View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF18359_low_13 (Length: 412)
Name: NF18359_low_13
Description: NF18359
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF18359_low_13 |
 |  |
|
| [»] scaffold0001 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0023 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0215 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0529 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1734 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0076 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0420 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0122 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0160 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1711 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0084 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0396 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0021 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0109 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1295 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0507 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0361 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0016 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0686 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0151 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0184 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0079 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0063 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0057 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0035 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0165 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0342 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0833 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0467 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0589 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0387 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1867 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0213 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0092 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0480 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0158 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1164 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0892 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0598 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0193 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0107 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0080 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0039 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0673 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Original strand, 13838783 - 13839166
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13838783 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcattcattccatcatatttcaacaacaacatgtcgtaattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
13838882 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13838883 |
aatccatttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatc |
13838982 |
T |
 |
| Q |
211 |
ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13838983 |
ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaat |
13839082 |
T |
 |
| Q |
311 |
cttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13839083 |
catacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaat |
13839166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 51158275 - 51158009
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
51158275 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaa |
51158176 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
51158175 |
caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
51158076 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
51158075 |
ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaat |
51158009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15859330 - 15859024
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||| || |||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15859330 |
aattcaccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
15859231 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15859230 |
ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg |
15859131 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15859130 |
ttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaat |
15859031 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
15859030 |
tatccat |
15859024 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 90 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12030443 - 12030139
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12030443 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaacca |
12030344 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12030343 |
tagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttg |
12030244 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataat |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12030243 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag |
12030144 |
T |
 |
| Q |
389 |
caaaa |
393 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
12030143 |
caaaa |
12030139 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Original strand, 2049777 - 2050082
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| || || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2049777 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
2049876 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2049877 |
tagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttg |
2049976 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataat |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2049977 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag |
2050076 |
T |
 |
| Q |
389 |
caaaat |
394 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
2050077 |
caaaat |
2050082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14842818 - 14842556
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
14842818 |
caatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa |
14842719 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |
|
|
| T |
14842718 |
caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaa |
14842619 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatca |
390 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14842618 |
ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatca |
14842556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 118 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15936894 - 15936633
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
15936894 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctc |
15936795 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa |
317 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
15936794 |
aaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa |
15936695 |
T |
 |
| Q |
318 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15936694 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaatt |
15936633 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17912738 - 17912483
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
17912738 |
caattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaattcaacta |
17912639 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||| || |||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
17912638 |
caacatatcaaa-ttcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
17912540 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17912539 |
ttcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
17912483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15938726 - 15938475
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
15938726 |
caatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa |
15938627 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
15938626 |
caacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
15938527 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
15938526 |
ttcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaatt |
15938475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 128 - 341
Target Start/End: Original strand, 15614840 - 15615053
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | ||| ||| | |
|
|
| T |
15614840 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaa |
15614939 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
15614940 |
taacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaa |
15615039 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaa |
341 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
15615040 |
ttcatgcatacaaa |
15615053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16744420 - 16744106
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
16744420 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacattta |
16744321 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
||| || | | ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| | ||| | |||| |||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
16744320 |
ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactataacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcatttt |
16744222 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16744221 |
tacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaat |
16744122 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
16744121 |
catccataatcaaaat |
16744106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 16821099 - 16821369
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| || |
|
|
| T |
16821099 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttatttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaata |
16821198 |
T |
 |
| Q |
182 |
acaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcattttta |
280 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
16821199 |
acattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattttta |
16821298 |
T |
 |
| Q |
281 |
catatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16821299 |
catatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca |
16821369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 385
Target Start/End: Original strand, 45860801 - 45861068
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
45860801 |
ttctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc |
45860900 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |
|
|
| T |
45860901 |
aaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcataca |
45861000 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45861001 |
atcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
45861068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 125 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13975982 - 13975722
Alignment:
| Q |
125 |
caacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaa |
224 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||||| || |
|
|
| T |
13975982 |
caacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaa |
13975883 |
T |
 |
| Q |
225 |
ccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatca |
323 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |
|
|
| T |
13975882 |
tgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatca |
13975783 |
T |
 |
| Q |
324 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13975782 |
acaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
13975722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 125 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13955150 - 13954890
Alignment:
| Q |
125 |
caacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaa |
224 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||||| || |
|
|
| T |
13955150 |
caacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaa |
13955051 |
T |
 |
| Q |
225 |
ccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatca |
323 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |
|
|
| T |
13955050 |
tgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatca |
13954951 |
T |
 |
| Q |
324 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13954950 |
acaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
13954890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 55316215 - 55316468
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
55316215 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc |
55316314 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
55316315 |
aacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
55316414 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
55316415 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
55316468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 41270071 - 41270324
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
41270071 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc |
41270170 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |
|
|
| T |
41270171 |
aacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcataca |
41270270 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
41270271 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
41270324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15468717 - 15468338
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcaca---------aaacc |
101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
15468717 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatacattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaatttcaccaaaac |
15468618 |
T |
 |
| Q |
102 |
accaacaacaa-tccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatag |
200 |
Q |
| |
|
| ||||||||| || | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||||||||| | |
|
|
| T |
15468617 |
aacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatgg |
15468518 |
T |
 |
| Q |
201 |
aacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg-aacatgtaat |
298 |
Q |
| |
|
|| | |||| | | |||| | ||| || ||| || |||| |||| ||||| | | || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
15468517 |
aatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataa-tttcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaat |
15468419 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | | | || |||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15468418 |
ttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
15468338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 2449369 - 2449238
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
2449369 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
2449270 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2449269 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
2449238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 22275088 - 22275423
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcaca---------aaacc |
101 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |
|
|
| T |
22275088 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcactaatttcacaaatttcaccaaaac |
22275187 |
T |
 |
| Q |
102 |
accaacaacaa-tccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatag |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||||||||| | |
|
|
| T |
22275188 |
accaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatgg |
22275287 |
T |
 |
| Q |
201 |
aacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg-aacatgtaat |
298 |
Q |
| |
|
|| | |||| | | |||| | ||| || ||| || |||| |||| ||||| | | || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
22275288 |
aatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataa-tttcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaat |
22275386 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgca |
335 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22275387 |
ttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
22275423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 47984646 - 47984765
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
47984646 |
ttctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctc |
47984745 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca |
237 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
47984746 |
aatccaacaacaacttagca |
47984765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 48003220 - 48003339
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
48003220 |
ttctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctc |
48003319 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca |
237 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48003320 |
aatccaacaacaacttagca |
48003339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 48421624 - 48421704
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48421624 |
catcaacaattaaccacaaccacaatttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
48421704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 47993933 - 47994052
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
47993933 |
ttctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctc |
47994032 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca |
237 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
47994033 |
aatccaacaacaacttagca |
47994052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 48012506 - 48012625
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
48012506 |
ttctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctc |
48012605 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca |
237 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48012606 |
aatccaacaacaacttagca |
48012625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11986424 - 11986169
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||| | | ||||||||| ||||| |||||| | || | |||| | |
|
|
| T |
11986424 |
caatccatgaatatgcatacccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaa |
11986325 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa--catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatc |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||| |||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
11986324 |
caacttagcaaaattcactatttgagcacaattt-cataacttgacattaatacatactttaaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatt |
11986226 |
T |
 |
| Q |
326 |
aattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatc |
382 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11986225 |
aaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatc |
11986169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 14177227 - 14177158
Alignment:
| Q |
22 |
aaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14177227 |
aaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcaaccacaacatgtcataattcatcaatt |
14177158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 18969968 - 18970048
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18969968 |
catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgctttccatcagaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
18970048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17956281 - 17956210
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
17956281 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag |
17956210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 385
Target Start/End: Original strand, 19231979 - 19232044
Alignment:
| Q |
320 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19231979 |
atcatcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
19232044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 368
Target Start/End: Original strand, 17139481 - 17139754
Alignment:
| Q |
97 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc |
195 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||||||| ||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
17139481 |
aaactaccaacaacatctcatttcgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc |
17139580 |
T |
 |
| Q |
196 |
aatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacat |
293 |
Q |
| |
|
||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||| | || |||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
17139581 |
aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcata--tttcaacatataccattttctcatagtttgaacat |
17139678 |
T |
 |
| Q |
294 |
gtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| | |||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17139679 |
gaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
17139754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 369
Target Start/End: Original strand, 14080701 - 14080756
Alignment:
| Q |
315 |
caattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14080701 |
caattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
14080756 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 39656390 - 39656467
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39656390 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcatgccatcatattt---gaacaacatgtcataattcaccaatt |
39656467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4145923 - 4145814
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttgga |
359 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
4145923 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattgga |
4145824 |
T |
 |
| Q |
360 |
gcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
| |||||||| |
|
|
| T |
4145823 |
gtacgaattt |
4145814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 381
Target Start/End: Original strand, 54651557 - 54651717
Alignment:
| Q |
222 |
caaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg-aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaatt |
319 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
54651557 |
caacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtataattt-cataacttaacatttatacatactttgcaacatgcaatttcactcacaatcatacaatt |
54651655 |
T |
 |
| Q |
320 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattat |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
54651656 |
atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattat |
54651717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47784851 - 47784767
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
47784851 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
47784767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6228735 - 6228625
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
6228735 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattag |
6228636 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
6228635 |
agcacgaattt |
6228625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11329235 - 11329081
Alignment:
| Q |
97 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc |
195 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||||||| ||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
11329235 |
aaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc |
11329136 |
T |
 |
| Q |
196 |
aatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt |
250 |
Q |
| |
|
||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
11329135 |
aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
11329081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 55441141 - 55440848
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
55441141 |
aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatca |
55441042 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatt |
276 |
Q |
| |
|
||| || | | ||||||||| || || ||| | || | |||| |||||||||| ||| | ||||| |||| |||| || ||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
55441041 |
cttagcatcaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagca-tattttcatcatatatcatt |
55440943 |
T |
 |
| Q |
277 |
tttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattat-catcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||| |||| ||| ||||| | ||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
55440942 |
ttctcatactttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaattt |
55440848 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 17191703 - 17191788
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
17191703 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
17191788 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 17204843 - 17204928
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
17204843 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
17204928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19261069 - 19260821
Alignment:
| Q |
140 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaa |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || || ||||||| |||||||| | |||||| || || || ||| | || | |||| || | ||||||||| | | |
|
|
| T |
19261069 |
atgcatacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtata |
19260970 |
T |
 |
| Q |
240 |
attcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatc-atcaattcatgcata |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || | |||||| || || | |||| |||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||| || | ||||| ||| |
|
|
| T |
19260969 |
attcaccaattgagcata-ttttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatc |
19260871 |
T |
 |
| Q |
338 |
caaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataa |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19260870 |
taaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataa |
19260821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 252
Target Start/End: Original strand, 14295404 - 14295568
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
14295404 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaa |
14295503 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga |
252 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14295504 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattga |
14295568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14814974 - 14814765
Alignment:
| Q |
161 |
catcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaat |
259 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||| || || || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
14814974 |
catcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaat |
14814875 |
T |
 |
| Q |
260 |
tttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttg |
357 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
14814874 |
t--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataatta |
14814777 |
T |
 |
| Q |
358 |
gagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
14814776 |
aagcacgaattt |
14814765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 242
Target Start/End: Original strand, 16880114 - 16880242
Alignment:
| Q |
115 |
catttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcata |
213 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| || |
|
|
| T |
16880114 |
catttatcaccaataattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatctta |
16880213 |
T |
 |
| Q |
214 |
actcaatccaaccacaacttagcaaaatt |
242 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
16880214 |
tcacaattcaacaacaacatagcataatt |
16880242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 153
Target Start/End: Original strand, 30152908 - 30152972
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc |
153 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
30152908 |
tttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
30152972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 30207378 - 30207462
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30207378 |
tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
30207462 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3576522 - 3576439
Alignment:
| Q |
286 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| |
|
|
| T |
3576522 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaatt |
3576439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 379
Target Start/End: Original strand, 49232396 - 49232694
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || | || | |||||||| || ||||| || | | ||||| ||| |
|
|
| T |
49232396 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagtta |
49232495 |
T |
 |
| Q |
182 |
acaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttac |
281 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| ||| | |||||| | |||| | ||| || ||| || |||| |||| ||||| | || || ||||| |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
49232496 |
acaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataa-tttcataacttaacatttatac |
49232594 |
T |
 |
| Q |
282 |
ata-tttg-aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
49232595 |
atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
49232694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 158
Target Start/End: Original strand, 33341847 - 33341916
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga |
158 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
33341847 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatga |
33341916 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 41661702 - 41661812
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
41661702 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaag |
41661801 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
41661802 |
agcacgaattt |
41661812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9590839 - 9590754
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattca-tgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
9590839 |
tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattt |
9590754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14528286 - 14528145
Alignment:
| Q |
97 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| | | || | ||||||||| ||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
14528286 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc |
14528187 |
T |
 |
| Q |
196 |
aatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagca |
237 |
Q |
| |
|
||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
14528186 |
aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagca |
14528145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 252
Target Start/End: Original strand, 17100645 - 17100782
Alignment:
| Q |
116 |
atttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataa |
214 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| | || |
|
|
| T |
17100645 |
atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttat |
17100744 |
T |
 |
| Q |
215 |
ctcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattga |
252 |
Q |
| |
|
| |||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17100745 |
cacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga |
17100782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 252
Target Start/End: Original strand, 17101330 - 17101467
Alignment:
| Q |
116 |
atttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataa |
214 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| | || |
|
|
| T |
17101330 |
atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttat |
17101429 |
T |
 |
| Q |
215 |
ctcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattga |
252 |
Q |
| |
|
| |||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17101430 |
cacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga |
17101467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 153
Target Start/End: Original strand, 19946664 - 19946728
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc |
153 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
19946664 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagc |
19946728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47785017 - 47784920
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaa |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||| |||| |||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
47785017 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaa |
47784920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12560510 - 12560362
Alignment:
| Q |
97 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc |
195 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | || | | || ||||||||||| ||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
12560510 |
aaactaccaacaacatctcatttctcaacatcaaatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatc |
12560411 |
T |
 |
| Q |
196 |
aatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca |
244 |
Q |
| |
|
|| || || |||||||| | |||| |||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
12560410 |
cattgatcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattca |
12560362 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 12953126 - 12953210
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || || |||||||| |
|
|
| T |
12953126 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaatt |
12953210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13301552 - 13301472
Alignment:
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaa |
366 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
13301552 |
tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaa |
13301472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13312208 - 13312128
Alignment:
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaa |
366 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
13312208 |
tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaa |
13312128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 252
Target Start/End: Original strand, 14301031 - 14301195
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| | |||| | ||||||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
14301031 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaacaa |
14301130 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga |
252 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14301131 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattga |
14301195 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14059482 - 14059214
Alignment:
| Q |
102 |
accaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatag |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||||| || |||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
14059482 |
accaacaacatctcatttctcatcaacagatcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattg |
14059383 |
T |
 |
| Q |
201 |
aacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaat |
298 |
Q |
| |
|
|||| |||| || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || | ||||| | | ||||||| |||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
14059382 |
aacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattgagcata--tttcaacatatgtcattttctcatactttgaacatgaaat |
14059285 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||| | || || | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14059284 |
ttctctaaaaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
14059214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 369
Target Start/End: Original strand, 15517795 - 15517878
Alignment:
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
15517795 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
15517878 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 131
Target Start/End: Original strand, 7853948 - 7853990
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaat |
131 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7853948 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat |
7853990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31412443 - 31412349
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31412443 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcata |
31412349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16934270 - 16934241
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16934270 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
16934241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Original strand, 25058876 - 25058997
Alignment:
| Q |
260 |
tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg |
357 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |
|
|
| T |
25058876 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
25058975 |
T |
 |
| Q |
358 |
gagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25058976 |
gagcacgaatttagcaacaatt |
25058997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 349
Target Start/End: Original strand, 34560061 - 34560126
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34560061 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcat |
34560126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 158
Target Start/End: Original strand, 45581597 - 45581666
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga |
158 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
45581597 |
tttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatga |
45581666 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 16880285 - 16880369
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
16880285 |
tttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaatt |
16880369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24929165 - 24928782
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24929165 |
catcaacaattaaccacaaccagaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcgtaattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
24929066 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |
|
|
| T |
24929065 |
aatccatttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagac |
24928966 |
T |
 |
| Q |
211 |
ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24928965 |
ataactcaatccaaccacaacttagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
24928866 |
T |
 |
| Q |
311 |
cttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24928865 |
catacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaat |
24928782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16193973 - 16193707
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
16193973 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa |
16193874 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
16193873 |
caatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaattatcatcaa |
16193774 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
16193773 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaat |
16193707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 118 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 43373735 - 43373468
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
43373735 |
ttctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctc |
43373636 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa |
317 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
43373635 |
aaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataa |
43373536 |
T |
 |
| Q |
318 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
43373535 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccat |
43373468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 128 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16405229 - 16404975
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | | |
|
|
| T |
16405229 |
caattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaattta---a |
16405133 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
16405132 |
caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
16405033 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
16405032 |
ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccat |
16404975 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 128 - 367
Target Start/End: Original strand, 24548988 - 24549227
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | ||| ||| | |
|
|
| T |
24548988 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaa |
24549087 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
24549088 |
taacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
24549187 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
24549188 |
ttcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaat |
24549227 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 128 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6774503 - 6774264
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
6774503 |
caattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaa |
6774404 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
6774403 |
taacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
6774304 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
6774303 |
ttcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaat |
6774264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
| Q |
133 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | | |||| |
|
|
| T |
17345581 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataact |
17345679 |
T |
 |
| Q |
233 |
tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat |
332 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17345680 |
tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
17345779 |
T |
 |
| Q |
333 |
gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17345780 |
gcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat |
17345832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22907606 - 22907214
Alignment:
| Q |
1 |
atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcata--------attcaccaattt |
92 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
22907606 |
atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaattt |
22907507 |
T |
 |
| Q |
93 |
cacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataa |
191 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | || |
|
|
| T |
22907506 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa |
22907407 |
T |
 |
| Q |
192 |
catcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaac |
291 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
22907406 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac |
22907308 |
T |
 |
| Q |
292 |
atgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22907307 |
atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
22907214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21844828 - 21844576
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||| | ||| |
|
|
| T |
21844828 |
ttctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctc |
21844729 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
21844728 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
21844629 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
21844628 |
atcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
21844576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21852221 - 21851969
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
21852221 |
ttctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctc |
21852122 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
21852121 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcataca |
21852022 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
21852021 |
atcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
21851969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41507177 - 41507029
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41507177 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataactcaccaattccactaaaccaccaacaac |
41507078 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
41507077 |
aatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatga |
41507029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 370
Target Start/End: Original strand, 30120734 - 30120971
Alignment:
| Q |
134 |
atgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaactt |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
30120734 |
atgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaactt |
30120833 |
T |
 |
| Q |
234 |
agca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat |
332 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||| ||||||| |
|
|
| T |
30120834 |
aggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcat |
30120933 |
T |
 |
| Q |
333 |
gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
30120934 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
30120971 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 5238219 - 5238350
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5238219 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
5238318 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5238319 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
5238350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 24661379 - 24661248
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
24661379 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
24661280 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24661279 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
24661248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 43685678 - 43685809
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
43685678 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
43685777 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43685778 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
43685809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 222947 - 222754
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
222947 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
222848 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
310 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
222847 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
222754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 736570 - 736377
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
736570 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
736471 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
310 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
736470 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
736377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 860465 - 860272
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
860465 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
860366 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
310 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
860365 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
860272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16674648 - 16674395
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
16674648 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc |
16674549 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
16674548 |
aacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
16674449 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
16674448 |
actaacataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaattta |
16674395 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 2544855 - 2544958
Alignment:
| Q |
28 |
aaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaa |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2544855 |
aaccacaacttatgattatgcataccatcatatttcaacaacaacatgtcgtaattcaccaatttcacaaaaccactaacaacagtccatttctcaacaa |
2544954 |
T |
 |
| Q |
128 |
caat |
131 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
2544955 |
caat |
2544958 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 250
Target Start/End: Original strand, 23837153 - 23837325
Alignment:
| Q |
79 |
taattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23837153 |
taattcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca |
23837252 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt |
250 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| ||||| || || || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
23837253 |
cttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
23837325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 23217924 - 23218004
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23217924 |
catcaacaatcaaccacaactacaacttataatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
23218004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21198439 - 21198152
Alignment:
| Q |
84 |
caccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
21198439 |
caccaattttaccaaaccaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttag |
21198340 |
T |
 |
| Q |
183 |
caaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttac |
281 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||| ||||| || || || | |||| |||| ||||| || || |||||| ||||| || || |||| || | ||||| ||| | |
|
|
| T |
21198339 |
caacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataatt--caacatatatcactttctc |
21198242 |
T |
 |
| Q |
282 |
ata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
21198241 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
21198152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 22981244 - 22981318
Alignment:
| Q |
17 |
caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
22981244 |
caatcaaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt |
22981318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 26011656 - 26011741
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
26011656 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
26011741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22321654 - 22321574
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22321654 |
catcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatgcattccatcacaatttaacaataacatgttataattcaccaatt |
22321574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23226353 - 23226076
Alignment:
| Q |
94 |
acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataac |
192 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||| | ||| |
|
|
| T |
23226353 |
acaaaaccaacaacaacaatccatttctcataatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaac |
23226254 |
T |
 |
| Q |
193 |
atcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaa |
290 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | || | | ||| |||| ||||| || || ||||| | || |||| || || |||| || ||| || || |||||| ||| | |
|
|
| T |
23226253 |
atcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcaatcatttgagcataa--ttcataagttaacacttatacatacttttga |
23226156 |
T |
 |
| Q |
291 |
catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
23226155 |
catgcaaattcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt |
23226076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Original strand, 41246614 - 41246733
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
41246614 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
41246713 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaat |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
41246714 |
ttaacaacaacaacatcaat |
41246733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 691965 - 691909
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
310 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
691965 |
cacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
691909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 17285366 - 17285450
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17285366 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattggagcacgaatt |
17285450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24717159 - 24717111
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24717159 |
ttcaccaattttacaaaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaa |
24717111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22006554 - 22006256
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || | || | || | |||||||| |||||||| || | ||||||| ||| |
|
|
| T |
22006554 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcagtccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaataacatcagtta |
22006455 |
T |
 |
| Q |
182 |
acaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttac |
281 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| ||| | |||||| | |||| | ||| || ||| || |||| |||| ||||| | || || ||||| |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
22006454 |
acaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataa-tttcataacttaacatttatac |
22006356 |
T |
 |
| Q |
282 |
ata-tttg-aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22006355 |
atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
22006256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22736108 - 22735958
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaata |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| | | |||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
22736108 |
caccaacaacaactcatttttcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagttagcaagaacaacatcaatt |
22736009 |
T |
 |
| Q |
200 |
gaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt |
250 |
Q |
| |
|
||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||| |
|
|
| T |
22736008 |
gaacatgaatcttatcacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatt |
22735958 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 15933460 - 15933545
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
15933460 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattt |
15933545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 25296320 - 25296405
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
25296320 |
tttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattt |
25296405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 25758340 - 25758425
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
25758340 |
tttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattt |
25758425 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13662561 - 13662263
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||| | |||| |||||||| |||||||| || | | ||||| ||| |
|
|
| T |
13662561 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttagttctcatcatcaatccataattatgtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagtta |
13662462 |
T |
 |
| Q |
182 |
acaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttac |
281 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| ||| | |||||| | |||| | ||| || ||| || |||| |||| ||||| | || || ||||| |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
13662461 |
acaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataa-tttcataacttaacatttatac |
13662363 |
T |
 |
| Q |
282 |
ata-tttg-aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||||||||||| |||| | | | || ||||| ||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13662362 |
atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
13662263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18261695 - 18261471
Alignment:
| Q |
146 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcac |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||| || || | | |||| |||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
18261695 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
18261596 |
T |
 |
| Q |
246 |
caatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaac |
342 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
18261595 |
caattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaagatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaac |
18261498 |
T |
 |
| Q |
343 |
atatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
18261497 |
atatcatcataactagagcacgaattt |
18261471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Original strand, 17285223 - 17285321
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17285223 |
aattcaccaattttgcaaaactaccaacaacaactcatttctcatcctcaagtcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca |
17285321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 5238126 - 5238203
Alignment:
| Q |
1 |
atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca |
78 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5238126 |
atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca |
5238203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 5854776 - 5854861
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
5854776 |
tttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
5854861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15319455 - 15319414
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15319455 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca |
15319414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15499824 - 15499783
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15499824 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca |
15499783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22089090 - 22089049
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22089090 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca |
22089049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Original strand, 23149985 - 23150026
Alignment:
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23149985 |
ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt |
23150026 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24661472 - 24661395
Alignment:
| Q |
1 |
atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca |
78 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24661472 |
atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca |
24661395 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31194615 - 31194490
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
31194615 |
aattcaccaattttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcaccaacaaatcatgaatcatgtgcacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcat |
31194516 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaaca |
204 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31194515 |
ttagcaacaacaacatcaattgaaca |
31194490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39447057 - 39446892
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| | || | | ||||||||| |
|
|
| T |
39447057 |
aattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcataatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcac |
39446958 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
39446957 |
ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca |
39446892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21259685 - 21259637
Alignment:
| Q |
22 |
aaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaaca |
70 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
21259685 |
aaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaaca |
21259637 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 353
Target Start/End: Original strand, 33172322 - 33172459
Alignment:
| Q |
217 |
caatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttg |
314 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
33172322 |
caattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatt |
33172419 |
T |
 |
| Q |
315 |
caattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33172420 |
caattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcata |
33172459 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 146 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 45559161 - 45558953
Alignment:
| Q |
146 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcac |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||| || || | | |||| |||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
45559161 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
45559062 |
T |
 |
| Q |
246 |
caatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatca-tcaattcatgcatacaaac |
342 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | | |||||| | ||||| |
|
|
| T |
45559061 |
caattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaac |
45558964 |
T |
 |
| Q |
343 |
atatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
45558963 |
atatcatcata |
45558953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23151919 - 23151833
Alignment:
| Q |
284 |
atttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatca-tcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23151919 |
atttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattt |
23151833 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37653726 - 37653616
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| || |
|
|
| T |
37653726 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcagcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgcatacaaacacatcaccataattaa |
37653627 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
37653626 |
agcacgaattt |
37653616 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 3431577 - 3431548
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3431577 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
3431548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 13721224 - 13721195
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13721224 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
13721195 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19993346 - 19993249
Alignment:
| Q |
79 |
taattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat |
175 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| ||| |||| | |||| | ||||||| |
|
|
| T |
19993346 |
taattcaccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacat |
19993249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Original strand, 23158367 - 23158408
Alignment:
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
23158367 |
ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcatgaattt |
23158408 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 23837360 - 23837445
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
23837360 |
tttgaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
23837445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 29759919 - 29759972
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
29759919 |
caccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
29759972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 43685585 - 43685662
Alignment:
| Q |
1 |
atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca |
78 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43685585 |
atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca |
43685662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Original strand, 171794 - 172177
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
171794 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgttgtaattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
171893 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
171894 |
aatccatttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatc |
171993 |
T |
 |
| Q |
211 |
ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
310 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
171994 |
gtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaat |
172093 |
T |
 |
| Q |
311 |
cttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
172094 |
catacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaat |
172177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Original strand, 177497 - 177880
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
177497 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgttgtaattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
177596 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
177597 |
aatccatttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatc |
177696 |
T |
 |
| Q |
211 |
ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
310 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
177697 |
gtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaat |
177796 |
T |
 |
| Q |
311 |
cttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
177797 |
catacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaat |
177880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 70913 - 70840
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag |
152 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
70913 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaag |
70840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Original strand, 271914 - 272297
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
271914 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaactacatgtcttaattcactaatttcacaaaaccaccaacaac |
272013 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
272014 |
aatccatttctctataacaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatc |
272113 |
T |
 |
| Q |
211 |
ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
272114 |
ataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaat |
272213 |
T |
 |
| Q |
311 |
cttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
272214 |
catacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaat |
272297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37209 - 36913
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37209 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca |
37110 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37109 |
taacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
37010 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37009 |
aacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccat |
36913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 462744 - 463010
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
462744 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaa |
462843 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
462844 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa |
462943 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
462944 |
ttcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaat |
463010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36982737 - 36982441
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||| ||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
36982737 |
tttcactaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa |
36982638 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36982637 |
taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
36982538 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36982537 |
aacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
36982441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 8891199 - 8891505
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| ||| |||||||||| || || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8891199 |
aattcatcattttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
8891298 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8891299 |
ttaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg |
8891398 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8891399 |
ttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaat |
8891498 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
8891499 |
tatccat |
8891505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 87 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19795004 - 19794704
Alignment:
| Q |
87 |
caatttcac-aaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaaca |
184 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
19795004 |
caatttcaccaaaaacaccaacaaaaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacg |
19794905 |
T |
 |
| Q |
185 |
accataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || |
|
|
| T |
19794904 |
gaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttccta |
19794805 |
T |
 |
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca |
384 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
19794804 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatcca |
19794705 |
T |
 |
| Q |
385 |
t |
385 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
19794704 |
t |
19794704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20627570 - 20627308
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||| ||| | |
|
|
| T |
20627570 |
caattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaa |
20627471 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
20627470 |
caacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
20627371 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatca |
390 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20627370 |
ttcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatca |
20627308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24341646 - 24341390
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
24341646 |
caattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaa |
24341547 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
24341546 |
caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
24341447 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24341446 |
ttcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatcca |
24341390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43643214 - 43642958
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
43643214 |
caattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataa |
43643115 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
43643114 |
caactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
43643015 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
43643014 |
ttcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatcca |
43642958 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 101 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25265675 - 25265390
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaata |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
25265675 |
caccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaatt |
25265576 |
T |
 |
| Q |
200 |
gaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatt |
299 |
Q |
| |
|
||||| | || | | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25265575 |
gaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatt |
25265476 |
T |
 |
| Q |
300 |
tcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25265475 |
tcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
25265390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 128 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7508101 - 7507894
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaat-agaacaagaatcataactcaatccaacc |
226 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
7508101 |
caatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aaca |
7508003 |
T |
 |
| Q |
227 |
acaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca |
326 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
7508002 |
acaacttagccaaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
7507903 |
T |
 |
| Q |
327 |
attcatgca |
335 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
7507902 |
attcatgca |
7507894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17396920 - 17396653
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| || || || ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
17396920 |
ttctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc |
17396821 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
17396820 |
aaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
17396721 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17396720 |
atcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
17396653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 25601911 - 25602066
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25601911 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
25602010 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatca |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
25602011 |
aatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatca |
25602066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19886917 - 19886664
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19886917 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
19886818 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | |||||||||| || | |||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
19886817 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca |
19886718 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
19886717 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
19886664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19689532 - 19689401
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
19689532 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
19689433 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19689432 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
19689401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 23820203 - 23820334
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23820203 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
23820302 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23820303 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
23820334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14906571 - 14906440
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14906571 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
14906472 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14906471 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
14906440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 20015143 - 20015274
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
20015143 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaa |
20015242 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20015243 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
20015274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Original strand, 22274681 - 22274738
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat |
139 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22274681 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaattcatgaat |
22274738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 369
Target Start/End: Original strand, 19666498 - 19666775
Alignment:
| Q |
94 |
acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataac |
192 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| |||| | ||| |
|
|
| T |
19666498 |
acaaaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaacaac |
19666597 |
T |
 |
| Q |
193 |
atcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaa |
290 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | || | | ||| ||| ||||| ||||| ||||| |||| |||| || || |||| || ||| || || |||||| |||||| |
|
|
| T |
19666598 |
atcaattgaacatggttctcatcataattcaataacaacatagcataattcaaccatttgagcataa--ttcataagttaacacttatacatactttgaa |
19666695 |
T |
 |
| Q |
291 |
catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
19666696 |
catgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattt |
19666775 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 368
Target Start/End: Original strand, 67958 - 68238
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||| |||| | |
|
|
| T |
67958 |
tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa |
68057 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tt |
286 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || || | ||||| | ||||| ||| |||| || |
|
|
| T |
68058 |
caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata--tttcaacatatatcactttctcatactt |
68155 |
T |
 |
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
68156 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
68238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 67859 - 67933
Alignment:
| Q |
17 |
caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
67859 |
caattaaccacaacgacaaattataatcatacattccatcatattacaacaacaacatgtcataaatcaccaatt |
67933 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Original strand, 22283914 - 22283971
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat |
139 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
22283914 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaat |
22283971 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 24884848 - 24884933
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattc-atgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
24884848 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattt |
24884933 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 25305405 - 25305526
Alignment:
| Q |
84 |
caccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
25305405 |
caccaatttcgcaaaactaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttag |
25305504 |
T |
 |
| Q |
183 |
caaccataacatcaatagaaca |
204 |
Q |
| |
|
| || | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25305505 |
ccacaacaacatcaattgaaca |
25305526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24571583 - 24571409
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |||| | |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
24571583 |
aattcaccaatttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagccaagc-atgagttatcatcaacaacatca |
24571485 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga |
252 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24571484 |
cttaacaacaacaacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattga |
24571409 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 91
Target Start/End: Original strand, 7321586 - 7321644
Alignment:
| Q |
33 |
caacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
7321586 |
caacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt |
7321644 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19433614 - 19433498
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacc |
187 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
19433614 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaaca |
19433515 |
T |
 |
| Q |
188 |
ataacatcaatagaaca |
204 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19433514 |
acaacatcaattgaaca |
19433498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 366
Target Start/End: Original strand, 19660044 - 19660124
Alignment:
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaa |
366 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
19660044 |
tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaa |
19660124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19669191 - 19669116
Alignment:
| Q |
288 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagca |
362 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
19669191 |
gaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagca |
19669116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 353
Target Start/End: Original strand, 9636761 - 9636976
Alignment:
| Q |
139 |
tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| | |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||| || || | | |||| |||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
9636761 |
tatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcac |
9636860 |
T |
 |
| Q |
239 |
aattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgca |
335 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || || |||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| | |
|
|
| T |
9636861 |
aattcaacaattagagcataatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgta |
9636958 |
T |
 |
| Q |
336 |
tacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9636959 |
ttcaaacatatcatcata |
9636976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22579933 - 22579863
Alignment:
| Q |
298 |
tttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22579933 |
tttcaccaacaacaattcaattatcataacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
22579863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Original strand, 12728352 - 12728393
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12728352 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca |
12728393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24686077 - 24686036
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24686077 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca |
24686036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Original strand, 34824435 - 34824476
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34824435 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca |
34824476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36890966 - 36890869
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaac |
186 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
36890966 |
tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaac |
36890869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22775290 - 22775206
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| | |||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22775290 |
tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22775206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780584
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| | |||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22780668 |
tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22780584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 368
Target Start/End: Original strand, 43646059 - 43646139
Alignment:
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
43646059 |
aacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaatt |
43646139 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 198
Target Start/End: Original strand, 32465822 - 32465933
Alignment:
| Q |
88 |
aatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaac |
186 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | | |||||| |
|
|
| T |
32465822 |
aatttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaac |
32465921 |
T |
 |
| Q |
187 |
cataacatcaat |
198 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |
|
|
| T |
32465922 |
aacaacatcaat |
32465933 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 28974003 - 28974124
Alignment:
| Q |
79 |
taattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |
|
|
| T |
28974003 |
taattcaccaattttcactaaaacaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg |
28974102 |
T |
 |
| Q |
177 |
aattaacaaccataacatcaat |
198 |
Q |
| |
|
| ||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
28974103 |
acttagcaacaacaacatcaat |
28974124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 42178265 - 42178236
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42178265 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
42178236 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 368
Target Start/End: Original strand, 25305637 - 25305677
Alignment:
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
25305637 |
ttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
25305677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19469
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||| ||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
19173 |
tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa |
19272 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19273 |
taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
19372 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19373 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
19469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Original strand, 21257 - 21553
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||| ||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
21257 |
tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa |
21356 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21357 |
taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
21456 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21457 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
21553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Original strand, 48565 - 48870
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
48565 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca |
48664 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
48665 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttg |
48764 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataat |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
48765 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag |
48864 |
T |
 |
| Q |
389 |
caaaat |
394 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
48865 |
caaaat |
48870 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 351
Target Start/End: Original strand, 36089 - 36323
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
36089 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctc |
36188 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
36189 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcataca |
36288 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36289 |
actaacatcaattcatacatacaaacataacatca |
36323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 154303 - 154262
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
154303 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccatcaacaatttatttctca |
154262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Original strand, 23506922 - 23507237
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23506922 |
aattcatcattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaa |
23507021 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23507022 |
ttaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttt |
23507121 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23507122 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaat |
23507221 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23507222 |
tatccataagcaaaat |
23507237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27182845 - 27182547
Alignment:
| Q |
88 |
aatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaac |
186 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27182845 |
aatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagc |
27182746 |
T |
 |
| Q |
187 |
cataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt |
286 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| |
|
|
| T |
27182745 |
cataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatt |
27182646 |
T |
 |
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27182645 |
tgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccat |
27182547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18531324 - 18531068
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
18531324 |
caattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaa |
18531225 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
18531224 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
18531125 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18531124 |
ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
18531068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22054090 - 22053834
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
22054090 |
caattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaa |
22053991 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |
|
|
| T |
22053990 |
caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaa |
22053891 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca |
384 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22053890 |
ttcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
22053834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
| Q |
133 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||| |
|
|
| T |
34939289 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgact |
34939387 |
T |
 |
| Q |
233 |
tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat |
332 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34939388 |
tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
34939487 |
T |
 |
| Q |
333 |
gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
34939488 |
gcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat |
34939540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29188486 - 29188290
Alignment:
| Q |
171 |
aacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaactt |
270 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29188486 |
aacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaactt |
29188387 |
T |
 |
| Q |
271 |
atcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
29188386 |
atcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaat |
29188290 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17471956 - 17471586
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
17471956 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcaccaaaacaccaacaac |
17471857 |
T |
 |
| Q |
111 |
aa-tccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaat |
209 |
Q |
| |
|
|| || | |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
17471856 |
aattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaat |
17471757 |
T |
 |
| Q |
210 |
cataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg-aacatgtaatttcaccaac |
307 |
Q |
| |
|
| | || | | ||| || ||| || |||| |||| ||||| | | || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
17471756 |
tacatcttatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataa-tttcattacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccac |
17471658 |
T |
 |
| Q |
308 |
aatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
|| | | | || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17471657 |
aaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaatt |
17471586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 128 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43443641 - 43443398
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||| ||| | ||||| |||| | |
|
|
| T |
43443641 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaa |
43443542 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca |
326 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |
|
|
| T |
43443541 |
caacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca |
43443442 |
T |
 |
| Q |
327 |
attcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
43443441 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
43443398 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18778248 - 18777995
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18778248 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
18778149 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
18778148 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca |
18778049 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
18778048 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
18777995 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22366737 - 22366484
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
22366737 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactc |
22366638 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
22366637 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca |
22366538 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
22366537 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
22366484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 25426624 - 25426877
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25426624 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
25426723 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | |||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
25426724 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca |
25426823 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
25426824 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
25426877 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Original strand, 27009837 - 27010089
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
27009837 |
ttctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc |
27009936 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | || |
|
|
| T |
27009937 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcataca |
27010036 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
27010037 |
atcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
27010089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 12370 - 12623
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12370 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
12469 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | |||||||||| || | |||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
12470 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca |
12569 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
12570 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
12623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 2031697 - 2031845
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
2031697 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataactcaccaattccattaaaccaccaacaac |
2031796 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
2031797 |
aatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatga |
2031845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 19499895 - 19500148
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19499895 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
19499994 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | |||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
19499995 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca |
19500094 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
19500095 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
19500148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21073851 - 21073598
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21073851 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
21073752 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | |||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
21073751 |
aaattaacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca |
21073652 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
21073651 |
actaacatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
21073598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4200226 - 4200007
Alignment:
| Q |
133 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
4200226 |
catgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaaca |
4200127 |
T |
 |
| Q |
233 |
tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattca |
331 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| | || ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
4200126 |
taagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattca |
4200027 |
T |
 |
| Q |
332 |
tgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4200026 |
tgcatacaaacataacatca |
4200007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 20623101 - 20623232
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20623101 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
20623200 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20623201 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
20623232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21233659 - 21233528
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21233659 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
21233560 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21233559 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
21233528 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25900537 - 25900408
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
25900537 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
25900438 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatcc |
383 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25900437 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatcc |
25900408 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 16536329 - 16536460
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16536329 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
16536428 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16536429 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
16536460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 37052876 - 37053007
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37052876 |
cacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
37052975 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37052976 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
37053007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 25004863 - 25004943
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25004863 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcatttcatcatattccaacaacaacatgtcataaatcaccaatt |
25004943 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 382
Target Start/End: Original strand, 32950699 - 32950955
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||| |||| | | ||||||||| ||||| |||||| | ||| | |||| | |
|
|
| T |
32950699 |
caatccatgaatatgcagacccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaa |
32950798 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttat-catttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcat |
324 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
32950799 |
caacatagtaaaattcaccatttgagcacaattt-cataactttgacctttatacatactttgaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcat |
32950897 |
T |
 |
| Q |
325 |
caattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatc |
382 |
Q |
| |
|
||| |||| || || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32950898 |
caaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatc |
32950955 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21310794 - 21310709
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21310794 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
21310709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 369
Target Start/End: Original strand, 29918129 - 29918212
Alignment:
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29918129 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt |
29918212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 369
Target Start/End: Original strand, 432479 - 432710
Alignment:
| Q |
139 |
tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | || |||||||| |||| |||| ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| | |
|
|
| T |
432479 |
tatgaatacccaagccaggaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtat |
432578 |
T |
 |
| Q |
239 |
aattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgca |
335 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || || |||| || | ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
432579 |
aattcatcaatttgagcataatt--caacatatatcattttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgca |
432676 |
T |
 |
| Q |
336 |
tacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
432677 |
ttcaaacatatcatcataattggagcgcgaattt |
432710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23981614 - 23981516
Alignment:
| Q |
273 |
catttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
23981614 |
catttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
23981516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 19862371 - 19862456
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
19862371 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19862456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21297260 - 21297175
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
21297260 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagaggacgaattt |
21297175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5450928 - 5450844
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
5450928 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt |
5450844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21222693 - 21222609
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
21222693 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
21222609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29190553 - 29190481
Alignment:
| Q |
96 |
aaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaac |
167 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29190553 |
aaaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaac |
29190481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 369
Target Start/End: Original strand, 22885806 - 22885889
Alignment:
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
22885806 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattaaagcacgaattt |
22885889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1219816 - 1219775
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1219816 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca |
1219775 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 11342661 - 11342714
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
11342661 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
11342714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 20623008 - 20623085
Alignment:
| Q |
1 |
atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca |
78 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20623008 |
atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca |
20623085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21233752 - 21233675
Alignment:
| Q |
1 |
atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca |
78 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21233752 |
atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca |
21233675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 368
Target Start/End: Original strand, 21617181 - 21617262
Alignment:
| Q |
288 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
21617181 |
gaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
21617262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22883380 - 22883339
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22883380 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca |
22883339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1168474 - 1168204
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaata |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | ||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
1168474 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt |
1168375 |
T |
 |
| Q |
200 |
gaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaat |
298 |
Q |
| |
|
|| || ||| | || | |||| || | ||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1168374 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagca-tattttcaacatatatcattttctcatactttgaacatgtaat |
1168276 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttcaccaacaatcttgcaattat-catcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
| || ||||| | | | ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||| |
|
|
| T |
1168275 |
tcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcatgaattt |
1168204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 368
Target Start/End: Original strand, 16595699 - 16595753
Alignment:
| Q |
315 |
caattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16595699 |
caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
16595753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26559925 - 26559815
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || ||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
26559925 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaag |
26559826 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
26559825 |
agcacgaattt |
26559815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 9730679 - 9730650
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9730679 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
9730650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10778089 - 10777968
Alignment:
| Q |
260 |
tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg |
357 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |
|
|
| T |
10778089 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
10777990 |
T |
 |
| Q |
358 |
gagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10777989 |
gagcacgaatttagcaacaatt |
10777968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Original strand, 23514521 - 23514550
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23514521 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
23514550 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Original strand, 23514698 - 23514819
Alignment:
| Q |
260 |
tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg |
357 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |
|
|
| T |
23514698 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
23514797 |
T |
 |
| Q |
358 |
gagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23514798 |
gagcacgaatttagcaacaatt |
23514819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Original strand, 4865218 - 4865338
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatg-attcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||| | | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
4865218 |
aattcaccattttcatcaaaacaccaacaacacctcatctctcaacaacaattcaagaattatgcaaacccaagccatgaaattatcatcaacaacatga |
4865317 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaat |
198 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4865318 |
ataaacaaccataacaacaat |
4865338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 368
Target Start/End: Original strand, 23494125 - 23494165
Alignment:
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23494125 |
ttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaatt |
23494165 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 367
Target Start/End: Original strand, 24084214 - 24084322
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
24084214 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgtaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattag |
24084313 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
24084314 |
ggcacgaat |
24084322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 28902353 - 28902437
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| | | |||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28902353 |
tttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
28902437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 28938748 - 28938832
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| | | |||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28938748 |
tttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
28938832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 13246387 - 13246693
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13246387 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
13246486 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13246487 |
ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg |
13246586 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13246587 |
ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaat |
13246686 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
13246687 |
tatccat |
13246693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 54118550 - 54118244
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54118550 |
aattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
54118451 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
54118450 |
ttaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattg |
54118351 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
54118350 |
ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaat |
54118251 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
54118250 |
tatccat |
54118244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15675346 - 15675090
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
15675346 |
caattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaa |
15675247 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
15675246 |
caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
15675147 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15675146 |
ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
15675090 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 358
Target Start/End: Original strand, 31115635 - 31115865
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
31115635 |
caattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaa |
31115734 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
31115735 |
caacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
31115834 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31115835 |
ttcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
31115865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 216 - 394
Target Start/End: Original strand, 121983 - 122161
Alignment:
| Q |
216 |
tcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgc |
315 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
121983 |
tcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttac |
122082 |
T |
 |
| Q |
316 |
aattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
122083 |
aattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaat |
122161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 26680071 - 26680463
Alignment:
| Q |
1 |
atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcacc--------aattt |
92 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||| | ||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
26680071 |
atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcgattcccaaattt |
26680170 |
T |
 |
| Q |
93 |
cacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataa |
191 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | || |
|
|
| T |
26680171 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa |
26680270 |
T |
 |
| Q |
192 |
catcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaac |
291 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
26680271 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaac |
26680369 |
T |
 |
| Q |
292 |
atgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26680370 |
atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
26680463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 190 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104251
Alignment:
| Q |
190 |
aacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttga |
289 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10104445 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattga |
10104346 |
T |
 |
| Q |
290 |
acatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10104345 |
acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatcca |
10104251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Original strand, 10644215 - 10644467
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
10644215 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctc |
10644314 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |
|
|
| T |
10644315 |
aaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcataca |
10644414 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
10644415 |
attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
10644467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13048474 - 13048221
Alignment:
| Q |
133 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||| | ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
13048474 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaacaact |
13048375 |
T |
 |
| Q |
233 |
tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattca |
331 |
Q |
| |
|
||| | ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
13048374 |
taggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatca |
13048275 |
T |
 |
| Q |
332 |
tgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13048274 |
tgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat |
13048221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 34395144 - 34395309
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34395144 |
catcaacaattaaccacaatcacaacttatgatcaagcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcgtaattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
34395243 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat |
175 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| | ||||||| |
|
|
| T |
34395244 |
aatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacat |
34395309 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 47357650 - 47357903
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47357650 |
ttctcatcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
47357749 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
47357750 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca |
47357849 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
47357850 |
actaacatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
47357903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 10488694 - 10488825
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
10488694 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
10488793 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10488794 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
10488825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16328057 - 16327926
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16328057 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
16327958 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16327957 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
16327926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 128 - 221
Target Start/End: Original strand, 111401 - 111494
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatc |
221 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
111401 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
111494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885570
Alignment:
| Q |
190 |
aacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg |
288 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
40885749 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatactttg |
40885651 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
40885650 |
aacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt |
40885570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 384
Target Start/End: Original strand, 33240893 - 33240962
Alignment:
| Q |
315 |
caattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca |
384 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33240893 |
caatcatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
33240962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41166233 - 41165947
Alignment:
| Q |
84 |
caccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| | | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
41166233 |
caccaatttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttag |
41166134 |
T |
 |
| Q |
183 |
caaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgaacacaattttcacaacttatcatttttac |
281 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||| ||||| || || | | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || || |||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
41166133 |
caacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa--ttcaacatatatcactttctc |
41166036 |
T |
 |
| Q |
282 |
ata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
41166035 |
atactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaatatattatcataattggagcacaaatt |
41165947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5682824 - 5682753
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
5682824 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag |
5682753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 82
Target Start/End: Original strand, 19559422 - 19559481
Alignment:
| Q |
23 |
accacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataat |
82 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19559422 |
accacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcaacaacaacatgtcataat |
19559481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 34177830 - 34177767
Alignment:
| Q |
28 |
aaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34177830 |
aaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacaagtcataattcaccaatt |
34177767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18494620 - 18494329
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | | || | ||||||||| |
|
|
| T |
18494620 |
aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatca |
18494521 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatt |
276 |
Q |
| |
|
|||||||| | | || |||| || || ||||| |||| |||| |||| ||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||| | || |||| |
|
|
| T |
18494520 |
cttaacaacaacagcaacaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcaca--tttcaacatataccatt |
18494423 |
T |
 |
| Q |
277 |
ttt-acata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18494422 |
tttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
18494329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25119505 - 25119457
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25119505 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa |
25119457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 368
Target Start/End: Original strand, 15044794 - 15045074
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||||| |||||||| || ||| ||||| | ||| | |||||||| |||| |||||| | ||||||||| ||| |||| | |
|
|
| T |
15044794 |
tttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaa |
15044893 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tt |
286 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || || |||| || | ||||| ||| |||| || |
|
|
| T |
15044894 |
caacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatactt |
15044991 |
T |
 |
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15044992 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
15045074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13809766 - 13809511
Alignment:
| Q |
115 |
catttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcata |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| |||| | |||| | ||||||||||||| |||| | ||||||||| || || ||||| || |
|
|
| T |
13809766 |
catttctcaacaaccaatcatgaatcatgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatcatgaatctta |
13809667 |
T |
 |
| Q |
214 |
actcaatccaaccacaacttagcaaaattcacc-aattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatc |
311 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||||| ||||| |||||| | |||||| || | ||||| | || |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
13809666 |
tcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcata--tttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaaatctcaccaacaaca |
13809569 |
T |
 |
| Q |
312 |
ttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13809568 |
attcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt |
13809511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 14901187 - 14901307
Alignment:
| Q |
79 |
taattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||| | |||| |||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
14901187 |
taatttaccaattttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatca |
14901286 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaat |
198 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
14901287 |
cttagcaacaacaacatcaat |
14901307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 381
Target Start/End: Original strand, 7850005 - 7850259
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||| |||| | ||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
7850005 |
caattcatgattatgtatactcaagtcatgattcatcaacaacatactcctttaacaacaacaacatcaatgaaacacaattcatatctcaattcaacaa |
7850104 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaatt-caccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca |
326 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
7850105 |
tcacttagcaaaatttcatcacttgagcacaattttcataacttcacattttcacataattggacatacaattccaccaacaatcacacagttttcatca |
7850204 |
T |
 |
| Q |
327 |
attcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattat |
381 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
7850205 |
atacattcattcaaacataacatctccattggagcacgaatttaacagcaattat |
7850259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17145896 - 17145655
Alignment:
| Q |
139 |
tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || ||||| | || ||||||||| |||| | | | ||||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
17145896 |
tatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaa |
17145797 |
T |
 |
| Q |
239 |
aattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcat |
336 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||| | |
|
|
| T |
17145796 |
aattcactaattgagtataattt-cacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgtac |
17145698 |
T |
 |
| Q |
337 |
acaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
17145697 |
aagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaatt |
17145655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18238381 - 18238173
Alignment:
| Q |
146 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcac |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||| || || | | |||| |||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
18238381 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
18238282 |
T |
 |
| Q |
246 |
caatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaat-tcatgcatacaaac |
342 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| || ||||| |
|
|
| T |
18238281 |
caattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaac |
18238184 |
T |
 |
| Q |
343 |
atatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
18238183 |
atatcatcata |
18238173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 335
Target Start/End: Original strand, 8374525 - 8374722
Alignment:
| Q |
139 |
tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| || ||||| | || ||||||||| |||| | | | ||||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| ||||| || || |
|
|
| T |
8374525 |
tatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatattaa |
8374624 |
T |
 |
| Q |
239 |
aattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgca |
335 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||||| || |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8374625 |
aattcactaattgagtataattt-cataacttaacatttatacatactttgaagcatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
8374722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 18276596 - 18276681
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
18276596 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattt |
18276681 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 47535150 - 47535065
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
47535150 |
tttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
47535065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 153
Target Start/End: Original strand, 14951728 - 14951792
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc |
153 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
14951728 |
tttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
14951792 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15013365 - 15013282
Alignment:
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
15013365 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaa-catatcatcataattagagcacgaattta |
15013282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15109434 - 15109350
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
15109434 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt |
15109350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23270225 - 23270106
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
23270225 |
aattcaccattttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
23270126 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaat |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
23270125 |
ttaacaacaacaacatcaat |
23270106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7964802 - 7964712
Alignment:
| Q |
280 |
acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||| |||| |
|
|
| T |
7964802 |
acatacttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattt |
7964712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 252
Target Start/End: Original strand, 16732124 - 16732298
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaa-tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
16732124 |
aattcaccaagtttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatga |
16732223 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattga |
252 |
Q |
| |
|
||| |||| | |||||||| || || ||| | || | |||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16732224 |
cttagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga |
16732298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Original strand, 18168930 - 18168971
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18168930 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca |
18168971 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 47535337 - 47535236
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| | || ||||| |||| |||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
47535337 |
aattcaccaattttacaaaaccatcaacaacaactcatttctcattaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacgtcaa |
47535238 |
T |
 |
| Q |
179 |
tt |
180 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
47535237 |
tt |
47535236 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40905034 - 40904934
Alignment:
| Q |
271 |
atcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
40905034 |
atcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatcataactagagcacgaatt |
40904935 |
T |
 |
| Q |
369 |
t |
369 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
40904934 |
t |
40904934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Original strand, 44055871 - 44055967
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat |
175 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |
|
|
| T |
44055871 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat |
44055967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10104488 - 10104449
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaac |
167 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10104488 |
caattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac |
10104449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 30232581 - 30232498
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30232581 |
tttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
30232498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 91
Target Start/End: Original strand, 9795314 - 9795344
Alignment:
| Q |
61 |
ttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9795314 |
ttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
9795344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41256479 - 41256370
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| || | |
|
|
| T |
41256479 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattc-aacatttcatcataattag |
41256381 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
41256380 |
agcacgaattt |
41256370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7185945 - 7185844
Alignment:
| Q |
270 |
tatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| |
|
|
| T |
7185945 |
tatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaat |
7185846 |
T |
 |
| Q |
368 |
tt |
369 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
7185845 |
tt |
7185844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 335
Target Start/End: Original strand, 22738406 - 22738483
Alignment:
| Q |
260 |
tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgca |
335 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22738406 |
tttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
22738483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 90 - 382
Target Start/End: Original strand, 148688 - 148981
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
148688 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaacca |
148787 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
148788 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
148887 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatc |
382 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
148888 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatc |
148981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Original strand, 8855 - 9111
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
8855 |
caattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaa |
8954 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
8955 |
caacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
9054 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9055 |
ttcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatcca |
9111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 85670 - 85779
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
85670 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatt-aaacatatcatcataattag |
85768 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
85769 |
agcacgaattt |
85779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 352
Target Start/End: Original strand, 53508 - 53576
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaat-tcatgcatacaaacatatcatcat |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
53508 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcat |
53576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 80 - 387
Target Start/End: Original strand, 1081 - 1389
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1081 |
aattcatcattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaa |
1180 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1181 |
ttaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttt |
1280 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1281 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat |
1380 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccataa |
387 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
1381 |
tatccataa |
1389 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3839 - 3573
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
3839 |
caatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa |
3740 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
3739 |
caacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
3640 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3639 |
ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaat |
3573 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:
Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 101 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5345 - 5061
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatag |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
5345 |
caccaacaacattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattg |
5246 |
T |
 |
| Q |
201 |
aacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattt |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
5245 |
aacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtacttt |
5146 |
T |
 |
| Q |
301 |
caccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5145 |
caccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccat |
5061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 123460 - 123164
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
123460 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
123361 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||| |
|
|
| T |
123360 |
taacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
123261 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
123260 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccat |
123164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 255105 - 255009
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat |
175 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| | ||||||| |
|
|
| T |
255105 |
aattcacaaatttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacat |
255009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 261711 - 261615
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat |
175 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| | ||||||| |
|
|
| T |
261711 |
aattcacaaatttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacat |
261615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11581045 - 11580739
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11581045 |
aattcatcattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcgtcctcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
11580946 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11580945 |
ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg |
11580846 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
11580845 |
ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataat |
11580746 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
11580745 |
tatccat |
11580739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13037320 - 13037014
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13037320 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
13037221 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13037220 |
ttaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg |
13037121 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13037120 |
ttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaat |
13037021 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
13037020 |
tatccat |
13037014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 133 - 394
Target Start/End: Original strand, 16211777 - 16212038
Alignment:
| Q |
133 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
16211777 |
catgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact |
16211876 |
T |
 |
| Q |
233 |
tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16211877 |
tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcat |
16211976 |
T |
 |
| Q |
333 |
gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
16211977 |
gcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaat |
16212038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 128 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 47481288 - 47481031
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
47481288 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaa |
47481189 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
47481188 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaa |
47481089 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
47481088 |
ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
47481031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 3059972 - 3060238
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
3059972 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaa |
3060071 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |
|
|
| T |
3060072 |
caacttaacaaaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaa |
3060171 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3060172 |
ttaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaat |
3060238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Original strand, 36052634 - 36052927
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36052634 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
36052733 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36052734 |
caacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
36052830 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36052831 |
aacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccat |
36052927 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 118 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18254102 - 18253841
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
18254102 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctc |
18254003 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa |
317 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
18254002 |
aaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa |
18253903 |
T |
 |
| Q |
318 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18253902 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaatt |
18253841 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 93 - 384
Target Start/End: Original strand, 13320984 - 13321278
Alignment:
| Q |
93 |
cacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13320984 |
cacaaaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa |
13321083 |
T |
 |
| Q |
192 |
catcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca-caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttga |
289 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
13321084 |
catcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttga |
13321182 |
T |
 |
| Q |
290 |
a-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatcca |
384 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13321183 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca |
13321278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 128 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16479207 - 16478968
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| || | |
|
|
| T |
16479207 |
caatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaa |
16479108 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
16479107 |
taacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
16479008 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
16479007 |
ttcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaat |
16478968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 7292887 - 7293279
Alignment:
| Q |
1 |
atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcata--------attcaccaattt |
92 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
7292887 |
atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaattt |
7292986 |
T |
 |
| Q |
93 |
cacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataa |
191 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | || |
|
|
| T |
7292987 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa |
7293086 |
T |
 |
| Q |
192 |
catcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaac |
291 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
7293087 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac |
7293185 |
T |
 |
| Q |
292 |
atgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7293186 |
atgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
7293279 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25292597 - 25292338
Alignment:
| Q |
126 |
aacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaac |
225 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
25292597 |
aacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaac |
25292498 |
T |
 |
| Q |
226 |
cacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatc |
325 |
Q |
| |
|
||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |
|
|
| T |
25292497 |
gacaacctaggagaattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaac |
25292398 |
T |
 |
| Q |
326 |
aattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25292397 |
aattcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat |
25292338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Original strand, 13572672 - 13572924
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
13572672 |
ttctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc |
13572771 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13572772 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacaca |
13572871 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
13572872 |
atcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
13572924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 10989406 - 10989658
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10989406 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
10989505 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| | | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
10989506 |
aaatta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
10989604 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
10989605 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
10989658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 128 - 351
Target Start/End: Original strand, 2437463 - 2437687
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| | |||| ||| | |
|
|
| T |
2437463 |
caatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaa |
2437562 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaa-ttcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca |
326 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |
|
|
| T |
2437563 |
caacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca |
2437662 |
T |
 |
| Q |
327 |
attcatgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2437663 |
attcatgcatacaaacataacatca |
2437687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 118 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13911281 - 13911046
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
13911281 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctc |
13911182 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaactt-agca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgc |
315 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| || | ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
13911181 |
aaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatac |
13911082 |
T |
 |
| Q |
316 |
aattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13911081 |
aattaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
13911046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 11516359 - 11516490
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
11516359 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
11516458 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11516459 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
11516490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15441695 - 15441564
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15441695 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
15441596 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15441595 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
15441564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 30262260 - 30262129
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
30262260 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
30262161 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30262160 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
30262129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 296233 - 295970
Alignment:
| Q |
116 |
atttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataac |
215 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||||||| |||||||||| || | |||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||| ||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
296233 |
atttttcaacatcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaacatcaattgaacatgaatcacaac |
296137 |
T |
 |
| Q |
216 |
tcaatccaacca-caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttg |
314 |
Q |
| |
|
|||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||| | | |||||| | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
296136 |
acaattcaaacatcaatttagcaaaattcaccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcata |
296037 |
T |
 |
| Q |
315 |
caattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattat |
381 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||| || | | || || |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
296036 |
acattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacacgaatttagcaacaattat |
295970 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 91
Target Start/End: Original strand, 13352011 - 13352079
Alignment:
| Q |
23 |
accacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13352011 |
accacaaccacaacttataatcatgcattccatcccaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
13352079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17224229 - 17224058
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17224229 |
aattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcac |
17224130 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt |
250 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| ||||| || || || |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
17224129 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
17224058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 252
Target Start/End: Original strand, 13274742 - 13274917
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
13274742 |
aattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatca |
13274841 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga |
252 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13274842 |
cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattga |
13274917 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16915013 - 16914928
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
16915013 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
16914928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15978043 - 15977975
Alignment:
| Q |
17 |
caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattca |
85 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15978043 |
caattaacaacaaccacaacttataatcatgtattcaaccacaattcaacaacaacatgtcataattca |
15977975 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 9611470 - 9611555
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
9611470 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
9611555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 9839041 - 9839126
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
9839041 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
9839126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 13377691 - 13377775
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13377691 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
13377775 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15951087 - 15950789
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||| || | || | |||||||| |||||||| || | | ||||| ||| |
|
|
| T |
15951087 |
ttcaccaatttcagaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagtta |
15950988 |
T |
 |
| Q |
182 |
acaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttac |
281 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||| ||| | |||||| | |||| | ||| || ||| || |||| |||| ||||| | || ||||| || |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
15950987 |
acaataatcacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatac |
15950889 |
T |
 |
| Q |
282 |
ata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15950888 |
atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
15950789 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16570262 - 16570123
Alignment:
| Q |
115 |
catttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcata |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||| ||| |||| | ||||||||| || || ||| | || |
|
|
| T |
16570262 |
catttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaactta |
16570163 |
T |
 |
| Q |
214 |
actcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga |
252 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16570162 |
tctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattga |
16570123 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 252
Target Start/End: Original strand, 16595400 - 16595539
Alignment:
| Q |
115 |
catttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcata |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||| ||| |||| | ||||||||| || || ||| | || |
|
|
| T |
16595400 |
catttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaactta |
16595499 |
T |
 |
| Q |
214 |
actcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga |
252 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16595500 |
tctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattga |
16595539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 252
Target Start/End: Original strand, 11287372 - 11287546
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
11287372 |
aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatga |
11287471 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattga |
252 |
Q |
| |
|
||| |||| | |||||||| || || ||| | || | |||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11287472 |
cttagcaacaacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga |
11287546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26070545 - 26070264
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||| |||| | |
|
|
| T |
26070545 |
tttcaccaaactaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaa |
26070446 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-ttt |
287 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||| | || | |||| || | ||||| || || |||||||||||| | || ||||||| | || |||||| |||| ||| |
|
|
| T |
26070445 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagca-tattttcaacatataccattttctcatacttt |
26070347 |
T |
 |
| Q |
288 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattat-catcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| | ||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
26070346 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattt |
26070264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26094332 - 26094051
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||| |||| | |
|
|
| T |
26094332 |
tttcaccaaactaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaa |
26094233 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-ttt |
287 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||| | || | |||| || | ||||| || || |||||||||||| | || ||||||| | || |||||| |||| ||| |
|
|
| T |
26094232 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagca-tattttcaacatataccattttctcatacttt |
26094134 |
T |
 |
| Q |
288 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattat-catcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| | ||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
26094133 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattt |
26094051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 28722247 - 28722357
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
28722247 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactag |
28722346 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
28722347 |
agcacgaattt |
28722357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 49047966 - 49047675
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
49047966 |
aattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcgtttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcagcaacaacatca |
49047867 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatt |
276 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| || || ||||| ||||||||| || | ||||| | || || | |
|
|
| T |
49047866 |
cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcata--tttcaacatataccact |
49047769 |
T |
 |
| Q |
277 |
tttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
49047768 |
ctctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataattggagcacaaatt |
49047675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 1937297 - 1937252
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaa |
127 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1937297 |
ttcatcaatttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaa |
1937252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12248395 - 12248238
Alignment:
| Q |
97 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
12248395 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagtcatgcattatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatc |
12248296 |
T |
 |
| Q |
196 |
aatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattga |
252 |
Q |
| |
|
|| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12248295 |
cattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattga |
12248238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14272000 - 14271899
Alignment:
| Q |
270 |
tatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
14272000 |
tatcattttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaat |
14271901 |
T |
 |
| Q |
368 |
tt |
369 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
14271900 |
tt |
14271899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 48356806 - 48356891
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
48356806 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattt |
48356891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113989
Alignment:
| Q |
343 |
atatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14114031 |
atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
14113989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423639
Alignment:
| Q |
343 |
atatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14423681 |
atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
14423639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 14935497 - 14935607
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| | | |
|
|
| T |
14935497 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactag |
14935596 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
14935597 |
agcacgaattt |
14935607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 15363090 - 15363200
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| | | |
|
|
| T |
15363090 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactag |
15363189 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
15363190 |
agcacgaattt |
15363200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48622758 - 48622664
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
48622758 |
tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaatt |
48622664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 126392 - 126445
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
126392 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
126445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15441788 - 15441711
Alignment:
| Q |
1 |
atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca |
78 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15441788 |
atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca |
15441711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 18151547 - 18151494
Alignment:
| Q |
17 |
caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaaca |
70 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18151547 |
caatcaaccacaaccacaacttataatcatgtattcaatcacaattcaacaaca |
18151494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 30262353 - 30262276
Alignment:
| Q |
1 |
atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca |
78 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30262353 |
atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca |
30262276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 14940892 - 14940999
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
14940892 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaattt---aattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattag |
14940988 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
14940989 |
agcacgaattt |
14940999 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 15368485 - 15368592
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
15368485 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaattt---aattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattag |
15368581 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
15368582 |
agcacgaattt |
15368592 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7284341 - 7284299
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaat |
131 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7284341 |
atttaacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat |
7284299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 15358934 - 15359028
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15358934 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccata |
15359028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Original strand, 371048 - 371077
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
371048 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
371077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14251194 - 14251165
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14251194 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
14251165 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15822722 - 15822549
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
15822722 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgac |
15822623 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattga |
252 |
Q |
| |
|
|| |||| | ||||||||| || || ||| | || | |||| |||| ||||| |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
15822622 |
atatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttga |
15822549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18980140 - 18980019
Alignment:
| Q |
260 |
tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg |
357 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |
|
|
| T |
18980140 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
18980041 |
T |
 |
| Q |
358 |
gagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18980040 |
gagcacgaatttagcaacaatt |
18980019 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 380
Target Start/End: Original strand, 4446358 - 4446469
Alignment:
| Q |
270 |
tatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||| | ||||||| || |
|
|
| T |
4446358 |
tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtgtgcaaacatatcatcataactagagcacgtat |
4446457 |
T |
 |
| Q |
368 |
ttatcaacaatta |
380 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |
|
|
| T |
4446458 |
tt-tcaacaatta |
4446469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 13274939 - 13275023
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13274939 |
tttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt |
13275023 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17224023 - 17223939
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
17224023 |
tttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
17223939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Original strand, 35094773 - 35094869
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat |
175 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
35094773 |
aattcatcattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacat |
35094869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 23153404 - 23153710
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23153404 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatccttaattcatgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaa |
23153503 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23153504 |
ttaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg |
23153603 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23153604 |
ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaat |
23153703 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
23153704 |
tatccat |
23153710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14626375 - 14626113
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
14626375 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaa |
14626276 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
14626275 |
caacttagcataattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
14626176 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatca |
390 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14626175 |
ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatca |
14626113 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
| Q |
133 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | |||| |
|
|
| T |
1657999 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataact |
1657901 |
T |
 |
| Q |
233 |
tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat |
332 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1657900 |
tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
1657801 |
T |
 |
| Q |
333 |
gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1657800 |
gcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
1657748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 128 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1650350 - 1650111
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
1650350 |
caattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacca |
1650251 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
1650250 |
taacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
1650151 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
1650150 |
ttcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaat |
1650111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 35009735 - 35009439
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||| ||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
35009735 |
tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa |
35009636 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | || | | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
35009635 |
caacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg |
35009536 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35009535 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
35009439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
| Q |
133 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | | |||| |
|
|
| T |
15862484 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataact |
15862581 |
T |
 |
| Q |
233 |
tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat |
332 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862582 |
tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat |
15862681 |
T |
 |
| Q |
333 |
gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15862682 |
gcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat |
15862734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Original strand, 25175559 - 25175812
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25175559 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
25175658 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
25175659 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca |
25175758 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
25175759 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaattta |
25175812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 133 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27654224 - 27653986
Alignment:
| Q |
133 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
27654224 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
27654125 |
T |
 |
| Q |
233 |
tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattca |
331 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
27654124 |
taggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
27654025 |
T |
 |
| Q |
332 |
tgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
27654024 |
tgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaattta |
27653986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16826010 - 16825755
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| || || |||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16826010 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactc |
16825911 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat--cttg |
314 |
Q |
| |
|
|| ||| |||| |||| | |||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16825910 |
aaattaacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaatta |
16825811 |
T |
 |
| Q |
315 |
caattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
16825810 |
caactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
16825755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 385
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666137
Alignment:
| Q |
190 |
aacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg |
288 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| | |||| |||| |
|
|
| T |
29665941 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatactttg |
29666039 |
T |
 |
| Q |
289 |
aa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29666040 |
aaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat |
29666137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18381974 - 18381684
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18381974 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcac |
18381875 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaa-cacaattttcacaacttatcattt |
277 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| ||||| || || || | |||| |||| ||||| |||| |||||| ||||| || || || |||| | ||||| || |
|
|
| T |
18381874 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcataa--ttcaacatatatcactt |
18381777 |
T |
 |
| Q |
278 |
ttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||| || |||||| |||| |
|
|
| T |
18381776 |
tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaatt |
18381684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 304
Target Start/End: Original strand, 27740844 - 27741021
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||| | | | |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
27740844 |
caattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaa |
27740943 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt--gaacatgtaatttcacc |
304 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27740944 |
cgacttagcaaaattcaccaattgagcacaa-tttcataacttgacatttatacatacttcgaaacatgtaatttcacc |
27741021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15889914 - 15889840
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattca |
85 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15889914 |
catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcatcaacaacatgtcataattca |
15889840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Original strand, 21623124 - 21623414
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
21623124 |
aattcaccaattttaccaaactaccaacaacaactcatttttcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcac |
21623223 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgaacacaattttcacaacttatcattt |
277 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||||||||| || || || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || || |||| | ||||| || |
|
|
| T |
21623224 |
ttagcaacaacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa--ttcaacatatatcactt |
21623321 |
T |
 |
| Q |
278 |
ttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21623322 |
tctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaatt |
21623414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19983588 - 19983516
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
19983588 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagc |
19983516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35015454 - 35015382
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
35015454 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
35015382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35136279 - 35136013
Alignment:
| Q |
104 |
caacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaa |
202 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||| |
|
|
| T |
35136279 |
caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa |
35136180 |
T |
 |
| Q |
203 |
caagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaattt |
300 |
Q |
| |
|
|| | || | | ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||| ||||| ||| || || |||| | |||||||||| || || |
|
|
| T |
35136179 |
catggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataatt--cacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaatt |
35136082 |
T |
 |
| Q |
301 |
caccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35136081 |
cac-aacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt |
35136013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25640757 - 25640683
Alignment:
| Q |
17 |
caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
25640757 |
caatcaaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt |
25640683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15005099 - 15005034
Alignment:
| Q |
26 |
acaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15005099 |
acaaccacaacttataatcattcattctatcacaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
15005034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16887877 - 16887792
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16887877 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt |
16887792 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18629693 - 18629608
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
18629693 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
18629608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 22585754 - 22585681
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattc |
84 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22585754 |
catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattc |
22585681 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 22590585 - 22590512
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattc |
84 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22590585 |
catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattc |
22590512 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 385
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
| Q |
300 |
tcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
27751603 |
tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat |
27751688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17083298 - 17083200
Alignment:
| Q |
270 |
tatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
17083298 |
tatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
17083200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 369
Target Start/End: Original strand, 29605614 - 29605696
Alignment:
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
29605614 |
tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt |
29605696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 369
Target Start/End: Original strand, 33324673 - 33324939
Alignment:
| Q |
104 |
caacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaa |
202 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||| |
|
|
| T |
33324673 |
caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa |
33324772 |
T |
 |
| Q |
203 |
caagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaattt |
300 |
Q |
| |
|
|| | || | | ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||| || || ||| || || |||| | |||||||||| || || |
|
|
| T |
33324773 |
catggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataatt--cataagttagcacttatacacactttgaacatgcaaatt |
33324870 |
T |
 |
| Q |
301 |
caccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33324871 |
cac-aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt |
33324939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17557102 - 17557012
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaac |
375 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17557102 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-caaacatatcatcataattagagcacgaatttaacaac |
17557012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22362047 - 22361765
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacc |
187 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| | ||||||||| || |||||| || |||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
22362047 |
attttacaaaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca |
22361948 |
T |
 |
| Q |
188 |
ataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttat--catttttacata |
284 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||| |||| | | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || || |||| |||||||| || ||| |||| |
|
|
| T |
22361947 |
acaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt----caacttatgtcactttctcata |
22361852 |
T |
 |
| Q |
285 |
-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
22361851 |
ctttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattt |
22361765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 180
Target Start/End: Original strand, 18583299 - 18583393
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga---ttcatcaaccacaacatcaatt |
180 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18583299 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacaacatcaatt |
18583393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 368
Target Start/End: Original strand, 18398909 - 18399184
Alignment:
| Q |
94 |
acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataac |
192 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||||| ||| |||| | ||| |
|
|
| T |
18398909 |
acaaaaccaacaacaacaactcatttcttatca-caattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaac |
18399007 |
T |
 |
| Q |
193 |
atcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaa |
290 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| | | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || || | ||||| | || ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
18399008 |
atcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata--tttcaacatatactattttctcatactttgaa |
18399105 |
T |
 |
| Q |
291 |
catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18399106 |
catgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
18399184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33538479 - 33538370
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttgg |
358 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
33538479 |
ttcacaacatatcactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatt-tcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagttag |
33538381 |
T |
 |
| Q |
359 |
agcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
33538380 |
agcacgaattt |
33538370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 180
Target Start/End: Original strand, 29665887 - 29665950
Alignment:
| Q |
117 |
tttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
29665887 |
tttctcatcaccaatccatgaatatgcatacccaagtcatgattcacccacaacaacatcaatt |
29665950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15079793 - 15079709
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15079793 |
tttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcatgcatacaa-catatcatcctagttagagcacgaattta |
15079709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 366
Target Start/End: Original strand, 15740375 - 15740473
Alignment:
| Q |
270 |
tatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaa |
366 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15740375 |
tatcatttttatatactttgatcattcaatttcaccaacaaccaatcaattatcaccaatttcttacatacaaacatagcatcataattggagcacgaa |
15740473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16556432 - 16556394
Alignment:
| Q |
85 |
accaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16556432 |
accaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca |
16556394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16632988 - 16632950
Alignment:
| Q |
85 |
accaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16632988 |
accaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca |
16632950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Original strand, 1556142 - 1556263
Alignment:
| Q |
260 |
tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg |
357 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |
|
|
| T |
1556142 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
1556241 |
T |
 |
| Q |
358 |
gagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1556242 |
gagcacgaatttagcaacaatt |
1556263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Original strand, 16232029 - 16232150
Alignment:
| Q |
260 |
tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg |
357 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |
|
|
| T |
16232029 |
tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa |
16232128 |
T |
 |
| Q |
358 |
gagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16232129 |
gagcacgaatttagcaacaatt |
16232150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22226034 - 22225993
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
22226034 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaagaatttatttctca |
22225993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17375121 - 17375053
Alignment:
| Q |
17 |
caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattca |
85 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
17375121 |
caatcaaccataaccacaaattataatcatgtattcaatcacaaatcaacaacaacatgacatagttca |
17375053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 101 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 26699 - 26419
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatag |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
26699 |
caccaacaacactcaaattctcatcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattg |
26600 |
T |
 |
| Q |
201 |
aacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattt |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
26599 |
aacaagaatcataactcattctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtacttt |
26500 |
T |
 |
| Q |
301 |
caccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattat |
381 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26499 |
caccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattat |
26419 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 118 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8444 - 8180
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | || | | |
|
|
| T |
8444 |
ttctcatcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcat |
8345 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa |
317 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
8344 |
aattcaacaaca---tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaa |
8248 |
T |
 |
| Q |
318 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8247 |
ttatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
8180 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7025
Alignment:
| Q |
77 |
cataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat |
175 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | || ||||| |||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
7319 |
cataattcaccaattttacaaaaccatcattcacaactcatttctcatcaacaattcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatat |
7220 |
T |
 |
| Q |
176 |
caattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatca |
274 |
Q |
| |
|
|| ||| || | | ||||||||| ||||| || || || | |||||||| ||||| || || |||| | ||||| || || |||| || | ||||| |
|
|
| T |
7219 |
cacttagcagcaacaacatcaattgaacatgattcttatcacaatccaataacaacataacataattaaacaatttgagcataatt--caacatatatca |
7122 |
T |
 |
| Q |
275 |
tttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
7121 |
ctttctcatactttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
7025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0106 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:
Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 87 - 394
Target Start/End: Original strand, 41693 - 42001
Alignment:
| Q |
87 |
caatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaa |
185 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41693 |
caatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctaataatcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacag |
41792 |
T |
 |
| Q |
186 |
ccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatat |
285 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41793 |
ccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatat |
41892 |
T |
 |
| Q |
286 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41893 |
ttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
41992 |
T |
 |
| Q |
386 |
aatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
|| |||||| |
|
|
| T |
41993 |
aagcaaaat |
42001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 90 - 392
Target Start/End: Original strand, 20931312 - 20931615
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20931312 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
20931411 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20931412 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg |
20931511 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataat |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20931512 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag |
20931611 |
T |
 |
| Q |
389 |
caaa |
392 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
20931612 |
caaa |
20931615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 20445636 - 20445942
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| ||| ||||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20445636 |
aattcatcattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaa |
20445735 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20445736 |
ttaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttg |
20445835 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
| | || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20445836 |
ttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaat |
20445935 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
20445936 |
tatccat |
20445942 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20893932 - 20893626
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20893932 |
aattcacaaatttcttcaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaa |
20893833 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20893832 |
ttaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg |
20893733 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20893732 |
ttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaat |
20893633 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
20893632 |
tatccat |
20893626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 20531401 - 20531707
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| ||| ||||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20531401 |
aattcatcattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaa |
20531500 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20531501 |
ttaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttg |
20531600 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
| | || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20531601 |
ttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaat |
20531700 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
20531701 |
tatccat |
20531707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Original strand, 20913004 - 20913302
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20913004 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaacca |
20913103 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20913104 |
taacatcaattgaacaagaatca------aatt-aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg |
20913196 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataat |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20913197 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaag |
20913296 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 101 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37844735 - 37844450
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatag |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37844735 |
caccaacaacattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattg |
37844636 |
T |
 |
| Q |
201 |
aacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcac-aacttatcatttttacatatttgaacatgtaatt |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| | | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
37844635 |
aacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatt |
37844536 |
T |
 |
| Q |
300 |
tcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37844535 |
tcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccat |
37844450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 41394228 - 41394494
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
41394228 |
caatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaa |
41394327 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
41394328 |
taacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
41394427 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41394428 |
tttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaat |
41394494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 351
Target Start/End: Original strand, 2116260 - 2116484
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataac-tcaatccaacc |
226 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| ||| |
|
|
| T |
2116260 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaaca |
2116359 |
T |
 |
| Q |
227 |
acaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca |
326 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
2116360 |
ataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
2116459 |
T |
 |
| Q |
327 |
attcatgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2116460 |
attcatgcatacaaacataacatca |
2116484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 335
Target Start/End: Original strand, 22227815 - 22228022
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
22227815 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa |
22227914 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
22227915 |
caacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaa |
22228014 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgca |
335 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
22228015 |
ttcatgca |
22228022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 335
Target Start/End: Original strand, 22232512 - 22232719
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
22232512 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa |
22232611 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
22232612 |
caacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaa |
22232711 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgca |
335 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
22232712 |
ttcatgca |
22232719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 351
Target Start/End: Original strand, 45051484 - 45051652
Alignment:
| Q |
183 |
caaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttaca |
282 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45051484 |
caacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttaca |
45051583 |
T |
 |
| Q |
283 |
tatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
45051584 |
tatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatca |
45051652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18601374 - 18601140
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
18601374 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc |
18601275 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
18601274 |
aacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
18601175 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18601174 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
18601140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5072644 - 5072391
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
5072644 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc |
5072545 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
5072544 |
aacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
5072445 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
5072444 |
actaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
5072391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 51452624 - 51452755
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
51452624 |
cacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
51452723 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51452724 |
gttgaagcacgaatttagcaacaattatccat |
51452755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Original strand, 20177131 - 20177421
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| ||| |||||| |||| |||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
20177131 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac |
20177230 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgaacacaattttcacaacttatcattt |
277 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| |||| || | || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || || |||| | ||||| || |
|
|
| T |
20177231 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa--ttcaacatatatcactt |
20177328 |
T |
 |
| Q |
278 |
ttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20177329 |
tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaatt |
20177421 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13377131 - 13377012
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||| |||| ||| || | ||||||||| |
|
|
| T |
13377131 |
aattcaccaatttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcac |
13377032 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaat |
198 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
13377031 |
ttagcaacaacaacatcaat |
13377012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22143635 - 22143361
Alignment:
| Q |
97 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| || | | |||||| |
|
|
| T |
22143635 |
aaaccaacaacaacaatcgatttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatc |
22143536 |
T |
 |
| Q |
196 |
aatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacat |
293 |
Q |
| |
|
||| || || | || | | ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||| || || ||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22143535 |
aattgagcatggttctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaaccatttgagcataatt--cataagttaacatttatacatactttgaacat |
22143438 |
T |
 |
| Q |
294 |
gtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22143437 |
gcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattt |
22143361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44035267 - 44035219
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44035267 |
ttcaccaattgcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa |
44035219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 369
Target Start/End: Original strand, 21194986 - 21195261
Alignment:
| Q |
96 |
aaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacat |
194 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||| |
|
|
| T |
21194986 |
aaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacat |
21195085 |
T |
 |
| Q |
195 |
caatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaaca |
292 |
Q |
| |
|
||| |||| || || | | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| || || |||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
21195086 |
taattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt--cacaatatatcattttcacatactatgaaca |
21195183 |
T |
 |
| Q |
293 |
tgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
21195184 |
tacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt |
21195261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 51627956 - 51627665
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
51627956 |
aattcaccaatttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatca |
51627857 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatt |
276 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||| | || || ||||| |||||||||||| | ||||| | || |||| |
|
|
| T |
51627856 |
cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacata--tttcaacatataccatt |
51627759 |
T |
 |
| Q |
277 |
tttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatc-aattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||| | |||||| ||||| | |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
51627758 |
ttctcatactttgaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaatt |
51627665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 17609090 - 17609174
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
17609090 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaatt |
17609174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15861713 - 15861650
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag |
152 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
15861713 |
tttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag |
15861650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 152
Target Start/End: Original strand, 22366985 - 22367048
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag |
152 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
22366985 |
tttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag |
22367048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41229231 - 41229105
Alignment:
| Q |
79 |
taattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||| | || ||||| |||| |||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
41229231 |
taattcaccaattttaccaaactaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatca |
41229132 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaaca |
204 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41229131 |
cttagcaacaacaacatcaattgaaca |
41229105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18060054 - 18060013
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18060054 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca |
18060013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 36356367 - 36356294
Alignment:
| Q |
296 |
aatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
36356367 |
aatttcaccaacaacatttcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaatt |
36356294 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 49967606 - 49967725
Alignment:
| Q |
79 |
taattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
49967606 |
taattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatctcattcctcaacaacaa-ccatgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatga |
49967704 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaat |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
49967705 |
cttaacaacaacaacatcaat |
49967725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27329840 - 27329757
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27329840 |
tttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
27329757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Original strand, 45051448 - 45051487
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaac |
167 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
45051448 |
caattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaac |
45051487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 368
Target Start/End: Original strand, 16646105 - 16646158
Alignment:
| Q |
316 |
aattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16646105 |
aattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
16646158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 21650336 - 21650307
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21650336 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaca |
21650307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37233945 - 37233876
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37233945 |
tttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcata |
37233876 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38033748 - 38033675
Alignment:
| Q |
296 |
aatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
38033748 |
aatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaatt |
38033675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 51452531 - 51452608
Alignment:
| Q |
1 |
atgagatggacatcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtca |
78 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51452531 |
atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacatgtca |
51452608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 16656800 - 16656884
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| | | |||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16656800 |
tttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
16656884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 130
Target Start/End: Original strand, 21859977 - 21860017
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa |
130 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21859977 |
tttcaccaaaccaacaacaacaattcatttctcaacaacaa |
21860017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247442
Alignment:
| Q |
133 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
247694 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
247595 |
T |
 |
| Q |
233 |
tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
247594 |
tagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcat |
247495 |
T |
 |
| Q |
333 |
gcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
247494 |
gcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
247442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 253349 - 253206
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
253349 |
catcaacaattaaccaaacccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
253250 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
253249 |
aatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
253206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 118 - 394
Target Start/End: Original strand, 8874 - 9150
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
8874 |
ttctcatcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctc |
8973 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa |
317 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8974 |
aaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaa |
9073 |
T |
 |
| Q |
318 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
9074 |
ttatcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaat |
9150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1542 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:
Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 135 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 784 - 534
Alignment:
| Q |
135 |
tgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaactta |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |
|
|
| T |
784 |
tgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaactta |
685 |
T |
 |
| Q |
235 |
gcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
684 |
gcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
585 |
T |
 |
| Q |
335 |
atacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
584 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1212 - 951
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||| | | |||||| ||| | |
|
|
| T |
1212 |
caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaa |
1114 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
1113 |
caacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
1014 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatca |
390 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1013 |
ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatca |
951 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 118 - 382
Target Start/End: Original strand, 48183 - 48447
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
48183 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctc |
48282 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa |
317 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
48283 |
aaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa |
48382 |
T |
 |
| Q |
318 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatc |
382 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48383 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatc |
48447 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6320 - 6059
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||| | |
|
|
| T |
6320 |
caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaa |
6222 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
6221 |
caacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
6122 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatca |
390 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6121 |
ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatca |
6059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 128464 - 128160
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
128464 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatcca |
128365 |
T |
 |
| Q |
189 |
taacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
128364 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttg |
128266 |
T |
 |
| Q |
289 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataat |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
128265 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataag |
128166 |
T |
 |
| Q |
389 |
caaaat |
394 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
128165 |
caaaat |
128160 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31917 - 31697
Alignment:
| Q |
133 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || || || ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
31917 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
31818 |
T |
 |
| Q |
233 |
t-agca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattc |
330 |
Q |
| |
|
| || | ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| |
|
|
| T |
31817 |
ttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattc |
31718 |
T |
 |
| Q |
331 |
atgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
31717 |
atgcattcaaacataacatca |
31697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 118 - 394
Target Start/End: Original strand, 12111 - 12385
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
12111 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctc |
12210 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaa |
317 |
Q |
| |
|
||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
12211 |
aatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaa |
12308 |
T |
 |
| Q |
318 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12309 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaat |
12385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Original strand, 107753 - 108004
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
107753 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa |
107852 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
107853 |
caacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
107952 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
107953 |
ttcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaatt |
108004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 64784 - 64527
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
64784 |
ttctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc |
64685 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
64684 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
64585 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatc-----aattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
64584 |
atcatcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
64527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 89915 - 89863
Alignment:
| Q |
319 |
tatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89915 |
tatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
89863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 101 - 385
Target Start/End: Original strand, 41626 - 41911
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaata |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
41626 |
caccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaatt |
41725 |
T |
 |
| Q |
200 |
gaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatt |
299 |
Q |
| |
|
||||| | || | | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41726 |
gaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatt |
41825 |
T |
 |
| Q |
300 |
tcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41826 |
tcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat |
41911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:
Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 128 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9594 - 9371
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
9594 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaa |
9495 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
9494 |
taacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
9395 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9394 |
ttcatgcatacaaacataacatca |
9371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 128 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16492 - 16269
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
16492 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaa |
16393 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
16392 |
taacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
16293 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16292 |
ttcatgcatacaaacataacatca |
16269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 128 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34718 - 34460
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaat-agaacaagaatcataactcaatccaacc |
226 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
34718 |
caatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaaca |
34619 |
T |
 |
| Q |
227 |
acaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca |
326 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
34618 |
acaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
34519 |
T |
 |
| Q |
327 |
attcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
34518 |
attcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat |
34460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 4831 - 4940
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4831 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaac---aacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
4927 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
4928 |
aatccatttctca |
4940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0529 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:
Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Original strand, 2968 - 3220
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaat-agaacaagaatcataactcaatccaacc |
226 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
2968 |
caattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaaca |
3067 |
T |
 |
| Q |
227 |
acaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca |
326 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
3068 |
acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
3167 |
T |
 |
| Q |
327 |
attcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaatt |
379 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
3168 |
attcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaatt |
3220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 385
Target Start/End: Original strand, 13512 - 13769
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | || | | ||| |||| | |
|
|
| T |
13512 |
caattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaa |
13611 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
13612 |
caacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
13711 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13712 |
ttcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
13769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37371 - 37066
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
37371 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcta |
37272 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttt |
278 |
Q |
| |
|
||| || | | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
37271 |
ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatccaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcatttt |
37173 |
T |
 |
| Q |
279 |
tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaat |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37172 |
cacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat |
37073 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
37072 |
tatccat |
37066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Original strand, 41267 - 41315
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41267 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa |
41315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 128 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5460 - 5254
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
5460 |
caatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa |
5362 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
5361 |
caactcagcaaaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
5262 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgca |
335 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
5261 |
ttcatgca |
5254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 103192 - 102923
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaata |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| | ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
103192 |
caccaacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaataacatcaatt |
103093 |
T |
 |
| Q |
200 |
gaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattc-accaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaa |
297 |
Q |
| |
|
||||| |||| || | |||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||| | || | || ||| | || || ||| |||| |||||||||| || |
|
|
| T |
103092 |
gaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaatttagcata--ttccaccatataccactttctcatactttgaacatgaaa |
102995 |
T |
 |
| Q |
298 |
tttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
102994 |
tttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt |
102923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Original strand, 109545 - 109717
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaata-tgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
109545 |
aattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatca |
109644 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt |
250 |
Q |
| |
|
||| |||| | |||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
109645 |
cttagcaacaacaacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatt |
109717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 239 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51173
Alignment:
| Q |
239 |
aattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatac |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51328 |
aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac |
51229 |
T |
 |
| Q |
339 |
aaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccataatcaaaat |
394 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
51228 |
aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaat |
51173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0369 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:
Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 128 - 335
Target Start/End: Original strand, 3728 - 3936
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | |
|
|
| T |
3728 |
caatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaa |
3827 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatca-tttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatca |
326 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
3828 |
caacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
3927 |
T |
 |
| Q |
327 |
attcatgca |
335 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
3928 |
attcatgca |
3936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1734 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:
Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Original strand, 1286 - 1414
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1286 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
1385 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaat |
139 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1386 |
aatccatttctcaacaacaaatcatgaat |
1414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 29978 - 30126
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29978 |
catcaacaattaaccacaacaacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
30077 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
30078 |
aatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatga |
30126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Original strand, 31 - 283
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
31 |
ttctcatcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctc |
130 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
131 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
230 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
231 |
atcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 381
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5788
Alignment:
| Q |
146 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagca-aaattca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
5552 |
acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca |
5651 |
T |
 |
| Q |
245 |
ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacat |
344 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5652 |
ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat |
5751 |
T |
 |
| Q |
345 |
atcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattat |
381 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5752 |
aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattat |
5788 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 234 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 89605 - 89454
Alignment:
| Q |
234 |
agcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatg |
333 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89605 |
agcataattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
89506 |
T |
 |
| Q |
334 |
catacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
89505 |
catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
89454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 369
Target Start/End: Original strand, 79519 - 79786
Alignment:
| Q |
104 |
caacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaa |
202 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| | || |||| ||| |||| | ||||||||| ||| |
|
|
| T |
79519 |
caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
79618 |
T |
 |
| Q |
203 |
caagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt-gaacatgtaattt |
300 |
Q |
| |
|
|| | ||| | | ||| |||| ||||| || || |||||| |||||| | || |||| ||||| ||| || || ||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
79619 |
catggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcataatt--cacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaattt |
79716 |
T |
 |
| Q |
301 |
caccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
79717 |
caccaccaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattt |
79786 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107784
Alignment:
| Q |
334 |
catacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
107835 |
catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccat |
107784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 133 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21356 - 21138
Alignment:
| Q |
133 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
21356 |
catgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaact |
21257 |
T |
 |
| Q |
233 |
tagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcat |
332 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
21256 |
taggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaat |
21157 |
T |
 |
| Q |
333 |
gcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21156 |
ggatacaaacataacatca |
21138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14306 - 14083
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaacca |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||||| | | | |
|
|
| T |
14306 |
caatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaa |
14207 |
T |
 |
| Q |
228 |
caacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
14206 |
caacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaa |
14107 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
14106 |
ttcatgcatacagacataacatca |
14083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 350
Target Start/End: Original strand, 42993 - 43226
Alignment:
| Q |
118 |
ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
42993 |
ttctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctc |
43092 |
T |
 |
| Q |
218 |
aatccaaccacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgca |
316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
43093 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
43192 |
T |
 |
| Q |
317 |
attatcatcaattcatgcatacaaacatatcatc |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
43193 |
attatcatcaattcatgcatagaaacataacatc |
43226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Original strand, 39063 - 39104
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
39063 |
ttcaccaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctca |
39104 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0420 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:
Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 229 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13469 - 13347
Alignment:
| Q |
229 |
aacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaat |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
13469 |
aacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
13370 |
T |
 |
| Q |
329 |
tcatgcatacaaacatatcatca |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13369 |
tcatgcatacaaacataacatca |
13347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:
Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24557 - 24415
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24557 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcttaattcaccaatttctttaaaccaccaacaac |
24458 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
24457 |
aatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag |
24415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 3406 - 3525
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaac |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3406 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataactcaccaattccactaaaccaccaacaac |
3505 |
T |
 |
| Q |
111 |
aatccatttctcaacaacaa |
130 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3506 |
attccatttctcaacaacaa |
3525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:
Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Original strand, 9339 - 9480
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9339 |
aattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
9438 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9439 |
ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat |
9480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13647 - 13537
Alignment:
| Q |
17 |
caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatcca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13647 |
caattaaccacaaccacaatttatgatcatgcattccatcatatttcaacaagaacatgtcgtaattcaccaatttcacaaaaccactaacaacaatcca |
13548 |
T |
 |
| Q |
117 |
tttctcaacaa |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
13547 |
tttctcaacaa |
13537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 273 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 104721 - 104623
Alignment:
| Q |
273 |
catttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattca-tgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
104721 |
catttatacatactttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattt |
104623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 93858 - 93773
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| | ||||| | | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
93858 |
tttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaattt |
93773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 116358 - 116284
Alignment:
| Q |
17 |
caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
116358 |
caattaacaacaaccacaacttataatcatgtattcaaccacaaatcaataacaacatgtcacaattcatcaatt |
116284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 26927 - 27058
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
26927 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
27026 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27027 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
27058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 254 - 381
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22799
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22672 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
22771 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattat |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22772 |
gttggagcacgaatttagcaacaattat |
22799 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1713 - 1582
Alignment:
| Q |
254 |
cacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1713 |
cacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa |
1614 |
T |
 |
| Q |
354 |
gttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1613 |
gttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
1582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1711 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:
Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 238 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1439 - 1307
Alignment:
| Q |
238 |
aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcata |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1439 |
aaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcata |
1340 |
T |
 |
| Q |
338 |
caaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
370 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
1339 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
1307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:
Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 77138 - 76847
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
77138 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcac |
77039 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgaacacaattttcacaacttatcattt |
277 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| ||||| ||||| | | |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||| || |||| | ||||| || |
|
|
| T |
77038 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataa--ttcaacatatatcactt |
76941 |
T |
 |
| Q |
278 |
ttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||| |
|
|
| T |
76940 |
tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaattt |
76847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0084 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:
Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 56347 - 56102
Alignment:
| Q |
138 |
atatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagca |
237 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| | | ||||||||| ||||| |||||| | || | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
56347 |
atatgcatacccaagtcatgattcacccacaacaacatcaattaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagca |
56248 |
T |
 |
| Q |
238 |
aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa--catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgca |
335 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| || || |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
56247 |
aaattcaccatttgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgca |
56149 |
T |
 |
| Q |
336 |
tacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatc |
382 |
Q |
| |
|
|| || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
56148 |
cacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatc |
56102 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12068 - 11947
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaa-tttcacaaaaccaccaacaa |
109 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| || |
|
|
| T |
12068 |
catcaacaattaaacacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaattttcaccaaaacaccaaaaa |
11969 |
T |
 |
| Q |
110 |
caatccatttctcaacaacaat |
131 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11968 |
catctcatttctcaacaccaat |
11947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22255 - 22186
Alignment:
| Q |
22 |
aaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22255 |
aaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
22186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 132541 - 132422
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
132541 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
132442 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaat |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
132441 |
ttaacaacaacaacatcaat |
132422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Original strand, 11660 - 11762
Alignment:
| Q |
97 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| | |||| | ||||| ||| ||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
11660 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatc |
11759 |
T |
 |
| Q |
196 |
aat |
198 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
11760 |
aat |
11762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0483
Description:
Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 1089 - 1017
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataatt |
83 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1089 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataatt |
1017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Original strand, 6823 - 6907
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
6823 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaatt |
6907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Original strand, 6617 - 6715
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
6617 |
aattcacccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatca |
6715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:
Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 45876 - 45804
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataatt |
83 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45876 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataatt |
45804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1295 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:
Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 159 - 233
Alignment:
| Q |
17 |
caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
159 |
caattaatcacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcaacaatt |
233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0507 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:
Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 1703 - 1629
Alignment:
| Q |
17 |
caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1703 |
caattaatcacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
1629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:
Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 222 - 385
Target Start/End: Original strand, 3289 - 3453
Alignment:
| Q |
222 |
caaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaac-atgtaatttcaccaacaatcttgcaatt |
319 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||| | |
|
|
| T |
3289 |
caacaacaacttagcaaaattcaccatttgagtacaattt-cataacttgatatttatacatactttgaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaat |
3387 |
T |
 |
| Q |
320 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttatcaacaattatccat |
385 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
3388 |
atcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat |
3453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 180
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3266
Alignment:
| Q |
101 |
caccaacaacaat-ccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaatt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3186 |
caccaacaacaattccaattctcttcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaatt |
3266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 335
Target Start/End: Original strand, 54410 - 54630
Alignment:
| Q |
116 |
atttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataac |
215 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||| |||| | | | ||||||||| ||||| |||||| | | |
|
|
| T |
54410 |
atttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatc |
54509 |
T |
 |
| Q |
216 |
tcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttg-aacatgtaatttcaccaacaatctt |
313 |
Q |
| |
|
||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
54510 |
tcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcat |
54608 |
T |
 |
| Q |
314 |
gcaattatcatcaattcatgca |
335 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54609 |
acaattatcatcaattcatgca |
54630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 335
Target Start/End: Original strand, 45077 - 45244
Alignment:
| Q |
169 |
acaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaac |
268 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | | | ||||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |
|
|
| T |
45077 |
acaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaattt-caaaac |
45175 |
T |
 |
| Q |
269 |
ttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgca |
335 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45176 |
ttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
45244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 162476 - 162404
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
162476 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
162404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 116804 - 116687
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
116804 |
aattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcac |
116705 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatca |
196 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
116704 |
ttagcaacaacaacatca |
116687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 166554 - 166482
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
166554 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
166482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:
Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6380 - 6309
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaag |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
6380 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag |
6309 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0151 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:
Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22646 - 22422
Alignment:
| Q |
146 |
acccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcac |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| || ||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| || ||| | |||||| |||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
22646 |
acccaaactatgaatcttcaacaacaatatcaattaacaacaacaacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
22547 |
T |
 |
| Q |
246 |
caatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt-gaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaac |
342 |
Q |
| |
|
|||| || || |||| || || ||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22546 |
taatttgagcataatt--cataagttagcatttatacatattttgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaac |
22449 |
T |
 |
| Q |
343 |
atatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
22448 |
atatcatcatatttagagcacgaattt |
22422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:
Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 369
Target Start/End: Original strand, 8001 - 8257
Alignment:
| Q |
115 |
catttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcata |
213 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || |||| | ||||||||| ||||| | || | |
|
|
| T |
8001 |
catttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctca |
8100 |
T |
 |
| Q |
214 |
actcaatccaaccacaacttagcaaaattcacc-aattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatc |
311 |
Q |
| |
|
| ||| | || ||||| ||||| |||||||| |||||| || || | || || ||| || || |||||| |||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
8101 |
tcataattccacaacaacatagcataattcacccaattgagcataaat--cataagttagcacttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaaca |
8198 |
T |
 |
| Q |
312 |
ttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8199 |
attcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:
Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 211
Target Start/End: Original strand, 48520 - 48603
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatca |
211 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48520 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatca |
48603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Original strand, 35435 - 35724
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35435 |
aattcaccaattttacaaaaccaccaaca-caactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcac |
35533 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcattt |
277 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| ||||| || || || | || | |||| ||||| ||||| || ||| ||||| || | |||| || | ||||| || |
|
|
| T |
35534 |
ttagcaacaaaaacatcaattgaacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatttgagtataatt--caacatatatcactt |
35631 |
T |
 |
| Q |
278 |
ttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35632 |
tctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaatt |
35724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:
Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31577 - 31529
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31577 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa |
31529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 369
Target Start/End: Original strand, 21477 - 21758
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacc |
187 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | ||| |||| |
|
|
| T |
21477 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaaca |
21576 |
T |
 |
| Q |
188 |
ataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tt |
286 |
Q |
| |
|
| |||||||| | || ||| | || | |||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| | || |||||| |||| || |
|
|
| T |
21577 |
acaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagca-tattttcaacatataccattttctcatactt |
21675 |
T |
 |
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||| | |||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
21676 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattt |
21758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 198
Target Start/End: Original strand, 31176 - 31286
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacc |
187 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | ||| |||| |
|
|
| T |
31176 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaaca |
31275 |
T |
 |
| Q |
188 |
ataacatcaat |
198 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |
|
|
| T |
31276 |
aaaacatcaat |
31286 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:
Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1449 - 1348
Alignment:
| Q |
270 |
tatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattc-atgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1449 |
tatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaat |
1350 |
T |
 |
| Q |
368 |
tt |
369 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
1349 |
tt |
1348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9704 - 9603
Alignment:
| Q |
270 |
tatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattc-atgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9704 |
tatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaat |
9605 |
T |
 |
| Q |
368 |
tt |
369 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
9604 |
tt |
9603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0079 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:
Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4049 - 3969
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
4049 |
catcaacaatcaagcacaaccacaacttataattatgcattccatcacaattcaataacaacatgtcgtaattcatcaatt |
3969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:
Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 109 - 26
Alignment:
| Q |
128 |
caatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatca |
211 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
109 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatca |
26 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22577 - 22429
Alignment:
| Q |
222 |
caaccacaacttagcaaaattcacc-aattgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaatt |
319 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| ||| || || |||| | |||||||||| || ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
22577 |
caacaacaacttagcataattcacccaattgagcataatt--cacaagttaacacttatacacactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaatt |
22480 |
T |
 |
| Q |
320 |
atcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22479 |
atcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattt |
22429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0063 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:
Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 44311 - 44249
Alignment:
| Q |
22 |
aaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattc |
84 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44311 |
aacctcaaccacaacttgtaatcatgcatcccatcacaattcaacaacaacatgtcataattc |
44249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0058 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:
Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 70361 - 70307
Alignment:
| Q |
316 |
aattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
70361 |
aattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt |
70307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 5936 - 6010
Alignment:
| Q |
17 |
caattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
5936 |
caatcaaccacaaccacaacttacaatcatgcattcgatcacaattcaactacaacatgtcataaatcatcaatt |
6010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:
Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 2687 - 2772
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
2687 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
2772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2401 - 2317
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2401 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
2317 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:
Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 109754 - 109582
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
109754 |
aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatga |
109655 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt |
250 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| || || ||| | || | |||| || | ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
109654 |
cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatt |
109582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 118255 - 118078
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
118255 |
aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatga |
118156 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgaaca |
255 |
Q |
| |
|
||| |||| | |||||||| || || ||| | || | |||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
118155 |
cttagcaacaacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaaca |
118078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 367
Target Start/End: Original strand, 28501 - 28781
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacc |
187 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
28501 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaaca |
28600 |
T |
 |
| Q |
188 |
ataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgaacacaattttcacaacttatcatttttacata-t |
285 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||| | || || |||| |||| ||||| || || |||||| ||| |||| || || |||| | ||||| ||| |||| | |
|
|
| T |
28601 |
acaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttgagcataa--ttcaacatatatcactttctcatact |
28698 |
T |
 |
| Q |
286 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
28699 |
ttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
28781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0389 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:
Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 368
Target Start/End: Original strand, 10854 - 10908
Alignment:
| Q |
315 |
caattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
10854 |
caattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaatt |
10908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:
Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 369
Target Start/End: Original strand, 29944 - 30211
Alignment:
| Q |
104 |
caacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaa |
202 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| || |||| ||||| | || | ||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
29944 |
caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatacgtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcgcttaacaacaacaacatcaattaaa |
30043 |
T |
 |
| Q |
203 |
caagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gaacacaattttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaattt |
300 |
Q |
| |
|
|| || || | | |||| |||| | ||| ||||| |||||| ||||| || || |||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
30044 |
catgattctcatcacaattcaacaaaaacatagcacaattcaacaattagagcaaaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaattt |
30141 |
T |
 |
| Q |
301 |
caccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
|||| |||| | ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30142 |
cacctacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatagtaagagcacgaattt |
30211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1587 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
1546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8732 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 747 - 700
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaa |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
747 |
ttcaccaatt-cacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaacaa |
700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0833 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:
Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Original strand, 3265 - 3351
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat |
175 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |
|
|
| T |
3265 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat |
3351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0467 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:
Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 10458 - 10335
Alignment:
| Q |
260 |
tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg |
357 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| | || ||||||||| || |
|
|
| T |
10458 |
tttcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaa |
10359 |
T |
 |
| Q |
358 |
gagcacgaatttatcaacaattat |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10358 |
gagcacgaatttagcaacaattat |
10335 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 159257 - 159332
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagc |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
159257 |
aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagc |
159332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Original strand, 85287 - 85459
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaa-tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
85287 |
aattcaccaagtttcaccaaaacaccaacaacgtctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatga |
85386 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt |
250 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| || || ||| | || | |||| || | ||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
85387 |
cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaatt |
85459 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Original strand, 7807 - 7909
Alignment:
| Q |
97 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc |
195 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | | || ||||||||||| ||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
7807 |
aaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatc |
7906 |
T |
 |
| Q |
196 |
aat |
198 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
7907 |
aat |
7909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 368
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8051
Alignment:
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8011 |
ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
8051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 368
Target Start/End: Original strand, 31184 - 31266
Alignment:
| Q |
287 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
31184 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaatt |
31266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0387 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:
Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1063 - 962
Alignment:
| Q |
270 |
tatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
1063 |
tatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaat |
964 |
T |
 |
| Q |
368 |
tt |
369 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
963 |
tt |
962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0095 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:
Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34019 - 33854
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttc-acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| | || | | ||||||||| |
|
|
| T |
34019 |
aattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcataatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcac |
33920 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| || || ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
33919 |
ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca |
33854 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1867 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:
Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Original strand, 110 - 273
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacc |
187 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | || |||| |
|
|
| T |
110 |
attttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaca |
208 |
T |
 |
| Q |
188 |
ataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattga |
252 |
Q |
| |
|
| ||||||||| || || ||| | || | |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
209 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattga |
273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0213 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:
Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 29122 - 29174
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaataca |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
29122 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatatctcatcatcaataca |
29174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:
Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 242
Target Start/End: Original strand, 3310 - 3438
Alignment:
| Q |
115 |
catttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatagaacaagaatcata |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | | || ||||||||||| ||| |||| ||||||||| || || ||||| || |
|
|
| T |
3310 |
catttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattgatcatgaatctta |
3409 |
T |
 |
| Q |
214 |
actcaatccaaccacaacttagcaaaatt |
242 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
3410 |
tcacaattcaactacaacatagcataatt |
3438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 368
Target Start/End: Original strand, 3525 - 3565
Alignment:
| Q |
328 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
368 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3525 |
ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
3565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:
Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Original strand, 265 - 436
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||| | |||||| | ||||||| |
|
|
| T |
265 |
aattcacccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcac |
364 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaatagaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt |
250 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| ||||| || || || | |||| |||| | ||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
365 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt |
436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5537 - 5418
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
5537 |
aattcaccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgac |
5438 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttaacaaccataacatcaat |
198 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
5437 |
ttagcaacaacaacatcaat |
5418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9156 - 9054
Alignment:
| Q |
97 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| | |||| | ||||||||| ||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
9156 |
aaaccaccgacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc |
9057 |
T |
 |
| Q |
196 |
aat |
198 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
9056 |
aat |
9054 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 197
Target Start/End: Original strand, 8942 - 9061
Alignment:
| Q |
80 |
aattcaccaattt-cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
8942 |
aattcaccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatga |
9041 |
T |
 |
| Q |
178 |
attaacaaccataacatcaa |
197 |
Q |
| |
|
||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
9042 |
cttagcaacaacaacatcaa |
9061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Original strand, 24925 - 25010
Alignment:
| Q |
89 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat |
175 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |
|
|
| T |
24925 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacat |
25010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 285 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 97283 - 97200
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattc-atgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaat |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
97283 |
tttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
97200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1164 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:
Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 175
Target Start/End: Original strand, 1347 - 1433
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat |
175 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
1347 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacat |
1433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0892 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:
Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 333
Target Start/End: Original strand, 3551 - 3625
Alignment:
| Q |
260 |
tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatg |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
3551 |
tttcacaacttaacaattatacatgctttgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatg |
3625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0598 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:
Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 3388 - 3482
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3388 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcata |
3482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0193 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:
Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 4742 - 4836
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4742 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccata |
4836 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:
Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 112
Target Start/End: Original strand, 39606 - 39636
Alignment:
| Q |
82 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39606 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaa |
39636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:
Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43883 - 43805
Alignment:
| Q |
285 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagca |
362 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |
|
|
| T |
43883 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagca |
43805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 27634 - 27728
Alignment:
| Q |
261 |
ttcacaacttatcatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcata |
353 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27634 |
ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcata |
27728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:
Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12809 - 12740
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga |
158 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12809 |
tttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatga |
12740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19190 - 19121
Alignment:
| Q |
90 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatga |
158 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19190 |
tttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatga |
19121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1105 - 1017
Alignment:
| Q |
88 |
aatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaatacatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacat |
175 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||| |
|
|
| T |
1105 |
aatttcaccaaatcaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat |
1017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:
Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 335
Target Start/End: Original strand, 54012 - 54088
Alignment:
| Q |
260 |
tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttgcaattatcatcaattcatgca |
335 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||| | | | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
54012 |
tttcacaacttaacaattatacatgctttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
54088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University