View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18400_high_3 (Length: 591)

Name: NF18400_high_3
Description: NF18400
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18400_high_3
NF18400_high_3
[»] chr4 (109 HSPs)
chr4 (18-577)||(33246354-33246909)
chr4 (19-309)||(12624656-12624945)
chr4 (20-298)||(22651435-22651712)
chr4 (21-300)||(30153081-30153358)
chr4 (21-309)||(22750700-22750987)
chr4 (52-273)||(37625013-37625234)
chr4 (21-312)||(19654385-19654676)
chr4 (19-273)||(52198585-52198837)
chr4 (21-273)||(25477221-25477471)
chr4 (36-312)||(26203087-26203363)
chr4 (21-275)||(5448656-5448905)
chr4 (58-311)||(13096436-13096688)
chr4 (58-311)||(20291298-20291549)
chr4 (71-302)||(29584861-29585090)
chr4 (21-309)||(7002142-7002429)
chr4 (18-243)||(43800834-43801058)
chr4 (18-274)||(54438505-54438760)
chr4 (21-274)||(46729301-46729552)
chr4 (21-270)||(34543701-34543952)
chr4 (24-274)||(24072762-24073011)
chr4 (20-230)||(40411200-40411409)
chr4 (21-274)||(16070426-16070678)
chr4 (21-273)||(10602068-10602316)
chr4 (22-228)||(21171765-21171969)
chr4 (21-274)||(39237446-39237699)
chr4 (66-310)||(14602554-14602801)
chr4 (62-274)||(52226014-52226226)
chr4 (15-273)||(38136351-38136603)
chr4 (21-310)||(31486446-31486735)
chr4 (56-278)||(41945666-41945886)
chr4 (52-273)||(51787767-51787986)
chr4 (65-309)||(39414196-39414437)
chr4 (59-275)||(20262292-20262505)
chr4 (39-273)||(43509079-43509311)
chr4 (52-309)||(20185549-20185802)
chr4 (46-272)||(52552395-52552619)
chr4 (37-272)||(39196907-39197143)
chr4 (21-273)||(51918513-51918760)
chr4 (52-273)||(31840094-31840311)
chr4 (46-274)||(48472379-48472606)
chr4 (21-273)||(20116448-20116698)
chr4 (21-310)||(20293702-20293995)
chr4 (123-310)||(41919997-41920184)
chr4 (91-273)||(56373273-56373453)
chr4 (21-243)||(5168005-5168226)
chr4 (21-274)||(50782773-50783018)
chr4 (28-310)||(54701159-54701433)
chr4 (58-243)||(32236857-32237043)
chr4 (52-273)||(5932883-5933102)
chr4 (86-273)||(37174943-37175130)
chr4 (61-279)||(45079709-45079926)
chr4 (72-273)||(20016521-20016717)
chr4 (142-273)||(28116483-28116614)
chr4 (72-272)||(10541167-10541365)
chr4 (47-275)||(5536491-5536705)
chr4 (64-305)||(5416772-5417008)
chr4 (21-197)||(31917449-31917622)
chr4 (39-241)||(52676048-52676250)
chr4 (23-193)||(54359759-54359927)
chr4 (52-282)||(3684077-3684306)
chr4 (48-181)||(8246336-8246468)
chr4 (48-181)||(8250465-8250597)
chr4 (23-219)||(44812467-44812662)
chr4 (39-190)||(3094409-3094563)
chr4 (152-273)||(26186743-26186864)
chr4 (135-292)||(45628046-45628203)
chr4 (21-149)||(31936952-31937080)
chr4 (64-226)||(32107888-32108050)
chr4 (142-267)||(20791929-20792054)
chr4 (110-232)||(52768841-52768967)
chr4 (110-273)||(52977553-52977715)
chr4 (86-228)||(34643436-34643576)
chr4 (135-225)||(41459631-41459721)
chr4 (24-131)||(20792129-20792235)
chr4 (21-96)||(39813816-39813891)
chr4 (116-219)||(56217005-56217108)
chr4 (72-182)||(48609429-48609538)
chr4 (188-273)||(3094178-3094263)
chr4 (84-211)||(20540029-20540152)
chr4 (64-221)||(36513201-36513367)
chr4 (145-257)||(31937373-31937485)
chr4 (65-207)||(754031-754178)
chr4 (119-217)||(21121019-21121117)
chr4 (21-97)||(50438172-50438248)
chr4 (61-180)||(31552257-31552375)
chr4 (122-207)||(726666-726751)
chr4 (52-189)||(3113446-3113580)
chr4 (106-188)||(49544991-49545072)
chr4 (21-97)||(11792606-11792681)
chr4 (21-97)||(11861273-11861348)
chr4 (21-97)||(23611333-23611408)
chr4 (52-111)||(30050142-30050201)
chr4 (63-194)||(53484344-53484474)
chr4 (168-265)||(18683539-18683634)
chr4 (90-232)||(31294193-31294334)
chr4 (152-216)||(30049750-30049814)
chr4 (86-172)||(15169990-15170077)
chr4 (143-226)||(30866699-30866782)
chr4 (56-130)||(47846713-47846785)
chr4 (148-206)||(26170251-26170309)
chr4 (253-309)||(50438926-50438982)
chr4 (102-185)||(3506749-3506832)
chr4 (150-193)||(25841983-25842026)
chr4 (59-114)||(56216660-56216715)
chr4 (219-281)||(30049419-30049481)
chr4 (252-305)||(50165869-50165922)
chr4 (65-121)||(15592646-15592702)
chr4 (172-228)||(31552181-31552237)
chr4 (54-122)||(56077196-56077264)
[»] chr8 (95 HSPs)
chr8 (21-313)||(26878587-26878878)
chr8 (21-314)||(43980442-43980732)
chr8 (20-309)||(24962223-24962510)
chr8 (24-275)||(25198283-25198532)
chr8 (21-309)||(31746265-31746551)
chr8 (19-274)||(24512023-24512278)
chr8 (21-310)||(40517702-40517987)
chr8 (21-273)||(57047-57298)
chr8 (21-267)||(45183721-45183965)
chr8 (64-309)||(36437461-36437706)
chr8 (21-255)||(12762856-12763088)
chr8 (72-296)||(14577560-14577785)
chr8 (21-309)||(40790749-40791035)
chr8 (73-309)||(45203719-45203953)
chr8 (21-291)||(7172197-7172464)
chr8 (21-272)||(41086971-41087220)
chr8 (21-273)||(1177014-1177265)
chr8 (21-312)||(25184987-25185280)
chr8 (23-273)||(43191342-43191587)
chr8 (36-309)||(38202866-38203138)
chr8 (52-303)||(2562618-2562869)
chr8 (31-274)||(7772507-7772748)
chr8 (22-313)||(10396090-10396378)
chr8 (86-310)||(34882629-34882852)
chr8 (23-310)||(17933664-17933948)
chr8 (21-272)||(31252514-31252763)
chr8 (52-274)||(38761246-38761469)
chr8 (56-273)||(5191443-5191658)
chr8 (52-273)||(45185156-45185377)
chr8 (21-273)||(885458-885707)
chr8 (64-311)||(22590333-22590579)
chr8 (21-316)||(40601899-40602194)
chr8 (123-310)||(24276517-24276702)
chr8 (52-310)||(37141685-37141942)
chr8 (21-274)||(38773207-38773460)
chr8 (64-272)||(36309497-36309703)
chr8 (52-274)||(37956116-37956330)
chr8 (58-276)||(37600783-37601001)
chr8 (21-274)||(38770046-38770298)
chr8 (52-275)||(39543550-39543775)
chr8 (21-232)||(34157954-34158163)
chr8 (37-274)||(40337066-40337302)
chr8 (52-279)||(31673587-31673813)
chr8 (124-273)||(25888591-25888740)
chr8 (52-226)||(1769339-1769510)
chr8 (19-189)||(40807868-40808037)
chr8 (58-273)||(14846820-14847031)
chr8 (91-274)||(12998617-12998804)
chr8 (52-260)||(30262430-30262635)
chr8 (121-279)||(3113491-3113649)
chr8 (52-265)||(14739433-14739650)
chr8 (138-310)||(16002698-16002870)
chr8 (56-221)||(23399673-23399835)
chr8 (187-310)||(14906561-14906683)
chr8 (174-312)||(16644047-16644185)
chr8 (21-206)||(45283346-45283528)
chr8 (52-177)||(41371691-41371818)
chr8 (84-197)||(14522266-14522379)
chr8 (21-122)||(16357133-16357234)
chr8 (56-221)||(23280699-23280860)
chr8 (159-270)||(3006777-3006888)
chr8 (202-309)||(14522643-14522750)
chr8 (113-232)||(35794779-35794898)
chr8 (72-268)||(41541550-41541744)
chr8 (98-279)||(2031213-2031386)
chr8 (152-274)||(44255448-44255570)
chr8 (58-159)||(10860830-10860930)
chr8 (119-232)||(35709055-35709168)
chr8 (58-144)||(4273862-4273947)
chr8 (21-102)||(2303258-2303339)
chr8 (21-102)||(2327852-2327933)
chr8 (21-148)||(3005983-3006109)
chr8 (52-202)||(10709381-10709529)
chr8 (135-197)||(33385318-33385380)
chr8 (86-268)||(34869831-34870007)
chr8 (64-232)||(12894102-12894273)
chr8 (129-265)||(27569-27705)
chr8 (116-189)||(14907213-14907286)
chr8 (21-97)||(5969799-5969874)
chr8 (21-97)||(31008331-31008406)
chr8 (21-97)||(41726154-41726229)
chr8 (135-189)||(7727321-7727375)
chr8 (208-310)||(45283827-45283928)
chr8 (112-273)||(43182529-43182689)
chr8 (210-274)||(4273955-4274019)
chr8 (21-81)||(13486946-13487006)
chr8 (105-180)||(16643582-16643660)
chr8 (21-97)||(19726509-19726584)
chr8 (21-97)||(27679070-27679145)
chr8 (85-187)||(34116233-34116336)
chr8 (30-82)||(3656103-3656155)
chr8 (116-232)||(31498949-31499065)
chr8 (86-183)||(38662516-38662613)
chr8 (66-213)||(11444017-11444162)
chr8 (116-156)||(4840803-4840843)
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (21-316)||(15512638-15512932)
chr1 (21-312)||(28948821-28949111)
chr1 (21-309)||(5084946-5085233)
chr1 (21-312)||(51996910-51997202)
chr1 (21-309)||(52141032-52141321)
chr1 (21-311)||(25063167-25063458)
chr1 (21-313)||(30898420-30898711)
chr1 (21-312)||(51390395-51390682)
chr1 (21-310)||(3143361-3143650)
chr1 (29-273)||(48721734-48721976)
chr1 (65-309)||(4813362-4813606)
chr1 (21-309)||(15179369-15179656)
chr1 (21-312)||(4817763-4818052)
chr1 (21-312)||(4829563-4829852)
chr1 (36-309)||(33231799-33232071)
chr1 (21-309)||(47643502-47643786)
chr1 (52-268)||(28723538-28723756)
chr1 (15-274)||(34696734-34696992)
chr1 (21-275)||(5321879-5322133)
chr1 (28-310)||(23982456-23982737)
chr1 (58-309)||(32152117-32152365)
chr1 (25-274)||(28334081-28334324)
chr1 (85-310)||(8984583-8984806)
chr1 (36-274)||(16582527-16582766)
chr1 (71-308)||(13723376-13723621)
chr1 (21-274)||(36084964-36085216)
chr1 (21-309)||(3831008-3831293)
chr1 (52-307)||(46495270-46495524)
chr1 (36-275)||(29140529-29140764)
chr1 (103-314)||(10842283-10842491)
chr1 (56-317)||(25258281-25258541)
chr1 (87-272)||(44652784-44652965)
chr1 (21-275)||(8877765-8878016)
chr1 (52-273)||(35365870-35366092)
chr1 (142-309)||(31305277-31305444)
chr1 (52-283)||(2342889-2343115)
chr1 (56-307)||(32047403-32047651)
chr1 (86-273)||(20564770-20564958)
chr1 (47-274)||(25269371-25269596)
chr1 (18-293)||(46591077-46591351)
chr1 (72-268)||(15911461-15911655)
chr1 (105-273)||(30336054-30336222)
chr1 (52-272)||(44395531-44395753)
chr1 (58-273)||(32144306-32144520)
chr1 (84-238)||(13145448-13145601)
chr1 (52-205)||(34012550-34012701)
chr1 (111-272)||(31807919-31808079)
chr1 (52-310)||(44335248-44335502)
chr1 (117-319)||(27531049-27531250)
chr1 (52-243)||(16395440-16395626)
chr1 (150-278)||(38680465-38680593)
chr1 (72-263)||(4081931-4082121)
chr1 (21-273)||(44163227-44163468)
chr1 (52-193)||(46732849-46732988)
chr1 (62-275)||(10160712-10160917)
chr1 (145-273)||(47754622-47754750)
chr1 (66-273)||(15457718-15457923)
chr1 (150-273)||(34102331-34102454)
chr1 (53-260)||(3072147-3072350)
chr1 (52-275)||(24414993-24415204)
chr1 (135-248)||(47070931-47071044)
chr1 (21-274)||(9675530-9675776)
chr1 (158-308)||(50692369-50692520)
chr1 (172-269)||(41737124-41737221)
chr1 (86-232)||(291555-291702)
chr1 (160-274)||(35001265-35001379)
chr1 (113-273)||(28679770-28679928)
chr1 (65-310)||(40261554-40261794)
chr1 (21-143)||(32715918-32716038)
chr1 (20-97)||(12843999-12844076)
chr1 (91-270)||(13352832-13353008)
chr1 (142-273)||(3143713-3143842)
chr1 (145-273)||(34331871-34331998)
chr1 (21-149)||(47753894-47754021)
chr1 (30-311)||(9684582-9684864)
chr1 (21-111)||(49033829-49033919)
chr1 (63-184)||(6282688-6282808)
chr1 (28-164)||(7957551-7957688)
chr1 (52-160)||(34102472-34102577)
chr1 (142-273)||(23393492-23393620)
chr1 (85-183)||(13698916-13699013)
chr1 (145-226)||(5852831-5852912)
chr1 (36-156)||(29302361-29302480)
chr1 (152-220)||(32715567-32715634)
chr1 (135-215)||(40612929-40613009)
chr1 (179-274)||(6282468-6282563)
chr1 (65-185)||(9380663-9380781)
chr1 (56-143)||(23393146-23393233)
chr1 (168-250)||(40205588-40205670)
chr1 (189-273)||(47133463-47133548)
chr1 (21-97)||(9293854-9293929)
chr1 (21-97)||(44258002-44258077)
chr1 (208-264)||(13698592-13698648)
chr1 (202-279)||(43189092-43189171)
chr1 (135-186)||(34028471-34028522)
chr1 (106-165)||(37733690-37733749)
chr1 (32-82)||(12792908-12792958)
chr1 (135-197)||(48573111-48573173)
chr1 (105-190)||(299043-299128)
chr1 (204-273)||(37733932-37734001)
chr1 (91-225)||(17426653-17426783)
chr1 (21-97)||(48302999-48303074)
chr1 (56-130)||(5852596-5852668)
chr1 (18-81)||(8984363-8984426)
chr1 (21-82)||(1846710-1846771)
chr1 (21-82)||(31305454-31305515)
chr1 (135-228)||(43414759-43414852)
chr1 (253-309)||(12845074-12845130)
chr1 (168-260)||(22786735-22786827)
[»] chr5 (88 HSPs)
chr5 (21-312)||(39690343-39690633)
chr5 (21-309)||(15898319-15898606)
chr5 (21-305)||(27642467-27642749)
chr5 (21-274)||(36177287-36177540)
chr5 (21-310)||(3558884-3559170)
chr5 (21-311)||(38971985-38972272)
chr5 (36-314)||(21912076-21912352)
chr5 (47-302)||(4857376-4857635)
chr5 (21-274)||(4738625-4738876)
chr5 (28-282)||(35568869-35569122)
chr5 (52-273)||(29866185-29866405)
chr5 (52-312)||(34877623-34877882)
chr5 (21-310)||(27587797-27588087)
chr5 (64-273)||(20946083-20946291)
chr5 (21-314)||(3247128-3247423)
chr5 (21-302)||(43453949-43454228)
chr5 (51-274)||(40979097-40979321)
chr5 (36-310)||(10523145-10523418)
chr5 (52-311)||(18729546-18729808)
chr5 (21-310)||(25017528-25017819)
chr5 (52-232)||(5151089-5151267)
chr5 (52-274)||(9946245-9946467)
chr5 (20-274)||(3630974-3631227)
chr5 (72-275)||(10934000-10934201)
chr5 (47-306)||(30347966-30348218)
chr5 (86-311)||(9375561-9375784)
chr5 (52-292)||(36750664-36750901)
chr5 (52-275)||(5845170-5845392)
chr5 (91-310)||(21574806-21575025)
chr5 (101-273)||(43060449-43060618)
chr5 (91-282)||(16042-16232)
chr5 (53-273)||(27798152-27798371)
chr5 (52-282)||(36347489-36347718)
chr5 (21-312)||(42644332-42644625)
chr5 (85-314)||(14044420-14044647)
chr5 (52-243)||(19281377-19281569)
chr5 (65-265)||(600769-600966)
chr5 (21-180)||(31641047-31641207)
chr5 (72-273)||(10656588-10656785)
chr5 (116-272)||(16496434-16496589)
chr5 (65-208)||(7736041-7736183)
chr5 (94-309)||(25690616-25690833)
chr5 (21-212)||(32401313-32401501)
chr5 (65-219)||(34676171-34676325)
chr5 (64-295)||(4745100-4745333)
chr5 (94-243)||(12895139-12895287)
chr5 (135-275)||(11980710-11980850)
chr5 (21-225)||(30317793-30317991)
chr5 (141-272)||(41521185-41521316)
chr5 (92-288)||(16969355-16969550)
chr5 (85-207)||(8717880-8718001)
chr5 (78-240)||(5764138-5764298)
chr5 (19-128)||(7510679-7510788)
chr5 (86-255)||(731871-732043)
chr5 (148-279)||(33583803-33583934)
chr5 (21-147)||(27925395-27925520)
chr5 (52-148)||(20975693-20975788)
chr5 (21-108)||(25690510-25690597)
chr5 (191-310)||(32067787-32067906)
chr5 (52-243)||(129636-129821)
chr5 (21-97)||(18032766-18032842)
chr5 (142-265)||(24781245-24781367)
chr5 (58-153)||(15966978-15967071)
chr5 (205-311)||(7510564-7510670)
chr5 (177-273)||(15967124-15967220)
chr5 (425-577)||(29373040-29373197)
chr5 (160-225)||(19089016-19089081)
chr5 (180-273)||(31642484-31642576)
chr5 (21-97)||(8760900-8760975)
chr5 (21-97)||(36745663-36745738)
chr5 (21-97)||(40144136-40144211)
chr5 (86-216)||(556054-556181)
chr5 (30-97)||(38040855-38040921)
chr5 (21-99)||(43060072-43060151)
chr5 (91-273)||(3529873-3530053)
chr5 (116-185)||(32068070-32068140)
chr5 (21-97)||(6514277-6514352)
chr5 (135-230)||(457810-457907)
chr5 (116-166)||(29874261-29874311)
chr5 (21-82)||(35758271-35758332)
chr5 (235-291)||(20976360-20976416)
chr5 (21-108)||(12895037-12895123)
chr5 (195-273)||(33862845-33862924)
chr5 (253-310)||(27925336-27925393)
chr5 (80-179)||(23648023-23648120)
chr5 (80-179)||(23810453-23810550)
chr5 (202-230)||(29874217-29874245)
chr5 (57-109)||(29874465-29874517)
[»] chr2 (115 HSPs)
chr2 (21-309)||(17663584-17663871)
chr2 (21-310)||(27297536-27297824)
chr2 (21-309)||(20361946-20362229)
chr2 (24-274)||(15851526-15851775)
chr2 (20-310)||(41865675-41865963)
chr2 (21-277)||(37355028-37355284)
chr2 (21-309)||(8064931-8065217)
chr2 (52-273)||(44424591-44424809)
chr2 (37-274)||(17250834-17251071)
chr2 (21-273)||(24774861-24775112)
chr2 (15-309)||(38449566-38449859)
chr2 (52-273)||(9718061-9718281)
chr2 (58-313)||(2131713-2131966)
chr2 (21-310)||(40345934-40346227)
chr2 (21-312)||(247617-247907)
chr2 (21-273)||(41665706-41665955)
chr2 (21-309)||(14420637-14420923)
chr2 (21-274)||(3237716-3237962)
chr2 (21-310)||(7278471-7278759)
chr2 (55-310)||(11459112-11459367)
chr2 (21-274)||(34329997-34330247)
chr2 (21-273)||(28264811-28265060)
chr2 (21-274)||(31644301-31644552)
chr2 (19-309)||(45214685-45214974)
chr2 (36-241)||(4758054-4758258)
chr2 (52-261)||(11071676-11071885)
chr2 (21-274)||(28733820-28734070)
chr2 (21-270)||(45150600-45150842)
chr2 (58-243)||(7255627-7255809)
chr2 (72-309)||(43709878-43710115)
chr2 (21-310)||(3645282-3645566)
chr2 (53-281)||(38981961-38982196)
chr2 (21-274)||(1246270-1246523)
chr2 (52-272)||(2048719-2048936)
chr2 (101-273)||(21012849-21013019)
chr2 (21-241)||(23464711-23464928)
chr2 (72-309)||(26512032-26512280)
chr2 (49-272)||(13534411-13534624)
chr2 (52-225)||(25731077-25731247)
chr2 (142-312)||(44421406-44421576)
chr2 (51-232)||(2521188-2521368)
chr2 (49-275)||(3326718-3326946)
chr2 (86-291)||(42250800-42251003)
chr2 (84-243)||(375266-375424)
chr2 (21-185)||(534549-534712)
chr2 (21-156)||(27749580-27749714)
chr2 (86-273)||(32677471-32677658)
chr2 (58-273)||(2916996-2917206)
chr2 (52-273)||(43650030-43650242)
chr2 (72-274)||(8383885-8384082)
chr2 (146-273)||(14527620-14527746)
chr2 (135-273)||(35178764-35178902)
chr2 (91-279)||(36174721-36174907)
chr2 (135-273)||(13477004-13477142)
chr2 (64-219)||(43119267-43119424)
chr2 (65-183)||(44274420-44274538)
chr2 (116-279)||(6275519-6275683)
chr2 (135-296)||(28190571-28190732)
chr2 (78-228)||(44101413-44101560)
chr2 (105-275)||(35241650-35241819)
chr2 (172-273)||(6597852-6597952)
chr2 (21-145)||(44421857-44421980)
chr2 (21-188)||(41327662-41327825)
chr2 (174-291)||(4033559-4033676)
chr2 (109-274)||(7257883-7258048)
chr2 (185-273)||(4398545-4398632)
chr2 (26-145)||(4033949-4034068)
chr2 (90-259)||(1604242-1604409)
chr2 (75-273)||(920569-920765)
chr2 (91-192)||(3389090-3389190)
chr2 (135-228)||(16808794-16808887)
chr2 (135-228)||(16848075-16848168)
chr2 (68-226)||(8393251-8393415)
chr2 (183-310)||(8667597-8667725)
chr2 (52-128)||(8667725-8667801)
chr2 (116-192)||(20427166-20427242)
chr2 (202-282)||(27749499-27749579)
chr2 (182-273)||(44274685-44274776)
chr2 (144-226)||(36846798-36846880)
chr2 (144-226)||(44462561-44462643)
chr2 (21-146)||(38107627-38107750)
chr2 (145-197)||(12498249-12498301)
chr2 (122-217)||(6408681-6408776)
chr2 (135-223)||(11121259-11121346)
chr2 (52-114)||(44284850-44284912)
chr2 (142-255)||(15578059-15578172)
chr2 (91-280)||(36175009-36175200)
chr2 (52-131)||(4398473-4398550)
chr2 (123-210)||(20360592-20360678)
chr2 (135-221)||(2654349-2654435)
chr2 (116-181)||(35178941-35179006)
chr2 (163-228)||(43638820-43638885)
chr2 (21-97)||(17513252-17513327)
chr2 (86-260)||(22590313-22590484)
chr2 (21-97)||(24128985-24129060)
chr2 (174-273)||(3337682-3337781)
chr2 (86-231)||(29971308-29971441)
chr2 (171-230)||(31583638-31583697)
chr2 (163-233)||(12417617-12417687)
chr2 (163-233)||(12429677-12429747)
chr2 (135-197)||(30401519-30401581)
chr2 (155-243)||(35453726-35453812)
chr2 (86-165)||(3337802-3337881)
chr2 (172-272)||(11168666-11168766)
chr2 (116-260)||(12121891-12122038)
chr2 (208-260)||(20426950-20427002)
chr2 (157-265)||(25731602-25731708)
chr2 (204-272)||(34042096-34042164)
chr2 (222-273)||(2395798-2395849)
chr2 (247-306)||(41327837-41327896)
chr2 (145-220)||(24490730-24490807)
chr2 (36-82)||(31900651-31900697)
chr2 (21-97)||(37314737-37314813)
chr2 (21-97)||(7153668-7153743)
chr2 (258-310)||(11071275-11071327)
[»] chr3 (106 HSPs)
chr3 (15-318)||(20945154-20945456)
chr3 (21-310)||(26517075-26517363)
chr3 (20-312)||(42891375-42891665)
chr3 (20-304)||(44083589-44083874)
chr3 (35-309)||(26042978-26043248)
chr3 (36-305)||(51263046-51263314)
chr3 (19-273)||(12077599-12077854)
chr3 (27-273)||(14645755-14646000)
chr3 (21-311)||(11388078-11388369)
chr3 (21-273)||(46048517-46048769)
chr3 (21-310)||(29676601-29676887)
chr3 (36-310)||(50524851-50525124)
chr3 (31-275)||(41727108-41727351)
chr3 (24-311)||(13084223-13084507)
chr3 (65-309)||(41739877-41740121)
chr3 (21-273)||(31819401-31819652)
chr3 (20-312)||(44338038-44338327)
chr3 (101-312)||(42010824-42011034)
chr3 (21-275)||(41308637-41308889)
chr3 (21-273)||(22659575-22659826)
chr3 (91-318)||(30475991-30476217)
chr3 (52-273)||(50363022-50363239)
chr3 (21-275)||(35145233-35145477)
chr3 (62-273)||(831261-831471)
chr3 (21-270)||(48309443-48309689)
chr3 (23-310)||(28477335-28477628)
chr3 (66-270)||(48902987-48903191)
chr3 (50-275)||(40645667-40645889)
chr3 (21-315)||(25750480-25750765)
chr3 (21-183)||(31530988-31531149)
chr3 (73-309)||(46435643-46435877)
chr3 (78-273)||(33287861-33288054)
chr3 (65-232)||(21932962-21933128)
chr3 (26-314)||(35765506-35765800)
chr3 (23-275)||(34055727-34055975)
chr3 (21-312)||(43186961-43187243)
chr3 (121-278)||(27638036-27638193)
chr3 (64-302)||(27047083-27047317)
chr3 (52-279)||(31474413-31474638)
chr3 (52-296)||(11140677-11140911)
chr3 (56-257)||(39617147-39617345)
chr3 (85-273)||(35055782-35055967)
chr3 (21-311)||(28228136-28228426)
chr3 (110-311)||(52325451-52325652)
chr3 (66-270)||(48901421-48901625)
chr3 (142-273)||(37729009-37729140)
chr3 (138-272)||(41825113-41825247)
chr3 (21-241)||(29349401-29349624)
chr3 (52-260)||(33411867-33412071)
chr3 (46-310)||(50092626-50092890)
chr3 (77-195)||(5504491-5504608)
chr3 (111-250)||(29611852-29611987)
chr3 (147-273)||(26121327-26121453)
chr3 (91-273)||(48581313-48581494)
chr3 (140-309)||(11344517-11344685)
chr3 (116-228)||(28229205-28229317)
chr3 (118-273)||(41543563-41543718)
chr3 (72-185)||(11396804-11396918)
chr3 (142-274)||(26998889-26999021)
chr3 (21-188)||(44698381-44698546)
chr3 (134-281)||(54555896-54556043)
chr3 (86-274)||(49000446-49000634)
chr3 (105-273)||(2421080-2421246)
chr3 (21-146)||(11345439-11345566)
chr3 (47-218)||(31826242-31826409)
chr3 (135-273)||(54425929-54426067)
chr3 (160-273)||(29645353-29645466)
chr3 (18-145)||(26999167-26999292)
chr3 (120-251)||(28243776-28243907)
chr3 (147-273)||(26243467-26243593)
chr3 (21-126)||(29645465-29645570)
chr3 (185-302)||(31531448-31531565)
chr3 (18-166)||(53716825-53716971)
chr3 (135-260)||(383614-383739)
chr3 (180-309)||(31650683-31650812)
chr3 (150-273)||(21864294-21864415)
chr3 (142-228)||(39931921-39932007)
chr3 (142-273)||(48213620-48213753)
chr3 (211-312)||(23157051-23157152)
chr3 (86-147)||(48214307-48214367)
chr3 (76-221)||(9178355-9178497)
chr3 (36-111)||(3475606-3475681)
chr3 (185-273)||(11393917-11394005)
chr3 (21-97)||(11676056-11676131)
chr3 (21-97)||(23241658-23241733)
chr3 (21-97)||(30464882-30464957)
chr3 (21-97)||(33635115-33635190)
chr3 (21-97)||(37599682-37599757)
chr3 (58-188)||(46202214-46202341)
chr3 (21-97)||(55257898-55257973)
chr3 (149-273)||(12236276-12236402)
chr3 (215-270)||(23068032-23068086)
chr3 (135-238)||(44647806-44647909)
chr3 (21-82)||(10259010-10259071)
chr3 (21-97)||(11335458-11335533)
chr3 (21-97)||(26725775-26725850)
chr3 (21-97)||(33987033-33987108)
chr3 (98-257)||(47916208-47916371)
chr3 (21-71)||(30476221-30476271)
chr3 (21-82)||(39850941-39851001)
chr3 (214-274)||(53717578-53717638)
chr3 (73-179)||(31650549-31650655)
chr3 (160-206)||(8325217-8325263)
chr3 (90-120)||(8818058-8818088)
chr3 (64-158)||(39932021-39932114)
chr3 (221-270)||(23071437-23071486)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (21-310)||(19838890-19839178)
chr6 (21-288)||(31945771-31946037)
chr6 (20-306)||(1763776-1764061)
chr6 (39-274)||(31536007-31536242)
chr6 (21-274)||(11302850-11303104)
chr6 (52-273)||(30465858-30466078)
chr6 (58-309)||(15981754-15982004)
chr6 (58-309)||(16327083-16327334)
chr6 (58-273)||(34513115-34513328)
chr6 (36-271)||(28238190-28238422)
chr6 (39-309)||(22410719-22410988)
chr6 (31-309)||(6791338-6791613)
chr6 (58-309)||(16350481-16350732)
chr6 (72-279)||(12514489-12514701)
chr6 (58-274)||(9461288-9461503)
chr6 (86-312)||(3887866-3888091)
chr6 (78-274)||(5895726-5895921)
chr6 (42-313)||(16186529-16186796)
chr6 (65-255)||(33607369-33607556)
chr6 (64-314)||(31780079-31780330)
chr6 (36-206)||(3729485-3729653)
chr6 (452-577)||(20643408-20643533)
chr6 (52-270)||(197339-197558)
chr6 (36-185)||(30248946-30249093)
chr6 (308-420)||(20643288-20643400)
chr6 (174-307)||(3729349-3729484)
chr6 (157-309)||(9428127-9428279)
chr6 (157-273)||(10669268-10669384)
chr6 (72-312)||(8644702-8644945)
chr6 (64-210)||(31486964-31487111)
chr6 (21-176)||(10260462-10260617)
chr6 (138-265)||(20522976-20523103)
chr6 (155-272)||(5084530-5084650)
chr6 (72-206)||(12503518-12503656)
chr6 (95-224)||(31039191-31039320)
chr6 (168-273)||(1514233-1514337)
chr6 (191-274)||(11081891-11081974)
chr6 (135-241)||(31152960-31153066)
chr6 (86-230)||(7365526-7365668)
chr6 (148-232)||(12514740-12514824)
chr6 (53-218)||(5457238-5457400)
chr6 (195-274)||(4250690-4250769)
chr6 (122-260)||(9941031-9941169)
chr6 (21-97)||(24067993-24068068)
chr6 (93-183)||(5191241-5191329)
chr6 (141-188)||(11082152-11082199)
chr6 (149-215)||(6418956-6419022)
chr6 (72-165)||(6419154-6419245)
chr6 (187-270)||(30248563-30248645)
chr6 (21-82)||(22351048-22351109)
chr6 (117-185)||(7595548-7595616)
chr6 (195-273)||(10260619-10260698)
chr6 (21-97)||(27442561-27442634)
chr6 (21-97)||(30269815-30269890)
[»] scaffold1091 (1 HSPs)
scaffold1091 (21-309)||(1771-2058)
[»] chr7 (89 HSPs)
chr7 (21-274)||(4089359-4089610)
chr7 (21-312)||(19235923-19236214)
chr7 (26-273)||(26632842-26633088)
chr7 (21-274)||(18121902-18122152)
chr7 (28-309)||(21388202-21388482)
chr7 (21-275)||(1324702-1324954)
chr7 (47-274)||(37673732-37673958)
chr7 (21-309)||(2276437-2276722)
chr7 (21-273)||(10685081-10685331)
chr7 (21-273)||(48767560-48767812)
chr7 (19-274)||(35128381-35128634)
chr7 (65-309)||(40740911-40741154)
chr7 (21-305)||(37491478-37491760)
chr7 (21-310)||(20123409-20123692)
chr7 (23-310)||(29635901-29636186)
chr7 (52-309)||(6376021-6376273)
chr7 (105-309)||(48193575-48193779)
chr7 (56-310)||(21809541-21809793)
chr7 (27-273)||(46783706-46783950)
chr7 (24-310)||(49100630-49100919)
chr7 (64-312)||(23875994-23876241)
chr7 (21-275)||(36726030-36726284)
chr7 (52-273)||(48610027-48610245)
chr7 (54-274)||(40263706-40263926)
chr7 (28-292)||(42983479-42983744)
chr7 (91-273)||(27213483-27213665)
chr7 (65-273)||(27170008-27170213)
chr7 (21-310)||(37047996-37048277)
chr7 (56-273)||(21800950-21801165)
chr7 (86-312)||(28663713-28663936)
chr7 (78-274)||(27162818-27163012)
chr7 (21-273)||(25750364-25750613)
chr7 (19-197)||(21759792-21759969)
chr7 (56-226)||(47458080-47458248)
chr7 (72-311)||(35960336-35960574)
chr7 (155-310)||(31373689-31373844)
chr7 (26-270)||(43601031-43601270)
chr7 (52-273)||(33181291-33181509)
chr7 (56-309)||(29723421-29723672)
chr7 (124-310)||(21392853-21393039)
chr7 (86-306)||(26200892-26201111)
chr7 (21-274)||(36116316-36116566)
chr7 (91-225)||(28038816-28038950)
chr7 (21-243)||(43465004-43465222)
chr7 (139-309)||(21752488-21752657)
chr7 (20-214)||(37136236-37136430)
chr7 (86-273)||(42993109-42993297)
chr7 (135-260)||(5334366-5334491)
chr7 (16-143)||(5333752-5333879)
chr7 (52-257)||(44648609-44648810)
chr7 (91-232)||(10408496-10408636)
chr7 (93-212)||(13907673-13907791)
chr7 (76-183)||(10593856-10593964)
chr7 (116-219)||(24700648-24700751)
chr7 (32-131)||(34118148-34118246)
chr7 (162-265)||(29992979-29993082)
chr7 (95-224)||(2409845-2409973)
chr7 (141-273)||(4068395-4068528)
chr7 (178-310)||(10595113-10595243)
chr7 (72-202)||(29993080-29993211)
chr7 (182-274)||(40211295-40211387)
chr7 (91-153)||(41672461-41672523)
chr7 (21-90)||(25098244-25098312)
chr7 (21-97)||(14801788-14801863)
chr7 (21-97)||(15248780-15248855)
chr7 (64-179)||(19477108-19477224)
chr7 (199-310)||(20124147-20124258)
chr7 (188-259)||(41672591-41672662)
chr7 (91-197)||(38729618-38729724)
chr7 (26-115)||(8318684-8318773)
chr7 (21-97)||(29983467-29983542)
chr7 (52-150)||(31365713-31365808)
chr7 (84-143)||(40211090-40211149)
chr7 (155-260)||(25828130-25828242)
chr7 (21-78)||(20124362-20124419)
chr7 (160-267)||(36195393-36195493)
chr7 (140-232)||(43026057-43026150)
chr7 (191-273)||(33671074-33671157)
chr7 (30-97)||(36858365-36858431)
chr7 (21-82)||(47423693-47423754)
chr7 (135-183)||(39102750-39102798)
chr7 (135-183)||(48832832-48832880)
chr7 (134-173)||(8318651-8318690)
chr7 (91-166)||(26828390-26828464)
chr7 (64-165)||(25829104-25829205)
chr7 (173-219)||(26830131-26830177)
chr7 (187-220)||(12645602-12645635)
chr7 (86-150)||(21291182-21291244)
chr7 (121-165)||(20124291-20124335)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (21-310)||(49095-49383)
scaffold0013 (72-243)||(61191-61361)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (66-310)||(214577-214824)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (36-271)||(38352-38584)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (21-197)||(25771-25946)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (91-273)||(99743-99926)
[»] scaffold0699 (1 HSPs)
scaffold0699 (138-270)||(7577-7708)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (52-179)||(24149-24275)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (187-309)||(19492-19612)
scaffold0176 (24-183)||(20100-20250)
[»] scaffold0182 (3 HSPs)
scaffold0182 (138-243)||(22086-22191)
scaffold0182 (168-263)||(18695-18790)
scaffold0182 (52-143)||(22554-22645)
[»] scaffold0559 (1 HSPs)
scaffold0559 (19-164)||(6614-6760)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (142-265)||(23628-23750)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (137-225)||(5866-5954)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (21-97)||(12953-13028)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (19-82)||(976-1039)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (19-89)||(54979-55049)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (21-97)||(44727-44800)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 109)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 577
Target Start/End: Original strand, 33246354 - 33246909
Alignment:
Q  18 aactactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  33246354 aactactccctccgtccata-atgtaaccacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactctttttcaaattactagatgcatttattattttt 33246452  T
Q  118 tttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaa 217  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33246453 tt--ctaaacatactcctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaa 33246550  T
Q  218 cacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatataataa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  33246551 cacacaaaatagacattttaattacactaacaacttttcttaaaaaatgtggaaaaggtaaaggag-tttacatataactacggagggagtatataataa 33246649  T
Q  318 ttcctattatccgagagaatgttgaattatttgtcattgtgtcagctgatttgctttgcatttaatgcttgatgataagtgagacttaaaagctatttgt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33246650 ttcctattatccgagagaatgttgaattatttgtcattgtgtcagcaggtttgctttgcatttaatgcttgatgataagtgagacttaaaagctatttgt 33246749  T
Q  418 ttttcagtaaattaagcactatacagcgggaaatgaatgcaaatccagactaacataaagtaaagacacttttcaactttcaaacatatctctataaaca 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33246750 ttttcagtaaattaagcactatacaaccggaaatgaatgcaaatgcagactaacataaagtaaagacacttttcaactttcaaacatatctctataaaca 33246849  T
Q  518 atctccataaattgtggaagacaccttgatttaaagcattggtgtcaagctgcatctgtg 577  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33246850 atctccataaatagtggaagacgccttgatttgaagcattggtgtccagctgcaactgtg 33246909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12624945 - 12624656
Alignment:
Q  19 actactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattt 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12624945 actactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttactattattt 12624846  T
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    | ||||||||||| | | |||||| ||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12624845 t-cctaaacatacccctcattaatcctactaatttgtcttaaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaac 12624747  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||| ||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12624746 acataaaatagtcacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaacggggggttacatatagggacggagggagta 12624656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22651712 - 22651435
Alignment:
Q  20 ctactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22651712 ctactcccttcatccttatatgtaatcacccatttgattttatttttatccttaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattatt-tttt 22651614  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22651613 tcctaaacatacccctaattaatattaataacttgtcttgaaacacgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttggtaatattaaca 22651514  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacaggga 298  Q
     |||||||| |||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||    
T  22651513 tacaaaataaacacattaattacattaataaattttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaggggttttagatataggga 22651435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 30153081 - 30153358
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccg-tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||    
T  30153081 tactccctccgtccttatatctaagccccctatttgactttatttttgtctctaaatgtaaatccatttttaaattattagatgcatttattatt--ttt 30153178  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  30153179 tcctaaacatactc-taattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaggataatttggtaatattatca 30153277  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacg 300  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||    
T  30153278 cacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaacgcaaagagagtttacatacagggacg 30153358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 22750700 - 22750987
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttt-aaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22750700 tactccctccgtccctatatgtaaccaccaatttgattttatttttgttcctaaatctaaa-tcctttttcaaattagtagatgcatttattattatttt 22750798  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
     |||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  22750799 -cctatacatacccctaattaatactactaagttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaata 22750897  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||| ||| |  |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  22750898 cacaaaacagatacattaattacacagacaacttttcttaagaaatgtgaaaaatgcaaagagggattacattaagggacggagggagta 22750987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 37625013 - 37625234
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37625013 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaacctcttttcaaattattagatgcatttattattatttttcctaaacatactcttaattaatactactaac 37625112  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| | | ||||     
T  37625113 taatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaatgataatttagtaatattaacacacaaaataaacacattaattatactgacaac 37625212  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37625213 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 37625234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19654676 - 19654385
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||  ||||||||| |||||    
T  19654676 tacttcctccgttcttatatctaagcatccatttgattttattttcatccctaaatgtaaactctttttcaaattattaaatgcgtttattatttttttt 19654577  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  19654576 cctaaacatactcctaactaatactactaacttgttttgaaatatgaaaagataaatttaatacacatacaaataaatgataatttggtaatatcaacac 19654477  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    | ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19654476 ataaaatagacacattaattacactaacagtttttcttaagaaatgtgaaaaatataaaagatgtttacatatagggacggagagagtatat 19654385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 52198585 - 52198837
Alignment:
Q  19 actactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattt 118  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||    
T  52198585 actacttcctccgtccctatatgtaagcacccatttgattt-agttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatacatttattatt-ttt 52198682  T
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  52198683 ttcctaaacatacccctaattaatactactaacttgttttgaaatataaaaagtcaaattcaatacacatacaaataaaagataatttggtaatattaat 52198782  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||| || |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  52198783 acacagaacagacatattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 52198837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25477471 - 25477221
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25477471 tacttcctccgtcc-tatatctaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtatacttattttcaaattactagatgcatttattatt-ttttt 25477374  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  25477373 cctaaacatacccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgtaatattaacac 25477274  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    | |||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25477273 ataaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 25477221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26203363 - 26203087
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcat 135  Q
    ||||||||| || || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | | |    
T  26203363 tatatgtaatcatccatttgattttacttttgtccttaaatgtaaactccttttcaaattattagatacatttattattttttttcctaaacattcccct 26203264  T
Q  136 aattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattt 235  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | |  |    
T  26203263 aattaatcatactaacttgtcttgaaatacgaaaagtcaaatttaatatacatacaaagaaaagacaattttgtaatattaacacataaaatatatacat 26203164  T
Q  236 taattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26203163 taattacagtaacaacttttcttaataaatgtggaaaaagtaaagggggcttacatatagggacggagggagtatat 26203087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5448905 - 5448656
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||    |||||    
T  5448905 tactccctccgtccctatatctaagc-cccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaacccccttctaaattattagatgtatttatt----ttttt 5448811  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5448810 tccaaacatacccataattaatactactaacatatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttcgtaatattaacac 5448711  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    |||||| |||||  ||||||| | | | ||  |||||||||||||||||||||||    
T  5448710 acaaaacagacacattaattatattgataacatttcttaagaaatgtgaaaaagg 5448656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 311
Target Start/End: Original strand, 13096436 - 13096688
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtct 157  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  13096436 tttatttttatccctaaatgcaaaccccttttcaaattactagatacatttattattatttttcctaaacatacccttaattaatactagtaacttgtct 13096535  T
Q  158 tgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttct 257  Q
    | ||||||| ||||| || ||| || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  13096536 taaaatatgaaaagttaatttttatgcacatagaaacaaatgacaatttggtaatattaacacacaacacagacacattaattacactaacaacttttct 13096635  T
Q  258 taagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtata 311  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13096636 taa-aaatgtgaaaaaagtaaagggagtttaaatacagggacggagggagtata 13096688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20291549 - 20291298
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtct 157  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||   ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  20291549 tttatttttgtctttaaatataaatctcttttcaaattactaaatgtatttattact-tttttcctaaacata-tcctaattaatactactaacttatct 20291452  T
Q  158 tgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttct 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||    
T  20291451 tgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttagtaatattaacccacaaaatagacacattaattacattaccaacttttct 20291352  T
Q  258 taagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtata 311  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20291351 taagaaatgtgaaaaaagcaaagggagtttacatatagggacgaagggagtata 20291298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 71 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29585090 - 29584861
Alignment:
Q  71 ctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaa 170  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||    
T  29585090 ctaaatataaactcatttttaaattactagatgcatttattattatttttc-taaa-atacttttaattaatactattaacttgtcttaaaatataaaaa 29584993  T
Q  171 gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29584992 gtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacacacagaatagacacattaattacactaacaatttttcttaagaaatgtgaa 29584893  T
Q  271 aaaggtaaagggggtttacatacagggacgga 302  Q
    ||| | |||||| | ||||||||| |||||||    
T  29584892 aaatgcaaagggtgcttacatacatggacgga 29584861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7002429 - 7002142
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |  |   |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7002429 tactccctccatccctatatataaccacccatttgactaaaaaattgtccctaaatataaacctcttttcaaattactagatgtatttattatt--tttt 7002332  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7002331 cctaaacatacccttaattaatactgctaacttatcttgaaatatgaaaaatcaaatttaacacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 7002232  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttctt-aagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    | |||||| | |  |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  7002231 ataaaatataaacattaattgcattaacaatttttcttaaagaaatgtgaaaaaagcaaaagggggttatatatagggacggagggagta 7002142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43801058 - 43800834
Alignment:
Q  18 aactactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  43801058 aactactccctccgtccctatatctaagcccccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaaccccctttcaaattactagatacatttattattatt 43800959  T
Q  118 tttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaa 217  Q
    || |||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43800958 tt-cctaaatatacccctaattaatactaccaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaattaaatacacatacaaacaaaggacaatttggtaatattaa 43800860  T
Q  218 cacacaaaatagacattttaattaca 243  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||    
T  43800859 cacacaaaacagacaccttaattaca 43800834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 54438760 - 54438505
Alignment:
Q  18 aactactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatt 117  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||| | |||||||||| ||    
T  54438760 aactactccctccgtctctatatctaagcatccattttattttatttttgtccctaaatgtaaatctcttttcaaattagtaga-gcatttattattttt 54438662  T
Q  118 tttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaa 217  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  54438661 tttcctaaacatgcctctaattaatactactatcttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaggataatttcgtaatattaa 54438562  T
Q  218 cacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54438561 cacacaaaacagacactttaattatacggacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 54438505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 46729552 - 46729301
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  46729552 tactccctccgtccctatatctaaacacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaatctctttttaaattattagatgcatttattatt-ttttt 46729454  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    || |||||||| | |||||||||| |  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  46729453 cccaaacatacccctaattaataccatcatcttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacataggacaatttcgtaatattaacac 46729354  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  46729353 acaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaa-aaatgtgaaaaag 46729301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34543952 - 34543701
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  34543952 tactcccttcgtccctatatataagcacccatttgattttctttttgttcctaattgtaaacttcttttcaaattactagatgcatttattatt--tttt 34543855  T
Q  121 cctaaacatactc-ataattaatactactaact---tgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatatta 216  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34543854 cctaaacattatccataattaatactactaactaattatcttgaaatatgaaaagtcaaaattaatacacatacaaacaaaggattatttggtaatatta 34543755  T
Q  217 acacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  34543754 acacacaaaatagacacattaattacacggacaacttttcttaagaaatgtgaa 34543701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24073011 - 24072762
Alignment:
Q  24 tccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcct 123  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24073011 tccctccgtctctatatctaagcacccatttgattttatttttgtccataaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattatt-tttttcct 24072913  T
Q  124 aaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacaca 223  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||||||||||| |    
T  24072912 aaacatacccttaattaatactaccatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacattcaagcaaatgacaatttcataatattaacacaaa 24072813  T
Q  224 aaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24072812 aaacagacacattaattacattgacaacttttcttaagaaatgtaaaaaag 24072762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 40411200 - 40411409
Alignment:
Q  20 ctactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40411200 ctactccctccgtccatatatttaagcatccatttgattttatttttgtccctaattgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattatt-tttt 40411298  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    || ||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||    
T  40411299 tcttaaacatacccctaattaatattattatcttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcataatattaaca 40411398  T
Q  220 cacaaaataga 230  Q
    |||||||||||    
T  40411399 cacaaaataga 40411409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16070678 - 16070426
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| |  || ||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16070678 tactccttccgtccctatatctaagcctccatttaatttaatttttatccctaaatgtaaaccccattttaaattactagatgtatttattatt-ttttc 16070580  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    || |||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16070579 ccaaaacgtacccctaattaatactactaacttgtattgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatataaacaaaagataatttggtaatattaacac 16070480  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||    
T  16070479 acaaaacagacacattaattacactgacagcatttcttaagaaatgtgaaaaag 16070426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Original strand, 10602068 - 10602316
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||| | ||||||  ||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  10602068 tactccctccattcatataactaagcacccattttactttatttttgtccataaatgtaaactcctttttaaattactagatgcattcattatt-ttttt 10602166  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  10602167 cctaaacatactcttaattaatactactaatttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatac----acaaacaaaagacaatttagtaatattaacac 10602262  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaaga-aatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  10602263 acaaaatagacaaattaattacactaccaacttttcttaaaagaatgtgaaaaa 10602316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21171969 - 21171765
Alignment:
Q  22 actccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttc 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||      
T  21171969 actccctccgtccctatatgtaaccacctatttgattttatttatgtctctaaatgtaaacttcttttcaaattactatatacatttattattttttt-- 21171872  T
Q  122 ctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacaca 221  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  21171871 ctaaacatacccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaagataatttgataatattaaccca 21171772  T
Q  222 caaaata 228  Q
    |||||||    
T  21171771 caaaata 21171765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 39237446 - 39237699
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttt-aaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39237446 tactccctccgtccatgtatctaagcattcatttgattttatttctgtctctaaatataaaaccttttttcaaattactagatgtatttattatt-tttt 39237544  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  39237545 tcctaaacatacccctaattaataatattatcttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaaca 39237644  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||| ||| |  ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39237645 cacaaaacagatacattaattacactgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 39237699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 310
Target Start/End: Original strand, 14602554 - 14602801
Alignment:
Q  66 tgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattat-tatttttcctaaacatactcataattaata--ctactaacttgtcttgaaa 162  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||| |||    
T  14602554 tgtccttaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattatatattttttctaaacatacccctaattaatatactactaacttatcttaaaa 14602653  T
Q  163 tatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaaga 262  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14602654 tataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacacaaaaactagacacattaattacactaacaacttttcttaaga 14602753  T
Q  263 aatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||| | ||||| | |||||||    
T  14602754 aatgtgaaaaaagtaaaagggggttatatataaggacgaatggagtat 14602801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52226226 - 52226014
Alignment:
Q  62 tttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaa 161  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  52226226 tttttgtccttaaatgtaaacacattttcaaattactagatgcatttattattatttttcttaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaa 52226127  T
Q  162 atatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaag 261  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| |||||  ||||||| | | ||||  ||||||||     
T  52226126 atatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaaggacaatttgataatattaacatataaaacagacacattaattatactgacaacatttcttaaa 52226027  T
Q  262 aaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||||||||||    
T  52226026 aaatgtgaaaaag 52226014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38136603 - 38136351
Alignment:
Q  15 atcaactactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattatt 114  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||| || || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||       
T  38136603 atcaaatactccctccgtctctatatttaagcatccatttgactttatttttatccataaatgtaaactccttttcaaattactagatacatttttt--- 38136507  T
Q  115 atttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatat 214  Q
       |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  38136506 ---tttcctgaacatacccctaattaatactactaacttgccttgaaatatgaaaaatcaaattaattacacatacaaacaaatgacaatttgataatat 38136410  T
Q  215 taacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38136409 taacacacaaaatagacacattaattacactaacaaattttcttaagaaatgtgaaaaa 38136351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31486735 - 31486446
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| |||   ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||     
T  31486735 tactccctccggccctatatctaaacacatatttgactttatttttgtctttaaatgtaaaccccttttcaaattactaaattcatttattattatttt- 31486637  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31486636 cctaaacatatctttaattaatattaccaacttgccttgaaatataaaaaatcaaatttaatacgcatataaacaaaggataatttagtaatattaacac 31486537  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtga-aaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31486536 acaaaatagacacattaattgcactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaaagcaaaaagggcttacatatagggacggagggagtat 31486446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 56 - 278
Target Start/End: Original strand, 41945666 - 41945886
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  41945666 attttatttttgtccctaaatgtaaatcccttttcaaattactatatgcatttattatt-tttttcctaaacatactcctacttaatattactatcttgt 41945764  T
Q  156 cttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaattttt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| | |||  ||||||||| | |||||||||    
T  41945765 cttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatacaaacaaaggacaatttcgtaatattatcacataaaaca-acacattaattacactgacaattttt 41945863  T
Q  256 cttaagaaatgtgaaaaaggtaa 278  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  41945864 cttaaaaaatgtgaaaaatgtaa 41945886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 51787986 - 51787767
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||  | |||||||||||| ||      
T  51787986 tttgattttatttttgtccttaaatataaactcctttttaaattactagatacatttattatt--ttttcctaaacatatccctaattaatactattatt 51787889  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||   ||||     
T  51787888 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgtctatttcgtaatattaacacacaaaacagacacattaattacaccgacaac 51787789  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  51787788 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 51787767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39414437 - 39414196
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaata 164  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  39414437 ttgtccctaaatataaaccccttttcaaattactagacacatttattatt-tttttcctaaacatacccctaattaataccactaacttatcttgaaata 39414339  T
Q  165 tgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaa 264  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||| |||||||||||||    
T  39414338 tgaaaagtcaaatttaa--cacatacaaacaaaagataatttgataatattaacacacaaaatagacatattaattgcattatcaacttttcttaagaaa 39414241  T
Q  265 tgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    | ||||||| |||||   || ||| ||| |||||| |||||||||    
T  39414240 tatgaaaaaagtaaaacagggttatatatagggacagagggagta 39414196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 275
Target Start/End: Original strand, 20262292 - 20262505
Alignment:
Q  59 ttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtctt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||||| ||   |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||    
T  20262292 ttatttttgtccctaaatgtaaacccattttcaaattactaaatgcatttattttt---tttcttaaacatacccttaattaatactactatcttgtttt 20262388  T
Q  159 gaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttctt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||    
T  20262389 gaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaataacaatttcgtaatattaacacacaaaacagacacattaattacactgacaacttttctt 20262488  T
Q  259 aagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    |||||||||||||||||    
T  20262489 aagaaatgtgaaaaagg 20262505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43509311 - 43509079
Alignment:
Q  39 atgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataat 138  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||| | ||||    
T  43509311 atgtaagcatccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattattagatgcatttattattttttttcttaaagatacccctaat 43509212  T
Q  139 taatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaa 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||    
T  43509211 taatactactaatttgtcttgaaatttgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgataatattaacacacaaaaca-acacattaa 43509113  T
Q  239 ttacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||| |  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  43509112 ttac-acgacaacgtttcttaagaaatgtgaaaaa 43509079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 309
Target Start/End: Original strand, 20185549 - 20185802
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||     
T  20185549 tttgattttatttttttttctaaatgtaaactc-tttttaaattactagaagcattttct----tttttcttaaacatacccttaattaatactactaat 20185643  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    ||  ||||||||| ||||||     
T  20185644 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacaaatacaaacaaaaggcaatttggtaatattaacacacaaaacttgcacattaattacactaacaaa 20185743  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtg-aaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20185744 ttttcttaagaaatgtgaaaaaatgtaaagggagtttacatatagggacgtagggagta 20185802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 272
Target Start/End: Original strand, 52552395 - 52552619
Alignment:
Q  46 cacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatact 145  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  52552395 cacccatttgactttatttttgtccctaaatataaatccctttttaaattattagatacatttattatt--ttttcttaaacatacccctaattaatact 52552492  T
Q  146 actaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaat 245  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || |||||| |    
T  52552493 actaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaattttatacacgtacaaacaaaggataatttggtaatattaacacataaagcagacaaatttattacact 52552592  T
Q  246 aacaatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
     |||| ||||||||| ||| |||||||    
T  52552593 gacaacttttcttaaaaaacgtgaaaa 52552619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 39196907 - 39197143
Alignment:
Q  37 atatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcata 136  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| | ||    
T  39196907 atatctaagcacccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaattatttttcaaattactagatgcatttattatttttttttctaaatatacaccta 39197006  T
Q  137 attaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaa-tagacattt 235  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  |||||  |    
T  39197007 attaataatactaacttgttttaaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgataatattaacacacaaaacaagacacat 39197106  T
Q  236 taattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39197107 taatcatagtgacaatttttcttaagaaatgtaaaaa 39197143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Original strand, 51918513 - 51918760
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaa--actcctttttaaattactagatgtatttattattattt 118  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  51918513 tactccctccgtctttatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaattatcccttttcaaattactagatgcatttattatt--tt 51918610  T
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51918611 ttcctcaacatacccttaattaatactgttaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaat----atacaaacaaagaataatttggtaatactaac 51918706  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||  |||||| || |||   ||||| |||| ||||||||||||    
T  51918707 acacaaaatagacacattaattgcattaa-ttttttttttaataaatgtgaaaaa 51918760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31840311 - 31840094
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||     
T  31840311 tttgactttatttttgtccctaaatataaaccccttttcaaattattagatgcatttatcat-atttttc-taaacatatccctaattaatactattaat 31840214  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
     |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||    
T  31840213 ctgtcttgaaatataaaaagacaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacacacaaaaaataca--ttaattacactaacaat 31840116  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  31840115 ttttcttaagaaatttgaaaaa 31840094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Original strand, 48472379 - 48472606
Alignment:
Q  46 cacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatact 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||| || |||  ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  48472379 cacccatttgattttatttttgtctttaaatgtaaactttttttcaaattaataaatgcttttattatt-tttttcctaa-catacccctaattaatact 48472476  T
Q  146 actaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaat 245  Q
    | || |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  48472477 attatcttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttcatacacatacaaagaaaggataatttcgtaatattaacacacaaaatagacacattaattacact 48472576  T
Q  246 aacaatttttctt-aagaaatgtgaaaaag 274  Q
     |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  48472577 gacaacttttcttaaaaaaatgtgaaaaag 48472606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20116698 - 20116448
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  20116698 tactccctccgtccctatatctaagcacccgtttgattttgtctttgtcccttaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttatt--tattttt 20116601  T
Q  121 c-ctaaacatactcataatt-aatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
      |||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||    
T  20116600 gtctaaacatacccctaatttaatactattatcttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcctaatattaac 20116501  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||| || ||  ||||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  20116500 acacaaaacaggca--ttaattacattgacaacttttcttaataaatatgaaaaa 20116448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20293995 - 20293702
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||| || || ||||||||||||||| | | ||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  20293995 tactcctttcgtccctatatctaagcatccatttgattttattttttttcataaatgtgaactcattttcaaattattagatgcatttattatttttttt 20293896  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||| ||     
T  20293895 cctaaacatacccttacttaatactactaacttgtattgaaatatgaatagtcaaatttaatacaaatacaaacaaaagacaattcagtaatattagcat 20293796  T
Q  221 acaaa--atagacatt--ttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    | |||  ||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | |||||   |||| ||| || ||||||||||||||    
T  20293795 aaaaaatatacacattaattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaggaaatttagatatagagacggagggagtat 20293702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 41919997 - 41920184
Alignment:
Q  123 taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacac 222  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41919997 taaacatacccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttatttcacatacaaacaaaagacaatttggtaatattaacacac 41920096  T
Q  223 aaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||||| || |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||| |||||||  ||||||||    
T  41920097 aaaatagaaatattaattgcactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaatgtaaaaggtgcttatatatagggacgtggggagtat 41920184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Original strand, 56373273 - 56373453
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||    
T  56373273 aaattactggatgcatttattatt--ttttcctaaacgtacccttaattaatactaataacttgtcttgaaatatgaaaaaacaaatttaatacacagac 56373370  T
Q  191 aaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  56373371 aaacaaatgacaatttggtaatattaacacacaaaataaacacattaattgcactaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 56373453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5168226 - 5168005
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| || || |||||    
T  5168226 tacttcctccgtccctatatctaagcaccaatttgattttatttttgtctctaaatgtaaacccgttttcatattactagatgcattttttttttttttt 5168127  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  5168126 c-taaacatacccttaattaatactactagcttgtattgaaatatgaaaaattaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagtaatattaacgc 5168028  T
Q  221 acaaaatagacattttaattaca 243  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  5168027 acaaaacagacatattaattaca 5168005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 50783018 - 50782773
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||    
T  50783018 tacttcctccgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgttcctaaatataacc-cctttttaagttactagatgcatttattatt--tttt 50782922  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||| || ||     |||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  50782921 cctaaacatacccctaattaatattatta-----tcttgaaatataaaaaattaaagttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaagac 50782827  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  50782826 acaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 50782773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 310
Target Start/End: Original strand, 54701159 - 54701433
Alignment:
Q  28 tccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt-cctaaa 126  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  54701159 tccgtccttatatctaagcactcatttgactttatttttgtccataaatgtaaacctcttttcaaattactagatacatttattattattttttcctaaa 54701258  T
Q  127 catactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaa 226  Q
    ||||| | ||||||      ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||   |||||| |||    
T  54701259 catacccttaatta------ctaacttatcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaataaatgacaatttgataata---acacactaaa 54701349  T
Q  227 tagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
     | |||| ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  54701350 caaacatattaattacactgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaatgtaaaggagacttacatacaggaacggagggagtat 54701433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32237043 - 32236857
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgt--atttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgt 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| || |    
T  32237043 tttatttttgtccctaaatataaatccccttttaaattactagatgtgcatttattattttttttc-taaacatacccctaattaatattactaatttat 32236945  T
Q  156 cttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattaca 243  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  32236944 attgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaagaataatttgataatattaacacacaaaacagacatattaattaca 32236857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5933102 - 5932883
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5933102 tttgactttatttttgtccctaaatataaatttcttttcaaattactagatgcaattattttt-tttttcttaaacatactcataattaataatactaac 5933004  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||    ||| | |||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||||| | ||||     
T  5933003 ttgtcttgaaattaaaaaaattaaatttaatacacataaaaacaaatgacaatttgataatattaacacacaaaacaaacacattaattacactgacaac 5932904  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  5932903 ttttcttaa-aaatgtgaaaaa 5932883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Original strand, 37174943 - 37175130
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatacta---ctaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaat 182  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||||   ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37174943 tttttaaattatgagatatatttattatt--ttttcctaaatatactcttaataaatactatttctaacttatcttgaaatatgaaaagtctaatttaat 37175040  T
Q  183 acacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37175041 acacatacaaacaaaagacaatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattac-acaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 37175130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 279
Target Start/End: Original strand, 45079709 - 45079926
Alignment:
Q  61 atttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttg-tcttg 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||    
T  45079709 atttttttccctaaatgtaaactatttttcaaattatcagattcatttattattattttttcttaacatacccttaattaatactattaactttatcttg 45079808  T
Q  160 aaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttctta 259  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  || ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || |||| | ||||||||    
T  45079809 aaatatgaaaagccaaatttaataca--tagaaagaaagaataatttgctaatattaacacacaaaatagatatgttaattgcactaactacttttctta 45079906  T
Q  260 agaaatgtgaaaaaggtaaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45079907 agaaatgtgaaaaaggtaaa 45079926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20016717 - 20016521
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaag 171  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20016717 taaatataaacctcttttcaaattactagattcatttattatt-tttttcataaacatacttttaattaatgctactaacttgtcttgaaatatgtaaac 20016619  T
Q  172 tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaa 271  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || |||| |  |||||||| ||||||||||    
T  20016618 tcaaatttaat--acatacaaacaaaggaaaatttggtaatattaacatacaaaatagaca--ttaattgcactaactacctttcttaaaaaatgtgaaa 20016523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 273
Target Start/End: Original strand, 28116483 - 28116614
Alignment:
Q  142 tactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatta 241  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28116483 tactactaatttaccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttggcaatattaacacacaaaatagacatattaatta 28116582  T
Q  242 caataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28116583 cactaacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 28116614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 10541167 - 10541365
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaag 171  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||||    
T  10541167 taaatataaactcatttttaaattattagattcatttattatt--ttttcctaaacatatccctaattaatactactaacatatcttgacatataaaaag 10541264  T
Q  172 tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaa 271  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||| || |||||| ||||||| |||||||| |||    
T  10541265 tcaaatttaatacacatttaaacaaaggataatttggtaatattaatacacaaaatatatacattaattgcattaacaacttttctttagaaatgtaaaa 10541364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5536705 - 5536491
Alignment:
Q  47 acccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatacta 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||       
T  5536705 acccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattatt-tttctcctaaacatacccctaattaata--- 5536610  T
Q  147 ctaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaata 246  Q
     |||          |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |     
T  5536609 -taat---------aatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgaaaatttcgtagtattaacacgcaaaacagacacattaattacactg 5536520  T
Q  247 acaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5536519 acaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 5536491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 305
Target Start/End: Original strand, 5416772 - 5417008
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaata--ctactaacttgtcttgaa 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||     ||||  || |||||  | |||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  5416772 tttgtccctaaatgtaagctcctttttaaattactagatgcatttttt-----ttttaatacacatatccctaattaatatactacaaacttatcttgaa 5416866  T
Q  162 atatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaag 261  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||  ||||| ||||||||||    
T  5416867 atattaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaacacaatttggtaatattaacaaacaaaatagacacatta--tacacaaacaacttttcttaag 5416964  T
Q  262 aaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggaggg 305  Q
    |||||||||| | | |||| | | ||||||||||||||| ||||    
T  5416965 aaatgtgaaagaagcaaagagagcttacatacagggacgaaggg 5417008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31917622 - 31917449
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||    
T  31917622 tactccctccgtccttatatttaagcactcatttgattttatttttatccttaaatgtaaaccctttttcaaattactagatgcatttatgat--ttttt 31917525  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa 197  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31917524 cctaaacatac-cctaattaatactactatcttatcttaaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa 31917449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52676250 - 52676048
Alignment:
Q  39 atgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataat 138  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||| ||||  | ||||    
T  52676250 atgtagccacccatttgatttgatttttttttctaaatgtaaacccctttttaaattataagatgcatttattattttttttc-taagcatatccttaat 52676152  T
Q  139 taatactactaacttgtctt-gaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatttta 237  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  52676151 taatactattaacttgtctttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatataaataaaggacaatttaataatattaatacaaaaaatagacatatta 52676052  T
Q  238 atta 241  Q
    ||||    
T  52676051 atta 52676048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 54359927 - 54359759
Alignment:
Q  23 ctccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcc 122  Q
    ||||||| |||  ||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  54359927 ctccctctgtctctatatctaaacactcatttaattttatttttgtctttaaatgtaaaccacttttcaaattactagatgcatttattatt--ttttcc 54359830  T
Q  123 taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaa 193  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  54359829 taaacatacacctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaa 54359759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 282
Target Start/End: Original strand, 3684077 - 3684306
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||  ||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  3684077 tttgactttatttttgtccttaaatataaatttatttttaaattattaaatgcatttattattttttt--ctaaatatacatccaattaatactactaac 3684174  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaa-gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    || |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||   ||||    
T  3684175 ttatcttgaaatatgaaaacgttaaatttaatatacatataaacaaatgataatttaataatattaatacacaaaatagacacattaattacaccgacaa 3684274  T
Q  251 tttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaaggg 282  Q
    | |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  3684275 tctttcttaataaatgtgaaaaaagcaaaggg 3684306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8246468 - 8246336
Alignment:
Q  48 cccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactac 147  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  8246468 cccgtttgacttaatttttgtccataaatgtaaaccctcttttaaattactagatgtatttattatt-tttttcctaaacatattcataattaatactat 8246370  T
Q  148 taacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaa 181  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  8246369 taatttgtcttgaaatatgaaaaattaaatttaa 8246336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8250597 - 8250465
Alignment:
Q  48 cccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactac 147  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  8250597 cccgtttgacttaatttttgtccataaatgtaaaccctcttttaaattactagatgtatttattatt-tttttcctaaacatattcataattaatactat 8250499  T
Q  148 taacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaa 181  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  8250498 taatttgtcttgaaatatgaaaaattaaatttaa 8250465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Original strand, 44812467 - 44812662
Alignment:
Q  23 ctccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcc 122  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||    
T  44812467 ctccatccgtccttatatctaagcattcatttgattttatttttgtccataattgaaaatccctttttaaagtattatatgcatttattatt-tttttcc 44812565  T
Q  123 taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    |||| |||| | |||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||    
T  44812566 taaagatacccctaattaatactactattttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacacacaaataaatgacaattttgtaatattaaca 44812662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3094563 - 3094409
Alignment:
Q  39 atgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttatta--ttatttttcctaaacata-ctcat 135  Q
    |||||| ||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| | | |    
T  3094563 atgtaagcactcatttgactttatttttgtgcttaaatgtaaactcctttttaaattagtagatatatttattattttatttttcctaaatataccccgt 3094464  T
Q  136 aattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3094463 aattaatactattaagttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatac 3094409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 273
Target Start/End: Original strand, 26186743 - 26186864
Alignment:
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||    
T  26186743 ttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgataatattaacacacaaaataaatatcttaattgcactaacaat 26186842  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  26186843 tattattaagaaatgtgaaaaa 26186864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 292
Target Start/End: Original strand, 45628046 - 45628203
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatt 234  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||      
T  45628046 taattaatattattaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacata-aaataaagggcaatttggtaatattaatacacaaaacagacaca 45628144  T
Q  235 ttaattacaataacaatttttctt-aagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacata 292  Q
    | ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  45628145 tcaattacactaacaacttttcttaaaaaaatgtgaaaaatataaaggggacttacata 45628203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 149
Target Start/End: Original strand, 31936952 - 31937080
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| || |  ||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31936952 tacttcctccgtccctatatctaagcatctatttaactttatttttgtccctaaatgtaaatcccttttcaaattactagatgcatttattattattttt 31937051  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactacta 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31937052 cctaaacatactcctaattaatagtacta 31937080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32108050 - 32107888
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaat 163  Q
    |||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||| |||||| || |||| ||||    
T  32108050 tttgtcctcaaatataaatttctttttaaattactagacacatttattattatttttcttaaacatatcctttattaatattactaatttatcttaaaat 32107951  T
Q  164 atgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaa 226  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  32107950 atgaaaagtcaaatttaatacatatacaaataaaagacaatttgataatattaatacacaaaa 32107888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20792054 - 20791929
Alignment:
Q  142 tactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatta 241  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20792054 tactactaacctaccttgaaatatgaaaactcaaatttaatacatatacaaataaaagataattatgtaatattaacacacaaaatagacatattaattg 20791955  T
Q  242 caataacaatttttcttaagaaatgt 267  Q
    || || ||| ||||||||||||||||    
T  20791954 cactaccaacttttcttaagaaatgt 20791929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 232
Target Start/End: Original strand, 52768841 - 52768967
Alignment:
Q  110 ttattatttttcctaaacatactcataattaatactac----taacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatt 205  Q
    ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||    || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  52768841 ttatttttcttcctaaacatacccctaattaatactacatactatcttctcttgaaatctgtaaagtcaaatttaatacacatacaaataaatgacaatt 52768940  T
Q  206 tggtaatattaacacacaaaatagaca 232  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  52768941 ttgtaatattcacacacaaaatagaca 52768967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 52977715 - 52977553
Alignment:
Q  110 ttattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggt 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||| | |||||||||||| |||  ||| |||  |    
T  52977715 ttattttttttcctaaacatacttctaattaatactactaacttattttgaaatataagaagtcaaattaagtacacatacaaataaaaaatagtttaat 52977616  T
Q  210 aatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | |||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  52977615 aatattaacacataaaatagacacatgaattgcattaacaactttttttaag-aatgtgaaaaa 52977553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34643576 - 34643436
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| || || |||  |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  34643576 ttttcaaattactagatgcatttattttt-ttcttctaaaacatacccttaattaatactactaatttatcttgaaatatgaaaaattaaatttaataca 34643478  T
Q  186 catacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaata 228  Q
    |||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  34643477 catacaaacaaa-gacaatttattaatattaacatacaaaata 34643436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41459721 - 41459631
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaa 225  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  41459721 taattaatactactaacttgtcatgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaataaaagacaatttagtaatattaacgcacaaa 41459631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20792235 - 20792129
Alignment:
Q  24 tccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcct 123  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  20792235 tccctccgtccctatatctaaacacccatttgattttatttttgatcctaaatgtaaatctctttttaaattactagatacatttattatt-tttttcct 20792137  T
Q  124 aaacatac 131  Q
    ||||||||    
T  20792136 aaacatac 20792129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Original strand, 39813816 - 39813891
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaatta 96  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39813816 tactccctccgttcttatatgtaaccatccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaatta 39813891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Original strand, 56217005 - 56217108
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatatt 215  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |    
T  56217005 tttttcctaaacatacctctaattaatactactatcttatcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacaaatacaaacaaaggacaatatcgtaatact 56217104  T
Q  216 aaca 219  Q
    ||||    
T  56217105 aaca 56217108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 182
Target Start/End: Original strand, 48609429 - 48609538
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaag 171  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  48609429 taaatataaactcatattcaaattactagatgtatttattatt-tttttcttaaatatacctctaattaatactactaactagttttgaaatatgaaaag 48609527  T
Q  172 tcaaatttaat 182  Q
    |||||||||||    
T  48609528 tcaaatttaat 48609538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3094263 - 3094178
Alignment:
Q  188 tacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3094263 tacaaacaaatgacaatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattactttaacaacttttcttaagaaatgtcaaaaa 3094178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20540152 - 20540029
Alignment:
Q  84 cctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||    ||| |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  20540152 ccttttcaaattaatagatgaatttattattttttta---aaaaatacccttaattaatactagtaacttgtattaaaatatg-aaagtcaaatttaata 20540057  T
Q  184 cacatacaaacaaaggataatttggtaa 211  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20540056 cacatacaaacaaagaacaatttggtaa 20540029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 36513201 - 36513367
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataatta--atactactaacttg------- 154  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  |||||| |||||||           
T  36513201 tttgtccctaaatgtaaacatcttttcaaattattggatgcatttattattatttttcctaaacatatccctaattaatatactattaacttgtcaagac 36513300  T
Q  155 tcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacaca 221  Q
    || | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||    
T  36513301 tcataaaatatgaaaaatcaaatttaatacatatacaaacaaaaaacaatttgataatattaacaca 36513367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 257
Target Start/End: Original strand, 31937373 - 31937485
Alignment:
Q  145 tactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaa 244  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||     
T  31937373 tactaactaatcttgaaatatgaaaagtcaaattttatatacatacaaacaaatgacaatttaataatattaacacacaaaacagacacattaattacag 31937472  T
Q  245 taacaatttttct 257  Q
    | |||| ||||||    
T  31937473 tgacaacttttct 31937485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 207
Target Start/End: Original strand, 754031 - 754178
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttatta---ttatttttc--ctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttg 159  Q
    |||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||   || ||||||  ||||| |||| | ||||||||| | ||||||| |||||    
T  754031 ttgtccctaattttaaactcattttcaaattactatatgcattttttaattttttttttcttctaaatatacccctaattaatattgctaacttatcttg 754130  T
Q  160 aaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttg 207  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  754131 aaatatgaaaagtcaaatttatcccacatacaaacaaaggataatttg 754178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21121117 - 21121019
Alignment:
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaa 217  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  21121117 ttcctaaacgtacccctaattaatactactaacttgtcttaaaatataaaaagttaaatttaatacgcatacaaacaaaagacagtttgataatattaa 21121019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 50438172 - 50438248
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  50438172 tactccctccgtccctatatgtaatcacccttttatttttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattac 50438248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31552375 - 31552257
Alignment:
Q  61 atttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttga 160  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| | | || ||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| |    
T  31552375 atttttttctctaaatataaactcctttttaaattattggttgcatttatttttttttttc-taaacatacccctaattaatactactcatttgtcttaa 31552277  T
Q  161 aatatgtaaagtcaaattta 180  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  31552276 aatatgaaaaatcaaattta 31552257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 726751 - 726666
Alignment:
Q  122 ctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttg 207  Q
    ||||| |||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  726751 ctaaatatacccctaattaatattgctaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttatcccacatacaaacaaaggataatttg 726666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3113580 - 3113446
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||| || |    || |||||||||| |  || || ||||||||||     
T  3113580 tttgactttatttttgtccctaaatataaaccttctttcaaattattagatgtattttttttc---ttccctaaacatatttttacttgatactactaat 3113484  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacata 189  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3113483 ttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacata 3113446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 49545072 - 49544991
Alignment:
Q  106 tttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacat 188  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||| | |||||||||||||||    
T  49545072 tttattatt-tttttcctaaacatactcctaattaatactactaacttatcttaaaatttaaaaaattaaatttaatacacat 49544991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 11792681 - 11792606
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  11792681 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 11792606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 11861348 - 11861273
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  11861348 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 11861273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 23611333 - 23611408
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  23611333 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 23611408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 30050201 - 30050142
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttatt 111  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  30050201 tttgattttatttttattcttaaatgtaaattcttttttaaattactagatgtatttatt 30050142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 194
Target Start/End: Original strand, 53484344 - 53484474
Alignment:
Q  63 ttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaa 162  Q
    |||||||||||||| ||||| | | |  ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||  || |||    
T  53484344 ttttgtccctaaatataaacacttatacaaattaccaggtgtatttattattttttttc-taaacaaacccctaattaatactattaacttgctttaaaa 53484442  T
Q  163 tatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaac 194  Q
    |||  ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  53484443 tataaaaaatcaaatataatacacataaaaac 53484474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 265
Target Start/End: Original strand, 18683539 - 18683634
Alignment:
Q  168 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaat 265  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||  | |||||| |||| |||||||||    
T  18683539 aaagtcaaatttaatacaaa--caaacaaaggacaagttggtaatattaacgcacaaaataaacacattaattgtattaacaactttttttaagaaat 18683634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31294334 - 31294193
Alignment:
Q  90 taaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacata 189  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||  ||||||  |||||| ||||||||||  ||| ||||||    
T  31294334 taaattattagatgcatttattat-atttttcttaagcatgcttctaattaatactattaatatgtcttacaatatgaaaagtcaaatcaaattcacata 31294236  T
Q  190 caaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagaca 232  Q
    ||||||||  | ||| | |||| ||| ||||||||| ||||||    
T  31294235 caaacaaataacaatgtagtaaaatttacacacaaactagaca 31294193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30049814 - 30049750
Alignment:
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatatta 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||    
T  30049814 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaactttaatacacatactaacaaagaacaatttgaaaatatta 30049750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 172
Target Start/End: Original strand, 15169990 - 15170077
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcc-taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagt 172  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||    
T  15169990 tttttaaattacaggatgcatttattattatttttccttaatcatacctttaattaatactattaacttgtttttaaatatgaaaagt 15170077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30866782 - 30866699
Alignment:
Q  143 actactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaa 226  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| || || ||||||    
T  30866782 actaataacttgtcttgaaaaataaaaagtcaaaattaatacacatacaaacaaataacaatttgttaataatagcatacaaaa 30866699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 130
Target Start/End: Original strand, 47846713 - 47846785
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacata 130  Q
    ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47846713 attttatttctgtttctaaatgcaaactccttcttaa--tattagatgcatttattattatttttcctaaacata 47846785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 26170251 - 26170309
Alignment:
Q  148 taacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataattt 206  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||    
T  26170251 taacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatacaaataaatgacaattt 26170309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 309
Target Start/End: Original strand, 50438926 - 50438982
Alignment:
Q  253 tttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  50438926 tttcttaagaaatgtgaaaaatgtaatggggggttatattaagggacggagggagta 50438982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3506832 - 3506749
Alignment:
Q  102 tgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||| |||||||| |||| | |||| |||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  3506832 tgtagttattatttttttccttaaatatacccacaattaatactattaacttgtcataaaatatgaaaagtaaaattaaataca 3506749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25842026 - 25841983
Alignment:
Q  150 acttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaa 193  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25842026 acttatcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaa 25841983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 114
Target Start/End: Original strand, 56216660 - 56216715
Alignment:
Q  59 ttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattatt 114  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  56216660 ttatttttatccttaaatgtaaatttcttttcaaattactagatgcatttattatt 56216715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30049481 - 30049419
Alignment:
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagg 281  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30049481 acacaaaatagacacattaattacactaatcacttttcttaaaaaatgtgaaaaaagtaaagg 30049419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 305
Target Start/End: Original strand, 50165869 - 50165922
Alignment:
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggaggg 305  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||    
T  50165869 ttttcttaagaaatatgaaaaatgtaaaaggtgtttacatacatggatggaggg 50165922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 15592646 - 15592702
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttc 121  Q
    |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15592646 ttgtccctaaatataagcactcttttaaattactagatgcatttattgttatttttc 15592702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31552237 - 31552181
Alignment:
Q  172 tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaata 228  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  31552237 tcaaatttaatacacatataaataaatgacaatttagtaatattaacataaaaaata 31552181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Original strand, 56077196 - 56077264
Alignment:
Q  54 tgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  56077196 tgattttatttttgtccctaaatataaacctttttttaaattacaatactcattaattattatttttcc 56077264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 95)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Original strand, 26878587 - 26878878
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26878587 tactccctccgtccctatatgtaacaacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaacttttttttaaattactagatgtatttattatt-ttttt 26878685  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26878686 cctaaacatacccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatatacatacaaacaaaggacaatttggtaatattaacac 26878785  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatata 313  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26878786 acaaaatagacacattaattacattaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaggcaaagggggtttacatatagagacggagggagtatata 26878878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 314
Target Start/End: Original strand, 43980442 - 43980732
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  43980442 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattatttt- 43980540  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  43980541 cctaaacatacccctaattaatcctactaatttatcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttagtaatattaacac 43980640  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatataa 314  Q
    | ||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43980641 ataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagaaaaggggg--tacatatagggacggagggagtaaataa 43980732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 309
Target Start/End: Original strand, 24962223 - 24962510
Alignment:
Q  20 ctactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24962223 ctactccctccgtccctatatgtaggcatccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattatttt 24962322  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
     ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24962323 -cctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaaca 24962421  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    || ||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24962422 cataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaa-gggaattacatatagggacggagggagta 24962510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25198532 - 25198283
Alignment:
Q  24 tccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcct 123  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  25198532 tccctccgtccctatatctaagcacctatttgactttatttttgtccctaaatgtaaactc-ttttcaaattactagatgcatttattattatttt-cct 25198435  T
Q  124 aaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacaca 223  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25198434 aaacatacccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaattttatacacatacaaacaaaggacaatttggtaatattaacacaca 25198335  T
Q  224 aaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    ||| | |||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25198334 aaacaaacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaagg 25198283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 31746265 - 31746551
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||| |||| |||| ||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||    
T  31746265 tacttcctcagtccctataactaagcacccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatacatttattatt--tttt 31746362  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  31746363 cctaaacatacccctaattaataatactaacttgctttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgtaatattaacac 31746462  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||    
T  31746463 acaaaatagacacattaattgcactaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaagaggggttacatataaggacgaagggagta 31746551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 274
Target Start/End: Original strand, 24512023 - 24512278
Alignment:
Q  19 actactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttt-aaattactagatgtatttattattatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||||    
T  24512023 actactccctccgtccatatatctaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaa-tcctttttcaaattcttagatgcatttattattatt 24512121  T
Q  118 tttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaa 217  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  24512122 tttcttaaacatacccctaattaatactactattttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgataatattaa 24512221  T
Q  218 cacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24512222 cacacaaaacagacacattaattacactgacaaattttcttaaaaaatgtgaaaaag 24512278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40517987 - 40517702
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  40517987 tactccctccgtccctatatctaaacatccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattattagatccatttattatt-ttttt 40517889  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40517888 cctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatttaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggtaatattaacac 40517789  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||| |||||    | ||||  | |||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||    
T  40517788 acaaaacagaca---catttactctgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaatgcaaagagggcttacatataaggacgaagggagtat 40517702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Original strand, 57047 - 57298
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||| || |||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  57047 tactccatctgtccctatatctaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattatt-ttttt 57145  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||    
T  57146 cctaaacatacccttaattaatactattatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaagaacaatttcgtaatattaacac 57245  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||| |||||  |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  57246 acaaaacagacacattaattacaccgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 57298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 267
Target Start/End: Original strand, 45183721 - 45183965
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45183721 tactccctccgtccctatatctaaacacacgtttgattttatttttgtctctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgcatttattatt-ttttt 45183819  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
     |||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45183820 tctaaacatacccctaatcaat-ctactaacttgtcttcaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaaggacaatttggtaatattaacac 45183918  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgt 267  Q
    | |||| | |||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  45183919 ataaaacaaacatatttattactatgacaacttttcttaagaaatgt 45183965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 36437706 - 36437461
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaat 163  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36437706 tttgtccttaaatataaactaattttcaaattactagatgcatttattatttttttgcctaaacatacccctaactaatactactaacttgtcttgaaat 36437607  T
Q  164 atgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaa 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||| ||    
T  36437606 atgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggtaatgttaacacacaaaatagacacattaattgcactaacattttttcttaaaaa 36437507  T
Q  264 atgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||| |||||| |||| | | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  36437506 atgtggaaaaggcaaagagagcttatatagagggacggagggagta 36437461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12763088 - 12762856
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12763088 tactccctccgtccttatatctaaacatccatttgattttatttttgtccctaaatctaaac-cctttccaaattactagatgcatttattatt-ttttt 12762991  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12762990 cctaaagatacccctaattaatattactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacac 12762891  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaattttt 255  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||| ||||    
T  12762890 acaaaatagacacattaattgcattaacaactttt 12762856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 296
Target Start/End: Original strand, 14577560 - 14577785
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttc-ctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaa 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14577560 taaatataaactcctttttaaattactagatgcatttattaatatttttttcttaacatatccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaa 14577659  T
Q  171 gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14577660 atcaaatttaatacacatacaaacaaagtacaatttggtaatattaacaaacaaaatagacacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaa 14577759  T
Q  271 aaaggtaaagggggtttacatacagg 296  Q
    ||| |||||||  | |||||||||||    
T  14577760 aaatgtaaaggatgcttacatacagg 14577785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 40791035 - 40790749
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| ||| |||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40791035 tactcgctctgtccctatgtctaaacacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaatttccttttcaaattactagaggtatttattatt-ttttt 40790937  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | ||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  40790936 cttaaacatgcccctagttaatactactaagttgtcttgaaatatgaatagtcaaatttattacatatacaaacaaatgacaatttggtaatattaatac 40790837  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    || ||| ||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40790836 ac-aaacagacgcattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaaataaagggggtttacattaagggacggagggagta 40790749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 45203953 - 45203719
Alignment:
Q  73 aaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagt 172  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45203953 aaatataaacccctttataaattactagatgcatttattattatttt-cctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagt 45203855  T
Q  173 caaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  45203854 caaatttaatacgcatacaaacaaaggacaagttggtaatattaacatacaaaatagacacattaattgcactaa-aaaatttcttaagaaatgtaaaaa 45203756  T
Q  273 aggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    | | |||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  45203755 atgcaaagggtgcttacatacagggatggagggagta 45203719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7172464 - 7172197
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  7172464 tactccctccgtctctatatctaaccatccatttgactttattttagtccctaaatgtaacc-ccttttcaaattactagatgcatttattatt--tttt 7172368  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  7172367 cataaacatgcccataataaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaattttaatgcacatacaaacaaatgacaattttataatattaacac 7172268  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacat 291  Q
    ||||||||||||  |||||||||  || || |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  7172267 acaaaatagacacattaattacaccaaaaagttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaaggggtttacat 7172197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41087220 - 41086971
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | | ||||| ||||||||| | |||||||||||||  | ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  41087220 tactccctccgtccttatatctaacctctcatttgactttatttttattcctaaatgtaaacatcctttcaaattactatatgcatttattatt-ttttt 41087122  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  41087121 cctaaa-atacccttaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaaggaaaatttgataatattaacac 41087023  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
    |||||  |||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41087022 acaaatcagacacattaattacactgacaatatttcttaagaaatgtgaaaa 41086971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Original strand, 1177014 - 1177265
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1177014 tactccctccgtccctatatgtaaacactcatttaattttacttttgtctctaaatataaacccctttttaaattactagatgcatttattatttttttt 1177113  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| |     
T  1177114 cctaaacatacccctaattaatactactatcttgttttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaataaaagacaatttcgtaatattaatat 1177213  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||    
T  1177214 acaaaacagacacattaattacact-ataacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 1177265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25185280 - 25184987
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattat--tattt 118  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| ||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||  | |||    
T  25185280 tactccctctgtccttatatctaagcactcatttaattctatttttgtccataaatgtaaacaccttttcaaattactagatgcattatttatctttttt 25185181  T
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  25185180 ttcctaaacatacccctaattaatactactatcttatcttgaaatatgaaaagacaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgtaatattaac 25185081  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    |||||||| |||||  ||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |  |||||  ||||||| | |||||||||    
T  25185080 acacaaaacagacacattagttacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaggcaatgggtgcatacattaagggacgaatggagtatat 25184987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Original strand, 43191342 - 43191587
Alignment:
Q  23 ctccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcc 122  Q
    |||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||     || |||    
T  43191342 ctccctccgtccttatatgtaagcatccatttgattttatttttgtctctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttttt-----ttctcc 43191436  T
Q  123 taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacac 222  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  43191437 taaacatacccctaattaatcctactaacttatcttgaaatatgaaaatttaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagtaatattaacacat 43191536  T
Q  223 aaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||  |||| || | ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43191537 aaaatagacacattaactaaattaacattttttcttaagaaatgtaaaaaa 43191587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 309
Target Start/End: Original strand, 38202866 - 38203138
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcat 135  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| | |    
T  38202866 tatatctaaacacccatttgattttatttttgtctctacatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattatt-tttttcttaaatatacccct 38202964  T
Q  136 aattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattt 235  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| | |||| |    
T  38202965 aattaatactaccatcttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgtaatattaacacacaaaacaaacatat 38203064  T
Q  236 taattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||  | ||||||||||||||    
T  38203065 taattacaccgacaacttttattaagaaatgtgaaaaagataacgggtgcctacattaaaggacggagggagta 38203138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 2562618 - 2562869
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||  | ||||||||||||||| |    
T  2562618 tttgattttatttttttttctaaatgtaaattcctttttaaattattagatgcatttattattttttttcataaatatatccctaattaatactactatc 2562717  T
Q  152 ttgtctt-gaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| | |||     
T  2562718 ttgtcttagtaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaacatacaaaacagacacattaattacactgacag 2562817  T
Q  251 tttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggag 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||  ||||||||||    
T  2562818 tttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaagggag-ttacattaagggacggag 2562869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7772748 - 7772507
Alignment:
Q  31 gtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacata 130  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7772748 gtccctatatgtaaacacccatttgattttacttttgtccctaaatataaacatcttttcaaattactagatgtatttattatt--ttttcctaaacata 7772651  T
Q  131 ctcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaataga 230  Q
      | |||||||||  | || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  7772650 tccctaattaatatcaatatcttatcttgaaatatgaaaagtgaaatttaatacacatacaaataaaggacaatttcgtaatattaacacacaaaacaga 7772551  T
Q  231 cattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  7772550 cacattaattacaatgacaacttttcttaaaaaatgtaaaaaag 7772507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 10396090 - 10396378
Alignment:
Q  22 actccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttc 121  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||    
T  10396090 actcccttcgtccctatatctaagcacccgtttgattttgtttttgtcccttaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttatttat-tttttc 10396188  T
Q  122 ctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacaca 221  Q
    |||||||||  | ||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  10396189 ctaaacatatccctaattaatattattatcttgtcttgaaatacgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgtaatattaacaca 10396288  T
Q  222 caaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatata 313  Q
    ||||| | |||  ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| | || ||| |  ||||   ||||||||||||||||||||    
T  10396289 caaaacaaaca--ttaattacattgacaacttttcttaataaatgtgaaaaatgaaatgggtgcatacaataagggacggagggagtatata 10396378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34882852 - 34882629
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  34882852 tttttaaattactatatttatttattatt-tttttcctaaacatattcttaattaatacgactaatttatcttaaaatatgaaaagtcaaatttaacaca 34882754  T
Q  186 catacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggt 285  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||     
T  34882753 catacaaacaaaagataatttgataatattaacacacaaaatagacacattaattgcattaacaatttttcttaaaaaatgtgaaaaaaataaaagggga 34882654  T
Q  286 ttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  34882653 ttatatataggaacggagggagtat 34882629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17933948 - 17933664
Alignment:
Q  23 ctccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttt-aaattactagatgtatttattattatttttc 121  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||    
T  17933948 ctccctccgtccttatatctaaacactcatttgattttatttttgtccctaaatataca-tcctttttcaaattactagatacatttattatt---tttc 17933853  T
Q  122 ctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaata-ttaacac 220  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||    
T  17933852 ctaaacatactcataattaatattaataccttgtcttcgtatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacagtttggtaatatttaacac 17933753  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||    
T  17933752 acaaaatagacacattaattacatcgacaatttttcttacgaaatgtgaaaaa-acaaagggggcttacatacaagaacggatggagtat 17933664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 31252514 - 31252763
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  31252514 tactcccttcgtccttatatctaagcatccatttgattttatttttgttcctaaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattattatttt- 31252612  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||    
T  31252613 cttaaacatacccctaatttatactactatcttgtcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatgcaaacaaatgtttatttcgtaatattaacac 31252712  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  31252713 acaaaacagacacattaattacactgataattttt-ttaagaaatgtgaaaa 31252763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 274
Target Start/End: Original strand, 38761246 - 38761469
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt-tcctaaacatactcataattaatactactaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||  | |||||||||||||||     
T  38761246 tttgattttatttttgtccctatatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattatttttttcttctaaacatatccctaattaatactactat 38761345  T
Q  151 cttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||    
T  38761346 cttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcataatattaacacacaaaacagacacattaattacactgacaa 38761445  T
Q  251 tttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
     |||| |||| |||| ||||||||    
T  38761446 ctttttttaataaatatgaaaaag 38761469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 56 - 273
Target Start/End: Original strand, 5191443 - 5191658
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgt 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||| |||| |||| ||||    
T  5191443 attttatttttgttcctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttaatatt-tttttcttaaacatacccctaattagtactgctaaattgt 5191541  T
Q  156 cttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaattttt 255  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |  |||||||||||    
T  5191542 cttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatataaacaatggacaatttggtaatattaacacacaaaacagacacattaattgc-ctaacaattttt 5191640  T
Q  256 cttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5191641 cttaagaaatgtgaaaaa 5191658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 45185156 - 45185377
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  45185156 tttgactttatttttgtctctaaatgtaaactcattttcaaattactggatgcatttattattattttttctaaacatacccttaatcaatactactaac 45185255  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||| |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||||  || |||||||  ||||     
T  45185256 ttgtcttaaaatttgaaaagtcaaaatgaatacacatacaaacaaaggacaatttgataatattaatacataaaacagacacatttattacaacgacaac 45185355  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45185356 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 45185377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 885707 - 885458
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  885707 tactccctccgttcgtatatctaagcacccatttgattttatttttggtcctaaatttaaaccccttttcaaattactagatgaatttattatt-ttttc 885609  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | |||| |||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  885608 cataaatatac-cttaattaataccactaatttgtcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttgataatattaacac 885510  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    || ||| ||||||  |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  885509 ac-aaacagacataataattacactgacaacttttcttaataaatgtgaaaaa 885458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22590579 - 22590333
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaat 163  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  | | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22590579 tttgtccctaaatataaacctcttttcaaattactagatccatttattattatttc-cttgaacatacccctaattaatactactaacttatcttgcaat 22590481  T
Q  164 atgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaa 263  Q
    ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||| ||||||||||||    
T  22590480 atgaaaagtcaaatttaacacttatacaaacaatggacaatttggtgatattaacacaaaaaatagacacattaattgcactaacaaattttcttaagaa 22590381  T
Q  264 atgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtata 311  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22590380 atgtgaaaaaagcaaagggggtttatatacaaggacggagagagtata 22590333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 316
Target Start/End: Original strand, 40601899 - 40602194
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||| || || ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40601899 tactccctccatcattatatctaaacatccatttgactttatttttgtccttaaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattattattttt 40601998  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
      || |||||| | ||| || || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40601999 tatacacatacccctaagtactagtactaacttgcattgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttagtaatattaacac 40602098  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatataata 316  Q
    | |||  |||||  |||||| || ||| || |||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||| |  |||| |||||||||| ||||    
T  40602099 ataaataagacacattaattgcactaataacttttctgaaaaaatgtgaaaaaagcaaagggggcttacatataaagacgaagggagtataaaata 40602194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 24276517 - 24276702
Alignment:
Q  123 taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacac 222  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24276517 taaacatacccctaattaatattactaacttgttttgaaatatgtaaagtaaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacacac 24276616  T
Q  223 aaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
      ||||||||  ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24276617 --aatagacacattaattatactaacaactttttttaagaaatgtgaaaaaggcaaagagggtttacatatagggacggagggagtat 24276702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37141942 - 37141685
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||| ||| |    
T  37141942 tttgattttatttttgtccctaattgtaaaccctttttcacattactagatgcatttattattttttttcctaaacatattcttaatta-tacttctatc 37141844  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| | ||||     
T  37141843 ttgacttgaaatacgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgtaatattaacacacaaaacagatacattaattacactgacaac 37141744  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||| |||| |||||||||||| | ||  || | ||||||  || ||||||||||||||    
T  37141743 tttttttaaaaaatgtgaaaaatgcaataggtgcttacattaagagacggagggagtat 37141685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 38773207 - 38773460
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  38773207 tactccctccgtcactatatctaagcactcatttgattttatttttatccctaaatttaaacctcttttcaaattattagatgcatttattatt-ttttt 38773305  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  38773306 cctaaacatacctctaattaatactaccatcttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttcatacacatacaaacaaaagacaatttcgtaatgttaacac 38773405  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaa-tttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||| |||||  |||||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38773406 acaaaacagacacattaattgcactgacaacttttttttaagaaatgtgaaaaag 38773460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 272
Target Start/End: Original strand, 36309497 - 36309703
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaat 163  Q
    |||||| |||||| ||||   |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36309497 tttgtctctaaatataaatctctttttaaattcttagatgcatttattattatttttcctaaacataaccctaattaataatactaacttgtcttaaaat 36309596  T
Q  164 atgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaa 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||  |||||||    
T  36309597 atgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgataatattaacacacaaaatagacacattaattacggtaacaaattt--ttaagaa 36309694  T
Q  264 atgtgaaaa 272  Q
    |||||||||    
T  36309695 atgtgaaaa 36309703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37956330 - 37956116
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||       |||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  37956330 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaacccctttttaaattactaaatgcattt-------tttttcgtaaacataccc-taattaatattattatc 37956239  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||     
T  37956238 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatctaatatacatacaaacaaaggacaaattcgtaatattaacacacaaaacagacacattaattacactgacaac 37956139  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37956138 ttttcttaagaaatgtgaaaaag 37956116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 276
Target Start/End: Original strand, 37600783 - 37601001
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaa-tactactaacttgtc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  37600783 tttatttttgtccctaaatgtaaactctctttcaaattattagatgcatttattattttttttc-taaacatacccctaattaaatattactaacttgtc 37600881  T
Q  157 ttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttc 256  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||  |||||  ||||||| | | ||||  ||||    
T  37600882 ttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttggcagtattaacacataaatcagacacattaattatacttacaacatttc 37600981  T
Q  257 ttaagaaatgtgaaaaaggt 276  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  37600982 ttaaaaaatgtgaaaaaggt 37601001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 38770046 - 38770298
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  | | || ||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  38770046 tactctctccgtccttatatctaagcacccatttgattttatttttgtttccagatataaaccccttttcaaattactaaatatatttattatt-ttttt 38770144  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    |||||| |||  | ||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  38770145 cctaaatatatccctaattaatactatcctcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaaattaatacacatacaaacaaatgacaatttcgtaatattaacac 38770244  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  38770245 acaaaataaacacattaattacactgacaacttatcttaagaaatatgaaaaag 38770298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Original strand, 39543550 - 39543775
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  39543550 tttgactttatttttgtccctaaatgtaaaccctttttcaaattactagatgcatttatttatttttttcctaaacat-ctcctacttaatgctactaac 39543648  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttgg---taatattaacacacaaaatagacattttaattacaataac 248  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||   ||    
T  39543649 ttgtcttgagatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttggtaataatattaacgcacaaaacagacacattaattacacggac 39543748  T
Q  249 aatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  39543749 aacatttcttaagaaatatgaaaaagg 39543775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34158163 - 34157954
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  34158163 tactctctccgttcctatatttaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaattcattttcaaattactatatgcatttattattatttt- 34158065  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  34158064 cctaaacatac-cataattaatcctactaatttgtcttaaaatacaaaaagccaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagtaatattaacac 34157966  T
Q  221 acaaaatagaca 232  Q
    | ||||||||||    
T  34157965 ataaaatagaca 34157954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Original strand, 40337066 - 40337302
Alignment:
Q  37 atatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcata 136  Q
    |||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||| |||||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  40337066 atatgtaaacactcatttaattttatttttatccttaaatgtaaacctattttcaaattactatatgcatttattatt-tttttcctaaacataccctta 40337164  T
Q  137 attaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatttt 236  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||  ||    
T  40337165 attaatactattatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaatttaaatacacatacaaacaaaggacaattttgtaatattaacatacaaaacatacacatt 40337264  T
Q  237 aattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||| | | | || ||||| |||||||||||||||||    
T  40337265 aattatactgataacttttcataagaaatgtgaaaaag 40337302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31673813 - 31673587
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    |||||||||| |||| ||| | ||||||||| | |||| ||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31673813 tttgattttacttttatccttcaatgtaaaccctttttcaaattacaagatacatttattattctttt-cctaaacatacccttaattaatactactaac 31673715  T
Q  152 ttgtc-ttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
     |||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||| |  ||||    
T  31673714 ctgtcattgaaatttgaatagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacatacaaaataaacacattaattac-accacaa 31673616  T
Q  251 tttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaa 279  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31673615 cttttcttaaaaaatgtgaaaaaagtaaa 31673587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 124 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25888740 - 25888591
Alignment:
Q  124 aaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacaca 223  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||    
T  25888740 aaacatactcctaattaatagtactaatttgtcttaaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatatgataatattaacataca 25888641  T
Q  224 aaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25888640 aaatagacatattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtaaaaaa 25888591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Original strand, 1769339 - 1769510
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1769339 tttgattttatttttgttactaaatgtaaacctcatttcaaattattagatgcatttattatt--ttttcttaaacatacccttaattaatactactaac 1769436  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaa 226  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  1769437 ttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaat-cacatacaaacaaatgacaatgtggtaatattaacatacaaaa 1769510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 40807868 - 40808037
Alignment:
Q  19 actactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattt 118  Q
    |||||||||||||||| || |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  40807868 actactccctccgtccctacatgtaaacccccatttgactttatttttgtccttaaatgtaaacctcatttcaaattactacatgcatttaatattattt 40807967  T
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacata 189  Q
    | |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40807968 t-cctaaacatacaactaatcaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacata 40808037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 273
Target Start/End: Original strand, 14846820 - 14847031
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtct 157  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||   | |||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  14846820 tttacttttgttgctaaatgtaaactcattttcgaattactatatatatttattatttttt---cgaaacataccc-taattaataccactaacttgtct 14846915  T
Q  158 tgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttct 257  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||   |||| ||||||    
T  14846916 tgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatatggtaatattaacgcacaaagcagacacattaattacaccgacaacttttct 14847015  T
Q  258 taagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||| ||||||||||||    
T  14847016 taaaaaatgtgaaaaa 14847031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Original strand, 12998617 - 12998804
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttg-----tcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12998617 aaattactcgatgcattaattatt-tttttcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgtcttgaaatatgaaaggtcaaatttaataca 12998715  T
Q  186 catacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||  | | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12998716 catacaaacaaaggacaatttagtaatattcacacacaaaatatgcacattaattgaactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 12998804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Original strand, 30262430 - 30262635
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttt-aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaa 150  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||| | | ||||||||||||||||    
T  30262430 tttgattttaattttgtccataaatataaa-tccttattcaaattactagatgcatt-attattttttt--ctaaacatgcccctaattaatactactaa 30262525  T
Q  151 cttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  30262526 cttgtcttgaaatttgaaaagttagatttaagacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacatacaaaatagacacattaattgcactaacaa 30262625  T
Q  251 tttttcttaa 260  Q
     |||| ||||    
T  30262626 ctttttttaa 30262635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 279
Target Start/End: Original strand, 3113491 - 3113649
Alignment:
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    |||||||||||   ||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  3113491 cctaaacataccattaattaatactataaacttatcttgaaatatgaaaaattaaatttaatacacatataaacaaaagacaatttgataatattaacac 3113590  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaa 279  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3113591 acaaaacagacatattaattacactgataattttttttaagaaatgtgaaaaatgtaaa 3113649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14739650 - 14739433
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactact--- 148  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || | ||| |||||       
T  14739650 tttgattttatctttatctctaaatgtaaatccctttctaaattactagatgtatatattact-tttttcctaaacataccgctattgaatgctacttca 14739552  T
Q  149 --aacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaata 246  Q
      |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  |||||||||       
T  14739551 ctaacttgtcttgaaatatgaatagtcacatttaatacacacacaaacaaaggataatttggtaatattaacatataaaataaacacattaattacacgg 14739452  T
Q  247 acaatttttcttaagaaat 265  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  14739451 acaacttttcttaaaaaat 14739433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 310
Target Start/End: Original strand, 16002698 - 16002870
Alignment:
Q  138 ttaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatttta 237  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||  |||    
T  16002698 ttaatactattatcttgttttgaaatataaaaagtcaaatttaatacaaatacaaacaaaggataatttcttaatattaacacacaaaactgacacatta 16002797  T
Q  238 attacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||  ||||||||| |||||||    
T  16002798 attacacagacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaaggaaatgggtgtctacattaagggacggatggagtat 16002870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 23399673 - 23399835
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    ||| ||||||||| ||  | || ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||     
T  23399673 attttatttttgttcctaaatgtaaacctagtttcaaattactaaat--actt-ttattttttttcttaaacatacctctaattaatactactaacttgg 23399769  T
Q  156 cttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacaca 221  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23399770 tttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacaca 23399835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14906683 - 14906561
Alignment:
Q  187 atacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| | || |||||||||||| ||||| |||| |    
T  14906683 atacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatattaattacattaataacttttatgaaaaaatgtgaaaaaagtaaaagggg-t 14906585  T
Q  287 tacatacagggacggagggagtat 310  Q
    || ||| |||||||||||||||||    
T  14906584 tatatagagggacggagggagtat 14906561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 312
Target Start/End: Original strand, 16644047 - 16644185
Alignment:
Q  174 aaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16644047 aaatttaacacacatacagacaaagaacaatttagtgatattaacacacaaaatatacacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 16644146  T
Q  274 ggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
     | || | | | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16644147 tgcaatgagtgcttacatacagggacggaaggagtatat 16644185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 45283346 - 45283528
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||    ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| |||||   |||||||  ||||||    
T  45283346 tactccctccgtccttatatctaagcatttatttgactttatttttgtccttaaatgtaaattctttttcaaattattagatacgtttatta--attttt 45283443  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataattt 206  Q
    ||||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45283444 cctaaacatatccctaattaatgttactaacttg-cttgaaatatgaatagtcaaatttaatacccatacaaacaaatgataattt 45283528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 177
Target Start/End: Original strand, 41371691 - 41371818
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt--cctaaacata-ctcataattaatactact 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41371691 tttgactttatttttgtccctaaatgtaaaccctcttgtaaattatcagatgcatttattattatttttttcctaaacataactc-taattaatactact 41371789  T
Q  149 aacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41371790 aacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaat 41371818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Original strand, 14522266 - 14522379
Alignment:
Q  84 cctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtc-aaatttaat 182  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||||||||    
T  14522266 ccttttcaaattactagatgcatttattatt-tttttcctaaacatacccttaattaatactactaacttatcttgaaatttgaatagtcaaaatttaat 14522364  T
Q  183 acacatacaaacaaa 197  Q
    |||||| ||||||||    
T  14522365 acacatgcaaacaaa 14522379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16357234 - 16357133
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||| |||||| |||||    
T  16357234 tactccctccgtccctatatgtaaccacccctttgtttttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattacaacatgcattaattatttttttt 16357135  T
Q  121 cc 122  Q
    ||    
T  16357134 cc 16357133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23280860 - 23280699
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgt 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||| ||   ||||||    |||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||     
T  23280860 attttatttttgttcctaaatgtaaatctattttcaaattactaaatacttttatt----tttttcttaaacgtacctctaattaatactactaacttgg 23280765  T
Q  156 cttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacaca 221  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23280764 cttgtaatatgaaaaatcaaatttaataaacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacaca 23280699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 270
Target Start/End: Original strand, 3006777 - 3006888
Alignment:
Q  159 gaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttctt 258  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||    
T  3006777 gaaatataaaaagtcaattttaatacacatacagataaatgataatttagtaatattaacacataaaatagacatattaattatactaacaacttttctt 3006876  T
Q  259 aagaaatgtgaa 270  Q
    ||||||| ||||    
T  3006877 aagaaatatgaa 3006888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 309
Target Start/End: Original strand, 14522643 - 14522750
Alignment:
Q  202 aatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacgg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||| | ||||||    
T  14522643 aatttggtaatattaacacacaaaacatacacattaattacactaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaatgtaaaggaaacttacatataaggacgg 14522742  T
Q  302 agggagta 309  Q
    ||||||||    
T  14522743 agggagta 14522750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35794898 - 35794779
Alignment:
Q  113 ttatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaat 212  Q
    |||||||| ||||||| || | | ||||||||||| || |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  35794898 ttattttttctaaacacaccccttattaatactaccaatttgtccgaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgataat 35794799  T
Q  213 attaacacacaaaatagaca 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  35794798 attaatacacaaaatagaca 35794779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41541744 - 41541550
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaactt-gtcttgaaatatgtaaa 170  Q
    ||||||||||||| |||| || |||| ||||  ||||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||||| || |||||| || |  ||||||| |||    
T  41541744 taaatgtaaactcattttcaagttaccagatacatttattattattttttgtaa-catacccttaattaatattattaactttgtatgaaaatatgaaaa 41541646  T
Q  171 gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtg 268  Q
    ||||||||||||||| |||  || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  41541645 gtcaaatttaatacatata--aataaaggacaatttgataatattgacacacaaaatagacacattagttgtactaactatttttcttaagaaatgtg 41541550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2031386 - 2031213
Alignment:
Q  98 tagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||||||    
T  2031386 tagatgtatttattattctttt-cttaaacatacctctaattaatactactaatttatcttgaaatatgaaaaatataatttaatacatatacgaacaaa 2031288  T
Q  198 ggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaa 279  Q
    ||| |||||| | ||||||||||       | |||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  2031287 ggacaatttgattatattaacac-------atacatattaattgcactaacaatttttctgaagaaatatgaaaaatgtaaa 2031213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44255570 - 44255448
Alignment:
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||  | |||      
T  44255570 ttgtctttaaatataaaaagtcaaatttaatacacgtacaaacaaatgacaatttgataatattaacacacaaaaaaggcacattaattacgctcacatc 44255471  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  44255470 ttttcttaacaaatgtgaaaaag 44255448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10860930 - 10860830
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtct 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  10860930 tttatttttatccctaaatgtaaatccatcttcaaattactagatgcatttattat-atttttcctaaacatttccataattaatactactaacttgtct 10860832  T
Q  158 tg 159  Q
    ||    
T  10860831 tg 10860830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Original strand, 35709055 - 35709168
Alignment:
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||| | | || || || |||||| ||||||||||    
T  35709055 ttcctaaatatactcataattaatactactaactaatcttaacatatgaaaagtcaaatttaatacacacatatacgaaagacaatttgataatattaac 35709154  T
Q  219 acacaaaatagaca 232  Q
    ||| ||| ||||||    
T  35709155 acataaactagaca 35709168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Original strand, 4273862 - 4273947
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatac 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  4273862 tttatttttgtccttaaatgtaaacttcttttcaaattactagatgcatttattatt-ttttttctaaacatacccttaattaatac 4273947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 2303339 - 2303258
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagat 102  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2303339 tactccctccgtccctatatctaagcaaccatttgaatttatttttgtcccgaaatgtaaactccttttcaaattactagat 2303258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 2327933 - 2327852
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagat 102  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2327933 tactccctccgtccctatatctaagcaaccatttgaatttatttttgtcccgaaatgtaaactccttttcaaattactagat 2327852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 148
Target Start/End: Original strand, 3005983 - 3006109
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  3005983 tactccctccgtcccggtatgtaaacacctatttgactttatttttgttcctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgaatttattatt-ttctt 3006081  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactact 148  Q
    |||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  3006082 cctaaagatacccctaattaatattact 3006109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10709529 - 10709381
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||    |||| |||||| ||||||  |||||||  ||||||  ||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  10709529 tttgattttatttttgtatttaaatgtaaatattttttcaaattattagatgcttttatta--attttttataaacatatccctaattattactactaac 10709432  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggata 202  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  10709431 ttgttttgaaatatgaatagtcaaatttaatacagataaaaacaaatgata 10709381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33385380 - 33385318
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33385380 taattaatactactaacttgtcttgaaatacgaaaagtcaaatttaatatacatataaacaaa 33385318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34870007 - 34869831
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| | || | |     ||||||| |||||||||||| || ||    
T  34870007 ttttaaaattattagatgcatttattattttttttc-taaacatacccttaattaatactgccaattag-----aaatatgaaaagtcaaattttatgca 34869914  T
Q  186 catacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtg 268  Q
    || | ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||   |||||||||||||| |||||||    
T  34869913 cagataaacaaatgacaatttgataatattaatacacaaaatatacacattagttacaccgacaatttttcttaaaaaatgtg 34869831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 12894102 - 12894273
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt---tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttga 160  Q
    |||||| |||||| ||||   ||||| |||||| |||||| ||||||| || ||||   ||||||| ||||   | |||||||||| ||| || ||||||    
T  12894102 tttgtctctaaatataaatctcttttcaaattagtagatgaatttattgtttttttctttcctaaaaatacatttgattaatactaataaattatcttga 12894201  T
Q  161 aatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagaca 232  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  12894202 aatatgaaaagtcaaactaaatacaaatacaaacaaatgacaatatggtaatatttccatacaaaatagaca 12894273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27705 - 27569
Alignment:
Q  129 tactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaata 228  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| ||| |||||  ||| |||||||||||||| | | ||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  27705 tactcgtaattaattctactaatttgttttgtaatataaaaaatcaaatttaatacatacataaacaaatgacaatttagtaacattcacacataaaata 27606  T
Q  229 gacattttaattacaataacaatttttcttaagaaat 265  Q
    |||   || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  27605 gacgcattcataacactaacaatttttcttaagaaat 27569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14907286 - 14907213
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacata 189  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  14907286 tttttcttaaacatacccttaattaatactgctaacttatcttgaaatatgaaaaatcaaatttaacacacata 14907213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 5969799 - 5969874
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  5969799 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 5969874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 31008331 - 31008406
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  31008331 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 31008406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 41726154 - 41726229
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  41726154 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 41726229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 189
Target Start/End: Original strand, 7727321 - 7727375
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacata 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  7727321 taattaatactactaacttgtcttggaatatgaaaagtcaaatgaaatacacata 7727375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 310
Target Start/End: Original strand, 45283827 - 45283928
Alignment:
Q  208 gtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggag 307  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||   ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  45283827 gtaatattaacacataaaacagacacattaattacattgataatttttcttaagaaatttgaaaaa-acaaaaggggcttacatatagggacggaggaag 45283925  T
Q  308 tat 310  Q
    |||    
T  45283926 tat 45283928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43182689 - 43182529
Alignment:
Q  112 attatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaa 211  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| || | || ||||| | ||| | |||||||||||||||| | | |||| | || ||  |||    
T  43182689 attattttttctaaacatacccctaattaatcctactaatttattttaaaatacgaaaatttaaatttaatacacatatatataaagaacaa-ttaataa 43182591  T
Q  212 tattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| |||| ||| || ||||| ||| |||| |||||||    
T  43182590 tattaacacataaaatagacacgttaactacattaataacttttcataaaaaatttgaaaaa 43182529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Original strand, 4273955 - 4274019
Alignment:
Q  210 aatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||||||||| |||| | |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4273955 aatattaacacataaaacaaacacattaattacactaacaatatttcttaagaaatgtgaaaaag 4274019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Original strand, 13486946 - 13487006
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaa 81  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13486946 tactctcttcgtccatatatttaaccacccatttgattttatttttatccttaaatgtaaa 13487006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 180
Target Start/End: Original strand, 16643582 - 16643660
Alignment:
Q  105 atttattattatttttcctaaacatactc---ataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaattta 180  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||    
T  16643582 atttattattattttttctaagcatacccctaataattaatactactaacttgtcttgaaacttgaaaagttaaattta 16643660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 19726509 - 19726584
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||    
T  19726509 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgcaaac-cttttttaaattac 19726584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 27679070 - 27679145
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  27679070 tactctcttcgtccatatatttaaacactcatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 27679145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34116336 - 34116233
Alignment:
Q  85 ctttttaaattactagatgtatttattattatttttcct-aaacata-ctcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaat 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||  ||| ||||||    
T  34116336 ctttttaaattactagatatatttattttattttttccttaaacatatctc-taactaatactactaacttgtcttgaaatttaaaaatccaagtttaat 34116238  T
Q  183 acaca 187  Q
    |||||    
T  34116237 acaca 34116233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3656155 - 3656103
Alignment:
Q  30 cgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaac 82  Q
    ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3656155 cgtccatatatttaaacatccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac 3656103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31499065 - 31498949
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatatt 215  Q
    |||||| |||||||||   |||||||||||||||| || |||| ||||||  ||| |||| || ||| |||||||||||||| || |||||  ||| |||    
T  31499065 tttttcataaacatacctctaattaatactactaatttatcttaaaatattaaaaatcaatttaaatgcacatacaaacaaatgacaatttaataaaatt 31498966  T
Q  216 aacacacaaaatagaca 232  Q
     ||||| ||| ||||||    
T  31498965 tacacataaactagaca 31498949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 183
Target Start/End: Original strand, 38662516 - 38662613
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaa-cttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||| |||| | ||||||||| || ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  38662516 ttttcaaattactaaatgcatttattattattttctc-aaatatacacctaattaatattattaaacttatcttgaaatataaaaagtcaaatttaata 38662613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11444162 - 11444017
Alignment:
Q  66 tgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatat 165  Q
    ||||||||||||||  | |  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||  | |||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  11444162 tgtccctaaatgtatgcccactttcaaattactagatgcatttattatt--ttttcc-aaatataaccctaattaatactactaatttgtcttaaagtat 11444066  T
Q  166 gtaaagtcaa-atttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaata 213  Q
    | || |||||  || |||||| ||| | ||||||| || ||||||||||    
T  11444065 gaaacgtcaatgttgaatacatatatacacaaagggtactttggtaata 11444017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Original strand, 4840803 - 4840843
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtc 156  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4840803 tttttcttaaacatactcgtaattaaaactactaacttgtc 4840843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 316
Target Start/End: Original strand, 15512638 - 15512932
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15512638 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattatttt- 15512736  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15512737 cctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacac 15512836  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatataata 316  Q
    | ||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15512837 ataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaggggggttacatatagggacggagggagtatataata 15512932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 28948821 - 28949111
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28948821 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattatttt- 28948919  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28948920 cctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacac 28949019  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    | ||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28949020 ataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaggggggttacatatagggacggagggagtatat 28949111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 5084946 - 5085233
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5084946 tactccctccgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattatt-ttttt 5085044  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  5085045 cctaaacatacccctaattaatactactatcttctcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttcgtaatattaacac 5085144  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |  |||||  ||||||||||||||||    
T  5085145 acaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaaggcaatgggtgcctacattaagggacggagggagta 5085233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 51997202 - 51996910
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||||||| |||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  51997202 tactccctctgtcccttaatgtagccacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaatccccttttcaaattacaatatgcatttattatt-ttttt 51997104  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtctt-gaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  51997103 cctaaacatactcttaattaatactactaacttgtctttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacgatttggtaatattaaca 51997004  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaa-tgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    || |||| | |||  ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51997003 cagaaaacatacaaattaattacactgacaacttttcttaagaaattgtgaaaatagcaaagggggtttacatatagggacggagggagtatat 51996910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 52141032 - 52141321
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  52141032 tactccatccgtccatatatttaagcatccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaatcactagatgcatttattatt-ttttt 52141130  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||  | || |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  52141131 cctaaacatatccctagttaatattactaacttgtcttaaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttgataatattaacac 52141230  T
Q  221 acaaaatagaca--ttttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||||||    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| || | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  52141231 acaaaatagacacgcattaattacactaataatttttcttaaaaaatgtgaaaaaagcaaatggaggttacatatagggacggatggagta 52141321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25063458 - 25063167
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatg--tatttattattattt 118  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| |||    
T  25063458 tactccctccatccctatatgtaaccacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaactccttttcaaattactagatacatatttattatt-ttt 25063360  T
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25063359 ttcctaaacatacccctaattaatcctactaacttgtcgtgaaatatgaaaagtgaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattaggtaatattaac 25063260  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtata 311  Q
    |||||||| |||||  ||| || || ||| || ||||||||| |||| | |||||  |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  25063259 acacaaaacagacacattatttgcattaataacttttcttaaaaaatataaaaaatataaaaggggtttacattcatgaacggagggagtata 25063167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Original strand, 30898420 - 30898711
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  30898420 tactccctctgtccctatatctaagtacctatttgattttatttttgttcctaaatgtaaaccctttttcaaattaccagatacatttattatt-ttttt 30898518  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30898519 cctaaacatacccctatttaatgctactaacttatcttaaaatatgaatagtcacatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 30898618  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatata 313  Q
    | |||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30898619 ataaaacagacacattaattacactgacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaaggagtttacatacagggacggagggaatatata 30898711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 51390395 - 51390682
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  51390395 tactccctccatccctatatctaaacacccatttgactttaattttgtccctaaatgtaaacccctttttaaattactagatgcatttattatt--tttt 51390492  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||    
T  51390493 cctaaacatacccttaattaaaactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggtaa---taacac 51390589  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttc-ttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||   ||| || | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  51390590 acaaaatagacacattaattgcattaacaattcttctttaagaaatgtgaaaaattcaaaaggtgcttagatatagggacggagggagtatat 51390682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3143650 - 3143361
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  3143650 tactctctccgtccctatatttaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtacaccccttttcaaattatcagatgcatttattattattttt 3143551  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
     | |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  3143550 tccaaacatacccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacataaaaacaaaagacaattttgtaatattaacac 3143451  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |  |||||  |||||| ||||||||||    
T  3143450 acaaagcagacacattaattacaatgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaatgggtgcctacattaagggacagagggagtat 3143361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Original strand, 48721734 - 48721976
Alignment:
Q  29 ccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaaca 128  Q
    |||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  48721734 ccgtccctatatctaaacacctatttgattttatttttgtccctaaatgtaaccctcttttcaaattactagatgcatttattatt--ttttcctaaaca 48721831  T
Q  129 tactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaata 228  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  48721832 tacccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaacacacaaaaca 48721931  T
Q  229 gacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||  ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||    
T  48721932 gacacattaattacactgacagcttttcttaagaaatgtgaaaaa 48721976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 65 - 309
Target Start/End: Original strand, 4813362 - 4813606
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaata 164  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  4813362 ttgtccctaaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattattttttttcctaaacatattcctaattaatacggctaacttattttgaaata 4813461  T
Q  165 tgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaa 264  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  4813462 tgaaaagtcaaatttaacacacatacaaacaaagaataatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattgcattaacaacttttcttaagaaa 4813561  T
Q  265 tgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  4813562 tgtgaaaaaagcaaaagggggttatatatagggacgaagggagta 4813606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15179656 - 15179369
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||| || ||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  15179656 tactcccttcgtccctatacgtaaccatccattttattttatttttgttcataaatgtaaaa-cctttttaaattattagatgcatttattattatattt 15179558  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
      ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  15179557 tttaaacatatccctaattaatcctactaacttgtcttgaaatacgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattttgtaatatttacgc 15179458  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    | ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15179457 ataaaatagacacattaattacactgacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaatggggtttacatatagggacgatgggagta 15179369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 4817763 - 4818052
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4817763 tactccctccgtcactatatctaagcacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaactcatttccaaattactagatgtatttattatt-ttgtt 4817861  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||    
T  4817862 cttaaacatactcttaattaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgataatattaatac 4817961  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaa-gggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    |||||| | |||   ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  4817962 acaaaacacaca--ataattacaccgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaaacaaaggggggtttacattaagggacaaagggagtatat 4818052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 4829563 - 4829852
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4829563 tactccctccgtcactatatctaagcacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaactcatttccaaattactagatgtatttattatt-ttgtt 4829661  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||    
T  4829662 cttaaacatactcttaattaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgataatattaatac 4829761  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaa-gggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    |||||| | |||   ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  4829762 acaaaacacaca--ataattacaccgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaaacaaaggggggtttacattaagggacaaagggagtatat 4829852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33232071 - 33231799
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcat 135  Q
    |||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  33232071 tatatgtaaatacccatttgattttacttttgtccctaaatataaattcattttcaaattactagatgcatttattatt-tttttcctaaacatacccct 33231973  T
Q  136 aattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattt 235  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |    
T  33231972 aattaataccactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcagatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaacacacaaaacagacacat 33231873  T
Q  236 taattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||  |  |||||  ||||||||||||||||    
T  33231872 taattacactgacaactttttttaagaaatgtgaaaaaggcaatggatggctacattaagggacggagggagta 33231799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 47643786 - 47643502
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||| ||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47643786 tactccttccgtccatacgtctaaacacccatttgattttatttttgtccataaatgtaaacccctttccaaattactagatgcatttattattattttt 47643687  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
       |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  47643686 ta-aaacatacccttaattaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatgcaaacaaaggacaatttagtaatattaacac 47643588  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    | || ||| |||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||| |||||    
T  47643587 aaaacatacaca--ttaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa-gcaaagggagtttacattaagggacggagagagta 47643502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Original strand, 28723538 - 28723756
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||    
T  28723538 tttgattttatttttgtccttaaatataaacatcttttcaaattactagatgcagttattattatttttcctaaacatacccctaattaatattaccaac 28723637  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgt--aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataaca 249  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28723638 ttgtcttgaaatatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattacactaaca 28723737  T
Q  250 atttttcttaagaaatgtg 268  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  28723738 acttttcttaaaaaatgtg 28723756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Original strand, 34696734 - 34696992
Alignment:
Q  15 atcaactactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattatt 114  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34696734 atcaactattccctccatccctatatctaagcatccatttgattttatttttgttcctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgtatttattatt 34696833  T
Q  115 atttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatat 214  Q
     ||||||||||||||   | |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  34696834 -tttttcctaaacatgtccctaattaatactactattttgtcttgaaataggaaaagtcaaatttcatgcacatacaaacaaatgacaatttcgtaatat 34696932  T
Q  215 taacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34696933 taacacacaaaacagacatattaattacactgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 34696992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Original strand, 5321879 - 5322133
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||     
T  5321879 tactccctccgtccctatgtctaaacacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatacatttattatttttttc 5321978  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||| |||||    
T  5321979 cctaaacatacccctagttaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaattttaatacatatacaaacaaataacaatttcgtaatataaacac 5322078  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | | || ||||||||| |||| |||||||||    
T  5322079 acaaaacagacacattaattacattgataacttttcttaaaaaatatgaaaaagg 5322133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 310
Target Start/End: Original strand, 23982456 - 23982737
Alignment:
Q  28 tccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaac 127  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||| |  |  ||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  23982456 tccgtccctatatctaaacactcatttgactttatttttatttcataatgtaaaccccttttcaaattgctagatacatttattattatttt-cctaaac 23982554  T
Q  128 atactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaat 227  Q
    |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||     
T  23982555 atatccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatacaaacaaatgtcaatttgataatattaacacacaaaac 23982654  T
Q  228 agacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  23982655 agacacattaattacattgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaatgcaaaggggacttacatatagggacggagggagtat 23982737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32152365 - 32152117
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtct 157  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  32152365 tttatttttgtccttagatgtaaa-tcccttttgaattactatatgcatttattatt--ttttcctaaacatacccctaattaatactactaacttatct 32152269  T
Q  158 tgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttct 257  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||    
T  32152268 taaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaataacaatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattgcaccaacaacttttct 32152169  T
Q  258 taagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | ||| ||| | ||||||||||||||    
T  32152168 taagaaatgtgaaaaatgtaaaaggtgcttagatataaggacggagggagta 32152117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 28334081 - 28334324
Alignment:
Q  25 ccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttccta 124  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28334081 ccctccgtccctatatgtaaacacccatttgattttacttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttatttttatttttccta 28334180  T
Q  125 aacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaa 224  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |      ||||||||||    
T  28334181 aacatacccctaattaataccactatcttgccttaaaatatgaaaattcaaatttaatacacatataagcaaaggacaatttcg------taacacacaa 28334274  T
Q  225 aatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    || |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28334275 aacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 28334324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Original strand, 8984583 - 8984806
Alignment:
Q  85 ctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatac 184  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8984583 cttttcaaattactagatgcatttatt-ttatttttcctaaacttaccc-taattaatactactaatttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatac 8984680  T
Q  185 acatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaaggggg 284  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||    
T  8984681 acatacaaacaaatgacaatttagtaatattaacacacaaaacagacacattaattacactaacaattttccttaaaaaatgtgaaaaatgcaaaggagg 8984780  T
Q  285 tttacatacagggacggagggagtat 310  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||    
T  8984781 cttacatatagggacagagggagtat 8984806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16582766 - 16582527
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatt--tttcctaaacatactc 133  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  16582766 tatatgtaaacacccatttgattttacttttgttcctaaatataaatttcttttcaaattactagatgcatttattattattattttcctaaacacaccc 16582667  T
Q  134 ataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacat 233  Q
     |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  16582666 -taattaatatcactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaagacaatttcgtaatattaacacacaaaacagacac 16582568  T
Q  234 tttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
     ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16582567 attaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 16582527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 71 - 308
Target Start/End: Original strand, 13723376 - 13723621
Alignment:
Q  71 ctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt--cctaaacatactcataattaatactacta------acttgtcttgaaa 162  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| ||||||||      |||| ||||||||    
T  13723376 ctaaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattattatttttttcctaaacatgcccctaattattactactagtactaacttatcttgaaa 13723475  T
Q  163 tatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaaga 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||    
T  13723476 tatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaatacacaaaatagacacattaattgcactaacaacttttcttaaga 13723575  T
Q  263 aatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagt 308  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  13723576 aatgtgaaaaatgcaaagggtgcttacataaagagatggagggagt 13723621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36085216 - 36084964
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttt-aaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36085216 tactccttccgtccctatatctaagcactcatttaattttatttttgtccctaaatgtaaa-tcttttttcaaattactagatgcatttattatt-tttt 36085119  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    || ||||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  36085118 tcttaaacatacccctaattaatactattatcttgtctcgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaataaaggataatttcttaatattaaca 36085019  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||| ||| |  ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  36085018 cacaaaacagatacattaattacactgataatttttcttaaaaaatgtgaaaaag 36084964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3831293 - 3831008
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  3831293 tactccctccgttcctatatctaagcgccaatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattaat-ttttt 3831195  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  3831194 cctaaacatatccctaattaatacttctatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaacatacatacaaacaaatgacaatttcgtaatattaacac 3831095  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||||||| |  ||||| ||  | | || ||||||||| |||||||||||| | ||  || ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  3831094 acaaaatagatacattaataac--tgataacttttcttaaaaaatgtgaaaaatgcaataggtgtttacattaagggacggaaggagta 3831008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 46495524 - 46495270
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  46495524 tttgattttatttttgtccgtaaatgtaaatccttttttaaattacaagatgcatttattatt--ttttcctaagcatacgcttaattaatactattaac 46495427  T
Q  152 ttgtctt-gaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||    
T  46495426 ttgtctttgaaatttgaaaagtcaaatttaatatacatacaaataaaggacaatttgataatattaacacacaaaacagacacattaattacactgacaa 46495327  T
Q  251 tttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggag 307  Q
    ||||| || | ||||||||||||   ||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  46495326 tttttttttaaaaatgtgaaaaaaacaaaggaggtttacatatatggacggagggag 46495270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 275
Target Start/End: Original strand, 29140529 - 29140764
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcat 135  Q
    |||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||    |||||||||| | |    
T  29140529 tatatgcaaacacccatttaattttacttttgtccttaaatgtaaacccctttttaaattattagatgtatttttttttctt----ctaaacatacccct 29140624  T
Q  136 aattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattt 235  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||  |    
T  29140625 aattaataccactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattttgtaatattaatacacaaaacagacacat 29140724  T
Q  236 taattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    ||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29140725 taattacaccggcaacttttcttaagaaatgtgaaaaagg 29140764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10842491 - 10842283
Alignment:
Q  103 gtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggata 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10842491 gtatttattatt-tttttcctaaacatacccctaattaataccgttaactcatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaacacacatacaaacaaacgata 10842393  T
Q  203 atttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacgga 302  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||| |    
T  10842392 atttggtaatattaa--cacaaaatagacatattaattgcattaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagtaaaagggggttatatatagggacgaa 10842295  T
Q  303 gggagtatataa 314  Q
    ||||||||||||    
T  10842294 gggagtatataa 10842283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25258541 - 25258281
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgt 155  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25258541 attttatttttgttcttaaatgtaaattcattttcaaattacaagatgcatttattattttttt--ctaaacatactcctaattaatactactaaattgt 25258444  T
Q  156 cttgaaatatgtaaa-gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttt 254  Q
     |||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||| || |||||| |||    
T  25258443 tttgaaacatgaaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggtaatatcaagacataaaatagacacattaattgcactaacaacttt 25258344  T
Q  255 tcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatataataa 317  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||| || | ||| ||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  25258343 tcttaaaaaatatgaaaaatgtaaaaggtgcttaaatataaggacagagggagtaaataataa 25258281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 87 - 272
Target Start/End: Original strand, 44652784 - 44652965
Alignment:
Q  87 ttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacac 186  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44652784 ttttaaattattagatgcatttattatt-tttttcctaaacatacccctaattaatactactaacttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacac 44652882  T
Q  187 atacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||    
T  44652883 atacaaacaaagaacaatgtggtaatattaaaacacaaaacagacacattaattacactaaca---tttcttaagaaatgtgaaaa 44652965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8878016 - 8877765
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||| || | ||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8878016 tactacctccgtccctatatctaagcaccaatttgattttatttt-gttcttaaatgtaaacta-ttttcaaattactagatgcatttattatt-ttttt 8877920  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
      ||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  8877919 aataaacatacccctaattaatactactatcttatcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgtaatattaacac 8877820  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    |||||| | |||  ||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8877819 acaaaacaaacacattaattatactgacaatttttcttaaaaaatatgaaaaagg 8877765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 35365870 - 35366092
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatt-tttcctaaacatactcataattaatactactaa 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||  |||    
T  35365870 tttgactttatttttgtccctaaacgcaaacccattttcaaattactagatgcatttattattattattttctaaacatacctttaattaatactgttaa 35365969  T
Q  151 cttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||    
T  35365970 cttgtcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgataatattaacacacaaaatagatacattacttacactaacaa 35366069  T
Q  251 tttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
     ||||  |||||||| |||||||    
T  35366070 cttttagtaagaaatatgaaaaa 35366092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31305444 - 31305277
Alignment:
Q  142 tactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatta 241  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||    
T  31305444 tactactaatttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggtaatattagcatacaaaatagacacattaatta 31305345  T
Q  242 caataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31305344 caccaacaacttttcttaataaatgtgaaaaaagcaaaaggggtttacatatagggacggagggagta 31305277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2343115 - 2342889
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||| |||||| |||||  |||| ||    || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2343115 tttgattttctttttatccctaaatgtaagtcccttttcaaattattagatacatttttt----ttcttcataaacataccc-taattaatactactaac 2343021  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||    
T  2343020 ttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacacacaaacaaaagacaatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaagtaaactaacaat 2342921  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  2342920 ttttcttaaaaaatgtgaaaaaagcaaagggg 2342889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32047651 - 32047403
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgt 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  32047651 attttatttttatccctaaatgtaaaccctttttcaaattacttgatgcatttattatt--ttttcttaaacatacccctaaataatactactatcttgt 32047554  T
Q  156 cttgaaatatgtaaa-gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttt 254  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| | |||| |||    
T  32047553 cttgaaatatgaaaaagtcaaatttaa--cacatacaaacaaatgacaatttcgtaatattaacacacaaaacaaacacattaattacactgacaacttt 32047456  T
Q  255 tcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggag 307  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||| |  |||||  ||||||||||||||    
T  32047455 tcttaagaaatgtgaaaaaagcaatgggtgcctacattaagggacggagggag 32047403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20564958 - 20564770
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcc-taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatac 184  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20564958 ttttcaaattactagatgcatttgttattatttttccctaaacatacatctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatac 20564859  T
Q  185 acatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20564858 acattcaaacaaaagacaattttgtaatattaacacataaagtagacacattagttacactatcaacttttcttaacaaatgtgaaaaa 20564770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25269596 - 25269371
Alignment:
Q  47 acccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatacta 146  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||| | |||||||||  |    
T  25269596 acccatttgattttacttttgttcctaaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattact--ttttcttaaacatacccctaattaatatca 25269499  T
Q  147 ctaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaata 246  Q
     || |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||| |     
T  25269498 ttatcttgcctcgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggaaaatttcgtaatattaacacataaaacagacacattatttacactg 25269399  T
Q  247 acaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25269398 acaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 25269371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 46591351 - 46591077
Alignment:
Q  18 aactactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatt 117  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  46591351 aactactccctctgtccctatatctaagcactcatttgactttatttttgtctttagatgtaaactttttttcaaattactagatgtatttattatc-tt 46591253  T
Q  118 tttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaa 217  Q
    ||||| ||| | || | ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||    
T  46591252 tttcccaaatacacccctaattaatattactaacttgtcttgaaatttgaaaaatcaaatttaatacacatagaaacaaaggacaattcgataatattaa 46591153  T
Q  218 cacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatac 293  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||| | |||| ||||||||| | |||| ||| | ||||| |||| ||| ||||    
T  46591152 cacacaaaacaaacacattaattacactcacaacttttcttaaaatatgtaaaacaagtaaaaggggcttatatac 46591077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 15911461 - 15911655
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaag 171  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||  ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  15911461 taaatataaaccccttttcaaattattagatgcatgtattattttttt--ctaaacatacctttaattaatattactaacttgtcttgaaatatgaaatg 15911558  T
Q  172 tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtg 268  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15911559 tcacatttaatacacatacaaacaaatggttatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaagtacactaacaacttttcttaagaaatgtg 15911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30336222 - 30336054
Alignment:
Q  105 atttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataat 204  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||||| |||    
T  30336222 atttattatttttttttctaaacatatccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaattcaaattttatacgcatagaaacaaaggacaat 30336123  T
Q  205 ttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  30336122 ttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattacaccgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 30336054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 44395753 - 44395531
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttc--ctaaacata-ctcataattaatactact 148  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||   |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||   ||||| ||| ||| |||||||||||| |    
T  44395753 tttgattttatttttatccttaaatataaatctctttttaaattattaaatgcatttattatttttttttttctaaatatatctc-taattaatactatt 44395655  T
Q  149 aacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataac 248  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||    
T  44395654 aacatgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatatacatacaaacaaaggataattttgtaatattaacacataaaataaacatattaattacactgac 44395555  T
Q  249 aatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
    ||  ||||||||||||||||||||    
T  44395554 aacatttcttaagaaatgtgaaaa 44395531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32144520 - 32144306
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtct 157  Q
    ||||||||||||| || ||||| | ||  |||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||    
T  32144520 tttatttttgtccttagatgtata-tcgcttttgaattactatatgcatttattattttttttcctaaacatatccctaattaatattattaacttgtct 32144422  T
Q  158 tgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttct 257  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||  ||||| ||||||    
T  32144421 taaaatatgaaaagtcaaattttatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacgcacaaaatagacacattaaatgcaccaacaacttttct 32144322  T
Q  258 taagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||| |||||    
T  32144321 taagaaatgtaaaaaa 32144306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13145601 - 13145448
Alignment:
Q  84 cctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  13145601 ccttttcaaattactagatgtattaattatt-tttttcctaaacatacccctaattaatattactaacttatcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatg 13145503  T
Q  184 cacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaa 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  13145502 cacatacaaacaaaggacaatttggtaatattaacatacaaaacagacatattaa 13145448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34012701 - 34012550
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  34012701 tttgattttatttttgtcgttaaatgtaaacttttttttaaattactagatgcatttattatt--ttttcctaaacatacccttaattaatactactatc 34012604  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34012603 ttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatataaacaaaggaaaatt 34012550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 111 - 272
Target Start/End: Original strand, 31807919 - 31808079
Alignment:
Q  111 tattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggta 210  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31807919 tattattttttctaatcataccc-taattaatactactaacttgtcttgaaataggaaatgtcaaatttgatacacatgcaaacaaaagataatttggta 31808017  T
Q  211 atattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  31808018 atattaacacacaaaatagacacattaattacactaacaacttttctcaagaagtgtgaaaa 31808079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44335502 - 44335248
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattacta-gatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || || || |||||||        ||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  44335502 tttgattttatttttgtccctaaatataaattcgtttttcaaataataagatgtat--------attttttttaaacatatccttaattaatactactaa 44335411  T
Q  151 cttgtctt-gaaatatgtaaagtcaaatttaat---acacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaata 246  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |     
T  44335410 cttgtctttgaaatttgaaaagtcaaatttaattatacacgtacaaacaaaggacaatttggtaatattaacacacaaaacagacacattaattacactg 44335311  T
Q  247 acaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  44335310 acaacttttattaagaaatgtgaaaaa-acaaagggggtttacatataggaacggagggagtat 44335248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 117 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27531250 - 27531049
Alignment:
Q  117 ttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatatta 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||  || |||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  27531250 ttttcttaaacatactcataattaatattactaacttatcttgaaatatgtagggttaaattttttatacatacaaacaaagaacaattaagtaatatta 27531151  T
Q  217 acacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatataata 316  Q
    |||||||||| | |||  ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27531150 acacacaaaacaaacacattaattatactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaatgcaaagggaacttacatacagggacggagggagtat-taata 27531052  T
Q  317 att 319  Q
    |||    
T  27531051 att 27531049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Original strand, 16395440 - 16395626
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||| |||  ||||||||| || ||||    
T  16395440 tttgactttatttttgttcgtaaatgcaaactc-tttttaaattattagatgcatttattatt---tttcctaaacacactt-taattaatattattaac 16395534  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattaca 243  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  16395535 ttgttatgaaatatgaaaagtcaaattttacacacatacaaacaaaagataatttggtaatattaacatacaaaatagacacattaattaca 16395626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 150 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38680593 - 38680465
Alignment:
Q  150 acttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataaca 249  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  38680593 acttgttttgaaatatgcaaagacaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgataatattaacacacaaaatagacacattaattacactaaca 38680494  T
Q  250 atttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaa 278  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38680493 acttttcttaagaaatgtgaaaaaagtaa 38680465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4082121 - 4081931
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaag 171  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||     
T  4082121 taaatataaactcattttcaaattactaaatgcatttgttattatttt-cctaaacatatccctaattaataatactaacttgtctttaaatatgaaaaa 4082023  T
Q  172 tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || |||  |||||| || ||| || ||||||||||||    
T  4082022 tcaaatttaatacacatacagacaaatgataatttagtaatattaacatacaaactaaacacattaattgcattaataacttttcttaagaa 4081931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44163468 - 44163227
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  44163468 tactccctccgtccctatacataagcacccatttgactttatttttatccctaaatgtaaac-ccctttcaaattactagatgcatttattat--ttttt 44163372  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
     | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||    ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  44163371 gccaaatacactcttaattaatactactaacttgtcttgaaatatg----atca----taatacacatacaaacaaatgacaatttaataatattaacac 44163280  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||| | |||  ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||    
T  44163279 acaaaacaaacacattaattacactgataactttttttaagaaatgtgaaaaa 44163227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Original strand, 46732849 - 46732988
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||     
T  46732849 tttgactttatttttgtccctaaatgtaaatccttttttaaattacta-atgcatttattatt-ttttccctaaacatacccctaattattactactaat 46732946  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaa 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46732947 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaa 46732988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10160917 - 10160712
Alignment:
Q  62 tttttgtccctaaatgtaaactccttttt-aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttga 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||  || ||||||    
T  10160917 tttttgtccctaaatgtaaacccctttttcaaattactagatgcgtttattatt-tttttcctaaacataccc-taattaatactattatattatcttga 10160820  T
Q  161 aatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaa 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||| |       |||||  ||||||||| | | || |||||||||    
T  10160819 aatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgaatatttcataatattaacgc-------agacacattaattacactgataacttttcttaa 10160727  T
Q  261 gaaatgtgaaaaagg 275  Q
    |||||||||||||||    
T  10160726 gaaatgtgaaaaagg 10160712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 273
Target Start/End: Original strand, 47754622 - 47754750
Alignment:
Q  145 tactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaa 244  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||     
T  47754622 tactaacttattttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacacaaaaaatagacacattaattgcac 47754721  T
Q  245 taacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  47754722 taacaattttttttaagaaatgtaaaaaa 47754750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 273
Target Start/End: Original strand, 15457718 - 15457923
Alignment:
Q  66 tgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatat 165  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  15457718 tgtccttaaatataaacccctttttaaatttttagatgtatttattat-attttttctaa-catattcctaattaatattactaatttgttctgaaatat 15457815  T
Q  166 gtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaat 265  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| | || |||| |  | |||||| |||| |||||||||    
T  15457816 gaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgataatattatcacacaaaataaatatattaactgtactaacaactttttttaagaaat 15457915  T
Q  266 gtgaaaaa 273  Q
     |||||||    
T  15457916 atgaaaaa 15457923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34102454 - 34102331
Alignment:
Q  150 acttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataaca 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | |    
T  34102454 acttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaataaacatacaaacaaagaataatttgataatattaacacacaaaacagacacattaattacaatgaaa 34102355  T
Q  250 atttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||| |||| |||||||    
T  34102354 atttttcttaaaaaatttgaaaaa 34102331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3072350 - 3072147
Alignment:
Q  53 ttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaact 152  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||  |||||| |||||  |||||||||| ||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  3072350 ttgactttatttttgttcctaaatgtaaccttatttacaaattagtagatacatttattattttttt--ctaaacatacctctaattaatactactaact 3072253  T
Q  153 tgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatt 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||  ||||||||||||| |||||| |||  |||||| || |||||| |    
T  3072252 tgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacataaaaaaaaa--acaatttaataatattaacacataaaataaacacattaattgcactaacaact 3072155  T
Q  253 tttcttaa 260  Q
    ||||||||    
T  3072154 tttcttaa 3072147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24415204 - 24414993
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||           ||| ||||     
T  24415204 tttgactttatttttatccttaaatataaatccccttttaaattactagatgcatttattattatttttt-taaatatac-----------actgctaat 24415117  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||   |||||    
T  24415116 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttggtaatattaacacacaaaagagatacattaattacaccgacaat 24415017  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
     || ||||| |||||| |||||||    
T  24415016 attacttaataaatgtaaaaaagg 24414993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 248
Target Start/End: Original strand, 47070931 - 47071044
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  47070931 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacgcatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacacataaaatagacaca 47071030  T
Q  235 ttaattacaataac 248  Q
    ||||||||| ||||    
T  47071031 ttaattacactaac 47071044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 9675530 - 9675776
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgatttta-tttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    |||||| ||||||  ||||| ||| ||||  |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||       ||||    
T  9675530 tactccatccgtctttatatctaaacaccaatttgattttagtttttttctctaaatgtaaacccctttacaaattacta-atgtattt-------tttt 9675621  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
     ||||||||||| | ||||||||| || || ||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  9675622 ccctaaacatacccctaattaatattattatcttattttgaaatatgaatagtcaaatttaatacacatacaaataaaggacaatttcgtaatattaaca 9675721  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||  |||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||||    
T  9675722 cacaaatcagacaaattaattacactgacaacttttcttaagaaacgtaaaaaag 9675776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 50692520 - 50692369
Alignment:
Q  158 tgaaatatgtaaagtcaaattta-atacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttc 256  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || | |||| |||||    
T  50692520 tgaaatatgaacagtcaaatttataaacacatacaaacaaaggacaatttggtaatactaacacacaaaatagacacattaattgcattgacaacttttc 50692421  T
Q  257 ttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagt 308  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||    
T  50692420 ttaagaaatgtgaaaagggcaaagggggcttatatatagggactgagggagt 50692369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 172 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41737221 - 41737124
Alignment:
Q  172 tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtga 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  41737221 tcaaatttaaaacacatacaaacaaaagacaatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacactaacaacttttcttaagaagtgtga 41737124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 232
Target Start/End: Original strand, 291555 - 291702
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttatt-attatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatac 184  Q
    |||| |||||||||  |||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  291555 ttttcaaattactatgtgtatttatttatttattttcctaaatatactcctaattaatactactaacttatcttaaaatataaaaagttaaatttaatac 291654  T
Q  185 acatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagaca 232  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  291655 aaatacaaacaaatgacaatttagtaatattaacatacaaaatagaca 291702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 35001265 - 35001379
Alignment:
Q  160 aaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttctta 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  35001265 aaatatgtaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcataacattaacacacaaaacagacattttgattacactgacaacttttctta 35001364  T
Q  260 agaaatgtgaaaaag 274  Q
    | |||||||||||||    
T  35001365 ataaatgtgaaaaag 35001379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 273
Target Start/End: Original strand, 28679770 - 28679928
Alignment:
Q  113 ttatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaat 212  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||    
T  28679770 ttatttttcctaaaaatacccctaattaatactaaaaacttatcttgaaatattaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaa-aacaatttaataat 28679868  T
Q  213 attaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  28679869 attaacacacaaaatagacacattaattgcattaacaactttttttaa-aaatgtgaaaaa 28679928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40261794 - 40261554
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaactt-gtcttgaaat 163  Q
    |||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  40261794 ttgttcctaaatgtgaatcccttttcaaattactatattcatttatcattatttt-ccttaacatcc--ataattaatatcactaactttgtcttgaaat 40261698  T
Q  164 atgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaa 263  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| || |||| | ||||| ||||||    
T  40261697 ataaaaagtcaaatttaatacatata--aacaaagggcaatttgataatattaacacacaaaataaacacattaattgcactaactacttttcataagaa 40261600  T
Q  264 atgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||| ||| ||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  40261599 atgtg-aaagggtaaaaagtgtttgcatatagggacggagggagtat 40261554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32716038 - 32715918
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  32716038 tactccctccgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgtctctaaatgtaaac-ccttttcaaattactagatgcgtttattatt-ttttt 32715941  T
Q  121 cctaaacatactcataattaata 143  Q
    | ||||||||| | |||||||||    
T  32715940 cataaacatacccctaattaata 32715918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 97
Target Start/End: Original strand, 12843999 - 12844076
Alignment:
Q  20 ctactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12843999 ctactccctccgtccctatatgtaaccacccttttgtttttatttttgtccctaaatgtaaacccctttttaaattac 12844076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13353008 - 13352832
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac-ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacata 189  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||  |||||    
T  13353008 aaattactagatgcacttattctt--ttttccttaacatactcttaattaatactactaactttgtctcgaaatatgaaaaggcaaatataat--acata 13352913  T
Q  190 caaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
    |||| ||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||  | |||| |  ||||||||||||||||||    
T  13352912 caaataaatgacaatttgctaatattaacacataaaacagacacattaattgaactaactacatttcttaagaaatgtgaa 13352832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 273
Target Start/End: Original strand, 3143713 - 3143842
Alignment:
Q  142 tactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatta 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| ||  ||||||||||||||  |||||||    
T  3143713 tactactaacttgtcttgaaatatgaaaaataatatttaataaacatacaaacaaaagacaatttgataataata--acacaaaatagacacattaatta 3143810  T
Q  242 caataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    || || ||| ||||||||||| || |||||||    
T  3143811 cactatcaacttttcttaagacatatgaaaaa 3143842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34331998 - 34331871
Alignment:
Q  145 tactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaa 244  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| || | ||||||||||||||||  ||| ||  |     
T  34331998 tactaacttctcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaaagataattcagtactactcacacacaaaatagacacattagttgtac 34331899  T
Q  245 taacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34331898 taacaattttttttaa-aaatgtgaaaaa 34331871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 149
Target Start/End: Original strand, 47753894 - 47754021
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||| || |||| ||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| || |||||||||| |||||||| |||||||    
T  47753894 tactccatctgtccctatatctaaacactcatttgactttatttttgtccctaaacgtaaacccattttcaacttactagatgcatttatta-tattttt 47753992  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactacta 149  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  47753993 cctaaacatacccctaattaatactacta 47754021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 311
Target Start/End: Original strand, 9684582 - 9684864
Alignment:
Q  30 cgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacat 129  Q
    ||||| ||||| ||| || || |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||   ||| ||    
T  9684582 cgtccttatatctaagcatccatttgattttatttttgttattaaatgtaaacccctttttaaattattagatgcatttattatttttttt--aaaatat 9684679  T
Q  130 actcataat---taatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaattta--atacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaa 224  Q
    || | ||||   |||||| ||||  |||||||||||||||  |||| |||||||  ||| | ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  9684680 acccctaattaataataccactatattgtcttgaaatatg--aagttaaatttaatatatatatataaataaaggacaattttgtaatattaacgcacaa 9684777  T
Q  225 aatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtata 311  Q
    || |||||  |||||||||   | || |||| |||| ||||||||||||  ||| ||  || || ||  ||||||||||||||||||    
T  9684778 aacagacacattaattacatcgataactttttttaaaaaatgtgaaaaatataatggctgtctatattaagggacggagggagtata 9684864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 49033919 - 49033829
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttatt 111  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  49033919 tactccctccgtccctgtatgtaaccaccaatttgattttacttttgtccctaaacataaacccctttttaaattactagatgcatttatt 49033829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6282808 - 6282688
Alignment:
Q  63 ttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaa 162  Q
    |||| |||||| || |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  6282808 ttttatccctacatataaactctgtttcaaattactagatacatttattattatttttc-taaacagactcctaattaatattactaatttgtcttaaaa 6282710  T
Q  163 tatgtaaagtcaaatttaatac 184  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
T  6282709 tatgaaaaatcaaatttaatac 6282688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Original strand, 7957551 - 7957688
Alignment:
Q  28 tccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattat-tatttttcctaaa 126  Q
    ||||||||||||| | | ||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||    
T  7957551 tccgtccatatatctcaacactcatttgactttatttttgttcttaaatgtaaacccctcttcaaattactagatgcatttattttatttttttcctaaa 7957650  T
Q  127 catactcataattaatactactaacttgtcttgaaata 164  Q
    ||||| | |||||||||||||||| || |||| |||||    
T  7957651 catacccttaattaatactactaatttatcttaaaata 7957688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 34102577 - 34102472
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  34102577 tttgattttatttttgtccctaaatataaccac-ttttcaaattattagatgcatttattatt--ttttcctaaacatgcccttaattaatactactaac 34102481  T
Q  152 ttgtcttga 160  Q
    |||||||||    
T  34102480 ttgtcttga 34102472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 273
Target Start/End: Original strand, 23393492 - 23393620
Alignment:
Q  142 tactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatta 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  23393492 tactaataacttgtcttgaaatatgaatagtcaaat--aatacacatacaaacaaatgacaatttaataa-attaatacacaaaatagatacattaatta 23393588  T
Q  242 caataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    || |||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  23393589 cattaacaacttttcttaaaaaatatgaaaaa 23393620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13699013 - 13698916
Alignment:
Q  85 ctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13699013 cttttcaaattactagttgcatttattatt-ttttccctaaacatacctataattaatactactaacttatcttaaaatatgaaaaatcaaatttaata 13698916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Original strand, 5852831 - 5852912
Alignment:
Q  145 tactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaa 226  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  5852831 tactatcttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatgcaaacaaaggacaatttcggaatattaacacataaaa 5852912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 156
Target Start/End: Original strand, 29302361 - 29302480
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcat 135  Q
    ||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  29302361 tatatctaaacacccatttaatttaatttttgtccttaaatataaatctcttttcaaattactagatgcatttattatt-tttttcctaaacatacccat 29302459  T
Q  136 aattaatactactaacttgtc 156  Q
    | |||||| ||||| ||||||    
T  29302460 atttaatattactatcttgtc 29302480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32715634 - 32715567
Alignment:
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32715634 ttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatac-aacaaagtataatttcgtaatattaacac 32715567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 40612929 - 40613009
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  40612929 taattaatactactaacttataatgaaatatgaaaagtcaaattaaatacacatttaaacaaagaataatttagtaatatt 40613009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6282563 - 6282468
Alignment:
Q  179 taatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6282563 taatacatatataaacaaaggacaattttataatattaacacataaaatagacacattaattgtactaacaatttttcttatgaaacgtgaaaaag 6282468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Original strand, 9380663 - 9380781
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac-ttgtcttgaaat 163  Q
    |||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  9380663 ttgtccctaaatgtaaacccatattcaaattactagatgcat---ttattatttttccttaacatacctttaattaagactactaactttatcttgaaat 9380759  T
Q  164 atgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    ||| ||| | ||||||||||||    
T  9380760 atgaaaatttaaatttaataca 9380781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 143
Target Start/End: Original strand, 23393146 - 23393233
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaata 143  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  23393146 attttatttttgttcttgaatgtaaatttctttttaaattattagatgcatttattattattttttctaaatatatccataattaata 23393233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 250
Target Start/End: Original strand, 40205588 - 40205670
Alignment:
Q  168 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  40205588 aaagtcaaatttgattcacaaacaaacaaaggacaatctagtaatattcacacacaaaatagacatattaatttcattaacaa 40205670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 273
Target Start/End: Original strand, 47133463 - 47133548
Alignment:
Q  189 acaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa-tttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47133463 acaaacaaatgacaatttaataatattaacacacaaaataaacacattaattacattaacaatttttttttaagaaatgtgaaaaa 47133548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 9293929 - 9293854
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  9293929 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 9293854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 44258077 - 44258002
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  44258077 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 44258002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13698648 - 13698592
Alignment:
Q  208 gtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaa 264  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13698648 gtaatattaacacgcaaaataaacatattaattacactaacaacttttcttaagaaa 13698592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43189171 - 43189092
Alignment:
Q  202 aatttggtaatattaacacacaaaatagac--attttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaa 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  43189171 aatttggtaatattaacatacaaaatagacatattataattgcactaacaacttttcttaagaattgtgacaaatgtaaa 43189092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 186
Target Start/End: Original strand, 34028471 - 34028522
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacac 186  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  34028471 taattaatactactaacttgccttggaatatgaaaagtcaaattaaatacac 34028522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 165
Target Start/End: Original strand, 37733690 - 37733749
Alignment:
Q  106 tttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatat 165  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37733690 tttattattattttttctaaatatatctttaattaatactactaacttgtcttgaaatat 37733749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12792958 - 12792908
Alignment:
Q  32 tccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaac 82  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12792958 tccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac 12792908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 197
Target Start/End: Original strand, 48573111 - 48573173
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa 197  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  48573111 taattagtactactaacttaccttaaaatatgaaaaattaaatttaatacacatacaaacaaa 48573173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Original strand, 299043 - 299128
Alignment:
Q  105 atttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||   |||||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  299043 atttattattattttttctaaatatacccctaattaatattacttgtttgtcttagaatatgaaaagtcaaattaaatatacatac 299128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 273
Target Start/End: Original strand, 37733932 - 37734001
Alignment:
Q  204 tttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37733932 tttgataatattaaaacacaaaatggacaaattaattgcactaacaatttttcgtaaaaaatgtgaaaaa 37734001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Original strand, 17426653 - 17426783
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| |||  | |||||||||| ||||| |||  ||| |||||  ||||  ||||| |||||||||      
T  17426653 aaattattagatgcatttattatt--ttttcctaaatatatccctaattaatacaactaaattgcattggaatataaaaaggaaaattaaatacacat-- 17426748  T
Q  191 aaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaa 225  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  17426749 aaacaaaggacaatttagtaaaattcacacacaaa 17426783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 48302999 - 48303074
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  48302999 tactctcttcgtccatatatttaaacactcatttgattttatttttgttcttaaatgtaaac-cttttttaaattac 48303074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 130
Target Start/End: Original strand, 5852596 - 5852668
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacata 130  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  5852596 attttatttttattcttaaatgtaaaactcttttcaaattactagatgcatttattat--tttttcctaaacata 5852668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Original strand, 8984363 - 8984426
Alignment:
Q  18 aactactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaa 81  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  8984363 aactactccctccatccctatatctaagcacccatttgactttatttttgtcccgaaatttaaa 8984426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Original strand, 1846710 - 1846771
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaac 82  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  1846710 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttttcgttaaatgtaaac 1846771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 31305515 - 31305454
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaac 82  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  31305515 tactccctccgtccctatatctaagcactcatttgactttatgtttgtccctgaatgtaaac 31305454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 43414759 - 43414852
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaata 228  Q
    |||||| |||| |||||||  ||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||  | | | | |||||||||||| ||||||||    
T  43414759 taattagtactgctaacttaccttaaaatatgaaaaattaaatttactacacatacaaacaaaatacattatagtaatattaacatacaaaata 43414852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 309
Target Start/End: Original strand, 12845074 - 12845130
Alignment:
Q  253 tttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  12845074 tttcttaagaaatgtgaaaaatgcaatggggggttatattaagggacggagggagta 12845130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 260
Target Start/End: Original strand, 22786735 - 22786827
Alignment:
Q  168 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaa 260  Q
    ||||| ||||| ||||||| || || |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||  |||| |||| || | |||||||||||    
T  22786735 aaagttaaattaaatacacctaaaagcaaaagataatttagtaaaattaatacacaaactagacacattaactacactaccgatttttcttaa 22786827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 88)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 39690343 - 39690633
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39690343 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattatttt- 39690441  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39690442 cctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacac 39690541  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    | ||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39690542 ataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaggggggttacatatagggacggagggagtatat 39690633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 15898319 - 15898606
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15898319 tactccctccgtccctatatctaagcatccgtttgactttatttttgtccctaaatataaactctttttcaaattactagatgcatttattattattttt 15898418  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15898419 cctaaacatacttttaattaatactgctaacttgtcttgaaatttgaaaggccaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttgataatattaacac 15898518  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15898519 acaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaaagtg-aaaatgcaaagggggtttacatatatggacggagggagta 15898606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27642749 - 27642467
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27642749 tactccctccgtccctatatgtaagcactcatttgattttatttttgtccataaatataaactccttttcaaattactagatgcatttattattattttt 27642650  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | ||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27642649 c-taaacatacccttaattaatcctactaatttatcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttagtaatattaacac 27642551  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggaggg 305  Q
    | ||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27642550 ataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaggggg-ttacatatagggacggaggg 27642467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36177540 - 36177287
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36177540 tactccctccgtccatatatctaagcatccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaattcattttcaaattactagatgtatttattatttttttt 36177441  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  36177440 cctaaacatacccttaattaatactacttttttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgtaatattaacac 36177341  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | | || |||||||||||||||| ||||||    
T  36177340 acaaaatagacacattaattacactgataacttttcttaagaaatgtaaaaaag 36177287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 3558884 - 3559170
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||  ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3558884 tactccctccatccctatatctaggcacctattttattttatttttgtccctaaatataaccctcttttcaaattactagatgcatttattatt-ttttt 3558982  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3558983 cctaaacatacccttaataaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggtaatattaacac 3559082  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||  | |||||||||||||||    
T  3559083 acaaaatagacacattaattataccaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa-acaaaaggggtttacattta-ggacggagggagtat 3559170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 38971985 - 38972272
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| |||   ||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  38971985 tactccctccgttcctatatctaagcacatatttgactttattttt-tccctaaatttaaaccccttttcaaattaatagatgcatttattatt-ttttt 38972082  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  38972083 cctaaacatacccttaattaatactactaacttatcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggtaatattaaca- 38972181  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtata 311  Q
       |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38972182 tttaaatagacacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaatgtaaaatgtgtttacatatagggacggagggagtata 38972272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21912352 - 21912076
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcat 135  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  21912352 tatatataagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattacaagatgcatttattattatttt-cctaaacatacccct 21912254  T
Q  136 aattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattt 235  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  21912253 aattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaacttaatacacatacaaacaaaagacaatttaataatattaacacataaaatagacacat 21912154  T
Q  236 taattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatataa 314  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  21912153 taactacactaacaacttttcttaataaatgtgaaaaaagcaaa-ggggcttatatatagggacggagggagtacataa 21912076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 302
Target Start/End: Original strand, 4857376 - 4857635
Alignment:
Q  47 acccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatacta 146  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4857376 acccatttgactttatttttgtctctaaatgtaaactcattttcaaattaccaaatgcatttattattttttttcttaaacatactcctaattaatacta 4857475  T
Q  147 ctaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatag--acatt--ttaattac 242  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||    
T  4857476 ctaacttatcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagtaatattaacacataaaatagacacattaattaattac 4857575  T
Q  243 aataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacgga 302  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||    
T  4857576 actaacaacttttattaagaaatgtgaaaaaagcaataggggtttacatacagggacgga 4857635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4738876 - 4738625
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| | ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  4738876 tactcccttcgtccctatatctaagcccccatctgagtttatttttgtccctaaatgtaaactctcttttaaattactagatgcatttatta--attttt 4738779  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  4738778 cctaaacatacccctaactaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacataaaaacaaaggtcaatttagtaatattaacac 4738679  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||| | | |  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4738678 acaaaacaaatacattaattacactgacaatatttcttaagaaatgtgaaaaag 4738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 282
Target Start/End: Original strand, 35568869 - 35569122
Alignment:
Q  28 tccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaac 127  Q
    ||||||| ||||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35568869 tccgtccctatatctaagcatccatttaattttatttttgtccctaattgtaaaccccttttcaaattactaaatgcatttattattatttt-cctaaac 35568967  T
Q  128 atactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaat 227  Q
    |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||     
T  35568968 atacccctaattagtactactaatttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagaataatttagtaatattaatacataaaac 35569067  T
Q  228 agacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaaggg 282  Q
    |||||  ||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35569068 agacacattaattacactgataacttttcttaagaaatgtgaaaaatgtaaaggg 35569122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29866405 - 29866185
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||||  ||||| || |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29866405 tttgactttattctttttcctaaatgtaaacctcttttcaagttactagatgcatttataatt-tttttcctaaacatacccctaattaatactactaac 29866307  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||     
T  29866306 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaacttggtaatattaacacacaaaaaagacatattaattgcactaacaac 29866207  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29866206 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 29866185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34877882 - 34877623
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||| || ||| |||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  34877882 tttgattttatttttgtccataaatgtaaatccccttttaaattattatatgcatttattatt-ttattcctaaatatactcctaattaatactacaaac 34877784  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||     
T  34877783 ttgtcttgaaaaatgaaaagtcaaatttaatacacacacaaacaaatgataatttggtaatattaacacacaaaacagacaaattaattacactgacaac 34877684  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
     ||||||||||||||||||||||| || |   || |||||  | |||||||||||||||||    
T  34877683 atttcttaagaaatgtgaaaaaggcaatgaatgtctacattaaaggacggagggagtatat 34877623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27588087 - 27587797
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||  ||||  | ||||||||    
T  27588087 tactccctccgtgcctatatctaaacacca-tttgattttatttttgtccgtaaatgtaaacccctttccaaattact-gatacattttattttattttt 27587990  T
Q  121 c---ctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaa 217  Q
    |   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  27587989 cttcctaaacatactcttaaataatactactaacttgtattgaaatttgaaaaatcaaatttaatacacatacatacaaaggacaatttagtaatattaa 27587890  T
Q  218 cacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||    
T  27587889 cacacaaaacagacacattaattatactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagtaaagggagtttacattaaaggacggagggagtat 27587797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20946291 - 20946083
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaat 163  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20946291 tttgtctctaaatataaacccctttttaaattactagacgcatttattatt-tttttgctaaacatactcctaattagtactactaacttgttttgaaat 20946193  T
Q  164 atgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaa 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||  |||||||||||    
T  20946192 atgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgataatattaacacacaaaatagacacgttaattgcactaacaacgtttcttaagaa 20946093  T
Q  264 atgtgaaaaa 273  Q
    || |||||||    
T  20946092 atatgaaaaa 20946083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 314
Target Start/End: Original strand, 3247128 - 3247423
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgttt-gattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| |||| |||| ||||  |||||| |||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  3247128 tactccctccgttcctatatataagcacccattttgattttatttttatccccaaatataaatcccttttcaaattattatatgcatttattattttttt 3247227  T
Q  120 tcc-taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    ||| |||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3247228 tccctaaatatacccctaattaatactacaatcttttcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaac 3247327  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatataa 314  Q
    | |||||| |||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  ||| |||||||||||||||||    
T  3247328 atacaaaacagacatattaattacactgtcaacttttcttaagaaatgtgaaaaaggcaatgggtatctacgttaaggaacggagggagtatataa 3247423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43454228 - 43453949
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| |||  ||||    
T  43454228 tactccctcagtccctatatgtaaacacccaattgactttatttttgtctctcaatgtaaacaccttttcaaattacatgatgtatttataatt--tttt 43454131  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||     
T  43454130 cctaaacatatcccgaattaataccactaacttgtcttgaaatttgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaaagatagtttgataatattaacat 43454031  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacgga 302  Q
    ||||||  ||||  ||||||| | |||||| |||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43454030 acaaaactgacacattaattatactaacaactttttttaagaaatataaaaaatataaagggggtttacatagagggacgga 43453949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 274
Target Start/End: Original strand, 40979097 - 40979321
Alignment:
Q  51 gtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttatt-attatttttcctaaacatactcataattaatactacta 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40979097 gtttgattttatttttatccctaaatgtaaagcccttttcaaatttctagatgcatttatttatttattttcctaaacatacccctaattaatactacta 40979196  T
Q  150 acttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataaca 249  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||  | |||    
T  40979197 tcttgtctttaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaatacacaaaacatacatgttaattaccttgaca 40979296  T
Q  250 atttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||    
T  40979297 acttttattaagaaatatgaaaaag 40979321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 10523145 - 10523418
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcct--aaacatactc 133  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| |    
T  10523145 tatatctaagcacccatttgactttatttttgtccataaatgtaaact--ttttcaaattattagatgcatttattattattttttctctaaacataccc 10523242  T
Q  134 ataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10523243 ctaattaatactactaacttgtcttgaaatataaatagtcaaatttaatacacataaaaacaaaaaacaatttggtaatattaacacacaaaacagacac 10523342  T
Q  234 tttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
     ||||||||| | | || ||||||||| |||| ||||||| |  ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  10523343 attaattacactgataacttttcttaaaaaatatgaaaaaag-caagagggcttacataaaaggacggagggagtat 10523418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18729808 - 18729546
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||     
T  18729808 tttgattttatttta-tccctaaatctaaaccccttttcaaattattagatgcatttattattatttttcctaaacatacccctaattaatactattaat 18729710  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaag----gataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataa 247  Q
    ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||    
T  18729709 ttaatttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaacaaatgatactttaataatattaacacacaaaatagacacattaattacacaaa 18729610  T
Q  248 caatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtata 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||   |||  | | |||||||||| |||||||||||||||    
T  18729609 taatttttcttaagaaatgtgaaaaaaaaaaaaagcgattacatacagagacggagggagtata 18729546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 25017528 - 25017819
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaatta---ctagatgtatttattattatt 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||   ||| ||| |||||||||| ||    
T  25017528 tactctctccgtccctatatctaagcattcatttgactttatttttgtccttaaatgtaaaccccctttcaaattattactatatgcatttattatt-tt 25017626  T
Q  118 tttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaa 217  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25017627 tttcctaaatatacccctaattaatactattaacttgtcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaa 25017726  T
Q  218 cacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| | | ||||  |||||||||||| |||||||||  || | | || |||||  |||||||||||||||||    
T  25017727 cacacaaaacagacacattaattatactgacaacatttcttaagaaacgtgaaaaagacaatgagtgtctacattaagggacggagggagtat 25017819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Original strand, 5151089 - 5151267
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | | | |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  5151089 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccctttgaaattactagatgcatttgtcaat-tttttcctaaacataccc-taattagtactactaac 5151186  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagaca 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5151187 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacacacaaataaaggacaatttggtaatattaatacacaaaaaagaca 5151267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 274
Target Start/End: Original strand, 9946245 - 9946467
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  9946245 tttgattttatttttgtccctaaatgtaattctcttttcaaattattagatgcatttattattttttttcctaaacatacccctaattaatactactatc 9946344  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||  ||||||| |   ||||     
T  9946345 ttgtcttgaaatataaaaagtcgaatttaatacacgtacaaacaaaggataatttcgtaatattaatacgtaaaacagacacattaattatatcgacaac 9946444  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  9946445 ttttattaaaaaatgtgaaaaag 9946467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Original strand, 3630974 - 3631227
Alignment:
Q  20 ctactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    ||||||||| | | ||||||| ||| || || ||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3630974 ctactcccttccttcatatatctaaacatccatttgattttatttttattcttaaatgtaaactctttttcaaattactagatgtatttattat--tttt 3631071  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaa---tatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatatta 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |  |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  3631072 tcctaaacatacccctaattaatactaccattttgtcttgaaatattatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggtcaattgcgtaatatta 3631171  T
Q  217 acacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3631172 acacacaaaaccgacacattaattac-acgacaattttt-ttaagaaatgtgaaaaag 3631227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10934201 - 10934000
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaag 171  Q
    |||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10934201 taaatgtaaattctttttcaaattattagatgcatttattatt--ttttcttaaacatattcttaattaatattactaacttgtattgaaatatgaaaag 10934104  T
Q  172 tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| | ||||  ||||| || ||||||||||    
T  10934103 tcaaatttaatacacatacaaacaaagaataatttggtaatattaacatacaaaacagacacattaattacactgacaacatttctgaaaaaatgtgaaa 10934004  T
Q  272 aagg 275  Q
    ||||    
T  10934003 aagg 10934000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 306
Target Start/End: Original strand, 30347966 - 30348218
Alignment:
Q  47 acccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatacta 146  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||| |||||| |||||  |||| ||      |||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  30347966 acccatttgattttctttttatccctaaatgtaagtcccttttcaaattattagatacatttttt------tttcataaacataccc-taattaatacta 30348058  T
Q  147 ctaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaata 246  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | ||    
T  30348059 ctaacttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacacacaaacaaaggaaaatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaagtaaatta 30348158  T
Q  247 acaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggaggga 306  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||| ||||| | ||||||| |||||    
T  30348159 acaacttttcttcagaaatgtgaaaaaagcaaagagggcttacacatagggacgaaggga 30348218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 311
Target Start/End: Original strand, 9375561 - 9375784
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  9375561 tttttaaattactagatatatttattatt-tttttcttaaacatattcttgattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaaatcaaatttaataaa 9375659  T
Q  186 catacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggt 285  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||| |  ||  ||||    
T  9375660 catacaaacaaaagacaatttggtaatattagcacacaaaataaatatattaattgcactaataatttttcctaa-aaatgtgaaaaaaggcaaaagggt 9375758  T
Q  286 ttacatacagggacggagggagtata 311  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  9375759 ttatatacatgaacggagggagtata 9375784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 292
Target Start/End: Original strand, 36750664 - 36750901
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||    
T  36750664 tttgattttatttttgtccctaaatataaacgccttttcaaattactagatgcatttattttt-ttttccctaaatatacccttaattaatactgctaac 36750762  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |  |||||||||||||||||| | |||  ||| ||||  ||||||     
T  36750763 ttgttttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaaggacagtctaataatattaacacacaaaacacaca--ttacttacgctaacaac 36750860  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacata 292  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  36750861 ttttattaagaattgtgaaaaatgtaaaaggggcttacata 36750901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5845392 - 5845170
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttt-aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaa 150  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5845392 tttgactttatttttgtttctaaatgtaaa-tcctctttcaaattattagatgcatttattaat-tttttcctaaacatactcctaattaatactactaa 5845295  T
Q  151 cttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| | | |  ||||||||| | ||||    
T  5845294 cttgtattgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgataatattaatacacaaaacaaatacattaattacactgacaa 5845195  T
Q  251 tttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
       |||||||||||| |||||||||    
T  5845194 caattcttaagaaatatgaaaaagg 5845170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 91 - 310
Target Start/End: Original strand, 21574806 - 21575025
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattattttt-cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacata 189  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||    
T  21574806 aaattactagatgcatttgttatttttttttcctaaacatacccctaattaatactacaaacttgtcttgaaacatgaaaagacaaatttaatacac-ta 21574904  T
Q  190 caaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttac 289  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||  || ||| |  |||    
T  21574905 caaacaaaggacaatttggtaatattaacatacaaaatagacacattaagtacactaaaaacatttcttaagaaatgtgaaaaagacaatgggtgcctac 21575004  T
Q  290 atacagggacggagggagtat 310  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  21575005 attaagggacggagggagtat 21575025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 273
Target Start/End: Original strand, 43060449 - 43060618
Alignment:
Q  101 atgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagga 200  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43060449 atgtttttattatt-tttttcctaaacata-tccgaattaatactactaacttgtcttggaatatg-aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaaga 43060545  T
Q  201 taatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  43060546 taatatggtaatattaacacacaaaatagacacattaattacactaacaacttttattaaaaaatgtgaaaaa 43060618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 282
Target Start/End: Original strand, 16042 - 16232
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  16042 aaattactagatgcatttattattatttt-cctaaacatacccctggttaatactactaacttgtcttgaaatgtgaaaagtcaaatttaatacaaatac 16140  T
Q  191 aaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaaggg 282  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |  |||||| || |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  16141 aaacaaaggacaatttagtaatattcacacaaaaaatagatacattaattgcactaacaactttccgttagaaatgtgaaaaaggtaaaggg 16232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27798371 - 27798152
Alignment:
Q  53 ttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttccta-aacatactcataattaatactactaac 151  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||  || || |||| | |||||||||| | ||||    
T  27798371 ttgactttatttttgttcctaaatgtaaatcaccttttaaattactaaatgcatttattattttattt--tagaatatacccctaattaataccaataac 27798274  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||    
T  27798273 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaacttaatacacatacaaacaaatgataatttgataatattaacacacaaaacagacaaattaattacactgacaat 27798174  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
     |||||||| ||||||||||||    
T  27798173 atttcttaaaaaatgtgaaaaa 27798152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 282
Target Start/End: Original strand, 36347489 - 36347718
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  36347489 tttgattttatttttgtccataaatgtaaatttcttttcaaattattagatgcatttattacc-tttttcctaaacatatccctaattaatattactaac 36347587  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||| | ||||     
T  36347588 ttgtcttgaaatgtgaatagtcaaatttaatacacatacaaacaaaaatcaatttgataatattaatacacaaaacagatacattaattacactgacaac 36347687  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaaggg 282  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36347688 ttttattaagaaatctgaaaaaagtaaaggg 36347718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 42644332 - 42644625
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt- 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||| | || |||||| || ||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||| | ||||||| |||||||     
T  42644332 tactctctccgtccttatatgtaagcactcattcgattttgttgttgtccctaaacgtaaaccccttctaaaattattagaagcatttatttttattttt 42644431  T
Q  120 -tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
     |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| |    
T  42644432 ttcctaaacatacccttaattaatacaactaacttgtcttgaaatatgaaaagacaaatttaatatacatacaaacaaatgacaatttgataatattagc 42644531  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    | ||||||||  ||  ||||||||| |||||  |||| ||   |||||||||||| | ||| || ||||| | | ||||||||| |||||||||    
T  42644532 atacaaaataatcacattaattacactaacagctttttttttaaaatgtgaaaaatgcaaaaggtgtttagaaatagggacggatggagtatat 42644625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Original strand, 14044420 - 14044647
Alignment:
Q  85 ctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatac 184  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  14044420 ctttttaaattattaaatgtatttattattatttt--ctaaatatatccctaattaatactgctaacttatcttcaaatatgaaaagtcaaatttaacac 14044517  T
Q  185 acatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaaggggg 284  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  14044518 acataaaaataaatgataatttgataatattaatacataaaatagacatattaactgcattaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagtaaaacgga 14044617  T
Q  285 tttacatacagggacggagggagtatataa 314  Q
     ||| ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  14044618 gttatatatagggacgtagggaatatataa 14044647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Original strand, 19281377 - 19281569
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt--cctaaacatactcataattaatactacta 149  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  19281377 tttgattttatttttgttcataaatataaacgcattttcaaatcactagatgtatttattattattttttacctaaacatatccctaattaatactacta 19281476  T
Q  150 acttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattaca 243  Q
    | |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  19281477 atttgttttgaaatatg-aatttcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttagtaatattaatacacaaaacagatacattaattaca 19281569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 600966 - 600769
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaata 164  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  600966 ttgtctctaaatataaacttatttttaaatttctagatgcatttatt--tatttttc-taaacataatcctaattaatattactaacttgtcttaaaata 600870  T
Q  165 tgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaa 264  Q
    |  ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  600869 taaaaaatcaaatttaatacatatacaaacaaatgacaatttgataatattaacacacataatagacacattaattgcactaacaagttttcttaagaaa 600770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Original strand, 31641047 - 31641207
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattatta-tttt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31641047 tactccctccgtccttatatgtaaacactcgtttgactttatttttgtccctaaatttaaatctcttttcaaattactagatgtatttattattattttt 31641146  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaattta 180  Q
    | |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  31641147 ttctaaacatacccctaattaataccactaacttatcttgaaatttgaaaagtcaaattta 31641207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10656785 - 10656588
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaag 171  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||    
T  10656785 taaatataatctccttctcaaattattagatgcatttattaat-tttttcctaaacataccc-taattaatactgctaacttatgttgaaatatgaaaag 10656688  T
Q  172 tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaa 271  Q
    |||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10656687 tcaaatttaacaccaatacaaaaaaaagataatttggtaattttaacacataaaatacaca--ttaattgcattaacaatttttcttaagaaatgtgaaa 10656590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16496589 - 16496434
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatatt 215  Q
    |||||| |||||||||   ||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496589 tttttcttaaacatacctttaactaatactattaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatatacatacaaacaaaggataatttggtaatatt 16496490  T
Q  216 aacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
    || |||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||    
T  16496489 aatacac-aaatagacataataattacactaacaacttttggtaagaaatgtgaaaa 16496434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7736183 - 7736041
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaata 164  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7736183 ttgtccctaaatataaaccccttttcaaattactagacgcatttattatt-tttttcctaaacatatccctaattaatactgctaacttatcttgaaata 7736085  T
Q  165 tgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttgg 208  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7736084 tgaaaagtcaaatttaacacacatacaaacaaatgataatttgg 7736041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 309
Target Start/End: Original strand, 25690616 - 25690833
Alignment:
Q  94 ttactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaa-gtcaaatttaatacacatacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  25690616 ttactagatgtatttattatt-tttttcttaaacatacccctaattaatacaactaacttgtcttgaaatttaaaaaagttgaatttaatacacatacaa 25690714  T
Q  193 acaaaggataatttggta--atattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttaca 290  Q
    |||||||| ||||||  |  |||||||||||||||| | |||  |||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||    
T  25690715 acaaaggacaatttgtaactatattaacacacaaaacatacacattaattacaccgacaacttttcttaagaaatgtgaacaaagcaaagggggctaaca 25690814  T
Q  291 tacagggacggagggagta 309  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  25690815 taaggggacggagggagta 25690833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 32401313 - 32401501
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||     
T  32401313 tactccctacgtccctatatcaaacc-cccatttgactttatttttgtccctaaatgcaaactc-ttttcaaattactagaaacatttattattatttt- 32401409  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaat 212  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  32401410 cctaagcacactcctaattaatactaccaacttgtcttaaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaaagacattttggtaat 32401501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34676325 - 34676171
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaaca-tactcataattaatactactaacttgtcttgaaat 163  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  34676325 ttgtccctaaatataaactccttttcaaattactagatacatttattttt-tttttccgaaacaatacccctaattaatactgctaacttatattgaaat 34676227  T
Q  164 atgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34676226 atgataagtcaaatttaacacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 34676171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4745333 - 4745100
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactacta---acttgtcttga 160  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  ||| |||| | |||||||||||| ||   || |||||| |    
T  4745333 tttgtctctaaatataaactccttttcaaattactagatgcatttatttttatttt-ctgaaatatac-cttaattaatactattattaacctgtcttaa 4745236  T
Q  161 aatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttctt-a 259  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| || |||| | ||||||| |    
T  4745235 aatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacccacaaaataaacacattaattgcactaactacttttcttaa 4745136  T
Q  260 agaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacag 295  Q
    | |||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  4745135 aaaaatgtgaaaaatgcaaagggtgcttacatacag 4745100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 243
Target Start/End: Original strand, 12895139 - 12895287
Alignment:
Q  94 ttactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12895139 ttactagatgtatttattatt-tttttcctaaacatacctctaattaatacaactaacttgtcttaaaatttaaaaaatcaaatttaatacacatacaaa 12895237  T
Q  194 caaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattaca 243  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  12895238 caaaagacaatttggtaatattaatacacaaaacagacacattaattaca 12895287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11980850 - 11980710
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatt 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||      
T  11980850 taattaatactactaacatgtcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacagtggataatatagtaatattaacacacaaaatagacaca 11980751  T
Q  235 ttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  11980750 ttaattacactaacaacttttattaaaaaatatgaaaaagg 11980710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30317991 - 30317793
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||   |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||| |||||| |||||  |||| ||     ||||    
T  30317991 tactcactccgtccttatatctaggtacccatttgattttctttttatccctaaatgtaagtcccttttcaaattattagatacatttttt-----tttt 30317897  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | | ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30317896 cattaacataccc-taattaatactactaacttgcattgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacacacaaacaaaggaaaatttggtaatattaacac 30317798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41521316 - 41521185
Alignment:
Q  141 atactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatt 240  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41521316 atactacaaacttattttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaatgacaatttaataatattaacacacaaaatagacatattaatt 41521217  T
Q  241 acaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
     || |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41521216 tcactaacaatttttcttaaaaaatgtaaaaa 41521185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16969550 - 16969355
Alignment:
Q  92 aattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacataca 191  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  16969550 aattactaaatgcatttattattatttttc-taaacatacctctaattaatattactaaattgtcttaaaatattaaaattcaaatttaacacacataca 16969452  T
Q  192 aacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggttta 288  Q
    || |||  | | |||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  16969451 aataaataacagtttgataatattaacaaacaaattagacacattaattatactaacaatttttgttaaaaaatgtgaaaaaggctaagggtgttta 16969355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 207
Target Start/End: Original strand, 8717880 - 8718001
Alignment:
Q  85 ctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatac 184  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8717880 cttttcaaattactagatgcacttattatt-tttttcctaaacatacccctaattaataatacgaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatac 8717978  T
Q  185 acatacaaacaaaggataatttg 207  Q
    | ||||||||||| || ||||||    
T  8717979 atatacaaacaaatgacaatttg 8718001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 240
Target Start/End: Original strand, 5764138 - 5764298
Alignment:
Q  78 taaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaat 177  Q
    |||||| ||||| |||||| |||| | |||||| |||  ||||| |||||||||   ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5764138 taaacttcttttcaaattattagaagcatttatcatt--ttttcataaacatacctctaattaatattattaacttgtcgtgaaatatgaaaagttaaat 5764235  T
Q  178 ttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatt 240  Q
    |||||||  ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5764236 ttaatacttatgtaaacaaaggataatttagtaatgttaacacacaaaatagacatgttaatt 5764298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7510788 - 7510679
Alignment:
Q  19 actactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattt 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||    
T  7510788 actactccctccgtccctatatgtaaacactcatttgactttattattgtccctaaatgtaaacgccttttcaaattactagatacatttattatttttt 7510689  T
Q  119 ttcctaaaca 128  Q
    | ||||||||    
T  7510688 tccctaaaca 7510679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 255
Target Start/End: Original strand, 731871 - 732043
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttc-ctaaacatactcataattaa-tactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  731871 ttttcaaattactagatacatttattattatttttaactaaatataaccttaattaagtaccagtaacttgtcttgaaatatgaaaaaacaaatttaata 731970  T
Q  184 cacatacaaac-aaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaattttt 255  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||| |||||||    
T  731971 cacatacaaacaaaagaacaatttgataatattaacacacaaaacaaacatattaactacattaataattttt 732043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33583934 - 33583803
Alignment:
Q  148 taacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataa 247  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   || || ||| |||    
T  33583934 taacttgtcttaaaaaatgtaaaatcaaatttaatacacgtttaaataaaggataatttagtaatattaacacacaaaatagtcgcattgataacattaa 33583835  T
Q  248 caatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaa 279  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33583834 caactttttttaagaaatgtgaaaaagataaa 33583803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27925520 - 27925395
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27925520 tactccctccgtccctgtatctaagcccccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaatcccttttcaaattactagatgcatttattatt-ttttt 27925422  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactac 147  Q
     |||||||||  | |||||| ||||||    
T  27925421 tctaaacatatccctaattagtactac 27925395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 148
Target Start/End: Original strand, 20975693 - 20975788
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactact 148  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| | | || |||||||||||    
T  20975693 tttgattttatttttgttcttaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttatt-ttttttttcctaaacatgcccctagttaatactact 20975788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 25690510 - 25690597
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtattt 108  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||    
T  25690510 tactcccttcgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaacttactagatgcattt 25690597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32067906 - 32067787
Alignment:
Q  191 aaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttaca 290  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||    
T  32067906 aaacaaatgacaatttggtaatattaacacacaaaatagacacatgaattgcactaactatttttcttaagaaatgtaaaaaaagtacaaagggcttaca 32067807  T
Q  291 tacagggacggagggagtat 310  Q
    || || |||||||| |||||    
T  32067806 tatagagacggaggaagtat 32067787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 129821 - 129636
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactca-taattaatactactaa 150  Q
    ||||| |||||||||||| ||| || |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||     ||||| |||||| |  |||||||||||| |||    
T  129821 tttgactttatttttgtctctacatataaaccattttttaaattactagatgcatttattatt-----tcctatacataccccctaattaatactattaa 129727  T
Q  151 cttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattaca 243  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    ||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  129726 cttgtcttaaaatatgaaaaatcaaatttaat--taatacccctaaagaacaatttggtaatattaatacacaaaatagacacattaattaca 129636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18032842 - 18032766
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||    
T  18032842 tactccctccgttcctatatgtaaccacccttttgattttatttttgtccttaaatgtaaagcccttttcaaattac 18032766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 265
Target Start/End: Original strand, 24781245 - 24781367
Alignment:
Q  142 tactactaactt-gtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatt 240  Q
    |||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||||    
T  24781245 tactactaactttgtcttcaaatgtgaaaaatcaaatttaatacacatacaaa-aaagaacaatttgataatattaacatacaaaataaacacattaatt 24781343  T
Q  241 acaataacaatttttcttaagaaat 265  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||    
T  24781344 acattaactattttt-ttaagaaat 24781367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 153
Target Start/End: Original strand, 15966978 - 15967071
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaactt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  15966978 tttatttttgtccctaaatgtaaac-ctctttcaaattactagatgcatttattatt-tttttcttaaagatacccctaattaatactactaactt 15967071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7510670 - 7510564
Alignment:
Q  205 ttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagg 304  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  7510670 ttggtaatattaacacacaaaacatacacattaattacactaataacttttcttaaaaaatgtgaaaaatacaaagggggcttatataaagggacggaag 7510571  T
Q  305 gagtata 311  Q
    |||||||    
T  7510570 gagtata 7510564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 273
Target Start/End: Original strand, 15967124 - 15967220
Alignment:
Q  177 tttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||    
T  15967124 tttaataaacatataaataaagggtaatttggtaatattaatacacaaaacagacacattaattacaccgacaacctttcttaagaaatgtgaaaaa 15967220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 425 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 29373197 - 29373040
Alignment:
Q  425 taaattaagcactatacagcgggaaatgaatgcaaatccagactaacataaagtaaaga-cacttttcaactttc--aaacatatctctata--aacaat 519  Q
    ||||||||||| | |||||   |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |  | |||||||||||||  ||||||    
T  29373197 taaattaagcattttacagttagaaaggaatgcaaatgcagcctaacataaagtaaaaaacacttttcaacttccggagacatatctctatataaacaat 29373098  T
Q  520 ctccataaattgtggaagacaccttgatttaaagcattggtgtcaagctgcatctgtg 577  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||| ||| |||||||| |||| | |||||| ||||    
T  29373097 ctccataaataatggatgacgccttgctttgaagcattgctgtccaactgcatttgtg 29373040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 225
Target Start/End: Original strand, 19089016 - 19089081
Alignment:
Q  160 aaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaa 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  19089016 aaatatgaaaagtcaaatttaatacaaatacaaacaaatgacaatttagtaatattaatacacaaa 19089081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 273
Target Start/End: Original strand, 31642484 - 31642576
Alignment:
Q  180 aatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  31642484 aatacacatataaacaaaagacagtttggtaatattaacacacaaaa-agacacattaattacactgacaattttttttaataaatgtgtaaaa 31642576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 8760900 - 8760975
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  8760900 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 8760975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 36745663 - 36745738
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  36745663 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaact-ttttttaaattac 36745738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 40144211 - 40144136
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  40144211 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaact-ttttttaaattac 40144136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 556181 - 556054
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||    |||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  556181 ttttcaaattactagatgt-tttattatttcttt--ctaaacatagcactaattaatatcattaatttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaataca 556085  T
Q  186 catacaaacaaaggataatttggtaatatta 216  Q
     ||||| | ||| || ||||| |||||||||    
T  556084 tatacagaaaaatgacaatttagtaatatta 556054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 38040921 - 38040855
Alignment:
Q  30 cgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  38040921 cgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaact-ttttttaaattac 38040855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Original strand, 43060072 - 43060151
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgt-aaactcctttttaaattacta 99  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43060072 tactccatccgttcttatatctaagcatccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaactccttttcaaattacta 43060151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3530053 - 3529873
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||   |||||||  |  || ||||||| || |||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||     
T  3530053 aaatgacttgatgcatttattattattttta--aaacatatcccaaagtaatactgctgacttctcttaaaatataaatagtcaaatttaatacacatat 3529956  T
Q  191 aaacaaaggataatttggt-aatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa-tttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||   ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  3529955 aaacaaagaacaatttagtaaatatt--tacacaaaatagacacattaattatactaacaatttttttttaagaaatgcgaaaaa 3529873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32068140 - 32068070
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaactt-gtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||||| | ||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32068140 tttttctttaacatacccttacttaatactactaactttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaataca 32068070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 6514277 - 6514352
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  6514277 tactctcttcgtccatatatttaaacactcatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 6514352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 457907 - 457810
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata--cacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaataga 230  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  457907 taattaatattaccaacttctcttaaaatatgaaatgtcaaatttaatacacacatataaacaaatgacaatttaataatattcagacacaaaataga 457810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 29874311 - 29874261
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatg 166  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29874311 tttttcctaaacatacccctaattaatactaataacttgttttgaaatatg 29874261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 35758332 - 35758271
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaac 82  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35758332 tactctcttcgtccatatatttaaacacctatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac 35758271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 291
Target Start/End: Original strand, 20976360 - 20976416
Alignment:
Q  235 ttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacat 291  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  20976360 ttaattacactgacaaattttcttaagaaatatgaaaaaagtaaagggggattacat 20976416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 12895037 - 12895123
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtattt 108  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||| |||||||||||    
T  12895037 tactccctccgtccctatatctaagcatca-tttaattttatttttgtccttaaatgtaaacctcttttcaacttattagatgtattt 12895123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 273
Target Start/End: Original strand, 33862845 - 33862924
Alignment:
Q  195 aaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttctt-aagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||| ||||| |||||||||  | |||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33862845 aaaggacaatttagtaatattagtatacaaaacagacacattaattacactgacaatttttcttaaagaaatgtgaaaaa 33862924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27925393 - 27925336
Alignment:
Q  253 tttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||| |  |||||| |||||||||||||||||    
T  27925393 tttcttaagaaatgtgaaaaaagcaatgggtgcctacataaagggacggagggagtat 27925336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Original strand, 23648023 - 23648120
Alignment:
Q  80 aactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaattt 179  Q
    ||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||  |||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||    
T  23648023 aactctttttcaaattattagatacatttattatt--ttttcctaaatatacatctaactaatactactaacttatcttaaaatataaaaagttaaattt 23648120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23810550 - 23810453
Alignment:
Q  80 aactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaattt 179  Q
    ||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||  |||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||    
T  23810550 aactctttttcaaattattagatacatttattatt--ttttcctaaatatacatctaactaatactactaacttatcttaaaatataaaaagttaaattt 23810453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29874245 - 29874217
Alignment:
Q  202 aatttggtaatattaacacacaaaataga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29874245 aatttggtaatattaacacacaaaataga 29874217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 29874517 - 29874465
Alignment:
Q  57 ttttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtattta 109  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||    
T  29874517 ttttttttttgttcctaaatgtaaaccccctttcaaattactagatgcattta 29874465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 115)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17663871 - 17663584
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17663871 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattatttt- 17663773  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17663772 cctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacac 17663673  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    | ||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17663672 ataaaataggcacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaggggggttacatatagggacggagggagta 17663584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27297824 - 27297536
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  27297824 tactccctccatccctatatctaagtaccaatttgattttatttttgtccttaaatgtaaactccttttcaaattagtagatgcatttattatt-ttttt 27297726  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27297725 cctaaacatatccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataattttgtaatattaacac 27297626  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  27297625 acaaaacagacacattaattacactaacagtttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaagggggtttacattaagggacagagggagtat 27297536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20362229 - 20361946
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20362229 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattatta-tttt 20362131  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20362130 cctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaattt-atacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacac 20362032  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    | ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||   ||| ||| ||||||||||||||||    
T  20362031 ataaaatagacacattaactacactaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaagcagaggg---ttatatatagggacggagggagta 20361946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15851775 - 15851526
Alignment:
Q  24 tccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcct 123  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15851775 tccctccgtccctatatctaagc-cccatttgattttatttttctccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattatttttcct 15851677  T
Q  124 aaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacaca 223  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |    
T  15851676 aaacatacccctaattaatactactattttgtcttgaaatatgaaaattcaaatttaatacacatataaacaaaggacaatttcataatattaacacaaa 15851577  T
Q  224 aaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15851576 aaacagacacattaattacactcacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 15851526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41865963 - 41865675
Alignment:
Q  20 ctactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  41865963 ctactccatccgtccctatatttaagcactcatttgattttatttttgttcctaaatgtaaacaccttttcaaattattagatgcatttattatt-tttt 41865865  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41865864 tcctaaacatacccctaataaatattactaacttgtcttaaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaa-ggataatttggtaatgttaaca 41865766  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||||||||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  41865765 cacaaaatagacacattaattagaccaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaaggggcttacattaagggaaggagggagtat 41865675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37355284 - 37355028
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||| || |||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  37355284 tactccatctgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgtctctaaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattatttatttt 37355185  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  37355184 cctaaacatacccttaattaatacttttatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgtaatattaacac 37355085  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggta 277  Q
    |||||| |||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37355084 acaaaagagacacattaattacacaaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaggta 37355028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 8064931 - 8065217
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||  |||||||   ||||||    
T  8064931 tactccctccgtccctatatttaagcccccatttgactttattattgtccctaaatgtaaaccccctttcaaattactagatacatttattc--attttt 8065028  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8065029 cctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaagttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 8065128  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||| || || ||| |  |||||  ||||||||||||||||    
T  8065129 acaaaacagacacattaattacactgacaacatttcttaggaaatgtgaaaagggcaatgggagcctacattaagggacggagggagta 8065217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44424809 - 44424591
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  44424809 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccctttttcaaattactagatgcatttattttt---tttcctaaacatacccctaattaatactactatc 44424713  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||     
T  44424712 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaacatacaaaacagacacattaattacactaacaac 44424613  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44424612 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 44424591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Original strand, 17250834 - 17251071
Alignment:
Q  37 atatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcata 136  Q
    |||||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  17250834 atatgtaaacactcatttaattttatttttgtctctaaatgtaaactcctttttaaattactatatgcatttattattttttttcctaaacataccttta 17250933  T
Q  137 attaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatttt 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  17250934 attaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaatttaaatacacatacaaacaaatgacaattttgtaatattaacacacaaaacagacacatt 17251033  T
Q  237 aattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17251034 aattatactaacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 17251071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24775112 - 24774861
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24775112 tactctctccgtccctatatttaagcatccatttgattttatttttgtccctaaatttaaatctcttttcgaattactagatatatttattatt-ttttt 24775014  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24775013 cctaaacatacccccgattagtactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttggtaatattaacac 24774914  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||| |  ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  24774913 acaaaatagatacattaattacactaataaattttcttaaaaaatgtgaaaaa 24774861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 309
Target Start/End: Original strand, 38449566 - 38449859
Alignment:
Q  15 atcaactactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattatt 114  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||||| || |||||||    
T  38449566 atcaattactcccgccgtccctatatataagcactcatttgactttatttttattcctaaatgtaaaccccttttcaacttactagatgcatatattatt 38449665  T
Q  115 atttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatat 214  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||| || | || |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38449666 -tttttcctaaacatacccctaattaatattattgacctgtcttgaaatatgaataatcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttgataatat 38449764  T
Q  215 taacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||| |||||||| |||||  |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  38449765 taatacacaaaacagacacattaattacaaaaataacttttattaagaaatgtgaaaaaagaaaaggagggttacatatagggacggagggagta 38449859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 9718061 - 9718281
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9718061 tttgattttatttttgtttctaaatgtaaacaccctttcaaattattagatgcatttattatt-tttttcctaaacatacccttaattaatactactaac 9718159  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||     
T  9718160 ttgtcttgaaatacgataagacaaatttaatacacatacaaacaaagaataatttggtaatattaacacacaaaacagacacattaattacactgacaac 9718259  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  9718260 atttcttaagaaatgtgaaaaa 9718281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 58 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2131966 - 2131713
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtct 157  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||  || |  ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  2131966 tttatttttgtgtctaaatgtaaacccctattcaaattactagatgtatttttttttccttct--taaacatacccctaattaatacaactaacttgtct 2131869  T
Q  158 tgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttct 257  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||    
T  2131868 ttaaatatgaaaagtcaaatttaatacagatacaaacaaaagataatttggtaatattaacacacaaaatagacatgttaattgcactaacaacttttct 2131769  T
Q  258 taagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatata 313  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  2131768 taagaaatgtaaaaaatgtaaaaggtatttagatacatggacgaagggagtatata 2131713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 40345934 - 40346227
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  40345934 tactctctccgtccctatatctaaacactcattttattttatttttgttcctaaatgtaaactccttttcaaattactagatacatttattatttttttt 40346033  T
Q  121 cc----taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatatta 216  Q
    ||    ||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||    
T  40346034 ccttcctaaacatacccctaattaatactacaaacttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaagacaatttagtaatatta 40346133  T
Q  217 acacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||||||||  |||  |||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  40346134 acacacaaaatgaacacattaattgcacaaacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaaaacaaagagggtttacatatagggacgaatggagtat 40346227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 247907 - 247617
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||| ||||     
T  247907 tactccctccgtccctatatctaagcacccatttgactttagttttatctctaaatgtaaactccttttcaaattagtagatgcaattattatt-ttttc 247809  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||    
T  247808 cctacacatacccttaatcaatactactaacttgtcttgagatatgaaaagtcaaatttaatatacatacaaacaaagggcaattttataatattaacac 247709  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||    || || | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  247708 acaaaatagacacattaattacactaacaactttccttaaaaaatgtgaaaaaacccaatggagcttaaatatagggacggagggagtatat 247617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41665955 - 41665706
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    | ||||| |||||    
T  41665955 tacttcctccgtccctatatctaagctcccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaactctctttcaaattactagatg---cttttatttttttt 41665859  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41665858 cctaaacatacccctaattaatactattaacttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttgatactattaacac 41665759  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  41665758 acaaaacagacacattaattacactgacaacatttcttaagaaatgtgaaaaa 41665706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14420923 - 14420637
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||  | ||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||  |    
T  14420923 tactccctccgtccttatatttaagcattcatttgactttatttttgtttctaaatgtaaacctcttttcagattactagatgcatttattatt-ttaat 14420825  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14420824 cctaaacatactcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaaagttaaatt-aatacacatgcaaacaaaggacaatttggtaatattaacac 14420726  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||| |||||  | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  14420725 acaaaacagacacattaattacactaacaacttttctttagaaaaataaaaaaagtaaagggggcttacatatagggacggagagagta 14420637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3237962 - 3237716
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||    
T  3237962 tactctcttcgtccctatatctaagcatccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgcattt-------ttttt 3237870  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
      ||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3237869 --taaacatatccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataattttgtaatattaacac 3237772  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataaca--atttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||| |||||  ||||||||| ||| |  | ||||||||| |||||||||||||    
T  3237771 acaaaacagacacattaattacattaataacacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 3237716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 7278471 - 7278759
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7278471 tactctctacgtccatatatctaagcaccaatttgattttatttttatctctaaatgtaaatcccttttcaaattactagatgcatttattattatttt- 7278569  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||   |||    
T  7278570 cttaaacatacccctaattaatactactaacttatcttgaaatattaatagtcaaatttaatacacatacaaacaaagggcaatttgataatatattcac 7278669  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||| ||||||  || |||| |||||||||    
T  7278670 acaaaacaaacatattaattacactgacaatttttcttaacaaatgtgaaaaaaacaaagagggcttacatgaagagacgaagggagtat 7278759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11459367 - 11459112
Alignment:
Q  55 gattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttg 154  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11459367 gattttatttttatccttaaatataaatctctttttaaattattagatgtatttatttttttttttcctaaacatactcttaattaatactactaacttg 11459268  T
Q  155 tcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttt 254  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||   |||| |||    
T  11459267 tcttgaaatttgaaaaatcaaatttaatacatatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacacacaaaacagacacattatttacaccgacaacttt 11459168  T
Q  255 tcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    || |||||||||||||||| | |||  | ||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  11459167 tcataagaaatgtgaaaaaagcaaaatgagtttatattaagggacggagcgagtat 11459112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34330247 - 34329997
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| || |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||    
T  34330247 tactccctccgtcactatatctaaacatctatttgattttatttttgtctataaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattttt---ttt 34330151  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34330150 cctaaacatatccctgattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattttgtaatattaacac 34330051  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||| ||  |  ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34330050 acaaaacaggtacattaattatactaacaactttttttaagaaatgtgaaaaag 34329997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Original strand, 28264811 - 28265060
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28264811 tactccctccgtctctatatctaaacactcatctgattttatttttgtcctttaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattaatattttt 28264910  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  28264911 cctaaacatacccctaattaatatta---acttgtcttgaaatatgaatagtcaaatttaatatacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacgc 28265007  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||| | |||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28265008 acaaaacaaacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 28265060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 31644301 - 31644552
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  31644301 tactcactctgtccttatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcattttcaaattactagatgcatttattatt--tttt 31644398  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||  || ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  31644399 cctaaacatacccctaattaatactactattttatcttgaattatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgtaatattaacac 31644498  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    | |||| |||||  ||||||| | | | || ||||||||  |||||||||||||    
T  31644499 aaaaaacagacacattaattaaactgataacttttcttataaaatgtgaaaaag 31644552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 45214974 - 45214685
Alignment:
Q  19 actactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattt 118  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||  ||| | ||||| ||||||||  || ||||||||| |  || ||| ||||||||||||  |||||||||| |||    
T  45214974 actactccctctgtccttatatttacgcactcatttgactttattttcttctctaaatgtatatcccatttcaaattactagatacatttattatt-ttt 45214876  T
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  45214875 ttcttaaacatacccctaattaatactactaatttatcttaaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaagggcaatttgaaaatattaac 45214776  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  45214775 acacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaatgcaaagggggcttacatatcgggacggagggagta 45214685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4758258 - 4758054
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcat 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| | |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  4758258 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtttctaaatgtaaatttcttttcagattattagatgcatttattatt-tttttcctaaacatattcct 4758160  T
Q  136 aattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattt 235  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||  |    
T  4758159 aattaatactactaatttttcttaaaatatgtaaagtcaaatttaatacacataaaaacaaaggacaatttcataatattaacacacaaaataaacacat 4758060  T
Q  236 taatta 241  Q
    ||||||    
T  4758059 taatta 4758054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11071885 - 11071676
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt-cctaaacatactcataattaatactactaa 150  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||||    
T  11071885 tttgactttatttttgtccctaaatctaaactccttttcaaattactagatgcatttattattattttttcctaaacatgcccctaattaatattactaa 11071786  T
Q  151 cttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||| || ||||||    
T  11071785 ct-gttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaagcaaaggacaatttagtaatattaacacataaattagacacattaattgcactaacaa 11071687  T
Q  251 tttttcttaag 261  Q
     ||||||||||    
T  11071686 cttttcttaag 11071676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28734070 - 28733820
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||     
T  28734070 tactccatccgtccctatatctaagcacccatttgactttatttttgtccctaaatctaaacctcttttcaaattactatatgcatttattattgtttt- 28733972  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||    
T  28733971 cctaaacatacccctaattaatactactaatttatcttgaaatataaaaagtcaaattttatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatatta--ac 28733874  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    | |||| |||||  |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28733873 ataaaacagacacattaattacaccgacaatttttcttaaaaaatgtgaaaaag 28733820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 270
Target Start/End: Original strand, 45150600 - 45150842
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  45150600 tactccctccgtccctatatttaatcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattgctagatacatttattattattttt 45150699  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | |||||||||   |||||||||||||   ||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  45150700 cttaaacatacctttaattaatactac---ct----ttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattgagtaatattaacac 45150792  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
    |||||||  |||  |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  45150793 acaaaatgaacacattaattgcacaaacaacttttcttaagaaatgtgaa 45150842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7255809 - 7255627
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtct 157  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  7255809 tttatttttatccctaaatataaaccc--tttcaaattactagatgtatttattattatttt-cctaaacatatccctaattaatactactaatttgtct 7255713  T
Q  158 tgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattaca 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  7255712 tgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacaaacaatcaaaggataatttggtaatattaatacacaaaacagacacattaattaca 7255627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 43710115 - 43709878
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaag 171  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  43710115 taaatataaattcttttttaaattattagatgcatttatgatt-ttattccttaacatacccataattaatactactaacttatcttgaaatataaaaag 43710017  T
Q  172 tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaattttt-cttaagaaatgtgaa 270  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43710016 taaattttaatacacatataaacaaaggacaattaagtaatattaacacacaaaatagacgcattaattgcactaacaatttttgcttaagaaatgtgaa 43709917  T
Q  271 aaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||| | |||||| | ||||||||||||| | ||||||||    
T  43709916 aaatgcaaagggtgcttacatacagggatgaagggagta 43709878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3645566 - 3645282
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||| |||||| |||||  |||| ||    || ||    
T  3645566 tactcactccgtccttatatctaagcacccatttgattttctttttatccctaaatgtaagtcccttttcaaattattagatacatttttt----ttctt 3645471  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  3645470 cataaacataccc-taattaatactactaacttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatatacacacaaacgaaggacaatttagtaatattaatac 3645372  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  3645371 acaaaatagacacattaagtaaactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaagaggacttacacatagggacagagggagtat 3645282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 281
Target Start/End: Original strand, 38981961 - 38982196
Alignment:
Q  53 ttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac- 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||   ||| |||||| | |||||||||||||||||     
T  38981961 ttgattttatttttgtccctaaatctaaacccatttttaaattattagatgcatttattatttttt---ctatacatacccctaattaatactactaaca 38982057  T
Q  152 -ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatag--acatt------ttaattac 242  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||      ||||||||    
T  38982058 attgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaaaataatttggtaatattaacacacaaaacagatacattaatacattaattac 38982157  T
Q  243 aataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagg 281  Q
    |   |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38982158 acagacaacttttcttaagaaatgtaaaaaatgtaaagg 38982196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 1246270 - 1246523
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| || || ||| |||||||||||| || ||||| |||||  ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1246270 tactccctccatccttatatctaaacatccatttaattttatttttgcccttaaatataaaccacttttcaaattactaaatacatttattattattttt 1246369  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaa-gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    | ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  1246370 c-taaacatacccctaattaatactattatcttgtcttgaaatatgaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagaacaatttcataatattaaca 1246468  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||| | |||  ||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1246469 cacaaaacaaacacgttaattatactgacaactttttttaagaaatgtgaaaaag 1246523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 272
Target Start/End: Original strand, 2048719 - 2048936
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttt-aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaa 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||    
T  2048719 tttgattttatttttgtttctaaatgtaaa-tcttttttcaaattattagatgcatttattatt-tttttcttaaacatacccctaataaatactactaa 2048816  T
Q  151 cttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |  ||| |||||  |||||    
T  2048817 cttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa-gataatttggt-atgttaacacataaaatagagacattatttacaccaacaa 2048914  T
Q  251 tttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  2048915 cttttcttaagaaatgtgaaaa 2048936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21013019 - 21012849
Alignment:
Q  101 atgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagga 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21013019 atgtatttatta--atttttcctaaatatactcctaatttatactactaacttgttttgaaatataaaaagtcaaatttaatatgcatacaaacaaagga 21012922  T
Q  201 taatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21012921 taatttgataatattaacacacaaaataaacacattaattgcactaacaacttttcttaagaaatttgaaaaa 21012849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23464928 - 23464711
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  23464928 tactacctccgtctctatatgtaaacactcatttaactttatttttgtccctaaatgtaaa-tctcttttaaattactagatgcatttatt--tattttt 23464832  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
     ||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| || |    
T  23464831 tctacaaatacccctaattaatactactaacttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatacaaataaaggacaatttgataatatttacgc 23464732  T
Q  221 acaaaatagacattttaatta 241  Q
    ||||||||||||  |||||||    
T  23464731 acaaaatagacacattaatta 23464711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26512280 - 26512032
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaata-----ctactaacttgt--------ctt 158  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||     ||||||||||||        |||    
T  26512280 taaatgtaaacttcttttcaaattattagatgtatttattattatttttc-taaacatacctttaattaatatactactactaacttgttttgttgtctt 26512182  T
Q  159 gaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttctt 258  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||  ||||||| | ||||||||||| ||    
T  26512181 gaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacacataaaataaacacattaattatactaacaatttttttt 26512082  T
Q  259 aagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||||||||| | ||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  26512081 aagaaatgtgaaaaaagcaaaaggagcttacataca-ggacggagtgagta 26512032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13534624 - 13534411
Alignment:
Q  49 ccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactact 148  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  13534624 ccgtttgattttatttttttctctaaatttaaattccatttcaaattactagatgcgtttattaat-tttttcctaaacatatccctaattaatactact 13534526  T
Q  149 aacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataac 248  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||       ||||||||||||||| | |||  ||||||||| | ||    
T  13534525 aacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaat--acatacaaaccaaggataat-------tattaacacacaaaacaaacacattaattacactgac 13534435  T
Q  249 aatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
    ||  ||||||||||||||||||||    
T  13534434 aacatttcttaagaaatgtgaaaa 13534411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Original strand, 25731077 - 25731247
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25731077 tttgactttatttttgtccttaaatgtaaac-ccttttcaaattactataaccatttataatt--ttttcctaaacatacccctaattaatactactaac 25731173  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaa 225  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25731174 ttgtcttaaaatatgaaaaatcaaatttaatatacatacaaacaaaagataatttgataatattaacacacaaa 25731247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 44421576 - 44421406
Alignment:
Q  142 tactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatta 241  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||| |  |||||||    
T  44421576 tactactaacttgtcttaaaatttaaaaaaacaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagtaatattaacaaacaaaacagatacattaatta 44421477  T
Q  242 caataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44421476 cactgacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaagtaaagggagtttacattaagggacggagggagtatat 44421406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 51 - 232
Target Start/End: Original strand, 2521188 - 2521368
Alignment:
Q  51 gtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaa 150  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  2521188 gttttattttatttttgtttctaaatgtaaatttcttttcaaattgctagatgcatttattattatttt-cctaaacatacccctaattaatcctactaa 2521286  T
Q  151 cttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagaca 232  Q
     |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  2521287 tttgtcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttaataatattaccacataaaatagaca 2521368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3326946 - 3326718
Alignment:
Q  49 ccgtttgattttatttttgtccct-aaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttc-ctaaacatactcataattaatacta 146  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  3326946 ccgtttgactttatttttgtccattaaatgtaaatctattttcaaattactagatgtatttattattatttttttctaaacatacccctaattaatacta 3326847  T
Q  147 ctaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaata 246  Q
    |||  || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| |||||  |||||||||       
T  3326846 ctacgttatcttgaaatatgaaaagttaaattttatacacatataaacaaaggacaatttaataatattaatatacaaaacagacacattaattacaccg 3326747  T
Q  247 acaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  3326746 acaattttttttaaaaaatatgaaaaagg 3326718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 291
Target Start/End: Original strand, 42250800 - 42251003
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttc-ctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatac 184  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42250800 tttttaaattactagatacatttattattatttttttctaaacatatttctaattaatactattaacttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatac 42250899  T
Q  185 acatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaaggggg 284  Q
    ||||| ||| ||| || ||||   ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  42250900 acatataaataaatgacaatt---taacattaaaacacaaaatagacacattaattacactaccaacttttcataagaaatgtgaaaaaagcaaaggggg 42250996  T
Q  285 tttacat 291  Q
     ||||||    
T  42250997 cttacat 42251003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Original strand, 375266 - 375424
Alignment:
Q  84 cctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    |||||||| ||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  375266 cctttttacattactatatggagttattatt-ttgttcctaaacatattcgtaatcaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaata 375364  T
Q  184 cacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattaca 243  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  375365 cacatacaaacaaatgacaatttgataatactaacacacaaaatagacacattaattaca 375424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 534712 - 534549
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  534712 tactccctccgtctctatatttaagcatccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttatt-tttttttt 534614  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  534613 cctaaatatacccctaattaatactattatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaataca 534549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27749714 - 27749580
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||    
T  27749714 tacttcctccgtccttatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattacaagatgcatttattact-ttttt 27749616  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtc 156  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27749615 cctaaacatacccctaattaatactactaacttgtc 27749580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32677658 - 32677471
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  32677658 ttttcaaattactagatacatttattatgtttttttctaaacatacccctaattaatactactaatttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttagtaca 32677559  T
Q  186 catacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
      |||||||||| || ||||||  ||||||||| || ||||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32677558 tgtacaaacaaatgacaatttgaaaatattaacccataaaatagacacattaattgtattaacaatttttcttaagaaatgtggaaaa 32677471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 273
Target Start/End: Original strand, 2916996 - 2917206
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactca-taattaatactactaacttgtc 156  Q
    ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2916996 tttatttttatctttaaatgtgaacttcttttcaaattactagatgtattaattattatttttt-taaaaata-tcactaattaatactactaacttgtc 2917093  T
Q  157 ttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttc 256  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||    ||| ||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||    
T  2917094 ttaaaatataaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttattaat----acatacaaaatagacacattaattatactaacaacttttc 2917189  T
Q  257 ttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||||| ||||    
T  2917190 ttaagaaatgtggaaaa 2917206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43650242 - 43650030
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| || |||        ||||||||   |||||||||| ||||||    
T  43650242 tttgattttatttttgttcttaaatgtaaac-cttttttaacttactagatgcattttttttta--------aaacatacctctaattaatacaactaac 43650152  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    |||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| | |||||    
T  43650151 ttgttttgaaatttaaaaggtcaaatttaatacacatacaaacaaagaacaatttagtaatattaacatacaaaacagacacattaattacactgacaat 43650052  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  43650051 ttttctaaagaaatgtaaaaaa 43650030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 274
Target Start/End: Original strand, 8383885 - 8384082
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaactt-gtcttgaaatatgtaaa 170  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||| || ||||||||    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  8383885 taaatgtaaacatcttttcaaattactaaatatatttatt----tttttccttaacatacccttaattaatactactagtttagtcttgaaatatgaaaa 8383980  T
Q  171 gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
     ||| ||||||||||  || | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  8383981 atcatatttaataca--taaagacaaatgacaatttggtaatattaacacacaaaataaacacattaattgcactaactatttttcttaagaaatatgaa 8384078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14527746 - 14527620
Alignment:
Q  146 actaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaat 245  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |    
T  14527746 actaacttgttttgaaatatgaaaaatcaaatttaatatacatacaaacaaatgataattcggtaatattaacacacaaaatagacacattaattaccct 14527647  T
Q  246 aacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14527646 aacaattttt-ttaaataatgtgaaaaa 14527620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 273
Target Start/End: Original strand, 35178764 - 35178902
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatt 234  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||||| | |||      
T  35178764 taattaatactactatcttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacaaatacaaataaaagacaatttcgtaatattatcacacaaaacatacaca 35178863  T
Q  235 ttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  35178864 ttaactacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 35178902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 279
Target Start/End: Original strand, 36174721 - 36174907
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||| | |||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  36174721 aaattactagatgaatttattatt--ttttcttaaacatacccctaattaatatcactaacttatattgaaatgataaaagtcaaatttaatacacatac 36174818  T
Q  191 aaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaa 279  Q
    ||| ||| || |||||  ||||| | |||||  |||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36174819 aaataaaagacaatttaataatactcacacatgaaatagacatattatttgcactaacaatttttcttaagaaacgtgaaaaagttaaa 36174907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 273
Target Start/End: Original strand, 13477004 - 13477142
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatt 234  Q
    |||||||||||||||| || | || ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||||     
T  13477004 taattaatactactaatttattttaaaatatgaaaaatcaaatttaatatgcatacaaataaaggacaatctagtaatattaacacataaaataaacata 13477103  T
Q  235 ttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13477104 ttaattgcactaacaatttttcttaaaaaatgtgaaaaa 13477142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Original strand, 43119267 - 43119424
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattt--ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaa 161  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |  | |||||||||||| ||  |  |||||||    
T  43119267 tttgtccctaaatataaatctcttttcaaattactagatgtatttattattttttatttcctaaacacatccttaattaatactaatatataatcttgaa 43119366  T
Q  162 atatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  43119367 atatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagtaatattaaca 43119424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Original strand, 44274420 - 44274538
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaata 164  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  44274420 ttgtccctaaatgtaaatcccttttcaaattactaaatgcatttattatttttttccttaaacatacccctaattaataccactaacttgtcttgaaatt 44274519  T
Q  165 tgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    || ||||||||||||||||    
T  44274520 tgaaaagtcaaatttaata 44274538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 279
Target Start/End: Original strand, 6275519 - 6275683
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaa-agtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatat 214  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||| |    
T  6275519 tttttcctaaacatacctctaattaatattattaacttgtcttgaaatatgaaatagttaaatttaatacatatacaaacaaaagacaatttcataat-t 6275617  T
Q  215 taacacacaaaatagacattttaattacaataacaa-tttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaa 279  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  6275618 taacacacaaaatagacacattaattgcactaacaatttttttttaagaaatgggaaaaatgtaaa 6275683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28190732 - 28190571
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatt 234  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  28190732 taattattactactaaattgtcttgaaatatgaaaaattaaacttaatacatatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacacaaaaaataaacata 28190633  T
Q  235 ttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagg 296  Q
    ||||||| | |||||| |||   |||||||||| ||||| | ||| || | |||||||||||    
T  28190632 ttaattatactaacaactttctctaagaaatgtcaaaaatgcaaaaggtgcttacatacagg 28190571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44101560 - 44101413
Alignment:
Q  78 taaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaat 177  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||   || | ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| ||||||    
T  44101560 taaaccccttttaaaattactagatgcatttattatt---ttacttaaacatatacctaattaatactacttacttgtctcaaaatataaaaaatcaaat 44101464  T
Q  178 ttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaata 228  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44101463 ttaatacacatataaataaagaataatttagtaatattaaaacacaaaata 44101413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 35241650 - 35241819
Alignment:
Q  105 atttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataat 204  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||    ||||||||| |||| |||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  35241650 atttattattttttttc-taaacatatctttaattaatattactgacttatcttgaagtataaaaagtcaaatttattacgcatacaaacaaatgataat 35241748  T
Q  205 ttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||   ||||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  35241749 ttgataatattaacaaacaaaacagacacattaattacacagacaacatttcttatgaaatgtaaaaaagg 35241819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6597952 - 6597852
Alignment:
Q  172 tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  6597952 tcaaatttaatacacatacaaa-aaaggatattttggtaatgttaacacacaaaatagacatattaattacatcaacaactttttgtaaaaaatgtgaaa 6597854  T
Q  272 aa 273  Q
    ||    
T  6597853 aa 6597852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44421980 - 44421857
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||    
T  44421980 tactccctccatccctatatctaagcacctatttgattttatttttgtctctaaatgtaaacccctttctaaattattagatgcatttatt-tttttttt 44421882  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatact 145  Q
    ||||||||||  | |||||||||||    
T  44421881 cctaaacatatccttaattaatact 44421857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Original strand, 41327662 - 41327825
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||      || |||      
T  41327662 tactccctccgtccatatatctaagcacccatttgactttatttttgtccataaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcat------ttgtttcc 41327755  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaac--ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacat 188  Q
    | ||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41327756 cataagcatacccgtaattcatactactaacttttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatgcacat 41327825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4033676 - 4033559
Alignment:
Q  174 aaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||| ||| || |||||||||||||| | |||||    
T  4033676 aaatttaatacacatacaaacaaagaacaatttagtaatattaacacagaaaacagaaacattaattacactaataacttttcttaagaaatataaaaaa 4033577  T
Q  274 ggtaaagggggtttacat 291  Q
     | |||||| ||||||||    
T  4033576 agcaaagggagtttacat 4033559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 274
Target Start/End: Original strand, 7257883 - 7258048
Alignment:
Q  109 attattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttgg 208  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||  | ||||||| |||| ||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||      
T  7257883 attattttttttcctaaatatacccttaattaattttgctaacttatcttaaaatataaaaagtcaaattttatacacgtacaaacgaatgacaatttaa 7257982  T
Q  209 taatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||||| |||| ||| | |||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  7257983 taatattaatacactaaacaaacacattaattacattaataatttttcttaaaaaatatgaaaaag 7258048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 4398545 - 4398632
Alignment:
Q  185 acatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4398545 acatacaaacaaatgacaatttcgtaatattaacacacaaaatagacacattaattacactaacaacttttcttaa-aaatgtgaaaaa 4398632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4034068 - 4033949
Alignment:
Q  26 cctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaa 125  Q
    ||||||||  ||||| ||| || || |||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4034068 cctccgtctctatatctaaacatccatttgattttattttagtccttaaatgtaatcccctttctaaattactagatgcatttattatttttttttctaa 4033969  T
Q  126 acatactcataattaatact 145  Q
    ||||||   |||||||||||    
T  4033968 acatacctttaattaatact 4033949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 259
Target Start/End: Original strand, 1604242 - 1604409
Alignment:
Q  90 taaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacata 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||| | ||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||| ||||| | ||    
T  1604242 taaattattagatgtatttattattatttt--ctaaacatacctctaattattcctactaatttgtcttcagatataaaaagtcaaattaaatacgcgta 1604339  T
Q  190 caaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttctta 259  Q
    ||||||||||| || ||  ||| ||| ||||| ||| ||||||| |||| |||| |  ||||||||||||    
T  1604340 caaacaaaggacaaattaataaaattcacacataaattagacatattaactacactgccaatttttctta 1604409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 273
Target Start/End: Original strand, 920569 - 920765
Alignment:
Q  75 atgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac-ttgtcttgaaatatgtaaagtc 173  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||   ||||||||| |||||||| |||||||   |||||| |||||||||| || | |||||||||| ||||||    
T  920569 atgtaaactcattttcaaattattatatccctttattattttttttccttaacatacatttaattagtactactaactttattttgaaatatgaaaagtc 920668  T
Q  174 aaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||||   || ||| |||| | | |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||| |||| |  ||  |||||||||||||||||    
T  920669 aaatttaatac---tataaataaagaagagtttgataatattaacatacaaaataaacatattaactacactaactacattatttaagaaatgtgaaaaa 920765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 192
Target Start/End: Original strand, 3389090 - 3389190
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||| ||    
T  3389090 aaattattagatgtttttattatt-tttttcttaaacatactcataactaatactattaatttgttttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacacac 3389188  T
Q  191 aa 192  Q
    ||    
T  3389189 aa 3389190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 16808794 - 16808887
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaata 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  16808794 taatttatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaattaattttaatatacatacaaacaaatgacaatttagtaatattaatacataaaata 16808887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 16848075 - 16848168
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaata 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  16848075 taatttatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaattaattttaatatacatacaaacaaatgacaatttagtaatattaatacataaaata 16848168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8393415 - 8393251
Alignment:
Q  68 tccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttc-ctaaacatactcataattaata-----ctactaacttgtcttgaa 161  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||  ||||| |||| | ||||||||      |||||||||| |||||||    
T  8393415 tccctaaatataaacccattttcaaattacaagatacatttattatttttttttactaaatatacccttaattaattaagtgctactaacttatcttgaa 8393316  T
Q  162 atatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaa 226  Q
    | ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  8393315 acatgaaaaaacaaatttaaaacacatacaaacaaagaaaaatttgataatattaacacacaaaa 8393251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8667725 - 8667597
Alignment:
Q  183 acacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac-acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagg 281  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | |||||| |||||| ||||||| | | |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  8667725 acacatacaaacaaaggagaatttgataatattaaagatacaaaacagacatattaattagactgacaacttttcttaggaaatgtgaaaaatgcaaagg 8667626  T
Q  282 gggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
     || || ||||||||||  ||||||||||    
T  8667625 aggcttgcatacagggagagagggagtat 8667597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8667801 - 8667725
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaaca 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8667801 tttgactttatttttgcccctaaatgtaaactcattttcaaataactagacgcatttattattatttttcctaaaca 8667725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20427242 - 20427166
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaa 192  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20427242 tttttcctaaacatacccttaattaatactgcaaacttgttctgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaa 20427166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27749579 - 27749499
Alignment:
Q  202 aatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaaggg 282  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27749579 aatttagtaatattaatacacaaaacagacatattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagtaaaggg 27749499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 273
Target Start/End: Original strand, 44274685 - 44274776
Alignment:
Q  182 tacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  44274685 tacacatacaaacaaatgacaatttggcaatattaacacataaaacagacacattaattacattgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 44274776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36846880 - 36846798
Alignment:
Q  144 ctactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaa 226  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  36846880 ctactaacttatcttgaaacatgaaaaaacaaatttaaaacacatacaaacaaagaaaaatttgataatattaacacacaaaa 36846798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 44462561 - 44462643
Alignment:
Q  144 ctactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaa 226  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  44462561 ctactaacttatcttgaaacatgaaaaaacaaatttaaaacacatacaaacaaagaaaaatttgataatattaacacacaaaa 44462643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38107750 - 38107627
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||  || ||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  38107750 tactccctccgtcgctatatctaagcacccatttgatttt-tttttgtcgctaaacatacacctcttttcaaattacaagatgcatttattatta-tttt 38107653  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatacta 146  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  38107652 cctaaacatacccctaattaatacta 38107627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 197
Target Start/End: Original strand, 12498249 - 12498301
Alignment:
Q  145 tactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12498249 tactaacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaa 12498301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6408776 - 6408681
Alignment:
Q  122 ctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaa 217  Q
    ||||||||||   |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||    
T  6408776 ctaaacatacctttaattaatactattaacttttcttgaaatatgaaaagttgaatttaatacacatacaaataaataataatttaataatattaa 6408681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11121346 - 11121259
Alignment:
Q  135 taattaatactactaactt-gtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacaca 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  11121346 taattaatactactaactttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaat--acatttaaacaaaggacaatttgataatatttacacaca 11121259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Original strand, 44284850 - 44284912
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattatt 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44284850 tttgattttatttttgtacctaaatataaactctttttcaaattcctagatgtatttattatt 44284912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 255
Target Start/End: Original strand, 15578059 - 15578172
Alignment:
Q  142 tactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatta 241  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||   |||||||| ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||| | |||  |||| ||    
T  15578059 tactactaacttatcttgaaacatgaaaaaataaatttaaaacacatacaaataaagaaaaatttgataatattaacacacaaaacaaacacattaacta 15578158  T
Q  242 caataacaattttt 255  Q
    || ||| |||||||    
T  15578159 cattaataattttt 15578172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Original strand, 36175009 - 36175200
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatt--tttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacat 188  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | |||||| |   |||||||||   |||| || |||| ||||||  ||||| ||||||||||   ||    
T  36175009 aaattactagattcatttattattattatttttcaaaacatgcctctaattaataacgctaatttatcttaaaatataaaaagttaaatttaatatgtat 36175108  T
Q  189 acaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaag 280  Q
    |||||||||| | || || || ||||| |||| |||||||||||  || |||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36175109 acaaacaaagaacaacttagtgatattcacacgcaaaatagacacattgattttattaataatttttcttaagaaatatgaaaaaggtaaag 36175200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 131
Target Start/End: Original strand, 4398473 - 4398550
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatac 131  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4398473 tttgactttatttttgttcctaaatgtaaaccctttttcaaattactagatgcatttatt-ttattttt-ctaaacatac 4398550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20360678 - 20360592
Alignment:
Q  123 taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggta 210  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  20360678 taaacatacccttaattaatactgcaaacttgttttgaaatataaaaagtcaaatttaataaacatac-aataaatgataatttggta 20360592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2654435 - 2654349
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacaca 221  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||| ||| |||||    
T  2654435 taattaatactattaacttatcttaaaatatgaaaaatcaaattaaatacacatataaacaaaagacaatttagtaacattcacaca 2654349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 35179006 - 35178941
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaa 181  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35179006 tttttcctaaacatacccctaattaataccgctaacttatcttgaaatatgaaaaatcaaatttaa 35178941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Original strand, 43638820 - 43638885
Alignment:
Q  163 tatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaata 228  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43638820 tatgaaaaatcaaatttaatacacatataaataaatgataattttgtaatattaacacgcaaaata 43638885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 17513327 - 17513252
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  17513327 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtctttaaatgtaaac-cttttttaaattac 17513252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Original strand, 22590313 - 22590484
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacata-ctcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatac 184  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||  ||| ||| ||||| || ||| ||| |||| |||||||||| | ||  ||||||||||     
T  22590313 tttttaaattattaaatttatttattattattttt--taagaatatctc-taattgattctattaatttgttttgaaatatgaagagataaatttaata- 22590408  T
Q  185 acatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaa 260  Q
    ||||| ||| | || | |||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22590409 acataaaaatatagaaaaatttaataaaattaacacacaaagtagacacattaattacattaacaatttttcttaa 22590484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24129060 - 24128985
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  24129060 tactctcttcgtccatatatttaaacatccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 24128985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3337781 - 3337682
Alignment:
Q  174 aaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||| || ||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||| |||  || ||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3337781 aaatttaatacacgtataaacaaatgacaatttgctaatattaacatgcaaaatatacacattgattgcagcaacatcttttcttaagaaatgtgaaaaa 3337682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29971441 - 29971308
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||          ||||||||||| || || || |||||||||| |    
T  29971441 ttttcaaattattagatgtatttattatt--ttttcctaaacatacccttaattaat----------tgtcttgaaatttgaaatgttaaatttaataga 29971354  T
Q  186 catacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagac 231  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  29971353 catacaaacaaaaaaaaatttagtaattttaacatacaaaacagac 29971308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 230
Target Start/End: Original strand, 31583638 - 31583697
Alignment:
Q  171 gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaataga 230  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  31583638 gtcaaatttaaagcacatacaaacaaaggacaatttgataatattaatacacaaagtaga 31583697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Original strand, 12417617 - 12417687
Alignment:
Q  163 tatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacat 233  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  12417617 tatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaataaaaaacaatttgttaatattaacacaaaaaatatacat 12417687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Original strand, 12429677 - 12429747
Alignment:
Q  163 tatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacat 233  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  12429677 tatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaataaaaaacaatttgttaatattaacacaaaaaatatacat 12429747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 197
Target Start/End: Original strand, 30401519 - 30401581
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa 197  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30401519 taattagtactactaacttaccttaaaatatgaaaaattaaatttaatacacatacaaacaaa 30401581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 243
Target Start/End: Original strand, 35453726 - 35453812
Alignment:
Q  155 tcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattaca 243  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  35453726 tcttcaaatatgaaaagttaaatttaataca--taaaaacaaagaacaatttagtaatattaacatataaaatagacacattaattaca 35453812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3337881 - 3337802
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacata-ctcataattaatactactaacttgtcttgaaatat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  3337881 tttttaaattactagatgtatttatt-tatttttttctaaatatatctcttaattaatattattaacttgtcttcaaatat 3337802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11168766 - 11168666
Alignment:
Q  172 tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaa 271  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||  |||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||    
T  11168766 tcaaatttaatatacatataaaccaaaaataacttaataatattaacacataaaataaacataaaaattacattaacaacttttcttaataaatgtaaaa 11168667  T
Q  272 a 272  Q
    |    
T  11168666 a 11168666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12122038 - 12121891
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaa-gtcaaatttaata--cacatacaaacaaaggataatttggtaat 212  Q
    |||||| || |||||| | ||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  |||||||||  |||  | |||||  ||||    
T  12122038 tttttcttatacatacccttaattaattttaataatttgtcttgaaatatgaaaaagtcaaatataatatacacatacaagtaaaaaacaatttaataat 12121939  T
Q  213 attaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaa 260  Q
    ||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  12121938 attcacatataaaatagacatattaattacactaacaactttttttaa 12121891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20427002 - 20426950
Alignment:
Q  208 gtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaa 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||    
T  20427002 gtaataataacacacaaaatagacacattaatttcactaacaatttttcttaa 20426950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25731708 - 25731602
Alignment:
Q  157 ttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttc 256  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||  |||| | ||||| ||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| | |||    
T  25731708 ttgaaatataaaaaatcaaatttaacacacatacaat-aaagaaaaatttagttttattaatacacaaaatagatactttaattacactaacaa-tcttc 25731611  T
Q  257 ttaagaaat 265  Q
    |||||||||    
T  25731610 ttaagaaat 25731602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 272
Target Start/End: Original strand, 34042096 - 34042164
Alignment:
Q  204 tttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  | ||||||||||| | || |||||||||||    
T  34042096 tttggtaatattaacatacaaaatagacacattaattgaactaacaatttttttaaaaaaatgtgaaaa 34042164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2395849 - 2395798
Alignment:
Q  222 caaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2395849 caaaatagacacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtaaaaaa 2395798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 306
Target Start/End: Original strand, 41327837 - 41327896
Alignment:
Q  247 acaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggaggga 306  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41327837 acaacttttcttatgaaatgtgaaaaatacaaagggggcttacatacaaggacggaggga 41327896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Original strand, 24490730 - 24490807
Alignment:
Q  145 tactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaaca--aaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| |  |   |||||||||||||||||||||    
T  24490730 tactaacttgttttgaattataaaaagtcaaatctaatacacatacaaaaaatataaataatttggtaatattaacac 24490807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 31900697 - 31900651
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaac 82  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31900697 tatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac 31900651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 37314737 - 37314813
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgt-aaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  37314737 tactctcttcgtccatatattttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatataaac-cttttttaaattac 37314813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 7153743 - 7153668
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  7153743 tactctcttcgtccatatatttaaacatctatttgattttatttttgttcttaaatgtaaac-cttttttaaattac 7153668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11071327 - 11071275
Alignment:
Q  258 taagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  11071327 taagaaatgtgaaaaatgcaaaaggggcttagatatagggacggagggagtat 11071275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 106)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 318
Target Start/End: Original strand, 20945154 - 20945456
Alignment:
Q  15 atcaactactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattatt 114  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  20945154 atcaaatactcccttcgtccctatatctaagcacccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttgttatt 20945253  T
Q  115 atttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatat 214  Q
    ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20945254 atttt-cctaaacataaccctaattaatactactaacttgtcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataattaggtaatat 20945352  T
Q  215 taacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatataa 314  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  20945353 taacacataaaatagacacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaatgtaaaaggtgtttacatatagggacggtgggagtataaaa 20945452  T
Q  315 taat 318  Q
    ||||    
T  20945453 taat 20945456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 26517075 - 26517363
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  26517075 tactccctccgtccatatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcttttacaaattactagatgcatttattatt-ttttg 26517173  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26517174 cctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaggacaatttggtaatattaacac 26517273  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    | |||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||| |||| || |||||||||    
T  26517274 agaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaatgcaaagggaacttacatagaggggcgaagggagtat 26517363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42891665 - 42891375
Alignment:
Q  20 ctactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  42891665 ctactccctccgtccctatacgtaaacacccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaacccctcttcaaattactagatgcatttattatt--ttt 42891568  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42891567 tcctaaacatacccctaattaataccactaacttgtctttaaatttgaaaagtcaaatttaatatacatacaaacaaaggacagtttggtaatattaaca 42891468  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    ||||||| |||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  42891467 cacaaaacagacaaattaattatactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaatacaaagagggtttacataaatgggcggagggagtatat 42891375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44083874 - 44083589
Alignment:
Q  20 ctactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  44083874 ctactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaacccattttcaaattactagatccatttattatt-tttt 44083776  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
     ||||||||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44083775 ccctaaacatacccctaattaatatcactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttggtaatattaaca 44083676  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaa-tgtgaaaaaggt-aaagggggtttacatacagggacggagg 304  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    |||||||  |||||||||||||||||||    
T  44083675 cacaaaatagatacattaattacaataacaatttttcttaaaaaaatgtgaaaaaaaacaaaggggacttacatacagggacggagg 44083589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26043248 - 26042978
Alignment:
Q  35 atatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactca 134  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |     
T  26043248 atatatctaagcacccatttgactttatttt-gtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagacgcatttattatt-tttttcctaaacataccc- 26043152  T
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatt 234  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  26043151 taattaatactactaa-ttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggtaacattaacacacaaaacagacata 26043053  T
Q  235 ttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| | ||| |||| |||||    
T  26043052 ttaattacactgacaatttttcttaagaaatgtaaaaaatgtaaagaggggttacataaaaggaaggagagagta 26042978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 51263314 - 51263046
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcat 135  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||  |    
T  51263314 tatatttaagcacccgtttgattttatatttgttcctaaatataaattcattttcaaattactagatgtatttgttaattttttttttaaacatactttt 51263215  T
Q  136 aattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattt 235  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||  |    
T  51263214 aattaatactactaacttatctttaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatactaacacataaaacagacacat 51263115  T
Q  236 taattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggaggg 305  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  51263114 taattacactaacaattttttttaagaaatgtgaaaaatgtaaa-ggggtttacatataggaacggaggg 51263046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 12077599 - 12077854
Alignment:
Q  19 actactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttatta-ttatt 117  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  12077599 actactccttccgtccctatatctaatcactcatttgattttatttttgtccttaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattaattttt 12077698  T
Q  118 tttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaa 217  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  12077699 tttcctaaacatacccctaattaatacttctatcttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgtaatattaa 12077798  T
Q  218 cacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||    
T  12077799 cacacaaaagagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatttgaaaaa 12077854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 273
Target Start/End: Original strand, 14645755 - 14646000
Alignment:
Q  27 ctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaa 126  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14645755 ctccgtccttatatctaagcacccatttgactttatttttgttcttaaatgtaaacccctttttaaattactatatgcatttattattttttttc-taaa 14645853  T
Q  127 catactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaa 226  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  14645854 catacccctagttaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaataacaatttggtaatattaacacacaaaa 14645953  T
Q  227 tagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14645954 tagacacattaattacactaacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 14646000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11388369 - 11388078
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| || |  |||||||  |  ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11388369 tactcccttcgtccgtatatgtaaacatctatttgattaaaaatttgtccttaaatgtaaaccctttttcaaattactagatgcatttattatttttttt 11388270  T
Q  121 cctaaacatactcataattaata--ctactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    | ||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  11388269 c-taaacatacccctaattaatatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaatacaatttggtaatattaac 11388171  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtata 311  Q
    || |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  11388170 acgcaaaatagacacattaattacactaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaatgggattatatatagggacgaagggagtata 11388078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46048769 - 46048517
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  46048769 tactccattcgtccctatatctaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattaatagatgcatttattatttttttt 46048670  T
Q  121 cctaaacatactca-taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    | ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  46048669 c-taaacataccccctaattaacactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaata 46048571  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46048570 cacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 46048517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 29676601 - 29676887
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||     
T  29676601 tactccctccgtccctatatctaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaacctcatttcaaattacta-atgcatttattatt--tttc 29676697  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  29676698 cctaaacatacccctaattaataccactatcttgtcttgaaatatgaaatgccaaatttaatacacatacaaataaaagacaatttcgtaatattaacac 29676797  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    | ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |  |||||  |||||||||||||||||    
T  29676798 ataaaatagacacattaattacactgacaatttttcttaagaaatatgaaaaaggcaatgggtgcctacattaagggacggagggagtat 29676887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 50524851 - 50525124
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcat 135  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  50524851 tatatctaagcacccatttgactttatttttgtccttaaatctaaaccctttttcaaattacaagatgcatttattatt-tttttcctaaacatacccct 50524949  T
Q  136 aattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattt 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  50524950 aattaaaactactaacttgtcttgaaatttcaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggtaatattaacacacaaaatatacatat 50525049  T
Q  236 taattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||||    | |  |||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||  |||||| ||||||||||    
T  50525050 taattaccccgagagcttttcttaagaaatgtgaaaaaagaaaagggtgcttacattaagggacagagggagtat 50525124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 41727108 - 41727351
Alignment:
Q  31 gtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacata 130  Q
    |||| ||||||||| ||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  41727108 gtccctatatgtaaacactcatttgattttacttttgttcttaaatgtaaacccctttttaaattactaaatgcatttattatt-tttttcttaaacata 41727206  T
Q  131 ctcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaataga 230  Q
    | | |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41727207 cccctaattaatatcactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaggacaattttgtaatattaacacacaaaacaga 41727306  T
Q  231 cattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    ||  ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  41727307 cacattaattacactgacaactttttttaagaaatgtgaaaaagg 41727351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 311
Target Start/End: Original strand, 13084223 - 13084507
Alignment:
Q  24 tccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcct 123  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  13084223 tccctccgtccctatatctaaacatccaattgattttatttttatccttaaacgtaaactccttttcaaattactagatgcatttat---tatttttcct 13084319  T
Q  124 aaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacaca 223  Q
    |||||||  | |||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13084320 aaacatatccctaattaatgctactaacttgtgttaaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttggtaatattaacacaca 13084419  T
Q  224 aaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtata 311  Q
    ||| |||||  ||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||   ||| ||| | || |||||||||||||    
T  13084420 aaacagacacattaattatactgacaacttttcttaagaaatatgaaaaaaataaagggaacttagatataaggccggagggagtata 13084507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 309
Target Start/End: Original strand, 41739877 - 41740121
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaata 164  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41739877 ttgtccctaaatataaactcattttcaaattactaggtacatttattatt-tttttcctaaacatacccttaattaatactgctaacttatcttgaaata 41739975  T
Q  165 tgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaa 264  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||| |||||||||||| |||    
T  41739976 tgaaaattcaaatttaacacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattgtattaataatttttcttaaaaaa 41740075  T
Q  265 tgtgaaaaaggt-aaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||| || ||| |||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  41740076 tgtgaaaaaagtaaaaagggggttatatataggaacggagggagta 41740121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31819652 - 31819401
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |   |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31819652 tactccctctatccctatatctaagcacctatttgattttatttttgtccctaaatataacccaattttcaaattactagatgcatttattatt-ttttt 31819554  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31819553 cctaaacatacccctaattaatactactatattgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaacac 31819454  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    | |||| |||||  |||||||||   | || ||||||||||||||||||||||    
T  31819453 ataaaacagacacattaattacaccgataacttttcttaagaaatgtgaaaaa 31819401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 44338327 - 44338038
Alignment:
Q  20 ctactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |  |  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  44338327 ctactccctccgtcccaatatgtaaacacccatttgactaaaaatttgtacctaaatgtaaaccccttttcaaattcctagatgcatttat-attatttt 44338229  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
     ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44338228 -cctaaacatacccctaattaatagtactaacttatcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatagaaacaaaggacaatttggtaatattaaca 44338130  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    || ||| ||||||  |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44338129 caaaaattagaca-attaactacactaacaacttttcttaaaaaatgtgaaaataacaaaaggggtttacatatagggacagagggagtatat 44338038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 101 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42011034 - 42010824
Alignment:
Q  101 atgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagga 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  42011034 atgtatttattatt-tttttcctaaacatacccataattaatactgctaatttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaacatacatacaaacaaagaa 42010936  T
Q  201 taatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacg 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||| || | ||| |||||||||||    
T  42010935 taatttgataatattaacacacaaaatagacacattaattacattaacaaattttcttaagaaatgtgaaaaaaacaaaaggagattatatacagggacg 42010836  T
Q  301 gagggagtatat 312  Q
    ||||||||||||    
T  42010835 gagggagtatat 42010824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Original strand, 41308637 - 41308889
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||| |||| ||| |||||| ||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||  || ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41308637 tacttcctcggtctatatatctaagcccccatttgactttatttttgtctctaaat-taaatcccctttcaaattactagatgcatttattatt-ttttt 41308734  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41308735 cctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagccaaatttaatacacatataaacaaagaataaattggtaatattaacac 41308834  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  41308835 acaaaacagacacattaattacactgacaacattttttaagaaatgtgaaaaagg 41308889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22659826 - 22659575
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||  || | ||||| |||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22659826 tactctctccgtccttatatctaaatactcatttgactttatttttgtctccaaatgtaaatctctttttaaattactagatgcatttattattatttt- 22659728  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    | ||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22659727 cataaacatatccttaattaatactactaatttgttttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttggtaatattaacac 22659628  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||| | |  ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22659627 acaaaataaatacattaattatactaacaacttttcttaagaaatgtaaaaaa 22659575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 91 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30476217 - 30475991
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30476217 aaattactagatgcatttattatt-tttttcctaaacatacccctaattaatactactatcttctcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatagacatac 30476119  T
Q  191 aaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttaca 290  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |  ||||    
T  30476118 aaacaaaggacaatttcgtaatattaacacacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaaggcaatgggtgcctaca 30476019  T
Q  291 tacagggacggagggagtatataataat 318  Q
    |  ||||||||||||||||  |||||||    
T  30476018 ttaagggacggagggagtaagtaataat 30475991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 50363239 - 50363022
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||| ||  ||   |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  50363239 tttgattttagttttgtccct-aatgtaaaacctttttcaaattactaaatacat---ttattatttttcctaaacatacccctaattaatactactaac 50363144  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| | |||||    
T  50363143 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaatacataaaacagacatattaattacactgacaat 50363044  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  50363043 ttttcttaaaaaatgtgaaaaa 50363022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35145477 - 35145233
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  35145477 tactccctccgtccctatatataagcaaccatttgattttatttttgtccctaaatataaactc-ttttcaaattactagatgcatttattatttttttt 35145379  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  35145378 cctaaacatatccctaattaatattaccattttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacaaatacaaacaaaggataatttcgtaatattaac-- 35145281  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
           |||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35145280 -------agacacgttaattacactcacaacttttcttaagaaatgtgaaaaagg 35145233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 831261 - 831471
Alignment:
Q  62 tttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaa 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||    
T  831261 tttttgtccttaaatgtaaactcctttttaaactactagatgcatttattattatttt-cctaaacatactcctaattaatactaataacttatattgaa 831359  T
Q  162 atatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaag 261  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |  ||  ||||||||| | |||| ||||||||||    
T  831360 atatgaaaaatcaaatttaatacacatataaacaaaggacaatttggtaatattaacacgcaatacatgcacattaattacattgacaacttttcttaag 831459  T
Q  262 aaatgtgaaaaa 273  Q
    |||| |||||||    
T  831460 aaatatgaaaaa 831471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 48309689 - 48309443
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||  |   |||||||||||| |||||   |||| |||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  48309689 tactccctccgtccctatatataactactcatttgattaaagaattgtccctaaatttaaaccaattttcaaattactagatatatttatt--tattttt 48309592  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  48309591 cctaaacatacccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaacacacatacaaacaaaggataattttgtaatattaacat 48309492  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||    
T  48309491 acaaaatagaca-cataattgcactaacaacttttcttaagaaacgtgaa 48309443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28477628 - 28477335
Alignment:
Q  23 ctccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcc 122  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |  || ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  28477628 ctccctccgtccctatatctaagcctccatttgactttatttttgcccctaaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattatt--ttttct 28477531  T
Q  123 taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacac 222  Q
     ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28477530 aaaatatacccctaattaatactactaatttgtcttgaaatatgaatagtcaaatttaatgcacatacaaacaaaagacaatttggtaatattaacacac 28477431  T
Q  223 aaaatagacattttaattacaataacaa--------tttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||| |||||  |||||| ||   ||||         |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  28477430 aaaacagacacattaattgcaccgacaacttttcttcttttcttaagaaatgtgaaaaaagaaaagggggcttacatatagggacggaggaagtat 28477335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 270
Target Start/End: Original strand, 48902987 - 48903191
Alignment:
Q  66 tgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatat 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||| ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48902987 tgtccctaaatctaaactcctttttaaattaatagatgcatttattattttattccctaaacctacccttaattaatactactaatttttcttgaaatat 48903086  T
Q  166 gtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaat 265  Q
      |||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  48903087 taaaagtcaaatttaatatatatacaaacaaatgacaatttagtaatattaacacacaaaatagacaaattaattgcactaactatttttcttaataaat 48903186  T
Q  266 gtgaa 270  Q
    |||||    
T  48903187 gtgaa 48903191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40645889 - 40645667
Alignment:
Q  50 cgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactacta 149  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  | ||| |||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  40645889 cgtttgactttatttttatccctaaatataaacctcctttcaaattattagatgcatttattatt---tttcctaaacatacccctaattaatactaata 40645793  T
Q  150 acttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataaca 249  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||   |||    
T  40645792 acttgtcttgaaatatgaaaaaccaagtttaatacacatacaaacaaaagacaatttggtaatattaacacacaaaacagacacattaattacacagaca 40645693  T
Q  250 atttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  40645692 acatttcttaagaaatgtgaaaaagg 40645667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25750765 - 25750480
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttattttt-gtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  25750765 tactccctccgtctttatatctaagcacccacttgactttattttttgtccttaaatgtaaactctttttcaaattactagatacatttattat-atttt 25750667  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
      ||| |||||  | |||||||||||||||| || |||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  25750666 --ctatacatatccttaattaatactactaaattttcttcaaa-------agtcaaatttaatacacatacaaacaaagaacaagttggtaatattaaca 25750576  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatataat 315  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25750575 cacaaaatagacaaattaattacattaacaacctttcttaagaaatgtaaaaaaagcaaagggagcttacatacagggacagagggagtacataat 25750480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Original strand, 31530988 - 31531149
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31530988 tactccctccgtccctatatctaagcacccatttgactttatttt-gtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattattttt 31531086  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  31531087 cctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaagttaaatttaata 31531149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 309
Target Start/End: Original strand, 46435643 - 46435877
Alignment:
Q  73 aaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtctt-gaaatatgtaaag 171  Q
    ||||||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||| || || ||| |||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  46435643 aaatgtaaaccttttttcaaattacaagatgcatttattttttttcttc-taaatatgcccttaattaatactactaacttgtctttgaaatttgaaaag 46435741  T
Q  172 tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaa 271  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  46435742 tcaaatttaataca--tacaaacaaaggacaatttggtaatattaacacacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaa 46435839  T
Q  272 aaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    || | ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46435840 aaagcaaagggggtttacatattgggacggagggagta 46435877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33288054 - 33287861
Alignment:
Q  78 taaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaat 177  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33288054 taaacttcttttcaaattactagatacatttactatt--ttttcctaaacatacatctaattaatactactaacttgtcttgaaatataaaaagtcaaat 33287957  T
Q  178 ttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  33287956 ttaatacacaaacaaacaaaggacaatttaataatattaacacacaaaatagacaaattaattacactacaaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 33287861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21933128 - 21932962
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaata 164  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  21933128 ttgtccctgaatataaacccattttcaaattactagatgcatttattatt-tttttcctaaacatacccctaattaatacggttaacttatcttgaaata 21933030  T
Q  165 tgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagaca 232  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21933029 tgaaaagtcaaatttaacacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagaca 21932962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 314
Target Start/End: Original strand, 35765506 - 35765800
Alignment:
Q  26 cctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttc--ct 123  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||   ||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||   ||    
T  35765506 cctccgtccctatatctaaacacttatttgactttatttttttctctaaatataatctcattttcaaattaatagatgtatttattattattttttttct 35765605  T
Q  124 aaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacac---atacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||   ||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||    
T  35765606 aaacatacctataattaatactactaacttgttttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatgatataaac-aaggtcaatttggtaatattaatac 35765704  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtg--aaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatataa 314  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||||  |||||   |||||||  ||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  35765705 acaaaacagacatattaattacactgataacttttcttaagaaatgtggaaaaaaaacaaaggggaattacatatagtgacggagggagtagataa 35765800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 34055727 - 34055975
Alignment:
Q  23 ctccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcc 122  Q
    |||||| ||||  ||||| ||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  34055727 ctccctgcgtctttatatctaagcacctatttgattttatttttttctctaaatgtatacccctttttaaattactagatatatttattattttttt--c 34055824  T
Q  123 taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacac 222  Q
    ||||||||| |||||||||||  | || ||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||  || || |||||  ||||||||||||||    
T  34055825 taaacatacccataattaatatcattatcttatcttgaaatacgaaaagtcaaagttaatatacataaaaa--aatgacaatttcataatattaacacac 34055922  T
Q  223 aaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    |||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34055923 aaaacagacatattaattacattgacaattttttttaagaaatgtgaaaaagg 34055975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 43186961 - 43187243
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||    
T  43186961 tacttcctccgtccctatatgtaaacatccatttgattttacttttgtccttaaatataaaccccttttcaatttactagatgcatttattatt-ttttt 43187059  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| |  ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  43187060 cctaaacataccctgaattaatatcactatcttgtcttgaaatatgaaaagtca--------acacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaatac 43187151  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||| || | | |  |||||  | |||||||||||||||||    
T  43187152 acaaaacagacacattaattacattgacaactttttttaagaaatatgaaaaaggcaatgagtgactacattaacggacggagggagtatat 43187243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 278
Target Start/End: Original strand, 27638036 - 27638193
Alignment:
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  27638036 cctaaacatacccctaattaataccactatcttgtcttgaaatatgaaatgtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattttataatattaacac 27638135  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaa 278  Q
    |||||||||| |  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27638136 acaaaatagagacattaattacactaataacttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaa 27638193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 302
Target Start/End: Original strand, 27047083 - 27047317
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaat 163  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |   |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  27047083 tttgtctctaaatataaattccatttcaaattactagatgaatttattattttttttcttcta---actcctaattaatactattaaattgtcttaaaat 27047179  T
Q  164 atgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaa 263  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||  |||||||||| |    
T  27047180 ataaaaagtcaaatttaatgcacatacaaacaaaagacaatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattgcactaacagcttttcttaagga 27047279  T
Q  264 atgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacgga 302  Q
    ||||| |||| | |||||| | |||||||||||||||||    
T  27047280 atgtg-aaaatgcaaagggtgcttacatacagggacgga 27047317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31474638 - 31474413
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  31474638 tttgactttatttttgtctctaaatataaactcatttttaaattattagatgtatttattatt--ttttcctaaacatacccctaattaatactactaat 31474541  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||| |||| || |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||  ||| ||| |  || ||     
T  31474540 ttgtcttaaaatttgaaaaactaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttaataatattaacgcacaaaacagacacattagttataccaaaaaa 31474441  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaa 279  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  31474440 ttttcttaaaaaatgtaaaaaagataaa 31474413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11140911 - 11140677
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||||     
T  11140911 tttgattttatttttatccctgaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattatt--ttttcctaaacatgcccctaattaatactactaa- 11140815  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
       |||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  ||| ||||| | | ||     
T  11140814 ---tcttgaaatatggaaagttaaatt----acacatacaaacaaaggataatttggtaatactaacacacaaaacatacacattatttacactgataac 11140722  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagg 296  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  11140721 ttttcttaaacaatgtgaaaaatgtaaaaggggcttacatacagg 11140677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 257
Target Start/End: Original strand, 39617147 - 39617345
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgt 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||| |||  | ||||||||||||||  |||||    
T  39617147 attttatttttgtcactaaatgtaaacctttttttaaatgattagatgcatttattatt-tttttcttaaatatatccctaattaatactact--cttgt 39617243  T
Q  156 cttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaattttt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| | |||| ||||    
T  39617244 cttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaacatacaaaacagacacattaattacactgacaactttt 39617343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 35055967 - 35055782
Alignment:
Q  85 ctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatac 184  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  35055967 cttttcaaattattagatgcatttattatt--ttatcctaaacatacccataattaatactactaacttgtattgaaatataaaaagtcaaatttaatac 35055870  T
Q  185 acatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35055869 acatacaagcaaatgacaatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaa-agcgttaactacttttcttaagaaatgtgaaaaa 35055782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28228426 - 28228136
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaac--tcctttttaaattactagatgtatttattattattt 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | || || |  | |||||||||||||| |||||  | ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  28228426 tactccctccgtccatatatataagcactcatt-gactaaaattttgtccctaaatataaaccattcttttcaaattagtagatgcatttattataattt 28228328  T
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||| |||||| |||    
T  28228327 ttc-taaatatactcataattaatactactaatttgtcttgaaaaatgaaaagtcacatttaatacacatacaaacaaatgacgttttgataatatgaac 28228229  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtata 311  Q
    |||||||    |||  |||||| || |||||| |||| ||||||||| | ||||| | ||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  28228228 acacaaacacaacacattaattgcactaacaactttttttaagaaatatcaaaaaagcaaaggaggcttatatatagggacggagagagtata 28228136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 311
Target Start/End: Original strand, 52325451 - 52325652
Alignment:
Q  110 ttattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggt 209  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  52325451 ttattatttttcctaatcatacccttaattaatattgctaacttatcttgaaatatgaaaaataaaatgtaataaacatataaacaaaggacaatttgat 52325550  T
Q  210 aatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||  |||||  |||||||    
T  52325551 aatattaacacataaaatagacacattaattacactaacattttttcttaagaaatgtgaaaaatgcaaagagtgcttacatacgaggacgaggggagta 52325650  T
Q  310 ta 311  Q
    ||    
T  52325651 ta 52325652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 270
Target Start/End: Original strand, 48901421 - 48901625
Alignment:
Q  66 tgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatat 165  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| | || ||||||| ||| | |||||||||||| ||| || |||| ||||||    
T  48901421 tgtctctaaatctaaacccctttttaaattaataaatgcatttattattttattccctaaacctacccttaattaatactattaatttttcttaaaatat 48901520  T
Q  166 gtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaat 265  Q
      |||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  48901521 taaaagtcaaatttaatatatatacaaacaaatgacaatttagtaatattaacacacaaaatagacaaattaattgcactaactatttttcttaataaat 48901620  T
Q  266 gtgaa 270  Q
    |||||    
T  48901621 gtgaa 48901625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 273
Target Start/End: Original strand, 37729009 - 37729140
Alignment:
Q  142 tactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatta 241  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37729009 tactactaacttattttgaaatatgagaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatatgataatattaacacacaaaatagacacattaatta 37729108  T
Q  242 caataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37729109 tattaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 37729140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 272
Target Start/End: Original strand, 41825113 - 41825247
Alignment:
Q  138 ttaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatttta 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  41825113 ttaatactactaacttgtcttaaaatatgaaatgtcaaatttgatacacatacaaacaaaagataatttggtaatattaacacataaaatagacacatta 41825212  T
Q  238 attacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
    |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  41825213 attacactgacaacttttcttaagaagtgtgaaaa 41825247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29349624 - 29349401
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  29349624 tactccctccgttcctatatctaaacactcatttgactttatttttgttcctaaatgtaaactcattttcaaattactagatgcattaattatt-ttttt 29349526  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacaca-tacaaacaaaggataatttg---gtaatatta 216  Q
    | |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||  | ||||||   |||||||||    
T  29349525 cttaaacatacctctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaattttatacatagtacaatcaaataacaatttggtagtaatatta 29349426  T
Q  217 acacacaaaatagacattttaatta 241  Q
    || ||||||| |||||  |||||||    
T  29349425 acgcacaaaacagacacgttaatta 29349401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Original strand, 33411867 - 33412071
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||| || |||| |||||| |||||  ||||||||||  ||| |||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  33411867 tttgattttatttttattcttaaatgtaaattcattttcaaattattagatacatttattatt--tttccctaaatatatccttaattaatactactaac 33411964  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    |||  |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||    
T  33411965 ttgcattgaaatatgaaaagacaaatttaataca--tacaaagaaaaaacaatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattgcactaacaat 33412062  T
Q  252 ttttcttaa 260  Q
    |||||||||    
T  33412063 ttttcttaa 33412071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50092890 - 50092626
Alignment:
Q  46 cacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatact 145  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||| |    
T  50092890 cacccatttaattttatttttgtccataaatataaatctattttcaaattaatagatgcatttattattatttttttaaaacatacccttaattaatatt 50092791  T
Q  146 actaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaat 245  Q
    |  | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||   |||  ||||||||| |    
T  50092790 atcatcttgtcttgaaatatgaaaagacaattttaatacacatacaaataaaggacaattttgtaatattaatacacaaaaccaacacattaattacact 50092691  T
Q  246 aacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
      ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||  |  | ||||||  |||||||||||||||||    
T  50092690 gtcaacttttgttaagaaatgtaaaaaaggcaatagatgcttacattaagggacggagggagtat 50092626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 195
Target Start/End: Original strand, 5504491 - 5504608
Alignment:
Q  77 gtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaa 176  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5504491 gtaaacccttttttaaattactatatgcatttattatt-tttttcctaaacatacccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaa 5504589  T
Q  177 tttaatacacatacaaaca 195  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5504590 tttaatacacatacaaaca 5504608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29611987 - 29611852
Alignment:
Q  111 tattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggta 210  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  29611987 tattatttttcctaaacatac-cctagttaa---tactaacttgtcttgaaatatgaaatgtcaaatttgatacacatacaaacaaaagataatttgata 29611892  T
Q  211 atattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  29611891 atattaacacacaaaatagacacattaattacactaacaa 29611852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26121453 - 26121327
Alignment:
Q  147 ctaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaata 246  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |     
T  26121453 ctaacttatcttgaaatatgaaaagtcaagtttaatacacatacaaacaaaggacaatttgataatattaacacacaaaacaaacacattaattacactg 26121354  T
Q  247 acaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||    
T  26121353 acaacttttcttaagaaatgtaaaaaa 26121327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48581494 - 48581313
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  48581494 aaattaatagataaatttattatt-tttttcctaaacatacctctaattagtactattaacttgtctggaaatatgaaaaatcaaatttaatacacataa 48581396  T
Q  191 aaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||  || || |||| |||||||||||||||||    
T  48581395 aaataaaggatagtttgttaatattaatacacaaaataaacacattaactacatcaataactttttttaagaaatgtgaaaaa 48581313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11344685 - 11344517
Alignment:
Q  140 aatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaat 239  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  11344685 aatactactgccttgtattgaaatataaaaaatcaaatttaatacacatacaaa-aaagaataatttggtaatgttaacacacaaaatagacacattaat 11344587  T
Q  240 tacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||  || || |||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||  ||||||| ||||||||    
T  11344586 tacaccaataacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaagggacttacattaagggacgaagggagta 11344517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28229317 - 28229205
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatatt 215  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28229317 ttttttctaaacatacccataattaatactactaacttgtcttaaaatattaaaagtcaaatttaatatacatacaaataaaggacaatttggtaatatt 28229218  T
Q  216 aacacacaaaata 228  Q
    || ||| ||||||    
T  28229217 aatacataaaata 28229205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 118 - 273
Target Start/End: Original strand, 41543563 - 41543718
Alignment:
Q  118 tttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaa 217  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||     
T  41543563 tttcctaaatatacgcctaattaatacaactatcttgtcttgaaatatgaaatgtcaaatttaatacacatacaaataaaagacaattttataatattat 41543662  T
Q  218 cacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||   |||| |||| |||||||||||||||||    
T  41543663 cacacaaaatagacacattaaatacacagacaactttttttaagaaatgtgaaaaa 41543718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11396918 - 11396804
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaata--ctactaacttgtcttgaaatatgtaa 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||    
T  11396918 taaatgtaaactccttttcaaattattagatgcatttattatt-tttttcctaaacatacacctaattaatatactactaacttatcttgaaatatgaaa 11396820  T
Q  170 agtcaaatttaataca 185  Q
    ||||||||||||||||    
T  11396819 agtcaaatttaataca 11396804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26999021 - 26998889
Alignment:
Q  142 tactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatta 241  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||    
T  26999021 tactactatcttctcttaaaatatgaaaaatcaaatttaatacacgtacaaacaaaagacaatttcgtaatattaacaaacaaaatagatacattaatta 26998922  T
Q  242 caataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26998921 taatgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 26998889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Original strand, 44698381 - 44698546
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||| ||||  ||||||||||  ||||    
T  44698381 tactccctccgcccttatatctaatcactcatttgactttatttttgtccttagatgtaaacccattttcaaattacaagatacatttattatt--tttt 44698478  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacat 188  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44698479 cttaaacattttcataattaatactactaatttatcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacat 44698546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 281
Target Start/End: Original strand, 54555896 - 54556043
Alignment:
Q  134 ataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacat 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  54555896 ataattaatactactaatttgtcttaaagtatgaaaagttaaaattaatatacatataaacaaatgataatttggtaaaattaacatataaaatagacat 54555995  T
Q  234 tttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagg 281  Q
     ||||||||| |||||   ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  54555996 attaattacactaacagcatttattaagaaatatgaaaaatgtaaagg 54556043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49000634 - 49000446
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattat-ttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatac 184  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||| | |||||||||||    
T  49000634 ttttcaaattaatagatgcatttattattatatttttctaaacacactcttaattaatactattaacttatcttaaaatataaaaaattaaatttaatac 49000535  T
Q  185 acatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||| ||||| |||| | |||| ||||| ||  ||||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  49000534 acataaaaacagaggacactttgataata-tattacacaaaatagacacattaattgcatcaacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 49000446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2421246 - 2421080
Alignment:
Q  105 atttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataat 204  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  2421246 atttattatt-tatttcctaaacatacctctaactaatactactaacttgtctttgaatataaaaagtcaaatttaatatacatacaaacaaatgacaat 2421148  T
Q  205 ttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |  ||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2421147 tttgtaatattaacacataagataga-aaattaattgtattaacaactttttttaagaaatgtgaaaaa 2421080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11345566 - 11345439
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttat--tattattt 118  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | || |||    
T  11345566 tactccctccgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgcccctaaatttaaaccccttttcaaattactagatgtatttataatttttttt 11345467  T
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatacta 146  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||    
T  11345466 ttcctaaacatacccctaataaatacta 11345439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31826409 - 31826242
Alignment:
Q  47 acccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatacta 146  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||    ||||| ||||||||||   ||||||||| ||    
T  31826409 acccatttaattttatttttatctctatatgtaaacccatttttaaattattagatacatttatt----ttttttctaaacataccattaattaatatta 31826314  T
Q  147 ctaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||    
T  31826313 ctaacttgtcttgcaatatacaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaagaacaattagataatattaac 31826242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 273
Target Start/End: Original strand, 54425929 - 54426067
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatt 234  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  54425929 taattaatactactaaccagacttaaaatatgaaaaattaaatttaatacacatataaacaaatgacaatttggtaatattaacacacaaaacagacaca 54426028  T
Q  235 ttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    | || |||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  54426029 tcaactacattgatattttttcttaagaaatgtgaaaaa 54426067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29645466 - 29645353
Alignment:
Q  160 aaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttctta 259  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||| ||||||  |||||||    
T  29645466 aaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgtaatattaacacataaaacagatacattaattacactaacaacatttctta 29645367  T
Q  260 agaaatgtgaaaaa 273  Q
    | ||||||||||||    
T  29645366 ataaatgtgaaaaa 29645353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26999292 - 26999167
Alignment:
Q  18 aactactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatt 117  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||    
T  26999292 aactactccatccgtctctatatctaaacatccatttgattttatttttgtcctcaaatgtaaacccctttttaaattattagatgcatttattat--tt 26999195  T
Q  118 tttcctaaacatactcataattaatact 145  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  26999194 tttcctaaacatacccctaattaatact 26999167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28243907 - 28243776
Alignment:
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| | |||||||||    
T  28243907 tcctaaatatacacatgattaatactactaacttatattgaaatataaaaagttaaatttaatacacacataaacaaaggacaatttgattatattaaca 28243808  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||| |||  ||||||||  |||||||    
T  28243807 cacaaaataaacacattaattaccttaacaat 28243776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26243593 - 26243467
Alignment:
Q  147 ctaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaata 246  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| |     
T  26243593 ctaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttaataacattaacacacaaaacaaacatattaattacactg 26243494  T
Q  247 acaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||  ||| |||| |||||| |||||    
T  26243493 acaaccttttttaaaaaatgtaaaaaa 26243467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 29645570 - 29645465
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29645570 tactccctccgtccttatatctaagcatttatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccacttttcaaattactagatgcatttattatttttttt 29645471  T
Q  121 cctaaa 126  Q
    ||||||    
T  29645470 cctaaa 29645465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 302
Target Start/End: Original strand, 31531448 - 31531565
Alignment:
Q  185 acatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaaggggg 284  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||    
T  31531448 acatacaaacaaaagacaatttgataatatcaacacacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaaaaggg 31531547  T
Q  285 tttacatacagggacgga 302  Q
     ||||||| |||||||||    
T  31531548 gttacatatagggacgga 31531565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 53716825 - 53716971
Alignment:
Q  18 aactactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatt 117  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| |  || ||| | ||||||||||||| ||||||||||  || ||| || |||||||||| ||||||||  |||    
T  53716825 aactactccatccgttcatatatctaagcctccatttaactttatttttgtccttaaatgtaaatcccctttcaatttactagatgcatttatta--att 53716922  T
Q  118 tttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatg 166  Q
    ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53716923 ttttctaaacatattcccaattaatactactaacttatcttgaaatatg 53716971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 383739 - 383614
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatt 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||     
T  383739 taattaatactactaacttgtattagaatgtgaaaagttaaattaaatacacatataaacaaatgataatttagtaaaattcacacacaaactagatata 383640  T
Q  235 ttaattacaataacaatttttcttaa 260  Q
    || | |||| || |||||||||||||    
T  383639 ttgactacactaccaatttttcttaa 383614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 309
Target Start/End: Original strand, 31650683 - 31650812
Alignment:
Q  180 aatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaa 279  Q
    |||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||    
T  31650683 aatatacatacaaataaatgacaatttggtaatattaccacataaaatagacacattaattgcattaacaattttttttaataaatgtgaaaaatgcaaa 31650782  T
Q  280 gggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||| | ||||||| | ||||| || |||||    
T  31650783 gggtgcttacatataaggacgaagagagta 31650812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21864415 - 21864294
Alignment:
Q  150 acttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataaca 249  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||| || |  ||    
T  21864415 acttatcttgaaatatgaaaattcaaatttaatatacatacaaa-aaaagacaatttggtaatattagcacataaaatagaca-cataattgcactgtca 21864318  T
Q  250 atttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  21864317 atttttcttgagaaatgtgaaaaa 21864294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39932007 - 39931921
Alignment:
Q  142 tactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaata 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||  |||||||||||||||    
T  39932007 tactactaacttgtcttaaaatatgaaaactaaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttaataaccttaacacacaaaata 39931921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48213753 - 48213620
Alignment:
Q  142 tactactaacttgtcttgaaatat--gtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaat 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |  || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  48213753 tactactaacttatcttgaaatataagagaaatcaaaattaatacacatacaaataaatgataataaggtaatattaacacacaaaataaacacattaat 48213654  T
Q  240 tacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |  | ||| || ||||||||| |||| |||||||    
T  48213653 tttattaataacttttcttaaaaaatatgaaaaa 48213620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23157152 - 23157051
Alignment:
Q  211 atattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  23157152 atattaactcacaaaacagacacattaattacactgacaatttttcttaagaaatgtgaacaaaacaaagggggttaacacaaggggacggagggagtat 23157053  T
Q  311 at 312  Q
    ||    
T  23157052 at 23157051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 48214367 - 48214307
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactac 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48214367 tttttaaattattagatgtatttattatt-tttttcctaaacatactcctaattaatactac 48214307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9178497 - 9178355
Alignment:
Q  76 tgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaa 175  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  | ||||||||  ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9178497 tgtaaacccctttttaaattactagatgcatttat--ttattttt--ttaacatacttctaattaatattattaacttgttttaaaatatgaaaagtcaa 9178402  T
Q  176 atttaatacac-atacaaacaaaggataatttggtaatattaacaca 221  Q
    |||  | | || ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||    
T  9178401 attatacatactatacaaataaaagataatttaataatattaacaca 9178355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 3475681 - 3475606
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttatt 111  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||    
T  3475681 tatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatataaacctctttttaacttactagatgcatttatt 3475606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11394005 - 11393917
Alignment:
Q  185 acatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||| ||| ||| || |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  11394005 acatataaataaatgacaatttgatagtattaacacacaaaatagacacattaattacactaacaactttttttaaaaaatgtgaaaaa 11393917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 11676056 - 11676131
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  11676056 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 11676131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 23241658 - 23241733
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  23241658 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaact-ttttttaaattac 23241733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 30464882 - 30464957
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  30464882 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 30464957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 33635190 - 33635115
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  33635190 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 33635115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 37599682 - 37599757
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  37599682 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 37599757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 188
Target Start/End: Original strand, 46202214 - 46202341
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtct 157  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |   ||||||   |||||||| |||| ||||   |||||||||||||||| || |||    
T  46202214 tttaattttgtctctaaatgtaaactcattttaaaattattaaaaacatttat---tatttttcttaaatatacatctaattaatactactaatttatct 46202310  T
Q  158 tgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacat 188  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  46202311 tgaaatttaaaaagtcaaatttaatacacat 46202341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 55257898 - 55257973
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  55257898 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaact-ttttttaaattac 55257973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12236402 - 12236276
Alignment:
Q  149 aacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataac 248  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||  |||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||   |||||| ||  ||||||||| ||||    
T  12236402 aacttgtctagaaatattaaaagtcgtatttaatacaaatacaaataaagaacaatttgataatattaacacgtgaaatagccacattaattacattaac 12236303  T
Q  249 aa--tttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||  ||||| |||||| ||||||||||    
T  12236302 aaatttttttttaagagatgtgaaaaa 12236276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23068086 - 23068032
Alignment:
Q  215 taacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23068086 taacacacaaaatagacacattaattacaataacaatttttcttaa-aaatgtgaa 23068032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44647909 - 44647806
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatt 234  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||   ||| |||||||||||     
T  44647909 taattaatactatcaacttgtattacaatatgaaaagtcaaattaaatacacatataaacaaatgacaatttagtaatattcgtacataaaatagacata 44647810  T
Q  235 ttaa 238  Q
    ||||    
T  44647809 ttaa 44647806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Original strand, 10259010 - 10259071
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaac 82  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10259010 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac 10259071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 11335458 - 11335533
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  11335458 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttggttttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 11335533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26725850 - 26725775
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  26725850 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttaattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 26725775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 33987033 - 33987108
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  33987033 tactctcttcgtccatatatttaaacatccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 33987108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47916371 - 47916208
Alignment:
Q  98 tagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaat-----actactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaa 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||     | ||||||||||| ||||||||   ||| || |||| |||||||||||||    
T  47916371 tagatgcatttattattatttttcttaaatatactcctacttaatgtagtattactaacttgtattgaaataaaaaaa-tcgaattaaatacacatacaa 47916273  T
Q  193 acaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttct 257  Q
    || || |||||||| || | ||| | ||||||| || |||| ||||||||| || ||| ||||||    
T  47916272 actaatgataatttagtcaaattcatacacaaactaaacatattaattacactatcaacttttct 47916208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 30476271 - 30476221
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccc 71  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30476271 tactccctccgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgtccc 30476221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 39851001 - 39850941
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaac 82  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39851001 tactctcttcgtccatatatttaac-acccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac 39850941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 274
Target Start/End: Original strand, 53717578 - 53717638
Alignment:
Q  214 ttaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53717578 ttaacacacaaaacagacacattaattacattgacaatatttcttaagaaatgtaaaaaag 53717638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 179
Target Start/End: Original strand, 31650549 - 31650655
Alignment:
Q  73 aaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacata-ctcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaag 171  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||  ||||||| || |||| | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  31650549 aaatataaacttcttttcaaattaatagatacatttattttttttttccttaaatatagctc-taattaatactactaacttatcttaagatatgaaaag 31650647  T
Q  172 tcaaattt 179  Q
    ||||||||    
T  31650648 tcaaattt 31650655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Original strand, 8325217 - 8325263
Alignment:
Q  160 aaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataattt 206  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8325217 aaatatgaaaattcaaatttaatacccatacaaacaaatgataattt 8325263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 120
Target Start/End: Original strand, 8818058 - 8818088
Alignment:
Q  90 taaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8818058 taaattactagatgtatttattattattttt 8818088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 39932114 - 39932021
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtctt 158  Q
    ||||| ||||||| ||||| | |||| ||| ||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||    
T  39932114 tttgttcctaaatataaacccattttcaaaatactaaatacatttattattgtttt-cctaaacatactcctatttaatactattaacttatctt 39932021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23071486 - 23071437
Alignment:
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23071486 acaaagtagacacattaattacaataacaatttttcttgaaaaatgtgaa 23071437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19839178 - 19838890
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19839178 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattatttt- 19839080  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19839079 cctaaacatacccctaattaatcctactaatttatcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacac 19838980  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    | ||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19838979 ataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaagggggattacatatagggacggagggagtat 19838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 31945771 - 31946037
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31945771 tactccctccgtccttatatgtaaccactcatttgattttatttttgtctctaaatgtaaacttcttttcaaattactagatgcatttattatt-ttttt 31945869  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31945870 cctaaacatatccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatataaacaaacgacaatttggtaatattaacac 31945969  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggttta 288  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  31945970 acaaaatagacacattaattacactaacaaattttcttaagaaatgtgaaaaaaggaaaggaggttta 31946037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1764061 - 1763776
Alignment:
Q  20 ctactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1764061 ctactccctccgtccctatatctaagcactcatttgattttatttttgtctctaaatataaacacctttccaaattattagatgcatttattattatttt 1763962  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1763961 -cctaaacatacccttaattaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaaca 1763863  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggaggga 306  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| | |||  | ||||||||  | |||||||||||    
T  1763862 cacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatatgaaaaaagcaaacagagtttacattaaaggacggaggga 1763776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31536242 - 31536007
Alignment:
Q  39 atgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataat 138  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  31536242 atgtaagcacccatttgattttatatttgtcactgaatgtaaaccccttttcaaattactagttgcatttattattttttttcctatacatacctataat 31536143  T
Q  139 taatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaa 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||| || ||||    
T  31536142 taatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaaagataatttgataatattaacaaataaaatagatatattaa 31536043  T
Q  239 ttacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31536042 ttacactaacaacttttcttaagaaatgtaaaaaag 31536007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11303104 - 11302850
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatg-tatttattattatttt 119  Q
    |||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||    
T  11303104 tactccctccgtccctatatctaagaacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaacttcttttcaaataactagatgctttttattattttttt 11303005  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11303004 tcttaaacatacccctaattaatactactattttgtcttgaaatgtgaaaagtcaaatttaatacacatgcaaacaaaggacaattttgtaatattaaca 11302905  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    || |||| |||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11302904 caaaaaacagacacattaattatactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 11302850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 30465858 - 30466078
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  30465858 tttgactttatttttgttcataaatgtaaacttcttttcaaattactagatgcatttattatt-tttttcctaaacatccccttaattaatactactaac 30465956  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||   ||||     
T  30465957 ttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttggtaatattaacacacaaaacaaacatattaattacaccgacaac 30466056  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  30466057 ttttgttaagaaatgtaaaaaa 30466078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 58 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15982004 - 15981754
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtct 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  15982004 tttatttttgtccctaaatgtaaaccttttttcaaattactagatgcatttattat-attttttcaaaacatacctataattaatactattaacttgtct 15981906  T
Q  158 tgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttct 257  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||| ||||||    
T  15981905 tgaaatatgaaaagttaaatttaagacacatacaaactaatgacaatttggtaatattaacacacaaaacagacacattaattacaccaacaacttttct 15981806  T
Q  258 taagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | || |||| ||| ||||||||||||    
T  15981805 taagaaatgtgaaaaatacaaagggagcttgcatataggaacggagggagta 15981754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16327334 - 16327083
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactac-taacttgtc 156  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||    
T  16327334 tttatttttgtctctaaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattat-atttttcctaaacatacctctaattaatactaaataacttgtc 16327236  T
Q  157 ttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttc 256  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | | |||| |||||    
T  16327235 ttgaaatatgaaaagttaaatttaatacaaatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacacacaaaacagacacattaattatattgacaacttttc 16327136  T
Q  257 ttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  16327135 ttaagaaatgtgaaaaatacaaaggaggcttacatataggaacgcagggagta 16327083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 273
Target Start/End: Original strand, 34513115 - 34513328
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtct 157  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  34513115 tttatttttgttcctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattttttt--ctaaacatacccctaattattactactatcttgtct 34513212  T
Q  158 tgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttct 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||   | |||| ||||||    
T  34513213 tgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttcgtaatattaacacacaaaacagacacattatttatgctgacaaattttct 34513312  T
Q  258 taagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||| |||||| |||||    
T  34513313 taaaaaatgtaaaaaa 34513328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 28238190 - 28238422
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttt-aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactca 134  Q
    ||||| ||| || |||||||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |     
T  28238190 tatatctaagcatccgtttgattttcttt--gtccttaaatgtaaa-tcctttttcaaattactagatgcatttattatt--ttttcctaaacatacccc 28238284  T
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaa-gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  28238285 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaagtcaaatttaataaacataaaaacaatggataatatggtaatattaacacacaaaatagacac 28238384  T
Q  234 tttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaa 271  Q
     ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28238385 attaattatactaacaatttttattaagaaatgtgaaa 28238422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Original strand, 22410719 - 22410988
Alignment:
Q  39 atgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattacta-gatgtatttattattatttttcctaaacatactcataa 137  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  22410719 atgtagccacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaa-tcctttttcaaataataagatgcatttattatt-tttttcctaagcatacccttaa 22410816  T
Q  138 ttaatactactaacttgtctt-gaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatttt 236  Q
    ||||||||||| | ||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||| |||||  ||    
T  22410817 ttaatactacttatttgtctttgtaatttgaaaggtcaaatttaatacacatacaaataaaagacaatttggtaatattaacataaaaaacagacacatt 22410916  T
Q  237 aattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  22410917 aattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagtaaa-ggggtttacatataaggatggagggagta 22410988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6791613 - 6791338
Alignment:
Q  31 gtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacata 130  Q
    |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6791613 gtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgtctttaaatgtaaaccccttttcaacttactagatgcatttattatt-tttttcctaaacata 6791515  T
Q  131 ctcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaataga 230  Q
    ||| || ||||||| | || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| | |    
T  6791514 ctcctagttaatacaattatcttgtcttgaaatttaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttaataatattaacacacaaaacaca 6791415  T
Q  231 cattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||  ||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||  |||| ||||||||||    
T  6791414 ca--ttaattacattgacaactttttttaagaaatgtgaaaaaagcaaaaggggctaacataaggggatggagggagta 6791338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16350732 - 16350481
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactac-taacttgtc 156  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||    
T  16350732 tttatttttgtctctaaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattat-atttttcctaaacatacctctaattaatactaaataacttgtc 16350634  T
Q  157 ttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttc 256  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||| ||||     
T  16350633 ttgaaatatgaaaagttaaatttaatacaaatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacacacaaaacagactcattaattacactgacaactttta 16350534  T
Q  257 ttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||| ||||||||||||   ||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  16350533 ttaaaaaatgtgaaaaatacaaaggaggcttacatataggaacgcagggagta 16350481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 279
Target Start/End: Original strand, 12514489 - 12514701
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt--cctaaacatactcataattaatacta---ctaacttgtcttgaaatatg 166  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||| | ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  12514489 taaatataaacttcttttcaaattactagatgcatttattatttttgttaccctaaacatacccctaattaataatagcactaacttgtcttgaaatatg 12514588  T
Q  167 taaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatg 266  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||| | |||    
T  12514589 aaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattgcactaacaatttttcttaaaatatg 12514688  T
Q  267 tgaaaaaggtaaa 279  Q
    ||||||| |||||    
T  12514689 tgaaaaatgtaaa 12514701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9461503 - 9461288
Alignment:
Q  58 tttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtct 157  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  9461503 tttatttttgtccttaaatgtaaaccctctttcaaattattagatgcatttattattttttttc-taaacatacccataattaattctactaacctgtct 9461405  T
Q  158 tgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttct 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||  |||||||||   ||||  |||||    
T  9461404 tgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagaataatttagtaatattaacacataaaacaaacacattaattacaccgacaacatttct 9461305  T
Q  258 taagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||| |||||||||||||    
T  9461304 taataaatgtgaaaaag 9461288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 312
Target Start/End: Original strand, 3887866 - 3888091
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaag-tcaaatttaatac 184  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  3887866 ttttcaaattattagatgcatttattatt-tttttcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaaatcaaatttaatac 3887964  T
Q  185 acatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaaggggg 284  Q
    ||||  ||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| || |    
T  3887965 acatgtaaacataagacaatttg-taatattaacacacaaaatagacacattaactgcaataacaacttttcttaagaaatgtgaaaattgcaaaaggtg 3888063  T
Q  285 tttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3888064 cttacatacaaggacggagggagtatat 3888091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5895921 - 5895726
Alignment:
Q  78 taaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaat 177  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || | | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5895921 taaaccccttttcaaattactagatgcatttattaat-tttttcctaaatatgcccctaattaataccactatcttgtcttgaaatatgaaaagttaaat 5895823  T
Q  178 ttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5895822 ttaatacacataaaaataaaggacaatttcgtaatattaatacacaaaacagacacattaattacattaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 5895726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16186796 - 16186529
Alignment:
Q  42 taaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaa 141  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||    
T  16186796 taaccacccatttgattttacttttgtccttaaatataaaccctttttcaaattactagatgcatttattttattttttcctaaacatacac-taattaa 16186698  T
Q  142 tactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatta 241  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||| |||||| |||||  |||||||    
T  16186697 taccactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaat--acatacaaacaagggacaatttcgtaa-attaacatacaaaacagacacattaatta 16186601  T
Q  242 caataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatata 313  Q
    || ||| || ||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |  |||||  ||||| |||||||| |||||    
T  16186600 cactaataacttttcttacaaaatgtgaaaaagataatgggtggctacattaagggatggagggaggatata 16186529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33607556 - 33607369
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaata 164  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  33607556 ttgtccctaaatataaacactttttcaaattactagatgcatttattttt---tttcctaaacatacccctaattaatactgctaacttatcatgaaata 33607460  T
Q  165 tgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaattttt 255  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  33607459 tgaaaagtcaaatttaacacacatacaaacaaaggataatttgataatattaacacactaaatagacacattaattgcattaacaattttt 33607369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31780330 - 31780079
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaat 163  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||     
T  31780330 tttgtctctaaatataaactccatttcaaattactagatagatttattattattattcctaaacataccccttattaatactattaacttgtcttgaaaa 31780231  T
Q  164 atg-taaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaaga 262  Q
    |||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||||| || || ||| |||| ||||||    
T  31780230 atgaaaaagtgaaatttaatacacaaacaaacaaaggacaatttagtaatatcaacatacaaaatagacacattaattgcattatcaacttttattaaga 31780131  T
Q  263 aatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatataa 314  Q
    ||| |||||||   ||| || | ||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  31780130 aatatgaaaaatacaaatggtgcttacatatagggacggagagagcatataa 31780079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3729653 - 3729485
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcat 135  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||  || |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |    
T  3729653 tatatgtgatcacccatttgattttatttttatctttatatgtaatcttctttttaaattattagatgcatttattattttttt--ctaaacatactcct 3729556  T
Q  136 aattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataattt 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3729555 aattaatattactaacttgtcttgaaatatgtaaagttaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattt 3729485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 452 - 577
Target Start/End: Original strand, 20643408 - 20643533
Alignment:
Q  452 gaatgcaaatccagactaacataaagtaaagacacttttcaactttcaaacatatctctataaacaatctccataaattgtggaagacaccttgatttaa 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |    
T  20643408 gaatgcaaatgcagactaacataaagtaaaaacacttttcaactttcaaacatatctctataaacaatctccataaatagtggaagacgccttgctttga 20643507  T
Q  552 agcattggtgtcaagctgcatctgtg 577  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||    
T  20643508 agcattggtgtccaactgcatttgtg 20643533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 270
Target Start/End: Original strand, 197339 - 197558
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttatta-ttatttttcctaaacatactcataattaatactactaa 150  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||    
T  197339 tttgactttatttttgtccttaaatgtaaacttctttttaaattactagatgcctttattatttatttttcttaaatatacctctaattaatactactaa 197438  T
Q  151 cttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    |||||||| ||||    ||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||| | |||  ||||||| | | | ||    
T  197439 cttgtcttaaaattgaaaaaattaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttaataatattgacacacaaaacaaacacattaattatactgataa 197538  T
Q  251 tttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
     |||||||||||||||||||    
T  197539 cttttcttaagaaatgtgaa 197558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30249093 - 30248946
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcat 135  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| | |    
T  30249093 tatatctaagcacccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaacctattttcaaattactagatccatttattatt--ttttcctaaacatacccct 30248996  T
Q  136 aattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30248995 aattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaataca 30248946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 308 - 420
Target Start/End: Original strand, 20643288 - 20643400
Alignment:
Q  308 tatataataattcctattatccgagagaatgttgaattatttgtcattgtgtcagctgatttgctttgcatttaatgcttgatgataagtgagacttaaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20643288 tatataataattcctattatcgcatagaatgttgaattatttgccattatgacagcaggtttgctttgcatttaatgcttgatgataagtgagacttaaa 20643387  T
Q  408 agctatttgtttt 420  Q
    |||||||| ||||    
T  20643388 agctatttttttt 20643400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3729484 - 3729349
Alignment:
Q  174 aaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgt--gaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||    
T  3729484 aaatttaatacacatacaaacaaagaacaatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattacaccaacaatttttcttaagaaatgtaaaaaa 3729385  T
Q  272 aaggtaaagggggtttacatacagggacggagggag 307  Q
    |||| |||| ||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  3729384 aaggcaaagagggtttatatataaggacggaaggag 3729349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 157 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9428279 - 9428127
Alignment:
Q  157 ttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttc 256  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | || ||| |||||    
T  9428279 ttgaaatatgaaaagtaaaattcaatatacatacaaacaaatgataatttgataatattaacacacaaaatagatacattaattatagtagcaacttttc 9428180  T
Q  257 ttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| || |||||| || |||||||||||||    
T  9428179 ttaagaaacgtgaaaaaaataaagggagtctacatatagagacggagggagta 9428127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 273
Target Start/End: Original strand, 10669268 - 10669384
Alignment:
Q  157 ttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttc 256  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||     
T  10669268 ttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacagatacaatcaaagaacaatttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattgcactaacaatttttt 10669367  T
Q  257 ttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    | || |||||| |||||    
T  10669368 taaaaaaatgtaaaaaa 10669384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 312
Target Start/End: Original strand, 8644702 - 8644945
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcct--aaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaa 169  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||  |  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||    
T  8644702 taaatataaacctcttttaaaattactagatgcatttattgtttttttttttttaaacatacccctaattaatactactaaattgtcttaaaatgagaaa 8644801  T
Q  170 agtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttgg---taatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatg 266  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||  || |||||||||   ||||||||||| |||||||||| || ||||||    |||||| |||| ||||||||||    
T  8644802 attcaaatttagtacaaatacaaac--agaataatttggtaataatattaacatacaaaatagatatattaattgtgctaacaactttttttaagaaatg 8644899  T
Q  267 tgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    ||||||| ||||| | |  ||||||  | |||||||||||||||||    
T  8644900 tgaaaaatgtaaaagagacttacatttaaggacggagggagtatat 8644945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Original strand, 31486964 - 31487111
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatac--tactaacttgtcttgaa 161  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||   || | |||| |||||||    
T  31486964 tttgtccttaaatgtaaatccttttttaaattactagatacatttattatt-tctttcctaaacatactcctagttaatatattatttacttatcttgaa 31487062  T
Q  162 atatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggta 210  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31487063 atatgaaaagtcaaacttaatacacatacaaacaaaagacaatttggta 31487111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 10260462 - 10260617
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttatta-ttatttt 119  Q
    ||||||||||||   ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||   |||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  10260462 tactccctccgttgctatatttaaacacccatttgattttatttttgtttttaaatgtaaattttttttcaaattactagatgcatttactatttttttt 10260561  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaa 176  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10260562 tcctaagcatacccctaattaatact-ctaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaa 10260617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20523103 - 20522976
Alignment:
Q  138 ttaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatttta 237  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| || ||   |||    
T  20523103 ttaatgctaataacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaagaaataatttggtaatattgacacacaaactaaactcatta 20523004  T
Q  238 attacaataacaatttttcttaagaaat 265  Q
    ||| || ||||||  |||||||||||||    
T  20523003 attgcactaacaacatttcttaagaaat 20522976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 272
Target Start/End: Original strand, 5084530 - 5084650
Alignment:
Q  155 tcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagaca----ttttaattacaataacaa 250  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||    | ||||||||| ||||||    
T  5084530 tcttgaaatataaaaagtcaacttta-tacacatacaaacaaaggacaatttgataatattaacacacaaaacaaacacatttattaattacactaacaa 5084628  T
Q  251 tttttcttaagaaatgtgaaaa 272  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  5084629 cttttcttaagaaatgtgaaaa 5084650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 206
Target Start/End: Original strand, 12503518 - 12503656
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcc-taaacatactcataattaatacta---ctaacttgtcttgaaatatgt 167  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||| || ||||||||| | ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||     
T  12503518 taaatataaacttcttttcaaattactggatgcattaattatttttttaccctaaacatacccctaattaataatagtactaacttgtcttgaaatatga 12503617  T
Q  168 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataattt 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  12503618 aaagtcaaatttactacacatacaaacaaaagacaattt 12503656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31039320 - 31039191
Alignment:
Q  95 tactagatgtatttatt-attatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31039320 tactagatgtatttatttactgtttttc-taaagatacccctaatcaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaattaaatgcacatacaaa 31039222  T
Q  194 caaaggataatttggtaatattaacacacaa 224  Q
    |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||    
T  31039221 caaatgataaattaataaaatttacacacaa 31039191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 273
Target Start/End: Original strand, 1514233 - 1514337
Alignment:
Q  168 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||  |||||||| |||| |    
T  1514233 aaagtcaaatttaatacacatataaacaattgataatttggtaatattaacatacaaaataaacatattaattgcactaacaa-ctttcttaaaaaatat 1514331  T
Q  268 gaaaaa 273  Q
    ||||||    
T  1514332 gaaaaa 1514337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11081974 - 11081891
Alignment:
Q  191 aaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11081974 aaacaaaggataatttggtaacattaatacagaaaatagatatattaattacactaacaacttttcttaagatatgtgaaaaag 11081891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 241
Target Start/End: Original strand, 31152960 - 31153066
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatt 234  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||| | ||||||||||      
T  31152960 taattaatattattaacttgttttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaataacaatttagtaatattgacatataaaatagacaca 31153059  T
Q  235 ttaatta 241  Q
    |||||||    
T  31153060 ttaatta 31153066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7365668 - 7365526
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||||| | | |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  7365668 ttttcaaattattagatatatttattatt-ttcttcataaacatcccc-taattaatactattaacttattttgaaatatgaaaaatcaaatataataca 7365571  T
Q  186 catacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaataga 230  Q
     ||||||| ||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  7365570 aatacaaataaatgataatttagtaatatgcaaacacaaaataga 7365526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Original strand, 12514740 - 12514824
Alignment:
Q  148 taacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagaca 232  Q
    |||||| |||| ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12514740 taacttatcttcaaatatgaaaggtcatatttaatacacatataaacaaatgataatttggtaatattaacatacaaaatggaca 12514824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5457400 - 5457238
Alignment:
Q  53 ttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaact 152  Q
    |||| ||||||||| || |||||| ||||  | |||| |||||| |||||| ||||||| ||   |  |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5457400 ttgactttatttttatctctaaatataaatccattttcaaattattagatgcatttattttt---tcccctaaacatacctctaattaatactactaact 5457304  T
Q  153 tgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    ||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  5457303 tgttttgaaatttaaaaaatcaaatttaatacatttacaaacaaagaacaatttgataatattaac 5457238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 274
Target Start/End: Original strand, 4250690 - 4250769
Alignment:
Q  195 aaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4250690 aaaggacaacttcgtaatattaacacacaaaacagacacattaattacactgacaatttttcttaagaaatgtaaaaaag 4250769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9941169 - 9941031
Alignment:
Q  122 ctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacaca 221  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| | | ||| |||| ||| | |||    
T  9941169 ctaaacatacctttaattaatactattaacttgtctttaaatatgaaaagtcaaattaaatacacttgcaaacaaagaacagtttagtaaaattcaaaca 9941070  T
Q  222 caaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaa 260  Q
    |||| |||| |  |||| |||| || ||| |||||||||    
T  9941069 caaattagatacattaactacattatcaacttttcttaa 9941031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 24067993 - 24068068
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  24067993 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 24068068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5191329 - 5191241
Alignment:
Q  93 attactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  5191329 attattagatatgtttattattttttttc--aaacataatcctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaattcaaattaaata 5191241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11082199 - 11082152
Alignment:
Q  141 atactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacat 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11082199 atactactaacttgtcttgaaatatgaaaattcaaatttaatacacat 11082152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6419022 - 6418956
Alignment:
Q  149 aacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatatt 215  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  6419022 aacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatgtaatacaaatacaaacaaagaaaaatttgataatatt 6418956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6419245 - 6419154
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatat 165  Q
    ||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6419245 taaatataaacctctttttaaattattagatgcatgaatt--tatttttcctaaacatactcttatttaatactattaacttatcttgaaatat 6419154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30248645 - 30248563
Alignment:
Q  187 atacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  30248645 atacaaacaaatgccaatttggtaatattaacacacaaaacaaacacattaa-tacacttacaacttttcttaagaaatgtgaa 30248563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Original strand, 22351048 - 22351109
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaac 82  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22351048 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttaattttatttttgtccttaaatgtaaac 22351109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 185
Target Start/End: Original strand, 7595548 - 7595616
Alignment:
Q  117 ttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    ||||| |||| |||| | ||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7595548 ttttcttaaaaatacccttaattgatactaaaaatttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaataca 7595616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 273
Target Start/End: Original strand, 10260619 - 10260698
Alignment:
Q  195 aaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa-tttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  10260619 aaagaataatttagtaatattaatacataaaatagatacgttaattacattaacaatttttttttaagaaatgtaaaaaa 10260698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 27442634 - 27442561
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27442634 tactccctccatccctatatgtaacca-cattttgtttttatttttgt-cctaaatgtaaac-ccttttcaaattac 27442561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 30269890 - 30269815
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||    
T  30269890 tactctcttcgtccatatatttaaacaccaatttgattttatttttgtttttaaatgtaaac-cttttttaaattac 30269815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1091 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1091
Description:

Target: scaffold1091; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 1771 - 2058
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  1771 tactccctccatccctatatctaagcacccatttgactttatttttgtccctcaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattatg-ttttt 1869  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1870 cctaaacatacccctaattaatactactaatttgtcttgcaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 1969  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  1970 acaaaatagacacattaattacactaacaacttatcttaagaaatgtgaaaaaagcaaagggaggttacatacagggacagagggagta 2058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 163; Significance: 9e-87; HSPs: 89)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 4089359 - 4089610
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  4089359 tactccctccgtccctatatctaaacacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactctttttaaaattactagatgcatttattatt--tttt 4089456  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4089457 cctaaacatacccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatacaaacaaaagataatttcgtaatattaacac 4089556  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4089557 acaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 4089610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 19235923 - 19236214
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttatt-attatttt 119  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||    
T  19235923 tacttcctccgtccctatatctaagcactcatttgactttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttatttatttattt 19236022  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  19236023 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaagaacaatatggtaatattaaca 19236122  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
     ||||||  ||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  19236123 tacaaaaccgacacattaattacactaacaacttttcttacgaaatgtgaaaaatgaaaaaaggg-ttacatttagggatggagggagtatat 19236214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26633088 - 26632842
Alignment:
Q  26 cctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaa 125  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  26633088 cctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtagacttcttttcaaattactagatgcatttattattacttt-cctaa 26632990  T
Q  126 acatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaa 225  Q
    |||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  26632989 acatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatgcacatacaaacaaaagataatttagtaatattaacacataaa 26632890  T
Q  226 atagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26632889 atagacacattaactacactaacaatttttcttaaaaaatgtgaaaaa 26632842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 18121902 - 18122152
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  18121902 tactccctccgtccctatatgtaagcacgcatttgactttatttttgtccctaaatgtaaac-cctttttaaattactagatgcatttattatt--tttt 18121998  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18121999 cctaaacatacgtctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaattttatacacattcaaacaaaggaaaatttagtaatattaacac 18122098  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    | |||| |||||   |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18122099 ataaaacagacacactaattacactcacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 18122152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21388482 - 21388202
Alignment:
Q  28 tccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaac 127  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21388482 tccgtccctatatttaagcacccatttgattttatttttgtctctaaatgtaaacccctttccaaattactagatgcatttattatt-tttttcctaaac 21388384  T
Q  128 atactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaat 227  Q
    ||||   ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  21388383 ataccattaattaatactactaacttatcttaaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacacacaaaac 21388284  T
Q  228 agacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||  |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  21388283 agacacattaattacaccgacaaattttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaagagagtttaaattaagggacggaggaagta 21388202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1324954 - 1324702
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  1324954 tactccctctgtccctatatctaagcccccattttattttatttttgtccctaaatgtaaaccccctttcaaattactagatgaatttattatt--tttt 1324857  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  1324856 cctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgataagattaacac 1324757  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||    
T  1324756 acaaaacagacacattaattacactgataacatttcttaagaaatgtgaaaaagg 1324702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37673958 - 37673732
Alignment:
Q  47 acccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatacta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||||| ||    
T  37673958 acccgtttgattttatttttgtctctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattatt-tttttcttaaacatgcccctaattaatatta 37673860  T
Q  147 ctaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaata 246  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |     
T  37673859 ttatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttcataatattaacacacaaaacagacacattaattacactc 37673760  T
Q  247 acaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37673759 acaacatttcttaagaaatgtgaaaaag 37673732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 2276437 - 2276722
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||   |||| || || ||       
T  2276437 tactccctccgtccctatatataagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaatcgcttttcaaattactagacacatttttttttctt--- 2276533  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2276534 cctaaacatacccttaattaatactagtaacttatcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggtaatattaacac 2276633  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||| |||||  |||| |||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  2276634 acaaaacagacaaattaactacactgacaacttttgttaagaaatgtgaaaaatgtaaaaggagtttacattaagggacggagggagta 2276722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10685331 - 10685081
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  10685331 tactccctccgtccttatatctaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattattttttt- 10685233  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
     |||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10685232 -ctaaacgtacccataattaatattactattttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaacac 10685134  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    | |||| |||||  ||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||    
T  10685133 ataaaacagacacattaattacactgataacttttcttaagaaatatgaaaaa 10685081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48767812 - 48767560
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  48767812 tactccctccgtccctatatctaagcccccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccctttcaaattactagatgcatttatttat-ttttt 48767714  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac-aaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48767713 cctaaacatacccctaattaatactaataacatgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaaacaaaggacaatttcgtaatattaaca 48767614  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  48767613 cacaaaacagacacattaattacactgacaacgttttttaagaaatgtgaaaaa 48767560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35128634 - 35128381
Alignment:
Q  19 actactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattt 118  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  35128634 actactccctccattcttatatttaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattatttttt 35128535  T
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  35128534 ttcttaaacatacccctaattaatactatcatcttgtcttgaaatatgaaaattcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcataatattaac 35128435  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  35128434 acacaaaacagacatattaattacactgacaacttttctta--aaatgtgaaaaag 35128381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 40741154 - 40740911
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaata 164  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40741154 ttgttcctaaatataaaccccttttaaaattactagacgcatttattatt--ttttcctaaacatacccctaattaatactgctaacttatcttgaaata 40741057  T
Q  165 tgtaaagtcaaatttaatacacata--caaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaaga 262  Q
    || |||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  40741056 tgaaaagtcaaatttaacacacatatacaaagaaatgataatttggtaatattaacacacaaaatagacatattaattacattaacaacttttcttaaga 40740957  T
Q  263 aatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  40740956 aatgtgaaaaagataaaagggg-ttatatatagggacggagggagta 40740911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Original strand, 37491478 - 37491760
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||  |||||    
T  37491478 tactccctccgtccatatatctaagcatctatttgactttatttttatccttaaatgtaaactc-tttttaaattaacagatacatttattatg-ttttt 37491575  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37491576 cctaaacatacccctaattaatattacaaatttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatacaaacaaaggataatttggtaatattaacat 37491675  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggaggg 305  Q
    | ||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||| ||| ||||||||    
T  37491676 ataaaatagacacattaattgcactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagtaaagagaacttacatataggaacggaggg 37491760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20123692 - 20123409
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||| ||      |||    
T  20123692 tactccctccgtcccttaatgtagccacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaacccctttc-aaattacaagatgcatttttt------ttt 20123600  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtctt-gaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    ||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20123599 cctaagcatatacttaattaatactaataacttgtctttgaaatttgaaaattcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttgataatattaaca 20123500  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20123499 cacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaagggagtttacatatagggacggaggaagtat 20123409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 310
Target Start/End: Original strand, 29635901 - 29636186
Alignment:
Q  23 ctccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcc 122  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  29635901 ctccctctgtccttatatctaagcacccatgtgactttatttttgtccctaaatgtaaatccattttcaaattattagatgcatttattatt-tttttcc 29635999  T
Q  123 taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacac 222  Q
    |||||| |  | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29636000 taaacagatccctaagtagtactactaacttgtcttgaaatatgaaaaattaaattaaatacacataaaaacaaaggc-aatttggtaatattaacacac 29636098  T
Q  223 aaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29636099 aaaacagacacattaattacattgacaacttttcttaaaaaatgtgtaaaatgcaaagggggtttacatatagggacggagggagtat 29636186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 309
Target Start/End: Original strand, 6376021 - 6376273
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaa- 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||     
T  6376021 tttgattttatttttgtccctaactctaaatttttttttaaattattagatgtatttattatt-tttttcctaaacatactcctaattaataatattaaa 6376119  T
Q  151 cttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa 250  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||    
T  6376120 cttgtcttaaaatttgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagtaatattaacacacaaaacagagacattaattacactaacaa 6376219  T
Q  251 tttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||     ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6376220 tttttcttaagaaatgtgaaaaaagt-----gggcttacatatagggacggagggagta 6376273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 48193779 - 48193575
Alignment:
Q  105 atttattattatttttcctaaacatactca-taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataa 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  48193779 atttattatt-tttttcctaaacataccccctaattaatacaactaatttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatactaatataaacaaaggataa 48193681  T
Q  204 tttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggag 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  48193680 tttggtaatattaacacacaaaatagacacattaattacactaacaatttttcttaaaaaatgtgaaaaatgcaaagggggcttacatacatggacggag 48193581  T
Q  304 ggagta 309  Q
    | ||||    
T  48193580 gtagta 48193575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 56 - 310
Target Start/End: Original strand, 21809541 - 21809793
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgt 155  Q
    |||||||||||||| | |||| | || || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21809541 attttatttttgtctccaaatattaa-tcttttctaaattactagatgcatttatt-ttatttttcttaaacatacccctaattaatactactaacttgt 21809638  T
Q  156 cttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaattttt 255  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||||||   |||| ||||    
T  21809639 tttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacacaaaaaacagacacattaattacatcgacaactttt 21809738  T
Q  256 cttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  21809739 cttaagaaatgtgaaaaatacaaaagggacttacatacaaggacagagggagtat 21809793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 273
Target Start/End: Original strand, 46783706 - 46783950
Alignment:
Q  27 ctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaa 126  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  |||||||||  |||||| ||||    
T  46783706 ctccgtccatatatctaaacacccattgaactttgtttttgtccctaaatgtaaactccatttcaacttactagatacatttattatgttttttc-taaa 46783804  T
Q  127 catactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaa 226  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  46783805 catgctc-taattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacgaacaaaagacaatttggtaatattaacacataaga 46783903  T
Q  227 tagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||  |||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  46783904 tagacacattaatttcactaataacttttcttaagaaatgtgaaaaa 46783950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49100919 - 49100630
Alignment:
Q  24 tccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcc-tttttaaattactagatgtatttattattattttt-- 120  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||      
T  49100919 tcccttcgtccatatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaattgtaaaccccctttttaaattactatatgcatttatttttattttttt 49100820  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||| || ||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49100819 cctaaacatacccctaattaatattattattttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgtaatattaacac 49100720  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    | |||| |||||  ||||||||| | |||| || | |||||| ||| |||||||| || ||| |  |||||  |||||| ||||||||||    
T  49100719 ataaaacagacacattaattacactgacaacttattttaagagatgcgaaaaaggcaatgggtggctacattaagggacagagggagtat 49100630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23876241 - 23875994
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaat 163  Q
    ||||||| ||||| |||  | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  23876241 tttgtccataaatataagtttctttttaaattattagatgcatttattattatttt-cctaaacataccactaattaatcatactaatttgtcttgaaat 23876143  T
Q  164 atgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaa 263  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  23876142 acgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttagtaatattaacacataaaatggacatattaactacactaacaactttttttaagaa 23876043  T
Q  264 atgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23876042 atgtgaaaaaagcaaagggaatttacatatagggacggagggagtatat 23875994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Original strand, 36726030 - 36726284
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt- 119  Q
    |||||| ||| ||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  36726030 tactccatccatccctatatctaagcccccatttgattttatttttgtctctaaatgtaaacccactttcaaattactagatgcatttattatttttttt 36726129  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36726130 tcctaaacttacccctaattaatactaccaacttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacata-aaacaaaggacaatttggtaatattaaca 36726228  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaagg 275  Q
    ||||||| | |||  ||||||||| ||||||  | |||||||| ||| ||||||||    
T  36726229 cacaaaacaaacacattaattacactaacaacatctcttaagagatgcgaaaaagg 36726284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 48610027 - 48610245
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||  | |||||||||| |||| |    
T  48610027 tttgattttatttttgtctttaaatgtaaa-tccttttcaaattactagatgcatttattattttttt--ctaaacatatccctaattaataccactatc 48610123  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| | ||||     
T  48610124 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttcgtaatattaatacacaaaacagacacattaattacagtgacaac 48610223  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  48610224 ttttcttaaaaaatgtgaaaaa 48610245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40263926 - 40263706
Alignment:
Q  54 tgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaactt 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||    
T  40263926 tgattttatttttatccctaaatgcaaatcactttttaaattattagatatatttattattttttttcataaacatagccctaattaatactactatctt 40263827  T
Q  154 gtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaattt 253  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||   |||| ||    
T  40263826 atcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgtaatattaacaatcaaaacagacacattaattacaccgacaactt 40263727  T
Q  254 ttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  40263726 ttcttaaaaaatgtgaaaaag 40263706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 292
Target Start/End: Original strand, 42983479 - 42983744
Alignment:
Q  28 tccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaac 127  Q
    ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42983479 tccgtccatatatctaagcatcaatttgattttatttttgtctttaaatataaactcattttcaaattgttagatctatttattattatttt-cctaaac 42983577  T
Q  128 atactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaat 227  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  ||||||||||| | ||||     
T  42983578 ataccattaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacataagacaatttaataatattaacatataaaag 42983677  T
Q  228 agacattttaattacaataacaa--tttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacata 292  Q
    |||||  |||||||||  | |||  ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  42983678 agacacattaattacaccatcaacttttttctcaagaaacgtgaaaaatgtaaaaggggcttacata 42983744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27213665 - 27213483
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  27213665 aaattactagatgcatttattattttttttcttaagaatactcctaataaatactattaacttgtcttgaaatatgaaatgtcaattttaatagacatac 27213566  T
Q  191 aaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27213565 aaacaaaggacaatttagtaatattaacacacaaaatagacatattagttgcactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 27213483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27170213 - 27170008
Alignment:
Q  65 ttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaata 164  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27170213 ttgtccctaaatataaactcatctttaaatgactagatgtatttattatt--ttttcataaacatactcataattaatactattaatttgtcttgaaata 27170116  T
Q  165 tgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaa 264  Q
    || |||||||||||||||| |||||  ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| || |||||  || ||||||||||    
T  27170115 tgaaaagtcaaatttaatagacatatgaacaaatcacaatttggtaatatt-acacacaaaatagacaaattaattgcactaacatgttgtcttaagaaa 27170017  T
Q  265 tgtgaaaaa 273  Q
    |||||||||    
T  27170016 tgtgaaaaa 27170008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37048277 - 37047996
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| || || |||      
T  37048277 tactccctccgtcc-tatatctaaacacctatttgactttatttttgtca-taaatgttaacttcttttcaaattactagatgcatttttttttcttt-- 37048182  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
     |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  37048181 -ctaaacataccc-taattaatactactaacttgtattgaaatatgaatagttaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttgggaacattaacac 37048084  T
Q  221 acaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  37048083 acaaaacagacacattaattacactgataacttttcttaagaaatgtgaaaaa-ataaa-ggggttcacattgaaggacggagggagtat 37047996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 273
Target Start/End: Original strand, 21800950 - 21801165
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| || |    
T  21800950 attttatttttgtctctaaatataaa-tcttttctaaattactagatgcatttaatattatttt-cttaaacatactcctaattaatactattaatttat 21801047  T
Q  156 cttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaattttt 255  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||   |||| ||||    
T  21801048 tttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaatgacaatttagtaatattaacacacaaaacagacacattaattacatcgacaactttt 21801147  T
Q  256 cttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21801148 cttaagaaatgtgaaaaa 21801165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28663936 - 28663713
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  28663936 tttttaaattactagatgcatttatgatt--ttttcctaaacatacccctaattaatactactaatttatcttgaaatatgagaagtcaaatttaatata 28663839  T
Q  186 catacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggt 285  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||    ||  |||     
T  28663838 catacaaacaaataataatttgataatattaacacacaaaatagacacattaattgtattaacaa-ctttcttaagaaatgtgaaaaaaaacaaaagggg 28663740  T
Q  286 ttacatacagggacggagggagtatat 312  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28663739 ttatatatagggacggagggagtatat 28663713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 274
Target Start/End: Original strand, 27162818 - 27163012
Alignment:
Q  78 taaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaa-gtcaaa 176  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  27162818 taaacaccttttcaaattactaaatgcatttattatt-tttttcctaaacatacttctaattaatactattaacttgtcttgaaatatgaaaaagttaaa 27162916  T
Q  177 tttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27162917 tttaatacacatacaaacaaatgacaatttggcaatattaaaacacaaaatacaca--ttaattgcactaacaactttacttaagaaatgtgaaaaag 27163012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25750613 - 25750364
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||     || |||||||| | |||||    
T  25750613 tactcactccgtctctatatctaagcaccgatttgactttatttttgtctctaaatataaactctttttcaaaata-----tgcatttattacttttttt 25750519  T
Q  121 c--ctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    |  |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  25750518 cttctaaacatacccctaattaatattactaccttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgtaatattaac 25750419  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||| |||||  ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  25750418 acacaaaacagacacattaattacactgacaactttttttaagaaatgtgaaaaa 25750364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21759969 - 21759792
Alignment:
Q  19 actactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattt 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| | |||    
T  21759969 actactccctccgtccctatatgtaagaatccatttgattttatgtttgtccctaaatgtaaactctatttcaaattactagatgcatttattact-ttt 21759871  T
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa 197  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  21759870 ttcctaaacatacccgtaattaatcctactaatttgtcttgaaatacgaaaagttaaatttaatacccattcaaacaaa 21759792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 226
Target Start/End: Original strand, 47458080 - 47458248
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||| |||| |||||    
T  47458080 attttatttttgtccctaaatgtaaattcctttttaaattactaaatgcatttattatt-ttttccctaaacatac-cctaattagtaccactatcttgt 47458177  T
Q  156 cttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaa 226  Q
    ||||||||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  47458178 cttgaaatataaaatattaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcataatattaacacacaaaa 47458248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35960574 - 35960336
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatact-actaacttgtcttgaaatatgtaaa 170  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||    
T  35960574 taaatataaactcatttttagattagtagatgcatttattatt--ttttcataaacatacccctaattaatacacactaacctgtcttgaaatatgaaaa 35960477  T
Q  171 gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||  ||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35960476 gtcaaatttaacacacatacaaacaaaagataatttagtaatataaatacataaaatagacacattaattgtactaacaattttttttaaggaatgtgaa 35960377  T
Q  271 aaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtata 311  Q
    |||   || ||  | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  35960376 aaatacaatggatgcttacattcagggacggagcgagtata 35960336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 31373689 - 31373844
Alignment:
Q  155 tcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttt 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||    
T  31373689 tcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagtaatattaacacacaaaatagacacattaattgccctaacaatttt 31373788  T
Q  255 tcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  | | ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  31373789 tcttaagaaatgtgaaaaatgcaaaaagtgcttagatatagggatggagggagtat 31373844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 270
Target Start/End: Original strand, 43601031 - 43601270
Alignment:
Q  26 cctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaa 125  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||   ||| |||  |||    
T  43601031 cctcggtccctatatttaagcactcatttgactttatttttgtccataaatgtaaaccacttttcaaattactagatatatatatatatatattttttaa 43601130  T
Q  126 acatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaa 225  Q
    |||||| |    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||    
T  43601131 acataccc----ttaatattactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaaggacaattttgtaatacttaca-acaaa 43601225  T
Q  226 atagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
    | |||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  43601226 acagacacctcaattacattaacaacttttcttaagaaatgtgaa 43601270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33181509 - 33181291
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33181509 tttgactttatttttgtccataaatgtaaaccc--tttcaaattattagatgcatttattaat-tttttcttaaacatactcctaattaatattactaac 33181413  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaat 251  Q
    ||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| | |||  |||| |||| | ||||     
T  33181412 ttgtcttaaagtatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaatatacaaaacaaacacattaactacactgacaac 33181313  T
Q  252 ttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
     ||| ||||||||| |||||||    
T  33181312 attttttaagaaatatgaaaaa 33181291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29723672 - 29723421
Alignment:
Q  56 attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgt 155  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  29723672 attttatttttgtctttaaatataaatccatttttaaattactagatgcatttattatt--ttttcttaaatatacttctaattaatactactatcttgt 29723575  T
Q  156 cttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacac-aaaatagacattttaattacaataacaatttt 254  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||| || ||  ||||||||||| |||| |||    
T  29723574 gttgaaatatgaaaagtcaaatttaatatatatgcaaacaaatgattatttcgtaatattaccacacaaaaacaggcacattaattacaatgacaaattt 29723475  T
Q  255 tcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    || ||| |||||||||||||  || ||| |  |||||  ||||||||||||||||    
T  29723474 tc-taaaaaatgtgaaaaagacaatgggtgcctacattaagggacggagggagta 29723421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 21392853 - 21393039
Alignment:
Q  124 aaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacaca 223  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  21392853 aaacatactcctaattaaatctactaacatgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaatataatttggtaatattaacactca 21392952  T
Q  224 aaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||||||  |||||| || |||||| ||||   || |||| ||||||| |||| | | | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  21392953 aaatagacacattaattgcactaacaaatttttaaaaaaaatatgaaaaatgtaatgagtgcttacatagaggtacggagggagtat 21393039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 306
Target Start/End: Original strand, 26200892 - 26201111
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaataca 185  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| ||  | ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26200892 tttttaaattactatatatatatattttt--tcttcttaaatatacttctaattaatactactaacttgttttaaaatatgaaaagttaaatttaataca 26200989  T
Q  186 catacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtg-aaaaaggtaaaggggg 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||| || ||| || |||||||||||||| || ||||| | |||||  |    
T  26200990 catacaaacaaagaataatttgataatattaatacacaaaatagacacaataattgcactaataacttttcttaagaaatatgaaaaaatgcaaaggatg 26201089  T
Q  285 tttacatacagggacggaggga 306  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  26201090 cttacatatagggacggaggga 26201111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36116566 - 36116316
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttg--attttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattt 118  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||   |||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||||||  ||||||     ||    
T  36116566 tactccctccgtctctatatttaagcacccattttttattttatttttgtctctaattgtaaatctctttttaaattactagatgcgtttatt-----tt 36116472  T
Q  119 ttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaac 218  Q
    || || || ||||   ||||||||| || || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  36116471 tttcttaagatacctctaattaatattattatcttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgtaatattaac 36116372  T
Q  219 acacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36116371 acataaaacagacacattaattacaccgacaacatttcttaagaaatgtgaaaaag 36116316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Original strand, 28038816 - 28038950
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  28038816 aaattactagatgtatttattatg-tttttcctaaacatattcataattaatactgctaacttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacaaatac 28038914  T
Q  191 aaacaaaggata-atttggtaatattaacacacaaa 225  Q
    |||||||  |   |||||||||||||||||||||||    
T  28038915 aaacaaaaaaaccatttggtaatattaacacacaaa 28038950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 43465004 - 43465222
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||  |||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||     
T  43465004 tactccctctgtccctatatctaagctcccatttgactttatttttgtctttaaatgtacactctctttcaaattactaaatgcatttattatttttttc 43465103  T
Q  121 cct-aaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    ||| |||||||| ||||||||||     | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||    
T  43465104 ccttaaacatacccataattaat-----tgacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgaaaatactaaca 43465198  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattaca 243  Q
    ||||||| |||||  |||||||||    
T  43465199 cacaaaacagacacattaattaca 43465222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21752657 - 21752488
Alignment:
Q  139 taatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaa 238  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||    
T  21752657 taatactattaact-gttttgaaatgtgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttggtaatattaacccacaaaataaacaaattaa 21752559  T
Q  239 ttacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagta 309  Q
    || || |||||| |||| |||||||||||| |||| | |||||| |||||||  |||| ||| ||||||||    
T  21752558 ttgcactaacaactttttttaagaaatgtggaaaatgcaaagggcgtttacaagcaggaacgaagggagta 21752488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37136430 - 37136236
Alignment:
Q  20 ctactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt 119  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||    |   |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  37136430 ctactccctccgtccctatatataaccatccatttgacaaaaaaattgtccctaaatataaacctcttttcaaattactagacgcattcattattatttt 37136331  T
Q  120 tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatat 214  Q
    |||||||||||| | |||||||||   ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37136330 tcctaaacatacccctaattaatatcgctaacttatcttaaaatatgaaaagtcaaatttaacacacatacaaacaaatgataatttggttatat 37136236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Original strand, 42993109 - 42993297
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaac--atactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    ||||||||| || ||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  42993109 tttttcaaatactagatgtatttattatt-tttttcctaaacttataacactaattaatattattaaattatcttgaaatatgaaaaatcaaatttaata 42993207  T
Q  184 cacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42993208 cacatactaacaaaggttaatttgataatattaacacataaaatagacacgttaattgtattaacaacttttcttaagaaatgtaaaaaa 42993297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 260
Target Start/End: Original strand, 5334366 - 5334491
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatt 234  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| | |||      
T  5334366 taattaataccactaatttgtcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgatagtttggtaatattaacatacaaaacaaacaca 5334465  T
Q  235 ttaattacaataacaatttttcttaa 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5334466 ttaattacactaacaatttttcttaa 5334491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 5333752 - 5333879
Alignment:
Q  16 tcaactactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattatta 115  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5333752 tcaattactccctcggtccctatatgtaaacatacatttgactttatttttgtccctaaatgtaaacccctttttaaattactagatgtatttataattt 5333851  T
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaata 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  5333852 tttttcctaaacatacccctaattaata 5333879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 257
Target Start/End: Original strand, 44648609 - 44648810
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaac 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||         
T  44648609 tttgattttatttttgttcctaattgtaaattcattttcaaat-actaaatgcatttattattatttttcttaaacgtacccttaactaatacta----- 44648702  T
Q  152 ttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggt--aatattaacacacaaaatagacattttaattacaataaca 249  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |  |||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||    
T  44648703 ttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaactaaagacaatttgatccaatattaacatacaaaatagacacattgattacattaaca 44648802  T
Q  250 atttttct 257  Q
    | ||||||    
T  44648803 acttttct 44648810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Original strand, 10408496 - 10408636
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    |||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10408496 aaattagtaggtgcatttattat-atttttcataaacatacccctaattaatactactaacttgcattgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatac 10408594  T
Q  191 aaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagaca 232  Q
    |||||||||| || || |||| ||| ||||||||| ||||||    
T  10408595 aaacaaaggacaaattagtaaaattcacacacaaactagaca 10408636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 212
Target Start/End: Original strand, 13907673 - 13907791
Alignment:
Q  93 attactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaa 192  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  13907673 attactagatgtatttattaat-tttttcctaaacacacccctaattaatactactaacttgtctttaaatatgaaaagtcaaatttattaaacatacaa 13907771  T
Q  193 acaaaggataatttggtaat 212  Q
    ||||| || |||||| ||||    
T  13907772 acaaatgacaatttgataat 13907791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 183
Target Start/End: Original strand, 10593856 - 10593964
Alignment:
Q  76 tgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtc-ttgaaatatgtaaagtca 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  10593856 tgtaaactccttttcaaattactagatgtatttattattttttttccgaagcatgcccctaattaatagtactaacttgtctttgaaatatgaaaaatca 10593955  T
Q  175 aatttaata 183  Q
    |||||||||    
T  10593956 aatttaata 10593964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Original strand, 24700648 - 24700751
Alignment:
Q  116 tttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatatt 215  Q
    ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24700648 tttttcctaaatatatccttaattaatactactaacttattttgaaatatgaaaagtcaacattaatacacatacaaacaaagaacaatttggtaatatt 24700747  T
Q  216 aaca 219  Q
    ||||    
T  24700748 aaca 24700751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 34118246 - 34118148
Alignment:
Q  32 tccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatac 131  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  34118246 tccatatatgtaagcacctatttgactttatttttgtctctaaatgtaaacttttttttaaattactagatgcagttattatt-tttttcctaaacatac 34118148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29993082 - 29992979
Alignment:
Q  162 atatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaag 261  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| || |||||| ||||||||||    
T  29993082 atatgaaaagttaaatttaacaaacacacaaacaaatgataatttggtagtattaacatacaaaatagacacattaattgcactaacaacttttcttaag 29992983  T
Q  262 aaat 265  Q
    ||||    
T  29992982 aaat 29992979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 224
Target Start/End: Original strand, 2409845 - 2409973
Alignment:
Q  95 tactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaac 194  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||     
T  2409845 tactaaatgcatttatt-ttatttttcttaaacatacctctaattaatactattaatttttcttgaaatatgaaaagacaaatttaatatacatacaaat 2409943  T
Q  195 aaaggataatttggtaatattaacacacaa 224  Q
    |||||| || || |||||||| ||| ||||    
T  2409944 aaaggacaacttagtaatattcacatacaa 2409973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4068528 - 4068395
Alignment:
Q  141 atactactaacttgtcttgaaatatgtaaag-tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaat 239  Q
    |||||||||| || |||| | ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  4068528 atactactaatttatcttaagatatgaaaaggttaaatctaatacacatacaaacaaagaataatttgataatattaacatacaaaatagatatattaat 4068429  T
Q  240 tacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    | || |||||| |||| | || |||| |||||||    
T  4068428 tgcattaacaacttttttaaaaaaatatgaaaaa 4068395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 310
Target Start/End: Original strand, 10595113 - 10595243
Alignment:
Q  178 ttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggta 277  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  10595113 ttaatacacatacaaacaaaagacagtttcgtaat--taacacacaaaacagacatattaattatactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaacgca 10595210  T
Q  278 aagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||  |||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  10595211 aaaagggtttacatccaggaagagagggagtat 10595243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29993211 - 29993080
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactac---taacttgtcttgaaatatgta 168  Q
    ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||||   |||||||| |||||||||| |    
T  29993211 taaatataaacttatttttaaaatactagatgcatttattatta--tttcctaaacataccactaattaatactactagtaacttgttttgaaatatgaa 29993114  T
Q  169 aagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggata 202  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  29993113 aagttaaatttaacaaacacacaaacaaatgata 29993080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 274
Target Start/End: Original strand, 40211295 - 40211387
Alignment:
Q  182 tacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 274  Q
    |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40211295 tacacatacaaataaatgacaatttcgtaatattaacacacaaaacagacacattaattacacaaacaatttttcttaaaaaatatgaaaaag 40211387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 153
Target Start/End: Original strand, 41672461 - 41672523
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaactt 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41672461 aaattactagatgcatttattattttttttcctaaacatacccctaattaatactactaactt 41672523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Original strand, 25098244 - 25098312
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttt 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25098244 tactccctccgtccctatatgtaaccacccttttgtttttatttttgtccttaaatgtaaa-tccttttt 25098312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 14801788 - 14801863
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  14801788 tactctcttcgtccatatatttaaacacccgtttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 14801863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 15248780 - 15248855
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  15248780 tactctcttcgtccatatatttaaacacccgtttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 15248855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 179
Target Start/End: Original strand, 19477108 - 19477224
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttt-tcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaa 162  Q
    |||||| |||||| |||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||| || ||||||||    
T  19477108 tttgtctctaaatataaatttcttttcagattactagattcatttattattgttttttcctaaatatatccctaattaatactactaatttatcttgaaa 19477207  T
Q  163 tatgtaaagtcaaattt 179  Q
    |||| ||||||||||||    
T  19477208 tatgaaaagtcaaattt 19477224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20124258 - 20124147
Alignment:
Q  199 gataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacaggga 298  Q
    |||||||| ||||| | || ||| ||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||  |||||    
T  20124258 gataatttagtaatgtcaatacataaaatagacacattaattacaccaacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaaagcaaaaggggcttacattaaggga 20124159  T
Q  299 cggagggagtat 310  Q
    ||||||||||||    
T  20124158 cggagggagtat 20124147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 259
Target Start/End: Original strand, 41672591 - 41672662
Alignment:
Q  188 tacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttctta 259  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  41672591 tacaaacaaaggataatttagttatattcacacacaaaatagacacattaattacactaacaagttttctta 41672662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Original strand, 38729618 - 38729724
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatac 190  Q
    ||||||||| || ||| ||||||  |||||| |||| |||| | |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  38729618 aaattactatatttatgtattatattttttcttaaatatacccctaattaatatcactagcttgtcttaaaatatgaaaaataaaatttaatacacatac 38729717  T
Q  191 aaacaaa 197  Q
    |||||||    
T  38729718 aaacaaa 38729724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 8318773 - 8318684
Alignment:
Q  26 cctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattatta 115  Q
    ||||||||| || || ||| || || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  8318773 cctccgtccttaaatctaagcatccatttgacgttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttataatta 8318684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29983542 - 29983467
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  29983542 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaa-tcttttttaaattac 29983467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Original strand, 31365713 - 31365808
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaa 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||  ||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31365713 tttgattttatttttgtctgtaaatgtaaactctttttcaaattattagatgcattta--att-ttttctctaaacatacccctaattaatactactaa 31365808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 143
Target Start/End: Original strand, 40211090 - 40211149
Alignment:
Q  84 cctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaata 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  40211090 ccttttcaaattactagatgtatttattattttttttcctaaacatatccctaattaata 40211149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25828242 - 25828130
Alignment:
Q  155 tcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacataca-------aacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataa 247  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||       ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||    
T  25828242 tcttgaaatataaaaagtcaaatttagtacacatacactgtgcaaacaaaatataatttcgtaatattaacacacaaaataggcatattaattttactaa 25828143  T
Q  248 caatttttcttaa 260  Q
    ||| |||||||||    
T  25828142 caacttttcttaa 25828130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20124419 - 20124362
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgt 78  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20124419 tactccctccgtccctatatttaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgt 20124362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 36195493 - 36195393
Alignment:
Q  160 aaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttctta 259  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||       |||||||| | ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||| |    
T  36195493 aaatatgaaaagtcaaatttaatatacattcaaataaagga-------gtaatatttatacacaaaatagacacattaattatactaacaatttttctaa 36195401  T
Q  260 agaaatgt 267  Q
    ||||||||    
T  36195400 agaaatgt 36195393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43026150 - 43026057
Alignment:
Q  140 aatactactaacttgtcttgaaatatgtaaag-tcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagaca 232  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  43026150 aatactacttacttctcttaaaatatgaaaaaattaaatttaatacacatacatacaaaagatagtttaataatattcacacacaaaatagaca 43026057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 273
Target Start/End: Original strand, 33671074 - 33671157
Alignment:
Q  191 aaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaa-tttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | | |||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33671074 aaacaaaagataatttggtaaaacttatacaccaaatagacatgttaattgaaataacaactttttcttaagaaatatgaaaaa 33671157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 36858431 - 36858365
Alignment:
Q  30 cgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  36858431 cgtccatatatttaaacatccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 36858365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 47423754 - 47423693
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaac 82  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  47423754 tactctcttcgtccatatatttaaacacccattttattttatttttgtccttaaatgtaaac 47423693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Original strand, 39102750 - 39102798
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  39102750 taattaatactactaacttgtcttggaatataaaaagtcaaattaaata 39102798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Original strand, 48832832 - 48832880
Alignment:
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  48832832 taattaatactagtaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaattaaata 48832880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8318690 - 8318651
Alignment:
Q  134 ataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtc 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8318690 ataattaatactattaacttgtcttgaaatatgaaaagtc 8318651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 166
Target Start/End: Original strand, 26828390 - 26828464
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatg 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||  || ||||| ||||| ||||||    
T  26828390 aaattattagatgtatttattattctttt-cctaaacatattcttaattaatatcaccaacttatcttgtaatatg 26828464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25829205 - 25829104
Alignment:
Q  64 tttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatt-tttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaa 162  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||| || ||  ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||    
T  25829205 tttgtccataaatataagctc-ttttcaaattattaaatacatttattattattattttctaaacatacccctaattagtattaataacttgtcttgaaa 25829107  T
Q  163 tat 165  Q
    |||    
T  25829106 tat 25829104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 219
Target Start/End: Original strand, 26830131 - 26830177
Alignment:
Q  173 caaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26830131 caaattaaatacacatataaacaaatgataatttagtaatattaaca 26830177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12645635 - 12645602
Alignment:
Q  187 atacaaacaaaggataatttggtaatattaacac 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12645635 atacaaacaaatgataatttggtaatattaacac 12645602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 150
Target Start/End: Original strand, 21291182 - 21291244
Alignment:
Q  86 tttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaa 150  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||| | ||||||    
T  21291182 tttttaaatttttagatgtatttattattatttttc--aaacataatcctaattaaaattactaa 21291244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20124335 - 20124291
Alignment:
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatat 165  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20124335 cctaaacatacccctaataaatactactaacttttcttgaaatat 20124291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49383 - 49095
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||| ||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  49383 tactctctcagtccatatatttaagcacccatttaactttatttttttctttaaatgtaaatcccttttcaaattactagatgtatttattatt--tttt 49286  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaa-gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaaca 219  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| || |||||  |||||||||||    
T  49285 cctaaacatacccctaattaatactactaatttgttttgaaatatgaaaaagtcaaatttaataaacatgcaaacaaatgacaatttaataatattaaca 49186  T
Q  220 cacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  | ||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  49185 cacaaagtagacatattaattacattaacaatttttcttaagaaatgtaaaaaatgcaaaaagtgtttaaatataaggacggagagagtat 49095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 243
Target Start/End: Original strand, 61191 - 61361
Alignment:
Q  72 taaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacata-ctcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaa 170  Q
    ||||| ||||||| || | |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| |||||| || | || || |||| |||    
T  61191 taaatataaactctttatcaaattattatatgcatttattattatttttc-taaacacatctc-taattaatattactaatttattttaaattatgaaaa 61288  T
Q  171 gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattaca 243  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||  |||||||||    
T  61289 gttaaatttaatacacatataaataaaggacaatttaataatattaacacacaaaacaaacacgttaattaca 61361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 214824 - 214577
Alignment:
Q  66 tgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattat-tatttttcctaaacatactcataattaata--ctactaacttgtcttgaaa 162  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||| |||    
T  214824 tgtccttaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattatatattttttctaaacatacccctaattaatatactactaacttatcttaaaa 214725  T
Q  163 tatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaaga 262  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  214724 tataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggtaatattaacacaaaaactagacacattaattacactaacaacttttcttaaga 214625  T
Q  263 aatgtgaaaaaggtaaagggggtttacatacagggacggagggagtat 310  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||| | ||||| | |||||||    
T  214624 aatgtgaaaaaagtaaaagggggttatatataaggacgaatggagtat 214577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 38352 - 38584
Alignment:
Q  36 tatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttt-aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactca 134  Q
    ||||| ||| || |||||||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |     
T  38352 tatatctaagcatccgtttgattttcttt--gtccttaaatgtaaa-tcctttttcaaattactagatgcatttattatt--ttttcctaaacatacccc 38446  T
Q  135 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaa-gtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  38447 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaagtcaaatttaataaacataaaaacaatggataatatggtaatattaacacacaaaatagacac 38546  T
Q  234 tttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaa 271  Q
     ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38547 attaattatactaacaatttttattaagaaatgtgaaa 38584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25946 - 25771
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattattttt 120  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25946 tactccctctgttcctatatgtaagcacctatttgattttagttttgtccctaaatgtaaacctcttttcaaattactagatatatttattatttttttt 25847  T
Q  121 cctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa 197  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25846 tctaaacatacccctaattaatactactcacttgtcttgaaatatg-aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa 25771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Original strand, 99743 - 99926
Alignment:
Q  91 aaattactagatgtatttattattatttttcc-taaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacata 189  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  99743 aaattactagatgcgtttattattatttttcccttaacatgcctctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatt 99842  T
Q  190 caaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 273  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  | | || || |||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  99843 caaacaaaagacaatttcgtaatattaacacacaaaatagacacataagttgcactaacaacttttcttaacaaatatgaaaaa 99926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0699 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0699
Description:

Target: scaffold0699; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7708 - 7577
Alignment:
Q  138 ttaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatttta 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||  | |    
T  7708 ttaatattactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaaggacaattttgtaatacttaca-acaaaatagacacctca 7610  T
Q  238 attacaataacaatttttcttaagaaatgtgaa 270  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7609 attacattaacaacttttcttaagaaatgtgaa 7577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24275 - 24149
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttt-aaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaatactactaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||    
T  24275 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaa-tcttctttcaaattactagatgcatttactattttttttc-taaacatacccctaattaatactattaa 24178  T
Q  151 cttgtcttgaaatatgtaaagtcaaattt 179  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24177 cttatcttgaaatatgaaaagtcaaattt 24149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19612 - 19492
Alignment:
Q  187 atacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaaatgtgaaaaaggtaaagggggtt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||   |||| |||||    
T  19612 atacaaacaaaggataatttggtaatattagcaca--aaatagacatattaattgcactgacaacttttcgtaagaaatgtgaaaaatacaaagtgggtt 19515  T
Q  287 tacatacagggacggagggagta 309  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  19514 tacattaagggacggagggagta 19492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20250 - 20100
Alignment:
Q  24 tccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcct 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||| ||||        ||||||| |||||| |    
T  20250 tccctccgtccttatatgtaagcatccatttgattttatttttgatcctaaatgtaaatctctttttaaataacta--------tattatt-tttttctt 20160  T
Q  124 aaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaata 183  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  20159 aaacatacctataattaatactactaacttgttttgaaatttgaaaagtcaaatttaata 20100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22191 - 22086
Alignment:
Q  138 ttaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacatttta 237  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||  |||    
T  22191 ttaataatactaacttgtcttcaaatatgaaaagttaaatttaatatacatacaaacaaaggacaatatggtaatattaatacacaaaacaaacacatta 22092  T
Q  238 attaca 243  Q
    ||||||    
T  22091 attaca 22086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18790 - 18695
Alignment:
Q  168 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaattacaataacaatttttcttaagaa 263  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| || |||||| |||| |||||||    
T  18790 aaagtcaaatttaaaacacatagaaacaaatgacaatttggtaatattaacccacaaaataaacaaattaattgcattaacaactttttttaagaa 18695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22645 - 22554
Alignment:
Q  52 tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattatttttcctaaacatactcataattaata 143  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||    
T  22645 tttgactttatttttgtctctacatgtaaacacactttcaaattactagatgcatttattaatttttttcctaaacatacccctaattaata 22554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0559 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0559
Description:

Target: scaffold0559; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6760 - 6614
Alignment:
Q  19 actactccctccgtccatatatgtaaccacccg--tttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattattat 116  Q
    |||||||||||||||| || |||||| | |||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  6760 actactccctccgtccctacatgtaaaccccccattttgactttatttttgtccttaaatgtaaacctcatttcaaattactacatgcatttaatattat 6661  T
Q  117 ttttcctaaacatactcataattaatactactaacttgtcttgaaata 164  Q
    ||| |||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6660 ttt-cctaaacatacaactaatcaatactactaacttgtcttgaaata 6614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 265
Target Start/End: Original strand, 23628 - 23750
Alignment:
Q  142 tactactaactt-gtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaaatagacattttaatt 240  Q
    |||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||||    
T  23628 tactactaactttgtcttcaaatgtgaaaaatcaaatttaatacacatacaaa-aaagaacaatttgataatattaacatacaaaataaacacattaatt 23726  T
Q  241 acaataacaatttttcttaagaaat 265  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||    
T  23727 acattaactattttt-ttaagaaat 23750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 225
Target Start/End: Original strand, 5866 - 5954
Alignment:
Q  137 attaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggtaatattaacacacaaa 225  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||    
T  5866 attaatactactaacttgtattaaattatgaaaagtcaaattaaatacacatatgaacaaagaacaatttagtaaaattcacacacaaa 5954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13028 - 12953
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  13028 tactctcttcgtccatatatttaaacacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaac-cttttttaaattac 12953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1039 - 976
Alignment:
Q  19 actactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaac 82  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  1039 actactccctccgtccctatatctaagctcccatttgactttatttttgtccctgattgtaaac 976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 55049 - 54979
Alignment:
Q  19 actactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttt 89  Q
    |||||||| ||||| | ||||| ||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  55049 actactccatccgttcctatatttaagcacctatttgattttatttttatctctaaatgtaaacccctttt 54979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 44727 - 44800
Alignment:
Q  21 tactccctccgtccatatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattac 97  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44727 tactccctccatccctatatgtaacca-cattttgtttttatttttgt-cctaaatgtaaac-ccttttcaaattac 44800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University