View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1831_low_48 (Length: 249)

Name: NF1831_low_48
Description: NF1831
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1831_low_48
NF1831_low_48
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-235)||(3806-4040)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (1-235)||(5738102-5738336)
chr6 (1-235)||(3596799-3597033)
chr6 (1-235)||(2379102-2379336)
chr6 (2-235)||(1125754-1125987)
chr6 (1-235)||(20185617-20185850)
chr6 (1-235)||(22150141-22150374)
chr6 (5-235)||(17106632-17106861)
chr6 (5-235)||(30655316-30655546)
chr6 (1-235)||(6513128-6513362)
chr6 (1-235)||(26942453-26942686)
chr6 (1-235)||(9953836-9954069)
chr6 (1-235)||(23384770-23385005)
chr6 (1-235)||(14281538-14281772)
chr6 (5-235)||(10289845-10290074)
chr6 (1-235)||(11402129-11402363)
chr6 (1-233)||(13005063-13005295)
chr6 (1-234)||(28111784-28112015)
chr6 (1-231)||(9839412-9839642)
chr6 (1-231)||(22561181-22561411)
chr6 (1-235)||(11125715-11125947)
chr6 (1-235)||(28230467-28230700)
chr6 (7-235)||(2846174-2846403)
chr6 (1-235)||(19475875-19476108)
chr6 (1-235)||(23007933-23008167)
chr6 (1-235)||(23780197-23780431)
chr6 (4-221)||(28107808-28108027)
chr6 (24-217)||(7128190-7128382)
chr6 (7-235)||(11247634-11247861)
chr6 (17-235)||(5259809-5260024)
chr6 (1-235)||(13946891-13947124)
chr6 (1-235)||(24410171-24410404)
chr6 (1-235)||(18856043-18856276)
chr6 (1-234)||(24400053-24400285)
chr6 (1-235)||(4512345-4512582)
chr6 (23-232)||(28848716-28848926)
chr6 (53-235)||(12988195-12988377)
chr6 (23-232)||(13021293-13021503)
chr6 (71-235)||(24371146-24371311)
chr6 (78-221)||(11192673-11192820)
chr6 (5-91)||(23842820-23842906)
chr6 (1-188)||(26896277-26896463)
chr6 (140-228)||(2372201-2372289)
chr6 (1-90)||(32109685-32109774)
chr6 (78-235)||(31072177-31072320)
chr6 (1-93)||(23847783-23847874)
chr6 (34-84)||(23667721-23667771)
chr6 (5-72)||(2372293-2372355)
chr6 (198-235)||(11188130-11188167)
[»] chr3 (81 HSPs)
chr3 (1-235)||(2775437-2775671)
chr3 (1-235)||(7486526-7486760)
chr3 (1-235)||(2778680-2778914)
chr3 (1-235)||(45896336-45896570)
chr3 (1-235)||(24125455-24125688)
chr3 (1-235)||(24128732-24128965)
chr3 (1-235)||(25584632-25584866)
chr3 (1-235)||(2873520-2873753)
chr3 (1-235)||(43926791-43927024)
chr3 (1-235)||(10884813-10885046)
chr3 (1-235)||(29343879-29344113)
chr3 (1-235)||(49742924-49743158)
chr3 (1-235)||(10106604-10106837)
chr3 (1-235)||(30690692-30690925)
chr3 (1-235)||(54723697-54723931)
chr3 (1-235)||(538782-539016)
chr3 (1-235)||(16184692-16184926)
chr3 (1-235)||(16243829-16244062)
chr3 (1-235)||(43809535-43809769)
chr3 (1-235)||(52199869-52200102)
chr3 (6-235)||(55034870-55035099)
chr3 (1-235)||(50461553-50461787)
chr3 (1-234)||(10881437-10881669)
chr3 (1-238)||(19301510-19301746)
chr3 (1-230)||(35751401-35751630)
chr3 (1-235)||(3840472-3840706)
chr3 (5-235)||(20728656-20728885)
chr3 (1-235)||(23298620-23298854)
chr3 (1-235)||(53815784-53816017)
chr3 (1-235)||(11190482-11190716)
chr3 (5-235)||(17040031-17040260)
chr3 (1-235)||(18644773-18645007)
chr3 (1-234)||(32287328-32287561)
chr3 (1-235)||(6434783-6435016)
chr3 (1-235)||(27091850-27092083)
chr3 (1-235)||(19304694-19304927)
chr3 (1-234)||(28008076-28008307)
chr3 (1-235)||(31549127-31549361)
chr3 (1-230)||(9392695-9392923)
chr3 (1-235)||(47051451-47051685)
chr3 (1-235)||(8461492-8461725)
chr3 (1-235)||(47054881-47055115)
chr3 (32-235)||(32367165-32367367)
chr3 (1-235)||(35412471-35412699)
chr3 (5-235)||(11784721-11784951)
chr3 (1-235)||(12561239-12561472)
chr3 (5-235)||(15195311-15195540)
chr3 (1-235)||(54719927-54720160)
chr3 (27-235)||(22416865-22417072)
chr3 (5-235)||(41976971-41977186)
chr3 (4-235)||(48064043-48064273)
chr3 (1-235)||(46884897-46885129)
chr3 (6-235)||(55032010-55032226)
chr3 (1-169)||(18641777-18641945)
chr3 (1-235)||(25442864-25443098)
chr3 (1-235)||(17141364-17141597)
chr3 (1-195)||(54461010-54461204)
chr3 (7-234)||(17545812-17546040)
chr3 (23-235)||(18542506-18542719)
chr3 (1-227)||(34983858-34984083)
chr3 (7-230)||(3292970-3293194)
chr3 (1-235)||(30220010-30220247)
chr3 (1-235)||(17531661-17531888)
chr3 (23-235)||(22993724-22993937)
chr3 (62-235)||(28265833-28266005)
chr3 (5-230)||(17528770-17528990)
chr3 (5-197)||(22783593-22783788)
chr3 (5-197)||(22787957-22788152)
chr3 (97-235)||(52988361-52988498)
chr3 (1-101)||(28266006-28266106)
chr3 (1-109)||(52309620-52309728)
chr3 (23-221)||(282218-282416)
chr3 (128-242)||(27308717-27308830)
chr3 (1-75)||(52990815-52990889)
chr3 (131-217)||(27308157-27308243)
chr3 (128-235)||(27298594-27298701)
chr3 (1-38)||(25486290-25486327)
chr3 (6-66)||(31857847-31857910)
chr3 (100-151)||(31857804-31857854)
chr3 (1-43)||(37408828-37408870)
chr3 (203-235)||(31857772-31857804)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (1-235)||(45941288-45941522)
chr1 (1-235)||(21107309-21107542)
chr1 (1-235)||(49498515-49498749)
chr1 (1-235)||(1950473-1950706)
chr1 (1-235)||(20398725-20398959)
chr1 (1-235)||(28110928-28111162)
chr1 (1-234)||(49853096-49853328)
chr1 (1-235)||(23021941-23022175)
chr1 (2-235)||(21018486-21018718)
chr1 (1-235)||(41058320-41058553)
chr1 (1-235)||(6070971-6071205)
chr1 (1-235)||(45960762-45960996)
chr1 (1-230)||(37183881-37184110)
chr1 (1-235)||(2794100-2794333)
chr1 (1-235)||(31204710-31204944)
chr1 (1-235)||(673088-673324)
chr1 (1-227)||(29643239-29643464)
chr1 (24-235)||(3796867-3797077)
chr1 (23-235)||(27355727-27355940)
chr1 (7-235)||(34732385-34732612)
chr1 (1-206)||(27354962-27355165)
chr1 (5-235)||(905707-905940)
chr1 (1-134)||(21111176-21111309)
chr1 (23-235)||(21434515-21434728)
chr1 (1-235)||(2405382-2405615)
chr1 (23-232)||(7635520-7635730)
chr1 (23-235)||(27331817-27332022)
chr1 (7-135)||(11667025-11667153)
chr1 (21-159)||(42022587-42022720)
chr1 (1-68)||(21114516-21114583)
chr1 (44-157)||(16055629-16055742)
chr1 (23-157)||(13430998-13431133)
chr1 (129-235)||(11668171-11668277)
chr1 (23-138)||(34065202-34065317)
chr1 (23-157)||(16056842-16056977)
chr1 (23-157)||(16061008-16061143)
chr1 (23-82)||(30938601-30938661)
chr1 (168-234)||(34066626-34066692)
chr1 (148-197)||(16062347-16062396)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (1-235)||(1-235)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-235)||(62388-62621)
scaffold0035 (1-219)||(63746-63963)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (5-235)||(23224932-23225162)
chr7 (1-235)||(8276843-8277077)
chr7 (1-235)||(4546727-4546960)
chr7 (1-235)||(17730672-17730905)
chr7 (5-235)||(20594121-20594350)
chr7 (1-235)||(26557357-26557590)
chr7 (1-235)||(48645332-48645565)
chr7 (5-235)||(4596036-4596265)
chr7 (1-235)||(2441301-2441535)
chr7 (1-229)||(13449799-13450027)
chr7 (1-235)||(6603316-6603550)
chr7 (1-235)||(45287092-45287325)
chr7 (1-235)||(9864749-9864983)
chr7 (1-235)||(13842498-13842731)
chr7 (1-235)||(16165606-16165840)
chr7 (1-226)||(9271488-9271705)
chr7 (1-235)||(26136151-26136384)
chr7 (1-227)||(37415446-37415673)
chr7 (5-235)||(9132787-9133016)
chr7 (1-235)||(26144531-26144764)
chr7 (4-235)||(14683470-14683700)
chr7 (1-235)||(10469002-10469235)
chr7 (1-235)||(37166170-37166403)
chr7 (1-235)||(3068000-3068233)
chr7 (1-160)||(45290503-45290661)
chr7 (1-235)||(20080741-20080974)
chr7 (1-134)||(11919888-11920021)
chr7 (85-235)||(11398132-11398282)
chr7 (1-156)||(4542734-4542888)
chr7 (7-235)||(18562561-18562790)
chr7 (14-206)||(13809553-13809745)
chr7 (7-235)||(5242180-5242409)
chr7 (7-235)||(7227385-7227613)
chr7 (7-235)||(5796409-5796638)
chr7 (122-235)||(4695382-4695494)
chr7 (58-235)||(10345072-10345248)
chr7 (1-104)||(35961079-35961182)
chr7 (106-227)||(37423085-37423205)
chr7 (1-82)||(4695491-4695572)
chr7 (143-235)||(22611771-22611863)
chr7 (78-235)||(24918052-24918209)
chr7 (2-58)||(11398073-11398129)
chr7 (98-212)||(2090486-2090600)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (1-235)||(26752719-26752953)
chr5 (1-235)||(41876782-41877016)
chr5 (1-235)||(34831635-34831868)
chr5 (1-235)||(41306545-41306778)
chr5 (1-235)||(4099535-4099768)
chr5 (1-235)||(20055645-20055878)
chr5 (1-235)||(22936955-22937189)
chr5 (1-235)||(26895622-26895855)
chr5 (5-235)||(18952564-18952793)
chr5 (1-235)||(42062792-42063026)
chr5 (4-235)||(43491626-43491857)
chr5 (1-235)||(7270887-7271120)
chr5 (1-231)||(21332698-21332927)
chr5 (1-227)||(21335716-21335941)
chr5 (1-235)||(7624973-7625207)
chr5 (1-235)||(31863571-31863819)
chr5 (1-235)||(33551993-33552225)
chr5 (1-235)||(14016156-14016390)
chr5 (1-235)||(40583120-40583353)
chr5 (1-235)||(14375813-14376059)
chr5 (1-235)||(12058510-12058743)
chr5 (1-235)||(17664423-17664655)
chr5 (1-235)||(34133001-34133234)
chr5 (1-235)||(34143232-34143465)
chr5 (5-235)||(39192199-39192430)
chr5 (1-235)||(12087829-12088062)
chr5 (7-235)||(21914992-21915221)
chr5 (52-235)||(2837174-2837357)
chr5 (1-235)||(17748311-17748544)
chr5 (1-235)||(26292662-26292895)
chr5 (1-235)||(26907473-26907706)
chr5 (1-235)||(28787347-28787573)
chr5 (1-176)||(22131159-22131334)
chr5 (1-131)||(37215019-37215149)
chr5 (14-235)||(18239527-18239748)
chr5 (116-235)||(32837888-32838007)
chr5 (99-235)||(30066213-30066348)
chr5 (23-230)||(18765681-18765889)
chr5 (54-234)||(11959245-11959421)
chr5 (147-230)||(23044040-23044123)
chr5 (64-221)||(563340-563497)
chr5 (23-231)||(31575288-31575499)
chr5 (1-117)||(23044130-23044246)
chr5 (1-66)||(30066348-30066413)
chr5 (173-235)||(22130135-22130197)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (1-235)||(24150542-24150776)
chr4 (1-235)||(39501518-39501752)
chr4 (1-235)||(34017799-34018033)
chr4 (1-235)||(40616826-40617060)
chr4 (1-235)||(48637375-48637609)
chr4 (5-235)||(5672765-5672995)
chr4 (1-231)||(19820602-19820831)
chr4 (1-235)||(52006549-52006782)
chr4 (1-235)||(52530953-52531187)
chr4 (1-235)||(56195397-56195631)
chr4 (5-235)||(5670447-5670677)
chr4 (1-235)||(18911369-18911602)
chr4 (1-234)||(24044159-24044391)
chr4 (1-232)||(15431952-15432182)
chr4 (1-235)||(37103234-37103466)
chr4 (1-235)||(40794872-40795106)
chr4 (1-235)||(44808973-44809207)
chr4 (4-235)||(5681298-5681528)
chr4 (1-235)||(3718994-3719227)
chr4 (1-235)||(3797826-3798059)
chr4 (1-235)||(27014133-27014367)
chr4 (1-235)||(27677073-27677306)
chr4 (1-235)||(40903101-40903335)
chr4 (1-235)||(34319935-34320169)
chr4 (5-231)||(44164657-44164882)
chr4 (1-235)||(15812154-15812389)
chr4 (1-235)||(12782775-12783008)
chr4 (1-235)||(15429874-15430107)
chr4 (1-235)||(48415547-48415781)
chr4 (1-235)||(56198723-56198957)
chr4 (4-235)||(38283510-38283740)
chr4 (1-235)||(12238135-12238369)
chr4 (1-235)||(15436488-15436721)
chr4 (3-235)||(15164062-15164295)
chr4 (5-235)||(19859544-19859773)
chr4 (1-235)||(29324695-29324929)
chr4 (1-235)||(19864535-19864764)
chr4 (1-235)||(15405099-15405336)
chr4 (1-235)||(18673100-18673333)
chr4 (1-235)||(33926842-33927076)
chr4 (1-235)||(46955496-46955730)
chr4 (5-232)||(49270556-49270779)
chr4 (1-235)||(33408335-33408569)
chr4 (39-235)||(15446792-15446987)
chr4 (1-219)||(30392455-30392672)
chr4 (7-235)||(53094377-53094605)
chr4 (5-235)||(11195546-11195775)
chr4 (1-235)||(21419659-21419892)
chr4 (1-235)||(53009576-53009809)
chr4 (7-235)||(8877525-8877753)
chr4 (1-235)||(40493385-40493619)
chr4 (7-235)||(8874785-8875013)
chr4 (1-235)||(25961928-25962162)
chr4 (31-235)||(35509835-35510038)
chr4 (23-235)||(22172413-22172626)
chr4 (95-232)||(27679337-27679473)
chr4 (1-221)||(29544892-29545111)
chr4 (106-234)||(19827361-19827488)
chr4 (8-234)||(37739783-37740013)
chr4 (1-139)||(5706355-5706496)
chr4 (23-235)||(33493732-33493947)
chr4 (98-235)||(48014167-48014304)
chr4 (22-234)||(5677447-5677650)
chr4 (1-68)||(39498346-39498413)
chr4 (1-48)||(15445383-15445430)
chr4 (81-171)||(8448654-8448744)
chr4 (1-53)||(35510043-35510095)
chr4 (181-221)||(24410206-24410246)
chr4 (4-63)||(8448590-8448648)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (1-235)||(8888489-8888722)
chr2 (1-235)||(37279695-37279929)
chr2 (1-235)||(42368730-42368963)
chr2 (4-235)||(11347917-11348148)
chr2 (4-235)||(43207912-43208142)
chr2 (1-235)||(24234948-24235182)
chr2 (1-235)||(25959707-25959941)
chr2 (1-235)||(24238220-24238454)
chr2 (4-234)||(31585962-31586192)
chr2 (1-235)||(40781325-40781558)
chr2 (1-235)||(5105579-5105813)
chr2 (5-235)||(9185447-9185677)
chr2 (1-235)||(30274787-30275021)
chr2 (1-235)||(25820865-25821098)
chr2 (2-227)||(26365794-26366019)
chr2 (1-235)||(6826625-6826857)
chr2 (1-235)||(9188671-9188905)
chr2 (1-235)||(22020920-22021154)
chr2 (1-235)||(31427560-31427794)
chr2 (1-235)||(36808461-36808694)
chr2 (1-235)||(25870637-25870870)
chr2 (1-235)||(25138950-25139184)
chr2 (1-235)||(43723553-43723786)
chr2 (4-235)||(27266641-27266872)
chr2 (1-235)||(9966388-9966622)
chr2 (1-235)||(13971913-13972146)
chr2 (1-235)||(45453726-45453960)
chr2 (2-235)||(38015371-38015604)
chr2 (1-227)||(45493175-45493400)
chr2 (1-227)||(45500917-45501142)
chr2 (1-235)||(25874028-25874267)
chr2 (5-235)||(5666371-5666600)
chr2 (4-235)||(33310519-33310750)
chr2 (1-235)||(45457014-45457248)
chr2 (1-208)||(29440375-29440581)
chr2 (5-227)||(16178988-16179209)
chr2 (5-235)||(1386445-1386674)
chr2 (32-235)||(16790807-16791011)
chr2 (1-235)||(37937238-37937471)
chr2 (1-235)||(12219649-12219882)
chr2 (1-235)||(40259158-40259391)
chr2 (24-235)||(3875139-3875349)
chr2 (1-230)||(22630699-22630927)
chr2 (1-235)||(17876959-17877192)
chr2 (1-235)||(17874606-17874834)
chr2 (1-126)||(10600876-10601001)
chr2 (14-234)||(30926401-30926614)
chr2 (23-230)||(35521401-35521613)
chr2 (23-166)||(34682622-34682764)
chr2 (152-235)||(10600799-10600876)
chr2 (183-235)||(17876211-17876263)
chr2 (53-227)||(11187946-11188120)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-235)||(19266-19500)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (1-235)||(5223-5456)
[»] scaffold0520 (3 HSPs)
scaffold0520 (1-235)||(8237-8470)
scaffold0520 (1-216)||(1566-1780)
scaffold0520 (191-235)||(4187-4231)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (1-235)||(18721299-18721533)
chr8 (1-234)||(16953645-16953878)
chr8 (1-235)||(12582876-12583109)
chr8 (1-235)||(18825905-18826139)
chr8 (1-235)||(25591497-25591730)
chr8 (1-235)||(25594675-25594909)
chr8 (1-235)||(45155287-45155521)
chr8 (1-235)||(14421612-14421847)
chr8 (1-235)||(5538791-5539025)
chr8 (1-235)||(18824412-18824646)
chr8 (1-235)||(17930849-17931082)
chr8 (1-235)||(36710654-36710888)
chr8 (1-221)||(21279787-21280006)
chr8 (5-235)||(13196725-13196954)
chr8 (11-235)||(23643687-23643911)
chr8 (36-235)||(22173976-22174175)
chr8 (1-235)||(5980331-5980564)
chr8 (1-235)||(10663767-10664000)
chr8 (1-227)||(25230956-25231182)
chr8 (5-235)||(43681892-43682122)
chr8 (1-235)||(12516470-12516705)
chr8 (5-235)||(38248421-38248650)
chr8 (1-232)||(10498232-10498462)
chr8 (1-235)||(8911515-8911750)
chr8 (1-235)||(31284542-31284775)
chr8 (1-235)||(23619382-23619615)
chr8 (1-235)||(33419524-33419757)
chr8 (1-235)||(2560420-2560654)
chr8 (5-221)||(44027115-44027330)
chr8 (1-134)||(33883368-33883501)
chr8 (5-197)||(5613739-5613934)
chr8 (25-235)||(4868125-4868330)
chr8 (7-235)||(30784797-30785014)
chr8 (1-48)||(20887589-20887636)
chr8 (1-60)||(14589639-14589698)
chr8 (6-40)||(5584428-5584462)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (1-235)||(5416-5650)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-235)||(198018-198251)
[»] scaffold1755 (1 HSPs)
scaffold1755 (5-223)||(4-221)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-231)||(292898-293127)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (1-235)||(3300-3534)
[»] scaffold0270 (1 HSPs)
scaffold0270 (1-235)||(81-315)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (1-235)||(57607-57841)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-235)||(67543-67776)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-211)||(248413-248622)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (1-201)||(89-289)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (5-221)||(89654-89870)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (4-210)||(27005-27210)
[»] scaffold1063 (1 HSPs)
scaffold1063 (5-208)||(2390-2595)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (23-235)||(19226-19431)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-235)||(30965-31198)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (1-235)||(29236-29469)
scaffold0084 (1-160)||(19226-19384)
scaffold0084 (190-235)||(19166-19211)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (1-226)||(2091-2315)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (1-235)||(3023-3256)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-227)||(58699-58926)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-171)||(241435-241604)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-235)||(10280-10513)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (1-235)||(118463-118697)
scaffold0002 (1-60)||(99253-99312)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (7-171)||(1-164)
[»] scaffold1785 (1 HSPs)
scaffold1785 (1-219)||(1136-1353)
[»] scaffold2073 (1 HSPs)
scaffold2073 (1-123)||(885-1007)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (90-235)||(14110-14254)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (23-235)||(48442-48655)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (23-235)||(9808-10022)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (1-72)||(7730-7801)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (1-84)||(15433-15516)


Alignment Details
Target: scaffold0427 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 3806 - 4040
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3806 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 3905  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3906 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 4005  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4006 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 4040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 5738102 - 5738336
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5738102 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 5738201  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5738202 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 5738301  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5738302 acaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtc 5738336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 3596799 - 3597033
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3596799 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 3596898  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3596899 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 3596998  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3596999 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 3597033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2379336 - 2379102
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  2379336 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcctgta 2379237  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2379236 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 2379137  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2379136 acaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtc 2379102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 1125754 - 1125987
Alignment:
Q  2 acctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1125754 acctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctaa 1125853  T
Q  102 ttctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaa 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  1125854 ttccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaa 1125953  T
Q  202 caattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1125954 caattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 1125987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20185850 - 20185617
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20185850 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagccccta 20185751  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20185750 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaatgttaacctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 20185652  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20185651 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 20185617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22150141 - 22150374
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22150141 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagccccta 22150240  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22150241 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaatgttaacctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 22150339  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22150340 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 22150374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 17106632 - 17106861
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17106632 tattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattc 17106731  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17106732 cttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaa 17106830  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17106831 ttcaattctgtctaagtagaaagttatggtc 17106861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30655546 - 30655316
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655546 tattcttatgaatgattctctagttccataatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctcaaactacagcccctaattc 30655447  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655446 cttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaa 30655347  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30655346 ttcaattctgtctaagtagaaagttatggtc 30655316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6513362 - 6513128
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  6513362 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacatccccta 6513263  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6513262 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattattcattcgtagactaaccatgtttattaga 6513163  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6513162 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 6513128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26942453 - 26942686
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26942453 cacctattcctatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaattacagccccta 26942552  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |    
T  26942553 attccttaggtggtctaataaactttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttatcaaa 26942651  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26942652 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 26942686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9954069 - 9953836
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9954069 cacctattcttatgaataattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 9953970  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9953969 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 9953871  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9953870 acaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtc 9953836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23384770 - 23385005
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23384770 cacctattcttatgaatgtttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgatttaggaccctcttctcaaactacagccccta 23384869  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgat--tattcattcctagactaaccctgtttatta 198  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23384870 attccttagttgttctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaacgattatatccattcctagactaaccctgtttatta 23384968  T
Q  199 gaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23384969 gaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 23385005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14281538 - 14281772
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14281538 cacctattcttatgaatgattctcttgtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttaagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 14281637  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14281638 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattatcaattcctagactaaccatgtttattaga 14281737  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14281738 acaattgaattaggtctaagtcgaaagttatggtc 14281772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10290074 - 10289845
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  10290074 tattcttatgaattattttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttaacttaggaccttcttctcaaattacagcccctaattc 10289975  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10289974 cttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacattaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttattagaacaa 10289876  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10289875 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 10289845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11402363 - 11402129
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||    
T  11402363 cacctattcttatgaatgtttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttcttatactatatccccta 11402264  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11402263 attccttaggtgttctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagattaaccctgtttattaga 11402164  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  11402163 acaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtc 11402129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13005295 - 13005063
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  13005295 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgaccctcttctcaaactacaaccccta 13005196  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  13005195 attccttaggtggtctaataatctttgaattttttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattatctattcctagactaaccatgattattaga 13005096  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatgg 233  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  13005095 acaattcaattaggtctaagtcgaaagttatgg 13005063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 28111784 - 28112015
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28111784 cacctattcttatgaatgattttctagttctacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatccccta 28111883  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28111884 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattcttcattcctagactaaccatgtttattaga 28111982  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
     ||||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  28111983 tcaattcaatttggtctaagtcg-aagctatggt 28112015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 9839412 - 9839642
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9839412 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaagtagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagtcccta 9839511  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||    
T  9839512 attccttaggtggtctaataatcttcgaaagttttacgaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatatttatttga 9839611  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctat 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9839612 acaattcaattaggtctaagtagaaagctat 9839642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22561181 - 22561411
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22561181 cacctattcttatgaatgattttctggtttcacgatagtcaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 22561280  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22561281 attccttaggtgatctcataatctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcagaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttga 22561380  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctat 231  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22561381 acaaatcaattaggtctaagtagaaagctat 22561411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 11125715 - 11125947
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||    
T  11125715 cacctattcttatgaatgatct-ctagttccacgatagttaacaaaatagtcctgatcagtcccttgagttaggaccctcttcacaaactaaagcccata 11125813  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  11125814 ttttcttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaaccaaatatcagtaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaaa 11125912  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11125913 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 11125947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28230700 - 28230467
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||    
T  28230700 cacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagccccta 28230601  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28230600 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattaga 28230502  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28230501 acaaatcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 28230467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2846403 - 2846174
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2846403 ttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaatagccataatcaatcccttgacataggaccctcttctcaaactacagcccctaattcct 2846304  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggtttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaat 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2846303 taggtggtctaatattctttgaaggttttaaagaacgttaacttaatatcacaaataaaagattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaat 2846204  T
Q  206 tcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  2846203 tcaattaggtctaagttgaaagctagggtc 2846174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19476108 - 19475875
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||    
T  19476108 cacctattcttgtgaatgagtctctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcagtcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccccta 19476009  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19476008 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttttaa-cacgttaacctactatcactaataaaggattatccattcctaggctaaccatgtttattaga 19475910  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  19475909 acaattcaattaggtctaagtcgaaaactatggtc 19475875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23008167 - 23007933
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||| |||    
T  23008167 cacctattcttgtgaatgattctttagtttcacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattacagcctcta 23008068  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23008067 attccttaggtggtctaatattctttaaaggttttaagaacgttaacctgatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttga 23007968  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23007967 acagttcagttaggtctaagttgaaagttatggtc 23007933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23780197 - 23780431
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||| |||    
T  23780197 cacctattcttgtgaatgattctttagtttcacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattacagcctcta 23780296  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23780297 attccttaggtggtctaatattctttaaaggttttaagaacgttaacctgatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttga 23780396  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23780397 acagttcagttaggtctaagttgaaagttatggtc 23780431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Original strand, 28107808 - 28108027
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28107808 ctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaatt 28107907  T
Q  104 ctttaggtggtctaataa---tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
      ||| ||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  28107908 tcttacgtggtctaataatattctttgaagg-tttaagtacgttaacctaatatgactaataatcgattatccattccatgactaaccgtgtttattaga 28108006  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagt 221  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  28108007 acaattcaattaggtctaagt 28108027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7128382 - 7128190
Alignment:
Q  24 ctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatc 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  7128382 ctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaca 7128283  T
Q  124 tttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtct 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7128282 tttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcagttaggtct 7128190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11247861 - 11247634
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| |  ||||| ||| | |||||||| |||||| |    
T  11247861 ttcttacgaatgattctctagtttcatgatggttaacaaaatatccttaatcaatcccttgacttagaactctcttatcagattacagccc-taattcct 11247763  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaatt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11247762 taggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattattcattcctagactaaccatgtttatttgaacaatt 11247663  T
Q  207 caattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11247662 caattatgtctaagttgaaagctatggtc 11247634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5260024 - 5259809
Alignment:
Q  17 tgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtct 116  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||   ||||| ||  |||||||||||    
T  5260024 tgattctctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcttaaaatac---ccctattttcttaggtggtct 5259928  T
Q  117 aataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtc 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  5259927 aatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattacccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtc 5259828  T
Q  217 taagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  5259827 taagttgaaagctatggtc 5259809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13947124 - 13946891
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||      |||| ||||||    
T  13947124 cacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaattaatcccttgagttatgaccctcttcgagggttacaaccccta 13947025  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13947024 attccttaggtggtttaataacctttgaaggttt-aagcacgttaatctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 13946926  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  13946925 acaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtc 13946891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24410404 - 24410171
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |   |||||||||||    
T  24410404 cacctattcttgtgaacgattcactagttctacgatagttaacaaataagtcctaatcaatcccttgagtcaggaccctctcctaaggttacagccccta 24410305  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| | | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24410304 attccttaggtggtctaataaccgtcggaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 24410206  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24410205 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 24410171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18856043 - 18856276
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |  |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| | ||||    
T  18856043 cacctattcttgtgaaagagtcactagttttgcgatagttaacaatatagtcctaatcaatcccttgagttaggaacctcttctagggttacaactccta 18856142  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18856143 atttcttaggtggtctgctaacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 18856241  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18856242 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 18856276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24400285 - 24400053
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |   |||| ||||||    
T  24400285 cacctattcttgtgaacgattcactagttctacgatagttaacaaattagtcctaatcaatcccttaagtgaggaccctctcctaaggttacaaccccta 24400186  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| | |||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24400185 attcctcaggtggtctaataaccgtcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 24400087  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24400086 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggt 24400053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4512582 - 4512345
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactac----agcc 96  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||     |||    ||||    
T  4512582 cacctattcttatgaatgattcattagttccacgataattaacaaaatagtcataatcaatccattgagttcggaccctcttctagggttacttgtagcc 4512483  T
Q  97 cctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttat 196  Q
    |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4512482 cctaattccttaggtggtctactaacttttgaaggttt-aagcatgttaacctaatatcactaataaatgattattcattcctagactaaccatgtttat 4512384  T
Q  197 tagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  4512383 tagaacaattcaattcagtctaagtcgaaagctagggtc 4512345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28848926 - 28848716
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||     
T  28848926 tctagttttacgatggttaactaaaatagtcctgataaatcccttgacttagggccctcttctcaaattacagtccctaattccttaggtgatctgatat 28848827  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  28848826 tctttgaaggttttgagaacgttaacctattatcacaaataaacgattatctattcctagactaaccttgtttatttgaacaattcaattaggtctgagt 28848727  T
Q  222 agaaagctatg 232  Q
     ||||||||||    
T  28848726 tgaaagctatg 28848716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Original strand, 12988195 - 12988377
Alignment:
Q  53 ctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaat 152  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  12988195 ctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcgcatattacagtccctaattccttaggtgatctaatattcttagaagatttgaagaacgctaacctaat 12988294  T
Q  153 atcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12988295 atcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattatgtctaagttgaaagttatggtc 12988377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Original strand, 13021293 - 13021503
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | || || |||||| || ||| ||| |||||||     
T  13021293 tctagttttacgatgattaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatagtccctaactccttaagtgatctaatat 13021392  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    |||| |||| ||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13021393 tcttagaagatttgaagaacattaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaacgatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagt 13021492  T
Q  222 agaaagctatg 232  Q
     ||||| ||||    
T  13021493 tgaaagttatg 13021503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24371311 - 24371146
Alignment:
Q  71 taggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgatta 170  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||| || |||||||||    
T  24371311 taggatcctcttatcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacattaacctattatcacaaataaacgatta 24371212  T
Q  171 ttcattcctagactaaccctgtttattagaac-aattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24371211 tccattcctagactaacccggtttatttgaacaaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtc 24371146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 221
Target Start/End: Original strand, 11192673 - 11192820
Alignment:
Q  78 ctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattc 177  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| || ||    
T  11192673 ctcttctcagactacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccaatc 11192772  T
Q  178 ctagac----taaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    ||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  11192773 ctagactaattaaccctgtttatttgaacatttcaattaggtctaagt 11192820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Original strand, 23842820 - 23842906
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaacta 91  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23842820 tattcttataaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttaggaccctcttctcaaacta 23842906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 26896277 - 26896463
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||  || ||||||||     |||||||||||    
T  26896277 cacctattcttgtgaatgattcactagttccacaataattaacaaaatagccataatcaatccattgagtttagaccctcttctagggttacagccccta 26896376  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaacc 188  Q
    |||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||    
T  26896377 atttcttaggtggtctcataacctttgaagg-tttaagcacattaacctaatatcactaataaaggattatccattcgtagagtaacc 26896463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2372289 - 2372201
Alignment:
Q  140 acgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagc 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2372289 acgttaacctaatatcactaataaacgattattcattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagc 2372201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 32109774 - 32109685
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaact 90  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32109774 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgataattaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttatgaccctcttctcaaact 32109685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31072320 - 31072177
Alignment:
Q  78 ctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattc 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||              |||||||||| |||||    
T  31072320 ctcttctcaaactacagcccctaattttttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaac--------------aaacgattatccattc 31072235  T
Q  178 ctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  31072234 ctagaccagccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 31072177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23847874 - 23847783
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactaca 93  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  23847874 cacctattct-atgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcttaatcaatctcttgagttaggtctctcttctcaaactaca 23847783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Original strand, 23667721 - 23667771
Alignment:
Q  34 gatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttct 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23667721 gatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttct 23667771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2372355 - 2372293
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtta 72  Q
    |||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2372355 tattcttatgaatga-----tagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtta 2372293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 235
Target Start/End: Original strand, 11188130 - 11188167
Alignment:
Q  198 agaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11188130 agaacaattcaattctgtttaagtagaaagctatggtc 11188167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 81)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2775671 - 2775437
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2775671 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctcaaactacagccccta 2775572  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775571 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 2775472  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775471 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 2775437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7486760 - 7486526
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7486760 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 7486661  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7486660 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 7486561  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7486560 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 7486526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2778914 - 2778680
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2778914 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctcaaactacagccccta 2778815  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2778814 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 2778715  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2778714 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 2778680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45896570 - 45896336
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45896570 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 45896471  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45896470 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 45896371  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45896370 acaactcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 45896336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24125688 - 24125455
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24125688 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 24125589  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24125588 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 24125490  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24125489 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 24125455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24128965 - 24128732
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24128965 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 24128866  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24128865 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 24128767  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24128766 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 24128732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25584866 - 25584632
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25584866 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 25584767  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25584766 atttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctggactaaccctgtttattaga 25584667  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25584666 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 25584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2873753 - 2873520
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2873753 cacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 2873654  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2873653 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcttagactaaccctgtttattaga 2873555  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2873554 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 2873520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43927024 - 43926791
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43927024 cacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 43926925  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43926924 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttattaga 43926826  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43926825 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 43926791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10885046 - 10884813
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10885046 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctcaaactacagccccta 10884947  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10884946 attccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 10884848  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10884847 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 10884813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 29343879 - 29344113
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29343879 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 29343978  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29343979 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaagattattcattcctagactaaccatgattattaga 29344078  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29344079 ataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 29344113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 49742924 - 49743158
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  49742924 cacctattcttatgaacgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 49743023  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  49743024 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacagacgattatccattcctaaactaaccctgtttattaga 49743123  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49743124 acaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtc 49743158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 10106604 - 10106837
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10106604 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctcaaactacagccccta 10106703  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10106704 attccttaggtggtctaataatatttgaagg-tgtaagcacgttaacctaatatcactaacaaatgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 10106802  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10106803 acaattcaattatgtctaagtagaaagttatggtc 10106837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30690925 - 30690692
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  30690925 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaataattctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaattacaaccccta 30690826  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  30690825 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattata 30690727  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30690726 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 30690692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54723931 - 54723697
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  54723931 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagccccta 54723832  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  54723831 tttccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcattaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 54723732  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  54723731 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 54723697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 539016 - 538782
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  539016 cacctattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 538917  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||  |    
T  538916 attccttaggtggtctaataatctttgaatgttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgaatatccattgctagactaaacctgtttatttaa 538817  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538816 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 538782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16184692 - 16184926
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||    
T  16184692 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacctttttcttaaactacagccccta 16184791  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16184792 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaagattatccattcctagactaaccatgtttattaga 16184891  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16184892 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 16184926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16244062 - 16243829
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16244062 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaactacagccccta 16243963  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16243962 attccttaggtgttctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatctattcctagactaaccctatttattaga 16243864  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16243863 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 16243829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43809769 - 43809535
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43809769 cacctactcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacacccccta 43809670  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43809669 attccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattaga 43809570  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  43809569 acaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtc 43809535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52200102 - 52199869
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52200102 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgataattaacaaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctcaaactacagccccta 52200003  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52200002 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 52199904  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  52199903 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 52199869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Original strand, 55034870 - 55035099
Alignment:
Q  6 attcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattct 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  55034870 attcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaatcctcttctcaaactacatcccctaattcc 55034969  T
Q  106 ttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaat 205  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  55034970 ttaggtggtttagtaatctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaatcatgtttattagaacaat 55035069  T
Q  206 tcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55035070 tcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 55035099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 50461553 - 50461787
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50461553 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 50461652  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50461653 attccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacattaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattaga 50461752  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  50461753 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 50461787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10881669 - 10881437
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10881669 cacctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagttctaatcaatcctttgacttaagaccctcttctcaaactacagccccta 10881570  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10881569 attccttaagtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagattaaccctgtttattaga 10881471  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10881470 acaattcaattctgtctaagtataaagctatggt 10881437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 19301510 - 19301746
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19301510 cacctattcttatgaatgattttctagttctacgatagttaacaaaatagttctaataaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 19301609  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19301610 atttcttaggtggtttaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaaagattatccattcctagactaaccatgtttattaga 19301708  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtctgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19301709 acaattcaattatgtctaagttgaaagctagggtctgt 19301746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35751630 - 35751401
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35751630 caccttttcgtattaatgattttctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 35751531  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35751530 attccttaggtggtctaataatctttgaagattttaagcacgttaacctaatatcattaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattaga 35751431  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagcta 230  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  35751430 acaactcaattaggtctaagttgaaagcta 35751401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3840706 - 3840472
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  3840706 cacctattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaacagtcctaatcaatcccttgagttagtaccctcttctcaaactacaaccccta 3840607  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  3840606 attccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattaga 3840507  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3840506 ataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 3840472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 20728656 - 20728885
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20728656 tattcttatgaatgattttctagttcgatgatatttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcctctaattc 20728755  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20728756 cttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacattaacctaatatcactaacaaaagattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaa 20728854  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20728855 ttcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 20728885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23298620 - 23298854
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23298620 cacctattcttatgaatgactttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 23298719  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  23298720 atttcttaggtggtctaagaatctttcaaggttttaagaacattaacctaatatcaccaacaaacgattatccattcctagactaacgatgtttattaga 23298819  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23298820 acaattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtc 23298854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 53816017 - 53815784
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  53816017 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagccccta 53815918  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  53815917 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 53815819  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  53815818 acaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtc 53815784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11190716 - 11190482
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11190716 cacctattcttatgaatgattttcttgttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaacctacaaccccta 11190617  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11190616 attccttaggtggtctaataattcttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaagtgattatccattcctcgactaaccatgtttattaga 11190517  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11190516 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 11190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 17040031 - 17040260
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17040031 tattcttatgaatgattctttagtttcatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttaagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattc 17040130  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17040131 cttagatgatctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacaattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaa 17040229  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17040230 ttcaattaggtctaagtcaaaagctatggtc 17040260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18644773 - 18645007
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||    
T  18644773 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctcagattacagtcccta 18644872  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18644873 attccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattgtccattcctagactaaccatgtttattaga 18644972  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  18644973 acaattcaattaggtttaagtcgaaagctaaggtc 18645007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 32287328 - 32287561
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||    
T  32287328 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagggccctcttctcaaactataatcccta 32287427  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32287428 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtatgttaacctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 32287527  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  32287528 acaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggt 32287561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 6434783 - 6435016
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6434783 cacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagatagaaccctcttctcaaactacagccccta 6434882  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6434883 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattaga 6434981  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  6434982 acaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtc 6435016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27092083 - 27091850
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27092083 cacctattcttattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga-cctcttctcaaactacatccccta 27091985  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27091984 atttcttaggcggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaaccttttatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 27091885  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||| | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27091884 acaagttaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 27091850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 19304694 - 19304927
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  19304694 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccctgagttacgaccctcttctcaaactacaaccccta 19304793  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  19304794 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaacatcattaacaaatgattatccattcctatactaaccatgttcattaga 19304892  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  19304893 acaattcatttatgtctaagttgaaagctagggtc 19304927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 28008076 - 28008307
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28008076 cacctattcttatgaattattctctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgaccctcttctcaaactacagccccta 28008175  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  28008176 attccttaggtggtctaataatctttgaatgttgtaagtacgt--atctattatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatatttattaga 28008273  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28008274 acaattcaattaggtctaagttgaaagctatggt 28008307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31549361 - 31549127
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  31549361 cacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttctaaaactacagacccta 31549262  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31549261 atttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaatgttaacctattatcactaataaacgattatccatttctagactaaccatgtttattaga 31549162  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31549161 acaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtc 31549127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9392923 - 9392695
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  9392923 cacctatacttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactctagccccta 9392824  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9392823 attccttaagtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaaactaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 9392725  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagcta 230  Q
    |||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  9392724 acaaatcaattagatctaagtcgaaagcta 9392695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47051685 - 47051451
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47051685 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 47051586  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  47051585 attccataggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcagtaacaaacggttatcctttcctagactaaccatgtttattaga 47051486  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  47051485 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 47051451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 8461492 - 8461725
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8461492 cacctattcttgtgaatgattctatagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgatttagtatcctcttctcaaactacagccccta 8461591  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8461592 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaaaaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 8461690  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  8461691 acaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtc 8461725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47055115 - 47054881
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47055115 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagccccta 47055016  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  47055015 attccataggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcagtaacaaacggttatcctttcctagactaaccatgtttattaga 47054916  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  47054915 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 47054881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 32367165 - 32367367
Alignment:
Q  32 acgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  32367165 acgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg 32367264  T
Q  132 ttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  32367265 ttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctat 32367363  T
Q  232 ggtc 235  Q
    ||||    
T  32367364 ggtc 32367367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35412699 - 35412471
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||    
T  35412699 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcagattacagtcccta 35412600  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      | ||||||||| |||||||||||    
T  35412599 attccttaggttagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattat------ccagactaaccatgtttattaga 35412506  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  35412505 acaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtc 35412471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11784951 - 11784721
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  | |||| ||||||||||    
T  11784951 tattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagccctaataaatcccttgagttaggaccctcttatcggattacaacccctaattc 11784852  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11784851 cttaggtggtctaataatcgttgaaggttttaagcacgttaatctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaa 11784752  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11784751 ttcaattaggtctaagtcgaaagctaaggtc 11784721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12561239 - 12561472
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||    
T  12561239 cacctattcttgtgaaagagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagccccta 12561338  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12561339 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 12561437  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12561438 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 12561472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 15195311 - 15195540
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| || |||||||    
T  15195311 tattcttataaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagataggaccctcttctaggactacaacctctaattc 15195410  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15195411 cttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaagattatccattcctagactaaccatgtttattagcacaa 15195509  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15195510 ttcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 15195540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54720160 - 54719927
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||    
T  54720160 cacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccccta 54720061  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  54720060 attccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 54719962  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  54719961 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 54719927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 22416865 - 22417072
Alignment:
Q  27 gtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatcttt 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22416865 gttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccttt 22416964  T
Q  127 gaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  22416965 gaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaac 22417063  T
Q  227 gctatggtc 235  Q
    |||||||||    
T  22417064 gctatggtc 22417072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41977186 - 41976971
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||              |||||||||||||| ||||||||||    
T  41977186 tattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccct--------------cttctcaaactacaacccctaattc 41977101  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  41977100 cttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaatcatgtttattagaacaa 41977002  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41977001 ttcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 41976971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 48064043 - 48064273
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaatt 103  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||    
T  48064043 ctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaatt 48064142  T
Q  104 ctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 203  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  48064143 ccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcatagactaaccatgtttattagaaca 48064241  T
Q  204 attcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  48064242 attcaattagatctaagtcgaaagctatggtc 48064273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 46885129 - 46884897
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     |||||||||||    
T  46885129 cacctattcttgtgaatgcttttctagtt-cacgatagttagcaaaatagtcctaatcaatcccttgagttgggaccctcttctagggttacagccccta 46885031  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||||    
T  46885030 attccttaggtgttctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatttctagaccaaccatgtttattaga 46884932  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  46884931 acaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtc 46884897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Original strand, 55032010 - 55032226
Alignment:
Q  6 attcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattct 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  55032010 attcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacatcccctgattcc 55032109  T
Q  106 ttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaat 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||             |||||||||||| |    
T  55032110 ttaggtggtctagtaatctttgaagcttttatgcacgttaacctaatatcactgacaaacgattatccattcc-------------tttattagaacagt 55032196  T
Q  206 tcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55032197 tcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 55032226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 18641777 - 18641945
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||    
T  18641777 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctcagattacagtcccta 18641876  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgatt 169  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18641877 attccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgatt 18641945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 25442864 - 25443098
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||    
T  25442864 cacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagccccta 25442963  T
Q  101 attctttaggtggtctaa-taatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattag 199  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | | ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25442964 attccttaggtggtctaaataaccgtcgaatgttt-aagcacgttaagctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattag 25443062  T
Q  200 aacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25443063 aacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 25443098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17141597 - 17141364
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| |||| |    
T  17141597 cacctattcttatgaatgattcgctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccccaa 17141498  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  |||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17141497 atttcttaggtggtctaataaccgttaaagg-tttaatcacgttaacctaatatcactaataaaggatcatccattcctagactaaccatgtttattaga 17141399  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  17141398 acaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtc 17141364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54461204 - 54461010
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||    
T  54461204 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataattcatcccttgagttaggaccctcttctcatattacagtcccta 54461105  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgttta 195  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  54461104 attccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactagtaaaggattatacattcctagactaaccatgttta 54461010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17546040 - 17545812
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||  |||||||||     
T  17546040 ttcttatgaatgattctctagtttcacgatggttaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttatgaccctcttctcagattacaatccctaattcc 17545941  T
Q  106 ttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaat 205  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17545940 ttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctagtatcataaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaataat 17545841  T
Q  206 tcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  17545840 tcaattaggtctaagttgaaaactatggt 17545812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18542719 - 18542506
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||| | ||||| ||||||||  ||||||| |||||||     
T  18542719 tctagcttcacgatggttaactaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaagaccttcttctcagattacagtccctaatttcttaggtgatctaatat 18542620  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18542619 tctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagt 18542520  T
Q  222 agaaagctatggtc 235  Q
     ||||| |||||||    
T  18542519 tgaaagttatggtc 18542506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 34983858 - 34984083
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||     |||||||||||    
T  34983858 cacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaagagtcataatcaatcccttgagttaggaccatcttctagggttacagccccta 34983957  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  34983958 attccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcactttaacctaatatcactaataaatgattatccattcttagactaaccatgtttattaga 34984056  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||    
T  34984057 acaattcaattaggtctaagttgaaag 34984083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Original strand, 3292970 - 3293194
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || ||||||  | |||| |||||||||| |    
T  3292970 ttcttatgaatgattctatagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaagacccacttctccgattacaacccctaattcct 3293069  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatat-cactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaat 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3293070 taggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacttaatataaaaaaataaacgattattcattcctagactaaccatgtttatttgaacaat 3293169  T
Q  206 tcaattatgtctaagtagaaagcta 230  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||    
T  3293170 tcaattaggtctaagttgaaggcta 3293194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 30220010 - 30220247
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  | | |  | ||||||    
T  30220010 cacctattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcatagattgtaaccccta 30220109  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa---gcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttatt 197  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |   |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  30220110 attccttaggtggtctaatattctttgaagcttttaagttgatagttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttatt 30220209  T
Q  198 agaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
     |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  30220210 tgaacaattcaattaggtttaagttgaaagctatggtc 30220247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 17531661 - 17531888
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||    
T  17531661 cacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccccta 17531760  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||       
T  17531761 attccttaggtggtctaataaccgttgaagg-tttaaacacgttaacctaatatcactaataaa-gattatccattcctagactaaccatgtttatt--- 17531855  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
      |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17531856 --aattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 17531888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 22993724 - 22993937
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  22993724 tctagttttacgatggttaactaaaatatccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaattacagtccctaattccttaggtgatctaatat 22993823  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22993824 tctttgaaggtttttagaacgttaacctagtatcacaaataaacgattatccattcctaaacttaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagt 22993923  T
Q  222 agaaagctatggtc 235  Q
     |||||||||||||    
T  22993924 tgaaagctatggtc 22993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 62 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28266005 - 28265833
Alignment:
Q  62 cccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaac 161  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||     
T  28266005 cccttgagatagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagaacgttaacctagtatcactaat 28265907  T
Q  162 aaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  28265906 aaaagattatccattcctagactaatcatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtc 28265833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 17528770 - 17528990
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| || |||||||    
T  17528770 tattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaataaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccactaattc 17528869  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17528870 cttaggtggtttaataaccgttgaagg-tttaagcacattaacctaatatcactaataaaggatt----attcctagactaaccatgtttattagaacaa 17528964  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagcta 230  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  17528965 ttcaattaggtctaagtcgaaagcta 17528990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22783788 - 22783593
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaa--ctacagcccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |   || ||||||||||    
T  22783788 tattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcccctaat 22783689  T
Q  103 tctttaggtggtctaata-atctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttatt 197  Q
    || ||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  22783688 tccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatacctagaataaccatgtttatt 22783593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22788152 - 22787957
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaa--ctacagcccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |   || ||||||||||    
T  22788152 tattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcccctaat 22788053  T
Q  103 tctttaggtggtctaata-atctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttatt 197  Q
    || ||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  22788052 tccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatacctagaataaccatgtttatt 22787957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52988498 - 52988361
Alignment:
Q  97 cctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttat 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52988498 cctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaagttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttat 52988400  T
Q  197 tagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  52988399 tagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtc 52988361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 28266106 - 28266006
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28266106 cacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagatagaaccctcttctcaaactacagccccta 28266007  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  28266006 a 28266006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 52309620 - 52309728
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  52309620 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagctaggaccatcttctcaaactacaaccccta 52309719  T
Q  101 attctttag 109  Q
    |||| ||||    
T  52309720 attccttag 52309728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 282218 - 282416
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||  |||| |||| | |||||||||| | ||||    ||||||| ||||||| |||||||     
T  282218 tctagttttacgatggttaattaaaatagttctaatcaatca-ttgacttagaaccctcttctcagattacaattactaattccttaggtgatctaatat 282316  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  282317 tcttcgaaggttttaagaacgttgacataatatcaccaataaacaattatccattcctagactaaccatgtttattcgaacaattcaattaggtctaagt 282416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 242
Target Start/End: Original strand, 27308717 - 27308830
Alignment:
Q  128 aaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||    
T  27308717 aaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataagcgattatctattcctagact-accatgtttatttgaacaactcaattaggtctaagtcgtaag 27308815  T
Q  228 ctatggtctgtggtc 242  Q
    ||| |||| ||||||    
T  27308816 ctagggtcagtggtc 27308830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 52990889 - 52990815
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagga 75  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52990889 cacctattcttgtgaatgagtctctagttttacgataattaacaaaatagtcgtaatcaatccattgagttagga 52990815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 217
Target Start/End: Original strand, 27308157 - 27308243
Alignment:
Q  131 gttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtct 217  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27308157 gttttaagaacgttaacctaataacacaaataaacgattatctattccttgattaaccttgtttatttgaacaattcaattaggtct 27308243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 27298594 - 27298701
Alignment:
Q  128 aaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||    | | ||||||  |||| || ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27298594 aaggttttaagaacgttaacataatatcacaggtatatgattatctattcataaactaaccgtatttatttgaacaattcaattatgtctaagttgtaag 27298693  T
Q  228 ctatggtc 235  Q
    ||| ||||    
T  27298694 ctagggtc 27298701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 25486327 - 25486290
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatag 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25486327 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatag 25486290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 31857910 - 31857847
Alignment:
Q  6 attcttatgaatgattttct---agtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccctt 66  Q
    |||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31857910 attcttatcaatgattttcttctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaattcctt 31857847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31857854 - 31857804
Alignment:
Q  100 aattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaa 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31857854 aattccttaggtggtctaataatttttgaagg-attaagcacgttaacctaa 31857804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 37408870 - 37408828
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac 43  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  37408870 cacctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaac 37408828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31857804 - 31857772
Alignment:
Q  203 aattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31857804 aattcaattaggtctaagtagaaagctatggtc 31857772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45941522 - 45941288
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  45941522 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacccttttctcaaactacagccccta 45941423  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45941422 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 45941323  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45941322 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 45941288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21107309 - 21107542
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21107309 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagccccta 21107408  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21107409 attccttagatggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 21107507  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21107508 acaattcaattttgtctaagtagaaagcaatggtc 21107542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 49498515 - 49498749
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49498515 cacctattcttatgaatgattttatagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 49498614  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49498615 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 49498713  T
Q  201 acaattcaattatgtc-taagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49498714 acaattcaattctgtcttaagtagaaagctatggtc 49498749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 1950473 - 1950706
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1950473 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctcaaactacagccccta 1950572  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1950573 attccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 1950671  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1950672 acaatacaattctgtctaagtagaaagctatggtc 1950706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20398959 - 20398725
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||    
T  20398959 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcagactacaaccccta 20398860  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20398859 attccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 20398760  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20398759 acaattcaattctgtcaaagtagaaagctatggtc 20398725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28111162 - 28110928
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28111162 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaacagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 28111063  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28111062 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctatactaaccctatttattaga 28110963  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28110962 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 28110928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 49853096 - 49853328
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49853096 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgacagttaacaaaatagtcctaatcaatcacttgacttaggaccctcttctcaaactacagccccta 49853195  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49853196 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcaataacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 49853294  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49853295 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggt 49853328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23021941 - 23022175
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||    
T  23021941 cacctattcttatgaatgatattctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttcttagaccacagccccta 23022040  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23022041 attccttaggtgatcaaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 23022140  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23022141 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 23022175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 21018486 - 21018718
Alignment:
Q  2 acctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21018486 acctattcttatgaatggttttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttatgaccctcttctcaaactacagcccctaa 21018585  T
Q  102 ttctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaa 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21018586 ttccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaaaa 21018684  T
Q  202 caattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21018685 caattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 21018718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 41058320 - 41058553
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41058320 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgatttaggaccctcttctcaaactacagccccta 41058419  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41058420 attccttaggtagtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctattatcactaacaaacaattatccattcctagactaaccctatttattaga 41058518  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41058519 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 41058553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 6070971 - 6071205
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6070971 cacctattcgtattaatgattttctatttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatccccta 6071070  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6071071 atttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 6071170  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  6071171 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 6071205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 45960762 - 45960996
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45960762 cacctatttgtattaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 45960861  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45960862 attccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 45960961  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  45960962 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 45960996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 37183881 - 37184110
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37183881 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 37183980  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  37183981 attccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacggttatccattcctagactaactatgtttattaga 37184080  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagcta 230  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37184081 acaattcaattaggtctaagtcgaaagcta 37184110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2794333 - 2794100
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2794333 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagccccta 2794234  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2794233 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaagctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 2794135  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  2794134 acaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtc 2794100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31204944 - 31204710
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31204944 cacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatatccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatccccta 31204845  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31204844 attccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 31204745  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  31204744 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 31204710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 673088 - 673324
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaa--tagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccc 98  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  673088 cacctattcttgtaaatgattttctagttccacgatagttaaaaaaaaatagtctcaatcaatcccttgagttaataccctcttctcaaactacaacccc 673187  T
Q  99 taattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttatta 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  673188 taattttttaggtggtctaataatctttgaagggtttaagtacgttaacataatatcactaataaacgattattcattcctagactaaccatgtttatta 673287  T
Q  199 gaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  673288 gaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 673324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 29643239 - 29643464
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||| || |||    
T  29643239 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctaggattacaacctcta 29643338  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29643339 attccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagattaaccatgtttattaga 29643437  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||    
T  29643438 acaattcaattaggtctaagtcgaaag 29643464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 3796867 - 3797077
Alignment:
Q  24 ctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3796867 ctagttttacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacc 3796966  T
Q  124 tttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtag 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3796967 tttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcg 3797065  T
Q  224 aaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||    
T  3797066 aaagctatggtc 3797077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 27355727 - 27355940
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  27355727 tctagtttcacgatggttaactaaaataggcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcatattacagtccctaattcattaggtgatctaatat 27355826  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27355827 tttttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagt 27355926  T
Q  222 agaaagctatggtc 235  Q
     |||||||||||||    
T  27355927 tgaaagctatggtc 27355940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 34732385 - 34732612
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||  |    
T  34732385 ttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaatagcccta-tcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaagtacatcccctaatttgt 34732483  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaatt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  34732484 taggtggtctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattattcattcctagactaactatgtttatttgaacaatt 34732583  T
Q  207 caattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  34732584 caattaggtttaagttgaaagttatggtc 34732612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 27354962 - 27355165
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||    
T  27354962 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataaccaatcccttgagttaggaccctcttcttaaactaca-acccta 27355060  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27355061 attccttaggtggtctattaatcttcgaagg-tttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatctattcctacactaaccatgtttattaga 27355159  T
Q  201 acaatt 206  Q
    ||||||    
T  27355160 acaatt 27355165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 905707 - 905940
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||||||    
T  905707 tattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagttttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctatggttacaacccctaattc 905806  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatat----cactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  905807 cttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 905905  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  905906 acaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtc 905940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 21111176 - 21111309
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21111176 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttaacttaggaccctcttctcaaactacagccccta 21111275  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttt 134  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21111276 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 21111309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 21434515 - 21434728
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||| ||  ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  21434515 tctactttcacgacagttaactaaaatagccataatcaatccattgacttaagacactcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatat 21434614  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  21434615 tatttgaaggttttaagaacgttaacctaatataacaaataaacgattattcattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtataagt 21434714  T
Q  222 agaaagctatggtc 235  Q
     |||||||||||||    
T  21434715 tgaaagctatggtc 21434728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2405615 - 2405382
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||     |||| ||| ||    
T  2405615 cacctattcttgtgaatgattccctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcaattgagttaggaccctctcctagggttacatccctta 2405516  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatcttt-gaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattag 199  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2405515 attccttaggtggtctaata-tctgtcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattag 2405418  T
Q  200 aacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  2405417 aacaattcaattaggtctaagtcgaacgttatggtc 2405382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7635730 - 7635520
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||| || |||||| ||||||| |||||||     
T  7635730 tctagtttcacgatgattaactaaaataaccctaatcaataccttgacttaggaccctcttctcagattacagtccataattccttaggtgatctaatat 7635631  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || || ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  7635630 tctttgaaggttttaagaacgttaacctcttattacaaataaacgattatctattcctagactgaccctgtttatttgaacaattcaatcaggtctaagt 7635531  T
Q  222 agaaagctatg 232  Q
     ||||| ||||    
T  7635530 tgaaagttatg 7635520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 27331817 - 27332022
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||          |||||||| ||||||| |||||||     
T  27331817 tctagtttcacgatggttaactaaaatagccctaataaatcccttgacttaggaacctcttctcag---------cctaattcattaggtgatctaatat 27331907  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattc-attcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaag 220  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27331908 tttttgaaggttttaacaacgttaacctaatatcacaaataaacgattattcaattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaag 27332007  T
Q  221 tagaaagctatggtc 235  Q
    | ||||| |||||||    
T  27332008 ttgaaagttatggtc 27332022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Original strand, 11667025 - 11667153
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    |||||| |||||| | |||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  11667025 ttcttacgaatgaatctctaatttcacaatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggatcctcttctcagattacagcccctaattcct 11667124  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggtttt 135  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11667125 taggtggtctaatattatttgaaggtttt 11667153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 42022720 - 42022587
Alignment:
Q  21 tttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaata 120  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||     |||||| |||||||    
T  42022720 tttctagttccactatagttaacaaaatagttttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactataacccctaa-----taggtgatctaata 42022626  T
Q  121 atctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcacta 159  Q
    || ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  42022625 atttttgaaggttttaattacgttatcctaatatcacta 42022587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 21114516 - 21114583
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttga 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21114516 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttga 21114583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 157
Target Start/End: Original strand, 16055629 - 16055742
Alignment:
Q  44 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgt 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  16055629 aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacaacccctaaatccttaggtgatctaatattctttgaaggtttgaagaatgt 16055728  T
Q  144 taacctaatatcac 157  Q
    ||||||||||||||    
T  16055729 taacctaatatcac 16055742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Original strand, 13430998 - 13431133
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaaca-aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||  ||||||     
T  13430998 tctagttttacgatggttaacttaaatagccctaatcaatcccttgacttaggactctcttctcatattacagtctctaattccttaggtgagctaatat 13431097  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcac 157  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  13431098 tctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcac 13431133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 235
Target Start/End: Original strand, 11668171 - 11668277
Alignment:
Q  129 aggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagc 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  11668171 aggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagagtaaccatatttatttgaaaaattcaattcggtctaagttgaaagc 11668270  T
Q  229 tatggtc 235  Q
    |||||||    
T  11668271 tatggtc 11668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Original strand, 34065202 - 34065317
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataat 122  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||| | ||||| | ||||| | || |||| |||||||||    
T  34065202 tctagtttcacgatggttaaccaaatagccctaatcaatctcttaacttaggaccctcctctcatattacagtctctaatacctttggtgatctaataat 34065301  T
Q  123 ctttgaaggttttaag 138  Q
    ||||||||||||||||    
T  34065302 ctttgaaggttttaag 34065317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Original strand, 16056842 - 16056977
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||   ||||||||| ||||||| |||||||     
T  16056842 tctagttttacgatgattaactaaaatagctctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacgatccctaattccttaggtgatctaatat 16056941  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcac 157  Q
     |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  16056942 actttaaaggtttgaataacgttaacctaatatcac 16056977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Original strand, 16061008 - 16061143
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||| ||||||| |||||||     
T  16061008 tctagttttacgatgattaactaaaatagccctaatcaatccattgacttaggattctcttctcatattacaatccctaattccttaggtgatctaatat 16061107  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcac 157  Q
     ||||  |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  16061108 actttataggtttgaagaacattaacctaatatcac 16061143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 82
Target Start/End: Original strand, 30938601 - 30938661
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctctt 82  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30938601 tctagtttcacgatggttaactaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggatcctctt 30938661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 234
Target Start/End: Original strand, 34066626 - 34066692
Alignment:
Q  168 ttattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  34066626 ttatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaatcaaattaggtataagttgtaagctatggt 34066692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 197
Target Start/End: Original strand, 16062347 - 16062396
Alignment:
Q  148 ctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttatt 197  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  16062347 ctaatatcacaaataaacgattatttattcgtagactaaccctgcttatt 16062396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 235 - 1
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  235 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 136  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  135 atttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 36  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 62621 - 62388
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  62621 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 62522  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  62521 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 62423  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  62422 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 62388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 63963 - 63746
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |     || ||||||||    
T  63963 cacctattcttgtgaatgcttttctagttccacaatagttaacaaaatagtctgaatcaatcccttgagttaggaccctcttatagggttatagccccta 63864  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  63863 attccttaggtggtataataaccttcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaaa 63765  T
Q  201 acaattcaattatgtctaa 219  Q
    ||||| |||||| ||||||    
T  63764 acaatacaattaggtctaa 63746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 23224932 - 23225162
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23224932 tattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattc 23225031  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23225032 cttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaa 23225131  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23225132 ttcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 23225162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8277077 - 8276843
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  8277077 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactatagccccta 8276978  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8276977 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatcaattcctagactaaccctgtttattaga 8276878  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8276877 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 8276843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4546960 - 4546727
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4546960 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagccccta 4546861  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4546860 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacaattatccattcctagactaaccctgtttattaga 4546762  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4546761 acaattcaattttgtctaagtagaaagcaatggtc 4546727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17730905 - 17730672
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17730905 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttaacttaggaccctcttctcaaactatagccccta 17730806  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17730805 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcattaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 17730707  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17730706 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 17730672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20594350 - 20594121
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20594350 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattc 20594251  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20594250 cttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaacgattatccattcttacactaaccctgtttattagaacaa 20594152  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20594151 ttcaattatgtctaagtagaaagttatggtc 20594121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26557590 - 26557357
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  26557590 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacatagaaccctcttctcaaactacagtcccta 26557491  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26557490 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctaaactaaccctgtttattaga 26557392  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26557391 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 26557357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48645565 - 48645332
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48645565 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 48645466  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  48645465 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctaatatcagtaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 48645367  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  48645366 acaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtc 48645332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 4596036 - 4596265
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4596036 tattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaaaaaaatagtcataatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattc 4596135  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4596136 cttagttggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacaattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 4596234  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4596235 ttcaattttgtctaagtagaaaactatggtc 4596265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 2441301 - 2441535
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2441301 cacctattcgtattaatgattttctaattctacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagtcccta 2441400  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2441401 attccttaggtggtttaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 2441500  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2441501 acaattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtc 2441535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 13449799 - 13450027
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  13449799 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagccctta 13449898  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13449899 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 13449998  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagct 229  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13449999 acaattcaattaggtctaagtcgaaagct 13450027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6603550 - 6603316
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6603550 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 6603451  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6603450 atttcttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 6603351  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  6603350 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 6603316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 45287092 - 45287325
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45287092 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagccccta 45287191  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45287192 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 45287290  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  45287291 acaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtc 45287325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 9864749 - 9864983
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  9864749 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccata 9864848  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9864849 attccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacttaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 9864948  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9864949 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 9864983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13842731 - 13842498
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13842731 cacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgaattaggaccctctcctcaaactacagccccta 13842632  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13842631 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatctattcctagactaaccatgtttattaga 13842533  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  13842532 acaattcaattaggtctaagtcgagagctagggtc 13842498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16165840 - 16165606
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  16165840 cacctatttgtattaatgattctctaattcaacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcagattacagccccta 16165741  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16165740 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattacccattcctagattaaccatgtttattaga 16165641  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    | |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16165640 ataattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 16165606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 9271488 - 9271705
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  9271488 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaagaaaatactcctaatcaatcccttgagttaggtccctcttctcaaactacaaccccta 9271587  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||    
T  9271588 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaaccaaatatcactaacaaacgattatccattcctag-------ttgtttattaga 9271679  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaa 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  9271680 acaattcaattaggtctaagtagaaa 9271705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26136151 - 26136384
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     || ||||||||    
T  26136151 cacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttcagttaggaccctcttctagggttaaagccccta 26136250  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26136251 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 26136349  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26136350 acaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtc 26136384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 37415446 - 37415673
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37415446 cacctattcttatgaatgattctctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttagaaccctcttctcaaactacagccccta 37415545  T
Q  101 att--ctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttatta 198  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37415546 attccccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttatta 37415644  T
Q  199 gaacaattcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  37415645 gaacaattcaattaggtataagtcgaaag 37415673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 9132787 - 9133016
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||    
T  9132787 tattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattc 9132886  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9132887 cttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaa 9132985  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9132986 ttccattaggtctaagtcgaaagctagggtc 9133016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26144531 - 26144764
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     || ||||||||    
T  26144531 cacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttcagttaggaccctcttctagggttaaagccccta 26144630  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26144631 attccttaggtggtctagtaacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 26144729  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26144730 acaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtc 26144764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 14683470 - 14683700
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaatt 103  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||    
T  14683470 ctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctaggattacagcccctaatt 14683569  T
Q  104 ctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 203  Q
    |  |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14683570 ccataggtggtctaatagttattgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaatgattatgcattcctagactaaccatgtttattagaaca 14683668  T
Q  204 attcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  14683669 attcaattaggtctaagtcaaaagttatggtc 14683700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10469235 - 10469002
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||    
T  10469235 cacctattcttgtgaattcttttctagttccatgatagttaaaaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccccta 10469136  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10469135 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatctattcctagactaaccatgtttattaga 10469037  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10469036 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 10469002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 37166170 - 37166403
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     |||| ||||||    
T  37166170 cacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaagtagtcctaatcaatcccttgagttaggactctcttctagggttacaaccccta 37166269  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37166270 attccttaggtggtctaataacctttgaatgttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaatgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 37166368  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37166369 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 37166403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 3068000 - 3068233
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||    
T  3068000 cacctattcttgtgaatgactcactagttctatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccccta 3068099  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3068100 attccttaggtggtctaataatcgttgaaggttt-aagcacattaacctaatatcactaataaaagattatccattcctagactaaccatgtatattaga 3068198  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3068199 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 3068233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 45290503 - 45290661
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45290503 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagccccta 45290602  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaa 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45290603 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaa 45290661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20080741 - 20080974
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     || || |||||    
T  20080741 cacctattcttctgaatgagtcactagttcaacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacccccttctagggttatagacccta 20080840  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20080841 atttcttaggtggtctaataatcgctgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 20080939  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  20080940 acaactcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 20080974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 11919888 - 11920021
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11919888 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgataggtaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 11919987  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttt 134  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11919988 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 11920021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 235
Target Start/End: Original strand, 11398132 - 11398282
Alignment:
Q  85 caaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagact 184  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  11398132 caaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccactcttagact 11398231  T
Q  185 aaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11398232 aaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 11398282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4542888 - 4542734
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4542888 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataattctaatcaatcccttgacctagaaccctcttctcaaactacagccccta 4542789  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatca 156  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4542788 attccttagttggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatca 4542734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 18562561 - 18562790
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattct 105  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||| ||||||  ||||||||| | ||||| |||||||||     
T  18562561 ttcttatgaatacttctctagttttacgatagttaactaaaatagccctgattaatcctttgacttaggactctcttctcatattacagtccctaattcc 18562660  T
Q  106 ttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaat 205  Q
    |||||||  |||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18562661 ttaggtgagctaatattattcgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttaattgaacaat 18562760  T
Q  206 tcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18562761 tcaattaggtctaagttgaaagctatggtc 18562790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 13809553 - 13809745
Alignment:
Q  14 gaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtgg 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| || ||||||| ||| ||||    
T  13809553 gaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaatagccctgatcaatcccttgacttaggaccctcttctcatattacaacctctaattccttatgtgg 13809652  T
Q  114 tctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaatt 206  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13809653 cctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaatt 13809745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 5242180 - 5242409
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  5242180 ttcttacgaatgattctctagtttcactatggttaacaaaatatccataaccaatcccttgacttaggaccctattctcagactacagcccctaattcct 5242279  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggtttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaat 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||| | |||||||| |||||||| |||||||    
T  5242280 taggtggtctaatattctttgaagattttaaagaacgttaacttaatatcacaaataaatgagtatccattcttggactaaccatgtttatttgaacaat 5242379  T
Q  206 tcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  5242380 tcaattaggtctaagttgaaagctagggtc 5242409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7227613 - 7227385
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||| |    
T  7227613 ttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaataaccataatcaatcccttgacttaggaccctattctccaattacagcctctaattcct 7227514  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaatt 206  Q
    ||  || ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | || |||||||||| |||| |||| ||| || |||||||| |||||| |    
T  7227513 tatatgatctaatattctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatctcaaataaacgattatccattgctaggctagccatgtttatttgaacaact 7227414  T
Q  207 caattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7227413 caattaggtctaagttgaaagctatggtc 7227385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5796638 - 5796409
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattct 105  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| |||   |||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||  | |||||||     
T  5796638 ttcttaagaataattctctagtttcatgatgactaactaaaatagctctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcatattacaatctctaattcc 5796539  T
Q  106 ttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaat 205  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||     
T  5796538 ttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacattatatcacaaataaacgattattcattcatagactaaccctttttatttgaaaaac 5796439  T
Q  206 tcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5796438 tcaattaggtctaagttgaaagctatggtc 5796409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4695494 - 4695382
Alignment:
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4695494 tctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaaatgtgtctaagt 4695396  T
Q  222 agaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||    
T  4695395 agaaagctatggtc 4695382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10345248 - 10345072
Alignment:
Q  58 caatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcac 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |     |||| |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10345248 caatcccttgagttaggaccctcttatagggttacaacccctaattccttagatggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacttaatatcac 10345150  T
Q  158 taacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10345149 taataaaggattatccattcttagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 10345072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 35961182 - 35961079
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35961182 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagtcaacaaaatagtcctaatcaatcccttgatttaggaccctcttctcaaactatagccccta 35961083  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  35961082 attc 35961079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 227
Target Start/End: Original strand, 37423085 - 37423205
Alignment:
Q  106 ttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37423085 ttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaat 37423183  T
Q  206 tcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
    ||||||| || ||||| |||||    
T  37423184 tcaattaggtataagtcgaaag 37423205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 4695572 - 4695491
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctctt 82  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4695572 cacctattcttatcaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctctt 4695491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Original strand, 22611771 - 22611863
Alignment:
Q  143 ttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  22611771 ttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaataattcaattaggtgtaagtcgaaagctagggtc 22611863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24918209 - 24918052
Alignment:
Q  78 ctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattc 177  Q
    ||||||||| | ||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |    ||||||||||||| || |  |||||||||| |||||    
T  24918209 ctcttctcagattacactccctaattccttatgtggtctaatattccctgaaagttttcaaagtgttaacctaatattacaattaaacgattatccattc 24918110  T
Q  178 ctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
     ||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24918109 atagacaagccctgtttaattgaacaatccaattatgtctaagttgaaagctttggtc 24918052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 58
Target Start/End: Original strand, 11398073 - 11398129
Alignment:
Q  2 acctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatc 58  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11398073 acctattcgtattaatgattttctagttctacgatagttagcaaaatagtcctaatc 11398129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2090600 - 2090486
Alignment:
Q  98 ctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttatt 197  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| || |  |||||||| |   |||||||||| |||||| |  ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  2090600 ctaattcattaggtgatctaatattcctcaaaggttttcaaaccgttaacctagtatcacaattaaacgatcatctattcctagactacccctgtttatt 2090501  T
Q  198 agaacaattcaatta 212  Q
     ||||||| ||||||    
T  2090500 tgaacaatccaatta 2090486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26752719 - 26752953
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26752719 caccttttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 26752818  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752819 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 26752918  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26752919 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 26752953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 41876782 - 41877016
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41876782 cacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 41876881  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41876882 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 41876981  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41876982 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 41877016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34831868 - 34831635
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34831868 cacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 34831769  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34831768 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 34831670  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34831669 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 34831635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 41306545 - 41306778
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  41306545 cacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttttcaaactacagccccta 41306644  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41306645 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatacctagactaaccctgtttattaga 41306743  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41306744 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 41306778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 4099535 - 4099768
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  4099535 cacctattcttatgaatgattttctagttgcacgatagttagcaaaatagtcataatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaactacagccccta 4099634  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099635 attctttaggtggtctaataatatttgaa-gatttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 4099733  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4099734 acaattcaattatgtataagtagaaagctatggtc 4099768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20055878 - 20055645
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  20055878 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcccgtgagttaggaccgtcttctcaaactacaaccccta 20055779  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055778 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-ttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 20055680  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20055679 acaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtc 20055645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22936955 - 22937189
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||| |||||    
T  22936955 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccctttagttaggaccctcttctcagattacagtcccta 22937054  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22937055 attccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 22937154  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22937155 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 22937189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26895622 - 26895855
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  26895622 cacctattcttatgaatgattttttagttcaacgataattaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagactctcttctcaaactacagcctcta 26895721  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26895722 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 26895820  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26895821 acaattcaattatgtctaagtcgaaagctatggtc 26895855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18952793 - 18952564
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18952793 tattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattc 18952694  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18952693 cttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacaattatccattcctaaactaaccatgtttattagaacaa 18952595  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  18952594 ttcaattagatctaagtcgaaagctatggtc 18952564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42063026 - 42062792
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||    
T  42063026 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttaggaccctcttctcatattacagtcccta 42062927  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42062926 attccttaggtgaactaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 42062827  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  42062826 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 42062792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43491857 - 43491626
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaatt 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  43491857 ctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactagaccccctaatt 43491758  T
Q  104 ctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 203  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43491757 ccttaggtggtttaataatctttgaagattttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaaca 43491658  T
Q  204 attcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  43491657 attcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 43491626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7271120 - 7270887
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7271120 cacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 7271021  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  7271020 attccttaggtggtctgataatctttgaagg-tttaaacacgttagcccaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccatgtttgttaga 7270922  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7270921 acaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtc 7270887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21332698 - 21332927
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21332698 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaataaaatagtcctaatcaattcattgacttagaaccctcttctcaaactacagccccta 21332797  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21332798 attccttagatgatctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgtttattaga 21332896  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332897 acaattcaattatgtctaagtagaaagctat 21332927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 21335716 - 21335941
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  21335716 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgacttagaaccgtcttctcaaactacagccccta 21335815  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21335816 attccttaggtgatctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatttatagactaaccctgtttattaga 21335914  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21335915 acaattcaattatgtctaagtagaaag 21335941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7625207 - 7624973
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  7625207 cacctatttgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacagcctcta 7625108  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7625107 attccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattaga 7625008  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  7625007 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 7624973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31863819 - 31863571
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31863819 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactatagccccta 31863720  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaac--------------gattattcattcctagactaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||              |||||| ||||||||||||||    
T  31863719 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgatcactaacaaatgattatccattcctagactaa 31863620  T
Q  187 ccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31863619 ccatgtttattagaataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 31863571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33552225 - 33551993
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33552225 cacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 33552126  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| |||||    
T  33552125 attccttaagtggtct-ataatctttgaagg-tttaagcacattaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactgaccatatttgttaga 33552028  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33552027 acaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtc 33551993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14016156 - 14016390
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14016156 cacctattcgtattaatgattttctagttccacggtagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 14016255  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||||||| |||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14016256 atttcttaggtggtttaataattctcgaaggtttaaagcactttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 14016355  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14016356 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 14016390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40583353 - 40583120
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||    
T  40583353 cacctattcttatgaatgattctataattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgaccctcttcttaaactacaaccccta 40583254  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||    
T  40583253 attccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaagaaacgattatctattcctagactaaccatctttattaga 40583155  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40583154 acaatttaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 40583120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14375813 - 14376059
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatc-------------ctcttctcaa 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |             |||| |||||    
T  14375813 cacctatttttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccttgagttaggaccctctactcaa 14375912  T
Q  88 actacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaac 187  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14375913 actacagaccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactagcaaacgattatccattcctagactaac 14376011  T
Q  188 cctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14376012 catgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 14376059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12058510 - 12058743
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||    
T  12058510 cacctattcttgtgaaagagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagccccta 12058609  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12058610 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 12058708  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  12058709 acaattcaattaggtttaagtcgaaagctatggtc 12058743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17664655 - 17664423
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| ||||||    
T  17664655 cacctattct-atgtatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctaagattacaaccccta 17664557  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17664556 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatcgattcctagactaaccatgtttattaga 17664458  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  17664457 acaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtc 17664423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 34133001 - 34133234
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||    
T  34133001 cacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagccccta 34133100  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34133101 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 34133199  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  34133200 acaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtc 34133234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 34143232 - 34143465
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||    
T  34143232 cacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagccccta 34143331  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34143332 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 34143430  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  34143431 acaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtc 34143465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39192430 - 39192199
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttct--agtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  39192430 tattcttatgaatgattctctctagttgcacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaagaccctcttcttaaactacaacccctaat 39192331  T
Q  103 tctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaac 202  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39192330 tccttaggtggtataataatctttcaagg-tttaagcacattaacctaatatcactaacaaacgattatctattcctagactaaccatgtttattagaac 39192232  T
Q  203 aattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  39192231 aattcaattagatctaggtcgaaagctatggtc 39192199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12088062 - 12087829
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||    
T  12088062 cacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccccta 12087963  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12087962 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 12087864  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  12087863 acaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtc 12087829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21915221 - 21914992
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattct 105  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||| |||||||||     
T  21915221 ttcttatgaatatttctctaatttcacgatggttaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttatgaccctcttctcagattacagtccctaattcc 21915122  T
Q  106 ttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaat 205  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21915121 ttaggtgatctaatattctttgaaggtttgaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattattcattcctagactaaccctgtttatttgaacaat 21915022  T
Q  206 tcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21915021 tcaattaggtctaagttgaaagctatggtc 21914992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2837357 - 2837174
Alignment:
Q  52 cctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaa 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  2837357 cctaatcaatcccttgatttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaacgttaacctat 2837258  T
Q  152 tatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2837257 tatcactaataaacgattatccattcataaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtc 2837174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17748544 - 17748311
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||| || ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||    
T  17748544 cacctatttttgtgaatgagtccctagtttaacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagccccta 17748445  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||| ||| |||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17748444 atttcttaagtgatctaataaccgtcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 17748346  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  17748345 acaattcaattagttctaagtcgaaagctatggtc 17748311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26292895 - 26292662
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |     |||| ||||||    
T  26292895 cacctattcttatcaatgattcgctagttccatgatagttaaccaaatagtccgaaccaatcccttgagttacgaccctcttatagggttacaaccccta 26292796  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26292795 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatacattcctagactaaccatgtttattaga 26292697  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  26292696 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 26292662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26907473 - 26907706
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||  ||    
T  26907473 cacctattcttatgaatgattcattagttctacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacctgta 26907572  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26907573 attccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcaccaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 26907671  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  26907672 acaattcaattaagtctaagtcgaaagctagggtc 26907706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 28787347 - 28787573
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaat--caatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccc 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||     
T  28787347 cacctattctgatgaatgattttctaattccacaatagttaacaaaatagtcttaatttcaatcccttgacttag-accctcttctcaaactacaaccca 28787445  T
Q  99 taattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttatta 198  Q
    |||||| |||| |||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28787446 taattccttagctggtctaataa---------ggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttatta 28787536  T
Q  199 gaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28787537 gaacaattcaattatgtccaagtagaaaactatggtc 28787573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22131334 - 22131159
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  22131334 cacctattcgtatgaatgattctctagttctacgatagttaacaaaatattcctaatcaatctcttgagttaggaccctcttctcaaactacaacaccta 22131235  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcatt 176  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22131234 attccttaggtggtttaataatccttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaataaacgattatccatt 22131159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37215149 - 37215019
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37215149 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 37215050  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaagg 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37215049 attccttaggtggtctaataatctttgaagg 37215019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 18239527 - 18239748
Alignment:
Q  14 gaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtgg 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| | || | |||||||||  ||||||||    
T  18239527 gaatgattctctagtttcacgataattaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggacccccttgtcagagtaaaacccctaatttcttaggtgg 18239626  T
Q  114 tctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattat 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  18239627 tctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatattacatataaacgattatccattcctagactagccttgtttatttgaacaattcaattag 18239726  T
Q  214 gtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  18239727 gtctaagttcaaagctatggtc 18239748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32838007 - 32837888
Alignment:
Q  116 taataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  32838007 taataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggt 32837908  T
Q  216 ctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  32837907 ctaagtcgaaagctatggtc 32837888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30066348 - 30066213
Alignment:
Q  99 taattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttatta 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||    
T  30066348 taattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagaacgttaacctaatatctctaacaaacgattatccactcctagactaaccatgtttgtta 30066250  T
Q  199 gaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30066249 gaacaattcatttaggtctaagtagaaagctatggtc 30066213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 230
Target Start/End: Original strand, 18765681 - 18765889
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||| | |   |||| | |||||||| ||| ||||||||| |     
T  18765681 tctagttttacgatggttaactaaaatagttataatcaatcccttgagttagatccctcttgttagcttacaactcctaattccttaagtggtctaacat 18765780  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18765781 tcttcgaaggttttaagagcgttaacctaatatcacaaataaatgattatttattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaaataggtctaagt 18765880  T
Q  222 agaaagcta 230  Q
     | ||||||    
T  18765881 cgtaagcta 18765889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Original strand, 11959245 - 11959421
Alignment:
Q  54 taatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaata 153  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||     ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11959245 taatcaatcctttgagttagaaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtgtaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaata 11959343  T
Q  154 tcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaatt-atgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    ||||||| ||| ||||| || |   |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||    
T  11959344 tcactaataaaggatta-tctt---tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaaggtctaagtcgaacgctatggt 11959421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23044123 - 23044040
Alignment:
Q  147 cctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagcta 230  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23044123 cctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagcta 23044040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 563340 - 563497
Alignment:
Q  64 cttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 163  Q
    |||||||||| | |||||| ||  | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| |   | ||||| ||||||||| |  ||    
T  563340 cttgagttagaaccctcttgtcggattacaacccctaattctttaggtgatctaatattcttcaaaggttttcaaagcattaacataatatcacaattaa 563439  T
Q  164 acgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  563440 acgattattcattcctagactaaccttgtttagttgaacaattcaattaggtctaagt 563497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31575499 - 31575288
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatccctt-gagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaata 120  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| || || |||  ||||||||||| ||||| | |||||||  |||||  |||||||    
T  31575499 tctagtttcacgatggttaactaaaatagctctaatcaatccctttgacttgggactctcttctcaaattacagtctctaattccctaggtaatctaata 31575400  T
Q  121 atctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaatta--tgtcta 218  Q
     ||||||||| |   ||| | |||||||||||||||| || |||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  31575399 ttctttgaag-taaaaagaaagttaacctaatatcacaaataaacgaatatccattctcagaataaccctgtttatttgaacaattcaattaggtgtcta 31575301  T
Q  219 agtagaaagctat 231  Q
    ||| |||||||||    
T  31575300 agttgaaagctat 31575288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23044246 - 23044130
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||      ||| ||||||    
T  23044246 cacctattcttatgaatgattcagtagtttcacgatagttaacaaaataatcttaatcaatgccttgagttaggaccctcttctagggtcacatccccta 23044147  T
Q  101 attctttaggtggtcta 117  Q
    |||| ||||||||||||    
T  23044146 attccttaggtggtcta 23044130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 30066413 - 30066348
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccctt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30066413 cacctattcttatgaatgattttctagttccgcgatagttaacaaaatagtgctaatcaatccctt 30066348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22130197 - 22130135
Alignment:
Q  173 cattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  22130197 cattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctagggtc 22130135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24150776 - 24150542
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24150776 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 24150677  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24150676 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctggactaaccctgtttattaga 24150577  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24150576 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 24150542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39501752 - 39501518
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39501752 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttaggaccctcttatcaaactacagccccta 39501653  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39501652 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 39501553  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39501552 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 39501518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 34017799 - 34018033
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34017799 cacctattcttatgaatgattttctggttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagccccta 34017898  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34017899 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 34017998  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34017999 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 34018033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 40616826 - 40617060
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40616826 cacctattcttatgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 40616925  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40616926 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaaaatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 40617025  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40617026 acaattcaattctctctaagtagaaagctatggtc 40617060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48637609 - 48637375
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48637609 cacctatgcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 48637510  T
Q  101 attctttaggtggtctaat-aatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattag 199  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48637509 attccttaggtggtctaataaatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattag 48637411  T
Q  200 aacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48637410 aacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 48637375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5672995 - 5672765
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5672995 tattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattc 5672896  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5672895 cttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaa 5672796  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5672795 ttcaattctgtctaagtagaaaactatggtc 5672765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19820831 - 19820602
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19820831 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagccccta 19820732  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19820731 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatcttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 19820633  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctat 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19820632 acaattcaattctgtctaagtagaaagctat 19820602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 52006549 - 52006782
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  52006549 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaactacagccccta 52006648  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  52006649 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtcaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaacctgtttattaga 52006747  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52006748 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 52006782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 52530953 - 52531187
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52530953 cacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatccccta 52531052  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52531053 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagagtgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 52531152  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  52531153 acaattcaattctgtctaagtaaaaagctatggtc 52531187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 56195631 - 56195397
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56195631 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 56195532  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  56195531 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 56195432  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  56195431 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 56195397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5670677 - 5670447
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5670677 tattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattc 5670578  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5670577 cttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaa 5670478  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5670477 tttaattctgtctaagtagaaaactatggtc 5670447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18911602 - 18911369
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18911602 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 18911503  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18911502 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctattatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 18911404  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18911403 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 18911369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 24044159 - 24044391
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24044159 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggacactcttctcaaactacagccccta 24044258  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24044259 atttcttaggtggtctaataatctttaaagg-tttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 24044357  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24044358 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggt 24044391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15432182 - 15431952
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15432182 cacctattcttatgaatgattctctagtaccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatccccta 15432083  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15432082 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaatctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 15431984  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatg 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15431983 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatg 15431952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 37103234 - 37103466
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37103234 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgacttagaaccctcttctcaaactacagccccta 37103333  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37103334 attcctttggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaa-cctgtttattaga 37103431  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37103432 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 37103466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40795106 - 40794872
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  40795106 cacctattcttatgaatgattttctagttacacgatagttaacagaatagtcctgatcaattccttgacttaagaccctcttctcaaactacagccccta 40795007  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40795006 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 40794907  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  40794906 acaattcaattctgtttaagtagaaagttatggtc 40794872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 44808973 - 44809207
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44808973 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 44809072  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44809073 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgatcatccattcctagactaaccatgtttattaga 44809172  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  44809173 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 44809207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5681528 - 5681298
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5681528 ctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatt 5681429  T
Q  104 ctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  5681428 ccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctagtatcactaacaaacgattatccattcctacactaaccatgcttattagaaca 5681330  T
Q  204 attcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  5681329 attcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 5681298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3719227 - 3718994
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3719227 cacctattcttatgaatgatttgctagttccacaatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttggcttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 3719128  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3719127 attccttaggtggtctaataatctttgaa-gatttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 3719029  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3719028 acaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtc 3718994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 3797826 - 3798059
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  3797826 cacctattcttattaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcacactacaaccccta 3797925  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3797926 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagattaaccctgtttattaga 3798024  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3798025 acaattcaattctgtctaaatagaaagctatggtc 3798059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27014367 - 27014133
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  27014367 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctg 27014268  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  27014267 attccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgttagcctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattaga 27014168  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27014167 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 27014133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 27677073 - 27677306
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27677073 cacctattcttatgaatgattttctagttccaccatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctcaaactacagccccta 27677172  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27677173 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcgctaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttattaga 27677271  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27677272 ataatttaattttgtctaagtagaaagctatggtc 27677306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 40903101 - 40903335
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  40903101 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggactctcttctcaaactacagccctta 40903200  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  40903201 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatcaattcctagactaaccatgattattaga 40903300  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40903301 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 40903335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 34319935 - 34320169
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34319935 cacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagccccta 34320034  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34320035 attccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 34320134  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  34320135 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 34320169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44164882 - 44164657
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  44164882 tattcttatgaatgattttatagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacaatccctaattc 44164783  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44164782 cttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcaggttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaa 44164684  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctat 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44164683 ttcaattttgtctaagtagaaagctat 44164657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15812154 - 15812389
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaa-tcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccct 99  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15812154 cacctattcgtattaatgattttctagttctacaatagttaacaaaatagtcctaaatcaatctcttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccct 15812253  T
Q  100 aattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattag 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15812254 aattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattag 15812353  T
Q  200 aacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15812354 aacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 15812389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12783008 - 12782775
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  12783008 cacctattcttataaatgattttctagtttcattagagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggacccttttctcaaactacaaccccta 12782909  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12782908 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatccctaacaaacgattatccattcatagactaaccctgtttattaga 12782810  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12782809 acaattcaattccgtctaagtagaaagctatggtc 12782775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15429874 - 15430107
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  15429874 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatccatcccttgacttgggacccacttctcaaactactgccccta 15429973  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15429974 attccttaggtggtctaattatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 15430072  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15430073 acaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtc 15430107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 48415547 - 48415781
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  48415547 cacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtcaggactctcttctcaaactacagctccta 48415646  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  48415647 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcaataataaatgattatccattcctagactaaccattattattaga 48415746  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48415747 aaaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 48415781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 56198957 - 56198723
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||     
T  56198957 cacctatttgtattaatcattttctagttctaagatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctctaactacaacccctg 56198858  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  56198857 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattaga 56198758  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  56198757 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 56198723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 38283510 - 38283740
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38283510 ctattcttatgaatgattttctagttccatgatagtaaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacagcccctaatt 38283609  T
Q  104 ctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38283610 ccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt-agcacgttaacctaatatcactaacaaaggattatccattcctagactaaccctgtttattagaaca 38283708  T
Q  204 attcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||  | | | |||||||||||||||||    
T  38283709 attcaatattctatcagtagaaagctatggtc 38283740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12238369 - 12238135
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| | |||    
T  12238369 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctcagattacagtctcta 12238270  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12238269 attccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 12238170  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12238169 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 12238135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15436488 - 15436721
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  15436488 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatccatcccttgacttgggacccacttctcaaactactgccccta 15436587  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15436588 attccttaggtggtctaattatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcaataaaaaacgattatacattcctagactaaccctgtttattaga 15436686  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15436687 acaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtc 15436721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15164295 - 15164062
Alignment:
Q  3 cctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15164295 cctattcttatgaatgattatctagttccatgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttcttaaactacaacccctaat 15164196  T
Q  103 tctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattca-ttcctagactaaccctgtttattagaa 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15164195 tccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcagattaacctaatatcactaacaaacgattatccatttcctagactaaccatgtttattagaa 15164096  T
Q  202 caattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15164095 caattcaattaggtctaagtcgaaagctaaggtc 15164062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 19859544 - 19859773
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859544 tattcttatgaattattttctagttccacgataattaataaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattc 19859643  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19859644 cttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaa 19859742  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
     | ||||| || |||||||||||||||||||    
T  19859743 cttaattaagtttaagtagaaagctatggtc 19859773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29324929 - 29324695
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  29324929 cacctattcatattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttatgaccattttctcaaactacagccccta 29324830  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29324829 attccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 29324730  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  29324729 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 29324695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 19864535 - 19864764
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19864535 cacctattcttatgaatgattttctagttc----atagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 19864630  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  19864631 atttcttagatggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaaa 19864729  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||| | ||||| || |||||||||||||||||||    
T  19864730 acaacttaattaagtttaagtagaaagctatggtc 19864764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15405099 - 15405336
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15405099 cacctatttgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatccattgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 15405198  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattat---tcattcctagactaaccctgtttatt 197  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||    
T  15405199 attccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattattcctagactaaccatgtttatt 15405298  T
Q  198 agaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  15405299 agaacaattcaattcggtctaagtcgaaagctagggtc 15405336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18673100 - 18673333
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     || ||||||||    
T  18673100 cacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttaaagccccta 18673199  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18673200 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 18673298  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18673299 acaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtc 18673333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33927076 - 33926842
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33927076 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccataatcaatcccttgagttaggaccctcttctaaaactacagccccta 33926977  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| | |||||||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  33926976 attcctcaggtggtctaataattctcaaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaatcatgtttattaga 33926877  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  33926876 acagttcaattagatctaagtcgaaagctagggtc 33926842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 46955496 - 46955730
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46955496 cacctatttgtattaatgattctctaattcaacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 46955595  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  46955596 attccttaggtggactaataatctttgaatgttttaaaaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagattaaccatgtttattaga 46955695  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| |||||||    
T  46955696 acaattcaattaggtctaaatcgaaagttatggtc 46955730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49270779 - 49270556
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  49270779 tattcttatgaatgattatctagttcaacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc-ttgagttaggaccctcttctcaaactacagtccctaattc 49270681  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
      ||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||    
T  49270680 cctaggtggtctaataat---tgaaggttttaagaatgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcatatactaaccatgtttatgagaacaa 49270584  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatg 232  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  49270583 ttcaattaggtctaagtcgaaagctatg 49270556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 33408335 - 33408569
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  33408335 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatggttaataaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactataaccccta 33408434  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||  ||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||    
T  33408435 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcacaaataactgattatctattcctagactaacaatgtttatttga 33408534  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33408535 acaactcaattaggtctaagtagacagctatggtc 33408569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 235
Target Start/End: Original strand, 15446792 - 15446987
Alignment:
Q  39 ttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 138  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  15446792 ttaaccaaatagttataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtccaataatcttagaaggttt-aag 15446890  T
Q  139 cacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  15446891 cacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgtttattagaacaattcaattcagtctaagtagaaagttatggtc 15446987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30392672 - 30392455
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||     |||| ||||||    
T  30392672 cacctatttttatgaatgattcgctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctagggttacaaccccta 30392573  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30392572 attcctaaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaagtattattcattcctagactaaccatgtttattaga 30392474  T
Q  201 acaattcaattatgtctaa 219  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  30392473 acaattcaattaggtctaa 30392455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 53094605 - 53094377
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| ||||||| || |    
T  53094605 ttcttacgaatgattctctagtttcacgatgattaacaaaataggcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcatagtacaacccctaactcct 53094506  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaatt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53094505 taggtggtctaatactctttgaatgttttatgaacgttaacttaatatcagaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaacaatt 53094406  T
Q  207 caattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  53094405 caattaggtctaagttgaaaactatggtc 53094377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11195775 - 11195546
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     || |||||||||||     
T  11195775 tattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaacagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaattt 11195676  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11195675 cttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aggcacgttaacctattatcactaataaatgattattcattcctaaactaaccatgtttattagaacaa 11195577  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  11195576 ttcaagtaggtctaagtcgaaagctagggtc 11195546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21419892 - 21419659
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     |||| | ||||    
T  21419892 cacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctagggttacatcaccta 21419793  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  21419792 attccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaagattatccattcctagactaaccatgcttattaga 21419694  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21419693 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 21419659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 53009576 - 53009809
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||     |||||||||||    
T  53009576 cacctattcttgtgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaattaatctcttgagttaggaccctcttctagggttacagccccta 53009675  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  53009676 atttcttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaatggttataaattcctagactaaccatgtttattaga 53009774  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  53009775 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 53009809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 8877525 - 8877753
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |  ||| |||||||||  |    
T  8877525 ttcttatgaatgactctctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggactctcttctccgatcacaacccctaatttct 8877624  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaatt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8877625 taggtggtctaatattctttgaaggttttaagaatgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaatt 8877724  T
Q  207 caattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  8877725 caattaaatctaagttgaaagctatggtc 8877753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 40493385 - 40493619
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttga-gttaggatcctcttctcaaactacagcccct 99  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||     |||| |||||    
T  40493385 cacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaaaaaaatagtcctaatcaatcccttgaagttacgaccctcttctagggttacaacccct 40493484  T
Q  100 aattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattag 199  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40493485 aattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatacattcctagactaaccatgtttattag 40493583  T
Q  200 aacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  40493584 aacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 40493619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 8874785 - 8875013
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| | |||||||||  | ||||||||||||||| |    
T  8874785 ttcttatgaatgattctctagtttcaagatggttaacaaaatagccataatcaatcgattgacttagaaccctcttctccgattacagcccctaattcct 8874884  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaatt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| || || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8874885 taggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacattaacttaatataacaaataaacgactatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaatt 8874984  T
Q  207 caattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8874985 caattaggtctaagttgaaagctatggtc 8875013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25962162 - 25961928
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||    
T  25962162 cacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatattcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagccccta 25962063  T
Q  101 attctttaggtggtctaa-taatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattag 199  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | | ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25962062 attccttaggtggtctaaataaccgtcgaatgttt-aagcacgttaagctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattag 25961964  T
Q  200 aacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  25961963 aacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 25961928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35510038 - 35509835
Alignment:
Q  31 cacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaag 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||    
T  35510038 cacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccattaaag 35509939  T
Q  131 gttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagcta 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  35509938 gttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacgatgtttattagaacaattcaattaggtctaattcgaaagcta 35509840  T
Q  231 tggtc 235  Q
     ||||    
T  35509839 gggtc 35509835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 22172413 - 22172626
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||  ||||||     
T  22172413 tctaatttaacgatagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgaactaatat 22172512  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  22172513 tcttcgaaggttttaagaacgttaacctaatatcgcaaataaacgattatccattcatagactaaccctgtttatttgaacaattcaataaggtctaagt 22172612  T
Q  222 agaaagctatggtc 235  Q
     |||||||||||||    
T  22172613 tgaaagctatggtc 22172626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 232
Target Start/End: Original strand, 27679337 - 27679473
Alignment:
Q  95 cccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgttt 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27679337 cccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgttt 27679435  T
Q  195 attagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatg 232  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27679436 attagaacaattcaattctgtataagtagaaagctatg 27679473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 29544892 - 29545111
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |     |||| ||||||    
T  29544892 cacctattattgtgaatgattaactagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttatgactctcttatagggttacaaccccta 29544991  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29544992 attccttaggaggtctaataacctttgaaggttt-aagcacattaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 29545090  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagt 221  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  29545091 acaattcaattaggtgtaagt 29545111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19827488 - 19827361
Alignment:
Q  106 ttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19827488 ttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaat 19827390  T
Q  206 tcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||    
T  19827389 tccattcagtctaagtagaaagctatggt 19827361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 234
Target Start/End: Original strand, 37739783 - 37740013
Alignment:
Q  8 tcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| | ||||||||| |    
T  37739783 tcttatgaatatttctctagtttcacgatggttagctaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattactgtccctaattcct 37739882  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacc---taatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||   ||||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |    
T  37739883 taggtgatctaataatctttgaaggttttacaaacattaacctaataatatcacaaataaacgattatccattcatagattaacccagtttatttgaaaa 37739982  T
Q  204 attcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  37739983 attcgattaggtctaagttgaaagctatggt 37740013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5706496 - 5706355
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaat-agtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||    
T  5706496 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctcagattacagtccct 5706397  T
Q  100 aattctttaggtggtctaataa-tctttg-aaggttttaagc 139  Q
    ||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5706396 aattccttaggtgagctaataattctttgtaaggttttaagc 5706355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 33493732 - 33493947
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgata--gttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaat 119  Q
    |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||| | ||| |||| | |||||| | |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  33493732 tctagttttacgataaagttaactaaaatagtcctatttaattccttaacttaggaccatcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaat 33493831  T
Q  120 aatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaa 219  Q
    | |||||||| |||| ||| |||||||| || |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33493832 attctttgaatgtttaaagaacgttaacatattatcacaaataaacgattatctattcctagactaactctgtttatttgaacaattcaattaggtctaa 33493931  T
Q  220 gtagaaagctatggtc 235  Q
     | | |||||||||||    
T  33493932 attgtaagctatggtc 33493947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 235
Target Start/End: Original strand, 48014167 - 48014304
Alignment:
Q  98 ctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttatt 197  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  48014167 ctaattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaatgtcacaaataaacgattatccattcctaaactaaccctgtttatt 48014266  T
Q  198 agaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  48014267 tgaacaattcaattaggtcaaagttgaaagttatggtc 48014304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 5677447 - 5677650
Alignment:
Q  22 ttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaata 120  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| | ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  5677447 ttctagtttcacgatggctaactaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccatcttctcagattacagtccctaattccttaagtgatctaata 5677546  T
Q  121 atctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaag 220  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | ||||    ||||||||      ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5677547 ttctttgaaggttttaaggacgttaaccttgtatcacaaatatacga----tcattcct------accttgtttatttgaacaattcaattaagtctaag 5677636  T
Q  221 tagaaagctatggt 234  Q
    | | ||| ||||||    
T  5677637 ttgtaagttatggt 5677650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 39498413 - 39498346
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttga 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39498413 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttga 39498346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 15445383 - 15445430
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaat 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15445383 cacctattcttatgaatgattttctacttccacgatagttaacaaaat 15445430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 171
Target Start/End: Original strand, 8448654 - 8448744
Alignment:
Q  81 ttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattat 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||| |||   ||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  8448654 ttctccaactacagcccctaatttcataggtgatctaataatctttaaaggtattacaaacgttaagctaatatcacaaacaaaggattat 8448744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 35510095 - 35510043
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcc 53  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35510095 cacctattcttatgaatgattcactagttccacgttagttaacaaaatagtcc 35510043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Original strand, 24410206 - 24410246
Alignment:
Q  181 gactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24410206 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 24410246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 8448590 - 8448648
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 63  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8448590 ctattcttatgaataatat-ctagttttacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcc 8448648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8888722 - 8888489
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8888722 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 8888623  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8888622 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 8888524  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8888523 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 8888489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 37279695 - 37279929
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37279695 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 37279794  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37279795 attccttacgtggtctaataatctttgaaggttttaagaatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 37279894  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37279895 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 37279929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 42368730 - 42368963
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  42368730 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 42368829  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42368830 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 42368928  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42368929 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 42368963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 11347917 - 11348148
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11347917 ctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatt 11348016  T
Q  104 ctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 203  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348017 tcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaaca 11348116  T
Q  204 attcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11348117 attcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 11348148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 43207912 - 43208142
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43207912 ctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagt-aggaccctcttctcaaactacagcccctaatt 43208010  T
Q  104 ctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 203  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43208011 ccttaggtggtctaatagtctttgaaggttgtaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 43208110  T
Q  204 attcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43208111 attcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 43208142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24235182 - 24234948
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24235182 cacctattcttatgaatgatttcctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 24235083  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24235082 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattata 24234983  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24234982 acaattcaattctgtctaagtagaaagatatggtc 24234948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 25959707 - 25959941
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  25959707 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcagactacaaccccta 25959806  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25959807 attccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 25959906  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25959907 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 25959941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24238454 - 24238220
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24238454 cacctattcttatgaatgatttcctagttccacgatagttaacaaaatatacctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 24238355  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24238354 attccttaggtggtctaataatctttgaagattttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 24238255  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24238254 acaattcaattctgtctaagtagaaagatatggtc 24238220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 31585962 - 31586192
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31585962 ctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatt 31586061  T
Q  104 ctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31586062 ccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaaca 31586161  T
Q  204 attcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31586162 attcaattctgtctaagtagaaagctatggt 31586192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40781558 - 40781325
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40781558 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 40781459  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40781458 atttcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttgacctaatattactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 40781360  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40781359 acaattcaattctgtctaagtagaaagctgtggtc 40781325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5105813 - 5105579
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5105813 cacctattcatatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 5105714  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  5105713 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctatactaaccatgattattaga 5105614  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5105613 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 5105579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 9185447 - 9185677
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  9185447 tattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagtctctaattc 9185546  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9185547 cttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgattattagaacaa 9185646  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9185647 ttcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 9185677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 30274787 - 30275021
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30274787 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaagaccctcttctcaaactacagccccta 30274886  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  30274887 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactgataaaggattatccattcctagactaaccatgattattaga 30274986  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30274987 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 30275021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 25820865 - 25821098
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25820865 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 25820964  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25820965 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctagtatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 25821063  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  25821064 acaattcaattaggtataagttgaaagctagggtc 25821098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26366019 - 26365794
Alignment:
Q  2 acctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26366019 acctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaa 26365920  T
Q  102 ttctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaa 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26365919 ttccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctaaactaaccatgtttattagaa 26365820  T
Q  202 caattcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
     |||||||||| || ||||| |||||    
T  26365819 aaattcaattaggtataagtcgaaag 26365794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6826857 - 6826625
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6826857 cacctatttttatgaatgattttctagttccacgat-gttaacaaaatagtcctaatcaaacccttgacttaggattctcttctcaaactacagccccta 6826759  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6826758 attccttaggtggtctaataatttttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 6826660  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6826659 acaattcaattctttctaagtagaaagctatggtc 6826625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 9188671 - 9188905
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9188671 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagtcaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 9188770  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  9188771 attacttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattaga 9188870  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9188871 acaattcaattctgtctaagtagaaatctatggtc 9188905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22021154 - 22020920
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  22021154 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacaaccccta 22021055  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22021054 attccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 22020955  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  22020954 acaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtc 22020920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 31427560 - 31427794
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31427560 cacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 31427659  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31427660 attccttaagtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagattaaccatgtttattaga 31427759  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31427760 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 31427794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 36808461 - 36808694
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||    
T  36808461 cacctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaagaccctcttcttaaactacagacccta 36808560  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36808561 attctttaggtggtctaataatctttgaaag-tttaagcacgttaacctaatattactaataaacgattatacattcctagactaaccctgtttattaga 36808659  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36808660 acaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtc 36808694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25870870 - 25870637
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  25870870 cacctattcttgtgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagttttaatcaatcccttgagttaggaccgtcttctcaaactacatccccta 25870771  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25870770 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacaattatccattcctagactaaccctgtttattaga 25870672  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25870671 acaattcaagtctgtctaagtagaaagctatggtc 25870637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 25138950 - 25139184
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25138950 cacctattcttatgaacgattttcaagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 25139049  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || |||| |||    
T  25139050 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattatgaga 25139149  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25139150 acaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtc 25139184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43723786 - 43723553
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||| |||||||||| || |||||    
T  43723786 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcctttaacttaggaccctcgtctcaaactatagtcccta 43723687  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43723686 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgctaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 43723588  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43723587 acagttcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 43723553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27266872 - 27266641
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaatt 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27266872 ctattcttatgaatgactttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaataaattccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaatt 27266773  T
Q  104 ctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27266772 ccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagtacgttaacctattatcactaataaacgattatccattcttagactaaccatgtttattagaaca 27266673  T
Q  204 attcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  27266672 attcaattaggtctaagtcgaaatctatggtc 27266641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 9966388 - 9966622
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9966388 cacctattcttatgaattattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaaacccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccctta 9966487  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  9966488 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaacgttaacttaacatcacaaataaatgattatccattcctagactaaccatgtttatttga 9966587  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9966588 acaattcaattaggtctaagtaggaagctatggtc 9966622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13971913 - 13972146
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| || | ||||||    
T  13971913 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttaacttaggacactcttctcaaaataaaaccccta 13972012  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13972013 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgttttttaga 13972111  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13972112 aaaatccaattaggtctaagtagaaagctatggtc 13972146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45453960 - 45453726
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45453960 cacctattcgtattaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagcactaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 45453861  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45453860 attccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 45453761  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  45453760 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 45453726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38015604 - 38015371
Alignment:
Q  2 acctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaa 101  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38015604 acctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaa 38015505  T
Q  102 ttctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaa 201  Q
    ||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38015504 ttccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcaccttaacctaatatcactaacaaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaa 38015405  T
Q  202 caattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  38015404 caattcaattaggtcaaagtcgaaagctagggtc 38015371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 45493175 - 45493400
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45493175 cacctattcttatgaatgattctctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagccccta 45493274  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45493275 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 45493373  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||    
T  45493374 acaattcaattaggtataagtcgaaag 45493400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 45500917 - 45501142
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45500917 cacctattcttatgaatgattctctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagccccta 45501016  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45501017 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 45501115  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||    
T  45501116 acaattcaattaggtataagtcgaaag 45501142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25874267 - 25874028
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  25874267 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagttttaatcaatcccttgagttaggaccgtcttctcaaactacatccccta 25874168  T
Q  101 a------ttctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgttt 194  Q
    |      ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25874167 accctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacaattatccattcctagactaaccctgttt 25874069  T
Q  195 attagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  25874068 attagaacaattcaagtctgtctaagtagaaagttatggtc 25874028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5666600 - 5666371
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||    
T  5666600 tattcttatgaatgattttctagttccaagatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattc 5666501  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5666500 cttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacta 5666402  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5666401 ttcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 5666371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33310750 - 33310519
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaatt 103  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33310750 ctattcatattaataattttctagttccacggtagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatt 33310651  T
Q  104 ctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 203  Q
    | |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33310650 ccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcaagttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaactatgtttattagaaca 33310551  T
Q  204 attcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  33310550 attcaattaggtctaagtccaaagctagggtc 33310519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45457248 - 45457014
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45457248 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcaaactacagccccta 45457149  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  45457148 attccttaggtggtctaataataatagaaggtttaaagaacgttaacctaatatcactaaaaaaagattatccattcatagactaaccatgtttattaga 45457049  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  45457048 acaattcaattaggtctaagtcgaaaactagggtc 45457014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29440581 - 29440375
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29440581 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagccccta 29440482  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29440481 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaagctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 29440383  T
Q  201 acaattca 208  Q
    ||||||||    
T  29440382 acaattca 29440375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16179209 - 16178988
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||| ||||||||||    
T  16179209 tattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctaggattacatcccctaattc 16179110  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16179109 cttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataatggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaa 16179011  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  16179010 ttcaattaggtctaagtcgaaag 16178988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 1386445 - 1386674
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||    
T  1386445 tattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattc 1386544  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1386545 cttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatttctagactaaccatgtttattagaacaa 1386643  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1386644 ttcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 1386674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 16790807 - 16791011
Alignment:
Q  32 acgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16790807 acgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggctacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg 16790906  T
Q  132 ttttaagcacgt--taacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagct 229  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  16790907 ttt-aagcacgtgttaacctaatatcactaacaaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagccgaaagct 16791005  T
Q  230 atggtc 235  Q
    ||||||    
T  16791006 atggtc 16791011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 37937238 - 37937471
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||| |    
T  37937238 cacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagccccca 37937337  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37937338 attccttaggtggtctaataatcgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctaaactaaccatgtttattaga 37937436  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37937437 ataattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtc 37937471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12219882 - 12219649
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     || | | | ||    
T  12219882 cacctattcttgtgaatgtttttctagttccacgatagttagcaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttatatctctta 12219783  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12219782 attccttatgtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 12219684  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  12219683 acaattcaattaggtttaagtcgaaagctagggtc 12219649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 40259158 - 40259391
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |     |||||| ||||    
T  40259158 cacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttatagggttacagcgccta 40259257  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  40259258 attccttaggtggtataataatcgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaatgattatccattcctaaactaaccatgtttattaga 40259356  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  40259357 acaattcaattaggtctaagtcgaaaactatggtc 40259391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3875349 - 3875139
Alignment:
Q  24 ctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatc 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3875349 ctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacc 3875250  T
Q  124 tttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtag 223  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  3875249 attgaaggttt-aatcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctatactaaccatgtttattagaaaaattcaattaggtctaagtcg 3875151  T
Q  224 aaagctatggtc 235  Q
    ||||||| ||||    
T  3875150 aaagctagggtc 3875139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22630927 - 22630699
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||     |||||||||||    
T  22630927 cacctattcttatgaatgattccctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccattttctagggttacagccccta 22630828  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  22630827 attccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcatgttaacctaatatcaataataaaatattatccattcttagactaacaatgtttattaga 22630729  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagcta 230  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22630728 acaattcaattaggtctaagtcgaaagcta 22630699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17877192 - 17876959
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||   |||||    | |||| ||| ||    
T  17877192 cacctattcttattaatgattctctagttccatgatagttaacaaaatagccaaaatcaatcccttgagttaggactttcttcgaggattacaaccctta 17877093  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||| | ||||| |||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17877092 attacttaggggctctaacaatctttgaacgtat-aagcacgttatcctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 17876994  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  17876993 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 17876959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 17874606 - 17874834
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||  |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||     |||| ||||||    
T  17874606 cacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatgattaacaaaatagtcttagtcaatcccttaagttaggaccctcttctagggttacaaccccta 17874705  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatct-ttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattag 199  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||      ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17874706 attccttaggtggtctaata-tctgttgaaggtt------acgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtgtattag 17874798  T
Q  200 aacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17874799 aacaattcaattaagtctaagtcgaaagctatggtc 17874834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 10601001 - 10600876
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  10601001 cacctatttttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagccctta 10600902  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatcttt 126  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||    
T  10600901 attccttaggtggtctagtaatcttt 10600876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30926614 - 30926401
Alignment:
Q  14 gaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc----tttag 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||     ||||    
T  30926614 gaatgattttctagtttcacgatggttagcaaaatagtcctaatcaatccattgacttaggaccctcttctcagatgacaacccctaattccttaattag 30926515  T
Q  110 gtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||           | |||| |||||||| |||||||||||    
T  30926514 gtggtctaatactctttgaaggttttatgaacgttaacttaatatcacaaataaacgattat-----------ccaaccatgtttatttgaacaattcaa 30926426  T
Q  210 ttatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||    
T  30926425 ttaggtctaagttgaaagctatggt 30926401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 230
Target Start/End: Original strand, 35521401 - 35521613
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    ||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||||| | ||||  ||||||||  ||||||| |||||||     
T  35521401 tctagtttttcgatggttaactaaaatagttctaatcaactcattgacttaggaccctcttctcagattacaatccctaatttcttaggtgatctaatat 35521500  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattc----attcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtct 217  Q
    |||||||||||||||||  || |||||| ||||||| || |||| ||||| |    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  35521501 tctttgaaggttttaagagcgctaaccttatatcacaaataaacaattatccatatattcctagactaaccatgtttatttgaacaaatcaattaggtct 35521600  T
Q  218 aagtagaaagcta 230  Q
    |||| ||||||||    
T  35521601 aagttgaaagcta 35521613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34682764 - 34682622
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| |||||||     
T  34682764 tctagtttcacgatggttaaccaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggactctcttctcagattacagtccctaattcctaaggtgatctaatat 34682665  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacg 166  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  34682664 tctttg--ggttttaagaacgttaacctgatatcacaaataaacg 34682622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10600876 - 10600799
Alignment:
Q  152 tatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||      |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10600876 tatcactaacaaacgattatcca------gactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 10600799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 17876211 - 17876263
Alignment:
Q  183 ctaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17876211 ctaaccatgtgtattagaacaattcaattaagtctaagtcgaaagctatggtc 17876263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11188120 - 11187946
Alignment:
Q  53 ctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaat 152  Q
    |||||||||||||||||| ||  | ||||||| | | |||| |||| ||||  ||||||| ||| ||| | || ||||||||| || | |||||  || |    
T  11188120 ctaatcaatcccttgagtcagagttctcttcttagattacatcccccaatttcttaggtgctctcatattgttcgaaggtttttagaatgttaatatatt 11188021  T
Q  153 atcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
     |||| |  ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  11188020 ctcacaattaaacggttatccattcctagactaaccatgtttaattaaacaattcaattaggtataagttgaaag 11187946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19500 - 19266
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19500 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaactctcttctcaaactacagccccta 19401  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19400 attccttaggtggtctaataaactttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 19301  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19300 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 19266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5456 - 5223
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5456 cacctattcttatgaatgattttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagccccta 5357  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  5356 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgatcatccattcctagactaaccctatttattaga 5258  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5257 acaatttaattctgtctaagtagaaagctatggtc 5223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 8237 - 8470
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8237 cacctattcttatgaatgattttctatttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcgatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagccccta 8336  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8337 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcacaaacaaacgattatccattcctagactaaccaagtttattaga 8435  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8436 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 8470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 1566 - 1780
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  1566 cacctattcttatgaatgattgtctagttacacaatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggaccgtcttctcaaactacaaccccta 1665  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1666 attccttaggtggtctaataatctttaaaag-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaga 1764  T
Q  201 acaattcaattatgtc 216  Q
    | ||||||||| ||||    
T  1765 ataattcaattctgtc 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Original strand, 4187 - 4231
Alignment:
Q  191 gtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4187 gtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 4231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18721299 - 18721533
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  18721299 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgactctcttctcatactacagccccta 18721398  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18721399 atttcttagttggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 18721498  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18721499 ataattcaattttgtctaagtagaaagctatggtc 18721533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16953878 - 16953645
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16953878 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 16953779  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16953778 attccttaggcggtctaataattctcgaaggtttaaagcacattaacctaatatcattaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttataaga 16953679  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggt 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16953678 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggt 16953645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12583109 - 12582876
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12583109 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttgacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 12583010  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12583009 attccttaggtggtgtaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacaattatctattcctagactaaccctgtttattaga 12582911  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12582910 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 12582876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18825905 - 18826139
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18825905 cacctattcgtattaatgatcttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 18826004  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18826005 attccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattaga 18826104  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18826105 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 18826139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 25591497 - 25591730
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  25591497 cacctatttttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagactctcttctcaaactacagccccta 25591596  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  25591597 attccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattaga 25591696  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25591697 acaattcaattttgtctaagta-aaagctatggtc 25591730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 25594675 - 25594909
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||    
T  25594675 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagactctcttctcaaactacagcccata 25594774  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  25594775 attccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcagtaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattaga 25594874  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25594875 acaaatcaattttgtctaagtagaaagctatggtc 25594909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 45155287 - 45155521
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
T  45155287 cacctattcttatgaatgattctctagtttcgcgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcaaactaaaaccccta 45155386  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  45155387 attccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttaataga 45155486  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45155487 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 45155521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14421847 - 14421612
Alignment:
Q  1 cacctattctta-tgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccct 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14421847 cacctattcttactgaatgattttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccct 14421748  T
Q  100 aattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattag 199  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14421747 aattccttaggtggtctgataatctttgaaggttttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcatagactaaccatgtttattag 14421648  T
Q  200 aacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14421647 aacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtc 14421612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 5538791 - 5539025
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  5538791 cacctattcttatgaatgattctctagttgcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttagaaccctcttctcaaactacaaccccta 5538890  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    ||||  |||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5538891 attccgtaggtggtttagtgatctttgaaggttttatgcacattaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaatcatgtttattaga 5538990  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5538991 acaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtc 5539025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18824412 - 18824646
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18824412 cacctattcgtattaatgatcttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 18824511  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18824512 attccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 18824611  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18824612 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 18824646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17931082 - 17930849
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17931082 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttacgaccctcttctcaaactacagccccta 17930983  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  17930982 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttgatcttatatcactaacaaacgattatccattcctatactaaccatgtttactaga 17930884  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17930883 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 17930849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 36710654 - 36710888
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36710654 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaaccccta 36710753  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36710754 attccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 36710853  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  36710854 acaattcaattaggtccaagtcgaaagctagggtc 36710888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21279787 - 21280006
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  21279787 cacctattcttatgaatgattctctagttacatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagactctcttcttaaactacagccccta 21279886  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21279887 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagaccaaccatgtttattaga 21279985  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagt 221  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  21279986 acaattcaattaggtctaagt 21280006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13196954 - 13196725
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||     
T  13196954 tattcttatgaatgattttctagttccaagatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcgaactacaacccctaattt 13196855  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13196854 cttaggtagtctaataatctttgaagg-tttgagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaa 13196756  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  13196755 ttcaattaggtttaagtcgaaagttatggtc 13196725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23643911 - 23643687
Alignment:
Q  11 tatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttagg 110  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  23643911 tatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttatgaccctcttctcagattacagcctctaattccttagg 23643812  T
Q  111 tggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaat 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23643811 tggtctaataatctttaaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaacatgtttattagaacaattcaat 23643712  T
Q  211 tatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    || ||||||||  ||||||| ||||    
T  23643711 taggtctaagtcaaaagctagggtc 23643687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Original strand, 22173976 - 22174175
Alignment:
Q  36 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173976 tagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 22174075  T
Q  136 aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22174076 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaatttaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 22174175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 5980331 - 5980564
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  5980331 cacctattcttatggatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagtccgta 5980430  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||    
T  5980431 atttcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatatctagactaaacttgtttattaga 5980529  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  5980530 acaagtcaattaggtctaagtcgaaagttatggtc 5980564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10664000 - 10663767
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  10664000 cacctattcttatgaatgattctctagttctatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagccctta 10663901  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10663900 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacattaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 10663802  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  10663801 acaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtc 10663767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25231182 - 25230956
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  25231182 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcctcta 25231083  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  25231082 attccttgggtgttctaataatatttgaaggttttaagtatgttaacctaatatcactaataaacgattatccattcctaagctaaccatgtttattaga 25230983  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||    
T  25230982 acaattcaattaggtctaagtcgaaag 25230956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 43681892 - 43682122
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||    
T  43681892 tattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcatattacagtccctaattc 43681991  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
      ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  43681992 cgtaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcatgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacat 43682091  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43682092 ttcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 43682122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12516470 - 12516705
Alignment:
Q  1 cacctattcttatg-aatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccct 99  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||  ||||    
T  12516470 cacctattcttttggaatggttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttcttagattacaatccct 12516569  T
Q  100 aattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattag 199  Q
    ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12516570 aattccttagttgatctaatattctttgaaggttttatgcactttaacataatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattag 12516669  T
Q  200 aacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  12516670 aacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtc 12516705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 38248421 - 38248650
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  38248421 tattcttatgaatgattctctagttccacgatagctaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttaggacattcttctcaaactacagcccctaattc 38248520  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||    
T  38248521 cttaggtggtctaataatctttgaaagtttt-agtacgttaacctaatatcactaataaacgattatccaaacctagactatctatgtttattagaacaa 38248619  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  38248620 ttcaattaggtctaagtcgtaagctatggtc 38248650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10498232 - 10498462
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||    
T  10498232 cacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagccccta 10498331  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10498332 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagtacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattccaagactaaccatgtttattaga 10498430  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatg 232  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10498431 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctatg 10498462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8911750 - 8911515
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactac-agcccct 99  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||    |||| | |||||    
T  8911750 cacctattcttgtgaatgattcactagttctatgatagttaacaaaatagtcctaataaatccctcgagtttagaccctcttctagggctacaaccccct 8911651  T
Q  100 aattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattag 199  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8911650 aattccttaggtggtctaataacctttgaaggttttaagcacgttaacataatatcactaataaaggattatgcattcctagactaaccatgtttattag 8911551  T
Q  200 aacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8911550 aacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 8911515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31284775 - 31284542
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||    
T  31284775 cacctattcttgtgaatgagtccctagttctatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacatccccta 31284676  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31284675 attccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaca 31284577  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  31284576 acaattcaattaggtctaagtcgaaggctatggtc 31284542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23619382 - 23619615
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||     |  ||||||||    
T  23619382 cacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagttctaatcaattcattgagttagaaccctcttctagggttgaagccccta 23619481  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23619482 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatttcactaataaatgattatccattcctagactaaccatgtttattaga 23619580  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23619581 acaattcaattatgtctaagtcgaaagctatggtc 23619615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33419757 - 33419524
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||    
T  33419757 cacctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatattcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccccta 33419658  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33419657 attccttatgtggtctaataacctttgaagg-tttaagcatgtttatctaatatcactaataaaggattatacattcctagactaaccatgtttattaga 33419559  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  33419558 acaattcaattcggtctaagtcgaaagctagggtc 33419524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2560654 - 2560420
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtt-aggatcctcttctcaaactacagcccct 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||  ||||||||| | |||| ||| |    
T  2560654 cacctattcttatgaatgattatctagttccacgatagttaacaaaatagccataatcaatcacttgagtttaagactctcttctcagattaca-cccat 2560556  T
Q  100 aattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattag 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||    
T  2560555 aattccttaggtggtctaataatctttgaaggctttaagcacgttaaactaatatcattaataaaggattatccattcctagactaaccatctgtattag 2560456  T
Q  200 aacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| | ||||||    
T  2560455 aacaattcagttaggtctaagtcgaaaaccatggtc 2560420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 44027115 - 44027330
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||||||    
T  44027115 tattcttgtgaatgattaactagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattc 44027214  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||    
T  44027215 cttaggtggtctaataatcgttgaagg-tttaaacacgttaacctaatgtcactaataaatgattattcattcctaacctaatcatgtttattagaaaaa 44027313  T
Q  205 ttcaattatgtctaagt 221  Q
    |||||||| ||||||||    
T  44027314 ttcaattaagtctaagt 44027330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 33883368 - 33883501
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  33883368 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacaaccccta 33883467  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttt 134  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33883468 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 33883501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Original strand, 5613739 - 5613934
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaa--ctacagcccctaat 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |   || ||||||||||    
T  5613739 tattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcccctaat 5613838  T
Q  103 tctttaggtggtctaata-atctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttatt 197  Q
    || ||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  5613839 tccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatacctagaataaccatgtttatt 5613934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4868330 - 4868125
Alignment:
Q  25 tagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatct 124  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | |||||  | |||||| ||||||| ||||||| |||    
T  4868330 tagtttcacgatggttaactaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcggattacagttcataattccttaggtgatctaatattct 4868231  T
Q  125 ttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtaga 224  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||     |||||| |||||||||||||| | |||||| ||    
T  4868230 ttgaaggttttaagaacgttcacctaatatcacaaataaaaaattatccattcctagactaa-----tttatttgaacaattcaattaggcctaagttga 4868136  T
Q  225 aagctatggtc 235  Q
    ||| |||||||    
T  4868135 aagttatggtc 4868125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30785014 - 30784797
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||  ||||| |||||||||  | ||||| | ||||||| |    
T  30785014 ttcttacgaatgattctctagtttcacgatagttaacaaaataaccctaatcaatccatggacgtaggaccctcttctcggattacagtctctaattcct 30784915  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaatt 206  Q
    |||||| | |||   ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||            || |||||||||| ||  | |||||||| ||||||||    
T  30784914 taggtgatttaaagttctctgaaggttttacgaacgttaacctaatatcac-----------aatccattcctagattattcatgtttatttgaacaatt 30784826  T
Q  207 caattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30784825 caattaggtctaagtagaaagctatggtc 30784797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 20887636 - 20887589
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaat 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20887636 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaat 20887589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 14589639 - 14589698
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaa 60  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14589639 cacctattcgtattaatgattttctagttccacgatcgttaacaaaatagccctaatcaa 14589698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 40
Target Start/End: Original strand, 5584428 - 5584462
Alignment:
Q  6 attcttatgaatgattttctagtttcacgatagtt 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5584428 attcttatgaatgattttctagttccacgatagtt 5584462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 5416 - 5650
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  5416 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctg 5515  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  5516 attccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgttagcctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattaga 5615  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5616 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 5650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 198251 - 198018
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  198251 cacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactatagcctcta 198152  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  198151 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaatgattatccattcctagactattcctgtttattaga 198053  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  198052 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 198018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1755 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1755
Description:

Target: scaffold1755; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 221 - 4
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||     
T  221 tattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaacatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaacttcagtccctaattg 122  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121 cttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaaggattatccattcctagactaaccctatttattagaacaa 23  T
Q  205 ttcaattatgtctaagtag 223  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  22 ttcaattaggtctaagtag 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 293127 - 292898
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  293127 cacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagccccta 293028  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  293027 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctatactaaccatgtttattaga 292929  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctat 231  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  292928 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctat 292898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 3300 - 3534
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||    
T  3300 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcatattacagtcccta 3399  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  3400 attccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcatgtttacctaatatcactaacaaacgattatccattcctaggttaaccatgtttattaga 3499  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3500 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 3534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 81 - 315
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  81 cacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaataaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagccccta 180  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  181 atttcttaggcggtctaataatctttcaaggtttttagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttatcaga 280  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  281 acaattcaattatatctaagtcgaaagctagggtc 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 57607 - 57841
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||     
T  57607 cacctattcttatgaacgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatctatccattgagttagggccctcttctcaaactacatcccctg 57706  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||    
T  57707 attgcttaggtggtctaatactctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcactaataaacgattatccatttctagactaaccatttttattaga 57806  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  57807 acaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtc 57841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 67543 - 67776
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||    
T  67543 cacctattgttatgattgattctctagtaccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttcttaaactacaactccta 67642  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  67643 attccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcatgttaacttaatatcactaacaaacgattatatattcctagactaaccatgtttattaga 67741  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  67742 acaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtc 67776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 248622 - 248413
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  248622 cacctattcttatgagtgattttctagttccacgacagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttcacaaactacaaccccta 248523  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  248522 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaatcatgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattaga 248424  T
Q  201 acaattcaatt 211  Q
    |||||||||||    
T  248423 acaattcaatt 248413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 89
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  289 cacctattcttatgaatgattttctagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaagactctcttctcaaactacagccccta 190  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  189 attccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgattagtaga 90  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  89 a 89  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 89870 - 89654
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  89870 tattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacagcccctaattc 89771  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaa 204  Q
     |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  89770 cttaggtggtctaataattctcgaaggtttgaagcacgttaacttaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaa 89671  T
Q  205 ttcaattatgtctaagt 221  Q
    |||||||| ||||||||    
T  89670 ttcaattaggtctaagt 89654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27210 - 27005
Alignment:
Q  4 ctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaatt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27210 ctattcttatgaatgattctctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccattgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaatt 27111  T
Q  104 ctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaaca 203  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27110 ccttaggtggtgtaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcacgaacaaacgattatccattcctagactaaccctatttattagaaca 27012  T
Q  204 attcaat 210  Q
    |||||||    
T  27011 attcaat 27005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1063 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1063
Description:

Target: scaffold1063; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2595 - 2390
Alignment:
Q  5 tattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2595 tattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcatactacagtccctaattc 2496  T
Q  105 tttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagac--taaccctgtttattagaac 202  Q
     |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2495 cttaggtgagctaatattctttgaacgttttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactataaccatgtttattagaac 2396  T
Q  203 aattca 208  Q
    ||||||    
T  2395 aattca 2390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19431 - 19226
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataat 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19431 tctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctaataat 19332  T
Q  123 ctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagta 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| |||     
T  19331 ctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaacc-------atagaacaattcaattaggtctcagtc 19239  T
Q  223 gaaagctatggtc 235  Q
    ||||| |||||||    
T  19238 gaaagttatggtc 19226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31198 - 30965
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||    
T  31198 cacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagccccta 31099  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31098 attccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatacattcctagactaaccatgtttattaga 31000  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30999 acaaatcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 30965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29469 - 29236
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||    
T  29469 cacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccccta 29370  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| | | ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29369 attcctcacgtggtctaataacttttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 29271  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  29270 acaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtc 29236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19384 - 19226
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||| ||||||    
T  19384 cacctattcttgtgaatgactccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagagttacaaccccta 19285  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaa 160  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19284 attccttagatggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaa 19226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19211 - 19166
Alignment:
Q  190 tgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  19211 tgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctatggtc 19166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 2091 - 2315
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||   | |||||||| ||    
T  2091 cacctattcttatgaatgattttctaattccacgatacttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttgggactctcttctaggattacagcccgta 2190  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2191 atttcttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagattaaccatgtttattaga 2289  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaa 226  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||    
T  2290 acaattcaattaggtctaagtcgaaa 2315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 3023 - 3256
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     |||| ||||||    
T  3023 cacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaccaaaatagtcctaatcaatccattgagttaggaccctcttctagtgttacaaccccta 3122  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3123 attccttaggtggtctaataatcgttgaaggttt-aagcatgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcgtagactaaccatgtttattaga 3221  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3222 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 3256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 58699 - 58926
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||    
T  58699 cacctattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagccccta 58798  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattag- 199  Q
    |||| ||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  58799 attccttatgcagtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaga 58897  T
Q  200 -aacaattcaattatgtctaagtagaaag 227  Q
     || |||||||||| |||||||| |||||    
T  58898 aaaaaattcaattaggtctaagtcgaaag 58926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 241604 - 241435
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  241604 cacctatttttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcgtaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactgcaggcccta 241505  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattat 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  241504 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacattaacctagtatcactaacaaatgattat 241435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10513 - 10280
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||     |||| ||||||    
T  10513 cacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccatcttctagggttacaaccccta 10414  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||  ||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10413 atttcttaggcggactaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattccttgactaaccatgtttattaga 10315  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10314 acaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 10280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 118463 - 118697
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| |    ||||| |  ||    
T  118463 cacctattcttatgaatgattcgctagtttcaggatagttaacaaaatagcactaatcaatcccttgacttaggaccctcttcgcgggttacagtctata 118562  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  118563 attccttagatgatctaatattctttgaaggttttacatgcgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttga 118662  T
Q  201 acaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  118663 acaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtc 118697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 99253 - 99312
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  99253 cacctattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacaaaatagccataatcaa 99312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 1
Alignment:
Q  7 ttcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  164 ttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcagtcccttgacttaggaccctattctcaaactacaacccctaatttct 65  T
Q  107 taggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattat 171  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64 taggtggtcaaataatctttgaaag-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1785
Description:

Target: scaffold1785; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1353 - 1136
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |     || ||||||||    
T  1353 cacctattcttgtgaatgcttttctagttccacaatagttaacaaaatagtctgaatcaatcccttgagttaggaccctcttatagggttatagccccta 1254  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattaga 200  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1253 attccttaggtggtataataaccttcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaaa 1155  T
Q  201 acaattcaattatgtctaa 219  Q
    ||||| |||||| ||||||    
T  1154 acaatacaattaggtctaa 1136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2073 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold2073
Description:

Target: scaffold2073; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 885 - 1007
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagccccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  885 cacctattcttatgaatgattatctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgggttaggaccctcttttcaaactacaaccccta 984  T
Q  101 attctttaggtggtctaataatc 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  985 attccttaggtggtctaataatc 1007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14254 - 14110
Alignment:
Q  90 tacagcccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccc 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||     
T  14254 tacagcccctaattccttaggtgatctaataaccgtcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacca 14156  T
Q  190 tgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14155 tgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 14110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 48442 - 48655
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||| || ||||     
T  48442 tctagtttcacgatggtcaactaaaatagtcataatcaatcccttgacgtaggaccctcttctcagattacggtccctaattccttaggtgatccaatat 48541  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagt 221  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| ||| ||||    
T  48542 tctttgaaggttttatgaatgttaacataatatcacaaataaacgattatccattcctaggctaaccttgtttacttgaacaattcaattaggtcaaagt 48641  T
Q  222 agaaagctatggtc 235  Q
     | |||||| ||||    
T  48642 tgtaagctagggtc 48655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10022 - 9808
Alignment:
Q  23 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataa 121  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | || || ||||||||| ||| ||| | |||||     
T  10022 tctaatttcacgatggttaaccaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattagagtccctaattccttatgtgttataatat 9923  T
Q  122 tctttgaaggttttaagcacgttaacc-taatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaag 220  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| || |||| ||||   |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  9922 tatttgaaggttttaagaaagttaaccttaatatcacaaataaacaattaccaattcctagactaactctgtttattcgatcaattcaattaggtctaag 9823  T
Q  221 tagaaagctatggtc 235  Q
    | ||||| |||||||    
T  9822 ttgaaagttatggtc 9808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 7730 - 7801
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7730 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtta 7801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15516 - 15433
Alignment:
Q  1 cacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggatcctcttct 84  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15516 cacctattcttgtgaatgagtcgctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttct 15433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University