View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18359_low_33 (Length: 255)

Name: NF18359_low_33
Description: NF18359
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18359_low_33
NF18359_low_33
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (4-255)||(41394357-41394609)
chr1 (54-255)||(20913165-20913367)
chr1 (54-255)||(20931480-20931682)
chr1 (54-226)||(37844374-37844549)
chr1 (54-255)||(20445814-20446019)
chr1 (66-255)||(20531579-20531770)
chr1 (54-255)||(20893551-20893754)
chr1 (127-255)||(51452627-51452755)
chr1 (161-254)||(2116391-2116484)
chr1 (161-255)||(45051558-45051652)
chr1 (6-85)||(21860334-21860414)
chr1 (12-85)||(44034829-44034903)
chr1 (177-255)||(22227944-22228022)
chr1 (177-255)||(22232641-22232719)
chr1 (6-65)||(41218749-41218808)
chr1 (161-251)||(18601140-18601230)
chr1 (13-65)||(13376711-13376763)
chr1 (13-65)||(27675139-27675191)
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (4-255)||(16743991-16744243)
chr3 (54-252)||(12030073-12030272)
chr3 (54-255)||(13839029-13839232)
chr3 (54-255)||(2049945-2050147)
chr3 (6-192)||(19231979-19232169)
chr3 (54-255)||(14842487-14842689)
chr3 (117-255)||(51158008-51158146)
chr3 (101-255)||(15858996-15859152)
chr3 (54-186)||(19260749-19260882)
chr3 (127-255)||(17912483-17912610)
chr3 (134-255)||(15936634-15936755)
chr3 (127-255)||(2449238-2449366)
chr3 (134-255)||(15938476-15938597)
chr3 (127-251)||(13975722-13975845)
chr3 (127-251)||(45860945-45861068)
chr3 (127-240)||(13954890-13955002)
chr3 (139-251)||(15614973-15615085)
chr3 (6-85)||(3992873-3992953)
chr3 (6-85)||(55513193-55513273)
chr3 (11-88)||(15857120-15857198)
chr3 (6-85)||(2844514-2844594)
chr3 (161-239)||(16821291-16821369)
chr3 (6-85)||(54037976-54038056)
chr3 (31-85)||(17955861-17955916)
chr3 (6-85)||(7854305-7854385)
chr3 (139-251)||(41270215-41270327)
chr3 (139-251)||(55316359-55316471)
chr3 (143-197)||(14080701-14080756)
chr3 (25-85)||(45581954-45582016)
chr3 (13-65)||(17191884-17191936)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (54-255)||(122024-122226)
chr4 (6-255)||(54118120-54118372)
chr4 (54-255)||(13246565-13246769)
chr4 (54-255)||(15675009-15675217)
chr4 (54-255)||(10104170-10104378)
chr4 (127-255)||(26680335-26680463)
chr4 (127-255)||(10488697-10488825)
chr4 (127-255)||(16327926-16328054)
chr4 (154-255)||(31115764-31115865)
chr4 (54-197)||(33240893-33241043)
chr4 (127-251)||(13048221-13048345)
chr4 (6-85)||(25119059-25119139)
chr4 (161-239)||(10644371-10644449)
chr4 (6-85)||(5682380-5682460)
chr4 (143-252)||(40885570-40885680)
chr4 (139-251)||(47357794-47357906)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (6-255)||(20627190-20627441)
chr2 (54-255)||(462873-463075)
chr2 (6-255)||(43642833-43643085)
chr2 (54-255)||(36982364-36982569)
chr2 (6-255)||(19794581-19794832)
chr2 (60-255)||(8891377-8891574)
chr2 (54-255)||(24341309-24341517)
chr2 (127-255)||(25265390-25265518)
chr2 (127-255)||(19689401-19689529)
chr2 (127-255)||(23820206-23820334)
chr2 (127-255)||(14906440-14906568)
chr2 (127-251)||(17396653-17396776)
chr2 (127-255)||(20015146-20015274)
chr2 (6-85)||(22284278-22284358)
chr2 (54-147)||(22863171-22863267)
chr2 (6-85)||(22275045-22275125)
chr2 (6-84)||(15633538-15633617)
chr2 (177-255)||(7507894-7507972)
chr2 (144-197)||(22579863-22579916)
chr2 (13-69)||(19660217-19660273)
chr2 (139-251)||(19886661-19886773)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (54-255)||(16193643-16193844)
chr8 (6-255)||(16404852-16405103)
chr8 (54-255)||(24928716-24928919)
chr8 (54-255)||(43373392-43373596)
chr8 (127-255)||(5238222-5238350)
chr8 (127-255)||(22907214-22907342)
chr8 (127-255)||(24661248-24661376)
chr8 (127-255)||(43685681-43685809)
chr8 (139-255)||(6774258-6774374)
chr8 (127-255)||(17345704-17345832)
chr8 (139-254)||(24549118-24549233)
chr8 (6-85)||(274766-274846)
chr8 (6-85)||(641003-641083)
chr8 (6-85)||(826809-826889)
chr8 (6-85)||(24716714-24716794)
chr8 (161-251)||(21844594-21844684)
chr8 (161-251)||(21851987-21852077)
chr8 (143-197)||(23226076-23226131)
chr8 (139-251)||(30120862-30120974)
chr8 (6-85)||(39115598-39115678)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (13-255)||(3060101-3060344)
chr7 (54-255)||(16211901-16212103)
chr7 (54-255)||(36052799-36053003)
chr7 (54-255)||(13036938-13037142)
chr7 (54-255)||(11580661-11580867)
chr7 (127-255)||(47481031-47481159)
chr7 (134-255)||(18253842-18253963)
chr7 (127-255)||(11516362-11516490)
chr7 (127-255)||(15441564-15441692)
chr7 (127-255)||(30262129-30262257)
chr7 (127-255)||(7293151-7293279)
chr7 (127-237)||(25292338-25292448)
chr7 (162-255)||(16478985-16479078)
chr7 (128-221)||(13321185-13321278)
chr7 (6-85)||(126738-126818)
chr7 (6-85)||(32493898-32493978)
chr7 (6-85)||(1936869-1936949)
chr7 (161-251)||(13572816-13572906)
chr7 (161-251)||(13911046-13911136)
chr7 (139-251)||(10989549-10989661)
chr7 (62-255)||(295900-296094)
chr7 (161-251)||(2437597-2437687)
chr7 (127-169)||(14113989-14114031)
chr7 (127-169)||(14423639-14423681)
chr7 (6-85)||(111121-111201)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (54-255)||(48733-48935)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (66-255)||(51121-51310)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (54-255)||(1259-1462)
scaffold0266 (54-255)||(3508-3710)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (54-255)||(41864-42066)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (53-255)||(36836-37041)
scaffold0077 (6-65)||(15319-15378)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (54-255)||(172040-172242)
scaffold0001 (54-255)||(177743-177945)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (54-255)||(26340-26543)
scaffold0162 (127-255)||(8180-8308)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (54-255)||(882-1084)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (54-255)||(23507100-23507302)
chr5 (54-255)||(27182471-27182675)
chr5 (54-255)||(18530988-18531195)
chr5 (54-255)||(22053753-22053961)
chr5 (127-255)||(20623104-20623232)
chr5 (127-255)||(21233528-21233656)
chr5 (127-255)||(34939412-34939540)
chr5 (129-255)||(25900408-25900534)
chr5 (127-255)||(16536332-16536460)
chr5 (127-255)||(37052879-37053007)
chr5 (139-254)||(29188284-29188399)
chr5 (161-251)||(27009981-27010071)
chr5 (161-251)||(4200007-4200097)
chr5 (161-251)||(43443417-43443507)
chr5 (139-251)||(19500039-19500151)
chr5 (139-251)||(22366481-22366593)
chr5 (139-251)||(25426768-25426880)
chr5 (11-65)||(11584394-11584448)
chr5 (161-251)||(18778014-18778104)
chr5 (139-251)||(12514-12626)
chr5 (139-251)||(21073595-21073707)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (62-255)||(19341-19537)
scaffold0195 (127-255)||(21425-21553)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (54-255)||(5990-6192)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (54-255)||(128095-128297)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (63-255)||(4996-5189)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (54-255)||(9013-9215)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (54-255)||(247366-247570)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (54-255)||(23153582-23153786)
chr6 (98-255)||(14626089-14626246)
chr6 (127-255)||(35009439-35009567)
chr6 (127-255)||(1657748-1657876)
chr6 (127-255)||(15862606-15862734)
chr6 (139-255)||(1650105-1650221)
chr6 (54-122)||(23148266-23148335)
chr6 (6-85)||(19983144-19983224)
chr6 (6-85)||(35015009-35015089)
chr6 (6-85)||(18583640-18583720)
chr6 (127-211)||(27751604-27751688)
chr6 (167-251)||(25175703-25175787)
chr6 (139-251)||(27653983-27654095)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (54-255)||(12248-12450)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (54-255)||(272160-272362)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (95-255)||(148856-149018)
scaffold0025 (65-255)||(8984-9180)
scaffold0025 (54-147)||(146844-146938)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (54-255)||(123087-123292)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (54-255)||(89378-89582)
scaffold0028 (54-178)||(107708-107835)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (127-255)||(13641-13769)
scaffold0132 (6-85)||(42677-42754)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (134-255)||(48322-48443)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (127-255)||(41783-41911)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (127-255)||(534-662)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (127-255)||(26930-27058)
scaffold0141 (134-255)||(22675-22796)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (127-255)||(1582-1710)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (127-255)||(37066-37194)
scaffold0078 (6-85)||(41632-41712)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (127-255)||(34460-34588)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (134-245)||(5674-5785)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (134-255)||(107882-108003)
scaffold0026 (142-184)||(89863-89905)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (138-255)||(3098-3215)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (161-254)||(13347-13440)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (161-254)||(9371-9464)
scaffold0215 (161-254)||(16269-16362)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (6-85)||(80187-80267)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (6-86)||(166116-166197)
scaffold0016 (12-86)||(162036-162111)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (6-85)||(31132-31212)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (12-85)||(5735-5809)
scaffold0686 (12-85)||(5941-6015)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (177-255)||(5254-5332)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (6-86)||(304-385)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (161-246)||(180-265)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (162-239)||(43149-43226)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (139-251)||(1304-1416)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (161-251)||(14083-14173)
scaffold0139 (161-251)||(21138-21228)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (127-220)||(3360-3453)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (177-237)||(3876-3936)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (6-65)||(1721-1780)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (143-197)||(8202-8257)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (6-65)||(19802-19861)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (143-196)||(70307-70361)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (143-184)||(1546-1587)
scaffold0456 (143-184)||(8691-8732)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41394609 - 41394357
Alignment:
Q  4 ggagaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattt 102  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41394609 ggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattt 41394510  T
Q  103 tcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  41394509 tcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatga 41394410  T
Q  203 ttgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41394409 ttgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 41394357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913165
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  20913167 att 20913165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931480
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  20931482 att 20931480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 226
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844549
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 37844549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445814
Alignment:
Q  54 taaggtaaggg-gttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtg 249  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| || | | |||||| |||| |||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  250 aaaatt 255  Q
    ||||||    
T  20445819 aaaatt 20445814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20531770 - 20531579
Alignment:
Q  66 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttga 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  20531770 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtga 20531671  T
Q  164 tgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| || | | |||||| |||| |||||||||    
T  20531670 taatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaatt 20531579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893754
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgt-aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtga 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||| || | | |||||| |||||||||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  251 aaatt 255  Q
    |||||    
T  20893750 aaatt 20893754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452627
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 51452627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2116484 - 2116391
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaat 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2116484 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaat 2116391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 45051652 - 45051558
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45051652 tgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 45051558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21860414 - 21860334
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  21860414 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034903
Alignment:
Q  12 ataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227944
Alignment:
Q  177 tgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaatt 22227944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232641
Alignment:
Q  177 tgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaatt 22232641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41218808 - 41218749
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41218808 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggg 41218749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 18601140 - 18601230
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||  |||| |||||||| ||||| ||||    
T  18601140 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 18601230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376763
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13376763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675139
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggg 27675139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 16743991 - 16744243
Alignment:
Q  4 ggagaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattt 102  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16743991 ggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattt 16744090  T
Q  103 tcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaaga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| || | ||    
T  16744091 tcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatga 16744190  T
Q  203 ttgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||| ||||  ||||||||  | || ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16744191 ttgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaatt 16744243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 252
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030272
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13839029
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| || | | |||||| ||||||||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  252 aatt 255  Q
    ||||    
T  13839032 aatt 13839029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049945
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| || ||||||||    
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  2049947 att 2049945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19232169 - 19231979
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtg-aatttt 103  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19232169 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaatttt 19232070  T
Q  104 caaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgat 192  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  19232069 caaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatgat 19231979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842689
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||| ||||| |||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  14842687 att 14842689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 117 - 255
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158146
Alignment:
Q  117 aattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaatt 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  217 acatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 51158146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 255
Target Start/End: Original strand, 15858996 - 15859152
Alignment:
Q  101 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgc 198  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15858996 tttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 15859095  T
Q  199 aagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    | ||||| ||||| ||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||||||||||    
T  15859096 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaatt 15859152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 186
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260882
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagt 186  Q
    || || | |||||||||||||  ||| |||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagt 19260882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912610
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaatt 17912610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936755
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgta 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  234 aaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaatt 15936755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449366
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| |  |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 2449366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938597
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgta 233  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  234 aaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaatt 15938597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 251
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975845
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
     || |||||||||| ||||| ||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaa 13975845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860945
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
     || |||||||||| ||||| ||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaa 45860945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 240
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955002
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  227 ttatgtaaaaatga 240  Q
     || ||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatga 13955002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15615085 - 15614973
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  15615085 tgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 15614986  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||||||||    
T  15614985 gataagttgtgaa 15614973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3992953 - 3992873
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  3992953 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 55513273 - 55513193
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  55513273 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857198
Alignment:
Q  11 cataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcat 88  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2844594 - 2844514
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  2844594 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821291
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatg 239  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatg 16821291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 54037976 - 54038056
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  54037976 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Original strand, 17955861 - 17955916
Alignment:
Q  31 tagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17955861 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7854385 - 7854305
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  7854385 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270215
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||  |||| ||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  41270227 gataagttatgaa 41270215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316359
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||  |||| ||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  55316371 gataagttatgaa 55316359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080701
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aagtgatgataattg 197  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 14080701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  25 tgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa--ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191884
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 17191884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 122024
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  122026 att 122024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 54118120 - 54118372
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  54118120 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttc 54118219  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  54118220 aaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 54118319  T
Q  203 ttgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  54118320 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaatt 54118372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246565
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||| ||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtga 250  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| || | | |||||| |||||||||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  251 aaatt 255  Q
    |||||    
T  13246569 aaatt 13246565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675217
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagtt 246  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  247 gtgaaaatt 255  Q
    |||||||||    
T  15675209 gtgaaaatt 15675217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104378
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    |||   | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagtt 246  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  247 gtgaaaatt 255  Q
    |||||||||    
T  10104370 gtgaaaatt 10104378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680335
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaatt 26680335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488697
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| |  |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 10488697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328054
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| |  |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 16328054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115764
Alignment:
Q  154 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaa 253  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  254 tt 255  Q
    ||    
T  31115765 tt 31115764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240893
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattg 197  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgatgattg 33240893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 251
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048345
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
     |||||||||| || ||||| ||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaa 13048345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 25119059 - 25119139
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  25119059 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10644449 - 10644371
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatg 239  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10644449 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatg 10644371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 5682380 - 5682460
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaag-gggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5682380 agaatcataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 252
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885680
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatc-aattatgtaaaaatgac 241  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||| || ||||||||| | | ||| ||||| ||||||||| || || |||||| ||||| |    
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  242 aagttgtgaaa 252  Q
    ||||| |||||    
T  40885670 aagttatgaaa 40885680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357794
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||| |  |||| ||||| ||||||||| |||  |||| ||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  47357806 gataagttatgaa 47357794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 20627190 - 20627441
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-tttt 103  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  20627190 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaatttt 20627289  T
Q  104 caaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagat 203  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||    
T  20627290 caaatattgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgat 20627389  T
Q  204 tgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    || ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  20627390 tgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaatt 20627441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462873
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  462875 att 462873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 43642833 - 43643085
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642833 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttc 43642932  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  43642933 aaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 43643032  T
Q  203 ttgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| || | | |||||  ||||||||||||||    
T  43643033 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaatt 43643085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982569
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  250 aaaatt 255  Q
    ||||||    
T  36982564 aaaatt 36982569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 19794581 - 19794832
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  19794581 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-c 19794679  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||    
T  19794680 aaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatga 19794779  T
Q  203 ttgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| || | | |||||| ||||||||||||||    
T  19794780 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaatt 19794832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8891574 - 8891377
Alignment:
Q  60 aaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaa 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8891574 aaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaa 8891475  T
Q  158 ctttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| |||| || | | |||||| ||||||||||||||    
T  8891474 ctgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaatt 8891377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341517
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagtt 246  Q
    |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  247 gtgaaaatt 255  Q
    |||||||||    
T  24341509 gtgaaaatt 24341517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265518
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaatt 25265518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689529
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 19689529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820206
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 23820206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906568
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| |  |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 14906568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 251
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396776
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
     || |||||||||| ||||| ||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaa 17396776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015146
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||   ||||| ||||  ||||||||| |  |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 20015146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22284358 - 22284278
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22284358 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863171
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 22863171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22275125 - 22275045
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  22275125 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15633617 - 15633538
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatca 84  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15633617 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 255
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7507972
Alignment:
Q  177 tgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaatt 7507972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 22579863 - 22579916
Alignment:
Q  144 aatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattg 197  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22579863 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatgtatgaagttatgataattg 22579916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660217
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaaggggttag 69  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaaggggttag 19660217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886773
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |  |||| ||||| ||||||||| |||  |||| |||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  19886761 gataagttatgaa 19886773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16193844
Alignment:
Q  54 taaggtaaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgct 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16193643 taaggtaaggggttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgct 16193742  T
Q  154 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaa 253  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16193743 ccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16193842  T
Q  254 tt 255  Q
    ||    
T  16193843 tt 16193844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 16404852 - 16405103
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||    
T  16404852 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttc 16404950  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  16404951 aaatgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 16405050  T
Q  203 ttgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| || | | |||||  ||||||||||||||    
T  16405051 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaatt 16405103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24928919
Alignment:
Q  54 taaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| || | | |||||| ||||||||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  252 aatt 255  Q
    ||||    
T  24928916 aatt 24928919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373596
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||| ||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtga 250  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  251 aaatt 255  Q
    |||||    
T  43373592 aaatt 43373596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238222
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 5238222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907342
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 22907342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661376
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 24661376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685681
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 43685681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774374
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  239 gacaagttgtgaaaatt 255  Q
    || ||||||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaatt 6774374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345704
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaatt 17345704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24549118
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  239 gacaagttgtgaaaat 254  Q
    || |||||||||||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaat 24549118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 274846 - 274766
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  274846 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 641003 - 641083
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  641003 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 826809 - 826889
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  826809 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 24716714 - 24716794
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24716714 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 21844594 - 21844684
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  21844594 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21844684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 21851987 - 21852077
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  21851987 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21852077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226131
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aagtgatgataattg 197  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 23226131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120862
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||  |||| ||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  30120874 gataagttatgaa 30120862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 39115678 - 39115598
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  39115678 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3060101
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaaggggtta-gtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgtt 111  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 3060245  T
Q  112 gtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtg 211  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| || | || |||||    
T  3060244 atatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtg 3060145  T
Q  212 caattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  3060144 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaatt 3060101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211901
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  16211903 att 16211901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052799
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtga 250  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  251 aaatt 255  Q
    |||||    
T  36052803 aaatt 36052799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037142
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtga 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || || |||| |||| |||| || | | |||||| |||||||||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  251 aaatt 255  Q
    |||||    
T  13037138 aaatt 13037142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11580867
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattt 148  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| ||||||||||     
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  149 gtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgt 248  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| || | | |||||| |||||||    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  249 gaaaatt 255  Q
    |||||||    
T  11580861 gaaaatt 11580867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481159
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 47481159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18253963
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgta 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  234 aaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaatt 18253963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516362
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 11516362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441692
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 15441692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262257
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 30262257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293151
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 7293151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 237
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292448
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  227 ttatgtaaaaa 237  Q
     ||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaa 25292448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 255
Target Start/End: Original strand, 16478985 - 16479078
Alignment:
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16478985 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 16479078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321185
Alignment:
Q  128 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatg 221  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 13321185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 126818 - 126738
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  126818 agaatcataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 32493898 - 32493978
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  32493898 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 1936869 - 1936949
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1936869 agaatcatagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13572906 - 13572816
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  13572906 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 13572816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 13911046 - 13911136
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||  |||| |||||||| ||||| ||||    
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 13911136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989549
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||  |||| ||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  10989561 gataagttatgaa 10989549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 295900 - 296094
Alignment:
Q  62 ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaact 159  Q
    |||||| ||||| | ||||||  |||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||| ||| || || |    
T  295900 ggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgttctaatt 295998  T
Q  160 ttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
      | || ||||||||| ||||||||  |||||||||   | ||||| ||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  295999 gaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaatt 296094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2437687 - 2437597
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||  |||| |||||||| ||||| ||||    
T  2437687 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 2437597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 169  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 169  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 111121 - 111201
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  111121 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48733
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||    
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  48735 att 48733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 66 - 255
Target Start/End: Original strand, 51121 - 51310
Alignment:
Q  66 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51121 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatg 51220  T
Q  166 atatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  51221 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaatt 51310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1259
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  252 aatt 255  Q
    ||||    
T  1262 aatt 1259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3710
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  3708 att 3710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41864
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  41866 att 41864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 53 - 255
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37041
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||| |    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtg 249  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  250 aaaatt 255  Q
    ||||||    
T  37036 aaaatt 37041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 15319 - 15378
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15319 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggg 15378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 172040
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| || | | |||||| |||||||||||    
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  172042 att 172040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177743
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| || | | |||||| |||||||||||    
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  177745 att 177743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26543
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||| |||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  252 aatt 255  Q
    ||||    
T  26540 aatt 26543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8308
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||| | ||||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaatt 8308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 882 - 1084
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  1082 att 1084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23507100
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  23507102 att 23507100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182675
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtga 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||| || | | |||||| |||||||||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  251 aaatt 255  Q
    |||||    
T  27182671 aaatt 27182675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531195
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatc---atcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  148 tgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttg 247  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  248 tgaaaatt 255  Q
    ||||||||    
T  18531188 tgaaaatt 18531195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22053961
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat--tttgtgaa--ttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagtt 246  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  247 gtgaaaatt 255  Q
    |||||||||    
T  22053953 gtgaaaatt 22053961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623104
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 20623104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233656
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| | ||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 21233656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939412
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaatt 34939412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900534
Alignment:
Q  129 ggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaatt 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||  ||||| ||| |  | |    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  229 atgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 25900534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536332
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| |  |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 16536332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052879
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| |  |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     |||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaatt 37052879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 254
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188399
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  239 gacaagttgtgaaaat 254  Q
    || |||||||||||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaat 29188399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27010071 - 27009981
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | || || ||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  27010071 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 27009981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 4200007 - 4200097
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||  |||| |||||||| ||||| ||||    
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 4200097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 43443417 - 43443507
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||  |||| |||||||| ||||| ||||    
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 43443507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19500039
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |  |||| ||||| ||||||||| |||  |||| ||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  19500051 gataagttatgaa 19500039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366593
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |  |||| ||||| ||||||||| |||  |||| ||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  22366581 gataagttatgaa 22366593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426768
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |  |||| ||||| ||||||||| |||  |||| ||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  25426780 gataagttatgaa 25426768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584394
Alignment:
Q  11 cataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 11584394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 18778014 - 18778104
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |  |||| ||||| ||||||||| |||  |||| |||||||| ||||| ||||    
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 18778104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12514
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |  |||| ||||| ||||||||| |||  |||| |||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  12526 gataagttatgaa 12514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073707
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||| |  |||| ||||| ||||||||| |||  |||| ||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  21073695 gataagttatgaa 21073707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19537 - 19341
Alignment:
Q  62 ggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaac 158  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19537 ggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaac 19438  T
Q  159 tttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19437 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 19341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21425
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 21425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6192
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| |||    
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  6190 att 6192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128297
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||  ||  |||||||||||    
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  128295 att 128297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 255
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5189
Alignment:
Q  63 gggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaacttt 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 5189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 9013
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  9015 att 9013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247570
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtga 250  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||| |||| |||| || | | |||||| |||||||||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  251 aaatt 255  Q
    |||||    
T  247566 aaatt 247570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153582
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||| ||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtga 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| || | | |||||| |||||||||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  251 aaatt 255  Q
    |||||    
T  23153586 aaatt 23153582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Original strand, 14626089 - 14626246
Alignment:
Q  98 aattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattg 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14626089 aattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 14626188  T
Q  198 caagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14626189 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaatt 14626246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009567
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaatt 35009567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657876
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaatt 1657876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862606
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaatt 15862606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650221
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  239 gacaagttgtgaaaatt 255  Q
    || ||||||||||||||    
T  1650205 gataagttgtgaaaatt 1650221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt 122  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 19983144 - 19983224
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  19983144 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 35015009 - 35015089
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  35015009 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18583720 - 18583640
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  18583720 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751604
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtg 211  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtg 27751604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25175787 - 25175703
Alignment:
Q  167 tatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||| |  |||| ||||| ||||||||| |||  |||| |||||||| ||||| ||||    
T  25175787 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 25175703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654095
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||| ||||||||||||| ||||| || ||| |  |||| ||||| ||||||||| |||  |||| ||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  27654083 gataagttatgaa 27654095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12248
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgt-aactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||| | || | ||||||||||| ||||||||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  252 aatt 255  Q
    ||||    
T  12251 aatt 12248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272160
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  || |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaa 252  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| |||| || | | |||||| |||||||||||    
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  272162 att 272160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 149018 - 148856
Alignment:
Q  95 gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgat 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  149018 gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 148919  T
Q  193 aattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  148918 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 148856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9180 - 8984
Alignment:
Q  65 gttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatttgtgctccaac 158  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  9180 gttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatc 9081  T
Q  159 tttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9080 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaatt 8984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146844
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaatt 146844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123292
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtg 249  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| || | | |||||| ||||||||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  250 aaaatt 255  Q
    ||||||    
T  123287 aaaatt 123292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89582
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtga 250  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| || | | |||| | |||||||||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  251 aaatt 255  Q
    |||||    
T  89578 aaatt 89582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 178
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||| ||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatg 178  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13641
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaatt 13641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42754 - 42677
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  42754 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48322
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  234 aaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaatt 48322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41783
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaatt 41783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 534 - 662
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     || | | ||||||  |||||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaatt 662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26930
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| |  |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 26930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22675
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| |  | |||||     
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  234 aaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||||||| ||||| ||||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaatt 22675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1710
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| |  |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 1710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37194
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| |  |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 37194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41712 - 41632
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  41712 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34588
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaa 226  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  227 ttatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    || |||||||||   ||||||||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaatt 34588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5674
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||| | || ||||||    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  234 aaaatgacaagt 245  Q
    ||||||| ||||    
T  5685 aaaatgataagt 5674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107882
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgta 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| | || |    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  234 aaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||||||| ||||||| ||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaatt 107882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 184
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  142 taaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 3098
Alignment:
Q  138 ttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaa 237  Q
    |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  238 tgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaatt 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 254
Target Start/End: Original strand, 13347 - 13440
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaat 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13347 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaat 13440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 254
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9464
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaat 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaat 9464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 254
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16362
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaat 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaat 16362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 80267 - 80187
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  80267 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 166116 - 166197
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  166116 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162111
Alignment:
Q  12 ataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 31132 - 31212
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  31132 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5809
Alignment:
Q  12 ataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6015
Alignment:
Q  12 ataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 255
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5332
Alignment:
Q  177 tgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaaaatt 255  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaatt 5332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 304 - 385
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  304 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 265 - 180
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagtt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  265 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagtt 180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 43149
Alignment:
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatg 239  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatg 43149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1416
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||  |||| ||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  239 gacaagttgtgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  1404 gataagttatgaa 1416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14173
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||| | ||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 14173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 21138 - 21228
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaatgacaagttgtgaa 251  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||  | ||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  21138 tgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacat 220  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3876
Alignment:
Q  177 tgcatgaagtgatgataattgcaagattgatggtgcaattacatgatcaattatgtaaaaa 237  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 3876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 1780 - 1721
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1780 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 1721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8202
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aagtgatgataattg 197  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 8202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 19802 - 19861
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19802 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 19861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 196
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70361
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aagtgatgataatt 196  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatt 70361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University