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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18389_high_7 (Length: 250)

Name: NF18389_high_7
Description: NF18389
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18389_high_7
NF18389_high_7
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (11-250)||(9302036-9302267)
chr5 (11-247)||(9352184-9352416)
chr5 (26-249)||(9367215-9367435)
chr5 (13-247)||(9332459-9332691)
chr5 (13-247)||(9305658-9305889)
chr5 (15-247)||(9309579-9309807)
chr5 (15-247)||(9355985-9356215)
chr5 (11-240)||(9288679-9288902)
chr5 (11-247)||(9373126-9373356)
chr5 (206-247)||(9293217-9293258)
chr5 (15-247)||(9348615-9348845)
chr5 (11-92)||(9297949-9298030)
chr5 (39-120)||(9293313-9293395)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9302267 - 9302036
Alignment:
Q  11 agaatatcacacgcaatatcattcacatattcacaatgttgggaaaacatcaaacaagattaccatatttaaagggaaatcctgcaggcaccacatgctc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9302267 agaatatcacatgcaatatcattcacatattcacaatgttg-----acatcaaacaagcttaccatatttaaagggaaatcctgcaggcaccacatgctc 9302173  T
Q  111 tacaccatcagcactaacaagtgctgcatagtttattaatttcattattatatcaatttaataattatcaaccaatcaatatgatgaatacctcttatat 210  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9302172 tacaccatca---ctaacaagtgctgcatattttattaatttcattattatatcaatttaacaattatcaaccaatcaatatgatgaatacctcttatat 9302076  T
Q  211 aaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaacttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9302075 aaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaacttc 9302036  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9352416 - 9352184
Alignment:
Q  11 agaatatcacacgcaatatcattcacatattcacaatgttgggaaaacatcaaacaagattaccatatttaaagggaaatcctgcaggcaccacatgctc 110  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9352416 agaatatcacatgcagtatcattcacatattcacaatgttgggaaaacatgtaacaagcttaccatatttaaagg-aaatcatgcaggcaccacatgctc 9352318  T
Q  111 tacaccatcagcactaacaagtgctgcatagtttattaatttcattattatatcaatttaataattatcaaccaatcaatatgatgaatacctcttatat 210  Q
    ||||||||||   |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9352317 tacaccatca---ctaacaagtgctgtttattttattaatttcattatcatatgaatttaataattatcaaccaatcaatatgacgaatacctcttatat 9352221  T
Q  211 aaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaac 247  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9352220 aaatagagattcaagaacttggtaacatcacacaaac 9352184  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Original strand, 9367215 - 9367435
Alignment:
Q  26 atatcattcacatattcacaatgttgggaaaacatcaaacaagattaccatatttaaagggaaatcctgcaggcaccacatgctctacaccatcagcact 125  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |       
T  9367215 atatcattcaaatattcacaatgttgggaaaacatctaacaagcttaccatattcaaaggggaatcatgcaggcaccacatgctctacaccatcaccg-- 9367312  T
Q  126 aacaagtgctgcatagtttattaatttcattattatatcaatttaataattatcaaccaatcaatatgatgaatacctcttatataaatagggagtcaag 225  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9367313 -acaagtgcttcatattttattaatttcattatcatatgaatttaataattctcaaccaatcaatatgatgaatacctcttatataaatagagagtcaag 9367411  T
Q  226 aacttggtaacatcacacaaactt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9367412 aacttggtaacatcacacaaactt 9367435  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9332691 - 9332459
Alignment:
Q  13 aatatcacacgcaatatcattcacatattcacaatgttgggaaaacatcaaacaagattaccatatttaaagggaaatcctgcaggcaccacatgctcta 112  Q
    |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9332691 aataccacatgcgataccattcacatattcacaatgctgggaaaacatctaacaaggttactatattcaaaaggaaatcatacaggcaccacatgctcta 9332592  T
Q  113 caccatcagcactaacaagtgctgcatagtttattaatttcat-tattatatcaatttaataattatcaaccaatcaatatgatgaatacctcttatata 211  Q
     ||||||| ||   |||||| ||||||| ||||| || ||  | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9332591 aaccatcatca---acaagtactgcatattttatcaacttattatattatatgaattaaataattatcaaccaatcaatatgacgaatacctcttatata 9332495  T
Q  212 aatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaac 247  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9332494 aatagagcatcaagaacttggtaacatcacacaaac 9332459  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9305889 - 9305658
Alignment:
Q  13 aatatcacacgcaatatcattcacatattcacaatgttgggaaaacatcaaacaagattaccatatttaaagggaaatcc-tgcaggcaccacatgctct 111  Q
    ||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||||||   |||||  |||||| |||||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  9305889 aatatcacatgcagtatcattaataaattcacaatgttggactaacatgtaacaagcttaccatattcaaagggaaattcatgtaggccccacatgctct 9305790  T
Q  112 acaccatcagcactaacaagtgctgcatagtttattaatt-tcattattatatcaatttaataattatcaaccaatcaatatgatgaatacctcttatat 210  Q
    |||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9305789 acaccatca---ctaacaagtgctgtatattttattaaaaatcattatcatatgaatttaataattatccaccaatcaatatgatgaatacatcttatat 9305693  T
Q  211 aaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaac 247  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9305692 aaata--gagtcaagaccttggtaacataacacaaac 9305658  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Original strand, 9309579 - 9309807
Alignment:
Q  15 tatcacacgcaatatcattcacatattcacaatgttgggaaaacatcaaacaagattaccatatttaaagggaaatcc-tgcaggcaccacatgctctac 113  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |  |   ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  9309579 tatcacatgcaatatcattaacatattcacaatgttgggtagaggtatgacaagcttaccatattcaaagggaaatccatgcaggcaccacatgctctaa 9309678  T
Q  114 accatcagcactaacaagtgctgcatagtttattaatttcattattatatcaatttaataattatcaaccaatcaatatgatgaatacctcttatataaa 213  Q
    |||||    | ||||||||| |   || |||||||||||  ||||||||| || |||||||| | ||||||||    || ||||||  |||||||||||     
T  9309679 accat---gattaacaagtgataactattttattaatttacttattatatgaaattaataatcagcaaccaatatcgatcatgaatggctcttatataa- 9309774  T
Q  214 tagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaac 247  Q
     || |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  9309775 -agagagtcaggaacttgggaacaccacacaaac 9309807  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Original strand, 9355985 - 9356215
Alignment:
Q  15 tatcacacgcaatatcattcacatattcacaatgttgggaaaacatcaaacaagattaccatatttaaagggaaatcc-tgcaggcaccacatgctctac 113  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||   ||||  |||||||||| ||| |||||| | ||||| || |||||||||||     
T  9355985 tatcacatgcaatatcattaacatattcacaatgttgggtagagatatgacaaccttaccatattcaaatggaaattcatgcagccagcacatgctctaa 9356084  T
Q  114 accatcagcactaacaagtgctgcatagtttattaatttcattattatatcaatttaataattatcaaccaatcaatatgatgaatacctcttatataaa 213  Q
    ||||| |    ||||||||| | | || ||||| |||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||    || ||||||  ||||||||||||    
T  9356085 accatgat---taacaagtgatacctattttatcaatttccttattatatgaaattaataatcagcaaccaatatcaatcatgaatggctcttatataaa 9356181  T
Q  214 tagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaac 247  Q
     || |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  9356182 gagagagtcaggcacttggtaacaccacacaaac 9356215  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9288902 - 9288679
Alignment:
Q  11 agaatatcacacgcaatatcattcacatattcacaatgttgggaaaacatcaaacaagattaccatatttaaagggaaatcc-tgcaggcaccacatgct 109  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| | | |||| |||||||||   |||||  |||||| |||||||||| ||| || |||   || ||||||||||||||    
T  9288902 agaataacacatgcagtatcattaataaattctcaatgttggactaacatgtaacaagcttaccatattcaaatggcaatttatgtaggcaccacatgct 9288803  T
Q  110 ctacaccatcagcactaacaagtgctgcatagtttattaatttcattattatatcaatttaataattatcaaccaatcaatatgatgaatacctcttata 209  Q
    ||||||||||     |||||| |||||  || |||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    || |||| || ||||||||    
T  9288802 ctacaccatcct---taacaactgctgtctattttattaattttgttattatatgaacataataattatcaaccaat----atcatgattagctcttata 9288710  T
Q  210 taaatagggagtcaagaacttggtaacatca 240  Q
    |||| || |||||||| ||||||||| ||||    
T  9288709 taaagagagagtcaagcacttggtaatatca 9288679  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 247
Target Start/End: Original strand, 9373126 - 9373356
Alignment:
Q  11 agaatatcacacgcaatatcattcacatattcacaatgttgggaaaacatcaaacaagattaccatatttaaagggaaa-tcctgcaggcaccacatgct 109  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| | | ||||||||||||||   |||||  |||||| |||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  9373126 agaataacacatgcagtatcattaataaattcacaatgttggactaacatgtaacaagcttaccatattcaaaggaaaattcatgtaggcaccacatgct 9373225  T
Q  110 ctacaccatcagcactaacaagtgctgcatagtttattaatttcattattatatcaatttaataattatcaaccaatcaatatgatgaatacctcttata 209  Q
    |||| ||||   || |||||| |||    || |||||| ||||| ||  ||||| || || ||||||||||||    |||||| |||| || ||||||||    
T  9373226 ctactccat---cattaacaactgccctctattttattcatttcctttctatatgaacttgataattatcaac----caatatcatgattagctcttata 9373318  T
Q  210 taaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaac 247  Q
    |||| || ||||| || ||||||||| |||| ||||||    
T  9373319 taaagagagagtctagcacttggtaatatcaaacaaac 9373356  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9293258 - 9293217
Alignment:
Q  206 tatataaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaac 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9293258 tatataaatagagagtcaagaacttggtaacatcacacaaac 9293217  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Original strand, 9348615 - 9348845
Alignment:
Q  15 tatcacacgcaatatcattcacatattcacaatgttgggaaaacatcaaacaagattaccatatttaaagggaaa-tcctgcaggcaccacatgctctac 113  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||   ||||  |||||||||| ||| ||||| || ||||| || |||||||||||     
T  9348615 tatcacatgcaatatcattaacatattcacaatgttgggtagagatatgacaaccttaccatattcaaatggaaattcatgcagccagcacatgctctaa 9348714  T
Q  114 accatcagcactaacaagtgctgcatagtttattaatttcattattatatcaatttaataattatcaaccaatcaatatgatgaatacctcttatataaa 213  Q
    |||||    | ||||||||| | | || ||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| | | ||||||    || ||||||   |||||||||||    
T  9348715 accat---gattaacaagtgatacctattttatcaatttccttattatatgagattaataatcagctaccaatatcaatcatgaatggatcttatataaa 9348811  T
Q  214 tagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaac 247  Q
     || |||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  9348812 gagagagtaaggaacttggtaacacaacacaaac 9348845  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 9298030 - 9297949
Alignment:
Q  11 agaatatcacacgcaatatcattcacatattcacaatgttgggaaaacatcaaacaagattaccatatttaaagggaaatcc 92  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||   |||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9298030 agaataacacatgcagtatcattaatatattcacaatgttggactaacatgtaacaagcttaccatattcaaagggaaatcc 9297949  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 9293395 - 9293313
Alignment:
Q  39 attcacaatgttgggaaaacatcaaacaagattaccatatttaaagggaaatcc-tgcaggcaccacatgctctacaccatca 120  Q
    ||||||||||||||   |||||  |||||| |||||||||| ||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  9293395 attcacaatgttggactaacatgtaacaagcttaccatattcaaatggcaattcatgtaggcaccacatgctctacaccatca 9293313  T

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