View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18398_high_17 (Length: 414)

Name: NF18398_high_17
Description: NF18398
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18398_high_17
NF18398_high_17
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-400)||(62256-62658)
scaffold0035 (1-400)||(63607-64000)
[»] chr3 (90 HSPs)
chr3 (1-400)||(24125323-24125725)
chr3 (1-400)||(24128600-24129002)
chr3 (1-400)||(2873388-2873790)
chr3 (1-400)||(7486394-7486797)
chr3 (1-400)||(2778548-2778951)
chr3 (1-400)||(43926659-43927061)
chr3 (1-400)||(2775305-2775708)
chr3 (1-400)||(45896204-45896607)
chr3 (1-400)||(30690560-30690962)
chr3 (1-400)||(10884682-10885083)
chr3 (1-400)||(20728615-20729017)
chr3 (1-399)||(49742887-49743289)
chr3 (22-400)||(52199737-52200117)
chr3 (1-400)||(16243697-16244099)
chr3 (1-400)||(10106568-10106969)
chr3 (5-400)||(54723565-54723964)
chr3 (1-399)||(29343842-29344244)
chr3 (1-392)||(10881312-10881706)
chr3 (1-399)||(3840341-3840743)
chr3 (1-392)||(53815660-53816054)
chr3 (1-400)||(25584511-25584903)
chr3 (1-388)||(538662-539053)
chr3 (1-400)||(41976839-41977227)
chr3 (1-400)||(16184655-16185058)
chr3 (1-400)||(43809403-43809806)
chr3 (1-392)||(6434746-6435140)
chr3 (26-400)||(19304683-19305059)
chr3 (1-400)||(11190350-11190753)
chr3 (1-400)||(9392558-9392960)
chr3 (1-400)||(19301473-19301875)
chr3 (1-400)||(55034824-55035230)
chr3 (1-401)||(8461455-8461858)
chr3 (1-400)||(50461516-50461919)
chr3 (1-400)||(17039990-17040392)
chr3 (20-400)||(35412339-35412716)
chr3 (1-400)||(32287291-32287694)
chr3 (1-400)||(54719795-54720197)
chr3 (22-400)||(15195292-15195672)
chr3 (1-392)||(27091726-27092120)
chr3 (1-400)||(47051319-47051722)
chr3 (1-400)||(22416802-22417204)
chr3 (1-400)||(28008039-28008440)
chr3 (1-400)||(47054749-47055152)
chr3 (3-391)||(48064005-48064396)
chr3 (1-392)||(12561202-12561596)
chr3 (1-400)||(11784589-11784992)
chr3 (1-400)||(32367098-32367499)
chr3 (1-400)||(34983821-34984223)
chr3 (22-400)||(17141232-17141612)
chr3 (1-336)||(23298583-23298920)
chr3 (1-392)||(25442827-25443222)
chr3 (1-400)||(46884776-46885166)
chr3 (1-400)||(30219973-30220379)
chr3 (1-400)||(35751278-35751667)
chr3 (3-396)||(17528731-17529123)
chr3 (98-392)||(28265712-28266005)
chr3 (1-282)||(31549115-31549398)
chr3 (22-291)||(18644758-18645028)
chr3 (134-392)||(52988237-52988497)
chr3 (3-345)||(17531626-17531963)
chr3 (22-400)||(3292948-3293331)
chr3 (1-392)||(22993664-22994060)
chr3 (41-400)||(22783416-22783788)
chr3 (41-400)||(22787780-22788152)
chr3 (1-281)||(55031964-55032237)
chr3 (22-204)||(18641762-18641945)
chr3 (67-351)||(18542426-18542711)
chr3 (28-228)||(54461012-54461213)
chr3 (234-400)||(52309759-52309928)
chr3 (22-269)||(17545812-17546062)
chr3 (238-390)||(31857650-31857804)
chr3 (1-137)||(28266006-28266143)
chr3 (1-145)||(52309583-52309728)
chr3 (271-400)||(17544440-17544570)
chr3 (26-281)||(282184-282441)
chr3 (296-400)||(11636658-11636762)
chr3 (290-400)||(6922570-6922682)
chr3 (1-113)||(52990813-52990926)
chr3 (1-79)||(37408828-37408907)
chr3 (1-64)||(6922682-6922746)
chr3 (1-72)||(10902094-10902166)
chr3 (29-74)||(25486290-25486335)
chr3 (136-186)||(31857804-31857854)
chr3 (168-281)||(27308722-27308834)
chr3 (271-351)||(38386862-38386941)
chr3 (296-392)||(22360278-22360375)
chr3 (168-370)||(27308159-27308359)
chr3 (168-280)||(27298599-27298711)
chr3 (352-400)||(18645025-18645075)
chr3 (42-102)||(31857847-31857910)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (22-400)||(42368715-42369095)
chr2 (1-400)||(11347877-11348280)
chr2 (1-400)||(40781193-40781595)
chr2 (1-400)||(8888356-8888759)
chr2 (1-400)||(25959670-25960073)
chr2 (1-400)||(37279658-37280061)
chr2 (1-400)||(24234816-24235219)
chr2 (1-399)||(43207872-43208273)
chr2 (1-399)||(9185406-9185808)
chr2 (1-400)||(24238088-24238491)
chr2 (1-400)||(6826493-6826894)
chr2 (22-399)||(5105448-5105828)
chr2 (1-399)||(31585922-31586324)
chr2 (1-400)||(43723422-43723823)
chr2 (1-400)||(25870505-25870907)
chr2 (1-399)||(9188634-9189036)
chr2 (1-400)||(25820828-25821230)
chr2 (1-370)||(30274750-30275121)
chr2 (1-400)||(13971876-13972278)
chr2 (22-400)||(36808446-36808826)
chr2 (22-400)||(25138935-25139316)
chr2 (1-400)||(25873896-25874304)
chr2 (1-400)||(31427523-31427926)
chr2 (22-400)||(26365654-26366035)
chr2 (22-377)||(5666264-5666619)
chr2 (1-400)||(22020789-22021191)
chr2 (1-400)||(45453595-45453997)
chr2 (2-392)||(45493139-45493532)
chr2 (2-392)||(45500881-45501274)
chr2 (1-400)||(16178848-16179250)
chr2 (1-400)||(27266509-27266912)
chr2 (1-400)||(33310387-33310790)
chr2 (1-400)||(38015239-38015642)
chr2 (1-392)||(37937201-37937595)
chr2 (1-400)||(12219516-12219919)
chr2 (1-400)||(45456882-45457285)
chr2 (1-400)||(22630562-22630964)
chr2 (1-392)||(1386404-1386798)
chr2 (1-392)||(16790739-16791135)
chr2 (3-392)||(40259123-40259515)
chr2 (1-332)||(9966351-9966684)
chr2 (22-400)||(17876827-17877207)
chr2 (1-374)||(3875035-3875410)
chr2 (1-243)||(29440375-29440618)
chr2 (1-400)||(30926268-30926664)
chr2 (187-399)||(10600667-10600876)
chr2 (22-313)||(17874591-17874877)
chr2 (230-400)||(17876223-17876395)
chr2 (22-162)||(10600876-10601016)
chr2 (269-392)||(29440252-29440377)
chr2 (80-398)||(35521423-35521746)
chr2 (1-201)||(34682622-34682824)
chr2 (197-283)||(11187925-11188011)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (1-400)||(23224891-23225294)
chr7 (1-399)||(17730541-17730942)
chr7 (1-399)||(8276712-8277114)
chr7 (1-400)||(4546595-4546997)
chr7 (1-400)||(26557226-26557627)
chr7 (1-400)||(4595995-4596397)
chr7 (1-377)||(20594014-20594391)
chr7 (1-392)||(45287055-45287449)
chr7 (1-400)||(48645200-48645602)
chr7 (1-400)||(9132746-9133148)
chr7 (1-400)||(6603184-6603587)
chr7 (23-400)||(13842366-13842745)
chr7 (22-400)||(13449784-13450164)
chr7 (1-400)||(26136114-26136516)
chr7 (1-376)||(2441264-2441641)
chr7 (1-400)||(9864712-9865115)
chr7 (1-400)||(14683430-14683832)
chr7 (1-400)||(26144494-26144896)
chr7 (1-400)||(16165474-16165877)
chr7 (1-400)||(3067963-3068365)
chr7 (1-400)||(10468870-10469272)
chr7 (1-376)||(37415409-37415787)
chr7 (1-400)||(37166133-37166535)
chr7 (1-400)||(20080704-20081106)
chr7 (158-400)||(4695250-4695494)
chr7 (25-400)||(7227253-7227632)
chr7 (1-391)||(5242136-5242532)
chr7 (121-400)||(11398132-11398414)
chr7 (23-400)||(13809525-13809901)
chr7 (94-400)||(10344940-10345248)
chr7 (6-261)||(9271456-9271705)
chr7 (1-195)||(45290466-45290661)
chr7 (90-400)||(5796279-5796590)
chr7 (140-376)||(37423083-37423319)
chr7 (22-351)||(18562539-18562871)
chr7 (5-191)||(4542734-4542921)
chr7 (1-170)||(11919851-11920021)
chr7 (178-400)||(22611771-22611995)
chr7 (1-143)||(35961076-35961219)
chr7 (258-393)||(9273364-9273501)
chr7 (267-374)||(45290667-45290774)
chr7 (1-118)||(4695491-4695609)
chr7 (177-351)||(24917972-24918145)
chr7 (176-349)||(2090385-2090557)
chr7 (22-94)||(11398057-11398129)
chr7 (1-57)||(10345266-10345323)
chr7 (335-400)||(9080903-9080970)
chr7 (22-79)||(22611718-22611775)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-400)||(19134-19537)
[»] chr4 (73 HSPs)
chr4 (1-400)||(39501386-39501789)
chr4 (1-400)||(48637243-48637646)
chr4 (1-400)||(19820466-19820868)
chr4 (1-400)||(24150410-24150813)
chr4 (1-400)||(34017762-34018165)
chr4 (1-400)||(52006512-52006914)
chr4 (22-400)||(24044144-24044524)
chr4 (1-400)||(52530916-52531319)
chr4 (22-400)||(3718862-3719242)
chr4 (1-398)||(38283470-38283870)
chr4 (1-400)||(44164521-44164923)
chr4 (22-400)||(15431817-15432197)
chr4 (4-400)||(27677039-27677438)
chr4 (1-400)||(15429837-15430239)
chr4 (1-400)||(37103197-37103598)
chr4 (1-399)||(40903064-40903466)
chr4 (1-400)||(5672620-5673036)
chr4 (1-400)||(40794740-40795143)
chr4 (1-400)||(56195265-56195668)
chr4 (1-400)||(12782643-12783045)
chr4 (1-400)||(15436451-15436853)
chr4 (1-399)||(27014002-27014404)
chr4 (22-399)||(48415532-48415912)
chr4 (1-400)||(5670302-5670718)
chr4 (1-400)||(5681166-5681568)
chr4 (1-400)||(34319898-34320301)
chr4 (1-400)||(44808936-44809339)
chr4 (1-400)||(29324563-29324965)
chr4 (20-400)||(15163930-15164314)
chr4 (1-400)||(15405062-15405468)
chr4 (1-400)||(19859503-19859904)
chr4 (22-400)||(15812139-15812523)
chr4 (1-330)||(3797789-3798119)
chr4 (1-392)||(56198599-56198994)
chr4 (22-388)||(12238018-12238384)
chr4 (1-400)||(19864498-19864895)
chr4 (1-333)||(40616789-40617137)
chr4 (1-400)||(11195413-11195816)
chr4 (22-400)||(53009561-53009941)
chr4 (1-400)||(40493348-40493751)
chr4 (22-400)||(46955481-46955862)
chr4 (1-400)||(33926705-33927113)
chr4 (1-392)||(21419535-21419929)
chr4 (1-400)||(18673063-18673454)
chr4 (1-400)||(25961796-25962199)
chr4 (1-377)||(33408298-33408676)
chr4 (138-400)||(19827228-19827492)
chr4 (1-400)||(29544855-29545257)
chr4 (63-399)||(35509704-35510042)
chr4 (1-369)||(49270454-49270820)
chr4 (1-271)||(18911368-18911639)
chr4 (75-325)||(15446792-15447042)
chr4 (31-400)||(8874772-8875145)
chr4 (22-398)||(30392313-30392687)
chr4 (1-400)||(8877481-8877885)
chr4 (2-399)||(53094246-53094648)
chr4 (134-321)||(27679340-27679527)
chr4 (1-400)||(37739738-37740144)
chr4 (68-360)||(22172422-22172715)
chr4 (134-400)||(48014167-48014432)
chr4 (249-392)||(8448773-8448918)
chr4 (22-158)||(5706374-5706511)
chr4 (269-400)||(15438431-15438564)
chr4 (1-104)||(39498346-39498450)
chr4 (80-281)||(33493756-33493958)
chr4 (1-84)||(15445346-15445430)
chr4 (317-400)||(27691442-27691527)
chr4 (328-400)||(18911292-18911366)
chr4 (58-184)||(5677447-5677575)
chr4 (1-88)||(35510044-35510132)
chr4 (1-67)||(19827489-19827556)
chr4 (117-210)||(8448654-8448748)
chr4 (300-399)||(5677690-5677790)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (1-400)||(49498478-49498881)
chr1 (1-400)||(41058283-41058685)
chr1 (1-399)||(45941157-45941559)
chr1 (1-400)||(20398593-20398996)
chr1 (1-400)||(23021904-23022307)
chr1 (1-400)||(1950436-1950838)
chr1 (1-400)||(21107272-21107674)
chr1 (27-400)||(49853086-49853461)
chr1 (1-400)||(28110797-28111199)
chr1 (1-400)||(21018448-21018849)
chr1 (1-400)||(2793968-2794370)
chr1 (1-400)||(37183844-37184247)
chr1 (2-400)||(6070935-6071337)
chr1 (1-400)||(31204578-31204981)
chr1 (1-400)||(45960725-45961128)
chr1 (2-400)||(673052-673456)
chr1 (1-400)||(905666-906072)
chr1 (1-400)||(3796807-3797209)
chr1 (1-400)||(29643202-29643604)
chr1 (1-392)||(2405258-2405652)
chr1 (22-241)||(27354947-27355165)
chr1 (1-391)||(34732341-34732734)
chr1 (1-175)||(21111139-21111314)
chr1 (168-392)||(11668175-11668401)
chr1 (23-392)||(7635394-7635767)
chr1 (22-305)||(21434477-21434763)
chr1 (1-392)||(27331757-27332145)
chr1 (22-271)||(27355689-27355941)
chr1 (1-104)||(21114479-21114583)
chr1 (286-388)||(42022427-42022531)
chr1 (1-170)||(11666982-11667152)
chr1 (1-194)||(42022587-42022783)
chr1 (311-400)||(27536579-27536669)
chr1 (80-192)||(16055629-16055742)
chr1 (1-192)||(13430938-13431133)
chr1 (1-170)||(34065142-34065313)
chr1 (90-192)||(16056874-16056977)
chr1 (1-73)||(27536512-27536585)
chr1 (22-192)||(16060970-16061143)
chr1 (59-118)||(30938601-30938661)
chr1 (315-392)||(34066737-34066815)
chr1 (203-282)||(34066626-34066705)
chr1 (258-294)||(42022531-42022567)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (1-400)||(26752682-26753085)
chr5 (1-400)||(41876745-41877148)
chr5 (1-400)||(34831502-34831905)
chr5 (1-400)||(41306508-41306910)
chr5 (1-400)||(4099498-4099905)
chr5 (1-400)||(7270755-7271157)
chr5 (1-391)||(20055522-20055915)
chr5 (1-400)||(18952432-18952834)
chr5 (1-400)||(21335679-21336081)
chr5 (1-400)||(33551860-33552262)
chr5 (1-400)||(21332661-21333065)
chr5 (1-400)||(26895585-26895987)
chr5 (1-400)||(31863438-31863856)
chr5 (1-400)||(40582988-40583390)
chr5 (22-400)||(17664291-17664670)
chr5 (1-400)||(42062660-42063063)
chr5 (22-400)||(22936940-22937321)
chr5 (1-400)||(43491494-43491897)
chr5 (22-400)||(7624841-7625222)
chr5 (1-400)||(14016119-14016522)
chr5 (1-400)||(26907436-26907838)
chr5 (1-400)||(34132964-34133366)
chr5 (1-400)||(34143195-34143597)
chr5 (22-400)||(14375798-14376193)
chr5 (1-400)||(12087697-12088099)
chr5 (3-400)||(26292530-26292930)
chr5 (22-400)||(28787332-28787706)
chr5 (1-392)||(12058473-12058867)
chr5 (1-374)||(39192095-39192471)
chr5 (5-392)||(17748187-17748577)
chr5 (90-373)||(2837071-2837355)
chr5 (135-400)||(30066081-30066348)
chr5 (22-400)||(21914862-21915243)
chr5 (1-392)||(11959159-11959545)
chr5 (152-400)||(32837759-32838007)
chr5 (1-377)||(18239476-18239854)
chr5 (1-167)||(37215019-37215185)
chr5 (182-400)||(23043904-23044123)
chr5 (1-211)||(22131159-22131371)
chr5 (207-400)||(22130004-22130198)
chr5 (26-398)||(31575159-31575533)
chr5 (1-102)||(30066348-30066450)
chr5 (1-120)||(23044163-23044283)
chr5 (26-283)||(18765647-18765907)
chr5 (309-400)||(28441425-28441518)
chr5 (100-256)||(563340-563497)
chr5 (315-351)||(563519-563555)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-400)||(3769-4172)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (1-400)||(2378970-2379373)
chr6 (1-400)||(3596762-3597165)
chr6 (2-400)||(20185485-20185886)
chr6 (2-400)||(22150105-22150506)
chr6 (22-400)||(5738087-5738468)
chr6 (1-400)||(26942416-26942818)
chr6 (1-399)||(9953705-9954106)
chr6 (1-400)||(30655184-30655587)
chr6 (1-400)||(10289713-10290115)
chr6 (1-400)||(11401997-11402400)
chr6 (1-391)||(1125716-1126110)
chr6 (1-400)||(11125678-11126079)
chr6 (1-400)||(9839375-9839778)
chr6 (1-400)||(22561144-22561547)
chr6 (1-313)||(23384733-23385048)
chr6 (1-400)||(4512213-4512619)
chr6 (1-400)||(6512993-6513399)
chr6 (26-400)||(28111773-28112148)
chr6 (22-392)||(28230343-28230715)
chr6 (1-392)||(24399928-24400322)
chr6 (1-400)||(14281501-14281904)
chr6 (1-392)||(24410048-24410441)
chr6 (1-400)||(13004929-13005332)
chr6 (1-284)||(17106591-17106875)
chr6 (1-400)||(19475743-19476145)
chr6 (1-400)||(2846042-2846447)
chr6 (1-392)||(18856006-18856400)
chr6 (2-400)||(28107769-28108172)
chr6 (1-370)||(13946791-13947161)
chr6 (22-400)||(11247502-11247883)
chr6 (1-400)||(12988104-12988507)
chr6 (53-400)||(5259677-5260024)
chr6 (1-400)||(13021233-13021636)
chr6 (233-400)||(11188130-11188299)
chr6 (1-243)||(7128199-7128442)
chr6 (102-400)||(31072045-31072332)
chr6 (248-398)||(23388326-23388478)
chr6 (134-351)||(24371065-24371284)
chr6 (37-271)||(23007932-23008167)
chr6 (37-271)||(23780197-23780432)
chr6 (1-223)||(26896240-26896463)
chr6 (256-400)||(28665501-28665647)
chr6 (59-350)||(28848634-28848926)
chr6 (98-400)||(11192657-11192961)
chr6 (225-400)||(26898075-26898252)
chr6 (175-364)||(2372104-2372289)
chr6 (22-128)||(23847784-23847889)
chr6 (1-126)||(32109685-32109811)
chr6 (22-127)||(23842801-23842906)
chr6 (1-108)||(2372293-2372396)
chr6 (70-120)||(23667721-23667771)
chr6 (1-87)||(24155347-24155434)
[»] scaffold0520 (3 HSPs)
scaffold0520 (1-400)||(8200-8602)
scaffold0520 (1-251)||(1530-1780)
scaffold0520 (230-400)||(4191-4363)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (22-400)||(12582744-12583124)
chr8 (1-400)||(16953512-16953915)
chr8 (1-399)||(18721262-18721664)
chr8 (1-393)||(13196600-13196995)
chr8 (1-400)||(14421480-14421884)
chr8 (23-400)||(17930717-17931096)
chr8 (1-400)||(5980294-5980696)
chr8 (2-400)||(18824376-18824778)
chr8 (1-399)||(25594638-25595040)
chr8 (2-399)||(25591461-25591861)
chr8 (1-400)||(21279750-21280152)
chr8 (1-400)||(18825868-18826271)
chr8 (1-400)||(36710617-36711020)
chr8 (1-392)||(10663643-10664037)
chr8 (1-400)||(22173904-22174307)
chr8 (1-400)||(33419392-33419794)
chr8 (1-400)||(45155250-45155653)
chr8 (1-400)||(38248380-38248782)
chr8 (22-400)||(23643555-23643936)
chr8 (22-400)||(43681873-43682254)
chr8 (1-392)||(10498195-10498589)
chr8 (24-359)||(5538778-5539114)
chr8 (1-400)||(8911383-8911787)
chr8 (3-392)||(31284414-31284810)
chr8 (1-377)||(25230841-25231219)
chr8 (1-370)||(23619345-23619715)
chr8 (18-365)||(2560325-2560673)
chr8 (1-330)||(12516433-12516765)
chr8 (41-400)||(5613739-5614111)
chr8 (1-400)||(30784665-30785058)
chr8 (1-323)||(44027074-44027397)
chr8 (1-170)||(33883331-33883501)
chr8 (61-351)||(4868041-4868330)
chr8 (296-399)||(23613277-23613382)
chr8 (1-84)||(20887589-20887673)
chr8 (2-96)||(14589603-14589698)
chr8 (1-76)||(5584377-5584462)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-384)||(197904-198288)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (1-396)||(5095-5493)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-400)||(292762-293164)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (1-399)||(5379-5782)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (22-400)||(67528-67908)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-400)||(89508-89911)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (23-400)||(3286-3665)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (1-396)||(57570-57969)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-400)||(58662-59066)
[»] scaffold0270 (3 HSPs)
scaffold0270 (1-400)||(44-447)
scaffold0270 (328-400)||(3733-3807)
scaffold0270 (328-400)||(10863-10937)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (1-400)||(2986-3395)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (22-392)||(30841-31213)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (1-270)||(1-272)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (1-400)||(2054-2456)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (1-392)||(29112-29506)
scaffold0084 (1-392)||(19042-19421)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (2-365)||(10185-10549)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (59-400)||(19094-19431)
[»] scaffold1785 (2 HSPs)
scaffold1785 (28-400)||(997-1362)
scaffold1785 (1-47)||(1-48)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (23-392)||(118449-118821)
scaffold0002 (20-96)||(99236-99312)
[»] scaffold1755 (1 HSPs)
scaffold1755 (1-258)||(4-262)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-246)||(248413-248659)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-245)||(27005-27250)
scaffold0080 (326-400)||(26927-27003)
[»] scaffold1208 (2 HSPs)
scaffold1208 (1-223)||(102-326)
scaffold1208 (254-348)||(1-95)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-207)||(241434-241641)
[»] scaffold1063 (1 HSPs)
scaffold1063 (22-243)||(2390-2620)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (1-206)||(1-206)
[»] scaffold2073 (1 HSPs)
scaffold2073 (1-159)||(848-1007)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (134-289)||(14091-14246)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (22-392)||(9685-10060)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (29-282)||(48411-48667)
scaffold0034 (315-369)||(48699-48752)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (1-108)||(7693-7801)
[»] scaffold0191 (2 HSPs)
scaffold0191 (296-400)||(1485-1591)
scaffold0191 (1-69)||(3988-4057)
[»] scaffold0048 (2 HSPs)
scaffold0048 (1-120)||(15433-15553)
scaffold0048 (299-400)||(24560-24663)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (345-400)||(1-58)


Alignment Details
Target: scaffold0035 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 62658 - 62256
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  62658 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 62559  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62558 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 62459  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62458 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 62359  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  62358 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 62259  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  62258 att 62256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 64000 - 63607
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  64000 ctttcgaatcatctatgttcccctaatcggtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttccacaatagttaacaaaatagtctgaatcaatcc 63901  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  63900 cttgagttaggaccctcttatagggttatagcccctaattccttaggtggtataataaccttcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 63801  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  63800 ggattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaatacaattaggtctaa-tcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 63702  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||||        || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  63701 ttatatttgatcagg--------agcattaagaacaattgaattgaataaaaactagaatgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttca 63610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 90)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24125725 - 24125323
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24125725 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 24125626  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24125625 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaa 24125526  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24125525 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 24125426  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24125425 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 24125326  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  24125325 att 24125323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24129002 - 24128600
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24129002 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 24128903  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24128902 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaa 24128803  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24128802 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 24128703  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24128702 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 24128603  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  24128602 att 24128600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2873790 - 2873388
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2873790 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 2873691  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2873690 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 2873591  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2873590 cgattatccattcttagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 2873491  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  2873490 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttca 2873391  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  2873390 att 2873388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7486797 - 7486394
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7486797 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 7486698  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7486697 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 7486598  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7486597 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 7486498  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7486497 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 7486398  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  7486397 aatt 7486394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2778951 - 2778548
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2778951 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 2778852  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2778851 cttgaattaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 2778752  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2778751 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 2778652  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2778651 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 2778552  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  2778551 aatt 2778548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43927061 - 43926659
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43927061 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 43926962  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926961 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 43926862  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43926861 cgattatccattcctagactaaccttgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 43926762  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43926761 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaactgaattgaataaaaactagattgtcatttacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 43926662  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  43926661 att 43926659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2775708 - 2775305
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2775708 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 2775609  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2775608 cttgaattaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 2775509  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2775508 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 2775409  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2775408 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 2775309  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  2775308 aatt 2775305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45896607 - 45896204
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45896607 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 45896508  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45896507 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 45896408  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45896407 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaactcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 45896308  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  45896307 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaatatggttc 45896208  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  45896207 aatt 45896204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30690962 - 30690560
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  30690962 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaataattctaatcaatcc 30690863  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30690862 cttgagttaggaccctcttctcaaattacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 30690763  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  30690762 cgattatccattcctagactaaccctgtttattataacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatat 30690663  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30690662 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacagtaaatagagtttcacagcaacatggttca 30690563  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  30690562 att 30690560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10885083 - 10884682
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10885083 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 10884984  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10884983 cttgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaaacacgttaacctaatatcactaacaaa 10884884  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10884883 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 10884784  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10884783 ttatatatgatcgggatat-aaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 10884685  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  10884684 att 10884682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 20728615 - 20729017
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  20728615 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttcgatgatatttaacaaaatagccctaatcaatcc 20728714  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20728715 cttgacttaggaccctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacattaacctaatatcactaacaaa 20728814  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20728815 agattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 20728914  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  20728915 ttatatttgataaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacgtggttca 20729014  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  20729015 att 20729017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 49742887 - 49743289
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49742887 ctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaacgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 49742986  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  49742987 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacag 49743086  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49743087 acgattatccattcctaaactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 49743186  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  49743187 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 49743286  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  49743287 aat 49743289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 52200117 - 52199737
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52200117 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgataattaacaaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctc 52200018  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52200017 aaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaa 52199918  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    || |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52199917 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 52199818  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  52199817 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 52199737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16244099 - 16243697
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16244099 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 16244000  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16243999 cttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgttctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaa 16243900  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16243899 cgattatctattcctagactaaccctatttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 16243800  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||   ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  16243799 ttacggttgatcaggatataaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttca 16243700  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  16243699 att 16243697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 10106568 - 10106969
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10106568 cttttgaatcatctatgtttcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccc 10106667  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaac 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10106668 ttgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatatttgaaggtgtaagcacgttaacctaatatcactaacaaat 10106767  T
Q  201 gattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10106768 gattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgct 10106867  T
Q  301 tatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  10106868 tatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcatagcaacatggttcaa 10106967  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  10106968 tt 10106969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 5 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 54723964 - 54723565
Alignment:
Q  5 cgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttg 103  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54723964 cgaatcatctatgttcccataattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttg 54723865  T
Q  104 agttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaaacga 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54723864 agttagaaccctcttctcaaactacagcccctatttccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcattaacaaacga 54723765  T
Q  203 ttatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgttta 302  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  54723764 ttatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgttta 54723665  T
Q  303 tatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  54723664 tatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 54723565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 29343842 - 29344244
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29343842 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 29343941  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29343942 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataa 29344041  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||| ||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29344042 aagattattcattcctagactaaccatgattattagaataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctaactaaatcatg 29344141  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  29344142 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactggattgtcattcacaataaatagagtttgacagcaacatggttc 29344241  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  29344242 aat 29344244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10881706 - 10881312
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10881706 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagttctaatcaatcc 10881607  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10881606 tttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 10881507  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10881506 cgattatccattcctagattaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtataaagctatggttagtagtcattcattctcactaaatcatgt 10881407  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10881406 ttatatttgatcaggatataaaaaacactaataacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 10881312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3840743 - 3840341
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3840743 ctttcgaatcatccatgttcccctaattgatatactacacctattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaacagtcctaatcaatcc 3840644  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  3840643 cttgagttagtaccctcttctcaaactacaacccctaattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataa 3840544  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3840543 aggattatccattcctagactaaccatgattattagaataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 3840444  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3840443 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 3840344  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  3840343 aat 3840341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 53816054 - 53815660
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53816054 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 53815955  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  53815954 cttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaataaa 53815855  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  53815854 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 53815755  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  53815754 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagttttacagcaacatg 53815660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25584903 - 25584511
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25584903 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 25584804  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25584803 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 25584704  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| |||    
T  25584703 acgattatccattcctggactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta-----------tcactaaatcatg 25584615  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  25584614 tttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttc 25584515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 539053 - 538662
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  539053 ctttcgaatcatatatgtttccctaattggtatactacacctattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 538954  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  538953 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaatgttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 538854  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||| ||||||||  |||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  538853 acgaatatccattgctagactaaacctgtttatttaaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtaattcattctcactaaatcatg 538754  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  538753 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaa 538662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41977227 - 41976839
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41977227 ctttcgaatcatctgtgttctcctaattggtatactgcacttattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 41977128  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||              |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41977127 ct--------------cttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaa 41977042  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41977041 cgattatccattcatagactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagttattcattctcactaaatcatgt 41976942  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41976941 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagagcaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 41976842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 16184655 - 16185058
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16184655 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 16184754  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16184755 cttgagttaggacctttttcttaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataa 16184854  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16184855 aagattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 16184954  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  16184955 tttatatttgatcaggatataaaaaacattaacaacaattgaattgaataaaaattagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttc 16185054  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  16185055 aatt 16185058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43809806 - 43809403
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43809806 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctactcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 43809707  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  43809706 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaccccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataa 43809607  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  43809606 aggattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcattcgttcacactaaatcatg 43809507  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43809506 tttatatttgatcaggatataaaaagcatcaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 43809407  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  43809406 aatt 43809403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 6434746 - 6435140
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6434746 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 6434845  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  6434846 cttgagatagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaataaa 6434945  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6434946 ggattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 6435045  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6435046 ttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 6435140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Original strand, 19304683 - 19305059
Alignment:
Q  26 ttggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaac 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19304683 ttggtacactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccctgagttacgaccctcttctcaaac 19304782  T
Q  126 tactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccct 225  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |    
T  19304783 tacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaacatcattaacaaatgattatccattcctatactaaccat 19304882  T
Q  226 gttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagt 325  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19304883 gttcattagaacaattcatttatgtctaagttgaaagctagggtcaatagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatttaaaaagc 19304982  T
Q  326 attaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  19304983 attaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacatcaacatggatcaatt 19305059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11190753 - 11190350
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11190753 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttcttgttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 11190654  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11190653 cttgagttagaaccctcttctcaacctacaacccctaattccttaggtggtctaataattcttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaa 11190554  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
      |||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  11190553 gtgattatccattcctcgactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 11190454  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  11190453 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgattc 11190354  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  11190353 aatt 11190350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9392960 - 9392558
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9392960 cttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctatacttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 9392861  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9392860 cttgagttaggaccctcttctcaaactctagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaaactaatatcactaacaaa 9392761  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||   ||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9392760 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaaatcaattagatctaagtcgaaagctaggatcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 9392661  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||    
T  9392660 ttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaatatgcttca 9392561  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  9392560 att 9392558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 19301473 - 19301875
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||| ||| ||||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  19301473 ctttcgaatcctctgagttcccgtatttgctacactgcacctattcttatgaatgattttctagttctacgatagttaacaaaatagttctaataaatcc 19301572  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19301573 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaatttcttaggtggtttaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 19301672  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19301673 agattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagttgaaagctagggtctgtagtcattcattctcactaaatcatgt 19301772  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||    
T  19301773 ttatatttgatcaggatttaaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacatcaacatggatca 19301872  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  19301873 att 19301875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 55034824 - 55035230
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattc----ttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatca 95  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55034824 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatca 55034923  T
Q  96 atcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcacta 194  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  55034924 atcccttgagttagaatcctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtttagtaatctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcacta 55035023  T
Q  195 acaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaat 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55035024 acaaacgattatccattcctagactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaat 55035123  T
Q  295 gatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  55035124 catgtttatatttgatca-gatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaacaaatagagtttcacaacaacatg 55035222  T
Q  393 gttcaatt 400  Q
     |||||||    
T  55035223 tttcaatt 55035230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Original strand, 8461455 - 8461858
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8461455 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattctatagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 8461554  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||    
T  8461555 cttgatttagtatcctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaaaaacgttaacctagtatcactaataaa 8461654  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8461655 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 8461754  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8461755 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagcacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 8461854  T
Q  398 attt 401  Q
    ||||    
T  8461855 attt 8461858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 50461516 - 50461919
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  50461516 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 50461615  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  50461616 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacattaacctaatatcactaacaa 50461715  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  50461716 acgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 50461815  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  50461816 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacaacaacatggatc 50461915  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  50461916 aatt 50461919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 17039990 - 17040392
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctct-aattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17039990 ctttcgaatcatcgatgttcccttaattggtatacaacacttattcttatgaatgattctttagtttcatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 17040089  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17040090 cttaagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagatgatctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 17040189  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17040190 caattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 17040289  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||    
T  17040290 ttatatttgatcaggatataaatagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataaagtttcacatcagcatggatca 17040389  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  17040390 att 17040392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35412716 - 35412339
Alignment:
Q  20 ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35412716 ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttc 35412617  T
Q  120 tcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagac 218  Q
    ||| | ||| | | ||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||    
T  35412616 tcagattacagtccctaattccttaggttagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatcc------agac 35412523  T
Q  219 taaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatat 318  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35412522 taaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatat 35412423  T
Q  319 aaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  35412422 aaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatagatcaatt 35412339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 32287291 - 32287694
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32287291 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 32287390  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  32287391 cttgagttagggccctcttctcaaactataatccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtatgttaacctaatatcactaataa 32287490  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32287491 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggttagtagtcattcattctcacgaaatcatg 32287590  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||    |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  32287591 tttatatggtgtcaatatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacatcaacatggttc 32287690  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  32287691 aatt 32287694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 54720197 - 54719795
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54720197 ctttcgaatcatctatgtttccataattggtatattgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 54720098  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     |||  || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54720097 cttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 54719998  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  54719997 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 54719898  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  54719897 ttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttca 54719798  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  54719797 att 54719795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 15195292 - 15195672
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15195292 ctaattggtatactgcacatattcttataaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagataggaccctcttcta 15195391  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
      |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  15195392 ggactacaacctctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaagattatccattcctagactaa 15195491  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    || |||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  15195492 ccatgtttattagcacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttaatcaggatataaa 15195591  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  15195592 aagcaataagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcatagcaacatggttcaatt 15195672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27092120 - 27091726
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27092120 ctttcgaatcatcgatgttctcctaattggtatactgcacctattcttattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 27092021  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||    
T  27092020 cttgagttaggacc-tcttctcaaactacatcccctaatttcttaggcggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaaccttttatcactaataa 27091922  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  27091921 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaagttaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagttattcgttctcactaaatcatg 27091822  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27091821 tttatatttgatcagaatataaaaagcattaacaacaattgaattgaattaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 27091726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47051722 - 47051319
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  47051722 ctttcgaatcatctatgttcccctaactggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcc 47051623  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  47051622 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccataggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcagtaacaa 47051523  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47051522 acggttatcctttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 47051423  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  47051422 tttatatttgaccaggatataaaaaacattaataacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaccatggatc 47051323  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  47051322 aatt 47051319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 22416802 - 22417204
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| || |  || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22416802 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacttattcttgtgaaagagtcactcgttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 22416901  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22416902 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 22417001  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22417002 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcattcgttctcactaaattatgt 22417101  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  22417102 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatgtttca 22417201  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  22417202 att 22417204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 28008039 - 28008440
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctctaa-ttggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | || || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28008039 ctttcgaatcatctatgttccccaaatttgtatactgcacctattcttatgaattattctctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 28008138  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtt-taagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  | ||| ||||||||| ||    
T  28008139 cttgagttatgaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaatgttgtaagtacgt--atctattatcactaataa 28008236  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| |||    
T  28008237 acgattatccattcctagactaaccatatttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggttagtagttatttgttctcactaaatcatg 28008336  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  28008337 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaatttaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggatc 28008436  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  28008437 aatt 28008440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47055152 - 47054749
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  47055152 ctttcgaatcatctatgttcccataactagtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcc 47055053  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  47055052 cttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcccctaattccataggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcagtaacaa 47054953  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47054952 acggttatcctttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 47054853  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  47054852 tttatatttgaccaggatataaaaaacattaataacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 47054753  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  47054752 aatt 47054749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 48064005 - 48064396
Alignment:
Q  3 ttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccct 101  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48064005 ttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccct 48064104  T
Q  102 tgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacg 201  Q
    |||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  48064105 tgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaagg 48064204  T
Q  202 attatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgttt 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  48064205 attatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgttt 48064304  T
Q  302 atatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacat 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  48064305 atatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactatattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacat 48064396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 12561202 - 12561596
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12561202 ctttcgaatcatctatgttcccctaattgatatactgcacctattcttgtgaaagagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 12561301  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12561302 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 12561401  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  12561402 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatat 12561501  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  12561502 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattcaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 12561596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11784992 - 11784589
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  11784992 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagccctaataaatcc 11784893  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11784892 cttgagttaggaccctcttatcggattacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggttttaagcacgttaatctaatatcactaataa 11784793  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  11784792 aggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctaaggtcagtagtcattcgttctcactaaatcata 11784693  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  11784692 tttatatgtgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 11784593  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  11784592 aatt 11784589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 32367098 - 32367499
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||| || |  |||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32367098 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcatctattattgtgaaagaatcactatctt-acgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 32367196  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32367197 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 32367296  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  32367297 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatat 32367396  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  32367397 ttatatttgatcaggatacaaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaaataatagagtttcacagcaacatggttca 32367496  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  32367497 att 32367499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 34983821 - 34984223
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||| ||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34983821 ctttcgaatgatctatgttcccctgattggtataccgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaagagtcataatcaatcc 34983920  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||| ||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  34983921 cttgagttaggaccatcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcactttaacctaatatcactaataaa 34984020  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34984021 tgattatccattcttagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagttagagtcggtagtcattcgttctcactaaatcatgt 34984120  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  34984121 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatgtttca 34984220  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  34984221 att 34984223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17141612 - 17141232
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17141612 ctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattcgctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttcta 17141513  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
        |||  || | |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  17141512 gggttacaaccccaaatttcttaggtggtctaataaccgttaaaggtttaatcacgttaacctaatatcactaataaaggatcatccattcctagactaa 17141413  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    || |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17141412 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 17141313  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||    
T  17141312 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcacaataacatgtttcaatt 17141232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 23298583 - 23298920
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctct-aattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23298583 ctttcgaatcatctaagttcccttaattggtatgctgcacctattcttatgaatgactttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 23298682  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  23298683 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaagaatctttcaaggttttaagaacattaacctaatatcaccaacaa 23298782  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  23298783 acgattatccattcctagactaacgatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcata 23298882  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23298883 tttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaataa 23298920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 25442827 - 25443222
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25442827 ctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatattgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 25442926  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaa-taatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25442927 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaaataaccgtcgaatgtttaagcacgttaagctaatatcactaataa 25443026  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  25443027 aggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 25443126  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||    
T  25443127 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagaaacatg 25443222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 46885166 - 46884776
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  46885166 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttc-acgatagttagcaaaatagtcctaatcaatcc 46885068  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||     ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46885067 cttgagttgggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtgttctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 46884968  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  46884967 ggattatccatttctagaccaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 46884868  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||           |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  46884867 ttat-----------atataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttca 46884779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 30219973 - 30220379
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30219973 ctttcgaatcatctaagttcccctaattggtcaactgcacctattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 30220072  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa----gcacgttaacctaatatcactaa 195  Q
    ||||| ||||||||||||||  | | |    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    |   |||||| ||||||||| ||    
T  30220073 cttgacttaggaccctcttcatagattgtaacccctaattccttaggtggtctaatattctttgaagcttttaagttgatagttaacttaatatcacaaa 30220172  T
Q  196 caaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatg 295  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  30220173 taaacgattatccattcatagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtttaagttgaaagctatggtcagtagtcattcactctcaccaaatc 30220272  T
Q  296 atgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa--atagtttcacagcaacatgg 393  Q
    || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  30220273 atctttatatttgataaggatataaagagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatatagtttcacagcaacatgt 30220372  T
Q  394 ttcaatt 400  Q
    |||||||    
T  30220373 ttcaatt 30220379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35751667 - 35751278
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35751667 ctttcgaatcatcgatgttcccctaatttgtatactgcaccttttcgtattaatgattttctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 35751568  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaag-gtttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35751567 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagattttaagcacgttaacctaatatcattaacaa 35751468  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||   ||||||||||||  ||                  
T  35751467 acgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaactcaattaggtctaagttgaaagctagactcagtagtcatttgtt-------------- 35751382  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||| ||||||| ||    
T  35751381 tttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcgcaggaacatggatc 35751282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 396
Target Start/End: Original strand, 17528731 - 17529123
Alignment:
Q  3 ttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccct 101  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17528731 ttcgaatcatctatgttcccctaattgatatactgcacatattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaataaaatagtcctaatcaatccct 17528830  T
Q  102 tgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacg 201  Q
    |||||||||||||||||||     |||  |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  17528831 tgagttaggaccctcttctagggttacaaccactaattccttaggtggtttaataaccgttgaaggtttaagcacattaacctaatatcactaataaagg 17528930  T
Q  202 attatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgttt 301  Q
    |||||    || |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  17528931 attat----tcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagagtcaatagtcattcgttatcactaaatcatgttt 17529026  T
Q  302 atatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  17529027 atatttgatcaaaatataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgacattcacaataaatagagtttcacagcagcatggttc 17529123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28266005 - 28265712
Alignment:
Q  98 cccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  28266005 cccttgagatagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaata 28265906  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    || |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||| ||    
T  28265905 aaagattatccattcctagactaatcatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagta---attcgttctcactaaatcat 28265809  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28265808 gtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 28265712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31549398 - 31549115
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31549398 cttttgaatcatctaagtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 31549299  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| ||    
T  31549298 cttgacttaggaccctcttctaaaactacagaccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaatgttaacctattatcactaataa 31549199  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattca 282  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31549198 acgattatccatttctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattca 31549115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 291
Target Start/End: Original strand, 18644758 - 18645028
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18644758 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctc 18644857  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    | | ||| | | |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18644858 agattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattgtccattcctagacta 18644957  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcacta 291  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18644958 accatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagctaaggtcagtagtcattcgttctcacta 18645028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 134 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 52988497 - 52988237
Alignment:
Q  134 ctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcatta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  52988497 ctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaagtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttatta 52988398  T
Q  234 gaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaa 333  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52988397 gaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaa 52988298  T
Q  334 taattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  52988297 caattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 52988237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 17531626 - 17531963
Alignment:
Q  3 ttcgaatcatctaagttc-tctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccct 101  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17531626 ttcgaatcatctatgttcctctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccct 17531725  T
Q  102 tgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacg 201  Q
    |||||||||||||||||||     |||  || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17531726 tgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaaacacgttaacctaatatcactaataaa-g 17531824  T
Q  202 attatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgttt 301  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||     ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17531825 attatccattcctagactaaccatgtttatta-----attcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaattatgttt 17531919  T
Q  302 atatttgatcaggatat-aaaaagtattaagaataattgaattga 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  17531920 atatttgatca-gatataaaaaagcattaagaacaattgaattga 17531963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 3292948 - 3293331
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttct 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  3292948 ctaattggtatattgcacctatttcttatgaatgattctatagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaagacccacttct 3293047  T
Q  121 caaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaac-aaacgattatccattcatagac 218  Q
    |  | |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |  ||  |||||||||| ||||| |||||    
T  3293048 ccgattacaacccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacttaatataaaaaaataaacgattattcattcctagac 3293147  T
Q  219 taaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatat 318  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||    
T  3293148 taaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaggctagggttagtagtcattcgttctcacgaaatcatgtttatatttgactaggatat 3293247  T
Q  319 aaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  3293248 aaaaagcattaagaacatttgagttgaataaaaactagattgtcattcacaatagatagagtttcacatcaacatgtttcaatt 3293331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 22993664 - 22994060
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattct-tatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaat 97  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||  || |||||||  ||||| |||||| ||||||  | ||||||||    
T  22993664 ctttcgaatcctctaagttcccctaattggtacactgcacctatttactatgaatacttctctagttttacgatggttaactaaaatatccctaatcaat 22993763  T
Q  98 cccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttta-agcacgttaacctaatatcactaac 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||     
T  22993764 cccttgacttaggaccctcttctcaaattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggtttttagaacgttaacctagtatcacaaat 22993863  T
Q  197 aaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatga 296  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |    
T  22993864 aaacgattatccattcctaaacttaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcactctcacgaattca 22993963  T
Q  297 tgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  22993964 tgtttatatctgataagtatataaaaaacattaagaaaaattgaattgaat-aaaactagattgatattcacaataaatagagttttacagcaacatg 22994060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22783788 - 22783416
Alignment:
Q  41 tattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactact--gccactaat 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||    ||| |||||    
T  22783788 tattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcccctaat 22783689  T
Q  139 tccttaggtggtctaataatcttt-gaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaa 236  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||| |||    
T  22783688 tccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatacctagaataaccatgtttatttgaa 22783589  T
Q  237 -------caattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtatta 329  Q
           ||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  22783588 ttttgaacaattcaattaagtctaagttgaaagttgtggtcagcagtcattcattctcacgaaatcatgtttatatttgataagggtataaaaagcatta 22783489  T
Q  330 agaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  22783488 agaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatccacaataaatagagtttcacatcaacatgtttcaatt 22783416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22788152 - 22787780
Alignment:
Q  41 tattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactact--gccactaat 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||    ||| |||||    
T  22788152 tattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcccctaat 22788053  T
Q  139 tccttaggtggtctaataatcttt-gaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaa 236  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||| |||    
T  22788052 tccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatacctagaataaccatgtttatttgaa 22787953  T
Q  237 -------caattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtatta 329  Q
           ||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  22787952 ttttgaacaattcaattaagtctaagttgaaagttgtggtcagcagtcattcattctcacgaaatcatgtttatatttgataagggtataaaaagcatta 22787853  T
Q  330 agaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  22787852 agaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatccacaataaatagagtttcacatcaacatgtttcaatt 22787780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 55031964 - 55032237
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattc----ttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatca 95  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55031964 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatca 55032063  T
Q  96 atcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaag-gtttaagcacgttaacctaatatcacta 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||     
T  55032064 atcccttgagttagaaccctcttctcaaactacatcccctgattccttaggtggtctagtaatctttgaagcttttatgcacgttaacctaatatcactg 55032163  T
Q  195 acaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 281  Q
    ||||||||||||||||||              || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55032164 acaaacgattatccattc-------------ctttattagaacagttcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 55032237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Original strand, 18641762 - 18641945
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18641762 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctc 18641861  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgatt 204  Q
    | | ||| | | |||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18641862 agattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgatt 18641945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 67 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18542711 - 18542426
Alignment:
Q  67 cacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaa 165  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||| | | |||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  18542711 cacgatggttaactaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaagaccttcttctcagattacagtccctaatttcttaggtgatctaatattctttgaa 18542612  T
Q  166 ggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagct 264  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |    
T  18542611 ggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagtt 18542512  T
Q  265 atggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaa 351  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  18542511 atggtcattagtcattcattctcacaaattcatg-ttatatgtgatcagtatataaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaa 18542426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54461213 - 54461012
Alignment:
Q  28 ggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaacta 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  54461213 ggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataattcatcccttgagttaggaccctcttctcatatta 54461114  T
Q  128 ctgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctg 226  Q
    | | | |||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||| ||    
T  54461113 cagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactagtaaaggattatacattcctagactaaccatg 54461014  T
Q  227 tt 228  Q
    ||    
T  54461013 tt 54461012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Original strand, 52309759 - 52309928
Alignment:
Q  234 gaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatat-aaaaagtattaaga 332  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  52309759 gaacaattcaattaggtctaagtagaaaactattgtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggaaataaaaaagcattaaga 52309858  T
Q  333 ataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  52309859 acaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 52309928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17546062 - 17545812
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17546062 ctaattggtatactgcacctatttcttatgaatgattctctagtttcacgatggttaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttatgaccctcttc 17545963  T
Q  120 tcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagac 218  Q
    ||| | |||   | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||| |||||    
T  17545962 tcagattacaatccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctagtatcataaataaacgattatccattcctagac 17545863  T
Q  219 taaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggt 269  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  17545862 taaccctgtttatttgaataattcaattaggtctaagttgaaaactatggt 17545812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 238 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31857804 - 31857650
Alignment:
Q  238 aattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataat 337  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  31857804 aattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatctttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaat 31857705  T
Q  338 tgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaaca 390  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31857704 tgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaaca 31857650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28266143 - 28266006
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28266143 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 28266044  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaa 137  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28266043 cttgagatagaaccctcttctcaaactacagcccctaa 28266006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 52309583 - 52309728
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52309583 ctttcgaatcaactatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 52309682  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttag 145  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  52309683 cttgagctaggaccatcttctcaaactacaacccctaattccttag 52309728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 271 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17544570 - 17544440
Alignment:
Q  271 agtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaa 370  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17544570 agtagtcattcattctcacgaattcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagatcaattgaattgaat-aaaactagattgtcattcacaa 17544472  T
Q  371 taaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  17544471 taaatagagtttcacaacaacatgtttcaatt 17544440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 281
Target Start/End: Original strand, 282184 - 282441
Alignment:
Q  26 ttggtatactgcacctat-tcttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaa 123  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||  ||||| |||||  ||||||||  |||||||||  |||| |||| ||||||||||||     
T  282184 ttggtaaactgcacctatgtcttatgaatattcctctagttttacgatggttaattaaaatagttctaatcaatca-ttgacttagaaccctcttctcag 282282  T
Q  124 actactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaac 222  Q
    | |||    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  282283 attacaattactaattccttaggtgatctaatattcttcgaaggttttaagaacgttgacataatatcaccaataaacaattatccattcctagactaac 282382  T
Q  223 cctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 281  Q
    | |||| ||| |||||||||||||  ||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  282383 catgtttattcgaacaattcaattaggtctaagtcaaaagttagggtcagtagtcattc 282441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11636762 - 11636658
Alignment:
Q  296 atgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa-atagtttcacagcaacatggt 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11636762 atgtttatatttaatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaat-aaaactagattgatattcacaataatagagtttcacagcaacatggt 11636664  T
Q  395 tcaatt 400  Q
    ||||||    
T  11636663 tcaatt 11636658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 290 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6922682 - 6922570
Alignment:
Q  290 taaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagca 387  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||    
T  6922682 taaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagcacaatcgaattgaataaaaactaaattgtcattcataataaatagagtttcacatca 6922583  T
Q  388 acatggttcaatt 400  Q
    |||| | ||||||    
T  6922582 acatagatcaatt 6922570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 52990926 - 52990813
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  52990926 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgagtctctagttttacgataattaacaaaatagtcgtaatcaatcc 52990827  T
Q  100 cttgagttaggacc 113  Q
     |||||||||||||    
T  52990826 attgagttaggacc 52990813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 37408907 - 37408828
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaac 79  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37408907 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaac 37408828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 6922746 - 6922682
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagt 64  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6922746 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagt 6922682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10902166 - 10902094
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgat 72  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10902166 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcaccgattcttatgaatgattttctagttccacgat 10902094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25486335 - 25486290
Alignment:
Q  29 gtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatag 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25486335 gtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatag 25486290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31857854 - 31857804
Alignment:
Q  136 aattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31857854 aattccttaggtggtctaataatttttgaaggattaagcacgttaacctaa 31857804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 281
Target Start/End: Original strand, 27308722 - 27308834
Alignment:
Q  168 tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatg 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||  |||||||| | |||||| |    
T  27308722 tttaagaacgttaacctaatatcacaaataagcgattatctattcctagact-accatgtttatttgaacaactcaattaggtctaagtcgtaagctagg 27308820  T
Q  268 gtcagtagtcattc 281  Q
    |||||| |||||||    
T  27308821 gtcagtggtcattc 27308834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 38386941 - 38386862
Alignment:
Q  271 agtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaa 351  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  38386941 agtagtcattcattctcacgaattcatgtttatacatgatcagtatataaaaagcattaa-aacaattgaattgaataaaa 38386862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22360375 - 22360278
Alignment:
Q  296 atgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  22360375 atgtttatatatgatcagtatataaaaaacattaagaacaattgaattgaatataaa-tagattgatattcacaagaaattgagtttcacatcaacatg 22360278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 370
Target Start/End: Original strand, 27308159 - 27308359
Alignment:
Q  168 tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatg 267  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| | || ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||| |||   || |||      
T  27308159 tttaagaacgttaacctaataacacaaataaacgattatctattccttgattaaccttgtttatttgaacaattcaattaggtcttagtcataaactaga 27308258  T
Q  268 gtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattca 367  Q
    ||||||||||||||  ||| || || | | | ||||||    |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  27308259 gtcagtagtcattcgatcttaccaattcaag-ttatatagtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaat-aaaactagattgatattca 27308356  T
Q  368 caa 370  Q
    |||    
T  27308357 caa 27308359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 280
Target Start/End: Original strand, 27298599 - 27298711
Alignment:
Q  168 tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatg 267  Q
    |||||| |||||||| |||||||||    | | ||||||| ||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |    
T  27298599 tttaagaacgttaacataatatcacaggtatatgattatctattcataaactaaccgtatttatttgaacaattcaattatgtctaagttgtaagctagg 27298698  T
Q  268 gtcagtagtcatt 280  Q
    ||||||| |||||    
T  27298699 gtcagtaatcatt 27298711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 400
Target Start/End: Original strand, 18645025 - 18645075
Alignment:
Q  352 actagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18645025 actagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacttggttcaatt 18645075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 31857910 - 31857847
Alignment:
Q  42 attcttatgaatgattttct---agttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccctt 102  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  31857910 attcttatcaatgattttcttctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaattcctt 31857847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 42368715 - 42369095
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42368715 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 42368814  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42368815 aaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaa 42368914  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42368915 ccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 42369014  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  42369015 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttcaatt 42369095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 11347877 - 11348280
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347877 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 11347976  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11347977 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 11348076  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11348077 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 11348176  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11348177 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataaagtttcacagcaacatggttc 11348276  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  11348277 aatt 11348280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40781595 - 40781193
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40781595 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 40781496  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  40781495 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttgacctaatattactaacaaa 40781396  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40781395 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctgtggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 40781296  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  40781295 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcagagcaacatggttca 40781196  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  40781195 att 40781193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8888759 - 8888356
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8888759 ctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcc 8888660  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8888659 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaa 8888560  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8888559 cgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 8888460  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagta-ttaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8888459 ttatatttgatcaggatataaaaagcatttaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 8888360  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  8888359 aatt 8888356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 25959670 - 25960073
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25959670 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 25959769  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25959770 cttgagttaggaccctcttctcagactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 25959869  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25959870 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 25959969  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25959970 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 25960069  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  25960070 aatt 25960073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 37279658 - 37280061
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37279658 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 37279757  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37279758 cttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattccttacgtggtctaataatctttgaaggttttaagaatgttaacctaatatcactaacaa 37279857  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  37279858 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcata 37279957  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  37279958 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacggcaacatggttc 37280057  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  37280058 aatt 37280061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24235219 - 24234816
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24235219 ctttcgaattatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatttcctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 24235120  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24235119 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 24235020  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24235019 acgattatccattcctagactaaccctgtttattataacaattcaattctgtctaagtagaaagatatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 24234920  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24234919 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 24234820  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  24234819 aatt 24234816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 43207872 - 43208273
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43207872 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 43207971  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtt-taagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43207972 cttgagt-aggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaatagtctttgaaggttgtaagaacgttaacctaatatcactaacaa 43208070  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43208071 acgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 43208170  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43208171 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 43208270  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  43208271 aat 43208273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 9185406 - 9185808
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9185406 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 9185505  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9185506 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagtctctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataa 9185605  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||| ||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9185606 aggattattcattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 9185705  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9185706 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 9185805  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  9185806 aat 9185808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24238491 - 24238088
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  24238491 ctttcgaattatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatttcctagttccacgatagttaacaaaatatacctaatcaatcc 24238392  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24238391 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagattttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 24238292  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  24238291 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagatatggtcagtagccattcattctcactaaatcatg 24238192  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24238191 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 24238092  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  24238091 aatt 24238088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6826894 - 6826493
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6826894 ctttcgaatcatctatgctcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgat-gttaacaaaatagtcctaatcaaacc 6826796  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6826795 cttgacttaggattctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatttttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 6826696  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6826695 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctttctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattttcactaaatcatgt 6826596  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6826595 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 6826496  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  6826495 att 6826493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 22 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5105828 - 5105448
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5105828 ctaattggtatactgcacctattcatatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 5105729  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||    
T  5105728 aaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctatacta 5105629  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5105628 accatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaattatgtttatatttgatcaggatataa 5105529  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaat 399  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  5105528 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttcaat 5105448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 31585922 - 31586324
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31585922 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 31586021  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  31586022 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataa 31586121  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  31586122 aggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggttagtagtcattcattctcactaaatcatg 31586221  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  31586222 attatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaatcaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttc 31586321  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  31586322 aat 31586324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43723823 - 43723422
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43723823 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 43723724  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
     || | ||||||||||| ||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43723723 tttaacttaggaccctcgtctcaaactatagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgctaacctaatatcactaacaaa 43723624  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43723623 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacagttcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 43723524  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  43723523 ttatatttgatca-gatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgttattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttca 43723425  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  43723424 att 43723422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25870907 - 25870505
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25870907 ctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatgctacacctattcttgtgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagttttaatcaatcc 25870808  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25870807 cttgagttaggaccgtcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 25870708  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25870707 caattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaagtctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 25870608  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25870607 ttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtaattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 25870508  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  25870507 att 25870505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 9188634 - 9189036
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9188634 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagtcaacaaaatagtcctaatcaatcc 9188733  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9188734 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattacttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataa 9188833  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9188834 aggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaatctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 9188933  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  9188934 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaatagagtttcacaacatcatggttc 9189033  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  9189034 aat 9189036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 25820828 - 25821230
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25820828 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 25820927  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25820928 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctagtatcactaacaaa 25821027  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25821028 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagttgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 25821127  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  25821128 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcacaacaacatgtttca 25821227  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  25821228 att 25821230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 30274750 - 30275121
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30274750 ctttcgaatcatctatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 30274849  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  30274850 cttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactgataa 30274949  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30274950 aggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 30275049  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaa 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30275050 tttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaa 30275121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 13971876 - 13972278
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971876 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 13971975  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971976 cttaacttaggacactcttctcaaaataaaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 13972075  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13972076 cgattatccattcctagactaaccatgttttttagaaaaatccaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 13972175  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13972176 ttatatttgatcatgatataaaaaacattaagaacagttgaattgaataataactatattgtcaatcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 13972275  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  13972276 att 13972278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 36808446 - 36808826
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  36808446 ctaattggtacactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctt 36808545  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
    ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  36808546 aaactacagaccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaagtttaagcacgttaacctaatattactaataaacgattatacattcctagactaa 36808645  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36808646 ccctgtttattagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattcttactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 36808745  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  36808746 aaacattaagaacaattgaattgaataaaaattagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 36808826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 25138935 - 25139316
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25138935 ctaattggtatactgcacctattcttatgaacgattttcaagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 25139034  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  25139035 aaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagacta 25139134  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    ||| || | || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25139135 accatgattatgagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttacatttgatcaggatataa 25139234  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  25139235 aaagcattaggaacaattaaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttcaatt 25139316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25874304 - 25873896
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25874304 ctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagttttaatcaatcc 25874205  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaa------ttccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcact 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25874204 cttgagttaggaccgtcttctcaaactacatcccctaaccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcact 25874105  T
Q  194 aacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaa 293  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25874104 aacaaacaattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaagtctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcattcattctcactaaa 25874005  T
Q  294 tgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacat 391  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  25874004 tcatatttatatttgatcagaatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtaattcacaataaatagagtttcacaccaacat 25873905  T
Q  392 ggttcaatt 400  Q
    |||||||||    
T  25873904 ggttcaatt 25873896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 31427523 - 31427926
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31427523 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 31427622  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31427623 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 31427722  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  31427723 acgattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 31427822  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  31427823 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 31427922  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  31427923 aatt 31427926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26366035 - 26365654
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26366035 ctaattggtatagtgtacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 26365936  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  26365935 aaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctaaacta 26365836  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26365835 accatgtttattagaaaaattcaattaggtataagtcgaaagttagggtcagtagtaattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataa 26365736  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  26365735 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggtttaatt 26365654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5666619 - 5666264
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5666619 ctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccaagatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttcta 5666520  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
        ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  5666519 gggttacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaa 5666420  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    || |||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5666419 ccatgtttattagaactattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcgttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 5666320  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 377  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5666319 aaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 5666264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22021191 - 22020789
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22021191 ctttcgaatcatctatgttaccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 22021092  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22021091 cttgagttagaaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagtacgttaacctaatatcactaataa 22020992  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22020991 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaatcatg 22020892  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa-atagtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||    |||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22020891 tttatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgagttgaataaaaactagattgtcattcacaataatagagtttcacagcaacatggttca 22020792  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  22020791 att 22020789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45453997 - 45453595
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  45453997 ctttcgaatcatataagtttctctaattggtataatgcacctattcgtattaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagcactaatcaatcc 45453898  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45453897 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaa 45453798  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  45453797 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 45453698  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  45453697 -ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 45453599  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  45453598 aatt 45453595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Original strand, 45493139 - 45493532
Alignment:
Q  2 tttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45493139 tttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccc 45493238  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaac 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||     
T  45493239 ttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaataaag 45493338  T
Q  201 gattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtt 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45493339 gattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagttagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtt 45493438  T
Q  301 tatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  45493439 tatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaactgaataaaaactaaattatcattcacaataaatagagttttacagcaacatg 45493532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Original strand, 45500881 - 45501274
Alignment:
Q  2 tttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45500881 tttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccc 45500980  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaac 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||     
T  45500981 ttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaataaag 45501080  T
Q  201 gattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtt 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45501081 gattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagttagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtt 45501180  T
Q  301 tatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  45501181 tatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaactgaataaaaactaaattatcattcacaataaatagagttttacagcaacatg 45501274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16179250 - 16178848
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16179250 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcatatattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcc 16179151  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||   | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16179150 cttgagttaggaccctcttctaggattacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataat 16179051  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  16179050 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatat 16178951  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16178950 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 16178851  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  16178850 att 16178848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27266912 - 27266509
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  27266912 ctttcaaatcatctatgttcccctaattggtataatgcagctattcttatgaatgactttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaataaattc 27266813  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  27266812 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagtacgttaacctattatcactaataa 27266713  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  27266712 acgattatccattcttagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaatctatggtcggtagtcattcgttctcactaaatcatg 27266613  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  27266612 tttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaatttaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacatcaacatggatc 27266513  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  27266512 aatt 27266509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33310790 - 33310387
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33310790 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcaactattcatattaataattttctagttccacggtagttaacaaaatagccctaatcaatcc 33310691  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  33310690 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcaagttaacctaatatcactaacaa 33310591  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  33310590 acgattatccattcctagactaactatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtccaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 33310491  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  33310490 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 33310391  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  33310390 aatt 33310387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38015642 - 38015239
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38015642 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattgatatactgaacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 38015543  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38015542 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcaccttaacctaatatcactaacaa 38015443  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  38015442 atgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtcaaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 38015343  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  38015342 tttatatttgatcatgatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 38015243  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  38015242 aatt 38015239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 37937201 - 37937595
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37937201 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 37937300  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37937301 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccccaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 37937400  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37937401 ggattatccattcctaaactaaccatgtttattagaataattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 37937500  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37937501 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattcaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 37937595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 12219919 - 12219516
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12219919 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgtttttctagttccacgatagttagcaaaatagtcataatcaatcc 12219820  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||   |   |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12219819 cttgagttaggaccctcttctagggttatatctcttaattccttatgtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 12219720  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtag-tcattcattctcactaaatgatg 298  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  12219719 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagctagggtcagtagttcattcgttctcactaaatgata 12219620  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  12219619 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttc 12219520  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  12219519 aatt 12219516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45457285 - 45456882
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45457285 ctttcgaatcatctaagttcccctaattgttatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 45457186  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  45457185 cttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataataatagaaggtttaaagaacgttaacctaatatcactaaaaa 45457086  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  45457085 aagattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaaactagggtcagtagtcattcgttctaactaaatcatg 45456986  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  45456985 tttatatttaatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattggataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacaacaacatggatc 45456886  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  45456885 aatt 45456882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22630964 - 22630562
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctct-aattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22630964 ctttcgaatcatttatgttcccttaattggtatactgcacctattcttatgaatgattccctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 22630865  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||| | ||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  22630864 cttgagttaggaccattttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcaataataaa 22630765  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
      ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22630764 atattatccattcttagactaacaatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggttagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 22630665  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  22630664 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacagttgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttca 22630565  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  22630564 att 22630562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 1386404 - 1386798
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1386404 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacttattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 1386503  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1386504 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 1386603  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |    
T  1386604 ggattatccatttctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcgttcgttctcactaaatcatat 1386703  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  1386704 ttatatttgatcatgatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 1386798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 16790739 - 16791135
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || |||| || |  |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16790739 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaagagtcactagtcttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 16790838  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgt--taacctaatatcactaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16790839 cttgagttaggaccctcttctagggctacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtgttaacctaatatcactaaca 16790938  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  16790939 aatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagccgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcattaaatcat 16791038  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||    
T  16791039 atttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacaacaacatg 16791135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 392
Target Start/End: Original strand, 40259123 - 40259515
Alignment:
Q  3 ttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccct 101  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40259123 ttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatccct 40259222  T
Q  102 tgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacg 201  Q
    |||||||||||| |||| |     ||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  40259223 tgagttaggaccttcttatagggttacagcgcctaattccttaggtggtataataatcgttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaatg 40259322  T
Q  202 attatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgttt 301  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  40259323 attatccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaaactatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgttt 40259422  T
Q  302 atatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||    
T  40259423 atatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacaacaacatg 40259515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 9966351 - 9966684
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9966351 cttttgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaattattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaaacc 9966450  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||| || ||    
T  9966451 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaacgttaacttaacatcacaaataa 9966550  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9966551 atgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagtaggaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 9966650  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaaga 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9966651 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaaga 9966684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17877207 - 17876827
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||      
T  17877207 ctaattgatatattgcacctattcttattaatgattctctagttccatgatagttaacaaaatagccaaaatcaatcccttgagttaggactttcttcga 17877108  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
      | |||  ||  ||||| |||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  17877107 ggattacaacccttaattacttaggggctctaacaatctttgaacgtataagcacgttatcctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaa 17877008  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    || |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17877007 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtaattcgttctcactaaatcatgtttatatttgaccaggatataaa 17876908  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17876907 aagaattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 17876827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3875410 - 3875035
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattctt-atgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatc 98  Q
    ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3875410 ctttcgaatcacctatgttcccctaattggtatactgcacatattctttattaataattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatc 3875311  T
Q  99 ccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||| |||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  3875310 ccttgagttaggacactcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccattgaaggtttaatcacgttaacctaatatcactaataa 3875211  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||| |||    
T  3875210 aggattatccattcctatactaaccatgtttattagaaaaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcggtagtaattcgttctcactaaatcatg 3875111  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3875110 tttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaa 3875035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29440618 - 29440375
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29440618 ctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 29440519  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||    
T  29440518 cttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaagctagtatcactaataaa 29440419  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattca 243  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29440418 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 29440375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30926664 - 30926268
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctctaattggtatactgcacctattct-tatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||| |||   ||| ||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  30926664 ctttcgaatcctctggtttccctaattgatatactgcacctattttctacgaatgattttctagtttcacgatggttagcaaaatagtcctaatcaatcc 30926565  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattcctta----ggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcacta 194  Q
     |||| ||||||||||||||||| |  ||  || |||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| |    
T  30926564 attgacttaggaccctcttctcagatgacaacccctaattccttaattaggtggtctaatactctttgaaggttttatgaacgttaacttaatatcacaa 30926465  T
Q  195 acaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaat 294  Q
    | |||||||||||||           ||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  30926464 ataaacgattatcca-----------accatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggttagcagtcattcattctcacaaaat 30926376  T
Q  295 gatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  30926375 catgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgacattcacaatagatagagtttcacaacaacatg 30926276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 187 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10600876 - 10600667
Alignment:
Q  187 tatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattct 286  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10600876 tatcactaacaaacgattatcca------gactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattct 10600783  T
Q  287 cactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcaca 384  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10600782 cactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaatctagattgtcattcacaataaatagagtttcaca 10600683  T
Q  385 gcaaca-tggttcaat 399  Q
    |||||| |||||||||    
T  10600682 gcaacattggttcaat 10600667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 17874591 - 17874877
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||     
T  17874591 ctaattggtacactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatgattaacaaaatagtcttagtcaatcccttaagttaggaccctcttcta 17874690  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatct-ttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
        |||  || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  17874691 gggttacaacccctaattccttaggtggtctaata-tctgttgaaggtt-----acgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagacta 17874784  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcag 313  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17874785 accatgtgtattagaacaattcaattaagtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcag 17874877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 230 - 400
Target Start/End: Original strand, 17876223 - 17876395
Alignment:
Q  230 attagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtatta 329  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17876223 attagaacaattcaattaagtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcatta 17876322  T
Q  330 agaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17876323 agaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacgataaatagagtttcacagcaacatgtttcaatt 17876395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10601016 - 10600876
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10601016 ctaattgatatactgcacctatttttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctc 10600917  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatcttt 162  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10600916 aaactacagcccttaattccttaggtggtctagtaatcttt 10600876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29440377 - 29440252
Alignment:
Q  269 tcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcac 368  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29440377 tcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattaaattgaataaaaactaaattgtcattcac 29440278  T
Q  369 aataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    |||||||  |||||||||||||||||    
T  29440277 aataaatagagtttcacagcaacatg 29440252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 398
Target Start/End: Original strand, 35521423 - 35521746
Alignment:
Q  80 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgt 178  Q
    ||||||||  |||||||  | |||| ||||||||||||||||| | |||   | |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||     
T  35521423 aaaatagttctaatcaactcattgacttaggaccctcttctcagattacaatccctaatttcttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagagcgc 35521522  T
Q  179 taacctaatatcactaacaaacgattatccat----tcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta 274  Q
    |||||| ||||||| || |||| |||||||||    || |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||| | ||||||    
T  35521523 taaccttatatcacaaataaacaattatccatatattcctagactaaccatgtttatttgaacaaatcaattaggtctaagttgaaagctaggatcagta 35521622  T
Q  275 gtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 374  Q
    ||| ||||||||||| || | ||| |||||| | ||||| ||||||||   |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |  ||||  |||    
T  35521623 gtctttcattctcacgaattcatg-ttatatattatcagtatataaaatacattaagaacaattgaattgagt-aaaactagattgatacccacatgaaa 35521720  T
Q  375 t--agtttcacagcaacatggttcaa 398  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||    
T  35521721 tagagtttcacaacaacatggttcaa 35521746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34682824 - 34682622
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaat 97  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||| |||| | ||||| |  || ||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||||    
T  34682824 ctttcgaatcctctgagtttccctaattggtacactgcacgtatttcctatgagtatttctctagtttcacgatggttaaccaaaatagccctaatcaat 34682725  T
Q  98 cccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| | ||| | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||||| |||||||||| ||||||| || |    
T  34682724 cccttgacttaggactctcttctcagattacagtccctaattcctaaggtgatctaatattctttg-ggttttaagaacgttaacctgatatcacaaata 34682626  T
Q  198 aacg 201  Q
    ||||    
T  34682625 aacg 34682622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11188011 - 11187925
Alignment:
Q  197 aaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcat 283  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| | |  ||||||||||||  || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  11188011 aaacggttatccattcctagactaaccatgtttaattaaacaattcaattaggtataagttgaaagttaatgtcagtagtcattcat 11187925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 23224891 - 23225294
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23224891 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 23224990  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23224991 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 23225090  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23225091 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 23225190  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23225191 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 23225290  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  23225291 aatt 23225294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17730942 - 17730541
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17730942 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 17730843  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17730842 cttaacttaggaccctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcattaacaaa 17730743  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17730742 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattttcactaaatcatgt 17730643  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa--atagtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17730642 ttatatttgatcaggatataaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataagtagagtttcacagcaacatggttca 17730543  T
Q  398 at 399  Q
    ||    
T  17730542 at 17730541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8277114 - 8276712
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8277114 ctttcgaagcatctatgttcccctaattggtataatgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 8277015  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8277014 cttgagttaggaccctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 8276915  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8276914 acgattatcaattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 8276815  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8276814 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 8276715  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  8276714 aat 8276712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4546997 - 4546595
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4546997 ctttcgaatcatctatgtttccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcc 4546898  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4546897 cttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 4546798  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4546797 caattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagcaatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 4546698  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4546697 ttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaatgaaaactagattgtaattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 4546598  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  4546597 att 4546595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26557627 - 26557226
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26557627 ctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 26557528  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26557527 cttgacatagaaccctcttctcaaactacagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 26557428  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26557427 cgattatccattcctaaactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 26557328  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26557327 ttatatttgattaggatat-aaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacattaaatagagtttcacagcaacatggttca 26557229  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  26557228 att 26557226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 4595995 - 4596397
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4595995 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatacttcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaaaaaaatagtcataatcaatcc 4596094  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4596095 cttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagttggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 4596194  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4596195 caattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaaactatggtcaatagtcattcattctcactaaatcatgt 4596294  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  4596295 ttatatttgattaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcagagcaacatggttca 4596394  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  4596395 att 4596397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20594391 - 20594014
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20594391 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacgtattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 20594292  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20594291 cttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaa 20594192  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20594191 cgattatccattcttacactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatat 20594092  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20594091 ttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataagaactagaatgtcattcacaataaatag 20594014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 45287055 - 45287449
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45287055 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 45287154  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  45287155 cttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaataaa 45287254  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  45287255 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 45287354  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45287355 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaataaagtttcacagcaacatg 45287449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 48645602 - 48645200
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  48645602 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcc 48645503  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  48645502 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctaatatcagtaacaaa 48645403  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  48645402 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtcagtagtcattcgttatcactaaatcatgt 48645303  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  48645302 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgatttgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatca 48645203  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  48645202 att 48645200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 9132746 - 9133148
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9132746 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 9132845  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9132846 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 9132945  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9132946 tgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattccattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 9133045  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9133046 ttatatttgatcaggatatagaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 9133145  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  9133146 att 9133148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6603587 - 6603184
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6603587 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 6603488  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6603487 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaa 6603388  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  6603387 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcaatagtcattcgttctcactaaatcatg 6603288  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  6603287 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 6603188  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  6603187 aatt 6603184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13842745 - 13842366
Alignment:
Q  23 taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13842745 taattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgaattaggaccctctcctca 13842646  T
Q  123 aactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaac 222  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13842645 aactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatctattcctagactaac 13842546  T
Q  223 cctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaa 322  Q
    | |||| |||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13842545 catgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgagagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 13842446  T
Q  323 agtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  13842445 agcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatcaatt 13842366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 13449784 - 13450164
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13449784 ctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 13449883  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13449884 aaactaaagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagacta 13449983  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13449984 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagct-gggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataa 13450082  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13450083 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacaacaacatggatcaatt 13450164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 26136114 - 26136516
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26136114 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 26136213  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||||     ||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26136214 cttcagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 26136313  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26136314 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 26136413  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  26136414 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatgtttca 26136513  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  26136514 att 26136516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 2441264 - 2441641
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2441264 ctttcgaatcatcgatgttctcctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattctacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 2441363  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2441364 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagtccctaattccttaggtggtttaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 2441463  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  2441464 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtcagtagtctttcgttctcactaaatcatg 2441563  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaata 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  2441564 tttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattgataataaata 2441641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 9864712 - 9865115
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagt-tctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9864712 ctttcaaatcatctatgtatccctaattggtatactacacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 9864811  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9864812 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccataattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacttaatatcactaacaa 9864911  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  9864912 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 9865011  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  9865012 tttatatttgatcaggatataaaaagcaataagaacaattgaattgaataaaaactacattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 9865111  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  9865112 aatt 9865115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 14683430 - 14683832
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14683430 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 14683529  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14683530 cttgagttaggaccctcttctaggattacagcccctaattccataggtggtctaatagttattgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 14683629  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14683630 tgattatgcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagttatggtcactagtcattcgttctcactaaatcatgt 14683729  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  14683730 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacagtaaataaagtttcacagaaacatggttca 14683829  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  14683830 att 14683832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 26144494 - 26144896
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26144494 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 26144593  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||||     ||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26144594 cttcagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctagtaacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 26144693  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26144694 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 26144793  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  26144794 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatgtttca 26144893  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  26144894 att 26144896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16165877 - 16165474
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16165877 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctatttgtattaatgattctctaattcaacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 16165778  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16165777 cttgagttaggaccctcttctcagattacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 16165678  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16165677 acgattacccattcctagattaaccatgtttattagaataattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 16165578  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  16165577 tttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 16165478  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  16165477 aatt 16165474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 3067963 - 3068365
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3067963 ctttcgaatcatctatgttcccctaattgttatactgcacctattcttgtgaatgactcactagttctatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 3068062  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  3068063 cttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggtttaagcacattaacctaatatcactaataaa 3068162  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  3068163 agattatccattcctagactaaccatgtatattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatga 3068262  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  3068263 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgttattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttca 3068362  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  3068363 att 3068365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10469272 - 10468870
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10469272 ctttcgaatcatctatgttcccctaattagtacactgcacctattcttgtgaattcttttctagttccatgatagttaaaaaaatagtcctaatcaatcc 10469173  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10469172 cttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 10469073  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  10469072 ggattatctattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcacgaaatcatgt 10468973  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  10468972 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaaaaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttca 10468873  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  10468872 att 10468870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 37415409 - 37415787
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  37415409 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatct 37415508  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattcc--ttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  37415509 cttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaata 37415608  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  37415609 aaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagttagggttagtagtcattcgttctcactaaatcat 37415708  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaata 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37415709 gtttatatttgatcaggatataaaaaacattaaaaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaata 37415787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 37166133 - 37166535
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37166133 ctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaagtagtcctaatcaatcc 37166232  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||| |||||||     |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37166233 cttgagttaggactctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaatgtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 37166332  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |    
T  37166333 tgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcgttcgttctcactaaatcatat 37166432  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  37166433 ttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcgttcacaataaatagagtttcacagcaacatggctca 37166532  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  37166533 att 37166535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 20080704 - 20081106
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20080704 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttctgaatgagtcactagttcaacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 20080803  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||| |||||     ||  | | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20080804 cttgagttaggacccccttctagggttatagaccctaatttcttaggtggtctaataatcgctgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 20080903  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  20080904 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaactcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagccattcgttctcactaaatcatgt 20081003  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||    
T  20081004 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaattagattatcattcacaataaatagagtttcacagcaacttgtttca 20081103  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  20081104 att 20081106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 158 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4695494 - 4695250
Alignment:
Q  158 tctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagta 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4695494 tctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaaatgtgtctaagta 4695395  T
Q  258 gaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactaga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4695394 gaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaataacaattgaattgaataaaaactaga 4695295  T
Q  358 ttgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4695294 ttgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 4695250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7227632 - 7227253
Alignment:
Q  25 attggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  7227632 attggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaataaccataatcaatcccttgacttaggaccctattctcca 7227533  T
Q  124 actactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaac 222  Q
    | ||| ||| |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| | | |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||  ||| ||| |    
T  7227532 attacagcctctaattccttatatgatctaatattctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatctcaaataaacgattatccattgctaggctagc 7227433  T
Q  223 cctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaa 322  Q
    | |||| ||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7227432 catgtttatttgaacaactcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaataatgtttatatttgatcaggatataaaa 7227333  T
Q  323 agtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  7227332 agcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttcatagcaacatgtttcaatt 7227253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 5242136 - 5242532
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctct-aattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||  ||||| |||||    
T  5242136 ctttcgaatcttctgagttcccttaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcactatggttaacaaaatatccataaccaatc 5242235  T
Q  99 ccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt--aagcacgttaacctaatatcactaac 196  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||| ||     
T  5242236 ccttgacttaggaccctattctcagactacagcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaagattttaaagaacgttaacttaatatcacaaat 5242335  T
Q  197 aaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatga 296  Q
    ||| || ||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| |    
T  5242336 aaatgagtatccattcttggactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagcagtcattcattatcacgaaatca 5242435  T
Q  297 tgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacat 391  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  5242436 tgtttatattctatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaatagatagagtttcacaacaacat 5242532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 121 - 400
Target Start/End: Original strand, 11398132 - 11398414
Alignment:
Q  121 caaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagact 219  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11398132 caaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccactcttagact 11398231  T
Q  220 aaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatata 319  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11398232 aaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatata 11398331  T
Q  320 aaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||  ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  11398332 aaaaacattcagaacaattgaactgaacaaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatcaatt 11398414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 400
Target Start/End: Original strand, 13809525 - 13809901
Alignment:
Q  23 taattggtatactgcacctattc-ttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13809525 taattggtatactgcacctatttattacgaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaatagccctgatcaatcccttgacttaggaccctcttctc 13809624  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    | | |||  || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  13809625 atattacaacctctaattccttatgtggcctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagacta 13809724  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    ||| |||| ||| |||     |||||  |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  13809725 accatgtttatttgaa-----caattaggtctgagttgaaagctatggccaatagtcattcattctcatgaaatcatgtttatatttgatcataatataa 13809819  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  13809820 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaatagatagagtttcacatcaacatgtttcaatt 13809901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10345248 - 10344940
Alignment:
Q  94 caatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcact 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |     |||  || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10345248 caatcccttgagttaggaccctcttatagggttacaacccctaattccttagatggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacttaatatcact 10345149  T
Q  194 aacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaa 293  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  10345148 aataaaggattatccattcttagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcagtcgttctcactaaa 10345049  T
Q  294 tgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa--atagtttcacagcaacat 391  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  10345048 tcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaatggaataaaaactagattatcattcacaataagtagagtttcaaagcaacat 10344949  T
Q  392 ggttcaatt 400  Q
    | |||||||    
T  10344948 gtttcaatt 10344940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 261
Target Start/End: Original strand, 9271456 - 9271705
Alignment:
Q  6 gaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttga 104  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  9271456 gaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaagaaaatactcctaatcaatcccttga 9271555  T
Q  105 gttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgatt 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9271556 gttaggtccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaaccaaatatcactaacaaacgatt 9271655  T
Q  205 atccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaa 261  Q
    |||||||| |||        |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9271656 atccattcctag-------ttgtttattagaacaattcaattaggtctaagtagaaa 9271705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 45290466 - 45290661
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45290466 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 45290565  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaa 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45290566 cttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaa 45290661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 90 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5796590 - 5796279
Alignment:
Q  90 taatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaata 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||   | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | |||    
T  5796590 taatcaatcccttgacttaggaccctcttatcatattacaatctctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacattata 5796491  T
Q  189 tcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctca 288  Q
    |||| || |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| || ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  5796490 tcacaaataaacgattattcattcatagactaaccctttttatttgaaaaactcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagcaggtattcattctca 5796391  T
Q  289 ctaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat-agtttcacagca 387  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  5796390 caaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaataattgaattgaat-aaaactagattgttattcataatagatgagtttcacagca 5796292  T
Q  388 acatggttcaatt 400  Q
    |||||||||||||    
T  5796291 acatggttcaatt 5796279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 140 - 376
Target Start/End: Original strand, 37423083 - 37423319
Alignment:
Q  140 ccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  37423083 ccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaa 37423182  T
Q  240 ttcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattg 339  Q
    |||||||  || ||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||    
T  37423183 ttcaattaggtataagtcgaaagttagggttagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaaaaacaattg 37423282  T
Q  340 aattgaataaaaactagattgtcattcacaataaata 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37423283 aattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaata 37423319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 351
Target Start/End: Original strand, 18562539 - 18562871
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcaccta-ttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttc 119  Q
    ||||||| || | |||||||| |||||||||||  || |||||||  |||||||||||| ||||||| | | || ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  18562539 ctaattgatacattgcacctacttcttatgaatacttctctagttttacgatagttaactaaaatagccctgattaatcctttgacttaggactctcttc 18562638  T
Q  120 tcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagac 218  Q
    ||| | ||| | | |||||||||||||||  |||||| | || |||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  18562639 tcatattacagtccctaattccttaggtgagctaatattattcgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagac 18562738  T
Q  219 taaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatat 318  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||||||    
T  18562739 taaccctgtttaattgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcaataaaacatgtttatattttataaggatat 18562838  T
Q  319 aaaaagtattaagaataattgaattgaataaaa 351  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  18562839 aaaaagcattaagaacaactgaattgaataaaa 18562871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4542921 - 4542734
Alignment:
Q  5 cgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttg 103  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  4542921 cgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataattctaatcaatcccttg 4542822  T
Q  104 agttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatca 191  Q
    |  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542821 acctagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagttggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatca 4542734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 11919851 - 11920021
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11919851 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgataggtaacaaaatagtcctaatcaatcc 11919950  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11919951 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 11920021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 178 - 400
Target Start/End: Original strand, 22611771 - 22611995
Alignment:
Q  178 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtc 277  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22611771 ttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaataattcaattaggtgtaagtcgaaagctagggtcagtagtc 22611870  T
Q  278 attcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat-- 375  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  22611871 attcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaaaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatag 22611970  T
Q  376 agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||| || ||||||| |||||||    
T  22611971 agtttcgcaacaacatgtttcaatt 22611995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35961219 - 35961076
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttc-tctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35961219 ctttcgaatcatctatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagtcaacaaaatagtcctaatcaatcc 35961120  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattcctt 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  35961119 cttgatttaggaccctcttctcaaactatagcccctaattcctt 35961076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 258 - 393
Target Start/End: Original strand, 9273364 - 9273501
Alignment:
Q  258 gaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactaga 357  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9273364 gaaacctatggtcaacagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaatattaagaacaattgaattgaataaaaactaga 9273463  T
Q  358 ttgtcattcacaataa--atagtttcacagcaacatgg 393  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9273464 tagtcattcacaataaatatagtttcacagcaacatgg 9273501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 267 - 374
Target Start/End: Original strand, 45290667 - 45290774
Alignment:
Q  267 ggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattc 366  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45290667 ggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattc 45290766  T
Q  367 acaataaa 374  Q
    ||||||||    
T  45290767 acaataaa 45290774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4695609 - 4695491
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4695609 ctttcgaatcatctatattcccctaattggtatactgcacctattcttatcaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 4695510  T
Q  100 cttgagttaggaccctctt 118  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  4695509 cttgacttaggaccctctt 4695491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24918145 - 24917972
Alignment:
Q  177 gttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagt 276  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24918145 gttaacctaatattacaattaaacgattatccattcatagacaagccctgtttaattgaacaatccaattatgtctaagttgaaagctttggtcagtagt 24918046  T
Q  277 cattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaa 351  Q
    ||||||| || || || | ||| ||| || |||| || |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24918045 cattcatacttacgaattcatg-ttacatatgattagtatataaaaagcattaagaacaattggattgaataaaa 24917972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2090557 - 2090385
Alignment:
Q  176 cgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtag 275  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||   | ||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  2090557 cgttaacctagtatcacaattaaacgatcatctattcctagactacccctgtttatttgaacaatccaattagatttaagttgaaagttattgtcggtag 2090458  T
Q  276 tcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataa 349  Q
     ||||||| ||||| || | ||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  2090457 gcattcatactcacaaattcatgtt-atatatgatcagtatataaaaaaaattaagaacaattgaattgaataa 2090385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 94
Target Start/End: Original strand, 11398057 - 11398129
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatc 94  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  11398057 ctaattggtatactgtacctattcgtattaatgattttctagttctacgatagttagcaaaatagtcctaatc 11398129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10345323 - 10345266
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgatt 57  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10345323 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatt 10345266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9080970 - 9080903
Alignment:
Q  335 aattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||  |||||||    
T  9080970 aattgaattgaataaaaactagattgtcattgacaataaatagagtttcacggcaacatctttcaatt 9080903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 79
Target Start/End: Original strand, 22611718 - 22611775
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaac 79  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  22611718 ctaattgatatactgcatctattcttatgaatgattcactagttccacgataattaac 22611775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19537 - 19134
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttc-tctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19537 ctttcgaatcatctatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 19438  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19437 cttgagttagaactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataaactttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 19338  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19337 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 19238  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19237 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 19138  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  19137 aatt 19134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39501789 - 39501386
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39501789 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 39501690  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39501689 tttgagttaggaccctcttatcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 39501590  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39501589 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 39501490  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39501489 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 39501390  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  39501389 aatt 39501386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 48637646 - 48637243
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48637646 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctatgcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 48637547  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataa-tctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48637546 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataaatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 48637447  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48637446 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 48637347  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48637346 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 48637247  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  48637246 aatt 48637243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19820868 - 19820466
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19820868 ctttcgaatcatctttgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 19820769  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19820768 cttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatcttaacctaatatcactaacaaa 19820669  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19820668 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatagtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 19820569  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19820568 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 19820469  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  19820468 att 19820466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24150813 - 24150410
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24150813 ctttcgaatcatctgtgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 24150714  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24150713 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 24150614  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24150613 acgattatccattcctggactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 24150514  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24150513 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 24150414  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  24150413 aatt 24150410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 34017762 - 34018165
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34017762 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctggttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 34017861  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34017862 cttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 34017961  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34017962 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 34018061  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34018062 tttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagactgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 34018161  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  34018162 aatt 34018165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 52006512 - 52006914
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52006512 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 52006611  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52006612 cttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgtcaacctaatatcactaacaaa 52006711  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52006712 cgattatccattcctagactaaacctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 52006811  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  52006812 ttatatttgatcaagatataaaaaacattaagaacaatcgaattgaataaaaactagattgtcattcacaatagatagagtttcacagcaacatggttca 52006911  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  52006912 att 52006914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 24044144 - 24044524
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24044144 ctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggacactcttctc 24044243  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24044244 aaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttaaaggtttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaa 24044343  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24044344 ccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtaagtagtaattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 24044443  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24044444 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 24044524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 52530916 - 52531319
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52530916 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 52531015  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  52531016 cttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagagtgttaacctaatatcactaacaa 52531115  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  52531116 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtaaaaagctatggtcaatagtcattcattctcactaaatcatg 52531215  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  52531216 tttatatttgatcaggatataaaaagcattcagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 52531315  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  52531316 aatt 52531319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3719242 - 3718862
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3719242 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatttgctagttccacaatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttggcttaggaccctcttctc 3719143  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3719142 aaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagatttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaa 3719043  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3719042 ccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtaatcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 3718943  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  3718942 aagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattttcattcacaataaatagagtttcacagcaatatggttcaatt 3718862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 38283470 - 38283870
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38283470 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccatgatagtaaacaaaatagtcataatcaatcc 38283569  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38283570 cttgagttaggactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttagcacgttaacctaatatcactaacaaa 38283669  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  38283670 ggattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaatattctatcagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcaggt 38283769  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38283770 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 38283869  T
Q  398 a 398  Q
    |    
T  38283870 a 38283870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 44164923 - 44164521
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44164923 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcttatgaatgattttatagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 44164824  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44164823 cttgacttaggaccctcttctcaaactacaatccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcaggttaacctaatatcactaacaaa 44164724  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44164723 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatagtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 44164624  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44164623 ttatatttgatcagaatataaaaaacattaagaacaattgaaataaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 44164524  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  44164523 att 44164521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15432197 - 15431817
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15432197 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagtaccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 15432098  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15432097 aaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaatctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaa 15431998  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15431997 ccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatgatcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaa 15431898  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  15431897 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatcaatt 15431817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 400
Target Start/End: Original strand, 27677039 - 27677438
Alignment:
Q  4 tcgaatcatctaagttc-tctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccctt 102  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27677039 tcgaatcatttatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccaccatagttaacaaaatagtcctaatcaatccctt 27677138  T
Q  103 gagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacga 202  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27677139 gacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcgctaacaaacga 27677238  T
Q  203 ttatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgttta 302  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27677239 ttatccattcctagactaaccttgtttattagaataatttaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgttta 27677338  T
Q  303 tatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  27677339 tatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaacaaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacatcaacatggttcaatt 27677438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 15429837 - 15430239
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15429837 cttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatccatcc 15429936  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15429937 cttgacttgggacccacttctcaaactactgcccctaattccttaggtggtctaattatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaa 15430036  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  15430037 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcgttcattttcattaaatcatgt 15430136  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  15430137 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagatagtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttca 15430236  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  15430237 att 15430239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 37103197 - 37103598
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37103197 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 37103296  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37103297 tttgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattcctttggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 37103396  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37103397 cgattatccattcctagactaa-cctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 37103495  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  37103496 ttatatttgaccaggatatataaagcattaataacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttaccagcaacatggttca 37103595  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  37103596 att 37103598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 40903064 - 40903466
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40903064 ctttagaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 40903163  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  40903164 cttgacttaggactctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataa 40903263  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | ||||||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40903264 aggattatcaattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 40903363  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40903364 tttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 40903463  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  40903464 aat 40903466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5673036 - 5672620
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5673036 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 5672937  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5672936 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 5672837  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatga-- 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  5672836 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaaactatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatc 5672737  T
Q  297 ---------tgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtc--attcacaataaat--agtttcac 383  Q
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  5672736 actaaatcttgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatattcacaataaatagagtttcac 5672637  T
Q  384 agcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||||||||||||    
T  5672636 agcaacatggttcaatt 5672620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40795143 - 40794740
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  40795143 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttacacgatagttaacagaatagtcctgatcaattc 40795044  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40795043 cttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 40794944  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  40794943 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtttaagtagaaagttatggtcagtagtcattcattctcactaaatcata 40794844  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40794843 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaatcgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 40794744  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  40794743 aatt 40794740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 56195668 - 56195265
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  56195668 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 56195569  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56195568 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 56195469  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  56195468 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 56195369  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  56195368 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 56195269  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  56195268 aatt 56195265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 12783045 - 12782643
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttc-tctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12783045 ctttcgaatcatctatgttcctctaattggtatactgcacctattcttataaatgattttctagtttcattagagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 12782946  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12782945 cttgacttaggacccttttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatccctaacaaa 12782846  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  12782845 cgattatccattcatagactaaccctgtttattagaacaattcaattccgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcatttttactaaatcatgt 12782746  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  12782745 ttatatttgatcagaatataaaaagtattaagaacaactgaaatgaataaaaacaagattgtcactcacaataaatagagtttcacaacaacatggttca 12782646  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  12782645 att 12782643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 15436451 - 15436853
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15436451 cttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatccatcc 15436550  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15436551 cttgacttgggacccacttctcaaactactgcccctaattccttaggtggtctaattatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcaataaaaaa 15436650  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  15436651 cgattatacattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcgttcattttcattaaatcatgt 15436750  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  15436751 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagatagtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttca 15436850  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  15436851 att 15436853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27014404 - 27014002
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27014404 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 27014305  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  27014304 tttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgttagcctaatatcactaataa 27014205  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27014204 aggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 27014105  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag--tttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  27014104 tttatatttgatcagaatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagattttcacaacaacatggttc 27014005  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  27014004 aat 27014002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 22 - 399
Target Start/End: Original strand, 48415532 - 48415912
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48415532 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtcaggactctcttctc 48415631  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  48415632 aaactacagctcctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcaataataaatgattatccattcctagacta 48415731  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    ||| |  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48415732 accattattattagaaaaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataa 48415831  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaat 399  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48415832 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaat 48415912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5670718 - 5670302
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5670718 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 5670619  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5670618 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 5670519  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattc-----------tc 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||    
T  5670518 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaatttaattctgtctaagtagaaaactatggtcagtagtcattcattctttctaaatcatc 5670419  T
Q  288 actaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtc--attcacaataaat--agtttcac 383  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  5670418 actaaatcttgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatattcacaataaatagagtttcac 5670319  T
Q  384 agcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||| |||||||||||    
T  5670318 agcaatatggttcaatt 5670302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5681568 - 5681166
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctct-aattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5681568 ctttcgaatcatcgatgttcccttaattggtatactgaaactattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 5681469  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5681468 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctagtatcactaacaaa 5681369  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |  |||||| ||||    
T  5681368 cgattatccattcctacactaaccatgcttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttatggctaaatcatgt 5681269  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  5681268 ttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaattgagtttcacagcaatatgattca 5681169  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  5681168 att 5681166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 34319898 - 34320301
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctct-aattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34319898 ctttcgaatcatcgatgttcccttaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 34319997  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34319998 cttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 34320097  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  34320098 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 34320197  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  34320198 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 34320297  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  34320298 aatt 34320301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 44808936 - 44809339
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44808936 ctttcgaatcatcgatgttctcctaattggtatattgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 44809035  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44809036 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 44809135  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  44809136 acgatcatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 44809235  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  44809236 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaatgaaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 44809335  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  44809336 aatt 44809339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 29324965 - 29324563
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29324965 ctttcgaatcatcgatgttccctaattggtatattgcacctattcatattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatccc 29324866  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29324865 ttgagttatgaccattttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 29324766  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29324765 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 29324666  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  29324665 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatcgagtttcacagcaacatggatca 29324566  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  29324565 att 29324563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15164314 - 15163930
Alignment:
Q  20 ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttc 119  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15164314 ctctaattggtatattgcccctattcttatgaatgattatctagttccatgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttc 15164215  T
Q  120 tcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatcca-ttcataga 217  Q
    | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15164214 ttaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcagattaacctaatatcactaacaaacgattatccatttcctaga 15164115  T
Q  218 ctaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggata 317  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15164114 ctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctaaggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgattatatttgatcaggata 15164015  T
Q  318 taaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15164014 taaaaaacattaagaacaatagaattgaataaaaactagattgtaattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 15163930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 15405062 - 15405468
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15405062 ctttcgaatcatctaagttcccctaattgatatactgcacctatttgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 15405161  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15405162 attgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaa 15405261  T
Q  199 acgattatccatt---catagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatg 295  Q
    |||||||||||||   | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15405262 acgattatccattattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattcggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatc 15405361  T
Q  296 atgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatgg 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  15405362 atgtttatatttgatcacgatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatgg 15405461  T
Q  394 ttcaatt 400  Q
     ||||||    
T  15405462 atcaatt 15405468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 19859503 - 19859904
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  19859503 ctttcgaatcatctatgatcccctaattggtatactgcacatattcttatgaattattttctagttccacgataattaataaaatagtcttaatcaatcc 19859602  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19859603 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaa 19859702  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19859703 cgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaacttaattaagtttaagtagaaagctatggtcagtagttattcattctcactaaatcatgt 19859802  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||    |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  19859803 ttatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaga-tgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatagttca 19859901  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  19859902 att 19859904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 15812139 - 15812523
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataa-tcaatcccttgagttaggaccctcttct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15812139 ctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttctacaatagttaacaaaatagtcctaaatcaatctcttgagttaggaccctcttct 15812238  T
Q  121 caaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagact 219  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15812239 caaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaacgattatccattcctagact 15812338  T
Q  220 aaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatata 319  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15812339 aaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatata 15812438  T
Q  320 aaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcatt--cacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  15812439 aaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaatataataaatagagtttcacagcaacatggatcaatt 15812523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 3797789 - 3798119
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3797789 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttattaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 3797888  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3797889 cttgagttaagaccctcttctcacactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 3797988  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3797989 cgattattcattcctagattaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaaatagaaagctatggtcagtagtcattcattctcattaaatcatgt 3798088  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaa 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3798089 ttatatgtgatcaggatataaaaagtattaa 3798119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 56198994 - 56198599
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56198994 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctatttgtattaatcattttctagttctaagatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 56198895  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56198894 cttgagttaggaccctcttctctaactacaacccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcatgttaacctaatatcactaacaa 56198795  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  56198794 acgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 56198695  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||    
T  56198694 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaattagattgtcattaataataaatagagtttcacagaaacatg 56198599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12238384 - 12238018
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12238384 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctc 12238285  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    | | ||| | | |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12238284 agattacagtctctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagacta 12238185  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcag--gatat 318  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  12238184 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggagatat 12238085  T
Q  319 aaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaa 388  Q
    |||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12238084 aaaaagcattaagaa-----caattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataaagtttcacagcaa 12238018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 19864498 - 19864895
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19864498 ctttcgaatcatctatgatcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttc----atagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 19864593  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19864594 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttagatggtctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaa 19864693  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19864694 cgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaacttaattaagtttaagtagaaagctatggtcagtagttattcattctcactaaatcatgt 19864793  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||    |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  19864794 ttatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaattaga-tgtcattcacaataaatagagtttcacagctacatggttca 19864892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 40616789 - 40617137
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40616789 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 40616888  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40616889 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaaaatcactaacaa 40616988  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc--------------att 284  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||              |||    
T  40616989 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctctctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaattcatt 40617088  T
Q  285 ctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaa 333  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40617089 ctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaa 40617137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11195816 - 11195413
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11195816 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaacagtcctaatcaatcc 11195717  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  11195716 cttgagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaatttcttaggtggtctaataacctttgaaggtttaggcacgttaacctattatcactaataaa 11195617  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||| ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11195616 tgattattcattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaagtaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 11195517  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag---tttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11195516 ttatatttgatcatgatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaaccagattgtcactcacaataaatagagttttcacagcaacatggttc 11195417  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  11195416 aatt 11195413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 53009561 - 53009941
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  53009561 ctaattagtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaattaatctcttgagttaggaccctcttcta 53009660  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
        ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||| ||||||||    
T  53009661 gggttacagcccctaatttcttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaatggttataaattcctagactaa 53009760  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    || |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53009761 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 53009860  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  53009861 aagtattaagaacaattgaattgaataaaacctagattatcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttcaatt 53009941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 40493348 - 40493751
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40493348 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtataccacacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaaaaaaatagtcctaatcaatcc 40493447  T
Q  100 cttga-gttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||| |||| |||||||||||     |||  || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40493448 cttgaagttacgaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataa 40493547  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  40493548 aggattatacattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 40493647  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  40493648 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttc 40493747  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  40493748 aatt 40493751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 46955481 - 46955862
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46955481 ctaattggtatactgcacctatttgtattaatgattctctaattcaacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 46955580  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  46955581 aaactacagcccctaattccttaggtggactaataatctttgaatgttttaaaaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagatta 46955680  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  46955681 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaaatcgaaagttatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcataatataa 46955780  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  46955781 aaagcattaagaacaattaaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatcaatt 46955862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33927113 - 33926705
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33927113 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccataatcaatcc 33927014  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33927013 cttgagttaggaccctcttctaaaactacagcccctaattcctcaggtggtctaataattctcaaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaa 33926914  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagt-----agtcattcattctcactaaa 293  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||||||   ||||||| |||||||| |||||||     |||||||| |||||||||||    
T  33926913 acgattatccattcctagactaatcatgtttattagaacagttcaattagatctaagtcgaaagctagggtcagtagtcaagtcattcgttctcactaaa 33926814  T
Q  294 tgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacat 391  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||| ||||||    
T  33926813 tcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcatcaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattaataataaatagagtttcacaacaacat 33926714  T
Q  392 ggttcaatt 400  Q
    || ||||||    
T  33926713 ggatcaatt 33926705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21419929 - 21419535
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21419929 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtataccacacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 21419830  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||| ||||||||||     |||  |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21419829 cttgagttagaaccctcttctagggttacatcacctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 21419730  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  21419729 agattatccattcctagactaaccatgcttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcgctcgttctcactaaatcatgt 21419630  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21419629 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 21419535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 18673063 - 18673454
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18673063 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 18673162  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18673163 cttgagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 18673262  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18673263 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 18673362  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  18673363 ttatatttgatcaggatataaaaagcatt-----------aattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatgtttca 18673451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25962199 - 25961796
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25962199 ctttcgaatcatcgatgttctcctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatattcctaatcaatcc 25962100  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaa-taatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25962099 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaaataaccgtcgaatgtttaagcacgttaagctaatatcactaataa 25962000  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||     
T  25961999 aggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcattaaatcatt 25961900  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaat--aaatagtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||    
T  25961899 tttatatttgatcaggatataaaaagctttaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaattaatatagtttcacagcaacatgtttc 25961800  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  25961799 aatt 25961796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Original strand, 33408298 - 33408676
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  33408298 ctttcgaatcctctaagttcccctaatcggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatggttaataaaatagccctaatcaatcc 33408397  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| || ||    
T  33408398 cttgacttaggaccctcttctcaaactataacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcacaaataa 33408497  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
      ||||||| |||| |||||||||  |||| ||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  33408498 ctgattatctattcctagactaacaatgtttatttgaacaactcaattaggtctaagtagacagctatggtcagtaatcattcattctcactaaatcatg 33408597  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 377  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33408598 tttatatctgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgagttgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 33408676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 138 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19827492 - 19827228
Alignment:
Q  138 ttccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaac 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19827492 ttccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaac 19827393  T
Q  238 aattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataat 337  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19827392 aattccattcagtctaagtagaaagctatggttagtagtcattcattctcactaaatcatgtttgtatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaat 19827293  T
Q  338 tgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19827292 tgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 19827228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 29544855 - 29545257
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttc-tctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29544855 ctttcgaatcatcgatgttcctctaattggtatattgcacctattattgtgaatgattaactagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 29544954  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||| ||| ||||| |     |||  || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  29544955 cttgagttatgactctcttatagggttacaacccctaattccttaggaggtctaataacctttgaaggtttaagcacattaacctaatatcactaataaa 29545054  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||  |||| || || |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29545055 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtgtaagtcaaaagttagggccagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 29545154  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  29545155 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatgtttca 29545254  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  29545255 att 29545257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 63 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 35510042 - 35509704
Alignment:
Q  63 gttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatcttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35510042 gttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccatt 35509943  T
Q  163 gaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaag 262  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||| | |||||    
T  35509942 aaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacgatgtttattagaacaattcaattaggtctaattcgaaag 35509843  T
Q  263 ctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtc 362  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35509842 ctagggtcagtagtcattcgttcttactaaatcatgtttatatttaatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatc 35509743  T
Q  363 attcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaat 399  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||    
T  35509742 attcacaataaatagagtttcacatcaacatgtttcaat 35509704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 49270820 - 49270454
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49270820 ctttcgaatcatctatattctcctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattatctagttcaacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 49270721  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  49270720 -ttgagttaggaccctcttctcaaactacagtccctaattccctaggtggtctaataat---tgaaggttttaagaatgttaacctaatatcactaacaa 49270625  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  49270624 acgattattcattcatatactaaccatgtttatgagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatgatcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 49270525  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaag---aataattgaattgaataaaaactagattgtcattcaca 369  Q
    ||||||||||   || |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49270524 tttatatttg---agaatataaaaagcattaagaacaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcaca 49270454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18911639 - 18911368
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18911639 cttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 18911540  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18911539 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctattatcactaacaaa 18911440  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtca 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  18911439 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtca 18911368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 75 - 325
Target Start/End: Original strand, 15446792 - 15447042
Alignment:
Q  75 ttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagc 174  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15446792 ttaaccaaatagttataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtccaataatcttagaaggtttaagc 15446891  T
Q  175 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15446892 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgtttattagaacaattcaattcagtctaagtagaaagttatggtcagta 15446991  T
Q  275 gtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagt 325  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15446992 gtaattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagt 15447042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 400
Target Start/End: Original strand, 8874772 - 8875145
Alignment:
Q  31 atactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactact 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||  | |||     
T  8874772 atactgcacctatttcttatgaatgattctctagtttcaagatggttaacaaaatagccataatcaatcgattgacttagaaccctcttctccgattaca 8874871  T
Q  130 gccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgtt 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  8874872 gcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacattaacttaatataacaaataaacgactatccattcctagactaaccatgtt 8874971  T
Q  229 cattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtatt 328  Q
     ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||    
T  8874972 tatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcggtagtcattcattctcactaaattatgtttatatttgatcaagtgataaaaagcatt 8875071  T
Q  329 aagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  8875072 aagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatttttcaatt 8875145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 30392687 - 30392313
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  30392687 ctaattggtatattgcacctatttttatgaatgattcgctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttcta 30392588  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
        |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||    
T  30392587 gggttacaacccctaattcctaaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaagtattattcattcctagactaa 30392488  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    || |||| |||||||||||||||||  |||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  30392487 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaattcaaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgattaagatataaa 30392388  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaa 398  Q
    ||| ||||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  30392387 aagcattac----aattgagatgaataaaaactagattgtcattcataataaatagagtttcacagcaacatgtttcaa 30392313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 8877481 - 8877885
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatc 98  Q
    ||||| |||||||||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  8877481 ctttcaaatcatctaagttcccctatttagtatactgcacctatttcttatgaatgactctctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatc 8877580  T
Q  99 ccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  |  ||  || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| || |    
T  8877581 ccttgacttaggactctcttctccgatcacaacccctaatttcttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaatgttaacttaatatcacaaata 8877680  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  8877681 aacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaaatctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattcccactaaatcat 8877780  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggtt 395  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||  |||||||||||| |||| ||    
T  8877781 gtttatatttgattaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaacttgattgtcatctacaatagatagagtttcacagcagcatgttt 8877880  T
Q  396 caatt 400  Q
    |||||    
T  8877881 caatt 8877885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 53094648 - 53094246
Alignment:
Q  2 tttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  53094648 tttcaaatcctctaagttcccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatgattaacaaaataggcctaatcaatcc 53094549  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||  || ||    
T  53094548 cttgacttaggaccctcttctcatagtacaacccctaactccttaggtggtctaatactctttgaatgttttatgaacgttaacttaatatcagaaataa 53094449  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||    
T  53094448 acgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaaactatggtcagtagtaattcgttctcacgaaatcatg 53094349  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||    |||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||    
T  53094348 tttatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaatttaattgaataaaaattagattgtcattcacaatagatagagtttcacagcaacatgtttc 53094249  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  53094248 aat 53094246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 134 - 321
Target Start/End: Original strand, 27679340 - 27679527
Alignment:
Q  134 ctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcatta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  27679340 ctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttatta 27679439  T
Q  234 gaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27679440 gaacaattcaattctgtataagtagaaagctatgttcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 27679527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 37739738 - 37740144
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttc-tctaattggtatactgcacctat-tcttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaat 97  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||| |||| | ||||||| | ||||||||    
T  37739738 ctttcgaatcatcagagttcctctaattggtacactgcacctatgtcttatgaatatttctctagtttcacgatggttagctaaaatagccctaatcaat 37739837  T
Q  98 cccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagca-cgttaacctaata---tcact 193  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||   ||||     
T  37739838 cccttgacttaggaccctcttatcagattactgtccctaattccttaggtgatctaataatctttgaaggttttacaaacattaacctaataatatcaca 37739937  T
Q  194 aacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaa 293  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  37739938 aataaacgattatccattcatagattaacccagtttatttgaaaaattcgattaggtctaagttgaaagctatggttagtagtcattcattctcacgaaa 37740037  T
Q  294 tgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa-atagtttcacagcaacatg 392  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  37740038 tcatgtttatatttgattagaatataaaaagcattaacaacaattgaattgaat-aaaactagattaatattcacaataatagagtttcacaacaacatg 37740136  T
Q  393 gttcaatt 400  Q
     |||||||    
T  37740137 attcaatt 37740144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 68 - 360
Target Start/End: Original strand, 22172422 - 22172715
Alignment:
Q  68 acgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaag 166  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  22172422 acgatagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgaactaatattcttcgaag 22172521  T
Q  167 gttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagcta 265  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  22172522 gttttaagaacgttaacctaatatcgcaaataaacgattatccattcatagactaaccctgtttatttgaacaattcaataaggtctaagttgaaagcta 22172621  T
Q  266 tggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattg 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22172622 tggtcagtaatcattcattctcacgaattcatg-ttatatgtgatcagtatataaaaatcattaataacaattgaattgaatcaaaactatattg 22172715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 134 - 400
Target Start/End: Original strand, 48014167 - 48014432
Alignment:
Q  134 ctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcatt 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  48014167 ctaattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaatgtcacaaataaacgattatccattcctaaactaaccctgtttatt 48014266  T
Q  233 agaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaaga 332  Q
     |||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  48014267 tgaacaattcaattaggtcaaagttgaaagttatggtcagtagttattcattctcacgaattcatatttatatttgatcagg--ataaaaagcattaaga 48014364  T
Q  333 ataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa-atagtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48014365 acaattgaattgaat-aaaactagattgatattgacaataatatagtttcacagcaacatggttcaatt 48014432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 392
Target Start/End: Original strand, 8448773 - 8448918
Alignment:
Q  249 gtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaata 348  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8448773 gtctaagtagaaagctatgaccagtagtcattcattcttacgaaatgatgtttatatttgatcaagatataaaaagcattaacaataattgaattgaata 8448872  T
Q  349 aaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  8448873 aaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacatcaacatg 8448918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5706511 - 5706374
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaat-agtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5706511 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttct 5706412  T
Q  121 caaactactgccactaattccttaggtggtctaataat 158  Q
    || | ||| | | |||||||||||||||  ||||||||    
T  5706411 cagattacagtccctaattccttaggtgagctaataat 5706374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 269 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15438564 - 15438431
Alignment:
Q  269 tcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcac 368  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  15438564 tcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattaat 15438465  T
Q  369 aataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  15438464 aataaatagagtttcacagcaacatggatcaatt 15438431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 39498450 - 39498346
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39498450 ctttcgaatcatctaagttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 39498351  T
Q  100 cttga 104  Q
    |||||    
T  39498350 cttga 39498346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 281
Target Start/End: Original strand, 33493756 - 33493958
Alignment:
Q  80 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgt 178  Q
    ||||||||| || | ||| |||| | |||||||| |||||||| | ||| | | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||    
T  33493756 aaaatagtcctatttaattccttaacttaggaccatcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaatgtttaaagaacgt 33493855  T
Q  179 taacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtca 278  Q
    |||| || |||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  33493856 taacatattatcacaaataaacgattatctattcctagactaactctgtttatttgaacaattcaattaggtctaaattgtaagctatggtcagtagtca 33493955  T
Q  279 ttc 281  Q
    |||    
T  33493956 ttc 33493958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 15445346 - 15445430
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaat 84  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15445346 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctacttccacgatagttaacaaaat 15445430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 317 - 400
Target Start/End: Original strand, 27691442 - 27691527
Alignment:
Q  317 ataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  27691442 ataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgattcaatt 27691527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 328 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18911366 - 18911292
Alignment:
Q  328 taagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18911366 taagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 18911292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Original strand, 5677447 - 5677575
Alignment:
Q  58 ttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaata 156  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| | | ||||||||||| ||| |||||||    
T  5677447 ttctagtttcacgatggctaactaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccatcttctcagattacagtccctaattccttaagtgatctaata 5677546  T
Q  157 atctttgaagg-tttaagcacgttaacct 184  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5677547 ttctttgaaggttttaaggacgttaacct 5677575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 35510132 - 35510044
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtc 88  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35510132 ctttcgaatcatctatattcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattcactagttccacgttagttaacaaaatagtc 35510044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 19827556 - 19827489
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttcc 67  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19827556 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtataatgcacatattcttatgaatgattttctagttcc 19827489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 210
Target Start/End: Original strand, 8448654 - 8448748
Alignment:
Q  117 ttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggt-ttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccat 210  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||   ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8448654 ttctccaactacagcccctaatttcataggtgatctaataatctttaaaggtattacaaacgttaagctaatatcacaaacaaaggattatccat 8448748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 399
Target Start/End: Original strand, 5677690 - 5677790
Alignment:
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag--tttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||  |||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  5677690 ttatatgtgatcaatatataaaaagcattaagaacagatgaattgagtaaaa-ctagattgatattcacaggaaatagagtttcacaacaacatggttca 5677788  T
Q  398 at 399  Q
    ||    
T  5677789 at 5677790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 49498478 - 49498881
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49498478 ctttcgaatcatctaagttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttatagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 49498577  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49498578 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 49498677  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtc-taagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  49498678 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtcttaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattatcactaaatcatg 49498777  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  49498778 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttc 49498877  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  49498878 aatt 49498881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 41058283 - 41058685
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttc-tctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41058283 ctttcgaatcatctatgttcctctaattggtatgctgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 41058382  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41058383 cttgatttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtagtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctattatcactaacaaa 41058482  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41058483 caattatccattcctagactaaccctatttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 41058582  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  41058583 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttca 41058682  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  41058683 att 41058685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 45941559 - 45941157
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45941559 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 45941460  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45941459 cttgagttaggacccttttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 45941360  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45941359 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 45941260  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaata--gtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45941259 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatttacaataaatagggtttcacagcaacatggttc 45941160  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  45941159 aat 45941157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20398996 - 20398593
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20398996 ctttcgagtcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 20398897  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20398896 cttgagttagaaccctcttctcagactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaa 20398797  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20398796 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtcaaagtagaaagctatggtcagtagtgattcattctcactaaatcatg 20398697  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20398696 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 20398597  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  20398596 aatt 20398593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 23021904 - 23022307
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23021904 ctttcgaatcatctaagttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatattctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 23022003  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23022004 cttgagttaggaccctcttcttagaccacagcccctaattccttaggtgatcaaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 23022103  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23022104 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 23022203  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23022204 tttatatttgattaggatataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 23022303  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  23022304 aatt 23022307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 1950436 - 1950838
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1950436 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 1950535  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1950536 cttgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 1950635  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1950636 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaatacaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatat 1950735  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  1950736 ttatatatgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcacatcaacatggttca 1950835  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  1950836 att 1950838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 21107272 - 21107674
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21107272 ctttcgaatcatctatgttcacctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 21107371  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21107372 cttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagatggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 21107471  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21107472 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagcaatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 21107571  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  21107572 ttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaatttaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttgacagcaacatggttca 21107671  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  21107672 att 21107674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 27 - 400
Target Start/End: Original strand, 49853086 - 49853461
Alignment:
Q  27 tggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaact 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  49853086 tggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgacagttaacaaaatagtcctaatcaatcacttgacttaggaccctcttctcaaact 49853185  T
Q  127 actgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctg 226  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49853186 acagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcaataacaaacgattatccattcctagactaaccctg 49853285  T
Q  227 ttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagta 326  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49853286 tttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggttagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagca 49853385  T
Q  327 ttaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  49853386 ttaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttcaatt 49853461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28111199 - 28110797
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28111199 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaacagtcctaatcaatcc 28111100  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28111099 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaatatcactaacaa 28111000  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28110999 acgattatccattcctatactaaccctatttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcattaaatcatg 28110900  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28110899 tttatatttgatcaggatataaaaa-cattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 28110801  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  28110800 aatt 28110797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 21018448 - 21018849
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21018448 ctttcgaatcatctatgttcccctaatttgtatactgaacctattcttatgaatggttttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 21018547  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21018548 cttgacttatgaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 21018647  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21018648 cgattatccattcctagactaaccctgtttattaaaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 21018747  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  21018748 ttatatttgatcaagata-aaaaagcgttaagaacagttgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacattgttca 21018846  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  21018847 att 21018849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2794370 - 2793968
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2794370 ctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 2794271  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||    
T  2794270 cttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaagctagtatcactaataaa 2794171  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2794170 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 2794071  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  2794070 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgattca 2793971  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  2793970 att 2793968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 37183844 - 37184247
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37183844 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 37183943  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37183944 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaa 37184043  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    ||| |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  37184044 acggttatccattcctagactaactatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctaggatcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 37184143  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  37184144 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 37184243  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  37184244 aatt 37184247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 6070935 - 6071337
Alignment:
Q  2 tttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6070935 tttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatattgcacctattcgtattaatgattttctatttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccc 6071034  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6071035 ttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaa 6071134  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6071135 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 6071234  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  6071235 ttatatttgatcagtatataaaaggcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatca 6071334  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  6071335 att 6071337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31204981 - 31204578
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  31204981 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatatccctaatcaatcc 31204882  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaag-cacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31204881 cttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaaacacgttaacctaatatcactaacaa 31204782  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  31204781 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 31204682  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  31204681 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacaacaacatggatc 31204582  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  31204581 aatt 31204578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 45960725 - 45961128
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  45960725 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtataatgcacctatttgtattaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcc 45960824  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45960825 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaa 45960924  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  45960925 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 45961024  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  45961025 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacaacaacatggatc 45961124  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  45961125 aatt 45961128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 673052 - 673456
Alignment:
Q  2 tttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaa--tagtcataatcaatc 98  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||    
T  673052 tttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtaaatgattttctagttccacgatagttaaaaaaaaatagtctcaatcaatc 673151  T
Q  99 ccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  673152 ccttgagttaataccctcttctcaaactacaacccctaattttttaggtggtctaataatctttgaagggtttaagtacgttaacataatatcactaata 673251  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  673252 aacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcaatagtcattcattctcactaaatcat 673351  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggtt 395  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  673352 gtttatattttatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggat 673451  T
Q  396 caatt 400  Q
    |||||    
T  673452 caatt 673456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 905666 - 906072
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  905666 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacttattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagttttaatcaatcc 905765  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatat----cactaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||     |||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||    
T  905766 cttgagttaggaccctcttctatggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatatatcactaa 905865  T
Q  196 caaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatg 295  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  905866 taaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatc 905965  T
Q  296 atgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatgg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  905966 atgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaataacatgg 906065  T
Q  394 ttcaatt 400  Q
    |||||||    
T  906066 ttcaatt 906072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 3796807 - 3797209
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3796807 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgcgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 3796906  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3796907 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 3797006  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  3797007 ggattatccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatat 3797106  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  3797107 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatgtttca 3797206  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  3797207 att 3797209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 29643202 - 29643604
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29643202 ctttcgaatcatcgatgttcccctaactagtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 29643301  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||   | |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  29643302 cttgagttaggaccctcttctaggattacaacctctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaataaa 29643401  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  29643402 ggattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttagggtcagtagtcattcgttcacactaaatcatgt 29643501  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  29643502 ttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaatttaattgaataaaaactaaattgtcattcaaaataaatagagtttcacagcaatatggttca 29643601  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  29643602 att 29643604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2405652 - 2405258
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  2405652 ctttcgaatcatctatgttttcctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattccctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatca 2405553  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatcttt-gaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
     ||||||||||||||||| ||     |||  ||  |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2405552 attgagttaggaccctctcctagggttacatcccttaattccttaggtggtctaata-tctgtcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataa 2405454  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  2405453 aggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgttatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 2405354  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  2405353 tttatatttgatcaggatatgaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaattgagtttcacaacaacatg 2405258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 27354947 - 27355165
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27354947 ctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataaccaatcccttgagttaggaccctcttctt 27355046  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  27355047 aaactacaacc-ctaattccttaggtggtctattaatcttcgaaggtttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatctattcctacactaa 27355145  T
Q  222 ccctgttcattagaacaatt 241  Q
    || |||| ||||||||||||    
T  27355146 ccatgtttattagaacaatt 27355165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 34732341 - 34732734
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | || ||||||    
T  34732341 ctttcgaatcctctgagttcccctaattggtatactgcaattatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaatagcccta-tcaatc 34732439  T
Q  99 ccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||  || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |    
T  34732440 ccttgacttaggaccctcttctcaaagtacatcccctaatttgttaggtggtctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaata 34732539  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  34732540 aacgattattcattcctagactaactatgtttatttgaacaattcaattaggtttaagttgaaagttatggtcagtagtcattcattctcaggaaatcat 34732639  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacat 391  Q
    ||||||||    |||  | |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  34732640 gtttatatcgtgtcaataaataaaaa-aattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaatagatagagtttcacagcaacat 34732734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 21111139 - 21111314
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21111139 ctttcgaatcatctatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 21111238  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagca 175  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21111239 cttaacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagca 21111314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 168 - 392
Target Start/End: Original strand, 11668175 - 11668401
Alignment:
Q  168 tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatg 267  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| | || ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11668175 tttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagagtaaccatatttatttgaaaaattcaattcggtctaagttgaaagctatg 11668274  T
Q  268 gtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattca 367  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11668275 gtcagtagtcattaattctcacaaaatcatgtttatatttgatcgggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattca 11668374  T
Q  368 caataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  11668375 caatagatagagtttcacagcaacatg 11668401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7635767 - 7635394
Alignment:
Q  23 taattggtatactgcaccta-ttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttct 120  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||  || ||||||| ||||||  ||||| ||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7635767 taattggtacactgcacctacttcctatgaatatttctctagtttcacgatgattaactaaaataaccctaatcaataccttgacttaggaccctcttct 7635668  T
Q  121 caaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagact 219  Q
    || | ||| | |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || || ||||||||||| |||| ||||||    
T  7635667 cagattacagtccataattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctcttattacaaataaacgattatctattcctagact 7635568  T
Q  220 aaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatata 319  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||   |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||||| |||||    
T  7635567 gaccctgtttatttgaacaattcaatcaggtctaagttgaaagttatgatcaatagtcattcattctcacgaattcatgtatatatgtgatcagcatata 7635468  T
Q  320 aaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||  ||||||||| |||||||    
T  7635467 aaaagcactaagaacaattgaattgaat-aaaactagattgatattcataagaaatagagtttcacatcaacatg 7635394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 21434477 - 21434763
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttc 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||    
T  21434477 ctaattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcacgacagttaactaaaatagccataatcaatccattgacttaagacactcttc 21434576  T
Q  120 tcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagac 218  Q
    ||| | ||| | | ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||    
T  21434577 tcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaatataacaaataaacgattattcattcctagac 21434676  T
Q  219 taaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatat 305  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21434677 taaccctgtttatttgaacaattcaattaggtataagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaaacatgtttatat 21434763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 27331757 - 27332145
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaat 97  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||||| | |||||||||| | |||||||  || ||||||| |||||| |||||| ||||||| | |||| |||    
T  27331757 ctttcgaatcctctgagtttccctaattggtacaatgcacctatttcctatgaatatttctctagtttcacgatggttaactaaaatagccctaataaat 27331856  T
Q  98 cccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagca-cgttaacctaatatcactaac 196  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||       |||  |||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||     
T  27331857 cccttgacttaggaacctcttctca-------gcc--taattcattaggtgatctaatattttttgaaggttttaacaacgttaacctaatatcacaaat 27331947  T
Q  197 aaacgattatcca-ttcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatg 295  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || |     
T  27331948 aaacgattattcaattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagttatggtcagtagtcattcattctcatgaattc 27332047  T
Q  296 atgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  27332048 atgtttatatgtgatcagtatataaaaagcattaataacaattgaattgaat-aaaactagattgatattcacaagaaataaagtttcatagcaacatg 27332145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 27355689 - 27355941
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttc 119  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||  || ||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27355689 ctaattggtacactgcacctatttcctatgaatatttctctagtttcacgatggttaactaaaataggcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttc 27355788  T
Q  120 tcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagac 218  Q
    ||| | ||| | | ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  27355789 tcatattacagtccctaattcattaggtgatctaatattttttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagac 27355888  T
Q  219 taaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtca 271  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  27355889 taaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtca 27355941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 21114479 - 21114583
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21114479 ctttcgaatcatctatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 21114578  T
Q  100 cttga 104  Q
    |||||    
T  21114579 cttga 21114583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 286 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42022531 - 42022427
Alignment:
Q  286 tcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag--tttcac 383  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  42022531 tcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagaatttcac 42022432  T
Q  384 agcaa 388  Q
    |||||    
T  42022431 agcaa 42022427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 11666982 - 11667152
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| || ||| || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  11666982 ctttcgaatcctctgatttccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgaatctctaatttcacaatggttaacaaaatagccctaatcaatcc 11667081  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 170  Q
    ||||| |||||| |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11667082 cttgacttaggatcctcttctcagattacagcccctaattccttaggtggtctaatattatttgaaggttt 11667152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42022783 - 42022587
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttc-tctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatt------ttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataat 93  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |      |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  42022783 ctttcgaatcctctgagttcctctaatcagtatgctgcacctattcttatgaatgaataagaatttctagttccactatagttaacaaaatagttttaat 42022684  T
Q  94 caatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcac 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||     |||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  42022683 caatcccttgagttaggaccctcttctcaaactataacccctaa-----taggtgatctaataatttttgaaggttttaattacgttatcctaatatcac 42022589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 400
Target Start/End: Original strand, 27536579 - 27536669
Alignment:
Q  311 caggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaa-actagattgtcattcacaataaatagtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27536579 caggatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaaactagattgtcattaataataaatagtttcacaacaacatggatcaatt 27536669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 192
Target Start/End: Original strand, 16055629 - 16055742
Alignment:
Q  80 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgt 178  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  16055629 aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacaacccctaaatccttaggtgatctaatattctttgaaggtttgaagaatgt 16055728  T
Q  179 taacctaatatcac 192  Q
    ||||||||||||||    
T  16055729 taacctaatatcac 16055742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 13430938 - 13431133
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcaccta-ttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaaca-aaatagtcataatcaat 97  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||| || |||| ||||||  || |||||||  ||||| ||||||  |||||| | ||||||||    
T  13430938 ctttcgaatcctctgagttcccctaattggtacactgcacttagttctcatgaatatttctctagttttacgatggttaacttaaatagccctaatcaat 13431037  T
Q  98 cccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcac 192  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| | ||| | | |||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||    
T  13431038 cccttgacttaggactctcttctcatattacagtctctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcac 13431133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 34065142 - 34065313
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatc 98  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||||||| | |||| ||||| | |||||||  || ||||||| |||||| |||||| |||||| | |||||||||    
T  34065142 ctttcgaatcctctgagttttcctaattggtacaatgcatctatttcctatgaatacttatctagtttcacgatggttaaccaaatagccctaatcaatc 34065241  T
Q  99 ccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 170  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| | ||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34065242 tcttaacttaggaccctcctctcatattacagtctctaatacctttggtgatctaataatctttgaaggttt 34065313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 192
Target Start/End: Original strand, 16056874 - 16056977
Alignment:
Q  90 taatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaata 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||   | ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  16056874 taatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacgatccctaattccttaggtgatctaatatactttaaaggtttgaataacgttaacctaata 16056973  T
Q  189 tcac 192  Q
    ||||    
T  16056974 tcac 16056977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 27536512 - 27536585
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgata 73  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27536512 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccaggata 27536585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 16060970 - 16061143
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcaccta-ttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttc 119  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||  || |||||||  |||||  ||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||  ||||||    
T  16060970 ctaattggtacactgcacctatttctcatgaatatttctctagttttacgatgattaactaaaatagccctaatcaatccattgacttaggattctcttc 16061069  T
Q  120 tcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcac 192  Q
    ||| | |||   | ||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  16061070 tcatattacaatccctaattccttaggtgatctaatatactttataggtttgaagaacattaacctaatatcac 16061143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 118
Target Start/End: Original strand, 30938601 - 30938661
Alignment:
Q  59 tctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctctt 118  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30938601 tctagtttcacgatggttaactaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggatcctctt 30938661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 392
Target Start/End: Original strand, 34066737 - 34066815
Alignment:
Q  315 atataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  34066737 atataaaaagcatcaagaacaattgaattgaat-aaaactagattgatattcacaagaaatagagtttcacaacaacatg 34066815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 282
Target Start/End: Original strand, 34066626 - 34066705
Alignment:
Q  203 ttatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattca 282  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||  ||||  || ||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  34066626 ttatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaatcaaattaggtataagttgtaagctatggttagtagtcattca 34066705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 42022567 - 42022531
Alignment:
Q  258 gaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaat 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42022567 gaaagatatggtcagtagtcattcgttctcactaaat 42022531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 26752682 - 26753085
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26752682 ctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatactgcaccttttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 26752781  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26752782 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 26752881  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  26752882 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtaattcattctcactaaatcatg 26752981  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26752982 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 26753081  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  26753082 aatt 26753085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 41876745 - 41877148
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41876745 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 41876844  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41876845 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 41876944  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  41876945 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattctttctcactaaatcatg 41877044  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41877045 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaaaaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 41877144  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  41877145 aatt 41877148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34831905 - 34831502
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34831905 ctttcgaatcttctgagttcccctaattggtataatgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 34831806  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34831805 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 34831706  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34831705 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 34831606  T
Q  300 ttatatttgatcaggatat-aaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34831605 ttatatttgatcaggaaataaaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 34831506  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  34831505 aatt 34831502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 41306508 - 41306910
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41306508 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 41306607  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41306608 cttgagttaggaccctcttttcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaa 41306707  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  41306708 cgattatccatacctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattcttattaaatcatgt 41306807  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41306808 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaattagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 41306907  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  41306908 att 41306910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 4099498 - 4099905
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4099498 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttgcacgatagttagcaaaatagtcataatcaatcc 4099597  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099598 cttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatatttgaagatttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 4099697  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4099698 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtataagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 4099797  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaa-----taattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4099798 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 4099897  T
Q  393 gttcaatt 400  Q
    ||||||||    
T  4099898 gttcaatt 4099905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7271157 - 7270755
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7271157 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagttctaatcaatcc 7271058  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  7271057 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctgataatctttgaaggtttaaacacgttagcccaatatcactaacaaa 7270958  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7270957 cgattatccattcatagactaaccatgtttgttagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 7270858  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  7270857 ttatatttgaccaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaatagaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttca 7270758  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  7270757 att 7270755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20055915 - 20055522
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20055915 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcc 20055816  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055815 cgtgagttaggaccgtcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 20055716  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20055715 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattctttctcactaaatcatgt 20055616  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacat 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20055615 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaacttgattgtcattcacgataaatagagtttcacagcaacat 20055522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18952834 - 18952432
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18952834 ctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 18952735  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18952734 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 18952635  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    | ||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18952634 caattatccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtcattagtcattcgttctcactaaatcatgt 18952535  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  18952534 ttatatttgatcagaatataaaaagcattaaaaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggatca 18952435  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  18952434 att 18952432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 21335679 - 21336081
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21335679 ctttcgaatcatctatgttcccctaatttgtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 21335778  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
     |||| |||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21335779 tttgacttagaaccgtcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 21335878  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21335879 cgattatccatttatagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagttatagtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 21335978  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21335979 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagagcaattgaattgaattaaaactatattgttattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 21336078  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  21336079 att 21336081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33552262 - 33551860
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33552262 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 33552163  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33552162 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaagtggtct-ataatctttgaaggtttaagcacattaacctaatatcactaacaaa 33552064  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| | ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33552063 cgattatccattcctagactgaccatatttgttagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattatcactaaatcatgt 33551964  T
Q  300 ttata-tttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33551963 ttatattttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 33551864  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  33551863 aatt 33551860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 21332661 - 21333065
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  21332661 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaataaaatagtcctaatcaattc 21332760  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332761 attgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagatgatctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 21332860  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatga--t 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  |    
T  21332861 cgattatccattcatagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatagtcagtagtcatttattctcactaaatcatct 21332960  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggtt 395  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  21332961 ttttatatttgatcatgatataaaaagcattaagagcaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggtt 21333060  T
Q  396 caatt 400  Q
    |||||    
T  21333061 caatt 21333065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 26895585 - 26895987
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26895585 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatgttgcacctattcttatgaatgattttttagttcaacgataattaacaaaatagtcctaatcaatcc 26895684  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26895685 cttgagttaagactctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 26895784  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  26895785 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcaatcgttctcactaaatcatgt 26895884  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  26895885 ttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaactgaattaaatagaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggatca 26895984  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  26895985 att 26895987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31863856 - 31863438
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31863856 ctttcgaatcatctatgttcccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 31863757  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31863756 cttgagttaggatcctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 31863657  T
Q  199 acgat--------------tatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcatt 284  Q
    |||||              ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31863656 acgatcactaacaaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcatt 31863557  T
Q  285 ctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagta-ttaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttc 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31863556 ctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcatttaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataaagtttc 31863457  T
Q  382 acagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  31863456 acagcaacatgtttcaatt 31863438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40583390 - 40582988
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40583390 ctttcgaatcctcgatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctataattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 40583291  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40583290 cttgagttatgaccctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaagaaa 40583191  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    |||||||| |||| |||||||||| | || |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  40583190 cgattatctattcctagactaaccatctttattagaacaatttaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatat 40583091  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40583090 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 40582991  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  40582990 att 40582988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17664670 - 17664291
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17664670 ctaattggtatactgcacctattct-atgtatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttcta 17664572  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
    | | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  17664571 agattacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatcgattcctagactaa 17664472  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    || |||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17664471 ccatgtttattagaacaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 17664372  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17664371 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 17664291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 42063063 - 42062660
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  42063063 cttttgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatct 42062964  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42062963 cttgagttaggaccctcttctcatattacagtccctaattccttaggtgaactaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 42062864  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  42062863 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 42062764  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  42062763 tttatatttgattaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcactgcaacttggttc 42062664  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  42062663 aatt 42062660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 22936940 - 22937321
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22936940 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccctttagttaggaccctcttctc 22937039  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    | | ||| | | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22937040 agattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagacta 22937139  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22937140 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataa 22937239  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  22937240 aatgcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacttggttcaatt 22937321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43491897 - 43491494
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43491897 ctttcgaatcatctatgttcccctaatcggtatattgcatctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcc 43491798  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43491797 cttgagttagaaccctcttctcaaactagaccccctaattccttaggtggtttaataatctttgaagattttatgcacgttaacctaatatcactaacaa 43491698  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  43491697 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcata 43491598  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||    
T  43491597 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaataacaattgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatgtttc 43491498  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  43491497 aatt 43491494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7625222 - 7624841
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7625222 ctaattggtatactacacctatttgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggactctcttctc 7625123  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7625122 aaactacagcctctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagacta 7625023  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7625022 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcatttgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataa 7624923  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  7624922 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatcaatt 7624841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 14016119 - 14016522
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14016119 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatagtgcacctattcgtattaatgattttctagttccacggtagttaacaaaatagccctaatcaatcc 14016218  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14016219 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaatttcttaggtggtttaataattctcgaaggtttaaagcactttaacctaatatcactaacaa 14016318  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14016319 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 14016418  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  14016419 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 14016518  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  14016519 aatt 14016522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 26907436 - 26907838
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26907436 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcattagttctacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 26907535  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     |||  ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26907536 cttgagttaggaccctcttctagggttacaacctgtaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcaccaataaa 26907635  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26907636 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaagtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 26907735  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  26907736 ttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaattaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatgtttca 26907835  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  26907836 att 26907838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 34132964 - 34133366
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34132964 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 34133063  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34133064 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 34133163  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  34133164 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatat 34133263  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  34133264 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataaagtttcacagcaacatgtttca 34133363  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  34133364 att 34133366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 34143195 - 34143597
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34143195 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 34143294  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34143295 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 34143394  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  34143395 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatat 34143494  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  34143495 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataaagtttcacagcaacatgtttca 34143594  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  34143595 att 34143597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 14375798 - 14376193
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccctt-------------gagtta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||             ||||||    
T  14375798 ctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccttgagtta 14375897  T
Q  109 ggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatcc 208  Q
    ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14375898 ggaccctctactcaaactacagaccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactagcaaacgattatcc 14375997  T
Q  209 attcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttg 308  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14375998 attcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttg 14376097  T
Q  309 atcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtt--tcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||    
T  14376098 atcagaatataacaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcgcaataaataaagtttctcacagcaacatgtttcaatt 14376193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 12088099 - 12087697
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12088099 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 12088000  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12087999 cttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 12087900  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  12087899 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatat 12087800  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  12087799 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataaagtttcacagcaacatgtttca 12087700  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  12087699 att 12087697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26292930 - 26292530
Alignment:
Q  3 ttcgaatcatctaagttc-tctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccct 101  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  26292930 ttcgaatcatctatgctcctctaattggtatactgcacctattcttatcaatgattcgctagttccatgatagttaaccaaatagtccgaaccaatccct 26292831  T
Q  102 tgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacg 201  Q
    ||||||| ||||||||| |     |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26292830 tgagttacgaccctcttatagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaagg 26292731  T
Q  202 attatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgttt 301  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26292730 attatacattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcggtagtcattcgttctcactaaatcatgttt 26292631  T
Q  302 atatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  26292630 atatttgatcaggatataaatagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttcaat 26292531  T
Q  400 t 400  Q
    |    
T  26292530 t 26292530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 28787332 - 28787706
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataat--caatcccttgagttaggaccctcttc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  28787332 ctaattggtatactgcacctattctgatgaatgattttctaattccacaatagttaacaaaatagtcttaatttcaatcccttgacttag-accctcttc 28787430  T
Q  120 tcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagact 219  Q
    |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28787431 tcaaactacaacccataattccttagctggtctaataa--------ggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagact 28787522  T
Q  220 aaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat-gtttatatttgatcaggatat 318  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  28787523 aaccttgtttattagaacaattcaattatgtccaagtagaaaactatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatagtttatatttgattaggatat 28787622  T
Q  319 aaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag--tttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  28787623 aaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagactttcacagcaacatgattcaatt 28787706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 12058473 - 12058867
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12058473 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 12058572  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12058573 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 12058672  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  12058673 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatat 12058772  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  12058773 ttatatttgaccaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagaatgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 12058867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39192471 - 39192095
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttct--agttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaat 97  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39192471 ctttcgaatcatcaatgttcccctaattgatataatgcacgtattcttatgaatgattctctctagttgcacgatagttaacaaaatagtcataatcaat 39192372  T
Q  98 cccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39192371 cccttgagttaagaccctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtataataatctttcaaggtttaagcacattaacctaatatcactaaca 39192272  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||    
T  39192271 aacgattatctattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaggtcgaaagctatggtcaatagtcatttgttctcattaaatcat 39192172  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 374  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39192171 atttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaattagattatcattcacaataaa 39192095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17748577 - 17748187
Alignment:
Q  5 cgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttg 103  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17748577 cgaatcatctatgttcccctaattggtataccgcacctatttttgtgaatgagtccctagtttaacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttg 17748478  T
Q  104 agttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgat 203  Q
    |||||||||||||||||     ||| ||| |||||| |||| ||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17748477 agttaggaccctcttctagggttacagcccctaatttcttaagtgatctaataaccgtcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggat 17748378  T
Q  204 tatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttat 303  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17748377 tatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattagttctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttat 17748278  T
Q  304 atttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  17748277 atttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 17748187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 90 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2837355 - 2837071
Alignment:
Q  90 taatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaata 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||    
T  2837355 taatcaatcccttgatttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaacgttaacctatta 2837256  T
Q  189 tcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctca 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2837255 tcactaataaacgattatccattcataaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctga 2837156  T
Q  289 ctaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa 373  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837155 ctaaatcatgtttatatttgatcgggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa 2837071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 135 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30066348 - 30066081
Alignment:
Q  135 taattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  ||||    
T  30066348 taattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctaatatctctaacaaacgattatccactcctagactaaccatgtttgttag 30066249  T
Q  235 aacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaat 334  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30066248 aacaattcatttaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcattaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaat 30066149  T
Q  335 aattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30066148 aattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 30066081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21915243 - 21914862
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttc 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||  || |||| || |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21915243 ctaattggtacactacacctatttcttatgaatatttctctaatttcacgatggttaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttatgaccctcttc 21915144  T
Q  120 tcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagac 218  Q
    ||| | ||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  21915143 tcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggtttgaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattattcattcctagac 21915044  T
Q  219 taaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatat 318  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  21915043 taaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaatcatgtttatatttgatcaggctat 21914944  T
Q  319 aaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa-atagtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  21914943 aaaaatcattaagaacaattgaattgaat-aaaactagattgattttcacaataatagagtttcatagcaacatggttcaatt 21914862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 11959159 - 11959545
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||| | ||||||||||    |||| |||||||||||    
T  11959159 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgagtccctagttctatgatagttaac----tagttataatcaatcc 11959254  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
     ||||||||| ||||||||||     ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11959255 tttgagttagaaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtgtaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 11959354  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctg-tctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
     |||||||  ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  11959355 ggattatc--tt--tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaaggtctaagtcgaacgctatggttagtagtcattcgttctcactaaatcatg 11959450  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  11959451 tttatatttgatcag-atataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttaacagcaacatg 11959545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 152 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32838007 - 32837759
Alignment:
Q  152 taataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgt 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||    
T  32838007 taataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggt 32837908  T
Q  251 ctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaa 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  32837907 ctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcac-aaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcatt--gaacaattgaattgaataaa 32837811  T
Q  351 aactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  32837810 aactagattgtcattcataataaatagagtttcacagcaaaatggttcaatt 32837759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Original strand, 18239476 - 18239854
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  18239476 ctttcgaatcctctgagttcccctaattggtgtactgcacctatttctttcgaatgattctctagtttcacgataattaacaaaatagccctaatcaatc 18239575  T
Q  99 ccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||| | ||   || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||  | |    
T  18239576 ccttgacttaggacccccttgtcagagtaaaacccctaatttcttaggtggtctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatattacatata 18239675  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18239676 aacgattatccattcctagactagccttgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttcaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaatcat 18239775  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 377  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  18239776 gtttatatttgat-aggatataaaaagcatgaagaacaattgaatttaataaaaagtagattttcattcacaatagatag 18239854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37215185 - 37215019
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37215185 ctttcgaatcatctaagttccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 37215086  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37215085 ttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg 37215019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23044123 - 23043904
Alignment:
Q  182 cctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 281  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  23044123 cctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggccagtagtcattc 23044024  T
Q  282 attctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag-ttt 380  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23044023 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagattt 23043924  T
Q  381 cacagcaacatggttcaatt 400  Q
    || | |||||||||||||||    
T  23043923 cataacaacatggttcaatt 23043904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22131371 - 22131159
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||     
T  22131371 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtatgaatgattctctagttctacgatagttaacaaaatattcctaatcaatct 22131272  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22131271 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacacctaattccttaggtggtttaataatccttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaataa 22131172  T
Q  199 acgattatccatt 211  Q
    |||||||||||||    
T  22131171 acgattatccatt 22131159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 207 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22130198 - 22130004
Alignment:
Q  207 ccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatt 306  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22130198 ccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctagggtccgtagtcattcaatctcacaaaatcatgtttatatt 22130099  T
Q  307 tgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  22130098 tgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattg-ataaaaactagattgtcattcataataaatagagtttcacagcaatatggatcaatt 22130004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31575533 - 31575159
Alignment:
Q  26 ttggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatccctt-gagttaggaccctcttctca 122  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||  || ||||||| |||||| |||||| |||||||   ||||||||||||| || || |||| |||||||||    
T  31575533 ttggtacactgcagctatttcatatgaatatttctctagtttcacgatggttaactaaaatagctctaatcaatccctttgacttgggactctcttctca 31575434  T
Q  123 aactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaac 222  Q
    || ||| | | |||||||| |||||  ||||||| |||||||||    ||| | |||||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||| ||||    
T  31575433 aattacagtctctaattccctaggtaatctaatattctttgaagtaaaaagaaagttaacctaatatcacaaataaacgaatatccattctcagaataac 31575334  T
Q  223 cctgttcattagaacaattcaatt--ctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    |||||| ||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||   | | |||| |||||||||| | || | ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31575333 cctgtttatttgaacaattcaattaggtgtctaagttgaaagcta---taattagtaattcattctctcgaatttatg-ttatatgtgatcagtatataa 31575238  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaa 398  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  31575237 aaagcattatgaacaattgaattaaat-aaaactagattgatattcacatgaaatagagtttcacaacaacatggttcaa 31575159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 30066450 - 30066348
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30066450 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccgcgatagttaacaaaatagtgctaatcaatcc 30066351  T
Q  100 ctt 102  Q
    |||    
T  30066350 ctt 30066348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23044283 - 23044163
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  23044283 cttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcagtagtttcacgatagttaacaaaataatcttaatcaatgc 23044184  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttct 120  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23044183 cttgagttaggaccctcttct 23044163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 283
Target Start/End: Original strand, 18765647 - 18765907
Alignment:
Q  26 ttggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaa 123  Q
    |||||| |||||||||||| | |||| ||  || |||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| | |     
T  18765647 ttggtaaactgcacctatttcctatgcatacttctctagttttacgatggttaactaaaatagttataatcaatcccttgagttagatccctcttgttag 18765746  T
Q  124 actactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaac 222  Q
      |||  |  ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||  |||| |||||||||    
T  18765747 cttacaactcctaattccttaagtggtctaacattcttcgaaggttttaagagcgttaacctaatatcacaaataaatgattatttattcctagactaac 18765846  T
Q  223 cctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcat 283  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |  |||||||| | |||||| | | |||||||||||||    
T  18765847 cctgtttatttgaacaattcaaataggtctaagtcgtaagctaggattagtagtcattcat 18765907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 309 - 400
Target Start/End: Original strand, 28441425 - 28441518
Alignment:
Q  309 atcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  28441425 atcagaatataaaaaatattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatgtttcaatt 28441518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 256
Target Start/End: Original strand, 563340 - 563497
Alignment:
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt---aagcacgttaacctaatatcactaac 196  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||  || ||||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||||   |||||  ||||| ||||||||| |      
T  563340 cttgagttagaaccctcttgtcggattacaacccctaattctttaggtgatctaatattcttcaaaggttttcaaagca--ttaacataatatcacaatt 563437  T
Q  197 aaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagt 256  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||  ||||||||    
T  563438 aaacgattattcattcctagactaaccttgtttagttgaacaattcaattaggtctaagt 563497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 351
Target Start/End: Original strand, 563519 - 563555
Alignment:
Q  315 atataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaa 351  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  563519 atataaaaagtattaagaacaattaaattgaataaaa 563555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 3769 - 4172
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3769 ctttcgaatcatctatgttaccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 3868  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  3869 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaatatcactaacaa 3968  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3969 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 4068  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4069 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacagttgaattgaataaaaactagattttcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 4168  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  4169 aatt 4172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2379373 - 2378970
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2379373 ctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 2379274  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2379273 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcctgtaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 2379174  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2379173 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 2379074  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  2379073 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacatcaatatggttc 2378974  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  2378973 aatt 2378970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 3596762 - 3597165
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3596762 ctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 3596861  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  3596862 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaatatcactaacaa 3596961  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3596962 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatttattctcactaaatcatg 3597061  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3597062 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcaaaataaatagagtttcacagcaacatggttc 3597161  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  3597162 aatt 3597165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20185886 - 20185485
Alignment:
Q  2 tttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20185886 tttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 20185787  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  20185786 ttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaatgttaacctaatatcactaataaac 20185687  T
Q  201 gattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20185686 gattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtt 20185587  T
Q  301 tatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  20185586 tatatttgatcaggatataaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcactgcagcatggttcaa 20185487  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  20185486 tt 20185485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 22150105 - 22150506
Alignment:
Q  2 tttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22150105 tttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 22150204  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22150205 ttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaatgttaacctaatatcactaataaac 22150304  T
Q  201 gattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22150305 gattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtt 22150404  T
Q  301 tatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  22150405 tatatttgatcaggatataaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcactgcagcatggttcaa 22150504  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  22150505 tt 22150506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 5738087 - 5738468
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5738087 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 5738186  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5738187 aaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagacta 5738286  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5738287 accctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataa 5738386  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  5738387 aaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatagatcaatt 5738468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 26942416 - 26942818
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26942416 ctttcgattcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcctatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 26942515  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26942516 cttgagttaggaccctcttctcaaattacagcccctaattccttaggtggtctaataaactttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 26942615  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26942616 cgattatccattcctagactaaccttgtttatcaaaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 26942715  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26942716 ttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaacgagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 26942815  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  26942816 att 26942818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9954106 - 9953705
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9954106 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 9954007  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9954006 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 9953907  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9953906 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 9953807  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  9953806 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaacaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttca 9953707  T
Q  398 at 399  Q
    ||    
T  9953706 at 9953705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30655587 - 30655184
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30655587 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacttattcttatgaatgattctctagttccataatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 30655488  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30655487 cttgaattaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 30655388  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30655387 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 30655288  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  30655287 tttatatttgatcgggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaatatggttc 30655188  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  30655187 aatt 30655184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10290115 - 10289713
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctct-aattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10290115 ctttcgaatcatctatgttccccgaattggtatactgcacttattcttatgaattattttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 10290016  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
     || | |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10290015 tttaacttaggaccttcttctcaaattacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacattaacctaatatcactaacaaa 10289916  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10289915 cgattatccattcctagactaaccttgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 10289816  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10289815 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaaatgtattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 10289716  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  10289715 att 10289713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11402400 - 11401997
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11402400 ctttcgattcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgtttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 11402301  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11402300 cttgagttaggaccctcttcttatactatatcccctaattccttaggtgttctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 11402201  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  11402200 acgattatccattcctagattaaccctgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 11402101  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11402100 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 11402001  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  11402000 aatt 11401997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 1125716 - 1126110
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1125716 ctttcgaatcatttatgttctcctaattggtatactggacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 1125815  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1125816 cttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataa 1125915  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  1125916 aggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagttattccttctcactaaatcatg 1126015  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacat 391  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  1126016 tttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaatgaatagagtttcacagcaacat 1126110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 11125678 - 11126079
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  11125678 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatct-ctagttccacgatagttaacaaaatagtcctgatcagtcc 11125776  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11125777 cttgagttaggaccctcttcacaaactaaagcccatattttcttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaaccaaatatcagtaacaaa 11125876  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  11125877 cgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttttcactaaatcatgt 11125976  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  11125977 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataaagtttcacaacaacatggttca 11126076  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  11126077 att 11126079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 9839375 - 9839778
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  9839375 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaagtagccctaatcaatcc 9839474  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | |||||||| ||||||||| || ||    
T  9839475 cttgacttaggaccctcttctcaaactacagtccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaagttttacgaacgttaacttaatatcacaaataa 9839574  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9839575 acgattatccattcctagactaaccatatttatttgaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatagtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 9839674  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  9839675 tttatatttgataaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaatagagtttcacagcaacatgtttc 9839774  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  9839775 aatt 9839778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 22561144 - 22561547
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22561144 ctttcaaatcatctacgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctggtttcacgatagtcaacaaaatagtcttaatcaatcc 22561243  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||  || ||    
T  22561244 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctcataatctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcagaaataa 22561343  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22561344 acgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaaatcaattaggtctaagtagaaagctattgttagtagtcattcattctcactaaatcatg 22561443  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  22561444 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtccttcacaataaatagagtttcacagcaacatgattc 22561543  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  22561544 aatt 22561547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 23384733 - 23385048
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23384733 ctttcgattcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgtttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 23384832  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23384833 cttgatttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagttgttctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 23384932  T
Q  200 cgat--tatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23384933 cgattatatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcat 23385032  T
Q  298 gtttatatttgatcag 313  Q
    ||||||||||||||||    
T  23385033 gtttatatttgatcag 23385048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4512619 - 4512213
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4512619 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcattagttccacgataattaacaaaatagtcataatcaatcc 4512520  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactact----gccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaa 195  Q
     ||||||| ||||||||||||     ||||    ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4512519 attgagttcggaccctcttctagggttacttgtagcccctaattccttaggtggtctactaacttttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaa 4512420  T
Q  196 caaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatg 295  Q
     ||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  4512419 taaatgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattcagtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatc 4512320  T
Q  296 atgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatgg 393  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4512319 atgtttatatttgatcacgagataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgg 4512220  T
Q  394 ttcaatt 400  Q
    |||||||    
T  4512219 ttcaatt 4512213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6513399 - 6512993
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6513399 ctttcgaatcatctatattcccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 6513300  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6513299 cttgagttaggactctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacctaatatcactaataa 6513200  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  6513199 acgattattcattcgtagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcattctcatgaaatcatg 6513100  T
Q  299 tttatattt----gatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag-tttcacagcaacatgg 393  Q
    ||||||| |      |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  6513099 tttatatatatggtgtcaatatataaaaagtattaagaacaattgaattgagtaaaaactagattgtcattcacaataaatagaggtcacaacaacatgg 6513000  T
Q  394 ttcaatt 400  Q
    |||||||    
T  6512999 ttcaatt 6512993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Original strand, 28111773 - 28112148
Alignment:
Q  26 ttggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28111773 ttggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttctacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaac 28111872  T
Q  126 tactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccct 225  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |    
T  28111873 tacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattcttcattcctagactaaccat 28111972  T
Q  226 gttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagt 325  Q
    ||| |||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    | |  ||||||||||     
T  28111973 gtttattagatcaattcaatttggtctaagtcg-aagctatggttagtagtcattcaatctcactaaatcatgtttatatagtgttaatatataaaaagc 28112071  T
Q  326 attaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  28112072 attaagaacaattgacttgaataaaaactagtttgtcattcacagtaaatagagtttcacaacaacatggttcaatt 28112148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28230715 - 28230343
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28230715 ctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttcta 28230616  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
        ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  28230615 gggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaa 28230516  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    || |||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28230515 ccatgtttattagaacaaatcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaa 28230416  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  28230415 aagcattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 28230343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24400322 - 24399928
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24400322 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtgaacgattcactagttctacgatagttaacaaattagtcctaatcaatcc 24400223  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||| ||| |||||||||| || |   |||  || ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24400222 cttaagtgaggaccctctcctaaggttacaacccctaattcctcaggtggtctaataaccgtcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 24400123  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24400122 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggttagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 24400023  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24400022 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 24399928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 14281501 - 14281904
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14281501 ctttcgaatcatctatgttcccctaattgggatactgcacctattcttatgaatgattctcttgtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 14281600  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14281601 cttaagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacctaatatcactaataa 14281700  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  14281701 acgattatcaattcctagactaaccatgtttattagaacaattgaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcattcattctaacgaaatcatg 14281800  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||    |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  14281801 tttatatggtgtcaatatataaaaagcaataagaacaattgaattgaataaaaactagattgttattcaaaataaatagagtttcacaacaacatggttc 14281900  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  14281901 aatt 14281904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24410441 - 24410048
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  24410441 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtgaacgattcactagttctacgatagttaacaaataagtcctaatcaatcc 24410342  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| || |   ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24410341 cttgagtcaggaccctctcctaaggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgtcggaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 24410242  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24410241 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 24410142  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  24410141 ttatatttgatca-gatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcaccataaatagagtttcacagcaacatg 24410048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13005332 - 13004929
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13005332 ctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatacttcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 13005233  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaa-ggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13005232 cttgagttatgaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaattttttaagtacgttaacctaatatcactaataa 13005133  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| || | |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13005132 acgattatctattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggccagtagtcattcattctcacgaaatcatg 13005033  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||    |||  |||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  13005032 tttatatggtgtcaatatataaaaaggatcaagaacaattaaattcaataaaaactagattgtcatttacaataaatagagtttcacaacaacatggttc 13004933  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  13004932 aatt 13004929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 17106591 - 17106875
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17106591 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 17106690  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17106691 cttgacttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaa 17106790  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcatt 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17106791 cgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcgttcatt 17106875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19476145 - 19475743
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19476145 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtctctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcagtcc 19476046  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     |||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||    
T  19476045 cttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttttaacacgttaacctactatcactaataaa 19475946  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |    
T  19475945 ggattatccattcctaggctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaaactatggtcagtagtcgttcgttctcactaaatcatat 19475846  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  19475845 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaaatgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataaagtttcacagcaacatgtttca 19475746  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  19475745 att 19475743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2846447 - 2846042
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatc 98  Q
    |||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2846447 ctttcgaatcctctaagtccccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaatagccataatcaatc 2846348  T
Q  99 ccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt--aagcacgttaacctaatatcactaac 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| ||     
T  2846347 ccttgacataggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaaagaacgttaacttaatatcacaaat 2846248  T
Q  197 aaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatga 296  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  2846247 aaaagattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagtagtcattcattatcacgaaatca 2846148  T
Q  297 tgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggt 394  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||  |    
T  2846147 tgtttatattttatcatgatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgttattcacaatatatagagtttcacaacaacatatt 2846048  T
Q  395 tcaatt 400  Q
    ||||||    
T  2846047 tcaatt 2846042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 18856006 - 18856400
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18856006 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttgcgatagttaacaatatagtcctaatcaatcc 18856105  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||| ||||||||     |||  |  |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18856106 cttgagttaggaacctcttctagggttacaactcctaatttcttaggtggtctgctaacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 18856205  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  18856206 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatat 18856305  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  18856306 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 18856400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 28107769 - 28108172
Alignment:
Q  2 tttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28107769 tttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacagctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcctaatcaatccc 28107868  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataa---tctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  28107869 ttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaatttcttacgtggtctaataatattctttgaaggtttaagtacgttaacctaatatgactaata 28107968  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    | |||||||||||||   |||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  28107969 atcgattatccattccatgactaaccgtgtttattagaacaattcaattaggtctaagt-caaagctatgatcattagtcattcattctctctaaatcat 28108067  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggtt 395  Q
    ||||||||    |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  28108068 gtttatatagtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcatagtaaatagagtttcacaacaacatggtt 28108167  T
Q  396 caatt 400  Q
    |||||    
T  28108168 caatt 28108172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13947161 - 13946791
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13947161 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaattaatcc 13947062  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||| ||||||||||      |||  || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13947061 cttgagttatgaccctcttcgagggttacaacccctaattccttaggtggtttaataacctttgaaggtttaagcacgttaatctaatatcactaataaa 13946962  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || |    
T  13946961 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcatttgttctcactaaatcatat 13946862  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaa 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13946861 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaa 13946791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11247883 - 11247502
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttct 120  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  11247883 ctaatttgtatactacacttatttcttacgaatgattctctagtttcatgatggttaacaaaatatccttaatcaatcccttgacttagaactctcttat 11247784  T
Q  121 caaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagact 219  Q
    || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  11247783 cagattacagcc-ctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattattcattcctagact 11247685  T
Q  220 aaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatata 319  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11247684 aaccatgtttatttgaacaattcaattatgtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgtaatcatgtttatatttgattaggatata 11247585  T
Q  320 aaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag--tttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  11247584 aaaagcattaagaacaattgaatttaataaaaactagattatcattcacaatagatagactttcacagcaacatgtttcaatt 11247502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 12988104 - 12988507
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattctt-atgaatgattttctagttccacgatagttaacaaa-atagtcataatcaat 97  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | ||||||  || |||||||  |||||  |||||| | ||||   ||||||||    
T  12988104 cttttgaatcctctaagttcccgtaattggtacactgcacctattcctcatgaatatttctctagttttacgatgattaacatacatagctctaatcaat 12988203  T
Q  98 cccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaac 196  Q
    ||||||| |||||||||||||| || | ||| | | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||     
T  12988204 cccttgacttaggaccctcttcgcatattacagtccctaattccttaggtgatctaatattcttagaagatttgaagaacgctaacctaatatcacaaat 12988303  T
Q  197 aaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatga 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12988304 aaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattatgtctaagttgaaagttatggtcagtagtcattcattctcacgaaatca 12988403  T
Q  297 tgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa-atagtttcacagcaacatggtt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  12988404 tgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaaatattgaattgaat-aaaactagattgatattcacaataatagagcttcacagcaacatggtt 12988502  T
Q  396 caatt 400  Q
    |||||    
T  12988503 caatt 12988507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5260024 - 5259677
Alignment:
Q  53 tgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtct 152  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||   | ||| || ||||||||||||    
T  5260024 tgattctctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcttaaaatac---ccctattttcttaggtggtct 5259928  T
Q  153 aataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtc 251  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||    
T  5259927 aatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattacccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtc 5259828  T
Q  252 taagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaa 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    |||  || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5259827 taagttgaaagctatggtcagtagtcattcattcttacagaatcatgtttatatggtgtcaatatctaaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaa 5259728  T
Q  352 actagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  5259727 actagattgtcattcacaatagatagagtttcacaacaacatgtttcaatt 5259677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 13021233 - 13021636
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaat 97  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || ||||||  || |||||||  |||||  ||||| ||||||| | ||||||||    
T  13021233 cttttgaatcctctaagttcccctaattggtacactgcacctatttctcatgaatatttctctagttttacgatgattaactaaaatagccctaatcaat 13021332  T
Q  98 cccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaac 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||  | | |||| |||||| ||| ||||||| |||| |||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||     
T  13021333 cccttgacttaggaccctcttctcagattatagtccctaactccttaagtgatctaatattcttagaagatttgaagaacattaacctaatatcacaaat 13021432  T
Q  197 aaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatga 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||| |    
T  13021433 aaacgattatccattcctagactaacgatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagttatgatcagtagtcattcattcttacgaaatca 13021532  T
Q  297 tgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa-atagtttcacagcaacatggtt 395  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  13021533 tgtttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaaatattgaattgaat-aaaactagattgatattcacaataatagagcttcacaacaacatggtt 13021631  T
Q  396 caatt 400  Q
    |||||    
T  13021632 caatt 13021636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 400
Target Start/End: Original strand, 11188130 - 11188299
Alignment:
Q  233 agaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaaga 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11188130 agaacaattcaattctgtttaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaaga 11188229  T
Q  333 ataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11188230 acaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 11188299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7128442 - 7128199
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7128442 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtataatgcacatattattgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 7128343  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7128342 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacatttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 7128243  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattca 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7128242 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 7128199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 102 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31072332 - 31072045
Alignment:
Q  102 tgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaaac 200  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||              ||||    
T  31072332 tgagttagggctctcttctcaaactacagcccctaattttttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaac--------------aaac 31072247  T
Q  201 gattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtt 300  Q
    |||||||||||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31072246 gattatccattcctagaccagccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtt 31072147  T
Q  301 tatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  31072146 tatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcgcagcaacatggatcaa 31072047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 248 - 398
Target Start/End: Original strand, 23388326 - 23388478
Alignment:
Q  248 tgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23388326 tgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaat 23388425  T
Q  348 aaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaa 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23388426 aaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaa 23388478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 134 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24371284 - 24371065
Alignment:
Q  134 ctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcatt 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  24371284 ctaattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacattaacctattatcacaaataaacgattatccattcctagactaacccggtttatt 24371185  T
Q  233 agaacaa-ttcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaag 331  Q
     |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24371184 tgaacaaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcattatatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaag 24371085  T
Q  332 aataattgaattgaataaaa 351  Q
    || |||||||||||||||||    
T  24371084 aacaattgaattgaataaaa 24371065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23008167 - 23007932
Alignment:
Q  37 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccacta 136  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||| |||    
T  23008167 cacctattcttgtgaatgattctttagtttcacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattacagcctcta 23008068  T
Q  137 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattaga 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||    
T  23008067 attccttaggtggtctaatattctttaaaggttttaagaacgttaacctgatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttga 23007968  T
Q  236 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtca 271  Q
    ||| |||| ||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  23007967 acagttcagttaggtctaagttgaaagttatggtca 23007932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 271
Target Start/End: Original strand, 23780197 - 23780432
Alignment:
Q  37 cacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccacta 136  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||| |||    
T  23780197 cacctattcttgtgaatgattctttagtttcacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattacagcctcta 23780296  T
Q  137 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattaga 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||    
T  23780297 attccttaggtggtctaatattctttaaaggttttaagaacgttaacctgatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttga 23780396  T
Q  236 acaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtca 271  Q
    ||| |||| ||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  23780397 acagttcagttaggtctaagttgaaagttatggtca 23780432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26896240 - 26896463
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26896240 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttccacaataattaacaaaatagccataatcaatcc 26896339  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
     |||||||  |||||||||||     ||| ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  26896340 attgagtttagaccctcttctagggttacagcccctaatttcttaggtggtctcataacctttgaaggtttaagcacattaacctaatatcactaataaa 26896439  T
Q  200 cgattatccattcatagactaacc 223  Q
     |||||||||||| |||| |||||    
T  26896440 ggattatccattcgtagagtaacc 26896463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 256 - 400
Target Start/End: Original strand, 28665501 - 28665647
Alignment:
Q  256 tagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaacta 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28665501 tagaaaactatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttttatttgatcatgatataaaaaatattaagaacaattgaattgaataaaaacta 28665600  T
Q  356 gattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28665601 gattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 28665647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28848926 - 28848634
Alignment:
Q  59 tctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataa 157  Q
    |||||||  ||||| |||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||| |||     
T  28848926 tctagttttacgatggttaactaaaatagtcctgataaatcccttgacttagggccctcttctcaaattacagtccctaattccttaggtgatctgatat 28848827  T
Q  158 tctttgaaggttta-agcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagt 256  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||| |||    
T  28848826 tctttgaaggttttgagaacgttaacctattatcacaaataaacgattatctattcctagactaaccttgtttatttgaacaattcaattaggtctgagt 28848727  T
Q  257 agaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaa 350  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  28848726 tgaaagctatgttcagcagtcattcattctcacgaattca-ggttatatatgatcagtatataaaaaacattaagaacagttgaattgaataaa 28848634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 98 - 400
Target Start/End: Original strand, 11192657 - 11192961
Alignment:
Q  98 cccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaac 196  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||     
T  11192657 cccttgacttaagactctcttctcagactacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaat 11192756  T
Q  197 aaacgattatccattcatagactaa----ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagta-gaaagctatggtcagtagtcattcattctcacta 291  Q
    ||||||||||||| || ||||||||    ||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||    |||| |    
T  11192757 aaacgattatccaatcctagactaattaaccctgtttatttgaacatttcaattaggtctaagtgtgaaacctatggtcagtagtcattc----tcacga 11192852  T
Q  292 aatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa-atagtttcacagcaaca 390  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||| |    
T  11192853 aatcatgtttatatttgattagcatatagaaagcattaagaacaattaaattgaat-aaaactagattgatattcacaataatagagtttcacaacaata 11192951  T
Q  391 tggttcaatt 400  Q
    || |||||||    
T  11192952 tgattcaatt 11192961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 225 - 400
Target Start/End: Original strand, 26898075 - 26898252
Alignment:
Q  225 tgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaag 324  Q
    |||| |||||||||| | ||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  26898075 tgtttattagaacaacttaattaggtctaattcgaaagctagggtcagtagtcattcgttgtcactaaatcatgtttaaatttgatcaggatataacaag 26898174  T
Q  325 tattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa--atagtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26898175 cattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatatagtttcacagcaacatgtttcaatt 26898252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 175 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2372289 - 2372104
Alignment:
Q  175 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||    |||||||    
T  2372289 acgttaacctaatatcactaataaacgattattcattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagc----gtcagta 2372194  T
Q  275 gtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcat 364  Q
    |||||  |||||||| |||| | ||||||||    |||  |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2372193 gtcatcaattctcacgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaacattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcat 2372104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23847889 - 23847784
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  23847889 ctaattggtatactgcacctattct-atgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcttaatcaatctcttgagttaggtctctcttctc 23847791  T
Q  122 aaactac 128  Q
    |||||||    
T  23847790 aaactac 23847784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 32109811 - 32109685
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  32109811 ctttcgaatcatcaatgttcccctaatttgtatgctgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgataattaacaaaatagttctaatcaatcc 32109712  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaact 126  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  32109711 cttgagttatgaccctcttctcaaact 32109685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 23842801 - 23842906
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23842801 ctaattgttatattgcacttattcttataaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttaggaccctcttctc 23842900  T
Q  122 aaacta 127  Q
    ||||||    
T  23842901 aaacta 23842906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 2372396 - 2372293
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2372396 ctttcgaatcatctatgttcccctagttggtatactgcacatattcttatgaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 2372302  T
Q  100 cttgagtta 108  Q
    |||||||||    
T  2372301 cttgagtta 2372293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 120
Target Start/End: Original strand, 23667721 - 23667771
Alignment:
Q  70 gatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttct 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667721 gatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttct 23667771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 24155347 - 24155434
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagt 87  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  24155347 ctttcgaatcatatatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaagtagt 24155434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 3)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 8200 - 8602
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8200 ctttcgaatcatttatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctatttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcgatcc 8299  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8300 cttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcacaaacaaa 8399  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8400 cgattatccattcctagactaaccaagtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 8499  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaata--gtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  8500 ttatatttgattaggatataaaaagcattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagtgtttcacatcaacatggttca 8599  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  8600 att 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 1530 - 1780
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1530 ctttcgaatcatatattttccctaattggtaaactgcacctattcttatgaatgattgtctagttacacaatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 1629  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaac 200  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1630 ttgacttaggaccgtcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaagtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaac 1729  T
Q  201 gattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtc 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1730 gattatccattcctagactaaccctgtttattagaataattcaattctgtc 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 400
Target Start/End: Original strand, 4191 - 4363
Alignment:
Q  230 attagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtatta 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  4191 attagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaaagcttta 4290  T
Q  330 agaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaata--gtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  4291 agaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagtgtttcacatcaacatggttcaatt 4363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 12583124 - 12582744
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12583124 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttgacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctc 12583025  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12583024 aaactacaacccctaattccttaggtggtgtaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacaattatctattcctagactaa 12582925  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12582924 ccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 12582825  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  12582824 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatagttcaatt 12582744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16953915 - 16953512
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16953915 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 16953816  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  16953815 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggcggtctaataattctcgaaggtttaaagcacattaacctaatatcattaacaa 16953716  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  16953715 acgattatccattcctagactaaccctgtttataagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtaagtagtcattcattctcactaaatcata 16953616  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16953615 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 16953516  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  16953515 aatt 16953512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 18721262 - 18721664
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18721262 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 18721361  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18721362 cttgagttatgactctcttctcatactacagcccctaatttcttagttggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 18721461  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18721462 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaataattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 18721561  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18721562 tttatatttgatcagtatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 18721661  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  18721662 aat 18721664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13196995 - 13196600
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctct-aattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13196995 ctttcaaatcatctatgttctcttaattggtatactgcacttattcttatgaatgattttctagttccaagatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 13196896  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13196895 cttgagttaggaccctcttctcgaactacaacccctaatttcttaggtagtctaataatctttgaaggtttgagcacgttaacctaatatcactaacaaa 13196796  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13196795 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagttatggtcggtagtcattcgttctcactaaatcatgt 13196696  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa--atagtttcacagcaacatgg 393  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13196695 ttttatttgatcaggatataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcgttcacaataaatatagtttcacagcaacatgg 13196600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14421884 - 14421480
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattctta-tgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatc 98  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14421884 ctttcgaatcatctatgttcccctaattgatatactgcacctattcttactgaatgattttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatc 14421785  T
Q  99 ccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  14421784 ccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctgataatctttgaaggttttaagaacgttaacctagtatcactaata 14421685  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14421684 aaggattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcat 14421585  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggtt 395  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||    
T  14421584 ctttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaattaatagagtttcacagcaacatgttt 14421485  T
Q  396 caatt 400  Q
    |||||    
T  14421484 caatt 14421480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17931096 - 17930717
Alignment:
Q  23 taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctca 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17931096 taattggtatattgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttacgaccctcttctca 17930997  T
Q  123 aactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaac 222  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17930996 aactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttgatcttatatcactaacaaacgattatccattcctatactaac 17930897  T
Q  223 cctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaa 322  Q
    | |||| | |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17930896 catgtttactagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaa 17930797  T
Q  323 agtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17930796 agcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggatcaatt 17930717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 5980294 - 5980696
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctct-aattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5980294 ctttcgaatcatctatgttcccttaattggtatactacacctattcttatggatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 5980393  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5980394 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagtccgtaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 5980493  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    |||||||||||   |||||||| | |||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5980494 cgattatccatatctagactaaacttgtttattagaacaagtcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 5980593  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag--tttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  5980594 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaatttaattgaataaaaactagattgacattcacaataaatagattttcacagcaacatggatca 5980693  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  5980694 att 5980696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 18824376 - 18824778
Alignment:
Q  2 tttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18824376 tttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgatcttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatccc 18824475  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18824476 ttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 18824575  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18824576 cgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 18824675  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  18824676 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatca 18824775  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  18824776 att 18824778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 25594638 - 25595040
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25594638 ctttcgaatcatctatcttcccctaattagtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 25594737  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  25594738 cttgagttaagactctcttctcaaactacagcccataattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcagtaataa 25594837  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25594838 aggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaaatcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 25594937  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25594938 tttatacttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttc 25595037  T
Q  397 aat 399  Q
    |||    
T  25595038 aat 25595040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 399
Target Start/End: Original strand, 25591461 - 25591861
Alignment:
Q  2 tttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25591461 tttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccc 25591560  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25591561 ttgagttaagactctcttctcaaactacagcccctaattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaa 25591660  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25591661 ggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattttgtctaagta-aaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 25591759  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25591760 ttatatttgatcataatataaaaaacattaagaacaagtgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 25591859  T
Q  398 at 399  Q
    ||    
T  25591860 at 25591861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 21279750 - 21280152
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21279750 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttacatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 21279849  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21279850 cttgagttaagactctcttcttaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaa 21279949  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21279950 cgattatccattcctagaccaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgagagttagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 21280049  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  21280050 ttatatttgattaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaacaataaatagagtttcacagcaacatggatca 21280149  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  21280150 att 21280152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 18825868 - 18826271
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18825868 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgatcttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 18825967  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18825968 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaa 18826067  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  18826068 acgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 18826167  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  18826168 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagtaacatggatc 18826267  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  18826268 aatt 18826271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 36710617 - 36711020
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36710617 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 36710716  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36710717 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaa 36710816  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  36710817 acgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtccaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 36710916  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  36710917 cttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacaacaacatggatc 36711016  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  36711017 aatt 36711020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10664037 - 10663643
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10664037 ctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattctctagttctatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 10663938  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  10663937 cttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacattaacctagtatcactaataaa 10663838  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10663837 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 10663738  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  10663737 ttatatttgatcatgatataaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcagaataaatagagtttcacagcaacatg 10663643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 22173904 - 22174307
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22173904 ctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactacacctatttgtattaattattctctaattcaacgttagttaacaaaatagccctaatcaatcc 22174003  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22174004 cttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 22174103  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22174104 acgattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaatttaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 22174203  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  22174204 tttatatttgatcagcatataaaaagcattaagaataattgaattgaataaaaactagatggtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 22174303  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  22174304 aatt 22174307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33419794 - 33419392
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33419794 ctttcgaatcatttatgttcccctaatttgtatactgcacctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatattcataatcaatcc 33419695  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     |||  || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||    
T  33419694 cttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttatgtggtctaataacctttgaaggtttaagcatgtttatctaatatcactaataaa 33419595  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33419594 ggattatacattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattcggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 33419495  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33419494 ttatatttgatcatgatataaagagctttaagaacaattaaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 33419395  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  33419394 att 33419392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 45155250 - 45155653
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45155250 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattctctagtttcgcgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 45155349  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttg-aaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  45155350 cttgagttaagaccctcttctcaaactaaaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagtacgttaacctaatatcactaataa 45155449  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||    
T  45155450 acgattatccattcctagactaaccatgtttaatagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcatttccacgaaatcatg 45155549  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||    |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  45155550 tttatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttc 45155649  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  45155650 aatt 45155653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 38248380 - 38248782
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  38248380 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacatattcttatgaatgattctctagttccacgatagctaacaaaatagtcctaatcaatct 38248479  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  38248480 cttgagttaggacattcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttagtacgttaacctaatatcactaataaa 38248579  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    ||||||||||  | ||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38248580 cgattatccaaacctagactatctatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgtaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaatcatgt 38248679  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||    |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38248680 ttatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 38248779  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  38248780 att 38248782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23643936 - 23643555
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23643936 ctaattggtatactgcacttctttgtatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttatgaccctcttctc 23643837  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23643836 agattacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagacta 23643737  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    | | |||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  23643736 aacatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaagtcatgtttattttttatcaggatataa 23643637  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  23643636 acagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcagaataaatacagtttcacagcaacatggatcaatt 23643555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 43681873 - 43682254
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43681873 ctaattggtatactacacttattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 43681972  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
    | | ||| | | |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  43681973 atattacagtccctaattccgtaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcatgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagacta 43682072  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  43682073 accatgtttattagaacatttcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcggtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataa 43682172  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||    
T  43682173 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaataaaatttcacaacaacatggttcaatt 43682254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 10498195 - 10498589
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10498195 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 10498294  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  10498295 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagtacgttaacctaatatcactaataaa 10498394  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || |    
T  10498395 ggattatccattccaagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatgatcagtagtcgttcgttctcactaaattatat 10498494  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  10498495 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgacttgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 10498589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 24 - 359
Target Start/End: Original strand, 5538778 - 5539114
Alignment:
Q  24 aattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5538778 aattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttgcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttagaaccctcttctcaa 5538877  T
Q  124 actactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaac 222  Q
    |||||  || |||||||| |||||||| || | |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  5538878 actacaacccctaattccgtaggtggtttagtgatctttgaaggttttatgcacattaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaat 5538977  T
Q  223 cctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaa 322  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  5538978 catgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcacttaatcatttttatatttgatcagtatataaaa 5539077  T
Q  323 agtattaagaataattgaattgaataaaaactagatt 359  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5539078 agcattaagaacaattgaattgaataaaaactagatt 5539114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8911787 - 8911383
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8911787 ctttcgaatcctctgagttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctatgatagttaacaaaatagtcctaataaatcc 8911688  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccac-taattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    || |||||  |||||||||||    ||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  8911687 ctcgagtttagaccctcttctagggctacaaccccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttttaagcacgttaacataatatcactaata 8911588  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    || |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  8911587 aaggattatgcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcat 8911488  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggtt 395  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  8911487 atttatatttgatcaggatataaaaagcattaaaaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgttt 8911388  T
Q  396 caatt 400  Q
    |||||    
T  8911387 caatt 8911383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31284810 - 31284414
Alignment:
Q  3 ttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccct 101  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31284810 ttcgaatcatctatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgagtccctagttctatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccct 31284711  T
Q  102 tgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacg 201  Q
    |||||||||||||||||||     |||  || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31284710 tgagttaggaccctcttctagggttacatcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaagg 31284611  T
Q  202 attatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgttt 301  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31284610 attatccattcctagactaaccatgtttattacaacaattcaattaggtctaagtcgaaggctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgttt 31284511  T
Q  302 atatttgatcagga----tataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  31284510 atatttgatcaggatatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 31284414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25231219 - 25230841
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25231219 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 25231120  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  25231119 cttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcctctaattccttgggtgttctaataatatttgaaggttttaagtatgttaacctaatatcactaataa 25231020  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  25231019 acgattatccattcctaagctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttacggtcagtagtcattcattctcacgaaatcata 25230920  T
Q  299 t-ttata---tttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 377  Q
    | |||||   | ||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25230919 tattatacggtgtgat----atataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 25230841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 23619345 - 23619715
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  23619345 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagttctaatcaattc 23619444  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
     ||||||||| ||||||||||     |   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23619445 attgagttagaaccctcttctagggttgaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatttcactaataaa 23619544  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  23619545 tgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatat 23619644  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaa 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23619645 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaa 23619715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2560673 - 2560325
Alignment:
Q  18 ttctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagtt-aggaccctc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||    
T  2560673 ttctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattatctagttccacgatagttaacaaaatagccataatcaatcacttgagtttaagactctc 2560574  T
Q  117 ttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcata 215  Q
    |||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||    
T  2560573 ttctcagattacaccca-taattccttaggtggtctaataatctttgaaggctttaagcacgttaaactaatatcattaataaaggattatccattccta 2560475  T
Q  216 gactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcagga 315  Q
    |||||||| | |  |||||||||||||| ||  |||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2560474 gactaaccatctgtattagaacaattcagttaggtctaagtcgaaaaccatggtcagtagtcattcgttatcactaaatcatgtttatatttgatcagga 2560375  T
Q  316 tataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcatt 365  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2560374 tataaaaaggattataaacaattgaattgaataaaaactagattttcatt 2560325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 12516433 - 12516765
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatg-aatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatc 98  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12516433 ctttcgaatcatctatattcccctaattggtatactgcacctattcttttggaatggttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatc 12516532  T
Q  99 ccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||   | |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  12516533 ccttgagttaggaccctcttcttagattacaatccctaattccttagttgatctaatattctttgaaggttttatgcactttaacataatatcactaaca 12516632  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  12516633 aacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcagtagccattcgttctcactaaattat 12516732  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaa 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12516733 gtttatatttgatcaagatataaaaagcattaa 12516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 5613739 - 5614111
Alignment:
Q  41 tattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactact--gccactaat 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||    ||| |||||    
T  5613739 tattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcccctaat 5613838  T
Q  139 tccttaggtggtctaataatcttt-gaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaa 236  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||| |||    
T  5613839 tccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatacctagaataaccatgtttatttgaa 5613938  T
Q  237 -------caattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtatta 329  Q
           ||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  5613939 ttttgaacaattcaattaagtctaagttgaaagttgtggtcagcagtcattcattctcacgaaatcatgtttatatttgataagggtataaaaagcatta 5614038  T
Q  330 agaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  5614039 agaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatccacaataaatagagtttcacatcaacatgtttcaatt 5614111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30785058 - 30784665
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatc 98  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  30785058 ctttcgaatcctctaagttcccctaattggtatattgtacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatagttaacaaaataaccctaatcaatc 30784959  T
Q  99 ccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaaca 197  Q
    | | ||  |||||||||||||||  | ||| | | ||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| |       
T  30784958 catggacgtaggaccctcttctcggattacagtctctaattccttaggtgatttaaagttctctgaaggttttacgaacgttaacctaatatcacaa--- 30784862  T
Q  198 aacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
            ||||||| |||| ||  | |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||    
T  30784861 --------tccattcctagattattcatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcaatagtcattcattctcacgaattcat 30784770  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggtt 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||    
T  30784769 gtttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacatcaacatgttt 30784670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 44027074 - 44027397
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44027074 ctttcgaatcatctatgttcccctaattgatataatgcacatattcttgtgaatgattaactagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 44027173  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  44027174 cttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggtttaaacacgttaacctaatgtcactaataaa 44027273  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||| ||||| ||  |||| | |||| ||||||| |||||||||  ||||||||  ||| ||||| |||||| |||||| |||||| ||||| || |    
T  44027274 tgattattcattcctaacctaatcatgtttattagaaaaattcaattaagtctaagtcaaaaactatgatcagtaatcattcgttctcagtaaatcatat 44027373  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaa 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  44027374 ttatatttgatcatgatataaaaa 44027397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 33883331 - 33883501
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33883331 ctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 33883430  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33883431 cttgagttagaaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 33883501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4868330 - 4868041
Alignment:
Q  61 tagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatct 160  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| |    |||||||||||||| ||||||| |||    
T  4868330 tagtttcacgatggttaactaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcggattacagttcataattccttaggtgatctaatattct 4868231  T
Q  161 ttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtaga 259  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| || |||  ||||||||||| ||||||||     || ||| |||||||||||||  | |||||| ||    
T  4868230 ttgaaggttttaagaacgttcacctaatatcacaaataaaaaattatccattcctagactaa-----tttatttgaacaattcaattaggcctaagttga 4868136  T
Q  260 aagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggat---ataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaa 351  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4868135 aagttatggtcaatagtcattcattctcacgaattcatctttatatttgatcaggatataataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaa 4868041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 296 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23613382 - 23613277
Alignment:
Q  296 atgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatgg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  23613382 atgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatgg 23613283  T
Q  394 ttcaat 399  Q
    ||||||    
T  23613282 ttcaat 23613277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20887673 - 20887589
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaat 84  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20887673 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaat 20887589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Original strand, 14589603 - 14589698
Alignment:
Q  2 tttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaa 96  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14589603 tttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatcgttaacaaaatagccctaatcaa 14589698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 5584377 - 5584462
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattc---------ttatgaatgattttctagttccacgatagtt 76  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5584377 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcataaaattcttatgaatgattttctagttccacgatagtt 5584462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 198288 - 197904
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  198288 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 198189  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  198188 cttgacttaggaccctcttctcaaactatagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 198089  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  198088 tgattatccattcctagactattcctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 197989  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagtttcaca 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  197988 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcataataaagagtttcaca 197904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5493 - 5095
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5493 ctttcgaatcatctatattcccctaattgatatagtgcacctattcttatgaatgattttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 5394  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5393 cttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctaatatcactaacaaa 5294  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5293 cgatcatccattcctagactaaccctatttattagaacaatttaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgt 5194  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  5193 ttatatttgataaggatataaaaagcattaaaaacagttgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatggttc 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 293164 - 292762
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  293164 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 293065  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  293064 cttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaataaa 292965  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  292964 ggattatccattcctatactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatcgtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgt 292865  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag--tttcacagcaacatggttca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  292864 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagaatttcacagcaacatgtttca 292765  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  292764 att 292762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 5379 - 5782
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5379 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 5478  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  5479 tttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgttagcctaatatcactaataa 5578  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    | |||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5579 aggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 5678  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaat-aaaaactagattgtcattcacaataaata--gtttcacagcaacatggtt 395  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5679 tttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaaactagattgtcatttacaataaatagggtttcacagcaacatggtt 5778  T
Q  396 caat 399  Q
    ||||    
T  5779 caat 5782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 400
Target Start/End: Original strand, 67528 - 67908
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  67528 ctaattggtatactgcacctattgttatgattgattctctagtaccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctt 67627  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  67628 aaactacaactcctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcatgttaacttaatatcactaacaaacgattatatattcctagactaa 67727  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    || |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  67728 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcggtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaa 67827  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  67828 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 67908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 89911 - 89508
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  89911 ctttcgaatcatctaagttcccctaattggtatactgcacatattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcc 89812  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  89811 cttgagttaggactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttgaagcacgttaacttaatatcactaacaa 89712  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  89711 acgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaattcaattaggtctaagtcaaaagttagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg 89612  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  89611 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatc 89512  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  89511 aatt 89508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 400
Target Start/End: Original strand, 3286 - 3665
Alignment:
Q  23 taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctca 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3286 taattggtataatgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctca 3385  T
Q  123 aactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
     | ||| | | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  3386 tattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcatgtttacctaatatcactaacaaacgattatccattcctaggttaa 3485  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    || |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3486 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 3585  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||    
T  3586 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactag-ttgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacttgtttcaatt 3665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 57570 - 57969
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  57570 ctttcgaatcatctatgttcacataattggtatattgcacctattcttatgaacgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatctatcc 57669  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||    
T  57670 attgagttagggccctcttctcaaactacatcccctgattgcttaggtggtctaatactctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcactaataa 57769  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  57770 acgattatccatttctagactaaccatttttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 57869  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  57870 tttatatttgatcaggatataaaaaacattaaaaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagtaacatggttc 57969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 58662 - 59066
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  58662 ctttcgaatcatctatgttcccctaatttgtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 58761  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     ||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  58762 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttatgcagtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 58861  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaa--ttcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgat 297  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||  |||||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  58862 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaaaaaaattcaattaggtctaagtcgaaagttagggttagtagtcattcgttctcactaaatcat 58961  T
Q  298 gtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggtt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  58962 gtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgttt 59061  T
Q  396 caatt 400  Q
    |||||    
T  59062 caatt 59066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 44 - 447
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctct-aattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  44 ctttcgaatcatcgatgttcccttaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaataaatcc 143  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttta-agcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  144 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggcggtctaataatctttcaaggtttttagaacgttaacctaatatcactaacaa 243  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  244 acgattatccattcctagactaaccatgtttatcagaacaattcaattatatctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaattcatg 343  T
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa--atagtttcacagcaacatggttc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  344 tttatatttgatcaggatataaagagcaataagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtaattaataataaatatagtttcacagcaacatggatc 443  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  444 aatt 447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 400
Target Start/End: Original strand, 3733 - 3807
Alignment:
Q  328 taagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  3733 taagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatcaatt 3807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 400
Target Start/End: Original strand, 10863 - 10937
Alignment:
Q  328 taagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  10863 taagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatggatcaatt 10937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 2986 - 3395
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2986 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaccaaaatagtcctaatcaatcc 3085  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||     |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  3086 attgagttaggaccctcttctagtgttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaataaa 3185  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagcta-------tggtcagtagtcattcattctcactaa 292  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||       | |||||||||||||| ||||||||||    
T  3186 ggattatccattcgtagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcagtagtcattcgttctcactaa 3285  T
Q  293 atgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaaca 390  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3286 atcatgtttatatttgattaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaaca 3385  T
Q  391 tggttcaatt 400  Q
    || |||||||    
T  3386 tgtttcaatt 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31213 - 30841
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31213 ctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttcta 31114  T
Q  122 aaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaa 221  Q
        ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  31113 gggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatacattcctagactaa 31014  T
Q  222 ccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaa 321  Q
    || |||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31013 ccatgtttattagaacaaatcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaa 30914  T
Q  322 aagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||    
T  30913 aagcattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacaacaacatg 30841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 272 - 1
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  272 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 173  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  172 cttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaa 73  T
Q  199 acgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72 acgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 2054 - 2456
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctct-aattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  2054 ctttagaatcatctatgttctccgaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatacttaacaaaatagccctaatcaatcc 2153  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||   | ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2154 cttgagttgggactctcttctaggattacagcccgtaatttcttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 2253  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| || ||||||| |||| |||||| ||||| || |    
T  2254 ggattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaatctagggccagtagtaattcgttctcaataaatcatat 2353  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttca 397  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2354 ttatatttgatcaggatgcaaaaagcattaagaacaattgaattgaataaacattagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttca 2453  T
Q  398 att 400  Q
    |||    
T  2454 att 2456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29506 - 29112
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29506 ctttcgaatcatctatgttcccctaatttttatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 29407  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||     |||  || ||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29406 cttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattcctcacgtggtctaataacttttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 29307  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |    
T  29306 ggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtctttcgttctcactaaatcatat 29207  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  29206 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 29112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19421 - 19042
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19421 ctttcgaatcatctatgttcacctcattggtatactgcacctattcttgtgaatgactccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 19322  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19321 cttgagttaggaccctcttctagagttacaacccctaattccttagatggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 19222  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgt 299  Q
     | |               ||| | |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |    
T  19221 ggtt---------------taagcatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctatggtcagtagtcgttcgttctcactaaatcatat 19137  T
Q  300 ttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  19136 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 19042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10549 - 10185
Alignment:
Q  2 tttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatccc 100  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10549 tttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatccc 10450  T
Q  101 ttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaac 200  Q
    ||||||||||||| ||||||     |||  || |||||| |||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10449 ttgagttaggaccatcttctagggttacaacccctaatttcttaggcggactaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaag 10350  T
Q  201 gattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtt 300  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  10349 gattatccattccttgactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcctgtt 10250  T
Q  301 tatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcatt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10249 tatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatt 10185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 59 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19431 - 19094
Alignment:
Q  59 tctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataat 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19431 tctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctaataat 19332  T
Q  159 ctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagta 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||  |||| |||     
T  19331 ctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaacc-------atagaacaattcaattaggtctcagtc 19239  T
Q  258 gaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaat-aaaaactag 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19238 gaaagttatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg-ttatatttgatcaagatataacaagcattatgaacaattgaattgaataaaaaactag 19140  T
Q  357 attgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  19139 attgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttcaatt 19094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold1785
Description:

Target: scaffold1785; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1362 - 997
Alignment:
Q  28 ggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaacta 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |     ||    
T  1362 ggtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttccacaatagttaacaaaatagtctgaatcaatcccttgagttaggaccctcttatagggtta 1263  T
Q  128 ctgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgt 227  Q
      ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  1262 tagcccctaattccttaggtggtataataaccttcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgt 1163  T
Q  228 tcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtat 327  Q
    | |||| |||||| |||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||        || ||    
T  1162 ttattaaaacaatacaattaggtctaa-tcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagg--------agcat 1072  T
Q  328 taagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  1071 taagaacaattgaattgaataaaaactagaatgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttcaatt 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 48 - 1
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattctt 47  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  48 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattctt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 392
Target Start/End: Original strand, 118449 - 118821
Alignment:
Q  23 taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctca 122  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  118449 taattggtccactgcacctattcttatgaatgattcgctagtttcaggatagttaacaaaatagcactaatcaatcccttgacttaggaccctcttcgcg 118548  T
Q  123 aactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagca--cgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 220  Q
       ||| | |  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  118549 ggttacagtctataattccttagatgatctaatattctttgaaggtttta-catgcgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagacta 118647  T
Q  221 accctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataa 320  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  118648 accatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaattcatgtttatatttgatcaggatataa 118747  T
Q  321 aaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  118748 aaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 118821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 96
Target Start/End: Original strand, 99236 - 99312
Alignment:
Q  20 ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaa 96  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  99236 ctctaattggttcactgcacctattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacaaaatagccataatcaa 99312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1755 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1755
Description:

Target: scaffold1755; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 262 - 4
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  262 ctttcgaatcatatatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaacatagtcctaatcaatcc 163  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162 cttgagttaggaccctcttctcaaacttcagtccctaattgcttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 63  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtag 258  Q
     |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  62 ggattatccattcctagactaaccctatttattagaacaattcaattaggtctaagtag 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 248659 - 248413
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  248659 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgagtgattttctagttccacgacagttaacaaaatagtcataatcaatcc 248560  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  248559 cttgacttaggaccctcttcacaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaatcatgttaacctaatatcactaacaaa 248460  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaatt 246  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  248459 cgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 248413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27250 - 27005
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27250 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattctctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 27151  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27150 attgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtgtaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcacgaacaaa 27051  T
Q  200 cgattatccattcatagactaaccctgttcattagaacaattcaat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27050 cgattatccattcctagactaaccctatttattagaacaattcaat 27005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27003 - 26927
Alignment:
Q  326 attaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27003 attaagaacaattgaattaaacaaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatggttcaatt 26927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 102
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  326 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 227  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaa 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  226 cttgagttaagactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataa 127  T
Q  199 acgattatccattcatagactaacc 223  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||    
T  126 aggattattcattcctagactaacc 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 254 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 95 - 1
Alignment:
Q  254 agtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaata 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  95 agtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaata 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 241641 - 241434
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  241641 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcgtaatcaatcc 241542  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  241541 cttgagttaggaccctcttctcaaactgcaggccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacattaacctagtatcactaacaaa 241442  T
Q  200 cgattatc 207  Q
     |||||||    
T  241441 tgattatc 241434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1063 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1063
Description:

Target: scaffold1063; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2620 - 2390
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctattcttat------gaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2620 ctaattggtatactgcacctattcttattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccct 2521  T
Q  116 cttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaa-ggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcat 214  Q
    ||||||| ||||| | | |||||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  2520 cttctcatactacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaacgttttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcct 2421  T
Q  215 agac--taaccctgttcattagaacaattca 243  Q
    ||||  ||||| |||| ||||||||||||||    
T  2420 agactataaccatgtttattagaacaattca 2390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 206 - 1
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  206 ctttcgaatcatatatgttcccctaattggtatactacac-tgttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcagtcc 108  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaa 199  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107 cttgacttaggaccctattctcaaactacaacccctaatttcttaggtggtcaaataatctttgaaagtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaa 8  T
Q  200 cgattat 206  Q
    |||||||    
T  7 cgattat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2073 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold2073
Description:

Target: scaffold2073; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 848 - 1007
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  848 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattatctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 947  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttctcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatc 159  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  948 cttgggttaggaccctcttttcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatc 1007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14246 - 14091
Alignment:
Q  134 ctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgttcatta 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  14246 ctaattccttaggtgatctaataaccgtcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttatta 14147  T
Q  234 gaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcac 289  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14146 gaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcac 14091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10060 - 9685
Alignment:
Q  22 ctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttc 119  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |  ||||  || |||| || |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10060 ctaattggtacactgcacctatttccttcgaatatttctctaatttcacgatggttaaccaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttc 9961  T
Q  120 tcaaactactgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacct-aatatcactaacaaacgattatccattcataga 217  Q
    ||| | ||  | | ||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || |||| |||| | |||| ||||    
T  9960 tcagattagagtccctaattccttatgtgttataatattatttgaaggttttaagaaagttaaccttaatatcacaaataaacaattaccaattcctaga 9861  T
Q  218 ctaaccctgttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatgatgtttatatttgatcaggata 317  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||  |||    
T  9860 ctaactctgtttattcgatcaattcaattaggtctaagttgaaagttatggtcaataatcattcattctcacgaattcatgtttttatgtgatcaatata 9761  T
Q  318 taaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatg 392  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  9760 taaaaagcattaagaacaattgaattgaat-aaaactatattgatattcataagaaatagagtttcacagcaacatg 9685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 48411 - 48667
Alignment:
Q  29 gtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaact 126  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||  || ||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |    
T  48411 gtatactgcacctatttcctataaatatttctctagtttcacgatggtcaactaaaatagtcataatcaatcccttgacgtaggaccctcttctcagatt 48510  T
Q  127 actgccactaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccct 225  Q
    || | | ||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||| | | |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  48511 acggtccctaattccttaggtgatccaatattctttgaaggttttatgaatgttaacataatatcacaaataaacgattatccattcctaggctaacctt 48610  T
Q  226 gttcattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattca 282  Q
    ||| | | |||||||||||||  ||| |||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  48611 gtttacttgaacaattcaattaggtcaaagttgtaagctagggtcagtagtcattca 48667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 369
Target Start/End: Original strand, 48699 - 48752
Alignment:
Q  315 atataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcaca 369  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  48699 atataaaaagcattaagaacaattgaattgaat-aaaactagattgatattcaca 48752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 7693 - 7801
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7693 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 7792  T
Q  100 cttgagtta 108  Q
    |||||||||    
T  7793 cttgagtta 7801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 296 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1591 - 1485
Alignment:
Q  296 atgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatgg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||     
T  1591 atgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatacacaataaatagagtttcacagcaacatgt 1492  T
Q  394 ttcaatt 400  Q
    |||||||    
T  1491 ttcaatt 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4057 - 3988
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagtt-ctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccac 69  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  4057 ctttcgaatcatctatgtttctctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttccac 3988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15553 - 15433
Alignment:
Q  1 ctttcgaatcatctaagttctc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15553 ctttcgaatcatctatgttcccctaattgggatactgcacctattcttgtgaatgagtcgctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 15454  T
Q  100 cttgagttaggaccctcttct 120  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15453 cttgagttaggaccctcttct 15433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 299 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24663 - 24560
Alignment:
Q  299 tttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||    
T  24663 tttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacaacaacatggttc 24564  T
Q  397 aatt 400  Q
    ||||    
T  24563 aatt 24560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 400
Target Start/End: Original strand, 1 - 58
Alignment:
Q  345 aataaaaactagattgtcattcacaataaat--agtttcacagcaacatggttcaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  1 aataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatagatcaatt 58  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University