View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18359_high_13 (Length: 412)

Name: NF18359_high_13
Description: NF18359
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18359_high_13
NF18359_high_13
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (11-394)||(13838783-13839166)
chr3 (128-394)||(51158009-51158275)
chr3 (80-385)||(15859024-15859330)
chr3 (90-393)||(12030139-12030443)
chr3 (90-394)||(2049777-2050082)
chr3 (128-390)||(14842556-14842818)
chr3 (118-379)||(15936633-15936894)
chr3 (128-385)||(17912483-17912738)
chr3 (128-379)||(15938475-15938726)
chr3 (128-341)||(15614840-15615053)
chr3 (80-394)||(16744106-16744420)
chr3 (82-351)||(16821099-16821369)
chr3 (118-385)||(45860801-45861068)
chr3 (125-385)||(13975722-13975982)
chr3 (125-385)||(13954890-13955150)
chr3 (118-370)||(55316215-55316468)
chr3 (118-370)||(41270071-41270324)
chr3 (11-379)||(15468338-15468717)
chr3 (254-385)||(2449238-2449369)
chr3 (11-335)||(22275088-22275423)
chr3 (118-237)||(47984646-47984765)
chr3 (118-237)||(48003220-48003339)
chr3 (11-91)||(48421624-48421704)
chr3 (118-237)||(47993933-47994052)
chr3 (118-237)||(48012506-48012625)
chr3 (128-382)||(11986169-11986424)
chr3 (22-91)||(14177158-14177227)
chr3 (11-91)||(18969968-18970048)
chr3 (82-152)||(17956210-17956281)
chr3 (320-385)||(19231979-19232044)
chr3 (97-368)||(17139481-17139754)
chr3 (315-369)||(14080701-14080756)
chr3 (11-91)||(39656390-39656467)
chr3 (261-369)||(4145814-4145923)
chr3 (222-381)||(54651557-54651717)
chr3 (285-368)||(47784767-47784851)
chr3 (261-369)||(6228625-6228735)
chr3 (97-250)||(11329081-11329235)
chr3 (80-369)||(55440848-55441141)
chr3 (285-369)||(17191703-17191788)
chr3 (285-369)||(17204843-17204928)
chr3 (140-387)||(19260821-19261069)
chr3 (90-252)||(14295404-14295568)
chr3 (161-369)||(14814765-14814974)
chr3 (115-242)||(16880114-16880242)
chr3 (90-153)||(30152908-30152972)
chr3 (285-368)||(30207378-30207462)
chr3 (286-368)||(3576439-3576522)
chr3 (82-379)||(49232396-49232694)
chr3 (89-158)||(33341847-33341916)
chr3 (261-369)||(41661702-41661812)
chr3 (285-369)||(9590754-9590839)
chr3 (97-237)||(14528145-14528286)
chr3 (116-252)||(17100645-17100782)
chr3 (116-252)||(17101330-17101467)
chr3 (89-153)||(19946664-19946728)
chr3 (101-197)||(47784920-47785017)
chr3 (97-244)||(12560362-12560510)
chr3 (285-368)||(12953126-12953210)
chr3 (287-366)||(13301472-13301552)
chr3 (287-366)||(13312128-13312208)
chr3 (90-252)||(14301031-14301195)
chr3 (102-368)||(14059214-14059482)
chr3 (287-369)||(15517795-15517878)
chr3 (89-131)||(7853948-7853990)
chr3 (261-353)||(31412349-31412443)
chr3 (82-111)||(16934241-16934270)
chr3 (260-379)||(25058876-25058997)
chr3 (285-349)||(34560061-34560126)
chr3 (90-158)||(45581597-45581666)
chr3 (285-368)||(16880285-16880369)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (11-394)||(24928782-24929165)
chr8 (128-394)||(16193707-16193973)
chr8 (118-385)||(43373468-43373735)
chr8 (128-385)||(16404975-16405229)
chr8 (128-367)||(24548988-24549227)
chr8 (128-367)||(6774264-6774503)
chr8 (133-385)||(17345581-17345832)
chr8 (1-385)||(22907214-22907606)
chr8 (118-369)||(21844576-21844828)
chr8 (118-369)||(21851969-21852221)
chr8 (11-158)||(41507029-41507177)
chr8 (134-370)||(30120734-30120971)
chr8 (254-385)||(5238219-5238350)
chr8 (254-385)||(24661248-24661379)
chr8 (254-385)||(43685678-43685809)
chr8 (118-310)||(222754-222947)
chr8 (118-310)||(736377-736570)
chr8 (118-310)||(860272-860465)
chr8 (118-370)||(16674395-16674648)
chr8 (28-131)||(2544855-2544958)
chr8 (79-250)||(23837153-23837325)
chr8 (11-91)||(23217924-23218004)
chr8 (84-369)||(21198152-21198439)
chr8 (17-91)||(22981244-22981318)
chr8 (285-369)||(26011656-26011741)
chr8 (11-91)||(22321574-22321654)
chr8 (94-369)||(23226076-23226353)
chr8 (80-198)||(41246614-41246733)
chr8 (254-310)||(691909-691965)
chr8 (285-368)||(17285366-17285450)
chr8 (82-130)||(24717111-24717159)
chr8 (82-379)||(22006256-22006554)
chr8 (101-250)||(22735958-22736108)
chr8 (285-369)||(15933460-15933545)
chr8 (285-369)||(25296320-25296405)
chr8 (285-369)||(25758340-25758425)
chr8 (82-379)||(13662263-13662561)
chr8 (146-369)||(18261471-18261695)
chr8 (80-177)||(17285223-17285321)
chr8 (1-78)||(5238126-5238203)
chr8 (285-369)||(5854776-5854861)
chr8 (82-123)||(15319414-15319455)
chr8 (82-123)||(15499783-15499824)
chr8 (82-123)||(22089049-22089090)
chr8 (328-369)||(23149985-23150026)
chr8 (1-78)||(24661395-24661472)
chr8 (80-204)||(31194490-31194615)
chr8 (80-244)||(39446892-39447057)
chr8 (22-70)||(21259637-21259685)
chr8 (217-353)||(33172322-33172459)
chr8 (146-353)||(45558953-45559161)
chr8 (284-369)||(23151833-23151919)
chr8 (261-369)||(37653616-37653726)
chr8 (82-111)||(3431548-3431577)
chr8 (82-111)||(13721195-13721224)
chr8 (79-175)||(19993249-19993346)
chr8 (328-369)||(23158367-23158408)
chr8 (285-369)||(23837360-23837445)
chr8 (101-153)||(29759919-29759972)
chr8 (1-78)||(43685585-43685662)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (11-394)||(171794-172177)
scaffold0001 (11-394)||(177497-177880)
scaffold0001 (80-152)||(70840-70913)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (11-394)||(271914-272297)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (90-385)||(36913-37209)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (128-394)||(462744-463010)
chr2 (90-385)||(36982441-36982737)
chr2 (80-385)||(8891199-8891505)
chr2 (87-385)||(19794704-19795004)
chr2 (128-390)||(20627308-20627570)
chr2 (128-384)||(24341390-24341646)
chr2 (128-384)||(43642958-43643214)
chr2 (101-385)||(25265390-25265675)
chr2 (128-335)||(7507894-7508101)
chr2 (118-385)||(17396653-17396920)
chr2 (11-165)||(25601911-25602066)
chr2 (118-370)||(19886664-19886917)
chr2 (254-385)||(19689401-19689532)
chr2 (254-385)||(23820203-23820334)
chr2 (254-385)||(14906440-14906571)
chr2 (254-385)||(20015143-20015274)
chr2 (82-139)||(22274681-22274738)
chr2 (94-369)||(19666498-19666775)
chr2 (90-368)||(67958-68238)
chr2 (17-91)||(67859-67933)
chr2 (82-139)||(22283914-22283971)
chr2 (285-369)||(24884848-24884933)
chr2 (84-204)||(25305405-25305526)
chr2 (80-252)||(24571409-24571583)
chr2 (33-91)||(7321586-7321644)
chr2 (89-204)||(19433498-19433614)
chr2 (287-366)||(19660044-19660124)
chr2 (288-362)||(19669116-19669191)
chr2 (139-353)||(9636761-9636976)
chr2 (298-368)||(22579863-22579933)
chr2 (82-123)||(12728352-12728393)
chr2 (82-123)||(24686036-24686077)
chr2 (82-123)||(34824435-34824476)
chr2 (90-186)||(36890869-36890966)
chr2 (285-368)||(22775206-22775290)
chr2 (285-368)||(22780584-22780668)
chr2 (289-368)||(43646059-43646139)
chr2 (88-198)||(32465822-32465933)
chr2 (79-198)||(28974003-28974124)
chr2 (82-111)||(42178236-42178265)
chr2 (328-368)||(25305637-25305677)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (90-385)||(19173-19469)
scaffold0195 (90-385)||(21257-21553)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (90-394)||(48565-48870)
scaffold0023 (118-351)||(36089-36323)
scaffold0023 (82-123)||(154262-154303)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (80-394)||(23506922-23507237)
chr5 (88-385)||(27182547-27182845)
chr5 (128-384)||(18531068-18531324)
chr5 (128-384)||(22053834-22054090)
chr5 (133-385)||(34939289-34939540)
chr5 (171-367)||(29188290-29188486)
chr5 (11-379)||(17471586-17471956)
chr5 (128-370)||(43443398-43443641)
chr5 (118-370)||(18777995-18778248)
chr5 (118-370)||(22366484-22366737)
chr5 (118-370)||(25426624-25426877)
chr5 (118-369)||(27009837-27010089)
chr5 (118-370)||(12370-12623)
chr5 (11-158)||(2031697-2031845)
chr5 (118-370)||(19499895-19500148)
chr5 (118-370)||(21073598-21073851)
chr5 (133-351)||(4200007-4200226)
chr5 (254-385)||(20623101-20623232)
chr5 (254-385)||(21233528-21233659)
chr5 (254-383)||(25900408-25900537)
chr5 (254-385)||(16536329-16536460)
chr5 (254-385)||(37052876-37053007)
chr5 (11-91)||(25004863-25004943)
chr5 (128-382)||(32950699-32950955)
chr5 (285-369)||(21310709-21310794)
chr5 (287-369)||(29918129-29918212)
chr5 (139-369)||(432479-432710)
chr5 (273-369)||(23981516-23981614)
chr5 (285-369)||(19862371-19862456)
chr5 (285-369)||(21297175-21297260)
chr5 (285-368)||(5450844-5450928)
chr5 (285-368)||(21222609-21222693)
chr5 (96-167)||(29190481-29190553)
chr5 (287-369)||(22885806-22885889)
chr5 (82-123)||(1219775-1219816)
chr5 (101-153)||(11342661-11342714)
chr5 (1-78)||(20623008-20623085)
chr5 (1-78)||(21233675-21233752)
chr5 (288-368)||(21617181-21617262)
chr5 (82-123)||(22883339-22883380)
chr5 (101-369)||(1168204-1168474)
chr5 (315-368)||(16595699-16595753)
chr5 (261-369)||(26559815-26559925)
chr5 (82-111)||(9730650-9730679)
chr5 (260-379)||(10777968-10778089)
chr5 (82-111)||(23514521-23514550)
chr5 (260-379)||(23514698-23514819)
chr5 (80-198)||(4865218-4865338)
chr5 (328-368)||(23494125-23494165)
chr5 (261-367)||(24084214-24084322)
chr5 (285-368)||(28902353-28902437)
chr5 (285-368)||(28938748-28938832)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (80-385)||(13246387-13246693)
chr4 (80-385)||(54118244-54118550)
chr4 (128-384)||(15675090-15675346)
chr4 (128-358)||(31115635-31115865)
chr4 (216-394)||(121983-122161)
chr4 (1-385)||(26680071-26680463)
chr4 (190-384)||(10104251-10104445)
chr4 (118-369)||(10644215-10644467)
chr4 (133-385)||(13048221-13048474)
chr4 (11-175)||(34395144-34395309)
chr4 (118-370)||(47357650-47357903)
chr4 (254-385)||(10488694-10488825)
chr4 (254-385)||(16327926-16328057)
chr4 (128-221)||(111401-111494)
chr4 (190-369)||(40885570-40885749)
chr4 (315-384)||(33240893-33240962)
chr4 (84-368)||(41165947-41166233)
chr4 (82-152)||(5682753-5682824)
chr4 (23-82)||(19559422-19559481)
chr4 (28-91)||(34177767-34177830)
chr4 (80-368)||(18494329-18494620)
chr4 (82-130)||(25119457-25119505)
chr4 (90-368)||(15044794-15045074)
chr4 (115-368)||(13809511-13809766)
chr4 (79-198)||(14901187-14901307)
chr4 (128-381)||(7850005-7850259)
chr4 (139-379)||(17145655-17145896)
chr4 (146-353)||(18238173-18238381)
chr4 (139-335)||(8374525-8374722)
chr4 (285-369)||(18276596-18276681)
chr4 (285-369)||(47535065-47535150)
chr4 (90-153)||(14951728-14951792)
chr4 (287-370)||(15013282-15013365)
chr4 (285-368)||(15109350-15109434)
chr4 (80-198)||(23270106-23270225)
chr4 (280-369)||(7964712-7964802)
chr4 (80-252)||(16732124-16732298)
chr4 (82-123)||(18168930-18168971)
chr4 (80-180)||(47535236-47535337)
chr4 (271-369)||(40904934-40905034)
chr4 (80-175)||(44055871-44055967)
chr4 (128-167)||(10104449-10104488)
chr4 (285-368)||(30232498-30232581)
chr4 (61-91)||(9795314-9795344)
chr4 (261-369)||(41256370-41256479)
chr4 (270-369)||(7185844-7185945)
chr4 (260-335)||(22738406-22738483)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (90-382)||(148688-148981)
scaffold0025 (128-384)||(8855-9111)
scaffold0025 (261-369)||(85670-85779)
scaffold0025 (285-352)||(53508-53576)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (80-387)||(1081-1389)
scaffold0266 (128-394)||(3573-3839)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (101-385)||(5061-5345)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (90-385)||(123164-123460)
scaffold0011 (80-175)||(255009-255105)
scaffold0011 (80-175)||(261615-261711)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (80-385)||(11580739-11581045)
chr7 (80-385)||(13037014-13037320)
chr7 (133-394)||(16211777-16212038)
chr7 (128-385)||(47481031-47481288)
chr7 (128-394)||(3059972-3060238)
chr7 (90-385)||(36052634-36052927)
chr7 (118-379)||(18253841-18254102)
chr7 (93-384)||(13320984-13321278)
chr7 (128-367)||(16478968-16479207)
chr7 (1-385)||(7292887-7293279)
chr7 (126-385)||(25292338-25292597)
chr7 (118-369)||(13572672-13572924)
chr7 (118-370)||(10989406-10989658)
chr7 (128-351)||(2437463-2437687)
chr7 (118-351)||(13911046-13911281)
chr7 (254-385)||(11516359-11516490)
chr7 (254-385)||(15441564-15441695)
chr7 (254-385)||(30262129-30262260)
chr7 (116-381)||(295970-296233)
chr7 (23-91)||(13352011-13352079)
chr7 (80-250)||(17224058-17224229)
chr7 (80-252)||(13274742-13274917)
chr7 (285-369)||(16914928-16915013)
chr7 (17-85)||(15977975-15978043)
chr7 (285-369)||(9611470-9611555)
chr7 (285-369)||(9839041-9839126)
chr7 (285-368)||(13377691-13377775)
chr7 (82-379)||(15950789-15951087)
chr7 (115-252)||(16570123-16570262)
chr7 (115-252)||(16595400-16595539)
chr7 (80-252)||(11287372-11287546)
chr7 (90-369)||(26070264-26070545)
chr7 (90-369)||(26094051-26094332)
chr7 (261-369)||(28722247-28722357)
chr7 (80-368)||(49047675-49047966)
chr7 (82-127)||(1937252-1937297)
chr7 (97-252)||(12248238-12248395)
chr7 (270-369)||(14271899-14272000)
chr7 (285-369)||(48356806-48356891)
chr7 (343-385)||(14113989-14114031)
chr7 (343-385)||(14423639-14423681)
chr7 (261-369)||(14935497-14935607)
chr7 (261-369)||(15363090-15363200)
chr7 (285-379)||(48622664-48622758)
chr7 (101-153)||(126392-126445)
chr7 (1-78)||(15441711-15441788)
chr7 (17-70)||(18151494-18151547)
chr7 (1-78)||(30262276-30262353)
chr7 (261-369)||(14940892-14940999)
chr7 (261-369)||(15368485-15368592)
chr7 (89-131)||(7284299-7284341)
chr7 (261-353)||(15358934-15359028)
chr7 (82-111)||(371048-371077)
chr7 (82-111)||(14251165-14251194)
chr7 (80-252)||(15822549-15822722)
chr7 (260-379)||(18980019-18980140)
chr7 (270-380)||(4446358-4446469)
chr7 (285-368)||(13274939-13275023)
chr7 (285-368)||(17223939-17224023)
chr7 (80-175)||(35094773-35094869)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (80-385)||(23153404-23153710)
chr6 (128-390)||(14626113-14626375)
chr6 (133-385)||(1657748-1657999)
chr6 (128-367)||(1650111-1650350)
chr6 (90-385)||(35009439-35009735)
chr6 (133-385)||(15862484-15862734)
chr6 (118-370)||(25175559-25175812)
chr6 (133-370)||(27653986-27654224)
chr6 (118-370)||(16825755-16826010)
chr6 (190-385)||(29665941-29666137)
chr6 (80-368)||(18381684-18381974)
chr6 (128-304)||(27740844-27741021)
chr6 (11-85)||(15889840-15889914)
chr6 (80-368)||(21623124-21623414)
chr6 (82-153)||(19983516-19983588)
chr6 (82-153)||(35015382-35015454)
chr6 (104-369)||(35136013-35136279)
chr6 (17-91)||(25640683-25640757)
chr6 (26-91)||(15005034-15005099)
chr6 (285-369)||(16887792-16887877)
chr6 (285-369)||(18629608-18629693)
chr6 (11-84)||(22585681-22585754)
chr6 (11-84)||(22590512-22590585)
chr6 (300-385)||(27751603-27751688)
chr6 (270-367)||(17083200-17083298)
chr6 (287-369)||(29605614-29605696)
chr6 (104-369)||(33324673-33324939)
chr6 (285-375)||(17557012-17557102)
chr6 (89-369)||(22361765-22362047)
chr6 (89-180)||(18583299-18583393)
chr6 (94-368)||(18398909-18399184)
chr6 (261-369)||(33538370-33538479)
chr6 (117-180)||(29665887-29665950)
chr6 (285-370)||(15079709-15079793)
chr6 (270-366)||(15740375-15740473)
chr6 (85-123)||(16556394-16556432)
chr6 (85-123)||(16632950-16632988)
chr6 (260-379)||(1556142-1556263)
chr6 (260-379)||(16232029-16232150)
chr6 (82-123)||(22225993-22226034)
chr6 (17-85)||(17375053-17375121)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (101-381)||(26419-26699)
scaffold0162 (118-385)||(8180-8444)
scaffold0162 (77-369)||(7025-7319)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (87-394)||(41693-42001)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (90-392)||(20931312-20931615)
chr1 (80-385)||(20445636-20445942)
chr1 (80-385)||(20893626-20893932)
chr1 (80-385)||(20531401-20531707)
chr1 (90-394)||(20913004-20913302)
chr1 (101-385)||(37844450-37844735)
chr1 (128-394)||(41394228-41394494)
chr1 (128-351)||(2116260-2116484)
chr1 (128-335)||(22227815-22228022)
chr1 (128-335)||(22232512-22232719)
chr1 (183-351)||(45051484-45051652)
chr1 (118-351)||(18601140-18601374)
chr1 (118-370)||(5072391-5072644)
chr1 (254-385)||(51452624-51452755)
chr1 (80-368)||(20177131-20177421)
chr1 (80-198)||(13377012-13377131)
chr1 (97-369)||(22143361-22143635)
chr1 (82-130)||(44035219-44035267)
chr1 (96-369)||(21194986-21195261)
chr1 (80-368)||(51627665-51627956)
chr1 (285-368)||(17609090-17609174)
chr1 (90-152)||(15861650-15861713)
chr1 (90-152)||(22366985-22367048)
chr1 (79-204)||(41229105-41229231)
chr1 (82-123)||(18060013-18060054)
chr1 (296-368)||(36356294-36356367)
chr1 (79-198)||(49967606-49967725)
chr1 (285-368)||(27329757-27329840)
chr1 (128-167)||(45051448-45051487)
chr1 (316-368)||(16646105-16646158)
chr1 (82-111)||(21650307-21650336)
chr1 (285-353)||(37233876-37233945)
chr1 (296-368)||(38033675-38033748)
chr1 (1-78)||(51452531-51452608)
chr1 (285-368)||(16656800-16656884)
chr1 (90-130)||(21859977-21860017)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (133-385)||(247442-247694)
scaffold0012 (11-153)||(253206-253349)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (118-394)||(8874-9150)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (135-385)||(534-784)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (128-390)||(951-1212)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (118-382)||(48183-48447)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (128-390)||(6059-6320)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (90-394)||(128160-128464)
scaffold0008 (133-351)||(31697-31917)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (118-394)||(12111-12385)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (128-379)||(107753-108004)
scaffold0026 (118-369)||(64527-64784)
scaffold0026 (319-370)||(89863-89915)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (101-385)||(41626-41911)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (128-351)||(9371-9594)
scaffold0215 (128-351)||(16269-16492)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (128-385)||(34460-34718)
scaffold0075 (11-123)||(4831-4940)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (128-379)||(2968-3220)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (128-385)||(13512-13769)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (80-385)||(37066-37371)
scaffold0078 (82-130)||(41267-41315)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (128-335)||(5254-5460)
scaffold0022 (101-368)||(102923-103192)
scaffold0022 (80-250)||(109545-109717)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (239-394)||(51173-51328)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (128-335)||(3728-3936)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (11-139)||(1286-1414)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (11-158)||(29978-30126)
scaffold0116 (118-369)||(31-283)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (146-381)||(5552-5788)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (234-385)||(89454-89605)
scaffold0028 (104-369)||(79519-79786)
scaffold0028 (334-385)||(107784-107835)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (133-351)||(21138-21356)
scaffold0139 (128-351)||(14083-14306)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (118-350)||(42993-43226)
scaffold0076 (82-123)||(39063-39104)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (229-351)||(13347-13469)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (11-152)||(24415-24557)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (11-130)||(3406-3525)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (80-220)||(9339-9480)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (17-127)||(13537-13647)
scaffold0032 (273-369)||(104623-104721)
scaffold0032 (285-369)||(93773-93858)
scaffold0032 (17-91)||(116284-116358)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (254-385)||(26927-27058)
scaffold0141 (254-381)||(22672-22799)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (254-385)||(1582-1713)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (238-370)||(1307-1439)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (80-369)||(76847-77138)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (138-382)||(56102-56347)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (11-131)||(11947-12068)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (22-91)||(22186-22255)
scaffold0021 (80-198)||(132422-132541)
scaffold0021 (97-198)||(11660-11762)
[»] scaffold0483 (3 HSPs)
scaffold0483 (11-83)||(1017-1089)
scaffold0483 (285-368)||(6823-6907)
scaffold0483 (80-177)||(6617-6715)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (11-83)||(45804-45876)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (17-91)||(159-233)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (17-91)||(1629-1703)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (222-385)||(3289-3453)
scaffold0361 (101-180)||(3186-3266)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (116-335)||(54410-54630)
scaffold0066 (169-335)||(45077-45244)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (82-153)||(162404-162476)
scaffold0016 (80-196)||(116687-116804)
scaffold0016 (82-153)||(166482-166554)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (82-152)||(6309-6380)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (146-369)||(22422-22646)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (115-369)||(8001-8257)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (128-211)||(48520-48603)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (80-368)||(35435-35724)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (82-130)||(31529-31577)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (89-369)||(21477-21758)
scaffold0120 (89-198)||(31176-31286)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (270-369)||(1348-1449)
scaffold0409 (270-369)||(9603-9704)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (11-91)||(3969-4049)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (128-211)||(26-109)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (222-369)||(22429-22577)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (22-84)||(44249-44311)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (316-369)||(70307-70361)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (17-91)||(5936-6010)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (285-369)||(2687-2772)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (285-368)||(2317-2401)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (80-250)||(109582-109754)
scaffold0035 (80-255)||(118078-118255)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (89-367)||(28501-28781)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (315-368)||(10854-10908)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (104-369)||(29944-30211)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (328-369)||(1546-1587)
scaffold0456 (328-369)||(8691-8732)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (82-130)||(700-747)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (89-175)||(3265-3351)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (260-381)||(10335-10458)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (80-153)||(159257-159332)
scaffold0014 (80-250)||(85287-85459)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (97-198)||(7807-7909)
scaffold0589 (328-368)||(8011-8051)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (287-368)||(31184-31266)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (270-369)||(962-1063)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (80-244)||(33854-34019)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (89-252)||(110-273)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (82-134)||(29122-29174)
[»] scaffold0092 (2 HSPs)
scaffold0092 (115-242)||(3310-3438)
scaffold0092 (328-368)||(3525-3565)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (80-250)||(265-436)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (80-198)||(5418-5537)
scaffold0480 (97-198)||(9054-9156)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (80-197)||(8942-9061)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (89-175)||(24925-25010)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (285-367)||(97200-97283)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (90-175)||(1347-1433)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (260-333)||(3551-3625)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (261-353)||(3388-3482)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (261-353)||(4742-4836)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (82-112)||(39606-39636)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (285-362)||(43805-43883)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (261-353)||(27634-27728)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (90-158)||(12740-12809)
scaffold0039 (90-158)||(19121-19190)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (88-175)||(1017-1105)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (260-335)||(54012-54088)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Original strand, 13838783 - 13839166
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13838783 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcattcattccatcatatttcaacaacaacatgtcgtaattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 13838882  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatc 210  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13838883 aatccatttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatc 13838982  T
Q  211 ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13838983 ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaat 13839082  T
Q  311 cttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13839083 catacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaat 13839166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 51158275 - 51158009
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  51158275 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaa 51158176  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  51158175 caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 51158076  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51158075 ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaat 51158009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15859330 - 15859024
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||||| |||||| ||| || |||||||||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859330 aattcaccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 15859231  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15859230 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 15859131  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15859130 ttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 15859031  T
Q  379 tatccat 385  Q
    |||||||    
T  15859030 tatccat 15859024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 90 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12030443 - 12030139
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12030443 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaacca 12030344  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
    || ||||||| |||||||||||| |  ||||   ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12030343 tagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttg 12030244  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataat 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12030243 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 12030144  T
Q  389 caaaa 393  Q
    |||||    
T  12030143 caaaa 12030139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Original strand, 2049777 - 2050082
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2049777 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 2049876  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
    || ||||||| |||||| ||||| | |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2049877 tagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttg 2049976  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataat 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  2049977 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 2050076  T
Q  389 caaaat 394  Q
    ||||||    
T  2050077 caaaat 2050082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14842818 - 14842556
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |    
T  14842818 caatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa 14842719  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  14842718 caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaa 14842619  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatca 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842618 ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatca 14842556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 118 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15936894 - 15936633
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  15936894 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctc 15936795  T
Q  218 aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa 317  Q
    ||   ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15936794 aaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 15936695  T
Q  318 ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  15936694 ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaatt 15936633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17912738 - 17912483
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  17912738 caattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaattcaacta 17912639  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    |||| || |||| |||| |||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17912638 caacatatcaaa-ttcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 17912540  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17912539 ttcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15938726 - 15938475
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |    
T  15938726 caatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa 15938627  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15938626 caacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 15938527  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    ||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| |||||  |||||||    
T  15938526 ttcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaatt 15938475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 128 - 341
Target Start/End: Original strand, 15614840 - 15615053
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||   ||| |    
T  15614840 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaa 15614939  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15614940 taacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaa 15615039  T
Q  328 ttcatgcatacaaa 341  Q
    ||||||||||||||    
T  15615040 ttcatgcatacaaa 15615053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16744420 - 16744106
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  16744420 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacattta 16744321  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    ||| || | | ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| | ||| |  |||| |||| | |||   ||||||||||| ||||| |||||||    
T  16744320 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactataacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcatttt 16744222  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16744221 tacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaat 16744122  T
Q  379 tatccataatcaaaat 394  Q
     |||||||||||||||    
T  16744121 catccataatcaaaat 16744106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 16821099 - 16821369
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatta 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||    
T  16821099 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttatttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaata 16821198  T
Q  182 acaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcattttta 280  Q
    |||  |||||||||||| ||||| |||||| | |||||  |||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||  ||| | |||| ||||||||    
T  16821199 acattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattttta 16821298  T
Q  281 catatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16821299 catatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 385
Target Start/End: Original strand, 45860801 - 45861068
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || |  ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||    
T  45860801 ttctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc 45860900  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  45860901 aaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcataca 45861000  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45861001 atcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 125 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13975982 - 13975722
Alignment:
Q  125 caacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaa 224  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || |  ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||||   ||    
T  13975982 caacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaa 13975883  T
Q  225 ccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatca 323  Q
      ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||    
T  13975882 tgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatca 13975783  T
Q  324 tcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13975782 acaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 125 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13955150 - 13954890
Alignment:
Q  125 caacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaa 224  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || |  ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||||   ||    
T  13955150 caacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaa 13955051  T
Q  225 ccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatca 323  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||    
T  13955050 tgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatca 13954951  T
Q  324 tcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13954950 acaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 55316215 - 55316468
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || |  ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||    
T  55316215 ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc 55316314  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  55316315 aacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 55316414  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  55316415 actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 55316468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 41270071 - 41270324
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || |  ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||    
T  41270071 ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc 41270170  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  41270171 aacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcataca 41270270  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  41270271 actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 41270324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15468717 - 15468338
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcaca---------aaacc 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |    
T  15468717 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatacattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaatttcaccaaaac 15468618  T
Q  102 accaacaacaa-tccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatag 200  Q
    | ||||||||| || | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||  | ||||||||| |    
T  15468617 aacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatgg 15468518  T
Q  201 aacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg-aacatgtaat 298  Q
    || | |||| | | |||| | ||| || ||| || |||| |||| ||||| |  | || |||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  15468517 aatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataa-tttcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaat 15468419  T
Q  299 ttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    |||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  15468418 ttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaatt 15468338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 2449369 - 2449238
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2449369 cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 2449270  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2449269 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 22275088 - 22275423
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcaca---------aaacc 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||         ||| |    
T  22275088 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcactaatttcacaaatttcaccaaaac 22275187  T
Q  102 accaacaacaa-tccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatag 200  Q
    ||||||||||| || | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||| |||||||  | ||||||||| |    
T  22275188 accaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatgg 22275287  T
Q  201 aacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg-aacatgtaat 298  Q
    || | |||| | | |||| | ||| || ||| || |||| |||| ||||| |  | || |||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  22275288 aatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataa-tttcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaat 22275386  T
Q  299 ttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgca 335  Q
    |||||| |||| | | | || ||||||||||||||||    
T  22275387 ttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 22275423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 47984646 - 47984765
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| | |||    
T  47984646 ttctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctc 47984745  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca 237  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  47984746 aatccaacaacaacttagca 47984765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 48003220 - 48003339
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| | |||    
T  48003220 ttctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctc 48003319  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca 237  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  48003320 aatccaacaacaacttagca 48003339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 48421624 - 48421704
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48421624 catcaacaattaaccacaaccacaatttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 48421704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 47993933 - 47994052
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| | |||    
T  47993933 ttctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctc 47994032  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca 237  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  47994033 aatccaacaacaacttagca 47994052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 48012506 - 48012625
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| | |||    
T  48012506 ttctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctc 48012605  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca 237  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  48012606 aatccaacaacaacttagca 48012625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11986424 - 11986169
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||| |||| | |   ||||||||| ||||| |||||| |  ||  | |||| |    
T  11986424 caatccatgaatatgcatacccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaa 11986325  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa--catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatc 325  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||  ||||  |||||| || ||  |||||||||||| | |||||| | ||||||||||     
T  11986324 caacttagcaaaattcactatttgagcacaattt-cataacttgacattaatacatactttaaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatt 11986226  T
Q  326 aattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatc 382  Q
    || ||||||| || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11986225 aaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatc 11986169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 14177227 - 14177158
Alignment:
Q  22 aaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14177227 aaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcaaccacaacatgtcataattcatcaatt 14177158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 18969968 - 18970048
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18969968 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgctttccatcagaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 18970048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17956281 - 17956210
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  17956281 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag 17956210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 385
Target Start/End: Original strand, 19231979 - 19232044
Alignment:
Q  320 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19231979 atcatcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19232044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 368
Target Start/End: Original strand, 17139481 - 17139754
Alignment:
Q  97 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 195  Q
    |||| ||||||||||   |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  17139481 aaactaccaacaacatctcatttcgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc 17139580  T
Q  196 aatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacat 293  Q
    ||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| |||||  ||||| |||||||| || |  |||||  |  || ||||||  |||| |||||||||    
T  17139581 aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcata--tttcaacatataccattttctcatagtttgaacat 17139678  T
Q  294 gtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    | ||||||||||||||   | |||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17139679 gaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaatt 17139754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 369
Target Start/End: Original strand, 14080701 - 14080756
Alignment:
Q  315 caattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14080701 caattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 39656390 - 39656467
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  39656390 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcatgccatcatattt---gaacaacatgtcataattcaccaatt 39656467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4145923 - 4145814
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttgga 359  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||   | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  4145923 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattgga 4145824  T
Q  360 gcacgaattt 369  Q
    | ||||||||    
T  4145823 gtacgaattt 4145814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 381
Target Start/End: Original strand, 54651557 - 54651717
Alignment:
Q  222 caaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg-aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaatt 319  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||  | ||||| || |||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||  |||||| | |||||    
T  54651557 caacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtataattt-cataacttaacatttatacatactttgcaacatgcaatttcactcacaatcatacaatt 54651655  T
Q  320 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattat 381  Q
    |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  54651656 atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattat 54651717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47784851 - 47784767
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  47784851 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt 47784767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6228735 - 6228625
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||| || |    
T  6228735 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattag 6228636  T
Q  359 agcacgaattt 369  Q
    |||||||||||    
T  6228635 agcacgaattt 6228625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11329235 - 11329081
Alignment:
Q  97 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 195  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  11329235 aaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc 11329136  T
Q  196 aatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt 250  Q
    ||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  11329135 aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 11329081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 55441141 - 55440848
Alignment:
Q  80 aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||  |||| | |||| | |||||||||    
T  55441141 aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatca 55441042  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatt 276  Q
     ||| || | | ||||||||| || || ||| | || | |||| |||||||||| ||| | ||||| |||| |||| ||  |||||||  |  |||||||    
T  55441041 cttagcatcaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagca-tattttcatcatatatcatt 55440943  T
Q  277 tttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattat-catcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||  |||| |||||||||| |||| ||| |||||   | ||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  55440942 ttctcatactttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaattt 55440848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 17191703 - 17191788
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17191703 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 17191788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 17204843 - 17204928
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17204843 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 17204928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19261069 - 19260821
Alignment:
Q  140 atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaa 239  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||  || ||||||| |||||||| | |||||| || || || ||| | || | |||| || | ||||||||| | |    
T  19261069 atgcatacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtata 19260970  T
Q  240 attcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatc-atcaattcatgcata 337  Q
    ||||||||||||| || | ||||||  || || |  |||| |||| |||||||||||||||  || |||||   | |||||||| || | ||||| |||     
T  19260969 attcaccaattgagcata-ttttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatc 19260871  T
Q  338 caaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataa 387  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19260870 taaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataa 19260821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 252
Target Start/End: Original strand, 14295404 - 14295568
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||||| |||  ||| |    
T  14295404 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaa 14295503  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga 252  Q
     ||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14295504 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattga 14295568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14814974 - 14814765
Alignment:
Q  161 catcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaat 259  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||| | |||||||||  |||| || || || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  14814974 catcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaat 14814875  T
Q  260 tttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttg 357  Q
    |  |||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||| ||     
T  14814874 t--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataatta 14814777  T
Q  358 gagcacgaattt 369  Q
     |||||||||||    
T  14814776 aagcacgaattt 14814765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 242
Target Start/End: Original strand, 16880114 - 16880242
Alignment:
Q  115 catttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcata 213  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  16880114 catttatcaccaataattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatctta 16880213  T
Q  214 actcaatccaaccacaacttagcaaaatt 242  Q
     | |||| |||| ||||| ||||| ||||    
T  16880214 tcacaattcaacaacaacatagcataatt 16880242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 153
Target Start/End: Original strand, 30152908 - 30152972
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc 153  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  30152908 tttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc 30152972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 30207378 - 30207462
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| | ||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30207378 tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 30207462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3576522 - 3576439
Alignment:
Q  286 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  3576522 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaatt 3576439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 379
Target Start/End: Original strand, 49232396 - 49232694
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatta 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||  | || | ||||||||   || |||||   || | | ||||| |||    
T  49232396 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagtta 49232495  T
Q  182 acaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttac 281  Q
    ||||  |  |||||||| ||| | |||||| | |||| | ||| || ||| || |||| |||| ||||| | || || ||||| |||||| ||||| |||    
T  49232496 acaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataa-tttcataacttaacatttatac 49232594  T
Q  282 ata-tttg-aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||| ||||||||    
T  49232595 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 49232694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 158
Target Start/End: Original strand, 33341847 - 33341916
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga 158  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  33341847 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatga 33341916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 41661702 - 41661812
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||   |    
T  41661702 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaag 41661801  T
Q  359 agcacgaattt 369  Q
    |||||||||||    
T  41661802 agcacgaattt 41661812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9590839 - 9590754
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattca-tgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| | ||||||||||||   | ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9590839 tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattt 9590754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14528286 - 14528145
Alignment:
Q  97 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 195  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||| | | || | ||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  14528286 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc 14528187  T
Q  196 aatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagca 237  Q
    ||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| |||||    
T  14528186 aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagca 14528145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 252
Target Start/End: Original strand, 17100645 - 17100782
Alignment:
Q  116 atttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataa 214  Q
    ||||| |||||||||   |||||| |||||||||||||| |||| | | || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| | ||     
T  17100645 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttat 17100744  T
Q  215 ctcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattga 252  Q
    | |||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17100745 cacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga 17100782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 252
Target Start/End: Original strand, 17101330 - 17101467
Alignment:
Q  116 atttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataa 214  Q
    ||||| |||||||||   |||||| |||||||||||||| |||| | | || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| | ||     
T  17101330 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttat 17101429  T
Q  215 ctcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattga 252  Q
    | |||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17101430 cacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga 17101467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 153
Target Start/End: Original strand, 19946664 - 19946728
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  19946664 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagc 19946728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47785017 - 47784920
Alignment:
Q  101 caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaa 197  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||| | |||||||| |||| |||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  47785017 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaa 47784920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12560510 - 12560362
Alignment:
Q  97 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 195  Q
    |||| ||||||||||   |||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| | || | | || ||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  12560510 aaactaccaacaacatctcatttctcaacatcaaatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatc 12560411  T
Q  196 aatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca 244  Q
     || || || |||||||| | |||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  12560410 cattgatcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattca 12560362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 12953126 - 12953210
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   |  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||    
T  12953126 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaatt 12953210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13301552 - 13301472
Alignment:
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaa 366  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||||| || |||||||||    
T  13301552 tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaa 13301472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13312208 - 13312128
Alignment:
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaa 366  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||||| || |||||||||    
T  13312208 tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaa 13312128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 252
Target Start/End: Original strand, 14301031 - 14301195
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||| | |||| | ||||||||| |||  ||| |    
T  14301031 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaacaa 14301130  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga 252  Q
     ||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14301131 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattga 14301195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14059482 - 14059214
Alignment:
Q  102 accaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatag 200  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||   ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | |||||||||  || |||| ||||||||||| |    
T  14059482 accaacaacatctcatttctcatcaacagatcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattg 14059383  T
Q  201 aacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaat 298  Q
    |||| ||||  || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || |  |||||  |  | |||||||  |||| |||||||||| |||    
T  14059382 aacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattgagcata--tttcaacatatgtcattttctcatactttgaacatgaaat 14059285  T
Q  299 ttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||| | || ||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14059284 ttctctaaaaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 14059214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 369
Target Start/End: Original strand, 15517795 - 15517878
Alignment:
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15517795 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 15517878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 131
Target Start/End: Original strand, 7853948 - 7853990
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7853948 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat 7853990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31412443 - 31412349
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  31412443 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcata 31412349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16934270 - 16934241
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934270 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 16934241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Original strand, 25058876 - 25058997
Alignment:
Q  260 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg 357  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||       
T  25058876 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 25058975  T
Q  358 gagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  25058976 gagcacgaatttagcaacaatt 25058997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 349
Target Start/End: Original strand, 34560061 - 34560126
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat 349  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34560061 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcat 34560126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 158
Target Start/End: Original strand, 45581597 - 45581666
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga 158  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||    
T  45581597 tttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatga 45581666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 16880285 - 16880369
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| ||||| || |||||   | ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16880285 tttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaatt 16880369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24929165 - 24928782
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24929165 catcaacaattaaccacaaccagaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcgtaattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 24929066  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatc 210  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  24929065 aatccatttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagac 24928966  T
Q  211 ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24928965 ataactcaatccaaccacaacttagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaat 24928866  T
Q  311 cttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24928865 catacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaat 24928782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16193973 - 16193707
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |    
T  16193973 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa 16193874  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  16193873 caatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaattatcatcaa 16193774  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  16193773 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaat 16193707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 118 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 43373735 - 43373468
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||    
T  43373735 ttctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctc 43373636  T
Q  218 aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa 317  Q
    ||   ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  43373635 aaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataa 43373536  T
Q  318 ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  43373535 ttatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccat 43373468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 128 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16405229 - 16404975
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |   |    
T  16405229 caattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaattta---a 16405133  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16405132 caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 16405033  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16405032 ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccat 16404975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 128 - 367
Target Start/End: Original strand, 24548988 - 24549227
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||   ||| |    
T  24548988 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaa 24549087  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24549088 taacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 24549187  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  24549188 ttcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaat 24549227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 128 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6774503 - 6774264
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||   ||| |    
T  6774503 caattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaa 6774404  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6774403 taacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 6774304  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  6774303 ttcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaat 6774264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
Q  133 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 232  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||| || | | ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataact 17345679  T
Q  233 tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat 332  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17345680 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 17345779  T
Q  333 gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17345780 gcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22907606 - 22907214
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcata--------attcaccaattt 92  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||| | |||||        |||||| |||||    
T  22907606 atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaattt 22907507  T
Q  93 cacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataa 191  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||    
T  22907506 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 22907407  T
Q  192 catcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaac 291  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||   ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||    
T  22907406 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac 22907308  T
Q  292 atgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22907307 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21844828 - 21844576
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||| ||||| | |||    
T  21844828 ttctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctc 21844729  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21844728 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcataca 21844629  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  21844628 atcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21844576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21852221 - 21851969
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| | |||    
T  21852221 ttctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctc 21852122  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  21852121 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcataca 21852022  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  21852021 atcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21851969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41507177 - 41507029
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41507177 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataactcaccaattccactaaaccaccaacaac 41507078  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga 158  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  41507077 aatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatga 41507029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 370
Target Start/End: Original strand, 30120734 - 30120971
Alignment:
Q  134 atgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaactt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||| | |||||   ||| |||||||    
T  30120734 atgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaactt 30120833  T
Q  234 agca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat 332  Q
    || | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||    
T  30120834 aggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcat 30120933  T
Q  333 gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  30120934 gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 30120971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 5238219 - 5238350
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5238219 cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 5238318  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5238319 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 24661379 - 24661248
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24661379 cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 24661280  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24661279 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 43685678 - 43685809
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43685678 cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 43685777  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43685778 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 222947 - 222754
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  222947 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc 222848  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 310  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  222847 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 736570 - 736377
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  736570 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc 736471  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 310  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  736470 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 860465 - 860272
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  860465 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc 860366  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 310  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  860365 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16674648 - 16674395
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| |||||| || || |  ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||    
T  16674648 ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc 16674549  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16674548 aacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 16674449  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  16674448 actaacataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaattta 16674395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 2544855 - 2544958
Alignment:
Q  28 aaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaa 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2544855 aaccacaacttatgattatgcataccatcatatttcaacaacaacatgtcgtaattcaccaatttcacaaaaccactaacaacagtccatttctcaacaa 2544954  T
Q  128 caat 131  Q
    ||||    
T  2544955 caat 2544958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 250
Target Start/End: Original strand, 23837153 - 23837325
Alignment:
Q  79 taattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  23837153 taattcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca 23837252  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt 250  Q
     ||| |||| | ||||||||| ||||| || || || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  23837253 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 23837325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 23217924 - 23218004
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23217924 catcaacaatcaaccacaactacaacttataatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 23218004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21198439 - 21198152
Alignment:
Q  84 caccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaa 182  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||  ||||||| ||| | |||||||| |||| |||| |||  |||||||| |||     
T  21198439 caccaattttaccaaaccaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttag 21198340  T
Q  183 caaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttac 281  Q
    |||| | ||||||||| ||||| || || || | |||| |||| ||||| || || |||||| ||||| || || ||||  ||  |  ||||| |||  |    
T  21198339 caacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataatt--caacatatatcactttctc 21198242  T
Q  282 ata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21198241 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 21198152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 22981244 - 22981318
Alignment:
Q  17 caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22981244 caatcaaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt 22981318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 26011656 - 26011741
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26011656 tttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 26011741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22321654 - 22321574
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22321654 catcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatgcattccatcacaatttaacaataacatgttataattcaccaatt 22321574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23226353 - 23226076
Alignment:
Q  94 acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataac 192  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||  |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  23226353 acaaaaccaacaacaacaatccatttctcataatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaac 23226254  T
Q  193 atcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaa 290  Q
    |||||| ||||| |  ||  | |  ||| |||| ||||| || || ||||| | || |||| || ||  |||| || ||| || || |||||| |||  |    
T  23226253 atcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcaatcatttgagcataa--ttcataagttaacacttatacatacttttga 23226156  T
Q  291 catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||| || |||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23226155 catgcaaattcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Original strand, 41246614 - 41246733
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |     
T  41246614 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac 41246713  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaat 198  Q
    |||||||| | |||||||||    
T  41246714 ttaacaacaacaacatcaat 41246733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 691965 - 691909
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 310  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  691965 cacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 691909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 17285366 - 17285450
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17285366 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattggagcacgaatt 17285450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24717159 - 24717111
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24717159 ttcaccaattttacaaaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaa 24717111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22006554 - 22006256
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatta 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||  | || | ||||||||   ||||||||   || | ||||||| |||    
T  22006554 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcagtccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaataacatcagtta 22006455  T
Q  182 acaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttac 281  Q
    ||||  |  |||||||| ||| | |||||| | |||| | ||| || ||| || |||| |||| ||||| | || || ||||| |||||| ||||| |||    
T  22006454 acaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataa-tttcataacttaacatttatac 22006356  T
Q  282 ata-tttg-aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||| ||||||||    
T  22006355 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 22006256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22736108 - 22735958
Alignment:
Q  101 caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaata 199  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| | | |||| ||||||||| ||| |||  | |||||||||     
T  22736108 caccaacaacaactcatttttcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagttagcaagaacaacatcaatt 22736009  T
Q  200 gaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt 250  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||    
T  22736008 gaacatgaatcttatcacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatt 22735958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 15933460 - 15933545
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  15933460 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattt 15933545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 25296320 - 25296405
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| |||||||||||||    | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25296320 tttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattt 25296405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 25758340 - 25758425
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| |||||||||||||    | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25758340 tttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattt 25758425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13662561 - 13662263
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatta 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| || |||| ||| | |||| ||||||||   ||||||||   || | | ||||| |||    
T  13662561 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttagttctcatcatcaatccataattatgtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagtta 13662462  T
Q  182 acaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttac 281  Q
    ||||  |  |||||||| ||| | |||||| | |||| | ||| || ||| || |||| |||| ||||| | || || ||||| |||||| ||||| |||    
T  13662461 acaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataa-tttcataacttaacatttatac 13662363  T
Q  282 ata-tttg-aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||| | | | || |||||  ||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||| ||||||||    
T  13662362 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 13662263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18261695 - 18261471
Alignment:
Q  146 acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcac 245  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||||| | |||||||||  |||| || ||  | | |||| |||| ||||| ||||| ||||||     
T  18261695 acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa 18261596  T
Q  246 caatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaac 342  Q
    ||||| || |||||||  |||||  ||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| |||| |  |||||    
T  18261595 caattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaagatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaac 18261498  T
Q  343 atatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||    
T  18261497 atatcatcataactagagcacgaattt 18261471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Original strand, 17285223 - 17285321
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||| |  |||  |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  17285223 aattcaccaattttgcaaaactaccaacaacaactcatttctcatcctcaagtcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca 17285321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 5238126 - 5238203
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca 78  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5238126 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 5854776 - 5854861
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||||||  |||||||||||||   | ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5854776 tttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 5854861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15319455 - 15319414
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15319455 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 15319414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15499824 - 15499783
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15499824 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 15499783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22089090 - 22089049
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22089090 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 22089049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Original strand, 23149985 - 23150026
Alignment:
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23149985 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 23150026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24661472 - 24661395
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca 78  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24661472 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31194615 - 31194490
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||| ||| ||||||  ||||||| |||   |||||||| |||| |||||||| |||| ||||     
T  31194615 aattcaccaattttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcaccaacaaatcatgaatcatgtgcacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcat 31194516  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaaca 204  Q
    ||| |||| | ||||||||| |||||    
T  31194515 ttagcaacaacaacatcaattgaaca 31194490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39447057 - 39446892
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||   ||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| |||| | || | | |||||||||     
T  39447057 aattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcataatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcac 39446958  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca 244  Q
    ||| |||| | ||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  39446957 ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 39446892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21259685 - 21259637
Alignment:
Q  22 aaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaaca 70  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21259685 aaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaaca 21259637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 353
Target Start/End: Original strand, 33172322 - 33172459
Alignment:
Q  217 caatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttg 314  Q
    |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || |||||||  |||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   |     
T  33172322 caattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatt 33172419  T
Q  315 caattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  33172420 caattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcata 33172459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 146 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 45559161 - 45558953
Alignment:
Q  146 acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcac 245  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||||| | |||||||||  |||| || ||  | | |||| |||| ||||| ||||| ||||||     
T  45559161 acccaagctatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa 45559062  T
Q  246 caatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatca-tcaattcatgcatacaaac 342  Q
    ||||| || |||||||  |||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| | | |||||| |  |||||    
T  45559061 caattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaac 45558964  T
Q  343 atatcatcata 353  Q
    |||||||||||    
T  45558963 atatcatcata 45558953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23151919 - 23151833
Alignment:
Q  284 atttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatca-tcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23151919 atttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattt 23151833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37653726 - 37653616
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||      
T  37653726 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcagcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgcatacaaacacatcaccataattaa 37653627  T
Q  359 agcacgaattt 369  Q
    |||||||||||    
T  37653626 agcacgaattt 37653616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 3431577 - 3431548
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431577 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 3431548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 13721224 - 13721195
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13721224 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 13721195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19993346 - 19993249
Alignment:
Q  79 taattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat 175  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| ||| |||| | |||| | |||||||    
T  19993346 taattcaccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacat 19993249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Original strand, 23158367 - 23158408
Alignment:
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23158367 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcatgaattt 23158408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 23837360 - 23837445
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| |||||||  |||||   | ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23837360 tttgaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattt 23837445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 29759919 - 29759972
Alignment:
Q  101 caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  29759919 caccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc 29759972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 43685585 - 43685662
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca 78  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  43685585 atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Original strand, 171794 - 172177
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  171794 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgttgtaattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 171893  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatc 210  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  171894 aatccatttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatc 171993  T
Q  211 ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 310  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  171994 gtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaat 172093  T
Q  311 cttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  172094 catacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaat 172177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Original strand, 177497 - 177880
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177497 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgttgtaattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 177596  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatc 210  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  177597 aatccatttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatc 177696  T
Q  211 ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 310  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  177697 gtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaat 177796  T
Q  311 cttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  177797 catacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaat 177880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 70913 - 70840
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag 152  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  70913 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaag 70840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Original strand, 271914 - 272297
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  271914 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaactacatgtcttaattcactaatttcacaaaaccaccaacaac 272013  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatc 210  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  272014 aatccatttctctataacaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatc 272113  T
Q  211 ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  272114 ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaat 272213  T
Q  311 cttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  272214 catacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaat 272297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37209 - 36913
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37209 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 37110  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37109 taacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 37010  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37009 aacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccat 36913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 462744 - 463010
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  462744 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaa 462843  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  462844 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa 462943  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  462944 ttcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaat 463010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36982737 - 36982441
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  36982737 tttcactaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 36982638  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982637 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36982538  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36982537 aacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 36982441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 8891199 - 8891505
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||| || |||||| ||| |||||||||| || ||  |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891199 aattcatcattttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 8891298  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8891299 ttaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 8891398  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  8891399 ttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 8891498  T
Q  379 tatccat 385  Q
    |||||||    
T  8891499 tatccat 8891505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 87 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19795004 - 19794704
Alignment:
Q  87 caatttcac-aaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaaca 184  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  19795004 caatttcaccaaaaacaccaacaaaaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacg 19794905  T
Q  185 accataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata 284  Q
       ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  19794904 gaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttccta 19794805  T
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19794804 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatcca 19794705  T
Q  385 t 385  Q
    |    
T  19794704 t 19794704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20627570 - 20627308
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | |||||   ||| |    
T  20627570 caattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaa 20627471  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20627470 caacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 20627371  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatca 390  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20627370 ttcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatca 20627308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24341646 - 24341390
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  24341646 caattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaa 24341547  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24341546 caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 24341447  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  24341446 ttcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatcca 24341390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43643214 - 43642958
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||   ||  |    
T  43643214 caattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataa 43643115  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  43643114 caactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 43643015  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43643014 ttcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatcca 43642958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 101 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25265675 - 25265390
Alignment:
Q  101 caccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaata 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||     
T  25265675 caccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaatt 25265576  T
Q  200 gaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatt 299  Q
    ||||| |  ||  | |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25265575 gaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatt 25265476  T
Q  300 tcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25265475 tcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 128 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7508101 - 7507894
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaat-agaacaagaatcataactcaatccaacc 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||  |||     
T  7508101 caatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aaca 7508003  T
Q  227 acaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca 326  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7508002 acaacttagccaaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 7507903  T
Q  327 attcatgca 335  Q
    |||||||||    
T  7507902 attcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17396920 - 17396653
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| || || || ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||    
T  17396920 ttctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc 17396821  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17396820 aaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcataca 17396721  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17396720 atcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 25601911 - 25602066
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25601911 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 25602010  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatca 165  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  25602011 aatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatca 25602066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19886917 - 19886664
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  19886917 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc 19886818  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | |||||||||| || | |||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  19886817 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 19886718  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  19886717 actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 19886664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19689532 - 19689401
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19689532 cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 19689433  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19689432 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 23820203 - 23820334
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23820203 cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 23820302  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23820303 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14906571 - 14906440
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14906571 cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 14906472  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14906471 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 20015143 - 20015274
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20015143 cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaa 20015242  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20015243 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Original strand, 22274681 - 22274738
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22274681 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaattcatgaat 22274738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 369
Target Start/End: Original strand, 19666498 - 19666775
Alignment:
Q  94 acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataac 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| |||| | |||    
T  19666498 acaaaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaacaac 19666597  T
Q  193 atcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaa 290  Q
    |||||| ||||| |  ||  | |  ||| |||  ||||| ||||| ||||| |||| |||| || ||  |||| || ||| || || |||||| ||||||    
T  19666598 atcaattgaacatggttctcatcataattcaataacaacatagcataattcaaccatttgagcataa--ttcataagttaacacttatacatactttgaa 19666695  T
Q  291 catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||| || |||||||| ||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  19666696 catgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattt 19666775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 368
Target Start/End: Original strand, 67958 - 68238
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || |||  ||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||| |||| |    
T  67958 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 68057  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tt 286  Q
     ||||||||| ||||| ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || || |  |||||  |  ||||| |||  |||| ||    
T  68058 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata--tttcaacatatatcactttctcatactt 68155  T
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  68156 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 68238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 67859 - 67933
Alignment:
Q  17 caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  67859 caattaaccacaacgacaaattataatcatacattccatcatattacaacaacaacatgtcataaatcaccaatt 67933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Original strand, 22283914 - 22283971
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  22283914 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaat 22283971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 24884848 - 24884933
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattc-atgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24884848 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 24884933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 25305405 - 25305526
Alignment:
Q  84 caccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaa 182  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||||| |||     
T  25305405 caccaatttcgcaaaactaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttag 25305504  T
Q  183 caaccataacatcaatagaaca 204  Q
    | || | ||||||||| |||||    
T  25305505 ccacaacaacatcaattgaaca 25305526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24571583 - 24571409
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||| |||| | |||| | |||||||||    
T  24571583 aattcaccaatttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagccaagc-atgagttatcatcaacaacatca 24571485  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga 252  Q
     |||||||| | ||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||    
T  24571484 cttaacaacaacaacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattga 24571409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 91
Target Start/End: Original strand, 7321586 - 7321644
Alignment:
Q  33 caacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7321586 caacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt 7321644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19433614 - 19433498
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacc 187  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||  ||| ||||     
T  19433614 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaaca 19433515  T
Q  188 ataacatcaatagaaca 204  Q
    | ||||||||| |||||    
T  19433514 acaacatcaattgaaca 19433498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 366
Target Start/End: Original strand, 19660044 - 19660124
Alignment:
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaa 366  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  19660044 tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaa 19660124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19669191 - 19669116
Alignment:
Q  288 gaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagca 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19669191 gaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagca 19669116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 353
Target Start/End: Original strand, 9636761 - 9636976
Alignment:
Q  139 tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaa 238  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||||| | |||||||||  |||| || ||  | | |||| |||| ||||| |||||     
T  9636761 tatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcac 9636860  T
Q  239 aattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgca 335  Q
    |||||| ||||| || || ||||  |||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| |    
T  9636861 aattcaacaattagagcataatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgta 9636958  T
Q  336 tacaaacatatcatcata 353  Q
    | ||||||||||||||||    
T  9636959 ttcaaacatatcatcata 9636976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22579933 - 22579863
Alignment:
Q  298 tttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||||||||||   | |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22579933 tttcaccaacaacaattcaattatcataacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt 22579863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Original strand, 12728352 - 12728393
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12728352 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 12728393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24686077 - 24686036
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24686077 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 24686036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Original strand, 34824435 - 34824476
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34824435 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 34824476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36890966 - 36890869
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaac 186  Q
    |||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||| ||||    
T  36890966 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaac 36890869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22775290 - 22775206
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| | ||||||||||||   | |||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22775290 tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22775206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780584
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| | ||||||||||||   | |||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22780668 tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22780584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 368
Target Start/End: Original strand, 43646059 - 43646139
Alignment:
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  43646059 aacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaatt 43646139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 198
Target Start/End: Original strand, 32465822 - 32465933
Alignment:
Q  88 aatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaac 186  Q
    |||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | | ||||||    
T  32465822 aatttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaac 32465921  T
Q  187 cataacatcaat 198  Q
     | |||||||||    
T  32465922 aacaacatcaat 32465933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 28974003 - 28974124
Alignment:
Q  79 taattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 176  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||   ||||||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | |||||||     
T  28974003 taattcaccaattttcactaaaacaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg 28974102  T
Q  177 aattaacaaccataacatcaat 198  Q
    | ||| |||| | |||||||||    
T  28974103 acttagcaacaacaacatcaat 28974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 42178265 - 42178236
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178265 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 42178236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 368
Target Start/End: Original strand, 25305637 - 25305677
Alignment:
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25305637 ttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt 25305677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19469
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  19173 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 19272  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19273 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 19372  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19373 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Original strand, 21257 - 21553
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  21257 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 21356  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21357 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 21456  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21457 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Original strand, 48565 - 48870
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  48565 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 48664  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  48665 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttg 48764  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataat 388  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  48765 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 48864  T
Q  389 caaaat 394  Q
    ||||||    
T  48865 caaaat 48870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 351
Target Start/End: Original strand, 36089 - 36323
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |  ||||| |||||  ||||||||| || ||||| |||||| | |||    
T  36089 ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctc 36188  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  36189 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcataca 36288  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 351  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36289 actaacatcaattcatacatacaaacataacatca 36323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 154303 - 154262
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  154303 ttcaccaatttcacaaaaccaccatcaacaatttatttctca 154262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Original strand, 23506922 - 23507237
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23506922 aattcatcattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaa 23507021  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23507022 ttaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttt 23507121  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  23507122 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaat 23507221  T
Q  379 tatccataatcaaaat 394  Q
    ||||||||| ||||||    
T  23507222 tatccataagcaaaat 23507237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27182845 - 27182547
Alignment:
Q  88 aatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaac 186  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27182845 aatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagc 27182746  T
Q  187 cataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  27182745 cataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatt 27182646  T
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27182645 tgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 27182547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18531324 - 18531068
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  18531324 caattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaa 18531225  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18531224 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 18531125  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18531124 ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcca 18531068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22054090 - 22053834
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  22054090 caattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaa 22053991  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  22053990 caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaa 22053891  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca 384  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22053890 ttcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcca 22053834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
Q  133 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 232  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | |  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgact 34939387  T
Q  233 tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat 332  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34939388 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 34939487  T
Q  333 gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34939488 gcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29188486 - 29188290
Alignment:
Q  171 aacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaactt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||   ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29188486 aacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaactt 29188387  T
Q  271 atcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  29188386 atcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaat 29188290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17471956 - 17471586
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17471956 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcaccaaaacaccaacaac 17471857  T
Q  111 aa-tccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaat 209  Q
    || || | |||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| | ||||    
T  17471856 aattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaat 17471757  T
Q  210 cataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg-aacatgtaatttcaccaac 307  Q
     | | || | | ||| || ||| || |||| |||| ||||| |  | || |||||  ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  17471756 tacatcttatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataa-tttcattacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccac 17471658  T
Q  308 aatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    || | | | || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  17471657 aaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaatt 17471586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 128 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43443641 - 43443398
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||| ||| | |||||  |||| |    
T  43443641 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaa 43443542  T
Q  228 caacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca 326  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||    
T  43443541 caacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 43443442  T
Q  327 attcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  43443441 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 43443398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18778248 - 18777995
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  18778248 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc 18778149  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  18778148 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 18778049  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  18778048 actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 18777995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22366737 - 22366484
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  22366737 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactc 22366638  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  22366637 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 22366538  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  22366537 actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 22366484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 25426624 - 25426877
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  25426624 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc 25426723  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | |||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  25426724 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 25426823  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  25426824 actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 25426877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Original strand, 27009837 - 27010089
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||    
T  27009837 ttctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc 27009936  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||    
T  27009937 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcataca 27010036  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  27010037 atcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 27010089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 12370 - 12623
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  12370 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc 12469  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | |||||||||| || | |||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  12470 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 12569  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  12570 actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 12623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 2031697 - 2031845
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  2031697 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataactcaccaattccattaaaccaccaacaac 2031796  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga 158  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  2031797 aatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatga 2031845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 19499895 - 19500148
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  19499895 ttctcatcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc 19499994  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | |||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  19499995 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 19500094  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  19500095 actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 19500148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21073851 - 21073598
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  21073851 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactc 21073752  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | |||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  21073751 aaattaacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 21073652  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  21073651 actaacatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 21073598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4200226 - 4200007
Alignment:
Q  133 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||| | |||||  |||| |||||     
T  4200226 catgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaaca 4200127  T
Q  233 tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattca 331  Q
    ||  | ||||||||||||| | || ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  4200126 taagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattca 4200027  T
Q  332 tgcatacaaacatatcatca 351  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  4200026 tgcatacaaacataacatca 4200007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 20623101 - 20623232
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20623101 cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 20623200  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20623201 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21233659 - 21233528
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21233659 cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 21233560  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21233559 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25900537 - 25900408
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25900537 cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 25900438  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatcc 383  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25900437 gttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 16536329 - 16536460
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16536329 cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 16536428  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16536429 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 37052876 - 37053007
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37052876 cacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 37052975  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37052976 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 25004863 - 25004943
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25004863 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcatttcatcatattccaacaacaacatgtcataaatcaccaatt 25004943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 382
Target Start/End: Original strand, 32950699 - 32950955
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||||| |||| | |   ||||||||| ||||| |||||| | |||  | |||| |    
T  32950699 caatccatgaatatgcagacccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaa 32950798  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttat-catttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcat 324  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||   | ||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  32950799 caacatagtaaaattcaccatttgagcacaattt-cataactttgacctttatacatactttgaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcat 32950897  T
Q  325 caattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatc 382  Q
    ||| |||| || || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  32950898 caaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatc 32950955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21310794 - 21310709
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21310794 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 21310709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 369
Target Start/End: Original strand, 29918129 - 29918212
Alignment:
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29918129 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 29918212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 369
Target Start/End: Original strand, 432479 - 432710
Alignment:
Q  139 tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaa 238  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||| |||| |||| ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| |     
T  432479 tatgaatacccaagccaggaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtat 432578  T
Q  239 aattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgca 335  Q
    |||||| ||||| || || ||||  ||  |  |||||||||  |||| |||||||||| | ||||||||||||   | ||||||||| ||| | ||||||    
T  432579 aattcatcaatttgagcataatt--caacatatatcattttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgca 432676  T
Q  336 tacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  432677 ttcaaacatatcatcataattggagcgcgaattt 432710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23981614 - 23981516
Alignment:
Q  273 catttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||   | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23981614 catttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaattt 23981516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 19862371 - 19862456
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19862371 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 19862456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21297260 - 21297175
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21297260 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagaggacgaattt 21297175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5450928 - 5450844
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  5450928 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt 5450844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21222693 - 21222609
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   |  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21222693 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt 21222609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29190553 - 29190481
Alignment:
Q  96 aaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaac 167  Q
    |||| ||||||||||||| ||  ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29190553 aaaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaac 29190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 369
Target Start/End: Original strand, 22885806 - 22885889
Alignment:
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22885806 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattaaagcacgaattt 22885889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1219816 - 1219775
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1219816 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 1219775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 11342661 - 11342714
Alignment:
Q  101 caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  11342661 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc 11342714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 20623008 - 20623085
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca 78  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20623008 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21233752 - 21233675
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca 78  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21233752 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 368
Target Start/End: Original strand, 21617181 - 21617262
Alignment:
Q  288 gaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21617181 gaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt 21617262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22883380 - 22883339
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22883380 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 22883339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1168474 - 1168204
Alignment:
Q  101 caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaata 199  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | ||| |||| | |||||||||     
T  1168474 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 1168375  T
Q  200 gaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaat 298  Q
    || || ||| | || | |||| || | ||||| | ||| |||||||||||||| ||  |||||||  |  |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  1168374 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagca-tattttcaacatatatcattttctcatactttgaacatgtaat 1168276  T
Q  299 ttcaccaacaatcttgcaattat-catcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |  || ||||| | | | ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  1168275 tcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcatgaattt 1168204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 368
Target Start/End: Original strand, 16595699 - 16595753
Alignment:
Q  315 caattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16595699 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 16595753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26559925 - 26559815
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || ||||||||| |||||||   |    
T  26559925 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaag 26559826  T
Q  359 agcacgaattt 369  Q
    |||||||||||    
T  26559825 agcacgaattt 26559815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 9730679 - 9730650
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9730679 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 9730650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10778089 - 10777968
Alignment:
Q  260 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg 357  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||       
T  10778089 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 10777990  T
Q  358 gagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  10777989 gagcacgaatttagcaacaatt 10777968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Original strand, 23514521 - 23514550
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514521 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 23514550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Original strand, 23514698 - 23514819
Alignment:
Q  260 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg 357  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||       
T  23514698 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 23514797  T
Q  358 gagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  23514798 gagcacgaatttagcaacaatt 23514819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Original strand, 4865218 - 4865338
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatg-attcatcaaccacaacatca 177  Q
    ||||||||| |||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||| | | |||| | ||||||| |    
T  4865218 aattcaccattttcatcaaaacaccaacaacacctcatctctcaacaacaattcaagaattatgcaaacccaagccatgaaattatcatcaacaacatga 4865317  T
Q  178 attaacaaccataacatcaat 198  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  4865318 ataaacaaccataacaacaat 4865338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 368
Target Start/End: Original strand, 23494125 - 23494165
Alignment:
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23494125 ttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaatt 23494165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 367
Target Start/End: Original strand, 24084214 - 24084322
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||| || |    
T  24084214 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgtaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattag 24084313  T
Q  359 agcacgaat 367  Q
     ||||||||    
T  24084314 ggcacgaat 24084322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 28902353 - 28902437
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||| | | ||||||||||||   | ||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28902353 tttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 28902437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 28938748 - 28938832
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||| | | ||||||||||||   | ||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28938748 tttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 28938832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 13246387 - 13246693
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246387 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 13246486  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13246487 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 13246586  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  13246587 ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaat 13246686  T
Q  379 tatccat 385  Q
    |||||||    
T  13246687 tatccat 13246693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 54118550 - 54118244
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118550 aattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 54118451  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  54118450 ttaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattg 54118351  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  54118350 ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaat 54118251  T
Q  379 tatccat 385  Q
    |||||||    
T  54118250 tatccat 54118244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15675346 - 15675090
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  15675346 caattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaa 15675247  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15675246 caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 15675147  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15675146 ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcca 15675090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 358
Target Start/End: Original strand, 31115635 - 31115865
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  31115635 caattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaa 31115734  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31115735 caacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 31115834  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31115835 ttcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 216 - 394
Target Start/End: Original strand, 121983 - 122161
Alignment:
Q  216 tcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgc 315  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  121983 tcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttac 122082  T
Q  316 aattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  122083 aattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaat 122161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 26680071 - 26680463
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcacc--------aattt 92  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||| | ||||| |||| |        |||||    
T  26680071 atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcgattcccaaattt 26680170  T
Q  93 cacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataa 191  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||    
T  26680171 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 26680270  T
Q  192 catcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaac 291  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  26680271 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaac 26680369  T
Q  292 atgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26680370 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 190 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104251
Alignment:
Q  190 aacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttga 289  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattga 10104346  T
Q  290 acatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca 384  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10104345 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatcca 10104251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Original strand, 10644215 - 10644467
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||| | |||    
T  10644215 ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctc 10644314  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||  |||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  10644315 aaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcataca 10644414  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  10644415 attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 10644467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13048474 - 13048221
Alignment:
Q  133 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || |  ||| | |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | ||||| | ||| ||||||    
T  13048474 catgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaacaact 13048375  T
Q  233 tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattca 331  Q
    ||| | ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||    
T  13048374 taggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatca 13048275  T
Q  332 tgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13048274 tgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 34395144 - 34395309
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34395144 catcaacaattaaccacaatcacaacttatgatcaagcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcgtaattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 34395243  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat 175  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| | |||||||    
T  34395244 aatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacat 34395309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 47357650 - 47357903
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  47357650 ttctcatcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc 47357749  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  47357750 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 47357849  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  47357850 actaacatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 47357903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 10488694 - 10488825
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10488694 cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 10488793  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10488794 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16328057 - 16327926
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16328057 cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 16327958  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16327957 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 128 - 221
Target Start/End: Original strand, 111401 - 111494
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatc 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  111401 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 111494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885570
Alignment:
Q  190 aacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg 288  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||  ||||| |||||| ||||    
T  40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatactttg 40885651  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  40885650 aacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 384
Target Start/End: Original strand, 33240893 - 33240962
Alignment:
Q  315 caattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca 384  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33240893 caatcatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcca 33240962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41166233 - 41165947
Alignment:
Q  84 caccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||     
T  41166233 caccaatttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttag 41166134  T
Q  183 caaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgaacacaattttcacaacttatcatttttac 281  Q
    |||| | ||||||||| ||||| || || |  | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||  ||||  |  ||||| |||  |    
T  41166133 caacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa--ttcaacatatatcactttctc 41166036  T
Q  282 ata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  41166035 atactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaatatattatcataattggagcacaaatt 41165947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5682824 - 5682753
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  5682824 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag 5682753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 82
Target Start/End: Original strand, 19559422 - 19559481
Alignment:
Q  23 accacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataat 82  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19559422 accacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcaacaacaacatgtcataat 19559481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 34177830 - 34177767
Alignment:
Q  28 aaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34177830 aaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacaagtcataattcaccaatt 34177767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18494620 - 18494329
Alignment:
Q  80 aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| | | || | |||||||||    
T  18494620 aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatca 18494521  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatt 276  Q
     |||||||| | | || |||| || || ||||| |||| |||| |||| ||||| |||||  || | ||||||||| ||||  |||||  |  || ||||    
T  18494520 cttaacaacaacagcaacaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcaca--tttcaacatataccatt 18494423  T
Q  277 ttt-acata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||  |||| ||||| |||| | ||||||||||||   | |||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18494422 tttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaatt 18494329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25119505 - 25119457
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119505 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa 25119457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 368
Target Start/End: Original strand, 15044794 - 15045074
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| || ||||||||||  |||||||| || |||  ||||| | ||| | |||||||| |||| |||||| | ||||||||| ||| |||| |    
T  15044794 tttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaa 15044893  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tt 286  Q
     ||||||||| ||||| ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || || ||||  ||  |  ||||| |||  |||| ||    
T  15044894 caacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatactt 15044991  T
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15044992 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 15045074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13809766 - 13809511
Alignment:
Q  115 catttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcata 213  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||| |||| | |||| | ||||||||||||| |||| | ||||||||| || || ||||| ||    
T  13809766 catttctcaacaaccaatcatgaatcatgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatcatgaatctta 13809667  T
Q  214 actcaatccaaccacaacttagcaaaattcacc-aattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatc 311  Q
     | |||| |||| ||||| ||||| |||||| | |||||| || |  |||||  |  || ||||||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||      
T  13809666 tcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcata--tttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaaatctcaccaacaaca 13809569  T
Q  312 ttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
     | |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13809568 attcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 13809511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 14901187 - 14901307
Alignment:
Q  79 taattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |  |||| |||||||| ||| |||||    
T  14901187 taatttaccaattttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatca 14901286  T
Q  178 attaacaaccataacatcaat 198  Q
     ||| |||| | |||||||||    
T  14901287 cttagcaacaacaacatcaat 14901307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 381
Target Start/End: Original strand, 7850005 - 7850259
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||| |||   ||  |||||||| | |||||||||  ||||  | ||||| |||||| |||| |    
T  7850005 caattcatgattatgtatactcaagtcatgattcatcaacaacatactcctttaacaacaacaacatcaatgaaacacaattcatatctcaattcaacaa 7850104  T
Q  228 caacttagcaaaatt-caccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca 326  Q
      ||||||||||||| || || |||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||  |||| |||||||||||   || || ||||||    
T  7850105 tcacttagcaaaatttcatcacttgagcacaattttcataacttcacattttcacataattggacatacaattccaccaacaatcacacagttttcatca 7850204  T
Q  327 attcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattat 381  Q
    || ||| ||| |||||||| ||||    |||||||||||||||| || |||||||    
T  7850205 atacattcattcaaacataacatctccattggagcacgaatttaacagcaattat 7850259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17145896 - 17145655
Alignment:
Q  139 tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaa 238  Q
    |||| |||||||||  || ||||| | || ||||||||| |||| | | | ||||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| ||||| || |||    
T  17145896 tatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaa 17145797  T
Q  239 aattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcat 336  Q
    ||||||| ||||||  | ||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||| |     
T  17145796 aattcactaattgagtataattt-cacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgtac 17145698  T
Q  337 acaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    |  || ||| ||||| |||  ||||||||||||| || |||||    
T  17145697 aagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaatt 17145655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18238381 - 18238173
Alignment:
Q  146 acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcac 245  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||||| | |||||||||  |||| || ||  | | |||| |||| ||||| ||||| ||||||     
T  18238381 acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa 18238282  T
Q  246 caatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaat-tcatgcatacaaac 342  Q
    ||||| || |||||||  |||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||| ||||| || |||||    
T  18238281 caattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaac 18238184  T
Q  343 atatcatcata 353  Q
    |||||||||||    
T  18238183 atatcatcata 18238173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Original strand, 8374525 - 8374722
Alignment:
Q  139 tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaa 238  Q
    |||| |||||||||| || ||||| | || ||||||||| |||| | | | ||||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| ||||| ||  ||    
T  8374525 tatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatattaa 8374624  T
Q  239 aattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgca 335  Q
    ||||||| ||||||  | ||||| || |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || ||||||||||||||||    
T  8374625 aattcactaattgagtataattt-cataacttaacatttatacatactttgaagcatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 8374722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 18276596 - 18276681
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   |  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18276596 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattt 18276681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 47535150 - 47535065
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  47535150 tttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 47535065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 153
Target Start/End: Original strand, 14951728 - 14951792
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc 153  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  14951728 tttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc 14951792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15013365 - 15013282
Alignment:
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  15013365 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaa-catatcatcataattagagcacgaattta 15013282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15109434 - 15109350
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  15109434 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt 15109350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23270225 - 23270106
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |     
T  23270225 aattcaccattttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac 23270126  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaat 198  Q
    |||||||| | |||||||||    
T  23270125 ttaacaacaacaacatcaat 23270106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7964802 - 7964712
Alignment:
Q  280 acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  7964802 acatacttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattt 7964712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 252
Target Start/End: Original strand, 16732124 - 16732298
Alignment:
Q  80 aattcaccaa-tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |    
T  16732124 aattcaccaagtttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatga 16732223  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattga 252  Q
     ||| |||| |  |||||||| || || ||| | || | |||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16732224 cttagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga 16732298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Original strand, 18168930 - 18168971
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18168930 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 18168971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 47535337 - 47535236
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||  |||||| |||| | || ||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  47535337 aattcaccaattttacaaaaccatcaacaacaactcatttctcattaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacgtcaa 47535238  T
Q  179 tt 180  Q
    ||    
T  47535237 tt 47535236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40905034 - 40904934
Alignment:
Q  271 atcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  40905034 atcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatcataactagagcacgaatt 40904935  T
Q  369 t 369  Q
    |    
T  40904934 t 40904934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Original strand, 44055871 - 44055967
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat 175  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | |||||||    
T  44055871 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 44055967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10104488 - 10104449
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaac 167  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10104488 caattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac 10104449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 30232581 - 30232498
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||   | |||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30232581 tttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt 30232498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 91
Target Start/End: Original strand, 9795314 - 9795344
Alignment:
Q  61 ttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9795314 ttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 9795344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41256479 - 41256370
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| || |    
T  41256479 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattc-aacatttcatcataattag 41256381  T
Q  359 agcacgaattt 369  Q
    |||||||||||    
T  41256380 agcacgaattt 41256370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7185945 - 7185844
Alignment:
Q  270 tatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||   | |||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||    
T  7185945 tatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaat 7185846  T
Q  368 tt 369  Q
    ||    
T  7185845 tt 7185844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 335
Target Start/End: Original strand, 22738406 - 22738483
Alignment:
Q  260 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgca 335  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || ||||||||||||||||    
T  22738406 tttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 22738483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 90 - 382
Target Start/End: Original strand, 148688 - 148981
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  148688 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaacca 148787  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148788 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 148887  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatc 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  148888 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatc 148981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Original strand, 8855 - 9111
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||  ||||||| |||||| |||| |    
T  8855 caattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaa 8954  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  8955 caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 9054  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9055 ttcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatcca 9111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 85670 - 85779
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| || |    
T  85670 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatt-aaacatatcatcataattag 85768  T
Q  359 agcacgaattt 369  Q
    |||||||||||    
T  85769 agcacgaattt 85779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 352
Target Start/End: Original strand, 53508 - 53576
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaat-tcatgcatacaaacatatcatcat 352  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  53508 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcat 53576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 80 - 387
Target Start/End: Original strand, 1081 - 1389
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1081 aattcatcattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaa 1180  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1181 ttaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttt 1280  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1281 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 1380  T
Q  379 tatccataa 387  Q
    |||||||||    
T  1381 tatccataa 1389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3839 - 3573
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |    
T  3839 caatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa 3740  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3739 caacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 3640  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3639 ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaat 3573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 101 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5345 - 5061
Alignment:
Q  101 caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatag 200  Q
    ||||||||||| || | |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5345 caccaacaacattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattg 5246  T
Q  201 aacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattt 300  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5245 aacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtacttt 5146  T
Q  301 caccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5145 caccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccat 5061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 123460 - 123164
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123460 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 123361  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  123360 taacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 123261  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  123260 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccat 123164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 255105 - 255009
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat 175  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| | |||||||    
T  255105 aattcacaaatttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacat 255009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 261711 - 261615
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat 175  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| | |||||||    
T  261711 aattcacaaatttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacat 261615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11581045 - 11580739
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||  |  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581045 aattcatcattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcgtcctcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 11580946  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  11580945 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 11580846  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  11580845 ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataat 11580746  T
Q  379 tatccat 385  Q
    |||||||    
T  11580745 tatccat 11580739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13037320 - 13037014
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037320 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 13037221  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    |||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13037220 ttaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 13037121  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    | | |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13037120 ttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 13037021  T
Q  379 tatccat 385  Q
    |||||||    
T  13037020 tatccat 13037014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 133 - 394
Target Start/End: Original strand, 16211777 - 16212038
Alignment:
Q  133 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||   ||| ||||||    
T  16211777 catgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 16211876  T
Q  233 tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16211877 tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcat 16211976  T
Q  333 gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  16211977 gcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaat 16212038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 128 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 47481288 - 47481031
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  47481288 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaa 47481189  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  47481188 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaa 47481089  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47481088 ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 3059972 - 3060238
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3059972 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaa 3060071  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  3060072 caacttaacaaaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaa 3060171  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    || ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3060172 ttaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaat 3060238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Original strand, 36052634 - 36052927
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052634 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 36052733  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
     ||||||||| |||||||||||| | |||||   |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052734 caacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36052830  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  36052831 aacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccat 36052927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 118 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18254102 - 18253841
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  18254102 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctc 18254003  T
Q  218 aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa 317  Q
    ||   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18254002 aaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 18253903  T
Q  318 ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  18253902 ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaatt 18253841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 93 - 384
Target Start/End: Original strand, 13320984 - 13321278
Alignment:
Q  93 cacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataa 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13320984 cacaaaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 13321083  T
Q  192 catcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca-caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttga 289  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||| |||||| |||||    
T  13321084 catcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttga 13321182  T
Q  290 a-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca 384  Q
    | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13321183 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 128 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16479207 - 16478968
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||   ||  |    
T  16479207 caatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaa 16479108  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16479107 taacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 16479008  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||    
T  16479007 ttcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaat 16478968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 7292887 - 7293279
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcata--------attcaccaattt 92  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||| | |||||        |||||| |||||    
T  7292887 atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaattt 7292986  T
Q  93 cacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataa 191  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||    
T  7292987 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 7293086  T
Q  192 catcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaac 291  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||   ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||    
T  7293087 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac 7293185  T
Q  292 atgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7293186 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25292597 - 25292338
Alignment:
Q  126 aacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaac 225  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |  || || ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||||   |||    
T  25292597 aacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaac 25292498  T
Q  226 cacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatc 325  Q
     ||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |    
T  25292497 gacaacctaggagaattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaac 25292398  T
Q  326 aattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25292397 aattcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Original strand, 13572672 - 13572924
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||    
T  13572672 ttctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc 13572771  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||    
T  13572772 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacaca 13572871  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  13572872 atcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 13572924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 10989406 - 10989658
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  10989406 ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc 10989505  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   | | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10989506 aaatta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 10989604  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  10989605 actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 10989658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 128 - 351
Target Start/End: Original strand, 2437463 - 2437687
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| | ||||    ||| |    
T  2437463 caatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaa 2437562  T
Q  228 caacttagcaaaa-ttcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca 326  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||    
T  2437563 caacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 2437662  T
Q  327 attcatgcatacaaacatatcatca 351  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  2437663 attcatgcatacaaacataacatca 2437687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 118 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13911281 - 13911046
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||| | |||    
T  13911281 ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctc 13911182  T
Q  218 aatccaaccacaactt-agca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgc 315  Q
    ||  |||| ||||||| || | ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13911181 aaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatac 13911082  T
Q  316 aattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13911081 aattaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 13911046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 11516359 - 11516490
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11516359 cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 11516458  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11516459 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15441695 - 15441564
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15441695 cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 15441596  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15441595 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 30262260 - 30262129
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30262260 cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 30262161  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30262160 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 296233 - 295970
Alignment:
Q  116 atttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataac 215  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| |||||||||| || | ||||||||||   |||||||||||| | | | ||||||||| ||||| |||||| |||    
T  296233 atttttcaacatcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaacatcaattgaacatgaatcacaac 296137  T
Q  216 tcaatccaacca-caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttg 314  Q
     |||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||| | | |||||| | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |     
T  296136 acaattcaaacatcaatttagcaaaattcaccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcata 296037  T
Q  315 caattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattat 381  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||| || |  | || || |||||||||| ||||||||||    
T  296036 acattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacacgaatttagcaacaattat 295970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 91
Target Start/End: Original strand, 13352011 - 13352079
Alignment:
Q  23 accacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13352011 accacaaccacaacttataatcatgcattccatcccaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 13352079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17224229 - 17224058
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||   |||||||||     
T  17224229 aattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcac 17224130  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt 250  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||||| || || ||   |||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  17224129 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 17224058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 252
Target Start/End: Original strand, 13274742 - 13274917
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| | |||||||||    
T  13274742 aattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatca 13274841  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga 252  Q
     ||| |||| | ||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  13274842 cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattga 13274917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16915013 - 16914928
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16915013 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 16914928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15978043 - 15977975
Alignment:
Q  17 caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattca 85  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15978043 caattaacaacaaccacaacttataatcatgtattcaaccacaattcaacaacaacatgtcataattca 15977975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 9611470 - 9611555
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9611470 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 9611555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 9839041 - 9839126
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9839041 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 9839126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 13377691 - 13377775
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13377691 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 13377775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15951087 - 15950789
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatta 181  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||  | || | ||||||||   ||||||||   || | | ||||| |||    
T  15951087 ttcaccaatttcagaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagtta 15950988  T
Q  182 acaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttac 281  Q
    ||||  || |||||||| ||| | |||||| | |||| | ||| || ||| || |||| |||| ||||| | || ||||| || |||||| ||||| |||    
T  15950987 acaataatcacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatac 15950889  T
Q  282 ata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||| ||||||||    
T  15950888 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 15950789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16570262 - 16570123
Alignment:
Q  115 catttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcata 213  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||| ||| |||| | ||||||||| || || ||| | ||    
T  16570262 catttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaactta 16570163  T
Q  214 actcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga 252  Q
     |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  16570162 tctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattga 16570123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 252
Target Start/End: Original strand, 16595400 - 16595539
Alignment:
Q  115 catttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcata 213  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||| ||| |||| | ||||||||| || || ||| | ||    
T  16595400 catttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaactta 16595499  T
Q  214 actcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga 252  Q
     |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  16595500 tctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattga 16595539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 252
Target Start/End: Original strand, 11287372 - 11287546
Alignment:
Q  80 aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |    
T  11287372 aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatga 11287471  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattga 252  Q
     ||| |||| | ||||||||  || || ||| | || | |||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11287472 cttagcaacaacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga 11287546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26070545 - 26070264
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| |||| | |||||||||   |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||| |||| |    
T  26070545 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaa 26070446  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-ttt 287  Q
     ||||||||| || || ||| | || | |||| || | ||||| || || |||||||||||| | ||  |||||||  |  || ||||||  |||| |||    
T  26070445 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagca-tattttcaacatataccattttctcatacttt 26070347  T
Q  288 gaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattat-catcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||||||||  || |||||   | ||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  26070346 gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattt 26070264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26094332 - 26094051
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| |||| | |||||||||   |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||| |||| |    
T  26094332 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaa 26094233  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-ttt 287  Q
     ||||||||| || || ||| | || | |||| || | ||||| || || |||||||||||| | ||  |||||||  |  || ||||||  |||| |||    
T  26094232 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagca-tattttcaacatataccattttctcatacttt 26094134  T
Q  288 gaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattat-catcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||||||||  || |||||   | ||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  26094133 gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattt 26094051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 28722247 - 28722357
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |    
T  28722247 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactag 28722346  T
Q  359 agcacgaattt 369  Q
    |||||||||||    
T  28722347 agcacgaattt 28722357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 49047966 - 49047675
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||   | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| | |||||||||    
T  49047966 aattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcgtttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcagcaacaacatca 49047867  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatt 276  Q
     ||| |||| | ||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| || || ||||| ||||||||| || |  |||||  |  || || |    
T  49047866 cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcata--tttcaacatataccact 49047769  T
Q  277 tttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
     |  |||| |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||    
T  49047768 ctctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataattggagcacaaatt 49047675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 1937297 - 1937252
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaa 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1937297 ttcatcaatttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaa 1937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12248395 - 12248238
Alignment:
Q  97 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 195  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |||  | |||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  12248395 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagtcatgcattatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatc 12248296  T
Q  196 aatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga 252  Q
     || || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  12248295 cattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattga 12248238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14272000 - 14271899
Alignment:
Q  270 tatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||   |  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  14272000 tatcattttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaat 14271901  T
Q  368 tt 369  Q
    ||    
T  14271900 tt 14271899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 48356806 - 48356891
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  48356806 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattt 48356891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113989
Alignment:
Q  343 atatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14114031 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423639
Alignment:
Q  343 atatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14423681 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 14935497 - 14935607
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||  | |    
T  14935497 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactag 14935596  T
Q  359 agcacgaattt 369  Q
    |||||||||||    
T  14935597 agcacgaattt 14935607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 15363090 - 15363200
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||  | |    
T  15363090 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactag 15363189  T
Q  359 agcacgaattt 369  Q
    |||||||||||    
T  15363190 agcacgaattt 15363200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48622758 - 48622664
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |  || ||||||||| |||  ||||||||||||| || |||||    
T  48622758 tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaatt 48622664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 126392 - 126445
Alignment:
Q  101 caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  126392 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc 126445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15441788 - 15441711
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca 78  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15441788 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 18151547 - 18151494
Alignment:
Q  17 caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaaca 70  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  18151547 caatcaaccacaaccacaacttataatcatgtattcaatcacaattcaacaaca 18151494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 30262353 - 30262276
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca 78  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30262353 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 14940892 - 14940999
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| |||| || |    
T  14940892 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaattt---aattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattag 14940988  T
Q  359 agcacgaattt 369  Q
    |||||||||||    
T  14940989 agcacgaattt 14940999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 15368485 - 15368592
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| |||| || |    
T  15368485 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaattt---aattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattag 15368581  T
Q  359 agcacgaattt 369  Q
    |||||||||||    
T  15368582 agcacgaattt 15368592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7284341 - 7284299
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7284341 atttaacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat 7284299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 15358934 - 15359028
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15358934 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccata 15359028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Original strand, 371048 - 371077
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  371048 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 371077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14251194 - 14251165
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14251194 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 14251165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15822722 - 15822549
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |     
T  15822722 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgac 15822623  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattga 252  Q
     || |||| | ||||||||| || || ||| | || | |||| |||| |||||  |||| ||||||||| ||||    
T  15822622 atatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttga 15822549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18980140 - 18980019
Alignment:
Q  260 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg 357  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||       
T  18980140 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 18980041  T
Q  358 gagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  18980040 gagcacgaatttagcaacaatt 18980019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 380
Target Start/End: Original strand, 4446358 - 4446469
Alignment:
Q  270 tatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  4446358 tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtgtgcaaacatatcatcataactagagcacgtat 4446457  T
Q  368 ttatcaacaatta 380  Q
    || ||||||||||    
T  4446458 tt-tcaacaatta 4446469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 13274939 - 13275023
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| ||||| || |||||   | |||||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13274939 tttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 13275023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17224023 - 17223939
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17224023 tttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt 17223939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Original strand, 35094773 - 35094869
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat 175  Q
    |||||| || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  || ||| |||||| |||||||| |||||| |||| | |||||||    
T  35094773 aattcatcattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacat 35094869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 23153404 - 23153710
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| |   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23153404 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatccttaattcatgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaa 23153503  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23153504 ttaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 23153603  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  23153604 ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaat 23153703  T
Q  379 tatccat 385  Q
    |||||||    
T  23153704 tatccat 23153710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14626375 - 14626113
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||   ||| |    
T  14626375 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaa 14626276  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14626275 caacttagcataattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 14626176  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatca 390  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14626175 ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatca 14626113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
Q  133 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 232  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | | ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataact 1657901  T
Q  233 tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat 332  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1657900 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 1657801  T
Q  333 gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1657800 gcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 128 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1650350 - 1650111
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||   |||||    
T  1650350 caattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacca 1650251  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1650250 taacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 1650151  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||    
T  1650150 ttcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaat 1650111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 35009735 - 35009439
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  35009735 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 35009636  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
     ||||||||| ||||| |  ||  | |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||    
T  35009635 caacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg 35009536  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35009535 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
Q  133 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 232  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataact 15862581  T
Q  233 tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat 332  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15862582 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 15862681  T
Q  333 gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  15862682 gcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 25175559 - 25175812
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  25175559 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc 25175658  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  25175659 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 25175758  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| || || ||   |||||||||||||    
T  25175759 actaacatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaattta 25175812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 133 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27654224 - 27653986
Alignment:
Q  133 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||   ||| ||||||    
T  27654224 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 27654125  T
Q  233 tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattca 331  Q
    ||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| || ||||||||||    
T  27654124 taggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 27654025  T
Q  332 tgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  27654024 tgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaattta 27653986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16826010 - 16825755
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| || || ||||  |||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  16826010 ttctcatcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc 16825911  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat--cttg 314  Q
    ||   ||| |||| |||| | |||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||     
T  16825910 aaattaacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaatta 16825811  T
Q  315 caattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  16825810 caactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 16825755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 385
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666137
Alignment:
Q  190 aacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg 288  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||| | |||| ||||    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatactttg 29666039  T
Q  289 aa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29666040 aaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18381974 - 18381684
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||     
T  18381974 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcac 18381875  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaa-cacaattttcacaacttatcattt 277  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||||| || || || | |||| |||| |||||  |||| |||||| ||||| || || ||  ||||  |  ||||| ||    
T  18381874 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcataa--ttcaacatatatcactt 18381777  T
Q  278 ttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |  |||| |||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  18381776 tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaatt 18381684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 304
Target Start/End: Original strand, 27740844 - 27741021
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||  ||| | | |  |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  27740844 caattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaa 27740943  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt--gaacatgtaatttcacc 304  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||    
T  27740944 cgacttagcaaaattcaccaattgagcacaa-tttcataacttgacatttatacatacttcgaaacatgtaatttcacc 27741021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15889914 - 15889840
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattca 85  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15889914 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcatcaacaacatgtcataattca 15889840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Original strand, 21623124 - 21623414
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||||| ||| |||||||||| |||| |||| |||  ||||||||     
T  21623124 aattcaccaattttaccaaactaccaacaacaactcatttttcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcac 21623223  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgaacacaattttcacaacttatcattt 277  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||| || || || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||  ||||  |  ||||| ||    
T  21623224 ttagcaacaacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa--ttcaacatatatcactt 21623321  T
Q  278 ttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |  |||| |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21623322 tctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaatt 21623414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19983588 - 19983516
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  19983588 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagc 19983516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35015454 - 35015382
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  35015454 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc 35015382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35136279 - 35136013
Alignment:
Q  104 caacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaa 202  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||  | ||||||||| |||    
T  35136279 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa 35136180  T
Q  203 caagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaattt 300  Q
    || |  ||  | |  ||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||| || ||||  ||||| ||| || || |||| | |||||||||| || ||    
T  35136179 catggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataatt--cacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaatt 35136082  T
Q  301 caccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||| |||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  35136081 cac-aacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt 35136013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25640757 - 25640683
Alignment:
Q  17 caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25640757 caatcaaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt 25640683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15005099 - 15005034
Alignment:
Q  26 acaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15005099 acaaccacaacttataatcattcattctatcacaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 15005034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16887877 - 16887792
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16887877 tttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt 16887792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18629693 - 18629608
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18629693 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 18629608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 22585754 - 22585681
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattc 84  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22585754 catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattc 22585681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 22590585 - 22590512
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattc 84  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22590585 catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattc 22590512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 385
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
Q  300 tcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17083298 - 17083200
Alignment:
Q  270 tatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17083298 tatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat 17083200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 369
Target Start/End: Original strand, 29605614 - 29605696
Alignment:
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  29605614 tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 29605696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 369
Target Start/End: Original strand, 33324673 - 33324939
Alignment:
Q  104 caacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaa 202  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||  | ||||||||| |||    
T  33324673 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa 33324772  T
Q  203 caagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaattt 300  Q
    || |  ||  | |  ||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||| || ||||  || || ||| || || |||| | |||||||||| || ||    
T  33324773 catggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataatt--cataagttagcacttatacacactttgaacatgcaaatt 33324870  T
Q  301 caccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||| |||||   | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33324871 cac-aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt 33324939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17557102 - 17557012
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaac 375  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  17557102 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-caaacatatcatcataattagagcacgaatttaacaac 17557012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22362047 - 22361765
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacc 187  Q
    |||| ||||||| | |||||||||  || |||||| || |||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| ||||     
T  22362047 attttacaaaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca 22361948  T
Q  188 ataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttat--catttttacata 284  Q
    | ||||||||| ||||| ||||   | | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || || ||||    ||||||||  || |||  ||||    
T  22361947 acaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt----caacttatgtcactttctcata 22361852  T
Q  285 -tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  22361851 ctttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattt 22361765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 180
Target Start/End: Original strand, 18583299 - 18583393
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga---ttcatcaaccacaacatcaatt 180  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||    
T  18583299 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacaacatcaatt 18583393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 368
Target Start/End: Original strand, 18398909 - 18399184
Alignment:
Q  94 acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataac 192  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||||| ||| |||| | |||    
T  18398909 acaaaaccaacaacaacaactcatttcttatca-caattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaac 18399007  T
Q  193 atcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaa 290  Q
    |||||| ||||| |||||  | | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || || |  |||||  |  ||  |||||  |||| ||||||    
T  18399008 atcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata--tttcaacatatactattttctcatactttgaa 18399105  T
Q  291 catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||| |||||| | |||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18399106 catgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 18399184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33538479 - 33538370
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg 358  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||   | ||||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |    
T  33538479 ttcacaacatatcactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatt-tcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagttag 33538381  T
Q  359 agcacgaattt 369  Q
    |||||||||||    
T  33538380 agcacgaattt 33538370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 180
Target Start/End: Original strand, 29665887 - 29665950
Alignment:
Q  117 tttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatt 180  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  29665887 tttctcatcaccaatccatgaatatgcatacccaagtcatgattcacccacaacaacatcaatt 29665950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15079793 - 15079709
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15079793 tttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcatgcatacaa-catatcatcctagttagagcacgaattta 15079709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 366
Target Start/End: Original strand, 15740375 - 15740473
Alignment:
Q  270 tatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaa 366  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||||| |   ||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15740375 tatcatttttatatactttgatcattcaatttcaccaacaaccaatcaattatcaccaatttcttacatacaaacatagcatcataattggagcacgaa 15740473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16556432 - 16556394
Alignment:
Q  85 accaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16556432 accaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 16556394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16632988 - 16632950
Alignment:
Q  85 accaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16632988 accaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 16632950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Original strand, 1556142 - 1556263
Alignment:
Q  260 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg 357  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||       
T  1556142 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 1556241  T
Q  358 gagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  1556242 gagcacgaatttagcaacaatt 1556263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Original strand, 16232029 - 16232150
Alignment:
Q  260 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg 357  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||       
T  16232029 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 16232128  T
Q  358 gagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  16232129 gagcacgaatttagcaacaatt 16232150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22226034 - 22225993
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22226034 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaagaatttatttctca 22225993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17375121 - 17375053
Alignment:
Q  17 caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattca 85  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||| ||||    
T  17375121 caatcaaccataaccacaaattataatcatgtattcaatcacaaatcaacaacaacatgacatagttca 17375053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 101 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 26699 - 26419
Alignment:
Q  101 caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatag 200  Q
    ||||||||||| || | |||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  26699 caccaacaacactcaaattctcatcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattg 26600  T
Q  201 aacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattt 300  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26599 aacaagaatcataactcattctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtacttt 26500  T
Q  301 caccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattat 381  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26499 caccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattat 26419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 118 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8444 - 8180
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |  ||  | |      
T  8444 ttctcatcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcat 8345  T
Q  218 aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa 317  Q
    ||| |||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  8344 aattcaacaaca---tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaa 8248  T
Q  318 ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8247 ttatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7025
Alignment:
Q  77 cataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | || ||||| |||| |||||||| |||| ||    
T  7319 cataattcaccaattttacaaaaccatcattcacaactcatttctcatcaacaattcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatat 7220  T
Q  176 caattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatca 274  Q
    || ||| || | | ||||||||| ||||| || || || | ||||||||  ||||| || || |||| | ||||| || || ||||  ||  |  |||||    
T  7219 cacttagcagcaacaacatcaattgaacatgattcttatcacaatccaataacaacataacataattaaacaatttgagcataatt--caacatatatca 7122  T
Q  275 tttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
     |||  |||| |||||||||  |||||||| |||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7121 ctttctcatactttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 7025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 87 - 394
Target Start/End: Original strand, 41693 - 42001
Alignment:
Q  87 caatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaa 185  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| |  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||     
T  41693 caatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctaataatcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacag 41792  T
Q  186 ccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatat 285  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41793 ccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatat 41892  T
Q  286 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41893 ttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 41992  T
Q  386 aatcaaaat 394  Q
    || ||||||    
T  41993 aagcaaaat 42001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 90 - 392
Target Start/End: Original strand, 20931312 - 20931615
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20931312 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 20931411  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20931412 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20931511  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataat 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20931512 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 20931611  T
Q  389 caaa 392  Q
    ||||    
T  20931612 caaa 20931615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 20445636 - 20445942
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20445636 aattcatcattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaa 20445735  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  20445736 ttaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttg 20445835  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  20445836 ttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaat 20445935  T
Q  379 tatccat 385  Q
    |||||||    
T  20445936 tatccat 20445942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20893932 - 20893626
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||| ||||||   ||| ||||||||||||| ||  |||||| || ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20893932 aattcacaaatttcttcaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaa 20893833  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20893832 ttaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 20893733  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  20893732 ttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaat 20893633  T
Q  379 tatccat 385  Q
    |||||||    
T  20893632 tatccat 20893626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 20531401 - 20531707
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20531401 aattcatcattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaa 20531500  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  20531501 ttaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttg 20531600  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  20531601 ttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaat 20531700  T
Q  379 tatccat 385  Q
    |||||||    
T  20531701 tatccat 20531707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Original strand, 20913004 - 20913302
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20913004 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaacca 20913103  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
    |||||||||| ||||||||||||      |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20913104 taacatcaattgaacaagaatca------aatt-aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20913196  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataat 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  20913197 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaag 20913296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 101 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37844735 - 37844450
Alignment:
Q  101 caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatag 200  Q
    ||||||||||| || | |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37844735 caccaacaacattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattg 37844636  T
Q  201 aacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcac-aacttatcatttttacatatttgaacatgtaatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |  ||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  37844635 aacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatt 37844536  T
Q  300 tcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37844535 tcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 37844450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 41394228 - 41394494
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||   ||| |    
T  41394228 caatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaa 41394327  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41394328 taacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 41394427  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41394428 tttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaat 41394494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 351
Target Start/End: Original strand, 2116260 - 2116484
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataac-tcaatccaacc 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||   |||     
T  2116260 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaaca 2116359  T
Q  227 acaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca 326  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2116360 ataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 2116459  T
Q  327 attcatgcatacaaacatatcatca 351  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  2116460 attcatgcatacaaacataacatca 2116484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 335
Target Start/End: Original strand, 22227815 - 22228022
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |    
T  22227815 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa 22227914  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  22227915 caacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaa 22228014  T
Q  328 ttcatgca 335  Q
    ||||||||    
T  22228015 ttcatgca 22228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 335
Target Start/End: Original strand, 22232512 - 22232719
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |    
T  22232512 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa 22232611  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  22232612 caacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaa 22232711  T
Q  328 ttcatgca 335  Q
    ||||||||    
T  22232712 ttcatgca 22232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 351
Target Start/End: Original strand, 45051484 - 45051652
Alignment:
Q  183 caaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttaca 282  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45051484 caacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttaca 45051583  T
Q  283 tatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  45051584 tatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatca 45051652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18601374 - 18601140
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || |  ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||    
T  18601374 ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc 18601275  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18601274 aacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 18601175  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 351  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18601174 actaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 18601140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5072644 - 5072391
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || |  ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||    
T  5072644 ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc 5072545  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5072544 aacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 5072445  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  5072444 actaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattta 5072391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 51452624 - 51452755
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51452624 cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 51452723  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  51452724 gttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Original strand, 20177131 - 20177421
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||  |||||| |||| ||| |||||| |||| |||||| | |||||||||     
T  20177131 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac 20177230  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgaacacaattttcacaacttatcattt 277  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||||  || |  || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||  ||||  |  ||||| ||    
T  20177231 ttagcaacaacaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa--ttcaacatatatcactt 20177328  T
Q  278 ttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |  |||| |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20177329 tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaatt 20177421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13377131 - 13377012
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||| |||| ||||| |||| ||| || | |||||||||     
T  13377131 aattcaccaatttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcac 13377032  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaat 198  Q
    ||| |||| | |||||||||    
T  13377031 ttagcaacaacaacatcaat 13377012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22143635 - 22143361
Alignment:
Q  97 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 195  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| || | | ||||||    
T  22143635 aaaccaacaacaacaatcgatttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatc 22143536  T
Q  196 aatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacat 293  Q
    ||| || || |  ||  | |  ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||||  || || ||| ||||| |||||| |||||||||    
T  22143535 aattgagcatggttctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaaccatttgagcataatt--cataagttaacatttatacatactttgaacat 22143438  T
Q  294 gtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    | || |||||||||||   | |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22143437 gcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattt 22143361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44035267 - 44035219
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44035267 ttcaccaattgcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa 44035219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 369
Target Start/End: Original strand, 21194986 - 21195261
Alignment:
Q  96 aaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacat 194  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| || |||  ||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||||| | |||||    
T  21194986 aaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacat 21195085  T
Q  195 caatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaaca 292  Q
     |||  |||| || ||  | | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || || ||||  |||||  ||||||||| ||||| | ||||||    
T  21195086 taattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt--cacaatatatcattttcacatactatgaaca 21195183  T
Q  293 tgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |  ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  21195184 tacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 21195261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 51627956 - 51627665
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||   |||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||| |||||    
T  51627956 aattcaccaatttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatca 51627857  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatt 276  Q
     ||| |||| | ||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||| | || || ||||| |||||||||||| |  |||||  |  || ||||    
T  51627856 cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacata--tttcaacatataccatt 51627759  T
Q  277 tttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatc-aattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||  |||| |||||||||| | |||||| |||||   | |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  51627758 ttctcatactttgaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaatt 51627665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 17609090 - 17609174
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  17609090 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaatt 17609174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15861713 - 15861650
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag 152  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  15861713 tttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag 15861650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 152
Target Start/End: Original strand, 22366985 - 22367048
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag 152  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  22366985 tttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag 22367048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41229231 - 41229105
Alignment:
Q  79 taattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||  |||||| |||| | || ||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  41229231 taattcaccaattttaccaaactaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatca 41229132  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaaca 204  Q
     ||| |||| | ||||||||| |||||    
T  41229131 cttagcaacaacaacatcaattgaaca 41229105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18060054 - 18060013
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18060054 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 18060013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 36356367 - 36356294
Alignment:
Q  296 aatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  36356367 aatttcaccaacaacatttcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaatt 36356294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 49967606 - 49967725
Alignment:
Q  79 taattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||   |||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||| | ||||||| |    
T  49967606 taattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatctcattcctcaacaacaa-ccatgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatga 49967704  T
Q  178 attaacaaccataacatcaat 198  Q
     |||||||| | |||||||||    
T  49967705 cttaacaacaacaacatcaat 49967725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27329840 - 27329757
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||   | |||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27329840 tttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt 27329757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Original strand, 45051448 - 45051487
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaac 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45051448 caattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaac 45051487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 368
Target Start/End: Original strand, 16646105 - 16646158
Alignment:
Q  316 aattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16646105 aattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 16646158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 21650336 - 21650307
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650336 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca 21650307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37233945 - 37233876
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37233945 tttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcata 37233876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38033748 - 38033675
Alignment:
Q  296 aatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  38033748 aatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaatt 38033675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 51452531 - 51452608
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca 78  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| |||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  51452531 atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 16656800 - 16656884
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||| | | ||||||||||||   | ||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16656800 tttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 16656884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 130
Target Start/End: Original strand, 21859977 - 21860017
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa 130  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21859977 tttcaccaaaccaacaacaacaattcatttctcaacaacaa 21860017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247442
Alignment:
Q  133 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  233 tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat 332  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  247594 tagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcat 247495  T
Q  333 gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  247494 gcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 247442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 253349 - 253206
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253349 catcaacaattaaccaaacccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 253250  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc 153  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  253249 aatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagc 253206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 118 - 394
Target Start/End: Original strand, 8874 - 9150
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  8874 ttctcatcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctc 8973  T
Q  218 aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa 317  Q
    ||   ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8974 aaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaa 9073  T
Q  318 ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  9074 ttatcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaat 9150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 135 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 784 - 534
Alignment:
Q  135 tgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaactta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||   ||||||    
T  784 tgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaactta 685  T
Q  235 gcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgc 334  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  684 gcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 585  T
Q  335 atacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  584 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1212 - 951
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||| | | ||||||  ||| |    
T  1212 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaa 1114  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1113 caacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 1014  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatca 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1013 ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatca 951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 118 - 382
Target Start/End: Original strand, 48183 - 48447
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  48183 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctc 48282  T
Q  218 aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa 317  Q
    ||   ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  48283 aaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 48382  T
Q  318 ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatc 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48383 ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatc 48447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6320 - 6059
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||| |    
T  6320 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaa 6222  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6221 caacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 6122  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatca 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6121 ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatca 6059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 128464 - 128160
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 188  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  128464 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatcca 128365  T
Q  189 taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 288  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||  ||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  128364 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttg 128266  T
Q  289 aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataat 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  128265 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataag 128166  T
Q  389 caaaat 394  Q
    ||||||    
T  128165 caaaat 128160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31917 - 31697
Alignment:
Q  133 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || || || |||||  |||||||||||| ||||| |||||| | |||||  |||| ||||||    
T  31917 catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact 31818  T
Q  233 t-agca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattc 330  Q
    | || | ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||    
T  31817 ttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattc 31718  T
Q  331 atgcatacaaacatatcatca 351  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  31717 atgcattcaaacataacatca 31697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 118 - 394
Target Start/End: Original strand, 12111 - 12385
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  12111 ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctc 12210  T
Q  218 aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa 317  Q
    |||   || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | |||    
T  12211 aatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaa 12308  T
Q  318 ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12309 ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaat 12385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Original strand, 107753 - 108004
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |    
T  107753 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa 107852  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  107853 caacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 107952  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  107953 ttcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaatt 108004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 64784 - 64527
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||    
T  64784 ttctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc 64685  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  64684 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcataca 64585  T
Q  317 attatcatc-----aattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    || ||||||     |||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  64584 atcatcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt 64527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 89915 - 89863
Alignment:
Q  319 tatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89915 tatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 101 - 385
Target Start/End: Original strand, 41626 - 41911
Alignment:
Q  101 caccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaata 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||     
T  41626 caccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaatt 41725  T
Q  200 gaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatt 299  Q
    ||||| |  ||  | |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41726 gaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatt 41825  T
Q  300 tcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41826 tcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 128 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9594 - 9371
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | |||||   ||| |    
T  9594 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaa 9495  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9494 taacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 9395  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatca 351  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  9394 ttcatgcatacaaacataacatca 9371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 128 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16492 - 16269
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | |||||   ||| |    
T  16492 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaa 16393  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16392 taacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 16293  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatca 351  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  16292 ttcatgcatacaaacataacatca 16269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 128 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34718 - 34460
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaat-agaacaagaatcataactcaatccaacc 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||     
T  34718 caatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaaca 34619  T
Q  227 acaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca 326  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34618 acaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 34519  T
Q  327 attcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34518 attcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 4831 - 4940
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4831 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaac---aacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 4927  T
Q  111 aatccatttctca 123  Q
    |||||||||||||    
T  4928 aatccatttctca 4940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Original strand, 2968 - 3220
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaat-agaacaagaatcataactcaatccaacc 226  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||     
T  2968 caattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaaca 3067  T
Q  227 acaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3068 acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 3167  T
Q  327 attcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt 379  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||| ||| ||||    
T  3168 attcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaatt 3220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 385
Target Start/End: Original strand, 13512 - 13769
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |  ||  | |  ||| |||| |    
T  13512 caattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaa 13611  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13612 caacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 13711  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13712 ttcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37371 - 37066
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  37371 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcta 37272  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt 278  Q
    ||| || | | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||   ||||||||||| ||||| |||||||    
T  37271 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatccaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcatttt 37173  T
Q  279 tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat 378  Q
     |||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  37172 cacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 37073  T
Q  379 tatccat 385  Q
    |||||||    
T  37072 tatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Original strand, 41267 - 41315
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41267 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa 41315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 128 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5460 - 5254
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |    
T  5460 caatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa 5362  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5361 caactcagcaaaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 5262  T
Q  328 ttcatgca 335  Q
    ||||||||    
T  5261 ttcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 103192 - 102923
Alignment:
Q  101 caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaata 199  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| | ||||||||| |||  ||| |||||||||||     
T  103192 caccaacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaataacatcaatt 103093  T
Q  200 gaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaa 297  Q
    ||||| ||||  || | |||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||| | || |  || ||| |  || || |||  |||| |||||||||| ||    
T  103092 gaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaatttagcata--ttccaccatataccactttctcatactttgaacatgaaa 102995  T
Q  298 tttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||| |||||   | |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  102994 tttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 102923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Original strand, 109545 - 109717
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaata-tgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||| |||| | |||| | |||||||||    
T  109545 aattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatca 109644  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt 250  Q
     ||| |||| | ||||||||  || || ||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  109645 cttagcaacaacaacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatt 109717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 239 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51173
Alignment:
Q  239 aattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatac 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  339 aaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat 394  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaat 51173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 128 - 335
Target Start/End: Original strand, 3728 - 3936
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |    
T  3728 caatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa 3827  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatca-tttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3828 caacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 3927  T
Q  327 attcatgca 335  Q
    |||||||||    
T  3928 attcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Original strand, 1286 - 1414
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1286 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 1385  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaat 139  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1386 aatccatttctcaacaacaaatcatgaat 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 29978 - 30126
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29978 catcaacaattaaccacaacaacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 30077  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga 158  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  30078 aatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatga 30126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Original strand, 31 - 283
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||    
T  31 ttctcatcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc 130  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  131 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcataca 230  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  231 atcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 381
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5788
Alignment:
Q  146 acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagca-aaattca 244  Q
    ||||||||||| |||||| || || |  ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| | |||||   ||| ||||||||| | |||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  245 ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacat 344  Q
    |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
Q  345 atcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattat 381  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5752 aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattat 5788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 234 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 89605 - 89454
Alignment:
Q  234 agcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatg 333  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  89605 agcataattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 89506  T
Q  334 catacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  89505 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 89454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 369
Target Start/End: Original strand, 79519 - 79786
Alignment:
Q  104 caacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaa 202  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| | || |||| ||| |||| | ||||||||| |||    
T  79519 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 79618  T
Q  203 caagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt-gaacatgtaattt 300  Q
    || |  ||| | |  ||| |||| ||||| || || |||||| |||||| | || ||||  ||||| ||| || ||  ||||| || ||||||| |||||    
T  79619 catggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcataatt--cacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaattt 79716  T
Q  301 caccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||| |||     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  79717 caccaccaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattt 79786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107784
Alignment:
Q  334 catacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccat 107784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 133 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21356 - 21138
Alignment:
Q  133 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 232  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||  | |||||   ||| ||||||    
T  21356 catgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaact 21257  T
Q  233 tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat 332  Q
    ||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  21256 taggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaat 21157  T
Q  333 gcatacaaacatatcatca 351  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  21156 ggatacaaacataacatca 21138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14306 - 14083
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca 227  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||  |||||||| ||| |||||||||||  | |||||   | | |    
T  14306 caatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaa 14207  T
Q  228 caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  14206 caacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaa 14107  T
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatca 351  Q
    |||||||||||| ||||| |||||    
T  14106 ttcatgcatacagacataacatca 14083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 350
Target Start/End: Original strand, 42993 - 43226
Alignment:
Q  118 ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc 217  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | ||||| |||||| | |||    
T  42993 ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctc 43092  T
Q  218 aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca 316  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  43093 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 43192  T
Q  317 attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43193 attatcatcaattcatgcatagaaacataacatc 43226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Original strand, 39063 - 39104
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  39063 ttcaccaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctca 39104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 229 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13469 - 13347
Alignment:
Q  229 aacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaat 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13469 aacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 13370  T
Q  329 tcatgcatacaaacatatcatca 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  13369 tcatgcatacaaacataacatca 13347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24557 - 24415
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24557 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcttaattcaccaatttctttaaaccaccaacaac 24458  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag 152  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  24457 aatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag 24415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 3406 - 3525
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3406 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataactcaccaattccactaaaccaccaacaac 3505  T
Q  111 aatccatttctcaacaacaa 130  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  3506 attccatttctcaacaacaa 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Original strand, 9339 - 9480
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9339 aattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 9438  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaat 220  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9439 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 9480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13647 - 13537
Alignment:
Q  17 caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatcca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13647 caattaaccacaaccacaatttatgatcatgcattccatcatatttcaacaagaacatgtcgtaattcaccaatttcacaaaaccactaacaacaatcca 13548  T
Q  117 tttctcaacaa 127  Q
    |||||||||||    
T  13547 tttctcaacaa 13537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 273 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 104721 - 104623
Alignment:
Q  273 catttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattca-tgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||   | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  104721 catttatacatactttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattt 104623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 93858 - 93773
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| | | |||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  93858 tttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaattt 93773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 116358 - 116284
Alignment:
Q  17 caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | ||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  116358 caattaacaacaaccacaacttataatcatgtattcaaccacaaatcaataacaacatgtcacaattcatcaatt 116284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 26927 - 27058
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26927 cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 27026  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27027 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 254 - 381
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22799
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22672 cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 22771  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattat 381  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22772 gttggagcacgaatttagcaacaattat 22799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1713 - 1582
Alignment:
Q  254 cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1713 cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 1614  T
Q  354 gttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1613 gttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 238 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1439 - 1307
Alignment:
Q  238 aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcata 337  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  1439 aaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcata 1340  T
Q  338 caaacatatcatcatagttggagcacgaattta 370  Q
    |||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  1339 caaacataacatcacagcaagagcacgaattta 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 77138 - 76847
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||  |||| ||||     
T  77138 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcac 77039  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgaacacaattttcacaacttatcattt 277  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||  | | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||  ||||  |  ||||| ||    
T  77038 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataa--ttcaacatatatcactt 76941  T
Q  278 ttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |  |||| |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  76940 tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaattt 76847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 56347 - 56102
Alignment:
Q  138 atatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagca 237  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||| | |   ||||||||| ||||| |||||| |  ||  | |||| |||||||||||    
T  56347 atatgcatacccaagtcatgattcacccacaacaacatcaattaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagca 56248  T
Q  238 aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa--catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgca 335  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || |||||  ||||| |||||| || ||  |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  56247 aaattcaccatttgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgca 56149  T
Q  336 tacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatc 382  Q
     || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  56148 cacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatc 56102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12068 - 11947
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaa-tttcacaaaaccaccaacaa 109  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||    
T  12068 catcaacaattaaacacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaattttcaccaaaacaccaaaaa 11969  T
Q  110 caatccatttctcaacaacaat 131  Q
    ||   |||||||||||| ||||    
T  11968 catctcatttctcaacaccaat 11947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22255 - 22186
Alignment:
Q  22 aaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22255 aaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 22186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 132541 - 132422
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |     
T  132541 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac 132442  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaat 198  Q
    |||||||| | |||||||||    
T  132441 ttaacaacaacaacatcaat 132422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Original strand, 11660 - 11762
Alignment:
Q  97 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 195  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| | |||| | ||||| ||| ||| |||| | ||||||    
T  11660 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatc 11759  T
Q  196 aat 198  Q
    |||    
T  11760 aat 11762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 1089 - 1017
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataatt 83  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1089 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataatt 1017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 6823 - 6907
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  6823 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaatt 6907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Original strand, 6617 - 6715
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||| ||||   |||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  6617 aattcacccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatca 6715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 45876 - 45804
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataatt 83  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45876 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataatt 45804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 159 - 233
Alignment:
Q  17 caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  159 caattaatcacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaacaatt 233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 1703 - 1629
Alignment:
Q  17 caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1703 caattaatcacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 1629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 222 - 385
Target Start/End: Original strand, 3289 - 3453
Alignment:
Q  222 caaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaac-atgtaatttcaccaacaatcttgcaatt 319  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||   |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  3289 caacaacaacttagcaaaattcaccatttgagtacaattt-cataacttgatatttatacatactttgaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaat 3387  T
Q  320 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat 385  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||| || |||||||||||    
T  3388 atcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 180
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3266
Alignment:
Q  101 caccaacaacaat-ccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatt 180  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  || |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3186 caccaacaacaattccaattctcttcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaatt 3266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 335
Target Start/End: Original strand, 54410 - 54630
Alignment:
Q  116 atttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataac 215  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||   |||||||| | || ||||||||| |||| | | | ||||||||| ||||| |||||| | |    
T  54410 atttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatc 54509  T
Q  216 tcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg-aacatgtaatttcaccaacaatctt 313  Q
    ||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||  ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| |    
T  54510 tcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcat 54608  T
Q  314 gcaattatcatcaattcatgca 335  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  54609 acaattatcatcaattcatgca 54630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 335
Target Start/End: Original strand, 45077 - 45244
Alignment:
Q  169 acaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaac 268  Q
    ||||||||| |||| | | | ||||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| || |||    
T  45077 acaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaattt-caaaac 45175  T
Q  269 ttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgca 335  Q
    ||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45176 ttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 162476 - 162404
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  162476 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc 162404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 116804 - 116687
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||| | |||||||| |||| |||||||| |||| ||||     
T  116804 aattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcac 116705  T
Q  179 ttaacaaccataacatca 196  Q
    ||| |||| | |||||||    
T  116704 ttagcaacaacaacatca 116687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 166554 - 166482
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  166554 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc 166482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6380 - 6309
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  6380 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag 6309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22646 - 22422
Alignment:
Q  146 acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcac 245  Q
    |||||| | |||| || ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||  |||| || ||| | |||||| |||| ||||| ||||| ||||||     
T  22646 acccaaactatgaatcttcaacaacaatatcaattaacaacaacaacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaattcaa 22547  T
Q  246 caatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt-gaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaac 342  Q
     |||| || || ||||  || || ||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||   |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22546 taatttgagcataatt--cataagttagcatttatacatattttgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaac 22449  T
Q  343 atatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  22448 atatcatcatatttagagcacgaattt 22422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 369
Target Start/End: Original strand, 8001 - 8257
Alignment:
Q  115 catttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcata 213  Q
    ||||||||| || |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||  || |||| | ||||||||| ||||| |  ||  |    
T  8001 catttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctca 8100  T
Q  214 actcaatccaaccacaacttagcaaaattcacc-aattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatc 311  Q
     |  ||| | || ||||| ||||| |||||||| |||||| || || |  || || ||| || || |||||| |||||||||| || |||||||||||      
T  8101 tcataattccacaacaacatagcataattcacccaattgagcataaat--cataagttagcacttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaaca 8198  T
Q  312 ttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8199 attcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 211
Target Start/End: Original strand, 48520 - 48603
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatca 211  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  48520 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatca 48603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Original strand, 35435 - 35724
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||     
T  35435 aattcaccaattttacaaaaccaccaaca-caactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcac 35533  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcattt 277  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||||| || || || | || | |||| ||||| ||||| || ||| ||||| ||  | ||||  ||  |  ||||| ||    
T  35534 ttagcaacaaaaacatcaattgaacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatttgagtataatt--caacatatatcactt 35631  T
Q  278 ttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |  |||| |||||||||| |||||||| |||||   | |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35632 tctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaatt 35724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31577 - 31529
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31577 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa 31529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 369
Target Start/End: Original strand, 21477 - 21758
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacc 187  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | ||| ||||     
T  21477 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaaca 21576  T
Q  188 ataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tt 286  Q
    | ||||||||   | || ||| | || | |||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||  |  || ||||||  |||| ||    
T  21577 acaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagca-tattttcaacatataccattttctcatactt 21675  T
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||||||  || |||||   | |||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  21676 tgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattt 21758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 198
Target Start/End: Original strand, 31176 - 31286
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacc 187  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | ||| ||||     
T  31176 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaaca 31275  T
Q  188 ataacatcaat 198  Q
    | |||||||||    
T  31276 aaaacatcaat 31286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1449 - 1348
Alignment:
Q  270 tatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattc-atgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1449 tatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaat 1350  T
Q  368 tt 369  Q
    ||    
T  1349 tt 1348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9704 - 9603
Alignment:
Q  270 tatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattc-atgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9704 tatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaat 9605  T
Q  368 tt 369  Q
    ||    
T  9604 tt 9603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4049 - 3969
Alignment:
Q  11 catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  4049 catcaacaatcaagcacaaccacaacttataattatgcattccatcacaattcaataacaacatgtcgtaattcatcaatt 3969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 109 - 26
Alignment:
Q  128 caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatca 211  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||    
T  109 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatca 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22577 - 22429
Alignment:
Q  222 caaccacaacttagcaaaattcacc-aattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaatt 319  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||  ||||| ||| || || |||| | |||||||||| || |||||||||||   | |||||    
T  22577 caacaacaacttagcataattcacccaattgagcataatt--cacaagttaacacttatacacactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaatt 22480  T
Q  320 atcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  22479 atcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattt 22429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 44311 - 44249
Alignment:
Q  22 aaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattc 84  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44311 aacctcaaccacaacttgtaatcatgcatcccatcacaattcaacaacaacatgtcataattc 44249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 70361 - 70307
Alignment:
Q  316 aattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  70361 aattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 5936 - 6010
Alignment:
Q  17 caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt 91  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  5936 caatcaaccacaaccacaacttacaatcatgcattcgatcacaattcaactacaacatgtcataaatcatcaatt 6010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 2687 - 2772
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2687 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattt 2772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2401 - 2317
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2401 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 109754 - 109582
Alignment:
Q  80 aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||| | |||| | ||||||| |    
T  109754 aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatga 109655  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt 250  Q
     ||| |||| | ||||||||| || || ||| | || | |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  109654 cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatt 109582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 118255 - 118078
Alignment:
Q  80 aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||| | |||| | ||||||| |    
T  118255 aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatga 118156  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaaca 255  Q
     ||| |||| | ||||||||  || || ||| | || | |||| || | ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  118155 cttagcaacaacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaaca 118078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 367
Target Start/End: Original strand, 28501 - 28781
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacc 187  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||  |||||| |||| | |||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||     
T  28501 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaaca 28600  T
Q  188 ataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-t 285  Q
    | ||||||||| |||||  | || ||   |||| |||| ||||| || || |||||| ||| |||| || ||  ||||  |  ||||| |||  |||| |    
T  28601 acaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttgagcataa--ttcaacatatatcactttctcatact 28698  T
Q  286 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    |||||||| |||||||||||||||   | || |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28699 ttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat 28781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 368
Target Start/End: Original strand, 10854 - 10908
Alignment:
Q  315 caattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10854 caattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaatt 10908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 369
Target Start/End: Original strand, 29944 - 30211
Alignment:
Q  104 caacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaa 202  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||| ||||| | || | ||||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||||| | |||||||||  ||    
T  29944 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatacgtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcgcttaacaacaacaacatcaattaaa 30043  T
Q  203 caagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaattt 300  Q
    || || ||  | | |||| |||| | ||| ||||| |||||| ||||| || || ||||  |||||  ||||||||| ||||| | |||||||| |||||    
T  30044 catgattctcatcacaattcaacaaaaacatagcacaattcaacaattagagcaaaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaattt 30141  T
Q  301 caccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    |||| ||||   | ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30142 cacctacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatagtaagagcacgaattt 30211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 747 - 700
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  747 ttcaccaatt-cacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaacaa 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Original strand, 3265 - 3351
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | |||||||    
T  3265 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 3351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 10458 - 10335
Alignment:
Q  260 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg 357  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |  || ||||||||| ||       
T  10458 tttcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaa 10359  T
Q  358 gagcacgaatttatcaacaattat 381  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  10358 gagcacgaatttagcaacaattat 10335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 159257 - 159332
Alignment:
Q  80 aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc 153  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  159257 aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagc 159332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Original strand, 85287 - 85459
Alignment:
Q  80 aattcaccaa-tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| | ||||||| |    
T  85287 aattcaccaagtttcaccaaaacaccaacaacgtctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatga 85386  T
Q  178 attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt 250  Q
     ||| |||| | ||||||||| || || ||| | || | |||| || | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  85387 cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaatt 85459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Original strand, 7807 - 7909
Alignment:
Q  97 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 195  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| | | || ||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  7807 aaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatc 7906  T
Q  196 aat 198  Q
    |||    
T  7907 aat 7909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 368
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8051
Alignment:
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8011 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 368
Target Start/End: Original strand, 31184 - 31266
Alignment:
Q  287 tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  31184 tgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaatt 31266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1063 - 962
Alignment:
Q  270 tatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| || || |||||||    
T  1063 tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaat 964  T
Q  368 tt 369  Q
    ||    
T  963 tt 962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34019 - 33854
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||   ||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| |||| | || | | |||||||||     
T  34019 aattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcataatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcac 33920  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca 244  Q
    ||| |||| | ||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  33919 ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 33854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Original strand, 110 - 273
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacc 187  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |  || ||||     
T  110 attttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaca 208  T
Q  188 ataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattga 252  Q
    | ||||||||| || || ||| | || | |||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  209 acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattga 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 29122 - 29174
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaataca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| || |||||||    
T  29122 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatatctcatcatcaataca 29174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 242
Target Start/End: Original strand, 3310 - 3438
Alignment:
Q  115 catttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcata 213  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| | | || ||||||||||| ||| ||||   ||||||||| || || ||||| ||    
T  3310 catttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattgatcatgaatctta 3409  T
Q  214 actcaatccaaccacaacttagcaaaatt 242  Q
     | |||| |||| ||||| ||||| ||||    
T  3410 tcacaattcaactacaacatagcataatt 3438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 368
Target Start/End: Original strand, 3525 - 3565
Alignment:
Q  328 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 368  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3525 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Original strand, 265 - 436
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||| ||||   |||||||  |||| | |||||| | |||||||     
T  265 aattcacccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcac 364  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt 250  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||||| || || || | |||| |||| | ||| ||||| |||||| |||||    
T  365 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5537 - 5418
Alignment:
Q  80 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 178  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| | ||||||| |     
T  5537 aattcaccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgac 5438  T
Q  179 ttaacaaccataacatcaat 198  Q
    ||| |||| | |||||||||    
T  5437 ttagcaacaacaacatcaat 5418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9156 - 9054
Alignment:
Q  97 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 195  Q
    |||||||| ||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||| | |||| | ||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  9156 aaaccaccgacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc 9057  T
Q  196 aat 198  Q
    |||    
T  9056 aat 9054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 197
Target Start/End: Original strand, 8942 - 9061
Alignment:
Q  80 aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 177  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |    
T  8942 aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatga 9041  T
Q  178 attaacaaccataacatcaa 197  Q
     ||| |||| | ||||||||    
T  9042 cttagcaacaacaacatcaa 9061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Original strand, 24925 - 25010
Alignment:
Q  89 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | |||||||    
T  24925 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacat 25010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 285 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 97283 - 97200
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattc-atgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat 367  Q
    |||||||||| |||| |||||||||   | ||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  97283 tttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat 97200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 175
Target Start/End: Original strand, 1347 - 1433
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat 175  Q
    |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | |||||||    
T  1347 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacat 1433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 333
Target Start/End: Original strand, 3551 - 3625
Alignment:
Q  260 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatg 333  Q
    |||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||||||| |||||| | | || ||||||||||||||    
T  3551 tttcacaacttaacaattatacatgctttgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatg 3625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 3388 - 3482
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  3388 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcata 3482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 4742 - 4836
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4742 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccata 4836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 112
Target Start/End: Original strand, 39606 - 39636
Alignment:
Q  82 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39606 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaa 39636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43883 - 43805
Alignment:
Q  285 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagca 362  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  43883 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagca 43805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 27634 - 27728
Alignment:
Q  261 ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcata 353  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  27634 ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcata 27728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12809 - 12740
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga 158  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||    
T  12809 tttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatga 12740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19190 - 19121
Alignment:
Q  90 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga 158  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||    
T  19190 tttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatga 19121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1105 - 1017
Alignment:
Q  88 aatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat 175  Q
    |||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | |||||||    
T  1105 aatttcaccaaatcaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 1017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 335
Target Start/End: Original strand, 54012 - 54088
Alignment:
Q  260 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgca 335  Q
    |||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||||||| |||| | | | || ||||||||||||||||    
T  54012 tttcacaacttaacaattatacatgctttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 54088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University