8271474  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    ||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8271475 agggaagggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgc 8271574  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    | || ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8271575 tttaagtgtggagctatgggtcattatgttagtgattgcaagaacgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagag 8271674  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8271675 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 8271774  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8271775 gaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcat 8271874  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8271875 tcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 8271953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 982
Target Start/End: Original strand, 13964012 - 13964909
Alignment:
Q  92 actcatatgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttg 191  Q
    ||||| ||||| | |||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | |  || || |  ||||| ||| | | |||||| | ||    
T  13964012 actcacatgcttgttgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggagaggttgtgacttggacaaggttcaaagctg 13964111  T
Q  192 aattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggc 291  Q
    | || ||||||||||| || ||  | || |||||||| | ||||||  | ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  13964112 agtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggc 13964211  T
Q  292 gaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatc 391  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13964212 gaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatc 13964311  T
Q  392 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattaca 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  13964312 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggagggttaagtctaattactaca 13964411  T
Q  492 aggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaag 591  Q
    ||||||||  |||||||| ||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13964412 aggctcagaatgagaagaaagggaagggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaag 13964511  T
Q  592 tttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcac 691  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  13964512 tttggcggatgtcaagtgctttaagtgtggatctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcac 13964611  T
Q  692 aaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 791  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964612 aaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 13964711  T
Q  792 cgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattat 884  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  13964712 cgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggcggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattat 13964811  T
Q  885 tgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13964812 tgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaaagtttggatttggttgtaactcgtttgttgcgtggaatggttattgataccc 13964909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 17202192 - 17201221
Alignment:
Q  19 gacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaagcagag 118  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||| | ||||| || ||||| ||  | || ||||| ||||| |||||||| || |||    
T  17202192 gacttgggtgcagggcatggagaggatatttcgtgctatggtgacgagtgatgaacagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggccgag 17202093  T
Q  119 cactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgaaag 218  Q
     | | |||||| ||||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||  |||    
T  17202092 tattagtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcaaagttcaaagctgagttcttgaggaagtattttcctgaag 17201993  T
Q  219 acttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttg 318  Q
    | |||||||||| ||||||  | ||||| |||||  |||| ||||||| ||||||  |||| | ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  17201992 atttgaggaccaggaaggaagtggagttcctgaacttgaagcaagggagcatgtccatagctgtgtatgtggcgaagtttgaggagcttttgaggttttg 17201893  T
Q  319 ttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatc 418  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17201892 tccgtacatcaatgctgaggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgtttaggagatc 17201793  T
Q  419 cgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagag 518  Q
    | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||| || ||||  |||  |||||||||||||||||    
T  17201792 ctagattttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgccgggagagttaaggctaattactaaaaggtacagaatgagaagagaggaagag 17201693  T
Q  519 gccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtg 618  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||| | | | |  ||  | |||||||| || || |||    
T  17201692 gccatggagttggaaaaccgtacaacaaggacagagagaagaagagagaagctggtggaggctctaagactaataagggtgctgtcaagttctttaagtg 17201593  T
Q  619 tggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgca 718  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||| | |||||| |  |  | |||   ||||||||| |||| ||||||||| ||   |||||| |    ||| |      
T  17201592 tggcatgatgggtcattatgctaatgagtccaagaagggcgatagttgctacaagtgtgggaaagcgggtcacaatgcaattgattgtacgaatgtggag 17201493  T
Q  719 agagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgg 818  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17201492 aaagagatcgcttgttacaattgtggagagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcattgaatgcgg 17201393  T
Q  819 aggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtg-ttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattctttta 910  Q
    ||||  ||||||| || |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17201392 aggaaatggagcatccagataatcttatctgatgtatgtgtttttatcaatagtactccattgattgcaattattgatactagtgctactcattctttta 17201293  T
Q  911 tctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  17201292 tctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcgagggatggtcatcgacaccc 17201221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 92 - 982
Target Start/End: Original strand, 22149403 - 22150291
Alignment:
Q  92 actcatatgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttg 191  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||| |||||||| ||||| |||||| |||  || || | |||||| ||||| | ||||||||  |    
T  22149403 actcatatgcttgctgaggaggcagagtattagtggactaatgccaaaggaagacttgagatggagggggaggtggtgacttgggcaaggttcaaggccg 22149502  T
Q  192 aattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggc 291  Q
    | |||||||||||||||||  || |||| |||||||| | ||||| | | || ||  | ||  |||| ||||| |  ||||| || ||||||||||||||    
T  22149503 agttcttgaggaagtatttttcggaagatttgaggacaaggaaggtggtagaattcttaaacttgaagcaaggaagtatgtctgtggccgagtatgcggc 22149602  T
Q  292 gaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatc 391  Q
    |||||| || ||  || | |||||||||   ||||||||||  ||| |||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||    
T  22149603 gaagtttgaagagtttgcaaggttttgtctgtacatcaatgtcgagaatgcaatggtgtccaagtgtgtgaagtttgagagtgggctttggctagatgtc 22149702  T
Q  392 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattaca 491  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  22149703 tatcagtacatgtgtgtgcaagagatccgtgattttgacactttggtgcacaagtgtcatatgtttgatgatgctgggaaagctaagactaattactaca 22149802  T
Q  492 aggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaag 591  Q
    |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||| |     
T  22149803 aggcgcaacgtgagaagagaggaaggggccatggagttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaagttggtggggcctctaagccgaa 22149902  T
Q  592 tttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcac 691  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||  ||| | | ||||| ||||||||| |||| | |||||    
T  22149903 tttggcggctgtcaagtgtttcaagtgtgtaaccatgggtcattatgccaatgattgtaagatggatatcagttgtcacaagtgtgggaaagcgagtcac 22150002  T
Q  692 aaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 791  Q
    |||||   ||| ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||    
T  22150003 aaggcttttgaatgcatgggtgttgcaaaagagattacttgctacaattgtggagagaagggtcacatta---------gtaccaagccgaagaaggcgg 22150093  T
Q  792 cgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattat 884  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  22150094 cgggaaaagtgtttgctttgaatgctgaggaggtggagcaaccagataatcttatctgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattat 22150193  T
Q  885 tgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22150194 tgatactggtgctagtcattcttttatcttggttagctgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaacggttattgataccc 22150291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25768779 - 25768423
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  25768779 ggagctcatacttgggtgcagggcatagagaggatattccgtgctatggtgacgagtgatgaccaaaaggtcagattggcgactcatatgcttgctgagg 25768680  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    | || || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  25768679 aggccgaacattggtggactaatgccaaaggaagacttgagttgggaggagaagttgtgacctgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtattt 25768580  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| | ||| || |||||   |||||| |  ||||| ||||| |||||     
T  25768579 ccctgaagatttgaggaccaggaaggaggttgagtttctgaacttgaaacaaggaagcatatctgtagctacgtatgcagaaaagtttgaggagctttca 25768480  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagttt 367  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  25768479 aggttttgtccgtacatcaatgctgaagatgctatggtttcaaagtgtgtgaagttt 25768423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 461
Target Start/End: Original strand, 17321420 - 17321620
Alignment:
Q  261 aagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgt 360  Q
    |||||| |||||| || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||| ||| | |  ||||||||    
T  17321420 aagggagcatgtccgtggctgagtatgcagcaaagtttgaagagctttcgaggtttttctcgtacattaatgttgaggatgcgatggtgtccaagtgtgt 17321519  T
Q  361 gaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgat 460  Q
    ||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  17321520 gaaatttgaaagtggacttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagattcgagagtttgataccttggtgcataagtgtcgtatgtttgat 17321619  T
Q  461 g 461  Q
    |    
T  17321620 g 17321620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 5225013 - 5224953
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatg 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5225013 ggagcatagacttgggtgcaggggatggagcggattttccaagctatggttacgggagatg 5224953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 10408662 - 10408625
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10408662 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 10408625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 12509918 - 12509955
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12509918 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 12509955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 28757013 - 28756976
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28757013 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 28756976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 47126638 - 47126601
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47126638 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 47126601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 706; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 706; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 22281668 - 22280693
Alignment:
Q  14 gcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaag 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  22281668 gcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgaggaag 22281569  T
Q  114 cagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22281568 cagagcactggtggaccaatgccaaaggaaggcttgagatgggaggtgatgtggtaacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 22281469  T
Q  214 gaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22281468 gaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttttgaatctgaagtaaggaatcatgtctgtagtcgagtatgcagcgaagttcgaggaactttcgaag 22281369  T
Q  314 ttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcagg 413  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  22281368 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatttatcagtacatgtttgttcagg 22281269  T
Q  414 agatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagagg 513  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||     
T  22281268 agatccgagacttttatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgttggaaaagctaagactaattactacaaggctcagaatgagaagaaaga 22281169  T
Q  514 aagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctat 613  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |    
T  22281168 aagaggccatggagttgtaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgttaggtgcttt 22281069  T
Q  614 aggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtg 713  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   |||    
T  22281068 aggtgtggaactttgggtcattatgccaatgattgtaagaatgatttgagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggctgattgcaagagtg 22280969  T
Q  714 ttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22280968 ttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaaatgtcatattagtactaagtgtacaaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 22280869  T
Q  814 tgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattct 906  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22280868 tgcggaggaggtggagcagcaggataatcttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcattca 22280769  T
Q  907 tttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22280768 tttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 22280693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 552 - 981
Target Start/End: Original strand, 22739072 - 22739508
Alignment:
Q  552 aaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaa 651  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22739072 aaggaaagaagagagaagttggtggggcctctaagccgaatttagcggatgtcaagtgctacaagtgtggaactttgggtcattatgccaatgattgtaa 22739171  T
Q  652 gaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaag 751  Q
    ||| ||  | ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||   ||| || |  |||||||| |  ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22739172 gaaggacattaattgccacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttttgaatgtaagggtgttgcgaaggatgttacttgctacaattgtggagagaag 22739271  T
Q  752 ggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagag 851  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22739272 ggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaagtggagcagccggataaatttatcagag 22739371  T
Q  852 gtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggt 944  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  22739372 gtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgtgcgtttgaaattggt 22739471  T
Q  945 tgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacacc 981  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22739472 tgtaactcctttgttgcgggggatggttatcgacacc 22739508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 884 - 982
Target Start/End: Original strand, 24567425 - 24567523
Alignment:
Q  884 ttgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24567425 ttgatactagtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcagggaatgattattgacaccc 24567523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 293 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 25131743 - 25131342
Alignment:
Q  293 aagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatct 392  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| ||| | |   |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |    
T  25131743 aagtttgaggagctttcgaggttttgtccgtacattaatgttgaggatgcgatggtgtcacagtgtgtgaaatttgaaagtggacttaggccggatattt 25131644  T
Q  393 atcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaa 492  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |  | |||  |||||||||||||    
T  25131643 atcagtatatgtgtgttcaggagattcgagattttgataccttggtgcaaaagtgtcgtatgtttgatgacgccggaagggttaaagctaattattacaa 25131544  T
Q  493 ggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagt 592  Q
    ||  ||   ||| |||| |||||  || |||||| |||  ||||| || | ||||||  |||||| ||||  |||| ||||||| ||||||| | | | |    
T  25131543 ggtgcaacatgataagaaaggaaagggtcatggatttgtgaaaccgtataacaaggataaaggaaggaagaaagaagctggtggaggctctaagtctaat 25131444  T
Q  593 ttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcaca 692  Q
      ||| ||||||| ||||| || |||||| || |||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||  | |||   ||||||||| |||||||||||||    
T  25131443 acggctgatgtcaggtgctttaagtgtggcacgttgggtgattttgctaatgagtgcaagaagggtgatagttgctacaagtgtgggaaagtgggtcaca 25131344  T
Q  693 ag 694  Q
    ||    
T  25131343 ag 25131342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 874 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 25131305 - 25131197
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggtta 973  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |    
T  25131305 attgcaattattgatactggtgctactcattcttctatctcggttagttgtgtttaacgtctgaatttggttgtaactccgttgtcgcgagggatggtca 25131206  T
Q  974 ttgacaccc 982  Q
    | |||||||    
T  25131205 tcgacaccc 25131197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 701; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 701; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Original strand, 21847117 - 21848095
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21847117 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccaagctatggttactggtgatgaccagaaggtcagattggcgactcatatgctagctgagg 21847216  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847217 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcagacttgagttggaaggtggtgttgtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 21847316  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  21847317 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggtgaagtttgaggagctttcg 21847416  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21847417 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 21847516  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||     
T  21847517 aggagattcgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaggctaagtctaattactacaaggctcagaatgagaagaa 21847616  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    |||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21847617 aggaaagggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgc 21847716  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    | || || | || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21847717 tttaagtttagagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtggaaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagag 21847816  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847817 gtgttgcaagacagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccatgccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 21847916  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847917 gaacgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcttttgattgcaattattgatactggtgctactcat 21848016  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21848017 tcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 21848095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Original strand, 20649135 - 20650113
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20649135 ggagcacagacttgggtgcagggcatggagcgggtttttcgagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgcttgctgagg 20649234  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20649235 aagcagagcacttgtggactaatgccaaaggaagacttgagttgggaggtgatgttgtgacctgggcgaagttcaaagttgaattcttgaggaagtgttt 20649334  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20649335 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatttaaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 20649434  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||| |    
T  20649435 aggttttgtccctacatcaatgttgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtaaatgtatgtac 20649534  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||  |||||| ||    
T  20649535 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttaatgatgctgggagagctaagactaattactataaggctcagaatgagaaaag 20649634  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||     
T  20649635 aggaagaggtcatggagttgggaaaccttacaacaaagacaaaggaaagaagagggaagctggtgggggctctaagccgaattttgcggatgtcaagtgt 20649734  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    || | |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    ||| ||||  |    
T  20649735 tacaagtgtggaaccatgggtcattatgccaatgattgtaagaaggatatcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggattttgaatgcaagg 20649834  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649835 gtgatgcaaaagagattacttgctacaattgtggggagaagggtcatattagtactaagtgtaccaggccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 20649934  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649935 gaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcat 20650034  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20650035 tcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcgggggatggttattgacaccc 20650113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 16415931 - 16415109
Alignment:
Q  166 ggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggg 265  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16415931 ggtgacctcggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaatgg 16415832  T
Q  266 atcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagt 365  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16415831 atcatgtctgtagccgaatatgcggcgaagtttgaggaactttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagt 16415732  T
Q  366 ttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgc 465  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  16415731 ttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgtccaggggatccgagactttgatactttggtgcataactgttg-atgtttgatgatgc 16415633  T
Q  466 tgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtga 565  Q
    ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  16415632 tgggaaagctgagactaattactacaaggctcagaatgataagagaggaaggggccatggagttggaaaaccgtacaacaaggacaaaggaaagaagaga 16415533  T
Q  566 gaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaatt 665  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||    
T  16415532 gaatctggtgggggctctaagccgaatttggcggatgtcaaatgcttcaagtgtggaaatatgggtcattatgctaatgattgtaagaaggatatcagtt 16415433  T
Q  666 gtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtac 765  Q
    ||| ||||||||  |||| ||||||||||||   ||| ||||   |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16415432 gtcacaagtgtgagaaagcgggtcacaaggcttatgaatgcaagagtgttgcaaaggagattacttgctacaattatggagagaaaggtcatattagtac 16415333  T
Q  766 caagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatc 865  Q
     |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  16415332 taagtgtaccaagccgaagaaggtggtgggaaaggtgtttgccttgaatgcggaggaggtggagcaaccggataaccttatccgaggtatgtgttttatc 16415233  T
Q  866 aatagta-------cattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgt 958  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||    
T  16415232 aatagtattccattgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattgattttgactcctttgt 16415133  T
Q  959 tgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16415132 tgcggggaatggttattgacaccc 16415109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Original strand, 21193332 - 21194310
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||  | |||||||| ||| | |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  21193332 ggagctcaaacttgggtgcagggcatggagaggatattttgtgctatggtgacgagtgatgaccagaaggtcagattgacgactcatatgcttgctgagg 21193431  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    | || ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |  || || |  ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  21193432 aggccgaatattggtggaccaatgccaagggaagacttgagattgttggggaagtcgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtattt 21193531  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  |||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||  ||||  |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21193532 ccctgaagatttgaggaccaggaaggaggtagcgtttctgaacttgaagtaagggagcatctctgtagccgagtatgcggcgaagttcgagaagctttcg 21193631  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21193632 aggttttgtccgtacatcattgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttc 21193731  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||| |||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  21193732 aggagatccgagattttgatactttggtgcataagtgtcgtaagtttgatgatgctggaagagttaaggctaactactacaaggctcaaagtgagaagag 21193831  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  21193832 aggaaagggtcatggagttgggaaaccgtacaacaaggacaaaagaaagaagagagaagttggtgggggctctaagccgagtttagcggatatcaagtgc 21193931  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||  |    
T  21193932 tataggtgtggaactttgggtcattatgccaatgattgtaagaaggacattagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgctgaatgcaagg 21194031  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
     ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21194032 atgttgcaagggatgttacttgttacaattgtggagagaagggccatatcagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcatt 21194131  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||       |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21194132 gaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttcatcaatagcactcatttgattggaattattgatattggtgctactcat 21194231  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21194232 tcttttatctcggttagttgtgttaagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcgggggatggttatcgacaccc 21194310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 722 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 22437580 - 22437313
Alignment:
Q  722 gagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 821  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||    
T  22437580 gagatcacttgttacaattgtggtgagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtggaaaaggtgtttgcattgaatgtggagg 22437481  T
Q  822 aggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctc 914  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22437480 aagtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcgattattgatactgatgttactcattcttttatctc 22437381  T
Q  915 ggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  22437380 ggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagggatggtcatcgacaccc 22437313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 752 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 23903421 - 23903185
Alignment:
Q  752 ggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagag 851  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  23903421 ggtcatatcagtgctaagtgtaccaagccaaagaaggtggcagaaaaggtgtttgcattgaatgcagaagaggtggagcagccggataatcttatatgag 23903322  T
Q  852 gtatgtgttttatcaatagtac------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggtt 945  Q
    |||| |||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  23903321 gtatatgttttatcaatagtactccttgattataattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgagcatttgaatttggtt 23903222  T
Q  946 gtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||    
T  23903221 gtaactccgttatcgcgagggatggtcatcgacaccc 23903185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 16268874 - 16268911
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16268874 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 16268911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 678; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 678; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 20929001 - 20928026
Alignment:
Q  14 gcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaag 113  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||    
T  20929001 gcacagacttgggtgtagggaatggaacggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcataagttgactgaggaag 20928902  T
Q  114 cagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20928901 cagagcattggtggaccaatgccaagggaaggcttgagatgggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttaaggaagtatttccc 20928802  T
Q  214 gaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgagg 313  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20928801 cgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaagaaaggaatcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcaagg 20928702  T
Q  314 ttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcagg 413  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20928701 ttttgtccctacatcaatgctcaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcagg 20928602  T
Q  414 agatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagagg 513  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||    
T  20928601 agatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactgtaaggctcagggtgagaagggagg 20928502  T
Q  514 aagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctat 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20928501 aagaggccatggagttggaaaacctttcagcaaggacaaaagtaagaagagagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctat 20928402  T
Q  614 aggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtg 713  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||  | ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||   |||    
T  20928401 aggtgtggaaccttaagtcattatgcccacgattgtaagaatgattggaattgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaagtcggctgattgcaagagtg 20928302  T
Q  714 ttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 813  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20928301 ttgcaagagagatttcttgttacaattgtggagagaaaggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgaa 20928202  T
Q  814 tgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattct 906  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20928201 tgcagaggaggtggagcagccggataatcttatttgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattct 20928102  T
Q  907 tttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20928101 tttatctcggttagttgtgttgatcgtttgaaattggttataactcctttgttacggggaatggttattgacaccc 20928026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 665; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 20528999 - 20528025
Alignment:
Q  15 cacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaagc 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  20528999 cacagacttgggtgcagaggatggagcggattttccaagctatggttacggaagatgaccagaaggttagactagcgactcatatgttgactgaggaagc 20528900  T
Q  115 agagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccg 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20528899 agagcactggtggactaatgccaaaggaaggcttgagatgggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccc 20528800  T
Q  215 aaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggt 314  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20528799 gaagacttgaggaccaagaaggacattgagtttctgaatctgaagtaaggaatcatgtctatagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggt 20528700  T
Q  315 tttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcagga 414  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20528699 tttttccctacatcaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggagatctaccagtacatatgtgttcagga 20528600  T
Q  415 gatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagagga 514  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| | |||||||    
T  20528599 gatccgagactttgatactttggtgaataagtatcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactacaaggcttagagtgataggagagga 20528500  T
Q  515 agaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctata 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20528499 agaggccatggagttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagggaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaggtgctata 20528400  T
Q  615 ggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgt 714  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||   ||||    
T  20528399 ggtgtggaaccttgggtcattatgccaatgattgtaagaatgacttgagttgtcataagtgtgggaaagcgggtcacaaggcgactaattgcaacagtgt 20528300  T
Q  715 tgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaat 814  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20528299 tgcatgagagattacttgttacaattgtggagagaaaggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcagcgggaaaggtgtttgctttgaat 20528200  T
Q  815 gcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattctt 907  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20528199 gcggaggaggtggaacagccgcataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatcctggtgctactcattctt 20528100  T
Q  908 ttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20528099 ttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 20528025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 982
Target Start/End: Original strand, 20827882 - 20828779
Alignment:
Q  92 actcatatgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||| | | |||||||| ||    
T  20827882 actcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctg 20827981  T
Q  192 aattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggc 291  Q
    | || ||||||||||| || ||  | || |||||||| | ||||||  | ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  20827982 agtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggc 20828081  T
Q  292 gaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatc 391  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20828082 gaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatc 20828181  T
Q  392 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattaca 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20828182 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactaca 20828281  T
Q  492 aggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaag 591  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20828282 aggctcagggtgaaaagagaggaagaggacatggggctggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaggccaag 20828381  T
Q  592 tttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcac 691  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  20828382 tttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcac 20828481  T
Q  692 aaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 791  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20828482 aaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcgg 20828581  T
Q  792 cgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattat 884  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  20828582 cgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattat 20828681  T
Q  885 tgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20828682 tgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 20828779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 871
Target Start/End: Original strand, 22128847 - 22129708
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| || ||| ||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | || ||||||||| | |||||||    
T  22128847 ggagctcagacgtgggtgcaaggcatggagaggatctttcgaactatggtgactagtgatgatcaaaaggtcaggttggctactcatatgattgctgagg 22128946  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaag-gcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatt 209  Q
    | || ||| | |||||||| ||||| |||| ||  ||||||| | || |  || |  ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |    
T  22128947 aggccgagtattggtggactaatgctaaggcaaaagcttgagattggtgaagaggttgtgacttgggctaagttcaaagctgagtttttgaggaagtact 22129046  T
Q  210 tcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttc 309  Q
    | ||  | || |||||||| | ||||||  | |||||  ||||  |||| ||||||| |||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  22129047 ttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggttgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgc 22129146  T
Q  310 gaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgtt 409  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  22129147 aaggttttgttcgtacatcaatgctgaggatgcgatggtttcgaagtgtgtgaaatttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgtt 22129246  T
Q  410 caggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaaga 509  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||||    || || ||||||  |  |   |||||||    
T  22129247 taggagatcctagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgccgcgaaggctaaagtgaactactacaagtttgtgaaagagaaga 22129346  T
Q  510 gaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtg 609  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||  |||   |||||| |||| || ||| | ||| || ||||||| |||    
T  22129347 gaggaagaggtcatggagttgggaaaccgtacaacaaggataaaggaaagaagaaagagaatggtggaggctttaagccgaatttagctgatgtcaggtg 22129446  T
Q  610 ctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcaga 709  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | | ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||   ||| || |      
T  22129447 ctacaagtgtggaactttgggtcattatgccaatgattgtaagaaagacattagttgccacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaag 22129546  T
Q  710 ggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctt 809  Q
    | ||||   |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22129547 gatgttttgaaggatattacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctt 22129646  T
Q  810 tgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagt 871  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  22129647 tgaatgcagaggaagtggagcagccagataatcttacccgaggtatttgttttatcaatagt 22129708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 255 - 982
Target Start/End: Original strand, 41214514 - 41215247
Alignment:
Q  255 tgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaa 354  Q
    |||| ||||||| |||||| || || |||||||| |||| ||| || || |||| |||||||||| | || || |||||||| ||||  ||| ||| |||    
T  41214514 tgaagcaagggagcatgtctgtggctgagtatgctgcgatgtttgaagagcttttgaggttttgtccgtatattaatgctgaagatgggatggtttcgaa 41214613  T
Q  355 gtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatg 454  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  41214614 gtgtgtgaagttcgaaagtgggctcaggctggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgcatg 41214713  T
Q  455 ttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaag 554  Q
    || ||||| || ||||  || |||   |  ||||||||| |   |  |||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||| ||||||| |||    
T  41214714 tttgatgacgccgggaaggccaaggtgagctattacaagtcggtgaatgagaagagaggaagaggtcatggatttgggaa-ccatacaacaaggacaaag 41214812  T
Q  555 gaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaa 654  Q
    ||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||    
T  41214813 gaaagaagaaagagactggtgggggctctaagccaagtttagctgatgtcaggtgctacaggtgtggaaccttcggtcattattccaatgattgtaagaa 41214912  T
Q  655 tgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggt 754  Q
     ||  | | ||| | ||||||||| || |  |||||||||||   ||| || |    ||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||    |||    
T  41214913 ggacattagttgccacaagtgtgggaaggcaggtcacaaggcttttgagtgtaagattgttgcaaaggatgttacttgttacaattgtggtgaagcaggt 41215012  T
Q  755 catattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggta 854  Q
    |||   ||||  | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||    
T  41215013 cattacagtaatatgtgtaccaagccaaagaaggcgacgggaaaggtgtttgcattgaatgccgaggaagtggagcaaccggataatcttatccgatgta 41215112  T
Q  855 tgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgt 947  Q
    ||||||||||||  |||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41215113 tgtgttttatcagcagtactccttggattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaatttggttgt 41215212  T
Q  948 aactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  41215213 aactccgttgttgcgagggatggttatcgacaccc 41215247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 354 - 637
Target Start/End: Original strand, 23312571 - 23312854
Alignment:
Q  354 agtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtat 453  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23312571 agtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcatgagatccgagattttgatactttggtgcataagtgtcgtat 23312670  T
Q  454 gttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaa 553  Q
    ||| ||||||||||| | || |||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||||   | ||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  23312671 gtttgatgatgctggaagagttaaggctaactactacaaggctcagaatgagaagagaggaaagagtcatggagttgggaaaccgtacaacaaggacaaa 23312770  T
Q  554 ggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattat 637  Q
    ||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23312771 ggaaagaagagagaagatggtggaggctctaagccgagtttagcggatgtcaaatgctatagatgtggaactttgggtcattat 23312854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 874 - 982
Target Start/End: Original strand, 22133031 - 22133139
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggtta 973  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||| |    
T  22133031 attgcaattattgataccggtgctactcattcttttacctcggttagttgtgttgagcatttgaaattggttctaactccgttgttgcgagggatggtca 22133130  T
Q  974 ttgacaccc 982  Q
    | |||||||    
T  22133131 tcgacaccc 22133139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 822 - 969
Target Start/End: Complemental strand, 20172302 - 20172147
Alignment:
Q  822 aggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgtttt-atcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatct 913  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||       |||| |||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  20172302 aggtggagcagccggataatctcatttgaggtatgtgtttttatcaatagtactcatttgattgaaattgttgatactagtgctacgtattctttcatct 20172203  T
Q  914 cggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatg 969  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| | ||||||    
T  20172202 cgcttagttgtgttgaacgtttgagtttggttttaactctgttgttgagaggaatg 20172147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 20074988 - 20075025
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20074988 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 20075025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20172780 - 20172643
Alignment:
Q  312 ggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttca 411  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||| || ||  | || ||  |||||||||| ||  ||||    
T  20172780 ggttttgtcccttcatcaatattgaggatgctatggtgtctaagtgtgtgaaggttgagagtggtctgagtcccgagattcatcagtacatctgctttca 20172681  T
Q  412 ggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtc 449  Q
     |||||| |||| ||| |||||||  |||| |||||||    
T  20172680 tgagatctgagattttgatactttgatgcacaagtgtc 20172643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 20297492 - 20297455
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20297492 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 20297455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 31537276 - 31537313
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31537276 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 31537313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 38910105 - 38910142
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38910105 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 38910142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 48425984 - 48425947
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48425984 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 48425947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 52988852 - 52988815
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52988852 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 52988815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 670; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 670; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 982
Target Start/End: Original strand, 6200 - 7180
Alignment:
Q  14 gcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaag 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  6200 gcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttgactgaggaag 6299  T
Q  114 cagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6300 cagagcactagtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaaatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 6399  T
Q  214 gaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaa---ctttcg 310  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  6400 tgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaagcaaggaatcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaattactttcg 6499  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6500 aggttctgtccctacattaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttc 6599  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  6600 aagagatccgagactttgatactttagtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactacaaagctcagggtgaaaagag 6699  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    ||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6700 aggaagaggacataaggttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgc 6799  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||       
T  6800 tataggtgtggaaacttaggtcactatgccaatgattgtaagaatgattggaattgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaagtcggctgattgcaaga 6899  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtc--atattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgct 808  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6900 gtgttgcaagagagattacttgctataattgtggagagaagggtcatatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttact 6999  T
Q  809 ttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactc 901  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||     
T  7000 ttgaatgtagaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactt 7099  T
Q  902 attcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7100 attcttttatctcggttagttgcgttgatcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 7180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 667; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 667; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 982
Target Start/End: Original strand, 130829 - 131807
Alignment:
Q  14 gcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaag 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  130829 gcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttctgagctattgttacggaagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaag 130928  T
Q  114 cagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130929 cagagcactagtggaccaatgccaagggaaggcttgaattgggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 131028  T
Q  214 gaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaa---ctttcg 310  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  131029 tgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaagcaaggaatcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaattactttcg 131128  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  131129 aggttctgtccctacattaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttc 131228  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  131229 aagagatccgagactttgatactttagtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactacaaagctcagggtgaaaagag 131328  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    ||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  131329 aggaagaggacataaggttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgc 131428  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||       
T  131429 tataggtgtggaaacttaggtcactatgcaaaagattgtaagaatgattggaattgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaagtcggctgattgcaaga 131528  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131529 gtgttgcaagagagattacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 131628  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  131629 gaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagaactcctttgattgcaattattgatacttgtgctactcat 131728  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131729 tattttatctcggttagttgtgttgatcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 131807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 27740 - 26762
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27740 ggagcacaaacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctacggtcacgagagatgaccagaaggtcagactagcgacttatatgcttgctgagg 27641  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  27640 aagcaaagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggggacctgggctaagttcaaagtcaaattcttgaggaagtattt 27541  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27540 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 27441  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  27440 aggttttgtccctatatcaatgctgaggatgctgtggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtggacttaggccggatatctatcaatacatgtgtgttc 27341  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||  ||| |||||    
T  27340 agtagatcctagacttttatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagactaattactacaaggcgcagaatgataagag 27241  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||| | |||||||||||     
T  27240 aggaaaaggccatggagttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatttggtgggggctctaagccgaatttgtcagatgtcaagtgt 27141  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    |  | | || ||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||   ||| || |       
T  27140 ttcaagagttgaaatatgggtcattatgctagtgattgtaagaaggatatcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttatgaatgtaaga 27041  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27040 gtgttgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatattagtactaagtttaccaagccgaagaagggggcggaaaaggtgtttgcttt 26941  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26940 gaatgcggaggaagtggagcaaccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactgttgctacttat 26841  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |  |||||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26840 tcttttatctcttttagttgtgtttattgtttgtttttggttgttactcctttgttgcgtggtatggttattgacaccc 26762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 664; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 664; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 957
Target Start/End: Original strand, 12671 - 13624
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12671 ggagcacagacttgggtctaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgctagctgagg 12770  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12771 aagcagagcactggtgggctaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgaactgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 12870  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12871 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaaattgagtttctgaatctgaaacaaggaaacatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 12970  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||     
T  12971 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaaatgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatcaatcagtacatgtgtgttt 13070  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  13071 aggagatccgagattttgatactttggttcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggagagctaagaccaattactacaaggctcagaatgacaagag 13170  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13171 tggaagaggccatggagttggtaaaccttacagcaaggacaagggaaagaagagataatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgc 13270  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||       
T  13271 tataggtgtggaaccttgggtcattatgctaatgattgtaagaatgacatgagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacagggcggctgattgcaaga 13370  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13371 gtgttgcaagggagatcacttgttataattgtggagagaaaggtcatattagtaccaagtgtaccaaaccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 13470  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13471 gaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcat 13570  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttg 957  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13571 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctttg 13624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 641; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 982
Target Start/End: Original strand, 1 - 939
Alignment:
Q  51 gagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttga 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  1 gagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgctagctgaggaagcagagcactggtgggctaatgccaaaggaagacttga 100  T
Q  151 gttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctg 250  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  101 gatgggaggtgatgtggtgaactgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggaaattgagtttctg 200  T
Q  251 aatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgattt 350  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  201 aatctgaaacaaggaaacatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggttt 300  T
Q  351 agaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcg 450  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||    
T  301 cgaaatgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatcaatcagtacatgtgtgtttaggagatccgagattttgatactttggttcataagtgtcg 400  T
Q  451 tatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggac 550  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  401 tatgtttgatgatgctgggagagctaagaccaattactacaaggctcagaatgacaagagtggaagaggccatggagttggtaaaccttacagcaaggac 500  T
Q  551 gaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgca 650  Q
     | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  501 aagggaaagaagagataatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaaccttgggtcattatgctaatgattgta 600  T
Q  651 agaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaa 750  Q
    |||||||  ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  601 agaatgacatgagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacagggcggctgattgcaagagtgttgcaagggagatcacttgttataattgtggagagaa 700  T
Q  751 gggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcaga 850  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  701 aggtcatattagtaccaagtgtaccaaaccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatctga 800  T
Q  851 ggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttgg 943  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  801 ggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtattgaacgtttgaaattgg 900  T
Q  944 ttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  901 ttgtaactcctttgtcgcaggggatggttattgacaccc 939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 609; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 609; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 981
Target Start/End: Original strand, 315 - 1269
Alignment:
Q  35 atggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  315 atggagcggattttccgagctatggttacgggagatgactagaaggtcaaacttgcaactcatatgctagctgaagaagcagagcactggtggacaaacg 414  T
Q  135 ccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaa 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  415 ccaaaggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctacgttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaa 514  T
Q  235 ggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgct 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  515 ggagattgagtttctaaatctgaagcaaggaatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgtctctacatcaatgcg 614  T
Q  335 gaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactt 434  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  615 gaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 714  T
Q  435 tagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaa 534  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  715 tggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactacaaggctcagggtgaaaagagaggaagaggacatggggctggaaa 814  T
Q  535 accttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcat 634  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| | || || | ||| |  | |||||||| | ||||||||    
T  815 accttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatttgtcagacgttaggtgtttcaagtgtggaaatatgggtcat 914  T
Q  635 tatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcaga-ggtgttgcaagagagattacttgt 733  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||     
T  915 tatgccaatgattgtaagaaggatatcagttgtcacaagtgtggaaaagcaggtcacaagggttatgaatgcaaagggtggtgcaaaggagattacttgc 1014  T
Q  734 tacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagc 833  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1015 tacaattgtggagagaagggtcacattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaagtggagcagc 1114  T
Q  834 cggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgt 926  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1115 tggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcattcttttatctcgattagttgtgt 1214  T
Q  927 tgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacacc 981  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1215 tgaacgtttgaaattggtcgtaactcctttgttgcggggaatggttatcgacacc 1269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 589; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 23509524 - 23508555
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||    
T  23509524 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgagg 23509425  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509424 aagcagagcactggtggaccaatgccaaaggaaggcttaagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 23509325  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| || ||||||||||||||||| |    
T  23509324 ccccgaagacttgaggaccaagaaggcgattgagtttctgaatctgaagcaaggaatcatgtctgtagccaagcatgtggtgaagttcgaggaacttttg 23509225  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23509224 aggttttgtccatacatcaatgctaaggatgctatgatttcgaagtgtgcgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttc 23509125  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||    
T  23509124 aggagatccgagactttgatactttgatgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactacaaggctcataatgataagag 23509025  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | | |  | || |||| |||     
T  23509024 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacaacaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatctctcagacgtcaggtgt 23508925  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    |  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||| |||| ||| |||||||    ||| |||||      
T  23508924 ttcaagtgtggaaatatgggtcattatgctaatgattgcaagaaggatatcaattttcacaagtgtgggaaagcgggccacaagggttttgaatgcagga 23508825  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    ||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23508824 gtgatgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagagtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcagcgggaaaggtgtttgcttt 23508725  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    ||||||         ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23508724 gaatgc---------ggagcagtcggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcat 23508634  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23508633 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggctgtaactcctttgttgcggggaatggttattaacaccc 23508555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 24585049 - 24584081
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||| ||||| ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| ||  | ||||| || ||||| ||  | || ||||| ||||| |||||||    
T  24585049 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcagatgcttgctgagg 24584950  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    | || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | |  || || |  ||||| ||| | | ||||||   ||| || ||||||||||| ||    
T  24584949 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggagaggttgtgacttggacaatgttcaaaactgagtttttgaggaagtactt 24584850  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
     ||  | || |||||||| | ||||||  | ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||| |     
T  24584849 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttaaggagcttgca 24584750  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24584749 aggttttgtccctacatcaatgttgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagttggagagtgggcttaggtcggatatctatcagtacatgtgtgttc 24584650  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||     
T  24584649 aggagatccgagagtttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaggttaagtctaattactacaaggctcagaatgagaagaa 24584550  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    ||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24584549 agggaagggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaa-aagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgc 24584451  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    | || ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24584450 tttaagtgtggagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagag 24584351  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24584350 gtgtttcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatatta---------gtaccaagccgaagaaggcagcgggaaaggtgtttgcttt 24584260  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24584259 gaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcat 24584160  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24584159 tcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 24584081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 21828385 - 21828203
Alignment:
Q  281 gagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggctta 380  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21828385 gagtatgcagcaaagtttgaggagctttcgaggttttgtacgtacattaatgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagttcgaaagtgggctta 21828286  T
Q  381 ggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatg 464  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||  || |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21828285 ggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagattagagatttcgat-ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 21828203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 920 - 982
Target Start/End: Original strand, 21934623 - 21934685
Alignment:
Q  920 gttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21934623 gttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 21934685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 339
Target Start/End: Original strand, 33314011 - 33314082
Alignment:
Q  268 catgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgagga 339  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  33314011 catgtcagtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccgtacattaatgcagagga 33314082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 17327960 - 17327922
Alignment:
Q  740 tgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaag 778  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17327960 tgtggagaaacgggtcatattagtaccaagtgtaccaag 17327922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 14884380 - 14884417
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14884380 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 14884417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 20345261 - 20345224
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20345261 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 20345224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 22505658 - 22505621
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22505658 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 22505621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 25851051 - 25851014
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25851051 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 25851014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 26056627 - 26056562
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaat 939  Q
    ||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  26056627 attgctattattgatacgagtgcgacacattcttttatttatgttggttgtgttgaacgtttgaat 26056562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 582; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 582; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 170 - 982
Target Start/End: Original strand, 12124 - 12943
Alignment:
Q  170 acctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatca 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12124 acctgggctaagttcaaggttgaattattgaggaagtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaatca 12223  T
Q  270 tgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttga 369  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12224 tgtctgtagccgagtatgcggcgaagttcgagcaactttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttga 12323  T
Q  370 gagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctggg 469  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12324 gagtgggcttaggccagatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctggg 12423  T
Q  470 atagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaat 569  Q
    |  | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||    
T  12424 aaggttaagtctaattactacaaggctcagggtgataggagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaataagagaaaat 12523  T
Q  570 ctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||     
T  12524 ctggtgggggctctaggccaagtttggtggatgtcaagggctataggtgtggaaccttaggtcattatgccaatgattgtaagcatgatttgaattgtca 12623  T
Q  670 caagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaag 769  Q
    ||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12624 caagtgtgggaaaacgggtcacaagtcggctgattgcaagagtgttgcaagagagattacttgttacaattctggagagaaagttcatattagtaccaag 12723  T
Q  770 tgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaata 869  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12724 tgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgattgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaata 12823  T
Q  870 gtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcg 962  Q
    ||||       |||||||||||||||| ||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12824 gtactcctttgattgcaattattgataatggagatactaatacttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcg 12923  T
Q  963 gggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12924 gggaatggttattgacaccc 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 11999 - 12121
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||    
T  11999 ggagcacggacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgagg 12098  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12099 aagcagagcactggtggaccaat 12121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 574; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 26142 - 25164
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  26142 ggagcacagacttgggtgcagggtatggggtggattttccgagctatggtgacaggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgttgagg 26043  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26042 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtaatgtggtgacttgggctaagttcaaagttgaattcttg-ggaagtattt 25944  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||  || | ||||||    
T  25943 ccctgaagacttgagaactaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtttgtagccgagtatgcggcgaagtttaagaagctttcg 25844  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||     
T  25843 aggttttgtccttacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttg 25744  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||     
T  25743 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgttggaagagctaagactaattactacaaggctcagaatgagaagaa 25644  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25643 gcgaaaaggccatggagttggaaaaccttacaacaaagacaaaggaaagaagagagaagctggtgggggctctaagccgagtttggcggatgtcaagtgc 25544  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||       
T  25543 tataggtgtggaactttgggtcattatgccaatgattgtaagaatgacattagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgctgagtgcaaga 25444  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    || ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  25443 gttttgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtacaaagccggagaaggcggcaagaaaggcgtttgcttt 25344  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtg-ttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactca 902  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25343 gaatgcggaggaactggagcaaccggataatcttatccgaggtatgtgtttttatcaatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactca 25244  T
Q  903 ttcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25243 ttcttttatctcggttagttatgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 25164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 524; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 982
Target Start/End: Original strand, 27104201 - 27105098
Alignment:
Q  92 actcatatgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||| | | |||||||| ||    
T  27104201 actcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctg 27104300  T
Q  192 aattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggc 291  Q
    | || ||||||||||| || ||  | || |||||||| | ||||||  | ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  27104301 agtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggc 27104400  T
Q  292 gaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatc 391  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27104401 gaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatc 27104500  T
Q  392 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattaca 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27104501 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactaca 27104600  T
Q  492 aggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaag 591  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27104601 aggctcagggtgaaaagagaggaagaggacatggggctggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaggccaag 27104700  T
Q  592 tttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcac 691  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  27104701 tttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcac 27104800  T
Q  692 aaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 791  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27104801 aaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcgg 27104900  T
Q  792 cgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattat 884  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  27104901 cgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattat 27105000  T
Q  885 tgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27105001 tgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 27105098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 27174124 - 27173227
Alignment:
Q  92 actcatatgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||| | | |||||||| ||    
T  27174124 actcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctg 27174025  T
Q  192 aattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggc 291  Q
    | || ||||||||||| || ||  | || |||||||| | ||||||  | ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  27174024 agtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggc 27173925  T
Q  292 gaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatc 391  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27173924 gaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatc 27173825  T
Q  392 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattaca 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27173824 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactaca 27173725  T
Q  492 aggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaag 591  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27173724 aggctcagggtgaaaagagaggaagaggacatggggctggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaggccaag 27173625  T
Q  592 tttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcac 691  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  27173624 tttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcac 27173525  T
Q  692 aaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 791  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27173524 aaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcgg 27173425  T
Q  792 cgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattat 884  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  27173424 cgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattat 27173325  T
Q  885 tgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27173324 tgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttgggtttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 27173227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 7827743 - 7826846
Alignment:
Q  92 actcatatgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||| | | |||||||| ||    
T  7827743 actcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctg 7827644  T
Q  192 aattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggc 291  Q
    | || ||||||||||| || ||  | || |||||||| | ||||||  | ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  7827643 agtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggc 7827544  T
Q  292 gaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatc 391  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7827543 gaagtttgaggagcttgcaaggttttgcccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatc 7827444  T
Q  392 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattaca 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7827443 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactaca 7827344  T
Q  492 aggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaag 591  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7827343 aggctcagggtgaaaagagaggaagaggacatggggctggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaggccaag 7827244  T
Q  592 tttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcac 691  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  7827243 tttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcac 7827144  T
Q  692 aaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 791  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7827143 aaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcgg 7827044  T
Q  792 cgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattat 884  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  7827043 cgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattat 7826944  T
Q  885 tgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7826943 tgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 7826846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 255 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 4443603 - 4442873
Alignment:
Q  255 tgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaa 354  Q
    |||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | | ||||| |||| ||||||||| ||| | |  ||    
T  4443603 tgaagcaagggagcatgtctgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcgaggttttatgcgtacattaatgttgaggatgcaatggtgtccaa 4443504  T
Q  355 gtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatg 454  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4443503 gtgtgtgaaatttgaaagtggacataggccggatatctatcagtatatgtgtgttaaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatg 4443404  T
Q  455 ttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaag 554  Q
    || |||||||  || | || |||  |||||||||||||||| ||   ||| |||| |||||  || |||||| |||| ||||| || | ||||||  |||    
T  4443403 tttgatgatgtcggaagagttaaagctaattattacaaggcgcaacatgataagaaaggaaagggtcatggatttgggaaaccgtataacaaggataaag 4443304  T
Q  555 gaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaa 654  Q
    ||| ||||    ||  |||||| ||||||| | | | |  ||| ||||||| ||||| || |||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4443303 gaaggaag----aagttggtggaggctctaagtctaatacggctgatgtcaggtgctttaagtgtggcacgttaggtcattttgctaatgagtgcaagaa 4443208  T
Q  655 tgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggt 754  Q
     | ||  | |||   ||||||||| |||||||||||||||||   ||| || |    ||| |  |  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4443207 gggtgatagttgctacaagtgtgggaaagtgggtcacaaggcttttgagtgtacgaatgtcgagaaggaggttacttgttacaattgtggtgagaaaggt 4443108  T
Q  755 catattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggta 854  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4443107 catatcagttctaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgtatgtggaggaagtggagcagccggataatcttatccgaggta 4443008  T
Q  855 tgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgt 947  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4443007 tgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttctacctcggttagttgtgttgagcgtttgaatttggttgt 4442908  T
Q  948 aactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  4442907 aactccgttgttgcgagggatggtcattgacaccc 4442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 730 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 13459238 - 13458990
Alignment:
Q  730 ttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggag 829  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13459238 ttgttacaattgtggcgagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagttgaagaaggtgacgggaaaagtgtttgcattgaatgcggaggaagtggag 13459139  T
Q  830 cagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagtt 922  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13459138 cagacggataatcttctccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatttcggttagtt 13459039  T
Q  923 gtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggt 971  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||    
T  13459038 gtgttgagcatttgaatttagttgtaactctgttgttgcgagggatggt 13458990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 765 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 22035167 - 22034972
Alignment:
Q  765 ccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttat 864  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||  || ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22035167 ccaagtgtaccaagccgaagaaggccatgggaagagtttttgcattgaatgttgaggacgtggagcagccggataatttaatatgaggtatgtgttttat 22035068  T
Q  865 caatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcc 953  Q
    |||||||||       ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22035067 caatagtactcatttgattgcaaatgttgatacttgtgctacgcattctttcatctcgcttagttgtgttgaacctttgaatttggttttaactcc 22034972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 797 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 14207456 - 14207278
Alignment:
Q  797 aaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgata 889  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||    
T  14207456 aaggtgttcgctttgaatgcggagtaagtggagcagccatataatcttatt-gaggtatgtgttttatcaatagtactcctttaattgcaattattaata 14207358  T
Q  890 ctggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggt 971  Q
    |||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  14207357 ctggcgctactcatt--ttggtctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactccgttgtcgcgtggaatggt 14207278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 797 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 14216146 - 14215968
Alignment:
Q  797 aaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgata 889  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||    
T  14216146 aaggtgttcgctttgaatgcggagtaagtggagcagccatataatcttatt-gaggtatgtgttttatcaatagtactcctttaattgcaattattaata 14216048  T
Q  890 ctggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggt 971  Q
    |||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  14216047 ctggcgctactcatt--ttggtctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactccgttgtcgcgtggaatggt 14215968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 755 - 938
Target Start/End: Original strand, 17142392 - 17142582
Alignment:
Q  755 catattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggta 854  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||||| ||  |||| |    
T  17142392 catattagcaccaagtgtaccaaaccgaagaaggcgggaggaaaggtctttgcattgaatgcagaagaggtgaagcagacgaataatttaatttgaggga 17142491  T
Q  855 tgtgttttatcaatagta-------cattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaa 938  Q
    ||||||||||||  ||||        ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17142492 tgtgttttatcatcagtattcaattgattgcaattattgattcgggtgcttttcattcttttatctcgcttagttgtgttgaacgtttgaa 17142582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 282 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 13459664 - 13459484
Alignment:
Q  282 agtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttag 381  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||     
T  13459664 agtatgctgcaaagtttgaggaacttccgaggttttatccctacattaatgtcgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaacgtgggcttaa 13459565  T
Q  382 gtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatga 462  Q
    |  ||| |||||||||||  |||||||| |||| ||  |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13459564 gctggatatctatcagtatgtgtgtgtttaggatattagagacttcgatactttggtgcacaagtgtcgtatattcgatga 13459484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Original strand, 16575119 - 16575220
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  16575119 ggagcacagacttaggtgcagggcatggagcggatattccatgccatggtgatgggagatgaccagaaggtcagactggcaactcatatgcttgctgagg 16575218  T
Q  111 aa 112  Q
    ||    
T  16575219 aa 16575220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16590543 - 16590442
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  16590543 ggagcacagacttaggtgcagggcatggagcggatattccatgccatggtgatgggagatgaccagaaggtcagactggcaactcatatgcttgctgagg 16590444  T
Q  111 aa 112  Q
    ||    
T  16590443 aa 16590442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 758 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 17131855 - 17131661
Alignment:
Q  758 attagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcg---gcggga---aaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagag 851  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |   | ||||   || || ||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||||| || |||||||    
T  17131855 attagtaccaagtgtacaaagccgaagaaggagaaagtgggaggtaaagtttttgcattgaatgttgaggaggtgcaagagccggataacttgatcagag 17131756  T
Q  852 gtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaat 939  Q
    |||||||||||| ||| |||||       |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||    
T  17131755 gtatgtgttttaacaacagtactccattgattgtaattattgatacgggtgctacccattcttttatatcgcttagttgtgcggaacgtttgaat 17131661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 725 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 14218272 - 14218206
Alignment:
Q  725 attacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 791  Q
    |||||||||| ||| |||||||||   || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14218272 attacttgtttcaactgtggagaggcaggccatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 14218206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 13965862 - 13965899
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13965862 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 13965899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 26091992 - 26092029
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26091992 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 26092029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 40925011 - 40925048
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40925011 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 40925048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 49155356 - 49155319
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49155356 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 49155319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 524; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 982
Target Start/End: Original strand, 16378936 - 16379833
Alignment:
Q  92 actcatatgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||| | | |||||||| ||    
T  16378936 actcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctg 16379035  T
Q  192 aattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggc 291  Q
    | || ||||||||||| || ||  | || |||||||| | ||||||  | ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  16379036 agtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggc 16379135  T
Q  292 gaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatc 391  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16379136 gaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatc 16379235  T
Q  392 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattaca 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16379236 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaattactaca 16379335  T
Q  492 aggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaag 591  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16379336 aggctcagggtgaaaagagaggaagaggacatggggctggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaggccaag 16379435  T
Q  592 tttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcac 691  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  16379436 tttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcac 16379535  T
Q  692 aaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 791  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16379536 aaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcgg 16379635  T
Q  792 cgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattat 884  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  16379636 cgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattat 16379735  T
Q  885 tgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16379736 tgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 16379833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 982
Target Start/End: Original strand, 16646532 - 16647429
Alignment:
Q  92 actcatatgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | |  || |  |  ||||| ||| | | |||||||  ||    
T  16646532 actcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggaggggttgtgacttggacaacgttcaagactg 16646631  T
Q  192 aattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggc 291  Q
    | || ||||||||||| || ||  | || |||||||| | ||||||  | ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  16646632 agtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggc 16646731  T
Q  292 gaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatc 391  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  16646732 gaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatc 16646831  T
Q  392 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattaca 491  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  16646832 tatcagtacatgtgtgttaaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaggttaagtctaattactaca 16646931  T
Q  492 aggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaag 591  Q
    ||||||||  |||||||| ||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16646932 aggctcagaatgagaagaaagggaagggctatggagttgggaaaccttacagcaaagataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaag 16647031  T
Q  592 tttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcac 691  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  16647032 tttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcac 16647131  T
Q  692 aaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 791  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16647132 aaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 16647231  T
Q  792 cgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattat 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  16647232 cgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattat 16647331  T
Q  885 tgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16647332 tgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttaaacgtttggatttggttgtaactcatttgttgcgtggaatggttattgacaccc 16647429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 468
Target Start/End: Original strand, 1660325 - 1660782
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1660325 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgtttgctgagg 1660424  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1660425 aagcagagtactggtggatcaatgccaagggcaggcttgagttgggcggtgatgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 1660524  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1660525 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttcg 1660624  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1660625 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggtcatctatcagtacatgtgtgttc 1660724  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgg 468  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1660725 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgg 1660782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 822
Target Start/End: Original strand, 21412008 - 21412819
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||    
T  21412008 ggagctcagacttgggtgcagggcatggagcggatatttcgtgctatggtgacgggagatgaccaaaaggccagattggcgactcatatgcttgctgagg 21412107  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    | || ||| |||||||||| |||| ||| |||||  ||||| ||||||| || |  ||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  21412108 aggctgagtactggtggactaatgtcaaaggaagatttgagatgggaggagaagttgtgacctgggcgaagttcaaagcagaattcttaaggaagtattt 21412207  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  |||| ||||| || | ||||||| | || |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  21412208 ccctgaagatttgagaactaggaaggaggtggaatttctgaacctgaagcagggaagcatgtctgtagccgagtatgaggcgaagtttgaggagctttcg 21412307  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21412308 aagttttgtccgtacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttc 21412407  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||||||  | |||||||    
T  21412408 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgttgcatgtttgttgatgctgggagagttaatgctaattactacaaggctcagaataagaagag 21412507  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    || || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  21412508 agaaaaaggccatggagttgggaaaccgtacaacaaggacaaggggaagaagagagaagctggtgggggctctaagccaaatttagcggatgtcaagtgc 21412607  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    || | |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||||  |||||||| |||| ||||||||||||   ||| || |  |    
T  21412608 tacaagtgtggaactataggtcattatgccaatgattgtaagaaggacattagttgtcataagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttttgaatgtaagg 21412707  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    ||||||| |  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21412708 gtgttgcgaaggatgttacttgatacaattgtggagagaagggttatattagtactaagtgtatcaagtcgaagaaggcggcgggaacagtgtttgcttt 21412807  T
Q  811 gaatgcggagga 822  Q
    |||| |||||||    
T  21412808 gaatacggagga 21412819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 16104104 - 16103605
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16104104 ggagtacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccaagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatgtgcttgctgagg 16104005  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16104004 aagcggagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgaaatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaagctgaattcttgaggaagtattt 16103905  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  16103904 ccctgaagacttgaggactaagaaggaggttgagtttctgaatttgaatcaaggaagcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcc 16103805  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||      
T  16103804 aggttttttccctacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgcgtct 16103705  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  16103704 aggagatccgagactttcatactttggtgcaaaagtgtcgtatgtttgatgatgctggaagagctaagactagttactacaaggctcagaatgagaagag 16103605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 521 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 16101304 - 16100836
Alignment:
Q  521 catggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtg 620  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16101304 catggagttggaaaaccttacaacaaagacaaaggaaagaagagagaagctggtgggggctataagccgagtttggcggatgtcaagtactataggtgtg 16101205  T
Q  621 gaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaag 720  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  | | |||||  |||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||  ||  |||| ||    
T  16101204 gaaccttgggtcattatgccaatgattgtaagaatgacattagttgtcataagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgttgaatgcaagggaattgcgag 16101105  T
Q  721 agagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggag 820  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16101104 agatgttacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaa 16101005  T
Q  821 gaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatct 913  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16101004 gaggtggagcaaccggataatcttatccgaagtatttgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatttttttatct 16100905  T
Q  914 cggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16100904 cggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 16100836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17786996 - 17786689
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaagg-tcagactagcgactcatatgctagctgag 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17786996 ggagcacagacttgggtgcagggtatggaacggattttccgagctatggttacgggaaatgaccagaaggctcagactagcgactcatatgctagctgag 17786897  T
Q  110 gaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatt 209  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17786896 gaagaagggcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctaggctaagttcaaggtcgaattcttgaggaaatatt 17786797  T
Q  210 tcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttc 309  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17786796 tccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgaatatgcggcgaagttcgaggaactttc 17786697  T
Q  310 gaggtttt 317  Q
    ||||||||    
T  17786696 gaggtttt 17786689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 654
Target Start/End: Original strand, 22364852 - 22365489
Alignment:
Q  17 cagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaagcag 116  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||  | |||||| | ||||||||  | |  ||||| ||||| |||||||| || |    
T  22364852 cagacttgggtgcagggcatagagaggatattccgtgctatggtgacaagtgatgactagaaggtcaggttggttactcacatgcttgctgaggaggccg 22364951  T
Q  117 agcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgaa 216  Q
    || | |||||||| ||| | |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  22364952 agtattggtggactaattctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcaaagttcaaagttgagttcttgaggaagtatttccctga 22365051  T
Q  217 agacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttt 316  Q
    ||  |||||||||| ||||||  | |||||  ||||  || | ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| || || |||||||| |||    
T  22365052 aggtttgaggaccaggaaggaagtagagttcttgaacttgtagcaagggagcatgtctgtagctgagtatacggcgaagtttgaagagctttcgagattt 22365151  T
Q  317 tgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggaga 416  Q
    | | | |||||||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22365152 tttccatacatcaatgttgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgagcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggaga 22365251  T
Q  417 tccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaag 516  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||| |||||||   ||  ||||||||||||| |    
T  22365252 tccgagattttgatactttggtgtataagtgtcgtatgtttgatgatgccgggagagttaaggctaattactacaaggtaaagaatgagaagagaggagg 22365351  T
Q  517 aggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctatagg 616  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| | | | |  ||  ||||||||||||| || |    
T  22365352 aggccatggagttggaaaaccgtacaacaaggacaaagggaagaagagagaagctggtggaggctctaagactaataagggtgatgtcaagtgctttaag 22365451  T
Q  617 tgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaa 654  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22365452 tgtggcacgatgggtcattatgctaatgagtgcaagaa 22365489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 14150085 - 14149316
Alignment:
Q  122 tggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgaaagact 221  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||| | || || || |  ||||| |||||||||||||||   || || ||||||||||| || |   | || |    
T  14150085 tggtggactaatgctaagggaaaacttgagattggtggagaggttgtgacttgggctaagttcaagaccgagtttttgaggaagtactttctagaggatt 14149986  T
Q  222 tgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttc 321  Q
    ||||||| | ||||||| | |||||  ||||  |||| |||||||  ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |    
T  14149985 tgaggactaggaaggaggtggagttcttgaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcggcgatgtttgaggagctgtcgaggttttgtcc 14149886  T
Q  322 ctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccga 421  Q
     |||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  14149885 gtacatcaatgctgaggatgcgatggtgtccaagtgtgtgaaatttgaaagtgggcttaggctggatttctatctgtatatgtgtgttcaagagatccga 14149786  T
Q  422 gactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggcc 521  Q
    || ||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || || | || ||||||| ||||||||||||| ||    || | || |||||   | |    
T  14149785 gattttgatacctt-gtgcatcagtgtcgtatgtttgatgacgccggaagagttaagtctgattattacaaggcacaaaaggataggaaaggaaagagtc 14149687  T
Q  522 atggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtgg 621  Q
    ||||| |||| ||||| |||| ||||||  | ||||||||| | ||| ||||||| || |||| |   ||||| || |||||||  |||| |||||||||    
T  14149686 atggatttgggaaaccgtacaacaaggataagggaaagaagagtgaaactggtggaggttctaaggtgagtttagctgatgtcagatgctttaggtgtgg 14149587  T
Q  622 aactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaaga 721  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||  |||||||||| ||| ||||| || | ||||||| |||| ||        ||     
T  14149586 aactttgggtcattatgctaacgattgcaagaaggatgagaaatgtttcaagtgtggacaagcgggtcccaggtcggctgagtgca-ag--------agg 14149496  T
Q  722 gagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  14149495 gagattacttgttacaattgtggtgagaagggtcatatcagtactaattgtaccaagccgaagaaggcggcagggaaggtgtttgcattgaatgcggagg 14149396  T
Q  822 aggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggt 894  Q
    | ||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||||||    
T  14149395 aagtggaacaactggataatcttatccgaggtatgtgttttatcgatagtactcctttgattgcaattattgatactggt 14149316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18421363 - 18421101
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18421363 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgatctatggtgacgagggatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgctaagg 18421264  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18421263 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgttgtgacctgggctaagttccaggttgaattcttgaggaagtattt 18421164  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtc 273  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18421163 ccctgaagacttgaggaccaacaaggagattgagtttctgaatctataacaagggatcatgtc 18421101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 874 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 18401574 - 18401466
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggtta 973  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18401574 attgcaattattgatattggtgttactgatacttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttggaactcctttgttgcggggaatggtta 18401475  T
Q  974 ttgacaccc 982  Q
    |||||||||    
T  18401474 ttgacaccc 18401466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 889 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 14133995 - 14133902
Alignment:
Q  889 actggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  14133995 actggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagggatggtcattgacaccc 14133902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 462
Target Start/End: Original strand, 19982383 - 19982534
Alignment:
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||| |  | ||| | || || |||||||||||  || |||    
T  19982383 aggttttgttcgtatattaatgttgaggatgctatggtttcaaaatgtgagaagtttgagagtcgtttgaggcccgagatttatcagtacatacgttttc 19982482  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatga 462  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||| || || |||| ||||||||| |||||    
T  19982483 atgagatccgagatttttatactttggtacacaagtatcgtatgtttgatga 19982534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 947 - 982
Target Start/End: Original strand, 1646239 - 1646274
Alignment:
Q  947 taactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646239 taactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 1646274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 510; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 964
Target Start/End: Complemental strand, 3675 - 2701
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3675 ggagcacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgctgagg 3576  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  3575 aagcagagaactagtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaagcttaattattgaggaagtattt 3476  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3475 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 3376  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | |    
T  3375 aggttttgtccctacatcaatgctgaagatgatatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtatcc 3276  T
Q  411 aggagatccgaga--------ctttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggt 502  Q
    | |||||||||||        |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||| ||| ||| ||||||||||||  |    
T  3275 aagagatccgagactttgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgttgatactggaagagccaagactagttactacaaggctcagaat 3176  T
Q  503 gagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatg 602  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  3175 gagaagaggggaaaaggccatggagttggaaaaccttgcaacaaagacaaagggaagaagagagaagctggtgggggctctaagtcgagttcggcggatg 3076  T
Q  603 tcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctga 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | | ||||| |||||| || |||| |||||| ||||| |||||    
T  3075 tcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgccaatgattgtaagaatgacattagttgtcacaagtgcgggaaagcgggtcataaggctgctga 2976  T
Q  703 ttgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtg 802  Q
     ||||   |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2975 gtgcaagagtgttggaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgagaaaggtg 2876  T
Q  803 tttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagta-------------cattgcaattattgata 889  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| |   |||||||              ||||||||||||||||    
T  2875 tttgctttgaatgcggaggaagtggagcaaccggataatcttatccgaggtctgtgttgtgcgaatagtagcatagtacctttgattgcaattattgata 2776  T
Q  890 ctggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggg 964  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2775 ccggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcttttgaaattggctgtaactcctttgttgcggg 2701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 505; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 91 - 982
Target Start/End: Original strand, 4226 - 5123
Alignment:
Q  91 gactcatatgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggtt 190  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| |||   | |||||||| |    
T  4226 gactcacatggtagctaaggaagcagagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggggaggttgtgacttggataaggttcaaggct 4325  T
Q  191 gaattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcgg 290  Q
    || || ||||||||||| || ||  | || ||||| || | ||||||  | ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  4326 gagtttttgaggaagtactttccagaggatttgagaactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcgg 4425  T
Q  291 cgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacat 390  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4426 cgaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacat 4525  T
Q  391 ctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattac 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  4526 ctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaggctaagtctaattactac 4625  T
Q  491 aaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaa 590  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  4626 aaggctcagggtgaaaagagaggaagaggacatggggctggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaagccac 4725  T
Q  591 gtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtca 690  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  4726 gtttggcggatgtcaagtgctttaagtgtggatctatgggtcactatgctagtgattgcaagaatgat-ttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtca 4824  T
Q  691 caaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcg 790  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4825 caaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcg 4924  T
Q  791 gcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaatta 883  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||    
T  4925 gcgggaaaggtgtttgctttgaacgcagaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaataatactcctttgattgcaatta 5024  T
Q  884 ttgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5025 tcgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 5123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 499; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 153 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 91324 - 90488
Alignment:
Q  153 tgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaa 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  91324 tgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaa 91225  T
Q  253 tctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttag 352  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  91224 tctgaaacatgggatcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctaagatttcg 91125  T
Q  353 aagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgta 452  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  91124 aagtatgtgaagtttgagagtgggcttaggacgaaaatctatcaataaatgtgtgttcaggagatcagagactttgaaactttggtgcataagtgtcgta 91025  T
Q  453 tgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacga 552  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||| |    
T  91024 tgtttgatgatgctgggagagctaagactaattactacaaggctcagaatgataaaagaggtagagggcatggagttggaaagccgtacaacaaggacaa 90925  T
Q  553 aggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaag 652  Q
    |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||| | |||| | ||||||||||| |  | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  90924 aggaaagaatagagagtctggtggcggctctaagccgaatttgtcagatgtcaagtgtttcaagtgtggaaatatgggtcattatgctaatgattgtaag 90825  T
Q  653 aatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagg 752  Q
    || ||  | | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||   ||| ||||   |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  90824 aaggacatcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttatgaatgcaagagtgttgaaaaggagattacttgatacaattgtggagagaaag 90725  T
Q  753 gtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagagg 852  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  90724 gttatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtatgctttgaatgcggaggaggtggagcaaccggataatcttatctgagg 90625  T
Q  853 tatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggtt 945  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  90624 tatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggtt 90525  T
Q  946 gtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90524 gtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 90488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 9121 - 8143
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||    
T  9121 ggagcacaaacgtgggtgcagggcacggagcggatattcggtgctatggtgacgggaggtgatcagaaggtcaaactggcgactcgtatgcttgttgagg 9022  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||| | |  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  9021 aagctgagcactattggactaatgccaaaggaagaattgagatgggaggtaaagttgtgacctgggcgaagttcaaagctgaattcttgatgaagtattt 8922  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8921 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 8822  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||| | | |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| || | || ||||||||  ||||||| |    
T  8821 aggttttatccgtacatcaatgctaaagatgctatggtttcgaagtgtgtaaagtttgaaagtgggcttaggccgaatatttatcagtatttgtgtgtcc 8722  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  8721 aggagatccgagactttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgttggaagagctaagactaattactataaggctcagaatgagaagag 8622  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  | |||| ||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  8621 aggaagaggccttggagttgggaagtcgtacaacaaggacaagggaaagaagagagaagccggtgggggctctaagccgaatttggcggatgtcaagtgc 8522  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagag 710  Q
    || | || |||||||||||||| |||||| |||||||| || || ||| | | ||||| ||||||||| |||| || |||||||||   | | ||||  |    
T  8521 tacaagtatggaactttgggtctttatgccaatgattgtaaaaaggatatcagttgtcacaagtgtgggaaagcggatcacaaggcttttaaatgcaagg 8422  T
Q  711 gtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 810  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8421 gtgttgcaaaggagattacttgctacaattctggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaatccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcttt 8322  T
Q  811 gaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcat 903  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8321 gaatgcggaagaagtggagcagccgaataatcttatctgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcat 8222  T
Q  904 tcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8221 tcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaaatggttgtaacccctttgttccggggaatggttattgacaccc 8143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 98 - 982
Target Start/End: Original strand, 20303 - 21193
Alignment:
Q  98 atgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattct 197  Q
    ||||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||| | || ||  | | |||| | ||||||| |||||||| ||| || |    
T  20303 atgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggataggtggtgccttgggctaggttcaaggctgagtttt 20402  T
Q  198 tgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtt 297  Q
    |||||||||| || ||  | || |||||||| | ||||||  | |||||  ||||  |||| |||||||  ||||| || || |||||||||||||||||    
T  20403 tgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtt 20502  T
Q  298 cgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcag 397  Q
     ||||| |||  |||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||    
T  20503 tgaggagcttgtgaggttttgtccgtacattaatgctaaggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctaccag 20602  T
Q  398 tacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctc 497  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| || |  | || |||  ||||||| |||||||| |    
T  20603 tatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataggtgtcatatgtttgatgacgccgaaagagataaagctaattactacaaggcgc 20702  T
Q  498 agggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggc 597  Q
    |   ||| | || |||||  || |||||| |||  ||||| || | ||||||  |||||| ||||  |||||||||||| ||||||| | | | |  |||    
T  20703 aacatgataggaaaggaaagggtcatggatttgtgaaaccgtataacaaggataaaggaaggaagaaagaatctggtggaggctctaagtctaataaggc 20802  T
Q  598 ggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcg 697  Q
    |||||||||||||| |  |||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |  |  | |||   | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  20803 ggatgtcaagtgctttgagtgtggcacgttgggtcattttgctaatgagtgcaagaagggcgatagttgctaccagtgtgaaaaagagggtcacaaggct 20902  T
Q  698 gctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaa 797  Q
     | || ||      |||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20903 tccgagtgttcgaatgttgcgaaggagattacttgttacaattgttgtgagaaaggacatatcagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcaggaa 21002  T
Q  798 aggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatac 890  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||     
T  21003 aggtgtttgctttgattgcggaggaagtggagcagccggataatcttatctgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatag 21102  T
Q  891 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||  |||||||| || ||||| || |||||||    
T  21103 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaccgtttgaacat-gttgtaactctgttgttgcgagggatggtcatcgacaccc 21193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 98 - 982
Target Start/End: Original strand, 29879 - 30769
Alignment:
Q  98 atgctagctgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattct 197  Q
    ||||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||| | || ||  | | |||| | ||||||| |||||||| ||| || |    
T  29879 atgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggataggtggtgccttgggctaggttcaaggctgagtttt 29978  T
Q  198 tgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtt 297  Q
    |||||||||| || ||  | || |||||||| | ||||||  | |||||  ||||  |||| |||||||  ||||| || || |||||||||||||||||    
T  29979 tgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtt 30078  T
Q  298 cgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcag 397  Q
     ||||| |||  |||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||    
T  30079 tgaggagcttgtgaggttttgtccgtacattaatgctaaggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctaccag 30178  T
Q  398 tacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctc 497  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| || |  | || |||  ||||||| |||||||| |    
T  30179 tatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataggtgtcatatgtttgatgacgccgaaagagataaagctaattactacaaggcgc 30278  T
Q  498 agggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggc 597  Q
    |   ||| | || |||||  || |||||| |||  ||||| || | ||||||  |||||| ||||  |||||||||||| ||||||| | | | |  |||    
T  30279 aacatgataggaaaggaaagggtcatggatttgtgaaaccgtataacaaggataaaggaaggaagaaagaatctggtggaggctctaagtctaataaggc 30378  T
Q  598 ggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcg 697  Q
    |||||||||||||| |  |||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |  |  | |||   | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  30379 ggatgtcaagtgctttgagtgtggcacgttgggtcattttgctaatgagtgcaagaagggcgatagttgctaccagtgtgaaaaagagggtcacaaggct 30478  T
Q  698 gctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaa 797  Q
     | || ||      |||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30479 tccgagtgttcgaatgttgcgaaggagattacttgttacaattgttgtgagaaaggacatatcagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcaggaa 30578  T
Q  798 aggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatac 890  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||     
T  30579 aggtgtttgctttgattgcggaggaagtggagcagccggataatcttatctgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatag 30678  T
Q  891 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||  |||||||| || ||||| || |||||||    
T  30679 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaccgtttgaacat-gttgtaactctgttgttgcgagggatggtcatcgacaccc 30769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 491; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 285 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 24653 - 23949
Alignment:
Q  285 atgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtc 384  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24653 atgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgcccctacatcaatgcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggcc 24554  T
Q  385 ggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  24553 ggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaggctaagtctaat 24454  T
Q  485 tattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctcta 584  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  24453 tactacaaggctcagggtgaaaagagaggaagaggacatggggctggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggtggctcta 24354  T
Q  585 ggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagt 684  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||     
T  24353 agccaagtttggcggatgtcaagtgctttaagtgtggatctatgggtcactatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagc 24254  T
Q  685 gggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaag 784  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24253 gggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaag 24154  T
Q  785 aaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attg 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  24153 aaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgcagaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattg 24054  T
Q  878 caattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattga 977  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24053 caattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattga 23954  T
Q  978 caccc 982  Q
    |||||    
T  23953 caccc 23949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 424; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 555 - 4
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  555 ggagcacatacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 456  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455 aagcagagcactgatggactaatgccaaaggaaggcttgagttgggaggttatgtggtgacgtgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 356  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  355 cccgtaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 256  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  255 aggttttgtccctacatcaatgttgaggatggtatgatctcgaagtgtttgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctattagtacatgtgtgttc 156  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||    
T  155 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgttgggaaagctaagtctaattactacaacgctcagagtgataggag 56  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaag 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  55 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaag 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 97489 - 96637
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  97489 ggagcccagacttgggtacagagcatggagcggatattccgtgctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagattggcgactcatatgcttgctgagg 97390  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||| || |  || |  ||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  97389 aagctgagcagtggtggactaatgccaaaagaagacttgagtttggtgaagaagttgtgacctggacaaagttcaaagctgaattcttgaggaaatattt 97290  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  97289 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttttgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgaggcgaagtttgaggagctttcg 97190  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  97189 aggttttgtccgtacatcaatgttgaagatgttatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgt--tc 97092  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||   |||||||||    
T  97091 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctggaagagctaagactaattactacaaggctcaaaatgagaagag 96992  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  96991 aggaagaggccatggagttggaaaaccgtacaacaaggacaaaggaaataagagagaagccggtgggggctctaagccgaatttggcggatgtcaagtgc 96892  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcac-aaggcggctgattgcaga 709  Q
    || | |||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||| ||  | ||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||   ||| ||||      
T  96891 tacaagtgtggaactatgggctattatgccaatgattgtaagaaggacattaattgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaaggcttttgaatgcaag 96792  T
Q  710 ggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctt 809  Q
    ||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  96791 ggtgttgcaaatgatgttacttgctacaattgtggagagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaaatgttttctt 96692  T
Q  810 tgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttat 864  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  96691 tgaatacggaggaagtggagcagccggattatcttatccgaggtatgtgttttat 96637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 416 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 1770 - 1197
Alignment:
Q  416 atccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaa 515  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1770 atccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctggaaaagttaactctaattactacaaggctcagggtgataagagaggaa 1671  T
Q  516 gaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctatag 615  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1670 gaggacatggggttggaaaactttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaggccaaatttggcggaagtcaagtgctatag 1571  T
Q  616 gtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgtt 715  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1570 gtgtggaaccttaggtcactatgccaatgattgtaagaatgatgtgaattgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgtt 1471  T
Q  716 gcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatg 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1470 gcaagagagattacttgttacaattgtggagagaaaggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcagcggcaaaggtgtttgctttgaatg 1371  T
Q  816 cggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttt 908  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1370 cggaggagctggagcagctggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcttttgatttcaattattgatactggtgctactcattcttt 1271  T
Q  909 tatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1270 tatctcggttagttgtgttgaacgtttgtttttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 1197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3374 - 3171
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||    
T  3374 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggttagactggcgactcatatgttgactgagg 3275  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3274 aagcagagcattggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 3175  T
Q  211 cccg 214  Q
    ||||    
T  3174 cccg 3171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 873
Target Start/End: Original strand, 8732 - 9574
Alignment:
Q  14 gcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaag 113  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |    
T  8732 gcacagacttggatgcagggtatggagcggattttccgagctatggttacggaagatgaccagaaggtcaggctagcgactcatatgttgactgaggagg 8831  T
Q  114 cagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 213  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8832 cagagcactggtggactagcgccaaaggaagacatgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 8931  T
Q  214 gaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgagg 313  Q
      |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||    
T  8932 tgaagacttgaggaccaataaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctgtctagg 9031  T
Q  314 ttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcagg 413  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  9032 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtggacttaggccggatatctatcaatacatgtgtgttaagg 9131  T
Q  414 agatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagagg 513  Q
    ||||| |||        ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||||| |||   || | || |||    
T  9132 agatctgag--------actttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgttgggaaggttaagtctgattattacaaggcacagaaggataggaaagg 9223  T
Q  514 aagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctat 613  Q
    ||   | |||||  ||||||| || |||| ||||||  | ||||||||| | ||||||||||| ||||||| | | ||||| | |||||||| ||||| |    
T  9224 aaagagtcatgggtttggaaatccgtacaacaaggataagggaaagaagagggaatctggtggaggctctaaggcgagtttagaggatgtcaggtgcttt 9323  T
Q  614 aggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtg 713  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||| |||  ||||||||||  || |||||| || ||||||||||||| ||       
T  9324 aagtttggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaagagtcagaaatgtttcaagtgtggactagcgggtcataaagcggctgattgca-ag--- 9419  T
Q  714 ttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 813  Q
         || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9420 -----agggagatcacttgctacaattgtggggagaaggatcatattagtaccaattgtaccaagccgaagaaggcggcggggaaggtgtttgctttgaa 9514  T
Q  814 tgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac 873  Q
    ||   | |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9515 tgaaaaagaggtggaacagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtac 9574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 182613 - 181976
Alignment:
Q  352 gaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgt 451  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  182613 gaagtgtttgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctattagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgt 182514  T
Q  452 atgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacg 551  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  182513 atgtttgatgatgttgggaaagctaagtctaattactacaacgctcagagtgataggagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacaacaaggaca 182414  T
Q  552 aaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaa 651  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| | || |||| ||| |  | |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||    
T  182413 aaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatttgtcagacgtcaggtgtttcaagtgtggaaatatgggtcattatgccaatgattgtaa 182314  T
Q  652 gaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaag 751  Q
    ||| ||| |   ||||| ||||||||| |||||||||||||| |    ||| ||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  182313 gaaggatatcggttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaaaggttatgaatgcaagggtgttgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaag 182214  T
Q  752 ggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagag 851  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  182213 ggtcagattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgtgaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgag 182114  T
Q  852 gtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggt 944  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  182113 gtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattcgt 182014  T
Q  945 tgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  182013 tgtaactccttttttgcggggaatggttattgacaccc 181976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 531 - 982
Target Start/End: Original strand, 73457 - 73915
Alignment:
Q  531 gaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttggg 630  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| | || |||| ||| |  | |||||||| | ||||    
T  73457 gaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatttgtcagacgtcaggtgtttcaagtgtggaaatatggg 73556  T
Q  631 tcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattact 730  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||| |||||||||||||| |||||||||      ||| || |   |||||||||  |||||||||    
T  73557 tcattatgctaatgattgtaagaaggatatcagttgtcacaagtgtggaaaagcgggtcacaaatgatatgaatgaaagagtgttgcaaaggagattact 73656  T
Q  731 tgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagc 830  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  73657 tgctacaattgcggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgtcgaggaggtggagc 73756  T
Q  831 agccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttg 923  Q
    | ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  73757 aaccggataatcttatatgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttatctcggttagttg 73856  T
Q  924 tgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  73857 tgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctctattgcggggaatggttattgacaccc 73915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 531 - 982
Target Start/End: Original strand, 77838 - 78296
Alignment:
Q  531 gaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttggg 630  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| | || |||| ||| |  | |||||||| | ||||    
T  77838 gaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatttgtcagacgtcaggtgtttcaagtgtggaaatatggg 77937  T
Q  631 tcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattact 730  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||| |||||||||||||| |||||||||      ||| || |   |||||||||  |||||||||    
T  77938 tcattatgctaatgattgtaagaaggatatcagttgtcacaagtgtggaaaagcgggtcacaaatgatatgaatgaaagagtgttgcaaaggagattact 78037  T
Q  731 tgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagc 830  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  78038 tgctacaattgcggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgtcgaggaggtggagc 78137  T
Q  831 agccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttg 923  Q
    | ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  78138 aaccggataatcttatatgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttatctcggttagttg 78237  T
Q  924 tgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  78238 tgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctctattgcggggaatggttattgacaccc 78296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Original strand, 73065 - 73251
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  73065 ggagcacagacttgggtgcagggtatagcgcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagccgagg 73164  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattct 197  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73165 aagcagagcactggtggactaacgccaaaggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattct 73251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Original strand, 77446 - 77632
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  77446 ggagcacagacttgggtgcagggtatagcgcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagccgagg 77545  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattct 197  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77546 aagcagagcactggtggactaacgccaaaggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattct 77632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 321 - 486
Target Start/End: Original strand, 73284 - 73449
Alignment:
Q  321 cctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccg 420  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73284 cctacttcaatgttgaggacgctatgatctcgaagtgtgtgaattttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccg 73383  T
Q  421 agactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaatta 486  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  73384 agactttgatactttggtgcaaaaatgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaatta 73449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 321 - 486
Target Start/End: Original strand, 77665 - 77830
Alignment:
Q  321 cctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccg 420  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77665 cctacttcaatgttgaggacgctatgatctcgaagtgtgtgaattttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccg 77764  T
Q  421 agactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaatta 486  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  77765 agactttgatactttggtgcacaaatgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagctaagtctaatta 77830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 874 - 971
Target Start/End: Original strand, 175723 - 175820
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggt 971  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||    
T  175723 attgcaattattgatactggtgctactcattctttcatctccgttagttgtgttaaacgtttgaatttggttgtgactccgttattgtgaggaatggt 175820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 646
Target Start/End: Original strand, 4711 - 5345
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  4711 ggagcacgaacttgggtgcagggcatggaacagattttctgagctgtggtcacaggagatgaccagaaggtcagactggcgactcaaatgcttgctgagg 4810  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||||||||||| || ||| |||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4811 aagcagagcactagttgactaatgtcaaaggaagg-ttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattctagaggaagtattt 4909  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4910 ccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtctttcgccgagtatgcggcgaagtttgaggaaccttcg 5009  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |    
T  5010 aggttttgcccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttagaccggatatctatcagtacatgtgtgtcc 5109  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| ||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  5110 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctagaagagccaagactagttactacaaggctcagaatgagaagag 5209  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  5210 aggaagaggccatggggttggaaaaccatacaacaaagacaaagggaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaaatttggcggatgtcaaatgc 5309  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgat 646  Q
    |  | ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5310 ttcaagtgtggatctatgggtcattatgctaatgat 5345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 730 - 982
Target Start/End: Original strand, 5363 - 5622
Alignment:
Q  730 ttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggag 829  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5363 ttgtcacaagtgcggagagaaaggtcaaattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaagtgtttgctttgaatgcggaggaggcggag 5462  T
Q  830 cagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagtt 922  Q
    || ||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5463 caaccggataatcttattcgtggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatcttggttagtt 5562  T
Q  923 gtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
     |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5563 atgttgagcgtttgaaattggttataactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 5622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 971
Target Start/End: Original strand, 25197 - 26008
Alignment:
Q  168 tgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggat 267  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||| || ||  | || || ||||| | ||||||  | |||||  ||||  |||| |||||||     
T  25197 tgacttgggctaagttcaaagctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttaaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggag 25296  T
Q  268 catgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagttt 367  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| | |||||||    
T  25297 catgttcgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttccgaggttttgtccgtacatcaatgctgaggatgcgatggtttccaagtgcgcgaagttt 25396  T
Q  368 gagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctg 467  Q
    || |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25397 gaaagtgggattaggccggatgtctatcagtatatgtgtgttcaagagattcaagattttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgttg 25496  T
Q  468 ggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgaga 567  Q
    |||  | |||| ||||||| |||||||| ||   |||||||| |||||  |||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||    
T  25497 ggaaggttaaggctaattactacaaggcgcaacatgagaagaaaggaaagggccatggagtttggaaaccgtacaacaaggacaaagggaagaagagaga 25596  T
Q  568 atctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgt 667  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | | ||||    
T  25597 agctggttggggctctaagccgagtttagcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgccaatgattgtaagaatgacattagttgt 25696  T
Q  668 cccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtacca 767  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  25697 cacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctactgattgcaagggtgttgcaagggatgttacttgttacaattgtggagagaaaggtcatattagtacta 25796  T
Q  768 agtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaa 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25797 agtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaaagcagaagaagtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaa 25896  T
Q  868 tagtac-------attgcaattattgatactggtgctactca-ttcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgtt 959  Q
    ||||||       |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  25897 tagtactcatttgattgcaattattgatattagtgctactcattttttttatctcggttagttgcgttgagcgtttgaaattgattgtaactccgttgtt 25996  T
Q  960 gcggggaatggt 971  Q
    ||| || |||||    
T  25997 gcgtgggatggt 26008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 427
Target Start/End: Original strand, 7776 - 8192
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7776 ggagcacagacttgggtgtaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcaaactagcgactcatatgctagctgagg 7875  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7876 aagcatagcactagtggaccaatgccaaaggcaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctatgttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 7975  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  7976 cccggaagacttgagggccaagaaggagatgaagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgtggcgaagttcgaggaacttttg 8075  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8076 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgcgcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 8175  T
Q  411 aggagatccgagacttt 427  Q
    ||||||||| |||||||    
T  8176 aggagatcccagacttt 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 608
Target Start/End: Original strand, 3266 - 3863
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||    
T  3266 ggagcacagacttgggtgcagggcatggagcggatattccatgctatggtgacgggagatgaccagaaggttagattggcgactcatatgcttactgagg 3365  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3366 aagcggagcactggtggactaatgccaagggaagacttgatatgggaggtgaagttgtgacctgggaaaagttcaaagctgaattcttgaggaagtattt 3465  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3466 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttttgaatctgaaacaaggaagcatgtctatagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 3565  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |    
T  3566 aggttttgtccctacatcaatgctgaagatgttatggtttcgaagtgtgtgaagtttgatagtgggcttaggccagatatctatcagtacatgtgtgtcc 3665  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||     
T  3666 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgctggaagagctaagactaattactacaaggttcagaatgagaagaa 3765  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagt 608  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  3766 aggaaaaggccatggagatggaaaatcgtacaacaaggacaaaggaaagaagagagaagttggtgggggctctaagccgagtttagcggatgtcaagt 3863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 630 - 982
Target Start/End: Original strand, 3862 - 4220
Alignment:
Q  630 gtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattac 729  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||  | | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||   || |||| || ||  ||||    
T  3862 gtcattatgccaatgattgtaagaatgacattagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgctgagtgcaagagtattgcgagggatgttac 3961  T
Q  730 ttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggag 829  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  3962 ttgttacaattgtggtgagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaagtgtcttctttgaacgcggaggaggtggag 4061  T
Q  830 cagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagtt 922  Q
     |||  |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4062 tagctagataatcttatctgagctatgtg-tttatcaatagtactccgttgattgcaattatcgatactggtgctactcattcttttatctcgattaatt 4160  T
Q  923 gtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4161 gtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgataccc 4220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 240 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 16636 - 15896
Alignment:
Q  240 ttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgagga 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  16636 ttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttcaggagctgtctaggttttgtccctacatcaatcttgagga 16537  T
Q  340 tgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtg 439  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16536 tgctatggtttcgaagcgtgtgaagtttgagagtggacttgggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaagagatccgagactttgatactttggtg 16437  T
Q  440 cataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaacctt 539  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||    || ||||||||||   | |||||| ||||||| || |    
T  16436 cataagtgtcgtatgtttgatgatgctgggaaagttaagtctgattattataaggcacataaggataagagaggaaagagtcatggatttggaaagccgt 16337  T
Q  540 acagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgc 639  Q
    | | ||||||  | ||||||||| ||||||||||||| | ||||| | | ||||||| ||||||||  | ||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  16336 ataacaaggataagggaaagaagagagaatctggtggagactctaaggcgagtttggaggatgtcagattcttcaagtgtgggactttgggtcattatgc 16237  T
Q  640 taatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaat 739  Q
    ||||||||||||||| | ||  || |||  || ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||       ||| ||||| |||||||| |||    
T  16236 taatgattgcaagaagggtgataaatgtttcaggtgtggacaagcaggtcacaagtcggctgattgca-ag-------aag-gagatcacttgttataat 16146  T
Q  740 tgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggata 839  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||    
T  16145 tgtggagagaagggccatattagtaccaagtgtaccaagccgaataaggtaacgggaaaagtgtttgctttgaattcagaggaggtggagcaaccgcata 16046  T
Q  840 attttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacg 932  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16045 atcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgttacttattcttttatctcggttagttgtgttgaacg 15946  T
Q  933 tttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15945 tttgtatttggttgtaactcctttgttgtttggaatggttattgacaccc 15896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16753 - 16637
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  16753 ggagcacagacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccataaggtcagactagcaactcatatgctaggtgaga 16654  T
Q  111 aagcagagcactggtgg 127  Q
    | || ||||||||||||    
T  16653 aggcggagcactggtgg 16637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 360 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 35691 - 35071
Alignment:
Q  360 tgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcga 459  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  35691 tgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttga 35592  T
Q  460 tgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaag 559  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||   || | || |||||   | |||||  ||||||| || |||| ||||||  | | ||||    
T  35591 tgatgctgggaaggttaagtctgattattacaaggcacagaaggataggaaaggaaagagtcatgggtttggaaagccgtacaacaaggataaggtaaag 35492  T
Q  560 aagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatg 659  Q
    ||| | | ||||||||| |||||||   | ||||| | |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  35491 aagagggtatctggtggaggctctaaagcgagtttagaggatgtcaggtgcttcaagtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaagagtg 35392  T
Q  660 tgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatat 759  Q
     ||| |||  ||||||||||  || |||||| || ||||||||||||| ||        || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35391 agaaatgtttcaagtgtggactagcgggtcataaagcggctgattgca-ag--------agggagatcacttgctataattgtggagagaagggtcatat 35301  T
Q  760 tagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggtatgtgt 859  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35300 tagtaccaattgtaccaagccaaagaaggcggtggggaaagtgtttgctttgaatgcagaagaggtggaacagccggataatcttatccgaggtatgtgt 35201  T
Q  860 tttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactc 952  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35200 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgtatttggttgtaactc 35101  T
Q  953 ctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35100 ctttgttgcgtggaatggttattgacaccc 35071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 255 - 982
Target Start/End: Original strand, 5597 - 6322
Alignment:
Q  255 tgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaa 354  Q
    |||| ||||||| |||||| || || ||||||||| | ||||| || || |||||| |||||||| | || || |||| ||| ||||| ||| ||| |||    
T  5597 tgaagcaagggagcatgtcagtggctgagtatgcgccaaagtttgaagagctttcgtggttttgtccgtatattaatgttgaagatgcaatggtttcgaa 5696  T
Q  355 gtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatg 454  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||  || ||||||||| ||||||||    
T  5697 gtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagatttgagattttgatatcttggtgcataagcgtcgtatg 5796  T
Q  455 ttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaag 554  Q
    || || |||||||| |  | ||  | |||||| | |||||| ||   ||| |||| ||||| ||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  5797 tttgaagatgctggaagggttagatataattactgcaaggcacaaaatgataagaaaggaaaaggtcatggatttgggaaaccgtacaacaaggacaaag 5896  T
Q  555 gaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaa 654  Q
    | |||||| ||||| ||||||| ||||||| | | ||||| || |||||||  |||| || |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  5897 ggaagaagagagaagctggtggaggctctaaggcgagtttagctgatgtcagatgctttaagtgtggaactttgggtcattactctagtaattgcaagaa 5996  T
Q  655 tgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggt 754  Q
      |||  | |||   |||||||||| ||| ||||||||||  |  ||| |||| ||       ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  5997 gaatgatagttgcttcaagtgtggacaagagggtcacaagtagtttgagtgca-ag-------aag-gagatcacttgttacaattgtggtaagaagggt 6087  T
Q  755 catattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagaggta 854  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6088 catatcagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcattgaatgcggaggaagtggagcagccggataatcttatctgaggta 6187  T
Q  855 tgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgt 947  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6188 tgtgttttatcaatagtactactttgattgcaataattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaatttggttgt 6287  T
Q  948 aactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
     ||||| || ||||| |||||||| || |||||||    
T  6288 gactccgttattgcgaggaatggtcatcgacaccc 6322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 127; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 726 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 2820 - 2559
Alignment:
Q  726 ttacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggt 825  Q
    ||||||||||||||||||| ||    ||||||   ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  2820 ttacttgttacaattgtggtgaagcaggtcattacagtaataagtgtaccaagctgaagaaggcggcgggaaaagtgtttgcattgaatgcagaggaagt 2721  T
Q  826 ggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggtt 918  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2720 ggagcagtcggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaataatactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggtt 2621  T
Q  919 agttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||    
T  2620 agttgtgttg--cgtttgaatttggttgtaactccgtttttgcgagggatggtcatcgacaccc 2559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 696
Target Start/End: Original strand, 35513 - 36197
Alignment:
Q  11 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccaaaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 110  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||| ||  | ||||| || ||||||||  | || || || ||||| |||||||    
T  35513 ggagctcagacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgagg 35612  T
Q  111 aagcagagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 210  Q
    |||| |||   |||||||| ||||| ||||| || |||||| | || || || |  ||||| ||||||| |||||||   || || |||| ||| || ||    
T  35613 aagctgagttttggtggactaatgctaaggggagacttgaggtcggtggagaggttgtgacttgggctaggttcaagaccgagtttttgacgaaatactt 35712  T
Q  211 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 310  Q
     ||  | || ||||| || |  |||||  | |||||  ||||| |||| |||||||  ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  35713 tcctgaggatttgagtactagaaaggaagtggagttcttgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggctgagtatgcagcaaagtttgaggagctttcg 35812  T
Q  311 aggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttc 410  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35813 aggttttgtccatacattaatgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttagcccggatatctatcagtatatgtgtgttc 35912  T
Q  411 aggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagag 510  Q
    |||||||  |||| ||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||   ||  ||||  || |   |  |||||||||    
T  35913 aggagattagagatttcgat-ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgacgccgggaaggccaaggtgaaccattaatagtcggtgaatgagaagag 36011  T
Q  511 aggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaaggacgaaggaaagaagtgagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgc 610  Q
    |||||| ||  ||||| |||| ||||| || | ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| | | ||||| || |||||||  | |    
T  36012 aggaaggggttatggatttgggaaaccgtataacaaggacaaagggaagaagagagacgctggtggaggctctaaggcgagtttagctgatgtcagatcc 36111  T
Q  611 tataggtgtggaactttgggtcattatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcccaagtgtggaaaagtgggtcacaaggc 696  Q
    | || |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || || | || ||||  ||||||||| || | ||||||||||||    
T  36112 tttaagtgtggaactttgggtcattactctagtgattgcaaaaaggacgagagttgtttcaagtgtgggaaggcgggtcacaaggc 36197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 255 - 549
Target Start/End: Original strand, 32459 - 32752
Alignment:
Q  255 tgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaa 354  Q
    |||| ||||||| |||||  || || ||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||| | |  ||    
T  32459 tgaagcaagggagcatgttcgtggctgagtatgcggcaaaatttgaggagcttgcgaggttttgttcgtacattaatgttgaggatgtgatg-tgtccaa 32557  T
Q  355 gtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatg 454  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32558 gtgtgtgaattttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgtttaggagatccaagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatg 32657  T
Q  455 ttcgatgatgctgggatagctaagtctaattattacaaggctcagggtgagaagagaggaagaggccatggagttggaaaaccttacagcaagga 549  Q
    || ||||| || || | || |||  ||||||| |||||||| ||   ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  32658 tttgatgacgccggaaaagttaaagctaattactacaaggcacacaatgaaaagagaggaagaagtcatggagttgggaaaccgtacaacaagga 32752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 98; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 726 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 3748 - 3485
Alignment:
Q  726 ttacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggt 825  Q
    ||||||||||||||| |||  |   ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||   ||||||||| || ||    
T  3748 ttacttgttacaattatggtcaagcgggtcatttcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggaggaaaaagtgtttgcaccgaatgcggatgaagt 3649  T
Q  826 ggagcagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggtt 918  Q
    |||||| || |||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3648 ggagcaaccagataatcttatctgaggaacatgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattctttcatctcggtt 3549  T
Q  919 agttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccc 982  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||||    
T  3548 agttgtgttcaacgtttgaatttgtttggaactctgttgttgcgagggatggtcatcgacaccc 3485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 4160 - 3987
Alignment:
Q  305 ctttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatctatcagtacatgt 404  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| || |||||||| || |    
T  4160 ctttccaggttttgcccgtacatcaatgcggaggatgttatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtaggcttaggctggatatgtatcagtatattt 4061  T
Q  405 gtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggatagctaag 478  Q
    |||| |||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||    
T  4060 gtgtccaggagatcgaagattttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgtcgggagagctaag 3987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 730 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 77675 - 77446
Alignment:
Q  730 ttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggag 829  Q
    ||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |  || ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  77675 ttgttacaattgtggggaagcaggtcatatcagtaccaagtgtaccaagctgaagaaagcggcgtggagagtttttgcattgaacgctgaggaggtggag 77576  T
Q  830 cagccggataattttatcagaggtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagtt 922  Q
    || || |||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||        ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  77575 caaccagataatctaatccgagatatgtattttatcaatagtactcctttgtttggaattgttgatactggtgctacgcattctttcatctcgcttagtt 77476  T
Q  923 gtgttgaacgtttgaatttggttgtaactc 952  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  77475 atgttgaacgtttgaatttggttttaactc 77446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 78103 - 77926
Alignment:
Q  293 aagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatct 392  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||  | ||| | || || |    
T  78103 aagtttgaggagctatcaaggttttgtcgctacattaatgttgaggatgctatggtgtcgaaatgtgtgaagtttgagagtggattgaggcccgagattt 78004  T
Q  393 atcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctggga 470  Q
    ||||||| || ||  |||| |||||  | |||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  78003 atcagtatatctgctttcatgagatttgtgactttgatactttggtgcacaagtgtcgcctgtttgatgacgctggga 77926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 63; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 953
Target Start/End: Original strand, 20807 - 21015
Alignment:
Q  752 ggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataattttatcagag 851  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |  || || || ||||| || ||||| ||||||  || ||||||| ||||| |||    
T  20807 ggtcatatcagtaccaagtgaaccaagccgaaaaaggcggcgtggagagttttcgcattgaacgcagaggaagtggagttgctggataatcttatccgag 20906  T
Q  852 gtatgtgttttatcaatagtac-------attgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggt 944  Q
    |||||||||| ||||||||| |       |||| |||| |||||||| || |||||||||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20907 gtatgtgtttcatcaatagtgctcctttgattgtaattgttgatactagttctactcattctttcttctcgactagttgtgttgatcgtttgaatttggt 21006  T
Q  945 tgtaactcc 953  Q
     ||||||||    
T  21007 agtaactcc 21015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2296 - 2182
Alignment:
Q  255 tgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaa 354  Q
    |||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||| ||| ||||| ||| ||| |||    
T  2296 tgaagcaagggagcatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggatttgtccgtacattaatgttgaagatgcgatggtttcgaa 2197  T
Q  355 gtgtgtgaagtttga 369  Q
    |||||||||||||||    
T  2196 gtgtgtgaagtttga 2182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 49341 - 49163
Alignment:
Q  293 aagttcgaggaactttcgaggttttgttcctacatcaatgctgaggatgctatgatttagaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggtcggacatct 392  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  | ||| | || || |    
T  49341 aagttcgaggagttgtcgatgttttgcccgtacattaatgttgaggatgctatgatatctaaatgtgtgaagtttgagagtggtttgaggcctgagattt 49242  T
Q  393 atcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttagtgcataagtgtcgtatgttcgatgatgctgggat 471  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||||| |||||    
T  49241 atcaatacatctgttttcatgagatcagagattttgatactttggtgcacaagtgtcacatgtttaatgatgccgggat 49163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29991
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30028 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 29991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 67318 - 67355
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  67318 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 67355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 41829 - 41792
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41829 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 41792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 39543 - 39580
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39543 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 39580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 874 - 911
Target Start/End: Original strand, 514563 - 514600
Alignment:
Q  874 attgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 911  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  514563 attgctattattgatactggtgctactcattgttttat 514600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University