View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18328_low_5 (Length: 659)

Name: NF18328_low_5
Description: NF18328
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18328_low_5
NF18328_low_5
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (210-642)||(8522570-8523002)
chr3 (19-161)||(8523042-8523184)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (216-641)||(25523231-25523656)
chr6 (217-503)||(24140436-24140722)
chr6 (25-134)||(25523052-25523161)
chr6 (53-134)||(24140793-24140874)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (216-641)||(11117611-11118036)
chr4 (51-134)||(11118106-11118189)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (210-635)||(42128348-42128773)
chr5 (210-634)||(42117207-42117631)
chr5 (210-641)||(34240757-34241188)
chr5 (212-641)||(34232986-34233415)
chr5 (204-641)||(42122948-42123385)
chr5 (229-613)||(41713768-41714152)
chr5 (300-641)||(41572300-41572641)
chr5 (300-641)||(41617939-41618280)
chr5 (20-145)||(42128835-42128960)
chr5 (273-449)||(41444005-41444181)
chr5 (20-134)||(34240561-34240675)
chr5 (19-145)||(42117714-42117840)
chr5 (20-123)||(34232818-34232924)
chr5 (55-136)||(41713612-41713693)
chr5 (25-100)||(41572040-41572115)
chr5 (25-100)||(41617679-41617754)
chr5 (51-134)||(42123461-42123544)
[»] chr2 (5 HSPs)
chr2 (203-635)||(12247913-12248345)
chr2 (203-641)||(11994584-11995023)
chr2 (216-408)||(32682113-32682311)
chr2 (27-141)||(12248416-12248530)
chr2 (27-156)||(11994399-11994528)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 210 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 8523002 - 8522570
Alignment:
Q  210 tactatgattctgtgattgtggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8523002 tactatgattctgtgattgtggcgacaaaagggaacaaaatgaaactagtgaaaattccaaacaactttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttg 8522903  T
Q  310 aaggagagattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatccataggaaa 409  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8522902 aaggcgagattccaaagattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattcccaaatccataggaaa 8522803  T
Q  410 cttgacatacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtcttggatctt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522802 cttgacatacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccgatgtgattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtcttggatctt 8522703  T
Q  510 tccaataatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgtggattaccct 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8522702 tccaataatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacatttacaaatgattcttatgaaggaaacttggatttatgtggattaccct 8522603  T
Q  610 tgtcaaaaatgtgtggacctgaacaacgttctg 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8522602 tgtcaaaaatgtgtggacctgaacaacattctg 8522570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8523184 - 8523042
Alignment:
Q  19 caaagctcaagcatccatttccagatttaactatttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagcctatttcaaaaagtttgaagc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8523184 caaagatcaagcatccatttccagatttaactatttttgatatctcaaacaataactttagtggtcctctaccaaaatcctatttcaaaaagtttgaagc 8523085  T
Q  119 catgatgaatgttactgagttggaatatatgtggaatagaata 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8523084 catgatgaatgttactgagttggaatacatgaggaatagaata 8523042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 216 - 641
Target Start/End: Original strand, 25523231 - 25523656
Alignment:
Q  216 gattctgtgattgtggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttgaaggag 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |   |||||| ||| |||||||||||||  |  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25523231 gattctgtgactgtggcaacaaaagggattcaaatgaaattggtgaaaattccaataaagtttgtatctattgatttttcaagaaacaaatttgaaggag 25523330  T
Q  316 agattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatccataggaaacttgac 415  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25523331 agattccaaatgctattggagagcttcatgcactcaaagggcttaacctttcccacaacagacttaccggtcatattcccaaatccataggaaacttgac 25523430  T
Q  416 atacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtcttggatctttccaat 515  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| | |||  |||||||||| || |||||||||||    
T  25523431 atacttggaatctctggatctttccctgaatatgttaaccggtgtgattcctgcggaattaaccaatttaaactttcttgaagtcatgaatctttccaat 25523530  T
Q  516 aatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgtggattacccttgtcaa 615  Q
    || | | | |||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25523531 aaccatttggtgggagaaatacctagaggaaagcaattcaacacatttacaaatgattcctatgaaggaaacttggggttatgtggatttcccttgtcaa 25523630  T
Q  616 aaatgtgtggacctgaacaacgttct 641  Q
    | |  ||||||| |||||||| ||||    
T  25523631 agagatgtggacttgaacaacattct 25523656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 217 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 24140722 - 24140436
Alignment:
Q  217 attctgtgattgtggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttgaaggaga 316  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24140722 attctgtgactgtggcaacaaaagggaccaaaatgacactggtgaaaattccaaaaaagtttgtaagtatcgatatgtcaagaaacaaatttgaaggaga 24140623  T
Q  317 gattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatccataggaaacttgaca 416  Q
    |||||||||   ||| || |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  24140622 gattccaaatgctatcggagagcttcatgcactcaaagggattaacctttcccataacagacttactggtcatattccccaatccatcggaaagttgaca 24140523  T
Q  417 tacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtcttg 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24140522 tacttggaatctttgaatctttcatcaaatatgttaaccggcgtgattccttcggaattaaccaatatgaacagtcttgaagtcttg 24140436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 134
Target Start/End: Original strand, 25523052 - 25523161
Alignment:
Q  25 tcaagcatccatttccagatttaactatttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagcctatttcaaaaagtttgaagccatgat 124  Q
    |||||||| |||||| |  |||||  ||||||||||||||| | || || ||  |||||  |||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||     
T  25523052 tcaagcattcatttcaaagtttaatcatttttgatatctcaggtaacaatttaggtggttttctaccaaaagcctatttaagaaattatgaagccatgaa 25523151  T
Q  125 gaatgttact 134  Q
    ||||||||||    
T  25523152 gaatgttact 25523161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24140874 - 24140793
Alignment:
Q  53 ttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagcctatttcaaaaagtttgaagccatgatgaatgttact 134  Q
    ||||||||||||  | || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||    
T  24140874 ttttgatatctctggaaacaacttcagtggttttctgccaaaagcctatttaaaaaattatgaagccatgaaggatgttact 24140793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 216 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 11118036 - 11117611
Alignment:
Q  216 gattctgtgattgtggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttgaaggag 315  Q
    |||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11118036 gattctgtgactgtggaaataaaagggaacaaaatgacactggtgaaaattccaataaagttagtaagtattgatttgtcaagaaacaaatttgaaggag 11117937  T
Q  316 agattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatccataggaaacttgac 415  Q
    ||||| ||||   |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  11117936 agattacaaatgctattggagagcttcatgcactcaaagggcttaatctttcccgtaacagacttactggtcatattcccaactccataggaaacttggc 11117837  T
Q  416 atacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtcttggatctttccaat 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||   |||||||||||| |   |  |||||||||||| ||| |||| |||    
T  11117836 atacttggaatctttggatctttcatcaaatatgttaaccagtgtgattcctgcagaattaaccaatttgggctttcttgaagtcttagatatttcaaat 11117737  T
Q  516 aatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgtggattacccttgtcaa 615  Q
    || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||    
T  11117736 aaccatctagtgggagaaatacctcaaggaaagcaattcaatacatttacaaatgattcctatgaaggaaattcagggttatgtggattacccttgtcaa 11117637  T
Q  616 aaatgtgtggacctgaacaacgttct 641  Q
    | |  |||||||||||||||| ||||    
T  11117636 agaaatgtggacctgaacaacattct 11117611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11118189 - 11118106
Alignment:
Q  51 atttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagcctatttcaaaaagtttgaagccatgatgaatgttact 134  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  11118189 atttttgatatctcgggcaacagctttagtggttttctaccaaaagcctatttaaaaaactatgaagctatgaagaatgttact 11118106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 210 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 42128773 - 42128348
Alignment:
Q  210 tactatgattctgtgattgtggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttg 309  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42128773 tactatgattctatgattgtggcgacaaaagggaacaaaaggacattggtgaaaattccaaatatctttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttg 42128674  T
Q  310 aaggagagattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatccataggaaa 409  Q
    ||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| |  || | |||||| |||||||| |||||    
T  42128673 aaggagatattccaaatgattttggtgagcttcatgcactaataggactcaacctttcccataacaaactcattggccctattccaaaatccatgggaaa 42128574  T
Q  410 cttgacatacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtcttggatctt 509  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| || |||||| || | || | ||  ||||||   ||||||| |||| |      |||||||||||| ||||||    
T  42128573 cttgacaaacttggaatggttggatctctcatcaaatgtgctcactgatgtgattcctgcagaattaagcaatttgggttttcttgaagtcttagatctt 42128474  T
Q  510 tccaataatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgtggattaccct 609  Q
    || ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42128473 tcaaataaccatctagtgggagaaatacctcaaggaccgcaattcaatacatttacaaatgattcctatgaaggaaacttggggttatgtggatttccct 42128374  T
Q  610 tgtcaaaaatgtgtggacctgaacaa 635  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||    
T  42128373 tgtcaaagaattgtggacctgaacaa 42128348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 210 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 42117631 - 42117207
Alignment:
Q  210 tactatgattctgtgattgtggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42117631 tactatgattctgtgattgtgtcgacaaaagggagcaaaatgacattggtgaaaattccaaacatttttgtaattattgatttgtcaaaaaacaaatttg 42117532  T
Q  310 aaggagagattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatccataggaaa 409  Q
    | ||||||||||||||   |||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  42117531 agggagagattccaaatgctattggagacctccatgcactcaaagggcttaacctttcccataacagactcaccggtcatattcccaaatccatgggaaa 42117432  T
Q  410 cttgacatacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtcttggatctt 509  Q
    |||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||   || |||   |||||||||||| |  ||  |||| |||||||| |||||    
T  42117431 cttgtcaaacttggaatcattggatctctcgtcaaatatgcttaccggtatgatccctgcagaattaaccaatttagactttcttcaagtcttgaatctt 42117332  T
Q  510 tccaataatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgtggattaccct 609  Q
    |||||||| | ||| |||||| |||||||||| |    ||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  42117331 tccaataaccatctagtgggaaaaatacctcaagagccgcacttcgatacatttccaaatgattcctacaaaggaaacttgggtttatgtggatttccgt 42117232  T
Q  610 tgtcaaaaatgtgtggacctgaaca 634  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
T  42117231 tgtcaaagatttgtggacctgaaca 42117207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 210 - 641
Target Start/End: Original strand, 34240757 - 34241188
Alignment:
Q  210 tactatgattctgtgattgtggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttg 309  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| |   |||||||||||  || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||     
T  34240757 tactatgattctgtgactgtgacgacaaaaggcatcaaaatgacactgacgaaaattccaacaatgtttgtaagtattgatttctcaagaaacaagttta 34240856  T
Q  310 aaggagagattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatccataggaaa 409  Q
    | ||||  ||||||||   ||| || || ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||  |||    
T  34240857 atggaggaattccaaatgatataggagaacttcacgcactcaaagggcttaacctttcacataacagactcactggtcctattcctcaatccatacaaaa 34240956  T
Q  410 cttgacatacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtcttggatctt 509  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| | || |||   ||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34240957 cttgacaaacttggaatcgttggatctctcgtcaaatatgctcactggtatgattcctgcagaattaaccaatttgaacagtcttgaagtcttggatctt 34241056  T
Q  510 tccaataatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgtggattaccct 609  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34241057 tccaataaccatcttgtgggagaaatacctcaaggaaagcaattcaatacatttacaaatgattcttataaagggaacttggggttatgtggattaccct 34241156  T
Q  610 tgtcaaaaatgtgtggacctgaacaacgttct 641  Q
    ||||||| |  |||||||| ||||||| ||||    
T  34241157 tgtcaaagaaatgtggaccggaacaacattct 34241188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 212 - 641
Target Start/End: Original strand, 34232986 - 34233415
Alignment:
Q  212 ctatgattctgtgattgtggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttgaa 311  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |     
T  34232986 ctatgattctgtgactgtggcaaacaaagggatcaatatgacattggtaaaaattccaataaactttgtaagtattgatttctcaagaaacaagtttaat 34233085  T
Q  312 ggagagattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatccataggaaact 411  Q
    ||||  ||||||||   ||| || || ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||  |||||    
T  34233086 ggaggaattccaaatgatataggagaacttcacgcactcaaagggcttaacctttcacataacagactcactggtcctattcctcaatccatacaaaact 34233185  T
Q  412 tgacatacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtcttggatctttc 511  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| | || |||   ||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34233186 tgacaaacttggaatcgttggatctctcgtcaaatatgctcactggtatgattcctgcagaattaaccaatttgaacagtcttgaagtcttggatctttc 34233285  T
Q  512 caataatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgtggattacccttg 611  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  34233286 caataaccatcttgtgggagaaatacctcaaggaaagcaattcaatacatttacaaatgattcttataaagggaacttggggttatgtggattacccttg 34233385  T
Q  612 tcaaaaatgtgtggacctgaacaacgttct 641  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||| ||||    
T  34233386 tcaaagaaatgtggaccggaacaacattct 34233415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 204 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 42123385 - 42122948
Alignment:
Q  204 gcaccctactatgattctgtgattgtggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaaca 303  Q
    |||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||| | || ||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42123385 gcacactactctgattctgtgaccgtggcaacaaaaggaaccaaaatgacactcgttaaaattccaaaaaagtttgtaagtattgatatgtcaagaaaca 42123286  T
Q  304 aatttgaaggagagattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatccat 403  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||  |||| ||    
T  42123285 aatttgaaggagagattccaaatgctattggaaagctacatgcactcatagggcttaacctttcccataacagactcaatggtcctattccccaatcaat 42123186  T
Q  404 aggaaacttgacatacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtcttg 503  Q
     ||| ||||| || |||||||||  |||||||| || ||||||||| | || | ||  ||||||   ||| |||||||| |   |  ||||||||||||     
T  42123185 tggatacttgtcaaacttggaatggttggatctctcatcaaatatgctcactgatgtgattcctgcagaactaaccaatttgggctttcttgaagtctta 42123086  T
Q  504 gatctttccaataatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgtggat 603  Q
    ||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  42123085 gatatttcaaataaccatcttgtgggagaaatacctcaaggaaagcagttcaatacatttacaaatgattcctatgaaggaaattcagggttatgtggat 42122986  T
Q  604 tacccttgtcaaaaatgtgtggacctgaacaacgttct 641  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  42122985 tacccttgtcaaaaaaatgtggacctgaacaacattct 42122948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 229 - 613
Target Start/End: Original strand, 41713768 - 41714152
Alignment:
Q  229 tggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttgaaggagagattccaaacat 328  Q
    ||||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |  |    
T  41713768 tggcgacaaaaggaaacaaaaccccacttgtgaaaattccaaaaatctttgcaagtattgatttttcaagaaataaatttgatggggagattccagatgt 41713867  T
Q  329 tattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatccataggaaacttgacatacttggaatct 428  Q
    |||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||  |||||| ||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||     
T  41713868 tattggagagcttcatgatctcaaagggcttaacctttcatataacaaactcactggtcacattccccaatccatgggaaacttgataaacttggaatca 41713967  T
Q  429 ttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtcttggatctttccaataatcgtcttgtgg 528  Q
    |||||||| || ||||||||| | || |||   |||||| |  | ||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  41713968 ttggatctctcgtcaaatatgctcactggtcggattcctgtaaagttaaccaatttggactttcttgaagtcttggatctttctaataaccatcttgtgg 41714067  T
Q  529 gagaaatacctcagggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgtggattacccttgtc 613  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41714068 gagaaatacctcaaggaaagcagttcaatacatttacaaatgattcctatgaaggaaacttggggttatgtggatttcccttgtc 41714152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 300 - 641
Target Start/End: Original strand, 41572300 - 41572641
Alignment:
Q  300 aacaaatttgaaggagagattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaat 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||  |||    
T  41572300 aacaattttgaaggagagattctgaatgttattggggagcttcactcactcaaagggcttaacctttcccataacagactcaccggtcctattcctcaat 41572399  T
Q  400 ccataggaaacttgacatacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagt 499  Q
    || ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||| ||||||||  ||||||| |||||| ||| || ||| |||    
T  41572400 ccgtaggaaacttgtcaaacatggaatcattggatctttcgtcaaatatactcactggtgtaattccttcagaattaatcaatctgaacggtattggagt 41572499  T
Q  500 cttggatctttccaataatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgt 599  Q
     ||| |||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||  |||||     
T  41572500 attgaatctttctcataaccatctagtgggagaaatacctcaaggaaaacagttcaatacattttccaatgactcatatgaaggaaacttgggattatgc 41572599  T
Q  600 ggattacccttgtcaaaaatgtgtggacctgaacaacgttct 641  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||    
T  41572600 ggatttcccttgtcaaagaaatgtgaacctgaacaacattct 41572641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 300 - 641
Target Start/End: Original strand, 41617939 - 41618280
Alignment:
Q  300 aacaaatttgaaggagagattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaat 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||  |||    
T  41617939 aacaattttgaaggagagattctgaatgttattggggagcttcactcactcaaagggcttaacctttcccataacagactcaccggtcctattcctcaat 41618038  T
Q  400 ccataggaaacttgacatacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagt 499  Q
    || ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||| ||||||||  ||||||| |||||| ||| || ||| |||    
T  41618039 ccgtaggaaacttgtcaaacatggaatcattggatctttcgtcaaatatactcactggtgtaattccttcagaattaatcaatctgaacggtattggagt 41618138  T
Q  500 cttggatctttccaataatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgt 599  Q
     ||| |||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||  |||||     
T  41618139 attgaatctttctcataaccatctagtgggagaaatacctcaaggaaaacagttcaatacattttccaatgactcatatgaaggaaacttgggattatgc 41618238  T
Q  600 ggattacccttgtcaaaaatgtgtggacctgaacaacgttct 641  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||    
T  41618239 ggatttcccttgtcaaagaaatgtgaacctgaacaacattct 41618280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 42128960 - 42128835
Alignment:
Q  20 aaagctcaagcatccatttccagatttaactatttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagcctatttcaaaaagtttgaagcc 119  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42128960 aaagatcaagcatccatttccaagtttaattatttttgatatctcaggcaataactttagcggtccgctaccaaaagcctattttaaaaagtttgaagcc 42128861  T
Q  120 atgatgaatgttactgagttggaata 145  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||    
T  42128860 atgaagaatgttactcaattggaata 42128835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 273 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 41444181 - 41444005
Alignment:
Q  273 atctttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttgaaggagagattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccata 372  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  41444181 atctttgtaagtattgatttttcaggaaacaaatttgaaggagacattccaaatgttattggtgagcttcatgcaatcataggactcaacctttcccaca 41444082  T
Q  373 acagacttacaggtcatattccgaaatccataggaaacttgacatacttggaatctttggatctttcctcaaatatg 449  Q
    | | |||||| |||   |||||  ||||| | ||||| |||| | || | |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  41444081 ataaacttactggtgcgattcctcaatcctttggaaatttgataaacatcgaatcaatggatctctcctcaaatatg 41444005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Original strand, 34240561 - 34240675
Alignment:
Q  20 aaagctcaagcatccatttccagatttaactatttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagcctatttcaaaaagtttgaagcc 119  Q
    |||| ||| ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  34240561 aaagatcaggcatccatttcctagtttagttatttttgatatctcaagcaataactttactggtccgctaccaaaagcctatttaaaatattttgaagcc 34240660  T
Q  120 atgatgaatgttact 134  Q
    |||| ||| ||||||    
T  34240661 atgaagaaagttact 34240675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 42117840 - 42117714
Alignment:
Q  19 caaagctcaagcatccatttccagatttaactatttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagcctatttcaaaaagtttgaagc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  42117840 caaagatcaagcatccatttccaagtttaattattttttatatctcaggaaataactttagctgtccgctaccaaaagcatttttaaaaaaatttgaagc 42117741  T
Q  119 catgatgaatgttactgagttggaata 145  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  42117740 catgaagaaagttactgaattggaata 42117714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Original strand, 34232818 - 34232924
Alignment:
Q  20 aaagctcaagcatccatttccagatttaactatttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctacca---aaagcctatttcaaaaagtttgaa 116  Q
    |||| ||||| ||||||||||   ||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  34232818 aaagatcaagaatccatttcccagtttagttatttttgatatctcgggaaataactttagtggtccgctaccaccgaaagactatttcaaaaagtatgaa 34232917  T
Q  117 gccatga 123  Q
    |||||||    
T  34232918 gccatga 34232924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Original strand, 41713612 - 41713693
Alignment:
Q  55 ttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagcctatttcaaaaagtttgaagccatgatgaatgttactga 136  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | || |||||| ||||||||||||    
T  41713612 ttgatatctcgggcaatgacttcagtggtccgctaccaaaagcctatttaaaaaattatcaaaccatgaagaatgttactga 41713693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Original strand, 41572040 - 41572115
Alignment:
Q  25 tcaagcatccatttccagatttaactatttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagccta 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  41572040 tcaagcatccatttcctagtttaattatttttgatatttcatccaataacttcagtggcccactaccaaaagccta 41572115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Original strand, 41617679 - 41617754
Alignment:
Q  25 tcaagcatccatttccagatttaactatttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagccta 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  41617679 tcaagcatccatttcctagtttaattatttttgatatttcatccaataacttcagtggcccactaccaaaagccta 41617754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42123544 - 42123461
Alignment:
Q  51 atttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagcctatttcaaaaagtttgaagccatgatgaatgttact 134  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  42123544 atttttgatatctctggaaataactttggtggttttctaccaaaagcctattcaaaaaattatgaagccatgaagaatgatact 42123461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 203 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12248345 - 12247913
Alignment:
Q  203 tgcaccctactatgattctgtgattgtggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12248345 tgcaccctactatgattctgtgattgtggcatcaaaagggaacaaaatgacatgggttaaaattccaaacatcttagtaattattgatttgtcaagaaac 12248246  T
Q  303 aaatttgaaggagagattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatcca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||    
T  12248245 aaatttgaaggagagattccaaatgttattgatgagcttcaagcacttatagggcttaacctttcccataacagactcattggtcctattcccaaatcca 12248146  T
Q  403 taggaaacttgacatacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtctt 502  Q
    | |||||||||||| |||||||||   ||||||| || ||||||||| | || | ||  |||||     ||||||||||| |   |  ||||| ||| ||    
T  12248145 tgggaaacttgacaaacttggaatggctggatctctcatcaaatatgctcactgatgtgattccagcaaaattaaccaatttgggctttcttgcagtttt 12248046  T
Q  503 ggatctttccaataatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgtgga 602  Q
     ||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| || ||| | || ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12248045 agacttttccaataaccatctagtgggagaaatacctcgaggaaaacagttcgagacattttcaaatgattcatatgtaggaaacttggagttatgtgga 12247946  T
Q  603 ttacccttgtcaaaaatgtgtggacctgaacaa 635  Q
    || ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12247945 tttcccttgtcaaagaagtgtggacctgaacaa 12247913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 203 - 641
Target Start/End: Original strand, 11994584 - 11995023
Alignment:
Q  203 tgcaccctactatgattctgtgattgtggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11994584 tgcaccctactatgattctgtgattgtggcgtcaaaagggaacaaaatgacatgggttaaaattccaaacatcttagtaattattgatttgtcaagaaac 11994683  T
Q  303 aaatttgaaggagagattccaaacattattggtgagcttcatgcaatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatcca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||    
T  11994684 aaatttgaaggagagattccaaatgttattgatgagcttcaagcacttatagggcttaacctttcccataacagactcattggtcctattcccaaatcca 11994783  T
Q  403 taggaaacttgacatacttggaatctttggatctttcctcaaatatgttaaccggtgcaattcctttggaattaaccaatcttaacagtcttgaagtctt 502  Q
    | |||||||||||| |||||||||   ||||||| || ||||||||| | || | ||  |||||     ||||||||||| |   |  ||||| ||| ||    
T  11994784 tgggaaacttgacaaacttggaatggctggatctctcatcaaatatgctcactgatgtgattccagcaaaattaaccaatttgggctttcttgcagtttt 11994883  T
Q  503 ggatctttccaataatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaatt-caatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttggagttatgtgg 601  Q
     ||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| || || | | || ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  11994884 agacttttccaataaccatctagtgggagaaatacctcgaggaaaacagttccgagacattttcaaatgattcatatgtaggaaacttggagttatgtga 11994983  T
Q  602 attacccttgtcaaaaatgtgtggacctgaacaacgttct 641  Q
    ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  11994984 atttcccttgtcaaagaagtgcggacctgaacaacgttct 11995023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 216 - 408
Target Start/End: Original strand, 32682113 - 32682311
Alignment:
Q  216 gattctgtgattgtggcgacaaaaggtaacaaaatgacatttgtgaaaattccaaacatctttgtaattattgatttgtcaagaaacaaatttgaaggag 315  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32682113 gattctgtgactatggggacaaaagggagcaaaatgacactagtgaaaattccaagaaactttgtaagtattgatttgtcaagaaacagatttgaaggag 32682212  T
Q  316 agattccaaacattattggtgagcttcatgc------aatcatagggcttaacctttcccataacagacttacaggtcatattccgaaatccataggaa 408  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  ||||||| ||||    
T  32682213 agattccaaatgctattggggagcttcatgcactcagaatcagagggcttaacctttcccataacagactcaccgatcatattccccaatccatgggaa 32682311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12248530 - 12248416
Alignment:
Q  27 aagcatccatttccagatttaactatttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagcctatttcaaaaagtttgaagccatgatga 126  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  12248530 aagcatccatttccaagtttaactatttttgatatctcaggcaataactttagtggtccgctaccaaatgcctattttgaaaagtttgaagccatgaaga 12248431  T
Q  127 atgttactgagttgg 141  Q
    ||||| |||| ||||    
T  12248430 atgttgctgaattgg 12248416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Original strand, 11994399 - 11994528
Alignment:
Q  27 aagcatccatttccagatttaactatttttgatatctcaagcaataactttagtggtcctctaccaaaagcctatttcaaaaagtttgaagccatgatga 126  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  11994399 aagcatccatttccaagtttaactatttttgatatctaaggcaataactttagtggtccgctaccaaatgcctattttgaaaagtttgaagccatgaaga 11994498  T
Q  127 atgttactgagttggaatatatgtggaata 156  Q
    ||||| |||| |||| ||| ||| ||||||    
T  11994499 atgttgctgaattggtatacatgaggaata 11994528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University