View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18315_low_6 (Length: 687)

Name: NF18315_low_6
Description: NF18315
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18315_low_6
NF18315_low_6
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (14-669)||(21332091-21332746)
chr4 (14-347)||(10985583-10985915)
chr4 (14-340)||(12885277-12885603)
chr4 (14-350)||(3268331-3268668)
chr4 (17-347)||(25239695-25240025)
chr4 (17-349)||(12217561-12217887)
chr4 (93-350)||(16396132-16396389)
chr4 (17-347)||(13861314-13861644)
chr4 (14-244)||(3270543-3270774)
chr4 (17-301)||(17282405-17282689)
chr4 (17-350)||(45313147-45313479)
chr4 (17-333)||(9901585-9901901)
chr4 (19-350)||(8082047-8082378)
chr4 (36-347)||(26780684-26780995)
chr4 (17-348)||(28891910-28892244)
chr4 (32-236)||(49402708-49402914)
chr4 (166-350)||(18284481-18284665)
chr4 (42-209)||(15455466-15455633)
chr4 (186-324)||(26778756-26778894)
chr4 (268-333)||(8168007-8168072)
chr4 (17-81)||(18284661-18284724)
chr4 (38-159)||(34845514-34845635)
chr4 (126-333)||(15427790-15427994)
chr4 (126-333)||(15434408-15434612)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (14-345)||(19441982-19442313)
chr1 (14-347)||(19967288-19967621)
chr1 (17-349)||(24973754-24974085)
chr1 (17-347)||(9858967-9859302)
chr1 (24-350)||(8995305-8995630)
chr1 (17-350)||(21817598-21817937)
chr1 (17-311)||(8990666-8990961)
chr1 (32-333)||(38621819-38622120)
chr1 (163-349)||(21815423-21815609)
chr1 (17-157)||(22186045-22186185)
chr1 (122-333)||(49472311-49472519)
chr1 (43-120)||(21815619-21815696)
chr1 (149-347)||(33028926-33029124)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (17-340)||(18573893-18574220)
chr8 (17-346)||(32008884-32009213)
chr8 (14-347)||(18040357-18040683)
chr8 (17-347)||(7999650-7999979)
chr8 (14-316)||(2085642-2085945)
chr8 (17-347)||(41280677-41281008)
chr8 (17-347)||(7454521-7454866)
chr8 (17-302)||(24033762-24034051)
chr8 (17-350)||(25820717-25821050)
chr8 (21-346)||(24060562-24060888)
chr8 (19-350)||(33273388-33273704)
chr8 (14-204)||(10532801-10532992)
chr8 (17-348)||(22609362-22609692)
chr8 (32-210)||(11709384-11709562)
chr8 (179-323)||(17775783-17775926)
chr8 (245-350)||(11709609-11709714)
chr8 (156-323)||(10532633-10532800)
chr8 (17-98)||(1788651-1788732)
chr8 (14-63)||(17775705-17775755)
chr8 (95-159)||(22282161-22282225)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (17-347)||(391459-391791)
scaffold0002 (18-350)||(380763-381095)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (14-349)||(3770257-3770593)
chr2 (14-347)||(23755687-23756021)
chr2 (14-347)||(25133793-25134136)
chr2 (14-347)||(41266065-41266399)
chr2 (17-302)||(42534036-42534322)
chr2 (17-347)||(3105204-3105535)
chr2 (50-333)||(26154865-26155148)
chr2 (17-347)||(27347171-27347499)
chr2 (19-317)||(19092723-19093021)
chr2 (17-233)||(23929797-23930014)
chr2 (17-209)||(29568315-29568507)
chr2 (14-95)||(26159154-26159236)
chr2 (245-347)||(23932908-23933010)
chr2 (287-350)||(26159093-26159156)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (17-323)||(29164849-29165155)
chr7 (19-347)||(30770057-30770384)
chr7 (14-334)||(20093533-20093853)
chr7 (14-350)||(9548825-9549171)
chr7 (14-323)||(21802447-21802757)
chr7 (17-336)||(47295562-47295880)
chr7 (19-347)||(18153131-18153459)
chr7 (14-347)||(22705602-22705929)
chr7 (33-333)||(7595367-7595670)
chr7 (17-350)||(2249857-2250192)
chr7 (17-347)||(21592744-21593076)
chr7 (79-333)||(38612620-38612874)
chr7 (17-221)||(18185625-18185829)
chr7 (82-317)||(30764879-30765114)
chr7 (150-350)||(21801711-21801911)
chr7 (15-121)||(22703894-22704001)
chr7 (17-165)||(28794078-28794226)
chr7 (253-333)||(40635520-40635598)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (17-347)||(23574394-23574724)
chr6 (19-347)||(29094885-29095214)
chr6 (14-347)||(4409193-4409528)
chr6 (14-347)||(15119590-15119921)
chr6 (24-350)||(18736007-18736334)
chr6 (14-347)||(8306061-8306390)
chr6 (17-334)||(29482591-29482909)
chr6 (17-349)||(14910605-14910938)
chr6 (19-334)||(18728923-18729239)
chr6 (17-281)||(12738495-12738760)
chr6 (17-302)||(24438474-24438760)
chr6 (16-231)||(7968479-7968695)
chr6 (44-349)||(15349494-15349800)
chr6 (18-340)||(18014333-18014656)
chr6 (17-318)||(18258492-18258794)
chr6 (93-349)||(17756884-17757140)
chr6 (17-215)||(19860052-19860251)
chr6 (138-347)||(21508507-21508716)
chr6 (45-347)||(15369492-15369795)
chr6 (19-205)||(15318989-15319175)
chr6 (14-148)||(18043337-18043472)
chr6 (72-349)||(3876374-3876651)
chr6 (253-345)||(19857705-19857797)
chr6 (244-350)||(23524248-23524354)
chr6 (243-345)||(18043505-18043607)
chr6 (80-190)||(23524128-23524238)
chr6 (254-334)||(27964962-27965042)
chr6 (250-349)||(15318845-15318943)
chr6 (39-157)||(14480017-14480135)
chr6 (174-235)||(14467175-14467236)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (17-350)||(16182-16516)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (17-347)||(28067893-28068223)
chr5 (17-333)||(23495349-23495664)
chr5 (14-334)||(5931187-5931508)
chr5 (14-347)||(8244508-8244846)
chr5 (17-332)||(36712534-36712848)
chr5 (17-350)||(20899462-20899795)
chr5 (17-301)||(5590612-5590896)
chr5 (33-333)||(15620075-15620374)
chr5 (17-334)||(41037527-41037854)
chr5 (45-340)||(33622367-33622664)
chr5 (38-235)||(42792503-42792700)
chr5 (17-207)||(22922050-22922241)
chr5 (17-209)||(22922645-22922838)
chr5 (17-347)||(38608267-38608608)
chr5 (132-347)||(22510097-22510312)
chr5 (147-347)||(13537860-13538060)
chr5 (88-324)||(19329816-19330052)
chr5 (167-350)||(24095343-24095526)
chr5 (17-58)||(19330050-19330092)
chr5 (128-157)||(31393167-31393196)
chr5 (305-333)||(5589324-5589352)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (18-350)||(29923-30256)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (14-235)||(47396-47618)
scaffold0034 (245-350)||(56224-56329)
[»] scaffold0989 (1 HSPs)
scaffold0989 (14-295)||(1444-1724)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (20-348)||(908-1237)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (17-347)||(4065-4396)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (17-350)||(151157-151490)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (87-334)||(19790346-19790593)
chr3 (17-333)||(22915052-22915367)
chr3 (43-347)||(16852878-16853181)
chr3 (17-318)||(16914706-16915008)
chr3 (92-349)||(44635823-44636081)
chr3 (14-97)||(1998003-1998087)
chr3 (17-331)||(3559006-3559317)
chr3 (17-91)||(19773386-19773462)
chr3 (43-107)||(22006519-22006583)
chr3 (43-107)||(22014036-22014100)
chr3 (143-319)||(13016461-13016636)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (18-269)||(1609-1861)
scaffold0058 (17-168)||(15365-15517)
scaffold0058 (236-320)||(15520-15603)
scaffold0058 (291-340)||(15692-15741)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (32-350)||(68689-69007)
scaffold0042 (32-216)||(74861-75045)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (17-332)||(7233-7548)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (17-339)||(242673-242996)
scaffold0008 (17-334)||(253313-253631)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (43-347)||(10741-11045)
[»] scaffold0265 (3 HSPs)
scaffold0265 (17-350)||(14872-15211)
scaffold0265 (163-349)||(17200-17386)
scaffold0265 (43-120)||(17113-17190)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (17-347)||(12323-12651)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (49-349)||(54471-54770)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (17-347)||(37095-37425)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (17-350)||(2694-3029)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (125-323)||(9243-9437)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (14-103)||(19147-19237)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (241-347)||(1968-2074)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (45-347)||(20154-20455)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (17-332)||(36664-36978)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (17-154)||(86424-86562)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (267-349)||(18227-18309)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (127-209)||(15998-16082)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 568; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 21332746 - 21332091
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtgg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21332746 cagagagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttggaaactgctttgagtcccctatttacagaggtggagggctgcagagccgttgtagtgg 21332647  T
Q  114 cacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagt 213  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21332646 cacacctggctctggcgcttacgaaatcatgggaagtataaccgccagaaagtttattgtgggaacgtgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagt 21332547  T
Q  214 ctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21332546 ctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtagtgtttggactttgaattgtattggacctaagtaa 21332447  T
Q  314 atgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagtacccatcaatatcaaactatcaaattgacatcaaatcaaattgttaagacatctaaatatgtac 413  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332446 atgggccaaagatcattttggccgatctagaacagtacccatcaatatcaaactatcaaattgacatcaaatcaaattgttaagacatctaaatatgtac 21332347  T
Q  414 ccctacttccacgccatatttggtagctcaaaataagatactccatgaacttgtgatttgcacgcatgtattggggaaaaaagaggaaaatctaacaata 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21332346 ccctacttccacgccatatttggtagctcaaaataagatactccatgaacttgtgatttgcacgcatgtattgggaaaaaaagaggaaaatctaacaata 21332247  T
Q  514 gtcatagagcaaaagtcaacaaatatttgatctccctaagtaattgacgtgcatctcgtgagtaaagtaaattttcacggtgtcttctgatccttggccg 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332246 gtcatagagcaaaagtcaacaaatatttgatctccctaagtaattgacgtgcatctcgtgagtaaagtaaattttcacggtgtcttctgatccttggccg 21332147  T
Q  614 gtaatttcttattcacaatcaatactaacaccagactcattactttatagcagaag 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332146 gtaatttcttattcacaatcaatactaacaccagactcattactttatagcagaag 21332091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10985915 - 10985583
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggtttg-aggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  10985915 cagagagagtgagggtttggaggaagaggtagattctaccttggga-ctgccgtgagtcccctatttatagaggtggatggctgcagagccgttgtaatg 10985817  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10985816 gcacacctggctctcgcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccag 10985717  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagta 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  10985716 tctcgttcgctctgtgcacccccttgtggggaaagg-gtgtgtcacaagtaactttgccaaacgtggtgtttgacctttggattgtattgggcctaagta 10985618  T
Q  313 aatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  10985617 aatgggccaaaggtccttttgcccggtccagaaca 10985583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 12885277 - 12885603
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   ||    
T  12885277 cagagagggtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgttgtgagtcccctatttataaaggtggagggctgcagagccattgtaatg 12885376  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12885377 gcacacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaaccag 12885476  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagta 312  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  12885477 tctctttcgctccatgcacccccttgcg-gggaaggggtatgttgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggttttggattgtattgggcctaagta 12885575  T
Q  313 aatgggccaaagatccttttggtcggtc 340  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  12885576 aatgggtcaaaagtccttttggccggtc 12885603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Original strand, 3268331 - 3268668
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  3268331 cagagagagtgagggtttagagggagagatagattctaccttggagacttccgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccattgtaatg 3268430  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3268431 acacacctggctctggcggttacgtaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccag 3268530  T
Q  213 tctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||   |||||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  3268531 tctctgtcgctccgtgcaccccccttgtgtgg-aaggggtgtgtcacaagtaattttgccaaaatcggtgtttgggctgtggattgttttgagcctaagt 3268629  T
Q  312 aaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  3268630 aaatgggccaaaggtccttttggccggtcccgaacagta 3268668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Original strand, 25239695 - 25240025
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  25239695 agagagtgagggtttgagagaaagaaagattctaccttggggactgcatttagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcac 25239794  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  25239795 accttactctgacggttacgaaattgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagactttggggttcgtttgaaccagtctc 25239894  T
Q  217 tttcgctctgtgcaccccctt-gtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    ||||| || |||||||||| | | ||| ||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  25239895 tttcgttccgtgcacccccctcgcgtg-aaagaggtgtgtcgcgagtaattttgtcaaacgtggtgtttaggctttggagtgtattgggcctaagtaaat 25239993  T
Q  316 gggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25239994 gggccaaagatccttttggccggtccagaaca 25240025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 12217561 - 12217887
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  12217561 agagagtgcgggtttagagggagagatagattctaccttggggactgtcgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgt------a 12217654  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12217655 aacctggctctggcggttacgaaatcgtaggaagtgtaaccgccagagagtttattgcaggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 12217754  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||    ||||||||||    
T  12217755 ctgtcgctccgtgcacccccatgtgtgg-aaggggtgtgttgcaagtaattttgctaaacgcggtgtttgggctgtggattgtattaggactaagtaaat 12217853  T
Q  316 gggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagt 349  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||    
T  12217854 gggccaaaggtccttttggccagtccagaacagt 12217887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 93 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16396389 - 16396132
Alignment:
Q  93 gctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacg 192  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  16396389 gctgcagagccgttgtagtggcacacctgactctggcgattaggaaatcatgggaagtgtaaccgccagagtgtttattgcgggaacgtgtagagagacg 16396290  T
Q  193 ttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagcttt 291  Q
    || ||||||| |||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16396289 ttgtggttcgcttgaaccagtctcgcttgctccgtgcaccccccttgtg-ggaaaggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgttttggcttt 16396191  T
Q  292 ggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16396190 ggattgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccagaacagta 16396132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Original strand, 13861314 - 13861644
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  13861314 agagagtgagggtttgagaagaagaaagattctaccttggggactgcattgagttccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatggcac 13861413  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    |||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||    
T  13861414 accttactctaacagttacgaaatcgtgggaagtgtaactgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccggtatc 13861513  T
Q  217 tttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    ||||| || ||||| |||||| | |||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  13861514 tttcgttccgtgcacccccctcgcgtgg-aaggggtgtgtcgcgagtaattttaccagacgtggtgtttgggctttggatggtattgggcctaagtaaat 13861612  T
Q  316 gggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    | | ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13861613 gagtcaaagatccttttggccggtccagaaca 13861644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Original strand, 3270543 - 3270774
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  3270543 cagagagagtgagggtttagagggagagatagatcctaccttggggactgccgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatg 3270642  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  3270643 gcacacctggctctggtggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgctagagagtttattgcgggaacgtgtagtgagacgttgtggttcgtttgaaccag 3270742  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcacccccttgtgtgga 244  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  3270743 tctctgttgctccgtgcacccccttgtgtgga 3270774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17282689 - 17282405
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagag-atagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  17282689 agagagtgagggtttgag-aggaggaaaggttctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 17282591  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17282590 caccttactctgacggttacgaattcgtgggaagtgtaaccgcttgtgggtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgttagaaccagtct 17282491  T
Q  216 ctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtatt 301  Q
    |||||| || ||||| |||||| | |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  17282490 ctttcgttccgtgcacccccctcgcgtgg-aaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtctgggctttggagtgtatt 17282405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Original strand, 45313147 - 45313479
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||| |||| | ||||||||| ||||| |||| | ||||||   |||||    
T  45313147 agagagtgagggtttagtgaaagagttagattctaccttggggactgttatgagttccct-tatatagaggtagagggttgcaaatccgttgtaatggca 45313245  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45313246 caccaggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagattattg-gggaacgtgcagagagacgttgtagttcgtttgaaccagtct 45313344  T
Q  216 ct-ttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaa 314  Q
     |  |||||| |||||||| || | | |  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||||    
T  45313345 ttgctcgctccgtgcaccctctcgcg-gagaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacatggtgcttgggctttgaattgtattgggcctaagtaaa 45313443  T
Q  315 tgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  45313444 tgggtcaaagttccttttggccggtccagaacagta 45313479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9901901 - 9901585
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| || | |||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  9901901 agagagtgagggttaagagggagatatcggttctaccttgaggactgctaagagtcccctatatatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggca 9901802  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| || || ||||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  9901801 cacctggctctgacggttacgaaatcgtgggacgtgtaaccgctagagagattattgcgggaatgtccagagagacgttgtggttcatttgaaccgatct 9901702  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
       |||||| |||||||||||||   || |||  |||||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9901701 agctcgctccgtgcacccccttg-cagggaagaggtgtgtcgcaagtaatattgccaaacgtgatatttgcgcttttgattgtattgagcctaagtaaat 9901603  T
Q  316 gggccaaagatccttttg 333  Q
    ||||  ||| ||||||||    
T  9901602 gggcataagctccttttg 9901585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 350
Target Start/End: Original strand, 8082047 - 8082378
Alignment:
Q  19 agagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcaca 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||    
T  8082047 agagtgagggtttagagaaagag-tagattctacattggggactgctaagagtcccctatatatagaggtggaggactgcagagccattgtaatggcaca 8082145  T
Q  118 cctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctct 217  Q
    ||||  ||   | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||       
T  8082146 cctgggtccaacagttacgaaatcgtggaaagtgtaaccgccagagaaataattgcgggaacgtgcaaatagatgttatggctcgtttgaaccggtcctg 8082245  T
Q  218 ttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgg 317  Q
     | |||| ||||||||||||    | ||||| ||  |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8082246 cttgctccgtgcacccccttcgcggaaaaggggtaagtcgcaagtaatgttgcaaaacgtggtgtttgggctttggattgtattgggcctaagtgaatgg 8082345  T
Q  318 gccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8082346 gcctaagatccttttggacggtccagaacagta 8082378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26780995 - 26780684
Alignment:
Q  36 aagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttac 135  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||| ||||||    
T  26780995 aagagttagattctaccttggggactgttatgactcccctatacagagaggtggagggctgcagagccgttgtaatgacacaccagactctggtggttac 26780896  T
Q  136 gaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccc 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| || | ||  ||| |||  | |||||||    
T  26780895 gaaaacgtgggaagtgtaaccgccagagagattattgcgggaacgtgcagagaaacgttgtggttcgtttgagccggccttgttctctccctacaccccc 26780796  T
Q  236 ttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggt 335  Q
     |    |  |||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||     
T  26780795 ctcacagagaaggggtgtgtagcaagtaatgttgccaaacgtggtgtttgggctttgaatagtattgggcctatgtaaatgggccaaaactccttttggc 26780696  T
Q  336 cggtcgagaaca 347  Q
    ||||| ||||||    
T  26780695 cggtccagaaca 26780684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 28891910 - 28892244
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||  |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||    
T  28891910 agagagtgaggtttagaggaaga-atagattctaccttggggactcttaagagtcccctatatatagaggtggagagctgcatagccgttgtaatggcac 28892008  T
Q  117 acctgactc----tggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    | |||  ||    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  28892009 atctgggtccggttggcagttgcgaaatcgtgggaagtgtaaccaccagagaaataattgtggaaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaacagg 28892108  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcacccccttgtgtgga-aaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    |||   | |||| |||||| |||||  | ||| |||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |    
T  28892109 tcttgcttgctccgtgcactccctt-cgcggagaaggggtatgtcgcaagtaatgttggcaaacgtggtgtttgaactttagattgtattgggcctaaat 28892207  T
Q  312 aaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacag 348  Q
    |||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  28892208 aaatggacctaagatccttttgaccggtccagaacag 28892244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 49402708 - 49402914
Alignment:
Q  32 gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcgg 131  Q
    |||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||    
T  49402708 gagggagatatatattctactttggggactgctatgagtcccctatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacaccaggctctggcgg 49402807  T
Q  132 ttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgc--aaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgc 229  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||  | ||||||||| | || |||||||||| ||||   | |||||||||    
T  49402808 ttacgagatcgtggaaagtgtaaccgccatagagattattgcggaaacgtgcagagagagacgttgtagtccgtttgaaccggtcttgcttgctctgtgc 49402907  T
Q  230 accccct 236  Q
    |||||||    
T  49402908 accccct 49402914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18284665 - 18284481
Alignment:
Q  166 tttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcac-ccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaa 264  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||| | |||||| || ||||||||  |||||    
T  18284665 tttattgtgggaacgttaaaaaagacgttggggttcgtttgacccagtctctttcattttgtgcactcccctcgcgtggaaggg-gtgtgtcgtgagtaa 18284567  T
Q  265 ctttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  18284566 ttttgccaaacgtgatgtttgggctttggatggtattgggcctaattaaatgggccaaagatccttttggccggtccataacagta 18284481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Original strand, 15455466 - 15455633
Alignment:
Q  42 tagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatc 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||   ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |  ||||||||||  | ||||||||| |||||     
T  15455466 tagattctaccttggggactgctaagagtcttatatatatagaggtggagggatgcaaagtcgttgtgaaggcacacctgtgtttggcggttatgaaata 15455565  T
Q  142 atgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaac 209  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  | ||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15455566 atgggaagtgtaaacgcaagagaaataattgcagaaacgtgcaaagagacgttgtggctcgtttgaac 15455633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26778894 - 26778756
Alignment:
Q  186 agagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtgga-aaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgttt 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| |  | ||| |||| ||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||||    
T  26778894 agagacgttgtggttcgtttgaaccggtcttgttcgctatgtgcacccccctc-gcggagaaggggtgggtcgcaagtaatgttgtcaaacatggtgttt 26778796  T
Q  285 gagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaag 324  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26778795 gagctttgaatagtattgagcctaagtaaatgagccaaag 26778756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 333
Target Start/End: Original strand, 8168007 - 8168072
Alignment:
Q  268 tgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttg 333  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  8168007 tgccaaacatggtgtttgggctttggattgtattggacctaagtaaatgggtcaaaactccttttg 8168072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18284724 - 18284661
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttat 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18284724 agagagtgagggtttagaggaagaga--gattctaccttggggactgcattgagtcccctatttat 18284661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 34845635 - 34845514
Alignment:
Q  38 gagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacga 137  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||   ||| ||||| | |||||||||||  |  ||||||| |||||   |||||||| ||  |||| |||||||||    
T  34845635 gagagagattctaccttggggactgcgaggagccccctttatatagaggtgggtgaatgcagagtcgttgtaatggcacacatgtgtctgacggttacga 34845536  T
Q  138 aatcatgggaagtgtaaccgcc 159  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  34845535 aatcgtgggaagtgtaaccgcc 34845514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 333
Target Start/End: Original strand, 15427790 - 15427994
Alignment:
Q  126 tggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctct 225  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||| ||| |||||  | |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||  |||||  | ||||     
T  15427790 tggcggttacgaaatagtgg-aactgtaaacgctagagaaataattgcgggaacgtgcaaagaaacgttgtggctcgtaggaactggtctcgcttgctcc 15427888  T
Q  226 gtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaaga 325  Q
    ||||||||| ||    ||||||| ||||||||||| |||  |||  ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||||||||||||| | ||||    
T  15427889 gtgcacccctttcgcgggaaaggggtgtgtcgcaaataatattgtgaaacgtggtatatg-gctt-ggattgtattgggcctaagtaaatgggtctaaga 15427986  T
Q  326 tccttttg 333  Q
    ||||||||    
T  15427987 tccttttg 15427994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 333
Target Start/End: Original strand, 15434408 - 15434612
Alignment:
Q  126 tggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctct 225  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||| ||| |||||  | |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||  |||||  | ||||     
T  15434408 tggcggttacgaaatagtgg-aactgtaaacgctagagaaataattgcgggaacgtgcaaagaaacgttgtggctcgtaggaactggtctcgcttgctcc 15434506  T
Q  226 gtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaaga 325  Q
    ||||||||| ||    ||||||| ||||||||||| |||  |||  ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||||||||||||| | ||||    
T  15434507 gtgcacccctttcgcgggaaaggggtgtgtcgcaaataatattgtgaaacgtggtatatg-gctt-ggattgtattgggcctaagtaaatgggtctaaga 15434604  T
Q  326 tccttttg 333  Q
    ||||||||    
T  15434605 tccttttg 15434612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19442313 - 19441982
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||    
T  19442313 cagagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagtgctgcaaagccgttgtaatg 19442214  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19442213 acacatctgactctggcggttacgaaatcgggggaagtataaccgccagagagtttattgtgggaacgtgtagagagacgttgtggttcgattgaaccag 19442114  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagta 312  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  19442113 tctctttcgctccgcacacccccttgtgtgg-aaggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagttttggattgtattgggcctaagta 19442015  T
Q  313 aatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaa 345  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  19442014 aatgggccaaaggtccttttggccggtccagaa 19441982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19967621 - 19967288
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   ||    
T  19967621 cagagagagtgagggtttagaggaagagatggattctaccttagggactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggttgcataaccgttgtaatg 19967522  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19967521 acacacctggctctggcggttacgaaatcgtgggtggtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccag 19967422  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagta 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||    
T  19967421 tctctttcgctccgtgcacccccttatgtgg-aaggggtgtgtcgcaggtaactttgtcaaacgtggtgtttggactttggatcgtattgggcctaagta 19967323  T
Q  313 aatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    |||||  ||||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  19967322 aatggatcaaaggtccttttgaccggtccagaaca 19967288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24974085 - 24973754
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt--gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggc 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||    
T  24974085 agagagtgagggttttagaggaagaga--gattctaccttggtgactgcattgagtcccctatttatagagttagagggctgcagagccgttgtaatggc 24973988  T
Q  115 acacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtc 214  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  24973987 acacctaactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgtgggaatgttgaaagagacgttgaggttcgtttgaaccggtc 24973888  T
Q  215 tctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaa 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||    
T  24973887 tctttcgttctgtgcacccccttgcttggaaggga-tgtgtcgcaagtaattttgcaaaacgtggtgtttgggctttggatgatattgggcctaagtaaa 24973789  T
Q  315 tgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagt 349  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  24973788 tggaccaaagaaccttttggccggtccataacagt 24973754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Original strand, 9858967 - 9859302
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9858967 agagactgagggtttagatgaagagatatattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtggttgca 9859066  T
Q  116 cacc----tgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaacca 211  Q
    |||     || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  9859067 cacacacttggctctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccaaagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaacga 9859166  T
Q  212 gtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    ||||||    
T  9859167 gtctcactcgctctgtgcaccccccttgcaggaaaggggtgtgttgcaagtaagtttgccaaacgtggtgtttggattttggattgtattaggtctaagt 9859266  T
Q  312 aaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
     |||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9859267 caataagtcaaagatccttttggccggtccagaaca 9859302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8995630 - 8995305
Alignment:
Q  24 gagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctga 122  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||      
T  8995630 gagggtttagaggaagagttagattctaccttggggaatgcagtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgat-tgacacacctag 8995532  T
Q  123 ctctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgc 222  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| | | ||||||| |||||  ||||    
T  8995531 ctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgctgagagacgttgtggcttgcttgaaccggtctcgctcgc 8995432  T
Q  223 tctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaa 322  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  8995431 tccgtgcaccccctcgtg-ggaaaggggtatgtcgcaagtaatgttgtcaaacgtggtgtttaggctttagatagtattgggtctaagtaaatgggccaa 8995333  T
Q  323 agatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||    
T  8995332 aggtccttttggtcggtccaaaacagta 8995305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21817937 - 21817598
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    ||||||||||||||| ||    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||   ||||||    
T  21817937 agagagtgagggttttagaggaagaaagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttataaaggtggatggccgcagagccgttgtaatggcac 21817838  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||  ||||    
T  21817837 acctaactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaacagcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgctggggttcgtttgaaccgatctc 21817738  T
Q  217 tttcgctctgtgca-------cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaa 309  Q
    ||||| || |||||       ||||||   |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||    
T  21817737 tttcgttccgtgcacccccccccccctcacgtgg-aaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatagtactgggcctaa 21817639  T
Q  310 gtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  21817638 gtgaatgggccaaagatccttttggccggtccaggacagta 21817598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8990961 - 8990666
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   |||||    
T  8990961 agagagtgagggtttagaggaagagttagattctaccgtggggactgcagtgagtcccctatttacagaggtggagggctgtagagccgttgtaatggca 8990862  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||| ||||    
T  8990861 cacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaactgtcagagagtttattgtgagaacgtgcagagagacgttgtggcttgcttgaaccggtct 8990762  T
Q  216 ctttcgctctgtgcaccccctt-gtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    |  || ||| |||||||| ||| ||| || |||| | |||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||  |||| ||| ||| |||||||||||    
T  8990761 cgctcactccgtgcaccctcttcgtg-gggaaggggcgtgtcgcaggtaatgttgtcaaacgaggtgtttggactttagatagtactgaacctaagt 8990666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 333
Target Start/End: Original strand, 38621819 - 38622120
Alignment:
Q  32 gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcgg 131  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  || |||||| ||    
T  38621819 gaggaagagtgagattctaccttggggactgcagtgagtcccttatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacatttggctctggtgg 38621918  T
Q  132 ttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcac 231  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||  |||||| ||| ||    
T  38621919 ttacgaaatcgtggaaagtgtaactgccaaacaatttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgttttaaccgatctcgctcgctccgtggac 38622018  T
Q  232 ccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttt 331  Q
    |||| |    || |||| || ||||||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||  ||||||    
T  38622019 ccccctcgcggggaaggggtatgtcgcaagtaatgtcgctaaacgtgatgtttgagctttggattgtattgggcctaagtaaataggtcaaaagtccttt 38622118  T
Q  332 tg 333  Q
    ||    
T  38622119 tg 38622120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21815609 - 21815423
Alignment:
Q  163 gagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccctt-gtgtggaaaggagtgtgtcgcaag 261  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| || ||||||| | ||    
T  21815609 gagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttccgtgcacccccctcgcgtggaaggg-gtgtgtcacgag 21815511  T
Q  262 taactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagt 349  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  21815510 taattttgccaaacgtggtgtttgggatttggatggtactgggcctaagtgaatgggccaaagattcttttggccggtccagaacagt 21815423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22186185 - 22186045
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  22186185 agagagtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggggactgctttaagtcccctatttatagaggtggatggctgcagagccgttgtaatggcac 22186086  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccg 157  Q
    |||| |||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22186085 accttactcggacggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccg 22186045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 333
Target Start/End: Original strand, 49472311 - 49472519
Alignment:
Q  122 actctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcg 221  Q
    |||||| ||||||||||||| | |  ||| |||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  49472311 actctgacggttacgaaatcgtag--agtataaccgcatgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcatttgaaccggtctctttcg 49472408  T
Q  222 ctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggcca 321  Q
     || ||||||||||| | ||||  ||| |||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||    
T  49472409 ttccgtgcaccccctcgcgtgg-gaggggtgtttcgcgagtaattttgtcaaacgcggtgtttggactttggatggtattgggcctaagtaaatgggtca 49472507  T
Q  322 aagatccttttg 333  Q
    ||||||||||||    
T  49472508 aagatccttttg 49472519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21815696 - 21815619
Alignment:
Q  43 agattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacct 120  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  21815696 agattctaccttggagactgcattgagtcccatatttatagaggtggagggctgcagagctgttgtaatggcacacct 21815619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 347
Target Start/End: Original strand, 33028926 - 33029124
Alignment:
Q  149 gtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgttt-gaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaag 247  Q
    |||||||||  |||||| |||||| | |||||| || ||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |  | |||| || ||||||||   | |||| |    
T  33028926 gtgtaaccgttagagagattattgcgagaacgtacatagagacgttgtggtttgttttgaaccggtcccgcttgctccgttcaccccctcacggggaagg 33029025  T
Q  248 gagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    | |||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| || ||||||  || |||||| ||||| ||||||    
T  33029026 g-gtgtgtcgcaagtaatatagtcaaacgtggtgtttgggctttggattatattgtgcctaagtaattgagccaaaactcattttggccggtccagaaca 33029124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18574220 - 18573893
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctacctt---gggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  18574220 agagagtgagagtttagaggaagagatagattctaccttcttggggaatgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatg 18574121  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  18574120 gcacacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccac 18574021  T
Q  213 tctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||    
T  18574020 tctcttttgctccatgcaccccccttgtgtggaaggga-tgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggctttgcattgtattaggcctaagt 18573922  T
Q  312 aaatgggccaaagatccttttggtcggtc 340  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  18573921 aaatggaccaaaaatccttttggccggtc 18573893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 32009213 - 32008884
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||    
T  32009213 agagagtgagggtttagaggaagagatagattttaccttggggagtactttgagtcccctatttatagaggtggagggctgtagagccgttgtaatggca 32009114  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32009113 cacctgactctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaatcgctagagagattattgcgggaacgtgcagagagacgctgtggttcgtttgaaccagtct 32009014  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||    
T  32009013 ctttcgctccgtgcacccccttgtgagg-aaggggtgtgtcacaagtaactttgtcaaacgtggtgtttgggctttcgattgtattgggcctaagtatat 32008915  T
Q  316 gggccaaagatccttttggtcggtcgagaac 346  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  32008914 gggtcaaaggtccttttggccggtccagaac 32008884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18040683 - 18040357
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||    
T  18040683 cagagagagtgaaggtttagaggaagagattgattctaccttggggactgctt-gagtcccctatttatagaggtggagagctgcagagccgttgtaatg 18040585  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18040584 gcacacctggctctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccag 18040485  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcaccc-ccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||      ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||    
T  18040484 tctctttcgctccgtgcacccaccttgtgtgg-aaggggtgtgtcacaagtaactttgc------tggtgtttgggctttggattatattg-gcctaagt 18040393  T
Q  312 aaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  18040392 aaatgggccaaaggtccttttggccggtccagaaca 18040357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Original strand, 7999650 - 7999979
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||   || ||    
T  7999650 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgccgtgagtctcctgtttatagaggtggaggactgcag--ccgttgtaatgaca 7999747  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7999748 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacatgcagagagacgttgtggttcgttggaaccagtct 7999847  T
Q  216 ctttcgctctgtgcac-ccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaa 314  Q
    || |||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||||||||||    
T  7999848 ctgtcgctccgtgcactcgccttgtgtgg-aaggggtgtgtcgcaagtaattttgccaaacgcggtgttcgggttgtggattgtattgggcctaagtaaa 7999946  T
Q  315 tgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  7999947 tgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 7999979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2085945 - 2085642
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||    
T  2085945 cagagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagaaccgttgtaatg 2085846  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||   |||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  2085845 gcacacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaattgccaggtcgtttattgcgggaacatgcagagagacattgtggttcgtttgaactag 2085746  T
Q  213 tctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||||  |||||||    
T  2085745 tctctttcgctccgtgtaccccccttgcttgg-aaggggtgtgttgcaagtaacttttccaaacgtggtgtttaggctttgaattgcattgggcctaagt 2085647  T
Q  312 aaatg 316  Q
    |||||    
T  2085646 aaatg 2085642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41281008 - 41280677
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||    
T  41281008 agagagtgaaggtttcgaggaag-gttagattctaccttggggactgttatgagtcccctatttatagaggtggaggactgcagagccgttgtaatggca 41280910  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  41280909 cacctgactctgggggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagag-cgttgtggctcgtttgaaccggtct 41280811  T
Q  216 ctttcgctctgtgca--cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaa 313  Q
       |||||| |||||  |||||||||| | || || |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||    
T  41280810 tgctcgctccgtgcacccccccttgtgcgaaagggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacatggtgtttgggctttggattgtgttgggcctaagtaa 41280711  T
Q  314 atgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  41280710 atgggtcaaaggtccttttgtccggtccagaaca 41280677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7454866 - 7454521
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttg-aggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||    
T  7454866 agagagtgagggtttacaggaagagatagattctaacttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggaaggctgcagagccgttgtaatggca 7454767  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  7454766 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgtcatagagtttattgtgggaacgtgcatagagacgttgtggctcgtatgaaccggtct 7454667  T
Q  216 ctttcgctctgtgca-------------cccccttgtgtgga-aaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtatt 301  Q
    |  |||||| |||||             |||||    | ||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  7454666 cgctcgctccgtgcacccccccccccccccccccccggcggagaaggggtgtgttgcaagtaagtttgccaaacgtggagtttgggctttggattgtgtt 7454567  T
Q  302 gaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7454566 gggcctaagtaaataggccaaagatccttttggccggtccagaaca 7454521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Original strand, 24033762 - 24034051
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatag---aggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||    |||||||||| |||||||||||||   ||    
T  24033762 agagagtgaaggtttagaggaagagatagattctacattggggactgctatgagtcccctagttataatataggtggagggttgcagagccgttgtaatg 24033861  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  24033862 gcacacttgactttggcggttacgaaatcgtggaaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacattgtggttcgtttgaaccag 24033961  T
Q  213 tctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattg 302  Q
    |||| ||  ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  24033962 tctcgttttctccgtgcaccccccttgtg-ggaaaggggtgtgacgcaagtaactttgccgaacgtggtgtttaggatttggattgtattg 24034051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Original strand, 25820717 - 25821050
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    ||||||| ||||||||||    ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  25820717 agagagtaagggtttgagaggaagaaagattctaccatggggactgcattgagtcccctatttttagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatggcac 25820816  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||| | ||  |    
T  25820817 accttactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgctggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaatcggttcc 25820916  T
Q  217 tttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatg 316  Q
    ||||| |  |||||||||| |     | |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   || || |||||     
T  25820917 tttcgtttcgtgcacccccctcacacggaaggtgtttgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatggtattcggcccaaataaatt 25821016  T
Q  317 ggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25821017 ggccaaagatccttttggccggtccagaacagta 25821050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 346
Target Start/End: Original strand, 24060562 - 24060888
Alignment:
Q  21 agtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacc 119  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24060562 agtgagggtttagaggaagcgatagattctaccttggagactgctaagagtcccttatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtgatggcacacc 24060661  T
Q  120 tgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctcttt 219  Q
     | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||   |    
T  24060662 aggctctggcggttacaaaatcgtaggaagtgtaactgccagagagattattgcaggaacatgcagagagatgttgtggttcgttagaaccggtcttgct 24060761  T
Q  220 cgctctgtgcacc-cccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatggg 318  Q
     |||| ||||||| |||| | | || |||| |||||||||||||||  || || |||||||| |||   |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24060762 tgctccgtgcacctccctcgcg-gggaaggggtgtgtcgcaagtaatgtttcctaacgtggtatttcgactttggattgtattgggcctaagtaaatggg 24060860  T
Q  319 ccaaagatccttttggtcggtcgagaac 346  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||    
T  24060861 ccaaagctccttttgaccggtccagaac 24060888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33273704 - 33273388
Alignment:
Q  19 agagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcaca 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||    
T  33273704 agagtgagggtttagagaaagagatagattctaccttggggactcctatgagtcccctatttatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggcaca 33273605  T
Q  118 cctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctct 217  Q
    | ||         |||       | |||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||      
T  33273604 cttg---------gtt-------cgtgggaagtgtaaccgccatagaacttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggctcgtttgaaccggtcttg 33273521  T
Q  218 ttcgctctgtgcaccccc-ttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatg 316  Q
     ||||||   |||||||| ||| | ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  33273520 ctcgctcctcgcaccccccttgcg-ggagaagagtgtgttgcaagtaaatttgccaaacgtggtgtttgggctttggatagtattaggcctaagtaaatg 33273422  T
Q  317 ggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33273421 ggccaaagatccttttggtcggtccataacagta 33273388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10532992 - 10532801
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    ||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  10532992 cagagggaatgagggtttagatgaagagataaattctaccttggggactccattaagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatg 10532893  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  10532892 gcacacctgactctggcggttacgaaatcgtggaaagtgtaaccgccagggtgtttattgcaggaacgtggagagagacgttgtggttcgtt 10532801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22609692 - 22609362
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtgg-- 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | || |  ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||      
T  22609692 agagagtgagggttttgaggaagagattgattctatctttgggattgttaagagtcccatat--atagaggtggagggttgcagagtcgttgtgatggta 22609595  T
Q  114 cacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagt 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||  |  |||||||||||||||| |    
T  22609594 cacacctggctctggcggttacgaaatcgtgagatgtgtaaccgacagagagtttattgcgtgaacatgcagagagatatcgtggttcgtttgaaccaat 22609495  T
Q  214 ctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaa 313  Q
    |||  |||||| ||||||||||| |   |||| ||| ||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  22609494 ctcgctcgctccgtgcaccccctcgcagggaaggga-tgtgttgcaaataatgttgtcaaacatggtgtttgggctttgga-tgtattgggcctaagtaa 22609397  T
Q  314 atgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacag 348  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22609396 atggatcaaagatccttttggtcggtccagaacag 22609362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 11709384 - 11709562
Alignment:
Q  32 gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcgg 131  Q
    |||| |||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||||||      
T  11709384 gagggagagatcgattctacctttcggactgctgagagtcccctatatatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggcacaccaggctctggcat 11709483  T
Q  132 ttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaacc 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11709484 ttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagattattgtgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaacc 11709562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 323
Target Start/End: Original strand, 17775783 - 17775926
Alignment:
Q  179 cgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtg 278  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17775783 cgtgcagagagacgttgtggttcgattgaaccagtctctttcgctccgtacacccccttgtgtggaaggg-gtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtg 17775881  T
Q  279 gtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaa 323  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17775882 atgtttgggctttggattgtattggacctaggtaaatgggccaaa 17775926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Original strand, 11709609 - 11709714
Alignment:
Q  245 aaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgaga 344  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  11709609 aaggggtgtgtcgcaagtaatattgtcaaacgtggtatttgggctttggattgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccaga 11709708  T
Q  345 acagta 350  Q
    | ||||    
T  11709709 atagta 11709714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10532800 - 10532633
Alignment:
Q  156 cgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccc-ttgtgtggaaaggagtgtg 254  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||  || || || |||||    
T  10532800 cgccagggtgtttattgcaggaacgtggagagagacgttgtggttcgtttgaaccaatctctttcgcttcgtgtaccccccttgcatgtaaggg-gtgtg 10532702  T
Q  255 tcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaa 323  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  10532701 ccgcaagtatctttgccaaacgtggcgtttgagctttgaatggtattgggcctaagtaaatgggtcaaa 10532633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Original strand, 1788651 - 1788732
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgca 98  Q
    ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1788651 agagagtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggtgactgcattgagtctcctatttatagaggtggagggctgca 1788732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 17775705 - 17775755
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgc 63  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17775705 cagagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgc 17775755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22282225 - 22282161
Alignment:
Q  95 tgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgcc 159  Q
    |||||||||||||   |||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  22282225 tgcagagccgttgtaatggcacacgtgtgtctggcggttacgaaatcttgagaagtgtaatcgcc 22282161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Original strand, 391459 - 391791
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  391459 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggca 391558  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  391559 cacctggctctggcggttacgaaattatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacctgcagagagacgttgtggttcgtttgaactagtct 391658  T
Q  216 ctttcgctctgtgca--cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaa 313  Q
    |  |||||| |||||  |||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  391659 cgctcgctccgtgcacccccccttgcg-ggaaaggggtgtgttgcaagtaagtttgccaaccgtggtgtttggggtttggattgtattggacctaagtaa 391757  T
Q  314 atgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  391758 atggaccacaggtccttttggtcggtccagaaca 391791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 350
Target Start/End: Original strand, 380763 - 381095
Alignment:
Q  18 gagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  380763 gagagtgagggtttagaggaagagatagatt-taccatggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcac 380861  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  380862 acctggctctggaggttacgaaattgtgagaagtgtaaccgccagagactttattgcgggaacgtgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctc 380961  T
Q  217 tttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatg 316  Q
      |||||| |||||||||| |    ||||||| |||||  |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  380962 gctcgctccgtgcaccccccttgcaggaaaggggtgtggtgcaagtaagtttgccaaccatggtgtttgggctttggattgtattgggcgtaagtaaatg 381061  T
Q  317 ggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    ||||| |  ||||||||| ||||| | |||||||    
T  381062 ggccacatgtccttttggccggtccataacagta 381095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Original strand, 3770257 - 3770593
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggtttga-ggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  3770257 cagagagagtgagggtttaaaggaagagatagattctaccttggggactgttgtgaatcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatg 3770356  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  3770357 gcacacctggctctggcggttacaaaatcgtggaaagtgtaaccgctagagagtttattgcggaaacgtgcagagagacgttgaggttcgtttgaaccag 3770456  T
Q  213 tctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    ||||| ||||||  |||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  3770457 tctctctcgctccatgcaccccccttgagtgg-aaggggtgtgttgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggctttgaattgtattgggcctaagt 3770555  T
Q  312 aaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagt 349  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3770556 aaatgggccaaaggtccttttggccggtccagaacagt 3770593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23756021 - 23755687
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||    
T  23756021 cagagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgttgtgagtcccctatttatagaggtggaaggctgtagagccgttgtaatg 23755922  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23755921 gcacacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcttttgaaccag 23755822  T
Q  213 tctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  23755821 tcactttcgctccgtgcaccccccttgcttgg-aaggggtgtgttgcaagtaactttaccaaacatggtgtttgggctttggattgtattgggcctaggt 23755723  T
Q  312 aaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  23755722 aaatgggccaaaggtccttttggccggtccagaaca 23755687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25134136 - 25133793
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25134136 cagagagaatgatggtttagaggaagagatagattctaccttagggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtagtg 25134037  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25134036 gcacacctggctctggcggttacgaaatcgtggtaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaaccag 25133937  T
Q  213 tctctttcgctctgtgca---------cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattga 303  Q
    ||||  | |||| |||||         ||||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  25133936 tctcgcttgctccgtgcaccccccaccccccccttttaggaaaggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggctttggattgtaatgg 25133837  T
Q  304 acctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| ||||||    
T  25133836 gcctaagtaaatgggtcaaagatctttttggcccgtccagaaca 25133793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41266399 - 41266065
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt--gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggt 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  41266399 cagagagagtgagggttttagaggaagagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaat 41266300  T
Q  112 ggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaacca 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41266299 ggcacacctggctctggcggttacgatatcgtgagaagtgtaaccgcccgagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaacca 41266200  T
Q  212 gtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    ||| | ||||||| ||||||||| |||  || || || | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||||||    
T  41266199 gtcac-ttcgctccgtgcaccccattgcctgaaagggggggtgttgcaagtaactttgccaaacatggtgtttggattttggatcgtattgggcctaagt 41266101  T
Q  312 aaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||||| ||||||    
T  41266100 aaatgggtctaaaatccttttgaccggtccagaaca 41266065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 42534322 - 42534036
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  42534322 agagagtgagggtttagcggaggagttagattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 42534223  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||    
T  42534222 catctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggctcgtttgaacaggtct 42534123  T
Q  216 ctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattg 302  Q
    |  |||||  ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42534122 cgctcgctacgtgcaccccccttgtg-ggaaaggggagtgtcgcaagtaaggttgacaaacgtggtgtttgggctttggattgtattg 42534036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Original strand, 3105204 - 3105535
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||   || ||    
T  3105204 agagagtgaggttttagaggaagagttagattctaccttggggactgctatgagtcccatatttatagaggtggaggattgtagagccgttgtaatgaca 3105303  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    ||||| |||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  3105304 cacctaactctcatggttatgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggctcgtttgaaccggtct 3105403  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    |  ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  3105404 cgctcgctctgtgcactcccttgtgggaaagggggtgtgtcgcaagtaatgttgtcaaacgtggtgtttgggctttggattgtgttgggcctaagtaaat 3105503  T
Q  316 gggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    || | |||| ||||||||| | ||| ||||||    
T  3105504 ggactaaaggtccttttggccagtccagaaca 3105535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26155148 - 26154865
Alignment:
Q  50 accttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaag 149  Q
    |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||    
T  26155148 acctcggggactgattggagtcccctatttatagaggtggagggctgcatagccgttataatggcacacctggctatggtggttacgaaatcgtgggaag 26155049  T
Q  150 tgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaagg 248  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  26155048 tgtaaccgccagagcgtttattgcgggaacgtacaaagagatgttgtggttcgtttgaactaatctctttcgctccgtgcaccccccttgtgtggaaggg 26154949  T
Q  249 agtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttg 333  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  26154948 a-tgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgaactttaaattatattggacctaagtaaatgggtcaaaagtccttttg 26154865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Original strand, 27347171 - 27347499
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||   |||||    
T  27347171 agagagtgatggttttgaggaagaga--gattctaccttggggactgcattgaatcccctatgtatagacgtggagggctacaaagccgttgtaatggca 27347268  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27347269 cacctaacactgacggttacgaaatcatgggaagtgtaactgcctatgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtct 27347368  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    |||||| | ||||||||||||    ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  27347369 ctttcgttatgtgcaccccctctcatgg-aaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtgatgtttgggctttggatggtattgggcttaagtaaat 27347467  T
Q  316 gggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  27347468 gggccaaagatccttttgaccggtccagaaca 27347499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 317
Target Start/End: Original strand, 19092723 - 19093021
Alignment:
Q  19 agagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcaca 117  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||    
T  19092723 agagagagggtttagaggaagagataaatcctaccttggggactgctatgagtcccctatatatagaggtggggggctgcagagccgttgtaatgacaca 19092822  T
Q  118 cctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctct 217  Q
    || |||||| |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||      
T  19092823 ccagactctcgcggtttcgaacttgtgggaagtgtaaccgccagagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaactagtcttg 19092922  T
Q  218 ttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgg 317  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||| ||  |||||  |||||||||||||    
T  19092923 ttcgctccgtgcaccccctcgtggagaaggga-tgtgtcgcaagtaatgttaccaaacatggtgtttgggctttgaataatattgggcctaagtaaatgg 19093021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 23929797 - 23930014
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  23929797 agagagtgagggtttagaggaagagttagattttaccttggggactgcagtgagtcccctatataaagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 23929896  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||| ||||    
T  23929897 cacctggctctggcggttacggaatcgtgggaagtgtaaccgccggagagtttattgtgggaacgtgcagagagacattgtggttcatttgaaccggtct 23929996  T
Q  216 ctttcgctctgtgcaccc 233  Q
    |  |||||| ||||||||    
T  23929997 cgctcgctccgtgcaccc 23930014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 29568315 - 29568507
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| |    
T  29568315 agagagtgagggtttagaggaagacatagattctaacttggcggttgctatgagtccccaatttatagaggtggagggctacagagccgttgtaatggta 29568414  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaac 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||    
T  29568415 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgctagagagtttattg-cggaacgtgtagagagacgttgtggctcgtttgaac 29568507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 26159236 - 26159154
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggct 95  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26159236 cagagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggct 26159154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 347
Target Start/End: Original strand, 23932908 - 23933010
Alignment:
Q  245 aaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgaga 344  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23932908 aaggggtgtgtcgcaagtaatgttgtcagacgtggtgtttgggctttggattgtattaggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtctaga 23933007  T
Q  345 aca 347  Q
    |||    
T  23933008 aca 23933010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26159156 - 26159093
Alignment:
Q  287 gctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  26159156 gctttgaattgtattgggcctaagtaaatgagccaaaagtccttttggccggtccagaacagta 26159093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 323
Target Start/End: Original strand, 29164849 - 29165155
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||    
T  29164849 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggacggctgcagagccgttgtaatgaca 29164948  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29164949 cacctgactctagaagttacgaaatcgtgggaagtgtaactgctagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 29165048  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||    
T  29165049 cgttcgctccgtgcacccccttgtg-ggaaaggggtgtgtcacaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggctttgggttgtattgggcctaaataaat 29165147  T
Q  316 gggccaaa 323  Q
    ||| ||||    
T  29165148 gggtcaaa 29165155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30770384 - 30770057
Alignment:
Q  19 agagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcaca 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||    
T  30770384 agagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagtgctgcagagccgttgtaatggcaca 30770285  T
Q  118 cctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctct 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  30770284 cctggctctggcggttacgaaatcgtggaaagtgtaactgccaaagagtttattgcgggaacgtgtagagagacgttgt-gttcgtttgaaccagtccct 30770186  T
Q  218 ttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgg 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  30770185 ttcgctccgtgcacccccttgtgtgg-aaggggtgtgtcgcaagtaacttcgtcaaacgtgatgtttgggctttgaattgtattgggcctaagtaaatgg 30770087  T
Q  318 gccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
      ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  30770086 ttcaaaggtccttttggccggtccagaaca 30770057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 20093533 - 20093853
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggtttg-aggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  20093533 cagagaaagtgcgggtttggagggagagatagtttctaccttggggactgccgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatg 20093632  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20093633 gcacacctggccctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccaccaaagagcttattgcgggaatgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccag 20093732  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagta 312  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  20093733 tctctgtcgctccgtgcaccctcttgtgtgg-aaggggtttgttgcaagtaactttgacaaacgtggtgtttggactttggattgtattggacctaagta 20093831  T
Q  313 aatgggccaaagatccttttgg 334  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  20093832 aatgggtcaaagatccttttgg 20093853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9549171 - 9548825
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |    
T  9549171 cagagagagtgagggtttagaggaagagatagattttaccttggggactactttgagtcccctttttataaaggtggagggctgcagagccgttgtagag 9549072  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  9549071 gcacacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtgtttcgtttgaaccag 9548972  T
Q  213 tctctttcgctctgtg---------cacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattga 303  Q
    ||||  | ||||  ||         | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  9548971 tctcgcttgctccatgccccccccccccccccttgtgggtaaaggggtgtgtcgcaagtaactataccaaacgtggcgtttgggctttggattgtattgg 9548872  T
Q  304 acctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  9548871 gactacgtaaatgggccaaacatccttttggccggtccagaacagta 9548825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 323
Target Start/End: Original strand, 21802447 - 21802757
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||    
T  21802447 cagagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggttgagggctacagagccgttgtaatg 21802546  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21802547 gcacacctggctctggtggttacgaaatcgtaggaagtgtaacagcgagagagtttattgcgagaacctgcagagagacgttgtggttcgtctgaaccag 21802646  T
Q  213 tctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||    
T  21802647 tctccttcgctccgtgcaccccccttgcgtgg-aaggcgtgtgttgaaagtaactttgacaaacgtggtgtttgagctttagattgtattcggcctaagt 21802745  T
Q  312 aaatgggccaaa 323  Q
    ||||| ||||||    
T  21802746 aaatgagccaaa 21802757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47295880 - 47295562
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  47295880 agagagtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcac 47295781  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47295780 accttactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaacgcttgtgagtttattgcgggaaggtggagagagacgttggggttcgtttgaaccagtctc 47295681  T
Q  217 tttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatg 316  Q
     |||| || ||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  47295680 cttcgttccgtgcaccccctcgcgtggaatgg-gtgtgtcgcgagtaatttttccaaacgtggtgtttgggctttgtagtgtattggacctaagtaaatg 47295582  T
Q  317 ggccaaagatccttttggtc 336  Q
    || |||||||||||||||||    
T  47295581 ggtcaaagatccttttggtc 47295562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 18153131 - 18153459
Alignment:
Q  19 agagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacac 118  Q
    ||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||     
T  18153131 agagtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggggaatgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgccgagtcgttgtaatggcacag 18153230  T
Q  119 ctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctt 218  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18153231 cttactctgacggttacgaaatggtgggaagtgtaaccgcctgcgagtttattgtgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctt 18153330  T
Q  219 tcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgg 317  Q
    | | || ||||| |||||| | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||    
T  18153331 ttgttccgtgcacccccctcgcgtgg-aaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacatggtgtttgggctttgtagtgtattgggcctaagtaaatgg 18153429  T
Q  318 gccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18153430 gccaaagatccttttggccggtccagaaca 18153459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Original strand, 22705602 - 22705929
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||    
T  22705602 cagagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggt------tgtgagtcccgtatttatagaggtggaggactgcagagccattgtaatg 22705695  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  22705696 gcacacctggctctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccggtagagaatttattgcaggaacgtgcagagaaacgttgtggttcgtttgaactag 22705795  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcaccc-ccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  22705796 tctctttcgctccgtgcacccgccttgcatgg-aaggggtgtgttgcaagtaactttgtcaaacgtggtgttgga-ctttggattgtattgggcctaagt 22705893  T
Q  312 aaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||    
T  22705894 aaatgggtcaaatgtccttttgaccggtctagaaca 22705929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Original strand, 7595367 - 7595670
Alignment:
Q  33 aggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||| | ||||  ||    
T  7595367 aggaagagatagattctaccttgggt-ctgtcatgattcccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatagcacacctggcgctggatgt 7595465  T
Q  133 tacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgca-- 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||  |||||| |||||      
T  7595466 tacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacattgtggttcgtttgaaccggtctcgctcgctccgtgcacc 7595565  T
Q  231 -cccccttgtgt-ggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatcc 328  Q
     ||||||  ||| || |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  7595566 cccccctcctgtggggaaggggtgtgttgcaagtaagtttgccaagcgtggtgtttaagctttgaattgtattgggcctgagtaaatgggccaaagatcc 7595665  T
Q  329 ttttg 333  Q
    |||||    
T  7595666 ttttg 7595670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2250192 - 2249857
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt--gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggc 114  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  2250192 agagagtgagagttttagaggaagagatagattctacattggggtttgctatgagtcccctatatatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggc 2250093  T
Q  115 acacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtc 214  Q
    ||||| | || |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2250092 acaccaggctttggcggttacaaaatcgtgggaattgtaaccgctagagatattattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtc 2249993  T
Q  215 tctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaa 313  Q
    |   | |||| ||||| |||||||| | || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    |||||||    
T  2249992 ttgcttgctccgtgcaccccccttgcg-gggaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacgtggtatttgagctttgaattgtattgggaataagtaa 2249894  T
Q  314 atgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    || || ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  2249893 ataggtcaaagctccttttggttggtccagaacagta 2249857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21593076 - 21592744
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    ||||||||||||||| ||    ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||    
T  21593076 agagagtgagggttttagaggaagaaagcttctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgctgagccgttgtaatggcac 21592977  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |  || |||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21592976 accttactctgacggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccgtctgttagcttattacgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctc 21592877  T
Q  217 tttcgctctgtgcaccccc---ttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaa 313  Q
    ||||| || ||||||||||   | | |||||| || ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||||||| |    
T  21592876 tttcgttccgtgcacccccccctcgcgtggaaggg-gtgtgtcgcgagtaatttagccaaacatggtgtttggactttggatggtattgggcctaagtga 21592778  T
Q  314 atgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  21592777 atgggccaaagattcttttggccggtccagaaca 21592744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 38612620 - 38612874
Alignment:
Q  79 tatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaa 178  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||   ||| ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38612620 tatagaggtggagatctgcagagccgttgtaatggtacaccaggctctggcggttacaaaatcgtgggaagtgtaactgccagagagattattgtgggaa 38612719  T
Q  179 cgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgc-acccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgt 277  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||| | |    | |||| |||| ||||||| | | || |||| |||| | ||||||||  |||||||||||    
T  38612720 cgtgcagagggacgttgtggttcgtttgaaccggccctgcttgctccgtgcaaccccctcgcgagg-aaggggtgttttgcaagtaatgttgccaaacgt 38612818  T
Q  278 ggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttg 333  Q
    |||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38612819 ggtgtttgggctttgaatagtattgagcctaagtaaatgggtcaaagctccttttg 38612874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 18185625 - 18185829
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    ||||||||||||||||||    ||| |||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||     |||||    
T  18185625 agagagtgagggtttgagaggaagaaagattctacgctggggactgcattgagtcccctattaataaatgtggagggctgcagagccgttttaacggcac 18185724  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18185725 accttactctgacggttacgaaatcgcgggaagtgtaaccgcttgcgagtttattgcgggaacatggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctc 18185824  T
Q  217 tttcg 221  Q
    |||||    
T  18185825 tttcg 18185829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30765114 - 30764879
Alignment:
Q  82 agaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgt 181  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||   || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||    
T  30765114 agaggtggagggctgcagagctgttgtagtggcacacctaggtccgacgggtacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagaaataattgcgggaatgt 30765015  T
Q  182 gcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcac-ccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggt 280  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||    | ||||||||||| ||||| | | |  |||| || |||||||||||| ||||||||||||||     
T  30765014 gcaaagagacattgtggttcgcttgaaccagtcctgcttgctctgtgcactcccctcgcg-gtgaaggggtatgtcgcaagtaaatttgccaaacgtgga 30764916  T
Q  281 gtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgg 317  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30764915 gtttaagcttgggattgtattggacctaagtaaatgg 30764879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21801911 - 21801711
Alignment:
Q  150 tgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaagga 249  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||   ||||||  | ||||||| |    ||| ||||    
T  21801911 tgtaaccgccagagaacttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaatcggtcttgctcgctccttacaccccccttgcaggagagga 21801812  T
Q  250 gtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagt 349  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  21801811 gtgtgttgcaagtaagttttccaaacgtggtgtttgggttttagatagtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccagaatagt 21801712  T
Q  350 a 350  Q
    |    
T  21801711 a 21801711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 22703894 - 22704001
Alignment:
Q  15 agagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtgg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  22703894 agagagagtgagggtttagaggacgagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccatatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatgg 22703993  T
Q  114 cacacctg 121  Q
    ||||||||    
T  22703994 cacacctg 22704001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28794226 - 28794078
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||| |||||   ||||||| ||||||||   |||||    
T  28794226 agagaatgagggtttagagggaga-atagattctaccttggggactgttaagagtcccctatatataaaggtgagtggctgcatagccgttgtaatggca 28794128  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagag 165  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28794127 cacgtgtgtctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagag 28794078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40635598 - 40635520
Alignment:
Q  253 tgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttg 333  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||   |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40635598 tgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttga-ctttggatgatattgggtctaagtgaatggg-caaagatccttttg 40635520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Original strand, 23574394 - 23574724
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||    
T  23574394 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttgtggactgctttgagtcccctatttatagaggtagagggctgcagagccgttgtaatggca 23574493  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    ||| || ||||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23574494 cacttggctctggctgttacgaagtcgtggaaagtgtaaccaccagagagtttattgcgagaacatgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 23574593  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23574594 cgttcgctccgtgcacgcccttgtg-ggaaaggggtgtatcacaagtaactttgtcaaacgtggtgtttgggctttggattgtattgggcctaagtaaat 23574692  T
Q  316 gggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  23574693 gggccaaaggtccttttgggcggtccagaaca 23574724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29095214 - 29094885
Alignment:
Q  19 agagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacac 118  Q
    ||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  29095214 agagtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacac 29095115  T
Q  119 ctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctt 218  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  29095114 ctaactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccggtctctt 29095015  T
Q  219 tcgctctgtgca--cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatg 316  Q
    ||| || |||||  |||||| | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  29095014 tcgttccgtgcaccccccctcgcgtgg-aaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatggtattgggcctaagtgaatg 29094916  T
Q  317 ggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29094915 ggccaaagatctttttggtcggtccagaaca 29094885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Original strand, 4409193 - 4409528
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||    
T  4409193 cagagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgcattgaatcctctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttacaatg 4409292  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4409293 gcacaccttgctctggcggttacaaaatcgtgagaagtgtaaccgctagggcgtttattgcgggaacgtgcatagagacgttgtggttcgtttgaaccag 4409392  T
Q  213 tctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtg-tttgagctttggattgtattgaacctaag 310  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||  |||||  ||||||    
T  4409393 tctctttcgctccgtgcaccccccttgcgt-gaaaggggtgtgtcacaagtaactttgtcaaacgtggtgttttgggctttgaatgatattgggcctaag 4409491  T
Q  311 taaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  4409492 taaatgggccaaatgtccttttggccgatcgagaaca 4409528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15119921 - 15119590
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||   ||    
T  15119921 cagagagagtgggggtttagatgaagagatagattctaccttggggattg--ttgagtcccctatttatagaggtggagagttgcagagccagtgtaatg 15119824  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15119823 gcacacctggctctggcggttacaaaatcgtgggaagtataaccgctagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaacctg 15119724  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcac-ccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||    
T  15119723 tctctttcactctgtgcaccccccttgtgtgg-aaggggtgtgtcataagtaactttgtcaaacgtggtgtttgggctctggattgtattgggcctaagt 15119625  T
Q  312 aaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  15119624 aaatgggcc-aaggtccttttggccggtccagaaca 15119590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 350
Target Start/End: Original strand, 18736007 - 18736334
Alignment:
Q  24 gagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctga 122  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||     
T  18736007 gagggtttagaggaagagataaattctagcttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgctgagccgttgtaatggcacacctgg 18736106  T
Q  123 ctctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgc 222  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||    
T  18736107 ctctggcggttacgaaattgtgggaagtctaatcgccagagagtttattgcgggaacgtgtagagagacgttgtggctcgtttgaaccaatctcgctcgc 18736206  T
Q  223 tctgtgcacccc-cttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggcca 321  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  18736207 tccgtgcacccctcttgcg-ggaaaggggtatattgcaagtaagtttgccaaacgtggtgtttgggctttggatattattgggcctaagtaaatgggcca 18736305  T
Q  322 aagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  18736306 aaaatccttttggccggtccagaacagta 18736334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Original strand, 8306061 - 8306390
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||    
T  8306061 cagagagagtgagggtttagaggaagagat----tctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatg 8306156  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  8306157 gcacacctgactctagcagttatgaaatcatggaaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacctacagagagacgttgtgactcgtttgaaccag 8306256  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagta 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||    
T  8306257 tctctttcgctctgtgcacctccttgtct-gaaagggggatgttgcaagtaactttgtcaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaagta 8306355  T
Q  313 aatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
     ||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||    
T  8306356 tatgggccaaatgtccttttgaccggtccagaaca 8306390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 334
Target Start/End: Original strand, 29482591 - 29482909
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||    
T  29482591 agagagtgggggtttagaggaagagatagattctaccttggggactactatgagtcccctatttatagaggtggagggctgtagagtcgttgtaatggca 29482690  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  29482691 cacctggttctagcggttacgaaatcgtgggaagtataactgtgagagagtttattgcgggaacatgcagagagacgttgtggctcgtttgaaccggtct 29482790  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    |  |||||| ||||| | | ||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  29482791 cgctcgctccgtgcagcactttgtgggaaaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacgtggcgtttgggctttggattgtgttgggcctgagtaaat 29482890  T
Q  316 gggccaaagatccttttgg 334  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29482891 gggccaaagatccttttgg 29482909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 14910605 - 14910938
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagatt-ctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||    
T  14910605 agagagtgagggtttagaggaagagctagatttctaccttggggactgcagtgagtcccctatatatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatggc 14910704  T
Q  115 acacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtc 214  Q
    |||| |  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  14910705 acacatcgctctggcagttacgaaattgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccggtc 14910804  T
Q  215 tctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaa 314  Q
    |   |||||| |||||||||| | || || |||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  14910805 ttgctcgctccgtgcacccccatttg-gggaaggggtgtgtcgcaaataatgttgccaaatgtggtgtttggactttggattctattgtgcctaagtaaa 14910903  T
Q  315 tgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagt 349  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  14910904 tgggcaaaaggtccttttggccggtccagaacagt 14910938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 334
Target Start/End: Original strand, 18728923 - 18729239
Alignment:
Q  19 agagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcaca 117  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||| |||    
T  18728923 agagtgagggattagaggaagagatagattctaccttgaggactgttatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagacattgtaatggaaca 18729022  T
Q  118 cctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctct 217  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||     
T  18729023 cctggctctggcgggtacaaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcggaaacgtgcagagagacgttgtggctcctttgaaccggtctcg 18729122  T
Q  218 ttcgctctgtgcaccc-ccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatg 316  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | ||||||  ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||   ||||||||||||    
T  18729123 ttcgctccgtgcaccctccttgcg-ggaaagcggtgtgttacaagtaagtttgtcaaacgtggtgtttgggttttggatagtattaggcctaagtaaatg 18729221  T
Q  317 ggccaaagatccttttgg 334  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18729222 ggccaaagatccttttgg 18729239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Original strand, 12738495 - 12738760
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  12738495 agagagtgggggtttagaggaagagatagattctacctaggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggca 12738594  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    || ||| || || || |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12738595 catctggctatgacgattacgaaatcgtgggaagtgtaacctctagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaactagtct 12738694  T
Q  216 ctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtg 281  Q
      ||||||| || || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12738695 tgttcgctccgtacaccccccttgtg-ggaaaggggtgtgtcgcaggtaactttgccaaacgtggtg 12738760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24438760 - 24438474
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||   || ||    
T  24438760 agagagtgagggtttagaggaagagatagattataccttggga-ctgctgtgagtcccctatttatagaggtagaggattgcagagtcgttgtaatgaca 24438662  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  24438661 cacctggctcttgcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagttgattgcaggaacgtgcaaagagacgatgtggttcgtttgaaccaatct 24438562  T
Q  216 ctttcgctctgtg--cacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattg 302  Q
    ||||| | | |||  |||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24438561 ctttctccccgtgcacacccccttgcgtgg-aaggggtgtgttgcaagtaacatagccaaatgtggtgtttgaactttggattgtattg 24438474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7968695 - 7968479
Alignment:
Q  16 gagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggc 114  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||    
T  7968695 gagagagtgagggttaagaggaaaagatagattctgccttggggactgcattgagtcccctatatatagaggtggagggctgcagagctgttgtaatggc 7968596  T
Q  115 acacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7968595 acacctgactctggcggttacgaaattgtggaaagtgtaaccgccagggggtttattgtgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtc 7968496  T
Q  215 tctttcgctctgtgcac 231  Q
    ||||||| || ||||||    
T  7968495 tctttcgttccgtgcac 7968479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15349800 - 15349494
Alignment:
Q  44 gattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcat 143  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  15349800 gattctacgttggggactgctaagagtcccctatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtgatagcacacctgggtctggcggttacgaaatcgt 15349701  T
Q  144 gggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcg-tttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccct-tgtgt 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||     ||||||||||||||||  | |     
T  15349700 gggaagtgtaaccgcgagagagattattgtgggaacgtgcaaagagatgttgtggttcgttttgaaccggtcttgcatgctctgtgcaccccctccgcga 15349601  T
Q  242 ggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcg 341  Q
     | |||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||     
T  15349600 tggaagg-gtgtgttgcaagtaatattgccaaacatggtgtttgatctttggattgtatcgggcctaagtaaacgggcctaagatccttttgaccggtcc 15349502  T
Q  342 agaacagt 349  Q
    ||||||||    
T  15349501 agaacagt 15349494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18014656 - 18014333
Alignment:
Q  18 gagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  18014656 gagagtgagggttaagaggaagagattgattctaccttggggactgctatgagtcccctacatatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcac 18014557  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||   | || || ||||||||||||||  ||||     
T  18014556 acctagctctggcggttacgaaatcgtgggaagtctaaccaccagagagattattgcgggaacgtacagtcaaacattgtggttcgtttgaactggtctt 18014457  T
Q  217 tttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatg 316  Q
      |||||| |||||||||| |    || |||| || ||||||||||||  |||||| | || |||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18014456 gctcgctccgtgcacccccctcgcggggaaggggtttgtcgcaagtaatattgccacatgtagtgtctggtctgtggattgtattgagcctaagtaaatg 18014357  T
Q  317 ggccaaagatccttttggtcggtc 340  Q
    |||||||| || |||||| |||||    
T  18014356 ggccaaagctcattttggccggtc 18014333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18258794 - 18258492
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||    
T  18258794 agagagtgagggtttagagaaaaatatagattctaccttggagactgttgtgagtcccctatttatagaggtagagggctgtagagccgttgtagtggca 18258695  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  18258694 cacctggctctgatggttacgaaattgtgggaagtgtaactgctaaagagtttattgcgggaatgtgcggagagacgttgtggttcctttgaaccggtct 18258595  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtgga-aaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaa 314  Q
    |  |||||  |||||||||||| |||||| || | || ||  |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18258594 cactcgcttcgtgcaccccctt-tgtggagaaagggtatgctgcaagtaagtttgcaaaacatggtgtttgggctttggattgtattgggcctaagtaaa 18258496  T
Q  315 tggg 318  Q
    ||||    
T  18258495 tggg 18258492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 93 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17757140 - 17756884
Alignment:
Q  93 gctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacg 192  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17757140 gctgccgagccgttgtaatggcacaccttactctgacggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgtgggaacgtggaaagagacg 17757041  T
Q  193 ttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagcttt 291  Q
    ||  ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||| | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17757040 ttggggttcgtttgaaccaatctttttcgttccgtgcacccccctcgcgtgg-aaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggcttt 17756942  T
Q  292 ggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagt 349  Q
     |||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  17756941 cgattgtattaggcctaagtaaatgtgtcaaagatccttttggccggtcccgaacagt 17756884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19860251 - 19860052
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |    
T  19860251 agagagtgacggtttagaggaatagataaattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcggagccgttgtaatggga 19860152  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19860151 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccaccagagagattattgtgggaacatgttgagagacgttgcggttcgtttgaaccagtct 19860052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21508716 - 21508507
Alignment:
Q  138 aatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccc-t 236  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  21508716 aatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcaggaacgtgcagagagacgctgtggttcgattgaaccagtctctttcgctccgtgcacccccct 21508617  T
Q  237 tgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtc 336  Q
    ||  ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  21508616 tgcatggaaggg-gtgtgttgcaagtaactttgtcaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgggcctaagtaaatgggccaaaggtccctttggcc 21508518  T
Q  337 ggtcgagaaca 347  Q
    | || ||||||    
T  21508517 gatccagaaca 21508507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15369795 - 15369492
Alignment:
Q  45 attctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatg 144  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| ||||||   |||||||||||||||||  |     
T  15369795 attctaccttggggactgctaagagtcctctatatatagaggtggagggctgtagagtcgttatgatggtacacctaggtctggcggttacgaaattgta 15369696  T
Q  145 ggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcg-tttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccctt-gtgtg 242  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  |  ||||  |||||| |||| | |      
T  15369695 ggaagtgtaaccgccagacagattattgcgggaacgtgcaaagagaagttgtggttcgttttgaaccggtcttgtatgctccttgcaccgccttcgcgaa 15369596  T
Q  243 gaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcga 342  Q
    | |||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |    
T  15369595 ggaagg-gtgtgttgcaaggaatattgccaaacgtggtgtttgagctttggattatattgggcttaagtaaatgcgcctaagatccttttggccggtcca 15369497  T
Q  343 gaaca 347  Q
    |||||    
T  15369496 gaaca 15369492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15319175 - 15318989
Alignment:
Q  19 agagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcaca 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||    
T  15319175 agagtgagggtttagagaaagag-tcgattctaccttggggactgctaagagttccctatatatagaggtggagggctgcagagtcgttgtgatggtaca 15319077  T
Q  118 cctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgttt 205  Q
    |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15319076 cctaggtctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgctagagagattattgcaggaacgtgcaaagagaagttgtggttcgttt 15318989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Original strand, 18043337 - 18043472
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||    
T  18043337 cagagagagtgagggtttagaggaagagataaattctaccttggggactgcatttagtcccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatg 18043436  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaa 148  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18043437 acacgcatgactctggcgggtacgaaatcatgggaa 18043472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 349
Target Start/End: Original strand, 3876374 - 3876651
Alignment:
Q  72 ccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttatt 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| |||||    
T  3876374 ccctatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtgaagacacacctaagtctggcggttacgaaatcgtaggaagtgtaatcgtcagagagattatt 3876473  T
Q  172 gtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtgga-aaggagtgtgtcgcaagtaactttgc 270  Q
    | |||||  |||||||||||||| | | || ||||||||  |||   | |||| ||||||||||||  | ||| |||| || |||| ||||||| |||||    
T  3876474 gcgggaatatgcaaagagacgttgtagctcatttgaaccgatcttgcttgctccgtgcaccccctt-cgcggagaaggggtatgtcacaagtaagtttgc 3876572  T
Q  271 caaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagt 349  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||  ||||| ||||||| || ||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3876573 caaacgtgaagtttgggcttgggactgtgttgggcctaaataaatggacctaaagtccttttggccggtccagaacagt 3876651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 253 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19857797 - 19857705
Alignment:
Q  253 tgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaa 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19857797 tgtcgcaactaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgagcctaagtaaatgcgccaaaggtccttttggtcggtccagaa 19857705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 350
Target Start/End: Original strand, 23524248 - 23524354
Alignment:
Q  244 aaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgag 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||    
T  23524248 aaaggggtgtgtcgcaagtaactttgcaaaacgtggtgtttgggctttgggttgtattgtacctaagtaaatgggccaaaggtccctttggccggtccag 23524347  T
Q  344 aacagta 350  Q
    |||||||    
T  23524348 aacagta 23524354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 345
Target Start/End: Original strand, 18043505 - 18043607
Alignment:
Q  243 gaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcga 342  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  18043505 gaaaggggtgtatcgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttgaatggtattgggcctaagtaaatgggccaaaggtccttttggccggtcca 18043604  T
Q  343 gaa 345  Q
    |||    
T  18043605 gaa 18043607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 190
Target Start/End: Original strand, 23524128 - 23524238
Alignment:
Q  80 atagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaac 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  23524128 atagacgtggagggctgcagagccattgtaatggcacacctggctctggcggttaagaaatcgtggaaagtgtaaccatcaaagagtttattgcgggaac 23524227  T
Q  180 gtgcaaagaga 190  Q
    ||||| |||||    
T  23524228 gtgcagagaga 23524238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 334
Target Start/End: Original strand, 27964962 - 27965042
Alignment:
Q  254 gtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttgg 334  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27964962 gtcgcgagtaattttaccaaacgtggtgtttgggctttggatgatattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttgg 27965042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15318943 - 15318845
Alignment:
Q  250 gtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagt 349  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| |||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||    
T  15318943 gtgtgtcgcaagtaatattgcaaaacgtggtgtttgag-tttggattgtattgggcttaagtcaataggcctaagatcctgctggccggtccagaacagt 15318845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Original strand, 14480017 - 14480135
Alignment:
Q  39 agatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaa 138  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |  ||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||| |||   |||||||| ||  || ||| ||||||||    
T  14480017 agatagattctacctaggggactgttaagagtcccctatatataccggtgggtggctgcagagccattgtaatggcacacgtgtgtccggcagttacgaa 14480116  T
Q  139 atcatgggaagtgtaaccg 157  Q
    ||| ||| || ||||||||    
T  14480117 atcgtggaaaatgtaaccg 14480135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 235
Target Start/End: Original strand, 14467175 - 14467236
Alignment:
Q  174 gggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccc 235  Q
    |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  14467175 gggaacgtgggaagagacgttgtagttcgtttgaactggtctcttttgctttgtgcaccccc 14467236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 180; Significance: 8e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16516 - 16182
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttga-ggaagagatagattctaccttggga-actgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggc 114  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||     
T  16516 agagagtgagagtttaaaggaagagataaattctaccttgggggactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccattgtaatggt 16417  T
Q  115 acacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtc 214  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16416 acacctggctctggcggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccaccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagatgttgtggttcgtttgaaccagtc 16317  T
Q  215 tctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaa 314  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  16316 tcattcgctccgtgcacccccttgtg-ggaaaggggtgtgtcgcatgtaacttttccaaacatagtgtttgggctttgggttgtattgggcctaagtaaa 16218  T
Q  315 tgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    ||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||    
T  16217 tggaccaaaggtccttttggccagtccagaacagta 16182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28068223 - 28067893
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  28068223 agagagtgagggtttagaggaagagagagattctaccttagggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 28068124  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  28068123 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccggagagtttattgcaggaacgtgcagagagacgttgaggctcgtttgaaccagtct 28068024  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagc-tttggattgtattgaacctaagtaaa 314  Q
    |  |||||| ||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  | |||||||     
T  28068023 cgctcgctccgtgcacccccttgcg-gaaaaggag-gtgttgcaagtaagtttgccaaacgtggtgcttgtgcttttggattgtattgggcgtaagtaag 28067926  T
Q  315 tgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28067925 tgggtcaaagatccttttggccggtccagaaca 28067893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 333
Target Start/End: Original strand, 23495349 - 23495664
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt--gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggc 114  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  23495349 agagagtgaaggttttagaggaagaga--gattctacattggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggc 23495446  T
Q  115 acacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtc 214  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  23495447 acacctaactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgtctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccggtc 23495546  T
Q  215 tctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaa 314  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  23495547 tctttcgttccgtgcacccccttgcgtgg-aaggggtgtgtcgcgagtaattttgcaaaacgtggtgtttgggctttggatgatattgagcctaagtaaa 23495645  T
Q  315 tgggccaaagatccttttg 333  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  23495646 tgggtcaaagatccttttg 23495664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 5931187 - 5931508
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  5931187 cagagagagtgagggtttagagggagagatagattctatcttggggactgtcgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatg 5931286  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
     ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5931287 acacacctggttctggcggttatgaaatcgtgggaagtgcaaccgccagagagtttattgcgggaatgtgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccag 5931386  T
Q  213 tctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagt 311  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| | | ||||||||||||  |||||||    
T  5931387 tctctatcgctccgtgcaccccccttgtgtgg-aaggggtgtgtcacaagtaattttgccaaacgcgatgtttgggttgtggattgtattgggcctaagt 5931485  T
Q  312 aaatgggccaaagatccttttgg 334  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  5931486 aaatgggccaaaggtacttttgg 5931508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Original strand, 8244508 - 8244846
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||    
T  8244508 cagagagagtgagggttttgaggaagagatagattctaccttgaggactgatgtgagtcccttatttatagaggtggagggctgcagagtcgt-gtgatg 8244606  T
Q  113 gcacacc------tgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttg 206  Q
    ||||| |      || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8244607 gcacatcattacatggctctggcggttacgaaatcgtggaaagtgtaatcgctagagagtttattgggggaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttg 8244706  T
Q  207 aaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacc 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| | |||||||   |||||||||||||| | ||    
T  8244707 aaccagtctctttcgctccgtgcacccccttgcgtgg-aaggggtgtgttgcaagtaactcagccaaatgcggtgtttagactttggattgtattaagcc 8244805  T
Q  307 taagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  8244806 taagtaaatgggctaaaattccttttggccggtccagaaca 8244846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36712848 - 36712534
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  36712848 agagagtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcac 36712749  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || | || ||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  36712748 acctaactctgacggttacgaaatcgtggaaagtgtaaccacctgcgattttattgcgagaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaactagtctc 36712649  T
Q  217 tttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatg 316  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  36712648 tttcgttccgtgcaccccctagcgtgg-aaggggtgtgtcgcgggtaattttgccaaacgtggtgtttaggctttggagtgtattgggcctaagtaaatg 36712550  T
Q  317 ggccaaagatcctttt 332  Q
    || |||||||||||||    
T  36712549 ggtcaaagatcctttt 36712534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20899795 - 20899462
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    ||||||||||||||| ||    ||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||   ||||||    
T  20899795 agagagtgagggttttagaggaagaaagattcaaccttggggactgcattgagtcccctatttataaaggtggagggctgcagattcgttgtaatggcac 20899696  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20899695 acctaactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctc 20899596  T
Q  217 tttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    ||||| || ||||| |||||| | |||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  | ||||| |||    
T  20899595 tttcgttccgtgcacccccctcgcgtgg-aaggggtgtgtcgcgagtaatttttccaaacgtggtgtttgggctttggatggtactgggcttaagtgaat 20899497  T
Q  316 gggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  20899496 gggccaaagatccttttggctggtccagaacagta 20899462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5590896 - 5590612
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    ||||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||    
T  5590896 agagagtaagggtttgagaggaagaaagattctaccttggggactgcattgaatcccctatttatagaggtggagggcagcagagccgttgtaatggcac 5590797  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5590796 accttactctgacggttacgaaattgtgggaagtgtaaccgcctgcgagtttattgcgggaatgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctc 5590697  T
Q  217 tttcgctctgtgcaccc-ccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtatt 301  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5590696 tttcgttctgtgcaccctcctcgcgt-gaaaggggtctgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggagtgtatt 5590612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15620374 - 15620075
Alignment:
Q  33 aggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||   |||||||| || ||||| ||||    
T  15620374 aggaagagatagattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtgaagggctgtagagctgttgtaatggcacacttggctctgacggt 15620275  T
Q  133 tacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacc 232  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||| || ||||    
T  15620274 tacgaaattgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcagagagacgttgtggctcgtttgaacccgtctcgctcgctccgtacacc 15620175  T
Q  233 cccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatcctttt 332  Q
    ||||||   || |||| ||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||   ||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  15620174 cccttgcaagg-aaggggtgcgttgcaagtaagtttgtcaaacgtggcgtttggactttggattgtattaggcctgaataaataggccaaatatcctttt 15620076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41037854 - 41037527
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttataga---------ggtggagggctgcagagccgtt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||    
T  41037854 agagagtgagggtttagaggaagagatatattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaatttatagaggtggagggctgcggagccgtt 41037755  T
Q  107 gcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttg 206  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||| |||| ||||    
T  41037754 gtaatggcacacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgtgaacgtgcagacagatgttatcgttcatttg 41037655  T
Q  207 aaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacc 306  Q
    ||||||||||  | |||  |||||||||| |    ||||||  |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |    
T  41037654 aaccagtctcgcttgcttcgtgcaccccccttgccggaaagtggtgtgttgcaagtaagtttgccaaccgtagtgtttgggctttggattgtattgagtc 41037555  T
Q  307 taagtaaatgggccaaagatccttttgg 334  Q
    |||||||||||| || || |||||||||    
T  41037554 taagtaaatgggtcataggtccttttgg 41037527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33622664 - 33622367
Alignment:
Q  45 attctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactct---ggcggttacgaaatc 141  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||| |||||   || ||||||||||||    
T  33622664 attctatcttagggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaattacacaccttactctgacggtggttacgaaatc 33622565  T
Q  142 atgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgt 241  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||    
T  33622564 ctgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgctggaacgtagaaagagacgttggggttcgtttaaaccagtctctttcgttctgtgcaccccctcacgt 33622465  T
Q  242 ggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtc 340  Q
    || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33622464 gg-aaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacatgatgtttgggctttggattgtattgggcttaagtaaatgggtcaaagatccttttggccggtc 33622367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 42792503 - 42792700
Alignment:
Q  38 gagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacga 137  Q
    |||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42792503 gagatagattctaccttggggattgttatgagtcccctagttatagaggtggagggctgcagagcagttgtagtggcacacctggctctggcggttacga 42792602  T
Q  138 aatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccc 235  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  42792603 aatcgtgggaagtgtaaccgctagagagtttattgcgggaacgtgcagagatacgttgtgactcgtttgaaccggtctcgcttgctctgtgcaccccc 42792700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22922241 - 22922050
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  22922241 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttgggaactgttatgagtcccctatttatagaggtggagggctacagagccgttgtagtgaca 22922142  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttga 207  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  22922141 cacctggctctggtggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccgccagaaagtttattcctgaaacgtacagagagacgttgtggttcgtttga 22922050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22922838 - 22922645
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  22922838 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggattgttatgagtcccctatttatagaggtggagggctacagagccgttgtagtgaca 22922739  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaac 209  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | || ||||| ||| ||||||||||||||    
T  22922738 cacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgctgaaacatacagagagaggttgtggttcgtttgaac 22922645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Original strand, 38608267 - 38608608
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt--gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggc 114  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  38608267 agagagtgagggttttagagggagaaa-agattctaccttagggactgcattgagtcccctatttatagaggtggaggtctacagagccgttgtggaggc 38608365  T
Q  115 acacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacg---------tgcaaagagacgttatggttcgttt 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||         |||||||||||||  | ||||||||    
T  38608366 acacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccaaagagtttattgcgggaacgtgcagaatatgcaaagagacgtcgtagttcgttt 38608465  T
Q  206 gaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaa--ctttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattga 303  Q
    ||||| ||||  || | |  ||||||||||| | || | | || ||||  ||| |||||   || ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  38608466 gaaccggtcttatttgattcgtgcaccccctcgcgtag-agggggtgtaccgcgagtaaagtttagccaaacatggagtttgaactttgaattgtattga 38608564  T
Q  304 acctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  38608565 acctaagtaaatgagtcaaaggtccttttggccggtccagaaca 38608608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 347
Target Start/End: Original strand, 22510097 - 22510312
Alignment:
Q  132 ttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcac 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  22510097 ttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacatggaaagagacgttggagttcgttttaaccagtctctttcgttccgtgcac 22510196  T
Q  232 cc-ccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatcctt 330  Q
    || ||| | |||| |||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||||||| ||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22510197 ccacctcgcgtgg-aaggggtgtgtcgcgggtaattttatcaaacgtggtgtttgaactttatagtgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatcctt 22510295  T
Q  331 ttggtcggtcgagaaca 347  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  22510296 ttggccggtccagaaca 22510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Original strand, 13537860 - 13538060
Alignment:
Q  147 aagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccctt-gtgtggaa 245  Q
    ||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| | | ||||||    
T  13537860 aagtgtaaccggctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcatttgaaccagtctctttcgttccgtacacccccctcgcgtggaa 13537959  T
Q  246 aggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaa 345  Q
     || ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||    
T  13537960 ggg-gtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtgatgtttgggctttggatggtattgggcctaagtaaatggaccaaatattcttttgatcggtccagaa 13538058  T
Q  346 ca 347  Q
    ||    
T  13538059 ca 13538060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19330052 - 19329816
Alignment:
Q  88 ggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaag 187  Q
    |||||||| ||||||| |||   |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  19330052 ggagggctacagagccattgtaatggcacaccaagctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagattattgcgggaacatgcagag 19329953  T
Q  188 agacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgag 287  Q
      ||||| ||| ||||||||||| ||||   |  ||| |||||||||| |    || ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| |    
T  19329952 taacgttgtggctcgtttgaaccggtcttgctttctccgtgcacccccctcgcagggaagggatgtctcgcaagtaatgttgccaaacgtggtatttggg 19329853  T
Q  288 ctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaag 324  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19329852 ctttgaattgtattgggcctaagtaaatgggccaaag 19329816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 350
Target Start/End: Original strand, 24095343 - 24095526
Alignment:
Q  167 ttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaac 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||  | |||| ||||| |||||| | | |||  || ||||| ||||||||||    
T  24095343 ttattgcgggaacgtgcaaagagacgttggggtttgtttgaaccggtctcgcttgctccgtgcatccccctcgcgcggacggg-gtgtgccgcaagtaac 24095441  T
Q  266 tttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  24095442 gttgccaaacgtggtatttgggctttggattgtattgggcctaagtagatgggccaaaactccttttggccggtccagaacagta 24095526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 19330092 - 19330050
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttggga 58  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19330092 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggga 19330050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 157
Target Start/End: Original strand, 31393167 - 31393196
Alignment:
Q  128 gcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31393167 gcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccg 31393196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5589352 - 5589324
Alignment:
Q  305 cctaagtaaatgggccaaagatccttttg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5589352 cctaagtaaatgggccaaagatccttttg 5589324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30256 - 29923
Alignment:
Q  18 gagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    || ||    
T  30256 gagagtgaggatttagaggaagagatagattctaccttagggactgctgtgagtcccgtatttatagaggtggagggctgcagagccattgtaacggaac 30157  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30156 acctggctctggtggttacgaaattgtgggaagtgtaacctccagagattttattgcgggaacgtgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctc 30057  T
Q  217 tttcgctctgtgcacc-cccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  30056 tttcgctccgtgcacctcccttgcatgg-aaggggtgtgttgcatgtaactttgccaaacgtgctgtttgggctttggattgtgttgggcctaattaaat 29958  T
Q  316 gggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  29957 gggccaaaggtccttttggccggtccagaacagta 29923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47618 - 47396
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  47618 cagagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatg 47519  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47518 gcacacttggctctggcggttacaaaattgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccag 47419  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcaccccc 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  47418 tctctttcgctccgtgcaccccc 47396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 56329 - 56224
Alignment:
Q  245 aaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgaga 344  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||    
T  56329 aaggggtgtgtcgcaagtaacttcgccaaacgtggtgtttgggctttggattgtattgggcctaagtaaatgggccaaaggtcctttttgtcagtccaga 56230  T
Q  345 acagta 350  Q
    | ||||    
T  56229 atagta 56224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0989 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0989
Description:

Target: scaffold0989; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1724 - 1444
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||   ||    
T  1724 cagagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctttgagtgccctatttatagaggtggacggctgtagagctgttgtaatg 1625  T
Q  113 gcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccag 212  Q
    ||||||||| |||| || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1624 gcacacctggctctagcagttataaaatcgtgagaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgtagagagatgttgtggttcgtttgaaccag 1525  T
Q  213 tctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggat 295  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1524 tctctttcgctccgtgca-ccccttgtggggaaggga-tgtgtcgcaagtaacttcgccaaacgtggtgtttgggctttggat 1444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1237 - 908
Alignment:
Q  20 gagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacac 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||| ||||    
T  1237 gagtgagggtttagaggaagagatagattctacgttggagactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggctacatagccgttgtaatggaacac 1138  T
Q  119 ctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctt 218  Q
    ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||      
T  1137 ctggctctagcgattacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcaggaacatgcagagaaacgttgtggttcgtttgaaccagtctcgc 1038  T
Q  219 tcgctctgtgcacccccttgtgtgga-aaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgg 317  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| |||| || ||  |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1037 tcgctccgtgcaccccctt-cgtggagaaggggtatgctgcaagtaagtttgctaaacgtggtgtttgggctttggattgtattggacctaagtaaatgg 939  T
Q  318 gccaaagatccttttggtcggtcgagaacag 348  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  938 gccaaaggtccttttgaccggtccagaacag 908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4396 - 4065
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4396 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctctcttggggactgatgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtagtggca 4297  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||     
T  4296 cacctggctctggtggttacgaaatcgtgggatgtgtaactgcgagagagtttattgcgagaacgtgcagatagacgttgtggttcgtttgaaccggtcc 4197  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtgga-aaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaa 314  Q
    |  |||||| ||| ||||||||  ||||| |||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4196 cgctcgctccgtgaaccccctt-cgtggagaaggggtatgctgcaagtaagtttgccaaacgtggtgtttggactttggattgtatttgacctaagtaaa 4098  T
Q  315 tgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    || |||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  4097 tgagccaaatatccttttggccggtccagaaca 4065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 151490 - 151157
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttga-ggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  151490 agagagtgagggtttaaaggaagagatagattctaccttagggaatgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtagtggaa 151391  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  151390 gacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgaaac-gccagagagtttattgcaggaacgtacagagagacgttgtggttcgtttgaatcggtct 151292  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtgga-aaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaa 314  Q
    |  |||||| |||||||||||| |||||  |||| || ||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||    
T  151291 cgctcgctccgtgcaccccctt-tgtggggaaggggtatgctgcaagtaagtttgccaaacgtagtgtttgggctttggattgtattaggcctaagtaaa 151193  T
Q  315 tgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  151192 tgggccaaagatccttttggccggtccagtacagta 151157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 87 - 334
Target Start/End: Original strand, 19790346 - 19790593
Alignment:
Q  87 tggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19790346 tggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctgactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgtcagagagtttattgtgggaacgtgcaga 19790445  T
Q  187 gagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttg 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  19790446 gagacgttgtggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccccttgtctgg-aaggggcgtgtcgcaagtaactttaccaaacacggtgtttg 19790544  T
Q  286 agctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttgg 334  Q
     | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19790545 ggttttggatggtattgggcctaagtaaatgggccaatgatccttttgg 19790593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 333
Target Start/End: Original strand, 22915052 - 22915367
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||   ||| |    
T  22915052 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctatgagtcccctatttataaaggtggagagctgcagagccgttgtaatggta 22915151  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    ||| || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  22915152 cacttggctccggcggttatgaaatcgtgggaagtgtaacagctagagagtttattgcgggaacgtgaagagagacgttgtgattcgtttgaactagtct 22915251  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    |  |||||| ||||| ||||||| | |||| || |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  22915252 cgctcgctccgtgca-ccccttgcg-ggaagggggtgtgttgcaagtaaacttgtcaaacgtggtgtttgcgcttcagattgtattgggcctaagtaaat 22915349  T
Q  316 gggccaaagatccttttg 333  Q
    | ||||||  ||||||||    
T  22915350 gagccaaatgtccttttg 22915367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16853181 - 16852878
Alignment:
Q  43 agattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatca 142  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16853181 agattctcccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcaaatatgttgtaatggcacacctggctctggcggttacgaaatcg 16853082  T
Q  143 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| || ||  |||||| ||| ||| || |  |      
T  16853081 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcggtaacgtgcagagagacgttgtggcttgtttgaaccggtgtcactcgctccgtgtacctccct-cgca 16852983  T
Q  243 gaaagg-agtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcg 341  Q
    || |||  ||| ||||||||| |  || ||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||     
T  16852982 gagaggtggtgcgtcgcaagtgatgttaccaaacgtggaatttgagctttggattgtattgggcctaagt-aatggtccaaaaacccttttggccggtcc 16852884  T
Q  342 agaaca 347  Q
    ||||||    
T  16852883 agaaca 16852878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 16914706 - 16915008
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  16914706 agagagtgagggttttgaggaagagatagattctgctttggggactgttaagagccctctatatatagaggtggagggctgcagagccattgtaatggca 16914805  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    ||  |   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||  | |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||     
T  16914806 cagatcggtctggcggttacgaaatcgtgggaggtgtaaccagtagagaaataattgcgggaacgtgcaaagagacgttgcggctcgtttgaaccggtcc 16914905  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
     | | |||| || ||||||| |    |  | || || |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||  |||||||||||    
T  16914906 ttcttgctccgttcacccccctcacggagagggggtatgtcgcaagtaagttttccaaacgtggtgtttgggtatgggattgtattgggcctaagtaaat 16915005  T
Q  316 ggg 318  Q
    |||    
T  16915006 ggg 16915008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 349
Target Start/End: Original strand, 44635823 - 44636081
Alignment:
Q  92 ggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagac 191  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||    
T  44635823 ggctgcagagccgttgtaatggcacacgtgagtccgtcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagagattcgcgggaacgtgcgaagagac 44635922  T
Q  192 gttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagcttt 291  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||  | |||| || || ||||||    || |||  |||||| || |||||  ||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  44635923 gttgtagttcgtttgaactagtctcgcttgctccgtacatccccttcgcggggaagcggtgtgttgcgagtaatgttgtcaaacatggtatttgaccttt 44636022  T
Q  292 gga-ttgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagt 349  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||  ||||| ||||||||    
T  44636023 cgatttgtattgagcctaagtaaatgggcctaatgttcttttgaccggtctagaacagt 44636081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Original strand, 1998003 - 1998087
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgc 97  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1998003 cagagagagtgagggtttagagacagagacagattctaccttggggactgctttgagtaccctatttatagaggtggagagctgc 1998087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3559317 - 3559006
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||   |||      
T  3559317 agagaatgagggtttagagggagag-tagattctaccttgggaactgttaagagtcccctatatatagagatgggtggctgcagagccgttgtaatggtt 3559219  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    ||  ||   ||| | ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||    ||| |||||| ||| |||||| |||   ||||||||||||| ||||    
T  3559218 catgtgttcctg-cagttacgaaatcgtggaaagtgtaacctccaaagagagatttgcgggaacatgcgaagagatgttgcagttcgtttgaaccggtct 3559120  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    | || |||||||||||||||| | | || |||| |||||| || |||||  |||||||| | ||| |||| || ||||||  ||||||  ||| ||||||    
T  3559119 cgtttgctctgtgcaccccctcgcg-gggaaggggtgtgttgcgagtaatgttgccaaatgcggtatttgggc-ttggataatattgagactatgtaaat 3559022  T
Q  316 gggccaaagatccttt 331  Q
    ||||| ||||||||||    
T  3559021 gggcctaagatccttt 3559006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 19773386 - 19773462
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttg--aggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggag 91  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19773386 agagagtgagggtttagaaggaagagatagattctaccttggggactgctgtgagtctcctatttatagaggtggag 19773462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 107
Target Start/End: Original strand, 22006519 - 22006583
Alignment:
Q  43 agattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttg 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22006519 agattctaccttggggactgctacgagtcccttatatatagaggtggagggctgcagagtcgttg 22006583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 107
Target Start/End: Original strand, 22014036 - 22014100
Alignment:
Q  43 agattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttg 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22014036 agattctaccttggggactgctacgagtcccttatatatagaggtggagggctgcagagtcgttg 22014100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13016636 - 13016461
Alignment:
Q  143 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||   ||||  | ||| |||||||||| ||||| |    
T  13016636 tgggaagtgtaaccgccagagagagattcgcgggaacgtgcgaagagacgttgtagttcgtttgaactgatctcgcttgctatgtgcacccctttgtg-g 13016538  T
Q  243 gaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggc 319  Q
    | |||| |||||| |||  |||  ||||||||||| || |||| |||| |  ||||| ||  |||||||||||||||    
T  13016537 ggaaggggtgtgttgcacataatgttgccaaacgttgtatttgggcttggatttgtactgggcctaagtaaatgggc 13016461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Original strand, 1609 - 1861
Alignment:
Q  18 gagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||     
T  1609 gagagtgagggtttagaggaagagatagattctacattggggactgttgtgagtcccctatttatagaggtggatggctgcagagccgttgtaatggcat 1708  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagag-tttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1709 acttggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagttttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccaatct 1808  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttg 269  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||    
T  1809 ctttcgctccgggcacccccttgtgtgg-aaggggtatgttgcaagtaactttg 1861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 15365 - 15517
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15365 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccgcggggactgttatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcaatggca 15464  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagttt 168  Q
      |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15465 tgcctgactctggcggttactaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagttt 15517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 320
Target Start/End: Original strand, 15520 - 15603
Alignment:
Q  236 ttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggcc 320  Q
    |||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||  | ||||||||||||||    
T  15520 ttgtgtggaaggg-gtatgttgcaagtaactttgccaaacgcgttgtttgagcttggtattgtattgggcataagtaaatgggcc 15603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 15692 - 15741
Alignment:
Q  291 tggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtc 340  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15692 tggattgtattgggcctaaataaataggccaaagatccttctggtcggtc 15741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 350
Target Start/End: Original strand, 68689 - 69007
Alignment:
Q  32 gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcgg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||  || ||||||    
T  68689 gaggaagatatagattctaccttgggcactgcggtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatgacacaccttgctttggcgg 68788  T
Q  132 ttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcac 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  | |||| ||||||    
T  68789 ttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgctagagagtttattgcgggaacgtgggaagagacgttgtggctcgtttgaactagtctcggttgctccgtgcac 68888  T
Q  232 ccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttt 331  Q
    |||| |    |  |||| |||||||||||||||  |||| |||||||| || || |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  68889 ccccctcgcagagaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgcaaaacgtggagtctgggctttgaattgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttt 68988  T
Q  332 tggtcggtcgagaacagta 350  Q
    ||| ||||  |||||||||    
T  68989 tggccggttcagaacagta 69007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 216
Target Start/End: Original strand, 74861 - 75045
Alignment:
Q  32 gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||| |    
T  74861 gaggaagagatagattctaccttggggaatgcggtgagtcccctatttatagaggtggagggctgtagagccgttgtaatggcacacctggctctggcag 74960  T
Q  132 ttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  74961 ttatgaaatcgtcggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcggagacacgttgtggctcgtttgaaccagtctc 75045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7548 - 7233
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    |||| |||||||||||||    ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  7548 agagggtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggggattgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatggcac 7449  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    |||| |||||| || |||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7448 accttactctgacg-ttacgaaatcgttggaagtgtaactgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctc 7350  T
Q  217 tttcgctctgtgca--cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaa 314  Q
    ||||| || |||||  |||||| |||||| | || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| || ||| ||||    
T  7349 tttcgttccgtgcaccccccctcgtgtgg-agggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacttggtgtttgggctttggatgatattggacataaataaa 7251  T
Q  315 tgggccaaagatcctttt 332  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7250 tgggccaaagatcctttt 7233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 339
Target Start/End: Original strand, 242673 - 242996
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | |||| ||||   ||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||    
T  242673 agagagtgaggatttagaggaagagttagattctatcctggggactgaagtgagtactctatatatagaggtggagggcggcagagccgttgtaatggca 242772  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  242773 cacctggctcttgcggttacgtaatcgtgggaagtgtaactgccaaagagtttattgcgggaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaaccggtct 242872  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
       |||||| |||||||| | | |  || |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  242873 tgctcgctccgtgcacccgcctatcggggaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacttggtgtttgggctttagattgtattgggcctaagtaaat 242972  T
Q  316 gggccaaagatccttttggtcggt 339  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  242973 gggacaaaggtccttttggccggt 242996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 334
Target Start/End: Original strand, 253313 - 253631
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| || |||||   |||||    
T  253313 agagagtgacggtttagaggaagagttagattctaccttggggactgtagtgagtcccctatatataaaggtggacggctgcaaagtcgttgtaatggca 253412  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  253413 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaactgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagatgttgtggttcatttgaaccggtct 253512  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
        | ||| |||||| ||| | |  || |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  253513 tgcactctccgtgcactcccctctcggggaaggggtgtgtcgcacgtaatgttgccaaacgtggtgtttgggatttggattgtattgggcctaagaaaat 253612  T
Q  316 gggccaaagatccttttgg 334  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  253613 gggccaaaggttcttttgg 253631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11045 - 10741
Alignment:
Q  43 agattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatca 142  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11045 agattctcccttggggactccattgagtccactatttataaaggtggagggctgtagagccgttgtaatggcacacctaactctgacggttacgaaatca 10946  T
Q  143 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcac-ccccttgtgt 241  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||  | ||| |||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||| |  |    
T  10945 tgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacatggaaagagacgttgggtttcttttgaaccggtctctttcgttccttgcactcccctcgcat 10846  T
Q  242 ggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcg 341  Q
    || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     
T  10845 gg-aaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatggtattgggcctaagtgaatgggccaaagatccttttggccgatcc 10747  T
Q  342 agaaca 347  Q
    ||||||    
T  10746 agaaca 10741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Original strand, 14872 - 15211
Alignment:
Q  17 agagagtgagggtttgaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcac 116  Q
    ||||||||||||||| ||    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||   ||||||    
T  14872 agagagtgagggttttagaggaagaaagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttataaaggtggatggccgcagagccgttgtaatggcac 14971  T
Q  117 acctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctc 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||  ||||    
T  14972 acctaactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaacagcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgctggggttcgtttgaaccgatctc 15071  T
Q  217 tttcgctctgtgca-------cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaa 309  Q
    ||||| || |||||       ||||||   |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||    
T  15072 tttcgttccgtgcacccccccccccctcacgtgg-aaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatagtactgggcctaa 15170  T
Q  310 gtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  15171 gtgaatgggccaaagatccttttggccggtccaggacagta 15211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 17200 - 17386
Alignment:
Q  163 gagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgca-cccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaag 261  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | |||| |||| ||||||| | ||    
T  17200 gagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttccgtgcacccccctcgcgtgg-aaggggtgtgtcacgag 17298  T
Q  262 taactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagt 349  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  17299 taattttgccaaacgtggtgtttgggatttggatggtactgggcctaagtgaatgggccaaagattcttttggccggtccagaacagt 17386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 120
Target Start/End: Original strand, 17113 - 17190
Alignment:
Q  43 agattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacct 120  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  17113 agattctaccttggagactgcattgagtcccatatttatagaggtggagggctgcagagctgttgtaatggcacacct 17190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Original strand, 12323 - 12651
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||   || | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  12323 agagagtgagggtttagaggaatagttagattataccttggggtttgttatgagtcccctatatatagaggtgaagggctgcagagccgttgtaatggca 12422  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  | ||||||| ||| || ||| |||| ||||    
T  12423 caccaggctctggcggttacaaaatcatgggaagtgtaaccgctagagagattattgcgggaacgtgc--acagacgttgtggctcatttaaaccggtct 12520  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
      ||||||||||||| ||||| | |  ||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  12521 tgttcgctctgtgcatcccctcgcggagaatgg-gtgtgtcgcaagtaatgttgcaaaacgtggtgtttgggctttgaattgtattaggcctaagtaaat 12619  T
Q  316 gggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  12620 gggccaaagctccttttggccggtccagaaca 12651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 54770 - 54471
Alignment:
Q  49 taccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatgggaa 148  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54770 tacctttgggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcatagccgttgtaatggtacaccttactctgacggttacgaaatcatgggaa 54671  T
Q  149 gtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccctt-gtgtggaaag 247  Q
    |||||||| || | |||||||||| ||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| | | |||||  |    
T  54670 gtgtaaccacctgtgagtttattgcgggaacgtggagagagacgttgggtttcgtttgaaccagtctccttcgttccgtgcgcccccctcgcgtgga--g 54573  T
Q  248 gagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    | ||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||| |||||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  54572 gggtgtgtctcgagtaattttgccaaacgtggattttgggctttgtagtgtattgggtctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccagaaca 54473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 115; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37425 - 37095
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||| | |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  37425 agagagtgagggttaagagggagagattgattctatcttgcggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtgatggca 37326  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    | || | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| | ||||    
T  37325 cgccaggctctggcggttatgaaatcgtgggaagtgtaaccg-cagagagattattgcaggaacatgcagagagacgttgcggtttgtttgaatcggtct 37227  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgt-gtgga-aaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaa 313  Q
       | ||||||||||||||  ||| | ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  37226 tgcttgctctgtgcacccc--tgtcgcggagaaggggtgtgtcgcaagtaacactgccaaacgtggtattttagatttggattgtattgagcctaagtaa 37129  T
Q  314 atgggccaaagatccttttggtcggtcgagaaca 347  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  37128 atgggtcaaagctccttttgaccggtccagaaca 37095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3029 - 2694
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || |||| | |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||    
T  3029 agagagtgagggcttcgagaaagagttagattctaccttcgggactgttatgagtccc-tatatatagaggtggagagctgcagagctgttgtaatggca 2931  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||||    
T  2930 caccaggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgctagagagattattactggaacgtgcagagagacattgtgtttcgtttgaaccggtct 2831  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgt-gtgga-aaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaa 313  Q
      ||||||| ||||||||||   | |  || ||||  ||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||   |||| ||||    
T  2830 tgttcgctccgtgcacccccccctcgcagagaagggttgtgtagcaagtaatgttgccaaagatggtgtttgggctttgaattgtattaggcctatgtaa 2731  T
Q  314 atgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagta 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  2730 atgggccaaagctccttttggtcggtccaaaacagta 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 323
Target Start/End: Original strand, 9243 - 9437
Alignment:
Q  125 ctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaa-ccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgct 223  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    |||||    
T  9243 ctggcggttacgaaattgtgggaagtgtaaaccgctagagagtttattgcaggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtc----tcgct 9338  T
Q  224 ctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaa 323  Q
    | |||||||  || | | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9339 ccgtgcacctgctcgcg-ggaaaggggtgtgtcgcaagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttgaatagtattggacccaagtaaatgggccaaa 9437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 19147 - 19237
Alignment:
Q  14 cagagagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagcc 103  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19147 cagagagagtgaggatttagaggaagagatagattctaccttggggactgcagtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagcc 19237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 241 - 347
Target Start/End: Original strand, 1968 - 2074
Alignment:
Q  241 tggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtc 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  1968 tggaaaggggtgtgtcgcaagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttgaatagtattggacccaagtaaatgggccaaaactccttttggccggtc 2067  T
Q  341 gagaaca 347  Q
     ||||||    
T  2068 cagaaca 2074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20455 - 20154
Alignment:
Q  45 attctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggcacacctgactctggcggttacgaaatcatg 144  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||  ||  |||||||| ||||  ||    
T  20455 attctaccttggggactgttaagagtcccctatttttagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggtacacttgggtcaagcggttacaaaattgtg 20356  T
Q  145 ggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccctt-gtgtgg 243  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||||||| | ||   |||||| |||||  |||||| |||  |||||  | |||||| |||||||||| | |  |    
T  20355 ggaagtgtaaccgctagagaaataattgtgggagcatgttgagagacattatgactcgtttaaactggtctcgcttgctctgcgcacccccttcgcgatg 20256  T
Q  244 aaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgag 343  Q
     |||| ||||||| |||||||  || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||| ||||||| || ||| ||    
T  20255 -aaggggtgtgtcacaagtaatatttccaaacgtggtatttg-ggtttggattgtattgctcctcggtaaatgggcctaagacccttttgatcagtctag 20158  T
Q  344 aaca 347  Q
    ||||    
T  20157 aaca 20154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36978 - 36664
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |  |||| |  ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||    
T  36978 agagaatgagggtttagagggagag-tagattctaccttagagactgttaagagtcccctatatatagaggtgggtggctgtagagccgttgtaatggca 36880  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcaaagagacgttatggttcgtttgaaccagtct 215  Q
    ||| ||  || | ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||    ||| |||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||   |||    
T  36879 cacgtgtgtccgacggttacgaaattgtgggaagtgtaacctccaaagagagatttgcgggaacttgcgaagagacgttgcagttcgtttgaactgttct 36780  T
Q  216 ctttcgctctgtgcacccccttgtgtggaaaggagtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaat 315  Q
    |  | |||||||||| | | ||    || |||| |||||| || |||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36779 cgcttgctctgtgcatctcgttcgcggggaaggggtgtgttgcgagtaatgttgccaaacgtggtatttgggc-ttggattgtattggacctaagaaaat 36681  T
Q  316 gggccaaagatcctttt 332  Q
    ||| | |||||||||||    
T  36680 gggactaagatcctttt 36664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 86562 - 86424
Alignment:
Q  17 agagagtgagggttt-gaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcggtggca 115  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||   |||||    
T  86562 agagagtgagagtttagaggaagaaatagattctatcttcgggactgctatgagtcccctatatatagaggtggagggttgcaaagtcgttgtaatggca 86463  T
Q  116 cacctgactctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaa 154  Q
    |||  | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  86462 cactaggctctggcgattacgaaatcgtggaaagtgtaa 86424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 349
Target Start/End: Original strand, 18227 - 18309
Alignment:
Q  267 ttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgaacctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcgagaacagt 349  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||    
T  18227 ttgccaatcgtggagtctgagctttgaatagtatttggcctaagtaaatgggccaaaggtccttttggccggtccaaaacagt 18309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16082 - 15998
Alignment:
Q  127 ggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtg--caaagagacgttatggttcgtttgaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  | |||||||||||   ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  16082 ggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccggtgagatattcgtgggaacgtggataaagatacgttacagttcgtttgaac 15998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University