View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18354_low_11 (Length: 363)

Name: NF18354_low_11
Description: NF18354
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18354_low_11
NF18354_low_11
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (23-363)||(20275-20615)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (23-329)||(19759-20065)
scaffold0122 (23-329)||(24063-24369)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (23-353)||(1494-1823)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (23-363)||(15276-15615)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (23-363)||(7283865-7284204)
chr7 (114-363)||(44865333-44865582)
chr7 (114-363)||(35094919-35095166)
chr7 (114-363)||(3895128-3895376)
chr7 (114-363)||(143742-143991)
chr7 (110-363)||(47289884-47290138)
chr7 (114-363)||(15822327-15822575)
chr7 (114-363)||(39046523-39046767)
chr7 (114-347)||(45452063-45452296)
chr7 (114-363)||(12369735-12369984)
chr7 (114-363)||(11287520-11287768)
chr7 (114-363)||(13862828-13863074)
chr7 (114-363)||(12759090-12759340)
chr7 (114-363)||(12248015-12248265)
chr7 (114-363)||(26070161-26070408)
chr7 (114-363)||(26093948-26094195)
chr7 (115-363)||(16569902-16570150)
chr7 (115-363)||(16595512-16595760)
chr7 (23-145)||(111078-111200)
chr7 (23-145)||(126739-126861)
chr7 (23-145)||(1936826-1936948)
chr7 (23-145)||(3060272-3060394)
chr7 (48-145)||(32493880-32493977)
chr7 (81-363)||(17223797-17224082)
chr7 (81-329)||(14271760-14272009)
chr7 (73-283)||(13377711-13377924)
chr7 (155-305)||(16914866-16915015)
chr7 (76-329)||(34241063-34241317)
chr7 (114-285)||(13274957-13275129)
chr7 (110-305)||(48356804-48357001)
chr7 (110-305)||(9611468-9611665)
chr7 (110-305)||(9839039-9839236)
chr7 (73-130)||(13389693-13389750)
chr7 (114-363)||(49047569-49047818)
chr7 (114-249)||(31501389-31501526)
chr7 (114-187)||(25124407-25124482)
chr7 (73-129)||(16919870-16919926)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (23-363)||(11584157-11584496)
chr5 (114-363)||(21397195-21397444)
chr5 (114-363)||(28261624-28261867)
chr5 (114-359)||(4865370-4865613)
chr5 (114-363)||(24183027-24183276)
chr5 (114-363)||(20712179-20712428)
chr5 (114-363)||(11337081-11337330)
chr5 (114-353)||(21646636-21646873)
chr5 (114-363)||(1168100-1168348)
chr5 (181-363)||(24475681-24475861)
chr5 (114-363)||(19405640-19405891)
chr5 (153-305)||(21906859-21907011)
chr5 (136-283)||(23981433-23981581)
chr5 (73-363)||(19862312-19862604)
chr5 (73-313)||(21222462-21222703)
chr5 (114-363)||(3673965-3674215)
chr5 (114-329)||(21310603-21310819)
chr5 (114-353)||(16595621-16595860)
chr5 (114-283)||(23466619-23466787)
chr5 (114-363)||(23494022-23494272)
chr5 (23-363)||(5450645-5450987)
chr5 (114-329)||(21297069-21297285)
chr5 (114-283)||(28902373-28902545)
chr5 (114-283)||(28938768-28938940)
chr5 (149-234)||(6456852-6456937)
chr5 (114-210)||(7728675-7728774)
chr5 (174-283)||(22885824-22885932)
chr5 (73-231)||(37983598-37983758)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (23-363)||(6213-6552)
scaffold0310 (105-363)||(1-258)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (114-363)||(13817615-13817862)
chr3 (114-363)||(317405-317652)
chr3 (114-359)||(16181842-16182085)
chr3 (114-363)||(19570586-19570832)
chr3 (114-363)||(16995956-16996203)
chr3 (114-363)||(22144167-22144416)
chr3 (114-354)||(38527841-38528079)
chr3 (114-363)||(50111946-50112195)
chr3 (114-363)||(54424115-54424364)
chr3 (114-360)||(6154226-6154472)
chr3 (114-363)||(12349434-12349683)
chr3 (114-363)||(14298524-14298773)
chr3 (114-363)||(14304151-14304400)
chr3 (114-363)||(17100756-17101004)
chr3 (114-363)||(17101441-17101689)
chr3 (114-363)||(8631893-8632142)
chr3 (114-363)||(34439237-34439487)
chr3 (114-363)||(35123799-35124047)
chr3 (114-363)||(17938677-17938925)
chr3 (114-363)||(14295541-14295790)
chr3 (114-363)||(14301168-14301417)
chr3 (109-360)||(17522780-17523030)
chr3 (203-363)||(53898440-53898599)
chr3 (23-145)||(7854306-7854428)
chr3 (173-362)||(55440803-55440992)
chr3 (114-362)||(3578192-3578440)
chr3 (114-363)||(11060902-11061150)
chr3 (23-145)||(2844515-2844637)
chr3 (23-145)||(3992874-3992996)
chr3 (23-145)||(55513194-55513316)
chr3 (48-145)||(54037958-54038055)
chr3 (235-363)||(6146763-6146890)
chr3 (23-145)||(15857072-15857194)
chr3 (114-218)||(6146664-6146769)
chr3 (218-352)||(19260839-19260972)
chr3 (30-145)||(19232090-19232205)
chr3 (114-248)||(14527975-14528110)
chr3 (190-363)||(11196291-11196456)
chr3 (48-145)||(17955814-17955915)
chr3 (30-145)||(45581955-45582070)
chr3 (23-145)||(16743950-16744072)
chr3 (114-363)||(11328859-11329105)
chr3 (68-283)||(17204863-17205081)
chr3 (114-363)||(17139611-17139861)
chr3 (118-363)||(14059112-14059357)
chr3 (73-283)||(17191723-17191936)
chr3 (30-90)||(28558550-28558610)
chr3 (192-283)||(15876250-15876341)
chr3 (81-283)||(3576298-3576503)
chr3 (114-363)||(12560131-12560380)
chr3 (73-240)||(13301323-13301491)
chr3 (73-240)||(13311979-13312147)
chr3 (114-363)||(16880226-16880477)
chr3 (73-150)||(38810868-38810945)
chr3 (81-148)||(15550919-15550986)
chr3 (173-363)||(39656629-39656817)
chr3 (114-240)||(11882113-11882240)
chr3 (219-283)||(47784767-47784831)
chr3 (73-128)||(12031849-12031904)
chr3 (114-187)||(51961031-51961106)
chr3 (174-248)||(15517848-15517921)
chr3 (115-248)||(33368822-33368957)
chr3 (114-248)||(9590648-9590784)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (114-363)||(25875816-25876063)
chr2 (114-363)||(23836601-23836849)
chr2 (114-360)||(32465964-32466207)
chr2 (114-363)||(36890581-36890829)
chr2 (114-363)||(271273-271521)
chr2 (114-363)||(4448028-4448277)
chr2 (114-355)||(25602135-25602377)
chr2 (114-363)||(28974152-28974400)
chr2 (114-355)||(27261915-27262156)
chr2 (23-145)||(19794538-19794660)
chr2 (114-360)||(24571188-24571433)
chr2 (114-363)||(22579758-22580006)
chr2 (38-145)||(20627162-20627269)
chr2 (23-145)||(22284279-22284404)
chr2 (48-145)||(22275046-22275143)
chr2 (42-145)||(43642809-43642912)
chr2 (62-148)||(15633535-15633621)
chr2 (109-363)||(68095-68351)
chr2 (114-355)||(31146073-31146317)
chr2 (73-247)||(19660098-19660273)
chr2 (73-363)||(43645996-43646289)
chr2 (81-262)||(25305634-25305818)
chr2 (73-232)||(19666761-19666921)
chr2 (114-283)||(23821534-23821704)
chr2 (114-283)||(23830613-23830783)
chr2 (114-326)||(722531-722742)
chr2 (114-210)||(19669003-19669101)
chr2 (301-360)||(6879543-6879601)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (23-231)||(8-216)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (114-363)||(37611771-37612020)
chr8 (114-363)||(22234700-22234947)
chr8 (114-363)||(20573087-20573336)
chr8 (114-363)||(19992952-19993198)
chr8 (114-363)||(20481708-20481955)
chr8 (114-363)||(41246761-41247009)
chr8 (114-363)||(20561526-20561775)
chr8 (114-281)||(25122626-25122793)
chr8 (23-145)||(24716671-24716793)
chr8 (23-145)||(39115599-39115721)
chr8 (23-145)||(16404809-16404931)
chr8 (118-218)||(7000524-7000624)
chr8 (114-363)||(21681105-21681356)
chr8 (23-145)||(274767-274889)
chr8 (23-145)||(640960-641082)
chr8 (23-145)||(826766-826888)
chr8 (73-363)||(21198005-21198296)
chr8 (23-363)||(23837301-23837643)
chr8 (73-283)||(17285386-17285600)
chr8 (114-208)||(20529748-20529843)
chr8 (114-363)||(22981376-22981622)
chr8 (114-363)||(39446660-39446910)
chr8 (257-355)||(20653944-20654041)
chr8 (73-329)||(33528562-33528819)
chr8 (73-363)||(29306520-29306813)
chr8 (73-313)||(5854766-5855007)
chr8 (110-305)||(15933458-15933655)
chr8 (23-234)||(31194127-31194340)
chr8 (271-363)||(20647882-20647973)
chr8 (69-283)||(26011676-26011888)
chr8 (110-228)||(22743001-22743122)
chr8 (174-248)||(27233047-27233120)
chr8 (197-329)||(25296295-25296426)
chr8 (197-329)||(25758315-25758446)
chr8 (192-363)||(38533752-38533922)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (114-363)||(14977-15224)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (114-363)||(44346930-44347177)
chr4 (114-363)||(53704629-53704877)
chr4 (114-363)||(55376494-55376741)
chr4 (114-363)||(23269829-23270078)
chr4 (118-363)||(8872372-8872615)
chr4 (114-363)||(34395360-34395609)
chr4 (114-363)||(44056018-44056266)
chr4 (114-363)||(30458006-30458255)
chr4 (114-363)||(53907604-53907843)
chr4 (114-363)||(12837096-12837344)
chr4 (114-363)||(16732272-16732520)
chr4 (114-305)||(20813442-20813634)
chr4 (114-363)||(21959359-21959607)
chr4 (114-283)||(819826-819996)
chr4 (133-363)||(45458769-45458999)
chr4 (23-145)||(54118077-54118199)
chr4 (23-145)||(5682337-5682459)
chr4 (27-145)||(25119020-25119138)
chr4 (114-363)||(52265403-52265652)
chr4 (114-305)||(27961131-27961324)
chr4 (114-363)||(30232391-30232640)
chr4 (110-329)||(7185735-7185954)
chr4 (114-283)||(18494224-18494392)
chr4 (114-363)||(13809405-13809654)
chr4 (114-363)||(15044931-15045181)
chr4 (73-283)||(15013137-15013347)
chr4 (114-247)||(41256263-41256399)
chr4 (195-363)||(47535042-47535209)
chr4 (73-150)||(41165808-41165885)
chr4 (319-363)||(820016-820060)
chr4 (114-259)||(14901437-14901584)
chr4 (114-248)||(7964606-7964742)
chr4 (73-130)||(47534933-47534990)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (114-363)||(11548-11798)
scaffold0359 (114-363)||(1420-1667)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (114-363)||(22403005-22403254)
chr1 (121-363)||(41212175-41212415)
chr1 (114-363)||(49967753-49968002)
chr1 (114-363)||(9783959-9784208)
chr1 (114-355)||(35054867-35055108)
chr1 (155-363)||(21718331-21718537)
chr1 (114-292)||(35522247-35522426)
chr1 (23-145)||(41218729-41218851)
chr1 (23-145)||(21860335-21860457)
chr1 (23-145)||(44034780-44034902)
chr1 (23-145)||(41394528-41394650)
chr1 (73-282)||(13376711-13376923)
chr1 (73-363)||(20177278-20177570)
chr1 (114-325)||(19603238-19603449)
chr1 (219-363)||(27329757-27329899)
chr1 (114-283)||(22143256-22143426)
chr1 (114-283)||(16656820-16656992)
chr1 (73-315)||(21195164-21195408)
chr1 (114-283)||(16646094-16646266)
chr1 (73-313)||(17609080-17609322)
chr1 (110-362)||(37233750-37234003)
chr1 (73-144)||(27675120-27675191)
chr1 (332-363)||(35522432-35522463)
chr1 (114-283)||(8537803-8537975)
chr1 (114-283)||(8603042-8603214)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (114-363)||(5143-5390)
scaffold0480 (114-363)||(8776-9026)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (114-363)||(254710-254958)
scaffold0011 (114-363)||(261316-261564)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (114-363)||(4388-4635)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (114-363)||(164318-164565)
scaffold0016 (23-145)||(166073-166195)
scaffold0016 (72-145)||(162036-162109)
scaffold0016 (73-150)||(116410-116487)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (114-363)||(11603-11852)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (114-363)||(4666-4913)
scaffold0447 (114-363)||(9280-9527)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (114-363)||(7275-7522)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (114-363)||(48250-48496)
scaffold0068 (114-363)||(61698-61944)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (114-363)||(18570382-18570630)
chr6 (114-363)||(32898893-32899142)
chr6 (114-363)||(22441037-22441285)
chr6 (114-363)||(13014603-13014853)
chr6 (114-363)||(16086120-16086369)
chr6 (114-363)||(16106619-16106868)
chr6 (114-363)||(18432746-18432994)
chr6 (23-145)||(18583641-18583763)
chr6 (114-363)||(18777249-18777481)
chr6 (181-363)||(31628371-31628552)
chr6 (23-145)||(19983101-19983223)
chr6 (23-145)||(35014966-35015088)
chr6 (114-363)||(18399041-18399290)
chr6 (73-363)||(21623271-21623563)
chr6 (73-283)||(22361619-22361830)
chr6 (114-329)||(17083093-17083307)
chr6 (114-283)||(33324874-33325046)
chr6 (114-262)||(25367130-25367280)
chr6 (114-361)||(21410944-21411191)
chr6 (114-283)||(35135906-35136078)
chr6 (81-305)||(18629469-18629695)
chr6 (110-305)||(17556909-17557104)
chr6 (114-307)||(16887685-16887881)
chr6 (174-283)||(29605632-29605739)
chr6 (114-283)||(15079606-15079774)
chr6 (73-232)||(33538223-33538384)
chr6 (73-145)||(14152632-14152704)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (114-360)||(717-963)
scaffold0673 (123-363)||(6749-6989)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (114-363)||(22794-23043)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (114-363)||(247-496)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (114-363)||(25314-25563)
scaffold0158 (213-363)||(25061-25210)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (114-363)||(10040-10289)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (114-355)||(132-370)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (114-363)||(132144-132394)
scaffold0021 (110-363)||(88378-88631)
scaffold0021 (114-363)||(11790-12041)
scaffold0021 (114-343)||(16022-16253)
scaffold0021 (114-343)||(25553-25784)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (114-363)||(7672-7922)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (114-268)||(2961-3115)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (114-363)||(60909-61159)
scaffold0001 (149-363)||(70552-70766)
scaffold0001 (114-253)||(79785-79925)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (114-363)||(24623-24872)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (114-363)||(11464-11712)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (114-363)||(117857-118107)
scaffold0035 (114-355)||(109356-109598)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (114-355)||(112441-112681)
scaffold0022 (114-305)||(102815-103009)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (114-355)||(85443-85683)
scaffold0014 (114-361)||(159404-159651)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (114-363)||(9090-9339)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (114-363)||(38401-38650)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (133-363)||(252903-253133)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (114-363)||(70716-70964)
scaffold0031 (155-342)||(31168-31352)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (114-363)||(21615-21862)
scaffold0120 (114-363)||(31314-31561)
scaffold0120 (114-223)||(47445-47554)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (114-363)||(33765-34014)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (118-355)||(2026-2263)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (110-363)||(46268-46521)
scaffold0034 (114-355)||(40769-41010)
scaffold0034 (23-145)||(80188-80310)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (114-363)||(471-720)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (175-363)||(5044-5231)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (155-345)||(6062-6251)
scaffold0342 (60-145)||(298-383)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (23-145)||(30418-30540)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (23-145)||(5686-5808)
scaffold0686 (56-145)||(5925-6014)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (27-145)||(31093-31211)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (27-145)||(41633-41751)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (23-145)||(42678-42797)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (218-355)||(146712-146848)
scaffold0025 (178-283)||(85715-85818)
scaffold0025 (110-305)||(53506-53703)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (73-363)||(76699-76991)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (114-362)||(3423-3671)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (114-345)||(7927-8157)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (114-363)||(33622-33872)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (73-283)||(197107-197318)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (114-283)||(1440-1611)
scaffold0456 (114-283)||(8585-8756)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (114-283)||(8192-8363)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (114-307)||(89760-89952)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (114-248)||(1242-1378)
scaffold0409 (114-248)||(9497-9633)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (195-363)||(2628-2795)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (81-305)||(6885-7112)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (81-282)||(69640-69843)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (73-285)||(35658-35873)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (295-363)||(32306-32373)
scaffold0091 (295-363)||(41930-41997)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (114-210)||(70201-70298)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (73-241)||(31244-31414)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (114-248)||(10879-11014)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (73-248)||(104477-104653)
scaffold0032 (173-305)||(93728-93860)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (318-363)||(617-662)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (114-307)||(22323-22518)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (81-145)||(1371-1435)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (73-329)||(43651-43908)
scaffold0080 (110-283)||(23562-23737)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (22-130)||(442-549)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (114-248)||(855-992)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (114-248)||(79756-79891)
scaffold0028 (334-363)||(89584-89613)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (219-283)||(6843-6907)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (220-363)||(28639-28781)


Alignment Details
Target: scaffold0049 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20615 - 20275
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20615 aagggttagagagaagaggagcttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 20516  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20515 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatt 20416  T
Q  223 cgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatata 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20415 cgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatata 20316  T
Q  323 tgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20315 tgttgaaaatatgctcaattggttaattatgctttgttgtt 20275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 329
Target Start/End: Original strand, 19759 - 20065
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19759 aagggttagagagaagaggagcttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 19858  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatt 19958  T
Q  223 cgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatata 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19959 cgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatata 20058  T
Q  323 tgttgaa 329  Q
    |||||||    
T  20059 tgttgaa 20065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 23 - 329
Target Start/End: Original strand, 24063 - 24369
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24063 aagggttagagagaagaggagcttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 24162  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24163 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatt 24262  T
Q  223 cgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatata 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263 cgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatata 24362  T
Q  323 tgttgaa 329  Q
    |||||||    
T  24363 tgttgaa 24369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1823 - 1494
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1823 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 1724  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1723 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttggatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcctatgtgatgaaatt 1624  T
Q  223 cgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatat 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||| |||| | |||    
T  1623 cgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattatatgttcaaa--gtatgagaaattggtat 1526  T
Q  322 atgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1525 atgttgaaaatatgctcaattgttgaattatg 1494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 15276 - 15615
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  15276 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaag 15375  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatt 222  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15376 ggggttagcattcatcataatcacttttgtaattttaaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtgaaatt 15475  T
Q  223 cgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatata 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||     
T  15476 cgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggacaattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtataaaaaaatgggtatg 15575  T
Q  323 tgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15576 tg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 15615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 7283865 - 7284204
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7283865 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaag 7283964  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  7283965 ggggttagttttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttatatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtgaaatt 7284064  T
Q  223 cgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatat 321  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| || | | |||    
T  7284065 cgtactctaattatgatgacatgtttagatgtgtgaagttatggatgattgaattgttattagttgaattgtatgttcaaagt--atgagaagttggtat 7284162  T
Q  322 atgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7284163 atgttgaaaatatgcttaattggtgaattatcctttgttgtt 7284204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 44865582 - 44865333
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44865582 taaggtaagggggttaga-ttcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 44865484  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||    
T  44865483 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 44865384  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44865383 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgtt 44865333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 35095166 - 35094919
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35095166 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 35095067  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  35095066 gatgaaattcatgctctaattgtgataacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtatatgaaa 35094968  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35094967 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcactgttgtt 35094919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3895376 - 3895128
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3895376 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataatt 3895277  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 312  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||    
T  3895276 gatgaaattcatgctctaattctgatgaaatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaa--gtatgaaa 3895179  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3895178 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 3895128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 143991 - 143742
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  143991 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtataaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 143892  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  143891 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 143793  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143792 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 143742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 47290138 - 47289884
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 207  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47290138 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaaatgcttaattggatgaattgattaattgttc 47290039  T
Q  208 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgt 307  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  47290038 ataaatgatgaaattcgagctctaattatgatgccatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgt 47289940  T
Q  308 atgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47289939 atgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 47289884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 15822327 - 15822575
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  15822327 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcagttatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 15822426  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  15822427 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatg-ttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaaatgtatgaa 15822525  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15822526 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaaatggtgaattatgctttgttgtt 15822575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 39046523 - 39046767
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046523 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 39046622  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||      ||||    
T  39046623 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattattgttagttgaattgtatgttcaa-----ttgaa 39046717  T
Q  313 aataga-tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39046718 aaatgagtatatg-tgaaaatat-ctcaattggtgaattatgcattgttgtt 39046767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 114 - 347
Target Start/End: Original strand, 45452063 - 45452296
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  45452063 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 45452162  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  45452163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 45452260  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtga 347  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45452261 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaatttgtga 45452296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 12369735 - 12369984
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  12369735 taaggtaagggggttagatttcatcattatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 12369834  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  12369835 tgattaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttacggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 12369932  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12369933 aaatgggtatctgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgccttgttgtt 12369984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11287768 - 11287520
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||      
T  11287768 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 11287670  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||     
T  11287669 tgatgaaattagtgctctgattatgttgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgag 11287572  T
Q  313 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11287571 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 11287520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 13862828 - 13863074
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||| |||||||||| ||||      
T  13862828 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaa----gcttaattgggtgaatagattaattgtccataaa 13862923  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  13862924 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 13863021  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13863022 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 13863074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12759340 - 12759090
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  12759340 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataa 12759241  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
     |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||   |    
T  12759240 atgatgaaatttgtgctccaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaaatgt-gaa 12759142  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12759141 aaaggggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 12759090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 12248015 - 12248265
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12248015 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aattgattacttgttcata 12248112  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |  |    
T  12248113 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgtttaaagtatgag 12248212  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12248213 aaaatag-tatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 12248265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 26070161 - 26070408
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  26070161 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26070257  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |  ||    
T  26070258 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26070357  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  26070358 aaat-ggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgtt 26070408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 26093948 - 26094195
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  26093948 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26094044  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |  ||    
T  26094045 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26094144  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  26094145 aaat-ggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgtt 26094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 115 - 363
Target Start/End: Original strand, 16569902 - 16570150
Alignment:
Q  115 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16569902 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16569999  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| |  |||    
T  16570000 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16570099  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16570100 aat-ggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 16570150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 115 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16595760 - 16595512
Alignment:
Q  115 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16595760 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16595663  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| |  |||    
T  16595662 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16595563  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16595562 aat-ggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 16595512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 111078 - 111200
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  111078 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaag 111177  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  111178 ggggttagttttcatcataatca 111200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 126861 - 126739
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  126861 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaag 126762  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  126761 ggggttagtttttatcataatca 126739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 1936826 - 1936948
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1936826 aagggttagagagaagaggaactcgaagaattcaagggtttgaagaatcatagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaag 1936925  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    | ||||||| || ||||||||||    
T  1936926 gaggttagtttttatcataatca 1936948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3060394 - 3060272
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  3060394 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcgtaggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaag 3060295  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||| ||| || ||||||||||    
T  3060294 ggggtaagtctttatcataatca 3060272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Original strand, 32493880 - 32493977
Alignment:
Q  48 aagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32493880 aagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 32493977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 363
Target Start/End: Original strand, 17223797 - 17224082
Alignment:
Q  81 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt---tgtaa-ttttcaattatttgtatga-t 174  Q
    ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||   ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  17223797 aaagtgaagcttgggctaagaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaatttttcaattattt-tatgatt 17223895  T
Q  175 aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattga 274  Q
    |||||||||||| ||  || | |||||||||||| |  || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| | |||||| || ||||||||    
T  17223896 aagtgcttaatt-gagtaaataattaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcacgaagttgtggataattga 17223994  T
Q  275 attgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||| |   ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  17223995 attgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatactcaaattgttgaattatgctatgttgtt 17224082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 329
Target Start/End: Original strand, 14271760 - 14272009
Alignment:
Q  81 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-ta 175  Q
    ||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  14271760 aaagtgaagcttaggttaggaattggtgataattaaggtaagggaattagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaata 14271858  T
Q  176 agtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaa 275  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||| ||    
T  14271859 agtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagttg-tcaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaa 14271956  T
Q  276 ttgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 329  Q
    |||||||| |   ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  14271957 ttgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaaat-gatatatgttgaa 14272009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377711
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttg 168  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  |||    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaatt-gttg 13377826  T
Q  169 tatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 267  Q
    |||| ||||||| || ||| ||  ||| |||||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  13377825 tatgaataagtgattcatt-gagtaatcgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttga 13377727  T
Q  268 taattgaattgttgtt 283  Q
    ||||||||||||||||    
T  13377726 taattgaattgttgtt 13377711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 305
Target Start/End: Original strand, 16914866 - 16915015
Alignment:
Q  155 ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatg 253  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||    
T  16914866 ttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatg 16914963  T
Q  254 tatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
     ||||| || ||| ||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  16914964 catgaaattgatg-ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 16915015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 329
Target Start/End: Original strand, 34241063 - 34241317
Alignment:
Q  76 gagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga 173  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | || ||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||    
T  34241063 gagctaaagtgaagcttgggttaagaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatga 34241162  T
Q  174 -taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataatt 272  Q
     |||||| |||||| ||  || ||||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||| |||||  ||||||  ||| ||||| ||    ||||||    
T  34241163 ttaagtgattaatt-gagtaagtgattaattgttcatagttgataaaattcgtgttataattatgatgttatgtttgaatgcatgaaattggtgataatt 34241261  T
Q  273 gaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 329  Q
    ||||||||||| |   ||||| ||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||    
T  34241262 gaattgttgttggtgaaattgcatgttaaaagtatgtgaaagta-atatatgttgaa 34241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13275129 - 13274957
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  13275129 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 13275032  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttag 285  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| | |||||| |   ||||||||||||||||||    
T  13275031 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttggtaattgaattgttgttag 13274957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 48357001 - 48356804
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 206  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| || ||||||||||  | || ||||||||||||    
T  48357001 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcattcgttgtatgattaaatgcttaattgagt-aagtgattaattgtt 48356903  T
Q  207 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    ||||  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  48356902 catagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 48356804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9611665 - 9611468
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 205  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  |||||||||||    
T  9611665 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9611568  T
Q  206 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  9611567 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9611468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9839236 - 9839039
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 205  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  |||||||||||    
T  9839236 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9839139  T
Q  206 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  9839138 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9839039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13389750 - 13389693
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttag 130  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13389750 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13389693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 49047569 - 49047818
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  49047569 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtta-tatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcaga 49047666  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      || |  |||| |||||| |||| | |||||||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |   ||||  ||||||||||| |  |    
T  49047667 attgttagaatttgtgctccaattataatgacatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 49047766  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    | | | | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  49047767 agagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgttatgttgtt 49047818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31501526 - 31501389
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||||    
T  31501526 taaggtaagggggttagaattcaacaataatcaattagttgtaattttc-attaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcat 31501429  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttta 249  Q
    |  |||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||    
T  31501428 agttgatgaaattagtgatctaattatgaagatatgttta 31501389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124407
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 25124407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16919926 - 16919870
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggtta 129  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16919926 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggtta 16919870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11584496 - 11584157
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11584496 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtgtgaataatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 11584397  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatt 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||    
T  11584396 ggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattaattaattgttcatgagtggtgaaatt 11584297  T
Q  223 cgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatata 322  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||  |||||||||||||  | ||||    
T  11584296 cgtgctctatttatgatgacatatttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtatgaaaa-gggtata 11584198  T
Q  323 tgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11584197 tgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 11584157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21397444 - 21397195
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21397444 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 21397345  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  21397344 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 21397246  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21397245 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 21397195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28261867 - 28261624
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28261867 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 28261768  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  28261767 ggtgaaattcgtgctctagttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt--atgaaa 28261670  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28261669 a---atatgtgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 28261624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 114 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4865613 - 4865370
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4865613 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 4865514  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 312  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||    
T  4865513 ggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaa 4865416  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgt 359  Q
    ||| | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4865415 aatgggtat-gggtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgt 4865370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 24183027 - 24183276
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  24183027 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 24183126  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  24183127 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtcatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttcaaagtgtatgaa 24183226  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24183227 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 24183276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20712428 - 20712179
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  20712428 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttgcaattttcaattacttgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataa 20712329  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg- 310  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||  |||||||||  |||||     
T  20712328 -tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataactgaattgttgttgattgaattacatgttcaaa--gtatga 20712232  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20712231 aaaatgggtatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 20712179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 11337081 - 11337330
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11337081 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattggttaattgttcataa 11337179  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||    
T  11337180 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatga 11337277  T
Q  312 aaata-gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
     |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11337278 gaatatggtaaatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgttatgttgtt 11337330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 21646636 - 21646873
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21646636 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttattgcaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaaatgttcatatg 21646734  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  21646735 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttaaaagtgtatgaa 21646833  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 353  Q
    ||| | ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21646834 aatgggtatgt-atgaaaatatgttcaattggtgaattatg 21646873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 1168100 - 1168348
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||||||||      
T  1168100 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaaatgcttattttggtgaattgattaattgttcataaa 1168198  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||  ||||||||||| |  |||    
T  1168199 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataatagaatggttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 1168298  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1168299 aat-gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcaatgttgtt 1168348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24475861 - 24475681
Alignment:
Q  181 ttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24475861 ttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-t 24475763  T
Q  281 gttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24475762 gttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 24475681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19405891 - 19405640
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19405891 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 19405793  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |  |    
T  19405792 aatgatgaaatttatgctctaattatgatgacatatttgaatgtatgaagttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 19405693  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||    
T  19405692 aaaa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattagttgaattatgattcgttgtt 19405640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21907011 - 21906859
Alignment:
Q  153 aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagat 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21907011 aattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagac 21906912  T
Q  253 gtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||    
T  21906911 atatgaagttatggataattgaattgatgttggttgaattacatgttcaaagt 21906859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 283
Target Start/End: Original strand, 23981433 - 23981581
Alignment:
Q  136 atcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaatt 234  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23981433 atcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaatttagtgcattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaatt 23981532  T
Q  235 gtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
     |||||| ||||||  ||| ||||| ||    |||||||||||||||||    
T  23981533 atgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgtt 23981581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19862604 - 19862312
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgt 169  Q
    ||||||| ||||||||| ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||    
T  19862604 taggagctaaagtgaagtttaggctaaaaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgt 19862505  T
Q  170 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 268  Q
    |||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||    
T  19862504 atgaataagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgat 19862406  T
Q  269 aattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||||||| |   ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19862405 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 19862312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 313
Target Start/End: Original strand, 21222462 - 21222703
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgt 169  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  21222462 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtatgggggttagagttcaatcataattatttagtgtaatttttcaatta-ttgt 21222560  T
Q  170 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 268  Q
    |||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||    
T  21222561 atgattaagtgcttaattg--agtattgattaattgttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgat 21222658  T
Q  269 aattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    |||| |||||||||| |   ||||| ||||||||||| |||||||    
T  21222659 aattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaa 21222703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3674215 - 3673965
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt---tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  3674215 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaattttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcat 3674118  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtat 309  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||  || ||||| |  |||||||||||||||||||   ||||  ||| ||||||| |      
T  3674117 aattgttagaattcgtgctcaaattatgatgatatgtttgaatacattaagttgttgataattgaattgttgttagggaaatttcatgatcaaagtatga 3674018  T
Q  310 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  3674017 gaaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 3673965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 329
Target Start/End: Original strand, 21310603 - 21310819
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  21310603 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 21310701  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||| | ||    
T  21310702 aatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21310801  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaa 329  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  21310802 aaaat-gatatatgttgaa 21310819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16595860 - 16595621
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  16595860 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgactaattgttcat 16595763  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtat 309  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||   ||||  ||||||||||| |      
T  16595762 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgatagagaaatttcatgttcaaagtatga 16595663  T
Q  310 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 353  Q
    |||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16595662 gaaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatg 16595621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23466787 - 23466619
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||     
T  23466787 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattattgcaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattgtgt-aattgattaattgttcataa 23466690  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
     |  |  ||||||||||| |||| ||   ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23466689 ttattagaattcgtgctccaattatggcaacatgtttgtatgtaagaagttatg-ataattgaattgttgtt 23466619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23494272 - 23494022
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||  |||||||||||||    
T  23494272 taaggtaagggggttagaaatcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aatcaattaattgttcat 23494175  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtat 309  Q
    |  || |  ||||||||||| || | ||||||||||||   ||| |||||||| || | |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  ||||    
T  23494174 aattgttagaattcgtgctccaactatgatgacatgttcgaatgcatgaagttgtggaaaattgaattgttattagtggaattttatgttcaaa--gtat 23494077  T
Q  310 gaa-aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  23494076 gaagaataggtatatgttg-agatatgcgaaattggttgaattatgctatgttgtt 23494022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 5450645 - 5450987
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaaga-atcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaa 121  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||  || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| | |||||||||||||    
T  5450645 aagggttagagagaagaggagcttgaaga-ttcaagaattggaagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgataataattaaggtaa 5450743  T
Q  122 gggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtat-gataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgat 216  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||| ||  |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||  || |    
T  5450744 gggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaatt-gttgcataaataaatgcttaatt-gagtaattgattaattgttcataattgtt 5450841  T
Q  217 gaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaata 316  Q
      ||||| ||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |   ||||  ||||||||||| |  |||| |     
T  5450842 agaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt- 5450940  T
Q  317 gatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  5450941 gatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgtt 5450987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 329
Target Start/End: Original strand, 21297069 - 21297285
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  21297069 taaggtaagggggttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcata 21297167  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      || | |||||||| |||||| | |||||| ||||||  | | ||||| ||    ||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||| | ||    
T  21297168 aatgttaaaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21297267  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaa 329  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  21297268 aaaat-gatatatgttgaa 21297285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28902545 - 28902373
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  28902545 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28902448  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| || ||||| |  |||||||||||||||||    
T  28902447 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgtt 28902373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28938940 - 28938768
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  28938940 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28938843  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| || ||||| |  |||||||||||||||||    
T  28938842 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgtt 28938768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6456937 - 6456852
Alignment:
Q  149 ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaatt 234  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  6456937 ttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaatt 6456852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7728774 - 7728675
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||   ||| |||  |||  |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7728774 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgtaaattttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 7728676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22885932 - 22885824
Alignment:
Q  174 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattg 273  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | ||||||||   || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    |||||||    
T  22885932 taagtgcttaattgaat-aattgataatttgttcatggttgttgaaattcgtgctttaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattg 22885834  T
Q  274 aattgttgtt 283  Q
    ||||||||||    
T  22885833 aattgttgtt 22885824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37983758 - 37983598
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  37983758 taggagctaaagtgaagcttgggctagaaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 37983659  T
Q  171 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 231  Q
    |||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||    
T  37983658 tgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaatttgtgctcta 37983598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 6213 - 6552
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6213 aagggttagagagaagatgaacttgaagaattcaagggtttgaataatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaag 6312  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  6313 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaactgttcataaatgatgaaatt 6412  T
Q  223 cgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatat 321  Q
    |||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||  |||| || | | |||    
T  6413 cgtgctatatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaagt--atgagaagttggtat 6510  T
Q  322 atgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  6511 atgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgtt 6552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 105 - 363
Target Start/End: Original strand, 1 - 258
Alignment:
Q  105 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaaatg 100  T
Q  205 ttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaag 304  Q
    || |||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  101 ttaataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaag 200  T
Q  305 tgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |  |||| || | | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  201 t--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgtt 258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13817862 - 13817615
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13817862 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgtacatatgt 13817763  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  13817762 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 13817664  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13817663 atgggtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 13817615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 317405 - 317652
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  317405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 317504  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 312  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||    
T  317505 gatgaaattcgtgctctaagtatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaa 317602  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  317603 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctaaattggtgaattatgcattgttgtt 317652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 114 - 359
Target Start/End: Original strand, 16181842 - 16182085
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16181842 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 16181941  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||||    
T  16181942 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttaaattacatgttcaaagtgtatgaaa 16182040  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgt 359  Q
    || | ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  16182041 atgggtatgtg-tgaaaatatgccaaattggtgaattatgcattgt 16182085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 19570586 - 19570832
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19570586 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaatttttcatatgt 19570684  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  19570685 gatgaaatttgtgctctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 19570783  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19570784 atgagtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 19570832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 16995956 - 16996203
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16995956 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattattcataagt 16996055  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 312  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| ||    
T  16996056 ggtgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttacttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaa 16996153  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16996154 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 16996203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 22144167 - 22144416
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||      
T  22144167 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactttttgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaactgttcataac 22144266  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  22144267 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 22144365  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22144366 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaagtatgcattgttgtt 22144416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 114 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38528079 - 38527841
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  38528079 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaactatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 38527980  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  38527979 gatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 38527881  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 354  Q
    || | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38527880 atgggtatgtg-ggaaaatatgctcaattggtgaattatgc 38527841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 50111946 - 50112195
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  50111946 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 50112045  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  50112046 tgatgaaattcatgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 50112143  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50112144 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 50112195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 54424364 - 54424115
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt-aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  54424364 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 54424265  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga- 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||  ||||||     
T  54424264 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 54424167  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54424166 aaattgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 54424115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 360
Target Start/End: Original strand, 6154226 - 6154472
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6154226 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttctatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6154325  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    | ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  6154326 tcatgaaattcgtcctctaattataatgacatgtttagatgtatgaaattatgaatagttgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtttatgaa 6154424  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgtt 360  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6154425 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 6154472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 12349434 - 12349683
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||      
T  12349434 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgtccataaa 12349533  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  | |    
T  12349534 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtataaatttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtgag-a 12349632  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12349633 agttgttatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 12349683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14298773 - 14298524
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  14298773 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14298674  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  14298673 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-a 14298575  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
     || | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14298574 tatggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 14298524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14304400 - 14304151
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  14304400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14304301  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  14304300 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-a 14304202  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
     || | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14304201 tatggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 14304151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17101004 - 17100756
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  17101004 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17100906  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||    
T  17100905 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 17100808  T
Q  313 a-atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17100807 acatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 17100756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17101689 - 17101441
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  17101689 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17101591  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||    
T  17101590 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 17101493  T
Q  313 a-atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17101492 acatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 17101441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8632142 - 8631893
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  8632142 taaggtaagggggttaggattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattaattaattgttcttaag 8632043  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |  | |    
T  8632042 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtttgag-a 8631944  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    | | | ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  8631943 agttggtatatgttgaaaatatgcttatttagtgaattatgctttgttgtt 8631893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 34439237 - 34439487
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34439237 taaggtaaggagattagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 34439336  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttta-gatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||  ||||||||||| | | |    
T  34439337 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttatgaggtatgaagttatggataaatgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgt-a 34439435  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34439436 aaatgggtatgtgtttaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 34439487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 35124047 - 35123799
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  35124047 taaggtaaaggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35123948  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||    
T  35123947 tgatgaaattcgtactttaattatgatgacgtgtttggatgtatgaaattatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgtt-aaagtgtatgaa 35123849  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35123848 aa-gggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 35123799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17938925 - 17938677
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |    
T  17938925 taagataagggggttagggttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcttgag 17938826  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga- 311  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||  |||  |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||     
T  17938825 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttggatgtataaag-catggttaagcgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaa--gtatgag 17938729  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17938728 aagttgatatatgttgaaaatatgcttaattgatgaattatgctttgttgtt 17938677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14295790 - 14295541
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||      
T  14295790 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14295692  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |  |||    
T  14295691 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14295592  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14295591 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 14295541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14301417 - 14301168
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||      
T  14301417 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14301319  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |  |||    
T  14301318 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14301219  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14301218 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 14301168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 360
Target Start/End: Original strand, 17522780 - 17523030
Alignment:
Q  109 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 207  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17522780 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgagaagtgcttatttgggtgaattgattatttgttc 17522878  T
Q  208 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgt 307  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |    
T  17522879 ataaatgatgaacttcgtgctctaattatgatgacagttttggatgtatgaagatgtggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtat 17522978  T
Q  308 atgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgtt 360  Q
    |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17522979 aacaaaat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtt 17523030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 203 - 363
Target Start/End: Original strand, 53898440 - 53898599
Alignment:
Q  203 tgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaa 302  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||||    
T  53898440 tgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatctatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgcattaaatgttcaa 53898538  T
Q  303 agtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53898539 agtgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 53898599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7854428 - 7854306
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7854428 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaag 7854329  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  7854328 ggggttagttttcatcataatca 7854306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 173 - 362
Target Start/End: Original strand, 55440803 - 55440992
Alignment:
Q  173 ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataatt 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  55440803 ataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatt 55440902  T
Q  273 gaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgt 362  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  55440903 gaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatgagaaaat-gatatatgatgaaaatatgctcaactggttgaattatactatgttgt 55440992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3578440 - 3578192
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  3578440 taaggtaagcgggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtaggaataagtgcttaattgggtaaattgattaattgttcataa 3578342  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
     |||||| |||| | |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |  ||    
T  3578341 atgatgatattcattctctaattatgatgacatgttga-atgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgttcaaagtatgaga 3578243  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgt 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  3578242 aaatag-tatatgttgaaaatatgctcaactggttgaattacgctatgttgt 3578192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 11060902 - 11061150
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||      
T  11060902 taaggtaagggggttggaattcatcataatcataattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattaattatttgttaatgg 11060999  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| |  ||    
T  11061000 atgatgaaattcgtgctctaattatgatca-atttttaaatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagttgaatttcaggttcaaagtatgaga 11061098  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11061099 aaat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 11061150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2844637 - 2844515
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  2844637 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaag 2844538  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  2844537 ggggttagtttttatcataatca 2844515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3992996 - 3992874
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    |||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3992996 aagggttaaagaggagaggaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 3992897  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  3992896 ggggttagtttttatcataatca 3992874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 55513316 - 55513194
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  55513316 aagggttagagagaagaggagcttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 55513217  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  55513216 ggggttagtttttatcataatca 55513194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Original strand, 54037958 - 54038055
Alignment:
Q  48 aagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  54037958 aagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 54038055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 235 - 363
Target Start/End: Original strand, 6146763 - 6146890
Alignment:
Q  235 gtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  6146763 gtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgta-ttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatat 6146861  T
Q  335 gctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6146862 gctcaattggtgaatcatgcattgttgtt 6146890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 15857072 - 15857194
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  15857072 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgatgaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaag 15857171  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  15857172 ggggttagtcttcatcataatca 15857194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 218
Target Start/End: Original strand, 6146664 - 6146769
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6146664 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6146763  T
Q  213 tgatga 218  Q
    ||||||    
T  6146764 tgatga 6146769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 218 - 352
Target Start/End: Original strand, 19260839 - 19260972
Alignment:
Q  218 aaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aaaata 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||| |||||     
T  19260839 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaaaaatg 19260936  T
Q  317 gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattat 352  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19260937 ggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattat 19260972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19232205 - 19232090
Alignment:
Q  30 agagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggtta 129  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19232205 agagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggtta 19232106  T
Q  130 gtgttcatcataatca 145  Q
    || || ||| ||||||    
T  19232105 gtctttatcttaatca 19232090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Original strand, 14527975 - 14528110
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  14527975 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgttcataa 14528073  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14528074 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 14528110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 363
Target Start/End: Original strand, 11196291 - 11196456
Alignment:
Q  190 tgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctga 289  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  11196291 tgaattgattaattgttcatggatgatgaaatttgtgctctaataatgatgatatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 11196390  T
Q  290 attgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| |||||| |        |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  11196391 attttatgttga--------gaaaat-ggtatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgatttgttgtt 11196456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Original strand, 17955814 - 17955915
Alignment:
Q  48 aagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttg----agttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17955814 aagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataat 17955913  T
Q  144 ca 145  Q
    ||    
T  17955914 ca 17955915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 45582070 - 45581955
Alignment:
Q  30 agagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaa-gggggtt 128  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45582070 agagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggag-aaaaatgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggtt 45581972  T
Q  129 agtgttcatcataatca 145  Q
    ||| || ||||||||||    
T  45581971 agtttttatcataatca 45581955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 16743950 - 16744072
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  16743950 aagggttagagagaggaggagcttgaagaattcaaggatttggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaac 16744049  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    | ||||||| || | ||||||||    
T  16744050 gaggttagtctttaccataatca 16744072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 11328859 - 11329105
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  11328859 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttca 11328956  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgta 308  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||||||||     || || ||||| | ||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |     
T  11328957 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgt-----tgcataaagttgttaataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 11329051  T
Q  309 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
     |||| | | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  11329052 agaaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 11329105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17205081 - 17204863
Alignment:
Q  68 aatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaatttt-caatt 163  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||    
T  17205081 aatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattccatcataatcattttagtgtaatttttcaatt 17204982  T
Q  164 atttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt 262  Q
     |  ||| ||  |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    
T  17204981 gtg-gtacgaacaagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaatt 17204884  T
Q  263 atgaataattgaattgttgtt 283  Q
     |  ||||| |||||||||||    
T  17204883 gttgataatcgaattgttgtt 17204863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17139861 - 17139611
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||    
T  17139861 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattcttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaagtgttcat 17139764  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtat 309  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||| |   |||||||||||||||| |   ||||  ||||||||| | |      
T  17139763 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaactatga 17139664  T
Q  310 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  17139663 gaaaat-ggtatatgttg-aaatatgctcaattggttgaatcatgctatgttgtt 17139611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 363
Target Start/End: Original strand, 14059112 - 14059357
Alignment:
Q  118 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtg 214  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||   ||    
T  14059112 gtaagggggttataattcatcataatcattttagtgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgact-aattgactaattgttcatgattg 14059209  T
Q  215 atgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa 314  Q
     |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||   ||||  ||||||||||| |  |||||    
T  14059210 ttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgtttttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaa 14059309  T
Q  315 tagatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    | || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  14059310 t-gacatatgttg-aaatatgctcaatttgatgaattatgctatgttgtt 14059357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191723
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 168  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||  ||||||||| ||||| || |    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcacaatcattttagtgtaatttttcaattgtt-g 17191838  T
Q  169 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 267  Q
    |||||  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |    
T  17191837 tatgaacaattgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttga 17191739  T
Q  268 taattgaattgttgtt 283  Q
    |||| |||||||||||    
T  17191738 taatcgaattgttgtt 17191723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 28558610 - 28558550
Alignment:
Q  30 agagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagc 90  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28558610 agagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaattgaagc 28558550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15876341 - 15876250
Alignment:
Q  192 aattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||| ||| |  |||| ||||||||||||    
T  15876341 aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgataatatgtttaaatgcatgatgttgttgataactgaattgttgtt 15876250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 283
Target Start/End: Original strand, 3576298 - 3576503
Alignment:
Q  81 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ata 175  Q
    ||||||||||||| | ||  | || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| | |||    
T  3576298 aaagtgaagcttgggctaggaatttgtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaatt-gttgtacgaata 3576396  T
Q  176 agtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaa 275  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||||| |  || |  ||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||    
T  3576397 agtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttcaaagttgttataattcgtactctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaa 3576495  T
Q  276 ttgttgtt 283  Q
    ||||||||    
T  3576496 ttgttgtt 3576503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 12560131 - 12560380
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  12560131 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcatttattgcaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcata 12560228  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||  ||| ||  |||  |||||||||  ||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  12560229 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgattgaatgcttgaagttattgatacttgaatttttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 12560328  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  12560329 aaagt-ggtatatg-tgaaaatatgcccaactggttgaattatgctatgttgtt 12560380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 240
Target Start/End: Original strand, 13301323 - 13301491
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtat 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||||  |||  ||||||    
T  13301323 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtgatttttcatttgttgtat 13301422  T
Q  172 ga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatg 240  Q
    || |||||||||||||| || || |||||| | |||| ||  || |||| |||||||||||||| |||||    
T  13301423 gattaagtgcttaattgaat-aagtgattattggttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatg 13301491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 240
Target Start/End: Original strand, 13311979 - 13312147
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtat 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||||  |||  ||||||    
T  13311979 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtgatttttcatttgttgtat 13312078  T
Q  172 ga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatg 240  Q
    || |||||||||||||| || || |||||| | |||| ||  || |||| |||||||||||||| |||||    
T  13312079 gattaagtgcttaattgaat-aagtgattattggttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatg 13312147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16880477 - 16880226
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  16880477 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaacaagtgtttaattgagt-aattgattaattgttca 16880380  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgta 308  Q
    ||  || |  ||||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||| | |||||| |  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |     
T  16880379 taattgtttgaattcgtgctccaattacgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatg 16880280  T
Q  309 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtg-aattatgctttgttgtt 363  Q
     |||| | | |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  16880279 agaaagt-ggtatatgtt-agaatatgctcaatttgtgaaattatgctatgttgtt 16880226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 150
Target Start/End: Original strand, 38810868 - 38810945
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 150  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  38810868 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttt 38810945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15550986 - 15550919
Alignment:
Q  81 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 148  Q
    ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15550986 aaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatcactt 15550919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 39656817 - 39656629
Alignment:
Q  173 ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataatt 272  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  || | |||| ||||||| |||| |||||  ||||||  || |||||| ||    ||||||    
T  39656817 ataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaatccgtgctccaattatgatgttatgtttgaatttatgaaattggtgataatt 39656719  T
Q  273 gaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  39656718 gaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 39656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Original strand, 11882113 - 11882240
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || || |||||| |||||| ||     
T  11882113 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaacttttaatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcttag 11882211  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatg 240  Q
     || |||| ||| |||||||||| |||||    
T  11882212 atgttgaatttcatgctctaattatgatg 11882240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 283
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784831
Alignment:
Q  219 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgtt 47784831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12031904 - 12031849
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggtt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12031904 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggtt 12031849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 187
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961106
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 51961106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15517921 - 15517848
Alignment:
Q  174 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15517921 taagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcataaatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgttt 15517848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Original strand, 33368822 - 33368957
Alignment:
Q  115 aaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  33368822 aaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaattttca-ttaattgcatgattaagtgcttatttgaat-aattaattatttgttcata 33368919  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
      || ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  33368920 gttgttgaaattcgtgctttaattgtggtgatatgttt 33368957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Original strand, 9590648 - 9590784
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  9590648 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaaattgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtggttaattgttcata 9590746  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
      || | |||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  9590747 gttgttaaaatccgtgctctaactatgatgatatgttt 9590784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 25875816 - 25876063
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25875816 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataagt 25875915  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  25875916 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 25876014  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25876015 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 25876063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 23836601 - 23836849
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  23836601 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgaatgataagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataagt 23836700  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  23836701 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattg-tgttagtggaattacatgttcaaagtgtatgaaa 23836799  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23836800 atgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 23836849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 114 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32466207 - 32465964
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32466207 taaggtaagggg-ttagtcttcatcataatcacttttgaaaattttaattatttgtacgataagtgcttatttgaatgaattgattaattgttcatatgt 32466109  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||    
T  32466108 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaa 32466011  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgtt 360  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32466010 aatggatatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 32465964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 36890581 - 36890829
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||      
T  36890581 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgttattttcaattatg-gtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 36890679  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |  |||    
T  36890680 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatggcatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 36890779  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36890780 aatgga-atatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctatgttgtt 36890829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 271521 - 271273
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||      
T  271521 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattattcataaa 271423  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  271422 tgaagaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-a 271324  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  271323 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgtt 271273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 4448028 - 4448277
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||      
T  4448028 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttatatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataaa 4448127  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  4448128 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-a 4448226  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | | | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4448227 aatgggtttgtgttgaaaatatgttcaattggtgaatgatgctttgttgtt 4448277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25602377 - 25602135
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  25602377 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatg 25602279  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  |||||    
T  25602278 gatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatg 25602181  T
Q  311 a-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 355  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25602180 agaaattgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgagttatgct 25602135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28974400 - 28974152
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  28974400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattatttcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 28974302  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |  |||    
T  28974301 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgagaa 28974202  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  28974201 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcatttggcgaattatgctatgttgtt 28974152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27262156 - 27261915
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27262156 taaggtaagggagttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatg 27262058  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||  |||||    
T  27262057 gatgatgaaatttgtgccctaattatgatgacatgtttggatgtataaagttatggataattgaattgttgttagttcaattacatgttcaaa--gtatg 27261960  T
Q  311 a-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 355  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27261959 agaaattggtatatgttgaaaatatgctc-attggtgaattatgct 27261915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 19794538 - 19794660
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19794538 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 19794637  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  19794638 ggggttagtcttcatcataatca 19794660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 360
Target Start/End: Original strand, 24571188 - 24571433
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaat-tttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  24571188 taaggttagggggttagaattcatcataatcattattgcaatgtttcaattatt-gtatgaataaatgcttaattgggt-aattgattaattgttcatag 24571285  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||   ||||  |||||||| || |  ||    
T  24571286 atgatgaaattcgtgctctaattttgatgacacgtttgaatgcatgaagttgtggatacttgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaggtatgaga 24571385  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgtt 360  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24571386 aaat-gatatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgctatgtt 24571433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 22579758 - 22580006
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  22579758 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 22579855  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
     || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   || | |||| |||| || |  ||    
T  22579856 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatgtatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaactttatgatcaaggtatgaga 22579954  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||  | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22579955 aaaatgttatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgctttgttgtt 22580006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 20627162 - 20627269
Alignment:
Q  38 gagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcat 137  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  20627162 gagaagcttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttat 20627261  T
Q  138 cataatca 145  Q
    ||||||||    
T  20627262 cataatca 20627269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22284404 - 22284279
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaa---cttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggt 119  Q
    ||||||||||| ||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22284404 aagggttagagagaagagagagagcttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggt 22284305  T
Q  120 aagggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    
T  22284304 aagggggttagtctttatcataatca 22284279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22275143 - 22275046
Alignment:
Q  48 aagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22275143 aagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatca 22275046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Original strand, 43642809 - 43642912
Alignment:
Q  42 aacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcata 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  43642809 aacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcata 43642908  T
Q  142 atca 145  Q
    ||||    
T  43642909 atca 43642912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15633621 - 15633535
Alignment:
Q  62 ttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  15633621 ttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatcactt 15633535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 68351 - 68095
Alignment:
Q  109 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaatt 203  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  68351 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataaattttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaatagattaatt 68254  T
Q  204 gttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaa 303  Q
    |||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |   ||||  |||||||||    
T  68253 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 68154  T
Q  304 gtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || |  |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  68153 gtatgagaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 68095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Original strand, 31146073 - 31146317
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||    
T  31146073 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatcttttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaataagtgcttaactgagt-aattgattaattgtcca 31146171  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgta 308  Q
    ||  || |  |||||||| || |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |     
T  31146172 taattgttagaattcgtgttccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatg 31146271  T
Q  309 tgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgct 355  Q
     |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31146272 agaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgct 31146317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660098
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgta 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||  |||  |||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaa-ggggttagaattcatcataatcactttagtgtaatttttcatttgttgta 19660175  T
Q  171 tga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtt 247  Q
    ||| |||||| |||| ||||  || |||||| |||||| ||  || |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  19660174 tgattaagtgtttaa-tggaataagtgattatttgttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatgatatgtt 19660098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 43646289 - 43645996
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt---tgtaattttcaattatttg 168  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||   ||||| |||| | |  |||    
T  43646289 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcagtcataatcatttttagtgtaaatttccaattgttg 43646190  T
Q  169 tatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 267  Q
    |||| ||||||| |||||| ||  || |||||||||||||| |  || |  |||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  43646189 tatgaataagtgtttaatt-gagtaaatgattaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttga 43646091  T
Q  268 taattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||| ||||||||| |   ||||  ||||| ||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  43646090 taattggattgttgttggtgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 43645996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25305818 - 25305634
Alignment:
Q  81 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatg-ata 175  Q
    ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  | ||||||| |||||  ||||||| |||    
T  25305818 aaagtgaagcttgggctatgaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtataattttacaatt-gttgtatgaata 25305720  T
Q  176 agtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt 262  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||||| |  || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  25305719 agtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtt 25305634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19666921 - 19666761
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgta 170  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||    
T  19666921 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgta 19666823  T
Q  171 tg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaa 232  Q
    || |||| |||||||||| || || ||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||    
T  19666822 tgaataaatgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcatgctctaa 19666761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 23821534 - 23821704
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  23821534 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23821631  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
      || | ||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||| | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  23821632 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgtt 23821704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 23830613 - 23830783
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  23830613 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23830710  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
      || | ||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||| | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  23830711 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgtt 23830783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 722742 - 722531
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||  || ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||     
T  722742 taaggtaaaggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttgcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataa 722645  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
     || | |||||||||||| |||| ||||   ||||||  ||||||||| ||    |||||||| |||||||| |   ||||| ||| ||||||| |||||    
T  722644 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatattatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatga 722545  T
Q  312 aaatagatatatgtt 326  Q
    |||| ||||||||||    
T  722544 aaat-gatatatgtt 722531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Original strand, 19669003 - 19669101
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  19669003 taaggtaacggggttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aaatgattaattgttcat 19669100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6879601 - 6879543
Alignment:
Q  301 aaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgtt 360  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  6879601 aaagtgtatgaaaatgggtatgtgt-gaaaatatactcaattggtgaattatgcattgtt 6879543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 216 - 8
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  216 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaataatcattggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 117  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  116 ggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaatt 17  T
Q  223 cgtgctcta 231  Q
    |||||||||    
T  16 cgtgctcta 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 37612020 - 37611771
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  37612020 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataag 37611921  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  37611920 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 37611822  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37611821 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 37611771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 22234700 - 22234947
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22234700 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgaatgaattgattaattgttcataagt 22234799  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  22234800 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacgtgtttagatgtatgaagttatgaataatttaattg-tgttagttgaattacatgctcaaagtgtatgaaa 22234898  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22234899 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 22234947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 20573087 - 20573336
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20573087 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20573186  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  20573187 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 20573286  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20573287 aa-gggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatcctttgttgtt 20573336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 19992952 - 19993198
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19992952 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttttgtaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 19993050  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  19993051 gatgaaatccgtactctaattatgatgacatgtttagatgtacgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacttgttcaaagtgtatgaaa 19993149  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19993150 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 19993198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20481955 - 20481708
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||       
T  20481955 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaat-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgttcatgga 20481858  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  20481857 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 20481760  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20481759 aaatggatatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatactttgttgtt 20481708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41247009 - 41246761
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  41247009 taaggtaagggggttagagttcatcataatcacttattgtaattttcaattagttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataaa 41246910  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt-gtatga 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||  ||||| ||||| | |  |    
T  41246909 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaattgttgttggttgaattacatgttaaaagtagga--a 41246812  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41246811 aaatgggtatatgatg-aaatatgcttaattggtgaattatgcattgttgtt 41246761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 20561526 - 20561775
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20561526 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20561625  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga- 311  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||     
T  20561626 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 20561723  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  20561724 aaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgtt 20561775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25122793 - 25122626
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25122793 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 25122694  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttg 281  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25122693 gatcaaattcgtgctccaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttg 25122626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 24716671 - 24716793
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24716671 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaag 24716770  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  24716771 ggggttagtctttatcataatca 24716793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39115721 - 39115599
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39115721 aagggttacagagaagagaaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaag 39115622  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    || |||||| |||||||||||||    
T  39115621 ggtgttagttttcatcataatca 39115599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 16404809 - 16404931
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16404809 aagggttagagagaataggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 16404908  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  16404909 ggggttagtcttcatcataatca 16404931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 218
Target Start/End: Original strand, 7000524 - 7000624
Alignment:
Q  118 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7000524 gtaagggggttagttttcatcataatcacttttttaattttcaattatttgtatgataagtgcttaataggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 7000623  T
Q  218 a 218  Q
    |    
T  7000624 a 7000624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21681356 - 21681105
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21681356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaatttgttgaattgattaattgttcata 21681258  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||| |  |    
T  21681257 aatgataaaattcgtgatctaattatgatgacatatttgaatgtataagtttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgtttaaagtatgag 21681158  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    | ||  | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21681157 agaa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatgctttgttgtt 21681105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 274889 - 274767
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  274889 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaaatgtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 274790  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  274789 ggggttagtttttatcataatca 274767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 640960 - 641082
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  640960 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaaatgtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 641059  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  641060 ggggttagtttttatcataatca 641082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 826766 - 826888
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  826766 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaaatgtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 826865  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  826866 ggggttagtttttatcataatca 826888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 363
Target Start/End: Original strand, 21198005 - 21198296
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgt 169  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||    
T  21198005 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcattataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gt 21198103  T
Q  170 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 268  Q
    ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||    
T  21198104 atgattaagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagat 21198202  T
Q  269 aattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||||||| |   ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  21198203 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgttatgttgtt 21198296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23837643 - 23837301
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaaga-atcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaa 121  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||  |||||||| ||| ||||||  |||||||| |||| | ||  | | |||||||||||||||||    
T  23837643 aagggttagagagaagagtagcttgaaga-ttcaagaatttgaagagatcctaggagataaagtgaaccttgggctaggaatcggtgataattaaggtaa 23837545  T
Q  122 gggggttagtgttca-tcataatcacttttgta---attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgat 216  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| |||  ||   |||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  ||||    
T  23837544 gggggttagaattcaatcataatcattttaatatagattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagatgat 23837447  T
Q  217 gaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaata 316  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||    ||||  ||||||||||| |  |||| |     
T  23837446 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttattgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt- 23837348  T
Q  317 gatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  23837347 gatatatgttg-aactatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 23837301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17285600 - 17285386
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactttt-gt---aattttcaattattt 167  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||    
T  17285600 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaaattttcaatt-gtt 17285502  T
Q  168 gtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatga 266  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |      
T  17285501 gtatgattaagtgcttaattgaat-aattgaataattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttg 17285403  T
Q  267 ataattgaattgttgtt 283  Q
    |||||||||||||||||    
T  17285402 ataattgaattgttgtt 17285386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 208
Target Start/End: Original strand, 20529748 - 20529843
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20529748 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 20529843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22981622 - 22981376
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  22981622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatt--ttgtatgaataagtgcttaattgggt-aattgattaattgttcaga 22981526  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  22981525 tg--atgaaatttgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 22981428  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  22981427 aaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 22981376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 39446660 - 39446910
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  39446660 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 39446757  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtat 309  Q
    |  || |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||  ||||    
T  39446758 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaa--gtat 39446855  T
Q  310 gaa-aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| ||  | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  39446856 gaagaagtgttatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgctatgttgtt 39446910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 355
Target Start/End: Original strand, 20653944 - 20654041
Alignment:
Q  257 gaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 355  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20653944 gaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgagaaattggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgct 20654041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33528819 - 33528562
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 170  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  33528819 taggagctaaagtgaagtttgagctaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 33528720  T
Q  171 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaata 269  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||||||||||| ||  || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||    
T  33528719 tgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcttagatgttgaattccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgata 33528621  T
Q  270 attgaattgttgttagctg-aattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 329  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33528620 attgaattgttgtt-gatgaaattgtatcttcttagtatatgaaaat-gatatatgttgaa 33528562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29306813 - 29306520
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag-ggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttg 168  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||  | || ||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  |||    
T  29306813 taggagctaaactgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagaggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttg 29306714  T
Q  169 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 267  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||  || | | ||||||||||||| | |||||| |||||   ||| ||||| |||   |    
T  29306713 tatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattgattgttcatagatgttaatattcgtgctctaactatgatgatatgttctaatgcatgaaattagtga 29306615  T
Q  268 taattgaattgttgttagctgaatt-gtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||    
T  29306614 taattgaattgttgttgg-tgaatttgtatgttcaaagtttgtgaaaat-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgtt 29306520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5855007 - 5854766
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgt 169  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| || |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||    
T  5855007 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattg-tgctaattaaggtaaggaggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gt 5854910  T
Q  170 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 268  Q
    ||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||    
T  5854909 atgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggcgat 5854811  T
Q  269 aattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||| |   ||| | ||||||||||| |||||||    
T  5854810 aattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaagtatatgaaa 5854766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15933655 - 15933458
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgtt-catcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  15933655 taattaaggtaagggggttagaattaaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 15933558  T
Q  206 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    |||||  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  15933557 tcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 15933458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Original strand, 31194127 - 31194340
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaat-agttggtgataattaaggtaa 121  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||  |  ||| ||||||||    
T  31194127 aagggttagagagaagaagaacttgagga-ttcaaagatttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttaagctagtgaattaat-ctaactaaggtaa 31194224  T
Q  122 gggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgat 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||   || |    
T  31194225 gggggttagttttcatcataatcatttttagtgcaaattttcaatt-gttgtatgaataattgcttaatt-gagtaattgattaattgttcatgattgtt 31194322  T
Q  217 gaaattcgtgctctaatt 234  Q
      ||||||||||||||||    
T  31194323 agaattcgtgctctaatt 31194340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 363
Target Start/End: Original strand, 20647882 - 20647973
Alignment:
Q  271 ttgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||| |||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  20647882 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgagaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgtt 20647973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26011888 - 26011676
Alignment:
Q  69 atcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattat 165  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | ||  | ||| || ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  26011888 atcataggaggtaaagtgaagcttgggctaggaattg-tgctaattaaggtaagggggtta---ttcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattat 26011793  T
Q  166 ttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttat 264  Q
    | ||||||| ||||| |||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||      
T  26011792 t-gtatgattaagtgtttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgg 26011695  T
Q  265 gaataattgaattgttgtt 283  Q
      |||||||||||||||||    
T  26011694 tgataattgaattgttgtt 26011676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22743122 - 22743001
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  22743122 taattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgt 22743024  T
Q  206 tcatatgtgatgaaattcgtgct 228  Q
    |||||  || |||||||||||||    
T  22743023 tcatagttgttgaaattcgtgct 22743001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 248
Target Start/End: Original strand, 27233047 - 27233120
Alignment:
Q  174 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27233047 taagtgcttaattgaat-aagtgattattagttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttt 27233120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25296426 - 25296295
Alignment:
Q  197 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtat 296  Q
    ||||||||||||||  || | |||||||||| |||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||| |||| |   ||||| ||    
T  25296426 attaattgttcatacatgttaaaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcat 25296327  T
Q  297 gttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 329  Q
    ||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  25296326 gttcaaagcttgtgaaaat-gatatatgttgaa 25296295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25758446 - 25758315
Alignment:
Q  197 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtat 296  Q
    ||||||||||||||  || | |||||||||| |||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||| |||| |   ||||| ||    
T  25758446 attaattgttcatacatgttaaaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcat 25758347  T
Q  297 gttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 329  Q
    ||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  25758346 gttcaaagcttttgaaaat-gatatatgttgaa 25758315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 38533922 - 38533752
Alignment:
Q  192 aattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaat 291  Q
    |||||| ||||||||||||  || |  ||||||| ||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||    
T  38533922 aattgactaattgttcataattgttagaattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaat 38533823  T
Q  292 tgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
       ||||||||||| |  |||||| | ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  38533822 ctcatgttcaaagtatgagaaaat-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattattgaattatgctatgttgtt 38533752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15224 - 14977
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatatgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 15125  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||  |||||||||||||||||||    
T  15124 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttagattacatgttcaaagtgtatgaaa 15026  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15025 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 14977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 44347177 - 44346930
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44347177 taaggtaagggagttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 44347078  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  44347077 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtaagaaa 44346979  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44346978 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgtt 44346930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 53704629 - 53704877
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53704629 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 53704728  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |    
T  53704729 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaa 53704826  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  53704827 aaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatggttgtt 53704877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 55376494 - 55376741
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55376494 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttttgaaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 55376593  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  55376594 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttctaa--gtatgaaa 55376691  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  55376692 aatgggtatgtg-tgaaaatatactcaattggtgaattatacattgttgtt 55376741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 23269829 - 23270078
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23269829 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 23269928  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  23269929 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 23270027  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23270028 aatgggtatgtgttgaaaatatactcaattgatgaattatgcattgttgtt 23270078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 118 - 363
Target Start/End: Original strand, 8872372 - 8872615
Alignment:
Q  118 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8872372 gtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtg 8872471  T
Q  218 aaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aaaata 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||     
T  8872472 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagctatgaatgattgaagtgttgttagttgaattgtatgttcaaa--gtatgaaaaatg 8872569  T
Q  317 gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8872570 ggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcgttgttgtt 8872615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34395609 - 34395360
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||      
T  34395609 taaggtaagggggttagaattcatcattatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaactgattaattgttcataaa 34395510  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  34395509 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtaatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 34395411  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34395410 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 34395360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 44056266 - 44056018
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44056266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 44056167  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  44056166 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat-tttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 44056070  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44056069 aaatgaatatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgtt 44056018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 30458255 - 30458006
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  30458255 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttgaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 30458156  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||| | | ||    
T  30458155 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatggataattaaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgt-aa 30458057  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30458056 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattacgcattgttgtt 30458006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 53907604 - 53907843
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  53907604 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtagttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggat--------taattgttcatatgt 53907695  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||  ||||| ||    
T  53907696 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttattagttggattgtatgttcaaa--gtatgaaa 53907793  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53907794 aatgggtatgtg-tgaaaatatgcccaattggtgaattatgcattgttgtt 53907843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 12837096 - 12837344
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  12837096 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgaatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 12837194  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga- 311  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||     
T  12837195 tgatgatattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 12837292  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12837293 aaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 12837344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16732520 - 16732272
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttc-aattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  16732520 taaggtaaagaggttagaattcatcataatcattattgcaattttttaattagt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 16732422  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||     
T  16732421 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgag 16732324  T
Q  313 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16732323 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 16732272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 305
Target Start/End: Original strand, 20813442 - 20813634
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20813442 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttaaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20813541  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  20813542 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagt 20813634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 21959359 - 21959607
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||      
T  21959359 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattaattgattgttcataaa 21959458  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||  ||  |||||  ||||| |    
T  21959459 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttaaatgtatgaagttatggatatttgaattgttgttgattgaattacat-ctcaaa--gtatgaa 21959555  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21959556 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 21959607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 819826 - 819996
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  819826 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 819925  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  819926 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 819996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 133 - 363
Target Start/End: Original strand, 45458769 - 45458999
Alignment:
Q  133 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 231  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45458769 ttcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataagtgatgaaatttgtgctcta 45458868  T
Q  232 attgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaa 331  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| | |  |||  | | |||||||| || |    
T  45458869 attatgatgacatgtttagatgtatgaagtgatagataattgaattgttgttagttgaattacatgctcaaaatatgagaagtttg-tatatgttaaaga 45458967  T
Q  332 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  45458968 tatgttcaattggtgaattatgctttgctgtt 45458999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 54118077 - 54118199
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  54118077 aagggttagagagaagagaaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 54118176  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  54118177 ggggttagtcttcatcataatca 54118199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 5682337 - 5682459
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5682337 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaag 5682436  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
     |||||||| || ||||||||||    
T  5682437 tgggttagtttttatcataatca 5682459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 25119020 - 25119138
Alignment:
Q  27 gttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaaggggg 126  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25119020 gttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggag 25119119  T
Q  127 ttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  25119120 ttagtttttatcataatca 25119138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 52265403 - 52265652
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  52265403 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgtttaattgggt-aattgattaattgttcata 52265500  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |  |    
T  52265501 gatgatgaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgag 52265600  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  52265601 aaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgcaatgttgtt 52265652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27961324 - 27961131
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  27961324 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattgttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 27961227  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    |  || |  ||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  27961226 aattgttagaatccgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttatgaataattgaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagt 27961131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 30232391 - 30232640
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  30232391 taaggtaagagggttagaattcatcataatcacttattgcaattttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcat 30232488  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtat 309  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| |   || |  ||| ||||||| | |    
T  30232489 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgt 30232587  T
Q  310 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||  |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30232588 gaaaagtgggttatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 30232640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 329
Target Start/End: Original strand, 7185735 - 7185954
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 207  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  7185735 taattaaggtaaggaggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttc 7185833  T
Q  208 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgt 307  Q
    |||  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||| |    
T  7185834 atagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtat 7185933  T
Q  308 atgaaaatagatatatgttgaa 329  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  7185934 gtgaaaat-gatatatgttgaa 7185954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 18494224 - 18494392
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||  | ||||||| |||||||||||     
T  18494224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatg-gtatgaataggtgcttaattgtgt-aattgatcaattgttcataa 18494321  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
     || |  ||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18494322 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgttcgtatgtatgaagttatg-ataattgaattgttgtt 18494392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 13809405 - 13809654
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  13809405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcata 13809502  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctga-attgtatgttcaaagtgtat 309  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |   |||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||| |      
T  13809503 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgtt-ggtgagatttcatgttcaaagtatga 13809601  T
Q  310 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  13809602 gaaaat-ggtatatgttg-aaatatgctcaattagttgaattatgctatgttgtt 13809654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15045181 - 15044931
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  15045181 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 15045084  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtat 309  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |   ||||  ||||||||||| |      
T  15045083 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15044984  T
Q  310 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  15044983 gaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgtt 15044931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Original strand, 15013137 - 15013347
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgt 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||| || ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||||| || || ||    
T  15013137 taggagctaaagtgaagcttgagctaggatttg-tgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaattttcatttgtt-gt 15013234  T
Q  170 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaa 267  Q
    ||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| || ||| |    
T  15013235 atgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgtttaaattcgtgctctaattatgatgatatgttga-atgcatgaaattgatg-a 15013331  T
Q  268 taattgaattgttgtt 283  Q
    ||||||||||||||||    
T  15013332 taattgaattgttgtt 15013347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 247
Target Start/End: Original strand, 41256263 - 41256399
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  41256263 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 41256361  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtt 247  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41256362 agttgttgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtt 41256399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 363
Target Start/End: Original strand, 47535042 - 47535209
Alignment:
Q  195 tgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgt 294  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| |   ||||      
T  47535042 tgattaattgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 47535141  T
Q  295 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    | ||||||||| |  |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  47535142 aagttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgatgaattatgctatgttgtt 47535209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 150
Target Start/End: Original strand, 41165808 - 41165885
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 150  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  41165808 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggggttagaattcatcataatcattttt 41165885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Original strand, 820016 - 820060
Alignment:
Q  319 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  820016 tatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 820060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14901584 - 14901437
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14901584 taaggtaagggggttaaatttcatcataatcattttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcat 14901487  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaa 259  Q
    || || |  |||||||||||||||| |||  | ||||||  |||||||||    
T  14901486 atttgttataattcgtgctctaattatgacaatatgtttgaatgtatgaa 14901437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Original strand, 7964606 - 7964742
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || ||| ||||||||||||    
T  7964606 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgttcata 7964704  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
      || | |||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  7964705 gttgttaaaatccgtgctctaattatgatgatatgttt 7964742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 130
Target Start/End: Original strand, 47534933 - 47534990
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttag 130  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47534933 taggagctaaagtgaagcttgggcgaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 47534990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 11548 - 11798
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11548 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 11647  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||    
T  11648 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttcttggttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 11747  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11748 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgcattgttgtt 11798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1667 - 1420
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||      
T  1667 taaggcaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatt--caattatttgtatgaaaagtggttaattgaatgaattgattaattgtgtataaa 1570  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  1569 tgatgaaattcgtgctctaatcatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttggtggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 1472  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1471 aaatgggtatgtgatgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgtt 1420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 22403005 - 22403254
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22403005 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 22403104  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  22403105 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtctagatgtatgaagttatgaataattaaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 22403203  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22403204 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 22403254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 121 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41212415 - 41212175
Alignment:
Q  121 agggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaa 220  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41212415 agggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaa 41212316  T
Q  221 ttcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aaaatagat 319  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||| | |    
T  41212315 ttcgtgctctaattatgatgacctgtttagaggtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaactgtatgttcaaa--gtatgaaaaatgggt 41212218  T
Q  320 atatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  41212217 atgtg-taaaaatatgctcaattagtgaattatgcactgttgtt 41212175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 49968002 - 49967753
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  49968002 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcacttattgtaattttcaattatttgcatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcaaaaa 49967903  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||  ||    
T  49967902 tcatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaattata-aaa 49967804  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  49967803 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgtt 49967753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 9783959 - 9784208
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  9783959 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttactgcaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgataaattgttcataag 9784058  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||  ||||     
T  9784059 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagt--atgag 9784156  T
Q  313 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9784157 aagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgtt 9784208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35055108 - 35054867
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta-attttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||      
T  35055108 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttatttctattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattggttaattgttcataaa 35055009  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  35055008 tgatttaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 35054911  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 355  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35054910 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 35054867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 155 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21718537 - 21718331
Alignment:
Q  155 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgt 254  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21718537 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatggatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgt 21718439  T
Q  255 atgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 353  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||| |||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21718438 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgagaaattggtatgtgttcaaaatatgctcaattggtgaattatg 21718341  T
Q  354 ctttgttgtt 363  Q
    || |||||||    
T  21718340 ctatgttgtt 21718331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 292
Target Start/End: Original strand, 35522247 - 35522426
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  35522247 taaggtaagggagttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagggcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35522346  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaatt 292  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35522347 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatt 35522426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41218851 - 41218729
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41218851 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaag 41218752  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| |||||||| ||||    
T  41218751 ggggttagttttcatcatgatca 41218729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21860457 - 21860335
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21860457 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 21860358  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  21860357 ggggttagtttttatcataatca 21860335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 44034780 - 44034902
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44034780 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagagtttgaagaattataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 44034879  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  44034880 ggggttagtttttatcataatca 44034902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41394650 - 41394528
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  41394650 aagggttagagagaggaggagcttgaagaattcaagggtttggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 41394551  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  41394550 ggggttagtctttatcataatca 41394528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 282
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376923
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 168  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-g 13376809  T
Q  169 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 267  Q
    |||||| ||||||||||||   | |||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  13376810 tatgattaagtgcttaatttagt-aattgattaattgttcatagatgatgagaatcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttga 13376908  T
Q  268 taattgaattgttgt 282  Q
    ||||| |||||||||    
T  13376909 taattaaattgttgt 13376923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20177570 - 20177278
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttg 168  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||    
T  20177570 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaatta-ttg 20177472  T
Q  169 tatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 267  Q
    ||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| | |||||| |  |    
T  20177471 tatgtttaagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttga 20177373  T
Q  268 taattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||||||||||||| |   ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  20177372 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 20177278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19603449 - 19603238
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  19603449 taaggtaagggggctagaattcatcataatca-tttagtgcaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 19603353  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtat 309  Q
    |  || | |||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||||||||| ||    |||||||| |||||||| |   ||||| ||| ||||||| |||    
T  19603352 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatat 19603253  T
Q  310 gaaaatagatatatgt 325  Q
    |||||| |||||||||    
T  19603252 gaaaat-gatatatgt 19603238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 363
Target Start/End: Original strand, 27329757 - 27329899
Alignment:
Q  219 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaataga 318  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| |   || |  ||| ||||||| | ||||||  |     
T  27329757 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgtgaaaagtgg 27329855  T
Q  319 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27329856 gttatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 27329899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 22143256 - 22143426
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22143256 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 22143352  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    |  || | ||||||||||||||| | ||||||  |||||  ||| ||||| ||    |||||||||||||||||    
T  22143353 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgtt 22143426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16656992 - 16656820
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  16656992 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16656895  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| || ||||| |  |||||||||||||||||    
T  16656894 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgtt 16656820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21195408 - 21195164
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgt 169  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| || ||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||    
T  21195408 taggagctaaagtgaagcttgggctaggatttg-tgctaactaaggtaaggggtttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgt 21195310  T
Q  170 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 268  Q
    ||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||| ||    ||    
T  21195309 atgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgat 21195211  T
Q  269 aattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaat 315  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  21195210 aattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaat 21195164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16646266 - 16646094
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  16646266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttca 16646169  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||| ||||| ||||    
T  16646168 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataatttaattgatgtt 16646094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17609322 - 17609080
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgt 169  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  17609322 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgt 17609224  T
Q  170 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 268  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |||||| ||| |||||  || |  |||||||||||||||| |||||| || |||  ||| ||||| ||    ||    
T  17609223 atgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattagttgatcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgat 17609125  T
Q  269 aattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||| ||||||||| |   ||||| ||||||||||| |||||||    
T  17609124 aattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaa 17609080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 362
Target Start/End: Original strand, 37233750 - 37234003
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | || ||| |||||||    
T  37233750 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtattattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgt 37233847  T
Q  206 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    | |||  || |  |||||||||| || || |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  37233848 taatagttgttagaattcgtgctttagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcaaagt 37233947  T
Q  306 gtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgt 362  Q
     ||||||| | ||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  37233948 atatgaaagt-gatatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgt 37234003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675120
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatc 144  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatc 27675120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 332 - 363
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522463
Alignment:
Q  332 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 35522463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 8537803 - 8537975
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||    
T  8537803 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8537901  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
       || ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  8537902 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 8537975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 8603042 - 8603214
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||    
T  8603042 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8603140  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
       || ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  8603141 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 8603214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 5143 - 5390
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5143 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttctaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 5242  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  5243 gatgaaattcgtgctcttattatgatgagatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 5341  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5342 ataggtatgtg-cgaaaatatgctcaattggtgaattaggcattgttgtt 5390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 8776 - 9026
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8776 taaggtaagggggttagagttcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggaaaattgattaattgttcata 8874  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |  |    
T  8875 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 8974  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8975 aaaat-gatatatgttg-atatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 9026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 254710 - 254958
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  254710 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 254808  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  254809 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttg-tagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 254907  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  254908 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 254958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 261316 - 261564
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  261316 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 261414  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  261415 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtag-tagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 261513  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  261514 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 261564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4635 - 4388
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4635 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacgtttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 4536  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  4535 gatgaaattcgtgctctaattataatgacatgtttagatgtatcaaattatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 4437  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | ||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4436 atgggtatgtg-tgaaaatatgttcaattggtgaattatgcattgttgtt 4388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 164565 - 164318
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  164565 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaattgtatggtaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataagt 164466  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  164465 gatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 164367  T
Q  314 atagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  164366 atgggtatgtg-tgaagatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 164318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 166073 - 166195
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  166073 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaatggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 166172  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  166173 ggggttagttttcatcataatca 166195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162109
Alignment:
Q  72 ataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 162109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 150
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116487
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 150  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcattttt 116487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 11603 - 11852
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11603 taagctaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 11702  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  |||||    
T  11703 tgatgaaatttgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggatgaattacatgttcaaagt--atgaa 11800  T
Q  313 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11801 aaatgggtattagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 11852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4913 - 4666
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4913 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 4816  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  ||||| ||    
T  4815 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaaa 4718  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4717 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9527 - 9280
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9527 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 9430  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  ||||| ||    
T  9429 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaaa 9332  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9331 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 9280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7275
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7522 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 7425  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  ||||| ||    
T  7424 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaaa 7327  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7326 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 48496 - 48250
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48496 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 48398  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  48397 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagt--atgaaa 48300  T
Q  314 a-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    | | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48299 aatgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgtt 48250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 61944 - 61698
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  61944 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 61846  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  61845 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagt--atgaaa 61748  T
Q  314 a-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    | | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  61747 aatgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgtt 61698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18570630 - 18570382
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18570630 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 18570531  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 312  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||||  |||||||||  ||||| ||    
T  18570530 gatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgatgttatggataattgaattgttattagttaaattacatgttcaaa--gtatgaaa 18570433  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18570432 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 18570382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 32899142 - 32898893
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  32899142 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 32899043  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  32899042 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 32898945  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32898944 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgtt 32898893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22441285 - 22441037
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  22441285 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcatatat 22441186  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aa 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||  ||||| |||  ||||| ||    
T  22441185 gatgaaattcgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtgatggggtgaattacatgttaaaa--gtatgaaa 22441088  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22441087 aatgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 22441037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 13014603 - 13014853
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattat--ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13014603 taaggtaagggggttagaatttatcataatcacttattgtaattttcaattatgtttgtatgaaaagtgctaaattgggtgaattgattaattgttcata 13014702  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||    
T  13014703 agtgatgaaattcgtgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttgaa---gtatg 13014799  T
Q  311 -aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
     ||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13014800 aaaaatgggtatgagttggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 13014853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16086369 - 16086120
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  16086369 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 16086270  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  | |||    
T  16086269 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattacatgttcaaagt--acgaa 16086172  T
Q  313 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || | | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  16086171 aaatgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgtt 16086120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16106868 - 16106619
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||      
T  16106868 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattaattaattgttcgtaaa 16106769  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  |||||||    
T  16106768 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 16106671  T
Q  313 aataga-tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  16106670 aaatgagtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgtt 16106619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18432994 - 18432746
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  18432994 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaaattttcaattatt-gtatgaaaagagcttaattgggtgaattgattatttgttcataaa 18432896  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||  ||||| |||  ||||| |    
T  18432895 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatacttgaattgttgttgattgaattacatgttaaaa--gtatgaa 18432798  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18432797 aaatgggtgtatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgtt 18432746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18583763 - 18583641
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583763 aagggttggagagaagaggaacttgaagaattcaagagtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 18583664  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  18583663 ggggttagttttcatcataatca 18583641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18777481 - 18777249
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||                 ||||||      
T  18777481 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattggaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattg-----------------ttcataaa 18777399  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  18777398 agatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 18777301  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18777300 aaatgggtatgtgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgtt 18777249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31628552 - 31628371
Alignment:
Q  181 ttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtt 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31628552 ttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtattcgaattatgattacatgtttagatgtatgaagttattgataattgaattgtt 31628453  T
Q  281 gttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||  |||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31628452 gttagttgaattacatgttcaaagt--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgtt 31628371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 19983101 - 19983223
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19983101 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 19983200  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  19983201 ggggttagtttttatcataatca 19983223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 35014966 - 35015088
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35014966 aagggttggagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 35015065  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  35015066 ggggttagtttttatcataatca 35015088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18399290 - 18399041
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  18399290 taaggtaagggggttagaattcttcataatcattttagtgtaaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcata 18399193  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  18399192 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 18399093  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18399092 aaaatag-tatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 18399041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21623563 - 21623271
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaattt-tcaattatttg 168  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||||| ||||||  |||    
T  21623563 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttctcaatt-gttg 21623465  T
Q  169 tatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 267  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |    
T  21623464 tatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcataaatgttagaattcgtgctccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttga 21623366  T
Q  268 taattgaattgttgttagctg-aattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  21623365 taattgaattgttgtt-gctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 21623271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Original strand, 22361619 - 22361830
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgtaatttt-caattatttgta 170  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||    
T  22361619 taggagctaaagtgaagcttggcctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtaatttttcaattgtt-gta 22361717  T
Q  171 tga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaata 269  Q
    ||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||    
T  22361718 tgaataagtgcttaattg-agcaaatgattaattgttcatagatgataaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgata 22361816  T
Q  270 attgaattgttgtt 283  Q
    ||||||||||||||    
T  22361817 attgaattgttgtt 22361830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 329
Target Start/End: Original strand, 17083093 - 17083307
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||     
T  17083093 taaggtaagggggttagaattcattttaatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatag 17083191  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
     || | | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||| | |||    
T  17083192 ttgttaatattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtg-ataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtga 17083290  T
Q  312 aaatagatatatgttgaa 329  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17083291 aaat-gatatatgttgaa 17083307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33325046 - 33324874
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatt--ttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||  |||||||| | |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33325046 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattatttcaattaat-gtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttca 33324949  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    ||  || | ||||||||||||||| |  ||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||||||||||||||    
T  33324948 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgataattgaattgttgtt 33324874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 262
Target Start/End: Original strand, 25367130 - 25367280
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  25367130 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagcaattgattaattgttcat 25367227  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt 262  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||||||||||||    
T  25367228 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaagtt 25367280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 361
Target Start/End: Original strand, 21410944 - 21411191
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  21410944 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gaggaattgactaattgttcat 21411041  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtat 309  Q
    |   | |  |||| |||||| |||| |||||  |||| |  ||| |||||||| |  |||||||||| |||||||  | ||||  ||||||||||| |      
T  21411042 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgttatgtatgaatgcatgaagttgttgataattgaatggttgttaaataaatttcatgttcaaagtatga 21411141  T
Q  310 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttg 361  Q
    |||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  21411142 gaaagt-ggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatgctatgttg 21411191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 35135906 - 35136078
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35135906 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattagat-aattgattaattgttca 35136003  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgtt 283  Q
    ||  || | ||||||||||||||| |  ||||| ||||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  35136004 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgtt 35136078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 305
Target Start/End: Original strand, 18629469 - 18629695
Alignment:
Q  81 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aag 177  Q
    ||||||||||||| | ||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||    
T  18629469 aaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaattttttatttgttgtatgattaag 18629568  T
Q  178 tgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaat 276  Q
    || ||||||| || || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  18629569 tgtttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatg-ataattgaat 18629666  T
Q  277 tgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    ||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  18629667 tgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 18629695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 305
Target Start/End: Original strand, 17556909 - 17557104
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatca-cttttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 206  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| || || ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  17556909 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatctagtgtaatttttcattaattgcattattaagtgcttaattgaat-aattgattatttgtt 17557007  T
Q  207 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||    ||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  17557008 catagttgtt-aaattcgtgctctaattatgatgatatgttt-gatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 17557104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 307
Target Start/End: Original strand, 16887685 - 16887881
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||||    
T  16887685 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattgaat-aaatgattaattgttca 16887782  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagctgaa-ttgtatgttcaaagtg 306  Q
    ||  || | ||||||||||||||| | |||| | ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||||||||||    
T  16887783 tagatgttaaaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaactgttgtt-ggtgaatttgcatgttcaaagtg 16887880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29605739 - 29605632
Alignment:
Q  174 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattg 273  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||    
T  29605739 taagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaa-ttagtgataattg 29605642  T
Q  274 aattgttgtt 283  Q
    ||||||||||    
T  29605641 aattgttgtt 29605632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 15079606 - 15079774
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15079606 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattattt-tatgaataagggattaattggat-aattgattaattattcat 15079702  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    |  || | ||||||||||||||| |  ||||| |||||   ||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  15079703 agatgtt-aaattcgtgctctaactaggatgatatgttgt-atgcatgaagttgaggataattgaattgttgtt 15079774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 232
Target Start/End: Original strand, 33538223 - 33538384
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || |||  || |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  33538223 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgcgaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 33538322  T
Q  171 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaa 232  Q
    |||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  33538323 tgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaa 33538384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14152704 - 14152632
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  14152704 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggcaagggggttattcttcatcataatca 14152632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 114 - 360
Target Start/End: Original strand, 717 - 963
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  717 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattgattgttcatatg 816  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||    
T  817 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagatgaattacatgttcaaagt--atgaa 914  T
Q  313 aa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgtt 360  Q
    || | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  915 aaatgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 123 - 363
Target Start/End: Original strand, 6749 - 6989
Alignment:
Q  123 ggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaat 221  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6749 ggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgatcagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatatgtgatgaaat 6848  T
Q  222 tcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatat 321  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||    
T  6849 tcgtgctctaattacgaggacatgtttagatgtatgaagttatgaatagttgaattgttgttggttgaattacatgttcagagtgtatgaaaatgggtat 6948  T
Q  322 atgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6949 gtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 6989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23043 - 22794
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23043 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatcaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 22944  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  22943 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttttgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 22846  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22845 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgtt 22794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 496 - 247
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  496 taaggtaagggggttagaattaatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 397  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||  |||||||||||    
T  396 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaaattcatgtttcaagtgtatgaa 297  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  296 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25563 - 25314
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25563 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 25464  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||  ||||||| |||    
T  25463 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25364  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25363 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgtt 25314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25210 - 25061
Alignment:
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||  ||||||| |||    
T  25210 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25111  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25110 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgtt 25061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10289 - 10040
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  10289 taaggtaagggggttagaattcataataatcattattgcaaattttcaattctttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 10190  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  10189 tgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagagtatgaa 10090  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10089 aa-gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 10040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 370 - 132
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 271  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga- 311  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||     
T  270 tgatgaaattcgtgctctaa---tgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattgcatgttcaaa--gtatgag 176  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 355  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  175 aaattggtatatgttgaaaatatgctcaattcgtgaattatgct 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 132144 - 132394
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  132144 taaggtaagggggttggaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttctatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 132243  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg- 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||     
T  132244 atgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattatatgttcaaa--gtatga 132341  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  132342 aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatcgttgtt 132394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 88631 - 88378
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  88631 taataaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgtcca 88532  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgta 308  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||  |||    
T  88531 taaatgatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaaatgttgttagttgaattacatgttcaaa--gta 88434  T
Q  309 tg-aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    || ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  88433 tgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgatcaattggtgaattatgctatgttgtt 88378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12041 - 11790
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12041 taaggtaaggtggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtcaattgattaattgttcata 11943  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |  |    
T  11942 aatgatgaatttcgtgctctaattatgatgacatgtttcaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 11843  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11842 aaaa-agatatgagttgaaaacatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 11790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16253 - 16022
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaatt-gttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16253 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 16155  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtat 309  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |      
T  16154 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 16055  T
Q  310 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattg 343  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  16054 gaaaat-gatatgagttgaaaatatgctccattg 16022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25784 - 25553
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaatt-gttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25784 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 25686  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtat 309  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |      
T  25685 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgttttaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 25586  T
Q  310 gaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattg 343  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  25585 gaaaat-gatatgagttgaaaatatgctccattg 25553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7922 - 7672
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  7922 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 7823  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgac-atgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg- 310  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  |||||     
T  7822 tgatgaaattcatgatctaattatgatgcctatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatga 7725  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7724 aaaatgggtatatgatgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 7672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 114 - 268
Target Start/End: Original strand, 2961 - 3115
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2961 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataaatgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 3060  T
Q  214 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3061 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 3115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 61159 - 60909
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  61159 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 61060  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg- 310  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  |||||     
T  61059 atgatgaaattcgtgctctaattatgataacatgtttagatgtatgatgttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa--gtatga 60962  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||| | ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  60961 aaaatgggtatgtgttaaaaatatacttaattggtgaattatgctttgttgtt 60909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 149 - 363
Target Start/End: Original strand, 70552 - 70766
Alignment:
Q  149 ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  70552 ttgtaattttcaattatttgtaagaaaagtgcttatttggatgagttgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 70651  T
Q  249 agatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtg 346  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70652 agatgtatgaagttaatgaataattgatttattgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaaaagtaggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtg 70749  T
Q  347 aattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||||| || |||||    
T  70750 aattatgcattattgtt 70766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 79785 - 79925
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  79785 taagctaagggggttagaattgatcataatcactcattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 79884  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatg 253  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  79885 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatg 79925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 24623 - 24872
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||      
T  24623 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgaaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgtccataaa 24722  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  24723 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttattgataattaaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaa 24820  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24821 aaatgggtatgtgttgaacatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 24872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11712
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||      
T  11464 taaggtatgggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaagtgtttaattgt-tgaattgattaattgttcataaa 11562  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  |||||||||  ||||| |    
T  11563 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaa--gtatgaa 11660  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11661 aaatgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgtt 11712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 117857 - 118107
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  117857 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 117955  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||    
T  117956 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atg 118053  T
Q  311 aaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    | || | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  118054 agaagttggtatatgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgtt 118107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Original strand, 109356 - 109598
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  109356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 109454  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||    
T  109455 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatg 109552  T
Q  311 a-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 355  Q
    | |||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  109553 agaaattggtatatattgaaaatatgataaattggtgaattatgct 109598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Original strand, 112441 - 112681
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||      
T  112441 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtacttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 112539  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga- 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||     
T  112540 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaacaattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 112637  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 355  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  112638 aaattggtatatgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgct 112681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 305
Target Start/End: Original strand, 102815 - 103009
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  102815 taaggtaaggggtttataattcatcataatcattttttgtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 102912  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||    
T  102913 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtttttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagt 103009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 85683 - 85443
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      
T  85683 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtttataaa 85585  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga- 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||     
T  85584 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 85487  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 355  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  85486 aaattggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgct 85443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 159651 - 159404
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  159651 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtacgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 159553  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  ||||||||||| |  |||    
T  159552 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatggcattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 159453  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttg 361  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  159452 aat-gatatgagttgaaattatgctcaattggttgaattatgctatgttg 159404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9339 - 9090
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt--caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| | ||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||     
T  9339 taaggtaagggggttagaatttatcataatcattattgcaattttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaatttttcataa 9241  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||    
T  9240 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atga 9143  T
Q  312 aaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
     || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9142 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 9090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 38650 - 38401
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  38650 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 38551  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| | |   |    
T  38550 tgatgaaatacgcgctctaattatgatgacatgtttagatttatgaatttatgaataattgaatttttgttggttgaattacatgttcaaag-gaagaga 38452  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38451 aatgggtatatgttgaaaatatgctcaattggcgaattatgcattgttgtt 38401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 133 - 363
Target Start/End: Original strand, 252903 - 253133
Alignment:
Q  133 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 231  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| |     
T  252903 ttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtgcataaatgataaaattcgtgctttg 253002  T
Q  232 attgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaa 330  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||  |||||| |||| | ||||||||||||    
T  253003 attatgatgacatgtttggatgtatgaagttagggataattgaattgttgttagttgaattacattttcaaa--gtatgagaaattggtatatgttgaaa 253100  T
Q  331 atatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  253101 atatgctcaattggtgaatcatgctttgttgtt 253133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 70964 - 70716
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||      
T  70964 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgtaattttcagttatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaatagtttataaa 70866  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |  |||    
T  70865 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatt-catgttcaaagtatgagaa 70767  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  70766 aatgga-atatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgctttgttgtt 70716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 155 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31352 - 31168
Alignment:
Q  155 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgt 254  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31352 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattatttgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgt 31254  T
Q  255 atgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaatt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31253 atgaagttatggataattgaattgtggttagttgaatt-catgttcaaagtataagaaaat-ggtatatgttgaaaatatgctcaatt 31168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21862 - 21615
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  21862 taaggtaagggggttataattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaaaggcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 21764  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| |  |||    
T  21763 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 21665  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21664 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 21615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31561 - 31314
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  31561 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 31463  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaa 312  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| |  |||    
T  31462 tgatgaaattcatgatctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattaaatgttcaaagtatgagaa 31364  T
Q  313 aatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  31363 aat-ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtaaattatactatgttgtt 31314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 223
Target Start/End: Original strand, 47445 - 47554
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  47445 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 47543  T
Q  213 tgatgaaattc 223  Q
    |||||||||||    
T  47544 tgatgaaattc 47554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34014 - 33765
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 211  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  34014 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattact-gtatgattaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcgtaa 33916  T
Q  212 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||    
T  33915 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatga 33818  T
Q  312 -aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
     |||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  33817 gaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgtt 33765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2263 - 2026
Alignment:
Q  118 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgat 216  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  2263 gtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgctcataaatgat 2165  T
Q  217 gaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaata 316  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |  ||||||     
T  2164 gaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgcgaaaat- 2066  T
Q  317 gatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgct 355  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2065 ggtatatgatgaaaatatgctcaattggttgaattatgct 2026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 46521 - 46268
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 208  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46521 taattaaggtaagagggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 46423  T
Q  209 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctg-aattgtatgttcaaagtgt 307  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |  ||| ||||||| |    
T  46422 taaatgatgaaattcgtactctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtat 46323  T
Q  308 atgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
     ||||||  |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46322 gtgaaaagtgggttatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 46268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41010 - 40769
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 212  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  41010 taaggtaagggggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaatagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 40912  T
Q  213 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctg-aattgtatgttcaaagtgtatga 311  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |  ||| ||||||| | |||    
T  40911 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtatgtga 40812  T
Q  312 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 355  Q
    |||  |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40811 aaagtgggttatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 40769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 80310 - 80188
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  80310 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttaaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaag 80211  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  80210 ggggttagtctttatcataatca 80188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 471 - 720
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  471 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcatttattgctatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 568  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |  |    
T  569 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaaattatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgag 668  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  669 aaaat-ggtatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgtt 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5231 - 5044
Alignment:
Q  175 aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattga 274  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5231 aagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattga 5132  T
Q  275 attgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatga-aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| |  |||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5131 attgttgttagttgaattacatgttcaca--gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgatttgttgtt 5044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6251 - 6062
Alignment:
Q  155 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgt 254  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  6251 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgacgacatgtttgaatgt 6153  T
Q  255 atgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||||  ||||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6152 atgaagttatggataattggattgttgttggtagaatttcatgttcaaagtatgagaaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 6062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Original strand, 298 - 383
Alignment:
Q  60 gtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  298 gtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatca 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 30540 - 30418
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30540 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcatagaagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaag 30441  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||| | |||||||||||||    
T  30440 ggggttatttttcatcataatca 30418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 5686 - 5808
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  5686 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaattataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaag 5785  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  5786 ggggttagttttcatcataatca 5808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 145
Target Start/End: Original strand, 5925 - 6014
Alignment:
Q  56 aagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5925 aagggtttgaagaattataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 31093 - 31211
Alignment:
Q  27 gttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaaggggg 126  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31093 gttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggg 31192  T
Q  127 ttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||| || |||| |||||    
T  31193 ttagtttttatcacaatca 31211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41751 - 41633
Alignment:
Q  27 gttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaaggggg 126  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41751 gttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggg 41652  T
Q  127 ttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||| || |||| |||||    
T  41651 ttagtttttatcacaatca 41633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 42797 - 42678
Alignment:
Q  23 aagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||   ||||||||    
T  42797 aagggttagagagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaag 42701  T
Q  123 ggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  42700 ggggttagtttttatcataatca 42678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 218 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 146848 - 146712
Alignment:
Q  218 aaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg-aaaata 316  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||||| |||||     
T  146848 aaattcatgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgtataattgaactgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaaaaatg 146751  T
Q  317 gatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 355  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146750 ggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 146712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 85818 - 85715
Alignment:
Q  178 tgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt 277  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||    |||||||||||    
T  85818 tgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttta-atgcatgaaattggtgataattgaatt 85721  T
Q  278 gttgtt 283  Q
    ||||||    
T  85720 gttgtt 85715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 53703 - 53506
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  53703 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 53606  T
Q  206 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    |||||  || |  ||||| |||||||||  |||||| ||||||  ||| ||||  ||    ||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  53605 tcatagttgttagaattcatgctctaataatgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 53506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 363
Target Start/End: Original strand, 76699 - 76991
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 168  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |    
T  76699 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-g 76797  T
Q  169 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 267  Q
    |||||| |||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |    
T  76798 tatgattaagtacttaattgagt-aattgagtaattgttcatagatgatgaaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttga 76896  T
Q  268 taattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||||||||||||| |   ||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  76897 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttg-aattatgttcaaattgttgaattatgctatgttgtt 76991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3671 - 3423
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  3671 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 3574  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  3573 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttaatgttcaaagtatgag 3474  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgt 362  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  3473 aaagt-ggtatatg-tgaaaatatgctcaattggtccaattatgctatgttgt 3423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8157 - 7927
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  8157 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 8060  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatg 310  Q
    | || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |  |    
T  8059 tttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 7960  T
Q  311 aaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggt 345  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7959 aaagt-ggtatatg-tgaaaatatgctcaattggt 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 33622 - 33872
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  33622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 33719  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtat 309  Q
    |  || |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||  ||||    
T  33720 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaa--gtat 33817  T
Q  310 gaa-aatagatatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||| ||  | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  33818 gaagaagtgttatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgctatgttgtt 33872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Original strand, 197107 - 197318
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  197107 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattg-tgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 197205  T
Q  171 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaata 269  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  || |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| || |  |||    
T  197206 tgattaagtgcttaattggat-aagtgattaattgttcttagatgttgaatttcgggctctaattatgatgatatgtttgaatgtatgaaattgttgata 197304  T
Q  270 attgaattgttgtt 283  Q
    ||||||||||||||    
T  197305 attgaattgttgtt 197318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 1440 - 1611
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1440 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 1537  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  1538 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 8585 - 8756
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8585 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 8682  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  8683 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 8756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8363 - 8192
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8363 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttaatgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttcat 8266  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgtt 283  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  8265 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgtt 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 307
Target Start/End: Original strand, 89760 - 89952
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  89760 taaggtaagggggttagaattcatcataatctttttagtgtaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttcata 89857  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagctgaa-ttgtatgttcaaagtgt 307  Q
      || | |||||||||||| || | |||||| ||||||  ||| ||||| || ||| ||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  89858 gatg-ttaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatg-atacttgaattgttgtt--gtgaatttgtatgttcaaagtgt 89952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Original strand, 1242 - 1378
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1242 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 1339  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  1340 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgttt 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9633
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9497 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 9594  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  9595 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgttt 9633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2795 - 2628
Alignment:
Q  195 tgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgt 294  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||    ||||||||||||||||| |   |||||     
T  2795 tgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgc 2696  T
Q  295 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  2695 atgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgtt 2628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 305
Target Start/End: Original strand, 6885 - 7112
Alignment:
Q  81 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taa 176  Q
    ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| |||  |||||||||  | |  |||||||| |||    
T  6885 aaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaattataatcattttaatgtaatttttcaatcgttgtatgaataa 6984  T
Q  177 gtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaat 276  Q
    |||||||||||  | ||| ||||  |||||||||  ||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||    
T  6985 gtgcttaattgagtaaat-gatttgttgttcataattgtcaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaat 7083  T
Q  277 tgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    |||||||||   ||||  |||||||||||    
T  7084 tgttgttagtgaaatttaatgttcaaagt 7112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 69843 - 69640
Alignment:
Q  81 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aa 176  Q
    ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  69843 aaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaagataagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaa 69745  T
Q  177 gtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaat 276  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||    ||||||||||    
T  69744 gtgcttaattg-agaaagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaaattggttataattgaat 69646  T
Q  277 tgttgt 282  Q
    ||||||    
T  69645 tgttgt 69640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35873 - 35658
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttg 168  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||  |||    
T  35873 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaatt-gttg 35775  T
Q  169 tatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 267  Q
    |||| ||| |||||||||| ||  ||  ||||||||||||| |  |  |  ||||||||||| |||  |||||| ||||||  ||| ||||||||||  |    
T  35774 tatgaataggtgcttaatt-gagtaaaagattaattgttcaaagttcttataattcgtgctccaatcatgatgatatgtttgaatgcatgaagttattga 35676  T
Q  268 taattgaattgttgttag 285  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35675 taattgaattgttgttag 35658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 32373 - 32306
Alignment:
Q  295 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32373 atgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgt-ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgtt 32306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 363
Target Start/End: Original strand, 41930 - 41997
Alignment:
Q  295 atgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41930 atgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgt-ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgtt 41997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Original strand, 70201 - 70298
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || || |||||||||||||||||||    
T  70201 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttgtgaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaaatgtat-aattgattaattgttcata 70298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31414 - 31244
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgt 169  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  31414 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgt 31316  T
Q  170 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatga 241  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| ||||||    
T  31315 atgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatga 31244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11014 - 10879
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  11014 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtataattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aaataattaattgttcata 10917  T
Q  211 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
      || |  |||||||||||||  | |||||| ||||||    
T  10916 gatgttataattcgtgctctatctatgatgatatgttt 10879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 248
Target Start/End: Original strand, 104477 - 104653
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgta 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||| | || ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||  |||||    
T  104477 taggagctaaagtgaagcttgggctaagaatttgtgctaattaaggtaagtgggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaatt-gttgta 104575  T
Q  171 tg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
    || |||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||  || | |||||| |||||||| | |||||| ||||||    
T  104576 tgaataattgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcatagatgttaaaattcatgctctaactatgatgatatgttt 104653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 305
Target Start/End: Original strand, 93728 - 93860
Alignment:
Q  173 ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgat-gaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataat 271  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||| |||||| |||| |  ||| |||||||| |  |||||    
T  93728 ataagtgcttaattgggtaaatt-attaattgttcataactgttagaaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataat 93826  T
Q  272 tgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagt 305  Q
    ||||| ||||||||   ||||  |||||||||||    
T  93827 tgaatggttgttagagaaatttcatgttcaaagt 93860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 363
Target Start/End: Original strand, 617 - 662
Alignment:
Q  318 atatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  617 atatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgtt 662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 307
Target Start/End: Original strand, 22323 - 22518
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22323 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgttattttttaatta-ttgtatgaataagtgattaattggatg-attgattgattgttcat 22420  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagctgaa-ttgtatgttcaaagtgt 307  Q
    |  || | ||||||||||||||| |  ||| | ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  22421 agatgttaaaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgtt-ggtgaatttgcatgttcaaagtgt 22518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Original strand, 1371 - 1435
Alignment:
Q  81 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 145  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1371 aaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatca 1435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 329
Target Start/End: Original strand, 43651 - 43908
Alignment:
Q  73 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgt 169  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||  ||||    
T  43651 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatt-gttgt 43749  T
Q  170 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 268  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||  || | |||||  |||||||||| |||||  ||||||  ||| ||||| ||    ||    
T  43750 atgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaattaatgctctaattatgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgat 43848  T
Q  269 aattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagatatatgttgaa 329  Q
    ||||||||||||||| |   ||||  ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  43849 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaaggatatgaaagt-gatatatgttgaa 43908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 283
Target Start/End: Original strand, 23562 - 23737
Alignment:
Q  110 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 206  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| | |  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  23562 taattaagataagggggttagaattcaatcataatgattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgtt 23660  T
Q  207 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    ||||  || ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||  ||  ||||| || |  |||||||||||||||||    
T  23661 catagttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgtatacatgaaatttttgataattgaattgttgtt 23737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 549 - 442
Alignment:
Q  22 taagggttagagggaagagaaacttaaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaa 121  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||| || |||||    ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| | ||||||    
T  549 taagggttagagagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagagggctaggagctaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataactgaggtaa 451  T
Q  122 gggggttag 130  Q
    |||||||||    
T  450 gggggttag 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Original strand, 855 - 992
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||  || || |||||| ||||||||    
T  855 taaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattaaat-aagtgattatttgttcat 953  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
    |  || | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  954 agttgttaaaattcgtgttctaattatgatgatatgttt 992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 79891 - 79756
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 209  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  79891 taaggtaagggg-ttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttcat 79795  T
Q  210 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 248  Q
    |  || | |||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  79794 agatgctaaaattcgtgcactaactatgatgatatgttt 79756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 363
Target Start/End: Original strand, 89584 - 89613
Alignment:
Q  334 tgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89584 tgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 89613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6907 - 6843
Alignment:
Q  219 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 283  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  6907 aattcgtgctataattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgtt 6843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28781 - 28639
Alignment:
Q  220 attcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagctgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaatagat 319  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||| |||||||||||| |   |||| |||||||||||| |  |||| | |||    
T  28781 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaagtatgagaaagt-gat 28683  T
Q  320 atatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 363  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  28682 atatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatggtatgttgtt 28639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University