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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18387_high_8 (Length: 513)

Name: NF18387_high_8
Description: NF18387
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18387_high_8
NF18387_high_8
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (17-506)||(24157253-24157741)
chr1 (17-506)||(20190629-20191118)
chr1 (17-502)||(36233308-36233790)
chr1 (69-506)||(20189048-20189485)
chr1 (233-502)||(48462806-48463074)
chr1 (315-502)||(36233853-36234040)
chr1 (134-502)||(20759106-20759464)
chr1 (291-499)||(48463830-48464035)
chr1 (284-502)||(40553903-40554120)
chr1 (134-188)||(31390245-31390299)
chr1 (413-502)||(31390149-31390237)
chr1 (413-502)||(40554650-40554738)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (17-502)||(22300095-22300580)
chr2 (134-506)||(18535618-18535990)
chr2 (134-502)||(24806599-24806969)
chr2 (134-502)||(24808455-24808825)
chr2 (359-506)||(31974034-31974181)
chr2 (398-502)||(22299690-22299794)
chr2 (284-502)||(44793275-44793492)
chr2 (413-502)||(44792615-44792703)
chr2 (441-502)||(24806089-24806151)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (17-502)||(13518159-13518644)
chr4 (17-506)||(39488349-39488838)
chr4 (17-502)||(15017842-15018324)
chr4 (17-502)||(15019482-15019964)
chr4 (134-502)||(9398935-9399303)
chr4 (17-229)||(9166926-9167138)
chr4 (316-499)||(13517922-13518105)
chr4 (20-179)||(19460552-19460708)
chr4 (17-124)||(19458007-19458114)
chr4 (17-132)||(19459700-19459815)
chr4 (284-502)||(11098499-11098718)
chr4 (415-502)||(21377201-21377287)
chr4 (36-179)||(19456246-19456389)
chr4 (426-502)||(46690508-46690584)
chr4 (320-502)||(42872931-42873112)
chr4 (414-502)||(18281342-18281429)
chr4 (429-500)||(22473681-22473750)
chr4 (17-65)||(24663614-24663662)
chr4 (17-59)||(21484653-21484695)
chr4 (408-481)||(19455904-19455977)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (17-502)||(9647134-9647619)
chr7 (17-502)||(7842676-7843161)
chr7 (17-499)||(9595635-9596117)
chr7 (17-499)||(9646598-9647080)
chr7 (134-502)||(40998535-40998903)
chr7 (134-502)||(41000394-41000763)
chr7 (220-506)||(23446658-23446944)
chr7 (17-59)||(9596171-9596213)
chr7 (459-502)||(24790122-24790165)
chr7 (459-502)||(24790156-24790199)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (17-502)||(244640-245122)
chr5 (17-502)||(29949587-29950069)
chr5 (17-502)||(29951225-29951707)
chr5 (426-506)||(21352695-21352775)
chr5 (402-502)||(38936717-38936817)
chr5 (315-499)||(16780615-16780797)
chr5 (438-506)||(21352602-21352670)
chr5 (408-484)||(23660939-23661015)
chr5 (408-484)||(23797555-23797631)
chr5 (16-77)||(27401975-27402036)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (17-502)||(8366107-8366592)
chr8 (134-502)||(17277991-17278358)
chr8 (318-502)||(17277409-17277593)
chr8 (350-502)||(6778187-6778338)
chr8 (284-502)||(17857163-17857380)
chr8 (429-502)||(23016372-23016444)
chr8 (459-502)||(17277677-17277720)
chr8 (413-502)||(23016690-23016778)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (61-502)||(25531636-25532077)
chr3 (134-502)||(5554107-5554475)
chr3 (134-502)||(23460202-23460570)
chr3 (134-505)||(16346631-16347002)
chr3 (134-506)||(47418292-47418664)
chr3 (233-502)||(5553198-5553467)
chr3 (138-502)||(47566476-47566839)
chr3 (282-502)||(16022616-16022836)
chr3 (307-467)||(32570515-32570674)
chr3 (305-502)||(2683485-2683681)
chr3 (410-454)||(25532823-25532867)
chr3 (29-93)||(2693788-2693852)
chr3 (40-99)||(2683933-2683989)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (17-369)||(1602-1954)
scaffold0269 (411-502)||(1962-2051)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (134-502)||(54856-55225)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (140-502)||(86583-86941)
scaffold0026 (399-502)||(643-746)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (134-502)||(241046-241414)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (134-502)||(399-769)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (331-506)||(31587-31762)
scaffold0146 (134-174)||(27480-27520)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (398-502)||(22399-22503)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (383-502)||(17657-17776)
scaffold0021 (383-502)||(27188-27307)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (429-502)||(13510-13582)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (284-502)||(5220-5437)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (429-502)||(4225-4297)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (284-502)||(11265-11481)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (413-502)||(375304-375392)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (463-502)||(12037064-12037103)
chr6 (469-502)||(12037016-12037049)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (458-502)||(8902-8946)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 454; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 506
Target Start/End: Original strand, 24157253 - 24157741
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24157253 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatgcagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 24157352  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24157353 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgca-attgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 24157451  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24157452 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 24157551  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  24157552 ttgagttaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagctaaaacaa 24157651  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24157652 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 24157741  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 506
Target Start/End: Original strand, 20190629 - 20191118
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20190629 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataatgatttggtggctgattaatgcaaataaaaga 20190728  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20190729 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttcaagacgtta 20190828  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20190829 caattccacaaacaccacctttaattcttcagcttacacactttcatcacgttttcaacttacaactcattttaaaacattaaatattccgaatttgctc 20190928  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||  |||||||    
T  20190929 ttgagtcaaacagatgaaatgtagataatttagtaagctttccaaagagttaaagatcacctcaaacggacatccaaagctccagatatagtcaaaacaa 20191028  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 506  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20191029 gacagacatatcatgacatacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattctataatgactttattattcttttca 20191118  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 36233790 - 36233308
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36233790 attacatgatgattttcactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcaaccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaatg 36233691  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36233690 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgtta 36233591  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||    
T  36233590 caattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatatttcgaatttgatc 36233494  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  36233493 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcgcctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaa 36233394  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36233393 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 36233308  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 506
Target Start/End: Original strand, 20189048 - 20189485
Alignment:
Q  69 ccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttaca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20189048 ccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttata 20189147  T
Q  169 tattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  20189148 tattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttaagcttacacactttaactacgt 20189247  T
Q  269 tttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 368  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  20189248 tttcaacttacaactcactttacaccattaaatattccgactttgctcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaattttgtaaactttccaacaagttg 20189347  T
Q  369 aagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatta 468  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  20189348 aagatcacctcaaacggacatccagaactccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaaccaaaattaattt 20189447  T
Q  469 ggttcttttattccataatgactttattattcttttca 506  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20189448 ggttcttttattccacaatgactttattatttttttca 20189485  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 233 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 48463074 - 48462806
Alignment:
Q  233 acctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatg 332  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  48463074 acctttaattcttcagtttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgctcttgaatcaaatagatg 48462975  T
Q  333 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatga 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  48462974 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacatcaaacggatatccagagctccaaatatagccaaaacaagacatacatatcatga 48462875  T
Q  433 cctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  48462874 cctacaaaaataaaactttgaatctaaaattaatttgattctttt-tttcgcaatgactttattattctt 48462806  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 315 - 502
Target Start/End: Original strand, 36233853 - 36234040
Alignment:
Q  315 tcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaac 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  36233853 tcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcgcctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaac 36233952  T
Q  415 aagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36233953 aagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 36234040  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 134 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20759464 - 20759106
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 233  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  20759464 aagttggtcgctgatcaatgcatgaggatgttacatattcatttgcacattgattaatcaaggcttgttatttatagatgttacaattccacaaacacca 20759365  T
Q  234 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatga 333  Q
     |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||  | |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||        ||||  |    
T  20759364 tctttaatttttcagcttatacactttaatcatatcttcaacttacagttcattttacaccattaaatattccgaatttgctctt--------cagacaa 20759273  T
Q  334 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgcc--agatatagcaaaaacaagacagacatatcatg 431  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  |||| |||||| ||||||  |||| |||||||   ||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20759272 aatgtagagaattttgtaaactttccatagagtaaaagattacctcactcggacatccagaactccatatatatagccaaaacaagacatacatatcatg 20759173  T
Q  432 acctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   || || ||||||||||||||||||    
T  20759172 acctacgaaaataaaactttgaa-ccaaaattaatttggttctt---tttcacaatgactttattattctt 20759106  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 291 - 499
Target Start/End: Original strand, 48463830 - 48464035
Alignment:
Q  291 aaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatc 390  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48463830 aaccattaaaaattccgaatttgct--tgagtcaaacagatgaaatgtaaagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatc 48463927  T
Q  391 cagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgac 490  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||    
T  48463928 cagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacaaaaataaaa-tttgaacccaaaattattttggttcttttattccacaataac 48464026  T
Q  491 tttattatt 499  Q
    |||||||||    
T  48464027 tttattatt 48464035  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 284 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 40554120 - 40553903
Alignment:
Q  284 cattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 382  Q
    ||||||| ||||| | |||| |||| ||| ||  |||||| | || |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  40554120 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccagcatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 40554022  T
Q  383 cggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattcc 482  Q
    ||||  |||||||  | ||||||    || |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  40554021 cggagttccagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 40553923  T
Q  483 ataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  40553922 ataatgaatttattattctt 40553903  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31390299 - 31390245
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatt 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31390299 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatt 31390245  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 413 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 31390237 - 31390149
Alignment:
Q  413 acaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31390237 acaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgaatttattattctt 31390149  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 413 - 502
Target Start/End: Original strand, 40554650 - 40554738
Alignment:
Q  413 acaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40554650 acaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgaatttattattctt 40554738  T

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Target: chr2 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 502
Target Start/End: Original strand, 22300095 - 22300580
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22300095 attacatgatgactttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccattaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataagagg 22300194  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22300195 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 22300294  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22300295 caattccacaaacaccacctttaattcttcagcttgcacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgctc 22300394  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  22300395 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaattccgtaagctttccaacaagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccggatatagcaaaaacaa 22300494  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22300495 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgaatttattattctt 22300580  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 134 - 506
Target Start/End: Original strand, 18535618 - 18535990
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18535618 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaatgcttattatggctagacgttacatttccacaaacacca 18535717  T
Q  234 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatga 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18535718 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgactcaaacagatga 18535817  T
Q  334 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgac 433  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18535818 aatgtagagaattttgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgac 18535917  T
Q  434 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 506  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18535918 ctacgaaaataagactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattcttttca 18535990  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 134 - 502
Target Start/End: Original strand, 24806599 - 24806969
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttc-tagacgttacaattccacaaacacc 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  24806599 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatggcctagacgttacaattccacaaacacc 24806698  T
Q  233 acctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatg 332  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  24806699 acctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttggatcaaacagatg 24806798  T
Q  333 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatga 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24806799 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccggagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatga 24806898  T
Q  433 cctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgac-tttattattctt 502  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24806899 cctacaaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgacttttattattctt 24806969  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 134 - 502
Target Start/End: Original strand, 24808455 - 24808825
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttc-tagacgttacaattccacaaacacc 232  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  24808455 aagttggtggcggatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatggcctagccgttacaattccacaaacacc 24808554  T
Q  233 acctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatg 332  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  24808555 acctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctaattacagctcattctgaaccattaaatattccgaatttgctcttggatcaaacagatg 24808654  T
Q  333 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatga 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24808655 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaatgagttaaagatcacctgaaacggacatccggagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatga 24808754  T
Q  433 cctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactt-tattattctt 502  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24808755 cctacaaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgacttctattattctt 24808825  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 359 - 506
Target Start/End: Original strand, 31974034 - 31974181
Alignment:
Q  359 caacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccca 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31974034 caacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagaactcccgatatagccaaaacaagacaaacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccca 31974133  T
Q  459 aaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31974134 aaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 31974181  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 398 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22299794 - 22299690
Alignment:
Q  398 ccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttatta 497  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22299794 ccagatataggcaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgaatttatta 22299695  T
Q  498 ttctt 502  Q
    |||||    
T  22299694 ttctt 22299690  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 284 - 502
Target Start/End: Original strand, 44793275 - 44793492
Alignment:
Q  284 cattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 382  Q
    ||||||| ||||| | |||| |||| ||| ||  |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  44793275 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 44793373  T
Q  383 cggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattcc 482  Q
    ||||  |||||||  | ||||||    || |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  44793374 cggagttccagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 44793472  T
Q  483 ataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  44793473 ataatgaatttattattctt 44793492  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 413 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 44792703 - 44792615
Alignment:
Q  413 acaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||||| | || ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44792703 acaagacagatacataatgacctacaaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgaatttattattctt 44792615  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 441 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 24806151 - 24806089
Alignment:
Q  441 aataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgac-tttattattctt 502  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24806151 aataaaacattgaacccaaaattaaattggttcttttattccacaatgacttttattattctt 24806089  T

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Target: chr4 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 502
Target Start/End: Original strand, 13518159 - 13518644
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518159 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataattttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 13518258  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13518259 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaataaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtaaaggctaattatttctagacgtta 13518358  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13518359 caattccacaaacaccacctttaattcttcagattacacaatttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgcac 13518458  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  13518459 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagttttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaa 13518558  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13518559 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 13518644  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 506
Target Start/End: Original strand, 39488349 - 39488838
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39488349 attacatgttgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataagagg 39488448  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39488449 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaagacttattatttctagacgtta 39488548  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  39488549 caatttcacaaacaccacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattctgagtttgctc 39488648  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||| ||    
T  39488649 ttgagtcaaacagatgaattgtggagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatctagagctccagatatagccaaaataa 39488748  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39488749 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgaatttattattcttttca 39488838  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 502
Target Start/End: Original strand, 15017842 - 15018324
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15017842 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagaaaatgcaaccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaatg 15017941  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15017942 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgtta 15018041  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||    
T  15018042 caattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatatttcgaatttgatc 15018138  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  15018139 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaa 15018238  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15018239 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 15018324  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 502
Target Start/End: Original strand, 15019482 - 15019964
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15019482 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcaaccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaatgaaatg 15019581  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15019582 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgtta 15019681  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||    
T  15019682 caattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatatttcgaatttgatc 15019778  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  15019779 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaa 15019878  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15019879 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 15019964  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 134 - 502
Target Start/End: Original strand, 9398935 - 9399303
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 233  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9398935 aagttagtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacatttatttgtgaaggcttattatgtctagacgttacaattccacaaacaccg 9399034  T
Q  234 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatga 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9399035 cctttaattcttcagctaacacactttaaccacgtcttctgcttatatatcattctacaccattaaatattccgaatttgctcttgagtcaaacagacga 9399134  T
Q  334 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgac 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9399135 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccatatatagccaaaacaagacagacatatcatgac 9399234  T
Q  434 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9399235 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 9399303  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9167138 - 9166926
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9167138 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatccaaccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaatg 9167039  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9167038 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgtta 9166939  T
Q  217 caattccacaaac 229  Q
    |||||||||||||    
T  9166938 caattccacaaac 9166926  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 316 - 499
Target Start/End: Original strand, 13517922 - 13518105
Alignment:
Q  316 cttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaaca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||  ||||| ||||| ||||||    
T  13517922 cttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacgaacatcggaagctccagacatagccaaaaca 13518021  T
Q  416 agacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattatt 499  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13518022 agacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaagttaatttggttcttttattccacaataactttattatt 13518105  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Original strand, 19460552 - 19460708
Alignment:
Q  20 acatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggtta 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||    
T  19460552 acatgatgattttgattctaaaactctttgaaaatgaaatgaaatgcagccactaattacaataatgttttggtggttgattaatgcaaaaaaaa--tta 19460649  T
Q  120 caaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgc 179  Q
    ||||| ||||||| ||| | | |  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19460650 caaaatgactctccaaggtag-gcttcatcaatgcatgaagaggttacacattcatttgc 19460708  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19458114 - 19458007
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  19458114 attacatgatgattttgattctaacactcttagaaaatgaaaggaagtgtagccactaattccaataatgttttagtggctgattagtgcaaagaaaagg 19458015  T
Q  117 ttacaaaa 124  Q
    ||||||||    
T  19458014 ttacaaaa 19458007  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19459815 - 19459700
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  19459815 attacatgattattttgattctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcatccattaattgcaataatgttttggtggttaattagtgcaaagaaaagg 19459716  T
Q  117 ttacaaaaggactctc 132  Q
    ||| |||| |||||||    
T  19459715 ttataaaacgactctc 19459700  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 11098718 - 11098499
Alignment:
Q  284 cattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 382  Q
    ||||||| ||||| | |||| |||| ||| ||  |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  11098718 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttatgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 11098620  T
Q  383 cggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa-ttaggttcttttattc 481  Q
    ||||  |||||||  | ||||||    || |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| || | |||||||||||    
T  11098619 cggagttccagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaaataaatttgattcttttattc 11098520  T
Q  482 cataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  11098519 cataatgaatttattattctt 11098499  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 415 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21377287 - 21377201
Alignment:
Q  415 aagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21377287 aagacagatacataatgacctacgaaaataaaaatctgaaccaaaaat-aatttggttcttttattccatattgactttattattctt 21377201  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19456389 - 19456246
Alignment:
Q  36 tctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaa 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||| || ||||||| ||    
T  19456389 tctaaaactcttagaaa-tgaaaggaaatgcatctactaattgcaataatgttttgg-gactgattagtgcaaagaaaatgttacataatgactctccaa 19456292  T
Q  136 -gttggtggc-taatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgc 179  Q
     || |||||| | |||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  19456291 ggtgggtggcttcatcaatgcatggagaggttacacattcatttgc 19456246  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 426 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 46690584 - 46690508
Alignment:
Q  426 atcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46690584 atcatgacctacgaaaataaaactttaaatttaaaattaatttagttcttttattccacactgactttattattctt 46690508  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 502
Target Start/End: Original strand, 42872931 - 42873112
Alignment:
Q  320 agtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaaga 418  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||| |||   |||||||  | ||||||    || ||||||    
T  42872931 agtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaatcgggattccagagctctagatatgatgaatacaaga 42873029  T
Q  419 cagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    || | | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42873030 catatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgaatttattattctt 42873112  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 502
Target Start/End: Original strand, 18281342 - 18281429
Alignment:
Q  414 caagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18281342 caagacagatacataatgacctacgaaaataactatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcgataatgactttattattctt 18281429  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22473750 - 22473681
Alignment:
Q  429 atgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattc 500  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22473750 atgaccaacgaaaataacaatttgaaccaaaaa--aaattggttcttttattccataatgactttattattc 22473681  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 24663614 - 24663662
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatg 65  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24663614 attacatgatgattttgattctaaaactcttagaaaataaaaggaaatg 24663662  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 21484653 - 21484695
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaag 59  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21484653 attacatgatgattttgattctaaaactcttacaaaatgaaag 21484695  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 19455977 - 19455904
Alignment:
Q  408 caaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttc-ttttattc 481  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19455977 caaaaacaaaacagacatataatcacctacaaaaataacactt-gaaaccaaaattaatttggttcattttattc 19455904  T

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Target: chr7 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 502
Target Start/End: Original strand, 9647134 - 9647619
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9647134 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataattttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 9647233  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9647234 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaataaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtaaaggctgattatttctagacgtta 9647333  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  9647334 caattccacaaacacctcctttaattcttcaggttacacaatttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgcac 9647433  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  9647434 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagttttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaa 9647533  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9647534 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 9647619  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7843161 - 7842676
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7843161 attacatgatgattttgactcaaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 7843062  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7843061 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaagaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 7842962  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  7842961 caattccacaaacacctcctttaattctccagcttacacactttaaccacgttttctacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgcac 7842862  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| | |||||||    
T  7842861 ttgagtcaaacggatgaattgtatagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctctagatataaccaaaacaa 7842762  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7842761 aacagacatatcttgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 7842676  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 499
Target Start/End: Original strand, 9595635 - 9596117
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9595635 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataatgttttggtggctgattaattcaaataaaagt 9595734  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595735 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggtggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 9595834  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  9595835 caattccacaaacacctcctttaattctccagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaagccattaaatattccgaatttgcac 9595934  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  ||||| ||||| |||||||    
T  9595935 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacgaacatcgggagctccagacatagccaaaacaa 9596034  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattatt 499  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9596035 gacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaagttaatttggttcttttattccacaataactttattatt 9596117  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 499
Target Start/End: Original strand, 9646598 - 9647080
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9646598 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataatgttttggtggctgattaattcaaataaaagt 9646697  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9646698 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggtggttacatattcatttggacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 9646797  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  9646798 caattccacaaacacctcctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaagccattaaatattccgaatttgcac 9646897  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||  ||||| ||||| |||||||    
T  9646898 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacgaacatcggaagctccagacatagccaaaacaa 9646997  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattatt 499  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9646998 gacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaagttaatttggttcttttattccacaataactttattatt 9647080  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 134 - 502
Target Start/End: Original strand, 40998535 - 40998903
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40998535 aagttggtggctgatcaatgcatgaaaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggattattatggctagacgttacaattccataaacacca 40998634  T
Q  234 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatga 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40998635 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcattttgcaccattaaatattaagaatttgctcttgaatcaaacagatga 40998734  T
Q  334 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgac 433  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  40998735 aatgtagagaattttgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaataagacagacatatcatgac 40998834  T
Q  434 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40998835 ctacgaaaataaaattttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 40998903  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 134 - 502
Target Start/End: Original strand, 41000394 - 41000763
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41000394 aagttggtggctgatcaatgcatgaaaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggattattatggctagacgttacaattccataaacacca 41000493  T
Q  234 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatga 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41000494 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacaactcattttgcaccattaaatattaagaatttgctcttgaatcaaacagatga 41000593  T
Q  334 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgac 433  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41000594 aatgtagagaatttcgcaagctttccaacgagttagagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagaccgacatatcatgac 41000693  T
Q  434 ctacg-aaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41000694 ctacgaaaaataaaattttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 41000763  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 220 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23446944 - 23446658
Alignment:
Q  220 ttccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23446944 ttccacaaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttg 23446845  T
Q  320 agtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagac 419  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23446844 actcaaacagatgaaatgtagagaatttggtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagac 23446745  T
Q  420 agacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23446744 agacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattcttttca 23446658  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 9596171 - 9596213
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaag 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596171 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaag 9596213  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 459 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 24790165 - 24790122
Alignment:
Q  459 aaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24790165 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 24790122  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 459 - 502
Target Start/End: Original strand, 24790156 - 24790199
Alignment:
Q  459 aaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24790156 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 24790199  T

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Target: chr5 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 502
Target Start/End: Original strand, 244640 - 245122
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  244640 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcaaccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaatg 244739  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  244740 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgtta 244839  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||    
T  244840 caattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatatttcgaatttgatc 244936  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  244937 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaa 245036  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  245037 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 245122  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 29950069 - 29949587
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29950069 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcaaccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaatg 29949970  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29949969 ttacaaaatgactctctaagctggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgtta 29949870  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  29949869 caattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatc 29949773  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  29949772 ttgaatcaaatagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaa 29949673  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29949672 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 29949587  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 29951707 - 29951225
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29951707 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcaaccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaatg 29951608  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29951607 ttacaaaatgactctctaagctggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgtta 29951508  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  29951507 caattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatc 29951411  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  29951410 ttgaatcaaatagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaa 29951311  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29951310 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 29951225  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 426 - 506
Target Start/End: Original strand, 21352695 - 21352775
Alignment:
Q  426 atcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21352695 atcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 21352775  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 402 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 38936817 - 38936717
Alignment:
Q  402 atatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattct 501  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38936817 atatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaattttgaacccaaaattgatttggttcttttatttcacaatgactttattattct 38936718  T
Q  502 t 502  Q
    |    
T  38936717 t 38936717  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 315 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16780797 - 16780615
Alignment:
Q  315 tcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaac 414  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||| || ||  |||| ||||||| || | ||||||| |||||| |||| ||||||| | || |||||||| |||||    
T  16780797 tcttgagttaaacagacgaaatgcagataactttctaagatttccaaggactcaaagatcgcctcaatcggacatccagaattccggatatagccaaaac 16780698  T
Q  415 aagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattatt 499  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||    
T  16780697 aagacaaacacatcatgaactacgaaaataaaacattgaa-ccaaaattaattcaattcttttatt-cacaatgactttattatt 16780615  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 438 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 21352670 - 21352602
Alignment:
Q  438 gaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 506  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21352670 gaaaataaaactttgaatccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 21352602  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 23661015 - 23660939
Alignment:
Q  408 caaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttc-ttttattccat 484  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23661015 caaaaacaagacagtcatataatcacctacgaaaataatac-ttgaaaccaaaattaatttggttcattttattccat 23660939  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 484
Target Start/End: Original strand, 23797555 - 23797631
Alignment:
Q  408 caaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttc-ttttattccat 484  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23797555 caaaaacaagacagtcatataatcacctacgaaaataatac-ttgaaaccaaaattaatttggttcattttattccat 23797631  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27402036 - 27401975
Alignment:
Q  16 aattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaatt 77  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  27402036 aattacaagatggctttgattctaaaactctcagaaaatgaaaataaatgcagccactaatt 27401975  T

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Target: chr8 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 8366592 - 8366107
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8366592 attacatgaggactttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataagagg 8366493  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8366492 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 8366393  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  8366392 caattccacaaacaccacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccgttaaatattccgaatttgctc 8366293  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaa 416  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  8366292 ttgagtcaaatagataaaatgtagagaattccgtaagctttcaaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccaaatatagccaaaacaa 8366193  T
Q  417 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8366192 gacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgaatttattattctt 8366107  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 134 - 502
Target Start/End: Original strand, 17277991 - 17278358
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17277991 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcattttcacattgatttgtgaaggcttattatgtctagacgttacaattccacaaacacca 17278090  T
Q  234 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatga 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  17278091 cctttaattcttcagctaacacactttaaccacgtcttctacttatagctcattctacaccactaaatattccgaatttgcttttgagtcaaacagacga 17278190  T
Q  334 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgac 433  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17278191 aatgtagaaaatttcgtaagctttccaatgagttaaagatcacctcaaacggacatctagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgac 17278290  T
Q  434 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17278291 ttacgaaaat-aaactttggacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 17278358  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 318 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 17277593 - 17277409
Alignment:
Q  318 tgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaag 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  17277593 tgagtcaaacagacgaaatgtagagaattccgtaagctttccaatgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaag 17277494  T
Q  418 acagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17277493 acatacatatcatgacctacaaaaataaaactttgaacccaaaattaatttgattcttttattccacaatgactttattattctt 17277409  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 350 - 502
Target Start/End: Original strand, 6778187 - 6778338
Alignment:
Q  350 taagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaact 449  Q
    ||||||||| || || | ||||| |||||||  || |||| |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||    
T  6778187 taagctttctaaagactcaaagaacacctcactcgaatattcagagctccaaatatagccaaaacaagacagacatatcatgacatgtgtaaataaaact 6778286  T
Q  450 ttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6778287 tagaa-ccaaaattaattcggttcttttattccacaataactttattattctt 6778338  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 284 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 17857380 - 17857163
Alignment:
Q  284 cattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 382  Q
    ||||||| ||||| | |||| |||| ||| ||  |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  17857380 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 17857282  T
Q  383 cggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattcc 482  Q
    ||||  |||||||  | ||||||    || |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  17857281 cggagttccagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 17857183  T
Q  483 ataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  17857182 ataatgaatttattattctt 17857163  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 502
Target Start/End: Original strand, 23016372 - 23016444
Alignment:
Q  429 atgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23016372 atgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgactttaatattctt 23016444  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 17277720 - 17277677
Alignment:
Q  459 aaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17277720 aaattaatttggttcttttattccataatgactttattattctt 17277677  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 502
Target Start/End: Original strand, 23016690 - 23016778
Alignment:
Q  413 acaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23016690 acaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaa-ccaaaaataatttgatttttttattccataacgactttaatattctt 23016778  T

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Target: chr3 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25532077 - 25531636
Alignment:
Q  61 aaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgagg 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25532077 aaatgcagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataagaggttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgagg 25531978  T
Q  161 aggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacacttt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25531977 aggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttacacacttt 25531878  T
Q  261 aaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttcca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25531877 aaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattctgaatttgctcttaagtcaaacagatgaaatgtagagaattccataagctttcca 25531778  T
Q  361 acgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaa 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25531777 acgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagtcaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaa 25531678  T
Q  461 attaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||    
T  25531677 attaatttggttctttttttctacaatgaatttattattctt 25531636  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 134 - 502
Target Start/End: Original strand, 5554107 - 5554475
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5554107 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttacacattgatttgtgaaggcttattatggctagacgttacaattccacaaacacca 5554206  T
Q  234 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatga 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5554207 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgaatcaaacagatga 5554306  T
Q  334 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgac 433  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5554307 aatgtagagaatttcgtaagctatccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgac 5554406  T
Q  434 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5554407 ctacgaaaataaaattttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 5554475  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 134 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 23460570 - 23460202
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 233  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23460570 aagttggtggttgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatggctagacgttacaattccacaaacacca 23460471  T
Q  234 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatga 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23460470 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacctacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgaatcaaacagatga 23460371  T
Q  334 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgac 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23460370 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatataatgac 23460271  T
Q  434 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23460270 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattctacaatgactttattattctt 23460202  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 134 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 16347002 - 16346631
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16347002 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaatgcttattatggctagacgttacatttccacaaacacca 16346903  T
Q  234 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatga 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16346902 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattctgaatttgctcttgactcaaacagatga 16346803  T
Q  334 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgac 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16346802 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgac 16346703  T
Q  434 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttc 505  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16346702 ctacgaaaataagactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattcttttc 16346631  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 134 - 506
Target Start/End: Original strand, 47418292 - 47418664
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47418292 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaatgcttattatggctagacgttacatttccacaaacacca 47418391  T
Q  234 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatga 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  47418392 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattctgaatttgctcttgactcaaacagatga 47418491  T
Q  334 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgac 433  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47418492 aatgtagagaattttgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgac 47418591  T
Q  434 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 506  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47418592 ctacgaaaataagactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattcttttca 47418664  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 233 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 5553467 - 5553198
Alignment:
Q  233 acctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatg 332  Q
    ||||||||||||||  || ||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||    
T  5553467 acctttaattcttcaactaacatacttcaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatatttcgaatttgctcttgaattaaacagatg 5553368  T
Q  333 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatga 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5553367 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagatagacatatcatga 5553268  T
Q  433 cctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5553267 cctacgaaaataaaattttgaacccaaaattaatttggttcttttatttcacaatgactttattattctt 5553198  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 138 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 47566839 - 47566476
Alignment:
Q  138 tggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctt 237  Q
    |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  47566839 tggtggttgatcaatgcttgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaagcttattatttctagaaattacaattccacaaacaccacttt 47566740  T
Q  238 taattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatg 337  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  47566739 taattcttcaacttgcacactttaatcacgtcttcaacttacagctcattctacaccattaaatattttgaatttgctc--gagtcaaacagacgaaatg 47566642  T
Q  338 tagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagac--atatcatgacct 435  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||| ||  ||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||| ||    
T  47566641 taaagaattttgtaagctttccaacgaattaaagatcacctcaatcgaacatccatagctccagatatagccaagacaagacaaacatatatcatgatct 47566542  T
Q  436 acgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||||||| ||| ||  ||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47566541 acgaaaataaaa-ttttaaatcaaaattaaatcaattcttttattccacaatgactttattattctt 47566476  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 282 - 502
Target Start/End: Original strand, 16022616 - 16022836
Alignment:
Q  282 ctcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaa 381  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16022616 ctcattctacaccactaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagacgaaatgtagagaacttcgtaagctttccaacgagttaaagaccacctcaa 16022715  T
Q  382 acggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattc 481  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16022716 acggacatccagagcttcagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttggacccaaaattaatttggttcttttattc 16022815  T
Q  482 cataatgactttattattctt 502  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16022816 cacaatgactttattattctt 16022836  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 32570674 - 32570515
Alignment:
Q  307 gaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatata 406  Q
    |||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||   |||||||||    
T  32570674 gaatttgctctcgagtcaaacatacaaaatgtagataattttgtaagctttccaacgaattaaagatcacctcaatataacatccagaactccagatata 32570575  T
Q  407 gcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatt 467  Q
    | |||||||| | |||||||| |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  32570574 gtaaaaacaaaatagacatataatgatctacgaaaataacatttagaa-ccaaaattaatt 32570515  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 2683681 - 2683485
Alignment:
Q  305 ccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagata 404  Q
    ||||||||| |||||| |   ||||| ||||| |||| ||||| |||| | || |||||| ||||||||||  | || |||| || || ||| | |||||    
T  2683681 ccgaattttttcttgaatacgacagacgaaatatagataattttgtaatcatttcaacgaattaaagatcatttgaatcggacattcaaagtcctagata 2683582  T
Q  405 tagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||  |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||||| | || |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2683581 tagataaaataagacagacatgttatgatctacaaaaataacactttgaaca-aaaattaatttgatttttttattccaaaatgattttattattctt 2683485  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 454
Target Start/End: Original strand, 25532823 - 25532867
Alignment:
Q  410 aaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25532823 aaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 25532867  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 2693852 - 2693788
Alignment:
Q  29 ttttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggt 93  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  2693852 ttttgattctgaaactcttagaaaataaaagtaaatgcaaccactaattgcaattatgttttggt 2693788  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2683989 - 2683933
Alignment:
Q  40 aaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctga 99  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2683989 aaactcttagaaaatgaacggaaatgcagc---taatttcaataatgttttggtggctga 2683933  T

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Target: scaffold0269 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 369
Target Start/End: Original strand, 1602 - 1954
Alignment:
Q  17 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1602 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccattaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataagagg 1701  T
Q  117 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1702 ttacaaaatgactctctaagttagtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaagcttattatttctagacgtta 1801  T
Q  217 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1802 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaaattacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgctc 1901  T
Q  317 ttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaa 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1902 ttgagtcagacagatgaaatgtagagaattccataagctttccaacgagttaa 1954  T

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Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 411 - 502
Target Start/End: Original strand, 1962 - 2051
Alignment:
Q  411 aaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  1962 aaacaagacaga--tatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgacattattattctt 2051  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 134 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 55225 - 54856
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  55225 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatggctagacgttacaattccacaaacacca 55126  T
Q  234 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatga 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  55125 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgaatcaaacagatga 55026  T
Q  334 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgac 433  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  55025 aatgtagagaattttgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagcgaaaacaagacagacatagcatgac 54926  T
Q  434 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgac-tttattattctt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  54925 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgacttttattattctt 54856  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 140 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 86941 - 86583
Alignment:
Q  140 gtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccaccttta 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  86941 gtggctaatcaatggatgaggaggttacatattgattttcacattgatttgtgaaggcttattatttatagacgttacaattccacaaacaccaccttta 86842  T
Q  240 attcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgta 339  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  86841 attcttcagcttactcactttaaccacgttttcagcttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgctcttgagtcaaacagatgaaattta 86742  T
Q  340 gagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacga 439  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||| ||||||| ||||||    ||| |||||||||||||| |    
T  86741 gagaatttcgtaagctttcaaacgagttaaagatcacctcaaacggacatcaggagctccatatatagccaaaaca----agagatatcatgacctacaa 86646  T
Q  440 aaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  86645 aaataaaacattgaacccaaaattaatttggttcctttattccacaatgactttattattctt 86583  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 399 - 502
Target Start/End: Original strand, 643 - 746
Alignment:
Q  399 cagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattat 498  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  643 cagatatagccaaaacaagatagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttgattcttttatttctcaatgactttattat 742  T
Q  499 tctt 502  Q
    ||||    
T  743 tctt 746  T

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Target: scaffold0013 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 134 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 241414 - 241046
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  241414 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttatatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatgtctagacgttacaattccacaaacacca 241315  T
Q  234 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatga 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||    
T  241314 cctttaattcttcagctaacacactttaaccacgtcttctacttatagctcattctacaccactaaatattccgaatttgctcctgagtcaaaaagacga 241215  T
Q  334 aatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgac 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  241214 aatgtagagaacttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagcttcagatatagccaaaacaagacagacatattatgac 241115  T
Q  434 ctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  241114 ctacgaaaataaaactttaaacccaaaattaatttggttcttttattctgcaatgactttattattctt 241046  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 134 - 502
Target Start/End: Original strand, 399 - 769
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttc-tagacgttacaattccacaaacacc 232  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  399 aagttggtggcggatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatggcctagccgttacaattccacaaacacc 498  T
Q  233 acctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatg 332  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  499 acctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctaattacagctcattctgaaccattaaatattccgaatttgctcttggatcaaacagatg 598  T
Q  333 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatga 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  599 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaatgagttaaagatcacctgaaacggacatccggagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatga 698  T
Q  433 cctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactt-tattattctt 502  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  699 cctacaaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgacttctattattctt 769  T

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Target: scaffold0146 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 331 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 31762 - 31587
Alignment:
Q  331 tgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcat 430  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31762 tgaaatgtagagaattttgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcat 31663  T
Q  431 gacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattcttttca 506  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31662 gacctacgaaaataagactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattcttttca 31587  T

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Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27520 - 27480
Alignment:
Q  134 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattca 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27520 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattca 27480  T

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Target: scaffold0096 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 398 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22503 - 22399
Alignment:
Q  398 ccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttatta 497  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22503 ccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttatta 22404  T
Q  498 ttctt 502  Q
    |||||    
T  22403 ttctt 22399  T

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Target: scaffold0021 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 383 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 17776 - 17657
Alignment:
Q  383 cggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattcc 482  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  17776 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacatacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattca 17677  T
Q  483 ataatgactttattattctt 502  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  17676 acactgactttattattctt 17657  T

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Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 383 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27307 - 27188
Alignment:
Q  383 cggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattcc 482  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  27307 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacatacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattca 27208  T
Q  483 ataatgactttattattctt 502  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  27207 acactgactttattattctt 27188  T

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Target: scaffold0094 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 502
Target Start/End: Original strand, 13510 - 13582
Alignment:
Q  429 atgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13510 atgacctacgaaaataaaaatttgaacccaaaat-aatttggttcttttattccataatgactttattattctt 13582  T

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Target: scaffold0321 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 284 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 5437 - 5220
Alignment:
Q  284 cattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 382  Q
    ||||||| ||||| | |||| |||| ||| ||  |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  5437 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 5339  T
Q  383 cggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattcc 482  Q
    ||||  |||||||| | ||||||    || |||||||| | | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  5338 cggagttccagagttctagatatgatgaatacaagacacatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 5240  T
Q  483 ataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  5239 ataatgaatttattattctt 5220  T

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Target: scaffold0139 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4297 - 4225
Alignment:
Q  429 atgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4297 atgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgactttattattctt 4225  T

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Target: scaffold0180 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 284 - 502
Target Start/End: Original strand, 11265 - 11481
Alignment:
Q  284 cattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 382  Q
    ||||||| ||||| | |||| |||| ||| ||  |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  11265 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 11363  T
Q  383 cggatatccagagtgccagatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattcc 482  Q
    ||||  | |||||  | ||||||    || |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  11364 cggagttgcagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaa-ccaaaaataatttgattcttttattcc 11462  T
Q  483 ataatgactttattattctt 502  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  11463 a-aatgactttaatattctt 11481  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 413 - 502
Target Start/End: Original strand, 375304 - 375392
Alignment:
Q  413 acaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||||| | || ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  375304 acaagacagatacataatgacctacaaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgaatttattattctt 375392  T

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Target: chr6 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 502
Target Start/End: Original strand, 12037064 - 12037103
Alignment:
Q  463 taattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12037064 taatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 12037103  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 469 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 12037049 - 12037016
Alignment:
Q  469 ggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12037049 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 12037016  T

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Target: scaffold0359 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 458 - 502
Target Start/End: Original strand, 8902 - 8946
Alignment:
Q  458 aaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 502  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8902 aaaattaacttggttcttatattccacaatgactttattattctt 8946  T

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