View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18336_high_1 (Length: 869)

Name: NF18336_high_1
Description: NF18336
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18336_high_1
NF18336_high_1
[»] chr6 (101 HSPs)
chr6 (371-854)||(26636604-26637087)
chr6 (371-854)||(26742570-26743053)
chr6 (371-854)||(26960082-26960566)
chr6 (12-371)||(26636219-26636578)
chr6 (12-371)||(26742185-26742544)
chr6 (371-841)||(25074825-25075295)
chr6 (371-843)||(26950701-26951173)
chr6 (12-371)||(26975524-26975883)
chr6 (371-842)||(26849670-26850141)
chr6 (12-371)||(26950316-26950675)
chr6 (12-371)||(26959699-26960056)
chr6 (12-371)||(26849285-26849644)
chr6 (12-371)||(25074443-25074799)
chr6 (371-843)||(27663966-27664429)
chr6 (29-344)||(27664482-27664797)
chr6 (376-843)||(26812491-26812958)
chr6 (371-579)||(26975909-26976117)
chr6 (157-371)||(31288986-31289200)
chr6 (640-848)||(26978607-26978815)
chr6 (559-834)||(27591782-27592057)
chr6 (559-834)||(27676381-27676656)
chr6 (622-834)||(26624480-26624692)
chr6 (622-834)||(26730457-26730669)
chr6 (191-345)||(26724320-26724474)
chr6 (12-120)||(31288878-31288986)
chr6 (622-843)||(27705006-27705227)
chr6 (622-843)||(31285768-31285989)
chr6 (628-827)||(26938244-26938443)
chr6 (203-316)||(28097748-28097861)
chr6 (206-319)||(29843289-29843402)
chr6 (622-818)||(27680159-27680355)
chr6 (206-318)||(28140302-28140414)
chr6 (191-343)||(26812280-26812432)
chr6 (191-306)||(26618392-26618506)
chr6 (624-843)||(27609872-27610091)
chr6 (624-843)||(27697338-27697557)
chr6 (623-802)||(28326688-28326867)
chr6 (623-802)||(28504324-28504503)
chr6 (624-834)||(27717260-27717470)
chr6 (541-697)||(28140663-28140819)
chr6 (371-519)||(31289227-31289375)
chr6 (625-843)||(26647691-26647909)
chr6 (625-843)||(26753659-26753877)
chr6 (625-843)||(27603456-27603674)
chr6 (645-715)||(28186626-28186696)
chr6 (625-834)||(26862792-26863001)
chr6 (608-843)||(26803641-26803876)
chr6 (645-707)||(28296628-28296690)
chr6 (645-707)||(28515383-28515445)
chr6 (624-708)||(26885278-26885362)
chr6 (645-779)||(28240589-28240723)
chr6 (609-703)||(26825015-26825109)
chr6 (206-316)||(29826753-29826863)
chr6 (191-312)||(28297049-28297170)
chr6 (191-312)||(28514903-28515024)
chr6 (608-715)||(28787433-28787540)
chr6 (608-715)||(28793554-28793661)
chr6 (194-312)||(28227707-28227825)
chr6 (194-312)||(28243550-28243668)
chr6 (645-715)||(28244027-28244097)
chr6 (207-300)||(26937797-26937890)
chr6 (381-521)||(28235533-28235673)
chr6 (656-702)||(28182361-28182407)
chr6 (625-702)||(27336988-27337065)
chr6 (625-702)||(27397728-27397805)
chr6 (381-429)||(27576131-27576179)
chr6 (381-521)||(28227920-28228060)
chr6 (174-289)||(26056657-26056772)
chr6 (174-289)||(26076627-26076742)
chr6 (624-703)||(26657173-26657252)
chr6 (624-703)||(26763144-26763223)
chr6 (207-290)||(27604035-27604118)
chr6 (605-776)||(29827178-29827349)
chr6 (605-843)||(29842744-29842982)
chr6 (651-685)||(2186064-2186098)
chr6 (725-843)||(25484371-25484489)
chr6 (725-843)||(25512203-25512321)
chr6 (207-289)||(26143636-26143718)
chr6 (645-843)||(27426364-27426562)
chr6 (622-668)||(27530231-27530277)
chr6 (207-289)||(27610452-27610534)
chr6 (207-289)||(27717831-27717913)
chr6 (605-715)||(28097323-28097433)
chr6 (194-312)||(28235320-28235438)
chr6 (754-843)||(26057263-26057352)
chr6 (754-843)||(26077233-26077322)
chr6 (754-843)||(26144209-26144298)
chr6 (207-282)||(25580490-25580565)
chr6 (207-290)||(26656733-26656816)
chr6 (207-290)||(26762704-26762787)
chr6 (198-345)||(26892866-26893013)
chr6 (207-290)||(27705735-27705818)
chr6 (219-290)||(28781881-28781952)
chr6 (207-289)||(25483827-25483909)
chr6 (207-289)||(25511660-25511742)
chr6 (653-715)||(28228192-28228254)
chr6 (452-521)||(26938068-26938137)
chr6 (227-280)||(27697927-27697980)
chr6 (191-300)||(28186145-28186254)
chr6 (60-105)||(28227573-28227618)
chr6 (452-497)||(29469158-29469203)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (12-371)||(17992465-17992824)
chr2 (371-846)||(17991964-17992439)
chr2 (191-316)||(3280411-3280536)
chr2 (477-707)||(3280723-3280953)
chr2 (624-787)||(17713508-17713671)
chr2 (629-787)||(17662487-17662645)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (371-843)||(26136846-26137318)
chr1 (206-368)||(26136655-26136817)
chr1 (624-843)||(267092-267311)
chr1 (608-715)||(28126555-28126662)
chr1 (227-290)||(267671-267734)
chr1 (207-289)||(28163707-28163789)
chr1 (207-264)||(28127032-28127089)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (624-835)||(18654233-18654444)
chr4 (624-843)||(18678308-18678527)
chr4 (624-843)||(18698148-18698367)
chr4 (624-843)||(18722833-18723052)
chr4 (624-843)||(18730252-18730471)
chr4 (624-843)||(18688374-18688593)
chr4 (381-783)||(5089762-5090164)
chr4 (191-289)||(5090285-5090383)
chr4 (207-290)||(18698727-18698810)
chr4 (207-290)||(18730831-18730914)
chr4 (645-843)||(18074993-18075191)
chr4 (208-290)||(18678887-18678969)
chr4 (53-98)||(5090476-5090521)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (191-306)||(16691619-16691734)
chr5 (645-715)||(16692099-16692169)
chr5 (393-499)||(16691847-16691953)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (624-834)||(2300-2510)
scaffold0349 (207-290)||(2870-2953)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (625-715)||(29272718-29272808)
chr8 (206-289)||(31905818-31905901)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (608-715)||(8682-8789)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (608-715)||(3592-3699)
scaffold0277 (608-715)||(12555-12662)
[»] scaffold0038 (9 HSPs)
scaffold0038 (645-779)||(40751-40885)
scaffold0038 (194-312)||(28205-28323)
scaffold0038 (194-312)||(43712-43830)
scaffold0038 (645-715)||(44189-44259)
scaffold0038 (381-521)||(35695-35835)
scaffold0038 (381-521)||(28418-28558)
scaffold0038 (194-312)||(35482-35600)
scaffold0038 (653-715)||(28690-28752)
scaffold0038 (60-105)||(28071-28116)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (645-715)||(57174-57244)
scaffold0019 (191-312)||(57603-57724)
[»] scaffold1870 (1 HSPs)
scaffold1870 (645-715)||(1-71)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (645-843)||(60801-60999)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 101)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 371 - 854
Target Start/End: Original strand, 26636604 - 26637087
Alignment:
Q  371 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagc 470  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26636604 gctatattagaagaaagatttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggacaggctggttggcttggtcgtggcagc 26636703  T
Q  471 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnntatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26636704 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattaaatttttttacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 26636803  T
Q  571 tgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagcttt 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26636804 tgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagcttt 26636903  T
Q  671 agaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagatt 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26636904 agaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagatt 26637003  T
Q  771 cttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaagagcgtagaaag 854  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26637004 cttaaagttagctatgacgctttggatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaagagcgtagaaag 26637087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 371 - 854
Target Start/End: Original strand, 26742570 - 26743053
Alignment:
Q  371 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagc 470  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26742570 gctatattagaagaaagatttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggacaggctggttggcttggtcgtggcagc 26742669  T
Q  471 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnntatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26742670 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattaaatttttttacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 26742769  T
Q  571 tgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagcttt 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26742770 tgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagcttt 26742869  T
Q  671 agaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagatt 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26742870 agaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagatt 26742969  T
Q  771 cttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaagagcgtagaaag 854  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26742970 cttaaagttagctatgacgctttggatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaagagcgtagaaag 26743053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 371 - 854
Target Start/End: Original strand, 26960082 - 26960566
Alignment:
Q  371 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagc 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26960082 gctatatcagaagaaagttttgttgattgtcgatgacgttgacaaaataaagcaagtgcaggttttgatcggagaggctagttggcttggtcgtgacagc 26960181  T
Q  471 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnn-tatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaa 569  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26960182 agagtaatcattaccactagagacaaacaattgttatcatctcatgggattaaaaaaaatatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaa 26960281  T
Q  570 ttgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26960282 ttgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctt 26960381  T
Q  670 tagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagat 769  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26960382 tagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagat 26960481  T
Q  770 tcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaagagcgtagaaag 854  Q
     |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  26960482 acttaaagtaagctatgacgctttggctgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgtgtctttaaagggcgtggaaag 26960566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 371
Target Start/End: Original strand, 26636219 - 26636578
Alignment:
Q  12 atgaatatgaacgtgattttattgaaaacatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttggactcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26636219 atgaatatgaacgtgattttattgaaaaaatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctctacatgttgctgattaccttgttggactcaa 26636318  T
Q  112 atctcgaatatcaaaagtgaactcacttctagacttggggtctactgatggagtctgcataataggaatccttggaaccggaggaatgggcaagacaaca 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  26636319 atctcgaatatcagaagtgaactcacttctagacttggggtctactgatggagtctgcataataggaatccttggaaccgaaggaatgggcaagacaaaa 26636418  T
Q  212 cttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatc 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26636419 cttgctcaagcaatttataatttgatttctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatc 26636518  T
Q  312 tccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttgaacatgttaatg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26636519 tccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttggacatgttaatg 26636578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 371
Target Start/End: Original strand, 26742185 - 26742544
Alignment:
Q  12 atgaatatgaacgtgattttattgaaaacatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttggactcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26742185 atgaatatgaacgtgattttattgaaaaaatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctctacatgttgctgattaccttgttggactcaa 26742284  T
Q  112 atctcgaatatcaaaagtgaactcacttctagacttggggtctactgatggagtctgcataataggaatccttggaaccggaggaatgggcaagacaaca 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  26742285 atctcgaatatcagaagtgaactcacttctagacttggggtctactgatggagtctgcataataggaatccttggaaccgaaggaatgggcaagacaaaa 26742384  T
Q  212 cttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatc 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26742385 cttgctcaagcaatttataatttgatttctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatc 26742484  T
Q  312 tccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttgaacatgttaatg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26742485 tccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttggacatgttaatg 26742544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 371 - 841
Target Start/End: Original strand, 25074825 - 25075295
Alignment:
Q  371 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagc 470  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  25074825 gctatgtcaaaagaaagttttgttgattctcgatgacattgacaaactaaagcaattgcaggttttggtcggagagcctagctggctcggtcgtggcagc 25074924  T
Q  471 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnntatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 570  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25074925 agagtcatcattaccactcgagacaaacatttgttatcatctcatgggattacaaaaatatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 25075024  T
Q  571 tgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagcttt 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25075025 tgttaagaacaaaggcttttaaaagtaaaaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcaattaaatatgcttctggccttccattagcttt 25075124  T
Q  671 agaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagatt 770  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  25075125 agaagttgtgggttccaacttgtttggaatgagtacaacagaatgcgagtctacattagataagtatgaaagaattccacctgaagatatccaaaaaata 25075224  T
Q  771 cttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaa 841  Q
    |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25075225 cttaaagtaagctttgacgctttggacgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgtttctttaa 25075295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 371 - 843
Target Start/End: Original strand, 26950701 - 26951173
Alignment:
Q  371 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagc 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26950701 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgatgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgattggagagcctggttggcttggtcgtggcagc 26950800  T
Q  471 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnntatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 570  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||       |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26950801 agagtcatcattaccactcgtgacaaacatttgttatcatgtcatgggattaaaaaaatatatgaagcagatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 26950900  T
Q  571 tgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagcttt 670  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26950901 tgttaagaatgatggcttttaaaagtaacaaaaatgattcaaggtatgatagtattttaaaccgtgcagttaaatatgctgctggccttccattagcttt 26951000  T
Q  671 agaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagatt 770  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  26951001 agaagtagtgggttctaacttgtttggaaagactatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagata 26951100  T
Q  771 cttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    |||||||| |||| ||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  26951101 cttaaagtaagctttgatgctttggacgaggaacaacagaatgtctttttggatattgtttgtgtctttaaag 26951173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 371
Target Start/End: Original strand, 26975524 - 26975883
Alignment:
Q  12 atgaatatgaacgtgattttattgaaaacatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttggactcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26975524 atgaatatgaacgtgattttattgaaaaaatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttggactcaa 26975623  T
Q  112 atctcgaatatcaaaagtgaactcacttctagacttggggtctactgatggagtctgcataataggaatccttggaaccggaggaatgggcaagacaaca 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  26975624 atctcgaatattaaaagtgaactcactactagacttggggtctactgatggagtcttcataataggaatccttggaactgggggaatgggtaagacaaca 26975723  T
Q  212 cttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26975724 cttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtaactgtttccttcacgatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatc 26975823  T
Q  312 tccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttgaacatgttaatg 371  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26975824 tccaagagcaactcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttggacatgttaatg 26975883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 371 - 842
Target Start/End: Original strand, 26849670 - 26850141
Alignment:
Q  371 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagc 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || ||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  26849670 gctatctcagaagaaagttttgttgattctcaatgatgttgacaaactaaatcagttggagaatttggtcggagagcctggttggcttggtcatggtagc 26849769  T
Q  471 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnntatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 570  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26849770 agagtcatcattaccactcgagacaaatgtttgttatcatctcatggaattaaaaaaatatacgaagcatatggtttaaacaaggaacaagctcttgaat 26849869  T
Q  571 tgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagcttt 670  Q
    || ||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26849870 tggtaagaacgaagacttttaaatgtaacaaaactgatgcaagctatgattacattttaaatcgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagcttt 26849969  T
Q  671 agaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagatt 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  26849970 agaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagaagaatgcgagtctacattagataagtatgaaagaattccacatgcagatattcaaaagata 26850069  T
Q  771 cttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaa 842  Q
    |||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26850070 cttagaataagctatgactctttggatgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgtttctttaaa 26850141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 371
Target Start/End: Original strand, 26950316 - 26950675
Alignment:
Q  12 atgaatatgaacgtgattttattgaaaacatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttggactcaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26950316 atgaatatgaacgcgattttattgaaaaaatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctctacatgttgctgattaccttgttggactcaa 26950415  T
Q  112 atctcgaatatcaaaagtgaactcacttctagacttggggtctactgatggagtctgcataataggaatccttggaaccggaggaatgggcaagacaaca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  26950416 atctcgaatatcagaagtgaattcactttcagagttgggatcaaacgatggagtctgcatgataggaatccttggaactgggggaatgggaaagacaaca 26950515  T
Q  212 cttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatc 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26950516 cttgctcaagcagtttataacttgattgctaatcaatttgaatgcaaatgttttcttcacaatgtgagagaaaattcagtaaaacatggcttagagtatc 26950615  T
Q  312 tccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttgaacatgttaatg 371  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26950616 tccaagagcagctcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttggacatgttaatg 26950675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 371
Target Start/End: Original strand, 26959699 - 26960056
Alignment:
Q  12 atgaatatgaacgtgattttattgaaaacatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttggactcaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26959699 atgagtatgaacgtgattttattgaaaaaatagttacagacgtctccaacaagattaaccatgttcctttacatgttgctgattaccttgttggtctcaa 26959798  T
Q  112 atctcgaatatcaaaagtgaactcacttctagacttggggtctactgatggagtctgcataataggaatccttggaaccggaggaatgggcaagacaaca 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26959799 atctcgaatatcaaaagtgaattcactttcagagttgggatcaaacgatggagtctgcatgataggaatccttggaactggaggaatgggaaagacaaca 26959898  T
Q  212 cttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatc 311  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26959899 ctttctcaagcagtttataattcgattgttcatcaatttgaatttaagtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatc 26959998  T
Q  312 tccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttgaacatgttaatg 371  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26959999 tccaagag--gatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttggacatgttaatg 26960056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 371
Target Start/End: Original strand, 26849285 - 26849644
Alignment:
Q  12 atgaatatgaacgtgattttattgaaaacatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttggactcaa 111  Q
    ||||||||||||   |||||||||  || |||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26849285 atgaatatgaacaccattttattgggaaaatagttaaggatgtctccaacaagatcaaccatgttcctttgcatgttgctgattaccttgttggacttaa 26849384  T
Q  112 atctcgaatatcaaaagtgaactcacttctagacttggggtctactgatggagtctgcataataggaatccttggaaccggaggaatgggcaagacaaca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  26849385 atctcgaatatcagaagtgaattcacttctagaattggaatctaatgatggagtctggaaaataggaatccttggaactggaggaatgggaaaaacaaca 26849484  T
Q  212 cttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatc 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  26849485 cttgctcaagcagtttataattcgattgctgatcaatttgaatgtaagtgtttccttcacgatgtgagagaaaattcacttaaacatggcttagagtttc 26849584  T
Q  312 tccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttgaacatgttaatg 371  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26849585 tccaagagcagctcctctccaaatcaatcagatttgaaactaagtttggacatgttaatg 26849644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 371
Target Start/End: Original strand, 25074443 - 25074799
Alignment:
Q  12 atgaatatgaacgtgattttattgaaaacatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttggactcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||       
T  25074443 atgaatatgaacgtgattttattgaaaaaatagttagagacgtctccaacaagattaaccaaattcctttacatgttactgattaccttgttggtcttcg 25074542  T
Q  112 atctcgaatatcaaaagtgaactcacttctagacttggggtctactgatggagtctgcataataggaatccttggaaccggaggaatgggcaagacaaca 211  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||     
T  25074543 atctcgaatttcagaagtgaattcacttctagacttgggatata---atggagtatgcataataggaatcgttggaactggtggaatgggcaagacaact 25074639  T
Q  212 cttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatc 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25074640 cttgctcaagcaatttataatttgattgctaatcaatttgaatgtaagtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttcaacatggcttagagtatc 25074739  T
Q  312 tccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttgaacatgttaatg 371  Q
    | ||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25074740 ttcaagagcagcttctctttaaatcaatcggatttgaaactaagtttggacatgttaatg 25074799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 371 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 27664429 - 27663966
Alignment:
Q  371 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagc 470  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || ||| ||   ||| |||||||| |||||||| | ||||  || |||    
T  27664429 gctatgtcggaagaaagttttgttgattcttgatgacgttgacaaaccaaatcagttggagaaattggtcggagagcctggttggttcggtcaaggaagc 27664330  T
Q  471 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnntatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 570  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||        ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||    
T  27664329 agagtcatcattaccactcgagacagatatttgttatcatgccatgggataacaaaaatatacgaagcagacagtttaaataaggaagaatctcttgaat 27664230  T
Q  571 tgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagcttt 670  Q
    |||||||||  | | |||||||||         ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27664229 tgttaagaaagatgacttttaaaa---------atgattccagctatgattatattttaaaccgtgcagttgaatatgcttctggccttccattagcttt 27664139  T
Q  671 agaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagatt 770  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27664138 aaaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagattgtgagtcaaccttagataagtatgaaagaattccacctgaagatatccaaaagata 27664039  T
Q  771 cttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    |||||||| |||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  27664038 cttaaagtaagctttgatactttggaagaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgttgcttcaaag 27663966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27664797 - 27664482
Alignment:
Q  29 tttattgaaaacatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttggactcaaatctcgaatatcaaaag 128  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27664797 tttattgaagaaatagttacagacgtctccaacaagatcaaccgttgtcatttacatgttgctgagtaccttgttggactcgaatctcgaatatcagaag 27664698  T
Q  129 tgaactcacttctagacttggggtctactgatggagtctgcataataggaatccttggaaccggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagttta 228  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27664697 tgaattcacttctagacttgggatgtaccgatggagtctacataataggaatccttggaactggaggtctgggtaagacaacacttgctgaagcagttta 27664598  T
Q  229 taatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatctccaagagcagatcctc 328  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27664597 taattcaattgttaatcaatttgaatgtaggtgtttcctttacaatgttagagaaaattcatttaaacatagcttaaagtatctccaagagcagctcctc 27664498  T
Q  329 tccaaatcaatcggat 344  Q
    ||||||||||||||||    
T  27664497 tccaaatcaatcggat 27664482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 376 - 843
Target Start/End: Original strand, 26812491 - 26812958
Alignment:
Q  376 atcagaagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagcagagt 475  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||| || |||||    
T  26812491 atcaaaagaaagttttgttgattctcgatgatgttgacaaaccaaagcaattgaaggttttggttggagagcctggttggctcggtcctggaagtagagt 26812590  T
Q  476 aatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnntatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaattgtta 575  Q
     ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||        | || ||   | |||| |||||| |  || ||||||||||||||||     
T  26812591 catcattaccactcgagacagacatttgctatcatgtcatgggataactagaatttatgacttagatggattaaatgacaaagaagctcttgaattgttt 26812690  T
Q  576 agaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaag 675  Q
    | ||  | ||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26812691 ataaagatggcatttaaaagtaacataattgattcaagttatgattacattttaaatcgcgcagtaaaatatacttctggccttccattagctatagaag 26812790  T
Q  676 tagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaa 775  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || || |||  ||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||| ||  | ||    
T  26812791 tagtgggttccaacttgtttggaaagagtattgaagagtgggaatctacattagataagtatgaaaggacgccacctgaagatatccaaaatatattcaa 26812890  T
Q  776 agttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    ||| |||| ||| |||||| |  ||||| || ||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  26812891 agtaagctttgatgctttggacaaagaagaaaagagtgtttttttggatattgtatgttgctttaaag 26812958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 371 - 579
Target Start/End: Original strand, 26975909 - 26976117
Alignment:
Q  371 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagc 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26975909 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgacattgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagagcctggttggcttggtcatggcagc 26976008  T
Q  471 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnntatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 570  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||       |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26976009 agagtcatcattaccactcgagacaaacaattgctatcaggtcatcggattgaaaagatatacgaagcaggtggtttaaataaagaagaagctcttgaat 26976108  T
Q  571 tgttaagaa 579  Q
    |||||||||    
T  26976109 tgttaagaa 26976117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 157 - 371
Target Start/End: Original strand, 31288986 - 31289200
Alignment:
Q  157 tgatggagtctgcataataggaatccttggaaccggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  31288986 tgatggagtctgcataataggaatacttggaactggaggaaggggtaaaacaacactttctcaagcaatttataattcgattattgatcaatttgaatgt 31289085  T
Q  257 ttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatctccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagt 356  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  31289086 aagtgtttccttcacattgtgagagaaaatgctgttaaacatggcttagagtatctccaagagcagctcctctccaaatcaatcggatttgaaagacagt 31289185  T
Q  357 ttgaacatgttaatg 371  Q
    ||| |||||||||||    
T  31289186 ttggacatgttaatg 31289200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 640 - 848
Target Start/End: Original strand, 26978607 - 26978815
Alignment:
Q  640 ttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatga 739  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  26978607 ttaactatgcttctggtcttccattagctttagaagtagtgggttcaagcttgtttggaaagagtatagcagagtgtgagtctatattagataagtatgg 26978706  T
Q  740 cagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttcttt 839  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26978707 aagaattccacctgaacatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgtgtcttt 26978806  T
Q  840 aaagagcgt 848  Q
    |||| ||||    
T  26978807 aaagggcgt 26978815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 559 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 27592057 - 27591782
Alignment:
Q  559 aagctcttgaattgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggcct 658  Q
    |||||||||||||||| ||    ||||||||||||| | |||||  |  |||||| |||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  27592057 aagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagcgtgcagttgtatatgcttctggcct 27591958  T
Q  659 tccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagat 758  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  27591957 tccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaattccacataaagat 27591858  T
Q  759 atccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtt 834  Q
    ||||||||||| |||| | | |||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27591857 atccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgtt 27591782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 559 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 27676656 - 27676381
Alignment:
Q  559 aagctcttgaattgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggcct 658  Q
    |||||||||||||||| ||    ||||||||||||| | |||||  |  |||||| |||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  27676656 aagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagcgtgcagttgtatatgcttctggcct 27676557  T
Q  659 tccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagat 758  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  27676556 tccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaattccacataaagat 27676457  T
Q  759 atccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtt 834  Q
    ||||||||||| |||| | | |||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27676456 atccaaaagatacttagactgagctatgatgctttggacgaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgtt 27676381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 622 - 834
Target Start/End: Original strand, 26624480 - 26624692
Alignment:
Q  622 acattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtc 721  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||     
T  26624480 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagta 26624579  T
Q  722 tttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtcttttta 821  Q
    |  |||||||  ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||| ||    
T  26624580 tacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttcta 26624679  T
Q  822 gatattgcttgtt 834  Q
    |||||||||||||    
T  26624680 gatattgcttgtt 26624692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 622 - 834
Target Start/End: Original strand, 26730457 - 26730669
Alignment:
Q  622 acattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtc 721  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||     
T  26730457 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagta 26730556  T
Q  722 tttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtcttttta 821  Q
    |  |||||||  ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||| ||    
T  26730557 tacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttcta 26730656  T
Q  822 gatattgcttgtt 834  Q
    |||||||||||||    
T  26730657 gatattgcttgtt 26730669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 345
Target Start/End: Original strand, 26724320 - 26724474
Alignment:
Q  191 ggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    |||||| |||| || || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26724320 ggaggattgggtaaaacgacacttactcgagcagtttatgatttgattgctgatcaatttgaagggttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcaa 26724419  T
Q  291 ttaaacatggcttagagtatctccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatt 345  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  26724420 ttaaatatggcttagaatatctccaagagaagctcctctccaaattaatcggatt 26724474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Original strand, 31288878 - 31288986
Alignment:
Q  12 atgaatatgaacgtgattttattgaaaacatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttggactcaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31288878 atgaatatgaacgagattttattgaaaaaatagttacagatgtctccaacaagattaaccatgttcctttacatgttgctgattaccttgttggtctcaa 31288977  T
Q  112 atctcgaat 120  Q
    |||||||||    
T  31288978 atctcgaat 31288986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 622 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 27705227 - 27705006
Alignment:
Q  622 acattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtc 721  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||  ||      
T  27705227 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttttagaagtaatgggttctaacttgtttggcaagaacatagaagaatggaagaa 27705128  T
Q  722 tttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtcttttta 821  Q
    |  |||||||  ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||| |     
T  27705127 tacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctt 27705028  T
Q  822 gatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    || |||||||||| ||| ||||    
T  27705027 gacattgcttgttgcttaaaag 27705006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 622 - 843
Target Start/End: Original strand, 31285768 - 31285989
Alignment:
Q  622 acattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtc 721  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | ||||  ||      
T  31285768 acattttaaaccgtgcagttgcatattcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaaaatggaagag 31285867  T
Q  722 tttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtcttttta 821  Q
    |  |||||||  ||||||||  |||||  || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||| |     
T  31285868 tacattagatgggtatgacaagattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctg 31285967  T
Q  822 gatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    || |||||||||| ||| ||||    
T  31285968 gacattgcttgttgcttcaaag 31285989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 628 - 827
Target Start/End: Original strand, 26938244 - 26938443
Alignment:
Q  628 taaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttatt 727  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| || |||  |||    
T  26938244 taaaccgtgcaattaaatacgcttctggccttccattagctttagaagttgtaggttcccatttgtttggaaagtgtatagcagaatgggaatctacatt 26938343  T
Q  728 agataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatatt 827  Q
    || ||||||||| || |||||||| | | || | |||||||| |||| ||| |||| |||   |||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||    
T  26938344 agctaagtatgaaaggattccacacggacatgttcaaaagatacttagagtaagctttgattgtttggatgaagaagaacaaagtgtctttctggatatt 26938443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28097861 - 28097748
Alignment:
Q  203 aagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggct 302  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28097861 aagacaacacttgcaaaagcggtttataatttcattgctggtcaatttgaatgtgtctgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagcaaaacatggct 28097762  T
Q  303 tagagtatctccaa 316  Q
    ||||| ||||||||    
T  28097761 tagagcatctccaa 28097748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 206 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29843402 - 29843289
Alignment:
Q  206 acaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttag 305  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29843402 acaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgataaatttgaatgtttgtgttttcttcacgacgggagagaaagttcagctaaacatggcttag 29843303  T
Q  306 agtatctccaagag 319  Q
    || |||||||||||    
T  29843302 agcatctccaagag 29843289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 622 - 818
Target Start/End: Original strand, 27680159 - 27680355
Alignment:
Q  622 acattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtc 721  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||  ||      
T  27680159 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttttggccttccgttagttttagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagattggaagca 27680258  T
Q  722 tttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtcttt 818  Q
    |  |||||||  ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||||  | ||||||||||||    
T  27680259 tacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaggtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtcttt 27680355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Original strand, 28140302 - 28140414
Alignment:
Q  206 acaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttag 305  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28140302 acaacacttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcataatgtgagagaaatttcagctaaacatggcttag 28140401  T
Q  306 agtatctccaaga 318  Q
    |  ||||||||||    
T  28140402 aagatctccaaga 28140414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 343
Target Start/End: Original strand, 26812280 - 26812432
Alignment:
Q  191 ggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    |||||| |||| || || |||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  26812280 ggaggattgggtaaaacgacacttactcgtgcactttataatttgattgctgatcaatttgatggtttgtgtttccttcacagtgtgcgagaaaattcaa 26812379  T
Q  291 ttaaacatggcttagagtatctccaagagcagatcctctccaaatcaatcgga 343  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||  ||||  ||||||||||| || |||||    
T  26812380 ttaaatatggcttagaacatctccagaagcaactcctctccaaaacactcgga 26812432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 306
Target Start/End: Original strand, 26618392 - 26618506
Alignment:
Q  191 ggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    |||||| |||| || || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  26618392 ggaggattgggtaaaacgacacttactcgagcagtttatgatttgattgctgatcaatttgaagggttgtgtttccttcacaatgtgagag-aaattcaa 26618490  T
Q  291 ttaaacatggcttaga 306  Q
    ||||| ||||||||||    
T  26618491 ttaaatatggcttaga 26618506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 624 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 27610091 - 27609872
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 723  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||  ||| |     
T  27610091 attttaaaccgtgctgttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaggaatggaagtata 27609992  T
Q  724 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttaga 823  Q
     |||||||  ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| | |||||  | || ||||||||| | ||    
T  27609991 cattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgattctttggaagaagaggagcaaagtgtctttctgga 27609892  T
Q  824 tattgcttgtttctttaaag 843  Q
     |||||||||| ||| ||||    
T  27609891 cattgcttgttgcttcaaag 27609872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 624 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 27697557 - 27697338
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 723  Q
    |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||| |     
T  27697557 attttaagtcgtgcagtttcatatgtttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatggaagtata 27697458  T
Q  724 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttaga 823  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| | |||||  | || ||||||||| | ||    
T  27697457 tattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcaaagtgtctttctgga 27697358  T
Q  824 tattgcttgtttctttaaag 843  Q
     |||||||||| ||| ||||    
T  27697357 cattgcttgttgcttcaaag 27697338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 623 - 802
Target Start/End: Original strand, 28326688 - 28326867
Alignment:
Q  623 cattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtct 722  Q
    ||||||| || ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | |||    
T  28326688 cattttatactgtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatagtagaatgtaaatct 28326787  T
Q  723 ttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaaga 802  Q
      |||| || ||||||| || |||||   | || | ||||||  ||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  28326788 gcattatatcagtatgaaaggattcccattaaaaagatccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaaga 28326867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 623 - 802
Target Start/End: Original strand, 28504324 - 28504503
Alignment:
Q  623 cattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtct 722  Q
    ||||||| || ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | |||    
T  28504324 cattttatactgtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatagtagaatgtaaatct 28504423  T
Q  723 ttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaaga 802  Q
      |||| || ||||||| || |||||   | || | ||||||  ||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  28504424 gcattatatcagtatgaaaggattcccattaaaaagatccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaaga 28504503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 624 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 27717470 - 27717260
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 723  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| | ||| ||||  ||||  |||||  ||  |     
T  27717470 attttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacatagaggaatggaagaata 27717371  T
Q  724 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttaga 823  Q
     |||||||  ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| | ||||| || || ||||||||| ||||    
T  27717370 cattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtctttctaga 27717271  T
Q  824 tattgcttgtt 834  Q
     ||||||||||    
T  27717270 cattgcttgtt 27717260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 541 - 697
Target Start/End: Original strand, 28140663 - 28140819
Alignment:
Q  541 atggtttaaataaggaacaagctcttgaattgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagt 640  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || ||| | | |   ||||| ||||||| ||| |||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  28140663 atgggttaaataaggaagaagctctagagttgctgaaatggaaggcatttaaaaataataaagttgattcaagttatgagcacattttaaaccgtgcagt 28140762  T
Q  641 taaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttgg 697  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  28140763 tacttatgcctctggccttccattggctttagaagtagttggttctagcttgtttgg 28140819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 519
Target Start/End: Original strand, 31289227 - 31289375
Alignment:
Q  371 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagc 470  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | || ||||| |   |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||    
T  31289227 gctatctcagaagaaagtgttgttgattctcgatgacatagacaaacgagagaaattgaacaatttggtcggagagcctggtcggcttggtcctggaagc 31289326  T
Q  471 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatggga 519  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  31289327 agagtcatcattaccacttgagacaaacaattgctatcaggtcatggga 31289375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 625 - 843
Target Start/End: Original strand, 26647691 - 26647909
Alignment:
Q  625 ttttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtcttt 724  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||  ||  |      
T  26647691 ttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatggaagggtac 26647790  T
Q  725 attagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagat 824  Q
    |||||||   ||||| |  |||||  || || | |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||| ||||     
T  26647791 attagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagac 26647890  T
Q  825 attgcttgtttctttaaag 843  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  26647891 attgcttgttgcttcaaag 26647909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 625 - 843
Target Start/End: Original strand, 26753659 - 26753877
Alignment:
Q  625 ttttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtcttt 724  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||  ||  |      
T  26753659 ttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatggaagggtac 26753758  T
Q  725 attagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagat 824  Q
    |||||||   ||||| |  |||||  || || | |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||| ||||     
T  26753759 attagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagac 26753858  T
Q  825 attgcttgtttctttaaag 843  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  26753859 attgcttgttgcttcaaag 26753877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 625 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 27603674 - 27603456
Alignment:
Q  625 ttttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtcttt 724  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||  |      
T  27603674 ttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttttggaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatggaagggtac 27603575  T
Q  725 attagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagat 824  Q
     |||||    ||||| |  |||||  || || | |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||| ||||     
T  27603574 gttagaaggatatgagaagattcccaataaaaagatccacgagattcttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagac 27603475  T
Q  825 attgcttgtttctttaaag 843  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  27603474 attgcttgttgcttcaaag 27603456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 645 - 715
Target Start/End: Original strand, 28186626 - 28186696
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatg 715  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  28186626 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataggagaatg 28186696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 625 - 834
Target Start/End: Original strand, 26862792 - 26863001
Alignment:
Q  625 ttttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtcttt 724  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| | | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||  | |        
T  26862792 ttttaaaccgtgcagttgcatatgcttccggccttccgttagttctcgaaatagtgggttctaacttgtttggaaagagcatggaagaatggcaatgcac 26862891  T
Q  725 attagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagat 824  Q
    |||||||  |||||| |  |||||  || |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || || ||||||||| |||||    
T  26862892 attagatgggtatgaaaagattcccaataaagagatccaaaggatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaagagcagcaaagtgtctttctagat 26862991  T
Q  825 attgcttgtt 834  Q
    ||||||||||    
T  26862992 attgcttgtt 26863001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 608 - 843
Target Start/End: Original strand, 26803641 - 26803876
Alignment:
Q  608 ttcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtata 707  Q
    |||||| |||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  26803641 ttcaagttatgaagacattttaaatcgtgcagtttcatatgcttcaggtcttcccttagttttagagatagtgggttccaacttgtttggaaagagcata 26803740  T
Q  708 gcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaac 807  Q
      ||||||  ||  |  |||||||   ||||| |  |||||  || || | |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| || |    
T  26803741 aaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagc 26803840  T
Q  808 agagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  26803841 agagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaag 26803876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 645 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 28296690 - 28296628
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtata 707  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28296690 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatata 28296628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 645 - 707
Target Start/End: Original strand, 28515383 - 28515445
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtata 707  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28515383 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatata 28515445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 624 - 708
Target Start/End: Original strand, 26885278 - 26885362
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatag 708  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26885278 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatag 26885362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 645 - 779
Target Start/End: Original strand, 28240589 - 28240723
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttgg-caagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacaga 743  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||| || ||   ||||||  ||||||| ||     
T  28240589 tatgcttctggcctaccattagctttagaagtagttggttccaacttgtttggattaga-tataggagaatgggaatccacattagaccagtatgaaagg 28240687  T
Q  744 attccacatgaagatatccaaaagattcttaaagtt 779  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  28240688 attccaaataaagagatccaaaagatacttaaagtt 28240723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 609 - 703
Target Start/End: Original strand, 26825015 - 26825109
Alignment:
Q  609 tcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagag 703  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26825015 tcaagttatgaacacattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtattagaaatagtgggttccaatttgtttggaaagag 26825109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 316
Target Start/End: Original strand, 29826753 - 29826863
Alignment:
Q  206 acaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttag 305  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | || |||||||||| |||||||| |||||  |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29826753 acaacacttgctcgagcaatttataatatgattggtgataaatttgaatgcttgtgttttcttcatgacttgagagaaagttcagctaaacatggcttag 29826852  T
Q  306 agtatctccaa 316  Q
    |  ||||||||    
T  29826853 aacatctccaa 29826863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28297170 - 28297049
Alignment:
Q  191 ggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||  || ||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  28297170 ggagggatgggaaagacaacacttgccagagcagtttataattccatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacaatgtaagggaaaattcag 28297071  T
Q  291 ttaaacatggcttagagtatct 312  Q
     |||| |||| |||||| ||||    
T  28297070 ctaaatatggtttagagcatct 28297049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 312
Target Start/End: Original strand, 28514903 - 28515024
Alignment:
Q  191 ggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||  || ||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  28514903 ggagggatgggaaagacaacacttgccagagcagtttataattccatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacaatgtaagggaaaattcag 28515002  T
Q  291 ttaaacatggcttagagtatct 312  Q
     |||| |||| |||||| ||||    
T  28515003 ctaaatatggtttagagcatct 28515024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 715
Target Start/End: Original strand, 28787433 - 28787540
Alignment:
Q  608 ttcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtata 707  Q
    |||||| |||||  || ||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  28787433 ttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcttatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgata 28787532  T
Q  708 gcagaatg 715  Q
    | ||||||    
T  28787533 gaagaatg 28787540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 715
Target Start/End: Original strand, 28793554 - 28793661
Alignment:
Q  608 ttcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtata 707  Q
    |||||| |||||  || ||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  28793554 ttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcgtatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgata 28793653  T
Q  708 gcagaatg 715  Q
    | ||||||    
T  28793654 gaagaatg 28793661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 312
Target Start/End: Original strand, 28227707 - 28227825
Alignment:
Q  194 ggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagtta 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| || ||  ||||||||||  |||||||||| |||||| |||| || |||||||||| ||    
T  28227707 ggaatgggaaagacaacacttgcaagggcagtttataattttatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacgatgtaagggaaaattcagcta 28227806  T
Q  294 aacatggcttagagtatct 312  Q
    || |||| |||||| ||||    
T  28227807 aatatggtttagagcatct 28227825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 312
Target Start/End: Original strand, 28243550 - 28243668
Alignment:
Q  194 ggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagtta 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||  || ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||  ||    
T  28243550 ggaatgggaaagacaacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttcttcacgatgtaagggaaaattcaacta 28243649  T
Q  294 aacatggcttagagtatct 312  Q
    || |||| |||||| ||||    
T  28243650 aatatggtttagagcatct 28243668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 645 - 715
Target Start/End: Original strand, 28244027 - 28244097
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatg 715  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||| ||||||    
T  28244027 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttcaaacttatttggaaataatataggagaatg 28244097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 26937797 - 26937890
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatgg 300  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||  |||||||||    
T  26937797 caacacttgcacgagcaatttataatttgattggtgatcaatttgaaagtttgtgttttcttcataatgtacgagaaaatgcaactaaacatgg 26937890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 381 - 521
Target Start/End: Original strand, 28235533 - 28235673
Alignment:
Q  381 aagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagcagagtaatca 480  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||||||||||||   |||||   || |||| |||||| ||| || | ||| ||||    
T  28235533 aagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaattgcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgatca 28235632  T
Q  481 tcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggatt 521  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  28235633 ttaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggatt 28235673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 656 - 702
Target Start/End: Original strand, 28182361 - 28182407
Alignment:
Q  656 ccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaaga 702  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28182361 ccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaaga 28182407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 625 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 27337065 - 27336988
Alignment:
Q  625 ttttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaaga 702  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27337065 ttttaaaccgtgcagtttcatatggttcgggcattcccttagttttagaaatagtgggttctaacttgtttggaaaga 27336988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 625 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 27397805 - 27397728
Alignment:
Q  625 ttttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaaga 702  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27397805 ttttaaaccgtgcagtttcatatggttcgggcattcccttagttttagaaatagtgggttctaacttgtttggaaaga 27397728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27576179 - 27576131
Alignment:
Q  381 aagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  27576179 aagaaagttttgttgattctcgatgatgttgacaaactaaagcagttgc 27576131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 521
Target Start/End: Original strand, 28227920 - 28228060
Alignment:
Q  381 aagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagcagagtaatca 480  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||   ||||    || |||| |||||| ||| || | ||| ||||    
T  28227920 aagaaagttctattgattctcgatgatgttcacaaactaaagcaattgcgggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatca 28228019  T
Q  481 tcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggatt 521  Q
    | ||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  28228020 ttaccactcgaaacaaacaattgctagcaagtcatgggatt 28228060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 289
Target Start/End: Original strand, 26056657 - 26056772
Alignment:
Q  174 taggaatccttggaaccggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaa 273  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| || | ||||| ||||| ||    
T  26056657 taggaatttttggtaccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataa 26056756  T
Q  274 tgtgagagaaaattca 289  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  26056757 tgtcagagagaattca 26056772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 289
Target Start/End: Original strand, 26076627 - 26076742
Alignment:
Q  174 taggaatccttggaaccggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaa 273  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| || | ||||| ||||| ||    
T  26076627 taggaatttttggtaccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataa 26076726  T
Q  274 tgtgagagaaaattca 289  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  26076727 tgtcagagagaattca 26076742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 624 - 703
Target Start/End: Original strand, 26657173 - 26657252
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagag 703  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  26657173 attttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagag 26657252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 624 - 703
Target Start/End: Original strand, 26763144 - 26763223
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagag 703  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  26763144 attttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagag 26763223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27604118 - 27604035
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  27604118 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcag 27604035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 605 - 776
Target Start/End: Original strand, 29827178 - 29827349
Alignment:
Q  605 tgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagt 704  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||| ||   |||||||| |||| |    
T  29827178 tgattcaagatatgatgacattttagaccgtgcaatagcttatgcttctggccttccgttggttttagaattagtaggtcccgcgttgtttggaaagaat 29827277  T
Q  705 atagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaa 776  Q
    |||| ||||||  | ||| |||||||||  ||||| || |||||  || |||| |||||||| || ||||||    
T  29827278 atagaagaatggaaatctatattagatagatatgaaaggattcctaataaagagatccaaaatatacttaaa 29827349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 605 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 29842982 - 29842744
Alignment:
Q  605 tgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaac-ttgtttggcaagag 703  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||| || | ||||||| |||| || |||| | |||||||| ||||     
T  29842982 tgattcaagctatgatgacattttagaccgtgcaatagcttatgcttctggccttccgttggttttagaattagtagg-tccagctttgtttggaaagaa 29842884  T
Q  704 tatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaa 803  Q
    ||||| ||||||  | |||  |||||||| |||||| || |||||  || |||| ||||| || || |||||| | |||| ||| |||||| | |||||     
T  29842883 tatagaagaatggaaatctacattagataggtatgaaaggattcctaataaagagatccacaatatacttaaaataagctttgatgctttggaggaagac 29842784  T
Q  804 caacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 843  Q
     ||||  |||| ||| | || |||||||||| ||| ||||    
T  29842783 gaacaaggtgtttttctcgacattgcttgttgcttcaaag 29842744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 685
Target Start/End: Original strand, 2186064 - 2186098
Alignment:
Q  651 tctggccttccattagctttagaagtagtgggttc 685  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2186064 tctggccttccattagctttagaagtagtgggttc 2186098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 725 - 843
Target Start/End: Original strand, 25484371 - 25484489
Alignment:
Q  725 attagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagat 824  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||  || |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||| |  | |||||||||||| ||||     
T  25484371 attagatgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagac 25484470  T
Q  825 attgcttgtttctttaaag 843  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  25484471 attgcttgttacttcaaag 25484489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 725 - 843
Target Start/End: Original strand, 25512203 - 25512321
Alignment:
Q  725 attagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagat 824  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||  || |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||| |  | |||||||||||| ||||     
T  25512203 attagatgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagac 25512302  T
Q  825 attgcttgtttctttaaag 843  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  25512303 attgcttgttacttcaaag 25512321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 289
Target Start/End: Original strand, 26143636 - 26143718
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 289  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  26143636 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 26143718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 27426562 - 27426364
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaa 744  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||  |  |||||||  |||||| |  |    
T  27426562 tatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaaga 27426463  T
Q  745 ttccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    ||||  || |||| |||||||  || |||||||| ||||||||  ||||| | |||||  | || ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  27426462 ttcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaag 27426364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 622 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 27530277 - 27530231
Alignment:
Q  622 acattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagct 668  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27530277 acattttaaaccgtgcacttacttatgcttctggccttccattagct 27530231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27610534 - 27610452
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 289  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  27610534 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 27610452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27717913 - 27717831
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 289  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  27717913 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 27717831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 605 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 28097433 - 28097323
Alignment:
Q  605 tgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagt 704  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| || || ||| || | ||||||||||||| ||| |||  |    
T  28097433 tgattcaagttatgagtgtattttaaaccgtgcaataaattatgctgctggccttccattggccttggaaatattaggttccaacttgtatggaaagcat 28097334  T
Q  705 atagcagaatg 715  Q
    |||| ||||||    
T  28097333 atagaagaatg 28097323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 312
Target Start/End: Original strand, 28235320 - 28235438
Alignment:
Q  194 ggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagtta 293  Q
    ||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||  || ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| | || || |||||||||  ||    
T  28235320 ggaattggaaagacaacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacgacgtaagggaaaattcatcta 28235419  T
Q  294 aacatggcttagagtatct 312  Q
    || |||| |||||| ||||    
T  28235420 aatatggtttagagcatct 28235438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 754 - 843
Target Start/End: Original strand, 26057263 - 26057352
Alignment:
Q  754 aagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  26057263 aagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaag 26057352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 754 - 843
Target Start/End: Original strand, 26077233 - 26077322
Alignment:
Q  754 aagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  26077233 aagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaag 26077322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 754 - 843
Target Start/End: Original strand, 26144209 - 26144298
Alignment:
Q  754 aagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  26144209 aagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaag 26144298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 282
Target Start/End: Original strand, 25580490 - 25580565
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagaga 282  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  25580490 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagaga 25580565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Original strand, 26656733 - 26656816
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  26656733 caacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagagaattcag 26656816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Original strand, 26762704 - 26762787
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  26762704 caacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagagaattcag 26762787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26893013 - 26892866
Alignment:
Q  198 tgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaaca 297  Q
    ||||||| ||||||||||  |  | ||||||||||||||||||    || ||||||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||    
T  26893013 tgggcaaaacaacacttgtacgggtagtttataatttgattgcatgccattttgaagctttttgttttcttcacaacgtgagagaaaattccgcaaagca 26892914  T
Q  298 tggcttagagtatctccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatt 345  Q
    ||| |||||  | ||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||    
T  26892913 tggtttagaaaacctccaagagaagctcctctcaaaaacaattggatt 26892866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27705818 - 27705735
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  27705818 caacacttgcaagagcaatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcag 27705735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Original strand, 28781881 - 28781952
Alignment:
Q  219 aagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  28781881 aagcagtttataacttaattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcag 28781952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 289
Target Start/End: Original strand, 25483827 - 25483909
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 289  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  25483827 caacacttgcaaaagcagtttttaattttcttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 25483909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 289
Target Start/End: Original strand, 25511660 - 25511742
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 289  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  25511660 caacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 25511742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 653 - 715
Target Start/End: Original strand, 28228192 - 28228254
Alignment:
Q  653 tggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatg 715  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||    
T  28228192 tggcattccattggttttagaagtagtgggttcaaacttgtttgggaagaatattgaagaatg 28228254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 521
Target Start/End: Original strand, 26938068 - 26938137
Alignment:
Q  452 ttggcttggtcgtggcagcagagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggatt 521  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| ||  | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  26938068 ttggcttggtcatggaagcaaagtcattgttaccactcgagacaaacatttgctatcatgtcatgggatt 26938137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27697980 - 27697927
Alignment:
Q  227 tataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgaga 280  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27697980 tataatttggttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcataatgtgaga 27697927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 300
Target Start/End: Original strand, 28186145 - 28186254
Alignment:
Q  191 ggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||   | ||| ||||||||||   ||||||||| |||||| |||| || | ||||||||    
T  28186145 ggaggaatgggaaagacgacacttgcaagagcagtttataattccctagctgatcaatttgatgatttgtgttttcttcacgatgtaaggggaaattcag 28186244  T
Q  291 ttaaacatgg 300  Q
     |||| ||||    
T  28186245 ctaaatatgg 28186254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 105
Target Start/End: Original strand, 28227573 - 28227618
Alignment:
Q  60 acaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttgg 105  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28227573 acaagatcaatcatgttcctttacatgttgccgattaccctgttgg 28227618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 497
Target Start/End: Original strand, 29469158 - 29469203
Alignment:
Q  452 ttggcttggtcgtggcagcagagtaatcatcaccactcgagacaaa 497  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29469158 ttggtttggtcgtggcagtagagtcatcatcaccactcgggacaaa 29469203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17992824 - 17992465
Alignment:
Q  12 atgaatatgaacgtgattttattgaaaacatagttacagacgtctcctacaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttggactcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  17992824 atgaatatgaacgtgattttattgaaaaaatagttacagacacttccaacaagattaaccacgttccattacatgttgccgattaccttattggtctcaa 17992725  T
Q  112 atctcgaatatcaaaagtgaactcacttctagacttggggtctactgatggagtctgcataataggaatccttggaaccggaggaatgggcaagacaaca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||     
T  17992724 atctcgaatatcagaagtgaattcacttctagacttggaatataatgatggtgtctgcataataggaatccttggtactggtggaatgggcaagacaact 17992625  T
Q  212 cttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttagagtatc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17992624 cttgctcaagcagtttataatttggttgctaatcaatttcaatgtaagtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagtcaaacatggcttagagtatc 17992525  T
Q  312 tccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttgaacatgttaatg 371  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  17992524 ttcaagagcagcttctctccaaatcaatcggatttgtaactaaatttggacatgttaatg 17992465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 371 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 17992439 - 17991964
Alignment:
Q  371 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagc 470  Q
    ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17992439 gctatgtcaaaagaaagttctcttgattctcgatgacatcgacaaactaaagcaattgcaggttttggttggagagcctggttggcttggtcgtggcagc 17992340  T
Q  471 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnntatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 570  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||       |||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||     
T  17992339 agagtcatcattaccactcgagacaaacatttgttaacatgtcatgggattaaaacaatatatgaagtagatggattaaatgaggaagaagctcttgaac 17992240  T
Q  571 tgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagcttt 670  Q
    |||||||    ||||| |||||| | ||  ||| |||||| || ||| | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17992239 tgttaaggtggaaggcatttaaaggcaacgaaattgattctagttataactatattttaaaccgtgtagttaaatatgctgctggcctcccattagcttt 17992140  T
Q  671 agaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagatt 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||  | | |  ||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||     
T  17992139 agaagtagtgggttccaacttgtttggaaagtgtttagcagattggaaatgtgcattggataagtatgaaaggataccacctgaagatatccaaaatata 17992040  T
Q  771 cttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaagagc 846  Q
    || ||| | |||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  17992039 ctaaaaataagctttgatgctctggatgaagaacaaaagagtgtctttttggatattgcttgttgcttcaaagagc 17991964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 316
Target Start/End: Original strand, 3280411 - 3280536
Alignment:
Q  191 ggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3280411 ggaggaatgggtaagacaactcttgcaagagcagtttataatttcattgctaatcaatttgaatgtgtatgttttcttcacaatgtgagagaaaattcag 3280510  T
Q  291 ttaaacatggcttagagtatctccaa 316  Q
      ||||||||  ||||| ||||||||    
T  3280511 caaaacatggtctagagcatctccaa 3280536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 477 - 707
Target Start/End: Original strand, 3280723 - 3280953
Alignment:
Q  477 atcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnntatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaattgttaa 576  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||        ||| |||  | |||  |||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  3280723 atcattaccactcgagacaaacacttgttatcaagtcatgggattgaactaacatatgaaatagatgagttaaataaggaagaagcacttgaattgctta 3280822  T
Q  577 gaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagt 676  Q
     |   |||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||  || || ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3280823 catggaaggcttttaaaagtaagcaagttaattcaagttatgagcacgttctaaaccgcgcagtaaattatgcttctggccttccattggcattagaagt 3280922  T
Q  677 agtgggttccaacttgtttggcaagagtata 707  Q
    | | ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3280923 attaggttccaacttgtttggaaagaatata 3280953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 624 - 787
Target Start/End: Original strand, 17713508 - 17713671
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 723  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||  ||||||||||||| ||| |||  | |||  | ||||    
T  17713508 atttcaaaccgtgcagtttcttatgcttctggccttccattggctttggaagtaataggttctcacttgtttggcaaaagtttagatgtatggaaatctt 17713607  T
Q  724 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatga 787  Q
     ||||||||| ||||| ||| |||  ||  |||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  17713608 cattagataaatatgaaagagttcttcacaaagagattcatgaaattcttaaagttagctatga 17713671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 629 - 787
Target Start/End: Original strand, 17662487 - 17662645
Alignment:
Q  629 aaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttatta 728  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||  ||||||||||||| ||| |||  | |||  | |||| ||||    
T  17662487 aaaccgtgcagtttcttatgcttctggccttccattggctttggaagtaataggttctcacttgtttggcaaaagtttagatgtatggaaatcttcatta 17662586  T
Q  729 gataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatga 787  Q
    ||||| ||||| ||| |||  ||  |||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  17662587 gataaatatgaaagagttcttcacaaagagattcatgaaattcttaaagttagctatga 17662645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 371 - 843
Target Start/End: Original strand, 26136846 - 26137318
Alignment:
Q  371 gctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagc 470  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||||||| ||| ||     
T  26136846 gctacatcaaaagaaaattttgttgattctcgatgacgttgacaagctaaagcagttgcaggttttggttggagagcctagttggcttggtcctgggagt 26136945  T
Q  471 agagtaatcatcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnntatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaat 570  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||       |||| ||||   ||   |||||||||||  ||||||||||||    
T  26136946 agagtcatcattaccacccgagacaaacatttgctatcatgtcatgggattaaaagaatatatgaagtcgatttcttaaataaggatgaagctcttgaat 26137045  T
Q  571 tgttaagaacaaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagcttt 670  Q
    |||| ||    | |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26137046 tgtttaggtggatggcttttaaaagtaaccacaatgactcaagttatgattatattttaaacagtgcagttaaatatgcttctggccttccgttagcttt 26137145  T
Q  671 agaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagatt 770  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| || |||  |||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||     
T  26137146 agaagtagtgggttccagcttgtttggaaagtgtacaacagaatgggaatctacattacagaagtatgaaaggattccacatgaagatatccaaaacata 26137245  T
Q  771 cttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  26137246 cttagagtaagctatgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtatttttggatattgcttgttgcttcaaag 26137318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 206 - 368
Target Start/End: Original strand, 26136655 - 26136817
Alignment:
Q  206 acaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagttaaacatggcttag 305  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26136655 acaacacttactcgagcagtttataatttgattgcggatcaatttgaaggattgtgcttccttcacaatgtgcgagaaaattcagttaaatatggcttag 26136754  T
Q  306 agtatctccaagagcagatcctctccaaatcaatcggatttgaaactaagtttgaacatgtta 368  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||| | ||||||||    
T  26136755 aatatctccaagagcagctcctctccaaatcaatcggattggagattaagttaggacatgtta 26136817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 624 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 267311 - 267092
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 723  Q
    |||||||  |||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||  |     
T  267311 attttaattcgtgcagttgcttatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagggta 267212  T
Q  724 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttaga 823  Q
     |||||||  |||||| |  |||||  || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| | |||||  | |||||||||||||||||    
T  267211 cattagatgggtatgataagattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatggtttggaagaagaggagcagagtgtctttttaga 267112  T
Q  824 tattgcttgtttctttaaag 843  Q
     |||||||||| ||| ||||    
T  267111 cattgcttgttgcttcaaag 267092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 28126662 - 28126555
Alignment:
Q  608 ttcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtata 707  Q
    |||||| |||||| |  |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  28126662 ttcaagttatgatgatgttttaaaccgggcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttatagaaatagtgggttccaacttatttggaaagagcata 28126563  T
Q  708 gcagaatg 715  Q
    | ||||||    
T  28126562 gaagaatg 28126555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 267734 - 267671
Alignment:
Q  227 tataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| | || ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  267734 tataattttattgctgatcaatttgaaggattatgttttcttcatgatgtgagagaaaattcag 267671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28163789 - 28163707
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 289  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||  |  |||||||||| ||||||    
T  28163789 caacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgagagagaattca 28163707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28127089 - 28127032
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgttt 264  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  28127089 caacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttt 28127032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 624 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 18654444 - 18654233
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 723  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||     
T  18654444 attttaaaccgtgcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatagaagtcgtgggttccaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgaatcta 18654345  T
Q  724 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttaga 823  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18654344 cattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagttttgatgctttggatgaagaacaacaaagtgtctttttgga 18654245  T
Q  824 tattgcttgttt 835  Q
    ||||||||||||    
T  18654244 tattgcttgttt 18654233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 624 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 18678527 - 18678308
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 723  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||     
T  18678527 attttaaaacgtgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatttcagaatgtgagtcta 18678428  T
Q  724 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttaga 823  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||| ||    
T  18678427 cattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaattgtctttttgga 18678328  T
Q  824 tattgcttgtttctttaaag 843  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  18678327 tattgcttgtttcttcaaag 18678308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 624 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 18698367 - 18698148
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 723  Q
    ||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||     
T  18698367 atttttaaccatgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagttttgcagaatgtgactcta 18698268  T
Q  724 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttaga 823  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18698267 cattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttgga 18698168  T
Q  824 tattgcttgtttctttaaag 843  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  18698167 tattgcttgtttcttcaaag 18698148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 624 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 18723052 - 18722833
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 723  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  18723052 attttaaaccgagcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtcta 18722953  T
Q  724 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttaga 823  Q
     |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18722952 cattagatatgtatgaaagaattccagatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgggcgaagaacaacaaagtgtctttttgga 18722853  T
Q  824 tattgcttgtttctttaaag 843  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  18722852 tattgcttgtttcttcaaag 18722833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 624 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 18730471 - 18730252
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 723  Q
    ||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||     
T  18730471 atttttaaccatgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagttttgcagaatgtgattcta 18730372  T
Q  724 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttaga 823  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18730371 cattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttgga 18730272  T
Q  824 tattgcttgtttctttaaag 843  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  18730271 tattgcttgtttcttcaaag 18730252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 624 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 18688593 - 18688374
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 723  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||     
T  18688593 attttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatttcagaatgtgagtcta 18688494  T
Q  724 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttaga 823  Q
     ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18688493 cattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttgga 18688394  T
Q  824 tattgcttgtttctttaaag 843  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  18688393 tattgcttgtttcttcaaag 18688374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 381 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 5090164 - 5089762
Alignment:
Q  381 aagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagcagagtaatca 480  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| | || ||| | |||||||||  ||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  5090164 aagaaagttcttttgattctcgatgatattgacaaactgaaacaactacaggttttggccggagaacctgattggtttggtcttggcagcagagtcatca 5090065  T
Q  481 tcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggattnnnnnnntatacgaagcatatggtttaaataaggaacaagctcttgaattgttaagaac 580  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||  || ||||||||||        |||||||| | ||||||||||| || |  |||||||| |||| |||||       
T  5090064 ttaccactcgagacaaacacttgctaaaatgtcatgggattgatataacatacgaagtagatggtttaaatgagaacgaagctcttcaattattaaggtg 5089965  T
Q  581 aaaggcttttaaaagtaagaaaaatgattcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtg 680  Q
     ||||||||||||| ||  |    | || |||| |||||    |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5089964 gaaggcttttaaaaatagtactgttaatccaagttatgaaggaattttaaaccgtgtggtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagttgtg 5089865  T
Q  681 ggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagtta 780  Q
    |||||||| |||||||| |||  ||||| | ||||  | |||||| ||||| ||||||| || |||||  || |||| ||||||||||| |||| ||| |    
T  5089864 ggttccaatttgtttggaaaggatatagaaaaatggaaatctttactagatgagtatgaaaggattcctaataaagaaatccaaaagatacttatagtga 5089765  T
Q  781 gct 783  Q
    |||    
T  5089764 gct 5089762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5090383 - 5090285
Alignment:
Q  191 ggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 289  Q
    ||||||||||| || || |||||||   ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  5090383 ggaggaatgggtaaaaccacacttggaaaagcaatttacaatttcattgctcatcaatttgaatgtctttgttttcttcccaatgtgagagaaaattca 5090285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18698810 - 18698727
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  18698810 caacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcag 18698727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18730914 - 18730831
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  18730914 caacacttgctaaagtaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcag 18730831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 843
Target Start/End: Original strand, 18074993 - 18075191
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaa 744  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||  |  |||||||  |||||| |  |    
T  18074993 tatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaaga 18075092  T
Q  745 ttccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    ||||  || |||| |||||||  || |||||||| ||||||||  ||||| | |||||  | || ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  18075093 ttcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaag 18075191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18678969 - 18678887
Alignment:
Q  208 aacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  18678969 aacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcag 18678887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 5090521 - 5090476
Alignment:
Q  53 gtctcctacaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattacc 98  Q
    |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  5090521 gtctccaacaagatcaatcacactcctttacatgttgctgattacc 5090476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 68; Significance: 7e-30; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 306
Target Start/End: Original strand, 16691619 - 16691734
Alignment:
Q  191 ggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||     
T  16691619 ggaggaatcggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcatgacgtgagagaaaattcat 16691718  T
Q  291 ttaaacatggcttaga 306  Q
     |||||||||||||||    
T  16691719 ctaaacatggcttaga 16691734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 645 - 715
Target Start/End: Original strand, 16692099 - 16692169
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatg 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  16692099 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtaggatctaacttgtttggaaagaatatagaagaatg 16692169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 499
Target Start/End: Original strand, 16691847 - 16691953
Alignment:
Q  393 ttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagcagagtaatcatcaccactcgag 492  Q
    |||||||||||||| |||||  |   |||||||||||| ||| || | |||||| | | |||| |||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  16691847 ttgattctcgatgatgttgatgagcaaaagcaattgcaagttatggttggagagcccgattggtttggtcctggaagtagagtcatcattaccactcgag 16691946  T
Q  493 acaaaca 499  Q
    |||||||    
T  16691947 acaaaca 16691953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 624 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 2510 - 2300
Alignment:
Q  624 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 723  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| | ||| ||||  ||||  |||||  ||  |     
T  2510 attttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacatagaggaatggaagaata 2411  T
Q  724 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttaga 823  Q
     |||||||  ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| | ||||| || || ||||||||| ||||    
T  2410 cattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtctttctaga 2311  T
Q  824 tattgcttgtt 834  Q
     ||||||||||    
T  2310 cattgcttgtt 2300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2953 - 2870
Alignment:
Q  207 caacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  2953 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcag 2870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 51; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 625 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 29272808 - 29272718
Alignment:
Q  625 ttttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatg 715  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  29272808 ttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatg 29272718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 31905818 - 31905901
Alignment:
Q  206 acaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 289  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  31905818 acaacacttgctctggctgtttataatctgattgccgatcactttgaagctttgtgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 31905901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 608 - 715
Target Start/End: Original strand, 8682 - 8789
Alignment:
Q  608 ttcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtata 707  Q
    |||||| |||||  || ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  8682 ttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgata 8781  T
Q  708 gcagaatg 715  Q
    | ||||||    
T  8782 gaagaatg 8789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 608 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 3699 - 3592
Alignment:
Q  608 ttcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtata 707  Q
    |||||| |||||  || ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  3699 ttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgata 3600  T
Q  708 gcagaatg 715  Q
    | ||||||    
T  3599 gaagaatg 3592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 608 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 12662 - 12555
Alignment:
Q  608 ttcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtata 707  Q
    |||||| |||||  || ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  12662 ttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgata 12563  T
Q  708 gcagaatg 715  Q
    | ||||||    
T  12562 gaagaatg 12555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 9)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 645 - 779
Target Start/End: Original strand, 40751 - 40885
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttgg-caagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacaga 743  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||| || ||   ||||||  ||||||| ||     
T  40751 tatgcttctggcctaccattagctttagaagtagttggttccaacttgtttggattaga-tataggagaatgggaatccacattagaccagtatgaaagg 40849  T
Q  744 attccacatgaagatatccaaaagattcttaaagtt 779  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  40850 attccaaataaagagatccaaaagatacttaaagtt 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 312
Target Start/End: Original strand, 28205 - 28323
Alignment:
Q  194 ggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagtta 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| || ||  ||||||||||  |||||||||| |||||| |||| || |||||||||| ||    
T  28205 ggaatgggaaagacaacacttgcaagggcagtttataattttatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacgatgtaagggaaaattcagcta 28304  T
Q  294 aacatggcttagagtatct 312  Q
    || |||| |||||| ||||    
T  28305 aatatggtttagagcatct 28323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 312
Target Start/End: Original strand, 43712 - 43830
Alignment:
Q  194 ggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagtta 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||  || ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||  ||    
T  43712 ggaatgggaaagacaacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttcttcacgatgtaagggaaaattcaacta 43811  T
Q  294 aacatggcttagagtatct 312  Q
    || |||| |||||| ||||    
T  43812 aatatggtttagagcatct 43830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 645 - 715
Target Start/End: Original strand, 44189 - 44259
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatg 715  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||| ||||||    
T  44189 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttcaaacttatttggaaataatataggagaatg 44259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 381 - 521
Target Start/End: Original strand, 35695 - 35835
Alignment:
Q  381 aagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagcagagtaatca 480  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||||||||||||   |||||   || |||| |||||| ||| || | ||| ||||    
T  35695 aagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaattgcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgatca 35794  T
Q  481 tcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggatt 521  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  35795 ttaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggatt 35835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 521
Target Start/End: Original strand, 28418 - 28558
Alignment:
Q  381 aagaaagttttgttgattctcgatgacgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgatcggagaggctggttggcttggtcgtggcagcagagtaatca 480  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||   ||||    || |||| |||||| ||| || | ||| ||||    
T  28418 aagaaagttctattgattctcgatgatgttcacaaactaaagcaattgcgggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatca 28517  T
Q  481 tcaccactcgagacaaacaattgttatcatctcatgggatt 521  Q
    | ||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  28518 ttaccactcgaaacaaacaattgctagcaagtcatgggatt 28558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 312
Target Start/End: Original strand, 35482 - 35600
Alignment:
Q  194 ggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagtta 293  Q
    ||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||  || ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| | || || |||||||||  ||    
T  35482 ggaattggaaagacaacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacgacgtaagggaaaattcatcta 35581  T
Q  294 aacatggcttagagtatct 312  Q
    || |||| |||||| ||||    
T  35582 aatatggtttagagcatct 35600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 653 - 715
Target Start/End: Original strand, 28690 - 28752
Alignment:
Q  653 tggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatg 715  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||    
T  28690 tggcattccattggttttagaagtagtgggttcaaacttgtttgggaagaatattgaagaatg 28752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 105
Target Start/End: Original strand, 28071 - 28116
Alignment:
Q  60 acaagatcaaccacgttcctttacatgttgctgattaccttgttgg 105  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28071 acaagatcaatcatgttcctttacatgttgccgattaccctgttgg 28116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 645 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 57244 - 57174
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatg 715  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  57244 tatgcttcaggccttccattggccttagaagtagtgggttcgaacttgtttggaaagaatataggagaatg 57174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 57724 - 57603
Alignment:
Q  191 ggaggaatgggcaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||  || ||  ||||||||||   ||||||||| |||||| | || || ||||||||||    
T  57724 ggaggaatgggaaagacaacacttgctagagcagtttttaattccatagccgatcaatttgatgatttgtgttttcttcacgacgtaagggaaaattcag 57625  T
Q  291 ttaaacatggcttagagtatct 312  Q
     |||| |||| |||||| ||||    
T  57624 ctaaatatggtttagagcatct 57603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1870
Description:

Target: scaffold1870; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 645 - 715
Target Start/End: Original strand, 1 - 71
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatg 715  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  1 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatg 71  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 843
Target Start/End: Original strand, 60801 - 60999
Alignment:
Q  645 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaa 744  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||  |  |||||||  |||||| |  |    
T  60801 tatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaaga 60900  T
Q  745 ttccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgaatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 843  Q
    ||||  || |||| |||||||  || |||||||| ||||||||  ||||| | |||||  | || ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  60901 ttcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaag 60999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University